INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 14 23 37 6.51138796280049 12.3027197753992 -5.79133181259871 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0690766182739774 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 169 174 343 78.6017546938059 93.0727496051939 -14.470994911388 C:G G C 10 0.534900859799965 0.129509709710299 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 15 10 25 6.97648710300052 5.34900859799965 1.62747850500087 T:C T C 10 0.534900859799965 0.553545164136958 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 35 38 73 16.2784699070012 20.3262326723987 -4.04776276539745 A:G A G 10 0.534900859799965 0.350401462888889 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 10 3 13 4.65099140200035 1.6047025793999 3.04628882260045 A:C C A 10 0.534900859799965 0.102499055737901 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 11 21 32 5.11609054220038 11.2329180557993 -6.11682751359888 T:G G T 10 0.534900859799965 0.0336097986060344 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 3548136 T/C 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548030_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548030_3548221:WDR8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 14 16 30 6.51138796280049 8.55841375679944 -2.04702579399895 A:G A G 10 0.534900859799965 0.469999256822193 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 20 20 40 9.3019828040007 10.6980171959993 -1.3960343919986 A:G G A 10 0.534900859799965 0.751759422506709 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 10 2 12 4.65099140200035 1.06980171959993 3.58118968240042 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0441097110945409 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 10473200 G/A 1 32 33 65 14.8831724864011 17.6517283733988 -2.76855588699773 A:G G A 10 0.534900859799965 0.534973189321625 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 10479791 G/A 1 127 118 245 59.0675908054044 63.1183014563959 -4.05071065099143 A:G G A 10 0.534900859799965 0.609004371413994 ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10479687_10480200:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10479687_10480201:PGD;ENSG00000142657:ENST00000498356:exon_10479687_10479887:PGD;ENSG00000142657:ENST00000496718:exon_10479474_10479865:PGD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 11728894 G/A 1 12 13 25 5.58118968240042 6.95371117739955 -1.37252149499913 A:G G A 10 0.534900859799965 0.689501648771211 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 A:G A G 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 10 19 29 4.65099140200035 10.1631163361993 -5.51212493419899 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0607587038441563 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 14108712 C/T 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 A:G A G 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 15752379 G/A 1 42 41 83 19.5341638884015 21.9309352517986 -2.3967713633971 A:G G A 10 0.534900859799965 0.66013763192773 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15752367_15752514:EFHD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 15900152 G/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15898848_15900219:AGMAT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 C:G G C 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 16577948 G/A 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 20827216 C/T 1 3 10 13 1.3952974206001 5.34900859799965 -3.95371117739955 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0473249118782269 ENSG00000090432:ENST00000264198:exon_20825943_20827912:MUL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 26496455 C/T 0 90 0 90 41.8589226180031 0 41.8589226180031 C C 10 0.534900859799965 5.71317473273954e-25 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 114 69 183 53.021301982804 36.9081593261976 16.1131426566064 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0176424208506754 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 26496960 C/T 1 164 86 250 76.2762589928057 46.001473942797 30.2747850500087 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.000132751767801449 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496909_26496971:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496909_26498551:ZNF593 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 A:C A C 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 36 34 70 16.7435690472013 18.1866292331988 -1.44306018599755 C:G C G 10 0.534900859799965 0.810828255840847 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 27660467 T/C 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000186501:ENST00000374073:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000374076:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000464720:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000486082:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000464813:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000478104:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000498220:exon_27660449_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000471456:exon_27658837_27660545:TMEM222;ENSG00000186501:ENST00000470223:exon_27659954_27660545:TMEM222 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 3 12 15 1.3952974206001 6.41881031759958 -5.02351289699948 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0165990861450671 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28208705 C/T 1 14 17 31 6.51138796280049 9.09331461659941 -2.58192665379892 T:C C T 10 0.534900859799965 0.372985896867814 ENSG00000130775:ENST00000442118:exon_28208482_28208986:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 22 10 32 10.2321810844008 5.34900859799965 4.88317248640112 A:G A G 10 0.534900859799965 0.109618786805945 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 29 12 41 13.487875065801 6.41881031759958 7.06906474820143 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0284602363533183 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 33 14 47 15.3482716266012 7.48861203719951 7.85965958940164 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0272855001526446 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28211835 C/T 1 25 19 44 11.6274785050009 10.1631163361993 1.46436216880154 T:C C T 10 0.534900859799965 0.762915511484802 ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373927:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28211806_28211928:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000492877:exon_28209909_28211962:C1orf38 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 248 201 449 115.344586769609 107.515072819793 7.82951394981569 A:G A G 10 0.534900859799965 0.478054432995724 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 A:G A G 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 12 4 16 5.58118968240042 2.13960343919986 3.44158624320056 A:G G A 10 0.534900859799965 0.13034100681029 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 238 252 490 110.693595367608 134.795016669591 -24.1014213019829 T:C C T 10 0.534900859799965 0.029739077878695 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 142 159 301 66.044077908405 85.0492367081944 -19.0051587997895 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0323547372745142 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 44 32 76 20.4643621688015 17.1168275135989 3.34753465520266 T:C T C 10 0.534900859799965 0.490864856893188 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 31907089 T/C 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 T:C T C 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31906911_31907524:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31906911_31907525:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31906911_31907524:SERINC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 33502376 G/A 0 25 0 25 11.6274785050009 0 11.6274785050009 G G 10 0.534900859799965 3.0626518117006e-07 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33502337_33502471:AK2;ENSG00000004455:ENST00000467905:exon_33502337_33502487:AK2;ENSG00000004455:ENST00000354858:exon_33502337_33502593:AK2;ENSG00000004455:ENST00000480134:exon_33502337_33502478:AK2;ENSG00000004455:ENST00000398192:exon_33502337_33502467:AK2;ENSG00000004455:ENST00000487289:exon_33502337_33502445:AK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 4 10 14 1.86039656080014 5.34900859799965 -3.48861203719951 A:G A G 10 0.534900859799965 0.104561526016219 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 36068863 T/C 1 122 143 265 56.7420951044043 76.490822951395 -19.7487278469907 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0162262103220142 ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36067185_36068975:PSMB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 36927733 G/A 1 34 47 81 15.8133707668012 25.1403404105984 -9.32696964379717 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0444795734790079 ENSG00000116898:ENST00000373116:exon_36927689_36927764:MRPS15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 40980559 G/A 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 13 13 26 6.04628882260045 6.95371117739955 -0.907422354799092 T:C T C 10 0.534900859799965 0.844673236061777 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 43632536 C/T 1 119 117 236 55.3467976838042 62.5834005965959 -7.23660291279175 T:C C T 10 0.534900859799965 0.361209849216883 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 43636484 C/G 1 42 49 91 19.5341638884015 26.2101421301983 -6.67597824179682 C:G C G 10 0.534900859799965 0.172474691375763 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43636427_43636550:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43636427_43636792:EBNA1BP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 22 23 45 10.2321810844008 12.3027197753992 -2.07053869099843 T:C T C 10 0.534900859799965 0.553280034626785 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 12 8 20 5.58118968240042 4.27920687839972 1.3019828040007 T:C C T 10 0.534900859799965 0.656764655580921 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 40 22 62 18.6039656080014 11.7678189155992 6.83614669240217 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0974229055342303 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 45974679 G/A 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45974468_45976739:MMACHC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 28 34 62 13.022775925601 18.1866292331988 -5.16385330759783 A:G A G 10 0.534900859799965 0.204095497113166 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 40 35 75 18.6039656080014 18.7215300929988 -0.117564484997377 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 53516383 C/A 1 27 24 51 12.5576767854009 12.8376206351992 -0.279943849798219 A:T:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53516281_53517375:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53516281_53517073:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53516281_53516575:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53516281_53516642:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53516281_53516932:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000430330:exon_53516281_53516798:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000484100:exon_53516281_53516690:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000533119:exon_53516281_53516734:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000435345:exon_53516281_53516785:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000488965:exon_53513530_53517282:SCP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 A:G G A 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:T T A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 59002282 A/C 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 A:C A C 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 28 16 44 13.022775925601 8.55841375679944 4.46436216880154 T:C T C 10 0.534900859799965 0.226320079868341 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 20 20 40 9.3019828040007 10.6980171959993 -1.3960343919986 T:G G T 10 0.534900859799965 0.751759422506709 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 16 34 50 7.44158624320056 18.1866292331988 -10.7450429899983 A:T T A 10 0.534900859799965 0.00265353434289404 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 75172652 T/C 1 30 10 40 13.952974206001 5.34900859799965 8.6039656080014 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00662612476391119 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75172583_75174511:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75172583_75172678:CRYZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 8 1 9 3.72079312160028 0.534900859799965 3.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0431967784660911 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 84961108 G/A 1 20 19 39 9.3019828040007 10.1631163361993 -0.861133532198636 A:G G A 10 0.534900859799965 0.872808227244349 ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 19 19 38 8.83688366380066 10.1631163361993 -1.32623267239867 T:C T C 10 0.534900859799965 0.745743523336367 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 11 11 22 5.11609054220038 5.88390945779962 -0.76781891559923 C:G G C 10 0.534900859799965 0.83196431766879 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:G T G 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 16 15 31 7.44158624320056 8.02351289699948 -0.581926653798917 T:C C T 10 0.534900859799965 0.858802032108497 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 11 15 26 5.11609054220038 8.02351289699948 -2.90742235479909 A:C A C 10 0.534900859799965 0.325886746948747 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 14 8 22 6.51138796280049 4.27920687839972 2.23218108440077 C:G C G 10 0.534900859799965 0.396875058456915 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 93744055 G/A 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 24 24 48 11.1623793648008 12.8376206351992 -1.67524127039832 T:C T C 10 0.534900859799965 0.665792191486086 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 100740505 G/C 1 19 28 47 8.83688366380066 14.977224074399 -6.14034041059836 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0798723764324564 ENSG00000137996:ENST00000370128:exon_100740380_100740521:RTCD1;ENSG00000137996:ENST00000260563:exon_100740380_100740521:RTCD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 109779073 G/A 1 28 50 78 13.022775925601 26.7450429899983 -13.7222670643973 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00204871670069685 ENSG00000031698:ENST00000234677:exon_109779013_109779170:SARS;ENSG00000031698:ENST00000369923:exon_109779013_109779170:SARS;ENSG00000031698:ENST00000468588:exon_109778853_109779995:SARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 14 14 28 6.51138796280049 7.48861203719951 -0.977224074399022 T:G G T 10 0.534900859799965 0.710193959056181 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 45 24 69 20.9294613090016 12.8376206351992 8.09184067380241 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.0538166920349639 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 161 115 276 74.8809615722056 61.513598876996 13.3673626952096 T:C C T 10 0.534900859799965 0.116571717273596 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A 1 241 1 242 112.088892788208 0.534900859799965 111.553991928408 A:T:C C A 10 0.534900859799965 4.55612956406125e-64 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 9 12 21 4.18589226180031 6.41881031759958 -2.23291805579927 T:C T C 10 0.534900859799965 0.38467997649197 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 A:G G A 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 12 21 33 5.58118968240042 11.2329180557993 -5.65172837339885 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0551329764539647 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 16 19 35 7.44158624320056 10.1631163361993 -2.72153009299878 T:C T C 10 0.534900859799965 0.398903928691939 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 12 11 23 5.58118968240042 5.88390945779962 -0.302719775399196 A:T A T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 T:C T C 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 116916105 C/T 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 T:C C T 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116915836_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116915882_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116915882_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116915882_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000488733:exon_116915891_116916145:ATP1A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C C T 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 39 24 63 18.1388664678014 12.8376206351992 5.3012458326022 A:G G A 10 0.534900859799965 0.206912329322076 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 20 20 0 10.6980171959993 -10.6980171959993 A G A 10 0.534900859799965 2.24342075370169e-07 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 18 18 0 9.62821547639937 -9.62821547639937 C T C 10 0.534900859799965 1.03709767312267e-06 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 18 18 0 9.62821547639937 -9.62821547639937 T G T 10 0.534900859799965 1.03709767312267e-06 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 17 17 0 9.09331461659941 -9.09331461659941 A C A 10 0.534900859799965 2.22984216370863e-06 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 39 0 39 18.1388664678014 0 18.1388664678014 G G 10 0.534900859799965 3.02349619389538e-11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 33 33 0 17.6517283733988 -17.6517283733988 C T C 10 0.534900859799965 1.06906154952561e-11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 41 41 0 21.9309352517986 -21.9309352517986 T C T 10 0.534900859799965 2.34081452168388e-14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 56 0 56 26.045551851202 0 26.045551851202 C C 10 0.534900859799965 1.11444695044219e-15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 C:G C G 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 14 15 29 6.51138796280049 8.02351289699948 -1.51212493419899 C:G C G 10 0.534900859799965 0.58268078856631 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 150054895 A/G 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136631:ENST00000369128:exon_150054800_150054967:VPS45;ENSG00000136631:ENST00000369130:exon_150054800_150054967:VPS45;ENSG00000136631:ENST00000419023:exon_150054800_150054967:VPS45;ENSG00000136631:ENST00000477558:exon_150054800_150055386:VPS45 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 150131481 T/C 1 235 230 465 109.298297947008 123.027197753992 -13.7288998069837 T:C T C 10 0.534900859799965 0.209500649778591 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 53 36 89 24.6502544306019 19.2564309527987 5.39382347780311 T:G G T 10 0.534900859799965 0.288084283984838 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 266 253 519 123.716371293209 135.329917529391 -11.6135462361819 T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.311754950855476 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 68 53 121 31.6267415336024 28.3497455693981 3.27699596420423 A:G G A 10 0.534900859799965 0.585105923175819 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 233 203 436 108.368099666608 108.584874539393 -0.216774872784754 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 151732504 C/T 1 89 87 176 41.3938234778031 46.536374802597 -5.14255132479385 T:C C T 10 0.534900859799965 0.45052427288718 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151732119_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151732123_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000468006:exon_151732130_151732507:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151732351_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000495867:exon_151732360_151732657:MRPL9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 153631943 G/A 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 A:G G A 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000478558:exon_153631203_153632042:SNAPIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 31 39 70 14.4180733462011 20.8611335321986 -6.44306018599755 A:G A G 10 0.534900859799965 0.149992794104886 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 154245917 T/C 1 55 68 123 25.5804527110019 36.3732584663976 -10.7928057553957 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0574183631319969 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154245344_154246074:HAX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 C:G C G 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 154898899 C/T 1 23 30 53 10.6972802246008 16.047025793999 -5.34974556939815 T:C C T 10 0.534900859799965 0.168218713586259 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154898830_154898959:PMVK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 10 3 13 4.65099140200035 1.6047025793999 3.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.102499055737901 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 A:G A G 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 25 29 54 11.6274785050009 15.512124934199 -3.88464642919811 T:C C T 10 0.534900859799965 0.339838475732612 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 T:C T C 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 61 69 130 28.3710475522021 36.9081593261976 -8.53711177399546 T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.135937670990636 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 156106185 T/C 1 124 174 298 57.6722933848043 93.0727496051939 -35.4004562203896 T:C:G T C 10 0.534900859799965 4.48218049723816e-05 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 19 14 33 8.83688366380066 7.48861203719951 1.34827162660115 T:C C T 10 0.534900859799965 0.728220810649499 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 156146640 G/A 1 53 42 95 24.6502544306019 22.4658361115985 2.18441831900332 A:G G A 10 0.534900859799965 0.681771391050965 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 23 29 52 10.6972802246008 15.512124934199 -4.81484470959818 A:G A G 10 0.534900859799965 0.210968593710063 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 58 33 91 26.975750131602 17.6517283733988 9.32402175820318 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0581084627216431 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:C C T 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 160268981 G/A 1 20 14 34 9.3019828040007 7.48861203719951 1.81337076680119 A:G G A 10 0.534900859799965 0.60769796603379 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160268892_160269054:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160268892_160269054:COPA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 28 47 75 13.022775925601 25.1403404105984 -12.1175644849974 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00535475207100867 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 31 18 49 14.4180733462011 9.62821547639937 4.78985786980171 A:G A G 10 0.534900859799965 0.197880143392236 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 163313539 C/T 1 10 18 28 4.65099140200035 9.62821547639937 -4.97722407439902 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0863557876442262 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 165648709 C/T 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 9 9 18 4.18589226180031 4.81410773819969 -0.628215476399371 A:G A G 10 0.534900859799965 0.816280727493184 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 165865478 G/A 1 16 15 31 7.44158624320056 8.02351289699948 -0.581926653798917 A:G G A 10 0.534900859799965 0.858802032108497 ENSG00000143179:ENST00000367879:exon_165865427_165865569:UCK2;ENSG00000143179:ENST00000462329:exon_165865427_165865569:UCK2;ENSG00000143179:ENST00000464197:exon_165865427_165865569:UCK2;ENSG00000143179:ENST00000469256:exon_165865427_165865569:UCK2;ENSG00000143179:ENST00000470820:exon_165864822_165865569:UCK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 65 64 129 30.2314441130023 34.2336550271978 -4.00221091419549 A:G G A 10 0.534900859799965 0.481770580130407 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 167905028 C/T 1 90 84 174 41.8589226180031 44.9316722231971 -3.07274960519391 T:C C T 10 0.534900859799965 0.649120724077289 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167904971_167905278:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167904971_167905136:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167904971_167905136:BRP44;ENSG00000143164:ENST00000450548:exon_167905021_167905350:DCAF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 T:C T C 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 168034974 G/A 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 A:G G A 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168034828_168034984:DCAF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 8 18 26 3.72079312160028 9.62821547639937 -5.90742235479909 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0287037084845106 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 57 49 106 26.510650991402 26.2101421301983 0.300508861203703 A:C A C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 182569626 T/C 1 43 48 91 19.9992630286015 25.6752412703983 -5.67597824179682 A:T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.248525108994213 ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 193065699 G/A 1 53 34 87 24.6502544306019 18.1866292331988 6.46362519740304 A:G G A 10 0.534900859799965 0.196898587995859 ENSG00000023572:ENST00000367439:exon_193065598_193065889:GLRX2;ENSG00000023572:ENST00000367440:exon_193065598_193065889:GLRX2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 197061086 A/C 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:C A C 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197061037_197061186:ASPM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 30 20 50 13.952974206001 10.6980171959993 3.25495701000175 A:G G A 10 0.534900859799965 0.396607871632492 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 23 36 59 10.6972802246008 19.2564309527987 -8.55915072819794 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0267742931874848 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 T:C T C 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 206669465 C/T 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206669445_206670223:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206669445_206670220:IKBKE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G G A 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 58 55 113 26.975750131602 29.4195472889981 -2.44379715739605 A:C A C 10 0.534900859799965 0.706197135670161 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 83 66 149 38.6032286366029 35.3034567467977 3.29977188980521 T:C T C 10 0.534900859799965 0.62259371816642 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 7 16 23 3.25569398140024 8.55841375679944 -5.3027197753992 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0349785538694263 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 212965095 G/A 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000487995:exon_212964872_212965124:NSL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 11 3 14 5.11609054220038 1.6047025793999 3.51138796280049 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0657480420080034 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 214507580 A/G 1 6 14 20 2.79059484120021 7.48861203719951 -4.6980171959993 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0430057939974577 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214505361_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214504293_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214507543_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214507543_214507651:SMYD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 218458753 C/T 1 21 1 22 9.76708194420073 0.534900859799965 9.23218108440077 T:C C T 10 0.534900859799965 3.72796190917355e-05 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218458684_218458797:RRP15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 13 15 28 6.04628882260045 8.02351289699948 -1.97722407439902 T:C C T 10 0.534900859799965 0.456976890177759 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 50 61 111 23.2549570100017 32.6289524477979 -9.37399543779612 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.0863989221540431 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 220197625 G/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220197606_220197798:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220197606_220197798:EPRS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 220298664 A/G 1 15 9 24 6.97648710300052 4.81410773819969 2.16237936480084 A:G A G 10 0.534900859799965 0.418803008714874 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000490891:exon_220298579_220298681:IARS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 222833538 C/G 1 16 10 26 7.44158624320056 5.34900859799965 2.09257764520091 C:G C G 10 0.534900859799965 0.438883119655303 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000475451:exon_222833519_222833656:MIA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 223934720 G/A 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223934699_223934765:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223934699_223934867:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223934699_223934867:CAPN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 226334500 T/C 1 10 5 15 4.65099140200035 2.67450429899983 1.97648710300052 T:C T C 10 0.534900859799965 0.438831218782805 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226332380_226334522:ACBD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C T C 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 16 26 42 7.44158624320056 13.9074223547991 -6.46583611159853 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0621346274240139 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 231376806 G/C 1 10 6 16 4.65099140200035 3.20940515879979 1.44158624320056 C:G G C 10 0.534900859799965 0.618079288529448 ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231376770_231376913:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231376770_231376916:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000451322:exon_231376770_231376836:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000421623:exon_231376770_231376924:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000471936:exon_231376770_231376933:C1orf131 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 234743237 G/A 1 47 35 82 21.8596595894016 18.7215300929988 3.13812949640287 A:G G A 10 0.534900859799965 0.508384546037308 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 26 21 47 12.0925776452009 11.2329180557993 0.859659589401643 T:C T C 10 0.534900859799965 0.884098385556711 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 235324545 T/A 1 17 17 34 7.90668538340059 9.09331461659941 -1.18662923319881 A:T T A 10 0.534900859799965 0.73270882191378 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 236716888 G/A 1 27 31 58 12.5576767854009 16.5819266537989 -4.02424986839797 A:G G A 10 0.534900859799965 0.29567819937854 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 5 16 21 2.32549570100017 8.55841375679944 -6.23291805579927 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00767695072920163 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 6 10 16 2.79059484120021 5.34900859799965 -2.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.219183186864788 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 T:C C T 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 17 21 38 7.90668538340059 11.2329180557993 -3.32623267239867 A:G A G 10 0.534900859799965 0.329840244290400 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP01258_parsed_pileup.txt . 1 246930564 G/C 1 59 53 112 27.4408492718021 28.3497455693981 -0.908896297596087 C:G G C 10 0.534900859799965 0.924594839297921 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246930497_246931439:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246930497_246931437:SCCPDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 19 10 29 8.83688366380066 5.34900859799965 3.48787506580101 A:G G A 10 0.534900859799965 0.263759607189424 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 1065710 C/T 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C:G C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 40 35 75 18.6039656080014 18.7215300929988 -0.117564484997377 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 31 23 54 14.4180733462011 12.3027197753992 2.11535357080189 T:C C T 10 0.534900859799965 0.588097820676093 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 26 22 48 12.0925776452009 11.7678189155992 0.324758729601678 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 10 13 23 4.65099140200035 6.95371117739955 -2.3027197753992 T:C C T 10 0.534900859799965 0.404844022079815 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 A:G A G 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 55 56 111 25.5804527110019 29.954448148798 -4.37399543779612 A:G G A 10 0.534900859799965 0.446766601824198 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:G T G 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 78 66 144 36.2777329356027 35.3034567467977 0.974276188805035 T:C T C 10 0.534900859799965 0.933465685270968 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 12214792 G/A 1 13 11 24 6.04628882260045 5.88390945779962 0.162379364800839 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378929:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378940:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378927:exon_12214764_12214865:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000498825:exon_12214489_12214865:NUDT5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 0 0 8 8 0 4.27920687839972 -4.27920687839972 G C G 10 0.534900859799965 0.00218959752384939 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 9 16 25 4.18589226180031 8.55841375679944 -4.37252149499913 A:G A G 10 0.534900859799965 0.107273055875128 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 16794623 C/T 1 8 19 27 3.72079312160028 10.1631163361993 -6.44232321459906 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0189104044957662 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16794533_16794652:RSU1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 A:C C A 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 22048330 C/T 1 40 51 91 18.6039656080014 27.2799438497982 -8.67597824179682 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0741203039281002 ENSG00000136770:ENST00000376980:exon_22048099_22048547:DNAJC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 25313254 C/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 34408636 T/C 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34408541_34408668:PARD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 58120125 C/G 1 46 50 96 21.3945604492016 26.7450429899983 -5.35048254079664 A:C:G C G 10 0.534900859799965 0.30639109768747 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120054_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58119448_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120054_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120054_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120054_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120054_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58119779_58120144:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58119941_58120142:ZWINT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 35 27 62 16.2784699070012 14.4423232145991 1.83614669240217 A:C C A 10 0.534900859799965 0.703192315015598 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 60146061 T/C 1 4 12 16 1.86039656080014 6.41881031759958 -4.55841375679944 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0249480887734303 ENSG00000108064:ENST00000487519:exon_60145980_60146098:TFAM;ENSG00000108064:ENST00000373899:exon_60145980_60146098:TFAM;ENSG00000108064:ENST00000373895:exon_60145980_60146098:TFAM;ENSG00000108064:ENST00000395377:exon_60145980_60146098:TFAM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 12 20 32 5.58118968240042 10.6980171959993 -5.11682751359888 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0774740406938111 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 A:T A T 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 13 5 18 6.04628882260045 2.67450429899983 3.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.155293602908341 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 94 93 187 43.7193191788033 49.7457799613967 -6.02646078259346 A:G G A 10 0.534900859799965 0.380105404344263 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 8 14 22 3.72079312160028 7.48861203719951 -3.76781891559923 A:G G A 10 0.534900859799965 0.134580831565991 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 37 28 65 17.2086681874013 14.977224074399 2.23144411300227 A:G G A 10 0.534900859799965 0.620251686075688 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 63 51 114 29.3012458326022 27.2799438497982 2.02130198280398 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.778346991581995 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 75523634 A/G 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G A G 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75523614_75523741:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75523614_75523741:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75523614_75523741:SEC24C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 81917486 T/C 1 121 123 244 56.2769959642042 65.7928057553957 -9.51580979119147 T:C T C 10 0.534900859799965 0.223470004685349 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000447489:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81917397_81917519:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000475974:exon_81917283_81917519:ANXA11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 95 65 160 44.1844183190033 34.7685558869977 9.41586243200559 A:G G A 10 0.534900859799965 0.153543249422894 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 90771829 T/C 1 12 9 21 5.58118968240042 4.81410773819969 0.767081944200734 T:C T C 10 0.534900859799965 0.82864894485234 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90771756_90771838:FAS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91099593 A/G 1 173 164 337 80.462151254606 87.7237410071943 -7.26158975258822 A:G A G 10 0.534900859799965 0.444738095919818 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:C A C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91484779 A/C 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 A:C A C 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 A:G G A 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 24 26 50 11.1623793648008 13.9074223547991 -2.74504298999825 A:T T A 10 0.534900859799965 0.479687248825698 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 29 35 64 13.487875065801 18.7215300929988 -5.23365502719776 T:C T C 10 0.534900859799965 0.210731926858993 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 15 23 38 6.97648710300052 12.3027197753992 -5.32623267239867 A:G A G 10 0.534900859799965 0.103169118886248 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 28 30 58 13.022775925601 16.047025793999 -3.02424986839797 A:G A G 10 0.534900859799965 0.433092630004028 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 10 13 23 4.65099140200035 6.95371117739955 -2.3027197753992 A:G A G 10 0.534900859799965 0.404844022079815 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 13 15 28 6.04628882260045 8.02351289699948 -1.97722407439902 C:G G C 10 0.534900859799965 0.456976890177759 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 23 11 34 10.6972802246008 5.88390945779962 4.81337076680119 C:G G C 10 0.534900859799965 0.121344601860524 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 20 9 29 9.3019828040007 4.81410773819969 4.48787506580101 A:G A G 10 0.534900859799965 0.135060038333198 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 17 12 29 7.90668538340059 6.41881031759958 1.48787506580101 T:C C T 10 0.534900859799965 0.710420465234456 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 96098373 C/T 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 172 168 340 79.997052114406 89.8633444463941 -9.86629233198811 T:C T C 10 0.534900859799965 0.301657445836486 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 97983635 C/A 1 19 12 31 8.83688366380066 6.41881031759958 2.41807334620108 A:C C A 10 0.534900859799965 0.472372820295735 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97983582_97983745:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97983582_97983745:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97983582_97983745:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97983582_97983745:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97983582_97983745:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_97983582_97983745:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000472763:exon_97983582_97983745:BLNK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 26 29 55 12.0925776452009 15.512124934199 -3.41954728899808 T:C C T 10 0.534900859799965 0.417647003585078 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 99125950 G/A 1 21 13 34 9.76708194420073 6.95371117739955 2.81337076680119 A:G G A 10 0.534900859799965 0.391607254494109 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 18 24 42 8.37178452360063 12.8376206351992 -4.46583611159853 A:G G A 10 0.534900859799965 0.215442657379282 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G G A 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C C T 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 T:C T C 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 C:G G C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 101473147 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101471601_101473236:COX15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 101486759 C/T 1 5 10 15 2.32549570100017 5.34900859799965 -3.02351289699948 T:C C T 10 0.534900859799965 0.128614383413173 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000016171:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000485884:exon_101486725_101486911:COX15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 102763761 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102763264_102763972:LZTS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103340056 G/A 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000166171:ENST00000470165:exon_103339817_103340065:DPCD;ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 6 10 16 2.79059484120021 5.34900859799965 -2.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.219183186864788 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103361088 C/T 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:C C T 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000434727:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103360960_103361093:DPCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103825929 T/G 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 T:G T G 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103825969 G/A 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 33 21 54 15.3482716266012 11.2329180557993 4.11535357080189 T:C T C 10 0.534900859799965 0.277924814690587 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 104140355 C/T 1 14 12 26 6.51138796280049 6.41881031759958 0.0925776452009082 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 104158628 G/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C:G G T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000077150:ENST00000423524:exon_104158496_104158716:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000467116:exon_104158496_104158975:NFKB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 11 11 22 5.11609054220038 5.88390945779962 -0.76781891559923 C:G C G 10 0.534900859799965 0.83196431766879 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 7 13 20 3.25569398140024 6.95371117739955 -3.6980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.117620093143275 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 31 32 63 14.4180733462011 17.1168275135989 -2.6987541673978 A:C A C 10 0.534900859799965 0.529011561329757 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 13 6 19 6.04628882260045 3.20940515879979 2.83688366380066 T:C T C 10 0.534900859799965 0.251289611662878 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 9 19 28 4.18589226180031 10.1631163361993 -5.97722407439902 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0352366362886478 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 95 90 185 44.1844183190033 48.1410773819969 -3.95665906299353 A:G G A 10 0.534900859799965 0.606035848395135 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 112058426 T/C 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000119953:ENST00000369603:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000369592:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000460483:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000471297:exon_112058406_112058568:SMNDC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 120801683 G/C 1 155 134 289 72.0903667310054 71.6767152131953 0.413651517810095 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120801506_120802284:EIF3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 120801908 T/A 1 118 84 202 54.8816985436041 44.9316722231971 9.95002632040706 A:T T A 10 0.534900859799965 0.180082387506170 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120801506_120802284:EIF3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 11 11 22 5.11609054220038 5.88390945779962 -0.76781891559923 A:G A G 10 0.534900859799965 0.83196431766879 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 120914628 C/T 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000183605:ENST00000490417:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000484960:exon_120914574_120914635:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000330036:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000466218:exon_120914574_120914689:SFXN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G G A 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 129902910 T/C 1 28 45 73 13.022775925601 24.0705386909984 -11.0477627653974 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00986132379489056 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 129903630 G/A 1 37 26 63 17.2086681874013 13.9074223547991 3.3012458326022 A:G G A 10 0.534900859799965 0.449583720650656 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 18 3 21 8.37178452360063 1.6047025793999 6.76708194420073 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00340488291276302 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 18 3 21 8.37178452360063 1.6047025793999 6.76708194420073 C:G C G 10 0.534900859799965 0.00340488291276302 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 16 2 18 7.44158624320056 1.06980171959993 6.37178452360063 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00322016530413163 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 T:G G T 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G A G 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 83 97 180 38.6032286366029 51.8853834005966 -13.2821547639937 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0518860899545591 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 52 61 113 24.1851552904018 32.6289524477979 -8.44379715739605 T:C C T 10 0.534900859799965 0.130986727100728 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 11 5 16 5.11609054220038 2.67450429899983 2.44158624320056 C:G C G 10 0.534900859799965 0.316685870393005 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 5 9 14 2.32549570100017 4.81410773819969 -2.48861203719951 C:G C G 10 0.534900859799965 0.193838689413672 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 864505 G/A 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000214063:ENST00000397397:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397411:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000399778:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397396:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000421676:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397408:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525334:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397406:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409543:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525201:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397404:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000524895:exon_864437_864653:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000532375:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000346501:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000464987:exon_864437_865825:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409531:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000527644:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000468468:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000529566:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000494815:exon_863272_864511:TSPAN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 27 36 63 12.5576767854009 19.2564309527987 -6.6987541673978 A:G G A 10 0.534900859799965 0.100810448689700 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 212 207 419 98.6010177224074 110.724477978593 -12.1234602561854 A:G G A 10 0.534900859799965 0.240108002775058 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 12 19 31 5.58118968240042 10.1631163361993 -4.58192665379892 A:C C A 10 0.534900859799965 0.107495259980908 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 101 84 185 46.9750131602035 44.9316722231971 2.04334093700647 A:G A G 10 0.534900859799965 0.768820331571151 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 27 22 49 12.5576767854009 11.7678189155992 0.789857869801713 T:C C T 10 0.534900859799965 0.886591801539746 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 28 46 74 13.022775925601 24.6054395507984 -11.5826636251974 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00728946063781627 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 31 36 67 14.4180733462011 19.2564309527987 -4.83835760659766 A:G G A 10 0.534900859799965 0.27052084617433 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 48 48 96 22.3247587296017 25.6752412703983 -3.35048254079665 A:C:G G C 10 0.534900859799965 0.539638064929369 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:T A T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 28 40 68 13.022775925601 21.3960343919986 -8.37325846639762 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0510857626355736 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 43 53 96 19.9992630286015 28.3497455693981 -8.35048254079664 A:G G A 10 0.534900859799965 0.101278135473391 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:T A T 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 A:T T A 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 8009241 C/T 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 T:C C T 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 19 29 48 8.83688366380066 15.512124934199 -6.67524127039832 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0600091788286878 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 10 15 25 4.65099140200035 8.02351289699948 -3.37252149499913 A:G A G 10 0.534900859799965 0.228777017331708 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 37 54 91 17.2086681874013 28.8846464291981 -11.6759782417968 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0154774794671383 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 11348669 G/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11348633_11348728:GALNTL4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 16 18 34 7.44158624320056 9.62821547639937 -2.18662923319881 C:G C G 10 0.534900859799965 0.494266102270786 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 18422487 C/A 1 120 154 274 55.8118968240042 82.3747324091946 -26.5628355851904 A:C C A 10 0.534900859799965 0.00158958128422924 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18422384_18422517:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000460405:exon_18422384_18422557:LDHA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 32 18 50 14.8831724864011 9.62821547639937 5.25495701000175 T:G T G 10 0.534900859799965 0.156683347870638 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 30 33 63 13.952974206001 17.6517283733988 -3.6987541673978 T:C T C 10 0.534900859799965 0.377940198627745 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 33054856 C/T 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C C T 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000121690:ENST00000241051:exon_33054808_33055128:DEPDC7;ENSG00000121690:ENST00000311388:exon_33054808_33055128:DEPDC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 33083263 G/A 1 11 2 13 5.11609054220038 1.06980171959993 4.04628882260045 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0265929077015328 ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33083076_33083272:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33083076_33083272:TCP11L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 15 13 28 6.97648710300052 6.95371117739955 0.0227759256009783 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 34904351 A/G 1 10 42 52 4.65099140200035 22.4658361115985 -17.8148447095982 A:G A G 10 0.534900859799965 4.8711978574005e-07 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34904136_34904363:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34903842_34904363:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34903845_34904363:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34903845_34904363:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34903917_34904363:APIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 13 12 25 6.04628882260045 6.41881031759958 -0.372521494999127 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 2 8 10 0.93019828040007 4.27920687839972 -3.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0527029702370021 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 34969112 A/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 57 39 96 26.510650991402 20.8611335321986 5.64951745920336 T:C C T 10 0.534900859799965 0.261663607103635 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 A:G A G 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 13 25 38 6.04628882260045 13.3725214949991 -7.32623267239867 A:C:G A G 10 0.534900859799965 0.0218131461565306 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 47256343 G/A 1 27 30 57 12.5576767854009 16.047025793999 -3.48934900859801 A:G G A 10 0.534900859799965 0.356730540368800 ENSG00000134574:ENST00000378603:exon_47256308_47256485:DDB2;ENSG00000134574:ENST00000256996:exon_47256308_47256485:DDB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 T:C T C 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 81 63 144 37.6730303562028 33.6987541673978 3.97427618880504 A:G G A 10 0.534900859799965 0.558874383880498 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 19 24 43 8.83688366380066 12.8376206351992 -4.0007369713985 T:C T C 10 0.534900859799965 0.225888829508330 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 T:C:G G C 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 13 6 19 6.04628882260045 3.20940515879979 2.83688366380066 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.251289611662878 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 T:G G T 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 522 275 797 242.781751184418 147.09773644499 95.6840147394279 C:G G C 10 0.534900859799965 7.42354264099306e-12 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C T C 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62439510 C/T 1 82 29 111 38.1381294964029 15.512124934199 22.6260045622039 T:C C T 10 0.534900859799965 1.43556215150428e-05 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 55 49 104 25.5804527110019 26.2101421301983 -0.629689419196367 T:C T C 10 0.534900859799965 0.921925614883358 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 25 39 64 11.6274785050009 20.8611335321986 -9.23365502719776 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0237127327079232 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 31 36 67 14.4180733462011 19.2564309527987 -4.83835760659766 T:C C T 10 0.534900859799965 0.27052084617433 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 15 10 25 6.97648710300052 5.34900859799965 1.62747850500087 A:C C A 10 0.534900859799965 0.553545164136958 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 77 68 145 35.8126337954027 36.3732584663976 -0.560624670994933 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.933840474199483 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 85 75 160 39.533426917003 40.1175644849974 -0.584137567994411 T:C C T 10 0.534900859799965 0.936980116215285 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 102 131 233 47.4401123004036 70.0720126337954 -22.6319003333919 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00308944290878689 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 63991581 G/A 1 32 28 60 14.8831724864011 14.977224074399 -0.0940515879979031 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991572_63991682:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991572_63991682:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991572_63991685:TRPT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 31 48 79 14.4180733462011 25.6752412703983 -11.2571679241972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0127707365305359 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 64009879 G/A 1 70 73 143 32.5569398140024 39.0477627653975 -6.490822951395 A:G G A 10 0.534900859799965 0.277360857374045 ENSG00000173486:ENST00000309366:exon_64009856_64010030:FKBP2;ENSG00000173486:ENST00000449942:exon_64009856_64010030:FKBP2;ENSG00000173486:ENST00000394540:exon_64009856_64010030:FKBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 A:G G A 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 69 64 133 32.0918406738024 34.2336550271978 -2.14181435339535 T:C T C 10 0.534900859799965 0.728627098509455 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 64880835 A/G 1 11 4 15 5.11609054220038 2.13960343919986 2.97648710300052 A:G A G 10 0.534900859799965 0.194126412933295 ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524986:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64880283_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529414:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530892:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64880692_64880886:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527851:exon_64880211_64881066:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534667:exon_64880686_64880886:TM7SF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 T:C C T 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 13 13 26 6.04628882260045 6.95371117739955 -0.907422354799092 T:C C T 10 0.534900859799965 0.844673236061777 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 T:G T G 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 A:G G A 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 997 1175 2172 463.703842779435 628.508510264959 -164.804667485524 A:T:G G A 10 0.534900859799965 1.57074814841649e-12 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 T:C C T 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 A:G G A 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 9 14 23 4.18589226180031 7.48861203719951 -3.3027197753992 T:G G T 10 0.534900859799965 0.210161332529243 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65685225 T/C 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 T:C T C 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 17 24 41 7.90668538340059 12.8376206351992 -4.93093525179857 A:G G A 10 0.534900859799965 0.158056441916375 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 41 37 78 19.0690647482014 19.7913318125987 -0.722267064397272 T:C C T 10 0.534900859799965 0.909860523658387 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 45 48 93 20.9294613090016 25.6752412703983 -4.74577996139675 C:G G C 10 0.534900859799965 0.350107130905604 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67068859 T/C 1 15 8 23 6.97648710300052 4.27920687839972 2.6972802246008 T:C T C 10 0.534900859799965 0.300305581932208 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 1 9 10 0.465099140200035 4.81410773819969 -4.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 0.007838459953554 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 2 8 10 0.93019828040007 4.27920687839972 -3.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0527029702370021 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67196049 G/A 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67200812 C/T 1 20 2 22 9.3019828040007 1.06980171959993 8.23218108440077 T:C C T 10 0.534900859799965 0.000334690613175859 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 17 2 19 7.90668538340059 1.06980171959993 6.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00184021182425772 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 61 80 141 28.3710475522021 42.7920687839972 -14.4210212317951 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0177914961868183 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67395456 A/T 1 13 31 44 6.04628882260045 16.5819266537989 -10.5356378311985 A:T A T 10 0.534900859799965 0.00211936753686241 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67395624 T/C 1 24 19 43 11.1623793648008 10.1631163361993 0.999263028601503 T:C T C 10 0.534900859799965 0.87873815653071 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67766704 G/A 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000110057:ENST00000530331:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000227471:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000525743:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000533424:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000524455:exon_67766643_67766845:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528423:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528096:exon_67766646_67767150:UNC93B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 67770499 G/T 1 11 3 14 5.11609054220038 1.6047025793999 3.51138796280049 T:G G T 10 0.534900859799965 0.0657480420080034 ENSG00000110057:ENST00000530331:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000227471:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000525743:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000533424:exon_67770492_67771268:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000524455:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528423:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528096:exon_67770492_67770939:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000530138:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000531152:exon_67770492_67770645:UNC93B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 13 17 30 6.04628882260045 9.09331461659941 -3.04702579399895 T:C C T 10 0.534900859799965 0.277837924956057 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 12 6 18 5.58118968240042 3.20940515879979 2.37178452360063 A:C C A 10 0.534900859799965 0.346220682106825 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 A:G A G 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 A:G A G 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 T:C T C 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 71821156 G/A 1 74 68 142 34.4173363748026 36.3732584663976 -1.95592209159503 A:G G A 10 0.534900859799965 0.800861453643674 ENSG00000184154:ENST00000427369:exon_71819651_71821825:LRTOMT;ENSG00000184154:ENST00000435085:exon_71819651_71821825:LRTOMT;ENSG00000184154:ENST00000419228:exon_71819651_71821828:LRTOMT;ENSG00000184154:ENST00000307198:exon_71819651_71821828:LRTOMT;ENSG00000110200:ENST00000227618:exon_71821134_71821271:C11orf51 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 72397201 G/A 1 23 25 48 10.6972802246008 13.3725214949991 -2.67524127039832 A:G G A 10 0.534900859799965 0.471384231206333 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72397087_72397236:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72397087_72397236:ARAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 16 16 32 7.44158624320056 8.55841375679944 -1.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.725631682516676 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 55 42 97 25.5804527110019 22.4658361115985 3.11461659940339 A:G G A 10 0.534900859799965 0.543056854093138 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 3 9 12 1.3952974206001 4.81410773819969 -3.41881031759958 A:T:C T C 10 0.534900859799965 0.0783985199572599 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 186 183 369 86.5084400772065 97.8868573433936 -11.3784172661871 A:G A G 10 0.534900859799965 0.250928344826065 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 77790653 T/C 1 174 51 225 80.9272503948061 27.2799438497982 53.6473065450079 T:C T C 10 0.534900859799965 1.79077621739751e-13 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 169 48 217 78.6017546938059 25.6752412703983 52.9265134234076 C:G G C 10 0.534900859799965 1.11089339019892e-13 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:C T C 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 24 29 53 11.1623793648008 15.512124934199 -4.34974556939815 T:C C T 10 0.534900859799965 0.270788496067714 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:C A C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 T:C C T 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 88045583 A/G 1 30 42 72 13.952974206001 22.4658361115985 -8.51286190559748 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0453372075474444 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000527018:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533865:exon_88045556_88045722:CTSC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 C:G C G 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 C:G G C 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 93913392 G/T 1 13 6 19 6.04628882260045 3.20940515879979 2.83688366380066 T:G G T 10 0.534900859799965 0.251289611662878 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 23 33 56 10.6972802246008 17.6517283733988 -6.95444814879804 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0806871288932784 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 107299631 G/A 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 108032707 G/T 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:G G T 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530859:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000527296:exon_108031911_108032762:NPAT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 111746041 A/G 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111744780_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111745483_111746828:AP001781.3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 111746231 G/A 1 5 12 17 2.32549570100017 6.41881031759958 -4.09331461659941 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0533893992537193 ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111744780_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111745483_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111746066_111746828:AP001781.3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 111753246 G/A 1 29 30 59 13.487875065801 16.047025793999 -2.55915072819794 A:G G A 10 0.534900859799965 0.516789855378184 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530799:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111753092_111753322:C11orf1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 111896251 G/C 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 111957665 G/A 1 2 8 10 0.93019828040007 4.27920687839972 -3.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0527029702370021 ENSG00000204370:ENST00000375549:exon_111957497_111957683:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528182:exon_111957596_111957683:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528048:exon_111957597_111957683:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528021:exon_111957597_111957683:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000526592:exon_111957623_111957683:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000525291:exon_111957623_111957683:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000530923:exon_111957642_111957683:SDHD;ENSG00000255292:ENST00000531744:exon_111957627_111957683:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000532699:exon_111957627_111957683:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000525987:exon_111957627_111957683:AP002884.2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 111959625 C/T 1 2 9 11 0.93019828040007 4.81410773819969 -3.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0298686862719098 ENSG00000204370:ENST00000375549:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528182:exon_111959591_111959728:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528021:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000526592:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000525291:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000530923:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000534010:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000255292:ENST00000531744:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000532699:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000525987:exon_111959591_111959735:AP002884.2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 116655600 G/A 1 25 13 38 11.6274785050009 6.95371117739955 4.67376732760133 A:G G A 10 0.534900859799965 0.144714127243011 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 83 36 119 38.6032286366029 19.2564309527987 19.3467976838042 A:G G A 10 0.534900859799965 0.000430808551277079 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 7 10 17 3.25569398140024 5.34900859799965 -2.09331461659941 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.339225682542055 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 T:C C T 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 T:C C T 10 0.534900859799965 1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 36 38 74 16.7435690472013 20.3262326723987 -3.58266362519741 A:G A G 10 0.534900859799965 0.416747744778855 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 11 10 21 5.11609054220038 5.34900859799965 -0.232918055799265 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 24 21 45 11.1623793648008 11.2329180557993 -0.0705386909984274 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 1163 1296 2459 540.910300052641 693.231514300755 -152.321214248114 A:T:C:G A G 10 0.534900859799965 8.63074618268317e-10 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 536 556 1092 249.293139147219 297.404878048781 -48.1117389015618 T:C:G T G 10 0.534900859799965 0.00358233267458183 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 A:T T A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G A G 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 A:G G A 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 126176578 G/A 1 32 41 73 14.8831724864011 21.9309352517986 -7.04776276539745 A:G G A 10 0.534900859799965 0.101691882158946 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126176465_126176639:DCPS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 38 35 73 17.6737673276013 18.7215300929988 -1.04776276539745 T:C T C 10 0.534900859799965 0.81553790724359 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 T:C T C 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 9 25 34 4.18589226180031 13.3725214949991 -9.18662923319881 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00171732057376153 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 29 29 58 13.487875065801 15.512124934199 -2.02424986839797 A:G G A 10 0.534900859799965 0.601380015685726 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 A:G G A 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 45 71 116 20.9294613090016 37.9779610457975 -17.0484997367959 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00199678178248967 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 150 116 266 69.7648710300052 62.0484997367959 7.71637129320929 T:G G T 10 0.534900859799965 0.356916534326248 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 T:C C T 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 8 10 18 3.72079312160028 5.34900859799965 -1.62821547639937 T:C C T 10 0.534900859799965 0.485119707477505 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 10 1 11 4.65099140200035 0.534900859799965 4.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0138429086747576 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 15 4 19 6.97648710300052 2.13960343919986 4.83688366380066 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0360036175798526 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 60 61 121 27.9059484120021 32.6289524477979 -4.72300403579577 T:C T C 10 0.534900859799965 0.412697058354841 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 49 47 96 22.7898578698017 25.1403404105984 -2.35048254079664 A:G A G 10 0.534900859799965 0.682659025297898 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4604 3313 7917 2141.31644148096 1772.12654851728 369.189892963677 A:T:C:G T C 10 0.534900859799965 7.9621942338779e-17 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4407 3386 7793 2049.69191086155 1811.17431128268 238.517599578872 A:T:C:G T C 10 0.534900859799965 6.02001910354153e-08 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6666496 C/T 1 72 78 150 33.4871380944025 41.7222670643973 -8.23512896999475 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.190524865011777 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6666261_6666808:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6666037_6666808:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6666037_6666808:NOP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6672570 G/A 1 22 34 56 10.2321810844008 18.1866292331988 -7.95444814879804 A:G G A 10 0.534900859799965 0.043540366006297 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6672481_6672678:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6672481_6672678:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6672481_6672680:NOP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 6672928 C/G 1 23 23 46 10.6972802246008 12.3027197753992 -1.60543955079839 C:G C G 10 0.534900859799965 0.659746286966469 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6672778_6672937:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6672778_6672937:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6672780_6672937:NOP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 A:G A G 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 7188562 G/T 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 T:G G T 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7187836_7188605:C1R;ENSG00000159403:ENST00000458061:exon_7187845_7188605:C1R HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 51 0 51 23.7200561502018 0 23.7200561502018 G G 10 0.534900859799965 1.45269787490980e-14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 57 61 118 26.510650991402 32.6289524477979 -6.11830145639587 T:C C T 10 0.534900859799965 0.269104319442230 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 9875218 A/C 1 171 44 215 79.531952974206 23.5356378311985 55.9963151430075 A:C A C 10 0.534900859799965 2.46019561678975e-15 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9875094_9875409:CLECL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 8 19 27 3.72079312160028 10.1631163361993 -6.44232321459906 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0189104044957662 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 50 52 102 23.2549570100017 27.8148447095982 -4.55988769959644 A:G G A 10 0.534900859799965 0.373376991479608 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 14 5 19 6.51138796280049 2.67450429899983 3.83688366380066 T:G T G 10 0.534900859799965 0.106012177678070 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 39 27 66 18.1388664678014 14.4423232145991 3.69654325320231 C:G C G 10 0.534900859799965 0.389443344374920 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 587 627 1214 273.013195297421 335.382839094578 -62.3696437971576 T:C:G C G 10 0.534900859799965 0.000356819829692218 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 18 17 35 8.37178452360063 9.09331461659941 -0.721530092998776 T:G T G 10 0.534900859799965 0.866205074046346 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 32 32 64 14.8831724864011 17.1168275135989 -2.23365502719776 A:G A G 10 0.534900859799965 0.61716015931473 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 16 24 40 7.44158624320056 12.8376206351992 -5.3960343919986 T:C C T 10 0.534900859799965 0.111984682548582 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 27 30 57 12.5576767854009 16.047025793999 -3.48934900859801 T:C:G G C 10 0.534900859799965 0.356730540368800 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 20 25 45 9.3019828040007 13.3725214949991 -4.07053869099843 T:C C T 10 0.534900859799965 0.235037337430852 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 8 18 26 3.72079312160028 9.62821547639937 -5.90742235479909 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0287037084845106 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 31944985 T/G 0 12 0 12 5.58118968240042 0 5.58118968240042 T T 10 0.534900859799965 0.000651088133365378 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 C:G C G 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 32138410 A/G 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G A G 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 17 25 42 7.90668538340059 13.3725214949991 -5.46583611159853 A:G A G 10 0.534900859799965 0.120873681108922 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 42835237 C/T 1 41 58 99 19.0690647482014 31.024249868398 -11.9551851201965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0200326006151527 ENSG00000134283:ENST00000395580:exon_42835117_42835759:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000449194:exon_42835117_42835759:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000317560:exon_42835117_42835328:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000358314:exon_42835117_42835328:PPHLN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 14 6 20 6.51138796280049 3.20940515879979 3.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 0.179206254010548 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 22 29 51 10.2321810844008 15.512124934199 -5.27994384979822 A:G A G 10 0.534900859799965 0.160447827414236 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 63 68 131 29.3012458326022 36.3732584663976 -7.07201263379542 T:C T C 10 0.534900859799965 0.221171473492446 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 57108461 T/C 1 398 450 848 185.109457799614 240.705386909984 -55.5959291103703 T:C T C 10 0.534900859799965 0.000149644534800944 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108386_57108471:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108386_57108471:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108386_57108471:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108386_57108471:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108386_57108471:NACA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 13 12 25 6.04628882260045 6.41881031759958 -0.372521494999127 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 69783937 T/C 1 14 20 34 6.51138796280049 10.6980171959993 -4.18662923319881 T:C T C 10 0.534900859799965 0.170364060644317 ENSG00000127337:ENST00000247843:exon_69783927_69784575:YEATS4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 A:G A G 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 142 136 278 66.044077908405 72.7465169327952 -6.70243902439029 A:G G A 10 0.534900859799965 0.434745429973998 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 82752037 T/G 1 27 27 54 12.5576767854009 14.4423232145991 -1.88464642919811 T:G T G 10 0.534900859799965 0.682822015195959 ENSG00000133773:ENST00000256151:exon_82752002_82752199:CCDC59 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 39 35 74 18.1388664678014 18.7215300929988 -0.582663625197412 A:G G A 10 0.534900859799965 0.907695925070204 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 99020125 T/C 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C T C 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000166130:ENST00000299157:exon_99018036_99020544:IKBIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 100732327 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100732306_100733912:SCYL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 108956433 C/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000431221:exon_108956382_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108956382_108956512:ISCU HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 27 21 48 12.5576767854009 11.2329180557993 1.32475872960168 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7730471420036 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 144 120 264 66.974276188805 64.1881031759958 2.78617301280923 A:G G A 10 0.534900859799965 0.757891526554124 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 118480721 T/C 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 T:C T C 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118480646_118480777:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118480646_118480777:WSB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 118582477 C/T 1 101 88 189 46.9750131602035 47.0712756623969 -0.0962625021933903 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000089220:ENST00000261313:exon_118582391_118583387:PEBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 120575407 T/C 1 14 12 26 6.51138796280049 6.41881031759958 0.0925776452009082 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575349_120575618:GCN1L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 14 4 18 6.51138796280049 2.13960343919986 4.37178452360063 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0560208187923533 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 120960057 C/T 1 10 15 25 4.65099140200035 8.02351289699948 -3.37252149499913 T:C C T 10 0.534900859799965 0.228777017331708 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120960017_120960166:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120960017_120960166:COQ5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 17 20 37 7.90668538340059 10.6980171959993 -2.79133181259871 A:G G A 10 0.534900859799965 0.411118319166261 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 18 26 44 8.37178452360063 13.9074223547991 -5.53563783119846 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0985728263478808 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 123003416 C/T 1 28 33 61 13.022775925601 17.6517283733988 -4.62895244779787 T:C C T 10 0.534900859799965 0.249730085859679 ENSG00000111011:ENST00000331738:exon_123003386_123003576:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000354654:exon_123003386_123003598:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000344591:exon_123003386_123003598:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000392442:exon_123003386_123003598:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000532695:exon_123003386_123003576:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000433877:exon_123003386_123003576:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527173:exon_123003386_123003576:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000418773:exon_123003386_123003576:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000525335:exon_123003386_123003498:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000528263:exon_123003386_123003575:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000532910:exon_123003386_123004034:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000526560:exon_123003386_123003576:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527461:exon_123003387_123003598:RSRC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 123738494 C/T 1 41 49 90 19.0690647482014 26.2101421301983 -7.14107738199685 T:C C T 10 0.534900859799965 0.139686591258067 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 123794104 G/T 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 T:G G T 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123794036_123794130:SBNO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 123799938 C/T 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 T:C C T 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 16 19 35 7.44158624320056 10.1631163361993 -2.72153009299878 A:G G A 10 0.534900859799965 0.398903928691939 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 31 34 65 14.4180733462011 18.1866292331988 -3.76855588699773 A:G A G 10 0.534900859799965 0.384862648366459 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 124421844 C/T 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124420983_124422377:CCDC92 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 A:G A G 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 125348216 C/G 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 C:G C G 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125348141_125348393:SCARB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 132237750 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132237668_132237908:SFSWAP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 132250712 G/C 1 21 22 43 9.76708194420073 11.7678189155992 -2.0007369713985 C:G G C 10 0.534900859799965 0.545460475519101 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132250663_132250853:SFSWAP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 11 10 21 5.11609054220038 5.34900859799965 -0.232918055799265 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 15 11 26 6.97648710300052 5.88390945779962 1.09257764520091 T:C C T 10 0.534900859799965 0.699226755009291 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 55 0 55 25.5804527110019 0 25.5804527110019 A A 10 0.534900859799965 2.18745694563764e-15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 119 4 123 55.3467976838042 2.13960343919986 53.2071942446043 T:C:G T C 10 0.534900859799965 2.67664964945934e-27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 155 139 294 72.0903667310054 74.3512195121951 -2.26085278118973 T:C C T 10 0.534900859799965 0.815197255205192 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 A:G A G 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 26789231 C/T 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 114 110 224 53.021301982804 58.8390945779962 -5.81779259519217 C:G G C 10 0.534900859799965 0.461433298526976 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 28197246 A/G 1 108 121 229 50.2307071416038 64.7230040357958 -14.492296894192 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0633840795548331 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 90 65 155 41.8589226180031 34.7685558869977 7.09036673100542 T:C C T 10 0.534900859799965 0.260701192786392 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 49 58 107 22.7898578698017 31.024249868398 -8.23439199859626 C:G G C 10 0.534900859799965 0.121061070547205 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 72 79 151 33.4871380944025 42.2571679241972 -8.77002982979472 A:G G A 10 0.534900859799965 0.165541343810237 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 32972884 A/G 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 A:G G A 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 27 26 53 12.5576767854009 13.9074223547991 -1.34974556939815 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.783430471884864 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 44 45 89 20.4643621688015 24.0705386909984 -3.60617652219689 A:T A T 10 0.534900859799965 0.458522979062284 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 43462607 G/A 1 29 27 56 13.487875065801 14.4423232145991 -0.954448148798043 A:G G A 10 0.534900859799965 0.893592443840493 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 23 21 44 10.6972802246008 11.2329180557993 -0.535637831198461 A:G G A 10 0.534900859799965 0.881084382056806 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 46705068 C/A 1 103 80 183 47.9052114406036 42.7920687839972 5.1131426566064 A:C C A 10 0.534900859799965 0.459614753264784 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46704949_46705073:LCP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 37 68 105 17.2086681874013 36.3732584663976 -19.1645902789963 T:C C T 10 0.534900859799965 0.000183145352572861 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 48619942 G/A 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 A:G G A 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 53035665 T/A 1 11 1 12 5.11609054220038 0.534900859799965 4.58118968240042 A:T T A 10 0.534900859799965 0.00778954819080089 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53035193_53036061:CKAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 60240961 C/T 1 14 6 20 6.51138796280049 3.20940515879979 3.3019828040007 T:C C T 10 0.534900859799965 0.179206254010548 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60239717_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60239725_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60240718_60240980:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000470420:exon_60240875_60240980:DIAPH3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 73320856 A/G 1 19 8 27 8.83688366380066 4.27920687839972 4.55767678540094 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0851198739486655 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73320639_73321249:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73320639_73321249:C13orf34 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 26 23 49 12.0925776452009 12.3027197753992 -0.210142130198287 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 T:C C T 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 78327455 A/C 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 A:C A C 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000139737:ENST00000466548:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000389459:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000418532:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000488699:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000377229:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000267219:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000436634:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000314070:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000351546:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000441784:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000358679:exon_78327338_78327493:SLAIN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 99947273 T/C 1 69 60 129 32.0918406738024 32.0940515879979 -0.00221091419549424 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 A:G A G 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 10 15 25 4.65099140200035 8.02351289699948 -3.37252149499913 A:C C A 10 0.534900859799965 0.228777017331708 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 113851548 A/G 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113851333_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113851487_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113851486_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000475433:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000484641:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000480971:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000477095:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000491548:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000462853:exon_113851492_113851557:PCID2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 13 115064423 G/A 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 A:G G A 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000474056:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000493727:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115064315_115064475:UPF3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 20823052 G/A 1 7 18 25 3.25569398140024 9.62821547639937 -6.37252149499913 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0145952979229994 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 96 126 222 44.6495174592034 67.3975083347956 -22.7479908755922 T:G T G 10 0.534900859799965 0.00241233735260996 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 39 19 58 18.1388664678014 10.1631163361993 7.97575013160203 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0473815574810577 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 48 24 72 22.3247587296017 12.8376206351992 9.48713809440251 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0250750672422587 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.52967727693347 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23021039 G/A 1 80 80 160 37.2079312160028 42.7920687839972 -5.5841375679944 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.384304489088605 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 164 140 304 76.2762589928057 74.8861203719951 1.39013862081063 A:T T A 10 0.534900859799965 0.908491230655344 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 48 27 75 22.3247587296017 14.4423232145991 7.88243551500262 T:G G T 10 0.534900859799965 0.081927660899187 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23299286 T/C 1 62 46 108 28.8361466924022 24.6054395507984 4.23070714160378 T:C T C 10 0.534900859799965 0.441191919632541 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23396756 G/A 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G G A 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000100462:ENST00000324366:exon_23396735_23396869:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397441:exon_23396735_23396869:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000216350:exon_23396735_23396823:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000421938:exon_23396735_23396823:PRMT5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23397409 G/A 1 13 18 31 6.04628882260045 9.62821547639937 -3.58192665379892 A:G G A 10 0.534900859799965 0.211583424851522 ENSG00000100462:ENST00000324366:exon_23397335_23397420:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397441:exon_23397335_23397420:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397440:exon_23397335_23397420:PRMT5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23549285 G/A 1 12 9 21 5.58118968240042 4.81410773819969 0.767081944200734 A:G G A 10 0.534900859799965 0.82864894485234 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23549383 G/T 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 T:G G T 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 T:C T C 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 1 10 11 0.465099140200035 5.34900859799965 -4.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0040328595620032 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 23947234 G/A 1 32 30 62 14.8831724864011 16.047025793999 -1.16385330759783 A:G G A 10 0.534900859799965 0.79983658792305 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23947216_23947402:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23947216_23947402:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23946712_23947402:NGDN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24422995 T/G 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 T:G T G 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24423007 G/A 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 3 9 12 1.3952974206001 4.81410773819969 -3.41881031759958 A:T A T 10 0.534900859799965 0.0783985199572599 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 512 508 1020 238.130759782418 271.729636778382 -33.5988769959644 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0354787307131947 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 37 29 66 17.2086681874013 15.512124934199 1.69654325320231 T:C C T 10 0.534900859799965 0.712494571887129 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 9 18 27 4.18589226180031 9.62821547639937 -5.44232321459906 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0517061743965445 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 9 12 21 4.18589226180031 6.41881031759958 -2.23291805579927 A:G G A 10 0.534900859799965 0.38467997649197 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 6 14 20 2.79059484120021 7.48861203719951 -4.6980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0430057939974577 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24707479 G/A 1 39 28 67 18.1388664678014 14.977224074399 3.16164239340234 A:G G A 10 0.534900859799965 0.464509083652054 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24707452_24707611:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24707452_24707611:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24707452_24707611:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24707452_24707611:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24707452_24707984:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24707452_24707611:GMPR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 6 11 17 2.79059484120021 5.88390945779962 -3.09331461659941 T:C C T 10 0.534900859799965 0.149930482845447 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24773387 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24776721 C/T 1 19 18 37 8.83688366380066 9.62821547639937 -0.791331812598706 T:C C T 10 0.534900859799965 0.86959814062322 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24774144_24778330:C14orf21;ENSG00000136305:ENST00000258807:exon_24776577_24776721:CIDEB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G G A 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 30 36 66 13.952974206001 19.2564309527987 -5.30345674679769 T:C C T 10 0.534900859799965 0.217370993236072 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 23 37 60 10.6972802246008 19.7913318125987 -9.0940515879979 A:T:C T C 10 0.534900859799965 0.0198471108304267 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 22 23 45 10.2321810844008 12.3027197753992 -2.07053869099843 C:G C G 10 0.534900859799965 0.553280034626785 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24909629 C/A 1 26 17 43 12.0925776452009 9.09331461659941 2.9992630286015 A:C C A 10 0.534900859799965 0.44505042423285 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 16 10 26 7.44158624320056 5.34900859799965 2.09257764520091 T:C C T 10 0.534900859799965 0.438883119655303 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 13 2 15 6.04628882260045 1.06980171959993 4.97648710300052 T:G T G 10 0.534900859799965 0.00946435315878301 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 13 2 15 6.04628882260045 1.06980171959993 4.97648710300052 A:T T A 10 0.534900859799965 0.00946435315878301 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 10 2 12 4.65099140200035 1.06980171959993 3.58118968240042 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0441097110945409 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 15 4 19 6.97648710300052 2.13960343919986 4.83688366380066 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0360036175798526 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 65 69 134 30.2314441130023 36.9081593261976 -6.67671521319532 C:G C G 10 0.534900859799965 0.260832788341342 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 35872926 G/A 1 64 49 113 29.7663449728022 26.2101421301983 3.55620284260395 A:G G A 10 0.534900859799965 0.511035097711583 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35872896_35873004:NFKBIA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 13 14 27 6.04628882260045 7.48861203719951 -1.44232321459906 C:G G C 10 0.534900859799965 0.700406252627522 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 13 17 30 6.04628882260045 9.09331461659941 -3.04702579399895 A:G G A 10 0.534900859799965 0.277837924956057 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 51206145 A/T 1 12 13 25 5.58118968240042 6.95371117739955 -1.37252149499913 A:T A T 10 0.534900859799965 0.689501648771211 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000480476:exon_51206090_51206205:NIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 14 14 28 6.51138796280049 7.48861203719951 -0.977224074399022 A:G A G 10 0.534900859799965 0.710193959056181 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 55529860 A/G 1 25 22 47 11.6274785050009 11.7678189155992 -0.140340410598357 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55529336_55530043:MAPK1IP1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 T:G G T 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 57938124 C/T 1 11 10 21 5.11609054220038 5.34900859799965 -0.232918055799265 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 62207557 C/T 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:C C T 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62207473_62207906:HIF1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 5 11 16 2.32549570100017 5.88390945779962 -3.55841375679944 T:C T C 10 0.534900859799965 0.083617752253552 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 56 41 97 26.045551851202 21.9309352517986 4.11461659940339 A:G A G 10 0.534900859799965 0.417264839040985 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 54 67 121 25.1153535708019 35.8383576065977 -10.7230040357958 A:C A C 10 0.534900859799965 0.0555259522605986 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 58 69 127 26.975750131602 36.9081593261976 -9.93240919459556 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0906304293907036 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91636395 C/T 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518871:exon_91636347_91636416:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521064:exon_91636347_91636466:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91636532 C/T 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 C C 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91666131 C/T 1 14 10 24 6.51138796280049 5.34900859799965 1.16237936480084 T:C C T 10 0.534900859799965 0.686624830629771 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91666248 T/C 1 23 12 35 10.6972802246008 6.41881031759958 4.27846990700122 T:C T C 10 0.534900859799965 0.175758517914167 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 13 5 18 6.04628882260045 2.67450429899983 3.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.155293602908341 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91691049 T/C 1 29 18 47 13.487875065801 9.62821547639937 3.85965958940164 T:C T C 10 0.534900859799965 0.306561447999631 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91691028_91691678:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91691028_91691678:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91691028_91691696:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91691028_91691703:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91691028_91691675:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91691028_91691699:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523576:exon_91691028_91691166:C14orf159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 91739108 C/G 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 93170661 T/A 1 121 105 226 56.2769959642042 56.1645902789963 0.112405685207904 A:T T A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170157_93170706:LGMN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 13 3 16 6.04628882260045 1.6047025793999 4.44158624320056 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0414820716963981 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 14 5 19 6.51138796280049 2.67450429899983 3.83688366380066 A:G G A 10 0.534900859799965 0.106012177678070 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:C T C 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 61 75 136 28.3710475522021 40.1175644849974 -11.7465169327952 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0478620894323531 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 43 38 81 19.9992630286015 20.3262326723987 -0.326969643797167 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 102508056 C/A 1 9 14 23 4.18589226180031 7.48861203719951 -3.3027197753992 A:C C A 10 0.534900859799965 0.210161332529243 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 102549983 C/T 1 240 274 514 111.623793648008 146.56283558519 -34.939041937182 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.0022517784292207 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102549883_102550030:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102549883_102550030:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102549883_102550030:HSP90AA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 326 285 611 151.622319705211 152.44674504299 -0.824425337778649 A:G G A 10 0.534900859799965 0.967657416436753 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 102695653 G/A 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000080823:ENST00000521249:exon_102695164_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000521766:exon_102695164_102695699:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000517966:exon_102695168_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000523485:exon_102695168_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000519569:exon_102695173_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000523231:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000524370:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522874:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000518686:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000361847:exon_102695178_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000392778:exon_102695178_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522867:exon_102695223_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000520266:exon_102695410_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000519058:exon_102695457_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000524214:exon_102695474_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000521937:exon_102695551_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522534:exon_102695604_102695994:RAGE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 102695693 T/C 1 3 12 15 1.3952974206001 6.41881031759958 -5.02351289699948 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0165990861450671 ENSG00000080823:ENST00000521249:exon_102695164_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000521766:exon_102695164_102695699:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000517966:exon_102695168_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000523485:exon_102695168_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000519569:exon_102695173_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000523231:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000524370:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522874:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000518686:exon_102695176_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000361847:exon_102695178_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000392778:exon_102695178_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522867:exon_102695223_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000520266:exon_102695410_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000519058:exon_102695457_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000524214:exon_102695474_102695703:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000521937:exon_102695551_102695994:RAGE;ENSG00000080823:ENST00000522534:exon_102695604_102695994:RAGE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 15 13 28 6.97648710300052 6.95371117739955 0.0227759256009783 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 10 14 24 4.65099140200035 7.48861203719951 -2.83762063519916 T:C C T 10 0.534900859799965 0.307000307671416 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 104029378 C/G 1 6 11 17 2.79059484120021 5.88390945779962 -3.09331461659941 C:G C G 10 0.534900859799965 0.149930482845447 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 75 64 139 34.8824355150026 34.2336550271978 0.648780487804856 T:C T C 10 0.534900859799965 0.932425160358709 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 5052 1023 6075 2349.68085629058 547.203579575364 1802.47727671521 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 106322261 C/T 1 1702 405 2107 791.598736620459 216.634848218986 574.963888401474 T:C C T 10 0.534900859799965 2.46225394286509e-151 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 106330067 C/G 0 81 0 81 37.6730303562028 0 37.6730303562028 C C 10 0.534900859799965 1.0291428550972e-22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 14 106330071 T/A,C 0 5 33 38 2.32549570100017 17.6517283733988 -15.3262326723987 T:C:G T C 10 0.534900859799965 2.94954609184430e-07 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 T:C C T 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 35830665 C/T 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000134146:ENST00000256538:exon_35830475_35830668:ATPBD4;ENSG00000134146:ENST00000440392:exon_35830475_35830668:ATPBD4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 21 13 34 9.76708194420073 6.95371117739955 2.81337076680119 A:T T A 10 0.534900859799965 0.391607254494109 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 T:C C T 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41106428 C/T 1 13 16 29 6.04628882260045 8.55841375679944 -2.51212493419899 T:C C T 10 0.534900859799965 0.359241351500948 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41106346_41106767:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41106346_41106767:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41106346_41106767:ZFYVE19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 23 11 34 10.6972802246008 5.88390945779962 4.81337076680119 A:G A G 10 0.534900859799965 0.121344601860524 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 23 11 34 10.6972802246008 5.88390945779962 4.81337076680119 A:C C A 10 0.534900859799965 0.121344601860524 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41672384 A/G 1 73 51 124 33.9522372346025 27.2799438497982 6.67229338480433 A:G A G 10 0.534900859799965 0.24268053378087 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450592:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41672291_41673245:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41672291_41673245:NUSAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41689166 C/A 1 20 6 26 9.3019828040007 3.20940515879979 6.09257764520091 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0178453666216582 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41689232 C/T 1 13 4 17 6.04628882260045 2.13960343919986 3.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0860716495303256 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 T:C C T 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C C T 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 T:G T G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 20 33 53 9.3019828040007 17.6517283733988 -8.34974556939815 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0267981132355133 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 27 43 70 12.5576767854009 23.0007369713985 -10.4430601859976 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0159631602626713 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 47 83 130 21.8596595894016 44.3967713633971 -22.5371117739955 T:C T C 10 0.534900859799965 9.45729418107526e-05 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 12 27 39 5.58118968240042 14.4423232145991 -8.86113353219864 A:C A C 10 0.534900859799965 0.00571531168691552 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 11 6 17 5.11609054220038 3.20940515879979 1.90668538340059 A:T T A 10 0.534900859799965 0.467712856324536 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 50782703 A/G 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 A:G A G 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50782460_50782722:USP8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 51000006 G/C 1 25 24 49 11.6274785050009 12.8376206351992 -1.21014213019829 C:G G C 10 0.534900859799965 0.775486116170348 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_50999506_51000071:AC012100.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 17 39 56 7.90668538340059 20.8611335321986 -12.954448148798 A:G G A 10 0.534900859799965 0.000670568786805062 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 5 14 19 2.32549570100017 7.48861203719951 -5.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0207748290951221 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 28 17 45 13.022775925601 9.09331461659941 3.92946130900157 A:G G A 10 0.534900859799965 0.295645195270053 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 16 14 30 7.44158624320056 7.48861203719951 -0.0470257939989516 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 25 17 42 11.6274785050009 9.09331461659941 2.53416388840147 T:G T G 10 0.534900859799965 0.444934320901757 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 66629394 T/C 1 27 28 55 12.5576767854009 14.977224074399 -2.41954728899808 T:C T C 10 0.534900859799965 0.58916401807924 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 11 6 17 5.11609054220038 3.20940515879979 1.90668538340059 A:G A G 10 0.534900859799965 0.467712856324536 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 97 92 189 45.1146165994034 49.2108791015968 -4.09626250219339 T:C C T 10 0.534900859799965 0.560356204980417 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 6 14 20 2.79059484120021 7.48861203719951 -4.6980171959993 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0430057939974577 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 75503399 G/A 1 84 82 166 39.0683277768029 43.8618705035971 -4.79354272679419 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.484050038155889 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 15 10 25 6.97648710300052 5.34900859799965 1.62747850500087 A:G G A 10 0.534900859799965 0.553545164136958 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 51 37 88 23.7200561502018 19.7913318125987 3.92872433760308 T:G G T 10 0.534900859799965 0.454732402260908 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 78834533 C/T 1 54 45 99 25.1153535708019 24.0705386909984 1.04481487980346 T:C C T 10 0.534900859799965 0.841194611623535 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78834519_78834561:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78834519_78834561:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78834519_78834561:PSMA4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 416 449 865 193.481242323215 240.170486050184 -46.6892437269698 A:T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.00151667231997508 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 55 44 99 25.5804527110019 23.5356378311985 2.04481487980346 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.688580043747014 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 17 48 65 7.90668538340059 25.6752412703983 -17.7685558869977 T:C T C 10 0.534900859799965 9.16549529658663e-06 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 123 122 245 57.2071942446043 65.2579048955957 -8.05071065099143 T:C C T 10 0.534900859799965 0.306213713936002 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 86 94 180 39.998526057203 50.2806808211967 -10.2821547639937 A:T:C A C 10 0.534900859799965 0.135045334598995 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 51 63 114 23.7200561502018 33.6987541673978 -9.97869801719601 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0739780673001358 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 T:G T G 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G A G 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 89811742 G/A 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89811630_89811756:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89811630_89811756:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89811630_89811756:FANCI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 8 13 21 3.72079312160028 6.95371117739955 -3.23291805579927 C:G G C 10 0.534900859799965 0.190792161249779 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 89862237 C/T 1 9 14 23 4.18589226180031 7.48861203719951 -3.3027197753992 T:C C T 10 0.534900859799965 0.210161332529243 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89862162_89862330:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89862162_89862330:POLG;ENSG00000140521:ENST00000530292:exon_89862162_89862330:POLG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 90628591 G/A 1 97 83 180 45.1146165994034 44.3967713633971 0.717845236006291 A:G G A 10 0.534900859799965 0.940532689687475 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:C A C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 14 12 26 6.51138796280049 6.41881031759958 0.0925776452009082 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 C:G C G 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 A:C C A 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 C:G C G 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 15 101814816 C/A 1 20 16 36 9.3019828040007 8.55841375679944 0.743569047201259 A:C C A 10 0.534900859799965 0.868223259948813 ENSG00000131871:ENST00000398226:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000531964:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526049:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526043:exon_101814797_101815566:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000528346:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000527833:exon_101814373_101814886:AC023024.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 188 152 340 87.4386383576066 81.3049306895947 6.13370766801189 C:G C G 10 0.534900859799965 0.514601801447847 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 417691 C/G 1 153 166 319 71.1601684506054 88.7935427267942 -17.6333742761888 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0495135244942405 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 418597 G/C 1 90 56 146 41.8589226180031 29.954448148798 11.9044744692051 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0560210097084084 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_418501_418635:MRPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 73 43 116 33.9522372346025 23.0007369713985 10.9515002632041 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0501644997516591 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 71 48 119 33.0220389542025 25.6752412703983 7.34679768380416 A:G G A 10 0.534900859799965 0.198268356059668 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 420179 G/A 1 84 56 140 39.0683277768029 29.954448148798 9.1138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.127803830845122 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 422158 G/A 1 29 23 52 13.487875065801 12.3027197753992 1.18515529040182 A:G G A 10 0.534900859799965 0.782299050945172 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_420773_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_421862_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_421864_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_421864_422283:TMEM8A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 52 44 96 24.1851552904018 23.5356378311985 0.649517459203356 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.918828983406148 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 132 95 227 61.3930865064046 50.8155816809967 10.5775048254079 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.162898408412900 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 11 5 16 5.11609054220038 2.67450429899983 2.44158624320056 T:G G T 10 0.534900859799965 0.316685870393005 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 717544 G/C 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 C:G G C 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 719592 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_719553_719606:RHOT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 720152 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720123_720175:RHOT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 12 6 18 5.58118968240042 3.20940515879979 2.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.346220682106825 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 13 15 28 6.04628882260045 8.02351289699948 -1.97722407439902 C:G C G 10 0.534900859799965 0.456976890177759 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 731771 C/T 1 59 48 107 27.4408492718021 25.6752412703983 1.76560800140374 T:C C T 10 0.534900859799965 0.77171420159336 ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 837175 C/T 1 9 12 21 4.18589226180031 6.41881031759958 -2.23291805579927 T:C C T 10 0.534900859799965 0.38467997649197 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_837077_837179:RPUSD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 845726 G/A 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 A:G G A 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 845797 G/C 1 9 9 18 4.18589226180031 4.81410773819969 -0.628215476399371 C:G G C 10 0.534900859799965 0.816280727493184 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 122 120 242 56.7420951044043 64.1881031759958 -7.44600807159154 A:G A G 10 0.534900859799965 0.367005978432653 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 T:C T C 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 23 21 44 10.6972802246008 11.2329180557993 -0.535637831198461 A:C C A 10 0.534900859799965 0.881084382056806 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 1869949 G/A 1 4 10 14 1.86039656080014 5.34900859799965 -3.48861203719951 A:G G A 10 0.534900859799965 0.104561526016219 ENSG00000063854:ENST00000397356:exon_1869898_1870015:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000397353:exon_1869898_1870015:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000262303:exon_1869898_1870015:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000455446:exon_1869898_1870015:HAGH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2009697 C/T 1 35 42 77 16.2784699070012 22.4658361115985 -6.18736620459731 T:C C T 10 0.534900859799965 0.171002405351314 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2009519_2009755:NDUFB10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 8 10 18 3.72079312160028 5.34900859799965 -1.62821547639937 A:C A C 10 0.534900859799965 0.485119707477505 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2025411 G/C 1 9 17 26 4.18589226180031 9.09331461659941 -4.90742235479909 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0749661638622606 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2026292 T/C 1 23 29 52 10.6972802246008 15.512124934199 -4.81484470959818 T:C T C 10 0.534900859799965 0.210968593710063 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026212_2026315:TBL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2026891 T/C 1 25 29 54 11.6274785050009 15.512124934199 -3.88464642919811 T:C T C 10 0.534900859799965 0.339838475732612 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2027120 G/A 1 26 34 60 12.0925776452009 18.1866292331988 -6.0940515879979 A:G G A 10 0.534900859799965 0.121674540227656 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2027055_2027285:TBL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2028677 A/G 1 20 25 45 9.3019828040007 13.3725214949991 -4.07053869099843 A:T:G A G 10 0.534900859799965 0.235037337430852 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 60 61 121 27.9059484120021 32.6289524477979 -4.72300403579577 T:C C T 10 0.534900859799965 0.412697058354841 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2049003 A/T 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:T A T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048966_2049122:ZNF598 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 27 17 44 12.5576767854009 9.09331461659941 3.46436216880154 T:C T C 10 0.534900859799965 0.364793691594658 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2223213 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000131653:ENST00000326181:exon_2223183_2223400:TRAF7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2285357 C/T 1 18 18 36 8.37178452360063 9.62821547639937 -1.25643095279874 T:C C T 10 0.534900859799965 0.739402622275745 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2301520 G/C 1 10 20 30 4.65099140200035 10.6980171959993 -6.04702579399895 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0287707904690274 ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2301516_2301615:DCI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2581081 C/G 1 10 5 15 4.65099140200035 2.67450429899983 1.97648710300052 C:G C G 10 0.534900859799965 0.438831218782805 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 A:C C A 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 2814443 G/C 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 C:G G C 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 3452193 T/G 1 11 1 12 5.11609054220038 0.534900859799965 4.58118968240042 T:G T G 10 0.534900859799965 0.00778954819080089 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 41 46 87 19.0690647482014 24.6054395507984 -5.53637480259696 A:G G A 10 0.534900859799965 0.23908006722759 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 3721773 G/C 1 67 69 136 31.1616423934023 36.9081593261976 -5.74651693279525 C:G G C 10 0.534900859799965 0.344779102576716 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3721723_3721792:TRAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 17 14 31 7.90668538340059 7.48861203719951 0.418073346201083 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:T T A 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 4659770 C/T 0 22 0 22 10.2321810844008 0 10.2321810844008 C C 10 0.534900859799965 1.10052123207739e-06 ENSG00000153443:ENST00000283474:exon_4658885_4659984:FAM100A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 A:G A G 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 46 33 79 21.3945604492016 17.6517283733988 3.74283207580276 C:G C G 10 0.534900859799965 0.430957557207737 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 10837913 C/G 1 6 11 17 2.79059484120021 5.88390945779962 -3.09331461659941 C:G C G 10 0.534900859799965 0.149930482845447 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10837818_10837922:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10837818_10837922:NUBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 42 29 71 19.5341638884015 15.512124934199 4.02203895420248 T:C:G C G 10 0.534900859799965 0.405138067944627 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 15818186 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 17232234 G/A 1 11 15 26 5.11609054220038 8.02351289699948 -2.90742235479909 A:G G A 10 0.534900859799965 0.325886746948747 ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17232212_17232388:XYLT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 T:C C T 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 8 1 9 3.72079312160028 0.534900859799965 3.18589226180031 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0431967784660911 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 21190853 A/C 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:C A C 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21190796_21191937:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21190796_21191935:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21190796_21191935:TMEM159 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 23634293 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23634290_23634451:PALB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 108 100 208 50.2307071416038 53.4900859799965 -3.25937883839273 A:G A G 10 0.534900859799965 0.676873439469962 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 24946793 C/T 1 19 20 39 8.83688366380066 10.6980171959993 -1.86113353219864 T:C C T 10 0.534900859799965 0.630888699245939 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24946791_24946960:ARHGAP17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 24955183 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24955092_24955183:ARHGAP17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 27 16 43 12.5576767854009 8.55841375679944 3.9992630286015 T:C T C 10 0.534900859799965 0.284455679221422 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 27268779 G/C 1 9 17 26 4.18589226180031 9.09331461659941 -4.90742235479909 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0749661638622606 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27268756_27268902:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27268756_27268902:NSMCE1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 27445755 C/T 1 13 6 19 6.04628882260045 3.20940515879979 2.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.251289611662878 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27445668_27445770:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27445668_27445770:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27445668_27445770:IL21R HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 11 4 15 5.11609054220038 2.13960343919986 2.97648710300052 A:G G A 10 0.534900859799965 0.194126412933295 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 16 30 46 7.44158624320056 16.047025793999 -8.60543955079839 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0118498788469809 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 30106158 G/A 1 15 9 24 6.97648710300052 4.81410773819969 2.16237936480084 A:G G A 10 0.534900859799965 0.418803008714874 ENSG00000090238:ENST00000398841:exon_30106110_30106218:YPEL3;ENSG00000090238:ENST00000398838:exon_30106110_30106218:YPEL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 481 565 1046 223.712686436217 302.21898578698 -78.5062993507634 A:T:G A G 10 0.534900859799965 1.27586723994326e-06 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 30393660 G/A 1 51 42 93 23.7200561502018 22.4658361115985 1.25422003860325 A:G G A 10 0.534900859799965 0.835721062941189 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 30776589 G/A 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000103549:ENST00000324685:exon_30776502_30776648:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000357890:exon_30776502_30776648:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000452273:exon_30776502_30776648:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000402121:exon_30776502_30776648:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000493683:exon_30776502_30776648:RNF40 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 31072909 G/A 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 31488916 C/G 0 9 0 9 4.18589226180031 0 4.18589226180031 C C 10 0.534900859799965 0.00460313644991216 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31488631_31489281:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31488631_31489279:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31488631_31489281:TGFB1I1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 53256663 C/T 1 18 13 31 8.37178452360063 6.95371117739955 1.41807334620108 T:C C T 10 0.534900859799965 0.719659997537689 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53256556_53256667:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53256556_53256667:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53256556_53256667:CHD9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 53526366 T/C 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 T:C T C 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53524952_53526431:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53525192_53526431:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53526324_53526434:AKTIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 53528079 T/C 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53528050_53528157:AKTIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 56857753 G/A 1 7 15 22 3.25569398140024 8.02351289699948 -4.76781891559923 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0531639722431231 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56857619_56857758:NUP93 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C C T 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 13 4 17 6.04628882260045 2.13960343919986 3.90668538340059 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0860716495303256 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 6 10 16 2.79059484120021 5.34900859799965 -2.55841375679944 T:C C T 10 0.534900859799965 0.219183186864788 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 58752568 C/T 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58752431_58752588:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58752121_58752592:GOT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 67116169 C/T 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C C T 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67116116_67116242:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67116116_67116211:CBFB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 13 11 24 6.04628882260045 5.88390945779962 0.162379364800839 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 67266065 T/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265942_67266097:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265942_67266097:FHOD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 67692468 G/A 1 23 18 41 10.6972802246008 9.62821547639937 1.06906474820143 A:G G A 10 0.534900859799965 0.757106736378983 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67692458_67692544:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67692458_67692544:ACD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 140 119 259 65.1138796280049 63.6532023161958 1.46067731180906 A:G A G 10 0.534900859799965 0.90089278385804 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 150 169 319 69.7648710300052 90.3982453061941 -20.6333742761889 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0213614015547203 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 17 12 29 7.90668538340059 6.41881031759958 1.48787506580101 T:C C T 10 0.534900859799965 0.710420465234456 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 69189866 T/C 1 29 22 51 13.487875065801 11.7678189155992 1.72005615020178 T:C T C 10 0.534900859799965 0.675263017870528 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69189774_69189896:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69189774_69189896:CIRH1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 69362968 C/T 1 22 17 39 10.2321810844008 9.09331461659941 1.13886646780136 T:C C T 10 0.534900859799965 0.750572839393108 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69360816_69363082:COG8;ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69362524_69363082:COG8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 22 17 39 10.2321810844008 9.09331461659941 1.13886646780136 A:G G A 10 0.534900859799965 0.750572839393108 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 72 58 130 33.4871380944025 31.024249868398 2.46288822600454 T:C C T 10 0.534900859799965 0.725244517836715 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 34 24 58 15.8133707668012 12.8376206351992 2.97575013160203 A:G G A 10 0.534900859799965 0.510840098378605 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 A:T A T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 76 86 162 35.3475346552027 46.001473942797 -10.6539392875943 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0983239365583802 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 C C 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:G G A 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 69 68 137 32.0918406738024 36.3732584663976 -4.28141779259521 T:C C T 10 0.534900859799965 0.493607118798274 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 6 15 21 2.79059484120021 8.02351289699948 -5.23291805579927 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0275069596495106 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 T:C T C 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 81124275 G/A 0 0 9 9 0 4.81410773819969 -4.81410773819969 A G A 10 0.534900859799965 0.00101837992572648 ENSG00000140905:ENST00000315467:exon_81124206_81124285:GCSH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 T:C T C 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:G A G 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 T:C T C 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84088041 G/C 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 C:G G C 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 11 12 23 5.11609054220038 6.41881031759958 -1.3027197753992 T:C C T 10 0.534900859799965 0.677565893754867 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 21 11 32 9.76708194420073 5.88390945779962 3.88317248640112 A:C C A 10 0.534900859799965 0.214690500105134 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:C C T 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 23 17 40 10.6972802246008 9.09331461659941 1.6039656080014 T:C C T 10 0.534900859799965 0.638056274923449 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 12 13 25 5.58118968240042 6.95371117739955 -1.37252149499913 A:G A G 10 0.534900859799965 0.689501648771211 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84793028 G/A 1 1 7 8 0.465099140200035 3.74430601859976 -3.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0290370039235518 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84792969_84793078:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84792969_84793078:USP10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 17 18 35 7.90668538340059 9.62821547639937 -1.72153009299878 A:G A G 10 0.534900859799965 0.613083345311784 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 85948098 G/A 1 8 10 18 3.72079312160028 5.34900859799965 -1.62821547639937 A:G G A 10 0.534900859799965 0.485119707477505 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85948079_85948126:IRF8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 T:G G T 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 32 26 58 14.8831724864011 13.9074223547991 0.975750131602027 T:C T C 10 0.534900859799965 0.895439249249522 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 15 11 26 6.97648710300052 5.88390945779962 1.09257764520091 A:G G A 10 0.534900859799965 0.699226755009291 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 89628073 G/A 1 1754 1546 3300 815.783891910861 826.956729250746 -11.1728373398847 A:T:C:G G A 10 0.534900859799965 0.701068161030591 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627986_89628118:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627986_89628159:RPL13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G A G 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 293138 G/A 1 6 21 27 2.79059484120021 11.2329180557993 -8.44232321459906 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00149668499121948 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 293274 A/G 1 2 10 12 0.93019828040007 5.34900859799965 -4.41881031759958 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0167338386485679 ENSG00000183688:ENST00000329099:exon_289769_293285:FAM101B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 649067 A/G 1 16 15 31 7.44158624320056 8.02351289699948 -0.581926653798917 A:G A G 10 0.534900859799965 0.858802032108497 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 650518 G/A 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 685846 C/T 1 10 15 25 4.65099140200035 8.02351289699948 -3.37252149499913 T:C C T 10 0.534900859799965 0.228777017331708 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685799_685931:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 686497 C/T 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_686321_686505:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_686323_686567:RNMTL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 32 25 57 14.8831724864011 13.3725214949991 1.51065099140199 A:C C A 10 0.534900859799965 0.790866232656807 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1442202 T/C 1 11 17 28 5.11609054220038 9.09331461659941 -3.97722407439902 T:C T C 10 0.534900859799965 0.183817636085738 ENSG00000174238:ENST00000313486:exon_1442163_1442246:PITPNA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1563804 C/T 1 8 14 22 3.72079312160028 7.48861203719951 -3.76781891559923 T:C C T 10 0.534900859799965 0.134580831565991 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1563726_1563872:PRPF8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 A:G A G 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 16 16 32 7.44158624320056 8.55841375679944 -1.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.725631682516676 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 1961535 A/G 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:G A G 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000177374:ENST00000399849:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000322941:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000416386:exon_1959965_1962980:HIC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 2227571 A/T 1 40 35 75 18.6039656080014 18.7215300929988 -0.117564484997377 A:T A T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167720:ENST00000344595:exon_2226949_2228554:SRR;ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2225992_2227668:TSR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 2227572 G/A 1 39 34 73 18.1388664678014 18.1866292331988 -0.0477627653974473 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167720:ENST00000344595:exon_2226949_2228554:SRR;ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2225992_2227668:TSR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 12 21 33 5.58118968240042 11.2329180557993 -5.65172837339885 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.0551329764539647 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 2597278 G/A 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2597194_2597333:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2597194_2597333:KIAA0664 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 13 11 24 6.04628882260045 5.88390945779962 0.162379364800839 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 116 121 237 53.9515002632041 64.7230040357958 -10.7715037725917 A:G A G 10 0.534900859799965 0.171523952775355 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 4577950 C/A 1 24 28 52 11.1623793648008 14.977224074399 -3.81484470959818 A:C:G C A 10 0.534900859799965 0.331028979592604 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4577855_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4577805_4577964:PELP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 10 16 26 4.65099140200035 8.55841375679944 -3.90742235479909 T:C C T 10 0.534900859799965 0.167755747456869 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 4910568 A/G 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G A G 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4910558_4910637:KIF1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 4927054 G/A 1 16 15 31 7.44158624320056 8.02351289699948 -0.581926653798917 A:G G A 10 0.534900859799965 0.858802032108497 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 14 5 19 6.51138796280049 2.67450429899983 3.83688366380066 T:C T C 10 0.534900859799965 0.106012177678070 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 12 2 14 5.58118968240042 1.06980171959993 4.51138796280049 A:G A G 10 0.534900859799965 0.015914234708859 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 T:C T C 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 56 54 110 26.045551851202 28.8846464291981 -2.83909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.633022582555442 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 44 43 87 20.4643621688015 23.0007369713985 -2.53637480259696 T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.592851393586263 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 16 11 27 7.44158624320056 5.88390945779962 1.55767678540094 A:T T A 10 0.534900859799965 0.569944117011018 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 63 60 123 29.3012458326022 32.0940515879979 -2.7928057553957 T:C C T 10 0.534900859799965 0.651649089507777 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 62 56 118 28.8361466924022 29.954448148798 -1.11830145639588 C:G C G 10 0.534900859799965 0.853963015413546 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5338269 T/C 1 79 78 157 36.7428320758028 41.7222670643973 -4.97943498859451 T:C T C 10 0.534900859799965 0.425211194035253 ENSG00000108561:ENST00000225698:exon_5338193_5338286:C1QBP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 5392173 A/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:C A C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 6663894 G/A 1 8 1 9 3.72079312160028 0.534900859799965 3.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0431967784660911 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7123838 C/T 1 27 3 30 12.5576767854009 1.6047025793999 10.952974206001 T:C C T 10 0.534900859799965 2.71419444728735e-05 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7123783_7123848:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7123783_7123848:ACADVL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7127146 G/A 1 60 58 118 27.9059484120021 31.024249868398 -3.11830145639588 A:G G A 10 0.534900859799965 0.580758044211222 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7127132_7127194:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7127132_7127194:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7127132_7127194:ACADVL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7154582 T/C 1 17 16 33 7.90668538340059 8.55841375679944 -0.651728373398846 T:C T C 10 0.534900859799965 0.862612432859578 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 32 25 57 14.8831724864011 13.3725214949991 1.51065099140199 T:C T C 10 0.534900859799965 0.790866232656807 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7254315 G/A 1 85 78 163 39.533426917003 41.7222670643973 -2.1888401473943 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.753801358267713 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7254269_7254318:ACAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7339525 G/T 1 18 6 24 8.37178452360063 3.20940515879979 5.16237936480084 T:G G T 10 0.534900859799965 0.0402322248741361 ENSG00000181284:ENST00000323206:exon_7339513_7340998:TMEM102;ENSG00000181284:ENST00000396568:exon_7339513_7340842:TMEM102 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7339526 C/T 1 17 5 22 7.90668538340059 2.67450429899983 5.23218108440077 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0311381278553664 ENSG00000181284:ENST00000323206:exon_7339513_7340998:TMEM102;ENSG00000181284:ENST00000396568:exon_7339513_7340842:TMEM102 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 3 9 12 1.3952974206001 4.81410773819969 -3.41881031759958 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0783985199572599 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 A:C C A 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 C:G C G 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 18 12 30 8.37178452360063 6.41881031759958 1.95297420600105 T:G T G 10 0.534900859799965 0.583879361622794 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 8092694 T/G 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 T:G T G 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 164 152 316 76.2762589928057 81.3049306895947 -5.02867169678895 A:G A G 10 0.534900859799965 0.5733480504276 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 9 16 25 4.18589226180031 8.55841375679944 -4.37252149499913 T:C C T 10 0.534900859799965 0.107273055875128 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 T:G T G 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 14 9 23 6.51138796280049 4.81410773819969 1.6972802246008 T:C C T 10 0.534900859799965 0.535478861923393 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 T:C T C 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 15881327 C/T 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000214941:ENST00000399277:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000399280:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000491631:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486655:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486706:exon_15881089_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000460252:exon_15881205_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000475498:exon_15881239_15881477:ZSWIM7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 16456614 T/G 1 1 7 8 0.465099140200035 3.74430601859976 -3.27920687839972 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0290370039235518 ENSG00000141040:ENST00000268727:exon_16453631_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395825:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395824:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000498796:exon_16456424_16456740:ZNF287 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 276 285 561 128.36736269521 152.44674504299 -24.0793823477804 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0422447603455895 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 197 201 398 91.6245306194069 107.515072819793 -15.8905422003861 A:G G A 10 0.534900859799965 0.119214256692318 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 16843667 G/A 1 283 242 525 131.62305667661 129.446008071592 2.17704860501837 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.861166690889017 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16843640_16843825:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16843640_16843825:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16843640_16843825:TNFRSF13B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 17080575 C/T 1 11 17 28 5.11609054220038 9.09331461659941 -3.97722407439902 T:C C T 10 0.534900859799965 0.183817636085738 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000313485:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000414263:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000462033:exon_17080566_17080726:MPRIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 7 12 19 3.25569398140024 6.41881031759958 -3.16311633619934 T:C C T 10 0.534900859799965 0.170694653144372 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 72 64 136 33.4871380944025 34.2336550271978 -0.746516932795245 A:G G A 10 0.534900859799965 0.93158816320089 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 18148884 T/A 1 40 61 101 18.6039656080014 32.6289524477979 -14.0249868397965 A:T T A 10 0.534900859799965 0.00677942454196236 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 18151905 C/A 1 29 24 53 13.487875065801 12.8376206351992 0.650254430601851 A:C C A 10 0.534900859799965 0.891250200581946 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18151864_18152035:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18151864_18152035:FLII HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 23 7 30 10.6972802246008 3.74430601859976 6.95297420600105 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0158462200192235 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 18250943 G/A 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18250810_18250970:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18250810_18250970:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18250810_18250970:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18250810_18250970:SHMT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 10 16 26 4.65099140200035 8.55841375679944 -3.90742235479909 A:G A G 10 0.534900859799965 0.167755747456869 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 18 0 18 8.37178452360063 0 8.37178452360063 T T 10 0.534900859799965 1.38875770108144e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 19 0 19 8.83688366380066 0 8.83688366380066 T T 10 0.534900859799965 7.3560856826458e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 19 0 19 8.83688366380066 0 8.83688366380066 G G 10 0.534900859799965 7.3560856826458e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 23 0 23 10.6972802246008 0 10.6972802246008 G G 10 0.534900859799965 5.85282341994681e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 22 0 22 10.2321810844008 0 10.2321810844008 C C 10 0.534900859799965 1.10052123207739e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 19 0 19 8.83688366380066 0 8.83688366380066 C C 10 0.534900859799965 7.3560856826458e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 12 0 12 5.58118968240042 0 5.58118968240042 C C 10 0.534900859799965 0.000651088133365378 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 25 0 25 11.6274785050009 0 11.6274785050009 C C 10 0.534900859799965 3.0626518117006e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 17 0 17 7.90668538340059 0 7.90668538340059 C C 10 0.534900859799965 2.62538815763530e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 C C 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 12 0 12 5.58118968240042 0 5.58118968240042 C C 10 0.534900859799965 0.000651088133365378 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 10 0 10 4.65099140200035 0 4.65099140200035 G G 10 0.534900859799965 0.00239113697481281 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 31 0 31 14.4180733462011 0 14.4180733462011 G G 10 0.534900859799965 5.5825373105767e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 52 30 82 24.1851552904018 16.047025793999 8.13812949640286 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0768155259157657 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 17 13 30 7.90668538340059 6.95371117739955 0.952974206001048 A:G G A 10 0.534900859799965 0.855242065396205 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 26671614 C/T 1 11 6 17 5.11609054220038 3.20940515879979 1.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.467712856324536 ENSG00000109079:ENST00000226225:exon_26671390_26674035:TNFAIP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:C A C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 A:C C A 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 24 23 47 11.1623793648008 12.3027197753992 -1.14034041059836 T:C C T 10 0.534900859799965 0.771309429321598 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 44 43 87 20.4643621688015 23.0007369713985 -2.53637480259696 T:C C T 10 0.534900859799965 0.592851393586263 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27228198 G/A 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27228008_27228319:DHRS13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 22 19 41 10.2321810844008 10.1631163361993 0.0690647482014342 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 C:G G C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 A:G G A 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C T C 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 33288582 C/G 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 C:G C G 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 0 0 11 11 0 5.88390945779962 -5.88390945779962 T C T 10 0.534900859799965 0.000220293104471919 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 35896093 G/A 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 21 5 26 9.76708194420073 2.67450429899983 7.09257764520091 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00530162016664526 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38146154 T/C 1 80 84 164 37.2079312160028 44.9316722231971 -7.72374100719426 T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.240614726333954 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38175866 G/A 1 41 31 72 19.0690647482014 16.5819266537989 2.48713809440252 A:G G A 10 0.534900859799965 0.636851672125707 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000476821:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38175351_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38175355_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38175361_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000491466:exon_38175398_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38175756_38175898:MED24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 A:G A G 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38186106 C/T 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 T:C C T 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38186001_38186112:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38186001_38186112:MED24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 13 21 34 6.04628882260045 11.2329180557993 -5.18662923319881 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0858795035292417 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 17 4 21 7.90668538340059 2.13960343919986 5.76708194420073 A:T T A 10 0.534900859799965 0.0144050491068597 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38991052 T/G 1 18 1 19 8.37178452360063 0.534900859799965 7.83688366380066 T:G T G 10 0.534900859799965 0.000240552430072523 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 38991053 T/A 1 18 1 19 8.37178452360063 0.534900859799965 7.83688366380066 A:T T A 10 0.534900859799965 0.000240552430072523 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 18 25 43 8.37178452360063 13.3725214949991 -5.0007369713985 A:G G A 10 0.534900859799965 0.129638766197315 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 17 4 21 7.90668538340059 2.13960343919986 5.76708194420073 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0144050491068597 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 11 2 13 5.11609054220038 1.06980171959993 4.04628882260045 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0265929077015328 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 40353722 A/G 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 40722162 G/A 1 18 22 40 8.37178452360063 11.7678189155992 -3.3960343919986 A:G G A 10 0.534900859799965 0.341860969847875 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000429573:exon_40722115_40722201:MLX HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 41113319 C/T 1 14 18 32 6.51138796280049 9.62821547639937 -3.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.291438696521591 ENSG00000108825:ENST00000360221:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000409399:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000421990:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000427569:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000409103:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000441280:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000450475:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000430739:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000436545:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000416949:exon_41113209_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000492036:exon_41112959_41113368:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000452752:exon_41113281_41113368:AARSD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 41165493 A/G 1 108 87 195 50.2307071416038 46.536374802597 3.69433233900681 A:G A G 10 0.534900859799965 0.615836494889530 ENSG00000068079:ENST00000415816:exon_41165493_41165679:IFI35;ENSG00000068079:ENST00000246911:exon_41165493_41165679:IFI35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 41165878 C/T 1 117 135 252 54.4165994034041 72.2116160729953 -17.7950166695912 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0269561915699310 ENSG00000068079:ENST00000438323:exon_41165793_41165899:IFI35;ENSG00000068079:ENST00000415816:exon_41165793_41165899:IFI35;ENSG00000068079:ENST00000246911:exon_41165793_41165899:IFI35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G G A 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 42397345 G/A 1 169 128 297 78.6017546938059 68.4673100543955 10.1344446394104 A:T:C:G G A 10 0.534900859799965 0.245108506376063 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42396993_42397484:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42396993_42397484:SLC25A39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 45 32 77 20.9294613090016 17.1168275135989 3.81263379540269 A:G A G 10 0.534900859799965 0.42463566871659 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 42399875 T/C 1 14 8 22 6.51138796280049 4.27920687839972 2.23218108440077 T:C T C 10 0.534900859799965 0.396875058456915 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42399787_42399896:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42399787_42399920:SLC25A39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 43171154 C/T 1 31 31 62 14.4180733462011 16.5819266537989 -2.16385330759783 T:C C T 10 0.534900859799965 0.611996316318265 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43171053_43171171:NMT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 11 22 33 5.11609054220038 11.7678189155992 -6.65172837339885 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0229996773887578 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 45699143 G/C 1 22 32 54 10.2321810844008 17.1168275135989 -6.88464642919811 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0753205884483568 ENSG00000141279:ENST00000530173:exon_45699134_45699372:NPEPPS;ENSG00000141279:ENST00000322157:exon_45699134_45700642:NPEPPS;ENSG00000141279:ENST00000530514:exon_45699134_45699483:NPEPPS;ENSG00000141279:ENST00000528565:exon_45699134_45699334:NPEPPS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 45917703 C/T 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 T:C C T 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45917557_45917738:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45917557_45917738:SCRN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 46000406 T/C 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46000328_46000640:SP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 46137021 G/A 1 39 35 74 18.1388664678014 18.7215300929988 -0.582663625197412 A:G G A 10 0.534900859799965 0.907695925070204 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 16 13 29 7.44158624320056 6.95371117739955 0.487875065801013 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 91 67 158 42.3240217582032 35.8383576065977 6.48566415160552 T:C C T 10 0.534900859799965 0.338592803884598 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 48940323 C/T 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 49043640 T/C 1 2 11 13 0.93019828040007 5.88390945779962 -4.95371117739955 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00928709768165766 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 49337993 A/G 1 28 25 53 13.022775925601 13.3725214949991 -0.349745569398149 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 55028242 C/T 1 16 5 21 7.44158624320056 2.67450429899983 4.76708194420073 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0473973584499926 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 56798128 A/G 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 A:G A G 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56798107_56798173:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56798107_56798173:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56798107_56798173:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000413590:exon_56798107_56798173:RAD51C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 T:C C T 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 215 229 444 99.9963151430075 122.492296894192 -22.4959817511845 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0362069761314918 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 64 53 117 29.7663449728022 28.3497455693981 1.41659940340409 A:G A G 10 0.534900859799965 0.853086656992477 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 6 13 19 2.79059484120021 6.95371117739955 -4.16311633619934 A:T T A 10 0.534900859799965 0.0662876401262792 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 24 10 34 11.1623793648008 5.34900859799965 5.81337076680119 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0574643835860323 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 73016489 C/T 1 44 42 86 20.4643621688015 22.4658361115985 -2.00147394279699 T:C C T 10 0.534900859799965 0.667284338972335 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016408_73016490:ICT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 52 54 106 24.1851552904018 28.8846464291981 -4.6994911387963 T:C T C 10 0.534900859799965 0.381630801840427 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 C C 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 17 7 24 7.90668538340059 3.74430601859976 4.16237936480084 T:C C T 10 0.534900859799965 0.103007697397189 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 37 38 75 17.2086681874013 20.3262326723987 -3.11756448499738 C:G G C 10 0.534900859799965 0.489051466591084 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 75398498 C/T 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75398134_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000407798:exon_75398140_75398550:SEPT9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 37 34 71 17.2086681874013 18.1866292331988 -0.977961045797517 A:G A G 10 0.534900859799965 0.813360330211463 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 106 92 198 49.3005088612037 49.2108791015968 0.0896297596069218 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 119 119 238 55.3467976838042 63.6532023161958 -8.30640463239168 T:C C T 10 0.534900859799965 0.298599822534613 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 30 24 54 13.952974206001 12.8376206351992 1.11535357080189 T:C T C 10 0.534900859799965 0.7866331732462 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 27 26 53 12.5576767854009 13.9074223547991 -1.34974556939815 A:G A G 10 0.534900859799965 0.783430471884864 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 13 13 26 6.04628882260045 6.95371117739955 -0.907422354799092 A:G G A 10 0.534900859799965 0.844673236061777 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 14 15 29 6.51138796280049 8.02351289699948 -1.51212493419899 T:C T C 10 0.534900859799965 0.58268078856631 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 14 12 26 6.51138796280049 6.41881031759958 0.0925776452009082 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 18 12 30 8.37178452360063 6.41881031759958 1.95297420600105 A:G G A 10 0.534900859799965 0.583879361622794 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79170576 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79219541 G/C 1 19 35 54 8.83688366380066 18.7215300929988 -9.88464642919811 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00896572238630132 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79225330 C/A 1 13 14 27 6.04628882260045 7.48861203719951 -1.44232321459906 A:C C A 10 0.534900859799965 0.700406252627522 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79226264 T/C 1 18 15 33 8.37178452360063 8.02351289699948 0.348271626601154 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C T C 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79478007 G/A 1 2678 2441 5119 1245.53549745569 1305.69299877171 -60.1575013160211 A:T:C:G G A 10 0.534900859799965 0.0927066062608501 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 13 13 26 6.04628882260045 6.95371117739955 -0.907422354799092 T:C C T 10 0.534900859799965 0.844673236061777 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80006619 C/T 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80005778_80006683:RFNG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80011773 C/T 1 12 15 27 5.58118968240042 8.02351289699948 -2.44232321459906 T:C C T 10 0.534900859799965 0.440946669159051 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 30 25 55 13.952974206001 13.3725214949991 0.580452711001922 A:G G A 10 0.534900859799965 0.893430629436807 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80016263 G/A 1 66 48 114 30.6965432532023 25.6752412703983 5.02130198280398 A:G G A 10 0.534900859799965 0.398213008903596 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80016217_80016292:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80016217_80016284:DUS1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 20 18 38 9.3019828040007 9.62821547639937 -0.326232672398671 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 18 18 36 8.37178452360063 9.62821547639937 -1.25643095279874 A:G G A 10 0.534900859799965 0.739402622275745 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 79 75 154 36.7428320758028 40.1175644849974 -3.37473240919462 T:C T C 10 0.534900859799965 0.628085195128502 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80196877 C/T 1 27 23 50 12.5576767854009 12.3027197753992 0.254957010001748 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80196578_80197354:SLC16A3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 28 18 46 13.022775925601 9.62821547639937 3.39456044920161 T:C T C 10 0.534900859799965 0.375730197602123 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 24 19 43 11.1623793648008 10.1631163361993 0.999263028601503 A:G G A 10 0.534900859799965 0.87873815653071 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 658064 G/C 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 C:G G C 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 27 22 49 12.5576767854009 11.7678189155992 0.789857869801713 T:G G T 10 0.534900859799965 0.886591801539746 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 9119489 A/T 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:T A T 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9119472_9119523:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9119472_9119564:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000465096:exon_9119471_9119588:NDUFV2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 74 60 134 34.4173363748026 32.0940515879979 2.32328478680468 A:G A G 10 0.534900859799965 0.729360793293285 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 C:G C G 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 79 65 144 36.7428320758028 34.7685558869977 1.97427618880503 C:G C G 10 0.534900859799965 0.802228381750788 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 12 13 25 5.58118968240042 6.95371117739955 -1.37252149499913 T:C T C 10 0.534900859799965 0.689501648771211 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 17 5 22 7.90668538340059 2.67450429899983 5.23218108440077 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0311381278553664 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 38 37 75 17.6737673276013 19.7913318125987 -2.11756448499738 A:G A G 10 0.534900859799965 0.644724526946877 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 11 17 28 5.11609054220038 9.09331461659941 -3.97722407439902 A:C C A 10 0.534900859799965 0.183817636085738 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 A:G A G 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 26 21 47 12.0925776452009 11.2329180557993 0.859659589401643 T:C C T 10 0.534900859799965 0.884098385556711 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 34398914 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 13 5 18 6.04628882260045 2.67450429899983 3.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.155293602908341 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 51686228 T/G 1 92 84 176 42.7891208984032 44.9316722231971 -2.14255132479384 T:G T G 10 0.534900859799965 0.762834542476272 ENSG00000134046:ENST00000256429:exon_51686135_51686273:MBD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 A:G G A 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 35 30 65 16.2784699070012 16.047025793999 0.231444113002272 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:T A T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:G T G 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 C:G C G 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 57026361 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57026263_57026503:LMAN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 17 16 33 7.90668538340059 8.55841375679944 -0.651728373398846 A:G G A 10 0.534900859799965 0.862612432859578 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 22 22 44 10.2321810844008 11.7678189155992 -1.53563783119846 T:C C T 10 0.534900859799965 0.653505605882135 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 29 32 61 13.487875065801 17.1168275135989 -3.62895244779787 T:C C T 10 0.534900859799965 0.370940983616204 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 34 47 81 15.8133707668012 25.1403404105984 -9.32696964379717 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0444795734790079 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 49 39 88 22.7898578698017 20.8611335321986 1.92872433760308 C:G C G 10 0.534900859799965 0.748793062072663 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 44 57 101 20.4643621688015 30.489349008598 -10.0249868397965 T:C:G G T 10 0.534900859799965 0.0465361269616723 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 25 30 55 11.6274785050009 16.047025793999 -4.41954728899808 T:C C T 10 0.534900859799965 0.279474413440009 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 871987 G/A 1 15 24 39 6.97648710300052 12.8376206351992 -5.86113353219864 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0763742613948688 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 872089 A/G 1 21 12 33 9.76708194420073 6.41881031759958 3.34827162660115 A:G A G 10 0.534900859799965 0.295884388540374 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 875389 G/A 1 6 12 18 2.79059484120021 6.41881031759958 -3.62821547639937 A:G G A 10 0.534900859799965 0.100571851495914 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_875244_875454:MED16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 899444 C/T 1 19 15 34 8.83688366380066 8.02351289699948 0.813370766801189 T:C C T 10 0.534900859799965 0.864214966378732 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_899440_899495:C19orf22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 0 88 0 88 40.9287243376031 0 40.9287243376031 G G 10 0.534900859799965 2.17925449731352e-24 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 37 72 109 17.2086681874013 38.5128619055975 -21.3041937181962 T:C T C 10 0.534900859799965 4.64907519820679e-05 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1010691 A/G 1 25 42 67 11.6274785050009 22.4658361115985 -10.8383576065977 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00967646555307546 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 5 10 15 2.32549570100017 5.34900859799965 -3.02351289699948 A:G A G 10 0.534900859799965 0.128614383413173 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 4 12 16 1.86039656080014 6.41881031759958 -4.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0249480887734303 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C T C 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 29 19 48 13.487875065801 10.1631163361993 3.32475872960168 T:C C T 10 0.534900859799965 0.386330591164559 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 287 264 551 133.48345323741 141.213826987191 -7.73037374978074 T:C T C 10 0.534900859799965 0.521915997443277 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 T:C T C 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 T:C T C 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 A:G A G 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C C T 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 24 23 47 11.1623793648008 12.3027197753992 -1.14034041059836 A:G A G 10 0.534900859799965 0.771309429321598 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 21 29 50 9.76708194420073 15.512124934199 -5.74504298999825 A:G G A 10 0.534900859799965 0.118915065327387 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 17 7 24 7.90668538340059 3.74430601859976 4.16237936480084 A:G A G 10 0.534900859799965 0.103007697397189 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 T:C T C 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2098063 A/T 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:T A T 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000099840:ENST00000395307:exon_2098051_2098126:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098051_2098333:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098051_2098333:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000300960:exon_2098051_2098126:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395301:exon_2098051_2098126:IZUMO4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2273146 C/T 1 933 950 1883 433.937497806633 508.155816809967 -74.2183190033342 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.000626032032782503 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2344637 C/T 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 C C 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2344551_2344650:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2344551_2344650:AC004410.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2353148 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 17 16 33 7.90668538340059 8.55841375679944 -0.651728373398846 T:C T C 10 0.534900859799965 0.862612432859578 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 2733250 C/T 1 31 26 57 14.4180733462011 13.9074223547991 0.510650991401992 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 24 21 45 11.1623793648008 11.2329180557993 -0.0705386909984274 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 28 24 52 13.022775925601 12.8376206351992 0.185155290401816 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 A:G G A 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3544665 G/A 1 30 12 42 13.952974206001 6.41881031759958 7.53416388840147 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0203740994265168 ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544198_3544730:C19orf28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3752515 G/A 1 7 16 23 3.25569398140024 8.55841375679944 -5.3027197753992 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0349785538694263 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:C C T 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 29 23 52 13.487875065801 12.3027197753992 1.18515529040182 A:G G A 10 0.534900859799965 0.782299050945172 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 102 87 189 47.4401123004036 46.536374802597 0.903737497806603 A:G G A 10 0.534900859799965 0.94190776967289 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 101 86 187 46.9750131602035 46.001473942797 0.97353921740654 A:G A G 10 0.534900859799965 0.941590483608569 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 10 14 24 4.65099140200035 7.48861203719951 -2.83762063519916 T:C T C 10 0.534900859799965 0.307000307671416 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 T:C C T 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 A:C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 16 11 27 7.44158624320056 5.88390945779962 1.55767678540094 A:G A G 10 0.534900859799965 0.569944117011018 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 15 7 22 6.97648710300052 3.74430601859976 3.23218108440077 T:C C T 10 0.534900859799965 0.20199553699413 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 18 13 31 8.37178452360063 6.95371117739955 1.41807334620108 A:G A G 10 0.534900859799965 0.719659997537689 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 34 28 62 15.8133707668012 14.977224074399 0.836146692402167 A:G A G 10 0.534900859799965 0.89895584480664 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 18 11 29 8.37178452360063 5.88390945779962 2.48787506580101 T:C C T 10 0.534900859799965 0.457181850596794 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 18 12 30 8.37178452360063 6.41881031759958 1.95297420600105 T:C T C 10 0.534900859799965 0.583879361622794 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 73 58 131 33.9522372346025 31.024249868398 2.92798736620458 A:G G A 10 0.534900859799965 0.661658859088927 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 5915151 C/T 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 49 49 98 22.7898578698017 26.2101421301983 -3.42028426039658 T:C T C 10 0.534900859799965 0.543704294413791 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 T:G G T 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 20 34 54 9.3019828040007 18.1866292331988 -8.88464642919811 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0196196993881326 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 6760974 T/C 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7623941 G/A 1 25 12 37 11.6274785050009 6.41881031759958 5.20866818740129 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0996351912497837 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7623736_7624037:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7623736_7624037:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7623736_7624037:PNPLA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:G G A 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 57 34 91 26.510650991402 18.1866292331988 8.32402175820318 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0923674564353286 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 76 43 119 35.3475346552027 23.0007369713985 12.3467976838042 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0270423924700733 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7747293 T/G 1 134 182 316 62.3232847868047 97.3519564835936 -35.028671696789 T:G T G 10 0.534900859799965 9.40108177675355e-05 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 299 401 700 139.06464291981 214.495244779786 -75.4306018599756 A:G G A 10 0.534900859799965 1.18345059520391e-08 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 213 112 325 99.0661168626074 59.9088962975961 39.1572205650114 A:G G A 10 0.534900859799965 1.31917167343518e-05 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 241 137 378 112.088892788208 73.2814177925952 38.8074749956132 A:G G A 10 0.534900859799965 6.79701186647226e-05 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 14 11 25 6.51138796280049 5.88390945779962 0.627478505000874 C:G C G 10 0.534900859799965 0.843639271199329 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 7998386 G/C 1 25 43 68 11.6274785050009 23.0007369713985 -11.3732584663976 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00708301916534071 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7998370_7998455:TIMM44 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 8551094 T/C 1 172 199 371 79.997052114406 106.445271100193 -26.448218985787 A:T:C T C 10 0.534900859799965 0.00672732336613831 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 8553630 C/T 1 249 199 448 115.809685909809 106.445271100193 9.36441480961567 T:C C T 10 0.534900859799965 0.394015052241951 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8553575_8553885:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8553575_8553885:HNRNPM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 T:C T C 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10445805 T/C 1 41 35 76 19.0690647482014 18.7215300929988 0.347534655202658 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10445742_10446029:ICAM3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 A:G A G 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 A:G A G 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 11 9 20 5.11609054220038 4.81410773819969 0.3019828040007 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 8 15 23 3.72079312160028 8.02351289699948 -4.3027197753992 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0933985829969672 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 22 19 41 10.2321810844008 10.1631163361993 0.0690647482014342 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 65 55 120 30.2314441130023 29.4195472889981 0.811896824004194 A:G G A 10 0.534900859799965 0.927197011444227 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 11618630 G/A 1 12 17 29 5.58118968240042 9.09331461659941 -3.51212493419899 A:G G A 10 0.534900859799965 0.198547361463897 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 12774208 G/C 1 2 9 11 0.93019828040007 4.81410773819969 -3.88390945779962 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0298686862719098 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12774131_12774232:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774122_12774276:MAN2B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 5 11 16 2.32549570100017 5.88390945779962 -3.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.083617752253552 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 T:C T C 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14204002 A/G 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 A:G A G 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000072062:ENST00000308677:exon_14202509_14204049:PRKACA;ENSG00000072062:ENST00000350356:exon_14202509_14204049:PRKACA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14512256 C/T 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 T:C C T 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512198_14512375:CD97 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 12 11 23 5.58118968240042 5.88390945779962 -0.302719775399196 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 87 90 177 40.463625197403 48.1410773819969 -7.67745218459381 A:G A G 10 0.534900859799965 0.258809103774281 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 89 73 162 41.3938234778031 39.0477627653975 2.34606071240566 A:G A G 10 0.534900859799965 0.752946440120153 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 92 117 209 42.7891208984032 62.5834005965959 -19.7942796981927 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00673874935017029 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14582584 C/T 1 148 113 261 68.8346727496052 60.443797157396 8.39087559220913 T:C C T 10 0.534900859799965 0.320874037591263 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 9 9 18 4.18589226180031 4.81410773819969 -0.628215476399371 A:G G A 10 0.534900859799965 0.816280727493184 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 A:C C A 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 15512393 G/A 1 9 17 26 4.18589226180031 9.09331461659941 -4.90742235479909 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0749661638622606 ENSG00000011243:ENST00000397410:exon_15511961_15512414:AKAP8L;ENSG00000011243:ENST00000263378:exon_15511961_15512414:AKAP8L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 16197320 T/C 1 24 29 53 11.1623793648008 15.512124934199 -4.34974556939815 T:C T C 10 0.534900859799965 0.270788496067714 ENSG00000167460:ENST00000344824:exon_16197233_16197350:TPM4;ENSG00000167460:ENST00000300933:exon_16197233_16197350:TPM4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 16259623 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 17 8 25 7.90668538340059 4.27920687839972 3.62747850500087 T:C C T 10 0.534900859799965 0.164167120951884 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 T:C T C 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 11 12 23 5.11609054220038 6.41881031759958 -1.3027197753992 A:G A G 10 0.534900859799965 0.677565893754867 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17535472 G/A 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000141971:ENST00000528604:exon_17535430_17535486:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000317040:exon_17535430_17535486:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000392702:exon_17535430_17535486:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528515:exon_17535430_17535486:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000524382:exon_17535430_17535486:FAM125A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 17835962 G/C 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 C:G G C 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17835858_17835998:MAP1S HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 62 65 127 28.8361466924022 34.7685558869977 -5.93240919459556 T:G T G 10 0.534900859799965 0.327861745387492 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 401 416 817 186.504755220214 222.518757676785 -36.0140024565715 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0127247896628986 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 608 555 1163 282.780277241621 296.869977188981 -14.0896999473593 A:G A G 10 0.534900859799965 0.410605707185408 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 A:G A G 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 14 29 43 6.51138796280049 15.512124934199 -9.0007369713985 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00855213760448376 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18672894 G/C 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 C:G G C 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18672846_18672967:C19orf50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18679399 C/T 1 25 25 50 11.6274785050009 13.3725214949991 -1.74504298999825 T:C C T 10 0.534900859799965 0.671649142159012 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 0 57 1 58 26.510650991402 0.534900859799965 25.975750131602 A:C C A 10 0.534900859799965 1.15023189446775e-14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 74 89 163 34.4173363748026 47.6061765221969 -13.1888401473943 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0411370443543484 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 78 69 147 36.2777329356027 36.9081593261976 -0.630426390594863 T:C T C 10 0.534900859799965 0.934242483452542 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19033442 G/A 1 18 13 31 8.37178452360063 6.95371117739955 1.41807334620108 A:G G A 10 0.534900859799965 0.719659997537689 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19033413_19033553:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19033413_19033553:DDX49 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19039080 G/A 1 56 59 115 26.045551851202 31.5591507281979 -5.51359887699598 A:G G A 10 0.534900859799965 0.305613767459046 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038937_19039436:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038937_19039438:DDX49 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19105259 G/A 1 15 17 32 6.97648710300052 9.09331461659941 -2.11682751359888 A:G G A 10 0.534900859799965 0.48241794551443 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19105175_19106089:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19105175_19105295:SUGP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19230883 C/T 1 15 6 21 6.97648710300052 3.20940515879979 3.76708194420073 T:C C T 10 0.534900859799965 0.125805920338761 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19257680 C/T 1 17 28 45 7.90668538340059 14.977224074399 -7.07053869099843 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0369128808050186 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000475290:exon_19257593_19257992:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257551_19257684:AC002126.6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G G A 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19606991 A/G 1 11 13 24 5.11609054220038 6.95371117739955 -1.83762063519916 A:G A G 10 0.534900859799965 0.540805266570369 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606861_19607028:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606861_19607028:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606861_19607028:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606861_19607028:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606861_19607028:GATAD2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 69 50 119 32.0918406738024 26.7450429899983 5.34679768380416 C:G C G 10 0.534900859799965 0.358433749257031 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 24310413 G/C 1 1 7 8 0.465099140200035 3.74430601859976 -3.27920687839972 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0290370039235518 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 30165184 G/A 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 A:G G A 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 T:C T C 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 A A 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 0 13 0 13 6.04628882260045 0 6.04628882260045 T T 10 0.534900859799965 0.000341115848438660 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 11 1 12 5.11609054220038 0.534900859799965 4.58118968240042 A:C A C 10 0.534900859799965 0.00778954819080089 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 A:G G A 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 163 169 332 75.8111598526057 90.3982453061941 -14.5870854535884 A:G A G 10 0.534900859799965 0.110824535051872 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 93 104 197 43.2542200386033 55.6296894191964 -12.3754693805931 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0862954940293083 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 246 218 464 114.414388489209 116.608387436392 -2.19399894718377 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.85239900737079 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 32 45 77 14.8831724864011 24.0705386909984 -9.18736620459731 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0396049841317571 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 41 22 63 19.0690647482014 11.7678189155992 7.3012458326022 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0765590219090312 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 A:T A T 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 18 8 26 8.37178452360063 4.27920687839972 4.09257764520091 A:C A C 10 0.534900859799965 0.118924485668031 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 T:C T C 10 0.534900859799965 0.246471813846146 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 36612481 G/A 1 32 57 89 14.8831724864011 30.489349008598 -15.6061765221969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.000941254118098366 ENSG00000105254:ENST00000221855:exon_36612429_36612620:TBCB;ENSG00000105254:ENST00000392178:exon_36612429_36612787:TBCB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:C C T 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 58 55 113 26.975750131602 29.4195472889981 -2.44379715739605 T:C T C 10 0.534900859799965 0.706197135670161 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 30 24 54 13.952974206001 12.8376206351992 1.11535357080189 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7866331732462 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39196736 G/A 1 23 20 43 10.6972802246008 10.6980171959993 -0.000736971398495712 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 128 127 255 59.5326899456045 67.9324091945956 -8.39971924899109 T:C T C 10 0.534900859799965 0.315200041023789 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 58 66 124 26.975750131602 35.3034567467977 -8.32770661519567 T:G T G 10 0.534900859799965 0.149638737103104 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39340561 G/A 1 21 23 44 9.76708194420073 12.3027197753992 -2.53563783119846 A:G G A 10 0.534900859799965 0.454134024416825 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39340340_39340617:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39340340_39340617:HNRNPL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39880011 G/A 1 23 28 51 10.6972802246008 14.977224074399 -4.27994384979822 A:G G A 10 0.534900859799965 0.261995117341664 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000221266:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39879922_39880023:PAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 A:G G A 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 11 5 16 5.11609054220038 2.67450429899983 2.44158624320056 A:G G A 10 0.534900859799965 0.316685870393005 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 19 9 28 8.83688366380066 4.81410773819969 4.02277592560098 C:G C G 10 0.534900859799965 0.134704578990074 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 11 9 20 5.11609054220038 4.81410773819969 0.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 1172 943 2115 545.096192314441 504.411510791367 40.6846815230739 A:T:C A C 10 0.534900859799965 0.077466967201471 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 1140 919 2059 530.21301982804 491.573890156168 38.639129671872 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0889451736898544 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 39955515 C/T 1 13 19 32 6.04628882260045 10.1631163361993 -4.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.158790444964849 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 54 47 101 25.1153535708019 25.1403404105984 -0.024986839796469 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 20 10 30 9.3019828040007 5.34900859799965 3.95297420600105 A:G A G 10 0.534900859799965 0.199470024042959 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 8 2 10 3.72079312160028 1.06980171959993 2.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.117939365427231 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 T:C T C 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 41847860 G/A 1 112 108 220 52.0911037024039 57.7692928583962 -5.67818915599231 A:G G A 10 0.534900859799965 0.457645886327299 ENSG00000105329:ENST00000221930:exon_41847788_41847935:TGFB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 31 46 77 14.4180733462011 24.6054395507984 -10.1873662045973 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0221061562079928 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 9 12 21 4.18589226180031 6.41881031759958 -2.23291805579927 A:G G A 10 0.534900859799965 0.38467997649197 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 C:G G C 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G A G 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 A:C C A 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G A G 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:T A T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 44681717 T/G 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 T:G T G 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 19 10 29 8.83688366380066 5.34900859799965 3.48787506580101 A:C C A 10 0.534900859799965 0.263759607189424 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 12 9 21 5.58118968240042 4.81410773819969 0.767081944200734 A:G A G 10 0.534900859799965 0.82864894485234 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 46878989 G/A 1 15 17 32 6.97648710300052 9.09331461659941 -2.11682751359888 A:G G A 10 0.534900859799965 0.48241794551443 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467902:exon_46878860_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527193:exon_46878884_46879008:PPP5C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 47878858 C/T 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47878723_47878965:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47878723_47878965:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47878723_47878965:DHX34 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 48248834 T/C 1 205 122 327 95.3453237410072 65.2579048955957 30.0874188454114 A:T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.000860056003047624 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 48248907 G/C 1 276 176 452 128.36736269521 94.1425513247938 34.2248113704158 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00132129328113533 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 48254799 T/C 1 143 104 247 66.509177048605 55.6296894191964 10.8794876294086 T:C T C 10 0.534900859799965 0.180363539117569 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 68 95 163 31.6267415336024 50.8155816809967 -19.1888401473943 A:C:G A G 10 0.534900859799965 0.00278441973383744 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 48259787 C/T 1 435 393 828 202.318125987015 210.216037901386 -7.89791191437106 T:C C T 10 0.534900859799965 0.601310342019396 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000422743:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000325566:exon_48259785_48259861:GLTSCR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 13 11 24 6.04628882260045 5.88390945779962 0.162379364800839 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49376582 G/A 1 20 27 47 9.3019828040007 14.4423232145991 -5.14034041059836 A:G G A 10 0.534900859799965 0.144961122501334 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 78 71 149 36.2777329356027 37.9779610457975 -1.70022811019479 T:C T C 10 0.534900859799965 0.805674841026801 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 101 77 178 46.9750131602035 41.1873662045973 5.78764695560622 C:G G C 10 0.534900859799965 0.408889291431904 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 56 63 119 26.045551851202 33.6987541673978 -7.65320231619584 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.168604322558835 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49377873 G/A 1 156 127 283 72.5554658712055 67.9324091945956 4.62305667660989 A:G G A 10 0.534900859799965 0.592263727191103 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49377918 G/T 1 146 112 258 67.9044744692051 59.9088962975961 7.99557817160901 T:G G T 10 0.534900859799965 0.349219560286753 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49407660 G/A 1 10 18 28 4.65099140200035 9.62821547639937 -4.97722407439902 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0863557876442262 ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000443560:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000411700:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000451312:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49407604_49407711:NUCB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1085 1149 2234 504.632567117038 614.60108791016 -109.968520793122 A:T:C T C 10 0.534900859799965 3.35018563555603e-06 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G A G 10 0.534900859799965 0.517334924233721 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 13 14 27 6.04628882260045 7.48861203719951 -1.44232321459906 A:G A G 10 0.534900859799965 0.700406252627522 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49514320 C/T 1 104 131 235 48.3703105808036 70.0720126337954 -21.7017020529918 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.00486561712504825 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49514256_49514350:RUVBL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 C:G C G 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 13 16 29 6.04628882260045 8.55841375679944 -2.51212493419899 A:G G A 10 0.534900859799965 0.359241351500948 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 109 100 209 50.6958062818038 53.4900859799965 -2.7942796981927 C:G C G 10 0.534900859799965 0.728978532718938 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 25 21 46 11.6274785050009 11.2329180557993 0.394560449201608 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 13 5 18 6.04628882260045 2.67450429899983 3.37178452360063 C:G G C 10 0.534900859799965 0.155293602908341 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 50435998 C/T 1 33 38 71 15.3482716266012 20.3262326723987 -4.97796104579752 T:C C T 10 0.534900859799965 0.284211380995260 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 6 10 16 2.79059484120021 5.34900859799965 -2.55841375679944 A:G G A 10 0.534900859799965 0.219183186864788 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 158 203 361 73.4856641516055 108.584874539393 -35.0992103877874 T:C C T 10 0.534900859799965 0.000261283008926041 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 156 182 338 72.5554658712055 97.3519564835936 -24.7964906123882 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00747627386680201 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 39 40 79 18.1388664678014 21.3960343919986 -3.25716792419724 T:C T C 10 0.534900859799965 0.49933102389119 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 27 32 59 12.5576767854009 17.1168275135989 -4.55915072819794 C:G C G 10 0.534900859799965 0.242755594846602 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 28 35 63 13.022775925601 18.7215300929988 -5.6987541673978 A:G A G 10 0.534900859799965 0.165350218175214 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 89 65 154 41.3938234778031 34.7685558869977 6.62526759080538 A:G G A 10 0.534900859799965 0.294618295103934 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 54627915 C/T 1 17 20 37 7.90668538340059 10.6980171959993 -2.79133181259871 T:C C T 10 0.534900859799965 0.411118319166261 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445811:exon_54627878_54628033:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445124:exon_54627878_54628009:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000447810:exon_54627878_54627962:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54627878_54628035:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000498612:exon_54627878_54628035:PRPF31 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 54634830 C/T 1 59 49 108 27.4408492718021 26.2101421301983 1.23070714160377 T:C C T 10 0.534900859799965 0.847390400512955 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54634769_54634867:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54634738_54635140:PRPF31 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 T:G T G 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 7 10 17 3.25569398140024 5.34900859799965 -2.09331461659941 T:C T C 10 0.534900859799965 0.339225682542055 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 3 10 13 1.3952974206001 5.34900859799965 -3.95371117739955 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0473249118782269 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 T:G G T 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55143982 T/C 1 3 9 12 1.3952974206001 4.81410773819969 -3.41881031759958 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0783985199572599 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143915_55144211:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55144521 C/T 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55145093 G/C 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 C:G G C 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 46 13 59 21.3945604492016 6.95371117739955 14.4408492718021 T:C C T 10 0.534900859799965 0.000123855699832854 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55175297 C/T 1 12 6 18 5.58118968240042 3.20940515879979 2.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.346220682106825 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55175212_55175413:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175292_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175212_55175496:LILRB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55175795 G/A 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 A:G G A 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55178148 G/A 1 16 4 20 7.44158624320056 2.13960343919986 5.3019828040007 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0228842613572556 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55178198 C/G 1 21 8 29 9.76708194420073 4.27920687839972 5.48787506580101 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0422328035465049 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 0 0 8 8 0 4.27920687839972 -4.27920687839972 G C G 10 0.534900859799965 0.00218959752384939 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 0 0 16 16 0 8.55841375679944 -8.55841375679944 A C A 10 0.534900859799965 4.79433731644741e-06 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 0 0 15 15 0 8.02351289699948 -8.02351289699948 A C A 10 0.534900859799965 1.03082050729774e-05 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 0 0 11 11 0 5.88390945779962 -5.88390945779962 G T G 10 0.534900859799965 0.000220293104471919 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55789079 C/T 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000133265:ENST00000433386:exon_55789010_55789214:HSPBP1;ENSG00000133265:ENST00000255631:exon_55789010_55789214:HSPBP1;ENSG00000133265:ENST00000376343:exon_55789010_55789214:HSPBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55897956 G/A 1 1036 866 1902 481.842709247236 463.22414458677 18.6185646604665 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.395154329172207 ENSG00000108107:ENST00000458349:exon_55897938_55898061:RPL28;ENSG00000108107:ENST00000344063:exon_55897938_55898061:RPL28;ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55897938_55898061:RPL28;ENSG00000108107:ENST00000428193:exon_55897938_55898061:RPL28;ENSG00000108107:ENST00000431533:exon_55897938_55898408:RPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55899709 C/A 1 2945 2414 5359 1369.7169678891 1291.25067555712 78.4662923319875 A:T:C:G C A 10 0.534900859799965 0.0326528326667443 ENSG00000108107:ENST00000344063:exon_55899611_55903449:RPL28;ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55967848 C/T 1 20 30 50 9.3019828040007 16.047025793999 -6.74504298999825 T:C C T 10 0.534900859799965 0.064970570900628 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55967716_55967856:ISOC2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55994975 G/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 55998281 C/T 1 17 8 25 7.90668538340059 4.27920687839972 3.62747850500087 T:C C T 10 0.534900859799965 0.164167120951884 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 7 10 17 3.25569398140024 5.34900859799965 -2.09331461659941 T:C C T 10 0.534900859799965 0.339225682542055 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 12 13 25 5.58118968240042 6.95371117739955 -1.37252149499913 T:C C T 10 0.534900859799965 0.689501648771211 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 42 38 80 19.5341638884015 20.3262326723987 -0.792068783997202 A:G A G 10 0.534900859799965 0.91091988643732 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 19 58718269 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58718087_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58718087_58718361:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58718087_58718361:ZNF274 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 79 96 175 36.7428320758028 51.3504825407966 -14.6076504649939 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0280004145697889 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 2 12 14 0.93019828040007 6.41881031759958 -5.48861203719951 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0051145266064986 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 48 41 89 22.3247587296017 21.9309352517986 0.39382347780311 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10581757 A/G 1 67 91 158 31.1616423934023 48.6759782417968 -17.5143358483945 A:C:G A G 10 0.534900859799965 0.00651320425964543 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10581635_10581849:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10581635_10581849:ODC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10582196 C/T 1 93 107 200 43.2542200386033 57.2343919985963 -13.980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0553649883487106 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10582138_10582300:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10582138_10582300:ODC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10585164 C/T 1 4 11 15 1.86039656080014 5.88390945779962 -4.02351289699948 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0412156107455973 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10585057_10585175:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10585057_10585175:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000446285:exon_10585057_10585175:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000443218:exon_10585057_10585175:ODC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 40 23 63 18.6039656080014 12.3027197753992 6.3012458326022 T:C C T 10 0.534900859799965 0.129490281094460 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 73 54 127 33.9522372346025 28.8846464291981 5.06759080540444 T:C T C 10 0.534900859799965 0.375364954260772 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 51 37 88 23.7200561502018 19.7913318125987 3.92872433760308 T:C C T 10 0.534900859799965 0.454732402260908 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 15 11 26 6.97648710300052 5.88390945779962 1.09257764520091 T:C C T 10 0.534900859799965 0.699226755009291 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 10 2 12 4.65099140200035 1.06980171959993 3.58118968240042 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0441097110945409 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 17897488 T/C 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C T C 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17897353_17897531:SMC6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 17962928 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 17963123 A/G 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 A:G A G 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G A G 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 13 8 21 6.04628882260045 4.27920687839972 1.76708194420073 T:C C T 10 0.534900859799965 0.515435550872733 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 A:C:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:C C A 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 5 11 16 2.32549570100017 5.88390945779962 -3.55841375679944 T:C T C 10 0.534900859799965 0.083617752253552 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:G G T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 C:G C G 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 49 45 94 22.7898578698017 24.0705386909984 -1.28068082119671 T:C T C 10 0.534900859799965 0.836428198524297 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 49 50 99 22.7898578698017 26.7450429899983 -3.95518512019654 A:G G A 10 0.534900859799965 0.480842161293223 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 37454811 C/T 1 17 11 28 7.90668538340059 5.88390945779962 2.02277592560098 T:C C T 10 0.534900859799965 0.570625342030966 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 10 5 15 4.65099140200035 2.67450429899983 1.97648710300052 A:G G A 10 0.534900859799965 0.438831218782805 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 47710049 T/C 1 53 45 98 24.6502544306019 24.0705386909984 0.579715739603426 T:C T C 10 0.534900859799965 0.919747891354401 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47709918_47710367:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47709918_47710360:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47709918_47710088:MSH2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 54858214 A/G 1 20 10 30 9.3019828040007 5.34900859799965 3.95297420600105 A:G A G 10 0.534900859799965 0.199470024042959 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 14 10 24 6.51138796280049 5.34900859799965 1.16237936480084 T:C C T 10 0.534900859799965 0.686624830629771 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 16 19 35 7.44158624320056 10.1631163361993 -2.72153009299878 A:G A G 10 0.534900859799965 0.398903928691939 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 62100380 G/T 1 89 111 200 41.3938234778031 59.3739954377961 -17.980171959993 T:C:G G T 10 0.534900859799965 0.0129089868304817 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100332_62100428:CCT4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 62449763 T/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:T T A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000170340:ENST00000301998:exon_62449347_62451866:B3GNT2;ENSG00000170340:ENST00000405767:exon_62449347_62451684:B3GNT2;ENSG00000170340:ENST00000340715:exon_62449383_62450929:B3GNT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 65216798 C/A 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 A:C C A 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 44 38 82 20.4643621688015 20.3262326723987 0.138129496402868 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 67632214 C/T 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1;ENSG00000143971:ENST00000462772:exon_67632129_67632467:ETAA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 9 11 20 4.18589226180031 5.88390945779962 -1.6980171959993 A:G G A 10 0.534900859799965 0.505439553901546 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 38 28 66 17.6737673276013 14.977224074399 2.69654325320231 A:G G A 10 0.534900859799965 0.538950305234692 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 47 28 75 21.8596595894016 14.977224074399 6.88243551500262 C:G G C 10 0.534900859799965 0.131992830388548 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:T A T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 92 85 177 42.7891208984032 45.466573082997 -2.67745218459381 T:C C T 10 0.534900859799965 0.706741743657861 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 73455600 C/T 1 7 12 19 3.25569398140024 6.41881031759958 -3.16311633619934 T:C C T 10 0.534900859799965 0.170694653144372 ENSG00000135617:ENST00000258083:exon_73455134_73455702:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000480093:exon_73455459_73455702:C2orf7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 41 16 57 19.0690647482014 8.55841375679944 10.510650991402 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00513757603805863 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 74688563 C/T 1 25 29 54 11.6274785050009 15.512124934199 -3.88464642919811 T:C C T 10 0.534900859799965 0.339838475732612 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 9 3 12 4.18589226180031 1.6047025793999 2.58118968240042 T:C C T 10 0.534900859799965 0.157743408538479 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 77 66 143 35.8126337954027 35.3034567467977 0.509177048604997 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 75185856 G/T 1 35 37 72 16.2784699070012 19.7913318125987 -3.51286190559748 T:G G T 10 0.534900859799965 0.411170284723627 ENSG00000115350:ENST00000483063:exon_75185619_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000393918:exon_75185775_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000485527:exon_75185832_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000459636:exon_75185833_75186019:POLE4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 75874015 C/G 1 15 9 24 6.97648710300052 4.81410773819969 2.16237936480084 C:G C G 10 0.534900859799965 0.418803008714874 ENSG00000115364:ENST00000493686:exon_75873909_75874036:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75873909_75874036:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000358788:exon_75873920_75874035:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75873929_75874036:MRPL19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 45 50 95 20.9294613090016 26.7450429899983 -5.81558168099668 T:C T C 10 0.534900859799965 0.258063307615029 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 20 22 42 9.3019828040007 11.7678189155992 -2.46583611159853 T:G T G 10 0.534900859799965 0.536610125882847 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 204 178 382 94.8802246008071 95.2123530443938 -0.332128443586654 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 215 203 418 99.9963151430075 108.584874539393 -8.58855939638538 T:C C T 10 0.534900859799965 0.40490639335646 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 18 9 27 8.37178452360063 4.81410773819969 3.55767678540094 T:C C T 10 0.534900859799965 0.182525818893904 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 85843348 C/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85843215_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85843266_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000455732:exon_85843275_85843579:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85843275_85843435:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85843292_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85843300_85843377:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85843309_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85843310_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85843317_85843586:USP39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 71 68 139 33.0220389542025 36.3732584663976 -3.35121951219514 T:C T C 10 0.534900859799965 0.610167500148858 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 3115 4622 7737 1448.78382172311 2472.31177399544 -1023.52795227233 T:C:G C G 10 0.534900859799965 2.91993611728057e-120 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 89160789 C/G 0 35 0 35 16.2784699070012 0 16.2784699070012 C C 10 0.534900859799965 4.04120104646884e-10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 89161069 G/C 1 16 3 19 7.44158624320056 1.6047025793999 5.83688366380066 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00948963543452851 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 89442250 C/T 1 65 189 254 30.2314441130023 101.096262502193 -70.8648183891911 T:C C T 10 0.534900859799965 2.51984803005301e-19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G A G 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 14 8 22 6.51138796280049 4.27920687839972 2.23218108440077 T:C T C 10 0.534900859799965 0.396875058456915 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 97166204 A/G 1 1 7 8 0.465099140200035 3.74430601859976 -3.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0290370039235518 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 98275449 C/T 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98275342_98275466:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274890_98275466:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000460427:exon_98275277_98275466:ACTR1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 T:C T C 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 2 8 10 0.93019828040007 4.27920687839972 -3.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0527029702370021 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 99811314 G/A 1 14 21 35 6.51138796280049 11.2329180557993 -4.72153009299878 A:G G A 10 0.534900859799965 0.127648723252948 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99811214_99811552:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99811214_99811360:MRPL30 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 19 18 37 8.83688366380066 9.62821547639937 -0.791331812598706 A:G G A 10 0.534900859799965 0.86959814062322 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 161 177 338 74.8809615722056 94.6774521845938 -19.7964906123882 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.0333572169691805 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 51 54 105 23.7200561502018 28.8846464291981 -5.16459027899633 T:C T C 10 0.534900859799965 0.328841190117066 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 8 13 21 3.72079312160028 6.95371117739955 -3.23291805579927 A:G A G 10 0.534900859799965 0.190792161249779 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 A:G A G 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 15 12 27 6.97648710300052 6.41881031759958 0.557676785400943 C:G G C 10 0.534900859799965 0.849958207872425 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 113332898 G/A 1 9 14 23 4.18589226180031 7.48861203719951 -3.3027197753992 A:G G A 10 0.534900859799965 0.210161332529243 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113332424_113333876:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113332424_113333876:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113332424_113334635:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000448770:exon_113332424_113333606:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113332424_113333872:POLR1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 113346508 C/T 1 55 26 81 25.5804527110019 13.9074223547991 11.6730303562028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0101207242449156 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 83 58 141 38.6032286366029 31.024249868398 7.57897876820493 C:G C G 10 0.534900859799965 0.206469305496898 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 15 6 21 6.97648710300052 3.20940515879979 3.76708194420073 T:C T C 10 0.534900859799965 0.125805920338761 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 22 7 29 10.2321810844008 3.74430601859976 6.48787506580101 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0156953880494709 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 122125213 G/A 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000472776:exon_122125164_122125407:CLASP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 90 75 165 41.8589226180031 40.1175644849974 1.74135813300577 A:C A C 10 0.534900859799965 0.815166177144134 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 16 10 26 7.44158624320056 5.34900859799965 2.09257764520091 C:G G C 10 0.534900859799965 0.438883119655303 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 35 30 65 16.2784699070012 16.047025793999 0.231444113002272 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 8 13 21 3.72079312160028 6.95371117739955 -3.23291805579927 T:C T C 10 0.534900859799965 0.190792161249779 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 131103635 C/T 1 83 93 176 38.6032286366029 49.7457799613967 -11.1425513247938 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0966357923480036 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460100:exon_131103591_131103822:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103352_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000475074:exon_131103518_131103685:IMP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 133539566 G/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000176771:ENST00000317721:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000409261:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000473859:exon_133539513_133539596:NCKAP5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C C T 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 27 30 57 12.5576767854009 16.047025793999 -3.48934900859801 T:C C T 10 0.534900859799965 0.356730540368800 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 0 0 131 131 0 70.0720126337954 -70.0720126337954 A G A 10 0.534900859799965 2.80844098522885e-44 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 173457692 A/T 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:T A T 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000152256:ENST00000282077:exon_173457663_173457776:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000392571:exon_173457663_173457776:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000410055:exon_173457663_173457776:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000466437:exon_173457663_173457776:PDK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 T:C T C 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 175213645 G/C 1 86 81 167 39.998526057203 43.3269696437972 -3.32844358659416 C:G G C 10 0.534900859799965 0.641829739241851 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175212749_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175212750_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175212878_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175213124_175213900:CIR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 175260355 G/T 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:G G T 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175260279_175260429:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175260279_175260443:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175260279_175260397:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175260279_175260412:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000461454:exon_175260279_175260434:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000472169:exon_175260279_175260437:CIR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 20 15 35 9.3019828040007 8.02351289699948 1.27846990700122 A:C A C 10 0.534900859799965 0.736183157362525 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 182395345 G/A 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 9 17 26 4.18589226180031 9.09331461659941 -4.90742235479909 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0749661638622606 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 9 2 11 4.18589226180031 1.06980171959993 3.11609054220038 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0725181354555253 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 A:G A G 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 T:G G T 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 A:T A T 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 187368733 G/A 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.204400293033589 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 191235901 A/C 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 A:C A C 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 A:T T A 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 33 30 63 15.3482716266012 16.047025793999 -0.698754167397798 T:C T C 10 0.534900859799965 0.899851113355488 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 14 15 29 6.51138796280049 8.02351289699948 -1.51212493419899 A:G A G 10 0.534900859799965 0.58268078856631 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 113 110 223 52.556202842604 58.8390945779962 -6.28289173539221 T:C T C 10 0.534900859799965 0.420714354319614 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G A G 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 C:G C G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 4 10 14 1.86039656080014 5.34900859799965 -3.48861203719951 A:C C A 10 0.534900859799965 0.104561526016219 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:C A C 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 20 18 38 9.3019828040007 9.62821547639937 -0.326232672398671 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 202010101 C/A 1 11 2 13 5.11609054220038 1.06980171959993 4.04628882260045 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0265929077015328 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000355558:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000342795:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000439154:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000462763:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202010101_202010155:CFLAR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 203157538 A/G 1 56 39 95 26.045551851202 20.8611335321986 5.18441831900332 A:G A G 10 0.534900859799965 0.304861179784066 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203157500_203157626:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203157500_203157626:NOP58 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 209108317 C/T 1 2 9 11 0.93019828040007 4.81410773819969 -3.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0298686862719098 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000441842:exon_209108151_209108328:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000454793:exon_209108211_209108328:IDH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 29 28 57 13.487875065801 14.977224074399 -1.48934900859801 C:G C G 10 0.534900859799965 0.693072717779301 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 A:T A T 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 9 2 11 4.18589226180031 1.06980171959993 3.11609054220038 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0725181354555253 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 219269183 A/G 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 A:G A G 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219269020_219269399:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219269020_219270664:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219269020_219269202:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219269020_219269202:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219269020_219269496:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219269020_219269310:CTDSP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 A:G G A 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220077739 T/G 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 T:G T G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220077730_220077787:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000497882:exon_220077730_220077787:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000295750:exon_220077730_220077787:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220077730_220077787:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220077730_220077787:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000492543:exon_220077730_220078142:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220077730_220077787:ATG9A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 20 15 35 9.3019828040007 8.02351289699948 1.27846990700122 T:C C T 10 0.534900859799965 0.736183157362525 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220371035 C/G 1 28 39 67 13.022775925601 20.8611335321986 -7.83835760659766 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0656155348262979 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220370976_220371709:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000480034:exon_220370976_220371416:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000496536:exon_220370976_220371144:GMPPA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 23 18 41 10.6972802246008 9.62821547639937 1.06906474820143 T:C C T 10 0.534900859799965 0.757106736378983 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 13 11 24 6.04628882260045 5.88390945779962 0.162379364800839 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 10 6 16 4.65099140200035 3.20940515879979 1.44158624320056 T:C T C 10 0.534900859799965 0.618079288529448 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 225343004 G/A 1 32 25 57 14.8831724864011 13.3725214949991 1.51065099140199 A:G G A 10 0.534900859799965 0.790866232656807 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225342917_225343062:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225342917_225343062:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000497715:exon_225342917_225344841:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000454323:exon_225342917_225343062:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225342917_225343062:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225342917_225343062:CUL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 109 95 204 50.6958062818038 50.8155816809967 -0.119775399192868 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 102 100 202 47.4401123004036 53.4900859799965 -6.04997367959295 A:G A G 10 0.534900859799965 0.398232144521945 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 40 36 76 18.6039656080014 19.2564309527987 -0.652465344797342 T:C C T 10 0.534900859799965 0.908785756329442 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 48 48 96 22.3247587296017 25.6752412703983 -3.35048254079665 A:G G A 10 0.534900859799965 0.539638064929369 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 18 22 40 8.37178452360063 11.7678189155992 -3.3960343919986 T:C C T 10 0.534900859799965 0.341860969847875 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 18 14 32 8.37178452360063 7.48861203719951 0.883172486401119 A:G G A 10 0.534900859799965 0.859901752609429 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 234749783 C/G 1 27 23 50 12.5576767854009 12.3027197753992 0.254957010001748 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 17 20 37 7.90668538340059 10.6980171959993 -2.79133181259871 T:C T C 10 0.534900859799965 0.411118319166261 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 15 14 29 6.97648710300052 7.48861203719951 -0.512124934198987 T:C T C 10 0.534900859799965 0.854754186847023 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 10 3 13 4.65099140200035 1.6047025793999 3.04628882260045 T:C T C 10 0.534900859799965 0.102499055737901 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 26 24 50 12.0925776452009 12.8376206351992 -0.745042989998254 A:G A G 10 0.534900859799965 0.887662698398602 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 20 11 31 9.3019828040007 5.88390945779962 3.41807334620108 A:T T A 10 0.534900859799965 0.280165126514015 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 44 23 67 20.4643621688015 12.3027197753992 8.16164239340234 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0499786113708436 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 5 11 16 2.32549570100017 5.88390945779962 -3.55841375679944 T:C T C 10 0.534900859799965 0.083617752253552 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 14 7 21 6.51138796280049 3.74430601859976 2.76708194420073 A:G A G 10 0.534900859799965 0.276723172652549 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 14 9 23 6.51138796280049 4.81410773819969 1.6972802246008 T:C T C 10 0.534900859799965 0.535478861923393 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 18 18 36 8.37178452360063 9.62821547639937 -1.25643095279874 T:C C T 10 0.534900859799965 0.739402622275745 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 78 55 133 36.2777329356027 29.4195472889981 6.85818564660465 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.258578283387156 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 41 28 69 19.0690647482014 14.977224074399 4.09184067380241 T:G T G 10 0.534900859799965 0.336982558668074 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 38 30 68 17.6737673276013 16.047025793999 1.62674153360238 A:G A G 10 0.534900859799965 0.716946367944537 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 20 26 46 9.3019828040007 13.9074223547991 -4.60543955079839 T:C C T 10 0.534900859799965 0.1855947653833 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 2774910 G/A 1 63 36 99 29.3012458326022 19.2564309527987 10.0448148798035 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0441987238772096 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 20 10 30 9.3019828040007 5.34900859799965 3.95297420600105 T:C T C 10 0.534900859799965 0.199470024042959 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 19 9 28 8.83688366380066 4.81410773819969 4.02277592560098 T:C T C 10 0.534900859799965 0.134704578990074 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G A G 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 6195753 T/C 0 14 0 14 6.51138796280049 0 6.51138796280049 T T 10 0.534900859799965 0.000179136886029545 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 6195833 G/A 0 23 0 23 10.6972802246008 0 10.6972802246008 G G 10 0.534900859799965 5.85282341994681e-07 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 16 27 43 7.44158624320056 14.4423232145991 -7.0007369713985 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0455962225023609 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 24944447 G/A 1 14 19 33 6.51138796280049 10.1631163361993 -3.65172837339885 A:G G A 10 0.534900859799965 0.224386952687450 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24943581_24944658:C20orf3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 A:G A G 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 30157026 A/G 1 153 103 256 71.1601684506054 55.0947885593964 16.065379891209 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0450628354409312 ENSG00000101294:ENST00000335574:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000340852:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000398174:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000376127:exon_30156923_30157345:HM13;ENSG00000101294:ENST00000492709:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000469097:exon_30156923_30157221:HM13;ENSG00000101294:ENST00000460389:exon_30156923_30157111:HM13;ENSG00000101294:ENST00000468559:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000493364:exon_30156923_30157055:HM13;ENSG00000101294:ENST00000487281:exon_30156923_30157370:HM13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:C T C 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 25 15 40 11.6274785050009 8.02351289699948 3.6039656080014 T:C C T 10 0.534900859799965 0.271154592020852 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 32256055 G/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000182584:ENST00000330271:exon_32254304_32256331:C20orf134 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 9 2 11 4.18589226180031 1.06980171959993 3.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0725181354555253 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 30 22 52 13.952974206001 11.7678189155992 2.18515529040182 T:C C T 10 0.534900859799965 0.580339545787034 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G A G 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 42320881 C/T 1 17 34 51 7.90668538340059 18.1866292331988 -10.2799438497982 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00462880397242112 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42320797_42320959:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42320797_42320959:MYBL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 25 39 64 11.6274785050009 20.8611335321986 -9.23365502719776 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0237127327079232 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 40 58 98 18.6039656080014 31.024249868398 -12.4202842603966 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0146848022305779 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 7 12 19 3.25569398140024 6.41881031759958 -3.16311633619934 A:G G A 10 0.534900859799965 0.170694653144372 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 T:C T C 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 44420637 G/A 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 9 1 10 4.18589226180031 0.534900859799965 3.65099140200035 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0245111317258062 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 44512638 G/T 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:G G T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 T:G T G 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G A G 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 8 13 21 3.72079312160028 6.95371117739955 -3.23291805579927 T:C T C 10 0.534900859799965 0.190792161249779 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 48522124 T/G 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 T:G T G 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 9 11 20 4.18589226180031 5.88390945779962 -1.6980171959993 A:G G A 10 0.534900859799965 0.505439553901546 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 54961463 T/C 1 14 8 22 6.51138796280049 4.27920687839972 2.23218108440077 T:C T C 10 0.534900859799965 0.396875058456915 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 55088404 A/G 1 31 20 51 14.4180733462011 10.6980171959993 3.72005615020178 A:G A G 10 0.534900859799965 0.327591753876983 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55088371_55088484:C20orf43 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 55982671 G/A 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 A:G G A 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000132819:ENST00000356208:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000440234:exon_55982599_55982769:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000342690:exon_55982599_55982832:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000344785:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000371219:exon_55982599_55982916:RBM38 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 7 12 19 3.25569398140024 6.41881031759958 -3.16311633619934 C:G C G 10 0.534900859799965 0.170694653144372 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 209 171 380 97.2057203018073 91.468047025794 5.73767327601328 A:G G A 10 0.534900859799965 0.571850571239465 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 60878783 C/G 1 81 71 152 37.6730303562028 37.9779610457975 -0.304930689594691 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000130706:ENST00000491935:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60878624_60878837:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60878314_60878837:ADRM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 1822 1652 3474 847.410633444464 883.656220389542 -36.2455869450786 T:C T C 10 0.534900859799965 0.220752252829658 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 43 1 44 19.9992630286015 0.534900859799965 19.4643621688015 A:C C A 10 0.534900859799965 4.65149255982968e-11 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 61537114 G/A 1 13 9 22 6.04628882260045 4.81410773819969 1.23218108440077 A:G G A 10 0.534900859799965 0.6725738608257 ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61536350_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61536355_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61536357_61537452:DIDO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 61538601 C/T 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61538499_61538711:DIDO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 61598731 C/T 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 T:C C T 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61598055_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61598689_61599949:SLC17A9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 0 16 0 16 7.44158624320056 0 7.44158624320056 A A 10 0.534900859799965 4.97074066684552e-05 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62192215 C/T 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000478861:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 13 21 34 6.04628882260045 11.2329180557993 -5.18662923319881 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0858795035292417 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 20 11 31 9.3019828040007 5.88390945779962 3.41807334620108 T:G G T 10 0.534900859799965 0.280165126514015 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 T:C C T 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 20 62641575 G/A 1 27 28 55 12.5576767854009 14.977224074399 -2.41954728899808 A:G G A 10 0.534900859799965 0.58916401807924 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62641553_62641671:PRPF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 15873026 T/C 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15872850_15873056:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15872850_15873056:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15872850_15873056:SAMSN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 33 33 66 15.3482716266012 17.6517283733988 -2.30345674679769 A:G G A 10 0.534900859799965 0.622227155880951 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 50 60 110 23.2549570100017 32.0940515879979 -8.83909457799616 T:C T C 10 0.534900859799965 0.103912233441431 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 19 17 36 8.83688366380066 9.09331461659941 -0.256430952798741 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 26978950 A/G 1 46 61 107 21.3945604492016 32.6289524477979 -11.2343919985963 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0327796789423127 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 30433876 C/T 1 36 160 196 16.7435690472013 85.5841375679944 -68.8405685207931 T:C C T 10 0.534900859799965 4.6789214843218e-24 ENSG00000156261:ENST00000389159:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000286788:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000470450:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000496121:exon_30433817_30433888:CCT8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 34924228 G/A 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 A:G G A 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 25 9 34 11.6274785050009 4.81410773819969 6.81337076680119 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0241703848153672 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 T:C T C 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 37445039 G/A 1 77 59 136 35.8126337954027 31.5591507281979 4.25348306720475 A:G G A 10 0.534900859799965 0.492282756910285 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 42748935 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 107 114 221 49.7656080014037 60.978698017196 -11.2130900157923 T:C C T 10 0.534900859799965 0.138036144756455 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 232 233 465 107.903000526408 124.631900333392 -16.7288998069837 A:G G A 10 0.534900859799965 0.125029948307067 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 225 184 409 104.647306545008 98.4217582031936 6.2255483418143 T:C T C 10 0.534900859799965 0.552201536203858 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 42824733 G/A 1 283 267 550 131.62305667661 142.818529566591 -11.1954728899807 A:G G A 10 0.534900859799965 0.347169233370809 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 44273691 G/A 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 44283574 C/T 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44283550_44283706:WDR4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 30 46 76 13.952974206001 24.6054395507984 -10.6524653447973 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0155857052272275 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 36 32 68 16.7435690472013 17.1168275135989 -0.373258466397623 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 44485350 G/A 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G G A 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485313_44485382:CBS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 45173480 C/T 1 80 81 161 37.2079312160028 43.3269696437972 -6.11903842779437 T:C C T 10 0.534900859799965 0.343892065533689 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000461123:exon_45173464_45173600:PDXK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 25 24 49 11.6274785050009 12.8376206351992 -1.21014213019829 T:C T C 10 0.534900859799965 0.775486116170348 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 19 19 38 8.83688366380066 10.1631163361993 -1.32623267239867 T:C T C 10 0.534900859799965 0.745743523336367 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 T:C T C 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 8 19 27 3.72079312160028 10.1631163361993 -6.44232321459906 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0189104044957662 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 9 6 15 4.18589226180031 3.20940515879979 0.976487103000524 A:G A G 10 0.534900859799965 0.796973056882962 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 19122665 C/T 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19122573_19122688:DGCR14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 102 96 198 47.4401123004036 51.3504825407966 -3.91037024039309 A:G G A 10 0.534900859799965 0.61812248389414 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 13 8 21 6.04628882260045 4.27920687839972 1.76708194420073 A:C C A 10 0.534900859799965 0.515435550872733 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 12 8 20 5.58118968240042 4.27920687839972 1.3019828040007 A:G G A 10 0.534900859799965 0.656764655580921 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 19951816 C/T 1 48 36 84 22.3247587296017 19.2564309527987 3.06832777680293 T:C C T 10 0.534900859799965 0.514034407037932 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951691_19953168:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951633_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951691_19951822:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951691_19951823:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951691_19951822:COMT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 15 10 25 6.97648710300052 5.34900859799965 1.62747850500087 A:G A G 10 0.534900859799965 0.553545164136958 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 23055533 G/A 1 16 1 17 7.44158624320056 0.534900859799965 6.90668538340059 A:G G A 10 0.534900859799965 0.000424963808142089 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 23055539 G/T 1 17 1 18 7.90668538340059 0.534900859799965 7.37178452360063 T:G G T 10 0.534900859799965 0.00023648105919051 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 23223278 A/T 0 0 41 41 0 21.9309352517986 -21.9309352517986 T A T 10 0.534900859799965 2.34081452168388e-14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 23223395 G/C 0 25 0 25 11.6274785050009 0 11.6274785050009 G G 10 0.534900859799965 3.0626518117006e-07 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 71 56 127 33.0220389542025 29.954448148798 3.06759080540444 A:G G A 10 0.534900859799965 0.59496081438196 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 22 13 35 10.2321810844008 6.95371117739955 3.27846990700122 A:G G A 10 0.534900859799965 0.310949772680357 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 346 297 643 160.924302509212 158.86555536059 2.05874714862247 T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.874457657527655 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 3 6 9 1.3952974206001 3.20940515879979 -1.81410773819969 T:C C T 10 0.534900859799965 0.319384848646534 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 26884141 G/A 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 12 15 27 5.58118968240042 8.02351289699948 -2.44232321459906 A:G G A 10 0.534900859799965 0.440946669159051 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 T:G G T 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 12 15 27 5.58118968240042 8.02351289699948 -2.44232321459906 T:C C T 10 0.534900859799965 0.440946669159051 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 4 13 17 1.86039656080014 6.95371117739955 -5.09331461659941 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0148874083183578 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 24 26 50 11.1623793648008 13.9074223547991 -2.74504298999825 T:C T C 10 0.534900859799965 0.479687248825698 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 A:G G A 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 31854630 A/G 1 9 3 12 4.18589226180031 1.6047025793999 2.58118968240042 A:G A G 10 0.534900859799965 0.157743408538479 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31854461_31854636:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31854461_31854636:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31854461_31854636:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31854461_31854636:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31854461_31854636:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31854461_31854636:EIF4ENIF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 A:G A G 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 13 8 21 6.04628882260045 4.27920687839972 1.76708194420073 T:C T C 10 0.534900859799965 0.515435550872733 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 61 68 129 28.3710475522021 36.3732584663976 -8.00221091419549 T:C T C 10 0.534900859799965 0.159159492802203 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 33 35 68 15.3482716266012 18.7215300929988 -3.37325846639762 T:C C T 10 0.534900859799965 0.466146497126031 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 17 16 33 7.90668538340059 8.55841375679944 -0.651728373398846 A:G G A 10 0.534900859799965 0.862612432859578 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 32 27 59 14.8831724864011 14.4423232145991 0.440849271802062 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 7 16 23 3.25569398140024 8.55841375679944 -5.3027197753992 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0349785538694263 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 12 11 23 5.58118968240042 5.88390945779962 -0.302719775399196 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 36657740 G/A 1 16 7 23 7.44158624320056 3.74430601859976 3.6972802246008 A:G G A 10 0.534900859799965 0.145235097348435 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000439680:exon_36657642_36657745:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36657642_36657768:APOL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 17 11 28 7.90668538340059 5.88390945779962 2.02277592560098 A:G G A 10 0.534900859799965 0.570625342030966 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 36661691 G/A 1 43 29 72 19.9992630286015 15.512124934199 4.48713809440252 A:G G A 10 0.534900859799965 0.34467718561569 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 36661891 G/A 1 38 25 63 17.6737673276013 13.3725214949991 4.3012458326022 A:G G A 10 0.534900859799965 0.313062901152023 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 108 101 209 50.2307071416038 54.0249868397965 -3.7942796981927 A:G A G 10 0.534900859799965 0.627606348058336 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 53 41 94 24.6502544306019 21.9309352517986 2.71931917880329 T:C T C 10 0.534900859799965 0.606157996437594 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 37524092 G/A 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 A:G G A 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 45 51 96 20.9294613090016 27.2799438497982 -6.35048254079664 T:C C T 10 0.534900859799965 0.219504075213064 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 1 10 11 0.465099140200035 5.34900859799965 -4.88390945779962 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0040328595620032 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 12 11 23 5.58118968240042 5.88390945779962 -0.302719775399196 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:C T C 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39147235 A/C 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 A:C A C 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417595:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000438058:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000456894:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000480307:exon_39147215_39147446:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000420859:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000452294:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000494273:exon_39146903_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000433561:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417332:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000439339:exon_39147215_39147378:SUN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 11 3 14 5.11609054220038 1.6047025793999 3.51138796280049 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0657480420080034 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 4 9 13 1.86039656080014 4.81410773819969 -2.95371117739955 A:C C A 10 0.534900859799965 0.162107674100002 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 41 49 90 19.0690647482014 26.2101421301983 -7.14107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.139686591258067 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 11 14 25 5.11609054220038 7.48861203719951 -2.37252149499913 C:G G C 10 0.534900859799965 0.423546813818574 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 C:G G C 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 21 9 30 9.76708194420073 4.81410773819969 4.95297420600105 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0979337289113688 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 136 151 287 63.2534830672048 80.7700298297947 -17.51654676259 A:C A C 10 0.534900859799965 0.038505751677544 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 39917960 A/T 1 433 431 864 201.387927706615 230.542270573785 -29.1543428671698 A:T:C A T 10 0.534900859799965 0.0479284258073638 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917778_39918691:ATF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 41652250 C/T 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652195_41652294:RANGAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 13 19 32 6.04628882260045 10.1631163361993 -4.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.158790444964849 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 368 341 709 171.156483593613 182.401193191788 -11.2447095981752 T:G G T 10 0.534900859799965 0.407615819227727 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 C:G G C 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42336172 G/A 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42336143_42336223:CENPM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C C T 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 143 110 253 66.509177048605 58.8390945779962 7.67008247060884 A:G G A 10 0.534900859799965 0.344976636672518 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42486736 C/A 1 132 108 240 61.3930865064046 57.7692928583962 3.62379364800839 A:T:C:G C A 10 0.534900859799965 0.651126083970057 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 58 60 118 26.975750131602 32.0940515879979 -5.11830145639588 T:G G T 10 0.534900859799965 0.357183253476745 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 121 88 209 56.2769959642042 47.0712756623969 9.20572030180731 T:C C T 10 0.534900859799965 0.212303576888237 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 43010817 G/A 1 11 4 15 5.11609054220038 2.13960343919986 2.97648710300052 A:G G A 10 0.534900859799965 0.194126412933295 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 43195134 C/T 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 22 16 38 10.2321810844008 8.55841375679944 1.67376732760133 C:G G C 10 0.534900859799965 0.628553929911279 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 80 85 165 37.2079312160028 45.466573082997 -8.25864186699423 A:G A G 10 0.534900859799965 0.211942444018868 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 15 7 22 6.97648710300052 3.74430601859976 3.23218108440077 A:G A G 10 0.534900859799965 0.20199553699413 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 25 25 50 11.6274785050009 13.3725214949991 -1.74504298999825 T:C T C 10 0.534900859799965 0.671649142159012 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 29 27 56 13.487875065801 14.4423232145991 -0.954448148798043 A:G A G 10 0.534900859799965 0.893592443840493 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 36 40 76 16.7435690472013 21.3960343919986 -4.65246534479734 A:C A C 10 0.534900859799965 0.302021791923788 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 58 52 110 26.975750131602 27.8148447095982 -0.839094577996157 C:G G C 10 0.534900859799965 0.92393308034552 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 11 20 31 5.11609054220038 10.6980171959993 -5.58192665379892 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0485520006074899 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 A:G A G 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 29 18 47 13.487875065801 9.62821547639937 3.85965958940164 T:C C T 10 0.534900859799965 0.306561447999631 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 19 9 28 8.83688366380066 4.81410773819969 4.02277592560098 C:G G C 10 0.534900859799965 0.134704578990074 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 33 48 81 15.3482716266012 25.6752412703983 -10.3269696437972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0254290422615216 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 4878595 C/A 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000478515:exon_4878458_4878632:ITPR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 13 17 30 6.04628882260045 9.09331461659941 -3.04702579399895 T:C:G C G 10 0.534900859799965 0.277837924956057 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 9827059 C/T 1 36 23 59 16.7435690472013 12.3027197753992 4.44084927180206 T:C C T 10 0.534900859799965 0.296505786843733 ENSG00000171148:ENST00000301964:exon_9827000_9827109:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000492103:exon_9827000_9827109:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000440161:exon_9827000_9827109:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000343450:exon_9827000_9827109:TADA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 35 27 62 16.2784699070012 14.4423232145991 1.83614669240217 T:C T C 10 0.534900859799965 0.703192315015598 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 23 26 49 10.6972802246008 13.9074223547991 -3.21014213019829 T:C C T 10 0.534900859799965 0.391760901172081 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 9 6 15 4.18589226180031 3.20940515879979 0.976487103000524 C:G C G 10 0.534900859799965 0.796973056882962 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 13 4 17 6.04628882260045 2.13960343919986 3.90668538340059 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0860716495303256 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G G A 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 14199908 C/T 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 T:C C T 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 15297570 C/T 1 10 6 16 4.65099140200035 3.20940515879979 1.44158624320056 T:C C T 10 0.534900859799965 0.618079288529448 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15296357_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15296360_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000412806:exon_15296511_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15297096_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15297096_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15297157_15297810:SH3BP5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 102 99 201 47.4401123004036 52.9551851201965 -5.51507281979298 T:C T C 10 0.534900859799965 0.437727695640507 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 52 64 116 24.1851552904018 34.2336550271978 -10.0484997367959 A:C A C 10 0.534900859799965 0.063155967465605 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 25792697 C/A 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:C C A 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000151092:ENST00000428257:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000422724:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280700:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000493324:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000396649:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000308710:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280699:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000417874:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000427041:exon_25792672_25792754:NGLY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 25833320 A/G 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G A G 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25833261_25833488:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000449808:exon_25833261_25833332:OXSM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 25835983 T/C 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 T:C T C 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25835583_25836025:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25835583_25836014:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000420173:exon_25835583_25836025:OXSM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 27424718 A/G 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000465487:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27424644_27424741:SLC4A7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 A:G G A 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 33907915 A/G 1 27 22 49 12.5576767854009 11.7678189155992 0.789857869801713 A:G A G 10 0.534900859799965 0.886591801539746 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 24 23 47 11.1623793648008 12.3027197753992 -1.14034041059836 A:G A G 10 0.534900859799965 0.771309429321598 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 C:G G C 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 38168125 A/C 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 A:C A C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 19 15 34 8.83688366380066 8.02351289699948 0.813370766801189 T:C T C 10 0.534900859799965 0.864214966378732 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 A:G A G 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 43602803 C/T 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43602712_43602894:ANO10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 44881909 A/G 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G A G 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44881889_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44881847_44881948:KIF15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 45017782 A/G 1 25 42 67 11.6274785050009 22.4658361115985 -10.8383576065977 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00967646555307546 ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45017722_45017826:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000467846:exon_45017743_45017826:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45017743_45017826:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45017756_45017826:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000481405:exon_45017768_45017826:EXOSC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 67 76 143 31.1616423934023 40.6524653447973 -9.490822951395 C:G G C 10 0.534900859799965 0.131027572317238 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 C:G C G 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:G G A 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G G A 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 A:G G A 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 49053219 A/G 1 147 95 242 68.3695736094051 50.8155816809967 17.5539919284085 A:C:G A G 10 0.534900859799965 0.0241170123567447 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000354294:exon_49053187_49053261:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49052958_49053773:DALRD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 49136849 T/C 1 109 90 199 50.6958062818038 48.1410773819969 2.55472889980696 T:C T C 10 0.534900859799965 0.723068826424311 ENSG00000172053:ENST00000453392:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482468:exon_49136775_49136864:QARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 34 29 63 15.8133707668012 15.512124934199 0.301245832602202 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 19 19 38 8.83688366380066 10.1631163361993 -1.32623267239867 T:C T C 10 0.534900859799965 0.745743523336367 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 50369546 C/A 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50369481_50369597:RASSF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 28 25 53 13.022775925601 13.3725214949991 -0.349745569398149 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 6 10 16 2.79059484120021 5.34900859799965 -2.55841375679944 T:C C T 10 0.534900859799965 0.219183186864788 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C C T 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 34 30 64 15.8133707668012 16.047025793999 -0.233655027197763 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 35 42 77 16.2784699070012 22.4658361115985 -6.18736620459731 A:G G A 10 0.534900859799965 0.171002405351314 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 25 22 47 11.6274785050009 11.7678189155992 -0.140340410598357 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 53226207 C/T 1 62 41 103 28.8361466924022 21.9309352517986 6.9052114406036 T:C C T 10 0.534900859799965 0.198986659333460 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53226124_53226733:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53226124_53226570:PRKCD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 A:C A C 10 0.534900859799965 0.638786412185127 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 20 19 39 9.3019828040007 10.1631163361993 -0.861133532198636 T:C T C 10 0.534900859799965 0.872808227244349 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 T:C C T 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 23 21 44 10.6972802246008 11.2329180557993 -0.535637831198461 T:C C T 10 0.534900859799965 0.881084382056806 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 62317005 A/G 1 11 1 12 5.11609054220038 0.534900859799965 4.58118968240042 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00778954819080089 ENSG00000114405:ENST00000462069:exon_62317000_62317074:C3orf14;ENSG00000114405:ENST00000232519:exon_62317000_62317074:C3orf14;ENSG00000114405:ENST00000465142:exon_62317000_62317010:C3orf14;ENSG00000114405:ENST00000494481:exon_62317000_62317074:C3orf14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G A G 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 67451197 G/A 1 12 6 18 5.58118968240042 3.20940515879979 2.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.346220682106825 ENSG00000172340:ENST00000493112:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67451155_67451275:SUCLG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 9 3 12 4.18589226180031 1.6047025793999 2.58118968240042 T:C T C 10 0.534900859799965 0.157743408538479 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 62 33 95 28.8361466924022 17.6517283733988 11.1844183190033 A:C C A 10 0.534900859799965 0.0233937165119499 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 23 23 46 10.6972802246008 12.3027197753992 -1.60543955079839 A:G G A 10 0.534900859799965 0.659746286966469 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 24 20 44 11.1623793648008 10.6980171959993 0.464362168801538 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 A:G A G 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 A:T A T 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 C:G G C 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 14 6 20 6.51138796280049 3.20940515879979 3.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 0.179206254010548 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 119327670 G/A 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 119336918 C/T 1 15 9 24 6.97648710300052 4.81410773819969 2.16237936480084 T:C C T 10 0.534900859799965 0.418803008714874 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119336866_119337033:PLA1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 119338444 G/A 1 26 14 40 12.0925776452009 7.48861203719951 4.6039656080014 A:G G A 10 0.534900859799965 0.156280314092502 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119338410_119338499:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119338410_119338499:PLA1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 119347623 C/A 1 10 14 24 4.65099140200035 7.48861203719951 -2.83762063519916 A:C C A 10 0.534900859799965 0.307000307671416 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119347548_119347712:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119347548_119347712:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119347548_119347712:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119347548_119347712:PLA1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 117 96 213 54.4165994034041 51.3504825407966 3.06611686260744 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.680967944100163 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 89 88 177 41.3938234778031 47.0712756623969 -5.67745218459381 T:C T C 10 0.534900859799965 0.407729501528318 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121363680 C/T 1 59 55 114 27.4408492718021 29.4195472889981 -1.97869801719602 T:C C T 10 0.534900859799965 0.708588033458421 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121363077_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121363665_121363775:HCLS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121415540 T/C 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 T:C T C 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 A:G G A 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 17 12 29 7.90668538340059 6.41881031759958 1.48787506580101 T:C C T 10 0.534900859799965 0.710420465234456 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121507231 A/T 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 A:T A T 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121507131_121507279:IQCB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 121825197 G/A 1 28 24 52 13.022775925601 12.8376206351992 0.185155290401816 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121825045_121825347:CD86 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 122354895 T/C 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 T:C T C 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 122437236 A/C 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 A:C A C 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000474669:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398157:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000475640:exon_122437231_122437805:PARP14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 122880191 T/C 1 4 10 14 1.86039656080014 5.34900859799965 -3.48861203719951 T:C T C 10 0.534900859799965 0.104561526016219 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 17 12 29 7.90668538340059 6.41881031759958 1.48787506580101 A:G A G 10 0.534900859799965 0.710420465234456 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 9 9 18 4.18589226180031 4.81410773819969 -0.628215476399371 A:G A G 10 0.534900859799965 0.816280727493184 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 127327309 G/A 1 13 13 26 6.04628882260045 6.95371117739955 -0.907422354799092 A:G G A 10 0.534900859799965 0.844673236061777 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127327225_127327359:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127327225_127327359:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127327225_127327359:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127327225_127327359:MCM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 127540635 C/T 1 11 16 27 5.11609054220038 8.55841375679944 -3.44232321459906 T:C C T 10 0.534900859799965 0.246638261233095 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000479967:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000494830:exon_127540537_127540681:MGLL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 33 24 57 15.3482716266012 12.8376206351992 2.51065099140199 T:C C T 10 0.534900859799965 0.595738720055528 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 20 15 35 9.3019828040007 8.02351289699948 1.27846990700122 C:G C G 10 0.534900859799965 0.736183157362525 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 28 37 65 13.022775925601 19.7913318125987 -6.76855588699773 T:C C T 10 0.534900859799965 0.105832046444265 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 129023630 G/A 1 23 30 53 10.6972802246008 16.047025793999 -5.34974556939815 A:G G A 10 0.534900859799965 0.168218713586259 ENSG00000183624:ENST00000383463:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000417226:exon_129023432_129024136:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000502878:exon_129023432_129024146:C3orf37;ENSG00000183624:ENST00000389735:exon_129023432_129024105:C3orf37 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 13 9 22 6.04628882260045 4.81410773819969 1.23218108440077 A:T:G A G 10 0.534900859799965 0.6725738608257 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 133327457 T/C 1 13 19 32 6.04628882260045 10.1631163361993 -4.11682751359888 T:C T C 10 0.534900859799965 0.158790444964849 ENSG00000163781:ENST00000503338:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000503464:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133327379_133327540:TOPBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 138347957 G/A 1 10 12 22 4.65099140200035 6.41881031759958 -1.76781891559923 A:G G A 10 0.534900859799965 0.523916670285833 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 15 14 29 6.97648710300052 7.48861203719951 -0.512124934198987 T:C T C 10 0.534900859799965 0.854754186847023 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 T:C C T 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 10 5 15 4.65099140200035 2.67450429899983 1.97648710300052 T:G T G 10 0.534900859799965 0.438831218782805 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 C:G C G 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 42 36 78 19.5341638884015 19.2564309527987 0.277732935602728 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 T:C T C 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 17 27 44 7.90668538340059 14.4423232145991 -6.53563783119846 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0505673539309683 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 62 41 103 28.8361466924022 21.9309352517986 6.9052114406036 T:C C T 10 0.534900859799965 0.198986659333460 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 39 23 62 18.1388664678014 12.3027197753992 5.83614669240217 A:C A C 10 0.534900859799965 0.161261216106933 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 9 12 21 4.18589226180031 6.41881031759958 -2.23291805579927 T:G T G 10 0.534900859799965 0.38467997649197 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 T:C T C 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 183899832 C/T 1 64 64 128 29.7663449728022 34.2336550271978 -4.46731005439553 T:C C T 10 0.534900859799965 0.47856621539998 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000432591:exon_183899700_183899842:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000476434:exon_183899700_183899868:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000463935:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000480260:exon_183899407_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000442686:exon_183899803_183899835:AP2M1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 183901281 G/A 1 74 61 135 34.4173363748026 32.6289524477979 1.78838392700472 A:G G A 10 0.534900859799965 0.796058908739427 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183901270_183901450:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183901270_183901836:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183901270_183901853:AP2M1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 6 11 17 2.79059484120021 5.88390945779962 -3.09331461659941 A:G A G 10 0.534900859799965 0.149930482845447 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 16 21 37 7.44158624320056 11.2329180557993 -3.79133181259871 A:G A G 10 0.534900859799965 0.249229353496715 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 1 459 9 468 213.480505351816 4.81410773819969 208.666397613616 A:T:G G T 10 0.534900859799965 6.05480603787167e-110 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 90 95 185 41.8589226180031 50.8155816809967 -8.95665906299353 A:G A G 10 0.534900859799965 0.210116903098539 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 186507757 G/A 1 116 102 218 53.9515002632041 54.5598876995964 -0.608387436392384 A:G G A 10 0.534900859799965 0.94595333285499 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186507669_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186507681_186508195:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186507684_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186507689_186507853:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186507692_186507849:RFC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 T:C C T 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:C C A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 16 10 26 7.44158624320056 5.34900859799965 2.09257764520091 A:C C A 10 0.534900859799965 0.438883119655303 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 30 27 57 13.952974206001 14.4423232145991 -0.489349008598008 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.895345254293575 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 193372687 A/G 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:G A G 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193372651_193372816:OPA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 193385047 C/T 1 13 5 18 6.04628882260045 2.67450429899983 3.37178452360063 T:C C T 10 0.534900859799965 0.155293602908341 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000445863:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000429164:exon_193384965_193385069:OPA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 195269901 G/C 1 31 23 54 14.4180733462011 12.3027197753992 2.11535357080189 C:G G C 10 0.534900859799965 0.588097820676093 ENSG00000184203:ENST00000328432:exon_195269727_195270209:PPP1R2;ENSG00000184203:ENST00000438848:exon_195269727_195270176:PPP1R2;ENSG00000184203:ENST00000413183:exon_195269727_195269981:PPP1R2;ENSG00000184203:ENST00000462906:exon_195269727_195270209:PPP1R2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 196199246 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 7 19 26 3.25569398140024 10.1631163361993 -6.90742235479909 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00927694056826081 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 196544948 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196544928_196545027:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000426668:exon_196544928_196545027:PAK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 16 8 24 7.44158624320056 4.27920687839972 3.16237936480084 T:C T C 10 0.534900859799965 0.223650470019122 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 9 3 12 4.18589226180031 1.6047025793999 2.58118968240042 A:G A G 10 0.534900859799965 0.157743408538479 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 197427696 C/T 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 T:C C T 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 11 5 16 5.11609054220038 2.67450429899983 2.44158624320056 A:G A G 10 0.534900859799965 0.316685870393005 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 862363 C/A 1 10 12 22 4.65099140200035 6.41881031759958 -1.76781891559923 A:C C A 10 0.534900859799965 0.523916670285833 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_862327_863745:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_862327_862473:GAK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 35 44 79 16.2784699070012 23.5356378311985 -7.25716792419724 A:G G A 10 0.534900859799965 0.114279770308753 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 65 50 115 30.2314441130023 26.7450429899983 3.48640112300402 A:G G A 10 0.534900859799965 0.57508680759138 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 69 47 116 32.0918406738024 25.1403404105984 6.95150026320405 A:G G A 10 0.534900859799965 0.226165683160344 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 72 59 131 33.4871380944025 31.5591507281979 1.92798736620458 A:G A G 10 0.534900859799965 0.792895386589809 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 31 25 56 14.4180733462011 13.3725214949991 1.04555185120196 A:G G A 10 0.534900859799965 0.790790293219989 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 21 22 43 9.76708194420073 11.7678189155992 -2.0007369713985 T:C C T 10 0.534900859799965 0.545460475519101 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 1843324 C/T 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000505551:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000466175:exon_1843074_1843524:LETM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 41 31 72 19.0690647482014 16.5819266537989 2.48713809440252 A:G G A 10 0.534900859799965 0.636851672125707 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 34 24 58 15.8133707668012 12.8376206351992 2.97575013160203 T:G G T 10 0.534900859799965 0.510840098378605 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 20 17 37 9.3019828040007 9.09331461659941 0.208668187401294 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 21 12 33 9.76708194420073 6.41881031759958 3.34827162660115 T:C T C 10 0.534900859799965 0.295884388540374 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 21 16 37 9.76708194420073 8.55841375679944 1.20866818740129 A:G A G 10 0.534900859799965 0.74361468538109 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 3231661 G/A 1 14 9 23 6.51138796280049 4.81410773819969 1.6972802246008 A:G G A 10 0.534900859799965 0.535478861923393 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 54 51 105 25.1153535708019 27.2799438497982 -2.16459027899633 A:G A G 10 0.534900859799965 0.69625945109108 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 38 20 58 17.6737673276013 10.6980171959993 6.97575013160203 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0861667492545971 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 5830393 C/T 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 T:C C T 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 33 48 81 15.3482716266012 25.6752412703983 -10.3269696437972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0254290422615216 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 T:C T C 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 C:G G C 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 39 33 72 18.1388664678014 17.6517283733988 0.487138094402518 A:T A T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 19 22 41 8.83688366380066 11.7678189155992 -2.93093525179857 A:G G A 10 0.534900859799965 0.434169124689964 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 86 76 162 39.998526057203 40.6524653447973 -0.653939287594334 T:C T C 10 0.534900859799965 0.937330416968212 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 10 16 26 4.65099140200035 8.55841375679944 -3.90742235479909 T:C T C 10 0.534900859799965 0.167755747456869 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 35 47 82 16.2784699070012 25.1403404105984 -8.86187050359713 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0593051440444994 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 22 24 46 10.2321810844008 12.8376206351992 -2.60543955079839 T:C T C 10 0.534900859799965 0.462867241313852 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 14 23 37 6.51138796280049 12.3027197753992 -5.79133181259871 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0690766182739774 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38775794 A/G 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 A:G A G 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 15 2 17 6.97648710300052 1.06980171959993 5.90668538340059 A:T A T 10 0.534900859799965 0.00560283142039811 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 16 6 22 7.44158624320056 3.20940515879979 4.23218108440077 T:G T G 10 0.534900859799965 0.087084332637703 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 38995374 T/C 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 T T 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 15 11 26 6.97648710300052 5.88390945779962 1.09257764520091 T:C C T 10 0.534900859799965 0.699226755009291 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 43 35 78 19.9992630286015 18.7215300929988 1.27773293560273 A:G A G 10 0.534900859799965 0.820892316751216 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 12 9 21 5.58118968240042 4.81410773819969 0.767081944200734 A:G G A 10 0.534900859799965 0.82864894485234 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 37 30 67 17.2086681874013 16.047025793999 1.16164239340234 T:C C T 10 0.534900859799965 0.807508688326605 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 21 19 40 9.76708194420073 10.1631163361993 -0.396034391998601 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 15 13 28 6.97648710300052 6.95371117739955 0.0227759256009783 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 76730195 A/G 1 17 10 27 7.90668538340059 5.34900859799965 2.55767678540094 A:G A G 10 0.534900859799965 0.342634151627529 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76730106_76730204:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76730106_76730204:USO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 33 30 63 15.3482716266012 16.047025793999 -0.698754167397798 A:G G A 10 0.534900859799965 0.899851113355488 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 37 38 75 17.2086681874013 20.3262326723987 -3.11756448499738 C:G G C 10 0.534900859799965 0.489051466591084 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 77977235 T/C 1 26 27 53 12.0925776452009 14.4423232145991 -2.34974556939815 T:C T C 10 0.534900859799965 0.582397226184833 ENSG00000118816:ENST00000237654:exon_77977115_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000506614:exon_77977115_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000511943:exon_77977115_77977253:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000505609:exon_77977197_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000504697:exon_77977218_77977255:CCNI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 79103004 G/A 0 57 0 57 26.510650991402 0 26.510650991402 G G 10 0.534900859799965 5.69150981877598e-16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 13 24 37 6.04628882260045 12.8376206351992 -6.79133181259871 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0312184257383617 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 104067195 T/C 1 24 23 47 11.1623793648008 12.3027197753992 -1.14034041059836 T:C:G T C 10 0.534900859799965 0.771309429321598 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 21 19 40 9.76708194420073 10.1631163361993 -0.396034391998601 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 104104006 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104103919_104104048:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104103919_104104048:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104103919_104104048:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104103919_104104048:CENPE HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 110603891 T/C 1 35 45 80 16.2784699070012 24.0705386909984 -7.7920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0924501576303404 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 219 247 466 101.856711703808 132.120512370591 -30.2638006667837 A:T A T 10 0.534900859799965 0.00529325360837707 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 35 41 76 16.2784699070012 21.9309352517986 -5.65246534479734 A:G A G 10 0.534900859799965 0.2069270664632 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 122735142 A/G 1 83 68 151 38.6032286366029 36.3732584663976 2.22997017020528 A:G A G 10 0.534900859799965 0.744610929370477 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000509980:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122735021_122737602:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000511132:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503139:exon_122734910_122735782:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122734910_122735202:EXOSC9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 140 154 294 65.1138796280049 82.3747324091946 -17.2608527811897 A:C:G G C 10 0.534900859799965 0.0467452103725927 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 12 20 32 5.58118968240042 10.6980171959993 -5.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0774740406938111 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 129867280 T/A 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:T T A 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 378 1 379 175.807474995613 0.534900859799965 175.272574135813 A:G G A 10 0.534900859799965 3.70184138668185e-101 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 140213698 A/G 1 63 67 130 29.3012458326022 35.8383576065977 -6.53711177399546 A:G A G 10 0.534900859799965 0.25439451911907 ENSG00000109390:ENST00000503997:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000394228:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000505036:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000265500:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000394225:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000503453:exon_140213684_140213763:NDUFC1;ENSG00000109390:ENST00000394223:exon_140213684_140213763:NDUFC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 8 5 13 3.72079312160028 2.67450429899983 1.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.593153785600142 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 151199080 G/A 1 1 8 9 0.465099140200035 4.27920687839972 -3.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0151440948330184 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 154553973 G/A 1 39 22 61 18.1388664678014 11.7678189155992 6.37104755220213 A:G G A 10 0.534900859799965 0.123027163196623 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154553870_154553990:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 40 48 88 18.6039656080014 25.6752412703983 -7.07127566239692 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.135746507891505 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 33 41 74 15.3482716266012 21.9309352517986 -6.58266362519741 A:T:C:G A C 10 0.534900859799965 0.130973356453400 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 35 27 62 16.2784699070012 14.4423232145991 1.83614669240217 T:C T C 10 0.534900859799965 0.703192315015598 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 T:G G T 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 177243366 G/T 1 20 7 27 9.3019828040007 3.74430601859976 5.55767678540094 T:G G T 10 0.534900859799965 0.0342817652012194 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177243321_177243396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177243321_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177243321_177243394:SPCS3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 10 5 15 4.65099140200035 2.67450429899983 1.97648710300052 A:G A G 10 0.534900859799965 0.438831218782805 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 12 16 28 5.58118968240042 8.55841375679944 -2.97722407439902 A:C C A 10 0.534900859799965 0.343711612917152 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 12 15 27 5.58118968240042 8.02351289699948 -2.44232321459906 T:G T G 10 0.534900859799965 0.440946669159051 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 14 9 23 6.51138796280049 4.81410773819969 1.6972802246008 T:C T C 10 0.534900859799965 0.535478861923393 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 19 9 28 8.83688366380066 4.81410773819969 4.02277592560098 A:G A G 10 0.534900859799965 0.134704578990074 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 T:C T C 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 186320880 A/G 1 30 45 75 13.952974206001 24.0705386909984 -10.1175644849974 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0205605663752551 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 4 186320906 C/G 1 41 52 93 19.0690647482014 27.8148447095982 -8.74577996139675 C:G C G 10 0.534900859799965 0.077053777937522 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 20 17 37 9.3019828040007 9.09331461659941 0.208668187401294 A:C:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 205574 G/A 1 16 18 34 7.44158624320056 9.62821547639937 -2.18662923319881 A:G G A 10 0.534900859799965 0.494266102270786 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 226090 C/T 1 20 20 40 9.3019828040007 10.6980171959993 -1.3960343919986 A:T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.751759422506709 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 231042 C/T 1 33 35 68 15.3482716266012 18.7215300929988 -3.37325846639762 T:C C T 10 0.534900859799965 0.466146497126031 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 235364 C/T 1 39 33 72 18.1388664678014 17.6517283733988 0.487138094402518 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G G A 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 6604288 T/C 1 20 20 40 9.3019828040007 10.6980171959993 -1.3960343919986 T:C T C 10 0.534900859799965 0.751759422506709 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6603982_6604389:NSUN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 10282396 A/G 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G A G 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000164237:ENST00000503834:exon_10282309_10282400:CMBL;ENSG00000164237:ENST00000296658:exon_10282309_10282400:CMBL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 14681593 G/T 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 T:G G T 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 46 47 93 21.3945604492016 25.1403404105984 -3.74577996139675 A:G G A 10 0.534900859799965 0.467505009162468 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 34945122 A/G 1 37 40 77 17.2086681874013 21.3960343919986 -4.18736620459731 A:G A G 10 0.534900859799965 0.361874947513933 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000514237:exon_34944972_34945130:DNAJC21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 34954079 C/G 1 31 37 68 14.4180733462011 19.7913318125987 -5.37325846639762 C:G C G 10 0.534900859799965 0.224006023729597 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000506762:exon_34954031_34954296:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000509626:exon_34953631_34954106:DNAJC21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 37299049 C/T 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C C T 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37298970_37299080:NUP155 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 43656024 T/C 1 1 7 8 0.465099140200035 3.74430601859976 -3.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0290370039235518 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 43700242 A/G 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G A G 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43700221_43700339:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43700221_43700339:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43700221_43700339:NNT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 52394407 T/C 1 14 9 23 6.51138796280049 4.81410773819969 1.6972802246008 T:C T C 10 0.534900859799965 0.535478861923393 ENSG00000164172:ENST00000361377:exon_52391512_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000510818:exon_52393743_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000450852:exon_52393882_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000396954:exon_52393892_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000502402:exon_52393897_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000338412:exon_52393898_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000508922:exon_52393929_52394541:MOCS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 52394439 T/C 1 14 10 24 6.51138796280049 5.34900859799965 1.16237936480084 T:C T C 10 0.534900859799965 0.686624830629771 ENSG00000164172:ENST00000361377:exon_52391512_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000510818:exon_52393743_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000450852:exon_52393882_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000396954:exon_52393892_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000502402:exon_52393897_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000338412:exon_52393898_52394497:MOCS2;ENSG00000164172:ENST00000508922:exon_52393929_52394541:MOCS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 T:C T C 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 18 14 32 8.37178452360063 7.48861203719951 0.883172486401119 A:G G A 10 0.534900859799965 0.859901752609429 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 6 12 18 2.79059484120021 6.41881031759958 -3.62821547639937 T:C T C 10 0.534900859799965 0.100571851495914 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 A:G G A 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 34 17 51 15.8133707668012 9.09331461659941 6.72005615020178 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0677947113155842 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 21 21 42 9.76708194420073 11.2329180557993 -1.46583611159853 T:C T C 10 0.534900859799965 0.757475729947199 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 27 38 65 12.5576767854009 20.3262326723987 -7.76855588699773 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0617819615752711 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 66479189 G/A 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 A:G G A 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 66492412 C/G 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 C:G C G 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66492380_66492627:CD180 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 22 9 31 10.2321810844008 4.81410773819969 5.41807334620108 T:G G T 10 0.534900859799965 0.0701500477587309 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 T:C C T 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:T T A 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 48 60 108 22.3247587296017 32.0940515879979 -9.76929285839623 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0666167226844379 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 74065145 A/G 1 43 89 132 19.9992630286015 47.6061765221969 -27.6069134935954 A:G A G 10 0.534900859799965 1.77160250525059e-06 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74065039_74065189:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74065039_74065379:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74065039_74065189:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000515524:exon_74065123_74065189:NSA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 117 98 215 54.4165994034041 52.4202842603966 1.99631514300751 A:G A G 10 0.534900859799965 0.837555988913844 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 74077474 C/T 1 10 11 21 4.65099140200035 5.88390945779962 -1.23291805579927 T:C C T 10 0.534900859799965 0.664426203928233 ENSG00000198780:ENST00000389156:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000514215:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510496:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510609:exon_74073401_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000380515:exon_74076956_74077833:FAM169A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 14 14 28 6.51138796280049 7.48861203719951 -0.977224074399022 A:C C A 10 0.534900859799965 0.710193959056181 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 5 12 17 2.32549570100017 6.41881031759958 -4.09331461659941 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0533893992537193 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 77473165 A/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77473163_77473260:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77473163_77473260:AP3B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 5 14 19 2.32549570100017 7.48861203719951 -5.16311633619934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0207748290951221 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 22 23 45 10.2321810844008 12.3027197753992 -2.07053869099843 C:G C G 10 0.534900859799965 0.553280034626785 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 919 1257 2176 427.426109843832 672.370380768556 -244.944270924724 A:G A G 10 0.534900859799965 7.85225116667668e-26 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 86695274 A/G 1 28 25 53 13.022775925601 13.3725214949991 -0.349745569398149 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000134480:ENST00000505587:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510921:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000508855:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000511207:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504115:exon_86695211_86695322:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86695211_86695322:CCNH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 94230358 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000506568:exon_94230354_94230540:MCTP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 96076487 G/A 0 19 0 19 8.83688366380066 0 8.83688366380066 G G 10 0.534900859799965 7.3560856826458e-06 ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96076449_96076487:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96076449_96076487:CAST HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 16 3 19 7.44158624320056 1.6047025793999 5.83688366380066 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.00948963543452851 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 20 14 34 9.3019828040007 7.48861203719951 1.81337076680119 T:C C T 10 0.534900859799965 0.60769796603379 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 T T 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 A:T T A 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 C:G G C 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 111066590 A/G 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 A:G A G 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 112349070 T/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112349018_112355820:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112349018_112349546:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112349018_112356667:DCP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G A G 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 14 11 25 6.51138796280049 5.88390945779962 0.627478505000874 T:C T C 10 0.534900859799965 0.843639271199329 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 132387979 T/A 1 12 8 20 5.58118968240042 4.27920687839972 1.3019828040007 A:T T A 10 0.534900859799965 0.656764655580921 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132387654_132388049:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000321956:exon_132387662_132388049:HSPA4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 A:G G A 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 134074319 G/T 1 16 9 25 7.44158624320056 4.81410773819969 2.62747850500087 T:G G T 10 0.534900859799965 0.322219768763121 ENSG00000164615:ENST00000297156:exon_134074191_134074482:CAMLG;ENSG00000164615:ENST00000514518:exon_134074273_134074482:CAMLG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 98 91 189 45.5797157396034 48.6759782417968 -3.0962625021934 A:G A G 10 0.534900859799965 0.662320395615043 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 134670741 C/T 1 79 61 140 36.7428320758028 32.6289524477979 4.1138796280049 T:C C T 10 0.534900859799965 0.499111162801542 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 72 53 125 33.4871380944025 28.3497455693981 5.13739252500437 A:G A G 10 0.534900859799965 0.371140772687237 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 186 187 373 86.5084400772065 100.026460782593 -13.518020705387 A:G G A 10 0.534900859799965 0.161492902137877 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 32 94 126 14.8831724864011 50.2806808211967 -35.3975083347956 T:C T C 10 0.534900859799965 2.40827463319972e-10 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 26 32 58 12.0925776452009 17.1168275135989 -5.02424986839797 A:G G A 10 0.534900859799965 0.190860113384433 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 7 3 10 3.25569398140024 1.6047025793999 1.65099140200035 A:G A G 10 0.534900859799965 0.355662672503667 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 35 31 66 16.2784699070012 16.5819266537989 -0.303456746797693 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:C T C 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 C:G C G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 149772280 C/G 1 24 25 49 11.1623793648008 13.3725214949991 -2.21014213019829 C:G C G 10 0.534900859799965 0.568260826471119 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 T:C C T 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 150158455 C/T 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000254970:ENST00000526627:exon_150157508_150158534:AC010441.1;ENSG00000181368:ENST00000324552:exon_150157508_150158534:C5orf62 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:G G A 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 14 15 29 6.51138796280049 8.02351289699948 -1.51212493419899 A:G A G 10 0.534900859799965 0.58268078856631 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 159492062 A/G 1 43 38 81 19.9992630286015 20.3262326723987 -0.326969643797167 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159491939_159492518:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159491939_159492518:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522073:exon_159491939_159492518:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000520274:exon_159491939_159492137:TTC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 162911075 C/A 1 37 35 72 17.2086681874013 18.7215300929988 -1.51286190559748 A:C C A 10 0.534900859799965 0.724800912678207 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162911075_162911251:HMMR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 13 9 22 6.04628882260045 4.81410773819969 1.23218108440077 C:G C G 10 0.534900859799965 0.6725738608257 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 13 27 40 6.04628882260045 14.4423232145991 -8.3960343919986 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0103557423015146 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 20 17 37 9.3019828040007 9.09331461659941 0.208668187401294 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 14 21 35 6.51138796280049 11.2329180557993 -4.72153009299878 A:G G A 10 0.534900859799965 0.127648723252948 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176335686 C/T 1 11 6 17 5.11609054220038 3.20940515879979 1.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.467712856324536 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176335634_176335695:UIMC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 13 2 15 6.04628882260045 1.06980171959993 4.97648710300052 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00946435315878301 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176734657 C/T 1 15 14 29 6.97648710300052 7.48861203719951 -0.512124934198987 T:C C T 10 0.534900859799965 0.854754186847023 ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734206_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734209_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734215_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734436_176734704:MXD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 39 42 81 18.1388664678014 22.4658361115985 -4.32696964379717 C:G G C 10 0.534900859799965 0.373250225573047 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 20 23 43 9.3019828040007 12.3027197753992 -3.0007369713985 A:G A G 10 0.534900859799965 0.364170833011667 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 14 5 19 6.51138796280049 2.67450429899983 3.83688366380066 T:C T C 10 0.534900859799965 0.106012177678070 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 8 7 15 3.72079312160028 3.74430601859976 -0.0235128969994758 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 32 27 59 14.8831724864011 14.4423232145991 0.440849271802062 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 927 1 928 431.146902965432 0.534900859799965 430.612002105632 T:C T C 10 0.534900859799965 6.07620547311204e-250 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179007951 T/G 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000514238:exon_179007948_179008013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179007948_179008013:RUFY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179016621 T/C 1 3 11 14 1.3952974206001 5.88390945779962 -4.48861203719951 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0281864276580277 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508609:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000514238:exon_179016547_179016648:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000509797:exon_179016364_179016648:RUFY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179020562 C/T 1 3 17 20 1.3952974206001 9.09331461659941 -7.6980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.000518424120203754 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508609:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000509797:exon_179020479_179020614:RUFY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179021869 T/C 1 10 16 26 4.65099140200035 8.55841375679944 -3.90742235479909 T:C T C 10 0.534900859799965 0.167755747456869 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179021867_179021964:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179021867_179021964:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179021867_179021964:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179021867_179021964:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179021867_179021964:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179021867_179021964:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508609:exon_179021867_179021899:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179021867_179021964:RUFY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 14 11 25 6.51138796280049 5.88390945779962 0.627478505000874 A:G G A 10 0.534900859799965 0.843639271199329 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 10 15 25 4.65099140200035 8.02351289699948 -3.37252149499913 C:G G C 10 0.534900859799965 0.228777017331708 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179228623 G/A 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 A:G G A 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 67 56 123 31.1616423934023 29.954448148798 1.2071942446043 T:C C T 10 0.534900859799965 0.856883499177138 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 11 18 29 5.11609054220038 9.62821547639937 -4.51212493419899 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0975604137444827 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 1 9 10 0.465099140200035 4.81410773819969 -4.34900859799965 T:G G T 10 0.534900859799965 0.007838459953554 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 26 21 47 12.0925776452009 11.2329180557993 0.859659589401643 A:G A G 10 0.534900859799965 0.884098385556711 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 311938 C/T 1 18 2 20 8.37178452360063 1.06980171959993 7.3019828040007 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00104658228985174 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_311880_311962:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_311880_311962:DUSP22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 1 26 12 38 12.0925776452009 6.41881031759958 5.67376732760133 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0738484945895711 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 36 43 79 16.7435690472013 23.0007369713985 -6.25716792419724 A:G G A 10 0.534900859799965 0.176116679819102 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 36 38 74 16.7435690472013 20.3262326723987 -3.58266362519741 A:G G A 10 0.534900859799965 0.416747744778855 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 9 13 22 4.18589226180031 6.95371117739955 -2.76781891559923 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.286967349777060 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 7883386 G/A 1 51 61 112 23.7200561502018 32.6289524477979 -8.90889629759608 A:G G A 10 0.534900859799965 0.106960420807694 ENSG00000239264:ENST00000379757:exon_7881750_7883499:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7881750_7883499:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000473453:exon_7883377_7883499:TXNDC5;ENSG00000188428:ENST00000439343:exon_7881755_7883499:MUTED HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 7 6 13 3.25569398140024 3.20940515879979 0.0462888226004541 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 13305345 G/C 1 13 21 34 6.04628882260045 11.2329180557993 -5.18662923319881 C:G G C 10 0.534900859799965 0.0858795035292417 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13305183_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13305183_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13305186_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13305186_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13305186_13305419:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13305186_13305419:TBC1D7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 13321321 A/C 1 12 22 34 5.58118968240042 11.7678189155992 -6.18662923319881 A:C A C 10 0.534900859799965 0.0387700335130315 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321306_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 15663118 T/C 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 T:C T C 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15663045_15663273:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15663045_15663238:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15663045_15663261:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15663045_15663289:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15663045_15663251:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15663045_15663206:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15663045_15663151:DTNBP1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 35 44 79 16.2784699070012 23.5356378311985 -7.25716792419724 T:C C T 10 0.534900859799965 0.114279770308753 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 18256625 A/G 1 32 38 70 14.8831724864011 20.3262326723987 -5.44306018599755 A:G A G 10 0.534900859799965 0.230630905307345 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18256592_18256670:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18256592_18256686:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18256604_18256686:DEK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 20 21 41 9.3019828040007 11.2329180557993 -1.93093525179857 A:G G A 10 0.534900859799965 0.639156465233879 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 9 4 13 4.18589226180031 2.13960343919986 2.04628882260045 A:G G A 10 0.534900859799965 0.282043202339778 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 21594847 C/G 1 20 15 35 9.3019828040007 8.02351289699948 1.27846990700122 C:G C G 10 0.534900859799965 0.736183157362525 ENSG00000124766:ENST00000244745:exon_21593972_21598847:SOX4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G G A 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 8 4 12 3.72079312160028 2.13960343919986 1.58118968240042 C:G G C 10 0.534900859799965 0.401701118978379 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 28 22 50 13.022775925601 11.7678189155992 1.25495701000175 A:G G A 10 0.534900859799965 0.777775082574646 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 24781719 G/C 1 12 4 16 5.58118968240042 2.13960343919986 3.44158624320056 C:G G C 10 0.534900859799965 0.13034100681029 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 24781735 C/T 1 10 3 13 4.65099140200035 1.6047025793999 3.04628882260045 T:C C T 10 0.534900859799965 0.102499055737901 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 26056549 A/G 1 91 108 199 42.3240217582032 57.7692928583962 -15.445271100193 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0327653982215588 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 26056604 G/A 1 195 198 393 90.6943323390068 105.910370240393 -15.2160379013863 A:G G A 10 0.534900859799965 0.129307954052569 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 52 53 105 24.1851552904018 28.3497455693981 -4.16459027899633 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.434811627808674 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 10 14 24 4.65099140200035 7.48861203719951 -2.83762063519916 A:G A G 10 0.534900859799965 0.307000307671416 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 23 23 46 10.6972802246008 12.3027197753992 -1.60543955079839 A:G A G 10 0.534900859799965 0.659746286966469 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 27858310 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000197153:ENST00000359303:exon_27858160_27858570:HIST1H3J HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C C T 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 29910663 G/A 1 76 246 322 35.3475346552027 131.585611510791 -96.2380768555888 A:G G A 10 0.534900859799965 1.08482286739034e-27 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30030057 G/A 1 68 72 140 31.6267415336024 38.5128619055975 -6.8861203719951 A:G G A 10 0.534900859799965 0.270722577634116 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30030001_30030110:ZNRD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 61 55 116 28.3710475522021 29.4195472889981 -1.04849973679595 A:G A G 10 0.534900859799965 0.852864212525322 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 12 9 21 5.58118968240042 4.81410773819969 0.767081944200734 A:C C A 10 0.534900859799965 0.82864894485234 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30313029 C/T 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 T:C C T 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30312936_30313175:RPP21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 239 206 445 111.158694507808 110.189577118793 0.969117389015551 T:C T C 10 0.534900859799965 0.962106128550242 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 194 184 378 90.2292331988068 98.4217582031936 -8.19252500438678 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.409619141399532 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 19 13 32 8.83688366380066 6.95371117739955 1.88317248640112 A:G G A 10 0.534900859799965 0.596202001227544 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 30523981 G/C 1 8 6 14 3.72079312160028 3.20940515879979 0.511387962800489 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30523908_30524951:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30523908_30525008:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30523908_30525008:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30523908_30525008:GNL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 16 16 32 7.44158624320056 8.55841375679944 -1.11682751359888 T:C T C 10 0.534900859799965 0.725631682516676 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G G A 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31116502 C/T 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 T:C C T 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116395_31116505:CCHCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 11 3 14 5.11609054220038 1.6047025793999 3.51138796280049 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0657480420080034 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 12 6 18 5.58118968240042 3.20940515879979 2.37178452360063 C:G C G 10 0.534900859799965 0.346220682106825 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 11 9 20 5.11609054220038 4.81410773819969 0.3019828040007 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C,G 0 0 12 12 0 6.41881031759958 -6.41881031759958 C:G A G 10 0.534900859799965 0.000102458133481886 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 13 6 19 6.04628882260045 3.20940515879979 2.83688366380066 T:C T C 10 0.534900859799965 0.251289611662878 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 15 8 23 6.97648710300052 4.27920687839972 2.6972802246008 C:G C G 10 0.534900859799965 0.300305581932208 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 14 1 15 6.51138796280049 0.534900859799965 5.97648710300052 T:C T C 10 0.534900859799965 0.00136722531375318 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1469 388 1857 683.230636953851 207.541533602386 475.689103351465 A:T:C:G C T 10 0.534900859799965 1.05715550346506e-116 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31323321 G/A 1 391 228 619 181.853763818214 121.957396034392 59.8963677838216 A:G G A 10 0.534900859799965 1.24891510030263e-06 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 258 72 330 119.995578171609 38.5128619055975 81.4827162660115 A:C:G G A 10 0.534900859799965 2.14842194788205e-20 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 28 32 60 13.022775925601 17.1168275135989 -4.0940515879979 A:G G A 10 0.534900859799965 0.302837345478591 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 57 60 117 26.510650991402 32.0940515879979 -5.58340059659591 A:G A G 10 0.534900859799965 0.309262604194214 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 58 56 114 26.975750131602 29.954448148798 -2.97869801719602 C:G C G 10 0.534900859799965 0.575014825655193 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 83 68 151 38.6032286366029 36.3732584663976 2.22997017020528 T:C C T 10 0.534900859799965 0.744610929370477 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 C:G G C 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 14 9 23 6.51138796280049 4.81410773819969 1.6972802246008 A:G A G 10 0.534900859799965 0.535478861923393 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 29 44 73 13.487875065801 23.5356378311985 -10.0477627653974 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0190911278190113 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 23 20 43 10.6972802246008 10.6980171959993 -0.000736971398495712 A:C C A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 13 4 17 6.04628882260045 2.13960343919986 3.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0860716495303256 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 32 22 54 14.8831724864011 11.7678189155992 3.11535357080189 A:G G A 10 0.534900859799965 0.416244387039383 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 12 11 23 5.58118968240042 5.88390945779962 -0.302719775399196 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 80 114 194 37.2079312160028 60.978698017196 -23.7707668011932 A:C C A 10 0.534900859799965 0.000687921521503635 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32410987 A/G 1 1148 1200 2348 533.93381294964 641.881031759958 -107.947218810318 A:T:C:G A G 10 0.534900859799965 8.56306477594989e-06 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 841 826 1667 391.148376908229 441.828110194771 -50.6797332865417 A:T:C:G A C 10 0.534900859799965 0.0131364543360002 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 1235 825 2060 574.397438147043 441.293209334971 133.104228812072 A:T:C:G T G 10 0.534900859799965 4.02770040604847e-09 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32628045 C/G 0 9 0 9 4.18589226180031 0 4.18589226180031 C C 10 0.534900859799965 0.00460313644991216 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32632832 A/T 0 297 0 297 138.13444463941 0 138.13444463941 A A 10 0.534900859799965 2.27160009520124e-81 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32714067 G/A 0 22 0 22 10.2321810844008 0 10.2321810844008 G G 10 0.534900859799965 1.10052123207739e-06 ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32784676 C/T 1 8 3 11 3.72079312160028 1.6047025793999 2.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.239062645351779 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 A:C C A 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 14 10 24 6.51138796280049 5.34900859799965 1.16237936480084 T:C C T 10 0.534900859799965 0.686624830629771 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 149 170 319 69.2997718898052 90.9331461659941 -21.6333742761888 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0157755612532911 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32906565 T/A 1 42 38 80 19.5341638884015 20.3262326723987 -0.792068783997202 A:T T A 10 0.534900859799965 0.91091988643732 ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000248993:ENST00000429234:exon_32906461_32906742:XXbac-BPG181M17.5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32916555 G/A 1 56 91 147 26.045551851202 48.6759782417968 -22.6304263905949 A:G G A 10 0.534900859799965 0.000187176993877677 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32916391_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000473725:exon_32916518_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32916548_32916645:HLA-DMA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 T:G G T 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33048564 G/A 0 189 0 189 87.9037374978066 0 87.9037374978066 G G 10 0.534900859799965 6.4415743780359e-52 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33048641 A/G 1 282 3 285 131.15795753641 1.6047025793999 129.55325495701 A:G A G 10 0.534900859799965 1.03177320699662e-71 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 134 38 172 62.3232847868047 20.3262326723987 41.997052114406 T:C T C 10 0.534900859799965 5.4282304690789e-11 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 163 34 197 75.8111598526057 18.1866292331988 57.6245306194069 T:C C T 10 0.534900859799965 1.13129440317042e-17 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 167 20 187 77.6715564134058 10.6980171959993 66.9735392174065 T:C T C 10 0.534900859799965 6.73569722702511e-26 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33052998 C/T 1 181 46 227 84.1829443762063 24.6054395507984 59.5775048254079 T:C C T 10 0.534900859799965 2.63619720557172e-16 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33053640 T/C 1 361 110 471 167.900789612213 58.8390945779962 109.061695034216 T:C:G T C 10 0.534900859799965 3.72777566883416e-25 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 A:G G A 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33169895 C/G 1 32 27 59 14.8831724864011 14.4423232145991 0.440849271802062 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33169849_33169899:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33169849_33169902:SLC39A7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 12 21 33 5.58118968240042 11.2329180557993 -5.65172837339885 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0551329764539647 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 27 26 53 12.5576767854009 13.9074223547991 -1.34974556939815 C:G G C 10 0.534900859799965 0.783430471884864 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 43 41 84 19.9992630286015 21.9309352517986 -1.93167222319706 A:G A G 10 0.534900859799965 0.743041456567358 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 5 16 21 2.32549570100017 8.55841375679944 -6.23291805579927 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00767695072920163 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 28 33 61 13.022775925601 17.6517283733988 -4.62895244779787 A:C C A 10 0.534900859799965 0.249730085859679 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 36887476 C/T 1 13 6 19 6.04628882260045 3.20940515879979 2.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.251289611662878 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36887354_36887477:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36887354_36887477:C6orf89 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 38 39 77 17.6737673276013 20.8611335321986 -3.18736620459731 T:C T C 10 0.534900859799965 0.494213625612022 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:G G A 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 37443950 G/A 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 19 13 32 8.83688366380066 6.95371117739955 1.88317248640112 T:G T G 10 0.534900859799965 0.596202001227544 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 46 56 102 21.3945604492016 29.954448148798 -8.55988769959643 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0922670232678355 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 A:C A C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 T:G G T 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 T:C C T 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 43190293 C/T 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43190269_43190379:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43190269_43190379:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43190269_43190382:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43190269_43190379:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000506830:exon_43190269_43190379:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000503766:exon_43189243_43191906:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000505405:exon_43190269_43190735:CUL9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 9 10 19 4.18589226180031 5.34900859799965 -1.16311633619934 A:C A C 10 0.534900859799965 0.64986861338841 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 210 150 360 97.6708194420073 80.2351289699948 17.4356904720126 A:G G A 10 0.534900859799965 0.072297382081483 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 44268371 T/C 1 7 13 20 3.25569398140024 6.95371117739955 -3.6980171959993 T:C T C 10 0.534900859799965 0.117620093143275 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44267391_44268448:AARS2;ENSG00000124608:ENST00000491573:exon_44268309_44269003:AARS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 44371690 T/C 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 54173413 A/G 1 11 4 15 5.11609054220038 2.13960343919986 2.97648710300052 A:G A G 10 0.534900859799965 0.194126412933295 ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54173395_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54173395_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000339741:exon_54173203_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54173253_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370865:exon_54173349_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54173371_54173703:TINAG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 54186147 T/C 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 T:C T C 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54186095_54186184:TINAG HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 13 13 0 6.95371117739955 -6.95371117739955 A G A 10 0.534900859799965 4.76531897889256e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 8 0 8 3.72079312160028 0 3.72079312160028 C C 10 0.534900859799965 0.00889131889615425 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 71289188 C/T 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 T:C C T 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 A:G A G 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 71298323 C/T 1 20 26 46 9.3019828040007 13.9074223547991 -4.60543955079839 T:C C T 10 0.534900859799965 0.1855947653833 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71298318_71299272:C6orf57 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:G G A 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 79713465 G/A 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79713447_79713575:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79713447_79713575:PHIP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 87969341 G/A 1 14 14 28 6.51138796280049 7.48861203719951 -0.977224074399022 A:G G A 10 0.534900859799965 0.710193959056181 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 14 13 27 6.51138796280049 6.95371117739955 -0.442323214599057 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 103 96 199 47.9052114406036 51.3504825407966 -3.44527110019305 C:G G C 10 0.534900859799965 0.669945476217253 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 28 34 62 13.022775925601 18.1866292331988 -5.16385330759783 A:G A G 10 0.534900859799965 0.204095497113166 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 T:C T C 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 27 27 54 12.5576767854009 14.4423232145991 -1.88464642919811 T:C C T 10 0.534900859799965 0.682822015195959 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 14 17 31 6.51138796280049 9.09331461659941 -2.58192665379892 A:G G A 10 0.534900859799965 0.372985896867814 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 132618241 A/G 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000079931:ENST00000367963:exon_132617194_132618456:MOXD1;ENSG00000079931:ENST00000336749:exon_132617208_132618456:MOXD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 390 232 622 181.388664678014 124.096999473592 57.2916652044217 A:T:G A G 10 0.534900859799965 3.63010840102554e-06 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 17 15 32 7.90668538340059 8.02351289699948 -0.116827513598881 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136597174 G/A 1 78 1 79 36.2777329356027 0.534900859799965 35.7428320758028 A:G G A 10 0.534900859799965 3.88042901234805e-20 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 84 0 84 39.0683277768029 0 39.0683277768029 T T 10 0.534900859799965 1.55189621024018e-23 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 95 0 95 44.1844183190033 0 44.1844183190033 A A 10 0.534900859799965 2.09997962465023e-26 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 96 0 96 44.6495174592034 0 44.6495174592034 A A 10 0.534900859799965 1.09221104532279e-26 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 12 0 12 5.58118968240042 0 5.58118968240042 G G 10 0.534900859799965 0.000651088133365378 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 17 0 17 7.90668538340059 0 7.90668538340059 T T 10 0.534900859799965 2.62538815763530e-05 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 136599458 C/T 0 21 0 21 9.76708194420073 0 9.76708194420073 C C 10 0.534900859799965 2.07104627781169e-06 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 14 20 34 6.51138796280049 10.6980171959993 -4.18662923319881 A:C A C 10 0.534900859799965 0.170364060644317 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 149903597 A/G 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 A:G A G 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000055211:ENST00000367419:exon_149903576_149903739:C6orf72 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C C T 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 29 27 56 13.487875065801 14.4423232145991 -0.954448148798043 A:G G A 10 0.534900859799965 0.893592443840493 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 C:G C G 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 5 13 18 2.32549570100017 6.95371117739955 -4.62821547639937 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0335442653697264 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 151766822 C/A 1 6 8 14 2.79059484120021 4.27920687839972 -1.48861203719951 A:C C A 10 0.534900859799965 0.437667470109608 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 15 19 34 6.97648710300052 10.1631163361993 -3.18662923319881 A:G G A 10 0.534900859799965 0.304636834338888 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 153603515 G/T 1 5 343 348 2.32549570100017 183.470994911388 -181.145499210388 A:T:C:G G T 10 0.534900859799965 1.70284847305399e-105 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 155153492 C/T 1 10 9 19 4.65099140200035 4.81410773819969 -0.163116336199336 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 157528197 C/T 1 13 16 29 6.04628882260045 8.55841375679944 -2.51212493419899 T:C C T 10 0.534900859799965 0.359241351500948 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157527301_157530284:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157527301_157529495:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000445852:exon_157527301_157529204:ARID1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 10 17 27 4.65099140200035 9.09331461659941 -4.44232321459906 T:C T C 10 0.534900859799965 0.121190885864402 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 167343141 G/A 1 269 275 544 125.111668713809 147.09773644499 -21.986067731181 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0644854304015333 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 308 328 636 143.250535181611 175.447482014389 -32.1969468327778 A:T:G A G 10 0.534900859799965 0.0109321043255981 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 55 41 96 25.5804527110019 21.9309352517986 3.64951745920336 C:G G C 10 0.534900859799965 0.475390445457305 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 540090 T/C 0 0 8 8 0 4.27920687839972 -4.27920687839972 C T C 10 0.534900859799965 0.00218959752384939 ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_540068_540136:PDGFA;ENSG00000189385:ENST00000338259:exon_539540_540235:AC147651.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 3 11 14 1.3952974206001 5.88390945779962 -4.48861203719951 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0281864276580277 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:G A G 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 2578246 C/T 1 14 17 31 6.51138796280049 9.09331461659941 -2.58192665379892 T:C C T 10 0.534900859799965 0.372985896867814 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 2976767 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 5256232 C/T 1 15 5 20 6.97648710300052 2.67450429899983 4.3019828040007 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0713373797196031 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000465102:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000480238:exon_5256194_5256290:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000488359:exon_5256222_5256290:WIPI2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 5257573 G/A 1 12 6 18 5.58118968240042 3.20940515879979 2.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.346220682106825 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5257553_5257644:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5256721_5258662:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000465102:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000480238:exon_5257553_5257645:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000488359:exon_5257553_5257645:WIPI2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 5391702 C/G 1 2 9 11 0.93019828040007 4.81410773819969 -3.88390945779962 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0298686862719098 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5390919_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5391633_5391725:TNRC18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 56 47 103 26.045551851202 25.1403404105984 0.905211440603601 T:C T C 10 0.534900859799965 0.921405896524325 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 5781041 C/G 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000011275:ENST00000425013:exon_5780604_5781275:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389902:exon_5780604_5781446:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389900:exon_5780604_5781275:RNF216 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 5 10 15 2.32549570100017 5.34900859799965 -3.02351289699948 T:G G T 10 0.534900859799965 0.128614383413173 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 6048973 C/A 1 37 28 65 17.2086681874013 14.977224074399 2.23144411300227 A:C C A 10 0.534900859799965 0.620251686075688 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6048876_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6048886_6049009:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6048921_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6048947_6049129:AIMP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 T:C T C 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 17 30 47 7.90668538340059 16.047025793999 -8.14034041059836 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0191153546251984 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 11 11 22 5.11609054220038 5.88390945779962 -0.76781891559923 T:C T C 10 0.534900859799965 0.83196431766879 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 12 19 31 5.58118968240042 10.1631163361993 -4.58192665379892 C:G C G 10 0.534900859799965 0.107495259980908 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 30655542 T/C 1 121 120 241 56.2769959642042 64.1881031759958 -7.91110721179157 T:C T C 10 0.534900859799965 0.332770459417498 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30655512_30655674:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30655512_30655674:GARS;ENSG00000106105:ENST00000484093:exon_30655512_30655674:GARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 30671087 T/C 1 151 161 312 70.2299701702053 86.1190384277944 -15.8890682575891 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0783775545016496 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30671064_30671157:GARS;ENSG00000106105:ENST00000444666:exon_30671064_30671157:GARS;ENSG00000106105:ENST00000465748:exon_30671064_30671157:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30670765_30671157:GARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 30673401 A/G 1 334 394 728 155.343112826812 210.750938761186 -55.4078259343746 A:G A G 10 0.534900859799965 4.24811205007316e-05 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30673351_30673649:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30673351_30673527:GARS;ENSG00000106105:ENST00000496643:exon_30673351_30673649:GARS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 32908945 T/C 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 35937861 C/T 1 54 42 96 25.1153535708019 22.4658361115985 2.64951745920336 T:C C T 10 0.534900859799965 0.610277128911445 ENSG00000122545:ENST00000435235:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000399034:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000350320:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000399035:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000425198:exon_35937858_35942825:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000492940:exon_35937858_35938137:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000485569:exon_35937825_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000462732:exon_35937858_35937993:SEPT7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 151 103 254 70.2299701702053 55.0947885593964 15.1351816108089 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0592065495005871 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 21 23 44 9.76708194420073 12.3027197753992 -2.53563783119846 T:C T C 10 0.534900859799965 0.454134024416825 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 27 25 52 12.5576767854009 13.3725214949991 -0.814844709598184 T:C T C 10 0.534900859799965 0.889707224194967 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 61 43 104 28.3710475522021 23.0007369713985 5.37031058080364 A:G G A 10 0.534900859799965 0.325847417561058 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 70 84 154 32.5569398140024 44.9316722231971 -12.3747324091946 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0522350504049188 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 T:G T G 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 A:G G A 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 44098033 C/T 1 33 44 77 15.3482716266012 23.5356378311985 -8.18736620459731 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0675897769591454 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000439815:exon_44098028_44098092:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000441904:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44098031_44098582:DBNL HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 44156491 G/A 1 78 49 127 36.2777329356027 26.2101421301983 10.0675908054044 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.0756692876573061 ENSG00000106628:ENST00000406581:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000395803:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000223361:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000452185:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000436844:exon_44156416_44156614:POLD2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 19 22 41 8.83688366380066 11.7678189155992 -2.93093525179857 T:C C T 10 0.534900859799965 0.434169124689964 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 27 20 47 12.5576767854009 10.6980171959993 1.85965958940164 A:G G A 10 0.534900859799965 0.661769136180153 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 28 17 45 13.022775925601 9.09331461659941 3.92946130900157 T:C C T 10 0.534900859799965 0.295645195270053 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 84 101 185 39.0683277768029 54.0249868397965 -14.9566590629935 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0322948710965923 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 57 28 85 26.510650991402 14.977224074399 11.533426917003 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0123139650965114 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 61 33 94 28.3710475522021 17.6517283733988 10.7193191788033 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0295998576722438 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 64 42 106 29.7663449728022 22.4658361115985 7.30050886120371 A:G G A 10 0.534900859799965 0.172916839931826 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 16 9 25 7.44158624320056 4.81410773819969 2.62747850500087 A:G G A 10 0.534900859799965 0.322219768763121 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 38 40 78 17.6737673276013 21.3960343919986 -3.72226706439727 A:G G A 10 0.534900859799965 0.427806359175841 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 43 49 92 19.9992630286015 26.2101421301983 -6.21087910159678 A:T:C A C 10 0.534900859799965 0.210285159607008 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 16 6 22 7.44158624320056 3.20940515879979 4.23218108440077 A:C C A 10 0.534900859799965 0.087084332637703 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 27 23 50 12.5576767854009 12.3027197753992 0.254957010001748 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 73097555 C/T 1 19 14 33 8.83688366380066 7.48861203719951 1.34827162660115 T:C:G C T 10 0.534900859799965 0.728220810649499 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 6 11 17 2.79059484120021 5.88390945779962 -3.09331461659941 T:C C T 10 0.534900859799965 0.149930482845447 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 C:G G C 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 73814749 G/C 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 A:G A G 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 T:C C T 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 30 40 70 13.952974206001 21.3960343919986 -7.44306018599755 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0927690809956442 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 23 9 32 10.6972802246008 4.81410773819969 5.88317248640112 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0496832789416156 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 13 9 22 6.04628882260045 4.81410773819969 1.23218108440077 T:C T C 10 0.534900859799965 0.6725738608257 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 76111994 C/G 1 4 4 8 1.86039656080014 2.13960343919986 -0.27920687839972 C:G C G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 1 9 10 0.465099140200035 4.81410773819969 -4.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.007838459953554 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 76131706 A/G 1 12 2 14 5.58118968240042 1.06980171959993 4.51138796280049 A:G A G 10 0.534900859799965 0.015914234708859 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 77569559 C/T 1 3 8 11 1.3952974206001 4.27920687839972 -2.88390945779962 T:C C T 10 0.534900859799965 0.127810877205120 ENSG00000006576:ENST00000427986:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000422959:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000307305:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000424760:exon_77569347_77569776:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000275575:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000416283:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000248550:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000479515:exon_77569347_77569776:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000470215:exon_77569516_77569619:PHTF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 91632306 C/T 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 91708898 A/G 1 7 11 18 3.25569398140024 5.88390945779962 -2.62821547639937 A:G A G 10 0.534900859799965 0.243128832512550 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91708393_91709424:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91708393_91709466:AKAP9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 92761875 C/G 1 17 13 30 7.90668538340059 6.95371117739955 0.952974206001048 C:G C G 10 0.534900859799965 0.855242065396205 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 7 8 15 3.25569398140024 4.27920687839972 -1.02351289699948 T:C C T 10 0.534900859799965 0.615364224761686 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 7 1 8 3.25569398140024 0.534900859799965 2.72079312160028 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0756544627069956 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99690690 G/C 1 444 416 860 206.504018248816 222.518757676785 -16.0147394279699 C:G G C 10 0.534900859799965 0.274248288168791 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99690351_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99690403_99690739:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99690404_99690756:MCM7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99690747 T/C 1 380 315 695 176.737673276013 168.493770836989 8.24390243902428 T:C T C 10 0.534900859799965 0.543048563265933 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99690351_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99690404_99690756:MCM7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99693552 G/A 1 184 151 335 85.5782417968064 80.7700298297947 4.80821196701172 A:G G A 10 0.534900859799965 0.622234492731876 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693397_99693611:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000354230:exon_99693445_99693599:MCM7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 38 26 64 17.6737673276013 13.9074223547991 3.76634497280224 A:T A T 10 0.534900859799965 0.381559457955636 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 44 32 76 20.4643621688015 17.1168275135989 3.34753465520266 A:G A G 10 0.534900859799965 0.490864856893188 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 89 76 165 41.3938234778031 40.6524653447973 0.741358133005768 A:G G A 10 0.534900859799965 0.937891708663432 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 54 48 102 25.1153535708019 25.6752412703983 -0.559887699596437 A:G A G 10 0.534900859799965 0.921250384803962 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 4 8 12 1.86039656080014 4.27920687839972 -2.41881031759958 T:C T C 10 0.534900859799965 0.246471813846146 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 100867295 A/G 1 129 119 248 59.9977890858045 63.6532023161958 -3.65541323039133 A:G A G 10 0.534900859799965 0.65623364597405 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100867218_100867471:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000485387:exon_100867218_100867471:ZNHIT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 107559722 A/T 1 19 36 55 8.83688366380066 19.2564309527987 -10.4195472889981 A:T A T 10 0.534900859799965 0.00635556632769076 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107559639_107560360:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107559639_107560038:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107559639_107559828:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107559639_107560158:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107559639_107560100:DLD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 111981006 T/C 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 T:C T C 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 14 19 33 6.51138796280049 10.1631163361993 -3.65172837339885 C:G G C 10 0.534900859799965 0.224386952687450 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 24 17 41 11.1623793648008 9.09331461659941 2.06906474820143 T:C C T 10 0.534900859799965 0.535908242217712 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 127953238 G/A 1 13 7 20 6.04628882260045 3.74430601859976 2.3019828040007 A:G G A 10 0.534900859799965 0.372802021681163 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000481788:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000495327:exon_127953141_127953327:RBM28 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 19 22 41 8.83688366380066 11.7678189155992 -2.93093525179857 A:G G A 10 0.534900859799965 0.434169124689964 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 11 9 20 5.11609054220038 4.81410773819969 0.3019828040007 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 129813717 G/A 1 5 3 8 2.32549570100017 1.6047025793999 0.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.7318527356854 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 1 8 9 0.465099140200035 4.27920687839972 -3.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0151440948330184 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 138265391 A/G 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000122779:ENST00000343526:exon_138265307_138265439:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000415680:exon_138265307_138265439:TRIM24 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/G 1 6 9 15 2.79059484120021 4.81410773819969 -2.02351289699948 C:G C G 10 0.534900859799965 0.313512491587793 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 140158851 C/G 1 8 12 20 3.72079312160028 6.41881031759958 -2.6980171959993 C:G C G 10 0.534900859799965 0.265703033362835 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140158807_140159033:MKRN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 56 0 56 26.045551851202 0 26.045551851202 T T 10 0.534900859799965 1.11444695044219e-15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 4 14 18 1.86039656080014 7.48861203719951 -5.62821547639937 C:G G C 10 0.534900859799965 0.00877219938859724 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 5 13 18 2.32549570100017 6.95371117739955 -4.62821547639937 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0335442653697264 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 7 158449304 C/T 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 T:C C T 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158449294_158449397:NCAPG2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 C:G C G 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 13 16 29 6.04628882260045 8.55841375679944 -2.51212493419899 A:G A G 10 0.534900859799965 0.359241351500948 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 623696 G/A 1 34 27 61 15.8133707668012 14.4423232145991 1.37104755220213 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.797836765431388 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 6302033 A/G 1 2 6 8 0.93019828040007 3.20940515879979 -2.27920687839972 A:G A G 10 0.534900859799965 0.156746431254236 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 6302106 C/A 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:C C A 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 C:G G C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 10 4 14 4.65099140200035 2.13960343919986 2.51138796280049 T:C C T 10 0.534900859799965 0.283653753460098 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 6479160 C/T 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 8654898 C/T 1 18 37 55 8.37178452360063 19.7913318125987 -11.4195472889981 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00262295878142091 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000521881:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520715:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520091:exon_8654875_8655001:MFHAS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 11406598 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 10 13 23 4.65099140200035 6.95371117739955 -2.3027197753992 T:C T C 10 0.534900859799965 0.404844022079815 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 51 47 98 23.7200561502018 25.1403404105984 -1.42028426039657 T:C T C 10 0.534900859799965 0.839641683377416 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 9 16 25 4.18589226180031 8.55841375679944 -4.37252149499913 T:C T C 10 0.534900859799965 0.107273055875128 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 18080015 G/A 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 A:G G A 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 18080196 T/G 1 7 17 24 3.25569398140024 9.09331461659941 -5.83762063519916 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0227247020548708 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 21767265 G/A 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 A:G G A 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 8 11 19 3.72079312160028 5.88390945779962 -2.16311633619934 A:C:G A G 10 0.534900859799965 0.362874568773422 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 5 10 15 2.32549570100017 5.34900859799965 -3.02351289699948 T:C T C 10 0.534900859799965 0.128614383413173 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 22428708 A/G 1 1 10 11 0.465099140200035 5.34900859799965 -4.88390945779962 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0040328595620032 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 18 18 36 8.37178452360063 9.62821547639937 -1.25643095279874 A:G A G 10 0.534900859799965 0.739402622275745 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 25364443 A/C 1 30 25 55 13.952974206001 13.3725214949991 0.580452711001922 A:C A C 10 0.534900859799965 0.893430629436807 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 42 33 75 19.5341638884015 17.6517283733988 1.88243551500262 A:G G A 10 0.534900859799965 0.728811547178737 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 26223857 C/T 1 11 17 28 5.11609054220038 9.09331461659941 -3.97722407439902 T:C C T 10 0.534900859799965 0.183817636085738 ENSG00000221914:ENST00000380737:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000524169:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000315985:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518215:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518890:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000517754:exon_26223831_26223922:PPP2R2A;ENSG00000221914:ENST00000518208:exon_26222614_26223922:PPP2R2A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 11 7 18 5.11609054220038 3.74430601859976 1.37178452360063 A:G A G 10 0.534900859799965 0.638786412185127 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C T C 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 A:G G A 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 15 14 29 6.97648710300052 7.48861203719951 -0.512124934198987 T:C C T 10 0.534900859799965 0.854754186847023 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 10 24 34 4.65099140200035 12.8376206351992 -8.18662923319881 C:G C G 10 0.534900859799965 0.00552349369582041 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 35 31 66 16.2784699070012 16.5819266537989 -0.303456746797693 A:C A C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 C:G G C 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 32 27 59 14.8831724864011 14.4423232145991 0.440849271802062 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 4 10 14 1.86039656080014 5.34900859799965 -3.48861203719951 A:G A G 10 0.534900859799965 0.104561526016219 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 38695996 T/C 1 4 7 11 1.86039656080014 3.74430601859976 -1.88390945779962 T:C T C 10 0.534900859799965 0.366244712770073 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38695988_38696025:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38695988_38696028:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38695988_38696064:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38695988_38696064:TACC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 41355096 C/T 1 6 6 12 2.79059484120021 3.20940515879979 -0.418810317599581 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000147533:ENST00000518270:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000520817:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000276530:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000405786:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000523420:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000357743:exon_41355028_41355180:GOLGA7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 5 11 16 2.32549570100017 5.88390945779962 -3.55841375679944 A:G A G 10 0.534900859799965 0.083617752253552 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 56699588 G/A 1 9 14 23 4.18589226180031 7.48861203719951 -3.3027197753992 A:G G A 10 0.534900859799965 0.210161332529243 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56698797_56699619:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56698797_56699619:TGS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 56708701 T/C 1 7 7 14 3.25569398140024 3.74430601859976 -0.488612037199511 T:C T C 10 0.534900859799965 0.796288793939284 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56708537_56708711:TGS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 56711713 A/G 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G A G 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 14 4 18 6.51138796280049 2.13960343919986 4.37178452360063 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0560208187923533 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 56985814 T/C 1 2373 3193 5566 1103.68025969468 1707.93844534129 -604.258185646605 A:T:C T C 10 0.534900859799965 3.98657952133155e-59 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56985506_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56985601_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56985632_56986327:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56985634_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56985686_56985831:RPS20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 13 13 26 6.04628882260045 6.95371117739955 -0.907422354799092 A:G G A 10 0.534900859799965 0.844673236061777 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 25 32 57 11.6274785050009 17.1168275135989 -5.48934900859801 A:G G A 10 0.534900859799965 0.183756994966039 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 67342252 G/A 1 27 31 58 12.5576767854009 16.5819266537989 -4.02424986839797 A:G G A 10 0.534900859799965 0.29567819937854 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 T:C T C 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 72 49 121 33.4871380944025 26.2101421301983 7.27699596420423 A:G A G 10 0.534900859799965 0.202240692532224 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 41 45 86 19.0690647482014 24.0705386909984 -5.00147394279699 C:G C G 10 0.534900859799965 0.282180036460592 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 13 26 39 6.04628882260045 13.9074223547991 -7.86113353219864 T:G T G 10 0.534900859799965 0.0150969639174837 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 10 8 18 4.65099140200035 4.27920687839972 0.371784523600629 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 9 7 16 4.18589226180031 3.74430601859976 0.441586243200559 A:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 13 12 25 6.04628882260045 6.41881031759958 -0.372521494999127 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 99115082 C/T 1 18 24 42 8.37178452360063 12.8376206351992 -4.46583611159853 T:C C T 10 0.534900859799965 0.215442657379282 ENSG00000132541:ENST00000254878:exon_99114572_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000522791:exon_99114625_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000520507:exon_99114667_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000521560:exon_99114692_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000519608:exon_99114847_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000520989:exon_99114975_99115132:HRSP12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 100899741 C/T 1 252 261 513 117.204983330409 139.609124407791 -22.4041410773821 T:C C T 10 0.534900859799965 0.051390060945289 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 469 373 842 218.131496753816 199.518020705387 18.6134760484294 A:T:G G A 10 0.534900859799965 0.201316046924294 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 12 14 26 5.58118968240042 7.48861203719951 -1.90742235479909 A:G A G 10 0.534900859799965 0.556316287284465 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 52 36 88 24.1851552904018 19.2564309527987 4.92872433760308 T:C T C 10 0.534900859799965 0.336307454521987 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 128098838 G/A 0 14 0 14 6.51138796280049 0 6.51138796280049 G G 10 0.534900859799965 0.000179136886029545 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 128751016 G/A 1 48 41 89 22.3247587296017 21.9309352517986 0.39382347780311 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136997:ENST00000259523:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000528568:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000517291:exon_128750497_128751018:MYC;ENSG00000136997:ENST00000377970:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000454617:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000524013:exon_128750497_128751265:MYC HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 130864456 A/G 1 15 9 24 6.97648710300052 4.81410773819969 2.16237936480084 A:G A G 10 0.534900859799965 0.418803008714874 ENSG00000153310:ENST00000522746:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000523509:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000401979:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000519110:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000523288:exon_130861489_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000358017:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000522250:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000519824:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000517654:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000519540:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000522941:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000311292:exon_130864408_130864524:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000517801:exon_130864408_130864524:FAM49B HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 19 24 43 8.83688366380066 12.8376206351992 -4.0007369713985 A:G G A 10 0.534900859799965 0.225888829508330 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 18 19 37 8.37178452360063 10.1631163361993 -1.79133181259871 A:C:G G A 10 0.534900859799965 0.622208400404984 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 5 5 10 2.32549570100017 2.67450429899983 -0.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 17 13 30 7.90668538340059 6.95371117739955 0.952974206001048 A:G G A 10 0.534900859799965 0.855242065396205 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144658270 G/A 1 12 7 19 5.58118968240042 3.74430601859976 1.83688366380066 A:G G A 10 0.534900859799965 0.493018951852085 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144658248_144658336:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658248_144658332:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658248_144658332:NAPRT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144658730 G/A 1 14 6 20 6.51138796280049 3.20940515879979 3.3019828040007 A:G G A 10 0.534900859799965 0.179206254010548 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 21 9 30 9.76708194420073 4.81410773819969 4.95297420600105 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0979337289113688 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 6 3 9 2.79059484120021 1.6047025793999 1.18589226180031 T:C C T 10 0.534900859799965 0.517334924233721 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 145541635 T/C 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000185000:ENST00000332324:exon_145541577_145541680:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524965:exon_145541577_145541680:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524844:exon_145541577_145541680:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000531896:exon_145541580_145541680:DGAT1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 8 146157104 C/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 C:G C G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 439376 G/A 1 6 13 19 2.79059484120021 6.95371117739955 -4.16311633619934 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0662876401262792 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_439245_439388:DOCK8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 38 31 69 17.6737673276013 16.5819266537989 1.09184067380241 A:G G A 10 0.534900859799965 0.810542157604882 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 4844549 G/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:G G T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4844525_4844681:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000442869:exon_4844525_4844681:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4844525_4844681:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381728:exon_4844525_4844681:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000441844:exon_4844525_4844681:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4844525_4844681:RCL1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 T:G T G 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 3 7 10 1.3952974206001 3.74430601859976 -2.34900859799965 A:G G A 10 0.534900859799965 0.204400293033589 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 19116258 A/G 1 55 77 132 25.5804527110019 41.1873662045973 -15.6069134935954 A:G A G 10 0.534900859799965 0.00677694528349181 ENSG00000147872:ENST00000411567:exon_19115760_19116647:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19115768_19116647:PLIN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 19126281 C/T 1 11 8 19 5.11609054220038 4.27920687839972 0.836883663800664 T:C C T 10 0.534900859799965 0.819610462451019 ENSG00000147872:ENST00000411567:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000276914:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000434144:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000380465:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000380464:exon_19126112_19126307:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000475923:exon_19125504_19126446:PLIN2;ENSG00000147872:ENST00000472715:exon_19125631_19126307:PLIN2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 21333254 T/C 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 T:C T C 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000198642:ENST00000359039:exon_21331018_21335429:KLHL9 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 26842506 G/A 1 5 6 11 2.32549570100017 3.20940515879979 -0.883909457799616 A:G G A 10 0.534900859799965 0.764489955379427 ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26840683_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26842264_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26842392_26842645:C9orf82 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 26923258 G/A 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 A:G G A 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000137055:ENST00000397292:exon_26923176_26923345:PLAA;ENSG00000137055:ENST00000520884:exon_26923176_26923345:PLAA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 12 12 24 5.58118968240042 6.41881031759958 -0.837620635199162 T:C T C 10 0.534900859799965 0.838629781615932 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 67 45 112 31.1616423934023 24.0705386909984 7.09110370240392 T:C T C 10 0.534900859799965 0.185964163284156 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 33076645 A/G 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 A:C:G A G 10 0.534900859799965 1 ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33076581_33076657:SMU1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 33255271 G/C 1 71 78 149 33.0220389542025 41.7222670643973 -8.70022811019479 C:G G C 10 0.534900859799965 0.162925225013102 ENSG00000107262:ENST00000379701:exon_33255023_33255306:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379707:exon_33255047_33255306:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379704:exon_33255076_33255306:AL161445.1;ENSG00000254882:ENST00000472232:exon_33255217_33255306:BAG1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 33369965 G/A 1 9 9 18 4.18589226180031 4.81410773819969 -0.628215476399371 A:G G A 10 0.534900859799965 0.816280727493184 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33369904_33371155:NFX1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 33624557 G/A 0 261 0 261 121.390875592209 0 121.390875592209 G G 10 0.534900859799965 1.45614228502110e-71 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 136 138 274 63.2534830672048 73.8163186523952 -10.5628355851904 T:C T C 10 0.534900859799965 0.203958834392636 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37126682 G/A 1 13 10 23 6.04628882260045 5.34900859799965 0.697280224600804 A:G G A 10 0.534900859799965 0.83658865621555 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37304280 T/C 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 T:C T C 10 0.534900859799965 1 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37304185_37304310:ZCCHC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37305603 C/A 1 10 7 17 4.65099140200035 3.74430601859976 0.906685383400594 A:C C A 10 0.534900859799965 0.809186579842186 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37305541_37305711:ZCCHC7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 46 64 110 21.3945604492016 34.2336550271978 -12.8390945779962 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0165492619150083 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 7 10 17 3.25569398140024 5.34900859799965 -2.09331461659941 T:G G T 10 0.534900859799965 0.339225682542055 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 9 8 17 4.18589226180031 4.27920687839972 -0.0933146165994057 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 15 12 27 6.97648710300052 6.41881031759958 0.557676785400943 T:C T C 10 0.534900859799965 0.849958207872425 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 27 23 50 12.5576767854009 12.3027197753992 0.254957010001748 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 23 6 29 10.6972802246008 3.20940515879979 7.48787506580101 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00496415173118024 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 T:C C T 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 T:C C T 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 5 8 13 2.32549570100017 4.27920687839972 -1.95371117739955 A:G G A 10 0.534900859799965 0.40544154308793 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 6 4 10 2.79059484120021 2.13960343919986 0.650991402000349 A:C A C 10 0.534900859799965 0.759843301828803 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 80881519 T/C 1 13 21 34 6.04628882260045 11.2329180557993 -5.18662923319881 T:C T C 10 0.534900859799965 0.0858795035292417 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 4 6 10 1.86039656080014 3.20940515879979 -1.34900859799965 A:C C A 10 0.534900859799965 0.52967727693347 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 14 11 25 6.51138796280049 5.88390945779962 0.627478505000874 A:G G A 10 0.534900859799965 0.843639271199329 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 A:G G A 10 0.534900859799965 1 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 25 32 57 11.6274785050009 17.1168275135989 -5.48934900859801 T:C C T 10 0.534900859799965 0.183756994966039 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 2 7 9 0.93019828040007 3.74430601859976 -2.81410773819969 T:C C T 10 0.534900859799965 0.0916885275569552 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 T:C T C 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 13 15 28 6.04628882260045 8.02351289699948 -1.97722407439902 T:G T G 10 0.534900859799965 0.456976890177759 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 36 30 66 16.7435690472013 16.047025793999 0.696543253202307 C:G G C 10 0.534900859799965 0.902254500977899 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 3 5 8 1.3952974206001 2.67450429899983 -1.27920687839972 A:C:G A G 10 0.534900859799965 0.485140256839366 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 244 209 453 113.484190208809 111.794279698193 1.68991051061583 A:G A G 10 0.534900859799965 0.887713918717218 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 23 10 33 10.6972802246008 5.34900859799965 5.34827162660115 A:G A G 10 0.534900859799965 0.079802990671498 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 11 22 33 5.11609054220038 11.7678189155992 -6.65172837339885 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0229996773887578 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 7 5 12 3.25569398140024 2.67450429899983 0.581189682400419 A:G A G 10 0.534900859799965 0.780928961477 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 117103900 T/C 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 T:C T C 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 117108971 C/T 1 13 9 22 6.04628882260045 4.81410773819969 1.23218108440077 T:C C T 10 0.534900859799965 0.6725738608257 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 123163053 G/A 1 10 10 20 4.65099140200035 5.34900859799965 -0.6980171959993 A:G G A 10 0.534900859799965 0.824562693211149 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000474262:exon_123163020_123163297:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000484546:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480467:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000433194:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123163020_123163163:CDK5RAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 18 7 25 8.37178452360063 3.74430601859976 4.62747850500087 C:G C G 10 0.534900859799965 0.0721614007149697 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 123182202 C/T 1 7 4 11 3.25569398140024 2.13960343919986 1.11609054220038 T:C C T 10 0.534900859799965 0.559712720019471 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 123205912 C/G 1 6 2 8 2.79059484120021 1.06980171959993 1.72079312160028 C:G C G 10 0.534900859799965 0.298615879778015 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 53 53 106 24.6502544306019 28.3497455693981 -3.6994911387963 A:T:G A G 10 0.534900859799965 0.496291127788204 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 123688217 G/A 1 37 28 65 17.2086681874013 14.977224074399 2.23144411300227 A:G G A 10 0.534900859799965 0.620251686075688 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123688214_123688579:TRAF1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 124088908 C/G 1 7 2 9 3.25569398140024 1.06980171959993 2.18589226180031 C:G C G 10 0.534900859799965 0.189256357550161 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373807:exon_124088790_124088960:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124088860_124089070:GSN HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 124103523 A/G 1 2 8 10 0.93019828040007 4.27920687839972 -3.34900859799965 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0527029702370021 ENSG00000148175:ENST00000286713:exon_124101355_124103686:STOM;ENSG00000148175:ENST00000347359:exon_124103048_124103686:STOM;ENSG00000148175:ENST00000442659:exon_124103480_124103651:STOM HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 15 34 49 6.97648710300052 18.1866292331988 -11.2101421301983 T:C C T 10 0.534900859799965 0.00145920082086944 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 51 55 106 23.7200561502018 29.4195472889981 -5.6994911387963 A:G A G 10 0.534900859799965 0.284805660858606 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 127620224 C/T 1 1412 1187 2599 656.719985962449 634.927320582559 21.7926653798908 A:T:C C T 10 0.534900859799965 0.397842332391633 ENSG00000136942:ENST00000373570:exon_127620159_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000493018:exon_127620162_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000487431:exon_127620162_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000348462:exon_127620163_127620346:RPL35 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 130536484 C/T 1 11 6 17 5.11609054220038 3.20940515879979 1.90668538340059 T:C C T 10 0.534900859799965 0.467712856324536 ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 A:G G A 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 48 32 80 22.3247587296017 17.1168275135989 5.20793121600279 C:G G C 10 0.534900859799965 0.263425179243525 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 51 32 83 23.7200561502018 17.1168275135989 6.6032286366029 A:G A G 10 0.534900859799965 0.153815058563667 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131020382 C/G 1 8 8 16 3.72079312160028 4.27920687839972 -0.558413756799441 C:G C G 10 0.534900859799965 0.8069346018918 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131020400 C/G 1 9 9 18 4.18589226180031 4.81410773819969 -0.628215476399371 C:G C G 10 0.534900859799965 0.816280727493184 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 6 7 13 2.79059484120021 3.74430601859976 -0.953711177399546 T:C C T 10 0.534900859799965 0.782377610111155 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 13 39 52 6.04628882260045 20.8611335321986 -14.8148447095982 T:C C T 10 0.534900859799965 3.77497187947539e-05 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131379998 C/A 1 12 33 45 5.58118968240042 17.6517283733988 -12.0705386909984 A:C C A 10 0.534900859799965 0.000442200334848157 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 27 20 47 12.5576767854009 10.6980171959993 1.85965958940164 A:G G A 10 0.534900859799965 0.661769136180153 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 10 16 26 4.65099140200035 8.55841375679944 -3.90742235479909 T:C C T 10 0.534900859799965 0.167755747456869 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 13 22 35 6.04628882260045 11.7678189155992 -5.72153009299878 A:G A G 10 0.534900859799965 0.0619855052947488 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131484072 G/A 1 11 23 34 5.11609054220038 12.3027197753992 -7.18662923319881 A:G G A 10 0.534900859799965 0.0155703913402995 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372672:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372664:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000406904:exon_131483947_131484096:ZDHHC12 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 9 5 14 4.18589226180031 2.67450429899983 1.51138796280049 A:G G A 10 0.534900859799965 0.593856821088126 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 13 14 27 6.04628882260045 7.48861203719951 -1.44232321459906 C:G G C 10 0.534900859799965 0.700406252627522 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 30 22 52 13.952974206001 11.7678189155992 2.18515529040182 A:C A C 10 0.534900859799965 0.580339545787034 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 131909736 C/T 1 22 18 40 10.2321810844008 9.62821547639937 0.603965608001399 T:C C T 10 0.534900859799965 0.875459401791218 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131909666_131911223:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131909666_131911224:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131909666_131911225:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131909666_131910277:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131909666_131910566:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131909666_131910236:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131909666_131910285:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131909666_131910051:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131909666_131910274:PPP2R4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 12 5 17 5.58118968240042 2.67450429899983 2.90668538340059 A:G G A 10 0.534900859799965 0.223815697619181 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 74 34 108 34.4173363748026 18.1866292331988 16.2307071416038 C:G C G 10 0.534900859799965 0.00189865963298661 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 49 34 83 22.7898578698017 18.1866292331988 4.6032286366029 A:G A G 10 0.534900859799965 0.324101204957880 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 16 16 32 7.44158624320056 8.55841375679944 -1.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.725631682516676 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 8 14 22 3.72079312160028 7.48861203719951 -3.76781891559923 A:G G A 10 0.534900859799965 0.134580831565991 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 136216882 G/A 1 637 657 1294 296.268152307422 351.429864888577 -55.1617125811547 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00216761261469382 ENSG00000148303:ENST00000323345:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000496554:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000463740:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000426651:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000468019:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000485706:exon_136216767_136217238:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000315731:exon_136216856_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000489392:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000412126:exon_136216856_136216907:RPL7A HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 136228006 G/A 1 33 39 72 15.3482716266012 20.8611335321986 -5.51286190559748 A:G G A 10 0.534900859799965 0.196167125149189 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227932_136228045:SURF2 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 7 9 16 3.25569398140024 4.81410773819969 -1.55841375679944 T:C C T 10 0.534900859799965 0.462650935811148 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 138830081 C/T 1 27 18 45 12.5576767854009 9.62821547639937 2.92946130900157 T:C C T 10 0.534900859799965 0.455531401087574 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138830068_138830206:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000489050:exon_138830068_138830206:UBAC1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 139270806 G/A 1 26 8 34 12.0925776452009 4.27920687839972 7.81337076680119 A:G G A 10 0.534900859799965 0.00894718849038894 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 5 4 9 2.32549570100017 2.13960343919986 0.185892261800315 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 139297266 C/T 1 16 16 32 7.44158624320056 8.55841375679944 -1.11682751359888 T:C C T 10 0.534900859799965 0.725631682516676 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139296932_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139297096_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139297117_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139297134_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139297240_139297339:SDCCAG3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 9 6 15 4.18589226180031 3.20940515879979 0.976487103000524 A:G A G 10 0.534900859799965 0.796973056882962 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP01258_parsed_pileup.txt . 9 139306467 C/T 1 12 17 29 5.58118968240042 9.09331461659941 -3.51212493419899 T:C C T 10 0.534900859799965 0.198547361463897 ENSG00000165688:ENST00000371720:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000446975:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139306449_139306651:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139306449_139306651:PMPCA HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 6 5 11 2.79059484120021 2.67450429899983 0.116090542200384 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 221795 C/G 1 70 38 108 32.5569398140024 20.3262326723987 12.2307071416038 C:G C G 10 0.534900859799965 0.020315483584759 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 5 7 12 2.32549570100017 3.74430601859976 -1.41881031759958 A:G G A 10 0.534900859799965 0.564972632290018 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 34 31 65 15.8133707668012 16.5819266537989 -0.768555886997728 T:C C T 10 0.534900859799965 0.90128821852379 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 19 20 39 8.83688366380066 10.6980171959993 -1.86113353219864 T:C C T 10 0.534900859799965 0.630888699245939 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 8 9 17 3.72079312160028 4.81410773819969 -1.09331461659941 T:C T C 10 0.534900859799965 0.633626139184497 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 12 10 22 5.58118968240042 5.34900859799965 0.232181084400769 T:C C T 10 0.534900859799965 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP01258_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 4 5 9 1.86039656080014 2.67450429899983 -0.814107738199685 C:G C G 10 0.534900859799965 0.741822035977202 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX