INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 987133 C/T 1 65 54 119 31.016796240427 28.2322000464145 2.78459619401253 T:C C T 10 0.522818519378046 0.64685049885801 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_987108_987195:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_987108_987195:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_987108_987195:AGRN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 990280 C/T 1 52 46 98 24.8134369923416 24.0496518913901 0.763785100951491 T:C C T 10 0.522818519378046 0.919631984587717 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1139202 T/C 1 21 30 51 10.020811093061 15.6845555813414 -5.66374448828035 T:C T C 10 0.522818519378046 0.12387263102394 ENSG00000186891:ENST00000328596:exon_1138888_1139340:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1138891_1139348:TNFRSF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1178245 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000184163:ENST00000462849:exon_1178215_1178293:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000478606:exon_1178215_1178538:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000330388:exon_1178215_1178293:FAM132A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 93 97 190 44.3778776978417 50.7133963796705 -6.33551868182875 A:G G A 10 0.522818519378046 0.38365091019258 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1250318 G/A 1 51 63 114 24.3362555117197 32.9375667208169 -8.60131120909724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.111546072172584 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1250204_1250813:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531020:exon_1250204_1250521:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000533916:exon_1250204_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1249793_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526797:exon_1250206_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1250207_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1250258_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1250296_1250342:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1250298_1250342:CPSF3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 63 52 115 30.0624332791831 27.1865630076584 2.87587027152471 C:G C G 10 0.522818519378046 0.640999527606786 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 23 32 55 10.9751740543049 16.7301926200975 -5.75501856579253 T:C C T 10 0.522818519378046 0.137700567731226 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1334475 G/C 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000221978:ENST00000400809:exon_1334399_1334692:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000496007:exon_1334399_1334689:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000481223:exon_1334399_1334691:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000408952:exon_1334399_1334691:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000488340:exon_1334399_1334708:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000425335:exon_1334399_1334689:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000408918:exon_1334399_1334697:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000425598:exon_1334368_1334705:CCNL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 33 55 88 15.7469888605245 28.7550185657925 -13.0080297052681 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0072811313749754 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 145 175 320 69.1913146901833 91.4932408911581 -22.3019262009747 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0137106735719818 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 T:C T C 10 0.522818519378046 0.246697181289009 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1635004 T/C 1 15 20 35 7.15772220932931 10.4563703875609 -3.29864817823161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.310939082549559 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1634915_1635011:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1634915_1635063:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1634915_1635063:CDK11A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1635566 G/A 1 28 21 49 13.3610814574147 10.979188906939 2.38189255047574 A:G G A 10 0.522818519378046 0.568064336753713 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 27 29 56 12.8838999767928 15.1617370619633 -2.27783708517058 A:C C A 10 0.522818519378046 0.593527650940336 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 34 38 72 16.2241703411464 19.8671037363657 -3.64293339521931 T:G G T 10 0.522818519378046 0.410577306554047 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 81 47 128 38.6516999303783 24.5724704107682 14.0792295196101 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0131491402552882 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 217 179 396 103.548381294964 93.5845149686702 9.96386632629378 A:G G A 10 0.522818519378046 0.339197275845834 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 2444414 G/A 1 5 12 17 2.38590740310977 6.27382223253655 -3.88791482942678 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0866776016309947 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000471361:exon_2444327_2444452:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000487804:exon_2443845_2444478:PANK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 13 17 30 6.2033592480854 8.88791482942678 -2.68455558134138 T:C T C 10 0.522818519378046 0.363906038877937 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 85 108 193 40.5604258528661 56.464400092829 -15.9039742399629 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0252627640240551 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 2494330 G/A 1 232 334 566 110.706103504293 174.621385472267 -63.9152819679741 A:G G A 10 0.522818519378046 8.12372969022139e-08 ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463835:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482602:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000480305:exon_2494304_2494335:TNFRSF14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 3544191 G/A 1 19 30 49 9.06644813181713 15.6845555813414 -6.61810744952425 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0635170849715887 ENSG00000158109:ENST00000378344:exon_3544064_3544217:TPRG1L;ENSG00000158109:ENST00000344579:exon_3544064_3544217:TPRG1L;ENSG00000158109:ENST00000456805:exon_3544064_3544217:TPRG1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 3548050 G/A 1 42 27 69 20.0416221861221 14.1161000232072 5.92552216291482 A:G G A 10 0.522818519378046 0.184652764750128 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548030_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548030_3548221:WDR8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 18 2 20 8.58926665119517 1.04563703875609 7.54362961243908 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000507372617600748 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 3807590 C/T 1 14 16 30 6.68054072870736 8.36509631004874 -1.68455558134138 T:C C T 10 0.522818519378046 0.586397139849636 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6142308 T/C 1 16 25 41 7.63490368995126 13.0704629844512 -5.43555929449989 T:C T C 10 0.522818519378046 0.116945624358826 ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 35 42 77 16.7013518217684 21.9583778138779 -5.25702599210954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.254455495610047 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6278414 A/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 52 42 94 24.8134369923416 21.9583778138779 2.85505917846367 A:G A G 10 0.522818519378046 0.606127666882242 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 72 77 149 34.3570666047807 40.2570259921095 -5.89995938732886 A:G G A 10 0.522818519378046 0.367100894444761 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6704635 A/G 1 20 18 38 9.54362961243908 9.41073334880483 0.132896263634251 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 10 12 22 4.77181480621954 6.27382223253655 -1.50200742631701 C:G G C 10 0.522818519378046 0.531402320360827 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 7897133 A/G 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 A A 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7897059_7897209:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7897059_7897209:PER3;ENSG00000049246:ENST00000494684:exon_7896868_7897209:PER3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 10473238 G/A 1 121 120 241 57.7389591552564 62.7382223253655 -4.99926317010909 A:G G A 10 0.522818519378046 0.519924273198716 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 10511544 C/T 1 1 14 15 0.477181480621954 7.31945927129264 -6.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000323639760294951 ENSG00000175279:ENST00000320498:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000175279:ENST00000336114:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000400900:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000470413:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000465026:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000241563:ENST00000377049:exon_10511434_10511959:CORT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 10511589 T/C 0 0 14 14 0 7.31945927129264 -7.31945927129264 C T C 10 0.522818519378046 3.17373108416564e-05 ENSG00000175279:ENST00000320498:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000175279:ENST00000336114:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000400900:exon_10511434_10512210:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000470413:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000251503:ENST00000465026:exon_10511434_10511716:APITD1;ENSG00000241563:ENST00000377049:exon_10511434_10511959:CORT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 11 18 29 5.24899628684149 9.41073334880483 -4.16173706196334 T:C C T 10 0.522818519378046 0.138636572935384 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 74 75 149 35.3114295660246 39.2113889533534 -3.89995938732886 A:G G A 10 0.522818519378046 0.566105783100502 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 48 37 85 22.9047110698538 19.3442852169877 3.56042585286609 C:G C G 10 0.522818519378046 0.449650596826830 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 11181327 C/T 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C C T 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11181303_11181425:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11181303_11181425:MTOR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 11190646 G/A 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11190586_11190834:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11190586_11191615:MTOR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 11854457 G/A 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 T:C C T 10 0.522818519378046 0.414517478089946 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 23 35 58 10.9751740543049 18.2986481782316 -7.32347412392667 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0651026762717455 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 17 33 50 8.11208517057322 17.2530111394755 -9.1409259689023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0105652307749309 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 14 13 27 6.68054072870736 6.7966407519146 -0.116100023207243 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 23 27 50 10.9751740543049 14.1161000232072 -3.1409259689023 T:G T G 10 0.522818519378046 0.398075894512748 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 11 16 27 5.24899628684149 8.36509631004874 -3.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.252081759495933 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 14105568 G/A 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 20 20 40 9.54362961243908 10.4563703875609 -0.91274077512184 A:G A G 10 0.522818519378046 0.874522810547516 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 15752379 G/A 1 84 98 182 40.0832443722441 51.2362148990485 -11.1529705268044 A:G G A 10 0.522818519378046 0.102770775522749 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15752367_15752514:EFHD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 106 92 198 50.5812369459271 48.0993037827802 2.48193316314689 T:C C T 10 0.522818519378046 0.776065920140418 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:C A C 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 18 16 34 8.58926665119517 8.36509631004874 0.224170341146435 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 15909850 C/G 1 20 19 39 9.54362961243908 9.93355186818287 -0.389922255743794 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 15987602 A/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 32 12 44 15.2698073799025 6.27382223253655 8.99598514736597 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00647663558144744 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16255644 C/T 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 T:C C T 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000375753:exon_16254586_16255713:SPEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 8 12 20 3.81745184497563 6.27382223253655 -2.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.371143970102355 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 7 21 28 3.34027036435368 10.979188906939 -7.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00413811782049240 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16558493 A/G 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000132881:ENST00000375599:exon_16558195_16558792:C1orf89 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16577908 G/C 1 21 22 43 10.020811093061 11.502007426317 -1.48119633325598 C:G G C 10 0.522818519378046 0.651211501029653 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16577948 G/A 1 29 32 61 13.8382629380367 16.7301926200975 -2.89192968206081 A:G G A 10 0.522818519378046 0.522067992963489 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 A:G A G 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 185 113 298 88.2785739150615 59.0784926897192 29.2000812253423 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00074643999768558 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 8 39 47 3.81745184497563 20.3899222557438 -16.5724704107682 A:G G A 10 0.522818519378046 1.05096433893138e-06 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 17 8 25 8.11208517057322 4.18254815502437 3.92953701554885 T:C T C 10 0.522818519378046 0.159960831497985 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24077451 C/T 1 16 15 31 7.63490368995126 7.84227779067069 -0.207374100719426 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 54 51 105 25.7677999535855 26.6637444882803 -0.895944534694831 T:C C T 10 0.522818519378046 0.922248020329579 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 9 10 19 4.29463332559759 5.22818519378046 -0.933551868182875 T:C T C 10 0.522818519378046 0.819186685477746 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 27 1 28 12.8838999767928 0.522818519378046 12.3610814574147 T:C T C 10 0.522818519378046 3.77041552133496e-07 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 31 3 34 14.7926258992806 1.56845555813414 13.2241703411464 T:C C T 10 0.522818519378046 2.23689600047796e-06 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 20 10 30 9.54362961243908 5.22818519378046 4.31544441865862 C:G G C 10 0.522818519378046 0.143437749507336 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 21 4 25 10.020811093061 2.09127407751218 7.92953701554885 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00196053257185097 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 14 11 25 6.68054072870736 5.75100371315851 0.929537015548849 A:G G A 10 0.522818519378046 0.841950225699242 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C T C 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 24981439 A/G 1 46 34 80 21.9503481086099 17.7758296588536 4.17451844975632 A:G A G 10 0.522818519378046 0.372096278980983 ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000374389:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000479034:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000470243:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000496882:exon_24981346_24981614:SRRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 25667027 G/A 1 46 53 99 21.9503481086099 27.7093815270364 -5.75903341842655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.268836369529855 ENSG00000183726:ENST00000374358:exon_25666965_25667070:TMEM50A;ENSG00000183726:ENST00000498135:exon_25666965_25667070:TMEM50A;ENSG00000183726:ENST00000480937:exon_25666965_25667070:TMEM50A;ENSG00000183726:ENST00000468704:exon_25666965_25667070:TMEM50A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26496455 C/T 1 107 105 212 51.0584184265491 54.8959445346948 -3.83752610814576 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.630496769298931 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 197 216 413 94.0047516825249 112.928800185658 -18.924048503133 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0682495564701552 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 24 21 45 11.4523555349269 10.979188906939 0.473166627987927 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26883511 A/C 1 40 36 76 19.0872592248782 18.8214666976097 0.265792527268502 A:C A C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26883489_26883591:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26883489_26883527:RPS6KA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 48 52 100 22.9047110698538 27.1865630076584 -4.2818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.423738551744136 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 114 116 230 54.3986887909028 60.6469482478533 -6.24825945695058 C:G C G 10 0.522818519378046 0.42859406404327 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 21 28 49 10.020811093061 14.6389185425853 -4.61810744952426 A:G A G 10 0.522818519378046 0.200113196342329 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 22 28 50 10.497992573683 14.6389185425853 -4.1409259689023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.259463821154296 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 29442291 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000159023:ENST00000343067:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398863:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398861:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000356093:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398865:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000358989:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373800:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000349460:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000347529:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373798:exon_29442211_29442315:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000460378:exon_29442211_29442315:EPB41 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 562 654 1216 268.175992109538 341.923311673242 -73.747319563704 A:T:C:G C T 10 0.522818519378046 2.4014198295038e-05 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 554 596 1150 264.358540264563 311.599837549315 -47.2412972847529 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.00550773592847824 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 101 84 185 48.1953295428174 43.9167556277559 4.27857391506149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.556370682601585 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 33100323 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33100303_33100393:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000466361:exon_33099959_33100393:ZBTB8OS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 33133968 T/C 1 47 38 85 22.4275295892318 19.8671037363657 2.56042585286609 T:C T C 10 0.522818519378046 0.589316662553047 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33133826_33133999:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33133826_33133999:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000527118:exon_33133826_33133999:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000401893:exon_33133826_33134180:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000524393:exon_33133921_33133999:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33133826_33133999:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33133826_33133999:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33133920_33133999:RBBP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 14 18 32 6.68054072870736 9.41073334880483 -2.73019262009747 A:G G A 10 0.522818519378046 0.378459639583063 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 114 105 219 54.3986887909028 54.8959445346948 -0.497255743792081 T:C T C 10 0.522818519378046 0.946202214008055 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 38 22 60 18.1328962636343 11.502007426317 6.63088883731724 T:C:G G T 10 0.522818519378046 0.0936244851862192 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38329999 C/G 1 27 27 54 12.8838999767928 14.1161000232072 -1.23220004641448 C:G C G 10 0.522818519378046 0.786042800993254 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000487328:exon_38329984_38330521:INPP5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 11 24 35 5.24899628684149 12.5476444650731 -7.29864817823161 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0168794949956789 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38348506 G/A 1 13 6 19 6.2033592480854 3.13691111626828 3.06644813181713 A:G G A 10 0.522818519378046 0.175452094094042 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38348479_38348590:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38348479_38348590:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38348479_38348590:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38348479_38348590:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38348479_38348590:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38348479_38348590:INPP5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 116 118 234 55.3530517521467 61.6925852866094 -6.33953353446277 C:G G C 10 0.522818519378046 0.432429824226272 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 36 39 75 17.1785333023903 20.3899222557438 -3.21138895335345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.48906200011308 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 11 21 32 5.24899628684149 10.979188906939 -5.73019262009747 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0509844171791799 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 40705427 C/G 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 C:G C G 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 40882753 A/G 1 151 134 285 72.0544035739151 70.0576815966582 1.99672197725688 A:G A G 10 0.522818519378046 0.858849435785638 ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40882452_40882768:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40882452_40882768:SMAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 18 22 40 8.58926665119517 11.502007426317 -2.91274077512184 T:C C T 10 0.522818519378046 0.429207866402117 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 42046613 G/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:G G T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 47 34 81 22.4275295892318 17.7758296588536 4.65169993037827 T:C T C 10 0.522818519378046 0.318386818914184 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43213897 G/A 1 18 12 30 8.58926665119517 6.27382223253655 2.31544441865862 A:G G A 10 0.522818519378046 0.466589946286752 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43213871_43213988:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43213871_43213988:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43213871_43213988:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43213871_43213988:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43213871_43213988:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000460831:exon_43213871_43214414:LEPRE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43220601 G/A 1 25 27 52 11.9295370155488 14.1161000232072 -2.18656300765839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.580375481610123 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43220540_43220888:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43220540_43220661:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43220540_43220888:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43220540_43220661:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43220540_43220661:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43220540_43220607:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000447502:exon_43220540_43220658:LEPRE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43223508 G/A 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43223454_43223593:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43223454_43223593:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43223454_43223593:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43223454_43223593:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000463465:exon_43223454_43223616:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000397054:exon_43223454_43223593:LEPRE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43228001 G/T 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43227994_43228146:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43227994_43228146:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43227994_43228146:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43227994_43228146:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000463465:exon_43227994_43228074:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000397054:exon_43227994_43228146:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000372526:exon_43227994_43228017:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000492956:exon_43225657_43228146:LEPRE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 59 74 133 28.1537073566953 38.6885704339754 -10.5348630772801 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0688371579928564 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43908515 C/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 C:G C G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43908490_43908757:KIAA0467 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 43919413 A/G 1 26 22 48 12.4067184961708 11.502007426317 0.904711069853791 A:G A G 10 0.522818519378046 0.885378760422716 ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43919266_43919496:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43919266_43919634:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917876_43919580:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43919266_43919464:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43919266_43919519:HYI;ENSG00000178922:ENST00000469587:exon_43919266_43919479:HYI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 44132744 C/T 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000066135:ENST00000439179:exon_44132625_44132762:KDM4A;ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44132625_44132762:KDM4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 44154651 G/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 C:G G C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44154585_44154766:KDM4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 44156702 A/G 1 9 4 13 4.29463332559759 2.09127407751218 2.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.273369431451006 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44156516_44156720:KDM4A;ENSG00000066135:ENST00000481296:exon_44156261_44156720:KDM4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 45811136 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 13 8 21 6.2033592480854 4.18254815502437 2.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393742775407513 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46079979 A/C 1 145 115 260 69.1913146901833 60.1241297284753 9.06718496170804 A:C A C 10 0.522818519378046 0.264483918627576 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46079965_46080038:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46079965_46080038:NASP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46106052 G/A 1 33 28 61 15.7469888605245 14.6389185425853 1.10807031793919 A:G G A 10 0.522818519378046 0.7990451869019 ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46105882_46106075:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46105882_46106075:GPBP1L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 16 15 31 7.63490368995126 7.84227779067069 -0.207374100719426 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46500613 T/C 1 24 12 36 11.4523555349269 6.27382223253655 5.17853330239034 T:C T C 10 0.522818519378046 0.095804360115699 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 37 21 58 17.6557147830123 10.979188906939 6.67652587607333 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0877716373048896 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 82 62 144 39.1288814110002 32.4147482014389 6.71413320956137 T:C C T 10 0.522818519378046 0.278710837703166 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 40 18 58 19.0872592248782 9.41073334880483 9.67652587607333 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0121077705663969 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 18 55 73 8.58926665119517 28.7550185657925 -20.1657519145974 A:G A G 10 0.522818519378046 1.77045357169054e-06 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 51 17 68 24.3362555117197 8.88791482942678 15.4483406822929 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000142720839588931 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 19 8 27 9.06644813181713 4.18254815502437 4.88389997679276 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0813196557442666 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 47840592 A/G 1 39 42 81 18.6100777442562 21.9583778138779 -3.34830006962173 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.504970960673628 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47840581_47840657:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47840581_47840657:CMPK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 49224584 G/T 1 14 5 19 6.68054072870736 2.61409259689023 4.06644813181713 T:G G T 10 0.522818519378046 0.06875229877064 ENSG00000162373:ENST00000371833:exon_49224572_49224956:BEND5;ENSG00000162373:ENST00000476079:exon_49224572_49224605:BEND5;ENSG00000162373:ENST00000463562:exon_49224572_49225038:BEND5;ENSG00000162373:ENST00000294347:exon_49224572_49224956:BEND5;ENSG00000162373:ENST00000476096:exon_49224572_49224927:BEND5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 52231560 C/T 1 36 21 57 17.1785333023903 10.979188906939 6.19934439545137 T:C C T 10 0.522818519378046 0.111954262883240 ENSG00000117859:ENST00000371714:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371709:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000337809:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371710:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435274:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435686:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371707:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000447887:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000495776:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000428468:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000453295:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000489990:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000530544:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000532975:exon_52231494_52231577:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531828:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000361556:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000462759:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000486942:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000528603:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000475697:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531061:exon_52231494_52231653:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531819:exon_52231212_52231653:OSBPL9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 53679057 G/A 1 59 50 109 28.1537073566953 26.1409259689023 2.01278138779298 A:G G A 10 0.522818519378046 0.773772112960389 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 53679096 T/C 1 66 65 131 31.493977721049 33.983203759573 -2.48922603852403 T:C T C 10 0.522818519378046 0.663206053993816 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 57 52 109 27.1993443954514 27.1865630076584 0.0127813877929839 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 14 19 33 6.68054072870736 9.93355186818287 -3.25301113947552 A:G A G 10 0.522818519378046 0.297258881578533 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 A:G G A 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 58999651 T/G 1 15 5 20 7.15772220932931 2.61409259689023 4.54362961243908 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0455654006636223 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999621_58999732:OMA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C T C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 11 1 12 5.24899628684149 0.522818519378046 4.72617776746345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0069569782863362 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 75 72 147 35.7886110466466 37.6429333952193 -1.85432234857277 T:C T C 10 0.522818519378046 0.804512865128615 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 42 65 107 20.0416221861221 33.983203759573 -13.9415815734509 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0086729323273041 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 71 80 151 33.8798851241587 41.8254815502437 -7.94559642608495 A:G A G 10 0.522818519378046 0.221608821882447 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 39 48 87 18.6100777442562 25.0952889301462 -6.48521118589001 T:C T C 10 0.522818519378046 0.197505835624622 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 54 49 103 25.7677999535855 25.6181074495243 0.14969250406126 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 13 10 23 6.2033592480854 5.22818519378046 0.975174054304942 T:C C T 10 0.522818519378046 0.835285176690354 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 92732022 G/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92731976_92732049:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92731976_92732049:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495852:exon_92731976_92732049:GLMN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 11 14 25 5.24899628684149 7.31945927129264 -2.07046298445115 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430012309906698 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 93646418 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 14 8 22 6.68054072870736 4.18254815502437 2.49799257368299 C:G C G 10 0.522818519378046 0.393878100948442 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 95367773 A/G 1 1 18 19 0.477181480621954 9.41073334880483 -8.93355186818287 A:G A G 10 0.522818519378046 2.15842804474936e-05 ENSG00000117519:ENST00000370206:exon_95367677_95367814:CNN3;ENSG00000117519:ENST00000487539:exon_95367677_95367814:CNN3;ENSG00000117519:ENST00000415017:exon_95367677_95367814:CNN3;ENSG00000117519:ENST00000474409:exon_95367734_95367814:CNN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 C:G G C 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 12 23 35 5.72617776746345 12.0248259456951 -6.29864817823161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0412679611193136 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 21 14 35 10.020811093061 7.31945927129264 2.70135182176839 T:C T C 10 0.522818519378046 0.400562341047815 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 41 31 72 19.5644407055001 16.2073741007194 3.35706660478069 T:G G T 10 0.522818519378046 0.479621260758848 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 110584257 C/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110584158_110584264:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110584158_110584264:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110584158_110584264:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000473429:exon_110583793_110584483:FAM40A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:T A T 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 540 405 945 257.677999535855 211.741500348109 45.9364991877465 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00302328072894997 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 111737293 G/A 1 11 23 34 5.24899628684149 12.0248259456951 -6.77582965885356 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0246572777823146 ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111737200_111737348:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111737200_111737348:DENND2D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 111783981 G/A 1 254 222 476 121.204096077976 116.065711301926 5.1383847760501 A:G G A 10 0.522818519378046 0.646606452739386 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G G A 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 111992095 C/T 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 11 11 22 5.24899628684149 5.75100371315851 -0.502007426317013 T:C T C 10 0.522818519378046 0.834912590229453 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 A:G G A 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 19 16 35 9.06644813181713 8.36509631004874 0.701351821768389 A:G A G 10 0.522818519378046 0.86672112730153 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 116916105 C/T 1 22 17 39 10.497992573683 8.88791482942678 1.61007774425621 T:C C T 10 0.522818519378046 0.634093601603931 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116915836_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116915882_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116915882_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116915882_116916145:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000488733:exon_116915891_116916145:ATP1A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 117635401 G/A 1 22 9 31 10.497992573683 4.70536667440241 5.79262589928057 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0467607134084049 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117635353_117635523:TTF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 120277341 C/G 1 100 83 183 47.7181480621954 43.3939371083778 4.32421095381758 T:C:G C G 10 0.522818519378046 0.55413814996822 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120277257_120277389:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120277257_120277389:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000469443:exon_120276927_120277389:PHGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 120277370 T/C 1 125 84 209 59.6476850777442 43.9167556277559 15.7309294499884 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.0316895516839682 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120277257_120277389:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120277257_120277389:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000469443:exon_120276927_120277389:PHGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 20 0 20 9.54362961243908 0 9.54362961243908 C C 10 0.522818519378046 2.70288406206776e-06 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 144916676 C/T 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 C C 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 1 16 1 17 7.63490368995126 0.522818519378046 7.11208517057322 C:G C G 10 0.522818519378046 0.000336753038503922 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 1 15 1 16 7.15772220932931 0.522818519378046 6.63490368995126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000620132095782085 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 144922523 C/T 0 12 0 12 5.72617776746345 0 5.72617776746345 C C 10 0.522818519378046 0.00055645330269769 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 1 9 1 10 4.29463332559759 0.522818519378046 3.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0227710816327027 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 32 38 70 15.2698073799025 19.8671037363657 -4.59729635646322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.283543891153398 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 73 73 0 38.1657519145974 -38.1657519145974 A:C T C 10 0.522818519378046 3.4986570079978e-24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 61 61 0 31.8919296820608 -31.8919296820608 T G T 10 0.522818519378046 2.51014265467395e-20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 70 70 0 36.5972963564632 -36.5972963564632 A C A 10 0.522818519378046 3.21996111584499e-23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 79 0 79 37.6973369691344 0 37.6973369691344 G G 10 0.522818519378046 5.98151536745425e-23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 52 52 0 27.1865630076584 -27.1865630076584 C T C 10 0.522818519378046 1.95679883083313e-17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 71 71 0 37.1201148758413 -37.1201148758413 T C T 10 0.522818519378046 1.53650581280403e-23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 86 0 86 41.037607333488 0 41.037607333488 C C 10 0.522818519378046 6.22202004845893e-25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 C:G C G 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 149876665 G/A 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000159164:ENST00000369146:exon_149874870_149876749:SV2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 93 43 136 44.3778776978417 22.481196333256 21.8966813645857 T:C:G G T 10 0.522818519378046 0.000198634259348514 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 150248200 G/A 1 6 52 58 2.86308888373172 27.1865630076584 -24.3234741239267 A:G G A 10 0.522818519378046 3.27399591174466e-11 ENSG00000118292:ENST00000369102:exon_150248150_150248208:C1orf54;ENSG00000118292:ENST00000369099:exon_150248150_150248208:C1orf54;ENSG00000118292:ENST00000369098:exon_150248150_150248208:C1orf54 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 32 20 52 15.2698073799025 10.4563703875609 4.81343699234161 A:G G A 10 0.522818519378046 0.211811822066796 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 150997155 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000143363:ENST00000467771:exon_150997087_150997271:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000450884:exon_150997087_150997271:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_150997087_150997271:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_150997087_150997271:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_150997090_150997271:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_150997087_150997271:PRUNE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151089888 A/C 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:C A C 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000143458:ENST00000368918:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368917:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368916:exon_151089868_151089992:GABPB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151219406 G/T 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 T:G G T 10 0.522818519378046 0.177905026249726 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151219396_151219441:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151219396_151219441:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151219396_151219441:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151219396_151219441:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151219396_151219441:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151219396_151219441:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000489625:exon_151219396_151219441:PIP5K1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 496 490 986 236.682014388489 256.181074495243 -19.4990601067534 A:T:C T C 10 0.522818519378046 0.213956078784649 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151262453 C/T 1 26 24 50 12.4067184961708 12.5476444650731 -0.140925968902302 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151262154_151262483:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151262154_151262483:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151262154_151262483:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151262154_151262483:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151262154_151262483:ZNF687 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151288496 A/G 1 15 11 26 7.15772220932931 5.75100371315851 1.4067184961708 A:G A G 10 0.522818519378046 0.695704929825334 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 288 243 531 137.428266419123 127.044900208865 10.3833662102575 A:G G A 10 0.522818519378046 0.384989247931980 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 32 37 69 15.2698073799025 19.3442852169877 -4.07447783708518 A:C A C 10 0.522818519378046 0.337390920028707 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 74 72 146 35.3114295660246 37.6429333952193 -2.33150382919472 A:G A G 10 0.522818519378046 0.740552374964764 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 0 0 12 12 0 6.27382223253655 -6.27382223253655 C G C 10 0.522818519378046 0.000139380803775562 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 153533898 A/G 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000196754:ENST00000368708:exon_153533584_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368711:exon_153533596_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000487430:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000497140:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368710:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368709:exon_153533819_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368707:exon_153533825_153534067:S100A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 153534027 C/T 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000196754:ENST00000368708:exon_153533584_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368711:exon_153533596_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000487430:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000497140:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368710:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368709:exon_153533819_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368707:exon_153533825_153534067:S100A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 153662340 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000169418:ENST00000368680:exon_153662282_153662456:NPR1;ENSG00000169418:ENST00000428723:exon_153662282_153662456:NPR1;ENSG00000169418:ENST00000368677:exon_153662282_153662456:NPR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 T:C C T 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 21 24 45 10.020811093061 12.5476444650731 -2.52683337201207 T:C T C 10 0.522818519378046 0.460065955001111 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 154904840 T/C 1 77 70 147 36.7429740078905 36.5972963564632 0.145677651427235 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154904828_154904891:PMVK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 46 37 83 21.9503481086099 19.3442852169877 2.60606289162218 T:C C T 10 0.522818519378046 0.584554065193751 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 154938235 G/C 1 12 22 34 5.72617776746345 11.502007426317 -5.77582965885357 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0581319391366077 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154938115_154938238:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938019_154938257:SHC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 154938662 T/C 1 13 26 39 6.2033592480854 13.5932815038292 -7.38992225574379 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0236684850338677 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938638_154938707:SHC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:C A C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155033308 G/A 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033239_155033308:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000468053:exon_155033239_155033308:ADAM15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155112440 A/C 1 106 90 196 50.5812369459271 47.0536667440241 3.52757020190298 A:C A C 10 0.522818519378046 0.617693444944079 ENSG00000179085:ENST00000368399:exon_155112367_155112883:DPM3;ENSG00000179085:ENST00000368400:exon_155112367_155112721:DPM3;ENSG00000179085:ENST00000341298:exon_155112367_155112747:DPM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155206168 C/T 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 T:C C T 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000177628:ENST00000368373:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000327247:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000402928:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000427500:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000428024:exon_155206036_155206260:GBA;ENSG00000177628:ENST00000478472:exon_155206036_155206250:GBA;ENSG00000177628:ENST00000491081:exon_155205973_155206260:GBA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 148 175 323 70.6228591320492 91.4932408911581 -20.8703817591089 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0222612845382108 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155629964 C/T 1 127 136 263 60.6020480389882 71.1033186354143 -10.5012705964261 T:C C T 10 0.522818519378046 0.195598921925044 ENSG00000163374:ENST00000359205:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000355499:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000311573:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000347088:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361831:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368340:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000295566:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000436865:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000354691:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000442834:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368330:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000407221:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000404643:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361140:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368339:exon_155629248_155630704:YY1AP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 155735901 C/T 1 18 19 37 8.58926665119517 9.93355186818287 -1.3442852169877 T:C C T 10 0.522818519378046 0.742800814192079 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000497369:exon_155735240_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000476028:exon_155735249_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471442:exon_155735249_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000477831:exon_155735250_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000495937:exon_155735250_155736500:GON4L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 211 167 378 100.685292411232 87.3106927361337 13.3745996750986 T:C T C 10 0.522818519378046 0.180636375243178 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156106185 T/C 1 495 424 919 236.204832907867 221.675052216292 14.5297806915757 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.338506748696394 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156146529 C/T 1 88 123 211 41.9919702947319 64.3066778834997 -22.3147075887677 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00236073530627535 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 196 116 312 93.527570201903 60.6469482478533 32.8806219540496 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000218766832642039 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 15 16 31 7.15772220932931 8.36509631004874 -1.20737410071943 A:G G A 10 0.522818519378046 0.72105496133213 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156503876 G/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156503801_156503933:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156503801_156503933:IQGAP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156694024 G/T 1 23 17 40 10.9751740543049 8.88791482942678 2.08725922487816 T:G G T 10 0.522818519378046 0.531014279535613 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156693940_156694140:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000472824:exon_156693940_156694140:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156693940_156694140:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156693750_156694140:ISG20L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 18 43 61 8.58926665119517 22.481196333256 -13.8919296820608 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000443795805007156 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156705593 G/C 1 20 17 37 9.54362961243908 8.88791482942678 0.655714783012298 C:G G C 10 0.522818519378046 0.870498746331351 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156705517_156705701:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156705517_156705701:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156705517_156705701:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156705414_156705701:C1orf66 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/G 1 26 21 47 12.4067184961708 10.979188906939 1.42752958923184 A:G A G 10 0.522818519378046 0.770715896326443 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 157494106 C/T 1 11 21 32 5.24899628684149 10.979188906939 -5.73019262009747 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0509844171791799 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 157504422 C/T 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 157504433 C/G 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 C:G C G 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 157508908 T/C 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 200 192 392 95.4362961243908 100.381155720585 -4.94485959619405 C:G G C 10 0.522818519378046 0.649135234068708 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 158988270 T/C 1 59 65 124 28.1537073566953 33.983203759573 -5.82949640287771 T:C T C 10 0.522818519378046 0.322926993164016 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158988019_158988441:IFI16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 208 195 403 99.2537479693664 101.949611278719 -2.69586330935255 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.803220640543608 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 159021506 C/T 1 115 96 211 54.8758702715247 50.1905778602924 4.68529241123229 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.535637210213497 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159021469_159023514:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159021469_159023514:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159021469_159021888:IFI16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 159174683 T/C 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000213088:ENST00000368122:exon_159174064_159174770:DARC;ENSG00000213088:ENST00000359381:exon_159173803_159174770:DARC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 160063531 G/A 1 20 9 29 9.54362961243908 4.70536667440241 4.83826293803667 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0932207570937154 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000448417:exon_160063500_160063961:IGSF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 160321065 A/G 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321012_160321162:NCSTN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 160324078 C/T 1 24 15 39 11.4523555349269 7.84227779067069 3.6100777442562 T:C C T 10 0.522818519378046 0.265567806032608 ENSG00000162736:ENST00000368065:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000459963:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424645:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424754:exon_160323908_160324080:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000435149:exon_160323908_160324080:NCSTN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 160616703 G/T 1 77 94 171 36.7429740078905 49.1449408215363 -12.4019668136459 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0658904855551656 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1444 1226 2670 689.050058018102 640.975504757484 48.0745532606172 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0629274339232569 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:T A T 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 165648710 G/A 1 21 22 43 10.020811093061 11.502007426317 -1.48119633325598 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.651211501029653 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 165667781 T/G 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:G T G 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165667615_165668100:ALDH9A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 166039898 C/G 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 C:G C G 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000188859:ENST00000435676:exon_166039069_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000456900:exon_166039072_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000441649:exon_166038749_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000354422:exon_166039256_166040000:FAM78B;ENSG00000188859:ENST00000338353:exon_166039257_166040000:FAM78B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 187 141 328 89.2329368763054 73.7174112323045 15.5155256440009 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0869227101233994 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 32 43 75 15.2698073799025 22.481196333256 -7.21138895335345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.105736679259023 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 169345868 A/G 1 2 12 14 0.954362961243908 6.27382223253655 -5.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00555620947682752 ENSG00000117475:ENST00000367808:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000329281:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000367807:exon_169345778_169346621:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000420531:exon_169345778_169346132:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000426663:exon_169345778_169346217:BLZF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 169346081 G/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000117475:ENST00000367808:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000329281:exon_169345778_169346217:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000367807:exon_169345778_169346621:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000420531:exon_169345778_169346132:BLZF1;ENSG00000117475:ENST00000426663:exon_169345778_169346217:BLZF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 80 136 216 38.1745184497563 71.1033186354143 -32.9288001856579 A:G A G 10 0.522818519378046 8.25378913560513e-06 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 9 11 20 4.29463332559759 5.75100371315851 -1.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.65556110720683 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 27 7 34 12.8838999767928 3.65972963564632 9.22417034114644 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00161976411457433 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 82 63 145 39.1288814110002 32.9375667208169 6.19131469018333 A:C:G A C 10 0.522818519378046 0.319182871394444 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 171483718 G/T 1 64 82 146 30.5396147598051 42.8711185889998 -12.3315038291947 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0464954731828285 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 48 30 78 22.9047110698538 15.6845555813414 7.22015548851241 C:G G C 10 0.522818519378046 0.112707820286732 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 18 15 33 8.58926665119517 7.84227779067069 0.746988860524481 A:G A G 10 0.522818519378046 0.862627047462256 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 171755041 G/A 1 20 31 51 9.54362961243908 16.2073741007194 -6.66374448828035 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0686111360276933 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 19 23 42 9.06644813181713 12.0248259456951 -2.95837781387793 A:G G A 10 0.522818519378046 0.440324582601068 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 218 209 427 104.025562775586 109.269070550012 -5.24350777442565 T:C C T 10 0.522818519378046 0.628214858624123 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 173735378 T/C 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 T T 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000076321:ENST00000209884:exon_173735285_173735428:KLHL20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 36 32 68 17.1785333023903 16.7301926200975 0.448340682292869 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 179312752 C/T 1 15 6 21 7.15772220932931 3.13691111626828 4.02081109306103 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0848273583540288 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179312725_179312770:SOAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 179852074 T/C 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000143337:ENST00000528443:exon_179851177_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000398836:exon_179851177_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000325993:exon_179851420_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000367610:exon_179851420_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000271583:exon_179851432_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000435319:exon_179851447_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000531630:exon_179851929_179852112:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000527391:exon_179852024_179852127:TOR1AIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 179887125 G/A 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000143337:ENST00000398836:exon_179886587_179890583:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000325993:exon_179887082_179887374:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000367610:exon_179886587_179889211:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000271583:exon_179886587_179888412:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000435319:exon_179886587_179887533:TOR1AIP1;ENSG00000143337:ENST00000447964:exon_179886587_179887306:TOR1AIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 26 28 54 12.4067184961708 14.6389185425853 -2.23220004641449 A:G G A 10 0.522818519378046 0.587079192272264 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 181548341 A/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000198216:ENST00000524607:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000533229:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181548208_181548360:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181548208_181548360:CACNA1E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 183486859 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000116698:ENST00000440812:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507691:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000444547:exon_183486761_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000419169:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000456731:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183486823_183486955:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183486823_183486955:SMG7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 183895435 A/C 1 13 10 23 6.2033592480854 5.22818519378046 0.975174054304942 A:C A C 10 0.522818519378046 0.835285176690354 ENSG00000143344:ENST00000304685:exon_183895239_183897666:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000367531:exon_183895239_183897665:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000360851:exon_183895239_183897665:RGL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 184764410 C/T 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 T:C C T 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 185278176 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185278135_185278304:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185278135_185278304:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000392007:exon_185278135_185278304:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000367497:exon_185278135_185278304:IVNS1ABP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 186321242 C/T 1 18 15 33 8.58926665119517 7.84227779067069 0.746988860524481 T:C C T 10 0.522818519378046 0.862627047462256 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000491783:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000469463:exon_186321084_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186321147_186321242:TPR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 198725202 C/A 1 30 19 49 14.3154444186586 9.93355186818287 4.38189255047575 A:C C A 10 0.522818519378046 0.252698826748261 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198725035_198726412:PTPRC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 A:T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C T C 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 40 32 72 19.0872592248782 16.7301926200975 2.35706660478069 A:G A G 10 0.522818519378046 0.63755926914724 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 201355669 T/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 201358304 C/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:C C A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201358288_201358431:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201358288_201358431:LAD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 41 26 67 19.5644407055001 13.5932815038292 5.97115920167092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.178121072506746 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 72 75 147 34.3570666047807 39.2113889533534 -4.85432234857277 A:G G A 10 0.522818519378046 0.457645175924001 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 201981862 T/C 1 21 20 41 10.020811093061 10.4563703875609 -0.435559294499887 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000163435:ENST00000359651:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367284:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367283:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000490203:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000446188:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000470384:exon_201981573_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000479874:exon_201981697_201981887:ELF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 203743653 C/T 1 9 1 10 4.29463332559759 0.522818519378046 3.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0227710816327027 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 25 26 51 11.9295370155488 13.5932815038292 -1.66374448828035 A:C C A 10 0.522818519378046 0.675704133808493 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 204379617 T/C 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 204518499 C/G 1 9 13 22 4.29463332559759 6.7966407519146 -2.50200742631701 C:G C G 10 0.522818519378046 0.295879508077689 ENSG00000198625:ENST00000367182:exon_204518241_204527248:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000454264:exon_204518241_204527248:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000367183:exon_204518394_204518810:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000463049:exon_204518241_204523329:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000391947:exon_204518241_204518786:MDM4;ENSG00000198625:ENST00000444261:exon_204518241_204518516:MDM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 206646630 T/A 1 11 7 18 5.24899628684149 3.65972963564632 1.58926665119517 A:T T A 10 0.522818519378046 0.488968467594439 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206646539_206646657:IKBKE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 18 8 26 8.58926665119517 4.18254815502437 4.4067184961708 A:G G A 10 0.522818519378046 0.114830012681343 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 206651107 G/A 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 G G 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206651092_206651202:IKBKE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 206821569 C/T 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000143479:ENST00000391931:exon_206820733_206822541:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367109:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367105:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367108:exon_206820733_206822542:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367106:exon_206820733_206822459:DYRK3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 32 31 63 15.2698073799025 16.2073741007194 -0.9375667208169 T:C C T 10 0.522818519378046 0.89977401180023 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 207269858 T/C 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000123843:ENST00000469326:exon_207268279_207269960:C4BPB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 207653395 C/A 1 16 9 25 7.63490368995126 4.70536667440241 2.92953701554885 A:C C A 10 0.522818519378046 0.317159513391763 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 20 7 27 9.54362961243908 3.65972963564632 5.88389997679276 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0322344835346418 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 33 16 49 15.7469888605245 8.36509631004874 7.38189255047575 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0442628672815834 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 33 12 45 15.7469888605245 6.27382223253655 9.47316662798793 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00446679720303756 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 88 85 173 41.9919702947319 44.4395741471339 -2.44760385240196 C:G C G 10 0.522818519378046 0.760902909060809 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 21 23 44 10.020811093061 12.0248259456951 -2.00401485263403 T:C T C 10 0.522818519378046 0.550647233196772 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 211840498 T/C 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 T:C T C 10 0.522818519378046 0.274460962299708 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000489633:exon_211840448_211840573:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211839772_211840573:NEK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 A:G A G 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 30 33 63 14.3154444186586 17.2530111394755 -2.9375667208169 T:C T C 10 0.522818519378046 0.528663385754924 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 T:C C T 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 215793834 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000136636:ENST00000259154:exon_215793399_215795073:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000444044:exon_215793399_215795147:KCTD3;ENSG00000136636:ENST00000495537:exon_215793399_215795073:KCTD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 217604654 T/C 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217600334_217604707:GPATCH2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 225600169 C/T 1 23 12 35 10.9751740543049 6.27382223253655 4.70135182176839 T:C C T 10 0.522818519378046 0.128629268283738 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225600156_225600347:LBR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 226050512 C/T 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226050471_226050551:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000474478:exon_226050471_226050799:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000483779:exon_226050471_226050551:TMEM63A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 227069677 T/C 1 10 4 14 4.77181480621954 2.09127407751218 2.68054072870736 T:C T C 10 0.522818519378046 0.185914534035155 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 227182033 G/A 0 32 0 32 15.2698073799025 0 15.2698073799025 G G 10 0.522818519378046 1.02325042733130e-09 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227177566_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227177566_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227177567_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227181328_227182100:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227181968_227182100:CDC42BPA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 45 56 101 21.4731666279879 29.2778370851706 -7.80467045718265 A:G G A 10 0.522818519378046 0.135025199152971 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 46 49 95 21.9503481086099 25.6181074495243 -3.66775934091437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.473283670955928 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 227954677 C/T 1 59 58 117 28.1537073566953 30.3234741239267 -2.16976676723138 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.711860632052735 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 228289843 C/T 1 31 43 74 14.7926258992806 22.481196333256 -7.68857043397541 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0809892288258677 ENSG00000143793:ENST00000469781:exon_228289040_228290261:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000272139:exon_228289781_228289866:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000485896:exon_228289781_228290083:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000472617:exon_228289781_228289866:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000492757:exon_228289781_228289866:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000465199:exon_228289757_228289866:C1orf35 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 228362682 G/A 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362393_228362730:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362393_228362730:C1orf69 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229622162 A/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229623338 T/C 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229623213_229623360:NUP133 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229730452 G/A 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:G T G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229773941 A/G 1 5 12 17 2.38590740310977 6.27382223253655 -3.88791482942678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0866776016309947 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 A:T T A 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 21 8 29 10.020811093061 4.18254815502437 5.83826293803666 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0393121190083874 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 21 5 26 10.020811093061 2.61409259689023 7.4067184961708 A:G G A 10 0.522818519378046 0.004915738641318 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 0 21 0 21 10.020811093061 0 10.020811093061 C C 10 0.522818519378046 1.39601812080774e-06 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 23 2 25 10.9751740543049 1.04563703875609 9.92953701554885 A:G G A 10 0.522818519378046 2.84956913318355e-05 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234743237 G/A 1 99 86 185 47.2409665815734 44.962392666512 2.27857391506149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.768694493306515 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 234744480 G/A 1 43 44 87 20.518803666744 23.004014852634 -2.48521118589001 A:G G A 10 0.522818519378046 0.593854917613286 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 235345346 C/T 1 11 18 29 5.24899628684149 9.41073334880483 -4.16173706196334 T:C C T 10 0.522818519378046 0.138636572935384 ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000444620:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235343454_235346108:ARID4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 15 21 36 7.15772220932931 10.979188906939 -3.82146669760966 A:G A G 10 0.522818519378046 0.243198816272398 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 14 21 35 6.68054072870736 10.979188906939 -4.29864817823161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.175917062089336 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 12 2 14 5.72617776746345 1.04563703875609 4.68054072870736 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0141983257918061 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 14 1 15 6.68054072870736 0.522818519378046 6.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00113963630404871 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 14 6 20 6.68054072870736 3.13691111626828 3.54362961243908 T:C C T 10 0.522818519378046 0.122855061020348 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 8 20 28 3.81745184497563 10.4563703875609 -6.63891854258529 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0134695484537490 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 1 19 1 20 9.06644813181713 0.522818519378046 8.54362961243908 T:G G T 10 0.522818519378046 5.34126814673268e-05 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 1 19 1 20 9.06644813181713 0.522818519378046 8.54362961243908 A:T T A 10 0.522818519378046 5.34126814673268e-05 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 11 33 44 5.24899628684149 17.2530111394755 -12.004014852634 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000383462512286213 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 21 21 42 10.020811093061 10.979188906939 -0.958377813877934 T:C C T 10 0.522818519378046 0.877487670924755 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 38 28 66 18.1328962636343 14.6389185425853 3.49397772104896 T:C T C 10 0.522818519378046 0.459985858431902 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 36 35 71 17.1785333023903 18.2986481782316 -1.12011487584127 T:C T C 10 0.522818519378046 0.813051456983646 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 34 28 62 16.2241703411464 14.6389185425853 1.58525179856115 A:G A G 10 0.522818519378046 0.704959104613931 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236723074 G/C 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 C:G G C 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 5 10 15 2.38590740310977 5.22818519378046 -2.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.195994901009809 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 16 17 33 7.63490368995126 8.88791482942678 -1.25301113947552 A:G A G 10 0.522818519378046 0.728839376751847 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 22 28 50 10.497992573683 14.6389185425853 -4.1409259689023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.259463821154296 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 243419429 T/A 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000391846:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000490065:exon_243419336_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243419358_243419542:SDCCAG8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 1 246755002 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366511:exon_246754814_246755243:CNST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 91 92 183 43.4235147365978 48.0993037827802 -4.67578904618242 T:C C T 10 0.522818519378046 0.505954733220458 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3179738 G/A 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 G G 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3179735_3179762:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000433193:exon_3179735_3179904:PFKP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 102 120 222 48.6725110234393 62.7382223253655 -14.0657113019262 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0601444622244809 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 63 67 130 30.0624332791831 35.0288407983291 -4.96640751914599 T:C C T 10 0.522818519378046 0.429538603382137 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 63 72 135 30.0624332791831 37.6429333952193 -7.58050011603622 T:C T C 10 0.522818519378046 0.197165758306859 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 41 39 80 19.5644407055001 20.3899222557438 -0.82548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 0.911029602353347 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 4 13 17 1.90872592248782 6.7966407519146 -4.88791482942678 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0260795252789011 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 11 17 28 5.24899628684149 8.88791482942678 -3.63891854258529 T:C T C 10 0.522818519378046 0.188348939121894 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 5790420 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 5803368 A/G 1 15 15 30 7.15772220932931 7.84227779067069 -0.68455558134138 A:G A G 10 0.522818519378046 0.856180537932261 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5803253_5803434:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5803253_5803434:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000487196:exon_5803253_5803764:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000459693:exon_5802803_5803434:C10orf18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 12 8 20 5.72617776746345 4.18254815502437 1.54362961243908 T:G T G 10 0.522818519378046 0.512380593640314 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 8115908 G/A 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000107485:ENST00000379328:exon_8115702_8117161:GATA3;ENSG00000107485:ENST00000346208:exon_8115702_8116853:GATA3;ENSG00000107485:ENST00000461472:exon_8115702_8116027:GATA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 56 38 94 26.7221629148294 19.8671037363657 6.85505917846367 A:G G A 10 0.522818519378046 0.179426816859369 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 4 10 14 1.90872592248782 5.22818519378046 -3.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.106723132817195 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 15 23 38 7.15772220932931 12.0248259456951 -4.86710373636575 A:G A G 10 0.522818519378046 0.143213634766017 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 28 50 78 13.3610814574147 26.1409259689023 -12.7798445114876 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00436287850095425 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 47 74 121 22.4275295892318 38.6885704339754 -16.2610408447436 C:G C G 10 0.522818519378046 0.00345996079118629 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 15177280 T/C 1 42 23 65 20.0416221861221 12.0248259456951 8.01679624042701 T:C T C 10 0.522818519378046 0.047675215610799 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 45 47 92 21.4731666279879 24.5724704107682 -3.09930378278023 A:C C A 10 0.522818519378046 0.532703287759502 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 9 12 21 4.29463332559759 6.27382223253655 -1.97918890693897 A:G A G 10 0.522818519378046 0.513308181962307 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 26800759 C/T 1 34 16 50 16.2241703411464 8.36509631004874 7.8590740310977 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0327702502136701 ENSG00000077420:ENST00000445780:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000335513:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000376236:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000490118:exon_26800676_26800835:APBB1IP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 27306678 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27306431_27306721:ANKRD26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 31137611 C/T 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31137460_31138220:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31137460_31138372:ZNF438 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 31750099 C/T 1 10 4 14 4.77181480621954 2.09127407751218 2.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.185914534035155 ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000424869:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31749966_31750166:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000493835:exon_31749966_31750165:ZEB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 32582006 T/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:T T A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32581916_32582122:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32581916_32582122:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32581916_32582122:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32581916_32582122:EPC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 34408636 T/C 1 27 5 32 12.8838999767928 2.61409259689023 10.2698073799025 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000253724907675936 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34408541_34408668:PARD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 34620220 C/T 1 66 111 177 31.493977721049 58.0328556509631 -26.5388779299141 T:C C T 10 0.522818519378046 8.15625959418068e-05 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34620045_34620272:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34620045_34620272:PARD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 11 14 25 5.24899628684149 7.31945927129264 -2.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.430012309906698 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 43292451 G/C 1 26 47 73 12.4067184961708 24.5724704107682 -12.1657519145974 C:G G C 10 0.522818519378046 0.00474498558144621 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 43882418 A/T 1 292 294 586 139.336992341611 153.708644697146 -14.371652355535 A:T A T 10 0.522818519378046 0.246912928020442 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 45472785 C/T 1 1 50 51 0.477181480621954 26.1409259689023 -25.6637444882803 T:C C T 10 0.522818519378046 2.33240347534921e-15 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 45479476 G/T 1 2 13 15 0.954362961243908 6.7966407519146 -5.84227779067069 T:G G T 10 0.522818519378046 0.00304851253320044 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45479389_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45479389_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471941:exon_45478476_45480418:RASSF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 45480350 G/A 1 2 13 15 0.954362961243908 6.7966407519146 -5.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00304851253320044 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471941:exon_45478476_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471808:exon_45480324_45480418:RASSF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 45499009 A/G 1 31 38 69 14.7926258992806 19.8671037363657 -5.07447783708518 A:G A G 10 0.522818519378046 0.230216640618344 ENSG00000165512:ENST00000298299:exon_45498728_45500774:ZNF22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 45499272 C/G 1 49 28 77 23.3818925504757 14.6389185425853 8.74297400789045 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0521354391428335 ENSG00000165512:ENST00000298299:exon_45498728_45500774:ZNF22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 45920506 G/A 1 8 14 22 3.81745184497563 7.31945927129264 -3.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.142061348999446 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45920408_45920580:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000483623:exon_45920408_45920580:ALOX5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 46122199 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 50732280 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50732079_50732823:ERCC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 51582911 C/T 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000330923:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51582796_51582939:NCOA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 51589246 T/C 1 36 28 64 17.1785333023903 14.6389185425853 2.53961475980505 T:C T C 10 0.522818519378046 0.534809831801875 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51589225_51590732:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51589225_51590732:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51589225_51590734:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51589225_51590731:NCOA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 18 0 18 8.58926665119517 0 8.58926665119517 G G 10 0.522818519378046 1.01631266243485e-05 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 9 11 20 4.29463332559759 5.75100371315851 -1.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.65556110720683 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 15 24 39 7.15772220932931 12.5476444650731 -5.3899222557438 A:G A G 10 0.522818519378046 0.107956901799775 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 69 78 147 32.9255221629148 40.7798445114876 -7.85432234857277 T:C T C 10 0.522818519378046 0.215515227155439 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:G G T 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/G 1 23 15 38 10.9751740543049 7.84227779067069 3.13289626363425 A:G A G 10 0.522818519378046 0.333680076376377 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 4 11 15 1.90872592248782 5.75100371315851 -3.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0677330756934676 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 65225450 C/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_65225255_65225641:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_65225255_65225722:JMJD1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 69695936 T/G 1 24 12 36 11.4523555349269 6.27382223253655 5.17853330239034 T:G T G 10 0.522818519378046 0.095804360115699 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69695910_69695992:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69695910_69695992:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69695910_69695992:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69695910_69695992:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69695910_69695992:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69695910_69695992:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69695910_69695992:HERC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 70098341 G/A 1 169 131 300 80.6436702251102 68.489226038524 12.1544441865862 A:G G A 10 0.522818519378046 0.165659816202041 ENSG00000096746:ENST00000469172:exon_70096956_70098444:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000461310:exon_70098260_70098444:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000265866:exon_70098260_70098444:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000480987:exon_70098260_70098399:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000486854:exon_70098260_70098444:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000467249:exon_70098260_70098432:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000354695:exon_70098260_70098399:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000481819:exon_70096563_70098444:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000491200:exon_70098260_70098444:HNRNPH3;ENSG00000096746:ENST00000490442:exon_70098097_70098444:HNRNPH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 13 7 20 6.2033592480854 3.65972963564632 2.54362961243908 A:G G A 10 0.522818519378046 0.273132298373759 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 70863699 C/T 1 699 494 1193 333.549854954746 258.272348572755 75.2775063819911 A:T:C C T 10 0.522818519378046 1.34444091595454e-05 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 71151885 C/T 1 46 25 71 21.9503481086099 13.0704629844512 8.87988512415873 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0427279729420570 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000467710:exon_71151881_71151918:HK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 117 84 201 55.8302332327686 43.9167556277559 11.9134776050127 T:C C T 10 0.522818519378046 0.104169088171314 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 71906238 G/A 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 13 16 29 6.2033592480854 8.36509631004874 -2.16173706196333 T:C C T 10 0.522818519378046 0.460889625504142 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 73521371 C/T 1 41 10 51 19.5644407055001 5.22818519378046 14.3362555117197 T:C C T 10 0.522818519378046 5.6059010697998e-05 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 73533177 A/G 1 9 17 26 4.29463332559759 8.88791482942678 -4.5932815038292 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0790579932984927 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73533115_73533255:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73533115_73533196:C10orf54 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 74886544 A/G 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000166321:ENST00000488223:exon_74886393_74886585:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000357321:exon_74886431_74886585:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000372997:exon_74886431_74886585:NUDT13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 17 10 27 8.11208517057322 5.22818519378046 2.88389997679276 A:G G A 10 0.522818519378046 0.336212248871896 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 28 33 61 13.3610814574147 17.2530111394755 -3.89192968206081 A:C C A 10 0.522818519378046 0.369882188376343 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 77807027 T/C 1 32 31 63 15.2698073799025 16.2073741007194 -0.9375667208169 T:C T C 10 0.522818519378046 0.89977401180023 ENSG00000148655:ENST00000354343:exon_77806922_77807061:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000372499:exon_77806922_77807061:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000496424:exon_77806637_77807061:C10orf11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 79795388 T/C 1 3886 4042 7928 1854.32723369691 2113.23245532606 -258.905221629149 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 6.08773136441414e-09 ENSG00000138326:ENST00000440692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000478655:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000372360:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000401656:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000464716:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000476545:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000360830:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000466129:exon_79795269_79795844:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000475468:exon_79795269_79795412:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000482069:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000465692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000467106:exon_79795269_79795448:RPS24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 81064950 G/C 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 C:G G C 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81064921_81064988:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81064921_81064988:ZMIZ1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 T:G G T 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 238 249 487 113.569192388025 130.181811325133 -16.6126189371084 A:G G A 10 0.522818519378046 0.134560968723493 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 38 21 59 18.1328962636343 10.979188906939 7.15370735669528 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0682689667574759 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:T A T 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 90673024 G/A 1 1 10 11 0.477181480621954 5.22818519378046 -4.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00461012857101643 ENSG00000138134:ENST00000371926:exon_90672858_90673215:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371927:exon_90672858_90673215:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371924:exon_90672858_90673215:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371922:exon_90672113_90673215:STAMBPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:G G A 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:T T A 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 9 19 28 4.29463332559759 9.93355186818287 -5.63891854258529 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0374170450228554 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:G A G 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 12 17 29 5.72617776746345 8.88791482942678 -3.16173706196333 A:G A G 10 0.522818519378046 0.267874636611497 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 95262981 A/G 1 13 22 35 6.2033592480854 11.502007426317 -5.29864817823161 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0899323512916048 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95262870_95263145:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95262870_95263145:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95262870_95263145:CEP55 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 22 35 57 10.497992573683 18.2986481782316 -7.80065560454862 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0460850267501089 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 33 29 62 15.7469888605245 15.1617370619633 0.585251798561147 T:C C T 10 0.522818519378046 0.899584033069993 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 96098493 T/A 1 17 8 25 8.11208517057322 4.18254815502437 3.92953701554885 A:T T A 10 0.522818519378046 0.159960831497985 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 11 17 28 5.24899628684149 8.88791482942678 -3.63891854258529 A:C A C 10 0.522818519378046 0.188348939121894 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 97380991 G/C 1 19 22 41 9.06644813181713 11.502007426317 -2.43555929449989 C:G G C 10 0.522818519378046 0.532312669097316 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97380788_97381008:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97380788_97381008:ALDH18A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 97388162 G/A 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 A:G G A 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97388125_97388249:ALDH18A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:T A T 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 67 79 146 31.9711592016709 41.3026630308656 -9.33150382919472 T:C C T 10 0.522818519378046 0.135764081085087 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 52 71 123 24.8134369923416 37.1201148758413 -12.3066778834997 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0299881969175046 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 13 13 26 6.2033592480854 6.7966407519146 -0.593281503829196 T:C C T 10 0.522818519378046 0.846541780450938 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99160152 A/G 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 22 28 50 10.497992573683 14.6389185425853 -4.1409259689023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.259463821154296 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 43 42 85 20.518803666744 21.9583778138779 -1.43957414713391 A:G G A 10 0.522818519378046 0.828251357962316 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99219987 G/C 1 45 37 82 21.4731666279879 19.3442852169877 2.12888141100023 C:G G C 10 0.522818519378046 0.659812606883358 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 99361627 C/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000241935:ENST00000370647:exon_99361614_99361747:DHDPSL;ENSG00000241935:ENST00000370646:exon_99361614_99361747:DHDPSL;ENSG00000241935:ENST00000488438:exon_99361614_99361747:DHDPSL;ENSG00000241935:ENST00000370642:exon_99361614_99361747:DHDPSL;ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99361614_99361747:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99361614_99361747:RP11-548K23.11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 100179892 C/T 1 25 26 51 11.9295370155488 13.5932815038292 -1.66374448828035 T:C C T 10 0.522818519378046 0.675704133808493 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 100195488 C/T 1 18 18 36 8.58926665119517 9.41073334880483 -0.821466697609658 T:C C T 10 0.522818519378046 0.867973480842673 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000498219:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100195392_100195529:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100195392_100195529:HPS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 101473147 A/G 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 A:G A G 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101471601_101473236:COX15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 101486759 C/T 1 16 15 31 7.63490368995126 7.84227779067069 -0.207374100719426 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000016171:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000485884:exon_101486725_101486911:COX15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 177 121 298 84.4611220700858 63.2610408447436 21.2000812253423 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0147829183957475 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103339142 G/A 1 55 48 103 26.2449814342075 25.0952889301462 1.14969250406126 A:G G A 10 0.522818519378046 0.844150156663714 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103338639_103339310:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103338641_103339574:POLL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 25 29 54 11.9295370155488 15.1617370619633 -3.23220004641449 A:G A G 10 0.522818519378046 0.415054484926276 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103344589 T/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:G T G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000426919:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000454524:exon_103344368_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000413344:exon_103344444_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000461587:exon_103344551_103344676:POLL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103558701 G/A 1 30 30 60 14.3154444186586 15.6845555813414 -1.36911116268276 A:G G A 10 0.522818519378046 0.79638565335662 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103900729 G/A 1 25 29 54 11.9295370155488 15.1617370619633 -3.23220004641449 A:G G A 10 0.522818519378046 0.415054484926276 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103906479 G/C 1 32 34 66 15.2698073799025 17.7758296588536 -2.50602227895104 C:G G C 10 0.522818519378046 0.540897382672583 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103906429_103907149:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103906429_103907149:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000370012:exon_103906429_103907149:PPRC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 59 36 95 28.1537073566953 18.8214666976097 9.33224065908563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.064084197954195 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104127312 C/T 1 23 14 37 10.9751740543049 7.31945927129264 3.6557147830123 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.252264257502104 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104127235_104127317:GBF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104136729 A/G 1 43 57 100 20.518803666744 29.8006556045486 -9.2818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0713050711956765 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104136692_104136897:GBF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104136873 G/A 1 36 36 72 17.1785333023903 18.8214666976097 -1.64293339521932 A:G G A 10 0.522818519378046 0.724489160924116 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104136692_104136897:GBF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.766565170835604 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 183 172 355 87.3242109538176 89.9247853330239 -2.60057437920634 A:G G A 10 0.522818519378046 0.790717684909943 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 39 34 73 18.6100777442562 17.7758296588536 0.834248085402642 C:G C G 10 0.522818519378046 0.906926183094302 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 35 23 58 16.7013518217684 12.0248259456951 4.67652587607333 A:G G A 10 0.522818519378046 0.238375884127064 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 30 26 56 14.3154444186586 13.5932815038292 0.722162914829424 T:C C T 10 0.522818519378046 0.894079085941656 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105203785 C/T 1 36 40 76 17.1785333023903 20.9127407751218 -3.7342074727315 T:C C T 10 0.522818519378046 0.42244902119545 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105203672_105203825:PDCD11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 45 32 77 21.4731666279879 16.7301926200975 4.74297400789046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.305459037198831 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105361816 T/G 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 T:G T G 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105361911 G/A 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 4 10 14 1.90872592248782 5.22818519378046 -3.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.106723132817195 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105362209 T/C 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 28 25 53 13.3610814574147 13.0704629844512 0.29061847296356 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 25 23 48 11.9295370155488 12.0248259456951 -0.095288930146209 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 260 121 381 124.067184961708 63.2610408447436 60.8061441169645 A:T:C C A 10 0.522818519378046 2.87675865043952e-10 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 106027165 G/A 1 112 165 277 53.4443258296588 86.2650556973776 -32.8207298677187 A:G G A 10 0.522818519378046 8.6895133068822e-05 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 C:G C G 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 119043458 T/G 1 9 17 26 4.29463332559759 8.88791482942678 -4.5932815038292 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0790579932984927 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119040000_119044982:PDZD8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 19 6 25 9.06644813181713 3.13691111626828 5.92953701554885 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0256174069907763 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 121596498 C/T 1 45 62 107 21.4731666279879 32.4147482014389 -10.9415815734509 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0416377096259712 ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121596408_121596541:C10orf119 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:T A T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 10 16 26 4.77181480621954 8.36509631004874 -3.5932815038292 A:G G A 10 0.522818519378046 0.173401103832856 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 126480381 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000203791:ENST00000466270:exon_126480293_126480437:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000368837:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000368836:exon_126480293_126480439:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000464099:exon_126480293_126480437:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000358960:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000426050:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000483542:exon_126480293_126480446:METTL10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129899543 C/T 1 327 192 519 156.038344163379 100.381155720585 55.6571884427941 T:C C T 10 0.522818519378046 9.83149769766918e-07 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 242 266 508 115.477918310513 139.06972615456 -23.5918078440474 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0368723481485953 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 280 182 462 133.610814574147 95.1529705268044 38.4578440473427 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000330113677119692 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 181 245 426 86.3698479925737 128.090537247621 -41.7206892550476 C:G G C 10 0.522818519378046 5.46182503629899e-05 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 187 94 281 89.2329368763054 49.1449408215363 40.0879960547691 A:G G A 10 0.522818519378046 1.5325468096609e-06 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 109 206 315 52.012781387793 107.700614991877 -55.6878336040845 T:C C T 10 0.522818519378046 3.64648853872885e-10 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 201 130 331 95.9134776050127 67.966407519146 27.9470700858668 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00242521247470614 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 222 130 352 105.934288698074 67.966407519146 37.9678811789278 T:G T G 10 0.522818519378046 4.78622983179767e-05 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 210 160 370 100.20811093061 83.6509631004874 16.557147830123 T:C C T 10 0.522818519378046 0.086105716075164 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 75 86 161 35.7886110466466 44.962392666512 -9.17378161986541 A:G A G 10 0.522818519378046 0.155888910363464 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129904474 G/A 1 45 21 66 21.4731666279879 10.979188906939 10.493977721049 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00963918201650247 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 40 21 61 19.0872592248782 10.979188906939 8.10807031793919 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0403769447611645 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129905429 C/T 1 34 48 82 16.2241703411464 25.0952889301462 -8.87111858899977 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0596484250850151 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 25 32 57 11.9295370155488 16.7301926200975 -4.80065560454862 A:T T A 10 0.522818519378046 0.233034179925221 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129906364 G/A 1 17 26 43 8.11208517057322 13.5932815038292 -5.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.125885328260334 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 15 19 34 7.15772220932931 9.93355186818287 -2.77582965885356 T:C C T 10 0.522818519378046 0.39220071798164 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 29 27 56 13.8382629380367 14.1161000232072 -0.277837085170576 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 20 17 37 9.54362961243908 8.88791482942678 0.655714783012298 C:G G C 10 0.522818519378046 0.870498746331351 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129910475 T/G 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000484853:exon_129910397_129910713:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 8 12 20 3.81745184497563 6.27382223253655 -2.45637038756092 C:G C G 10 0.522818519378046 0.371143970102355 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 31 17 48 14.7926258992806 8.88791482942678 5.90471106985379 T:C C T 10 0.522818519378046 0.111167551543137 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 23 20 43 10.9751740543049 10.4563703875609 0.518803666744022 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 44 49 93 20.995985147366 25.6181074495243 -4.62212230215828 T:C C T 10 0.522818519378046 0.351594861880979 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 10 134540400 C/T 1 9 11 20 4.29463332559759 5.75100371315851 -1.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.65556110720683 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000487614:exon_134540325_134540853:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000498337:exon_134540325_134540409:INPP5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 11 20 31 5.24899628684149 10.4563703875609 -5.20737410071943 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0720696345659513 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 19 33 52 9.06644813181713 17.2530111394755 -8.18656300765839 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0260097144299112 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 23 8 31 10.9751740543049 4.18254815502437 6.79262589928057 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0182033091562207 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 293385 C/T 1 12 22 34 5.72617776746345 11.502007426317 -5.77582965885357 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0581319391366077 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293366_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293366_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293366_293483:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293366_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 48 39 87 22.9047110698538 20.3899222557438 2.51478881410999 A:G A G 10 0.522818519378046 0.667957371278341 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 309201 G/A 1 367 254 621 175.125603388257 132.795903922024 42.3296994662334 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000727656384620022 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 314278 T/C 1 1986 1965 3951 947.682420515201 1027.33839057786 -79.6559700626599 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.0113315540016553 ENSG00000185885:ENST00000528780:exon_314164_314356:IFITM1;ENSG00000185885:ENST00000328221:exon_313997_314356:IFITM1;ENSG00000185885:ENST00000408968:exon_313853_314356:IFITM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 0 0 94 94 0 49.1449408215363 -49.1449408215363 G A G 10 0.522818519378046 6.25542118420042e-31 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 320805 G/T 1 1 71 72 0.477181480621954 37.1201148758413 -36.6429333952193 T:G G T 10 0.522818519378046 5.85717780914876e-22 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 433867 G/A 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_433815_433937:ANO9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 277 240 517 132.179270132281 125.476444650731 6.70282548155022 C:G G C 10 0.522818519378046 0.567287569534538 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 252 235 487 120.249733116732 122.862352053841 -2.61261893710841 A:T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.82069804494271 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 499120 G/A 1 197 202 399 94.0047516825249 105.609340914365 -11.6045892318404 A:G G A 10 0.522818519378046 0.249372529292341 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_499062_499185:RNH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 9 13 22 4.29463332559759 6.7966407519146 -2.50200742631701 A:G A G 10 0.522818519378046 0.295879508077689 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 772490 G/A 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177225:ENST00000528309:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526650:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_772427_772614:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532839:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_772427_772521:PDDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 A:C C A 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 837549 C/T 1 31 13 44 14.7926258992806 6.7966407519146 7.99598514736597 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0158954140243125 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 17 50 67 8.11208517057322 26.1409259689023 -18.0288407983291 A:G G A 10 0.522818519378046 1.17584843981909e-05 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 488 431 919 232.864562543514 225.334781851938 7.5297806915757 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.620581422712545 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 631 549 1180 301.101514272453 287.027367138547 14.0741471339057 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.41468873335286 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 49 61 110 23.3818925504757 31.8919296820608 -8.51003713158507 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.105752612851783 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 23 27 50 10.9751740543049 14.1161000232072 -3.1409259689023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.398075894512748 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 A:G G A 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 1011597 G/A 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 A:G G A 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 1501670 G/C 1 24 24 48 11.4523555349269 12.5476444650731 -1.09528893014621 C:G G C 10 0.522818519378046 0.774285689678662 ENSG00000182208:ENST00000399693:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000329957:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000526462:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000427202:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000526698:exon_1501623_1502115:AC091196.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 2924610 G/A 1 13 7 20 6.2033592480854 3.65972963564632 2.54362961243908 A:G G A 10 0.522818519378046 0.273132298373759 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 2929552 A/G 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 A:G A G 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2929463_2929560:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2929463_2929560:SLC22A18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 2950558 A/G 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000181649:ENST00000314222:exon_2950126_2950685:PHLDA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 106 157 263 50.5812369459271 82.0825075423532 -31.5012705964261 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.000121162987498666 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 30 24 54 14.3154444186586 12.5476444650731 1.76779995358551 A:C C A 10 0.522818519378046 0.683881807671291 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 146 111 257 69.6684961708053 58.0328556509631 11.6356405198422 A:G A G 10 0.522818519378046 0.151244486623681 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 A:C C A 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 16 12 28 7.63490368995126 6.27382223253655 1.36108145741471 T:C C T 10 0.522818519378046 0.706426464838565 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 14 11 25 6.68054072870736 5.75100371315851 0.929537015548849 A:G G A 10 0.522818519378046 0.841950225699242 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 7 15 22 3.34027036435368 7.84227779067069 -4.50200742631701 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0854093100432508 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 51 57 108 24.3362555117197 29.8006556045486 -5.46440009282897 T:C T C 10 0.522818519378046 0.335451434342989 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 86 79 165 41.037607333488 41.3026630308656 -0.265055697377598 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 70 143 213 33.4027036435368 74.7630482710606 -41.3603446275238 T:C T C 10 0.522818519378046 1.28387195366768e-08 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 164 107 271 78.2577628220005 55.9415815734509 22.3161812485495 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.00735639968340244 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6238856 T/G 1 10 20 30 4.77181480621954 10.4563703875609 -5.68455558134138 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0440617368713981 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 37 7 44 17.6557147830123 3.65972963564632 13.995985147366 A:G A G 10 0.522818519378046 1.34727836625934e-05 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6341365 C/T 1 10 29 39 4.77181480621954 15.1617370619633 -10.3899222557438 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00107155195337695 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6341323_6341385:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6341748 C/T 0 18 0 18 8.58926665119517 0 8.58926665119517 C C 10 0.522818519378046 1.01631266243485e-05 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6477831 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000110171:ENST00000530899:exon_6477527_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000525074:exon_6477527_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000345851:exon_6477527_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000359518:exon_6477527_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000336043:exon_6477527_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000379914:exon_6477527_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000529058:exon_6477806_6478259:TRIM3;ENSG00000110171:ENST00000527237:exon_6477527_6477841:TRIM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6624660 G/A 1 32 16 48 15.2698073799025 8.36509631004874 6.90471106985379 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0592791739072349 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6624634_6624850:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000534343:exon_6624634_6624809:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6624634_6624834:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6624634_6624827:RRP8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 101 87 188 48.1953295428174 45.48521118589 2.71011835692735 T:C C T 10 0.522818519378046 0.715465228326728 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 144 161 305 68.7141332095614 84.1737816198654 -15.459648410304 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.0853424225137127 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:T A T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 6638599 T/C 1 16 21 37 7.63490368995126 10.979188906939 -3.3442852169877 T:C T C 10 0.522818519378046 0.324001381499262 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6638532_6638646:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6638221_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6638532_6638659:TPP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 7649531 G/A 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7649516_7649577:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529575:exon_7649516_7649577:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7649516_7649577:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7649516_7649577:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7649516_7649577:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532416:exon_7649516_7649577:PPFIBP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 47 37 84 22.4275295892318 19.3442852169877 3.08324437224413 A:G G A 10 0.522818519378046 0.51439599345441 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 55 33 88 26.2449814342075 17.2530111394755 8.99197029473195 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0690509275663494 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 7689029 A/C 1 33 15 48 15.7469888605245 7.84227779067069 7.90471106985379 A:C A C 10 0.522818519378046 0.029176154509891 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7688774_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689003_7689044:CYB5R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 8009241 C/T 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 57 40 97 27.1993443954514 20.9127407751218 6.28660362032954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.222874222869607 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 52 48 100 24.8134369923416 25.0952889301462 -0.281851937804603 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 10521764 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 3 10 13 1.43154444186586 5.22818519378046 -3.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0492332397122063 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 14 17 31 6.68054072870736 8.88791482942678 -2.20737410071943 T:C C T 10 0.522818519378046 0.474760861326864 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 101 99 200 48.1953295428174 51.7590334184266 -3.5637038756092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.620965361610048 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 11314618 G/A 1 22 19 41 10.497992573683 9.93355186818287 0.564440705500113 A:G G A 10 0.522818519378046 0.877255448353205 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11314576_11314740:GALNTL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 25 16 41 11.9295370155488 8.36509631004874 3.56444070550011 T:C T C 10 0.522818519378046 0.278342708110777 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 11971495 A/G 1 12 16 28 5.72617776746345 8.36509631004874 -2.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.348462366114306 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11971436_11971551:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11971436_11971551:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11971436_11971551:USP47;ENSG00000170242:ENST00000530041:exon_11971436_11971522:USP47;ENSG00000170242:ENST00000530369:exon_11971436_11971551:USP47 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 17096715 T/C 1 1807 1747 3554 862.266935483871 913.363953353446 -51.0970178695756 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.0867727998565042 ENSG00000110700:ENST00000531008:exon_17096644_17097159:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000531908:exon_17096644_17096744:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000526895:exon_17096644_17096744:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525634:exon_17096644_17096744:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525828:exon_17096644_17096744:RPS13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 25 22 47 11.9295370155488 11.502007426317 0.427529589231836 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 18102014 G/A 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 A:G G A 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000166788:ENST00000532403:exon_18101958_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18101839_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18101891_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530436:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18101892_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530237:exon_18101895_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18101896_18102038:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18101920_18102038:SAAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 18108512 T/C 1 5 24 29 2.38590740310977 12.5476444650731 -10.1617370619633 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000130490734025386 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 18305355 C/T 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 T:C C T 10 0.522818519378046 0.274460962299708 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18305342_18305448:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18305342_18305448:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18305342_18305448:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18305342_18305448:HPS5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 18373478 T/C 1 18 15 33 8.58926665119517 7.84227779067069 0.746988860524481 T:C T C 10 0.522818519378046 0.862627047462256 ENSG00000110768:ENST00000453096:exon_18373428_18373516:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000534641:exon_18373428_18373516:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000418116:exon_18373428_18373516:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000265963:exon_18373428_18373516:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000530496:exon_18373428_18373516:GTF2H1;ENSG00000110768:ENST00000526630:exon_18373119_18373516:GTF2H1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 T:C T C 10 0.522818519378046 0.177905026249726 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 31 27 58 14.7926258992806 14.1161000232072 0.676525876073331 T:C C T 10 0.522818519378046 0.895998446549284 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 22 12 34 10.497992573683 6.27382223253655 4.22417034114643 T:C C T 10 0.522818519378046 0.170754045624394 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34492985 G/C 1 26 20 46 12.4067184961708 10.4563703875609 1.95034810860988 C:G G C 10 0.522818519378046 0.658469545429212 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34492915_34493609:CAT;ENSG00000121691:ENST00000534710:exon_34492915_34493606:CAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 26 39 65 12.4067184961708 20.3899222557438 -7.98320375957299 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0617004723325034 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 12 23 35 5.72617776746345 12.0248259456951 -6.29864817823161 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.0412679611193136 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 24 19 43 11.4523555349269 9.93355186818287 1.51880366674402 A:G G A 10 0.522818519378046 0.760546074515429 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34938269 C/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34938310 T/C 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 T:C T C 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 15 22 37 7.15772220932931 11.502007426317 -4.3442852169877 A:G A G 10 0.522818519378046 0.187776635351946 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 43940602 C/G 1 68 68 136 32.4483406822929 35.5516593177071 -3.10331863541425 C:G C G 10 0.522818519378046 0.607437958698296 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 78 67 145 37.2201554885124 35.0288407983291 2.19131469018333 A:T:G G T 10 0.522818519378046 0.739996402400131 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 44254001 G/A 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000528159:exon_44253903_44254046:EXT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 44639921 C/T 1 3 12 15 1.43154444186586 6.27382223253655 -4.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0173247889652166 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 946 718 1664 451.413680668368 375.383696913437 76.0299837549314 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000190083811013615 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 47198147 G/A 1 13 14 27 6.2033592480854 7.31945927129264 -1.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.703496842234386 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527927:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000532438:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000529455:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000525398:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000531750:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000525314:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527097:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528444:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000524727:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000529599:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528041:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000529439:exon_47198067_47198335:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000530596:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533939:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526185:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528708:exon_47198067_47198338:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000524586:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000530794:exon_47198067_47198185:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528072:exon_47197765_47198185:ARFGAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 47434986 G/A 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 A:G G A 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000526614:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000529740:exon_47434951_47435058:SLC39A13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 47441928 C/T 1 315 282 597 150.312166395916 147.434822464609 2.87734393130654 T:C C T 10 0.522818519378046 0.837722047946338 ENSG00000165916:ENST00000298852:exon_47441815_47441960:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530912:exon_47441815_47441960:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000524447:exon_47441890_47441960:PSMC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 29 13 42 13.8382629380367 6.7966407519146 7.04162218612207 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0309412179940264 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 93 99 192 44.3778776978417 51.7590334184266 -7.38115572058484 A:G A G 10 0.522818519378046 0.311865827058598 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 A:G A G 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 82 86 168 39.1288814110002 44.962392666512 -5.83351125551173 C:G C G 10 0.522818519378046 0.395763330921893 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 44 57 101 20.995985147366 29.8006556045486 -8.80467045718265 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0901347059814124 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 83 89 172 39.6060628916222 46.5308482246461 -6.92478533302391 A:C C A 10 0.522818519378046 0.321086859262035 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 256 221 477 122.15845903922 115.542892782548 6.61556625667205 A:G G A 10 0.522818519378046 0.551593334279422 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 51 77 128 24.3362555117197 40.2570259921095 -15.9207704803899 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00588268378319702 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 40 34 74 19.0872592248782 17.7758296588536 1.3114295660246 T:C T C 10 0.522818519378046 0.816375814225715 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60701136 C/G 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 C:G C G 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 9 14 23 4.29463332559759 7.31945927129264 -3.02482594569506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.21807391097219 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60705355 G/A 1 56 77 133 26.7221629148294 40.2570259921095 -13.5348630772801 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0191815046300103 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60705342_60705497:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60705342_60705497:SLC15A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60709520 C/A 1 61 21 82 29.1080703179392 10.979188906939 18.1288814110002 A:C C A 10 0.522818519378046 5.4192517512679e-05 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60709507_60709617:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60709507_60709617:SLC15A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 60899767 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000167987:ENST00000301765:exon_60897730_60900011:VPS37C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 61165769 A/G 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 61213555 C/T 1 106 51 157 50.5812369459271 26.6637444882803 23.9174924576468 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000117383290513348 ENSG00000167985:ENST00000301761:exon_61213413_61214225:SDHAF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 A:G A G 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 17 9 26 8.11208517057322 4.70536667440241 3.4067184961708 T:C C T 10 0.522818519378046 0.238700034690363 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 34 24 58 16.2241703411464 12.5476444650731 3.67652587607333 T:G G T 10 0.522818519378046 0.359544906376087 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 71 64 135 33.8798851241587 33.4603852401949 0.419499883963788 A:T:C A C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 25 25 50 11.9295370155488 13.0704629844512 -1.1409259689023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.778381235387664 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 20 26 46 9.54362961243908 13.5932815038292 -4.04965189139012 T:C C T 10 0.522818519378046 0.241282516090175 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 T:C T C 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 220 206 426 104.97992573683 107.700614991877 -2.72068925504762 T:C C T 10 0.522818519378046 0.80848271803247 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 63594418 G/A 1 66 44 110 31.493977721049 23.004014852634 8.48996286841494 A:G G A 10 0.522818519378046 0.126343980500354 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63594400_63595151:C11orf84 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 63970625 G/A 1 228 204 432 108.797377581806 106.654977953121 2.14239962868412 A:G G A 10 0.522818519378046 0.847361288682778 ENSG00000168439:ENST00000358794:exon_63970597_63970700:STIP1;ENSG00000168439:ENST00000305218:exon_63970597_63970700:STIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 63979162 C/T 1 233 164 397 111.183284984915 85.7422371779995 25.4410478069157 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0119081193232157 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 63990505 C/G 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 63994230 G/T 1 147 135 282 70.1456776514272 70.5805001160362 -0.434822464608985 T:C:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64132904 C/T 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000532885:exon_64132773_64132937:RPS6KA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 207 166 373 98.7765664887445 86.7878742167556 11.9886922719888 T:C T C 10 0.522818519378046 0.233164150469406 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64802388 A/C 1 20 11 31 9.54362961243908 5.75100371315851 3.79262589928057 A:C A C 10 0.522818519378046 0.208912622946211 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802319_64802434:SNX15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 15 11 26 7.15772220932931 5.75100371315851 1.4067184961708 T:C C T 10 0.522818519378046 0.695704929825334 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64854812 G/A 1 47 47 94 22.4275295892318 24.5724704107682 -2.14494082153632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.680543310495658 ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854788_64854905:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854788_64854882:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854788_64854888:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 41 21 62 19.5644407055001 10.979188906939 8.58525179856115 T:C C T 10 0.522818519378046 0.030719707329152 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 37 33 70 17.6557147830123 17.2530111394755 0.402703643536778 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 T:C C T 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65268198 G/A 1 1385 1400 2785 660.896350661406 731.945927129264 -71.0495764678582 A:T:C:G G A 10 0.522818519378046 0.0070679587806184 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65270976 G/A 1 35 43 78 16.7013518217684 22.481196333256 -5.77984451148759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.212712874128666 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G A G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65338117 C/T 1 119 93 212 56.7845961940125 48.6221223021583 8.16247389185424 T:C C T 10 0.522818519378046 0.271836866214771 ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65338075_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000526877:exon_65338075_65338210:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000533115:exon_65338074_65338226:SSSCA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 30 27 57 14.3154444186586 14.1161000232072 0.199344395451378 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 25 18 43 11.9295370155488 9.41073334880483 2.51880366674402 T:G T G 10 0.522818519378046 0.450907783756556 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 22 23 45 10.497992573683 12.0248259456951 -1.52683337201207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.657759788116952 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 19 17 36 9.06644813181713 8.88791482942678 0.178533302390344 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 141 103 244 67.2825887676955 53.8503074959387 13.4322812717568 A:G G A 10 0.522818519378046 0.095480870941428 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 A:C A C 10 0.522818519378046 0.3459472668797 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 2460 2551 5011 1173.86644233001 1333.7100429334 -159.843600603389 A:T:C:G G A 10 0.522818519378046 6.41002271392963e-06 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65628334 G/A 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 C:G G C 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 37 17 54 17.6557147830123 8.88791482942678 8.76779995358551 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0199170476731675 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 26 21 47 12.4067184961708 10.979188906939 1.42752958923184 A:G G A 10 0.522818519378046 0.770715896326443 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 36 46 82 17.1785333023903 24.0496518913901 -6.87111858899977 T:G G T 10 0.522818519378046 0.150391400763867 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65636053 T/C 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000172638:ENST00000531972:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526628:exon_65635981_65637393:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528176:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000307998:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000532084:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531005:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000527969:exon_65635951_65636311:EFEMP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65684929 C/T 1 70 79 149 33.4027036435368 41.3026630308656 -7.89995938732886 T:C C T 10 0.522818519378046 0.218564071905338 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65685225 T/C 1 44 42 86 20.995985147366 21.9583778138779 -0.96239266651196 T:C T C 10 0.522818519378046 0.914122244131802 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 74 60 134 35.3114295660246 31.3691111626828 3.94231840334183 A:G G A 10 0.522818519378046 0.545149298829344 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 126 144 270 60.1248665583662 75.2858667904386 -15.1610002320724 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0676411893857253 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 153 131 284 73.008766535159 68.489226038524 4.51954049663493 A:G G A 10 0.522818519378046 0.634715471549487 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 77 99 176 36.7429740078905 51.7590334184266 -15.0160594105361 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0283642101241146 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 66287196 G/A 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533644:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000527251:exon_66287088_66287215:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000335157:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533557:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000525809:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526035:exon_66287092_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000532908:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529766:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524907:exon_66287088_66287228:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000524458:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000533430:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529953:exon_66287088_66287219:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000528543:exon_66287088_66287358:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66287154_66287219:BBS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 66288725 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 66331458 A/G 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G A G 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000174080:ENST00000310325:exon_66330934_66331478:CTSF;ENSG00000174080:ENST00000527141:exon_66330935_66331478:CTSF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 66392434 T/G 1 28 28 56 13.3610814574147 14.6389185425853 -1.27783708517058 T:G T G 10 0.522818519378046 0.78963313416608 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67034266 C/A 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:C C A 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000173020:ENST00000308595:exon_67033881_67034283:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000526285:exon_67033952_67034283:ADRBK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67075354 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000172830:ENST00000308127:exon_67075317_67075410:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000532881:exon_67075317_67075410:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000308298:exon_67075317_67075377:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000376757:exon_67075317_67075410:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000532181:exon_67075317_67075410:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000529224:exon_67075044_67075410:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000527821:exon_67075317_67075410:SSH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67079177 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000172830:ENST00000308127:exon_67079062_67080071:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000532881:exon_67079062_67080076:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000308298:exon_67079062_67080073:SSH3;ENSG00000172830:ENST00000376757:exon_67079062_67080063:SSH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 11 18 29 5.24899628684149 9.41073334880483 -4.16173706196334 T:C T C 10 0.522818519378046 0.138636572935384 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67165015 T/C 1 23 28 51 10.9751740543049 14.6389185425853 -3.66374448828035 T:C T C 10 0.522818519378046 0.328469848418373 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164935_67165880:RAD9A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 27 10 37 12.8838999767928 5.22818519378046 7.6557147830123 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0129888209820761 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 104 105 209 49.6268739846832 54.8959445346948 -5.26907055001162 T:C C T 10 0.522818519378046 0.488939853789944 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 130 108 238 62.033592480854 56.464400092829 5.56919238802505 T:C C T 10 0.522818519378046 0.47619634564134 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67209869 T/G 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:G T G 10 0.522818519378046 0.806867708781804 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67351585 C/G 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 C:G C G 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 2245 1538 3783 1071.27242399629 804.094882803435 267.177541192852 A:T:C:G A G 10 0.522818519378046 2.74428696763173e-18 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 3290 2321 5611 1569.92707124623 1213.46178347644 356.465287769784 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 1.24523327095439e-21 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 67814979 G/C 1 50 58 108 23.8590740310977 30.3234741239267 -6.46440009282897 A:C:G G C 10 0.522818519378046 0.247602011746088 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67814900_67815039:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67814900_67815039:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000529364:exon_67814900_67815039:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67814900_67815039:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000528981:exon_67814900_67815039:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67814900_67815039:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525516:exon_67814941_67815039:TCIRG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 22 21 43 10.497992573683 10.979188906939 -0.48119633325598 A:G A G 10 0.522818519378046 0.880251142470216 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 70253475 C/T 1 5 11 16 2.38590740310977 5.75100371315851 -3.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.131513831648772 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000482755:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000527622:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70253404_70253490:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000415461:exon_70253459_70253490:CTTN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 46 26 72 21.9503481086099 13.5932815038292 8.35706660478069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0584568126274892 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 74994352 G/A 1 14 9 23 6.68054072870736 4.70536667440241 1.97517405430494 A:G G A 10 0.522818519378046 0.532244732814475 ENSG00000137486:ENST00000420843:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000393505:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000360025:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000532525:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000524400:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000533609:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000527385:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000529280:exon_74994331_74994527:ARRB1;ENSG00000137486:ENST00000533255:exon_74994331_74994527:ARRB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 77090939 C/T 1 29 9 38 13.8382629380367 4.70536667440241 9.13289626363425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00309511262968831 ENSG00000149269:ENST00000356341:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000530617:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000278568:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000528203:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000533568:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000526910:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000529248:exon_77090939_77091039:PAK1;ENSG00000149269:ENST00000524847:exon_77090939_77091039:PAK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 77413223 T/C 1 61 50 111 29.1080703179392 26.1409259689023 2.96714434903689 T:C T C 10 0.522818519378046 0.634950027606286 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 13 23 36 6.2033592480854 12.0248259456951 -5.82146669760966 T:C T C 10 0.522818519378046 0.065457162846216 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 78204211 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78204109_78204241:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78204109_78204241:NARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 82564294 T/G 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:G T G 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 82880341 G/A 1 3 14 17 1.43154444186586 7.31945927129264 -5.88791482942678 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00582959970528915 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82879470_82881037:PCF11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 17 20 37 8.11208517057322 10.4563703875609 -2.3442852169877 A:C A C 10 0.522818519378046 0.511342651330165 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 18 12 30 8.58926665119517 6.27382223253655 2.31544441865862 A:G G A 10 0.522818519378046 0.466589946286752 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 88045583 A/G 1 100 196 296 47.7181480621954 102.472429798097 -54.7542817359016 A:G A G 10 0.522818519378046 2.07607828608193e-10 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000527018:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533865:exon_88045556_88045722:CTSC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 0 0 26 26 0 13.5932815038292 -13.5932815038292 G A G 10 0.522818519378046 4.42357189478494e-09 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 0 0 41 41 0 21.4355592944999 -21.4355592944999 T C T 10 0.522818519378046 6.6992594251345e-14 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 93521258 T/C 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93521167_93521333:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93521167_93522962:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93521167_93521333:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93521167_93521333:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93521167_93521333:MED17;ENSG00000042429:ENST00000528786:exon_93521167_93521333:MED17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 93530817 A/G 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93530701_93530885:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93530701_93530885:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93530701_93530885:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93530701_93530885:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93530701_93530885:MED17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 93540765 T/C 1 17 18 35 8.11208517057322 9.41073334880483 -1.29864817823161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.736066735208448 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525613:exon_93540684_93540801:MED17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 C:G C G 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 24 15 39 11.4523555349269 7.84227779067069 3.6100777442562 C:G G C 10 0.522818519378046 0.265567806032608 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 107299631 G/A 1 22 21 43 10.497992573683 10.979188906939 -0.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.880251142470216 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 108009660 C/A 1 55 63 118 26.2449814342075 32.9375667208169 -6.69258528660943 A:C C A 10 0.522818519378046 0.231466135825637 ENSG00000075239:ENST00000265838:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000531813:exon_108009625_108009768:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000528370:exon_108009625_108009891:ACAT1;ENSG00000075239:ENST00000534773:exon_108009447_108009768:ACAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111613299 G/A 1 9 18 27 4.29463332559759 9.41073334880483 -5.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0547427397631916 ENSG00000137713:ENST00000311129:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000412902:exon_111613247_111613330:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000426998:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000527614:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000427203:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000534521:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000341980:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000393055:exon_111613247_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000529672:exon_111612777_111613389:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000531890:exon_111613247_111613389:PPP2R1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111635619 A/G 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000137713:ENST00000311129:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000412902:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000527614:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000427203:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000534521:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000341980:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000393055:exon_111635529_111635629:PPP2R1B;ENSG00000137713:ENST00000531373:exon_111635529_111635629:PPP2R1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 10 4 14 4.77181480621954 2.09127407751218 2.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.185914534035155 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111746041 A/G 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111744780_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111745483_111746828:AP001781.3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111746231 G/A 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111744780_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111745483_111746828:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111746066_111746828:AP001781.3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111753246 G/A 1 101 58 159 48.1953295428174 30.3234741239267 17.8718554188907 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00529919884373076 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530799:exon_111753092_111753322:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111753092_111753322:C11orf1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111896251 G/C 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111899635 A/G 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111899516_111899669:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111899516_111899669:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111899516_111899669:DLAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 116728956 C/T 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 31 27 58 14.7926258992806 14.1161000232072 0.676525876073331 A:G A G 10 0.522818519378046 0.895998446549284 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:C C A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 C:G C G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 117695403 T/C 1 258 360 618 123.112822000464 188.214666976097 -65.1018449756324 T:C T C 10 0.522818519378046 1.85848971017705e-07 ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117695369_117695459:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117694877_117695459:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117695369_117695455:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000317594:exon_117695369_117695459:FXYD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118068752 T/C 1 9 21 30 4.29463332559759 10.979188906939 -6.68455558134138 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0168715188895861 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118068683_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118068324_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118068683_118068806:AMICA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118074337 A/G 1 2 11 13 0.954362961243908 5.75100371315851 -4.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0100466661678204 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118071189_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118074143_118076105:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118074143_118074380:AMICA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 11 11 22 5.24899628684149 5.75100371315851 -0.502007426317013 A:G A G 10 0.522818519378046 0.834912590229453 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 28 30 58 13.3610814574147 15.6845555813414 -2.32347412392667 T:C C T 10 0.522818519378046 0.599736398175398 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118888963 G/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 C:G G C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118889034 T/C 1 242 258 500 115.477918310513 134.887177999536 -19.409259689023 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.088817255198911 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118889498 A/C 1 27 10 37 12.8838999767928 5.22818519378046 7.6557147830123 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0129888209820761 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889142_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889473_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889476_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000528230:exon_118889476_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525303:exon_118889476_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000434101:exon_118889476_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889476_118889680:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889476_118889680:TRAPPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 154 60 214 73.4859480157809 31.3691111626828 42.1168368530981 T:C C T 10 0.522818519378046 5.77666535644204e-09 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 43 40 83 20.518803666744 20.9127407751218 -0.39393710837782 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118924835 T/A 1 20 21 41 9.54362961243908 10.979188906939 -1.43555929449989 A:T T A 10 0.522818519378046 0.754997551325209 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118924833_118924948:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118923085_118924948:HYOU1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 3 13 16 1.43154444186586 6.7966407519146 -5.36509631004874 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0100988102621874 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 18 6 24 8.58926665119517 3.13691111626828 5.45235553492689 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0387384186662656 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 28 15 43 13.3610814574147 7.84227779067069 5.51880366674402 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0955325403468757 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2553 2991 5544 1218.24432002785 1563.75019145974 -345.505871431887 A:T:C:G A G 10 0.522818519378046 1.77579846734019e-20 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 124 88 212 59.1705035971223 46.0080297052681 13.1624738918542 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0739066499248225 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 124624150 G/A 1 74 70 144 35.3114295660246 36.5972963564632 -1.28586679043863 A:G G A 10 0.522818519378046 0.867636125693607 ENSG00000149564:ENST00000442070:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000444566:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000435477:exon_124624141_124624236:ESAM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 124972114 G/A 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124971097_124974937:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124972028_124972247:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124972028_124972198:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124972028_124972247:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000524373:exon_124972028_124972705:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000533273:exon_124972028_124972705:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529530:exon_124972028_124972213:TMEM218 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 T A T 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 126139100 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000110074:ENST00000533839:exon_126138950_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126139028_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126139030_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126139041_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000529802:exon_126139052_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526525:exon_126139066_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126139085_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126139087_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126139089_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126139096_126139186:FOXRED1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 112 102 214 53.4443258296588 53.3274889765607 0.11683685309815 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 126176578 G/A 1 104 70 174 49.6268739846832 36.5972963564632 13.02957762822 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0487275643644416 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126176465_126176639:DCPS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 28 27 55 13.3610814574147 14.1161000232072 -0.755018565792531 T:C T C 10 0.522818519378046 0.892977799413527 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 17 12 29 8.11208517057322 6.27382223253655 1.83826293803667 A:G G A 10 0.522818519378046 0.578732322657605 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 9 4 13 4.29463332559759 2.09127407751218 2.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.273369431451006 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 10 12 22 4.77181480621954 6.27382223253655 -1.50200742631701 T:C T C 10 0.522818519378046 0.531402320360827 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 988894 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_988739_989197:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_988739_989197:WNK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 57 46 103 27.1993443954514 24.0496518913901 3.14969250406126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.555237571324668 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 12 13 25 5.72617776746345 6.7966407519146 -1.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.693522691443741 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 54 32 86 25.7677999535855 16.7301926200975 9.03760733348804 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0525246613992446 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 3782647 A/T 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 T A T 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 14 4 18 6.68054072870736 2.09127407751218 4.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0339640075555004 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 27 32 59 12.8838999767928 16.7301926200975 -3.84629264330471 T:C C T 10 0.522818519378046 0.362052759229184 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6500105 T/G 0 14 0 14 6.68054072870736 0 6.68054072870736 T T 10 0.522818519378046 0.000145739575792676 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 196 278 474 93.527570201903 145.343548387097 -51.8159781851938 A:C:G G A 10 0.522818519378046 2.01625833023689e-06 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 42 25 67 20.0416221861221 13.0704629844512 6.97115920167091 A:G A G 10 0.522818519378046 0.111191416798560 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 48 37 85 22.9047110698538 19.3442852169877 3.56042585286609 A:G A G 10 0.522818519378046 0.449650596826830 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6567907 C/T 1 41 35 76 19.5644407055001 18.2986481782316 1.26579252726851 T:C C T 10 0.522818519378046 0.818854455022443 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 19 27 46 9.06644813181713 14.1161000232072 -5.04965189139012 A:G A G 10 0.522818519378046 0.142525828846474 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 30 34 64 14.3154444186586 17.7758296588536 -3.46038524019494 A:C C A 10 0.522818519378046 0.45305454636373 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6635274 G/A 1 38 51 89 18.1328962636343 26.6637444882803 -8.5308482246461 A:G G A 10 0.522818519378046 0.072069378510701 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6635234_6635366:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6635234_6635366:NCAPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6637941 C/T 1 152 107 259 72.531585054537 55.9415815734509 16.5900034810861 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0401464596696852 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 109 129 238 52.012781387793 67.4435889997679 -15.430807611975 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0513593590593973 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 61 59 120 29.1080703179392 30.8462926433047 -1.73822232536552 A:G G A 10 0.522818519378046 0.784307959663534 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 14 60 74 6.68054072870736 31.3691111626828 -24.6885704339754 T:C T C 10 0.522818519378046 6.13795030151492e-09 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 45 39 84 21.4731666279879 20.3899222557438 1.08324437224413 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.828019519699653 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 5 15 20 2.38590740310977 7.84227779067069 -5.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0227027750669912 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 7047143 C/A 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 24 0 24 11.4523555349269 0 11.4523555349269 G G 10 0.522818519378046 1.93376477818270e-07 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 58 56 114 27.6765258760733 29.2778370851706 -1.60131120909725 C:G C G 10 0.522818519378046 0.779183401238178 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 115 97 212 54.8758702715247 50.7133963796705 4.16247389185425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.582867915896997 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 18 21 39 8.58926665119517 10.979188906939 -2.3899222557438 T:C T C 10 0.522818519378046 0.522126092072328 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 10659799 T/C 0 447 0 447 213.300121838013 0 213.300121838013 T T 10 0.522818519378046 1.45169111730076e-126 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 10862595 T/G 1 55 84 139 26.2449814342075 43.9167556277559 -17.6717741935484 T:G T G 10 0.522818519378046 0.00288298369520362 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10862507_10862713:CSDA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 12630346 G/A 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 A:G G A 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000111266:ENST00000228862:exon_12628831_12630949:DUSP16;ENSG00000111266:ENST00000298573:exon_12628831_12630949:DUSP16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 30 40 70 14.3154444186586 20.9127407751218 -6.59729635646322 T:G T G 10 0.522818519378046 0.120904697764467 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 33 24 57 15.7469888605245 12.5476444650731 3.19934439545138 T:C C T 10 0.522818519378046 0.428194883913663 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1159 1179 2338 553.053336040845 616.403034346716 -63.3496983058716 A:T:C:G C G 10 0.522818519378046 0.00907989880662602 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 21654831 G/T 1 9 2 11 4.29463332559759 1.04563703875609 3.24899628684149 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0684542396822566 ENSG00000111711:ENST00000229314:exon_21654699_21654882:GOLT1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:G A G 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 32 49 81 15.2698073799025 25.6181074495243 -10.3483000696217 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0256002510422621 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 25 23 48 11.9295370155488 12.0248259456951 -0.095288930146209 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 29521193 A/G 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 A:G A G 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 29617643 G/A 0 12 0 12 5.72617776746345 0 5.72617776746345 G G 10 0.522818519378046 0.00055645330269769 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 C:G G C 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 4 14 18 1.90872592248782 7.31945927129264 -5.41073334880483 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0158768955559009 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 32908266 G/C 1 30 24 54 14.3154444186586 12.5476444650731 1.76779995358551 C:G G C 10 0.522818519378046 0.683881807671291 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 32908575 A/G 1 19 13 32 9.06644813181713 6.7966407519146 2.26980737990253 A:G A G 10 0.522818519378046 0.481344541657888 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 39695445 G/A 1 18 6 24 8.58926665119517 3.13691111626828 5.45235553492689 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0387384186662656 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39695282_39695481:KIF21A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 47629368 G/T 1 21 27 48 10.020811093061 14.1161000232072 -4.09528893014621 T:C:G G T 10 0.522818519378046 0.250478594371113 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629207_47629770:FAM113B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 48075597 A/G 1 14 16 30 6.68054072870736 8.36509631004874 -1.68455558134138 A:G A G 10 0.522818519378046 0.586397139849636 ENSG00000005175:ENST00000432584:exon_48075479_48075600:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000380650:exon_48075479_48075600:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000005386:exon_48075479_48075600:RPAP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 48526659 G/A 1 37 24 61 17.6557147830123 12.5476444650731 5.10807031793919 A:G G A 10 0.522818519378046 0.201949531094770 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48526651_48526840:PFKM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 30 27 57 14.3154444186586 14.1161000232072 0.199344395451378 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 48543584 G/C 1 14 16 30 6.68054072870736 8.36509631004874 -1.68455558134138 C:G G C 10 0.522818519378046 0.586397139849636 ENSG00000177981:ENST00000317697:exon_48541574_48543781:ASB8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 50232439 T/C 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 T:C T C 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 51693021 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51692987_51693072:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51692987_51693072:BIN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 51751173 G/A 1 2 17 19 0.954362961243908 8.88791482942678 -7.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000259991551832501 ENSG00000139629:ENST00000356317:exon_51751133_51751234:GALNT6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 52450384 A/G 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G A G 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52450278_52450429:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52450278_52450429:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52450278_52450429:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52450278_52450429:NR4A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 52452606 C/T 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52452472_52453285:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52452472_52453285:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52452472_52453285:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52452472_52453291:NR4A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 52467406 A/G 1 76 53 129 36.2657925272685 27.7093815270364 8.55641100023206 A:G A G 10 0.522818519378046 0.134956579128776 ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 52642430 C/T 1 49 36 85 23.3818925504757 18.8214666976097 4.56042585286609 T:C C T 10 0.522818519378046 0.330846512736853 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52642375_52642709:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52642375_52642709:KRT7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53581376 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000139651:ENST00000416904:exon_53581285_53584654:ZNF740;ENSG00000139651:ENST00000267122:exon_53581285_53584654:ZNF740 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 13 20 33 6.2033592480854 10.4563703875609 -4.25301113947552 T:C T C 10 0.522818519378046 0.163764779261074 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53670545 C/A 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:C C A 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670404_53670643:ESPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53680135 C/T 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53681883 A/T 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 A:T A T 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 A:G G A 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 53687113 C/T 1 38 30 68 18.1328962636343 15.6845555813414 2.44834068229287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.627648386994081 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53687057_53687427:ESPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 19 16 35 9.06644813181713 8.36509631004874 0.701351821768389 A:G A G 10 0.522818519378046 0.86672112730153 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 54448106 A/G 0 11 0 11 5.24899628684149 0 5.24899628684149 A A 10 0.522818519378046 0.00108983038466757 ENSG00000198353:ENST00000303406:exon_54447701_54448145:HOXC4;ENSG00000198353:ENST00000430889:exon_54447661_54448145:HOXC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 83 67 150 39.6060628916222 35.0288407983291 4.57722209329309 T:C T C 10 0.522818519378046 0.463242443748431 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 21 31 52 10.020811093061 16.2073741007194 -6.18656300765839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0960446050353091 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 12 8 20 5.72617776746345 4.18254815502437 1.54362961243908 C:G C G 10 0.522818519378046 0.512380593640314 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 16 19 35 7.63490368995126 9.93355186818287 -2.29864817823161 A:G G A 10 0.522818519378046 0.499901817369517 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 18 11 29 8.58926665119517 5.75100371315851 2.83826293803666 T:C C T 10 0.522818519378046 0.353949986622967 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 A:T T A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 C:G C G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 3457 3308 6765 1649.61637851009 1729.48366210258 -79.8672835924815 A:T:C:G A T 10 0.522818519378046 0.0529644483205413 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2102 2355 4457 1003.03547226735 1231.2376131353 -228.202140867951 A:C:G A G 10 0.522818519378046 8.59401186881743e-12 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 18 18 36 8.58926665119517 9.41073334880483 -0.821466697609658 T:G T G 10 0.522818519378046 0.867973480842673 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 10 14 24 4.77181480621954 7.31945927129264 -2.5476444650731 A:G A G 10 0.522818519378046 0.314549779910552 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 351 331 682 167.490699698306 173.052929914133 -5.56223021582738 A:G A G 10 0.522818519378046 0.67346696228298 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 5 13 18 2.38590740310977 6.7966407519146 -4.41073334880483 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0562237849586215 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 62749124 A/T 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 A:T A T 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62749112_62749256:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62749112_62749256:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62749112_62749256:USP15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 12 3 15 5.72617776746345 1.56845555813414 4.15772220932931 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0379440782596598 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 66725160 C/T 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 110 109 219 52.4899628684149 56.987218612207 -4.49725574379208 A:G G A 10 0.522818519378046 0.543612411347922 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 69136252 T/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69136135_69136472:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69136135_69136472:NUP107 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 69233215 A/G 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69233054_69233629:MDM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 591 574 1165 282.014255047575 300.097830122998 -18.0835750754236 A:G G A 10 0.522818519378046 0.291177696702187 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 67 59 126 31.9711592016709 30.8462926433047 1.1248665583662 T:C:G C G 10 0.522818519378046 0.858880298542321 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 82792787 C/A 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 A:C C A 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 82824729 G/T 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:G G T 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82824672_82824766:C12orf26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 62 37 99 29.5852517985611 19.3442852169877 10.2409665815734 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0439237088000059 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 99007356 T/C 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 99007623 C/T 1 52 35 87 24.8134369923416 18.2986481782316 6.51478881411 T:C C T 10 0.522818519378046 0.16493520657186 ENSG00000166130:ENST00000342502:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000420861:exon_99007183_99008118:IKBIP;ENSG00000166130:ENST00000393042:exon_99007183_99008118:IKBIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 16 12 28 7.63490368995126 6.27382223253655 1.36108145741471 T:C T C 10 0.522818519378046 0.706426464838565 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 T:C C T 10 0.522818519378046 0.414517478089946 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 102437959 G/T 1 47 48 95 22.4275295892318 25.0952889301462 -2.66775934091437 T:G G T 10 0.522818519378046 0.608547703469023 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102437883_102437990:CCDC53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 102811644 C/A 1 27 4 31 12.8838999767928 2.09127407751218 10.7926258992806 A:C C A 10 0.522818519378046 8.27096843970204e-05 ENSG00000017427:ENST00000307046:exon_102811269_102811781:IGF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 104327979 C/T 1 348 296 644 166.05915525644 154.754281735902 11.3048735205384 T:C C T 10 0.522818519378046 0.385571099999955 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 106848414 A/G 1 10 3 13 4.77181480621954 1.56845555813414 3.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0966494022259154 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106848280_106848489:POLR3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 5 14 19 2.38590740310977 7.31945927129264 -4.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0359551262108928 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 108102757 A/G 1 41 52 93 19.5644407055001 27.1865630076584 -7.62212230215828 A:G A G 10 0.522818519378046 0.120097975313057 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108102703_108102793:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108102703_108102793:PWP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G A G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 108134781 G/A 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108134723_108135037:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108134723_108135037:PRDM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 109186185 C/T 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109186062_109186605:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109186062_109186605:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109186062_109186605:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000326470:exon_109185730_109186605:SSH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 109520769 A/G 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135093:ENST00000392784:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000377883:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000257548:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000479219:exon_109520648_109520867:USP30;ENSG00000135093:ENST00000491362:exon_109520500_109520867:USP30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 27 27 54 12.8838999767928 14.1161000232072 -1.23220004641448 T:G G T 10 0.522818519378046 0.786042800993254 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 26 27 53 12.4067184961708 14.1161000232072 -1.70938152703644 T:C C T 10 0.522818519378046 0.681183073555035 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110383141 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000139436:ENST00000338373:exon_110383065_110383154:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000360185:exon_110383065_110383154:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110383065_110383154:GIT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110385079 G/T 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:G G T 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000139436:ENST00000343646:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000354574:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000360185:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000361006:exon_110385061_110385309:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110385061_110385309:GIT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110386611 G/A 1 16 5 21 7.63490368995126 2.61409259689023 5.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0298606175874598 ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110385871_110386651:GIT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110474070 T/C 1 11 8 19 5.24899628684149 4.18254815502437 1.06644813181713 T:C T C 10 0.522818519378046 0.65415663787627 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110474066_110474133:ANKRD13A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110820718 C/T 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C C T 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000196510:ENST00000455511:exon_110820648_110820765:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000354390:exon_110820648_110820765:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000450008:exon_110820648_110820765:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000452721:exon_110820648_110820765:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000471602:exon_110820648_110821070:ANAPC7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 11 20 31 5.24899628684149 10.4563703875609 -5.20737410071943 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0720696345659513 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 54 64 118 25.7677999535855 33.4603852401949 -7.69258528660943 A:G G A 10 0.522818519378046 0.167249656631806 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 112229137 A/T 1 2 16 18 0.954362961243908 8.36509631004874 -7.41073334880483 A:T A T 10 0.522818519378046 0.000484774263277594 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112229110_112229223:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112229110_112229223:ALDH2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 113398919 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113398876_113399051:OAS3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 18 31 49 8.58926665119517 16.2073741007194 -7.61810744952426 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0319794657856390 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 113600805 A/G 1 132 122 254 62.9879554420979 63.7838593641216 -0.79590392202369 A:G A G 10 0.522818519378046 0.949946213225684 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113600737_113600850:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113600737_113600850:DDX54 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 117290433 G/A 1 19 15 34 9.06644813181713 7.84227779067069 1.22417034114644 A:G G A 10 0.522818519378046 0.733234219774329 ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117290143_117291434:RNFT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 117465981 T/C 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C T C 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000174989:ENST00000309909:exon_117465833_117468953:FBXW8;ENSG00000174989:ENST00000455858:exon_117465833_117468953:FBXW8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 17 26 43 8.11208517057322 13.5932815038292 -5.48119633325598 T:C T C 10 0.522818519378046 0.125885328260334 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 3 12 15 1.43154444186586 6.27382223253655 -4.84227779067069 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0173247889652166 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 32 41 73 15.2698073799025 21.4355592944999 -6.16575191459736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.160493053753936 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121442064 G/A 1 25 14 39 11.9295370155488 7.31945927129264 4.6100777442562 A:G G A 10 0.522818519378046 0.151495580239124 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 16 11 27 7.63490368995126 5.75100371315851 1.88389997679276 A:G G A 10 0.522818519378046 0.564684921071908 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 34 31 65 16.2241703411464 16.2073741007194 0.0167962404270092 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 29 37 66 13.8382629380367 19.3442852169877 -5.50602227895104 A:G G A 10 0.522818519378046 0.177914257037335 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 37 18 55 17.6557147830123 9.41073334880483 8.24498143420747 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.0302126562975892 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 67 77 144 31.9711592016709 40.2570259921095 -8.28586679043863 A:G A G 10 0.522818519378046 0.182022945141506 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 122817580 A/G 1 5 15 20 2.38590740310977 7.84227779067069 -5.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0227027750669912 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122817534_122817690:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122817534_122817690:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122817534_122817690:CLIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 124221796 G/A 1 4 11 15 1.90872592248782 5.75100371315851 -3.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0677330756934676 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124221606_124221818:ATP6V0A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 124427306 T/A 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 A:T T A 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124427291_124427332:CCDC92 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 124821483 C/A 1 60 61 121 28.6308888373172 31.8919296820608 -3.26104084474357 A:C C A 10 0.522818519378046 0.585526864854829 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 18 21 39 8.58926665119517 10.979188906939 -2.3899222557438 T:C T C 10 0.522818519378046 0.522126092072328 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 124829255 A/G 1 18 16 34 8.58926665119517 8.36509631004874 0.224170341146435 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 72 97 169 34.3570666047807 50.7133963796705 -16.3563297748898 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0135289056344234 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 125441347 T/C 1 22 18 40 10.497992573683 9.41073334880483 1.08725922487816 T:C T C 10 0.522818519378046 0.754272363653691 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 22 19 41 10.497992573683 9.93355186818287 0.564440705500113 T:C T C 10 0.522818519378046 0.877255448353205 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 125587278 G/A 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125587225_125587339:AACS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 42 44 86 20.0416221861221 23.004014852634 -2.96239266651196 T:C C T 10 0.522818519378046 0.589646954399584 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132326298 G/A 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132326169_132326345:MMP17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132426432 C/T 1 63 56 119 30.0624332791831 29.2778370851706 0.784596194012522 T:C C T 10 0.522818519378046 0.927004445508468 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132425837_132426528:PUS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132549300 A/G 1 12 26 38 5.72617776746345 13.5932815038292 -7.86710373636575 A:G A G 10 0.522818519378046 0.013877340857671 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132562126 G/A 1 37 33 70 17.6557147830123 17.2530111394755 0.402703643536778 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 19 21 40 9.06644813181713 10.979188906939 -1.91274077512184 A:G G A 10 0.522818519378046 0.635541648142928 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 T:C T C 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132631855 C/T 1 40 17 57 19.0872592248782 8.88791482942678 10.1993443954514 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00760249605502021 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132631826_132631933:NOC4L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 132633374 G/A 1 30 46 76 14.3154444186586 24.0496518913901 -9.7342074727315 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0287906672645323 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132633329_132633440:NOC4L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 133294333 C/T 0 46 0 46 21.9503481086099 0 21.9503481086099 C C 10 0.522818519378046 1.95891893475292e-13 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 133306339 C/G 1 49 65 114 23.3818925504757 33.983203759573 -10.6013112090973 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0491432141698327 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 20637071 A/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20636986_20637111:ZMYM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.246697181289009 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 21735998 T/C 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21735929_21736014:SKA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 21751005 G/C 1 16 10 26 7.63490368995126 5.22818519378046 2.4067184961708 C:G G C 10 0.522818519378046 0.433360460128227 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 25 33 58 11.9295370155488 17.2530111394755 -5.32347412392667 C:G C G 10 0.522818519378046 0.188665106253714 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 14 13 27 6.68054072870736 6.7966407519146 -0.116100023207243 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 6 14 20 2.86308888373172 7.31945927129264 -4.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.070687716479435 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 25049676 G/A 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25049610_25049734:PARP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C T C 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 28004018 A/C 1 109 58 167 52.012781387793 30.3234741239267 21.6893072638663 A:C A C 10 0.522818519378046 0.000821025956237208 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000435781:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000438571:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000466776:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28004007_28004103:GTF3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 236 139 375 112.614829426781 72.6717741935484 39.9430552332327 C:G G C 10 0.522818519378046 3.38270101021965e-05 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 19 5 24 9.06644813181713 2.61409259689023 6.4523555349269 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0124602779483845 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 31725260 A/G 1 18 8 26 8.58926665119517 4.18254815502437 4.4067184961708 A:G A G 10 0.522818519378046 0.114830012681343 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31725084_31725328:HSPH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 31729729 A/G 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 33700374 T/G 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 33704065 T/C 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33703066_33704426:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33703066_33704426:STARD13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 46 26 72 21.9503481086099 13.5932815038292 8.35706660478069 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.0584568126274892 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 19 28 47 9.06644813181713 14.6389185425853 -5.57247041076816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.109963762209210 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 38 44 82 18.1328962636343 23.004014852634 -4.87111858899977 C:G G C 10 0.522818519378046 0.319934836207806 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 43 27 70 20.518803666744 14.1161000232072 6.40270364353678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.150677769692664 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 19 23 42 9.06644813181713 12.0248259456951 -2.95837781387793 A:G A G 10 0.522818519378046 0.440324582601068 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 28 20 48 13.3610814574147 10.4563703875609 2.90471106985379 A:C A C 10 0.522818519378046 0.470649321102718 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 29 24 53 13.8382629380367 12.5476444650731 1.29061847296356 T:C T C 10 0.522818519378046 0.784047124432985 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 39598616 G/A 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G G A 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39598610_39598693:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000496138:exon_39598614_39598693:C13orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 41331027 G/A 1 96 58 154 45.8094221397076 30.3234741239267 15.4859480157809 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0124187696940695 ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41331009_41331149:MRPS31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 41384940 G/A 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.797632243641906 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 41384997 C/G 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 C:G C G 10 0.522818519378046 0.618775956339144 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 24 44 68 11.4523555349269 23.004014852634 -11.5516593177071 A:T A T 10 0.522818519378046 0.00516991404090416 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 95 77 172 45.3322406590856 40.2570259921095 5.07521466697608 A:G A G 10 0.522818519378046 0.446421988156451 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 82 93 175 39.1288814110002 48.6221223021583 -9.49324089115805 A:C A C 10 0.522818519378046 0.151459992860204 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 50 0 50 23.8590740310977 0 23.8590740310977 G G 10 0.522818519378046 1.30645313088529e-14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 45515395 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45513384_45515457:NUFIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 55 55 110 26.2449814342075 28.7550185657925 -2.51003713158507 A:G G A 10 0.522818519378046 0.634749964170092 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 46701701 G/A 1 344 287 631 164.150429333952 150.048915061499 14.101514272453 A:G G A 10 0.522818519378046 0.264738391121949 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46700061_46701858:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46700061_46701858:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46700096_46701858:LCP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 47308109 A/G 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 148 161 309 70.6228591320492 84.1737816198654 -13.5509224878162 T:C C T 10 0.522818519378046 0.124494148361801 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 15 3 18 7.15772220932931 1.56845555813414 5.58926665119517 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0086209268116001 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 50587140 G/C 1 13 6 19 6.2033592480854 3.13691111626828 3.06644813181713 C:G G C 10 0.522818519378046 0.175452094094042 ENSG00000204977:ENST00000420995:exon_50586071_50588467:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000378182:exon_50586071_50592587:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000356017:exon_50586071_50587316:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000457662:exon_50586071_50587304:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000298772:exon_50586071_50587305:TRIM13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 52598799 G/A 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 52603266 T/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:T T A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 60545126 T/C 1 11 1 12 5.24899628684149 0.522818519378046 4.72617776746345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0069569782863362 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267215:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000465066:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267214:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000498416:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000453990:exon_60544986_60545294:DIAPH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 20 17 37 9.54362961243908 8.88791482942678 0.655714783012298 A:G G A 10 0.522818519378046 0.870498746331351 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 11 8 19 5.24899628684149 4.18254815502437 1.06644813181713 C:G G C 10 0.522818519378046 0.65415663787627 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 75866284 G/A 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75866238_75866407:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75866238_75866407:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75866238_75866407:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75866238_75866407:TBC1D4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 2 10 12 0.954362961243908 5.22818519378046 -4.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.017999840799673 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 76427347 C/A 1 10 3 13 4.77181480621954 1.56845555813414 3.2033592480854 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0966494022259154 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 76427403 G/A 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 A:G G A 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 76427410 C/G 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 19 26 45 9.06644813181713 13.5932815038292 -4.52683337201207 T:C C T 10 0.522818519378046 0.182789745730120 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 78327455 A/C 1 23 14 37 10.9751740543049 7.31945927129264 3.6557147830123 A:C A C 10 0.522818519378046 0.252264257502104 ENSG00000139737:ENST00000466548:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000389459:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000418532:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000488699:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000377229:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000267219:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000436634:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000314070:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000351546:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000441784:exon_78327338_78327493:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000358679:exon_78327338_78327493:SLAIN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 80911525 G/A 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 G G 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000136158:ENST00000377104:exon_80910111_80911891:SPRY2;ENSG00000136158:ENST00000377102:exon_80910111_80911891:SPRY2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 58 48 106 27.6765258760733 25.0952889301462 2.58123694592712 A:G A G 10 0.522818519378046 0.62832125717015 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 101287404 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 69 57 126 32.9255221629148 29.8006556045486 3.1248665583662 A:G A G 10 0.522818519378046 0.593686985872893 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 103492092 G/A 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000134897:ENST00000257336:exon_103491922_103493881:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000448849:exon_103491901_103492215:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000419638:exon_103491922_103492168:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000418659:exon_103491922_103492240:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000490317:exon_103491922_103492513:BIVM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C T C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 118 142 260 56.3074147133906 74.2402297516825 -17.932815038292 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0296016657734106 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 58 58 116 27.6765258760733 30.3234741239267 -2.64694824785334 A:G A G 10 0.522818519378046 0.642947662154455 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 13 11 24 6.2033592480854 5.75100371315851 0.452355534926896 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 111371958 G/A 1 48 42 90 22.9047110698538 21.9583778138779 0.946333255975855 A:G G A 10 0.522818519378046 0.916051917861266 ENSG00000153487:ENST00000338450:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000333219:exon_111371576_111373421:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375775:exon_111371576_111372522:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375777:exon_111371576_111373420:ING1;ENSG00000153487:ENST00000375774:exon_111371576_111373418:ING1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 111955465 T/C 1 22 14 36 10.497992573683 7.31945927129264 3.17853330239034 T:C T C 10 0.522818519378046 0.319873415143134 ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111955338_111958084:ARHGEF7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 T:C T C 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 21162053 T/G 1 10 14 24 4.77181480621954 7.31945927129264 -2.5476444650731 T:G T G 10 0.522818519378046 0.314549779910552 ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 34 27 61 16.2241703411464 14.1161000232072 2.10807031793919 T:C T C 10 0.522818519378046 0.610527944399482 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 52 39 91 24.8134369923416 20.3899222557438 4.42351473659781 A:G G A 10 0.522818519378046 0.401408903961433 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 A:G G A 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 29 24 53 13.8382629380367 12.5476444650731 1.29061847296356 A:G A G 10 0.522818519378046 0.784047124432985 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 285 339 624 135.996721977257 177.235478069158 -41.2387560919007 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00100439302163696 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 256 226 482 122.15845903922 118.156985379438 4.00147365978182 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.749632489908423 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 294 229 523 140.291355302854 119.725440937573 20.5659143652819 T:G G T 10 0.522818519378046 0.072808861141763 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 712 573 1285 339.753214202831 299.57501160362 40.1782025992109 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0254637251377326 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 54 15 69 25.7677999535855 7.84227779067069 17.9255221629148 T:C T C 10 0.522818519378046 1.01207265703560e-05 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23282110 A/G 1 17 1 18 8.11208517057322 0.522818519378046 7.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000182549084801669 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 99 105 204 47.2409665815734 54.8959445346948 -7.65497795312139 T:G G T 10 0.522818519378046 0.293614474215081 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 26 31 57 12.4067184961708 16.2073741007194 -3.80065560454862 C:G G C 10 0.522818519378046 0.354005811719525 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 31 18 49 14.7926258992806 9.41073334880483 5.38189255047574 A:G G A 10 0.522818519378046 0.152235791165313 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24033027 G/A 1 62 48 110 29.5852517985611 25.0952889301462 4.48996286841493 A:G G A 10 0.522818519378046 0.445278039174468 ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24032925_24033065:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24032925_24033065:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24032925_24033065:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 35 22 57 16.7013518217684 11.502007426317 5.19934439545138 A:G A G 10 0.522818519378046 0.185874069707771 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 0 45 0 45 21.4731666279879 0 21.4731666279879 G G 10 0.522818519378046 3.86462893656801e-13 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 160 130 290 76.3490368995126 67.966407519146 8.38262938036665 A:G G A 10 0.522818519378046 0.347019252938356 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 21 28 49 10.020811093061 14.6389185425853 -4.61810744952426 A:G G A 10 0.522818519378046 0.200113196342329 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 969 1031 2000 462.388854722673 539.025893478765 -76.637038756092 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000613317308045496 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 65 53 118 31.016796240427 27.7093815270364 3.30741471339057 T:C T C 10 0.522818519378046 0.580795075944296 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 103 94 197 49.1496925040613 49.1449408215363 0.00475168252493319 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 186 166 352 88.7557553956834 86.7878742167556 1.9678811789278 T:C C T 10 0.522818519378046 0.872859157036406 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24843620 T/C 1 9 1 10 4.29463332559759 0.522818519378046 3.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0227710816327027 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24843532_24843672:NFATC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 36 1 37 17.1785333023903 0.522818519378046 16.6557147830123 T:C T C 10 0.522818519378046 2.40551857186256e-09 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 25281843 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000168952:ENST00000396700:exon_25278862_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000323944:exon_25278868_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000419632:exon_25281308_25281938:STXBP6;ENSG00000168952:ENST00000445298:exon_25281308_25281938:STXBP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 17 21 38 8.11208517057322 10.979188906939 -2.86710373636575 C:G C G 10 0.522818519378046 0.417515893094028 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 5 16 21 2.38590740310977 8.36509631004874 -5.97918890693897 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0141722997540828 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 31583512 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583492_31583546:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583492_31583546:HECTD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 35222732 C/T 1 15 19 34 7.15772220932931 9.93355186818287 -2.77582965885356 T:C C T 10 0.522818519378046 0.39220071798164 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 23 28 51 10.9751740543049 14.6389185425853 -3.66374448828035 T:C T C 10 0.522818519378046 0.328469848418373 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 11 13 24 5.24899628684149 6.7966407519146 -1.5476444650731 C:G C G 10 0.522818519378046 0.546956746198156 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 69 70 139 32.9255221629148 36.5972963564632 -3.67177419354839 C:G C G 10 0.522818519378046 0.552972778466351 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 829 769 1598 395.5834474356 402.047441401717 -6.46399396611753 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.763806045064365 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 39556185 G/C 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 C:G G C 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39556133_39556212:SEC23A;ENSG00000100934:ENST00000457395:exon_39556133_39556212:SEC23A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 39650824 C/T 1 204 226 430 97.3450220468786 118.156985379438 -20.8119633325598 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0476998215204802 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 39650924 A/G 1 161 132 293 76.8262183801346 69.0120445579021 7.81417382223252 A:G A G 10 0.522818519378046 0.380529862889731 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 48 33 81 22.9047110698538 17.2530111394755 5.65169993037827 A:G A G 10 0.522818519378046 0.22238692120605 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 68 95 163 32.4483406822929 49.6677593409144 -17.2194186586215 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.00756057058498509 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 50065717 G/C 1 15 27 42 7.15772220932931 14.1161000232072 -6.95837781387793 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0433553662124855 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 31 18 49 14.7926258992806 9.41073334880483 5.38189255047574 T:C T C 10 0.522818519378046 0.152235791165313 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 50788213 C/T 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000125375:ENST00000311459:exon_50788201_50788312:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000245448:exon_50788201_50788312:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000426751:exon_50788201_50788312:ATP5S HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 21 17 38 10.020811093061 8.88791482942678 1.13289626363425 A:G G A 10 0.522818519378046 0.747768058032766 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:G T G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 T:G G T 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 16 8 24 7.63490368995126 4.18254815502437 3.4523555349269 A:G A G 10 0.522818519378046 0.21957374400876 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 51376774 G/A 0 9 0 9 4.29463332559759 0 4.29463332559759 G G 10 0.522818519378046 0.00420127319250026 ENSG00000100504:ENST00000532462:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000531889:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000216392:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000532107:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000528757:exon_51376728_51376820:PYGL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 54417522 A/G 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 G A G 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000125378:ENST00000245451:exon_54416454_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000417573:exon_54416457_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000395600:exon_54416457_54417606:BMP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 99 161 260 47.2409665815734 84.1737816198654 -36.932815038292 A:C A C 10 0.522818519378046 5.12117809877264e-06 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 55609418 G/A 1 170 192 362 81.1208517057322 100.381155720585 -19.2603040148527 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0454970732491725 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55609302_55609467:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55609302_55609467:LGALS3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 34 41 75 16.2241703411464 21.4355592944999 -5.21138895335345 A:G A G 10 0.522818519378046 0.248506065400619 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 19 15 34 9.06644813181713 7.84227779067069 1.22417034114644 A:G A G 10 0.522818519378046 0.733234219774329 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 57740964 G/A 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 57938260 T/C 1 17 33 50 8.11208517057322 17.2530111394755 -9.1409259689023 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0105652307749309 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 59112475 C/T 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000165617:ENST00000421793:exon_59111976_59112574:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 59112732 C/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 59113430 G/A 1 5 18 23 2.38590740310977 9.41073334880483 -7.02482594569506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00536059926130504 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 59951278 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59951244_59951311:JKAMP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:C T C 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:C C A 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 14 27 41 6.68054072870736 14.1161000232072 -7.43555929449989 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0274119241708742 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 85 80 165 40.5604258528661 41.8254815502437 -1.26505569737759 T:G G T 10 0.522818519378046 0.876269112131835 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 195 197 392 93.050388721281 102.995248317475 -9.94485959619404 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.336741378510064 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 12 8 20 5.72617776746345 4.18254815502437 1.54362961243908 T:C T C 10 0.522818519378046 0.512380593640314 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 68141105 C/T 1 93 68 161 44.3778776978417 35.5516593177071 8.82621838013459 T:C C T 10 0.522818519378046 0.179860634123529 ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68141092_68141548:VTI1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 69349196 G/A 1 69 60 129 32.9255221629148 31.3691111626828 1.55641100023206 A:G G A 10 0.522818519378046 0.792268470294652 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69349175_69349309:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69349175_69349309:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69349175_69349309:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69349175_69349309:ACTN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 69352230 G/A 1 43 37 80 20.518803666744 19.3442852169877 1.17451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.823578994498233 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 69522062 G/A 1 24 12 36 11.4523555349269 6.27382223253655 5.17853330239034 A:G G A 10 0.522818519378046 0.095804360115699 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 71109153 C/G 1 28 26 54 13.3610814574147 13.5932815038292 -0.232200046414485 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71108504_71109252:TTC9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 71199452 G/A 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 73425462 G/A 1 14 5 19 6.68054072870736 2.61409259689023 4.06644813181713 A:G G A 10 0.522818519378046 0.06875229877064 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 73739369 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000100767:ENST00000340738:exon_73739203_73741345:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000216658:exon_73739203_73741345:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000427855:exon_73739203_73741345:PAPLN;ENSG00000100767:ENST00000381166:exon_73739203_73741345:PAPLN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 58 30 88 27.6765258760733 15.6845555813414 11.991970294732 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0104313077359536 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 74062370 G/A 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 74420252 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74420138_74420272:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74420138_74420272:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74420138_74420272:COQ6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 34 31 65 16.2241703411464 16.2073741007194 0.0167962404270092 A:T:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 75189979 C/A 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 A:C C A 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000119616:ENST00000341162:exon_75189975_75190047:FCF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 40 43 83 19.0872592248782 22.481196333256 -3.39393710837782 A:T T A 10 0.522818519378046 0.510040578565952 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 75279461 G/A 1 36 27 63 17.1785333023903 14.1161000232072 3.0624332791831 A:G G A 10 0.522818519378046 0.452459310085604 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 47 36 83 22.4275295892318 18.8214666976097 3.60606289162218 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.443857735798356 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 16 27 43 7.63490368995126 14.1161000232072 -6.48119633325598 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0657070973561251 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 75601663 G/A 1 97 99 196 46.2866036203295 51.7590334184266 -5.47242979809702 A:G G A 10 0.522818519378046 0.474681898833519 ENSG00000170348:ENST00000303575:exon_75598173_75601709:TMED10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 76012864 A/G 1 226 221 447 107.843014620562 115.542892782548 -7.69987816198656 A:G A G 10 0.522818519378046 0.477766478675799 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 76012939 C/G 1 249 309 558 118.818188674867 161.550922487816 -42.7327338129497 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0.000309689032855912 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 64 78 142 30.5396147598051 40.7798445114876 -10.2402297516825 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0928917184243661 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 204 188 392 97.3450220468786 98.2898816430726 -0.944859596194036 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.95968461042101 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 81297635 A/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000100629:ENST00000281129:exon_81297487_81297638:C14orf145;ENSG00000100629:ENST00000435851:exon_81297487_81297638:C14orf145;ENSG00000100629:ENST00000393619:exon_81297487_81297638:C14orf145;ENSG00000100629:ENST00000216517:exon_81297487_81297638:C14orf145 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 21 25 46 10.020811093061 13.0704629844512 -3.04965189139012 A:G A G 10 0.522818519378046 0.379919052966865 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 90429858 G/A 1 14 12 26 6.68054072870736 6.27382223253655 0.406718496170803 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 90451500 A/G 1 31 29 60 14.7926258992806 15.1617370619633 -0.369111162682762 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90451476_90451554:TDP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 90770309 C/T 1 12 13 25 5.72617776746345 6.7966407519146 -1.07046298445115 T:C C T 10 0.522818519378046 0.693522691443741 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90770279_90770726:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90770279_90770726:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90770279_90770726:C14orf102 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 91883129 G/A 1 5 17 22 2.38590740310977 8.88791482942678 -6.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00875669172534432 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91883082_91883182:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000389856:exon_91883082_91883182:CCDC88C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 15 11 26 7.15772220932931 5.75100371315851 1.4067184961708 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.695704929825334 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 251 196 447 119.77255163611 102.472429798097 17.3001218380134 T:G T G 10 0.522818519378046 0.107396608203931 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 12 11 23 5.72617776746345 5.75100371315851 -0.024825945695059 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C C T 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 35 27 62 16.7013518217684 14.1161000232072 2.58525179856115 T:C C T 10 0.522818519378046 0.527840494951388 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 27 35 62 12.8838999767928 18.2986481782316 -5.41474820143885 A:G G A 10 0.522818519378046 0.203321932995064 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 118 180 298 56.3074147133906 94.1073334880483 -37.7999187746577 T:C C T 10 0.522818519378046 1.25181810106081e-05 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 93276654 T/C 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C T C 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93276599_93276722:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93276599_93276722:GOLGA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 94849201 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94848929_94849583:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94848929_94849578:SERPINA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 95999820 T/C 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.511900100712421 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 96010424 G/A 1 104 129 233 49.6268739846832 67.4435889997679 -17.8167150150847 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0215584499430421 ENSG00000182512:ENST00000331334:exon_96010284_96011055:GLRX5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 24 33 57 11.4523555349269 17.2530111394755 -5.80065560454862 A:G A G 10 0.522818519378046 0.14456296381946 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 97321689 C/T 1 62 32 94 29.5852517985611 16.7301926200975 12.8550591784637 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00949223950859839 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 99876505 A/G 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 102482399 C/T 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102482193_102482423:DYNC1H1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 15 12 27 7.15772220932931 6.27382223253655 0.883899976792757 T:C C T 10 0.522818519378046 0.847912280670244 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 141 144 285 67.2825887676955 75.2858667904386 -8.00327802274312 A:G G A 10 0.522818519378046 0.343546105733357 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 157 138 295 74.9174924576468 72.1489556741704 2.76853678347642 T:C C T 10 0.522818519378046 0.77088859754899 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 47 34 81 22.4275295892318 17.7758296588536 4.65169993037827 A:G G A 10 0.522818519378046 0.318386818914184 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105175957 A/G 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105175957_105176042:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105175957_105176042:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105175957_105176042:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105175957_105176042:INF2;ENSG00000203485:ENST00000474229:exon_105175957_105176042:INF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105180565 T/C 1 28 18 46 13.3610814574147 9.41073334880483 3.95034810860988 T:C T C 10 0.522818519378046 0.301568903052759 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 1 26 27 0.477181480621954 13.5932815038292 -13.1161000232072 A:C:G A G 10 0.522818519378046 8.94129915979149e-08 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105180785 C/T 1 21 33 54 10.020811093061 17.2530111394755 -7.23220004641449 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0561702523799537 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 73 71 144 34.8342480854026 37.1201148758413 -2.28586679043863 A:G G A 10 0.522818519378046 0.7388786689762 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 74 69 143 35.3114295660246 36.0744778370852 -0.763048271060583 T:C T C 10 0.522818519378046 0.933366974369235 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105834864 G/A 1 6 15 21 2.86308888373172 7.84227779067069 -4.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0466436829881584 ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105834796_105834876:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105834796_105834876:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105834796_105834876:PACS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105936506 C/T 1 110 114 224 52.4899628684149 59.6013112090972 -7.11134834068231 T:C C T 10 0.522818519378046 0.349691142049724 ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105936402_105937020:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105936402_105936575:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105936402_105937066:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000426567:exon_105936402_105936544:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481206:exon_105936402_105936567:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000494981:exon_105936402_105936634:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481635:exon_105936402_105936575:MTA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 105954546 C/T 1 638 1060 1698 304.441784636807 554.187630540729 -249.745845903922 T:C C T 10 0.522818519378046 5.05163044007892e-34 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954503_105954597:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954503_105954597:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954503_105954597:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954191_105954597:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954503_105954597:C14orf80 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 106306841 C/T 1 4251 787 5038 2028.49847412393 411.458174750522 1617.0402993734 T:C C T 10 0.522818519378046 0 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 709 3006 3715 338.321669760965 1571.59246925041 -1233.27079948944 A:T:C:G G A 10 0.522818519378046 0 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 30337377 G/C 0 0 13 13 0 6.7966407519146 -6.7966407519146 C G C 10 0.522818519378046 6.65099383159008e-05 ENSG00000215315:ENST00000400005:exon_30336926_30337498:AC111152.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 31234064 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31233769_31235308:FAN1;ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31231144_31234275:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31231144_31234275:MTMR10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 20 19 39 9.54362961243908 9.93355186818287 -0.389922255743794 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G G A 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 54 48 102 25.7677999535855 25.0952889301462 0.672511023439306 A:G A G 10 0.522818519378046 0.921296772937631 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 71 60 131 33.8798851241587 31.3691111626828 2.51077396147597 A:G G A 10 0.522818519378046 0.726601695844044 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 746 715 1461 355.977384543978 373.815241355303 -17.8378568113253 A:G G A 10 0.522818519378046 0.359352920504236 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40675443 G/T 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40675493 C/T 1 14 17 31 6.68054072870736 8.88791482942678 -2.20737410071943 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.474760861326864 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40683702 A/G 1 31 31 62 14.7926258992806 16.2073741007194 -1.41474820143885 A:G A G 10 0.522818519378046 0.79956619292812 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40683694_40683755:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40683694_40683755:C15orf23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 40758337 A/C 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 A:C A C 10 0.522818519378046 0.124191345419258 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40758140_40760441:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40758140_40760426:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40758140_40760426:BAHD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 41146880 T/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146837_41146887:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146837_41146887:SPINT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 41148199 C/T 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 19 21 40 9.06644813181713 10.979188906939 -1.91274077512184 C:G G C 10 0.522818519378046 0.635541648142928 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 42614205 G/A 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:G G A 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42613983_42614218:GANC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43020992 C/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 C:G C G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43020850_43021008:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43020850_43021008:CDAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43021505 C/T 1 1 11 12 0.477181480621954 5.75100371315851 -5.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00238898541265340 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43021427_43021560:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43021427_43021560:CDAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43021523 G/A 1 10 3 13 4.77181480621954 1.56845555813414 3.2033592480854 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0966494022259154 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43021427_43021560:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43021427_43021560:CDAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43531411 G/C 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 C:G G C 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43531361_43531464:TGM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43621947 A/G 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 37 33 70 17.6557147830123 17.2530111394755 0.402703643536778 A:T A T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43720253 A/G 1 12 13 25 5.72617776746345 6.7966407519146 -1.07046298445115 A:G A G 10 0.522818519378046 0.693522691443741 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000417342:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000467474:exon_43720214_43720314:TP53BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 43767874 G/C 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43767763_43767892:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43767763_43767892:TP53BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 131 166 297 62.510773961476 86.7878742167556 -24.2771002552797 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00523461769890923 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 44094013 T/G 1 28 36 64 13.3610814574147 18.8214666976097 -5.46038524019495 T:G T G 10 0.522818519378046 0.210501628939220 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 50 41 91 23.8590740310977 21.4355592944999 2.42351473659781 A:C A C 10 0.522818519378046 0.674965188235195 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 44120559 T/G 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44120273_44120564:WDR76 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 44581311 C/T 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 T:C C T 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000166734:ENST00000299957:exon_44580929_44581554:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000416522:exon_44580929_44581554:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000360824:exon_44580929_44581554:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000345795:exon_44580958_44581554:CASC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 44855395 T/C 1 21 21 42 10.020811093061 10.979188906939 -0.958377813877934 T:C T C 10 0.522818519378046 0.877487670924755 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44854894_44855499:SPG11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 45052012 G/C 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 C:G G C 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45051946_45052070:TRIM69;ENSG00000185880:ENST00000338264:exon_45051946_45052070:TRIM69 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 45059440 C/T 1 3 21 24 1.43154444186586 10.979188906939 -9.54764446507311 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000102660567206947 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45059429_45060025:TRIM69;ENSG00000185880:ENST00000338264:exon_45059429_45060023:TRIM69 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 45353297 C/T 0 21 0 21 10.020811093061 0 10.020811093061 C C 10 0.522818519378046 1.39601812080774e-06 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45353265_45353424:SORD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 0 0 25 25 0 13.0704629844512 -13.0704629844512 T A T 10 0.522818519378046 9.27020866153334e-09 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 48 31 79 22.9047110698538 16.2073741007194 6.69733696913436 T:C C T 10 0.522818519378046 0.143644855781307 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 12 22 34 5.72617776746345 11.502007426317 -5.77582965885357 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0581319391366077 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 50782703 A/G 1 23 12 35 10.9751740543049 6.27382223253655 4.70135182176839 A:G A G 10 0.522818519378046 0.128629268283738 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50782460_50782722:USP8;ENSG00000138592:ENST00000425032:exon_50782460_50782722:USP8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 51040384 T/C 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C T C 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51040310_51040399:AC012100.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52402010 T/A 1 9 1 10 4.29463332559759 0.522818519378046 3.77181480621954 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0227710816327027 ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52401460_52402170:BCL2L10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52605861 A/G 1 26 20 46 12.4067184961708 10.4563703875609 1.95034810860988 A:G A G 10 0.522818519378046 0.658469545429212 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 7 23 30 3.34027036435368 12.0248259456951 -8.68455558134138 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00158309082568001 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52652174 T/C 1 12 11 23 5.72617776746345 5.75100371315851 -0.024825945695059 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52652165_52652278:MYO5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52689631 T/G 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 T:G T G 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52689398_52689663:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52689398_52689663:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52689398_52689663:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52689398_52689663:MYO5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52877016 T/C 1 17 9 26 8.11208517057322 4.70536667440241 3.4067184961708 T:C T C 10 0.522818519378046 0.238700034690363 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52876942_52877141:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52876942_52877141:KIAA1370 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 61 93 154 29.1080703179392 48.6221223021583 -19.5140519842191 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00207317092005181 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 23 40 63 10.9751740543049 20.9127407751218 -9.9375667208169 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0158969081401924 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 16 16 32 7.63490368995126 8.36509631004874 -0.730192620097473 A:G G A 10 0.522818519378046 0.860419838988144 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 56756420 C/T 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000138587:ENST00000260453:exon_56756224_56756445:MNS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C:G C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 58001341 G/A 1 15 19 34 7.15772220932931 9.93355186818287 -2.77582965885356 A:G G A 10 0.522818519378046 0.39220071798164 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59408918 A/G 1 87 84 171 41.51478881411 43.9167556277559 -2.40196681364587 A:G A G 10 0.522818519378046 0.759565891300177 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59409495 G/A 1 107 76 183 51.0584184265491 39.7342074727315 11.3242109538176 A:G G A 10 0.522818519378046 0.103387745591877 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59429565 G/C 1 71 72 143 33.8798851241587 37.6429333952193 -3.76304827106058 C:G G C 10 0.522818519378046 0.55829799842067 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59428169_59429655:MYO1E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59453384 T/C 1 52 49 101 24.8134369923416 25.6181074495243 -0.804670457182649 T:C T C 10 0.522818519378046 0.920767224764736 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59453272_59453429:MYO1E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59506872 G/A 1 11 7 18 5.24899628684149 3.65972963564632 1.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.488968467594439 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59506839_59506919:MYO1E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 14 12 26 6.68054072870736 6.27382223253655 0.406718496170803 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 62165553 T/C 1 6 19 25 2.86308888373172 9.93355186818287 -7.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00480049350339373 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62165445_62165608:VPS13C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 62165577 G/A 1 8 19 27 3.81745184497563 9.93355186818287 -6.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.020587003967958 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62165445_62165608:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62165445_62165608:VPS13C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:C A C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 74 84 158 35.3114295660246 43.9167556277559 -8.60532606173128 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.17640637583067 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 65114484 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 66615250 A/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G A G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66615025_66615272:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66615025_66615272:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66615025_66615272:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66615025_66615272:DIS3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 A:G A G 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 43 36 79 20.518803666744 18.8214666976097 1.69733696913436 T:C C T 10 0.522818519378046 0.736370055204806 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 41 41 82 19.5644407055001 21.4355592944999 -1.87111858899977 T:C C T 10 0.522818519378046 0.740459012635886 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74276228 A/G 1 11 17 28 5.24899628684149 8.88791482942678 -3.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.188348939121894 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 69 49 118 32.9255221629148 25.6181074495243 7.30741471339057 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.197101121745956 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 78 77 155 37.2201554885124 40.2570259921095 -3.03687050359714 A:C:G G C 10 0.522818519378046 0.630500223661443 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 127 118 245 60.6020480389882 61.6925852866094 -1.09053724762127 A:G G A 10 0.522818519378046 0.898378490935946 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 76 85 161 36.2657925272685 44.4395741471339 -8.17378161986541 T:C T C 10 0.522818519378046 0.207265735414155 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 53 42 95 25.2906184729636 21.9583778138779 3.33224065908563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.53826795627977 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 31 24 55 14.7926258992806 12.5476444650731 2.24498143420747 A:G G A 10 0.522818519378046 0.590681105916751 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 75094871 G/A 1 536 502 1038 255.769273613367 262.454896727779 -6.68562311441175 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.686339061471122 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75094672_75095539:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75094672_75095537:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75094672_75095537:CSK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 83 130 213 39.6060628916222 67.966407519146 -28.3603446275238 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000113241875941282 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 79 77 156 37.6973369691344 40.2570259921095 -2.55968902297518 A:T:C T A 10 0.522818519378046 0.689406479469199 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 12 19 31 5.72617776746345 9.93355186818287 -4.20737410071943 T:C T C 10 0.522818519378046 0.151331507323559 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 450 556 1006 214.731666279879 290.687096774194 -75.9554304943143 T:C T C 10 0.522818519378046 1.80570959511860e-06 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 79058572 T/G 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79057978_79059393:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79057987_79059393:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79057987_79059393:ADAMTS7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 315 262 577 150.312166395916 136.978452077048 13.3337143188675 T:C C T 10 0.522818519378046 0.278617880181409 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 79237324 C/A 1 128 134 262 61.0792295196101 70.0576815966582 -8.97845207704806 A:C C A 10 0.522818519378046 0.29307699261005 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79237233_79237433:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79237293_79237420:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79237233_79237404:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79237120_79237436:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79237233_79237388:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79237233_79237340:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79236880_79237363:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528436:exon_79237233_79237384:CTSH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 79277409 C/T 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000058335:ENST00000419573:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394741:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000261752:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394745:exon_79277349_79277546:RASGRF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 408 289 697 194.690044093757 151.094552100255 43.5954919935019 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000961371454783201 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 215 102 317 102.59401833372 53.3274889765607 49.2665293571594 T:C C T 10 0.522818519378046 2.79029366885669e-08 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 67 30 97 31.9711592016709 15.6845555813414 16.2866036203295 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00104266185223973 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 78 16 94 37.2201554885124 8.36509631004874 28.8550591784637 T:G T G 10 0.522818519378046 6.20292532441752e-10 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 85 27 112 40.5604258528661 14.1161000232072 26.4443258296588 A:G G A 10 0.522818519378046 3.44078372830745e-07 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 13 24 37 6.2033592480854 12.5476444650731 -6.3442852169877 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0471164723795834 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 C:G C G 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 85188994 T/C 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 T:C T C 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 T:G T G 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 85200520 G/T 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:G G T 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000197696:ENST00000360476:exon_85200407_85200579:NMB;ENSG00000197696:ENST00000394588:exon_85200407_85200579:NMB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 86270398 A/G 1 26 12 38 12.4067184961708 6.27382223253655 6.13289626363425 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0515033107875892 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86270297_86270478:AKAP13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 86278323 G/A 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 A:G G A 10 0.522818519378046 0.414517478089946 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 25 24 49 11.9295370155488 12.5476444650731 -0.618107449524256 T:C C T 10 0.522818519378046 0.887062337250441 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 20 26 46 9.54362961243908 13.5932815038292 -4.04965189139012 A:G G A 10 0.522818519378046 0.241282516090175 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 11 8 19 5.24899628684149 4.18254815502437 1.06644813181713 A:G A G 10 0.522818519378046 0.65415663787627 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89169858 A/G 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 A:G A G 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89172558 G/C 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 C:G G C 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89172457_89172657:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89172457_89172657:AEN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 679 652 1331 324.006225342307 340.877674634486 -16.8714492921792 A:G A G 10 0.522818519378046 0.365226695855533 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89421327 A/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89420519_89421487:HAPLN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89803950 C/T 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89837139 G/T 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 T:G G T 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89837064_89837228:FANCI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 83 88 171 39.6060628916222 46.0080297052681 -6.40196681364587 T:C T C 10 0.522818519378046 0.358367957884968 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.325504437201279 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 97 81 178 46.2866036203295 42.3483000696217 3.93830355070781 T:C C T 10 0.522818519378046 0.599582245800523 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 T:C T C 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 18 6 24 8.58926665119517 3.13691111626828 5.45235553492689 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0387384186662656 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91485730 C/G 1 5 14 19 2.38590740310977 7.31945927129264 -4.93355186818287 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0359551262108928 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91485667_91485835:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91485667_91485978:UNC45A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91504819 C/T 1 8 20 28 3.81745184497563 10.4563703875609 -6.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0134695484537490 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91524841 G/T 1 18 15 33 8.58926665119517 7.84227779067069 0.746988860524481 T:G G T 10 0.522818519378046 0.862627047462256 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524729_91524899:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524729_91524899:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524729_91524899:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524729_91524899:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524729_91524899:PRC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 37 28 65 17.6557147830123 14.6389185425853 3.01679624042701 T:C C T 10 0.522818519378046 0.535046942974599 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 29 23 52 13.8382629380367 12.0248259456951 1.81343699234161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.677990224551658 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 91550232 G/A 1 7 12 19 3.34027036435368 6.27382223253655 -2.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.250439240184576 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91550180_91550276:VPS33B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 93521604 A/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93521464_93521613:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93521464_93521613:CHD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 25 17 42 11.9295370155488 8.88791482942678 3.04162218612207 A:C A C 10 0.522818519378046 0.359325554366158 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 100269613 C/T 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 C:G G C 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 3 8 11 1.43154444186586 4.18254815502437 -2.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.131842010035085 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 258 231 489 123.112822000464 120.771077976329 2.34174402413549 A:G A G 10 0.522818519378046 0.856351090568368 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 45 23 68 21.4731666279879 12.0248259456951 9.44834068229287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0281363079074355 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 30 17 47 14.3154444186586 8.88791482942678 5.42752958923184 T:C T C 10 0.522818519378046 0.143544382386502 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 34 13 47 16.2241703411464 6.7966407519146 9.42752958923184 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00787859403901209 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 23 11 34 10.9751740543049 5.75100371315851 5.22417034114644 T:C T C 10 0.522818519378046 0.085935856380022 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 9 4 13 4.29463332559759 2.09127407751218 2.2033592480854 T:C C T 10 0.522818519378046 0.273369431451006 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 110 230 340 52.4899628684149 120.248259456951 -67.7582965885356 A:G G A 10 0.522818519378046 1.67782216909533e-13 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 202 369 571 96.3906590856347 192.920033650499 -96.5293745648643 T:C:G C T 10 0.522818519378046 4.84503367153016e-16 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 570557 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 601632 T/C 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C T C 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_601512_601664:SOLH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 602403 C/G 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 41 32 73 19.5644407055001 16.7301926200975 2.83424808540264 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.558671116861213 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 23 19 42 10.9751740543049 9.93355186818287 1.04162218612207 T:C T C 10 0.522818519378046 0.760344817138562 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 37 26 63 17.6557147830123 13.5932815038292 4.0624332791831 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.316133054095130 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 37 27 64 17.6557147830123 14.1161000232072 3.53961475980505 A:G G A 10 0.522818519378046 0.384606219479374 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:C T C 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 717544 G/C 1 21 8 29 10.020811093061 4.18254815502437 5.83826293803666 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0393121190083874 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 28 32 60 13.3610814574147 16.7301926200975 -3.36911116268276 C:G C G 10 0.522818519378046 0.438555752535433 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 13 16 29 6.2033592480854 8.36509631004874 -2.16173706196333 A:G G A 10 0.522818519378046 0.460889625504142 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 36 20 56 17.1785333023903 10.4563703875609 6.72216291482942 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0819532164643806 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 30 26 56 14.3154444186586 13.5932815038292 0.722162914829424 A:G A G 10 0.522818519378046 0.894079085941656 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 57 41 98 27.1993443954514 21.4355592944999 5.76378510095149 C:G C G 10 0.522818519378046 0.266511413956594 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 21 23 44 10.020811093061 12.0248259456951 -2.00401485263403 T:C T C 10 0.522818519378046 0.550647233196772 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 C:G G C 10 0.522818519378046 0.586262826765089 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 26 15 41 12.4067184961708 7.84227779067069 4.56444070550011 T:C T C 10 0.522818519378046 0.162621725579825 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 39 32 71 18.6100777442562 16.7301926200975 1.87988512415873 A:G G A 10 0.522818519378046 0.721964632256528 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 45 23 68 21.4731666279879 12.0248259456951 9.44834068229287 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0281363079074355 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 A:G G A 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 9 13 22 4.29463332559759 6.7966407519146 -2.50200742631701 T:C C T 10 0.522818519378046 0.295879508077689 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 836081 C/A 1 53 42 95 25.2906184729636 21.9583778138779 3.33224065908563 A:C C A 10 0.522818519378046 0.53826795627977 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 836149 A/G 1 65 61 126 31.016796240427 31.8919296820608 -0.8751334416338 A:G A G 10 0.522818519378046 0.928997157569746 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 840378 A/G 1 2 10 12 0.954362961243908 5.22818519378046 -4.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.017999840799673 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840331_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000484349:exon_840347_840399:CHTF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 33 33 66 15.7469888605245 17.2530111394755 -1.50602227895104 T:C T C 10 0.522818519378046 0.713780534537226 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 80 69 149 38.1745184497563 36.0744778370852 2.10004061267114 A:C C A 10 0.522818519378046 0.74360030570722 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2049527 G/A 1 38 28 66 18.1328962636343 14.6389185425853 3.49397772104896 A:G G A 10 0.522818519378046 0.459985858431902 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2125834 T/C 1 17 15 32 8.11208517057322 7.84227779067069 0.269807379902528 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2125800_2125893:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2125800_2125893:TSC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 77 68 145 36.7429740078905 35.5516593177071 1.19131469018333 T:C T C 10 0.522818519378046 0.86821970849056 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2138584 G/C 1 45 39 84 21.4731666279879 20.3899222557438 1.08324437224413 C:G G C 10 0.522818519378046 0.828019519699653 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 18 14 32 8.58926665119517 7.31945927129264 1.26980737990253 A:G A G 10 0.522818519378046 0.725061426809395 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2140321 G/A 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2140454 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2140554 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2334978 C/A 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000167972:ENST00000301732:exon_2334780_2334999:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000382381:exon_2334780_2334999:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000436770:exon_2334780_2334999:ABCA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2506862 G/A 1 26 16 42 12.4067184961708 8.36509631004874 4.04162218612207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.220933300624791 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2506546_2508859:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2506546_2508855:CCNF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2564095 A/G 1 41 77 118 19.5644407055001 40.2570259921095 -20.6925852866094 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000141901474556282 ENSG00000185883:ENST00000330398:exon_2563871_2564183:ATP6V0C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 22 21 43 10.497992573683 10.979188906939 -0.48119633325598 A:C C A 10 0.522818519378046 0.880251142470216 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 23 35 58 10.9751740543049 18.2986481782316 -7.32347412392667 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0651026762717455 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2983516 C/T 1 7 21 28 3.34027036435368 10.979188906939 -7.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00413811782049240 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 2987315 G/A 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000344592:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000445831:exon_2986530_2987385:FLYWCH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 3165425 A/G 0 10 0 10 4.77181480621954 0 4.77181480621954 A A 10 0.522818519378046 0.00213796114358887 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3165356_3165569:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3165356_3165569:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000444510:exon_3165356_3165569:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000414351:exon_3165356_3165569:ZNF205 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 1 15 16 0.477181480621954 7.84227779067069 -7.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000165072783970944 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 3191356 G/A 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 54 63 117 25.7677999535855 32.9375667208169 -7.16976676723138 T:G G T 10 0.522818519378046 0.195663195318041 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4410357 G/C 1 51 43 94 24.3362555117197 22.481196333256 1.85505917846367 C:G G C 10 0.522818519378046 0.757081318350165 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4410279_4410364:CORO7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4412695 C/T 1 36 23 59 17.1785333023903 12.0248259456951 5.15370735669528 T:C C T 10 0.522818519378046 0.193976113173985 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4412613_4412739:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4412613_4412739:CORO7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 16 16 32 7.63490368995126 8.36509631004874 -0.730192620097473 T:C T C 10 0.522818519378046 0.860419838988144 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 A:T A T 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 18 21 39 8.58926665119517 10.979188906939 -2.3899222557438 A:T:G T A 10 0.522818519378046 0.522126092072328 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 40 52 92 19.0872592248782 27.1865630076584 -8.09930378278023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0955594626654586 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 5075542 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 5139133 C/T 1 33 9 42 15.7469888605245 4.70536667440241 11.0416221861221 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000560596964129466 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:C C A 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 10837913 C/G 1 21 37 58 10.020811093061 19.3442852169877 -9.32347412392667 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0173649584302024 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10837818_10837922:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10837818_10837922:NUBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 A:G G A 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 8 14 22 3.81745184497563 7.31945927129264 -3.50200742631701 T:C C T 10 0.522818519378046 0.142061348999446 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 39 40 79 18.6100777442562 20.9127407751218 -2.30266303086563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.652875873675362 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 12 13 25 5.72617776746345 6.7966407519146 -1.07046298445115 T:C C T 10 0.522818519378046 0.693522691443741 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 19 21 40 9.06644813181713 10.979188906939 -1.91274077512184 A:C A C 10 0.522818519378046 0.635541648142928 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11861408 G/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:G G T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11861273_11861434:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11861273_11861434:ZC3H7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11862903 T/A 1 5 10 15 2.38590740310977 5.22818519378046 -2.84227779067069 A:T T A 10 0.522818519378046 0.195994901009809 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11862887_11862951:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11862887_11862951:ZC3H7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 36 44 80 17.1785333023903 23.004014852634 -5.82548155024368 C:G G C 10 0.522818519378046 0.218338335423637 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 12009304 C/A 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 A:C C A 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_12009226_12009762:GSPT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 12142470 C/T 1 14 13 27 6.68054072870736 6.7966407519146 -0.116100023207243 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000140660:ENST00000268271:exon_12142229_12142477:RUNDC2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:C C A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 19 21 40 9.06644813181713 10.979188906939 -1.91274077512184 T:C C T 10 0.522818519378046 0.635541648142928 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 32 25 57 15.2698073799025 13.0704629844512 2.19934439545138 A:G A G 10 0.522818519378046 0.597575069487758 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 62 66 128 29.5852517985611 34.506022278951 -4.92077048038989 A:G A G 10 0.522818519378046 0.425981056878475 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 56 51 107 26.7221629148294 26.6637444882803 0.0584184265490748 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 64 58 122 30.5396147598051 30.3234741239267 0.216140635878386 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 17228368 G/A 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17228330_17228592:XYLT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 20 10 30 9.54362961243908 5.22818519378046 4.31544441865862 T:C C T 10 0.522818519378046 0.143437749507336 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 18 23 41 8.58926665119517 12.0248259456951 -3.43555929449989 T:C T C 10 0.522818519378046 0.34842901182173 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 21185384 G/A 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21185331_21185469:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21185331_21185469:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21185331_21185469:TMEM159 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 21190853 A/C 1 26 7 33 12.4067184961708 3.65972963564632 8.74698886052448 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0025414472236657 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21190796_21191937:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21190796_21191935:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21190796_21191935:TMEM159 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23360199 T/C 1 10 24 34 4.77181480621954 12.5476444650731 -7.77582965885357 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0092465058931843 ENSG00000168447:ENST00000343070:exon_23359913_23360231:SCNN1B;ENSG00000168447:ENST00000307331:exon_23359913_23360231:SCNN1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23379279 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000168447:ENST00000343070:exon_23379177_23379280:SCNN1B;ENSG00000168447:ENST00000307331:exon_23379177_23379280:SCNN1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23619235 A/C 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 A:C A C 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23619185_23619333:PALB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23641461 C/G 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23640961_23641790:PALB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 14 7 21 6.68054072870736 3.65972963564632 3.02081109306103 A:T A T 10 0.522818519378046 0.198910466352987 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23690219 G/T 1 32 15 47 15.2698073799025 7.84227779067069 7.42752958923184 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0398055001019962 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23690143_23690661:PLK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 A:C C A 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 24231248 C/T 1 109 70 179 52.012781387793 36.5972963564632 15.4154850313298 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0245253354066463 ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 56 32 88 26.7221629148294 16.7301926200975 9.99197029473195 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0332157018263658 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 94 116 210 44.8550591784637 60.6469482478533 -15.7918890693897 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0320717463270637 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 122 132 254 58.2161406358784 69.0120445579021 -10.7959039220237 T:C C T 10 0.522818519378046 0.187182073501487 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G A G 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 49 48 97 23.3818925504757 25.0952889301462 -1.71339637967047 T:C C T 10 0.522818519378046 0.760940872207254 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 20 35 55 9.54362961243908 18.2986481782316 -8.75501856579253 A:G A G 10 0.522818519378046 0.021219898641054 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 33 14 47 15.7469888605245 7.31945927129264 8.42752958923184 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0185098267560270 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 28603012 A/G 1 49 27 76 23.3818925504757 14.1161000232072 9.2657925272685 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0382965293057477 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 28917045 C/A 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 A:C C A 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28917025_28917080:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28917025_28917080:RABEP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 29859269 C/T 1 248 233 481 118.341007194245 121.816715015085 -3.47570782084014 T:C C T 10 0.522818519378046 0.784224369196012 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29859083_29859355:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29859083_29859341:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29859083_29859353:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29859083_29859353:MVP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:G G T 10 0.522818519378046 0.568000070744065 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 1123 1206 2329 535.874802738454 630.519134369923 -94.6443316314692 A:C:G A G 10 0.522818519378046 8.79137463710674e-05 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 19 12 31 9.06644813181713 6.27382223253655 2.79262589928057 T:C T C 10 0.522818519378046 0.370510096949308 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 30393660 G/A 1 96 65 161 45.8094221397076 33.983203759573 11.8262183801346 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0693626227714053 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 30408765 C/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 30 18 48 14.3154444186586 9.41073334880483 4.90471106985379 C:G C G 10 0.522818519378046 0.193145025582253 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 31102589 G/A 1 183 218 401 87.3242109538176 113.974437224414 -26.6502262705964 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00802847943361852 ENSG00000167397:ENST00000533518:exon_31102413_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000300851:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000319788:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000354895:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000394975:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000420057:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000394971:exon_31102425_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000498155:exon_31102496_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000472468:exon_31102503_31102663:VKORC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 58 72 130 27.6765258760733 37.6429333952193 -9.96640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0949100091075283 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 31141674 C/T 1 49 38 87 23.3818925504757 19.8671037363657 3.51478881410999 T:C C T 10 0.522818519378046 0.51985290641944 ENSG00000103510:ENST00000219797:exon_31141588_31141681:MYST1;ENSG00000103510:ENST00000448516:exon_31141588_31141681:MYST1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 31488916 C/G 1 40 2 42 19.0872592248782 1.04563703875609 18.0416221861221 C:G C G 10 0.522818519378046 1.63819190227340e-09 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31488631_31489281:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31488631_31489279:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31488631_31489281:TGFB1I1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 31926619 G/A 1 13 2 15 6.2033592480854 1.04563703875609 5.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0082618876748427 ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31925797_31928622:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31925797_31928622:ZNF267 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 50342658 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000121281:ENST00000394697:exon_50342578_50342703:ADCY7;ENSG00000121281:ENST00000254235:exon_50342578_50342703:ADCY7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 34 6 40 16.2241703411464 3.13691111626828 13.0872592248782 A:G G A 10 0.522818519378046 2.07341709744604e-05 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 57771126 G/T 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57770890_57771195:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57770890_57771195:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57771117_57771195:KATNB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 34 23 57 16.2241703411464 12.0248259456951 4.19934439545138 A:G G A 10 0.522818519378046 0.290411419038941 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 58587737 C/T 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 T:C C T 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 66975744 C/T 1 18 21 39 8.58926665119517 10.979188906939 -2.3899222557438 T:C C T 10 0.522818519378046 0.522126092072328 ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66975671_66975751:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66975671_66975751:CES2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 29 26 55 13.8382629380367 13.5932815038292 0.244981434207469 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67268008 G/A 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 A:G G A 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67578257 C/T 1 33 13 46 15.7469888605245 6.7966407519146 8.95034810860988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0112634989851095 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67691477 A/T 1 38 25 63 18.1328962636343 13.0704629844512 5.0624332791831 A:T A T 10 0.522818519378046 0.209793236164477 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 74 73 147 35.3114295660246 38.1657519145974 -2.85432234857277 A:G A G 10 0.522818519378046 0.679941836270168 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 14 13 27 6.68054072870736 6.7966407519146 -0.116100023207243 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C T C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 532 586 1118 253.86054769088 306.371652355535 -52.5111046646555 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00183547977992330 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 54 34 88 25.7677999535855 17.7758296588536 7.99197029473195 C:G G C 10 0.522818519378046 0.108921382814655 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 68088485 A/G 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68088477_68088520:DUS2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 68344363 A/C 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:C A C 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344238_68344516:SLC7A6OS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 68387457 C/T 1 36 52 88 17.1785333023903 27.1865630076584 -10.0080297052681 T:C C T 10 0.522818519378046 0.041991781860734 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68387395_68387469:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68387395_68387469:PRMT7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 65 34 99 31.016796240427 17.7758296588536 13.2409665815734 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00863498602967783 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 69368951 C/T 1 22 14 36 10.497992573683 7.31945927129264 3.17853330239034 T:C C T 10 0.522818519378046 0.319873415143134 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 69369234 C/T 1 31 35 66 14.7926258992806 18.2986481782316 -3.50602227895104 T:C C T 10 0.522818519378046 0.391800718462847 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 241 222 463 115.000736829891 116.065711301926 -1.0649744720353 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.925935339584867 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 69786207 T/A 1 119 119 238 56.7845961940125 62.2154038059875 -5.43080761197496 A:T T A 10 0.522818519378046 0.516509335126521 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69786144_69786274:NOB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 26 25 51 12.4067184961708 13.0704629844512 -0.663744488280347 T:C C T 10 0.522818519378046 0.889123753953531 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 70729448 T/C 1 26 21 47 12.4067184961708 10.979188906939 1.42752958923184 T:C T C 10 0.522818519378046 0.770715896326443 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70729447_70729526:VAC14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 71318001 G/T 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:G G T 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 5 10 15 2.38590740310977 5.22818519378046 -2.84227779067069 T:G G T 10 0.522818519378046 0.195994901009809 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 13 14 27 6.2033592480854 7.31945927129264 -1.11610002320724 C:G C G 10 0.522818519378046 0.703496842234386 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 A:C C A 10 0.522818519378046 0.177905026249726 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 12 17 29 5.72617776746345 8.88791482942678 -3.16173706196333 T:C T C 10 0.522818519378046 0.267874636611497 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 17 16 33 8.11208517057322 8.36509631004874 -0.253011139475518 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 39 31 70 18.6100777442562 16.2073741007194 2.40270364353678 A:C C A 10 0.522818519378046 0.632683700551766 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 74490556 G/A 1 56 47 103 26.7221629148294 24.5724704107682 2.14969250406126 A:G G A 10 0.522818519378046 0.69415908827059 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74490547_74490653:GLG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 7 12 19 3.34027036435368 6.27382223253655 -2.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.250439240184576 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 75662488 G/A 1 394 358 752 188.00950336505 187.16902993734 0.840473427709412 A:G G A 10 0.522818519378046 0.970886041586945 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75662467_75662610:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75662467_75662610:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75662467_75662610:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75662467_75662610:KARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 T:C T C 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 16 28 44 7.63490368995126 14.6389185425853 -7.00401485263403 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0485221782395992 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 81942175 A/G 1 75 68 143 35.7886110466466 35.5516593177071 0.236951728939424 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81942021_81942196:PLCG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 131 116 247 62.510773961476 60.6469482478533 1.86382571362263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.84853843623476 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 75 37 112 35.7886110466466 19.3442852169877 16.4443258296588 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00232019566527684 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 A:G G A 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 30 33 63 14.3154444186586 17.2530111394755 -2.9375667208169 A:C C A 10 0.522818519378046 0.528663385754924 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 20 19 39 9.54362961243908 9.93355186818287 -0.389922255743794 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 14 19 33 6.68054072870736 9.93355186818287 -3.25301113947552 A:T A T 10 0.522818519378046 0.297258881578533 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84520325 T/C 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 20 19 39 9.54362961243908 9.93355186818287 -0.389922255743794 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 29 41 70 13.8382629380367 21.4355592944999 -7.59729635646322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0732835552182968 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 4 47 51 1.90872592248782 24.5724704107682 -22.6637444882803 A:G A G 10 0.522818519378046 2.07538576731383e-11 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 43 1 44 20.518803666744 0.522818519378046 19.995985147366 T:C C T 10 0.522818519378046 2.5293342761182e-11 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 45 2 47 21.4731666279879 1.04563703875609 20.4275295892318 C:G G C 10 0.522818519378046 7.25936202567002e-11 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 87446053 G/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 T:C C T 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 49 36 85 23.3818925504757 18.8214666976097 4.56042585286609 A:G A G 10 0.522818519378046 0.330846512736853 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 70 88 158 33.4027036435368 46.0080297052681 -12.6053260617313 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0465898218485642 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88781125 T/C 1 55 56 111 26.2449814342075 29.2778370851706 -3.03285565096311 T:C T C 10 0.522818519378046 0.570198678765947 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88871908 A/G 1 49 67 116 23.3818925504757 35.0288407983291 -11.6469482478533 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0324912184373866 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 88873790 C/T 1 50 57 107 23.8590740310977 29.8006556045486 -5.94158157345093 T:C C T 10 0.522818519378046 0.287061657081946 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 49 38 87 23.3818925504757 19.8671037363657 3.51478881410999 A:G G A 10 0.522818519378046 0.51985290641944 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89348606 A/G 1 31 34 65 14.7926258992806 17.7758296588536 -2.98320375957299 A:G A G 10 0.522818519378046 0.459957577475503 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 69 57 126 32.9255221629148 29.8006556045486 3.1248665583662 A:G G A 10 0.522818519378046 0.593686985872893 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 67 64 131 31.9711592016709 33.4603852401949 -1.48922603852403 A:G G A 10 0.522818519378046 0.793878014295828 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89351930 C/T 1 22 23 45 10.497992573683 12.0248259456951 -1.52683337201207 T:C C T 10 0.522818519378046 0.657759788116952 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000378332:exon_89351789_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000378330:exon_89351848_89351967:ANKRD11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89764237 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 T:C T C 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89833576 G/C 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89833549_89833645:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89833549_89833645:FANCA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 17 12 29 8.11208517057322 6.27382223253655 1.83826293803667 T:C C T 10 0.522818519378046 0.578732322657605 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 89866043 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 16 90102835 A/G 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 G A G 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 15 7 22 7.15772220932931 3.65972963564632 3.49799257368299 A:C A C 10 0.522818519378046 0.199325911917565 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 649067 A/G 1 25 35 60 11.9295370155488 18.2986481782316 -6.36911116268276 A:G A G 10 0.522818519378046 0.120415915931345 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 21 17 38 10.020811093061 8.88791482942678 1.13289626363425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.747768058032766 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 650518 G/A 1 20 18 38 9.54362961243908 9.41073334880483 0.132896263634251 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 56 66 122 26.7221629148294 34.506022278951 -7.78385936412161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.174056536722895 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 35 21 56 16.7013518217684 10.979188906939 5.72216291482942 A:G G A 10 0.522818519378046 0.141628879585207 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1387472 C/T 1 23 17 40 10.9751740543049 8.88791482942678 2.08725922487816 T:C C T 10 0.522818519378046 0.531014279535613 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1387442_1387597:MYO1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1542153 G/A 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 G G 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1578939 C/T 1 22 20 42 10.497992573683 10.4563703875609 0.0416221861220674 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1580929 G/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 C:G G C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1580859_1580988:PRPF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1585130 A/G 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G A G 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585114_1585332:PRPF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1637164 C/T 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1684605 G/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:G G T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 1 9 10 0.477181480621954 4.70536667440241 -4.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 0.00884457321564113 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 58 45 103 27.6765258760733 23.5268333720121 4.14969250406126 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.431417571656342 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 1943888 T/C 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 2323517 C/T 1 10 12 22 4.77181480621954 6.27382223253655 -1.50200742631701 T:C C T 10 0.522818519378046 0.531402320360827 ENSG00000127804:ENST00000263092:exon_2319352_2323890:METT10D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 47 36 83 22.4275295892318 18.8214666976097 3.60606289162218 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.443857735798356 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C T C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 3631196 G/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:G G T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 43 66 109 20.518803666744 34.506022278951 -13.987218612207 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00931391547820042 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4718776 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4718771_4718881:PLD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4720469 C/T 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 T:C C T 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4720441_4720554:PLD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4721376 A/G 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G A G 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4721297_4721401:PLD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 T:C C T 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4800584 G/C 1 71 56 127 33.8798851241587 29.2778370851706 4.60204803898815 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.425398319184356 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4800499_4801355:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4800499_4801355:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4800499_4801355:MINK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C T C 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4904564 T/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4904517_4904696:KIF1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 102 75 177 48.6725110234393 39.2113889533534 9.46112207008586 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.175457225407463 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 22 6 28 10.497992573683 3.13691111626828 7.36108145741471 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00696862589636955 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 22 6 28 10.497992573683 3.13691111626828 7.36108145741471 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00696862589636955 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 23 14 37 10.9751740543049 7.31945927129264 3.6557147830123 T:C T C 10 0.522818519378046 0.252264257502104 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 22 2 24 10.497992573683 1.04563703875609 9.45235553492689 A:G A G 10 0.522818519378046 5.09453224008510e-05 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 18 2 20 8.58926665119517 1.04563703875609 7.54362961243908 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000507372617600748 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 32 4 36 15.2698073799025 2.09127407751218 13.1785333023903 A:G G A 10 0.522818519378046 5.26911801567796e-06 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 130 110 240 62.033592480854 57.5100371315851 4.52355534926895 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.561762006071602 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 117 97 214 55.8302332327686 50.7133963796705 5.11683685309815 T:C T C 10 0.522818519378046 0.494529121258987 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 59 47 106 28.1537073566953 24.5724704107682 3.58123694592712 A:T:G T A 10 0.522818519378046 0.497856760030032 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 48 31 79 22.9047110698538 16.2073741007194 6.69733696913436 T:C C T 10 0.522818519378046 0.143644855781307 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 C:G C G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 447 479 926 213.300121838013 250.430070782084 -37.1299489440706 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.0149082746711462 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7130545 A/G 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7130409_7130588:DVL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 11 24 35 5.24899628684149 12.5476444650731 -7.29864817823161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0168794949956789 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7144146 C/A 1 543 642 1185 259.109543977721 335.649489440706 -76.5399454629846 A:C C A 10 0.522818519378046 9.60396104658972e-06 ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 115 64 179 54.8758702715247 33.4603852401949 21.4154850313298 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00160087645672017 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.635194561032296 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7216763 C/T 1 78 70 148 37.2201554885124 36.5972963564632 0.622859132049193 T:C C T 10 0.522818519378046 0.93459743154002 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 55 37 92 26.2449814342075 19.3442852169877 6.90069621721976 T:C T C 10 0.522818519378046 0.174638959649788 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 20 16 36 9.54362961243908 8.36509631004874 1.17853330239034 A:G G A 10 0.522818519378046 0.740777061222911 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 84 78 162 40.0832443722441 40.7798445114876 -0.696600139243458 A:G A G 10 0.522818519378046 0.937404123728904 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 C:G G C 10 0.522818519378046 0.728833389284679 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 24 38 62 11.4523555349269 19.8671037363657 -8.41474820143885 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0411205708333268 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 17 16 33 8.11208517057322 8.36509631004874 -0.253011139475518 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 7400815 T/C 1 5 19 24 2.38590740310977 9.93355186818287 -7.5476444650731 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00325420147801473 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400675_7400836:POLR2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 8025180 T/C 1 4 16 20 1.90872592248782 8.36509631004874 -6.45637038756092 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00570315529267881 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8024299_8025340:HES7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 8025712 A/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8025661_8025748:HES7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 8167600 T/C 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 17 1 18 8.11208517057322 0.522818519378046 7.58926665119517 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000182549084801669 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 9846521 G/C 0 11 0 11 5.24899628684149 0 5.24899628684149 G G 10 0.522818519378046 0.00108983038466757 ENSG00000007237:ENST00000323816:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000396115:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000437099:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000432992:exon_9846438_9846553:GAS7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 11894428 G/A 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000154957:ENST00000446124:exon_11894291_11894480:ZNF18;ENSG00000154957:ENST00000322748:exon_11894291_11894480:ZNF18;ENSG00000154957:ENST00000454073:exon_11894291_11894480:ZNF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 12898295 T/C 1 75 64 139 35.7886110466466 33.4603852401949 2.32822580645161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.734409416217307 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12898081_12898379:ELAC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 12899902 C/T 1 62 54 116 29.5852517985611 28.2322000464145 1.35305175214666 T:C C T 10 0.522818519378046 0.852705315553764 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 13980058 A/T 1 9 4 13 4.29463332559759 2.09127407751218 2.2033592480854 A:T A T 10 0.522818519378046 0.273369431451006 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 49 56 105 23.3818925504757 29.2778370851706 -5.89594453469483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.282565150665418 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 59 50 109 28.1537073566953 26.1409259689023 2.01278138779298 A:C:G A C 10 0.522818519378046 0.773772112960389 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 124 138 262 59.1705035971223 72.1489556741704 -12.9784520770481 C:G C G 10 0.522818519378046 0.121910905935495 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 12 4 16 5.72617776746345 2.09127407751218 3.63490368995126 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0816762651460521 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 3 10 13 1.43154444186586 5.22818519378046 -3.7966407519146 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0492332397122063 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 C:G G C 10 0.522818519378046 0.274460962299708 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 660 773 1433 314.93977721049 404.13871547923 -89.1989382687399 A:T:G A G 10 0.522818519378046 2.45818410692983e-06 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 499 550 1049 238.113558830355 287.550185657925 -49.4366268275703 A:C A C 10 0.522818519378046 0.00243866336007972 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 33 22 55 15.7469888605245 11.502007426317 4.24498143420747 A:G G A 10 0.522818519378046 0.281366504086635 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 33 27 60 15.7469888605245 14.1161000232072 1.63088883731724 T:C C T 10 0.522818519378046 0.7000269390867 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 18148944 C/G 1 127 112 239 60.6020480389882 58.5556741703412 2.046373868647 C:G C G 10 0.522818519378046 0.796071814313602 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 18167505 T/C 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177427:ENST00000323019:exon_18167024_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395704:exon_18167098_18169095:SMCR7;ENSG00000177427:ENST00000395706:exon_18167024_18169095:SMCR7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 22 40 62 10.497992573683 20.9127407751218 -10.4147482014389 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0104371730993517 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 18630995 G/A 1 2 10 12 0.954362961243908 5.22818519378046 -4.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.017999840799673 ENSG00000108448:ENST00000395902:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000414850:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395672:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000424146:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395671:exon_18630838_18631071:TRIM16L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 34 30 64 16.2241703411464 15.6845555813414 0.539614759805056 A:G A G 10 0.522818519378046 0.901262481659945 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 A:T A T 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 20922410 C/T 1 7 15 22 3.34027036435368 7.84227779067069 -4.50200742631701 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0854093100432508 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20922397_20922498:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20922397_20922498:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20922397_20922498:USP22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 12 3 15 5.72617776746345 1.56845555813414 4.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0379440782596598 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21101603 G/A 1 57 70 127 27.1993443954514 36.5972963564632 -9.39795196101184 A:G G A 10 0.522818519378046 0.109530012693860 ENSG00000178307:ENST00000317635:exon_21101263_21102153:TMEM11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 93 0 93 44.3778776978417 0 44.3778776978417 T T 10 0.522818519378046 6.54166139865855e-27 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 86 0 86 41.037607333488 0 41.037607333488 T T 10 0.522818519378046 6.22202004845893e-25 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 97 0 97 46.2866036203295 0 46.2866036203295 G G 10 0.522818519378046 8.65856894945401e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 99 0 99 47.2409665815734 0 47.2409665815734 C C 10 0.522818519378046 2.22659641830269e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 100 0 100 47.7181480621954 0 47.7181480621954 C C 10 0.522818519378046 1.13106028372116e-28 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 113 0 113 53.9215073102808 0 53.9215073102808 C C 10 0.522818519378046 1.87087007905336e-32 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 109 0 109 52.012781387793 0 52.012781387793 C C 10 0.522818519378046 2.67721090877786e-31 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 93 1 94 44.3778776978417 0.522818519378046 43.8550591784637 T:C C T 10 0.522818519378046 4.04355572496964e-25 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 110 0 110 52.4899628684149 0 52.4899628684149 C C 10 0.522818519378046 1.37459133369296e-31 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 122 0 122 58.2161406358784 0 58.2161406358784 G G 10 0.522818519378046 4.9200470494384e-35 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 210 0 210 100.20811093061 0 100.20811093061 G G 10 0.522818519378046 1.09957565003364e-59 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:G G T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 25932816 G/A 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 33 35 68 15.7469888605245 18.2986481782316 -2.55165931770713 A:G G A 10 0.522818519378046 0.546342618343617 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 15 17 32 7.15772220932931 8.88791482942678 -1.73019262009747 A:C A C 10 0.522818519378046 0.597620232913149 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 25 23 48 11.9295370155488 12.0248259456951 -0.095288930146209 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 30 27 57 14.3154444186586 14.1161000232072 0.199344395451378 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27052358 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000160606:ENST00000292090:exon_27052322_27052404:TLCD1;ENSG00000160606:ENST00000394933:exon_27052322_27052404:TLCD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27065211 T/C 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000160602:ENST00000268766:exon_27065113_27065263:NEK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 80 72 152 38.1745184497563 37.6429333952193 0.531585054537004 T:C C T 10 0.522818519378046 0.935525957272126 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 74 70 144 35.3114295660246 36.5972963564632 -1.28586679043863 T:C C T 10 0.522818519378046 0.867636125693607 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27224617 C/A 0 19 0 19 9.06644813181713 0 9.06644813181713 C C 10 0.522818519378046 5.23837393233072e-06 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27224544_27224627:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27224544_27224627:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394910:exon_27224544_27224715:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000465427:exon_27224544_27224712:FLOT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27228198 G/A 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27228008_27228319:DHRS13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 154 135 289 73.4859480157809 70.5805001160362 2.90544789974469 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.768513850494618 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 29096011 C/T 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.217724522020312 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:T T A 10 0.522818519378046 0.113036050378061 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 29679401 A/G 1 5 11 16 2.38590740310977 5.75100371315851 -3.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.131513831648772 ENSG00000196712:ENST00000358273:exon_29679275_29679432:NF1;ENSG00000196712:ENST00000356175:exon_29679275_29679432:NF1;ENSG00000196712:ENST00000444181:exon_29679275_29679432:NF1;ENSG00000196712:ENST00000456735:exon_29679275_29679432:NF1;ENSG00000196712:ENST00000471572:exon_29679275_29679432:NF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 156 147 303 74.4403109770248 76.8543223485728 -2.41401137154794 A:G A G 10 0.522818519378046 0.818116744416888 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 30228590 C/T 1 8 18 26 3.81745184497563 9.41073334880483 -5.5932815038292 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0311094729688371 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 33348543 A/G 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000092871:ENST00000315249:exon_33348390_33348800:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000394597:exon_33348390_33348800:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000268850:exon_33348390_33348800:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000378516:exon_33348390_33348800:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000413582:exon_33348390_33348800:RFFL;ENSG00000092871:ENST00000415395:exon_33348413_33348800:RFFL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 33679728 C/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:C C A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000172716:ENST00000308377:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000394566:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000321335:exon_33677324_33680158:SLFN11;ENSG00000172716:ENST00000442678:exon_33677331_33680158:SLFN11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 14 13 27 6.68054072870736 6.7966407519146 -0.116100023207243 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 35 81 116 16.7013518217684 42.3483000696217 -25.6469482478533 A:T:G G A 10 0.522818519378046 2.34381519564221e-06 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 34958466 C/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 C:G C G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000129282:ENST00000250156:exon_34958001_34958781:MRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 95 82 177 45.3322406590856 42.8711185889998 2.46112207008586 T:C T C 10 0.522818519378046 0.763543744538938 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 36453208 T/C 1 22 21 43 10.497992573683 10.979188906939 -0.48119633325598 T:C T C 10 0.522818519378046 0.880251142470216 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36452990_36453215:MRPL45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 36478450 G/T 1 86 98 184 41.037607333488 51.2362148990485 -10.1986075655605 T:G G T 10 0.522818519378046 0.140118530551040 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36478392_36479101:MRPL45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 310 311 621 147.926258992806 162.596559526572 -14.6703005337666 A:T A T 10 0.522818519378046 0.244171754504087 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 36966701 G/T 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:G G T 10 0.522818519378046 0.553506961761619 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 12 20 32 5.72617776746345 10.4563703875609 -4.73019262009747 A:G A G 10 0.522818519378046 0.111400060717305 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 39 29 68 18.6100777442562 15.1617370619633 3.44834068229287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.46671812955556 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 37922691 T/C 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 21 18 39 10.020811093061 9.41073334880483 0.610077744256204 T:C C T 10 0.522818519378046 0.873999252090533 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 38189659 C/T 1 28 35 63 13.3610814574147 18.2986481782316 -4.9375667208169 T:C C T 10 0.522818519378046 0.256203680448994 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38189598_38189709:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38189598_38189709:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38189598_38189709:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38189598_38189709:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38189598_38189709:MED24;ENSG00000008838:ENST00000428757:exon_38189598_38189709:MED24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 38251883 G/A 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000126368:ENST00000246672:exon_38251697_38252340:NR1D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 38447569 T/C 1 22 10 32 10.497992573683 5.22818519378046 5.26980737990253 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0761148002195875 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38447310_38447591:CDC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 24 34 58 11.4523555349269 17.7758296588536 -6.32347412392667 A:G G A 10 0.522818519378046 0.114315624223902 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 38548550 G/T 1 190 136 326 90.6644813181713 71.1033186354143 19.561162682757 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0306266949931455 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548466_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548470_38548593:TOP2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:T T A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 39913688 A/G 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39913667_39913788:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39913667_39913788:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39913667_39913788:JUP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 40257055 T/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 91 60 151 43.4235147365978 31.3691111626828 12.054403573915 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0507989134481276 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 40282473 C/T 1 35 32 67 16.7013518217684 16.7301926200975 -0.0288407983290817 T:C:G C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40282355_40282608:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40282355_40282608:RAB5C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 40353722 A/G 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 A:G A G 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 142 155 297 67.7597702483175 81.0368705035971 -13.2771002552797 T:C T C 10 0.522818519378046 0.130963906412637 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:C A C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C T C 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 C:G C G 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 4 10 14 1.90872592248782 5.22818519378046 -3.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.106723132817195 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 A:C A C 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 C:G C G 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 42429839 G/C 1 362 393 755 172.739695985147 205.467678115572 -32.7279821304247 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.0178490860556357 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42429709_42429939:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42429709_42429939:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42429709_42429939:GRN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 42980189 G/A 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000167131:ENST00000417826:exon_42979733_42982758:CCDC103;ENSG00000167131:ENST00000410006:exon_42979733_42980250:CCDC103;ENSG00000214447:ENST00000331733:exon_42979733_42982758:FAM187A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 22 21 43 10.497992573683 10.979188906939 -0.48119633325598 T:C T C 10 0.522818519378046 0.880251142470216 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43006209 A/G 1 11 3 14 5.24899628684149 1.56845555813414 3.68054072870736 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0609433495022194 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43006187_43006392:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43006187_43006392:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43006187_43006392:KIF18B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 34 36 70 16.2241703411464 18.8214666976097 -2.59729635646322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.551647936167329 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 155 139 294 73.9631294964029 72.6717741935484 1.29135530285447 T:C C T 10 0.522818519378046 0.907106516006774 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43216472 A/G 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43216388_43216527:ACBD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43246456 G/A 1 26 17 43 12.4067184961708 8.88791482942678 3.51880366674402 A:G G A 10 0.522818519378046 0.290616343942490 ENSG00000168517:ENST00000307275:exon_43246382_43247406:HEXIM2;ENSG00000168517:ENST00000401829:exon_43246382_43247399:HEXIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 20 26 46 9.54362961243908 13.5932815038292 -4.04965189139012 A:G G A 10 0.522818519378046 0.241282516090175 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 3 10 13 1.43154444186586 5.22818519378046 -3.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0492332397122063 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 15 18 33 7.15772220932931 9.41073334880483 -2.25301113947552 T:C T C 10 0.522818519378046 0.487734378265704 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 46023295 C/G 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46023227_46023355:PNPO HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 11 8 19 5.24899628684149 4.18254815502437 1.06644813181713 A:G A G 10 0.522818519378046 0.65415663787627 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 45 60 105 21.4731666279879 31.3691111626828 -9.89594453469483 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0629731592975196 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 51 39 90 24.3362555117197 20.3899222557438 3.94633325597586 T:C C T 10 0.522818519378046 0.460373029075186 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 46620619 G/A 1 7 15 22 3.34027036435368 7.84227779067069 -4.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0854093100432508 ENSG00000173917:ENST00000504772:exon_46620317_46621070:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000330070:exon_46620017_46621109:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000509853:exon_46620521_46621109:HOXB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 46620688 G/C 1 10 17 27 4.77181480621954 8.88791482942678 -4.11610002320724 C:G G C 10 0.522818519378046 0.125709307504719 ENSG00000173917:ENST00000504772:exon_46620317_46621070:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000330070:exon_46620017_46621109:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000509853:exon_46620521_46621109:HOXB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 38 43 81 18.1328962636343 22.481196333256 -4.34830006962173 T:C C T 10 0.522818519378046 0.373884667216036 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 47300081 C/G 1 159 163 322 75.8718554188907 85.2194186586215 -9.34756323973082 C:G C G 10 0.522818519378046 0.315362698785993 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47299914_47300587:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47299914_47300398:ABI3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48432324 G/C 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48432215_48432417:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48432215_48432417:XYLT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48455985 A/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:T A T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48455961_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48455956_48456042:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48455956_48456042:EME1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 T:C T C 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48557326 G/A 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G G A 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48557348 T/C 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48557241_48557445:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000443328:exon_48557241_48557990:RSAD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 27 23 50 12.8838999767928 12.0248259456951 0.8590740310977 A:G A G 10 0.522818519378046 0.887725497648298 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 49043640 T/C 1 10 15 25 4.77181480621954 7.84227779067069 -3.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.235495507223354 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 49337993 A/G 1 31 35 66 14.7926258992806 18.2986481782316 -3.50602227895104 A:G A G 10 0.522818519378046 0.391800718462847 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 49338275 G/A 1 38 34 72 18.1328962636343 17.7758296588536 0.357066604780687 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 24 14 38 11.4523555349269 7.31945927129264 4.13289626363425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.196596229723048 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 57094781 T/C 1 7 19 26 3.34027036435368 9.93355186818287 -6.5932815038292 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0104306512702234 ENSG00000108395:ENST00000393066:exon_57094657_57094785:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000262294:exon_57094657_57094785:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000393065:exon_57094657_57094785:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000376149:exon_57094657_57094785:TRIM37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 31 35 66 14.7926258992806 18.2986481782316 -3.50602227895104 A:G G A 10 0.522818519378046 0.391800718462847 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 65919092 G/A 1 9 2 11 4.29463332559759 1.04563703875609 3.24899628684149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0684542396822566 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65918956_65919106:BPTF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 26 20 46 12.4067184961708 10.4563703875609 1.95034810860988 T:C T C 10 0.522818519378046 0.658469545429212 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 42 6 48 20.0416221861221 3.13691111626828 16.9047110698538 A:C A C 10 0.522818519378046 3.13797382642086e-07 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G A G 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 26 23 49 12.4067184961708 12.0248259456951 0.381892550475746 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 71228379 G/C 1 27 13 40 12.8838999767928 6.7966407519146 6.08725922487816 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0582548565098148 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71228225_71228510:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71228225_71228506:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71228225_71228533:FAM104A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 16 9 25 7.63490368995126 4.70536667440241 2.92953701554885 C:G G C 10 0.522818519378046 0.317159513391763 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 48 31 79 22.9047110698538 16.2073741007194 6.69733696913436 T:C C T 10 0.522818519378046 0.143644855781307 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 104 105 209 49.6268739846832 54.8959445346948 -5.26907055001162 T:C C T 10 0.522818519378046 0.488939853789944 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73127348 G/A 1 161 162 323 76.8262183801346 84.6966001392435 -7.87038175910887 A:G G A 10 0.522818519378046 0.403512912975426 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127276_73127376:NT5C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 17 20 37 8.11208517057322 10.4563703875609 -2.3442852169877 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511342651330165 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73824121 T/C 1 66 78 144 31.493977721049 40.7798445114876 -9.28586679043863 T:C T C 10 0.522818519378046 0.133160750911731 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73824079_73824167:UNC13D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 53 49 102 25.2906184729636 25.6181074495243 -0.327488976560694 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 26 18 44 12.4067184961708 9.41073334880483 2.99598514736597 C:G C G 10 0.522818519378046 0.450910858989867 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73886888 A/G 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 68 75 143 32.4483406822929 39.2113889533534 -6.76304827106058 T:C T C 10 0.522818519378046 0.276768005973462 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73945957 A/G 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73945799_73945978:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73945799_73945978:ACOX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 49 48 97 23.3818925504757 25.0952889301462 -1.71339637967047 T:C C T 10 0.522818519378046 0.760940872207254 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74099729 C/T 1 7 12 19 3.34027036435368 6.27382223253655 -2.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.250439240184576 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74099714_74099856:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74099714_74099827:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74099714_74099827:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74099714_74099839:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74099714_74099802:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74099714_74099802:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74099714_74099773:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405068:exon_74099714_74099824:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000406660:exon_74099714_74099815:EXOC7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74099779 T/C 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74099714_74099856:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74099714_74099827:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74099714_74099827:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74099714_74099839:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74099714_74099802:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74099714_74099802:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405068:exon_74099714_74099824:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000406660:exon_74099714_74099815:EXOC7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74152366 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74152291_74152402:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74152291_74152402:RNF157 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74163821 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000141576:ENST00000269391:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000319945:exon_74163732_74163878:RNF157;ENSG00000141576:ENST00000301610:exon_74163732_74163878:RNF157 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74266322 T/C 1 382 380 762 182.283325597586 198.671037363657 -16.3877117660711 T:C T C 10 0.522818519378046 0.245860941269009 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74387284 C/T 1 26 41 67 12.4067184961708 21.4355592944999 -9.02884079832908 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0280635035681956 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 7 14 21 3.34027036435368 7.31945927129264 -3.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.124230594228541 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.113036050378061 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 25 19 44 11.9295370155488 9.93355186818287 1.99598514736597 T:C C T 10 0.522818519378046 0.6512525992917 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 75483546 C/T 1 219 226 445 104.502744256208 118.156985379438 -13.6542411232305 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.200276335225724 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76121004 G/A 1 39 47 86 18.6100777442562 24.5724704107682 -5.96239266651196 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.234892770378522 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:T A T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 13 14 27 6.2033592480854 7.31945927129264 -1.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.703496842234386 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 99 87 186 47.2409665815734 45.48521118589 1.75575539568344 T:C T C 10 0.522818519378046 0.825919309729431 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 74 72 146 35.3114295660246 37.6429333952193 -2.33150382919472 A:G A G 10 0.522818519378046 0.740552374964764 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 20 25 45 9.54362961243908 13.0704629844512 -3.52683337201207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.300641388123278 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 19 23 42 9.06644813181713 12.0248259456951 -2.95837781387793 T:C T C 10 0.522818519378046 0.440324582601068 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 25 19 44 11.9295370155488 9.93355186818287 1.99598514736597 A:G A G 10 0.522818519378046 0.6512525992917 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76814782 G/A 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76814749_76814860:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76814749_76814860:USP36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 76823425 G/T 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 T:G G T 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76823327_76823429:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76823327_76823429:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76823158_76823429:USP36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 77082390 G/A 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 78087109 A/G 1 14 4 18 6.68054072870736 2.09127407751218 4.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0339640075555004 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 9 1 10 4.29463332559759 0.522818519378046 3.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0227710816327027 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 78293189 A/T 1 9 2 11 4.29463332559759 1.04563703875609 3.24899628684149 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0684542396822566 ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78292990_78295258:RNF213 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 78348319 A/C 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 A:C A C 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78348258_78348389:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78348258_78348389:RNF213 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 15 11 26 7.15772220932931 5.75100371315851 1.4067184961708 T:C C T 10 0.522818519378046 0.695704929825334 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79166384 C/T 1 18 11 29 8.58926665119517 5.75100371315851 2.83826293803666 T:C C T 10 0.522818519378046 0.353949986622967 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 20 10 30 9.54362961243908 5.22818519378046 4.31544441865862 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.143437749507336 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79170578 C/T 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C C T 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79173184 T/C 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79181024 T/C 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79180925_79181039:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79180925_79181039:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79180925_79181039:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79182797 T/C 1 4 11 15 1.90872592248782 5.75100371315851 -3.84227779067069 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0677330756934676 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79182728_79182822:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79193736 G/A 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 A:G G A 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79193680_79193873:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79193680_79193873:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79193680_79193873:AZI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79202687 A/C 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 A:C A C 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79202724 C/T 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79202743 C/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79202948 G/T 1 9 14 23 4.29463332559759 7.31945927129264 -3.02482594569506 T:G G T 10 0.522818519378046 0.21807391097219 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79203114 G/C 1 14 12 26 6.68054072870736 6.27382223253655 0.406718496170803 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79219621 G/A 1 66 59 125 31.493977721049 30.8462926433047 0.647685077744249 A:G G A 10 0.522818519378046 0.928862571420082 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79225330 C/A 1 45 28 73 21.4731666279879 14.6389185425853 6.83424808540264 A:C C A 10 0.522818519378046 0.127457949940838 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79226264 T/C 1 44 41 85 20.995985147366 21.4355592944999 -0.439574147133911 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 31 13 44 14.7926258992806 6.7966407519146 7.99598514736597 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0158954140243125 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 34 32 66 16.2241703411464 16.7301926200975 -0.506022278951036 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.90270411696434 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79516197 G/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79517566 G/A 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.246697181289009 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79517274_79518229:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79517274_79518229:C17orf70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79662019 G/A 1 35 39 74 16.7013518217684 20.3899222557438 -3.6885704339754 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.416575327502109 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 46 41 87 21.9503481086099 21.4355592944999 0.514788814109998 A:T:C:G T A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 73 64 137 34.8342480854026 33.4603852401949 1.3738628452077 T:C T C 10 0.522818519378046 0.864307581719863 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 55 52 107 26.2449814342075 27.1865630076584 -0.941581573450925 T:C C T 10 0.522818519378046 0.922966888761735 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80038629 G/A 1 134 109 243 63.9423184033418 56.987218612207 6.95509979113482 A:G G A 10 0.522818519378046 0.403882368494477 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80038568_80038798:FASN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 5 16 21 2.38590740310977 8.36509631004874 -5.97918890693897 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0141722997540828 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80059532 T/G 1 67 58 125 31.9711592016709 30.3234741239267 1.64768507774425 T:G T G 10 0.522818519378046 0.78882181138868 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80193882 G/A 1 24 25 49 11.4523555349269 13.0704629844512 -1.61810744952426 A:G G A 10 0.522818519378046 0.669985914306293 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 46 57 103 21.9503481086099 29.8006556045486 -7.85030749593874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.138773187501324 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80352234 G/A 1 20 22 42 9.54362961243908 11.502007426317 -1.95837781387793 A:G G A 10 0.522818519378046 0.643623726109392 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80352303 G/A 1 16 19 35 7.63490368995126 9.93355186818287 -2.29864817823161 A:G G A 10 0.522818519378046 0.499901817369517 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80373377 G/T 1 13 20 33 6.2033592480854 10.4563703875609 -4.25301113947552 T:G G T 10 0.522818519378046 0.163764779261074 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 9 2 11 4.29463332559759 1.04563703875609 3.24899628684149 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0684542396822566 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80391684 A/G 1 5 17 22 2.38590740310977 8.88791482942678 -6.50200742631701 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00875669172534432 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80391534_80391698:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80391534_80391698:HEXDC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 48 22 70 22.9047110698538 11.502007426317 11.4027036435368 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.00802060651433577 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80442683 T/G 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 115 86 201 54.8758702715247 44.962392666512 9.91347760501275 T:C T C 10 0.522818519378046 0.179634677352979 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80559252 C/T 1 41 25 66 19.5644407055001 13.0704629844512 6.49397772104896 T:C C T 10 0.522818519378046 0.138643534400995 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80559179_80560262:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80559179_80562483:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335241:exon_80559180_80559257:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000529652:exon_80559179_80560281:FOXK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80684784 G/A 1 31 35 66 14.7926258992806 18.2986481782316 -3.50602227895104 A:G G A 10 0.522818519378046 0.391800718462847 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684709_80685892:FN3KRP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80708607 C/T 1 27 3 30 12.8838999767928 1.56845555813414 11.3154444186586 T:C C T 10 0.522818519378046 2.27639651667335e-05 ENSG00000167363:ENST00000300784:exon_80708293_80709073:FN3K HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 91 59 150 43.4235147365978 30.8462926433047 12.5772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0411205620986356 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 17 80992932 A/C 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80992911_80992975:B3GNTL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 205 238 443 97.8222035275006 124.430807611975 -26.6086040844744 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0116922212211825 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 706558 C/T 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C C T 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_706470_706578:ENOSF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 3457539 A/G 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 9119489 A/T 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:T A T 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9119472_9119523:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9119472_9119564:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000465096:exon_9119471_9119588:NDUFV2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 85 114 199 40.5604258528661 59.6013112090972 -19.0408853562312 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00699435205264937 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 9570320 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9570155_9570681:PPP4R1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 1 9 10 0.477181480621954 4.70536667440241 -4.22818519378046 C:G C G 10 0.522818519378046 0.00884457321564113 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 29 31 60 13.8382629380367 16.2073741007194 -2.36911116268276 A:C C A 10 0.522818519378046 0.605719746677596 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 13095609 T/C 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 17 13 30 8.11208517057322 6.7966407519146 1.31544441865862 T:G G T 10 0.522818519378046 0.716164107637729 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 20577669 G/A 1 32 32 64 15.2698073799025 16.7301926200975 -1.46038524019495 A:G G A 10 0.522818519378046 0.802627182358662 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 21106668 C/G 1 18 13 31 8.58926665119517 6.7966407519146 1.79262589928057 C:G C G 10 0.522818519378046 0.5916042942634 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21106601_21106729:C18orf8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 22020543 C/G 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000154059:ENST00000284202:exon_22020460_22020582:IMPACT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 29122618 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 85 94 179 40.5604258528661 49.1449408215363 -8.58451496867023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.204084119778142 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 34398914 C/T 1 25 36 61 11.9295370155488 18.8214666976097 -6.89192968206081 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0949814783370882 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34398857_34398936:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34398857_34398936:C18orf10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 46690066 G/A 1 22 26 48 10.497992573683 13.5932815038292 -3.09528893014621 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.389152265900971 ENSG00000141627:ENST00000442713:exon_46690055_46690157:DYM;ENSG00000141627:ENST00000418472:exon_46690055_46690157:DYM;ENSG00000141627:ENST00000269445:exon_46690055_46690157:DYM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 78 69 147 37.2201554885124 36.0744778370852 1.14567765142723 T:C T C 10 0.522818519378046 0.86916437573553 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 58 45 103 27.6765258760733 23.5268333720121 4.14969250406126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.431417571656342 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 60241579 T/C 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 38 37 75 18.1328962636343 19.3442852169877 -1.21138895335345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.817701305001077 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 66344127 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000166479:ENST00000299608:exon_66340927_66344430:TMX3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 67534632 C/T 1 2 15 17 0.954362961243908 7.84227779067069 -6.88791482942678 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000899735077831102 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67534593_67534647:CD226 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 67718688 A/G 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67718647_67718784:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67718647_67718784:RTTN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 72776121 G/A 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.246697181289009 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 9 2 11 4.29463332559759 1.04563703875609 3.24899628684149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0684542396822566 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 74091235 G/C 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 C:G G C 10 0.522818519378046 0.246697181289009 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 77067000 T/G 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 T:G T G 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 77513721 T/C 1 34 36 70 16.2241703411464 18.8214666976097 -2.59729635646322 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.551647936167329 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 37 32 69 17.6557147830123 16.7301926200975 0.925522162914824 A:G G A 10 0.522818519378046 0.904219086495855 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 334474 T/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:G T G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_334400_334542:MIER2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 580710 G/A 1 390 402 792 186.100777442562 210.173044789975 -24.0722673474125 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0878326985505704 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 90 86 176 42.9463332559759 44.962392666512 -2.0160594105361 A:G G A 10 0.522818519378046 0.763439696730253 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 22 14 36 10.497992573683 7.31945927129264 3.17853330239034 C:G G C 10 0.522818519378046 0.319873415143134 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 A:T:G T G 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 899444 C/T 1 73 82 155 34.8342480854026 42.8711185889998 -8.03687050359713 T:C C T 10 0.522818519378046 0.199302187533772 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_899440_899495:C19orf22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 102 55 157 48.6725110234393 28.7550185657925 19.9174924576468 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0017450071101247 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 106 57 163 50.5812369459271 29.8006556045486 20.7805813413785 C:G C G 10 0.522818519378046 0.00124059652191880 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 990819 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 108 182 290 51.535599907171 95.1529705268044 -43.6173706196333 T:C T C 10 0.522818519378046 3.53993438692149e-07 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 158 118 276 75.3946739382687 61.6925852866094 13.7020886516593 A:G G A 10 0.522818519378046 0.103811461137122 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1048982 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1048894_1049004:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1048894_1049004:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1048894_1049004:ABCA7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1061804 T/C 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1061781_1061887:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1061781_1061887:ABCA7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 16 7 23 7.63490368995126 3.65972963564632 3.97517405430494 A:G G A 10 0.522818519378046 0.142381587870303 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 T:G G T 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 23 16 39 10.9751740543049 8.36509631004874 2.61007774425621 T:C T C 10 0.522818519378046 0.427159104010122 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 25 15 40 11.9295370155488 7.84227779067069 4.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.208951287825107 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 33 29 62 15.7469888605245 15.1617370619633 0.585251798561147 A:T A T 10 0.522818519378046 0.899584033069993 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 54 32 86 25.7677999535855 16.7301926200975 9.03760733348804 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0525246613992446 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1080189 G/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 C:G G C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 85 80 165 40.5604258528661 41.8254815502437 -1.26505569737759 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.876269112131835 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 29 53 82 13.8382629380367 27.7093815270364 -13.8711185889998 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.00263469073814312 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 18 12 30 8.58926665119517 6.27382223253655 2.31544441865862 C:G C G 10 0.522818519378046 0.466589946286752 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 T:C C T 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 19 14 33 9.06644813181713 7.31945927129264 1.74698886052448 A:G G A 10 0.522818519378046 0.60345776447202 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1113701 G/A 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1113534_1113703:SBNO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 19 20 39 9.06644813181713 10.4563703875609 -1.38992225574379 T:C T C 10 0.522818519378046 0.749095693569684 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 26 22 48 12.4067184961708 11.502007426317 0.904711069853791 T:C C T 10 0.522818519378046 0.885378760422716 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1969882 G/T 1 14 7 21 6.68054072870736 3.65972963564632 3.02081109306103 T:G G T 10 0.522818519378046 0.198910466352987 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1969507_1969958:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1969507_1969958:CSNK1G2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1979386 C/T 1 46 39 85 21.9503481086099 20.3899222557438 1.56042585286609 T:C C T 10 0.522818519378046 0.746068774327017 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979318_1979402:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979318_1979402:CSNK1G2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 1979811 A/G 1 64 58 122 30.5396147598051 30.3234741239267 0.216140635878386 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979751_1979834:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979751_1979819:CSNK1G2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 20 18 38 9.54362961243908 9.41073334880483 0.132896263634251 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2226833 T/G 1 41 39 80 19.5644407055001 20.3899222557438 -0.82548155024368 T:G T G 10 0.522818519378046 0.911029602353347 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 38 43 81 18.1328962636343 22.481196333256 -4.34830006962173 A:G A G 10 0.522818519378046 0.373884667216036 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 85 89 174 40.5604258528661 46.5308482246461 -5.97042237178 A:G G A 10 0.522818519378046 0.403911697236288 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 62 59 121 29.5852517985611 30.8462926433047 -1.26104084474357 T:C T C 10 0.522818519378046 0.855782001586454 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 50 60 110 23.8590740310977 31.3691111626828 -7.51003713158506 A:C A C 10 0.522818519378046 0.153648270534634 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 50 40 90 23.8590740310977 20.9127407751218 2.94633325597586 T:G G T 10 0.522818519378046 0.598072120009616 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 10 2 12 4.77181480621954 1.04563703875609 3.72617776746345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0409307209651302 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2989697 T/C 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 T:C T C 10 0.522818519378046 0.124191345419258 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2989533_2989783:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2989533_2989783:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2989533_2989783:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2989533_2989783:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000478073:exon_2989533_2989758:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000360309:exon_2989533_2989783:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2989533_2989783:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000469572:exon_2989533_2989783:TLE6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 2993513 C/T 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2993430_2993580:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2993430_2993580:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2993430_2993580:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2993430_2993580:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000360309:exon_2993430_2993537:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2993430_2993580:TLE6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3150139 G/A 1 15 16 31 7.15772220932931 8.36509631004874 -1.20737410071943 A:G G A 10 0.522818519378046 0.72105496133213 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3150129_3150283:GNA15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3544892 C/T 1 55 41 96 26.2449814342075 21.4355592944999 4.80942213970758 T:C C T 10 0.522818519378046 0.358321134269842 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3546340 G/A 1 41 33 74 19.5644407055001 17.2530111394755 2.3114295660246 A:G G A 10 0.522818519378046 0.642283408134592 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3546253_3546423:C19orf28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 26 15 41 12.4067184961708 7.84227779067069 4.56444070550011 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162621725579825 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3613346 G/A 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3613057_3613370:C19orf29OS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3633115 C/A 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:C C A 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3630182_3633167:PIP5K1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 24 26 50 11.4523555349269 13.5932815038292 -2.1409259689023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.573399628827636 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3759802 C/A 1 31 31 62 14.7926258992806 16.2073741007194 -1.41474820143885 A:C C A 10 0.522818519378046 0.79956619292812 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3759687_3760299:APBA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3760056 G/A 1 42 23 65 20.0416221861221 12.0248259456951 8.01679624042701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.047675215610799 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3759687_3760299:APBA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3976549 C/T 1 4035 3773 7808 1925.42727430958 1972.59427361337 -47.1669993037833 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.286930957742460 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3976055_3976745:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3976055_3976745:EEF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 3982047 G/A 1 1100 998 2098 524.899628684149 521.77288233929 3.1267463448595 A:G G A 10 0.522818519378046 0.895692211407443 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3981945_3982050:EEF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4012971 C/T 1 12 16 28 5.72617776746345 8.36509631004874 -2.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348462366114306 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 16 17 33 7.63490368995126 8.88791482942678 -1.25301113947552 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728839376751847 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 480 308 788 229.047110698538 161.028103968438 68.0190067300997 A:C:G G A 10 0.522818519378046 1.17243043297223e-06 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 659 487 1146 314.462595729868 254.612618937108 59.8499767927593 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000428633396388179 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 32 46 78 15.2698073799025 24.0496518913901 -8.77984451148759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.053606536198749 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 43 41 84 20.518803666744 21.4355592944999 -0.916755627755865 T:C C T 10 0.522818519378046 0.913118934710816 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 35 18 53 16.7013518217684 9.41073334880483 7.29061847296356 A:G G A 10 0.522818519378046 0.053565285806643 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 20 21 41 9.54362961243908 10.979188906939 -1.43555929449989 A:G A G 10 0.522818519378046 0.754997551325209 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 54 40 94 25.7677999535855 20.9127407751218 4.85505917846368 C:G G C 10 0.522818519378046 0.353087857420146 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4409511 A/G 1 29 28 57 13.8382629380367 14.6389185425853 -0.800655604548624 A:G A G 10 0.522818519378046 0.89478291062761 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 66 51 117 31.493977721049 26.6637444882803 4.83023323276862 T:C C T 10 0.522818519378046 0.405276196997794 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 249 228 477 118.818188674867 119.202622418194 -0.384433743327946 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4670236 C/G 1 127 161 288 60.6020480389882 84.1737816198654 -23.5717335808773 C:G C G 10 0.522818519378046 0.00554348923684584 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 A:G A G 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 133 153 286 63.4651369227199 79.991233464841 -16.5260965421212 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0509595735423793 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 5915151 C/T 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6230692 G/A 1 5 13 18 2.38590740310977 6.7966407519146 -4.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0562237849586215 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6230581_6230724:MLLT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6374930 C/T 1 229 213 442 109.274559062427 111.360344627524 -2.08578556509634 T:C C T 10 0.522818519378046 0.849079995559726 ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374822_6375040:ALKBH7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 T:C T C 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6454666 C/T 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 T:C C T 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6457543 C/T 1 14 9 23 6.68054072870736 4.70536667440241 1.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.532244732814475 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6457514_6457601:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6457514_6457601:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6457514_6457601:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6457514_6457601:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6457514_6457601:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6457514_6457601:SLC25A23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6458300 G/A 1 14 9 23 6.68054072870736 4.70536667440241 1.97517405430494 A:G G A 10 0.522818519378046 0.532244732814475 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6467627 C/T 1 180 146 326 85.8926665119517 76.3315038291947 9.561162682757 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.292747799164674 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6467219_6468129:DENND1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 22 26 48 10.497992573683 13.5932815038292 -3.09528893014621 T:G G T 10 0.522818519378046 0.389152265900971 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6534619 A/G 0 63 0 63 30.0624332791831 0 30.0624332791831 A A 10 0.522818519378046 2.20371692367298e-18 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6534620 T/A 0 63 0 63 30.0624332791831 0 30.0624332791831 T T 10 0.522818519378046 2.20371692367298e-18 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6534621 C/G 1 64 3 67 30.5396147598051 1.56845555813414 28.9711592016709 C:G C G 10 0.522818519378046 1.00298703705605e-14 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6534841 G/A 1 106 82 188 50.5812369459271 42.8711185889998 7.71011835692735 A:G G A 10 0.522818519378046 0.273888428370456 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6677989 G/A 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 A:G G A 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000125730:ENST00000245907:exon_6677846_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000428815:exon_6677846_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000467528:exon_6677852_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000482039:exon_6677878_6678034:C3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 6755120 C/T 1 2 11 13 0.954362961243908 5.75100371315851 -4.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0100466661678204 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7506808 C/T 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7506798_7506938:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7506798_7506938:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7506798_7506938:ARHGEF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7524846 C/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7532252 G/C 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 C:G G C 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7532100_7532570:ARHGEF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:G T G 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 A:G A G 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7585229 C/T 1 61 20 81 29.1080703179392 10.4563703875609 18.6516999303783 T:C C T 10 0.522818519378046 2.88413915369411e-05 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 7755427 C/T 1 1105 663 1768 527.285536087259 346.628678347644 180.656857739615 T:C:G C T 10 0.522818519378046 5.25585394440007e-18 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755292_7755443:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755292_7755443:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755292_7755443:FCER2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8121096 G/A 1 14 1 15 6.68054072870736 0.522818519378046 6.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00113963630404871 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000315626:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000458625:exon_8121036_8121153:CCL25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8121360 A/G 1 23 3 26 10.9751740543049 1.56845555813414 9.4067184961708 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000125024930493312 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121250_8121383:CCL25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 23 27 50 10.9751740543049 14.1161000232072 -3.1409259689023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.398075894512748 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8320555 G/A 1 9 15 24 4.29463332559759 7.84227779067069 -3.5476444650731 A:G G A 10 0.522818519378046 0.157963972015285 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 74 51 125 35.3114295660246 26.6637444882803 8.64768507774425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.128427592076605 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 50 81 131 23.8590740310977 42.3483000696217 -18.489226038524 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00154122241799318 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 80 32 112 38.1745184497563 16.7301926200975 21.4443258296588 A:G G A 10 0.522818519378046 4.10224800551233e-05 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 61 12 73 29.1080703179392 6.27382223253655 22.8342480854026 T:C:G C T 10 0.522818519378046 2.71860419065781e-08 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8373176 C/T 0 55 0 55 26.2449814342075 0 26.2449814342075 C C 10 0.522818519378046 4.53323838541972e-16 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 247 287 534 117.863825713623 150.048915061499 -32.1850893478766 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0055360020988872 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 21 4 25 10.020811093061 2.09127407751218 7.92953701554885 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00196053257185097 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 9267319 G/T 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 18 34 52 8.58926665119517 17.7758296588536 -9.18656300765839 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0121022720389202 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 10 19 29 4.77181480621954 9.93355186818287 -5.16173706196333 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0633103274921372 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 33 18 51 15.7469888605245 9.41073334880483 6.33625551171965 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0919191120251985 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 18 28 46 8.58926665119517 14.6389185425853 -6.04965189139012 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0780221607692198 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 438 525 963 209.005488512416 274.479722673474 -65.4742341610583 A:T:G A G 10 0.522818519378046 2.67545543040777e-05 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 528 672 1200 251.951821768392 351.334045022047 -99.3822232536552 A:C:G A G 10 0.522818519378046 9.84771176130373e-09 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 18 8 26 8.58926665119517 4.18254815502437 4.4067184961708 T:G T G 10 0.522818519378046 0.114830012681343 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 337 324 661 160.810158969598 169.393200278487 -8.58304130888843 A:T T A 10 0.522818519378046 0.508259663568457 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 0 9 0 9 4.29463332559759 0 4.29463332559759 C C 10 0.522818519378046 0.00420127319250026 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 84 87 171 40.0832443722441 45.48521118589 -5.40196681364587 A:G A G 10 0.522818519378046 0.444089431380897 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 16 10 26 7.63490368995126 5.22818519378046 2.4067184961708 A:C A C 10 0.522818519378046 0.433360460128227 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 16 12 28 7.63490368995126 6.27382223253655 1.36108145741471 T:C T C 10 0.522818519378046 0.706426464838565 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 16 9 25 7.63490368995126 4.70536667440241 2.92953701554885 A:G A G 10 0.522818519378046 0.317159513391763 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10469975 A/C 1 36 37 73 17.1785333023903 19.3442852169877 -2.16575191459736 A:C A C 10 0.522818519378046 0.640512668650211 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10469851_10469978:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10469851_10469978:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10469851_10469978:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10469851_10469978:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000533334:exon_10469851_10469978:TYK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 16 20 36 7.63490368995126 10.4563703875609 -2.82146669760966 A:C C A 10 0.522818519378046 0.405198740254853 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 40 52 92 19.0872592248782 27.1865630076584 -8.09930378278023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0955594626654586 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10664933 T/G 1 38 31 69 18.1328962636343 16.2073741007194 1.92552216291482 T:G T G 10 0.522818519378046 0.718060288359682 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 19 23 42 9.06644813181713 12.0248259456951 -2.95837781387793 C:G C G 10 0.522818519378046 0.440324582601068 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 14 10 24 6.68054072870736 5.22818519378046 1.4523555349269 A:G G A 10 0.522818519378046 0.683818962617994 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10679240 C/G 1 11 13 24 5.24899628684149 6.7966407519146 -1.5476444650731 C:G C G 10 0.522818519378046 0.546956746198156 ENSG00000129355:ENST00000393599:exon_10679189_10679631:CDKN2D;ENSG00000129355:ENST00000335766:exon_10679189_10679344:CDKN2D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 80 98 178 38.1745184497563 51.2362148990485 -13.0616964492922 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0512897121241948 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12060627 A/G 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 C:G G C 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12738766 T/C 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000173875:ENST00000446165:exon_12738535_12740461:ZNF791;ENSG00000173875:ENST00000343325:exon_12738535_12742735:ZNF791 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12760773 C/T 1 219 274 493 104.502744256208 143.252274309585 -38.7495300533767 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0005077746999153 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12760727_12760828:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12760727_12760828:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12760727_12760828:MAN2B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12767849 C/A 1 48 62 110 22.9047110698538 32.4147482014389 -9.51003713158507 A:C:G C A 10 0.522818519378046 0.070509673570053 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000433513:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000495617:exon_12767763_12767870:MAN2B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 65 77 142 31.016796240427 40.2570259921095 -9.24022975168254 T:C C T 10 0.522818519378046 0.130567086856565 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 43 52 95 20.518803666744 27.1865630076584 -6.66775934091437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.182483872406745 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12779170 G/A 1 477 447 924 227.615566256672 233.699878161987 -6.08431190531451 A:G G A 10 0.522818519378046 0.692828154333763 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12778881_12779239:C19orf56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12800597 T/C 1 18 14 32 8.58926665119517 7.31945927129264 1.26980737990253 T:C T C 10 0.522818519378046 0.725061426809395 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800575_12800688:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800575_12800688:FBXW9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12805431 T/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12805525 G/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 C:G G C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12807066 G/C 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 C:G G C 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12807187 C/T 1 11 11 22 5.24899628684149 5.75100371315851 -0.502007426317013 T:C C T 10 0.522818519378046 0.834912590229453 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12812169 A/G 1 19 16 35 9.06644813181713 8.36509631004874 0.701351821768389 A:G A G 10 0.522818519378046 0.86672112730153 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12813683 T/C 1 34 17 51 16.2241703411464 8.88791482942678 7.33625551171965 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0488546859294193 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12816559 G/T 1 18 8 26 8.58926665119517 4.18254815502437 4.4067184961708 T:G G T 10 0.522818519378046 0.114830012681343 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000420511:exon_12816496_12816582:TNPO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 70 72 142 33.4027036435368 37.6429333952193 -4.24022975168253 A:G G A 10 0.522818519378046 0.502040232212944 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 63 79 142 30.0624332791831 41.3026630308656 -11.2402297516825 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0644638959457411 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 64 61 125 30.5396147598051 31.8919296820608 -1.35231492225575 A:G A G 10 0.522818519378046 0.858007186790169 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 201 183 384 95.9134776050127 95.6757890461824 0.237688558830328 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13050425 C/T 1 970 854 1824 462.866036203295 446.487015548851 16.3790206544441 T:C C T 10 0.522818519378046 0.453243025685135 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13050242_13050445:CALR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 16 22 38 7.63490368995126 11.502007426317 -3.86710373636575 A:G A G 10 0.522818519378046 0.255723585527227 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 137 120 257 65.3738628452077 62.7382223253655 2.63564051984218 T:C C T 10 0.522818519378046 0.755220506646733 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 409 415 824 195.167225574379 216.969685541889 -21.8024599675099 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.133719297883640 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 13936385 C/T 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13936364_13936527:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13936364_13936527:ZSWIM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 20 11 31 9.54362961243908 5.75100371315851 3.79262589928057 T:C T C 10 0.522818519378046 0.208912622946211 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:C T C 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 T:C T C 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14578707 G/A 1 163 120 283 77.7805813413785 62.7382223253655 15.042359016013 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0744727696630408 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14578688_14578779:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14578688_14578779:PKN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 1 272 291 563 129.793362729171 152.140189139011 -22.3468264098399 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0633357185205934 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14582539 C/T 1 254 251 505 121.204096077976 131.22744836389 -10.0233522859132 T:C C T 10 0.522818519378046 0.373390452555383 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 23 10 33 10.9751740543049 5.22818519378046 5.74698886052448 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0545016337755219 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 14705574 T/C 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 T:C T C 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000187912:ENST00000397439:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000417570:exon_14705571_14705612:CLEC17A;ENSG00000187912:ENST00000339847:exon_14705571_14705612:CLEC17A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 38 30 68 18.1328962636343 15.6845555813414 2.44834068229287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.627648386994081 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 41 56 97 19.5644407055001 29.2778370851706 -9.71339637967046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0533198021854015 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17004049 T/C 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000160111:ENST00000443236:exon_17003758_17004150:CPAMD8;ENSG00000160111:ENST00000291440:exon_17003765_17004150:CPAMD8;ENSG00000160111:ENST00000388925:exon_17003765_17004150:CPAMD8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 11 13 24 5.24899628684149 6.7966407519146 -1.5476444650731 T:C C T 10 0.522818519378046 0.546956746198156 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17301935 G/A 1 6 14 20 2.86308888373172 7.31945927129264 -4.45637038756092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.070687716479435 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17301906_17302028:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17301906_17302028:MYO9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17306031 T/C 1 40 39 79 19.0872592248782 20.3899222557438 -1.30266303086563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.822094708912678 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 34 29 63 16.2241703411464 15.1617370619633 1.0624332791831 T:C C T 10 0.522818519378046 0.802395034187393 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 40 62 102 19.0872592248782 32.4147482014389 -13.3274889765607 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00967714039072436 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 63 38 101 30.0624332791831 19.8671037363657 10.1953295428174 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0461990939727027 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17389648 C/T 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 115 101 216 54.8758702715247 52.8046704571826 2.07119981434207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.785745009748717 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17417080 C/T 1 150 173 323 71.5772220932931 90.447603852402 -18.8703817591089 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0391721017680339 ENSG00000130312:ENST00000252602:exon_17416975_17417652:MRPL34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17516142 A/G 1 994 940 1934 474.318391738222 491.449408215363 -17.131016477141 A:T:C:G A G 10 0.522818519378046 0.439036428582806 ENSG00000130303:ENST00000416178:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000252593:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000446020:exon_17516100_17516427:BST2;ENSG00000130303:ENST00000527220:exon_17516100_17516339:BST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17844132 G/A 1 52 45 97 24.8134369923416 23.5268333720121 1.28660362032954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.83922853295711 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 17844227 G/A 1 98 96 194 46.7637851009515 50.1905778602924 -3.42679275934093 A:G G A 10 0.522818519378046 0.666423488682397 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 196 182 378 93.527570201903 95.1529705268044 -1.62540032490141 T:G T G 10 0.522818519378046 0.877349544526888 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 C:G C G 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18255359 G/A 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18284651 G/T 1 325 270 595 155.083981202135 141.161000232072 13.9229809700626 T:G G T 10 0.522818519378046 0.267839103956958 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18284579_18284783:IFI30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 1528 1430 2958 729.133302390346 747.630482710606 -18.4971803202602 A:G A G 10 0.522818519378046 0.495937945448944 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 17 32 49 8.11208517057322 16.7301926200975 -8.61810744952425 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0148753484926257 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18497137 G/A 1 25 27 52 11.9295370155488 14.1161000232072 -2.18656300765839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.580375481610123 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18499151 C/T 1 18 30 48 8.58926665119517 15.6845555813414 -7.09528893014621 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0434562935416638 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 61 87 148 29.1080703179392 45.48521118589 -16.3771408679508 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0.00826027165850404 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 0 131 0 131 62.510773961476 0 62.510773961476 C C 10 0.522818519378046 1.35428925718304e-37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 3839 2936 6775 1831.89970410768 1534.99517289394 296.904531213738 A:T:C:G G T 10 0.522818519378046 4.88081363643515e-13 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 19105259 G/A 1 74 59 133 35.3114295660246 30.8462926433047 4.46513692271988 A:G G A 10 0.522818519378046 0.487585133119443 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19105175_19106089:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19105175_19105295:SUGP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 19153616 G/A 1 30 30 60 14.3154444186586 15.6845555813414 -1.36911116268276 A:G G A 10 0.522818519378046 0.79638565335662 ENSG00000105676:ENST00000392335:exon_19153520_19153686:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000269932:exon_19153520_19153686:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000392336:exon_19153520_19153686:ARMC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 19257680 C/T 1 36 24 60 17.1785333023903 12.5476444650731 4.63088883731724 T:C C T 10 0.522818519378046 0.246855525177585 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000475290:exon_19257593_19257992:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257551_19257684:AC002126.6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 10 4 14 4.77181480621954 2.09127407751218 2.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.185914534035155 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 21131571 A/G 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 G A G 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 30106275 G/A 1 78 65 143 37.2201554885124 33.983203759573 3.23695172893942 A:G G A 10 0.522818519378046 0.616030504778458 ENSG00000105171:ENST00000221770:exon_30106151_30106706:POP4;ENSG00000105171:ENST00000392279:exon_30106151_30106677:POP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 30308425 A/G 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30308313_30308448:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30308313_30308448:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30308313_30308448:CCNE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 33882222 G/A 1 30 26 56 14.3154444186586 13.5932815038292 0.722162914829424 A:G G A 10 0.522818519378046 0.894079085941656 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33882201_33882385:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33882201_33882385:PEPD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35448956 T/C 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 78 21 99 37.2201554885124 10.979188906939 26.2409665815734 A:G G A 10 0.522818519378046 8.2658199125459e-08 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 94 72 166 44.8550591784637 37.6429333952193 7.21212578324436 C:G G C 10 0.522818519378046 0.277190997149301 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 35 54 89 16.7013518217684 28.2322000464145 -11.5308482246461 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0147429312699136 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 102 56 158 48.6725110234393 29.2778370851706 19.3946739382687 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00236992970633205 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 28 16 44 13.3610814574147 8.36509631004874 4.99598514736597 T:C C T 10 0.522818519378046 0.173713477454746 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 251 219 470 119.77255163611 114.497255743792 5.27529589231837 A:G A G 10 0.522818519378046 0.644394137805038 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35828635 C/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 210 263 473 100.20811093061 137.501270596426 -37.2931596658158 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00064625460800633 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 32 35 67 15.2698073799025 18.2986481782316 -3.02884079832908 A:G A G 10 0.522818519378046 0.4660586533216 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36205601 C/T 1 51 42 93 24.3362555117197 21.9583778138779 2.37787769784172 T:C C T 10 0.522818519378046 0.678347556111756 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 8 16 24 3.81745184497563 8.36509631004874 -4.5476444650731 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0684079401452901 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36387378 C/G 1 16 3 19 7.63490368995126 1.56845555813414 6.06644813181713 C:G C G 10 0.522818519378046 0.00517594253847809 ENSG00000167604:ENST00000352614:exon_36387294_36387440:NFKBID;ENSG00000167604:ENST00000396901:exon_36387294_36387440:NFKBID HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36387881 A/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000167604:ENST00000352614:exon_36387815_36387960:NFKBID;ENSG00000167604:ENST00000396901:exon_36387815_36387960:NFKBID HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36394272 T/C 1 132 66 198 62.9879554420979 34.506022278951 28.4819331631469 T:C T C 10 0.522818519378046 4.60133767529851e-05 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394253_36394318:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394253_36394318:HCST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36394678 T/C 1 156 89 245 74.4403109770248 46.5308482246461 27.9094627523787 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.000413415647123342 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394674_36394805:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394674_36394805:HCST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36435564 G/A 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 A:G G A 10 0.522818519378046 0.414517478089946 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36435450_36436084:LRFN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36530343 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36583651 G/A 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 A:G G A 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36583591_36583713:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36583591_36583713:WDR62 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36594063 C/T 1 25 15 40 11.9295370155488 7.84227779067069 4.08725922487816 T:C C T 10 0.522818519378046 0.208951287825107 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594058_36594109:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594058_36594109:WDR62 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 20 12 32 9.54362961243908 6.27382223253655 3.26980737990253 A:G G A 10 0.522818519378046 0.290021356735681 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 37854574 A/G 1 25 11 36 11.9295370155488 5.75100371315851 6.17853330239034 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0449434028470236 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 38652993 C/T 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38652893_38653011:SIPA1L3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39220006 C/A 1 443 312 755 211.391395915526 163.11937804595 48.2720178695753 A:C C A 10 0.522818519378046 0.000462506207401994 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219914_39222223:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219914_39220072:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219914_39222223:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219914_39220460:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219914_39220061:ACTN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39340561 G/A 1 55 36 91 26.2449814342075 18.8214666976097 7.42351473659781 A:G G A 10 0.522818519378046 0.141433123107487 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39340340_39340617:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39340340_39340617:HNRNPL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39664389 C/T 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000130669:ENST00000358301:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000321944:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000360442:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000457838:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000435673:exon_39664216_39664650:PAK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39666006 G/A 1 11 7 18 5.24899628684149 3.65972963564632 1.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.488968467594439 ENSG00000130669:ENST00000358301:exon_39665952_39666078:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000321944:exon_39665952_39666078:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000360442:exon_39665952_39666078:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000457838:exon_39665952_39666078:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000435673:exon_39665952_39666078:PAK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39880011 G/A 1 76 65 141 36.2657925272685 33.983203759573 2.28258876769551 A:G G A 10 0.522818519378046 0.736296526211072 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000221266:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39879922_39880023:PAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39908214 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908195_39908332:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908195_39908332:PLEKHG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 A:G G A 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 39972581 G/C 1 37 39 76 17.6557147830123 20.3899222557438 -2.7342074727315 C:G G C 10 0.522818519378046 0.566776363068068 ENSG00000105197:ENST00000314349:exon_39972523_39972673:TIMM50 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 15 13 28 7.15772220932931 6.7966407519146 0.361081457414712 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 236 199 435 112.614829426781 104.040885356231 8.57394407054998 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.414988179245261 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 31 18 49 14.7926258992806 9.41073334880483 5.38189255047574 T:C T C 10 0.522818519378046 0.152235791165313 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41086309 G/C 1 54 55 109 25.7677999535855 28.7550185657925 -2.98721861220702 C:G G C 10 0.522818519378046 0.567014220083604 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41086230_41086391:SHKBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41089390 G/C 1 51 52 103 24.3362555117197 27.1865630076584 -2.85030749593874 C:G G C 10 0.522818519378046 0.62221280991793 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41089304_41089391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41089304_41089391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41089304_41089391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41089304_41089391:SHKBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 81 116 197 38.6516999303783 60.6469482478533 -21.9952483174751 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00208501663824796 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41128309 C/T 1 16 16 32 7.63490368995126 8.36509631004874 -0.730192620097473 T:C C T 10 0.522818519378046 0.860419838988144 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128306_41128572:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128306_41128572:LTBP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 16 22 38 7.63490368995126 11.502007426317 -3.86710373636575 T:C C T 10 0.522818519378046 0.255723585527227 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41135376 C/T 1 60 35 95 28.6308888373172 18.2986481782316 10.3322406590856 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0395043516567046 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41135301_41135455:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41135301_41135455:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41135301_41135455:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 38 38 76 18.1328962636343 19.8671037363657 -1.7342074727315 A:G G A 10 0.522818519378046 0.731138512699964 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41235120 A/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41235107_41235320:ITPKC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 184 199 383 87.8013924344395 104.040885356231 -16.2394929217916 A:G A G 10 0.522818519378046 0.101659595718300 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41292601 A/T 1 100 94 194 47.7181480621954 49.1449408215363 -1.42679275934093 A:T A T 10 0.522818519378046 0.88575535855948 ENSG00000167578:ENST00000357052:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000378307:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000419646:exon_41292570_41292665:RAB4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 17 10 27 8.11208517057322 5.22818519378046 2.88389997679276 T:C T C 10 0.522818519378046 0.336212248871896 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 12 16 28 5.72617776746345 8.36509631004874 -2.63891854258529 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348462366114306 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41898809 T/C 1 58 62 120 27.6765258760733 32.4147482014389 -4.73822232536552 T:C T C 10 0.522818519378046 0.411395775400704 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41898772_41898885:EXOSC5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 46 38 84 21.9503481086099 19.8671037363657 2.08324437224413 A:G G A 10 0.522818519378046 0.663885590291746 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41928603 A/G 1 138 109 247 65.8510443258296 56.987218612207 8.86382571362263 A:G A G 10 0.522818519378046 0.278950837300934 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 122 136 258 58.2161406358784 71.1033186354143 -12.8871779995359 T:C C T 10 0.522818519378046 0.119082251237099 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 173 189 362 82.552396147598 98.8127001624507 -16.2603040148527 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0922159530920885 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 8 27 35 3.81745184497563 14.1161000232072 -10.2986481782316 C:G C G 10 0.522818519378046 0.000533517725116409 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 22 12 34 10.497992573683 6.27382223253655 4.22417034114643 T:C T C 10 0.522818519378046 0.170754045624394 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 39 43 82 18.6100777442562 22.481196333256 -3.87111858899977 T:C C T 10 0.522818519378046 0.439359407797832 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 42410098 C/T 1 109 83 192 52.012781387793 43.3939371083778 8.61884427941516 T:C C T 10 0.522818519378046 0.220029795627809 ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42410091_42410177:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42410091_42410177:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42410091_42410177:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42410091_42410177:ARHGEF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 104 129 233 49.6268739846832 67.4435889997679 -17.8167150150847 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0215584499430421 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 42799049 C/T 1 22 30 52 10.497992573683 15.6845555813414 -5.18656300765839 T:C C T 10 0.522818519378046 0.165970783643602 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42798976_42799949:CIC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 12 20 32 5.72617776746345 10.4563703875609 -4.73019262009747 T:G G T 10 0.522818519378046 0.111400060717305 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 21 36 57 10.020811093061 18.8214666976097 -8.80065560454863 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0235657750412559 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44098963 C/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44352665 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000159882:ENST00000324461:exon_44351091_44353307:ZNF230 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 A:G A G 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 T:C C T 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44500761 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44501227 A/G 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44536615 G/A 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:T A T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 A:G A G 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 91 86 177 43.4235147365978 44.962392666512 -1.53887792991415 T:C T C 10 0.522818519378046 0.821871180710473 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 53 63 116 25.2906184729636 32.9375667208169 -7.64694824785333 T:C C T 10 0.522818519378046 0.163846327402991 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 22 24 46 10.497992573683 12.5476444650731 -2.04965189139012 T:C T C 10 0.522818519378046 0.558556386350767 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 45912070 A/G 1 21 23 44 10.020811093061 12.0248259456951 -2.00401485263403 A:G A G 10 0.522818519378046 0.550647233196772 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 45923617 A/G 1 56 60 116 26.7221629148294 31.3691111626828 -4.64694824785334 A:G A G 10 0.522818519378046 0.403886983373471 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46124821 C/T 1 79 60 139 37.6973369691344 31.3691111626828 6.3282258064516 T:C C T 10 0.522818519378046 0.308487890012841 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124741_46124895:EML2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 85 39 124 40.5604258528661 20.3899222557438 20.1705035971223 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000292314513635922 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46269016 G/A 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46280838 G/C 1 14 5 19 6.68054072870736 2.61409259689023 4.06644813181713 C:G G C 10 0.522818519378046 0.06875229877064 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46280600_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46280600_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46280585_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46280600_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46280585_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46280585_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46280585_46280848:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46280585_46280848:DMPK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46289173 T/C 1 17 18 35 8.11208517057322 9.41073334880483 -1.29864817823161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.736066735208448 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46289503 C/T 1 12 8 20 5.72617776746345 4.18254815502437 1.54362961243908 T:C C T 10 0.522818519378046 0.512380593640314 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 102 84 186 48.6725110234393 43.9167556277559 4.75575539568344 T:C C T 10 0.522818519378046 0.509292365829492 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 28 58 86 13.3610814574147 30.3234741239267 -16.962392666512 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00031363046676889 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 32 26 58 15.2698073799025 13.5932815038292 1.67652587607333 C:G C G 10 0.522818519378046 0.694881123038769 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46509917 C/T 1 21 15 36 10.020811093061 7.84227779067069 2.17853330239034 T:C C T 10 0.522818519378046 0.507838482306921 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46509817_46509974:CCDC61 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 16 16 32 7.63490368995126 8.36509631004874 -0.730192620097473 A:G G A 10 0.522818519378046 0.860419838988144 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 46878989 G/A 1 62 74 136 29.5852517985611 38.6885704339754 -9.10331863541426 A:G G A 10 0.522818519378046 0.122850631255873 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467902:exon_46878860_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527193:exon_46878884_46879008:PPP5C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 T:G T G 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 183 183 366 87.3242109538176 95.6757890461824 -8.35157809236483 C:G C G 10 0.522818519378046 0.402552516233813 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 47278938 G/A 1 180 160 340 85.8926665119517 83.6509631004874 2.24170341146436 A:G G A 10 0.522818519378046 0.828204031392219 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 47761646 G/C 1 27 22 49 12.8838999767928 11.502007426317 1.38189255047575 C:G G C 10 0.522818519378046 0.775393107758841 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47761587_47761660:CCDC9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 47883086 T/G 1 14 6 20 6.68054072870736 3.13691111626828 3.54362961243908 T:G T G 10 0.522818519378046 0.122855061020348 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47882967_47883242:DHX34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 47885413 C/T 1 17 19 36 8.11208517057322 9.93355186818287 -1.82146669760966 T:C C T 10 0.522818519378046 0.617821696739092 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47885237_47885961:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47885237_47885961:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47885237_47885949:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47885237_47885536:DHX34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48248834 T/C 1 531 458 989 253.383366210258 239.450881875145 13.9324843351125 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.390111780133555 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48248907 G/C 1 994 780 1774 474.318391738222 407.798445114876 66.5199466233464 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.00156844760961741 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48254799 T/C 1 884 682 1566 421.828428869807 356.562230215827 65.2661986539799 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00100146265402578 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 512 640 1152 244.31691807844 334.603852401949 -90.286934323509 A:C:G A G 10 0.522818519378046 1.05003216319456e-07 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48259200 A/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48259220 C/T 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.309360911266949 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48259787 C/T 1 1405 1363 2768 670.439980273845 712.601641912277 -42.1616616384314 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.109995978849329 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000422743:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000325566:exon_48259785_48259861:GLTSCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48598823 A/G 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48598721_48598861:PLA2G4C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 57 53 110 27.1993443954514 27.7093815270364 -0.510037131585062 C:G C G 10 0.522818519378046 0.924316764445264 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 53 53 106 25.2906184729636 27.7093815270364 -2.41876305407288 A:G A G 10 0.522818519378046 0.697547888113661 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 22 30 52 10.497992573683 15.6845555813414 -5.18656300765839 T:C:G G T 10 0.522818519378046 0.165970783643602 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 5 10 15 2.38590740310977 5.22818519378046 -2.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.195994901009809 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 14 11 25 6.68054072870736 5.75100371315851 0.929537015548849 T:G G T 10 0.522818519378046 0.841950225699242 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49132575 C/T 1 21 19 40 10.020811093061 9.93355186818287 0.0872592248781583 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49132118_49133030:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131938_49132983:SPHK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49339098 T/C 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000087076:ENST00000263278:exon_49339062_49339100:HSD17B14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 187 197 384 89.2329368763054 102.995248317475 -13.7623114411697 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.167842571160585 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 189 176 365 90.1872998375493 92.0160594105361 -1.8287595729868 A:G G A 10 0.522818519378046 0.875136797580593 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 178 166 344 84.9383035507078 86.7878742167556 -1.84957066604782 C:G G C 10 0.522818519378046 0.871412584785435 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49377873 G/A 1 307 244 551 146.49471455094 127.567718728243 18.9269958226966 A:G G A 10 0.522818519378046 0.114514737341973 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49377918 G/T 1 287 277 564 136.951084938501 144.820729867719 -7.86964492921794 A:T:G G T 10 0.522818519378046 0.527262864039535 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 235 282 517 112.137647946159 147.434822464609 -35.2971745184498 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.00203347559064648 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 202 199 401 96.3906590856347 104.040885356231 -7.65022627059645 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.453635628834431 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 198 187 385 94.4819331631469 97.7670631236946 -3.28512996054772 C:G G C 10 0.522818519378046 0.759613446961236 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49407660 G/A 1 60 81 141 28.6308888373172 42.3483000696217 -13.7174112323045 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0226695874488392 ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000443560:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000411700:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000451312:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49407604_49407711:NUCB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49459554 C/T 1 369 287 656 176.079966349501 150.048915061499 26.0310512880018 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0421665961917005 ENSG00000087088:ENST00000502487:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000345358:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000391871:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000513545:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000515540:exon_49459455_49459573:BAX;ENSG00000087088:ENST00000356483:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000415969:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000354470:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000506183:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000293288:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000503726:exon_49459455_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000513217:exon_49459110_49459590:BAX;ENSG00000087088:ENST00000507757:exon_49459501_49459590:BAX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49470018 G/A 1 4208 3816 8024 2007.97967045718 1995.07546994662 12.9042005105587 A:T:C:G G A 10 0.522818519378046 0.779955026404385 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469840_49470135:FTL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49481243 T/C 1 32 30 62 15.2698073799025 15.6845555813414 -0.414748201438853 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49481181_49481259:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000472004:exon_49481181_49481243:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000496048:exon_49481181_49481259:GYS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49842610 G/A 1 456 587 1043 217.594755163611 306.894470874913 -89.299715711302 A:G G A 10 0.522818519378046 3.22650281400013e-08 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49842587_49842670:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49842587_49842670:CD37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:T A T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49949652 G/A 1 60 45 105 28.6308888373172 23.5268333720121 5.10405546530517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.330188204475454 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 A:T A T 10 0.522818519378046 0.414517478089946 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 22 18 40 10.497992573683 9.41073334880483 1.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.754272363653691 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 T:G T G 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 12 20 32 5.72617776746345 10.4563703875609 -4.73019262009747 T:C C T 10 0.522818519378046 0.111400060717305 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 10 25 35 4.77181480621954 13.0704629844512 -8.29864817823161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00610693035960106 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 A:T T A 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 10 12 22 4.77181480621954 6.27382223253655 -1.50200742631701 T:C T C 10 0.522818519378046 0.531402320360827 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50017724 C/T 1 15 28 43 7.15772220932931 14.6389185425853 -7.48119633325598 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0313619231456883 ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017697_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017468_50017743:FCGRT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50059982 C/G 1 236 220 456 112.614829426781 115.02007426317 -2.40524483638899 C:G C G 10 0.522818519378046 0.851287936994982 ENSG00000142546:ENST00000339093:exon_50059806_50059993:NOSIP;ENSG00000142546:ENST00000391853:exon_50059806_50059993:NOSIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 225 210 435 107.36583313994 109.79188906939 -2.42605592945003 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0.847783105267008 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 172 57 229 82.0752146669761 29.8006556045486 52.2745590624275 A:T:G G A 10 0.522818519378046 1.58425082673411e-12 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 47 34 81 22.4275295892318 17.7758296588536 4.65169993037827 A:G G A 10 0.522818519378046 0.318386818914184 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50926126 C/T 1 51 31 82 24.3362555117197 16.2073741007194 8.12888141100023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0772864468224092 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 90 71 161 42.9463332559759 37.1201148758413 5.82621838013459 T:C C T 10 0.522818519378046 0.385765611022698 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 51301687 C/T 1 266 287 553 126.93027384544 150.048915061499 -23.1186412160594 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0502379175267425 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 201 143 344 95.9134776050127 74.7630482710606 21.1504293339522 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0233494457375213 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 51323378 C/T 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 T:C C T 10 0.522818519378046 0.370821073431422 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 51323676 C/T 1 162 120 282 77.3033998607565 62.7382223253655 14.565177535391 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0840918242943957 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 0 0 10 10 0 5.22818519378046 -5.22818519378046 C T C 10 0.522818519378046 0.000612118920788434 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 0 10 0 10 4.77181480621954 0 4.77181480621954 C C 10 0.522818519378046 0.00213796114358887 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 53454789 A/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:T A T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 54080067 T/C 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514374:exon_54079951_54080113:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000509047:exon_54079951_54080074:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511567:exon_54079951_54080129:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54079951_54080107:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000502616:exon_54079951_54080071:ZNF331 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 39 26 65 18.6100777442562 13.5932815038292 5.01679624042701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.217506857489735 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 58 54 112 27.6765258760733 28.2322000464145 -0.555674170341153 T:C C T 10 0.522818519378046 0.924933294888715 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 26 28 54 12.4067184961708 14.6389185425853 -2.23220004641449 T:C C T 10 0.522818519378046 0.587079192272264 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 4 12 16 1.90872592248782 6.27382223253655 -4.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.042319693166473 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55485899 G/A 0 0 26 26 0 13.5932815038292 -13.5932815038292 A G A 10 0.522818519378046 4.42357189478494e-09 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55485868_55485912:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55485868_55485912:NLRP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 0 66 0 66 31.493977721049 0 31.493977721049 C C 10 0.522818519378046 3.03258593307349e-19 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55505673 C/T 0 0 76 76 0 39.7342074727315 -39.7342074727315 T C T 10 0.522818519378046 3.8014747443308e-25 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55505637_55505807:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55505637_55505807:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55505637_55505807:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55505637_55505807:NLRP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 0 120 1 121 57.2617776746345 0.522818519378046 56.7389591552564 T:C C T 10 0.522818519378046 9.79076733999517e-33 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 0 116 1 117 55.3530517521467 0.522818519378046 54.8302332327686 T:C T C 10 0.522818519378046 1.29047641312005e-31 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 20 18 38 9.54362961243908 9.41073334880483 0.132896263634251 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 13 10 23 6.2033592480854 5.22818519378046 0.975174054304942 T:C C T 10 0.522818519378046 0.835285176690354 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 16 15 31 7.63490368995126 7.84227779067069 -0.207374100719426 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 45 50 95 21.4731666279879 26.1409259689023 -4.66775934091437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.356379600357284 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 58 35 93 27.6765258760733 18.2986481782316 9.37787769784172 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0611900089036575 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 343 295 638 163.67324785333 154.231463216524 9.44178463680666 T:C C T 10 0.522818519378046 0.475652946689104 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 56733425 C/A 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000131848:ENST00000254165:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A;ENSG00000131848:ENST00000391713:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 7 12 19 3.34027036435368 6.27382223253655 -2.93355186818287 A:G A G 10 0.522818519378046 0.250439240184576 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 3 8 11 1.43154444186586 4.18254815502437 -2.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.131842010035085 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 8 12 20 3.81745184497563 6.27382223253655 -2.45637038756092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.371143970102355 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 24 47 71 11.4523555349269 24.5724704107682 -13.1201148758413 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00190660300607176 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 0 0 11 11 0 5.75100371315851 -5.75100371315851 C T C 10 0.522818519378046 0.000292091812938538 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.177905026249726 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 15 18 33 7.15772220932931 9.41073334880483 -2.25301113947552 A:G G A 10 0.522818519378046 0.487734378265704 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 17 24 41 8.11208517057322 12.5476444650731 -4.43555929449989 A:G G A 10 0.522818519378046 0.210598057141154 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 9 27 36 4.29463332559759 14.1161000232072 -9.82146669760966 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00122590368005873 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:C A C 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 58991638 C/T 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 59028162 G/C 1 25 15 40 11.9295370155488 7.84227779067069 4.08725922487816 C:G G C 10 0.522818519378046 0.208951287825107 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 59067585 G/A 1 184 222 406 87.8013924344395 116.065711301926 -28.2643188674867 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00535286939796796 ENSG00000130725:ENST00000253023:exon_59067080_59067596:UBE2M HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 7 16 23 3.34027036435368 8.36509631004874 -5.02482594569506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0384771796280866 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 57 42 99 27.1993443954514 21.9583778138779 5.24096658157344 T:C T C 10 0.522818519378046 0.315106114317185 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 67 39 106 31.9711592016709 20.3899222557438 11.5812369459271 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0253204968682059 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 43 65 108 20.518803666744 33.983203759573 -13.464400092829 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0119129474332111 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3482912 G/A 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.124191345419258 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 110 87 197 52.4899628684149 45.48521118589 7.00475168252493 T:C C T 10 0.522818519378046 0.353862984822962 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 65 81 146 31.016796240427 42.3483000696217 -11.3315038291947 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0681010923378836 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 44 57 101 20.995985147366 29.8006556045486 -8.80467045718265 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0901347059814124 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 10581757 A/G 1 176 185 361 83.9839405894639 96.7214260849385 -12.7374854954746 A:G A G 10 0.522818519378046 0.187865358066295 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10581635_10581849:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10581635_10581849:ODC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 57 50 107 27.1993443954514 26.1409259689023 1.05841842654907 T:C C T 10 0.522818519378046 0.84724965492952 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 48 52 100 22.9047110698538 27.1865630076584 -4.2818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.423738551744136 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 9 15 24 4.29463332559759 7.84227779067069 -3.5476444650731 A:G A G 10 0.522818519378046 0.157963972015285 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 190 185 375 90.6644813181713 96.7214260849385 -6.05694476676726 T:C C T 10 0.522818519378046 0.535490116044199 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 42 33 75 20.0416221861221 17.2530111394755 2.78861104664655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.564145829485498 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 15326875 C/A 1 42 30 72 20.0416221861221 15.6845555813414 4.35706660478069 A:C C A 10 0.522818519378046 0.345681057083418 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15326866_15327004:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15326866_15327004:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15326866_15327004:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15326866_15327004:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000433283:exon_15326866_15327004:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000423602:exon_15326866_15327004:NBAS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 14 7 21 6.68054072870736 3.65972963564632 3.02081109306103 T:C C T 10 0.522818519378046 0.198910466352987 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 17897488 T/C 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C T C 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17897353_17897531:SMC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 20403957 C/T 1 112 21 133 53.4443258296588 10.979188906939 42.4651369227199 T:C C T 10 0.522818519378046 1.70056436667166e-14 ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000447124:exon_20403913_20404052:SDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 A:G G A 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 25469502 C/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 26432662 G/T 1 67 110 177 31.9711592016709 57.5100371315851 -25.5388779299141 T:G G T 10 0.522818519378046 0.000153030497235192 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26432649_26432758:HADHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 26505745 G/A 1 66 47 113 31.493977721049 24.5724704107682 6.9215073102808 A:G G A 10 0.522818519378046 0.220768070802271 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26505713_26505792:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26505713_26505792:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26505713_26505792:HADHB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 24 22 46 11.4523555349269 11.502007426317 -0.0496518913901181 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 18 25 43 8.58926665119517 13.0704629844512 -4.48119633325598 A:G A G 10 0.522818519378046 0.221559769802681 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 29 23 52 13.8382629380367 12.0248259456951 1.81343699234161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.677990224551658 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 28 17 45 13.3610814574147 8.88791482942678 4.47316662798793 A:G A G 10 0.522818519378046 0.232226545545648 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27676287 A/T 0 10 0 10 4.77181480621954 0 4.77181480621954 A A 10 0.522818519378046 0.00213796114358887 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000425023:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000450564:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000443889:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000475909:exon_27676251_27676380:IFT172 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27865325 A/G 1 20 20 40 9.54362961243908 10.4563703875609 -0.91274077512184 A:G A G 10 0.522818519378046 0.874522810547516 ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27865296_27865386:ZNF512;ENSG00000198522:ENST00000515877:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000503738:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000424214:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000407583:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000461249:exon_27865296_27865386:GPN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27883958 C/T 1 32 19 51 15.2698073799025 9.93355186818287 5.33625551171965 T:C C T 10 0.522818519378046 0.160821191142671 ENSG00000119760:ENST00000337768:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000406540:exon_27883851_27885148:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000405491:exon_27883851_27884468:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000404798:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000464789:exon_27883629_27884468:SUPT7L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 27886820 G/T 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 T:G G T 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 9 12 21 4.29463332559759 6.27382223253655 -1.97918890693897 T:G G T 10 0.522818519378046 0.513308181962307 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 58 87 145 27.6765258760733 45.48521118589 -17.8086853098167 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00349859659962331 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 31178818 C/T 0 10 0 10 4.77181480621954 0 4.77181480621954 C C 10 0.522818519378046 0.00213796114358887 ENSG00000158089:ENST00000349752:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000324589:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000406653:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000356174:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000420311:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000430167:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000455477:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000464038:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000481023:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000424136:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000496397:exon_31178778_31178843:GALNT14;ENSG00000158089:ENST00000461193:exon_31178795_31178843:GALNT14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 11 18 29 5.24899628684149 9.41073334880483 -4.16173706196334 T:C C T 10 0.522818519378046 0.138636572935384 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 32 14 46 15.2698073799025 7.31945927129264 7.95034810860988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0257421761055829 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 44 55 99 20.995985147366 28.7550185657925 -7.75903341842656 A:G G A 10 0.522818519378046 0.131282052747615 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 42990025 C/T 1 57 50 107 27.1993443954514 26.1409259689023 1.05841842654907 T:C C T 10 0.522818519378046 0.84724965492952 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 32 19 51 15.2698073799025 9.93355186818287 5.33625551171965 T:G T G 10 0.522818519378046 0.160821191142671 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 29 30 59 13.8382629380367 15.6845555813414 -1.84629264330471 A:T T A 10 0.522818519378046 0.696337340396653 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 45169333 G/T 1 2 11 13 0.954362961243908 5.75100371315851 -4.7966407519146 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0100466661678204 ENSG00000138083:ENST00000260653:exon_45168902_45170049:SIX3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 13 17 30 6.2033592480854 8.88791482942678 -2.68455558134138 A:G G A 10 0.522818519378046 0.363906038877937 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 48010558 C/A 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 48018081 A/G 1 4 10 14 1.90872592248782 5.22818519378046 -3.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.106723132817195 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48018066_48018262:MSH6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 4 13 17 1.90872592248782 6.7966407519146 -4.88791482942678 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0260795252789011 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 18 19 37 8.58926665119517 9.93355186818287 -1.3442852169877 A:G A G 10 0.522818519378046 0.742800814192079 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54093956 G/A 1 56 29 85 26.7221629148294 15.1617370619633 11.5604258528661 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0124148795898672 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 20 25 45 9.54362961243908 13.0704629844512 -3.52683337201207 A:G A G 10 0.522818519378046 0.300641388123278 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:T A T 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54849508 A/G 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54849437_54849624:SPTBN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54858214 A/G 1 74 73 147 35.3114295660246 38.1657519145974 -2.85432234857277 A:G A G 10 0.522818519378046 0.679941836270168 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 46 55 101 21.9503481086099 28.7550185657925 -6.80467045718265 T:C C T 10 0.522818519378046 0.195409447547475 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 168 155 323 80.1664887444883 81.0368705035971 -0.870381759108867 A:G G A 10 0.522818519378046 0.95559567938861 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 33 19 52 15.7469888605245 9.93355186818287 5.81343699234161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.126484131026525 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 9 15 24 4.29463332559759 7.84227779067069 -3.5476444650731 T:G G T 10 0.522818519378046 0.157963972015285 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 42 46 88 20.0416221861221 24.0496518913901 -4.00802970526805 A:G A G 10 0.522818519378046 0.395813390728685 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 15 32 47 7.15772220932931 16.7301926200975 -9.57247041076816 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00539522128461491 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 A:G A G 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 61121570 A/G 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000162924:ENST00000295025:exon_61121532_61121680:REL;ENSG00000162924:ENST00000394479:exon_61121532_61121680:REL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 62 96 158 29.5852517985611 50.1905778602924 -20.6053260617313 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00106211411437336 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 5 13 18 2.38590740310977 6.7966407519146 -4.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0562237849586215 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 64780404 G/A 1 30 36 66 14.3154444186586 18.8214666976097 -4.50602227895104 A:G G A 10 0.522818519378046 0.270646605515701 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409183:exon_64779646_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000487769:exon_64780010_64780543:AFTPH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 65480917 A/G 1 12 11 23 5.72617776746345 5.75100371315851 -0.024825945695059 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65480862_65480998:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65480862_65480998:ACTR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 23 27 50 10.9751740543049 14.1161000232072 -3.1409259689023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.398075894512748 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 72 64 136 34.3570666047807 33.4603852401949 0.896681364585739 T:G G T 10 0.522818519378046 0.931652135781878 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 39 28 67 18.6100777442562 14.6389185425853 3.97115920167092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.392149075528781 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 15 15 30 7.15772220932931 7.84227779067069 -0.68455558134138 A:T A T 10 0.522818519378046 0.856180537932261 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 70529072 G/A 1 64 52 116 30.5396147598051 27.1865630076584 3.35305175214666 A:G G A 10 0.522818519378046 0.577445127817404 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70529057_70529222:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70529057_70529188:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70529057_70529188:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70528736_70529177:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70528802_70529126:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000498665:exon_70529057_70529144:FAM136A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 71417065 G/T 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 44 36 80 20.995985147366 18.8214666976097 2.17451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.65562196085714 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 73455600 C/T 1 24 20 44 11.4523555349269 10.4563703875609 0.995985147365975 T:C C T 10 0.522818519378046 0.88027403647098 ENSG00000135617:ENST00000258083:exon_73455134_73455702:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000480093:exon_73455459_73455702:C2orf7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 73786220 C/T 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73786099_73786269:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73786099_73786269:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73786099_73786269:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73786099_73786269:ALMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 73800058 G/A 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73799389_73800707:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73799389_73800551:ALMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 73829372 C/T 1 9 17 26 4.29463332559759 8.88791482942678 -4.5932815038292 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0790579932984927 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 167 190 357 79.6893072638663 99.3355186818287 -19.6462114179624 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0387998312978443 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 C:G C G 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 75185856 G/T 1 57 97 154 27.1993443954514 50.7133963796705 -23.5140519842191 T:G G T 10 0.522818519378046 0.000186253566630395 ENSG00000115350:ENST00000483063:exon_75185619_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000393918:exon_75185775_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000485527:exon_75185832_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000459636:exon_75185833_75186019:POLE4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 A:G G A 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 65 51 116 31.016796240427 26.6637444882803 4.35305175214666 C:G C G 10 0.522818519378046 0.457503383658743 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 317 362 679 151.266529357159 189.260304014853 -37.9937746576933 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00392884020937955 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 32 28 60 15.2698073799025 14.6389185425853 0.630888837317238 A:G A G 10 0.522818519378046 0.89783128296467 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 19 13 32 9.06644813181713 6.7966407519146 2.26980737990253 C:G C G 10 0.522818519378046 0.481344541657888 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 96919642 C/T 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 T:C C T 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96919538_96919853:TMEM127 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 97031698 C/T 1 44 39 83 20.995985147366 20.3899222557438 0.60606289162218 T:C C T 10 0.522818519378046 0.91295425133117 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97031614_97031796:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97031614_97031796:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97031614_97031771:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97031614_97031796:NCAPH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 97751457 C/T 1 45 22 67 21.4731666279879 11.502007426317 9.97115920167092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0194525178207559 ENSG00000144199:ENST00000414820:exon_97751436_97751598:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000272610:exon_97751436_97751598:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000463096:exon_97751436_97751935:FAHD2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 41 50 91 19.5644407055001 26.1409259689023 -6.57648526340219 C:G G C 10 0.522818519378046 0.173795609512225 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 98277090 T/C 1 20 13 33 9.54362961243908 6.7966407519146 2.74698886052448 T:C T C 10 0.522818519378046 0.386012599657573 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98277034_98277109:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98277034_98277109:ACTR1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 98373842 A/T 1 26 17 43 12.4067184961708 8.88791482942678 3.51880366674402 A:T A T 10 0.522818519378046 0.290616343942490 ENSG00000075568:ENST00000485245:exon_98372799_98373846:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98372803_98373846:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98372803_98373846:TMEM131 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 15 15 30 7.15772220932931 7.84227779067069 -0.68455558134138 T:C T C 10 0.522818519378046 0.856180537932261 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 T:C T C 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 33 26 59 15.7469888605245 13.5932815038292 2.15370735669529 A:G G A 10 0.522818519378046 0.604184221581591 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 99993019 A/G 1 300 314 614 143.154444186586 164.165015084706 -21.0105708981202 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0899116934676638 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99992810_99993099:EIF5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 233 174 407 111.183284984915 90.97042237178 20.2128626131353 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0471189754528722 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 72 84 156 34.3570666047807 43.9167556277559 -9.55968902297518 T:C T C 10 0.522818519378046 0.128465594147148 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 60 4 64 28.6308888373172 2.09127407751218 26.5396147598051 T:C C T 10 0.522818519378046 8.36460432963804e-13 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 105716194 G/A 1 101 102 203 48.1953295428174 53.3274889765607 -5.13215943374334 A:G G A 10 0.522818519378046 0.482923628741232 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105716128_105716418:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105716128_105716358:MRPS9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 3 11 14 1.43154444186586 5.75100371315851 -4.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0293923794731207 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 13 14 27 6.2033592480854 7.31945927129264 -1.11610002320724 T:C T C 10 0.522818519378046 0.703496842234386 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 10 20 30 4.77181480621954 10.4563703875609 -5.68455558134138 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0440617368713981 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 16 19 35 7.63490368995126 9.93355186818287 -2.29864817823161 A:G A G 10 0.522818519378046 0.499901817369517 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 72 69 141 34.3570666047807 36.0744778370852 -1.71741123230449 C:G C G 10 0.522818519378046 0.8006337914271 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 121036333 G/A 1 14 10 24 6.68054072870736 5.22818519378046 1.4523555349269 A:G G A 10 0.522818519378046 0.683818962617994 ENSG00000144118:ENST00000447591:exon_121036194_121036354:RALB;ENSG00000144118:ENST00000272519:exon_121036194_121036354:RALB;ENSG00000144118:ENST00000420510:exon_121036191_121036354:RALB;ENSG00000144118:ENST00000431732:exon_121036194_121036354:RALB;ENSG00000144118:ENST00000412383:exon_121036194_121036354:RALB;ENSG00000144118:ENST00000449649:exon_121036191_121036354:RALB;ENSG00000144118:ENST00000404963:exon_121036241_121036344:RALB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 122125213 G/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000074054:ENST00000429969:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000442289:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000263710:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000455322:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000397587:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000376194:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000409078:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000452274:exon_122125164_122125407:CLASP1;ENSG00000074054:ENST00000472776:exon_122125164_122125407:CLASP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 329 304 633 156.992707124623 158.936829890926 -1.94412276630314 A:T:C A C 10 0.522818519378046 0.904999773466986 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 127808076 G/A 1 66 19 85 31.493977721049 9.93355186818287 21.5604258528661 A:G G A 10 0.522818519378046 1.89615198584158e-06 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000462958:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127807958_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127807984_127808098:BIN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 18 46 64 8.58926665119517 24.0496518913901 -15.4603852401949 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000132618616494457 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 128767929 A/G 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G A G 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128767843_128767967:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128767843_128767967:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128767843_128767967:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000424298:exon_128767925_128767967:SAP130 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 8 15 23 3.81745184497563 7.84227779067069 -4.02482594569506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0993443127486353 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 132241704 C/T 1 377 173 550 179.897418194477 90.447603852402 89.4498143420747 T:C C T 10 0.522818519378046 1.26435177744050e-14 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 132241731 T/C 1 565 247 812 269.607536551404 129.136174286377 140.471362265027 T:C T C 10 0.522818519378046 1.40503238192050e-23 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 133539566 G/A 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000176771:ENST00000317721:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000409261:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000473859:exon_133539513_133539596:NCKAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 33 16 49 15.7469888605245 8.36509631004874 7.38189255047575 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0442628672815834 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 49 34 83 23.3818925504757 17.7758296588536 5.60606289162218 T:C T C 10 0.522818519378046 0.228423481956153 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 136511817 A/G 1 38 27 65 18.1328962636343 14.1161000232072 4.01679624042701 A:G A G 10 0.522818519378046 0.324263796434002 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136511109_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000470687:exon_136511729_136511847:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136511722_136511847:UBXN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 148695747 C/T 1 38 12 50 18.1328962636343 6.27382223253655 11.8590740310977 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000926797829140416 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148695715_148695782:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148695715_148695782:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148695715_148695782:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000488761:exon_148695715_148695749:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000481488:exon_148695546_148695782:ORC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 6 13 19 2.86308888373172 6.7966407519146 -3.93355186818287 T:C T C 10 0.522818519378046 0.105605407671991 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 152318938 T/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C T C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152318926_152318980:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152318926_152318980:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152318926_152318980:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152318926_152318980:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152318926_152318980:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152318926_152318980:RIF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 152321618 G/A 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 5 11 16 2.38590740310977 5.75100371315851 -3.36509631004874 T:G G T 10 0.522818519378046 0.131513831648772 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 160604372 A/G 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 178 141 319 84.9383035507078 73.7174112323045 11.2208923184033 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.217738094460409 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 138 123 261 65.8510443258296 64.3066778834997 1.54436644232999 T:C T C 10 0.522818519378046 0.852831665445776 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 163208893 T/G 1 25 35 60 11.9295370155488 18.2986481782316 -6.36911116268276 T:G T G 10 0.522818519378046 0.120415915931345 ENSG00000115271:ENST00000473240:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000446271:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000429691:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000437150:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000481161:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000453113:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000487445:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000479199:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000233612:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000421131:exon_163208848_163208917:GCA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 T:C T C 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 18 25 43 8.58926665119517 13.0704629844512 -4.48119633325598 T:C T C 10 0.522818519378046 0.221559769802681 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 185 241 426 88.2785739150615 125.999263170109 -37.7206892550476 A:T:C T A 10 0.522818519378046 0.000268273536346939 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 170917648 A/G 1 9 11 20 4.29463332559759 5.75100371315851 -1.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.65556110720683 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 26 33 59 12.4067184961708 17.2530111394755 -4.84629264330471 A:G G A 10 0.522818519378046 0.240900874462895 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 172604339 A/T 1 63 60 123 30.0624332791831 31.3691111626828 -1.30667788349966 A:T A T 10 0.522818519378046 0.856902781485957 ENSG00000077380:ENST00000340296:exon_172604286_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000534487:exon_172604286_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000263811:exon_172604286_172604919:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000409524:exon_172604289_172604399:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000397119:exon_172604286_172604919:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000410079:exon_172604286_172604499:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000358002:exon_172604286_172604499:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000508530:exon_172604289_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000534253:exon_172604289_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000409639:exon_172604289_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000409197:exon_172604286_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000532214:exon_172604286_172604921:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000409317:exon_172604286_172604521:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000409773:exon_172604286_172604926:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000409453:exon_172604289_172604930:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000482454:exon_172604286_172604919:DYNC1I2;ENSG00000077380:ENST00000479806:exon_172604286_172604917:DYNC1I2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 78 82 160 37.2201554885124 42.8711185889998 -5.65096310048736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.384723374272783 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 74 78 152 35.3114295660246 40.7798445114876 -5.468414945463 A:T A T 10 0.522818519378046 0.416906768244031 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:G T G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 11 19 30 5.24899628684149 9.93355186818287 -4.68455558134138 A:G A G 10 0.522818519378046 0.100619640257377 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 185801747 G/A 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 185802243 C/A 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:C C A 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 185803364 C/G 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 13 10 23 6.2033592480854 5.22818519378046 0.975174054304942 T:C T C 10 0.522818519378046 0.835285176690354 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 63 22 85 30.0624332791831 11.502007426317 18.5604258528661 T:C C T 10 0.522818519378046 4.69939989533407e-05 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 10 14 24 4.77181480621954 7.31945927129264 -2.5476444650731 T:C T C 10 0.522818519378046 0.314549779910552 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 191301368 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000151690:ENST00000392328:exon_191300703_191302287:MFSD6;ENSG00000151690:ENST00000281416:exon_191300638_191302287:MFSD6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 6 13 19 2.86308888373172 6.7966407519146 -3.93355186818287 A:T T A 10 0.522818519378046 0.105605407671991 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 151 166 317 72.0544035739151 86.7878742167556 -14.7334706428406 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.102996175105900 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 28 24 52 13.3610814574147 12.5476444650731 0.813436992341606 C:G C G 10 0.522818519378046 0.889951170191144 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 14 17 31 6.68054072870736 8.88791482942678 -2.20737410071943 A:G G A 10 0.522818519378046 0.474760861326864 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 A:C C A 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 8 14 22 3.81745184497563 7.31945927129264 -3.50200742631701 T:C T C 10 0.522818519378046 0.142061348999446 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 201438086 C/T 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 201438497 A/G 1 16 13 29 7.63490368995126 6.7966407519146 0.838262938036666 A:G A G 10 0.522818519378046 0.85328807174994 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 207003230 C/T 1 16 17 33 7.63490368995126 8.88791482942678 -1.25301113947552 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728839376751847 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207003209_207003338:NDUFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:G A G 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 13 19 32 6.2033592480854 9.93355186818287 -3.73019262009747 A:C C A 10 0.522818519378046 0.216750311379198 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 217279850 T/C 1 8 19 27 3.81745184497563 9.93355186818287 -6.11610002320724 T:C T C 10 0.522818519378046 0.020587003967958 ENSG00000138375:ENST00000430374:exon_217279370_217279864:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217279370_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000427645:exon_217279731_217280238:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217279836_217280238:SMARCAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 217364013 C/T 1 3561 3075 6636 1699.24325249478 1607.66694708749 91.5763054072866 A:T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0245251663145652 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363993_217366183:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363993_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000456586:exon_217363993_217364121:RPL37A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 1 9 10 0.477181480621954 4.70536667440241 -4.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00884457321564113 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 26 27 53 12.4067184961708 14.1161000232072 -1.70938152703644 C:G G C 10 0.522818519378046 0.681183073555035 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 25 26 51 11.9295370155488 13.5932815038292 -1.66374448828035 A:C C A 10 0.522818519378046 0.675704133808493 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 60 41 101 28.6308888373172 21.4355592944999 7.19532954281735 T:C C T 10 0.522818519378046 0.163654175568587 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 219508372 A/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:T A T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 93 98 191 44.3778776978417 51.2362148990485 -6.85833720120679 A:G A G 10 0.522818519378046 0.346486021330406 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 78 92 170 37.2201554885124 48.0993037827802 -10.8791482942678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.106675615880035 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 53 51 104 25.2906184729636 26.6637444882803 -1.37312601531679 A:G A G 10 0.522818519378046 0.844510135817712 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 14 13 27 6.68054072870736 6.7966407519146 -0.116100023207243 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 49 48 97 23.3818925504757 25.0952889301462 -1.71339637967047 A:C C A 10 0.522818519378046 0.760940872207254 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 28 12 40 13.3610814574147 6.27382223253655 7.08725922487816 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0266566408041616 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220083279 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220082847_220083712:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220082847_220083673:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220083177_220083395:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220082847_220085174:ATG9A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220087441 T/C 1 23 24 47 10.9751740543049 12.5476444650731 -1.57247041076816 T:C T C 10 0.522818519378046 0.66401088053666 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220087367_220087460:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220087367_220087615:ATG9A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220100787 C/T 1 58 51 109 27.6765258760733 26.6637444882803 1.01278138779298 T:C C T 10 0.522818519378046 0.923671973083045 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220371035 C/G 1 81 92 173 38.6516999303783 48.0993037827802 -9.44760385240196 C:G C G 10 0.522818519378046 0.1705324178789 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220370976_220371144:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220370976_220371709:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000480034:exon_220370976_220371416:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000496536:exon_220370976_220371144:GMPPA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 223423362 A/G 1 25 21 46 11.9295370155488 10.979188906939 0.950348108609882 A:G A G 10 0.522818519378046 0.882899349665402 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 277 203 480 132.179270132281 106.132159433743 26.0471106985379 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0175011721929364 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 224824617 A/G 1 62 51 113 29.5852517985611 26.6637444882803 2.9215073102808 A:G A G 10 0.522818519378046 0.638000236593737 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 228197238 G/A 1 124 118 242 59.1705035971223 61.6925852866094 -2.52208168948714 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.748137080511967 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000530359:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000531278:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000452930:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000470090:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000534203:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228197135_228197304:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436791:exon_228197135_228197304:MFF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 76 99 175 36.2657925272685 51.7590334184266 -15.4932408911581 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0229246344719132 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 79 76 155 37.6973369691344 39.7342074727315 -2.03687050359714 A:G G A 10 0.522818519378046 0.748465460803078 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 T:G G T 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231222675 T/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 T:C T C 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 166 139 305 79.2121257832444 72.6717741935484 6.54035158969596 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.456908422192264 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 T:C T C 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 5 24 29 2.38590740310977 12.5476444650731 -10.1617370619633 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000130490734025386 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 17 33 50 8.11208517057322 17.2530111394755 -9.1409259689023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0105652307749309 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 16 32 48 7.63490368995126 16.7301926200975 -9.09528893014621 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00913991088760918 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 A:G A G 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 237489904 C/T 1 14 11 25 6.68054072870736 5.75100371315851 0.929537015548849 T:C C T 10 0.522818519378046 0.841950225699242 ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 11 28 39 5.24899628684149 14.6389185425853 -9.38992225574379 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00338401126064668 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 28 21 49 13.3610814574147 10.979188906939 2.38189255047574 T:C T C 10 0.522818519378046 0.568064336753713 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 26 12 38 12.4067184961708 6.27382223253655 6.13289626363425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0515033107875892 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 239353001 C/T 1 21 22 43 10.020811093061 11.502007426317 -1.48119633325598 T:C C T 10 0.522818519378046 0.651211501029653 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 106 122 228 50.5812369459271 63.7838593641216 -13.2026224181945 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0847803099907571 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 13 20 33 6.2033592480854 10.4563703875609 -4.25301113947552 A:G G A 10 0.522818519378046 0.163764779261074 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 94 48 142 44.8550591784637 25.0952889301462 19.7597702483175 A:C A C 10 0.522818519378046 0.00098789506651529 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 35 26 61 16.7013518217684 13.5932815038292 3.10807031793919 A:G G A 10 0.522818519378046 0.444649161483931 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 19 20 39 9.06644813181713 10.4563703875609 -1.38992225574379 A:G A G 10 0.522818519378046 0.749095693569684 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242065781 G/A 1 43 36 79 20.518803666744 18.8214666976097 1.69733696913436 A:G G A 10 0.522818519378046 0.736370055204806 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242066250 C/T 1 20 9 29 9.54362961243908 4.70536667440241 4.83826293803667 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0932207570937154 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 19 14 33 9.06644813181713 7.31945927129264 1.74698886052448 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.60345776447202 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242173247 G/A 1 328 278 606 156.515525644001 145.343548387097 11.1719772569041 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.371190332303907 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242173235_242173378:HDLBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242610172 A/G 1 71 51 122 33.8798851241587 26.6637444882803 7.21614063587839 A:G A G 10 0.522818519378046 0.204960314836481 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 51 55 106 24.3362555117197 28.7550185657925 -4.41876305407288 A:T T A 10 0.522818519378046 0.436842005991281 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 90 79 169 42.9463332559759 41.3026630308656 1.64367022511022 A:G A G 10 0.522818519378046 0.817694730921905 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 5 17 22 2.38590740310977 8.88791482942678 -6.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00875669172534432 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 30 21 51 14.3154444186586 10.979188906939 3.33625551171965 T:C T C 10 0.522818519378046 0.401168295758888 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 330317 C/T 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000125841:ENST00000246039:exon_330177_330476:NRSN2;ENSG00000125841:ENST00000382291:exon_330282_330476:NRSN2;ENSG00000125841:ENST00000382285:exon_330282_330476:NRSN2;ENSG00000125841:ENST00000470439:exon_330282_330476:NRSN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 330408 C/G 1 17 2 19 8.11208517057322 1.04563703875609 7.06644813181713 C:G C G 10 0.522818519378046 0.000894342567430172 ENSG00000125841:ENST00000246039:exon_330177_330476:NRSN2;ENSG00000125841:ENST00000382291:exon_330282_330476:NRSN2;ENSG00000125841:ENST00000382285:exon_330282_330476:NRSN2;ENSG00000125841:ENST00000470439:exon_330282_330476:NRSN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 826127 C/T 1 21 21 42 10.020811093061 10.979188906939 -0.958377813877934 T:C C T 10 0.522818519378046 0.877487670924755 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 77 66 143 36.7429740078905 34.506022278951 2.23695172893942 T:G T G 10 0.522818519378046 0.73815869517521 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 80 117 197 38.1745184497563 61.1697667672314 -22.9952483174751 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00127193917687478 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 250 210 460 119.295370155488 109.79188906939 9.50348108609883 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.400860656577509 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 682 692 1374 325.437769784173 361.790415409608 -36.3526456254353 A:T:C T C 10 0.522818519378046 0.0518121725327144 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 2639162 T/C 1 136 125 261 64.8966813645857 65.3523149222558 -0.455633557670012 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000101365:ENST00000474315:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000466494:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000469213:exon_2639041_2639296:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000492240:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380851:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380843:exon_2639041_2639483:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000488299:exon_2639041_2639483:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000435594:exon_2639043_2639483:IDH3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 2774910 G/A 1 190 208 398 90.6644813181713 108.746252030634 -18.0817707124623 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0709725822778086 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 10 16 26 4.77181480621954 8.36509631004874 -3.5932815038292 T:C C T 10 0.522818519378046 0.173401103832856 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 11 3 14 5.24899628684149 1.56845555813414 3.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0609433495022194 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 T:G T G 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 3128578 A/C 1 14 12 26 6.68054072870736 6.27382223253655 0.406718496170803 A:C A C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 3171285 G/A 1 58 37 95 27.6765258760733 19.3442852169877 8.33224065908563 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.100022751823006 ENSG00000198171:ENST00000354488:exon_3170996_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000496781:exon_3170996_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000470203:exon_3171166_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000449522:exon_3171167_3171465:DDRGK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 3766885 G/A 1 22 21 43 10.497992573683 10.979188906939 -0.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.880251142470216 ENSG00000125817:ENST00000379751:exon_3764500_3767337:CENPB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 C:G C G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 3846397 C/T 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3846330_3849280:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3846330_3848972:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3846330_3847950:MAVS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 11 13 24 5.24899628684149 6.7966407519146 -1.5476444650731 T:C T C 10 0.522818519378046 0.546956746198156 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5843952 G/A 1 21 21 42 10.020811093061 10.979188906939 -0.958377813877934 A:G G A 10 0.522818519378046 0.877487670924755 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 27 19 46 12.8838999767928 9.93355186818287 2.95034810860988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.461006999923715 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 27 19 46 12.8838999767928 9.93355186818287 2.95034810860988 A:G A G 10 0.522818519378046 0.461006999923715 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 16 32 48 7.63490368995126 16.7301926200975 -9.09528893014621 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00913991088760918 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 16 32 48 7.63490368995126 16.7301926200975 -9.09528893014621 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00913991088760918 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 38 42 80 18.1328962636343 21.9583778138779 -3.82548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 0.433837611995525 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 16359650 C/T 1 1 13 14 0.477181480621954 6.7966407519146 -6.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000632556360432099 ENSG00000089177:ENST00000354981:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000355755:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000358562:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000377997:exon_16359450_16360126:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000378003:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000408042:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000377980:exon_16359450_16360808:KIF16B;ENSG00000089177:ENST00000251847:exon_16359450_16360808:KIF16B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 17594801 G/A 1 62 68 130 29.5852517985611 35.5516593177071 -5.96640751914598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.334182635111836 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17594323_17594865:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17594323_17594865:RRBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 82 81 163 39.1288814110002 42.3483000696217 -3.2194186586215 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.638446730195063 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 17610535 C/T 1 39 51 90 18.6100777442562 26.6637444882803 -8.05366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.09222845929262 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17610468_17610606:RRBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 106 84 190 50.5812369459271 43.9167556277559 6.66448131817125 T:C C T 10 0.522818519378046 0.345767738401212 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 9 14 23 4.29463332559759 7.31945927129264 -3.02482594569506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.21807391097219 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 T:C T C 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:C A C 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 24939590 G/C 1 1 9 10 0.477181480621954 4.70536667440241 -4.22818519378046 C:G G C 10 0.522818519378046 0.00884457321564113 ENSG00000077984:ENST00000480798:exon_24939564_24939680:CST7;ENSG00000077984:ENST00000376835:exon_24939564_24939680:CST7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 24994289 C/T 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25011423 T/C 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C T C 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25011395_25011594:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25011395_25011594:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25011395_25011594:ACSS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25038484 G/T 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 T:G G T 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25038405_25038818:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25038405_25039616:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376726:exon_25038405_25039616:ACSS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:G A G 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 17 26 43 8.11208517057322 13.5932815038292 -5.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.125885328260334 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 59 67 126 28.1537073566953 35.0288407983291 -6.8751334416338 A:G A G 10 0.522818519378046 0.246304175501690 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 53 34 87 25.2906184729636 17.7758296588536 7.51478881411 A:G G A 10 0.522818519378046 0.108831975797753 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 30354417 G/A 1 23 17 40 10.9751740543049 8.88791482942678 2.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.531014279535613 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30354359_30354485:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30354359_30354485:TPX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 16 11 27 7.63490368995126 5.75100371315851 1.88389997679276 T:C T C 10 0.522818519378046 0.564684921071908 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 31023052 G/A 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 26 27 53 12.4067184961708 14.1161000232072 -1.70938152703644 T:C T C 10 0.522818519378046 0.681183073555035 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 31025163 A/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 32264675 C/T 1 54 54 108 25.7677999535855 28.2322000464145 -2.46440009282897 T:C C T 10 0.522818519378046 0.700203585271699 ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 32379263 T/C 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 62 37 99 29.5852517985611 19.3442852169877 10.2409665815734 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0439237088000059 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 34242725 T/C 1 42 27 69 20.0416221861221 14.1161000232072 5.92552216291482 T:C T C 10 0.522818519378046 0.184652764750128 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 37383640 T/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 23 26 49 10.9751740543049 13.5932815038292 -2.61810744952425 A:G G A 10 0.522818519378046 0.477323603996216 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 40049450 T/A 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 A:T T A 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 42343821 C/G 1 160 205 365 76.3490368995126 107.177796472499 -30.8287595729868 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0.00136423430415728 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42343774_42343923:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42343774_42343923:MYBL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 42679955 A/G 1 47 28 75 22.4275295892318 14.6389185425853 7.78861104664655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0826203924699662 ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000442881:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42679946_42680185:TOX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 43243186 G/T 1 22 16 38 10.497992573683 8.36509631004874 2.13289626363425 T:G G T 10 0.522818519378046 0.519796371885942 ENSG00000168734:ENST00000372894:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000372892:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000372891:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000372889:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000372887:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000372882:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000477390:exon_43243175_43243409:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000372886:exon_43243175_43243348:PKIG;ENSG00000168734:ENST00000349959:exon_43242949_43243348:PKIG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 43 81 124 20.518803666744 42.3483000696217 -21.8294964028777 T:C T C 10 0.522818519378046 9.66417037423297e-05 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 43255220 T/C 1 37 44 81 17.6557147830123 23.004014852634 -5.34830006962173 T:C T C 10 0.522818519378046 0.266133055633412 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43255097_43255240:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43255097_43255240:ADA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 147 102 249 70.1456776514272 53.3274889765607 16.8181886748665 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0361384283789426 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 31 21 52 14.7926258992806 10.979188906939 3.81343699234161 A:G G A 10 0.522818519378046 0.331997474612485 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 45 31 76 21.4731666279879 16.2073741007194 5.2657925272685 T:C T C 10 0.522818519378046 0.251454979088050 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44420637 G/A 1 16 10 26 7.63490368995126 5.22818519378046 2.4067184961708 A:G G A 10 0.522818519378046 0.433360460128227 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 21 16 37 10.020811093061 8.36509631004874 1.6557147830123 T:C T C 10 0.522818519378046 0.624603777022244 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44505973 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44512638 G/T 1 29 23 52 13.8382629380367 12.0248259456951 1.81343699234161 T:G G T 10 0.522818519378046 0.677990224551658 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44640225 A/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G A G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000100985:ENST00000372330:exon_44640213_44640386:MMP9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 27 19 46 12.8838999767928 9.93355186818287 2.95034810860988 T:G T G 10 0.522818519378046 0.461006999923715 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 44750850 C/G 1 3 13 16 1.43154444186586 6.7966407519146 -5.36509631004874 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0100988102621874 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 22 12 34 10.497992573683 6.27382223253655 4.22417034114643 T:C C T 10 0.522818519378046 0.170754045624394 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 33 30 63 15.7469888605245 15.6845555813414 0.0624332791831019 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 47865340 C/T 1 5 11 16 2.38590740310977 5.75100371315851 -3.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.131513831648772 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 48523326 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 48729677 C/G 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000244687:ENST00000396059:exon_48729644_48729709:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000371674:exon_48729644_48729710:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000493090:exon_48729644_48729683:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000467839:exon_48729644_48729683:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000472923:exon_48729644_48729704:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000432266:exon_48729644_48729682:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000470565:exon_48729644_48729702:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000490289:exon_48729644_48729683:UBE2V1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 16 10 26 7.63490368995126 5.22818519378046 2.4067184961708 T:C C T 10 0.522818519378046 0.433360460128227 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 39 40 79 18.6100777442562 20.9127407751218 -2.30266303086563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.652875873675362 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 50803444 C/T 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.124191345419258 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 50803573 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 54961463 T/C 1 31 20 51 14.7926258992806 10.4563703875609 4.33625551171965 T:C T C 10 0.522818519378046 0.262518725557312 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 5 12 17 2.38590740310977 6.27382223253655 -3.88791482942678 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0866776016309947 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 57287542 A/G 1 17 12 29 8.11208517057322 6.27382223253655 1.83826293803667 A:G A G 10 0.522818519378046 0.578732322657605 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57287535_57287635:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57287535_57287636:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57287535_57287816:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57287535_57287635:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57287535_57287635:NPEPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 57289017 C/T 1 32 14 46 15.2698073799025 7.31945927129264 7.95034810860988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0257421761055829 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57288973_57289149:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57288973_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57288968_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57288476_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57287877_57289149:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525068:exon_57288787_57289149:NPEPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 38 36 74 18.1328962636343 18.8214666976097 -0.688570433975407 A:C C A 10 0.522818519378046 0.907669412284231 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 60768615 G/A 1 31 9 40 14.7926258992806 4.70536667440241 10.0872592248782 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00133267586003110 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000472005:exon_60768587_60768680:GTPBP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 60775932 C/T 1 82 29 111 39.1288814110002 15.1617370619633 23.9671443490369 T:C C T 10 0.522818519378046 3.83659422074216e-06 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60775739_60777808:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60775739_60777823:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60775739_60777823:GTPBP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:C A C 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 2804 2414 5218 1338.01687166396 1262.0839057786 75.9329658853558 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.0363786656615066 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 60966374 G/C 1 4 11 15 1.90872592248782 5.75100371315851 -3.84227779067069 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0677330756934676 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 103 99 202 49.1496925040613 51.7590334184266 -2.6093409143653 C:G C G 10 0.522818519378046 0.725164131264644 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 11 8 19 5.24899628684149 4.18254815502437 1.06644813181713 A:G A G 10 0.522818519378046 0.65415663787627 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 17 21 38 8.11208517057322 10.979188906939 -2.86710373636575 T:C C T 10 0.522818519378046 0.417515893094028 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 61834713 C/T 1 21 20 41 10.020811093061 10.4563703875609 -0.435559294499887 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 11 15 26 5.24899628684149 7.84227779067069 -2.5932815038292 A:G A G 10 0.522818519378046 0.332042226548126 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62193019 C/T 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 T:C C T 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192954_62193098:RP4-697K14.7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62193445 G/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193425_62193556:RP4-697K14.7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 12 4 16 5.72617776746345 2.09127407751218 3.63490368995126 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0816762651460521 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62221766 C/T 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000447518:exon_62221638_62221772:GMEB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62327199 A/G 1 29 31 60 13.8382629380367 16.2073741007194 -2.36911116268276 A:G A G 10 0.522818519378046 0.605719746677596 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62327131_62327606:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62327131_62327333:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62327131_62327606:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62327131_62327207:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62327131_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62327131_62328544:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62327131_62327598:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62327131_62327601:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62327131_62327207:RTEL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62614448 A/G 1 115 73 188 54.8758702715247 38.1657519145974 16.7101183569274 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0158386548208823 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62614400_62614568:PRPF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62641605 G/A 1 106 146 252 50.5812369459271 76.3315038291947 -25.7502668832676 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00126538876858785 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62641553_62641671:PRPF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62664353 G/A 1 244 144 388 116.432281271757 75.2858667904386 41.1464144813181 A:G G A 10 0.522818519378046 2.90379737245949e-05 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62664194_62664453:PRPF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62670294 G/A 1 115 5 120 54.8758702715247 2.61409259689023 52.2617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 2.53257083620465e-26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 20 62703490 C/T 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000171703:ENST00000461072:exon_62703223_62703699:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000475236:exon_62703223_62703699:TCEA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 15399864 T/C 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.511900100712421 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 15889304 C/G 1 26 20 46 12.4067184961708 10.4563703875609 1.95034810860988 C:G C G 10 0.522818519378046 0.658469545429212 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 58 53 111 27.6765258760733 27.7093815270364 -0.0328556509631071 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 82 79 161 39.1288814110002 41.3026630308656 -2.17378161986541 T:C T C 10 0.522818519378046 0.752712787902003 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 33 61 94 15.7469888605245 31.8919296820608 -16.1449408215363 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00089518954735594 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 30433876 C/T 1 162 318 480 77.3033998607565 166.256289162219 -88.9528893014621 A:T:C C T 10 0.522818519378046 4.10978160822466e-16 ENSG00000156261:ENST00000389159:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000286788:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000470450:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000496121:exon_30433817_30433888:CCT8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C T C 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 34721475 C/A 1 8 12 20 3.81745184497563 6.27382223253655 -2.45637038756092 A:C C A 10 0.522818519378046 0.371143970102355 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721397_34721596:IFNAR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 83 38 121 39.6060628916222 19.8671037363657 19.7389591552564 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00034816340253369 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 19 22 41 9.06644813181713 11.502007426317 -2.43555929449989 A:G G A 10 0.522818519378046 0.532312669097316 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 25 15 40 11.9295370155488 7.84227779067069 4.08725922487816 T:C C T 10 0.522818519378046 0.208951287825107 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 37445039 G/A 1 150 192 342 71.5772220932931 100.381155720585 -28.8039336272917 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00199618712853310 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 37833751 G/A 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000159261:ENST00000399137:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000399135:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000399136:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000342108:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000399139:exon_37832919_37834074:CLDN14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 37833983 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000159261:ENST00000399137:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000399135:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000399136:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000342108:exon_37832919_37834074:CLDN14;ENSG00000159261:ENST00000399139:exon_37832919_37834074:CLDN14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 T:C T C 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 21 14 35 10.020811093061 7.31945927129264 2.70135182176839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.400562341047815 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 26 19 45 12.4067184961708 9.93355186818287 2.47316662798793 C:G G C 10 0.522818519378046 0.55110155824902 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 8 15 23 3.81745184497563 7.84227779067069 -4.02482594569506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0993443127486353 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 43161877 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000183421:ENST00000332512:exon_43159529_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000352483:exon_43159545_43162157:RIPK4;ENSG00000183421:ENST00000330470:exon_43161640_43162157:RIPK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 44283703 G/A 1 7 14 21 3.34027036435368 7.31945927129264 -3.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.124230594228541 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44283550_44283706:WDR4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 14 9 23 6.68054072870736 4.70536667440241 1.97517405430494 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0.532244732814475 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 37 37 74 17.6557147830123 19.3442852169877 -1.68857043397541 T:G T G 10 0.522818519378046 0.727859965994444 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 68 64 132 32.4483406822929 33.4603852401949 -1.01204455790207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.862192745204895 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 44485350 G/A 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44485313_44485382:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44485313_44485382:CBS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45107766 G/A 1 9 27 36 4.29463332559759 14.1161000232072 -9.82146669760966 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00122590368005873 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 124 125 249 59.1705035971223 65.3523149222558 -6.18181132513347 A:G G A 10 0.522818519378046 0.446891985761437 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45168923 G/A 1 94 109 203 44.8550591784637 56.987218612207 -12.1321594337433 A:G G A 10 0.522818519378046 0.091936329976125 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 63 59 122 30.0624332791831 30.8462926433047 -0.783859364121614 T:C T C 10 0.522818519378046 0.927879314161465 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 81 83 164 38.6516999303783 43.3939371083778 -4.74223717799955 A:G A G 10 0.522818519378046 0.482151403904348 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 9 10 19 4.29463332559759 5.22818519378046 -0.933551868182875 A:G G A 10 0.522818519378046 0.819186685477746 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 16 19 35 7.63490368995126 9.93355186818287 -2.29864817823161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.499901817369517 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 11 14 25 5.24899628684149 7.31945927129264 -2.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.430012309906698 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 45 37 82 21.4731666279879 19.3442852169877 2.12888141100023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.659812606883358 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 35 44 79 16.7013518217684 23.004014852634 -6.30266303086563 A:C C A 10 0.522818519378046 0.176542664903821 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 53 36 89 25.2906184729636 18.8214666976097 6.4691517753539 T:C T C 10 0.522818519378046 0.202657569618384 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 145 114 259 69.1913146901833 59.6013112090972 9.59000348108609 C:G C G 10 0.522818519378046 0.237857704710538 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 4 15 19 1.90872592248782 7.84227779067069 -5.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00956166682289738 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 80 82 162 38.1745184497563 42.8711185889998 -4.69660013924345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.479593020953115 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 81 64 145 38.6516999303783 33.4603852401949 5.19131469018333 A:G A G 10 0.522818519378046 0.406564991073691 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 72 101 173 34.3570666047807 52.8046704571826 -18.447603852402 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00598898073606494 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 47666564 G/A 1 22 22 44 10.497992573683 11.502007426317 -1.00401485263403 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.765494682420933 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47666221_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47666542_47666800:MCM3AP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 21 47966977 C/T 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:C C T 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47966828_47967118:DIP2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 24 31 55 11.4523555349269 16.2073741007194 -4.75501856579253 A:C:G C A 10 0.522818519378046 0.225022335592866 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 7 16 23 3.34027036435368 8.36509631004874 -5.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0384771796280866 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 18075417 G/A 1 147 131 278 70.1456776514272 68.489226038524 1.65645161290321 A:G G A 10 0.522818519378046 0.857238855191032 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18074902_18075502:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18074935_18075502:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18075175_18075502:ATP6V1E1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 18077334 G/A 1 131 113 244 62.510773961476 59.0784926897192 3.43228127175677 A:G G A 10 0.522818519378046 0.700700908610179 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000473248:exon_18077295_18078058:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18077305_18077382:ATP6V1E1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 36 50 86 17.1785333023903 26.1409259689023 -8.96239266651196 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0658753912878263 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/C 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 T:C T C 10 0.522818519378046 0.414517478089946 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 19122665 C/T 1 21 33 54 10.020811093061 17.2530111394755 -7.23220004641449 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0561702523799537 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19122573_19122688:DGCR14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 216 197 413 103.071199814342 102.995248317475 0.0759514968670061 A:T:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 19468514 T/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000438587:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000455750:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000491520:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000483431:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000487669:exon_19468476_19468568:CDC45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 53 36 89 25.2906184729636 18.8214666976097 6.4691517753539 A:C A C 10 0.522818519378046 0.202657569618384 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 11 7 18 5.24899628684149 3.65972963564632 1.58926665119517 A:G G A 10 0.522818519378046 0.488968467594439 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 1 44 51 95 20.995985147366 26.6637444882803 -5.66775934091437 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0.259486662743852 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 58 69 127 27.6765258760733 36.0744778370852 -8.39795196101185 T:G T G 10 0.522818519378046 0.155023714800176 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 24179922 G/C 1 20 24 44 9.54362961243908 12.5476444650731 -3.00401485263403 C:G G C 10 0.522818519378046 0.370360258713901 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24179846_24180041:DERL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 24564477 C/T 1 29 19 48 13.8382629380367 9.93355186818287 3.90471106985379 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.312058822937422 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24564415_24564489:CABIN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 25010855 A/G 1 28 21 49 13.3610814574147 10.979188906939 2.38189255047574 A:G A G 10 0.522818519378046 0.568064336753713 ENSG00000100031:ENST00000248923:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000411974:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000412658:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000419133:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400382:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000452551:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000430030:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400383:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000417817:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000446402:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000421833:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000400380:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000455483:exon_25010743_25010871:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000430289:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000447416:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000432867:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000451366:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000428855:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000406383:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000425895:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000450398:exon_25010743_25010877:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000428338:exon_25010743_25010873:GGT1;ENSG00000100031:ENST00000487766:exon_25010829_25010873:GGT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 6 14 20 2.86308888373172 7.31945927129264 -4.45637038756092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.070687716479435 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26853905 C/A 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:T:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26854441 G/A 1 9 5 14 4.29463332559759 2.61409259689023 1.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430788246799537 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26859942 C/T 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26862212 T/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26862192_26864589:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26861421_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26862192_26862228:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000459918:exon_26862192_26862228:HPS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26884039 G/A 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 0.124191345419258 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 31 30 61 14.7926258992806 15.6845555813414 -0.891929682060807 A:G G A 10 0.522818519378046 0.898176326893839 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26936897 G/A 1 41 28 69 19.5644407055001 14.6389185425853 4.92552216291483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.278109081955481 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 26937321 G/A 1 18 29 47 8.58926665119517 15.1617370619633 -6.57247041076816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0585092580165427 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000442495:exon_26937172_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000454778:exon_26937237_26937684:TPST2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 20 25 45 9.54362961243908 13.0704629844512 -3.52683337201207 C:G C G 10 0.522818519378046 0.300641388123278 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 32 32 64 15.2698073799025 16.7301926200975 -1.46038524019495 T:G G T 10 0.522818519378046 0.802627182358662 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 29908025 G/A 1 59 39 98 28.1537073566953 20.3899222557438 7.76378510095149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.129347181219156 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 29940556 G/C 1 16 10 26 7.63490368995126 5.22818519378046 2.4067184961708 C:G G C 10 0.522818519378046 0.433360460128227 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000475187:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000440771:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000455450:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000428374:exon_29940449_29940592:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000418021:exon_29940449_29940592:THOC5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 30136701 G/C 1 26 40 66 12.4067184961708 20.9127407751218 -8.50602227895104 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0478319297467326 ENSG00000100319:ENST00000344318:exon_30136639_30136719:ZMAT5;ENSG00000100319:ENST00000397781:exon_30136639_30136719:ZMAT5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 62 55 117 29.5852517985611 28.7550185657925 0.830233232768613 T:C C T 10 0.522818519378046 0.926362430580681 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 30688339 G/A 1 51 45 96 24.3362555117197 23.5268333720121 0.809422139707582 A:G G A 10 0.522818519378046 0.918769537692706 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30687980_30688349:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 25 18 43 11.9295370155488 9.41073334880483 2.51880366674402 T:C T C 10 0.522818519378046 0.450907783756556 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 C:G G C 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 C:G G C 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 35 24 59 16.7013518217684 12.5476444650731 4.15370735669529 A:G G A 10 0.522818519378046 0.299215153326228 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 32435510 C/A 0 87 0 87 41.51478881411 0 41.51478881411 C C 10 0.522818519378046 3.24409144227784e-25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 32871365 G/A 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 19 22 41 9.06644813181713 11.502007426317 -2.43555929449989 T:G T G 10 0.522818519378046 0.532312669097316 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 29 21 50 13.8382629380367 10.979188906939 2.8590740310977 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.479870610974048 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 49 69 118 23.3818925504757 36.0744778370852 -12.6925852866094 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0210674984424285 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36537763 C/T 1 55 37 92 26.2449814342075 19.3442852169877 6.90069621721976 T:C C T 10 0.522818519378046 0.174638959649788 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 38 39 77 18.1328962636343 20.3899222557438 -2.25702599210954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.648861892762798 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 259 217 476 123.590003481086 113.451618705036 10.1383847760501 T:C T C 10 0.522818519378046 0.35910143686957 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 267 191 458 127.407455326062 99.8583372012068 27.5491181248549 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0100737727354155 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36688068 C/T 1 353 285 638 168.44506265955 149.003278022743 19.4417846368067 T:C C T 10 0.522818519378046 0.132006619721062 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36688032_36688280:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36688032_36688115:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36688032_36688280:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36688032_36688280:MYH9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 367 410 777 175.125603388257 214.355592944999 -39.2299895567418 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.00507020486565274 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 161 145 306 76.8262183801346 75.8086853098167 1.01753307031792 T:C T C 10 0.522818519378046 0.95437764726762 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 20 22 42 9.54362961243908 11.502007426317 -1.95837781387793 T:G G T 10 0.522818519378046 0.643623726109392 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 38046695 C/A 1 54 45 99 25.7677999535855 23.5268333720121 2.24096658157345 A:C:G C A 10 0.522818519378046 0.688043855813794 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 1 35 21 56 16.7013518217684 10.979188906939 5.72216291482942 A:G G A 10 0.522818519378046 0.141628879585207 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 85 59 144 40.5604258528661 30.8462926433047 9.71413320956137 T:C C T 10 0.522818519378046 0.113073802715248 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 53 62 115 25.2906184729636 32.4147482014389 -7.12412972847529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.192065201153155 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 39147235 A/C 1 27 20 47 12.8838999767928 10.4563703875609 2.42752958923184 A:C A C 10 0.522818519378046 0.559792210468515 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417595:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000438058:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000456894:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000480307:exon_39147215_39147446:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000420859:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000452294:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000494273:exon_39146903_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000433561:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417332:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000439339:exon_39147215_39147378:SUN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 39178701 A/G 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000100246:ENST00000216068:exon_39178668_39178875:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000437501:exon_39178668_39178750:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000406199:exon_39178668_39178875:DNAL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 22 10 32 10.497992573683 5.22818519378046 5.26980737990253 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0761148002195875 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 68 87 155 32.4483406822929 45.48521118589 -13.0368705035971 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0367719568518882 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 41652733 G/A 1 32 23 55 15.2698073799025 12.0248259456951 3.24498143420747 A:G G A 10 0.522818519378046 0.419517426516067 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652715_41652828:RANGAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 97 63 160 46.2866036203295 32.9375667208169 13.3490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0393401593336102 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 645 641 1286 307.78205500116 335.126670921328 -27.3446159201672 T:G G T 10 0.522818519378046 0.131691781211437 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42180353 C/T 1 10 4 14 4.77181480621954 2.09127407751218 2.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.185914534035155 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42180343_42180424:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42180343_42180424:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42180343_42180424:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42180343_42180424:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42180343_42180364:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42180343_42180424:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42180343_42180424:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42180343_42180424:MEI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42336172 G/A 1 24 11 35 11.4523555349269 5.75100371315851 5.70135182176839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0624668819365596 ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42336143_42336223:CENPM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 30 13 43 14.3154444186586 6.7966407519146 7.51880366674402 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0222646563605304 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 230 252 482 109.751740543049 131.750266883268 -21.9985263402182 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0498079667235405 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 100 48 148 47.7181480621954 25.0952889301462 22.6228591320492 T:G G T 10 0.522818519378046 0.000194689310925593 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 42970799 A/G 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.246697181289009 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 73 49 122 34.8342480854026 25.6181074495243 9.21614063587839 C:G G C 10 0.522818519378046 0.102889914738532 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 43455531 C/T 1 10 2 12 4.77181480621954 1.04563703875609 3.72617776746345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0409307209651302 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 43459846 G/A 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43459819_43459927:TTLL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 43576904 G/A 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 A:G G A 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43576748_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43576762_43576946:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43576748_43576946:TTLL12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 44489850 C/G 1 167 48 215 79.6893072638663 25.0952889301462 54.5940183337201 C:G C G 10 0.522818519378046 1.69706013291376e-14 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 166 68 234 79.2121257832444 35.5516593177071 43.6604664655372 T:C T C 10 0.522818519378046 8.41388637266186e-09 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 34 21 55 16.2241703411464 10.979188906939 5.24498143420747 T:C C T 10 0.522818519378046 0.177645355712243 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 50 38 88 23.8590740310977 19.8671037363657 3.99197029473195 C:G C G 10 0.522818519378046 0.455274379749841 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 45132704 T/C 1 6 20 26 2.86308888373172 10.4563703875609 -7.5932815038292 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00293474997520520 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 45132785 T/C 1 9 15 24 4.29463332559759 7.84227779067069 -3.5476444650731 T:C T C 10 0.522818519378046 0.157963972015285 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 C:G G C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 46722400 T/C 1 19 24 43 9.06644813181713 12.5476444650731 -3.48119633325598 T:C T C 10 0.522818519378046 0.359866475507039 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 47108189 C/T 1 1 10 11 0.477181480621954 5.22818519378046 -4.75100371315851 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00461012857101643 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47108065_47108190:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47108065_47108190:CERK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 47116905 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47116799_47116912:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47116799_47116912:CERK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50318061 G/C 1 74 83 157 35.3114295660246 43.3939371083778 -8.08250754235323 C:G G C 10 0.522818519378046 0.201954156925949 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 10 4 14 4.77181480621954 2.09127407751218 2.68054072870736 T:C C T 10 0.522818519378046 0.185914534035155 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 97 103 200 46.2866036203295 53.8503074959387 -7.56370387560921 A:C:G G C 10 0.522818519378046 0.28917478803204 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50639965 C/A 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:C C A 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000073169:ENST00000380903:exon_50639408_50640019:RP3-402G11.5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 19 16 35 9.06644813181713 8.36509631004874 0.701351821768389 T:C T C 10 0.522818519378046 0.86672112730153 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 T:C T C 10 0.522818519378046 0.177905026249726 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 23 24 47 10.9751740543049 12.5476444650731 -1.57247041076816 A:G A G 10 0.522818519378046 0.66401088053666 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 33 39 72 15.7469888605245 20.3899222557438 -4.64293339521931 A:G A G 10 0.522818519378046 0.289846195773388 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50704028 C/T 1 5 12 17 2.38590740310977 6.27382223253655 -3.88791482942678 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0866776016309947 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704011_50704089:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704011_50704089:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704011_50704089:MAPK11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 12 21 33 5.72617776746345 10.979188906939 -5.25301113947552 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0809605196802013 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50728881 C/T 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50728816_50729018:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50728828_50729018:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000425954:exon_50728529_50729026:PLXNB2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50876662 T/G 1 45 45 90 21.4731666279879 23.5268333720121 -2.05366674402414 T:C:G T G 10 0.522818519378046 0.674432224363083 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50876603_50876727:PPP6R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 24 35 59 11.4523555349269 18.2986481782316 -6.84629264330471 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0896207278945567 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50882427 C/T 1 58 57 115 27.6765258760733 29.8006556045486 -2.12412972847529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.709634352088736 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50882295_50882546:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000470046:exon_50881516_50882546:PPP6R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 90 124 214 42.9463332559759 64.8294964028777 -21.8831631469019 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00317065599460073 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50964255 C/T 1 331 557 888 157.947070085867 291.209915293572 -133.262845207705 T:C C T 10 0.522818519378046 3.03445105499794e-19 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50969647 C/G 1 157 145 302 74.9174924576468 75.8086853098167 -0.891192852169894 C:G C G 10 0.522818519378046 0.954079238791642 ENSG00000177989:ENST00000468249:exon_50969620_50970251:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000401779:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000403326:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000456888:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000438960:exon_50969620_50969770:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000424610:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000329363:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000405135:exon_50969620_50969770:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000428989:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000463472:exon_50969620_50969852:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000469660:exon_50969620_50969724:ODF3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 50987843 C/T 1 12 4 16 5.72617776746345 2.09127407751218 3.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0816762651460521 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 51009960 C/T 1 92 19 111 43.9006962172198 9.93355186818287 33.9671443490369 T:C C T 10 0.522818519378046 2.28138245149343e-11 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 7 36 43 3.34027036435368 18.8214666976097 -15.481196333256 C:G G C 10 0.522818519378046 1.66516959452117e-06 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 22 51018204 T/C 1 48 75 123 22.9047110698538 39.2113889533534 -16.3066778834997 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00372638892732924 ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51018156_51018259:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000531456:exon_51018156_51018259:CTA-384D8.32;ENSG00000100288:ENST00000406938:exon_51018156_51018259:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000492582:exon_51018156_51018259:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000464225:exon_51018156_51018231:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000471515:exon_51018156_51018231:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000484266:exon_51018156_51018259:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000481673:exon_51018156_51018259:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000479003:exon_51018156_51018259:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000468532:exon_51018156_51018259:CHKB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 3215901 G/A 1 3 12 15 1.43154444186586 6.27382223253655 -4.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0173247889652166 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000450014:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000498700:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000492178:exon_3215743_3215945:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000478353:exon_3215571_3215945:CRBN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 8809184 G/A 1 24 16 40 11.4523555349269 8.36509631004874 3.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.346814251904425 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 8809703 G/A 1 25 15 40 11.9295370155488 7.84227779067069 4.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.208951287825107 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR;ENSG00000180914:ENST00000449615:exon_8809598_8810015:OXTR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 9798475 G/A 1 43 43 86 20.518803666744 22.481196333256 -1.96239266651196 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.7462784024083 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302036:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000457221:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000359753:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000449570:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302008:exon_9798451_9798500:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000441094:exon_9798451_9798719:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000429146:exon_9798451_9798549:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798451_9798500:OGG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 138 95 233 65.8510443258296 49.6677593409144 16.1832849849153 T:C T C 10 0.522818519378046 0.035776736262438 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 9934753 A/G 1 138 96 234 65.8510443258296 50.1905778602924 15.6604664655372 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0424577534513915 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 10028294 G/A 1 50 74 124 23.8590740310977 38.6885704339754 -14.8294964028777 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00890571174054975 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10028191_10028804:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000487465:exon_10028191_10028522:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000429759:exon_10028191_10028366:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000470827:exon_10028191_10028586:TMEM111 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 19 11 30 9.06644813181713 5.75100371315851 3.31544441865862 A:G A G 10 0.522818519378046 0.273853776727649 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 10331457 G/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:G G T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000157017:ENST00000335542:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000481287:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000491589:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000430179:exon_10331446_10331559:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000422159:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000450603:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000449238:exon_10331446_10331559:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000437422:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000449554:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000287656:exon_10331446_10331559:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000457360:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000429122:exon_10331446_10331562:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000475759:exon_10331446_10331491:GHRL;ENSG00000157017:ENST00000476283:exon_10331446_10331491:GHRL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 10342943 T/G 1 288 227 515 137.428266419123 118.679803898816 18.7484625203063 T:G T G 10 0.522818519378046 0.102648409940003 ENSG00000157020:ENST00000397109:exon_10342615_10343058:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000337354:exon_10342615_10343058:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000350697:exon_10342615_10343058:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000479868:exon_10342617_10343058:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000343726:exon_10342619_10343058:SEC13;ENSG00000157020:ENST00000383801:exon_10342645_10343058:SEC13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 11382166 G/C 1 24 16 40 11.4523555349269 8.36509631004874 3.08725922487816 C:G G C 10 0.522818519378046 0.346814251904425 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000424071:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000434066:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000478638:exon_11382119_11382209:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000461278:exon_11382119_11382209:ATG7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 11643465 T/C 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 T:C T C 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11643307_11643496:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11643307_11643496:VGLL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 12545091 T/C 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:C T C 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000154743:ENST00000446004:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000314571:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000402228:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000284995:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000473755:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000383797:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000444864:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000415684:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000490981:exon_12544945_12545283:TSEN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C T C 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 26 36 62 12.4067184961708 18.8214666976097 -6.41474820143885 A:G A G 10 0.522818519378046 0.126508225853601 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 13395076 C/G 1 13 6 19 6.2033592480854 3.13691111626828 3.06644813181713 C:G C G 10 0.522818519378046 0.175452094094042 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395054_13395160:NUP210 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 15080696 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177463:ENST00000425241:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000323373:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000475707:exon_15079507_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000393102:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000383792:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000396874:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000478572:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000439011:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000413194:exon_15080629_15080734:NR2C2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 15115270 G/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:G G T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 15297570 C/T 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15296357_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15296360_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000412806:exon_15296511_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15297096_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15297096_15297810:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15297157_15297810:SH3BP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 A:G A G 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 32586521 C/T 1 20 16 36 9.54362961243908 8.36509631004874 1.17853330239034 T:C C T 10 0.522818519378046 0.740777061222911 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000413350:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000424991:exon_32586481_32586598:DYNC1LI1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 21 14 35 10.020811093061 7.31945927129264 2.70135182176839 T:G T G 10 0.522818519378046 0.400562341047815 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 22 14 36 10.497992573683 7.31945927129264 3.17853330239034 A:G G A 10 0.522818519378046 0.319873415143134 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 13 8 21 6.2033592480854 4.18254815502437 2.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393742775407513 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 38170810 C/G 1 49 52 101 23.3818925504757 27.1865630076584 -3.80467045718265 T:C:G C G 10 0.522818519378046 0.486098790205522 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38170781_38170879:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000418880:exon_38170781_38170879:ACAA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39129629 G/A 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39129619_39129724:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000413099:exon_39129619_39129724:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39129619_39129724:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39129619_39129724:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39129619_39129724:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000477197:exon_39129309_39129724:WDR48 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39139662 C/T 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 18 17 35 8.58926665119517 8.88791482942678 -0.298648178231611 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G G A 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 51 24 75 24.3362555117197 12.5476444650731 11.7886110466465 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00747779370112085 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 21 43 64 10.020811093061 22.481196333256 -12.4603852401949 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00240148243599077 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 42235345 G/A 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42235316_42235390:TRAK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 42242539 G/A 1 14 6 20 6.68054072870736 3.13691111626828 3.54362961243908 A:G G A 10 0.522818519378046 0.122855061020348 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42242310_42242546:TRAK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 44856496 C/G 1 5 11 16 2.38590740310977 5.75100371315851 -3.36509631004874 C:G C G 10 0.522818519378046 0.131513831648772 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000481166:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44856463_44856568:KIF15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 139 130 269 66.3282258064516 67.966407519146 -1.63818171269439 C:G G C 10 0.522818519378046 0.854882068883422 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 45533224 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45533009_45533292:LARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 1 9 10 0.477181480621954 4.70536667440241 -4.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00884457321564113 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 45559519 T/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45559455_45559564:LARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 45565554 A/G 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45565489_45565600:LARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 6 10 16 2.86308888373172 5.22818519378046 -2.36509631004874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.317831798340128 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 47537515 G/A 1 61 51 112 29.1080703179392 26.6637444882803 2.44432582965884 A:G G A 10 0.522818519378046 0.705374310867871 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47537130_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47537436_47537687:C3orf75 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 76 48 124 36.2657925272685 25.0952889301462 11.1705035971223 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0478966918372488 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 47 29 76 22.4275295892318 15.1617370619633 7.2657925272685 T:G G T 10 0.522818519378046 0.107835826351262 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 48506448 C/T 1 38 24 62 18.1328962636343 12.5476444650731 5.58525179856115 T:C C T 10 0.522818519378046 0.163868732004804 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48506230_48506482:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48506230_48506482:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48506230_48506482:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48506230_48506482:ATRIP;ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506445_48506482:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48506445_48506482:TREX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 48664473 C/T 1 14 6 20 6.68054072870736 3.13691111626828 3.54362961243908 T:C C T 10 0.522818519378046 0.122855061020348 ENSG00000225697:ENST00000420764:exon_48664309_48664485:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000489483:exon_48664309_48665974:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000395550:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000383733:exon_48664309_48664505:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000307364:exon_48664309_48664505:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000337000:exon_48664309_48664485:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000480524:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000455886:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000358747:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000466257:exon_48664327_48664485:SLC26A6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 31 30 61 14.7926258992806 15.6845555813414 -0.891929682060807 A:G G A 10 0.522818519378046 0.898176326893839 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49004574 C/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177479:ENST00000430423:exon_49004558_49004584:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000478224:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000356401:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000498314:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000462829:exon_49004558_49004649:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000490095:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000449376:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000482427:exon_49004558_49004716:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000483333:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000486316:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000444790:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000474936:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000484999:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000452385:exon_49004558_49004708:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000472640:exon_49004558_49004603:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000459976:exon_49004558_49004708:ARIH2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49053219 A/G 1 342 271 613 163.196066372708 141.68381875145 21.5122476212578 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.0822646691770376 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000354294:exon_49053187_49053261:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49052958_49053773:DALRD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49054692 T/C 1 33 23 56 15.7469888605245 12.0248259456951 3.72216291482942 T:C T C 10 0.522818519378046 0.350656891711826 ENSG00000178149:ENST00000441576:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000460505:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000341949:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498498:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000440857:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000313778:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000395462:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000484831:exon_49054661_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000420952:exon_49054661_49054789:DALRD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49068050 G/A 1 87 69 156 41.51478881411 36.0744778370852 5.44031097702482 A:G G A 10 0.522818519378046 0.422980737056802 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49067140_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000498392:exon_49067364_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49067365_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49067645_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000489642:exon_49067808_49068077:QRICH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49135961 C/G 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 C:G C G 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49738945 C/T 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49738924_49739041:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000494005:exon_49738924_49739041:RNF123 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 24 31 55 11.4523555349269 16.2073741007194 -4.75501856579253 A:G A G 10 0.522818519378046 0.225022335592866 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 10 17 27 4.77181480621954 8.88791482942678 -4.11610002320724 T:G T G 10 0.522818519378046 0.125709307504719 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49946812 G/A 1 14 7 21 6.68054072870736 3.65972963564632 3.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.198910466352987 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000455683:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000486107:exon_49946308_49948317:MON1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 3 8 11 1.43154444186586 4.18254815502437 -2.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.131842010035085 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 46 32 78 21.9503481086099 16.7301926200975 5.22015548851241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.257928450118356 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 8 17 25 3.81745184497563 8.88791482942678 -5.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0464376219741673 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 70 86 156 33.4027036435368 44.962392666512 -11.5596890229752 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0656055090620637 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 33 50 83 15.7469888605245 26.1409259689023 -10.3939371083778 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0274238683397747 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 22 10 32 10.497992573683 5.22818519378046 5.26980737990253 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0761148002195875 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52437748 A/C 1 8 15 23 3.81745184497563 7.84227779067069 -4.02482594569506 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0993443127486353 ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52437432_52437910:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52437432_52437910:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000490804:exon_52437719_52437910:BAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52510540 C/T 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000488380:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000420808:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000464280:exon_52510463_52510615:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000481211:exon_52510314_52510615:NISCH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52610651 T/A 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:T T A 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52610557_52610714:PBRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 102 96 198 48.6725110234393 50.1905778602924 -1.51806683685312 A:G G A 10 0.522818519378046 0.831417706950354 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52727511 C/T 1 371 311 682 177.034329310745 162.596559526572 14.4377697841726 T:C C T 10 0.522818519378046 0.283138182472926 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52727736 A/G 1 317 342 659 151.266529357159 178.803933627292 -27.5374042701323 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.0320136328103591 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52780197 A/T 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:T A T 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52780077_52780226:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52780077_52780226:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52780077_52780226:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000487068:exon_52780166_52780226:NEK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52820981 A/T 1 21 1 22 10.020811093061 0.522818519378046 9.49799257368299 A:T A T 10 0.522818519378046 1.55566050815604e-05 ENSG00000055957:ENST00000273283:exon_52820961_52821115:ITIH1;ENSG00000055957:ENST00000428133:exon_52820961_52821130:ITIH1;ENSG00000055957:ENST00000484844:exon_52820961_52821115:ITIH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52850999 A/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000055955:ENST00000266041:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000055955:ENST00000346281:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000055955:ENST00000485816:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000055955:ENST00000406595:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000055955:ENST00000441637:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000055955:ENST00000491663:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000055955:ENST00000461966:exon_52850900_52851074:ITIH4;ENSG00000243696:ENST00000468472:exon_52850900_52851074:MUSTN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 9 12 21 4.29463332559759 6.27382223253655 -1.97918890693897 T:C C T 10 0.522818519378046 0.513308181962307 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 52941583 C/T 1 18 17 35 8.58926665119517 8.88791482942678 -0.298648178231611 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000163935:ENST00000394752:exon_52941571_52941749:SFMBT1;ENSG00000163935:ENST00000358080:exon_52941571_52941749:SFMBT1;ENSG00000163935:ENST00000394750:exon_52941571_52941749:SFMBT1;ENSG00000163935:ENST00000296295:exon_52941571_52941749:SFMBT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 53155720 C/T 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53155715_53155816:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53155715_53155816:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000467048:exon_53155715_53155816:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394737:exon_53155523_53155816:RFT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 146 145 291 69.6684961708053 75.8086853098167 -6.14018913901138 T:C C T 10 0.522818519378046 0.481729574101476 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 15 15 30 7.15772220932931 7.84227779067069 -0.68455558134138 T:C C T 10 0.522818519378046 0.856180537932261 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 58191242 C/G 1 3 14 17 1.43154444186586 7.31945927129264 -5.88791482942678 C:G C G 10 0.522818519378046 0.00582959970528915 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 14 4 18 6.68054072870736 2.09127407751218 4.58926665119517 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0339640075555004 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 29 19 48 13.8382629380367 9.93355186818287 3.90471106985379 A:G A G 10 0.522818519378046 0.312058822937422 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 29 18 47 13.8382629380367 9.41073334880483 4.42752958923184 T:C C T 10 0.522818519378046 0.242603969068210 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 31 21 52 14.7926258992806 10.979188906939 3.81343699234161 T:G T G 10 0.522818519378046 0.331997474612485 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 66433676 A/G 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:G A G 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 12 6 18 5.72617776746345 3.13691111626828 2.58926665119517 T:C T C 10 0.522818519378046 0.246697181289009 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 87302890 G/A 1 20 16 36 9.54362961243908 8.36509631004874 1.17853330239034 A:G G A 10 0.522818519378046 0.740777061222911 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87302862_87303064:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87302862_87304698:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87302862_87303076:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000466696:exon_87302862_87303063:CHMP2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 1 14 15 0.477181480621954 7.31945927129264 -6.84227779067069 T:C T C 10 0.522818519378046 0.000323639760294951 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 8 19 27 3.81745184497563 9.93355186818287 -6.11610002320724 T:C T C 10 0.522818519378046 0.020587003967958 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 13 6 19 6.2033592480854 3.13691111626828 3.06644813181713 T:C C T 10 0.522818519378046 0.175452094094042 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 16 17 33 7.63490368995126 8.88791482942678 -1.25301113947552 T:C T C 10 0.522818519378046 0.728839376751847 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 100287704 A/G 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 105 94 199 50.1040554653052 49.1449408215363 0.959114643768842 T:C T C 10 0.522818519378046 0.943453759544008 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 7 12 19 3.34027036435368 6.27382223253655 -2.93355186818287 A:G A G 10 0.522818519378046 0.250439240184576 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:G T G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 108288326 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108288236_108288454:KIAA1524 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 18 28 46 8.58926665119517 14.6389185425853 -6.04965189139012 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0780221607692198 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 42 75 117 20.0416221861221 39.2113889533534 -19.1697667672314 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000405932089231065 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 112256630 A/G 1 67 71 138 31.9711592016709 37.1201148758413 -5.14895567417035 A:G A G 10 0.522818519378046 0.394974755596919 ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 112724619 A/G 1 45 47 92 21.4731666279879 24.5724704107682 -3.09930378278023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.532703287759502 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 19 14 33 9.06644813181713 7.31945927129264 1.74698886052448 A:T A T 10 0.522818519378046 0.60345776447202 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 113172461 C/T 1 8 12 20 3.81745184497563 6.27382223253655 -2.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.371143970102355 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113172313_113172797:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113172313_113172797:SPICE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 113187097 A/G 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113186986_113187251:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113186986_113187251:SPICE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 113798771 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000151576:ENST00000485050:exon_113798753_113798904:QTRTD1;ENSG00000151576:ENST00000281273:exon_113798753_113798904:QTRTD1;ENSG00000151576:ENST00000479882:exon_113798753_113798904:QTRTD1;ENSG00000151576:ENST00000493014:exon_113798753_113798904:QTRTD1;ENSG00000151576:ENST00000462869:exon_113798753_113798904:QTRTD1;ENSG00000151576:ENST00000483272:exon_113798714_113798904:QTRTD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 6 16 22 2.86308888373172 8.36509631004874 -5.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0303830108525416 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.124191345419258 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 120315411 G/A 1 2 47 49 0.954362961243908 24.5724704107682 -23.6181074495243 A:G G A 10 0.522818519378046 2.79904529444084e-13 ENSG00000065518:ENST00000461682:exon_120315202_120315493:NDUFB4;ENSG00000065518:ENST00000491335:exon_120315204_120315493:NDUFB4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 151 280 431 72.0544035739151 146.389185425853 -74.3347818519378 T:C C T 10 0.522818519378046 8.14445964898176e-13 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 98 92 190 46.7637851009515 48.0993037827802 -1.33551868182875 A:G G A 10 0.522818519378046 0.884589586595558 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 20 15 35 9.54362961243908 7.84227779067069 1.70135182176839 T:C C T 10 0.522818519378046 0.614421828892699 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:G G A 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121659860 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000163406:ENST00000489711:exon_121659678_121662949:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000295605:exon_121659678_121660099:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000436799:exon_121659678_121660457:SLC15A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121712098 G/A 1 11 6 17 5.24899628684149 3.13691111626828 2.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.340913792630009 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121712271 C/T 1 17 14 31 8.11208517057322 7.31945927129264 0.792625899280574 T:C C T 10 0.522818519378046 0.858168833373077 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121712358 A/G 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121712805 G/C 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 C:G G C 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000383663:exon_121712627_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 121825197 G/A 1 51 37 88 24.3362555117197 19.3442852169877 4.99197029473195 A:G G A 10 0.522818519378046 0.336896407237768 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121825045_121825347:CD86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 28 20 48 13.3610814574147 10.4563703875609 2.90471106985379 T:C T C 10 0.522818519378046 0.470649321102718 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 19 10 29 9.06644813181713 5.22818519378046 3.83826293803667 C:G G C 10 0.522818519378046 0.193235645287675 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 24 15 39 11.4523555349269 7.84227779067069 3.6100777442562 A:G A G 10 0.522818519378046 0.265567806032608 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 24 18 42 11.4523555349269 9.41073334880483 2.04162218612207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.541566201263107 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 125725334 T/C 1 17 18 35 8.11208517057322 9.41073334880483 -1.29864817823161 T:C T C 10 0.522818519378046 0.736066735208448 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725200_125725407:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504118:exon_125725201_125725471:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725206_125725407:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725216_125725407:SLC41A3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 127323592 G/A 1 32 50 82 15.2698073799025 26.1409259689023 -10.8711185889998 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0197620285154145 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000480910:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323451_127323626:MCM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 127540635 C/T 1 53 60 113 25.2906184729636 31.3691111626828 -6.0784926897192 T:C C T 10 0.522818519378046 0.259767103265319 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000479967:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000494830:exon_127540537_127540681:MGLL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 128525253 C/T 1 180 149 329 85.8926665119517 77.8999593873289 7.99270712462285 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.407800069494867 ENSG00000075785:ENST00000265062:exon_128525215_128525433:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000482525:exon_128525215_128525292:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000464496:exon_128525215_128525433:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000490093:exon_128525215_128525318:RAB7A;ENSG00000075785:ENST00000430113:exon_128525215_128525433:RAB7A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 28 25 53 13.3610814574147 13.0704629844512 0.29061847296356 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 228 189 417 108.797377581806 98.8127001624507 9.98467741935481 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.351658844963034 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 75 56 131 35.7886110466466 29.2778370851706 6.51077396147597 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293899218446221 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 98 65 163 46.7637851009515 33.983203759573 12.7805813413785 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0497657654965157 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 53 58 111 25.2906184729636 30.3234741239267 -5.03285565096311 A:G A G 10 0.522818519378046 0.343840841855523 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 19 25 44 9.06644813181713 13.0704629844512 -4.00401485263403 A:G G A 10 0.522818519378046 0.231872466806043 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 133356790 G/A 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133356720_133357006:TOPBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 134670524 C/T 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134670213_134670894:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134670213_134670560:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000474732:exon_134670213_134670604:EPHB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 134851605 C/T 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000482618:exon_134851556_134851608:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134851556_134851891:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000488154:exon_134851556_134851657:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134851556_134851891:EPHB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 134898742 C/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000154928:ENST00000398015:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000360935:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000425716:exon_134898702_134898824:EPHB1;ENSG00000154928:ENST00000493838:exon_134898702_134898824:EPHB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 138244400 C/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138244332_138244406:CEP70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 138289221 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000468900:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000462419:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000478673:exon_138289160_138289340:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000464035:exon_138289160_138289340:CEP70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 138347957 G/A 1 21 48 69 10.020811093061 25.0952889301462 -15.0744778370852 A:G G A 10 0.522818519378046 0.000391722600738513 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 19 53 72 9.06644813181713 27.7093815270364 -18.6429333952193 T:C T C 10 0.522818519378046 9.243157569894e-06 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 25 0 25 11.9295370155488 0 11.9295370155488 G G 10 0.522818519378046 1.00214212677435e-07 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 20 10 30 9.54362961243908 5.22818519378046 4.31544441865862 A:G G A 10 0.522818519378046 0.143437749507336 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 143 0 143 68.2369517289394 0 68.2369517289394 T T 10 0.522818519378046 5.43800361382895e-41 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 41 38 79 19.5644407055001 19.8671037363657 -0.302663030865634 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 155632314 A/G 1 85 93 178 40.5604258528661 48.6221223021583 -8.06169644929219 A:G A G 10 0.522818519378046 0.230800811891699 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155632208_155632359:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155632208_155632359:GMPS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 24 33 57 11.4523555349269 17.2530111394755 -5.80065560454862 T:C T C 10 0.522818519378046 0.14456296381946 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 18 14 32 8.58926665119517 7.31945927129264 1.26980737990253 A:C C A 10 0.522818519378046 0.725061426809395 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 A:G G A 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 170802910 C/T 1 17 7 24 8.11208517057322 3.65972963564632 4.4523555349269 T:C C T 10 0.522818519378046 0.100173612320126 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170802907_170803018:TNIK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 171338237 T/G 1 21 17 38 10.020811093061 8.88791482942678 1.13289626363425 T:G T G 10 0.522818519378046 0.747768058032766 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000467432:exon_171338176_171338310:PLD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 171395468 A/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171395356_171395643:PLD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 12 28 40 5.72617776746345 14.6389185425853 -8.91274077512184 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00640937910944312 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 7 14 21 3.34027036435368 7.31945927129264 -3.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.124230594228541 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 1 10 11 0.477181480621954 5.22818519378046 -4.75100371315851 T:G T G 10 0.522818519378046 0.00461012857101643 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 179052195 C/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:C C A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 182790249 G/A 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 A:G G A 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000486226:exon_182790215_182790275:MCCC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 182853554 G/A 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 13 24 37 6.2033592480854 12.5476444650731 -6.3442852169877 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0471164723795834 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 115 105 220 54.8758702715247 54.8959445346948 -0.0200742631701232 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 184042009 A/G 1 66 74 140 31.493977721049 38.6885704339754 -7.19459271292644 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.236698225023754 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184041989_184042014:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184041989_184042100:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184041989_184042135:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184041989_184042135:EIF4G1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 114 92 206 54.3986887909028 48.0993037827802 6.29938500812252 T:C C T 10 0.522818519378046 0.402893789734386 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 17 24 41 8.11208517057322 12.5476444650731 -4.43555929449989 A:C C A 10 0.522818519378046 0.210598057141154 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 A:C C A 10 0.522818519378046 0.274460962299708 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 81 117 198 38.6516999303783 61.1697667672314 -22.5180668368531 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00167799535309105 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 186791979 C/T 1 13 16 29 6.2033592480854 8.36509631004874 -2.16173706196333 T:C C T 10 0.522818519378046 0.460889625504142 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000427315:exon_186791947_186791992:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000442023:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186791193_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186791947_186792121:ST6GAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 18 21 39 8.58926665119517 10.979188906939 -2.3899222557438 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.522126092072328 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 187088656 C/T 1 12 12 24 5.72617776746345 6.27382223253655 -0.547644465073105 T:C C T 10 0.522818519378046 0.841016689152556 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 22 14 36 10.497992573683 7.31945927129264 3.17853330239034 T:C C T 10 0.522818519378046 0.319873415143134 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 28 20 48 13.3610814574147 10.4563703875609 2.90471106985379 A:C C A 10 0.522818519378046 0.470649321102718 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 19 19 38 9.06644813181713 9.93355186818287 -0.867103736365749 A:C C A 10 0.522818519378046 0.871359257968777 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 119 84 203 56.7845961940125 43.9167556277559 12.8678405662567 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0787982438987697 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 A:G G A 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 193372687 A/G 1 22 18 40 10.497992573683 9.41073334880483 1.08725922487816 A:G A G 10 0.522818519378046 0.754272363653691 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193372651_193372816:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193372651_193372816:OPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 14 32 46 6.68054072870736 16.7301926200975 -10.0496518913901 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00304974196103337 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 193385047 C/T 1 13 16 29 6.2033592480854 8.36509631004874 -2.16173706196333 T:C C T 10 0.522818519378046 0.460889625504142 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000445863:exon_193384959_193385069:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000429164:exon_193384965_193385069:OPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 194373577 G/A 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000437613:exon_194373458_194373831:LSG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 T:C T C 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 A:G G A 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 195269901 G/C 1 71 59 130 33.8798851241587 30.8462926433047 3.03359248085402 C:G G C 10 0.522818519378046 0.599844544824312 ENSG00000184203:ENST00000328432:exon_195269727_195270209:PPP1R2;ENSG00000184203:ENST00000438848:exon_195269727_195270176:PPP1R2;ENSG00000184203:ENST00000413183:exon_195269727_195269981:PPP1R2;ENSG00000184203:ENST00000462906:exon_195269727_195270209:PPP1R2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 27 23 50 12.8838999767928 12.0248259456951 0.8590740310977 A:G A G 10 0.522818519378046 0.887725497648298 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 15 14 29 7.15772220932931 7.31945927129264 -0.161737061963334 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 11 15 26 5.24899628684149 7.84227779067069 -2.5932815038292 T:G G T 10 0.522818519378046 0.332042226548126 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 196199246 T/C 1 18 15 33 8.58926665119517 7.84227779067069 0.746988860524481 T:C T C 10 0.522818519378046 0.862627047462256 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 14 14 28 6.68054072870736 7.31945927129264 -0.638918542585289 T:C T C 10 0.522818519378046 0.851573351026942 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 18 21 39 8.58926665119517 10.979188906939 -2.3899222557438 C:G C G 10 0.522818519378046 0.522126092072328 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 196544948 T/C 1 9 14 23 4.29463332559759 7.31945927129264 -3.02482594569506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.21807391097219 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196544928_196545027:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000426668:exon_196544928_196545027:PAK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 14 10 24 6.68054072870736 5.22818519378046 1.4523555349269 T:C T C 10 0.522818519378046 0.683818962617994 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197403844 T/C 1 16 24 40 7.63490368995126 12.5476444650731 -4.91274077512184 T:C T C 10 0.522818519378046 0.153549018379743 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197403088_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197403711_197403909:KIAA0226 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 14 9 23 6.68054072870736 4.70536667440241 1.97517405430494 A:G A G 10 0.522818519378046 0.532244732814475 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197427696 C/T 1 12 13 25 5.72617776746345 6.7966407519146 -1.07046298445115 T:C C T 10 0.522818519378046 0.693522691443741 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 14 2 16 6.68054072870736 1.04563703875609 5.63490368995126 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0047761657619151 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C C T 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197597044 C/T 1 10 6 16 4.77181480621954 3.13691111626828 1.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.46208822667801 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197597031_197597047:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000471667:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000473177:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000428136:exon_197597031_197597149:LRCH3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 3 197665599 G/T 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 T:G G T 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000490748:exon_197665419_197665903:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197665531_197665646:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197665537_197665646:IQCG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 517600 C/T 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 759872 T/C 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 T:C T C 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000185619:ENST00000362003:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000505655:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000521023:exon_759820_764428:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000470161:exon_759820_760396:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000430644:exon_759823_760387:PCGF3;ENSG00000185619:ENST00000440452:exon_759820_760193:PCGF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 844781 G/A 1 73 63 136 34.8342480854026 32.9375667208169 1.89668136458575 A:G G A 10 0.522818519378046 0.796940369680313 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_844724_844805:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_844724_845762:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_844724_847616:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_844724_844872:GAK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 944210 A/C 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 A:C A C 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_944209_944279:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_944209_944306:TMEM175 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 19 22 41 9.06644813181713 11.502007426317 -2.43555929449989 T:C T C 10 0.522818519378046 0.532312669097316 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 996888 C/T 1 11 2 13 5.24899628684149 1.04563703875609 4.2033592480854 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0242151165868947 ENSG00000127415:ENST00000247933:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000453894:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514698:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514224:exon_996824_996945:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000502829:exon_996824_997177:IDUA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1305799 C/T 1 43 34 77 20.518803666744 17.7758296588536 2.74297400789046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.569464412844669 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000508634:exon_1305767_1306374:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1305767_1305949:MAEA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 42 46 88 20.0416221861221 24.0496518913901 -4.00802970526805 T:C T C 10 0.522818519378046 0.395813390728685 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1729556 G/A 1 44 53 97 20.995985147366 27.7093815270364 -6.71339637967046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.186807903830614 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000493975:exon_1729435_1729821:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G 1 136 126 262 64.8966813645857 65.8751334416338 -0.978452077048047 C:G C G 10 0.522818519378046 0.901777586114922 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 147 118 265 70.1456776514272 61.6925852866094 8.45309236481781 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.325184389416849 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1742616 A/G 1 193 175 368 92.0960257600371 91.4932408911581 0.60278486887907 A:G A G 10 0.522818519378046 0.958432099958374 ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1742553_1742713:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1742553_1742713:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470808:exon_1742553_1743021:TACC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 1987521 G/A 1 33 38 71 15.7469888605245 19.8671037363657 -4.12011487584127 A:G G A 10 0.522818519378046 0.343756172458142 ENSG00000185049:ENST00000382882:exon_1987503_1987591:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000467661:exon_1987503_1987591:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000333877:exon_1987503_1987591:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000416258:exon_1987503_1987591:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000463820:exon_1987503_1987591:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000411638:exon_1987503_1987591:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000453740:exon_1987503_1987591:WHSC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 13 3 16 6.2033592480854 1.56845555813414 4.63490368995126 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0233666826308623 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 56 55 111 26.7221629148294 28.7550185657925 -2.03285565096311 T:C T C 10 0.522818519378046 0.70508619256777 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 2946920 T/C 1 24 26 50 11.4523555349269 13.5932815038292 -2.1409259689023 T:C T C 10 0.522818519378046 0.573399628827636 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2946855_2946956:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2946855_2946956:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2946855_2946956:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2946855_2946956:NOP14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 60 56 116 28.6308888373172 29.2778370851706 -0.646948247853338 A:G A G 10 0.522818519378046 0.926138515841602 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 3189547 C/A 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:C C A 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3189378_3189613:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3189378_3190820:HTT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 3213832 G/A 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 3234980 G/A 1 32 19 51 15.2698073799025 9.93355186818287 5.33625551171965 A:G G A 10 0.522818519378046 0.160821191142671 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3234890_3235080:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3234890_3235080:HTT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 4436517 A/T 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 A:T A T 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4436497_4436585:STX18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 4543541 T/C 1 11 19 30 5.24899628684149 9.93355186818287 -4.68455558134138 T:C T C 10 0.522818519378046 0.100619640257377 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4543524_4543737:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4543524_4543755:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512780:exon_4543524_4543758:STX18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 9 15 24 4.29463332559759 7.84227779067069 -3.5476444650731 T:C C T 10 0.522818519378046 0.157963972015285 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6303248 G/A 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6303541 C/T 1 20 17 37 9.54362961243908 8.88791482942678 0.655714783012298 T:C C T 10 0.522818519378046 0.870498746331351 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6303769 G/A 1 20 23 43 9.54362961243908 12.0248259456951 -2.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.541955536584154 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 26 14 40 12.4067184961708 7.31945927129264 5.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.115500203075359 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6303991 C/T 1 25 12 37 11.9295370155488 6.27382223253655 5.6557147830123 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0705982659602663 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 19 21 40 9.06644813181713 10.979188906939 -1.91274077512184 A:G A G 10 0.522818519378046 0.635541648142928 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 24 24 48 11.4523555349269 12.5476444650731 -1.09528893014621 T:C T C 10 0.522818519378046 0.774285689678662 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 8229005 C/T 1 13 10 23 6.2033592480854 5.22818519378046 0.975174054304942 T:C C T 10 0.522818519378046 0.835285176690354 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 25 12 37 11.9295370155488 6.27382223253655 5.6557147830123 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0705982659602663 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 18 12 30 8.58926665119517 6.27382223253655 2.31544441865862 T:C C T 10 0.522818519378046 0.466589946286752 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 0 0 57 57 0 29.8006556045486 -29.8006556045486 C T C 10 0.522818519378046 4.84132326292532e-19 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 10586571 G/A 1 18 4 22 8.58926665119517 2.09127407751218 6.49799257368299 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00520943588800238 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000429087:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000442825:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000507719:exon_10586551_10586579:CLNK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 11 4 15 5.24899628684149 2.09127407751218 3.15772220932931 A:C A C 10 0.522818519378046 0.124191345419258 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 13603981 T/C 1 10 3 13 4.77181480621954 1.56845555813414 3.2033592480854 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0966494022259154 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 C:G G C 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 27 31 58 12.8838999767928 16.2073741007194 -3.32347412392667 A:G G A 10 0.522818519378046 0.430967236778921 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 40 21 61 19.0872592248782 10.979188906939 8.10807031793919 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0403769447611645 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 234 155 389 111.660466465537 81.0368705035971 30.6235959619401 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00193458481269436 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 16 7 23 7.63490368995126 3.65972963564632 3.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.142381587870303 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 25408838 G/A 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:G G A 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000503805:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000505842:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25408819_25408875:ANAPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 25806319 C/T 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25806163_25806374:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25806163_25806374:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25806163_25806374:SEL1L3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 25823624 G/A 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 A:G G A 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25823618_25823750:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25823618_25823750:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25823618_25823750:SEL1L3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 26407878 T/C 1 8 21 29 3.81745184497563 10.979188906939 -7.16173706196334 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0087200797131491 ENSG00000168214:ENST00000512351:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000510778:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000506956:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000512671:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000345843:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000342295:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000361572:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514380:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514807:exon_26407797_26407885:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000348160:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000521677:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000532341:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000509158:exon_26407797_26407887:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000355476:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000513182:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511401:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000509991:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000515023:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000507561:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514730:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000507574:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514675:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000515573:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511546:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000504907:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000342320:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511451:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000504938:exon_26407797_26407892:RBPJ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 36069805 G/A 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000047365:ENST00000303965:exon_36067620_36069900:ARAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 18 18 36 8.58926665119517 9.41073334880483 -0.821466697609658 T:C T C 10 0.522818519378046 0.867973480842673 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 25 20 45 11.9295370155488 10.4563703875609 1.47316662798793 C:G G C 10 0.522818519378046 0.765775577608258 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:G T G 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:T A T 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 15 3 18 7.15772220932931 1.56845555813414 5.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0086209268116001 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 13 13 26 6.2033592480854 6.7966407519146 -0.593281503829196 A:G A G 10 0.522818519378046 0.846541780450938 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 39512347 T/C 1 21 10 31 10.020811093061 5.22818519378046 4.79262589928057 T:C T C 10 0.522818519378046 0.105115782894502 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000515021:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000514106:exon_39512287_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000510881:exon_39512317_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000503779:exon_39512329_39512481:UGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 41946923 G/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:G G T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000109133:ENST00000504986:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000264452:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000508448:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000513702:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000506794:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000513558:exon_41946810_41946943:TMEM33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 T:C T C 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 48147570 G/C 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 C:G G C 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147425_48147596:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147425_48147596:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147425_48147596:TEC;ENSG00000135605:ENST00000515146:exon_48147425_48147596:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147425_48147596:TEC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:G G A 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 54011576 T/C 1 15 12 27 7.15772220932931 6.27382223253655 0.883899976792757 T:C:G T C 10 0.522818519378046 0.847912280670244 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 12 15 27 5.72617776746345 7.84227779067069 -2.11610002320724 A:C A C 10 0.522818519378046 0.446014558592695 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 C:G C G 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 T:G G T 10 0.522818519378046 0.177905026249726 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 23 18 41 10.9751740543049 9.41073334880483 1.56444070550011 A:G G A 10 0.522818519378046 0.642967420941201 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 16 16 32 7.63490368995126 8.36509631004874 -0.730192620097473 A:G G A 10 0.522818519378046 0.860419838988144 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 96 82 178 45.8094221397076 42.8711185889998 2.93830355070781 T:C C T 10 0.522818519378046 0.707677933135394 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 74451073 A/G 1 15 21 36 7.15772220932931 10.979188906939 -3.82146669760966 A:G A G 10 0.522818519378046 0.243198816272398 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000335049:exon_74450897_74451081:RASSF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 74451092 T/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:G T G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 23 26 49 10.9751740543049 13.5932815038292 -2.61810744952425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.477323603996216 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 29 37 66 13.8382629380367 19.3442852169877 -5.50602227895104 A:G G A 10 0.522818519378046 0.177914257037335 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 20 27 47 9.54362961243908 14.1161000232072 -4.57247041076816 A:G A G 10 0.522818519378046 0.191521711833374 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 7 19 26 3.34027036435368 9.93355186818287 -6.5932815038292 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0104306512702234 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 44 49 93 20.995985147366 25.6181074495243 -4.62212230215828 A:G G A 10 0.522818519378046 0.351594861880979 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 A:G A G 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 76943947 G/A 1 147 141 288 70.1456776514272 73.7174112323045 -3.57173358087725 A:G G A 10 0.522818519378046 0.680092747189194 ENSG00000169245:ENST00000306602:exon_76943844_76943970:CXCL10;ENSG00000169245:ENST00000399485:exon_76943844_76943970:CXCL10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 12 11 23 5.72617776746345 5.75100371315851 -0.024825945695059 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 99993833 A/G 1 68 112 180 32.4483406822929 58.5556741703412 -26.1073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 9.8017843142936e-05 ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99993724_99993862:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99993337_99993862:ADH5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 104013796 T/C 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000164039:ENST00000296424:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000492366:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000464039:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000475058:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000432053:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000506521:exon_104013757_104013875:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000511354:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000504285:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000509245:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000513518:exon_104013533_104013853:BDH2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 104059542 G/A 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104059508_104059609:CENPE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 19 22 41 9.06644813181713 11.502007426317 -2.43555929449989 C:G C G 10 0.522818519378046 0.532312669097316 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 6 7 13 2.86308888373172 3.65972963564632 -0.796640751914599 T:C C T 10 0.522818519378046 0.783690543677666 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 104066461 A/G 1 13 20 33 6.2033592480854 10.4563703875609 -4.25301113947552 A:G A G 10 0.522818519378046 0.163764779261074 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000515478:exon_104066460_104066491:CENPE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 106395144 T/C 1 21 31 52 10.020811093061 16.2073741007194 -6.18656300765839 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0960446050353091 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000506815:exon_106395051_106395144:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 86 92 178 41.037607333488 48.0993037827802 -7.06169644929219 A:G A G 10 0.522818519378046 0.294467321704314 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 11 16 27 5.24899628684149 8.36509631004874 -3.11610002320724 A:C A C 10 0.522818519378046 0.252081759495933 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 123838758 A/G 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 129880770 G/A 1 15 13 28 7.15772220932931 6.7966407519146 0.361081457414712 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 A:T A T 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 21 10 31 10.020811093061 5.22818519378046 4.79262589928057 T:C C T 10 0.522818519378046 0.105115782894502 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 159636487 G/A 1 25 22 47 11.9295370155488 11.502007426317 0.427529589231836 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159636449_159636555:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159636449_159636555:PPID HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 159640428 T/C 1 16 22 38 7.63490368995126 11.502007426317 -3.86710373636575 T:C T C 10 0.522818519378046 0.255723585527227 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159640332_159640438:PPID HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 165118652 C/T 0 10 0 10 4.77181480621954 0 4.77181480621954 C C 10 0.522818519378046 0.00213796114358887 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 C:G G C 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 166259056 A/G 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000052802:ENST00000261507:exon_166258941_166259089:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000426682:exon_166258941_166259089:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000507013:exon_166258941_166259089:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000393766:exon_166258941_166259089:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000504317:exon_166258941_166259089:SC4MOL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 166263047 G/A 1 12 15 27 5.72617776746345 7.84227779067069 -2.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.446014558592695 ENSG00000052802:ENST00000261507:exon_166262903_166264312:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000426682:exon_166262903_166264224:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000393766:exon_166262903_166264181:SC4MOL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 T:G G T 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 13 1 14 6.2033592480854 0.522818519378046 5.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00208926982015458 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 12 1 13 5.72617776746345 0.522818519378046 5.2033592480854 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00381913495896194 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 170483300 C/T 1 14 10 24 6.68054072870736 5.22818519378046 1.4523555349269 T:C C T 10 0.522818519378046 0.683818962617994 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000509912:exon_170483288_170483347:NEK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 170634408 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 178359960 G/C 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 C:G G C 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000038002:ENST00000264595:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000446519:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000502310:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000506853:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000510635:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000510955:exon_178359899_178360011:AGA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 43 30 73 20.518803666744 15.6845555813414 4.83424808540264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.292040572064637 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 12 12 24 5.72617776746345 6.27382223253655 -0.547644465073105 A:G A G 10 0.522818519378046 0.841016689152556 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 186066995 G/A 1 123 111 234 58.6933221165003 58.0328556509631 0.660466465537233 A:G G A 10 0.522818519378046 0.947900306235775 ENSG00000151729:ENST00000281456:exon_186066913_186067053:SLC25A4;ENSG00000151729:ENST00000491736:exon_186066509_186067053:SLC25A4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 10 3 13 4.77181480621954 1.56845555813414 3.2033592480854 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0966494022259154 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 186283092 C/T 1 55 37 92 26.2449814342075 19.3442852169877 6.90069621721976 T:C C T 10 0.522818519378046 0.174638959649788 ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186283078_186283259:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000513433:exon_186283078_186283213:SNX25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 186321209 C/T 1 106 82 188 50.5812369459271 42.8711185889998 7.71011835692735 T:C C T 10 0.522818519378046 0.273888428370456 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186321171_186321395:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 190862126 A/G 0 91 0 91 43.4235147365978 0 43.4235147365978 A A 10 0.522818519378046 2.40186818818123e-26 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 190862142 C/T 0 101 0 101 48.1953295428174 0 48.1953295428174 C C 10 0.522818519378046 5.75208605337779e-29 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 190862154 T/C 1 100 5 105 47.7181480621954 2.61409259689023 45.1040554653052 T:C T C 10 0.522818519378046 2.8688867354453e-22 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 5 99 104 2.38590740310977 51.7590334184266 -49.3731260153168 T:G T G 10 0.522818519378046 8.15208914045992e-26 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 195318 T/C 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000185028:ENST00000328278:exon_194823_195468:LRRC14B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 29 22 51 13.8382629380367 11.502007426317 2.33625551171965 A:G G A 10 0.522818519378046 0.575950780436978 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 205574 G/A 1 22 32 54 10.497992573683 16.7301926200975 -6.23220004641449 A:G G A 10 0.522818519378046 0.102121287940859 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 235364 C/T 1 129 140 269 61.5564110002321 73.1945927129264 -11.6381817126944 T:C C T 10 0.522818519378046 0.160642850598480 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 442933 G/A 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 35 44 79 16.7013518217684 23.004014852634 -6.30266303086563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.176542664903821 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 1063998 G/A 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1063959_1064090:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1063959_1064090:SLC12A7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 1318491 G/A 1 136 119 255 64.8966813645857 62.2154038059875 2.68127755859827 A:G G A 10 0.522818519378046 0.754234039227944 ENSG00000049656:ENST00000320895:exon_1317859_1318568:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000507807:exon_1317868_1318568:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000503042:exon_1317983_1318568:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000320927:exon_1317983_1318568:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000503534:exon_1318290_1318568:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000515719:exon_1318414_1318568:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000506641:exon_1318470_1318568:CLPTM1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 35 34 69 16.7013518217684 17.7758296588536 -1.07447783708517 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.81062280971265 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 1799001 T/G 1 161 143 304 76.8262183801346 74.7630482710606 2.06317010907401 T:G T G 10 0.522818519378046 0.818653449541939 ENSG00000171421:ENST00000505818:exon_1798500_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000382647:exon_1798501_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000505059:exon_1798501_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000508987:exon_1798501_1799061:MRPL36;ENSG00000171421:ENST00000510999:exon_1798943_1799061:MRPL36 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 40 43 83 19.0872592248782 22.481196333256 -3.39393710837782 T:C C T 10 0.522818519378046 0.510040578565952 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 11 1 12 5.24899628684149 0.522818519378046 4.72617776746345 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0069569782863362 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 7878192 T/C 1 3 11 14 1.43154444186586 5.75100371315851 -4.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0293923794731207 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 7885959 A/G 1 4 14 18 1.90872592248782 7.31945927129264 -5.41073334880483 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0158768955559009 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7885898_7885967:MTRR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 6 15 21 2.86308888373172 7.84227779067069 -4.97918890693897 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0466436829881584 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 8 23 31 3.81745184497563 12.0248259456951 -8.20737410071943 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00355077350672445 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C T C 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 22 27 49 10.497992573683 14.1161000232072 -3.61810744952425 A:G A G 10 0.522818519378046 0.319461441552703 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 27 28 55 12.8838999767928 14.6389185425853 -1.75501856579253 T:C T C 10 0.522818519378046 0.686438726382289 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 93 75 168 44.3778776978417 39.2113889533534 5.16648874448827 A:G G A 10 0.522818519378046 0.440689021345642 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 19 22 41 9.06644813181713 11.502007426317 -2.43555929449989 T:C C T 10 0.522818519378046 0.532312669097316 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 34005899 C/T 1 3 15 18 1.43154444186586 7.84227779067069 -6.41073334880483 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00333640928554676 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_34005861_34006004:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_34005861_34006004:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_34005861_34006004:C1QTNF3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 T:C C T 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 42801268 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000507920:exon_42800921_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000509276:exon_42801030_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000514218:exon_42801036_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000513303:exon_42801207_42801433:SEPP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 43175103 C/T 1 12 8 20 5.72617776746345 4.18254815502437 1.54362961243908 T:C C T 10 0.522818519378046 0.512380593640314 ENSG00000172262:ENST00000510026:exon_43174549_43175836:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509156:exon_43174549_43175390:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000306938:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000399534:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000505606:exon_43174549_43176342:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509634:exon_43174549_43176349:ZNF131 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 43656074 C/T 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 T:C C T 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 11 14 25 5.24899628684149 7.31945927129264 -2.07046298445115 C:G G C 10 0.522818519378046 0.430012309906698 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 59893694 T/C 1 24 22 46 11.4523555349269 11.502007426317 -0.0496518913901181 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000035499:ENST00000265036:exon_59892739_59893741:DEPDC1B;ENSG00000035499:ENST00000453022:exon_59893456_59893741:DEPDC1B;ENSG00000035499:ENST00000512078:exon_59893495_59893741:DEPDC1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 10 15 25 4.77181480621954 7.84227779067069 -3.07046298445115 T:C T C 10 0.522818519378046 0.235495507223354 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 20 13 33 9.54362961243908 6.7966407519146 2.74698886052448 A:G G A 10 0.522818519378046 0.386012599657573 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 64956673 A/G 1 13 8 21 6.2033592480854 4.18254815502437 2.02081109306103 A:G A G 10 0.522818519378046 0.393742775407513 ENSG00000113597:ENST00000399438:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000512009:exon_64956526_64960211:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000438419:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000231526:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000505553:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000520525:exon_64956526_64956914:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000509234:exon_64956526_64956724:C5orf44 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 65084101 A/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65083945_65084311:NLN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C T C 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 66479477 C/T 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 T C T 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 67593363 T/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000145675:ENST00000521381:exon_67593240_67597649:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000521657:exon_67593240_67594581:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000396611:exon_67593240_67597647:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000274335:exon_67593240_67597649:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000320694:exon_67593240_67594411:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000336483:exon_67593240_67594411:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000518813:exon_67593240_67594433:PIK3R1;ENSG00000145675:ENST00000523872:exon_67593240_67594584:PIK3R1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 76 49 125 36.2657925272685 25.6181074495243 10.6476850777442 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0601366873034506 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 13 11 24 6.2033592480854 5.75100371315851 0.452355534926896 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 68709888 A/C 1 48 59 107 22.9047110698538 30.8462926433047 -7.94158157345093 A:C A C 10 0.522818519378046 0.146277689172281 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68709858_68710187:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000504177:exon_68709858_68710320:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68709858_68710628:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68709858_68710187:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68709858_68710626:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68709858_68710128:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68709858_68710082:RAD17 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 70798553 A/T 1 3 8 11 1.43154444186586 4.18254815502437 -2.75100371315851 A:T A T 10 0.522818519378046 0.131842010035085 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70798426_70798618:BDP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 44 37 81 20.995985147366 19.3442852169877 1.65169993037827 A:G A G 10 0.522818519378046 0.739699331266694 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 14 22 36 6.68054072870736 11.502007426317 -4.82146669760966 A:T A T 10 0.522818519378046 0.132728675601428 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 23 10 33 10.9751740543049 5.22818519378046 5.74698886052448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0545016337755219 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 74037386 T/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:T T A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000513331:exon_74037354_74037673:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74037354_74037434:GFM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 74077474 C/T 0 13 0 13 6.2033592480854 0 6.2033592480854 C C 10 0.522818519378046 0.000284563164675669 ENSG00000198780:ENST00000389156:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000514215:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510496:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510609:exon_74073401_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000380515:exon_74076956_74077833:FAM169A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 11 17 28 5.24899628684149 8.88791482942678 -3.63891854258529 A:C C A 10 0.522818519378046 0.188348939121894 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 29 36 65 13.8382629380367 18.8214666976097 -4.98320375957299 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.263643193471628 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 78610174 A/G 1 2 7 9 0.954362961243908 3.65972963564632 -2.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0962597694250242 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78610080_78610448:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78610080_78610674:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78610080_78610674:JMY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 41 39 80 19.5644407055001 20.3899222557438 -0.82548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 0.911029602353347 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 81549216 C/T 1 10 2 12 4.77181480621954 1.04563703875609 3.72617776746345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0409307209651302 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 15 3 18 7.15772220932931 1.56845555813414 5.58926665119517 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0086209268116001 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 358 508 866 170.83097006266 265.591807844047 -94.7608377813878 A:T:G A G 10 0.522818519378046 1.36120312051480e-10 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 17 9 26 8.11208517057322 4.70536667440241 3.4067184961708 T:C C T 10 0.522818519378046 0.238700034690363 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 38 26 64 18.1328962636343 13.5932815038292 4.53961475980505 C:G C G 10 0.522818519378046 0.263271627081412 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 5 10 15 2.38590740310977 5.22818519378046 -2.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.195994901009809 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 112349070 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112349018_112355820:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112349018_112349546:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112349018_112356667:DCP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 15 22 37 7.15772220932931 11.502007426317 -4.3442852169877 A:T T A 10 0.522818519378046 0.187776635351946 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 20 9 29 9.54362961243908 4.70536667440241 4.83826293803667 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0932207570937154 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 13 8 21 6.2033592480854 4.18254815502437 2.02081109306103 T:C C T 10 0.522818519378046 0.393742775407513 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 118451873 T/G 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:G T G 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000172869:ENST00000503802:exon_118451853_118452031:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118451853_118452031:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514151:exon_118451853_118452031:DMXL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 118811533 G/A 1 11 3 14 5.24899628684149 1.56845555813414 3.68054072870736 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0609433495022194 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512841:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503168:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507695:exon_118811519_118811568:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515250:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118811519_118811565:HSD17B4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 122682348 A/G 1 13 7 20 6.2033592480854 3.65972963564632 2.54362961243908 A:G A G 10 0.522818519378046 0.273132298373759 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 122708383 G/A 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122708344_122708466:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122708344_122708466:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122708344_122708466:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122708344_122708466:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122708344_122708466:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122708344_122708466:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122708344_122708466:CEP120 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 123983915 G/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123982372_123984826:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123982372_123984826:ZNF608 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 126140522 T/C 1 45 49 94 21.4731666279879 25.6181074495243 -4.14494082153633 T:C T C 10 0.522818519378046 0.410071190644272 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000472034:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000492190:exon_126140468_126140606:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000395354:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000463908:exon_126140468_126140624:LMNB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 126171974 C/T 1 59 42 101 28.1537073566953 21.9583778138779 6.19532954281735 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.232737935481754 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126171915_126172706:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126171915_126172712:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126171915_126172263:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000484340:exon_126171915_126172366:LMNB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 130500842 A/G 1 940 883 1823 448.550591784637 461.648752610815 -13.0981608261779 A:T:C:G A G 10 0.522818519378046 0.542214343694796 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130500788_130501178:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130500788_130500933:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130500788_130500994:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130500753_130501026:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130500753_130500913:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130500788_130501018:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130500788_130501034:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130500753_130500949:HINT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 131602166 T/C 1 14 1 15 6.68054072870736 0.522818519378046 6.15772220932931 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00113963630404871 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000463615:exon_131602157_131602454:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000418373:exon_131602157_131602238:PDLIM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 131607721 C/T 1 11 1 12 5.24899628684149 0.522818519378046 4.72617776746345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0069569782863362 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131607718_131609147:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131607718_131608025:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000462597:exon_131607718_131607756:PDLIM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 42 31 73 20.0416221861221 16.2073741007194 3.83424808540264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.412745803401984 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 0 24 0 24 11.4523555349269 0 11.4523555349269 C C 10 0.522818519378046 1.93376477818270e-07 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 167 165 332 79.6893072638663 86.2650556973776 -6.57574843351128 A:G A G 10 0.522818519378046 0.475587054213474 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 134670741 C/T 1 126 127 253 60.1248665583662 66.3979519610118 -6.27308540264564 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.450335919882791 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 116 127 243 55.3530517521467 66.3979519610118 -11.0449002088652 A:G A G 10 0.522818519378046 0.158265924096242 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 137892170 G/A 1 437 441 878 208.528307031794 230.562967045718 -22.0346600139244 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.137296780125336 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000524109:exon_137892141_137892281:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000512328:exon_137892141_137892262:HSPA9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 88 148 236 41.9919702947319 77.3771408679508 -35.3851705732189 T:C T C 10 0.522818519378046 4.39474684966685e-06 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 102 96 198 48.6725110234393 50.1905778602924 -1.51806683685312 A:G G A 10 0.522818519378046 0.831417706950354 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 19 31 50 9.06644813181713 16.2073741007194 -7.1409259689023 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0475892116742089 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 A:G A G 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 138858034 C/A 1 11 23 34 5.24899628684149 12.0248259456951 -6.77582965885356 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0246572777823146 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138857937_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138857953_138858093:TMEM173 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 138860779 G/T 1 10 20 30 4.77181480621954 10.4563703875609 -5.68455558134138 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0440617368713981 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138860744_138860927:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138860744_138860953:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138860744_138860927:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138860744_138861046:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138860744_138860927:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138860744_138860927:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138860771_138860927:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503838:exon_138860375_138860934:TMEM173 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 8 17 25 3.81745184497563 8.88791482942678 -5.07046298445115 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0464376219741673 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 57 81 138 27.1993443954514 42.3483000696217 -15.1489556741704 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0104748928986459 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 139918962 G/A 1 39 25 64 18.6100777442562 13.0704629844512 5.53961475980505 A:G G A 10 0.522818519378046 0.171130598681427 ENSG00000131503:ENST00000360839:exon_139918944_139919441:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000310356:exon_139918944_139919003:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000431508:exon_139918944_139919434:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000433049:exon_139918944_139919433:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000435794:exon_139918944_139919441:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000432301:exon_139918944_139919434:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000474060:exon_139918504_139921866:ANKHD1-EIF4EBP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 173 104 277 82.552396147598 54.3731260153168 28.1792701322812 T:G G T 10 0.522818519378046 0.00073213603810987 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:G G A 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 139946888 G/A 1 50 50 100 23.8590740310977 26.1409259689023 -2.2818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.689283478790372 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 140052271 A/G 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140051963_140053709:WDR55;ENSG00000255017:ENST00000533480:exon_140052030_140052491:AC116353.1;ENSG00000254679:ENST00000523844:exon_140052030_140052491:DND1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 140057509 C/T 1 95 69 164 45.3322406590856 36.0744778370852 9.25776282200045 T:C C T 10 0.522818519378046 0.159528491076362 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 140080460 C/T 1 43 30 73 20.518803666744 15.6845555813414 4.83424808540264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.292040572064637 ENSG00000146007:ENST00000519913:exon_140079747_140080497:ZMAT2;ENSG00000146007:ENST00000274712:exon_140080404_140080497:ZMAT2;ENSG00000146007:ENST00000515493:exon_140080404_140080497:ZMAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 12 11 23 5.72617776746345 5.75100371315851 -0.024825945695059 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 141021096 G/A 1 19 19 38 9.06644813181713 9.93355186818287 -0.867103736365749 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.871359257968777 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141019979_141021179:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141020549_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141020554_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518160:exon_141020776_141021130:FCHSD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 36 22 58 17.1785333023903 11.502007426317 5.67652587607333 A:G G A 10 0.522818519378046 0.149112742291541 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 T:C T C 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149212471 G/A 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 20 27 47 9.54362961243908 14.1161000232072 -4.57247041076816 T:C C T 10 0.522818519378046 0.191521711833374 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149755340 G/T 1 22 23 45 10.497992573683 12.0248259456951 -1.52683337201207 T:G G T 10 0.522818519378046 0.657759788116952 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 30 33 63 14.3154444186586 17.2530111394755 -2.9375667208169 A:G A G 10 0.522818519378046 0.528663385754924 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 39 39 78 18.6100777442562 20.3899222557438 -1.77984451148759 T:C T C 10 0.522818519378046 0.734328743085171 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 23 29 52 10.9751740543049 15.1617370619633 -4.18656300765839 T:C C T 10 0.522818519378046 0.268241961090490 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 150436503 G/C 1 223 282 505 106.411470178696 147.434822464609 -41.0233522859132 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.000299872113796294 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150436327_150436518:TNIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 928 803 1731 442.824414017173 419.823271060571 23.0011429566023 A:G A G 10 0.522818519378046 0.278928000035708 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 391 288 679 186.577958923184 150.571733580877 36.0062253423067 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00566545757818648 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 23 47 70 10.9751740543049 24.5724704107682 -13.5972963564632 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00116161213248136 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 153792490 C/T 1 14 3 17 6.68054072870736 1.56845555813414 5.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0142527225324668 ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153792449_153792565:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153792449_153792565:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153792449_153792565:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000517958:exon_153792449_153792565:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000427235:exon_153792449_153792565:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377657:exon_153792449_153792565:GALNT10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 17 23 40 8.11208517057322 12.0248259456951 -3.91274077512184 A:G G A 10 0.522818519378046 0.267804590856059 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154278049 T/C 1 14 18 32 6.68054072870736 9.41073334880483 -2.73019262009747 T:C T C 10 0.522818519378046 0.378459639583063 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154278000_154278210:GEMIN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 T:C C T 10 0.522818519378046 0.274460962299708 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 A:C A C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154306972 T/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C T C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 164 178 342 78.2577628220005 93.0616964492922 -14.8039336272917 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.116414837903358 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 27 21 48 12.8838999767928 10.979188906939 1.90471106985379 T:C C T 10 0.522818519378046 0.665310788125509 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 162911075 C/A 1 28 31 59 13.3610814574147 16.2073741007194 -2.84629264330472 A:C C A 10 0.522818519378046 0.515249008654251 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162911075_162911251:HMMR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 14 8 22 6.68054072870736 4.18254815502437 2.49799257368299 T:C C T 10 0.522818519378046 0.393878100948442 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 22 20 42 10.497992573683 10.4563703875609 0.0416221861220674 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 8 31 39 3.81745184497563 16.2073741007194 -12.3899222557438 T:C T C 10 0.522818519378046 7.21366147081322e-05 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 11 11 22 5.24899628684149 5.75100371315851 -0.502007426317013 T:G G T 10 0.522818519378046 0.834912590229453 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 56 58 114 26.7221629148294 30.3234741239267 -3.60131120909725 C:G C G 10 0.522818519378046 0.512872672025067 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 71 52 123 33.8798851241587 27.1865630076584 6.69332211650034 T:C C T 10 0.522818519378046 0.24129790920196 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169469088 G/C 1 49 46 95 23.3818925504757 24.0496518913901 -0.667759340914373 C:G G C 10 0.522818519378046 0.918431600059486 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169469017_169469136:DOCK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 169805956 C/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 C:G C G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169805168_169805977:KCNMB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 34 47 81 16.2241703411464 24.5724704107682 -8.34830006962173 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0746492885115799 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 34 36 70 16.2241703411464 18.8214666976097 -2.59729635646322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.551647936167329 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 30 35 65 14.3154444186586 18.2986481782316 -3.98320375957299 T:C T C 10 0.522818519378046 0.384922305233151 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 172196711 G/T 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 T:G G T 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000120129:ENST00000239223:exon_172196578_172196797:DUSP1;ENSG00000120129:ENST00000457103:exon_172196578_172196797:DUSP1;ENSG00000120129:ENST00000434080:exon_172196578_172196797:DUSP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 172585795 C/T 1 28 24 52 13.3610814574147 12.5476444650731 0.813436992341606 T:C C T 10 0.522818519378046 0.889951170191144 ENSG00000113734:ENST00000231668:exon_172585747_172585848:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000351486:exon_172585747_172585848:BNIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 172590789 C/A 1 51 25 76 24.3362555117197 13.0704629844512 11.2657925272685 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0111291091721376 ENSG00000113734:ENST00000231668:exon_172590728_172591343:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000351486:exon_172590728_172591390:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000352523:exon_172590728_172591344:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000393770:exon_172590728_172591060:BNIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 172590833 T/G 1 52 38 90 24.8134369923416 19.8671037363657 4.94633325597586 T:G T G 10 0.522818519378046 0.342377062184648 ENSG00000113734:ENST00000231668:exon_172590728_172591343:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000351486:exon_172590728_172591390:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000352523:exon_172590728_172591344:BNIP1;ENSG00000113734:ENST00000393770:exon_172590728_172591060:BNIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 17 18 35 8.11208517057322 9.41073334880483 -1.29864817823161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.736066735208448 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 174949412 T/C 1 23 16 39 10.9751740543049 8.36509631004874 2.61007774425621 T:C T C 10 0.522818519378046 0.427159104010122 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174949378_174949425:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174949378_174951106:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174949378_174949425:SFXN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 23 19 42 10.9751740543049 9.93355186818287 1.04162218612207 A:G G A 10 0.522818519378046 0.760344817138562 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 6 12 18 2.86308888373172 6.27382223253655 -3.41073334880483 T:C C T 10 0.522818519378046 0.155289099312309 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 175779725 G/A 1 17 13 30 8.11208517057322 6.7966407519146 1.31544441865862 A:G G A 10 0.522818519378046 0.716164107637729 ENSG00000122203:ENST00000298569:exon_175779625_175779751:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000393725:exon_175779625_175779751:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000432806:exon_175779625_175779751:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000510164:exon_175779625_175779751:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000506983:exon_175779625_175779751:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000503082:exon_175779692_175779751:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000504688:exon_175779706_175779751:KIAA1191 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 5 13 18 2.38590740310977 6.7966407519146 -4.41073334880483 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0562237849586215 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 42 25 67 20.0416221861221 13.0704629844512 6.97115920167091 A:G G A 10 0.522818519378046 0.111191416798560 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176517797 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000160867:ENST00000292408:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000503708:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000393648:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000502906:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000292410:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000453701:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000393637:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000430285:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000426612:exon_176517746_176518097:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000509511:exon_176517746_176517826:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000377207:exon_176517755_176518105:FGFR4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 82 78 160 39.1288814110002 40.7798445114876 -1.65096310048736 C:G G C 10 0.522818519378046 0.81266771944483 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 73 50 123 34.8342480854026 26.1409259689023 8.69332211650034 A:G A G 10 0.522818519378046 0.125172119188577 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 34 33 67 16.2241703411464 17.2530111394755 -1.02884079832908 T:C T C 10 0.522818519378046 0.80812064071766 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 176931341 G/A 0 153 0 153 73.008766535159 0 73.008766535159 G G 10 0.522818519378046 1.34909820874433e-43 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176930751_176931661:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176930785_176931661:DOK3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 1909 1 1910 910.93944650731 0.522818519378046 910.416627987932 T:C T C 10 0.522818519378046 0 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 178294059 T/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178293977_178294072:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000520377:exon_178293977_178294072:ZNF354B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 178294060 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178293977_178294072:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000520377:exon_178293977_178294072:ZNF354B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179020622 T/C 1 34 41 75 16.2241703411464 21.4355592944999 -5.21138895335345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.248506065400619 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508609:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179020479_179020646:RUFY1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179025789 G/A 1 54 49 103 25.7677999535855 25.6181074495243 0.14969250406126 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502531:exon_179025693_179025822:RUFY1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 44 34 78 20.995985147366 17.7758296588536 3.22015548851241 A:G G A 10 0.522818519378046 0.497693309426213 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 329 250 579 156.992707124623 130.704629844512 26.2880772801113 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.0304524042506229 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 378 317 695 180.374599675099 165.733470642841 14.641129032258 A:G G A 10 0.522818519378046 0.270997292552138 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 49 102 151 23.3818925504757 53.3274889765607 -29.945596426085 T:C T C 10 0.522818519378046 1.14205010316463e-06 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 24 35 59 11.4523555349269 18.2986481782316 -6.84629264330471 T:C:G G T 10 0.522818519378046 0.0896207278945567 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179280379 T/C 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 T:C T C 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000524068:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522157:exon_179280197_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523835:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519213:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519318:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000517338:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519398:exon_179280283_179280437:C5orf45 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 21 49 70 10.020811093061 25.6181074495243 -15.5972963564632 T:G T G 10 0.522818519378046 0.000182121808714659 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 179996111 C/T 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C C T 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000113300:ENST00000261951:exon_179996110_179996340:CNOT6;ENSG00000113300:ENST00000393356:exon_179996110_179996340:CNOT6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 40 61 101 19.0872592248782 31.8919296820608 -12.8046704571826 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0124656753495188 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 9 13 22 4.29463332559759 6.7966407519146 -2.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.295879508077689 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 C:G G C 10 0.522818519378046 0.586262826765089 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 0 76 0 76 36.2657925272685 0 36.2657925272685 G G 10 0.522818519378046 4.2528849922378e-22 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 75 45 120 35.7886110466466 23.5268333720121 12.2617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0280059037972491 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 19 11 30 9.06644813181713 5.75100371315851 3.31544441865862 T:C C T 10 0.522818519378046 0.273853776727649 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 4049321 C/T 1 13 4 17 6.2033592480854 2.09127407751218 4.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0529870529506475 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4049250_4049340:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4049250_4049340:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000481109:exon_4049250_4049340:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000463634:exon_4049250_4049340:PRPF4B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 4119492 T/C 1 39 56 95 18.6100777442562 29.2778370851706 -10.6677593409144 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0309008548154263 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4117542_4119509:PECI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 9 3 12 4.29463332559759 1.56845555813414 2.72617776746345 A:G A G 10 0.522818519378046 0.151024795833636 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 10751379 C/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000137210:ENST00000472062:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000379542:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000491103:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000480194:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000475942:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000467317:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000478732:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000486421:exon_10751366_10751467:TMEM14B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 7 11 18 3.34027036435368 5.75100371315851 -2.41073334880483 T:C T C 10 0.522818519378046 0.3459472668797 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 12294258 A/G 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12294174_12294329:EDN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 29 25 54 13.8382629380367 13.0704629844512 0.767799953585515 T:G G T 10 0.522818519378046 0.892066012410792 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 13365041 C/T 1 24 15 39 11.4523555349269 7.84227779067069 3.6100777442562 T:C C T 10 0.522818519378046 0.265567806032608 ENSG00000145990:ENST00000379287:exon_13358062_13365894:GFOD1;ENSG00000145990:ENST00000379284:exon_13358062_13365894:GFOD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 16145325 A/G 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 16290761 T/A 1 13 18 31 6.2033592480854 9.41073334880483 -3.20737410071943 A:T T A 10 0.522818519378046 0.282918702133609 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16290693_16290852:GMPR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 17626299 C/T 1 32 34 66 15.2698073799025 17.7758296588536 -2.50602227895104 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.540897382672583 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17626039_17626395:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17626039_17626395:NUP153 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 17626336 T/C 1 21 25 46 10.020811093061 13.0704629844512 -3.04965189139012 T:C T C 10 0.522818519378046 0.379919052966865 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17626039_17626395:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17626039_17626395:NUP153 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 17637386 G/A 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 80 82 162 38.1745184497563 42.8711185889998 -4.69660013924345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.479593020953115 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 24 21 45 11.4523555349269 10.979188906939 0.473166627987927 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26031962 G/A 1 15 12 27 7.15772220932931 6.27382223253655 0.883899976792757 A:G G A 10 0.522818519378046 0.847912280670244 ENSG00000124693:ENST00000244661:exon_26031878_26032288:HIST1H3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26032105 G/A 1 19 17 36 9.06644813181713 8.88791482942678 0.178533302390344 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000124693:ENST00000244661:exon_26031878_26032288:HIST1H3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26104382 C/T 1 95 82 177 45.3322406590856 42.8711185889998 2.46112207008586 T:C C T 10 0.522818519378046 0.763543744538938 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26184082 C/G 1 34 25 59 16.2241703411464 13.0704629844512 3.15370735669529 C:G C G 10 0.522818519378046 0.436566362051657 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 29 35 64 13.8382629380367 18.2986481782316 -4.46038524019494 A:G G A 10 0.522818519378046 0.316820294147914 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26189312 C/G 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 C:G C G 10 0.522818519378046 0.08126068111218 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:C C A 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 22 4 26 10.497992573683 2.09127407751218 8.4067184961708 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00117302018431650 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26199822 A/G 1 1 9 10 0.477181480621954 4.70536667440241 -4.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00884457321564113 ENSG00000197846:ENST00000359985:exon_26199748_26200942:HIST1H2BF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 24 18 42 11.4523555349269 9.41073334880483 2.04162218612207 T:C T C 10 0.522818519378046 0.541566201263107 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 A:G A G 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 1 8 9 0.477181480621954 4.18254815502437 -3.70536667440241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0168504456980632 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26252148 C/T 1 11 13 24 5.24899628684149 6.7966407519146 -1.5476444650731 T:C C T 10 0.522818519378046 0.546956746198156 ENSG00000197459:ENST00000356350:exon_26251879_26252303:HIST1H2BH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 22 18 40 10.497992573683 9.41073334880483 1.08725922487816 A:G A G 10 0.522818519378046 0.754272363653691 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 69 1 70 32.9255221629148 0.522818519378046 32.4027036435368 A:T:C T A 10 0.522818519378046 1.34536852844133e-18 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 0 53 0 53 25.2906184729636 0 25.2906184729636 G G 10 0.522818519378046 1.73350957633005e-15 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26374571 G/A 1 62 57 119 29.5852517985611 29.8006556045486 -0.215403805987478 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26374555_26374601:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26374555_26374601:BTN3A2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 125 97 222 59.6476850777442 50.7133963796705 8.93428869807379 A:G G A 10 0.522818519378046 0.253360818751171 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 25 26 51 11.9295370155488 13.5932815038292 -1.66374448828035 A:G A G 10 0.522818519378046 0.675704133808493 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 46 43 89 21.9503481086099 22.481196333256 -0.530848224646096 A:G A G 10 0.522818519378046 0.915947014371401 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 27833174 A/G 1 8 15 23 3.81745184497563 7.84227779067069 -4.02482594569506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0993443127486353 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 27835131 G/C 1 17 10 27 8.11208517057322 5.22818519378046 2.88389997679276 C:G G C 10 0.522818519378046 0.336212248871896 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 27835272 T/C 1 16 8 24 7.63490368995126 4.18254815502437 3.4523555349269 T:C T C 10 0.522818519378046 0.21957374400876 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 27839746 T/C 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 T:C T C 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 27858421 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197153:ENST00000359303:exon_27858160_27858570:HIST1H3J;ENSG00000197153:ENST00000479986:exon_27858413_27858588:HIST1H3J HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 28195521 A/G 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000137185:ENST00000531981:exon_28195443_28195736:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000425468:exon_28195468_28195615:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000252207:exon_28195468_28195615:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000531979:exon_28195468_28195615:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000418166:exon_28195468_28195576:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000527436:exon_28195468_28197008:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000526391:exon_28195468_28195615:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000527844:exon_28195468_28195615:ZNF193 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 28264717 C/T 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 28269663 A/G 1 7 4 11 3.34027036435368 2.09127407751218 1.24899628684149 A:G A G 10 0.522818519378046 0.553506961761619 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 234 183 417 111.660466465537 95.6757890461824 15.9846774193548 A:G A G 10 0.522818519378046 0.128496423300873 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 29910330 G/A 1 9 11 20 4.29463332559759 5.75100371315851 -1.45637038756092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.65556110720683 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 186 185 371 88.7557553956834 96.7214260849385 -7.96567068925508 A:T:C C A 10 0.522818519378046 0.435682529371886 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30071279 T/G 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204616:ENST00000471695:exon_30071249_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376734:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000496062:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376728:exon_30070676_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000477254:exon_30071139_30071566:TRIM31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30071330 C/T 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000204616:ENST00000471695:exon_30071249_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376734:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000496062:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376728:exon_30070676_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000477254:exon_30071139_30071566:TRIM31 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 31 35 66 14.7926258992806 18.2986481782316 -3.50602227895104 T:C T C 10 0.522818519378046 0.391800718462847 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 20 20 40 9.54362961243908 10.4563703875609 -0.91274077512184 T:C C T 10 0.522818519378046 0.874522810547516 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 12 16 28 5.72617776746345 8.36509631004874 -2.63891854258529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.348462366114306 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 46 27 73 21.9503481086099 14.1161000232072 7.83424808540264 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0783457697301191 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 46 27 73 21.9503481086099 14.1161000232072 7.83424808540264 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0783457697301191 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 544 480 1024 259.586725458343 250.952889301462 8.6338361568809 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.594990784750523 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30633327 G/A 1 23 33 56 10.9751740543049 17.2530111394755 -6.27783708517058 A:G G A 10 0.522818519378046 0.108214679730639 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30633256_30633510:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000415603:exon_30633256_30633510:DHX16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 97 111 208 46.2866036203295 58.0328556509631 -11.7462520306336 A:G G A 10 0.522818519378046 0.110386271110365 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 499 359 858 238.113558830355 187.691848456719 50.4217103736365 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000623744189014807 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30698541 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30698459_30698877:FLOT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 30709364 G/T 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:G G T 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000137312:ENST00000484168:exon_30708967_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000484693:exon_30709131_30709980:FLOT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31112484 C/T 1 50 41 91 23.8590740310977 21.4355592944999 2.42351473659781 T:C C T 10 0.522818519378046 0.674965188235195 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112464_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112406_31112565:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 39 53 92 18.6100777442562 27.7093815270364 -9.09930378278023 A:C C A 10 0.522818519378046 0.06062817026059 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31118898 A/T 1 15 22 37 7.15772220932931 11.502007426317 -4.3442852169877 A:T A T 10 0.522818519378046 0.187776635351946 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118732_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118736_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31118644_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31118662_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31118752_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31118847_31118899:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31118869_31118899:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 16 14 30 7.63490368995126 7.31945927129264 0.315444418658619 A:C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31122482 G/A 1 19 19 38 9.06644813181713 9.93355186818287 -0.867103736365749 A:G G A 10 0.522818519378046 0.871359257968777 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 1 17 20 37 8.11208517057322 10.4563703875609 -2.3442852169877 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511342651330165 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 20 7 27 9.54362961243908 3.65972963564632 5.88389997679276 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0322344835346418 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31129310 C/T 1 25 18 43 11.9295370155488 9.41073334880483 2.51880366674402 T:C C T 10 0.522818519378046 0.450907783756556 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129261_31129354:TCF19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31129707 C/T 1 28 18 46 13.3610814574147 9.41073334880483 3.95034810860988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.301568903052759 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 2464 2552 5016 1175.77516825249 1334.23286145277 -158.457693200279 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 7.903049657042e-06 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 2751 1280 4031 1312.726253191 669.207704803899 643.518548387096 T:C:G C G 10 0.522818519378046 5.33652587286635e-94 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 2102 113 2215 1003.03547226735 59.0784926897192 943.956979577628 T:C C T 10 0.522818519378046 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 126 1822 1948 60.1248665583662 952.5753423068 -892.450475748434 A:C:G C G 10 0.522818519378046 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 1436 95 1531 685.232606173126 49.6677593409144 635.564846832212 A:T:C:G G T 10 0.522818519378046 2.55230946161612e-282 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 1533 94 1627 731.519209793456 49.1449408215363 682.374268971919 T:C C T 10 0.522818519378046 5.64615860221856e-308 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 792 1 793 377.927732652588 0.522818519378046 377.40491413321 A:G G A 10 0.522818519378046 3.94750972432924e-221 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 24 4 28 11.4523555349269 2.09127407751218 9.36108145741471 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000412315040126634 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 27 4 31 12.8838999767928 2.09127407751218 10.7926258992806 T:C T C 10 0.522818519378046 8.27096843970204e-05 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1640 1101 2741 782.577628220004 575.623189835229 206.954438384776 A:T:C:G C T 10 0.522818519378046 2.17723739002178e-15 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31431813 A/G 1 30 32 62 14.3154444186586 16.7301926200975 -2.41474820143885 A:G A G 10 0.522818519378046 0.611490892566704 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 31 31 62 14.7926258992806 16.2073741007194 -1.41474820143885 T:C C T 10 0.522818519378046 0.79956619292812 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 C:G C G 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 7 1 8 3.34027036435368 0.522818519378046 2.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0725928624225001 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 49 51 100 23.3818925504757 26.6637444882803 -3.2818519378046 A:C C A 10 0.522818519378046 0.548616764590378 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 13 13 26 6.2033592480854 6.7966407519146 -0.593281503829196 A:G A G 10 0.522818519378046 0.846541780450938 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 108 90 198 51.535599907171 47.0536667440241 4.48193316314689 A:G G A 10 0.522818519378046 0.569384576513782 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 206 210 416 98.2993850081225 109.79188906939 -11.4925040612672 A:G A G 10 0.522818519378046 0.259497294317474 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 153 156 309 73.008766535159 81.5596890229752 -8.55092248781622 C:G C G 10 0.522818519378046 0.33358767801872 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 221 202 423 105.457107217452 105.609340914365 -0.152233696913456 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 12 8 20 5.72617776746345 4.18254815502437 1.54362961243908 C:G G C 10 0.522818519378046 0.512380593640314 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 70 106 176 33.4027036435368 55.4187630540729 -22.0160594105361 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00111586569713123 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 51 46 97 24.3362555117197 24.0496518913901 0.286603620329537 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31721033 G/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G G A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31727897 C/T 1 10 5 15 4.77181480621954 2.61409259689023 2.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 0.309360911266949 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000494646:exon_31727867_31727950:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31727867_31727993:MSH5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31747011 G/A 1 91 99 190 43.4235147365978 51.7590334184266 -8.33551868182875 A:G G A 10 0.522818519378046 0.245287947193882 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000463184:exon_31747007_31747069:VARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 C:G G C 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 9 6 15 4.29463332559759 3.13691111626828 1.15772220932931 T:G G T 10 0.522818519378046 0.61292925009842 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31777946 C/T 1 1 7 8 0.477181480621954 3.65972963564632 -3.18254815502437 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0318332254503089 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31847835 C/T 1 129 134 263 61.5564110002321 70.0576815966582 -8.50127059642611 T:C C T 10 0.522818519378046 0.29485880513429 ENSG00000204371:ENST00000478491:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000461880:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000494816:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31847542_31848041:EHMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 T:C T C 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 12 12 24 5.72617776746345 6.27382223253655 -0.547644465073105 A:C A C 10 0.522818519378046 0.841016689152556 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 60 52 112 28.6308888373172 27.1865630076584 1.44432582965885 T:C T C 10 0.522818519378046 0.850075294291526 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 59 61 120 28.1537073566953 31.8919296820608 -3.73822232536552 C:G G C 10 0.522818519378046 0.522959633592473 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 1 52 3 55 24.8134369923416 1.56845555813414 23.2449814342075 A:G G A 10 0.522818519378046 7.9828184537606e-12 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 130 58 188 62.033592480854 30.3234741239267 31.7101183569273 A:G A G 10 0.522818519378046 3.46118243454123e-06 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 218 244 462 104.025562775586 127.567718728243 -23.5421559526573 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0286469998583126 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 465 435 900 221.889388489209 227.42605592945 -5.53666744024142 A:C C A 10 0.522818519378046 0.71372289688 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2864 2808 5672 1366.64776050128 1468.07440241355 -101.426641912277 A:C:G A C 10 0.522818519378046 0.0072489905839274 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 2266 2241 4507 1081.29323508935 1171.6363019262 -90.3430668368535 A:T:C:G T G 10 0.522818519378046 0.00726905909900673 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 21 5 26 10.020811093061 2.61409259689023 7.4067184961708 A:G G A 10 0.522818519378046 0.004915738641318 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32782149 G/A 1 29 8 37 13.8382629380367 4.18254815502437 9.6557147830123 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00147542456097177 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782147_32782369:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32783086 A/G 1 6 14 20 2.86308888373172 7.31945927129264 -4.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.070687716479435 ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32782821_32783090:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32782821_32783090:HLA-DOB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 49 32 81 23.3818925504757 16.7301926200975 6.65169993037827 T:C C T 10 0.522818519378046 0.149004662514777 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 477 423 900 227.615566256672 221.152233696913 6.46333255975858 T:C T C 10 0.522818519378046 0.688874222964735 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 146 115 261 69.6684961708053 60.1241297284753 9.54436644232999 A:T:C T C 10 0.522818519378046 0.239807705913468 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 481 429 910 229.52429217916 224.289144813182 5.23514736597812 A:G G A 10 0.522818519378046 0.740073808444309 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 83 88 171 39.6060628916222 46.0080297052681 -6.40196681364587 A:G G A 10 0.522818519378046 0.358367957884968 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 7 23 30 3.34027036435368 12.0248259456951 -8.68455558134138 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00158309082568001 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 5 22 27 2.38590740310977 11.502007426317 -9.11610002320724 T:G G T 10 0.522818519378046 0.000394694816684314 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32974934 G/A 1 15 6 21 7.15772220932931 3.13691111626828 4.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0848273583540288 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974857_32974992:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 10 14 24 4.77181480621954 7.31945927129264 -2.5476444650731 T:C C T 10 0.522818519378046 0.314549779910552 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 643 297 940 306.827692039916 155.27710025528 151.550591784637 T:C T C 10 0.522818519378046 1.32032965383876e-23 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 689 343 1032 328.778040148526 179.32675214667 149.451288001857 T:C C T 10 0.522818519378046 4.82958584009732e-21 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 628 237 865 299.669969830587 123.907989092597 175.76198073799 T:C T C 10 0.522818519378046 3.44440978316848e-34 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33162540 C/G 1 25 34 59 11.9295370155488 17.7758296588536 -5.84629264330471 C:G C G 10 0.522818519378046 0.151381857568216 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33161997_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483821:exon_33162441_33162606:RXRB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 34 22 56 16.2241703411464 11.502007426317 4.72216291482942 A:G G A 10 0.522818519378046 0.229710547866575 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33169281 G/A 1 34 30 64 16.2241703411464 15.6845555813414 0.539614759805056 A:G G A 10 0.522818519378046 0.901262481659945 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 66 50 116 31.493977721049 26.1409259689023 5.35305175214666 A:G G A 10 0.522818519378046 0.352927745321044 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33260215 C/T 1 16 12 28 7.63490368995126 6.27382223253655 1.36108145741471 T:C C T 10 0.522818519378046 0.706426464838565 ENSG00000237441:ENST00000491168:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000483151:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000437840:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000466866:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000497454:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000421215:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000471319:exon_33260207_33260321:RGL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33281842 G/T 1 10 3 13 4.77181480621954 1.56845555813414 3.2033592480854 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0966494022259154 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33281843 A/T 1 8 3 11 3.81745184497563 1.56845555813414 2.24899628684149 A:T A T 10 0.522818519378046 0.231920878900205 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33281782_33282164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33281782_33282028:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33281782_33282031:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000458089:exon_33281782_33281989:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000467025:exon_33281782_33281992:TAPBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33286825 G/A 1 138 109 247 65.8510443258296 56.987218612207 8.86382571362263 A:G G A 10 0.522818519378046 0.278950837300934 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33286774_33286996:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33286774_33286996:DAXX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 93 86 179 44.3778776978417 44.962392666512 -0.584514968670241 A:G A G 10 0.522818519378046 0.940486560526474 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33648144 C/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33648106_33648231:ITPR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 T:C C T 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33658780 C/T 1 20 20 40 9.54362961243908 10.4563703875609 -0.91274077512184 T:C C T 10 0.522818519378046 0.874522810547516 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33658694_33658886:ITPR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 24 35 59 11.4523555349269 18.2986481782316 -6.84629264330471 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0896207278945567 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 34622496 G/A 1 26 14 40 12.4067184961708 7.31945927129264 5.08725922487816 A:G G A 10 0.522818519378046 0.115500203075359 ENSG00000196821:ENST00000374023:exon_34622402_34622556:C6orf106;ENSG00000196821:ENST00000374026:exon_34622402_34622556:C6orf106;ENSG00000196821:ENST00000374021:exon_34622402_34622556:C6orf106 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 36867376 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000416621:exon_36867202_36867409:C6orf89 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 6 15 21 2.86308888373172 7.84227779067069 -4.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0466436829881584 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 37443950 G/A 1 13 20 33 6.2033592480854 10.4563703875609 -4.25301113947552 A:G G A 10 0.522818519378046 0.163764779261074 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 27 35 62 12.8838999767928 18.2986481782316 -5.41474820143885 A:T T A 10 0.522818519378046 0.203321932995064 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 35 22 57 16.7013518217684 11.502007426317 5.19934439545138 A:G G A 10 0.522818519378046 0.185874069707771 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 39158816 C/T 0 0 10 10 0 5.22818519378046 -5.22818519378046 T C T 10 0.522818519378046 0.000612118920788434 ENSG00000164626:ENST00000359534:exon_39156749_39159531:KCNK5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 41303592 T/C 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41303393_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41303527_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41303589_41303666:NCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 41309552 T/C 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C T C 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41309532_41309667:NCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 41318438 A/G 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41318416_41318596:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41318416_41318625:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41318416_41318602:NCR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 253 250 503 120.726914597354 130.704629844512 -9.97771524715716 T:C C T 10 0.522818519378046 0.396430670145544 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 41658566 C/T 1 140 134 274 66.8054072870736 70.0576815966582 -3.25227430958461 T:C C T 10 0.522818519378046 0.716888158227994 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658401_41658655:TFEB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 62 72 134 29.5852517985611 37.6429333952193 -8.05768159665817 T:C C T 10 0.522818519378046 0.167423967859921 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 42044945 G/A 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000137413:ENST00000456846:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000494547:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372982:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000530512:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000320973:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372977:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000465926:exon_42044838_42044977:TAF8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 18 15 33 8.58926665119517 7.84227779067069 0.746988860524481 A:C A C 10 0.522818519378046 0.862627047462256 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 276 243 519 131.702088651659 127.044900208865 4.65718844279411 A:T:G G T 10 0.522818519378046 0.692686103203005 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 33 36 69 15.7469888605245 18.8214666976097 -3.07447783708518 T:G G T 10 0.522818519378046 0.472014875176342 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 33 36 69 15.7469888605245 18.8214666976097 -3.07447783708518 T:C C T 10 0.522818519378046 0.472014875176342 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 43022145 C/G 1 151 104 255 72.0544035739151 54.3731260153168 17.6812775585983 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0281478533953143 ENSG00000112651:ENST00000388752:exon_43021767_43022224:MRPL2;ENSG00000112651:ENST00000230413:exon_43021970_43022224:MRPL2;ENSG00000112651:ENST00000485654:exon_43021970_43022224:MRPL2;ENSG00000112651:ENST00000489623:exon_43021973_43022224:MRPL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 36 48 84 17.1785333023903 25.0952889301462 -7.91675562775587 A:C A C 10 0.522818519378046 0.100828274136305 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 57 50 107 27.1993443954514 26.1409259689023 1.05841842654907 T:G G T 10 0.522818519378046 0.84724965492952 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 54186147 T/C 1 23 5 28 10.9751740543049 2.61409259689023 8.36108145741471 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00187775423434192 ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54186095_54186184:TINAG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 38 22 60 18.1328962636343 11.502007426317 6.63088883731724 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0936244851862192 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 56376091 C/T 1 6 4 10 2.86308888373172 2.09127407751218 0.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.756458342779065 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000340834:exon_56375995_56376198:DST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 56463410 T/C 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C T C 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56463274_56463507:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56463274_56463507:DST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 56484783 G/A 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G G A 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 56489412 C/T 1 11 7 18 5.24899628684149 3.65972963564632 1.58926665119517 T:C C T 10 0.522818519378046 0.488968467594439 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000520645:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56489283_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000522360:exon_56489328_56489426:DST;ENSG00000151914:ENST00000518935:exon_56489171_56489426:DST HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 17 0 17 8.11208517057322 0 8.11208517057322 G G 10 0.522818519378046 1.97401243008663e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 13 0 13 6.2033592480854 0 6.2033592480854 A A 10 0.522818519378046 0.000284563164675669 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57393112 T/C 1 4 12 16 1.90872592248782 6.27382223253655 -4.36509631004874 T:C T C 10 0.522818519378046 0.042319693166473 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 12 12 0 6.27382223253655 -6.27382223253655 G A G 10 0.522818519378046 0.000139380803775562 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 19 19 0 9.93355186818287 -9.93355186818287 G A G 10 0.522818519378046 7.85213987556328e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 19 19 0 9.93355186818287 -9.93355186818287 A G A 10 0.522818519378046 7.85213987556328e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 16 16 0 8.36509631004874 -8.36509631004874 G T G 10 0.522818519378046 7.22665440415923e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 17 0 17 8.11208517057322 0 8.11208517057322 C C 10 0.522818519378046 1.97401243008663e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 14 14 0 7.31945927129264 -7.31945927129264 C T C 10 0.522818519378046 3.17373108416564e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 35 16 51 16.7013518217684 8.36509631004874 8.33625551171965 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0240650947960124 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 7 10 17 3.34027036435368 5.22818519378046 -1.88791482942678 T:C C T 10 0.522818519378046 0.468020213449497 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 74161740 C/T 1 11 11 22 5.24899628684149 5.75100371315851 -0.502007426317013 T:C C T 10 0.522818519378046 0.834912590229453 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 76344431 C/T 1 9 1 10 4.29463332559759 0.522818519378046 3.77181480621954 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0227710816327027 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000493959:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000487548:exon_76344423_76344772:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76344423_76344527:SENP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 76376552 G/A 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76376428_76376657:SENP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 76425288 A/G 1 37 36 73 17.6557147830123 18.8214666976097 -1.16575191459736 A:G A G 10 0.522818519378046 0.815409906076698 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76425101_76425620:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76425101_76427997:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76425101_76427994:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76425101_76425593:SENP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 76624741 C/T 1 49 37 86 23.3818925504757 19.3442852169877 4.03760733348804 T:C C T 10 0.522818519378046 0.390479423116049 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76624530_76626329:MYO6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:T A T 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 3 8 11 1.43154444186586 4.18254815502437 -2.75100371315851 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.131842010035085 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 68 65 133 32.4483406822929 33.983203759573 -1.53486307728012 A:G G A 10 0.522818519378046 0.795258858844509 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 83667045 C/T 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000118420:ENST00000369747:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000237186:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000392921:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000509102:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000430071:exon_83667031_83667169:UBE2CBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 14 9 23 6.68054072870736 4.70536667440241 1.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.532244732814475 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C T C 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 2 10 12 0.954362961243908 5.22818519378046 -4.27382223253655 T:C T C 10 0.522818519378046 0.017999840799673 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 19 19 38 9.06644813181713 9.93355186818287 -0.867103736365749 A:G G A 10 0.522818519378046 0.871359257968777 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 88228353 G/T 1 56 55 111 26.7221629148294 28.7550185657925 -2.03285565096311 T:G G T 10 0.522818519378046 0.70508619256777 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88228348_88228457:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88228348_88228457:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88228348_88228457:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000497828:exon_88228194_88228457:RARS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 89322421 C/G 1 11 14 25 5.24899628684149 7.31945927129264 -2.07046298445115 C:G C G 10 0.522818519378046 0.430012309906698 ENSG00000111880:ENST00000369485:exon_89319985_89322601:RNGTT;ENSG00000111880:ENST00000265607:exon_89319989_89322601:RNGTT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 90578318 A/G 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G A G 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 9 4 13 4.29463332559759 2.09127407751218 2.2033592480854 T:C T C 10 0.522818519378046 0.273369431451006 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 16 11 27 7.63490368995126 5.75100371315851 1.88389997679276 T:C T C 10 0.522818519378046 0.564684921071908 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 18 25 43 8.58926665119517 13.0704629844512 -4.48119633325598 C:G G C 10 0.522818519378046 0.221559769802681 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 106547372 C/G 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 C:G C G 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000450060:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000481163:exon_106547175_106547584:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106547175_106547427:PRDM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 14 28 42 6.68054072870736 14.6389185425853 -7.95837781387793 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0194087157923271 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 106991413 G/A 1 11 45 56 5.24899628684149 23.5268333720121 -18.2778370851706 A:G G A 10 0.522818519378046 6.63475546919148e-07 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106991315_106991472:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106991315_106991472:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106991315_106991472:AIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 106992464 A/G 1 14 41 55 6.68054072870736 21.4355592944999 -14.7550185657925 A:G A G 10 0.522818519378046 6.61214869715864e-05 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106992446_106992572:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106992459_106992572:AIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 107001414 A/T 1 9 18 27 4.29463332559759 9.41073334880483 -5.11610002320724 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0547427397631916 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_107001330_107001442:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_107001330_107001442:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_107001330_107001442:AIM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 46 46 92 21.9503481086099 24.0496518913901 -2.09930378278023 T:G G T 10 0.522818519378046 0.677517236692277 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 72 62 134 34.3570666047807 32.4147482014389 1.94231840334183 T:G G T 10 0.522818519378046 0.795438329742179 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 59 68 127 28.1537073566953 35.5516593177071 -7.39795196101184 A:G G A 10 0.522818519378046 0.213543315394786 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 109787329 G/T 1 16 9 25 7.63490368995126 4.70536667440241 2.92953701554885 T:G G T 10 0.522818519378046 0.317159513391763 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 110107517 T/C 1 9 7 16 4.29463332559759 3.65972963564632 0.634903689951263 T:C T C 10 0.522818519378046 0.806867708781804 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110107505_110107652:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000419951:exon_110107209_110107652:FIG4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 111628597 C/G 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 111628626 C/T 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:C C T 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 111901453 G/T 1 29 18 47 13.8382629380367 9.41073334880483 4.42752958923184 T:G G T 10 0.522818519378046 0.242603969068210 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 111913070 G/A 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.274460962299708 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 111913262 C/T 1 16 11 27 7.63490368995126 5.75100371315851 1.88389997679276 T:C C T 10 0.522818519378046 0.564684921071908 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 116892734 G/A 1 67 47 114 31.9711592016709 24.5724704107682 7.39868879090276 A:G G A 10 0.522818519378046 0.189183093704225 ENSG00000111832:ENST00000466444:exon_116892530_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000368590:exon_116892572_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000392526:exon_116892583_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000487832:exon_116892652_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000517800:exon_116892672_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000518117:exon_116892726_116892818:RWDD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 195 0 195 93.050388721281 0 93.050388721281 C C 10 0.522818519378046 1.23373383599531e-55 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 122773119 T/C 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000111897:ENST00000339697:exon_122773033_122773202:SERINC1;ENSG00000111897:ENST00000368454:exon_122773033_122773202:SERINC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 127771452 T/G 1 7 3 10 3.34027036435368 1.56845555813414 1.77181480621954 T:G T G 10 0.522818519378046 0.348861272667992 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127771135_127771497:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000473298:exon_127771135_127771497:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000464495:exon_127771332_127771497:RP3-403A15.5;ENSG00000189367:ENST00000368281:exon_127771135_127772361:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000009606:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000405702:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000483725:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000487331:exon_127771135_127771497:KIAA0408;ENSG00000189367:ENST00000472335:exon_127771191_127771497:KIAA0408;ENSG00000214338:ENST00000368268:exon_127771330_127771497:C6orf174 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 95 0 95 45.3322406590856 0 45.3322406590856 T T 10 0.522818519378046 3.38250383559294e-27 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 103 0 103 49.1496925040613 0 49.1496925040613 A A 10 0.522818519378046 1.49270920610743e-29 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 95 0 95 45.3322406590856 0 45.3322406590856 A A 10 0.522818519378046 3.38250383559294e-27 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 136597449 G/C 0 55 0 55 26.2449814342075 0 26.2449814342075 G G 10 0.522818519378046 4.53323838541972e-16 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 32 0 32 15.2698073799025 0 15.2698073799025 G G 10 0.522818519378046 1.02325042733130e-09 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 37 0 37 17.6557147830123 0 17.6557147830123 T T 10 0.522818519378046 3.92223321513077e-11 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 139695061 G/T 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 T:G G T 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 23 29 52 10.9751740543049 15.1617370619633 -4.18656300765839 T:C C T 10 0.522818519378046 0.268241961090490 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 143823157 T/C 1 20 54 74 9.54362961243908 28.2322000464145 -18.6885704339754 T:C:G T C 10 0.522818519378046 1.21634249283952e-05 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 149795522 G/A 1 8 2 10 3.81745184497563 1.04563703875609 2.77181480621954 A:G G A 10 0.522818519378046 0.113036050378061 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 149922850 C/T 1 14 14 28 6.68054072870736 7.31945927129264 -0.638918542585289 T:C C T 10 0.522818519378046 0.851573351026942 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000494504:exon_149922730_149922935:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000481905:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000470620:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149922776_149922888:KATNA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 20 17 37 9.54362961243908 8.88791482942678 0.655714783012298 T:C C T 10 0.522818519378046 0.870498746331351 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 71 59 130 33.8798851241587 30.8462926433047 3.03359248085402 A:G G A 10 0.522818519378046 0.599844544824312 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 30 27 57 14.3154444186586 14.1161000232072 0.199344395451378 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 35 33 68 16.7013518217684 17.2530111394755 -0.551659317707127 C:G G C 10 0.522818519378046 0.904002429179486 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 154771277 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000153721:ENST00000367209:exon_154771229_154771392:CNKSR3;ENSG00000153721:ENST00000367213:exon_154771229_154771392:CNKSR3;ENSG00000153721:ENST00000479339:exon_154771229_154771392:CNKSR3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 155153131 G/A 1 13 16 29 6.2033592480854 8.36509631004874 -2.16173706196333 A:G G A 10 0.522818519378046 0.460889625504142 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 155153307 G/A 1 21 22 43 10.020811093061 11.502007426317 -1.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.651211501029653 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 12 3 15 5.72617776746345 1.56845555813414 4.15772220932931 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0379440782596598 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 157522171 T/G 1 12 2 14 5.72617776746345 1.04563703875609 4.68054072870736 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0141983257918061 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157521839_157522622:ARID1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 158927651 A/G 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158927610_158932860:TULP4;ENSG00000130338:ENST00000367094:exon_158927610_158929408:TULP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 159188549 G/A 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.728833389284679 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 50 30 80 23.8590740310977 15.6845555813414 8.17451844975632 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0734314501243032 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 151 191 342 72.0544035739151 99.8583372012068 -27.8039336272917 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00286457487412904 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 157 183 340 74.9174924576468 95.6757890461824 -20.7582965885356 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.0259363602604402 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 26 31 57 12.4067184961708 16.2073741007194 -3.80065560454862 T:C T C 10 0.522818519378046 0.354005811719525 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 449 664 1113 214.254484799257 347.151496867023 -132.897012067765 A:C:G A G 10 0.522818519378046 1.73548751963396e-15 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 170103050 A/G 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G A G 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000185127:ENST00000439249:exon_170102533_170103380:C6orf120;ENSG00000185127:ENST00000332290:exon_170102257_170106401:C6orf120 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 293 196 489 139.814173822233 102.472429798097 37.3417440241355 T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.000791765154546297 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C T C 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 22 11 33 10.497992573683 5.75100371315851 4.74698886052448 A:G A G 10 0.522818519378046 0.116935779843657 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 13 16 29 6.2033592480854 8.36509631004874 -2.16173706196333 T:C T C 10 0.522818519378046 0.460889625504142 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 9 12 21 4.29463332559759 6.27382223253655 -1.97918890693897 A:G G A 10 0.522818519378046 0.513308181962307 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 930608 G/A 1 41 45 86 19.5644407055001 23.5268333720121 -3.96239266651196 A:G G A 10 0.522818519378046 0.450074606051587 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 931960 G/A 1 56 63 119 26.7221629148294 32.9375667208169 -6.21540380598747 A:G G A 10 0.522818519378046 0.271336136351853 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 1132153 G/A 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 A:G G A 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 141 111 252 67.2825887676955 58.0328556509631 9.24973311673241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.256559424060922 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 69 63 132 32.9255221629148 32.9375667208169 -0.0120445579020725 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 2583328 C/T 1 45 27 72 21.4731666279879 14.1161000232072 7.35706660478069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0981273952142921 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2583224_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2583224_2583596:C7orf27 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 13 10 23 6.2033592480854 5.22818519378046 0.975174054304942 T:G G T 10 0.522818519378046 0.835285176690354 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 25 18 43 11.9295370155488 9.41073334880483 2.51880366674402 T:C C T 10 0.522818519378046 0.450907783756556 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 49 14 63 23.3818925504757 7.31945927129264 16.0624332791831 A:T T A 10 0.522818519378046 3.94584468795426e-05 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 46 16 62 21.9503481086099 8.36509631004874 13.5852517985611 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000516893277706446 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 5567677 C/T 1 4041 4018 8059 1928.29036319332 2100.68481086099 -172.394447667673 A:T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.000124831378008 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567635_5567729:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567635_5568350:ACTB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 13 15 28 6.2033592480854 7.84227779067069 -1.63891854258529 A:G G A 10 0.522818519378046 0.574296099866423 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 187 211 398 89.2329368763054 110.314707588768 -21.0817707124623 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0351145217262673 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 6193521 G/C 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 C:G G C 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193518_6193612:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 6461424 C/T 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6461358_6462434:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6461358_6461435:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6461358_6461435:DAGLB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 25 24 49 11.9295370155488 12.5476444650731 -0.618107449524256 A:G G A 10 0.522818519378046 0.887062337250441 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 6631414 G/T 1 14 17 31 6.68054072870736 8.88791482942678 -2.20737410071943 T:G G T 10 0.522818519378046 0.474760861326864 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6631277_6631498:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6631334_6631498:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000472693:exon_6631388_6631498:C7orf26 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.250445696561260 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 7613039 C/T 1 12 14 26 5.72617776746345 7.31945927129264 -1.5932815038292 T:C C T 10 0.522818519378046 0.561197112755049 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000434746:exon_7612067_7613400:MIOS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 C:G G C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 12727909 T/C 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C T C 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 20421499 G/T 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:G G T 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000105855:ENST00000478974:exon_20421350_20421508:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000222573:exon_20421350_20421508:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000477859:exon_20418674_20421704:ITGB8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 90 46 136 42.9463332559759 24.0496518913901 18.8966813645857 T:C T C 10 0.522818519378046 0.00140249455270036 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 35 22 57 16.7013518217684 11.502007426317 5.19934439545138 T:C T C 10 0.522818519378046 0.185874069707771 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 26237238 A/G 0 0 17 17 0 8.88791482942678 -8.88791482942678 T A T 10 0.522818519378046 3.44842564851986e-06 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 27827103 T/A 1 42 38 80 20.0416221861221 19.8671037363657 0.174518449756317 A:T T A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27827037_27827222:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27827037_27827222:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27827037_27827222:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27827037_27827222:TAX1BP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 27 16 43 12.8838999767928 8.36509631004874 4.51880366674402 A:G A G 10 0.522818519378046 0.17352377240164 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 11 23 34 5.24899628684149 12.0248259456951 -6.77582965885356 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0246572777823146 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 2 10 12 0.954362961243908 5.22818519378046 -4.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.017999840799673 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 37272769 C/T 1 9 11 20 4.29463332559759 5.75100371315851 -1.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 0.65556110720683 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37272710_37272799:ELMO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 24 8 32 11.4523555349269 4.18254815502437 7.26980737990253 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0122119381308528 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 330 276 606 157.469888605245 144.297911348341 13.1719772569041 A:G G A 10 0.522818519378046 0.290562694925073 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 0 0 191 191 0 99.8583372012068 -99.8583372012068 T C T 10 0.522818519378046 4.25171215035092e-62 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44608785 G/A 1 57 72 129 27.1993443954514 37.6429333952193 -10.4435889997679 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0775513400784897 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44608729_44608802:DDX56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44685048 A/G 1 13 11 24 6.2033592480854 5.75100371315851 0.452355534926896 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000105953:ENST00000443864:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000419661:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44684926_44685117:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44684926_44685117:OGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 75 58 133 35.7886110466466 30.3234741239267 5.46513692271988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.385479589967113 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 67 54 121 31.9711592016709 28.2322000464145 3.73895915525643 A:G G A 10 0.522818519378046 0.524817476406389 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 81 55 136 38.6516999303783 28.7550185657925 9.89668136458574 T:C C T 10 0.522818519378046 0.102608077107350 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 14 17 31 6.68054072870736 8.88791482942678 -2.20737410071943 A:G A G 10 0.522818519378046 0.474760861326864 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 14 8 22 6.68054072870736 4.18254815502437 2.49799257368299 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393878100948442 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45004063 T/C 1 346 373 719 165.104792295196 195.011307728011 -29.9065154328151 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0275565982454205 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004014_45004118:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004014_45004118:MYO1G HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 237 161 398 113.092010907403 84.1737816198654 28.9182292875377 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00417734825480044 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45009341 A/G 1 272 214 486 129.793362729171 111.883163146902 17.9101995822696 A:G A G 10 0.522818519378046 0.111913707173322 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 172 152 324 82.0752146669761 79.468414945463 2.60679972151308 A:G G A 10 0.522818519378046 0.781238276581334 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45104131 G/A 1 50 41 91 23.8590740310977 21.4355592944999 2.42351473659781 A:G G A 10 0.522818519378046 0.674965188235195 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 102 115 217 48.6725110234393 60.1241297284753 -11.451618705036 A:G G A 10 0.522818519378046 0.134730483009542 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 45139919 A/C 1 110 104 214 52.4899628684149 54.3731260153168 -1.88316314690185 A:C A C 10 0.522818519378046 0.837418832126732 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 48141556 G/T 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 G G 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000183696:ENST00000416681:exon_48141421_48141579:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000331803:exon_48141421_48141579:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000341253:exon_48141421_48141579:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000429491:exon_48141421_48141579:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000421046:exon_48141421_48141579:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395564:exon_48141421_48141579:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000436673:exon_48141421_48141579:UPP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 0 0 16 16 0 8.36509631004874 -8.36509631004874 C A C 10 0.522818519378046 7.22665440415923e-06 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 66463938 G/A 0 8 0 8 3.81745184497563 0 3.81745184497563 G G 10 0.522818519378046 0.00827047343575293 ENSG00000198874:ENST00000359626:exon_66463804_66463941:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000442959:exon_66463804_66463941:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000475392:exon_66463804_66463941:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000361660:exon_66463804_66463941:TYW1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 21 13 34 10.020811093061 6.7966407519146 3.22417034114643 C:G G C 10 0.522818519378046 0.305340114637287 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 19 9 28 9.06644813181713 4.70536667440241 4.36108145741471 A:C C A 10 0.522818519378046 0.129274712189621 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 35 28 63 16.7013518217684 14.6389185425853 2.0624332791831 T:C C T 10 0.522818519378046 0.616623827771523 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 72985148 C/T 1 37 37 74 17.6557147830123 19.3442852169877 -1.68857043397541 T:C C T 10 0.522818519378046 0.727859965994444 ENSG00000106638:ENST00000459913:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72983993_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72984338_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000432538:exon_72984525_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72984741_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000488915:exon_72984801_72985302:TBL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 73097720 G/C 1 10 16 26 4.77181480621954 8.36509631004874 -3.5932815038292 C:G G C 10 0.522818519378046 0.173401103832856 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 73790969 G/A 1 16 24 40 7.63490368995126 12.5476444650731 -4.91274077512184 A:G G A 10 0.522818519378046 0.153549018379743 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000487091:exon_73790400_73791152:CLIP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 73944185 T/C 1 4 9 13 1.90872592248782 4.70536667440241 -2.7966407519146 T:C T C 10 0.522818519378046 0.165176464890548 ENSG00000006704:ENST00000265755:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000455841:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000424337:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000476977:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000489094:exon_73944064_73944247:GTF2IRD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 75051324 G/C 1 13 13 26 6.2033592480854 6.7966407519146 -0.593281503829196 C:G G C 10 0.522818519378046 0.846541780450938 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 51 34 85 24.3362555117197 17.7758296588536 6.56042585286609 T:C T C 10 0.522818519378046 0.159652320328792 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 75932065 G/T 1 292 40 332 139.336992341611 20.9127407751218 118.424251566489 T:G G T 10 0.522818519378046 1.37213801108011e-43 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75931990_75932073:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000447574:exon_75932005_75933182:HSPB1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 27 24 51 12.8838999767928 12.5476444650731 0.336255511719653 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 32 8 40 15.2698073799025 4.18254815502437 11.0872592248782 A:G A G 10 0.522818519378046 0.000384562640855101 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:G T G 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 90001496 G/C 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 C:G G C 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90001469_90001542:GTPBP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 25 12 37 11.9295370155488 6.27382223253655 5.6557147830123 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0705982659602663 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 91727487 A/G 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:G A G 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91727423_91727528:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000463118:exon_91727468_91727528:AKAP9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 75 84 159 35.7886110466466 43.9167556277559 -8.12814458110932 A:T A T 10 0.522818519378046 0.204608835462226 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 33 21 54 15.7469888605245 10.979188906939 4.76779995358551 T:C C T 10 0.522818519378046 0.220856614330386 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 20 25 45 9.54362961243908 13.0704629844512 -3.52683337201207 T:C C T 10 0.522818519378046 0.300641388123278 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 98984399 C/T 1 494 547 1041 235.727651427245 285.981730099791 -50.2540786725459 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0019076903793541 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000461486:exon_98984375_98984437:ARPC1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99017071 C/T 1 295 281 576 140.768536783476 146.912003945231 -6.1434671617545 T:C:G C T 10 0.522818519378046 0.616883722030262 ENSG00000106245:ENST00000403633:exon_99017014_99017239:BUD31;ENSG00000106245:ENST00000222969:exon_99017014_99017231:BUD31;ENSG00000106245:ENST00000456893:exon_99017014_99017235:BUD31;ENSG00000106245:ENST00000431419:exon_99017014_99017200:BUD31;ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99032677 C/T 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000419981:exon_99032548_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000437572:exon_99032654_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 25 25 50 11.9295370155488 13.0704629844512 -1.1409259689023 T:C T C 10 0.522818519378046 0.778381235387664 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99160079 A/T 1 17 1 18 8.11208517057322 0.522818519378046 7.58926665119517 A:T A T 10 0.522818519378046 0.000182549084801669 ENSG00000197343:ENST00000320583:exon_99159991_99160117:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000467680:exon_99159511_99160117:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000416144:exon_99159991_99160117:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000423973:exon_99159967_99160117:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000449244:exon_99159972_99160117:ZNF655 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 A:G A G 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 A:G G A 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99690690 G/C 1 640 523 1163 305.396147598051 273.434085634718 31.9620619633325 A:T:C:G G C 10 0.522818519378046 0.0643709392937396 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99690351_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99690403_99690739:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99690404_99690756:MCM7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99690747 T/C 1 536 485 1021 255.769273613367 253.566981898352 2.20229171501504 A:T:C T C 10 0.522818519378046 0.900302799647356 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99690351_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99690404_99690756:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99690404_99690756:MCM7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99693552 G/A 1 362 345 707 172.739695985147 180.372389185426 -7.63269320027854 A:G G A 10 0.522818519378046 0.57242470773282 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693397_99693611:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000354230:exon_99693445_99693599:MCM7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99693615 G/A 1 277 353 630 132.179270132281 184.55493734045 -52.375667208169 A:G G A 10 0.522818519378046 3.23796251103025e-05 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693397_99693790:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693397_99693790:MCM7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 40 25 65 19.0872592248782 13.0704629844512 6.01679624042701 A:T A T 10 0.522818519378046 0.138520558889219 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 61 38 99 29.1080703179392 19.8671037363657 9.24096658157344 A:G A G 10 0.522818519378046 0.069981331330919 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99725146 C/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 C:G C G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000214309:ENST00000398075:exon_99724991_99726118:MBLAC1;ENSG00000214309:ENST00000421390:exon_99724991_99725359:MBLAC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 113 120 233 53.9215073102808 62.7382223253655 -8.81671501508472 A:G G A 10 0.522818519378046 0.264982883418773 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:G A G 10 0.522818519378046 0.744812333345895 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 198 196 394 94.4819331631469 102.472429798097 -7.99049663495013 A:G A G 10 0.522818519378046 0.420323388976201 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100137085 G/C 1 12 12 24 5.72617776746345 6.27382223253655 -0.547644465073105 C:G G C 10 0.522818519378046 0.841016689152556 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100136834_100137190:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000477022:exon_100136835_100137190:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100136848_100137190:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100136882_100137190:AGFG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100160264 T/C 1 14 15 29 6.68054072870736 7.84227779067069 -1.16173706196333 T:C T C 10 0.522818519378046 0.712637707705076 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160217_100160305:AGFG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100180060 G/A 1 38 46 84 18.1328962636343 24.0496518913901 -5.91675562775587 A:G G A 10 0.522818519378046 0.229428995912948 ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100179938_100180082:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100179938_100180082:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100179938_100180082:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000470184:exon_100179664_100180076:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000485583:exon_100179761_100180082:LRCH4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100279946 G/A 1 11 9 20 5.24899628684149 4.70536667440241 0.543629612439079 A:G G A 10 0.522818519378046 0.827438469720215 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100279945_100280105:GIGYF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100282974 C/T 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100282967_100283104:GIGYF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 36 59 95 17.1785333023903 30.8462926433047 -13.6677593409144 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00540874109749377 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100470956 G/A 1 76 84 160 36.2657925272685 43.9167556277559 -7.65096310048737 A:G G A 10 0.522818519378046 0.235756327958841 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100470794_100471076:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100470794_100471076:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100470794_100471075:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100470794_100471076:TRIP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 138 112 250 65.8510443258296 58.5556741703412 7.29537015548849 T:C T C 10 0.522818519378046 0.375644011931833 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 33 15 48 15.7469888605245 7.84227779067069 7.90471106985379 A:C C A 10 0.522818519378046 0.029176154509891 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 257 259 516 122.635640519842 135.409996518914 -12.7743559990717 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.270653611884632 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 8 6 14 3.81745184497563 3.13691111626828 0.680540728707355 T:G T G 10 0.522818519378046 0.793562266719157 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100488658 G/C 1 8 10 18 3.81745184497563 5.22818519378046 -1.41073334880483 C:G G C 10 0.522818519378046 0.638489046751085 ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100488337_100488709:ACHE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100490077 G/A 1 10 9 19 4.77181480621954 4.70536667440241 0.0664481318171255 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100731748 T/G 1 6 16 22 2.86308888373172 8.36509631004874 -5.50200742631701 T:G T G 10 0.522818519378046 0.0303830108525416 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 100731896 T/C 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 T:C T C 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 102036877 T/G 1 14 11 25 6.68054072870736 5.75100371315851 0.929537015548849 T:G T G 10 0.522818519378046 0.841950225699242 ENSG00000128563:ENST00000496391:exon_102036424_102036984:PRKRIP1;ENSG00000128563:ENST00000397912:exon_102036810_102036984:PRKRIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 102079452 C/T 1 11 20 31 5.24899628684149 10.4563703875609 -5.20737410071943 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0720696345659513 ENSG00000160991:ENST00000482237:exon_102079391_102079494:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000498661:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102079404_102079628:ORAI2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 18 12 30 8.58926665119517 6.27382223253655 2.31544441865862 A:G G A 10 0.522818519378046 0.466589946286752 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 102113191 C/T 1 33 37 70 15.7469888605245 19.3442852169877 -3.59729635646322 T:C C T 10 0.522818519378046 0.404451327638117 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102113139_102113251:LRWD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 209 74 283 99.7309294499884 38.6885704339754 61.042359016013 T:C C T 10 0.522818519378046 1.60109585866837e-13 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 34 31 65 16.2241703411464 16.2073741007194 0.0167962404270092 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 107545874 C/T 1 26 21 47 12.4067184961708 10.979188906939 1.42752958923184 T:C C T 10 0.522818519378046 0.770715896326443 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000451081:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000478414:exon_107545806_107546208:DLD;ENSG00000091140:ENST00000489184:exon_107545806_107545949:DLD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 108213362 T/C 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 T:C T C 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108213343_108215294:DNAJB9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 111981007 G/A 1 33 30 63 15.7469888605245 15.6845555813414 0.0624332791831019 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 6 24 30 2.86308888373172 12.5476444650731 -9.68455558134138 T:G T G 10 0.522818519378046 0.00037750458529228 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 19 29 48 9.06644813181713 15.1617370619633 -6.09528893014621 A:G G A 10 0.522818519378046 0.083983184904343 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 54 27 81 25.7677999535855 14.1161000232072 11.6516999303783 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0102714275952896 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 116528240 C/T 1 2 15 17 0.954362961243908 7.84227779067069 -6.88791482942678 T:C C T 10 0.522818519378046 0.000899735077831102 ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 116557939 C/T 1 36 30 66 17.1785333023903 15.6845555813414 1.49397772104896 T:C C T 10 0.522818519378046 0.805575960087284 ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116557781_116559315:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116557781_116559312:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116557781_116558242:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116557781_116559312:CAPZA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 120428799 C/A 1 8 30 38 3.81745184497563 15.6845555813414 -11.8671037363657 A:C C A 10 0.522818519378046 0.000119973050297688 ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 126079144 A/G 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G A G 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000179603:ENST00000339582:exon_126078652_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000358373:exon_126078669_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000489939:exon_126078682_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000341617:exon_126078746_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000495315:exon_126078747_126079222:GRM8;ENSG00000179603:ENST00000472701:exon_126079131_126079222:GRM8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 127979372 T/G 1 8 14 22 3.81745184497563 7.31945927129264 -3.50200742631701 T:G T G 10 0.522818519378046 0.142061348999446 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127979281_127979375:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000478061:exon_127979281_127979375:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000459726:exon_127979281_127979375:RBM28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 127983761 C/T 1 22 16 38 10.497992573683 8.36509631004874 2.13289626363425 T:C C T 10 0.522818519378046 0.519796371885942 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127983730_127983962:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127983730_127983924:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000478061:exon_127983730_127983928:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000459726:exon_127983730_127983962:RBM28 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 57 62 119 27.1993443954514 32.4147482014389 -5.21540380598748 A:G G A 10 0.522818519378046 0.359433637464961 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 129479138 T/C 1 18 6 24 8.58926665119517 3.13691111626828 5.45235553492689 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0387384186662656 ENSG00000186591:ENST00000355621:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000473814:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000496698:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000483368:exon_129479047_129479581:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000480245:exon_129479065_129479175:UBE2H HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 129663496 C/T 1 23 17 40 10.9751740543049 8.88791482942678 2.08725922487816 T:C C T 10 0.522818519378046 0.531014279535613 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000481503:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129663351_129663563:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129663404_129663563:ZC3HC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 T:C T C 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134135595 G/A 1 44 40 84 20.995985147366 20.9127407751218 0.0832443722441347 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000498771:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000458165:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000487438:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000489022:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000491741:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000497983:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000484592:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467829:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000426422:exon_134135538_134135709:AKR1B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 50 23 73 23.8590740310977 12.0248259456951 11.8342480854026 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00665932935971993 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134849280 T/A 1 55 25 80 26.2449814342075 13.0704629844512 13.1745184497563 A:T T A 10 0.522818519378046 0.00341803369279273 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 50 22 72 23.8590740310977 11.502007426317 12.3570666047807 A:C A C 10 0.522818519378046 0.00431046209430656 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 28 39 67 13.3610814574147 20.3899222557438 -7.02884079832908 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0882058590070241 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 28 38 66 13.3610814574147 19.8671037363657 -6.50602227895104 A:G G A 10 0.522818519378046 0.111083575086254 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 22 15 37 10.497992573683 7.84227779067069 2.6557147830123 A:G G A 10 0.522818519378046 0.4142510380835 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 139090515 A/G 1 49 62 111 23.3818925504757 32.4147482014389 -9.03285565096311 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0880031090741026 ENSG00000146963:ENST00000354926:exon_139090390_139090533:LUC7L2;ENSG00000146963:ENST00000456182:exon_139090390_139090533:LUC7L2;ENSG00000146963:ENST00000263545:exon_139090390_139090533:LUC7L2;ENSG00000146963:ENST00000463912:exon_139090390_139090533:LUC7L2;ENSG00000146963:ENST00000498518:exon_139090390_139090533:LUC7L2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 17 21 38 8.11208517057322 10.979188906939 -2.86710373636575 A:G G A 10 0.522818519378046 0.417515893094028 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/G,T 0 0 29 29 0 15.1617370619633 -15.1617370619633 T:G C G 10 0.522818519378046 4.80644338650964e-10 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:G G A 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 139746793 C/T 1 7 7 14 3.34027036435368 3.65972963564632 -0.319459271292645 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000493262:exon_139746684_139746807:PARP12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 18 12 30 8.58926665119517 6.27382223253655 2.31544441865862 T:C T C 10 0.522818519378046 0.466589946286752 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 66 1 67 31.493977721049 0.522818519378046 30.9711592016709 T:C T C 10 0.522818519378046 9.18324054459015e-18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 148701168 C/T 1 311 365 676 148.403440473428 190.828759572987 -42.4253190995591 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00120466598681686 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 148767905 G/A 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000197362:ENST00000316286:exon_148766735_148769565:ZNF786;ENSG00000197362:ENST00000491431:exon_148767055_148769565:ZNF786;ENSG00000197362:ENST00000451334:exon_148767055_148769565:ZNF786 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 148950691 G/A 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000170260:ENST00000335870:exon_148950650_148952700:ZNF212;ENSG00000170260:ENST00000481584:exon_148950650_148950859:ZNF212;ENSG00000170260:ENST00000488917:exon_148950650_148950902:ZNF212 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 148951467 G/T 1 15 4 19 7.15772220932931 2.09127407751218 5.06644813181713 T:G G T 10 0.522818519378046 0.0215396178358077 ENSG00000170260:ENST00000335870:exon_148950650_148952700:ZNF212 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 149419635 T/G 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:G T G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149419513_149419644:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149419513_149419644:KRBA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 149430367 C/T 1 10 1 11 4.77181480621954 0.522818519378046 4.24899628684149 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0126192687328019 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 149576735 C/T 1 28 18 46 13.3610814574147 9.41073334880483 3.95034810860988 T:C C T 10 0.522818519378046 0.301568903052759 ENSG00000171130:ENST00000421974:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000456496:exon_149576424_149577782:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000425642:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000307445:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000429743:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000479613:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000471877:exon_149576424_149577783:ATP6V0E2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 25 20 45 11.9295370155488 10.4563703875609 1.47316662798793 T:C T C 10 0.522818519378046 0.765775577608258 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 13 33 46 6.2033592480854 17.2530111394755 -11.0496518913901 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00162157939362412 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 33 13 46 15.7469888605245 6.7966407519146 8.95034810860988 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0112634989851095 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 28 28 56 13.3610814574147 14.6389185425853 -1.27783708517058 C:G G C 10 0.522818519378046 0.78963313416608 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150389829 A/G 1 19 20 39 9.06644813181713 10.4563703875609 -1.38992225574379 A:G A G 10 0.522818519378046 0.749095693569684 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 20 27 47 9.54362961243908 14.1161000232072 -4.57247041076816 A:G A G 10 0.522818519378046 0.191521711833374 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 7 5 12 3.34027036435368 2.61409259689023 0.726177767463448 T:C C T 10 0.522818519378046 0.777218445181202 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150439737 C/T 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 T:C C T 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150439824 G/A 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 34 28 62 16.2241703411464 14.6389185425853 1.58525179856115 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.704959104613931 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 32 35 67 15.2698073799025 18.2986481782316 -3.02884079832908 A:G A G 10 0.522818519378046 0.4660586533216 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 26 38 64 12.4067184961708 19.8671037363657 -7.46038524019495 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0789981640313183 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 59 82 141 28.1537073566953 42.8711185889998 -14.7174112323045 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0143328246393920 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 151851392 C/T 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C C T 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000485241:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000418061:exon_151851352_151851530:MLL3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 152345726 A/G 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 A:G A G 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000196584:ENST00000495707:exon_152341864_152346448:XRCC2;ENSG00000196584:ENST00000359321:exon_152343589_152346448:XRCC2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 154739679 T/C 1 30 25 55 14.3154444186586 13.0704629844512 1.24498143420747 T:C T C 10 0.522818519378046 0.788062040139497 ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154739608_154739800:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154739613_154739713:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154739613_154739713:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154739542_154739713:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154739613_154739713:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154739613_154739713:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154739613_154739713:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154739613_154739713:PAXIP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 156469096 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 156746890 C/T 1 13 14 27 6.2033592480854 7.31945927129264 -1.11610002320724 T:C C T 10 0.522818519378046 0.703496842234386 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156746797_156746992:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000460332:exon_156746806_156746992:NOM1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 9 8 17 4.29463332559759 4.18254815502437 0.112085170573217 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 642489 T/C 1 51 49 100 24.3362555117197 25.6181074495243 -1.2818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.841562480255146 ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_642478_642612:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000524138:exon_642478_642612:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000518277:exon_642478_642612:ERICH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 3 10 13 1.43154444186586 5.22818519378046 -3.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0492332397122063 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 6 21 27 2.86308888373172 10.979188906939 -8.11610002320724 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00177829920499727 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 8747894 A/G 1 9 9 18 4.29463332559759 4.70536667440241 -0.410733348804829 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8747571_8751155:MFHAS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 9567700 C/A 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9567652_9567919:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9567652_9567730:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9567652_9567730:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000434877:exon_9567652_9567919:TNKS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 84 96 180 40.0832443722441 50.1905778602924 -10.1073334880483 A:T T A 10 0.522818519378046 0.136057500678632 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 15 10 25 7.15772220932931 5.22818519378046 1.92953701554885 T:C T C 10 0.522818519378046 0.549269145485727 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 11640784 A/G 1 12 7 19 5.72617776746345 3.65972963564632 2.06644813181713 A:G A G 10 0.522818519378046 0.368831616480381 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 33 25 58 15.7469888605245 13.0704629844512 2.67652587607333 T:C C T 10 0.522818519378046 0.513099067831037 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 11667358 C/T 1 283 366 649 135.042359016013 191.351578092365 -56.3092190763519 A:T:C C T 10 0.522818519378046 1.03320660749872e-05 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11667301_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 11 11 22 5.24899628684149 5.75100371315851 -0.502007426317013 T:G T G 10 0.522818519378046 0.834912590229453 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 17 11 28 8.11208517057322 5.75100371315851 2.36108145741471 T:C C T 10 0.522818519378046 0.450650940805616 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 18080001 G/A 1 5 14 19 2.38590740310977 7.31945927129264 -4.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0359551262108928 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 18080015 G/A 1 4 15 19 1.90872592248782 7.84227779067069 -5.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00956166682289738 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 18080115 C/T 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 18080196 T/G 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 T:G T G 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000171428:ENST00000517441:exon_18079551_18080263:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 21959726 G/A 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 A:G G A 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000436711:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000356512:exon_21959686_21959826:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 16 22 38 7.63490368995126 11.502007426317 -3.86710373636575 T:C T C 10 0.522818519378046 0.255723585527227 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 16 22 38 7.63490368995126 11.502007426317 -3.86710373636575 C:G G C 10 0.522818519378046 0.255723585527227 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 A:G G A 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 23290451 C/T 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 T:C C T 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23286665_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23290159_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23290439_23290667:ENTPD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 23292985 A/G 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23292905_23292990:ENTPD4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 23423669 A/G 1 6 6 12 2.86308888373172 3.13691111626828 -0.273822232536553 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 16 33 49 7.63490368995126 17.2530111394755 -9.61810744952425 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0063717572202834 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 87 73 160 41.51478881411 38.1657519145974 3.34903689951264 T:C C T 10 0.522818519378046 0.63516539180615 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 89 159 248 42.4691517753539 83.1281445811093 -40.6589928057554 T:C T C 10 0.522818519378046 2.90448216939225e-07 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 218 189 407 104.025562775586 98.8127001624507 5.21286261313527 A:T:G A G 10 0.522818519378046 0.619971337924308 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 228 189 417 108.797377581806 98.8127001624507 9.98467741935481 A:G A G 10 0.522818519378046 0.351658844963034 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 31 35 66 14.7926258992806 18.2986481782316 -3.50602227895104 C:G G C 10 0.522818519378046 0.391800718462847 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 132 121 253 62.9879554420979 63.2610408447436 -0.273085402645641 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 30623937 A/G 1 7 13 20 3.34027036435368 6.7966407519146 -3.45637038756092 A:G A G 10 0.522818519378046 0.177905026249726 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 17 6 23 8.11208517057322 3.13691111626828 4.97517405430494 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0578932468769344 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 41 29 70 19.5644407055001 15.1617370619633 4.40270364353678 T:C C T 10 0.522818519378046 0.338707236834428 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 48710955 A/G 1 21 23 44 10.020811093061 12.0248259456951 -2.00401485263403 A:G A G 10 0.522818519378046 0.550647233196772 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48710798_48710958:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48710798_48710958:AC103686.1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 53570138 T/C 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56702758 G/A 1 26 26 52 12.4067184961708 13.5932815038292 -1.18656300765839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.78229602557704 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56702741_56702858:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56702741_56702858:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56702656_56702858:TGS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56702798 C/G 1 24 27 51 11.4523555349269 14.1161000232072 -2.66374448828035 C:G C G 10 0.522818519378046 0.485470002286484 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56702741_56702858:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56702741_56702858:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56702656_56702858:TGS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56705280 A/C 1 16 18 34 7.63490368995126 9.41073334880483 -1.77582965885357 A:C A C 10 0.522818519378046 0.608066491089959 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56705257_56705343:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56705257_56705343:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56705257_56705343:TGS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 36 42 78 17.1785333023903 21.9583778138779 -4.77984451148759 A:G G A 10 0.522818519378046 0.308179173559401 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56962565 T/G 0 17 0 17 8.11208517057322 0 8.11208517057322 T T 10 0.522818519378046 1.97401243008663e-05 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56985814 T/C 1 3104 4773 7877 1481.17131585055 2495.41279299141 -1014.24147714087 A:T:C:G T C 10 0.522818519378046 3.57660501956888e-116 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56985506_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56985601_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56985632_56986327:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56985634_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56985686_56985831:RPS20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56986417 A/G 1 2 9 11 0.954362961243908 4.70536667440241 -3.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.031904144197345 ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986254_56986718:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986021_56986718:RPS20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 56986883 G/C 1 38 48 86 18.1328962636343 25.0952889301462 -6.96239266651196 C:G G C 10 0.522818519378046 0.160144885747028 ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56986813_56986915:RPS20 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 14 8 22 6.68054072870736 4.18254815502437 2.49799257368299 T:C C T 10 0.522818519378046 0.393878100948442 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 66619252 A/G 1 11 3 14 5.24899628684149 1.56845555813414 3.68054072870736 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0609433495022194 ENSG00000066855:ENST00000518609:exon_66619245_66619491:MTFR1;ENSG00000066855:ENST00000424808:exon_66619245_66619491:MTFR1;ENSG00000066855:ENST00000262146:exon_66619245_66619491:MTFR1;ENSG00000066855:ENST00000517944:exon_66619245_66619491:MTFR1;ENSG00000066855:ENST00000518800:exon_66619245_66619491:MTFR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 70588878 T/C 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 T:C T C 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70588844_70588908:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70588844_70588908:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70588844_70588908:SLCO5A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 A:G G A 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 18 8 26 8.58926665119517 4.18254815502437 4.4067184961708 A:G G A 10 0.522818519378046 0.114830012681343 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 74888616 G/C 1 44 36 80 20.995985147366 18.8214666976097 2.17451844975632 C:G G C 10 0.522818519378046 0.65562196085714 ENSG00000175606:ENST00000523794:exon_74888540_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74888430_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74888442_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74888444_74888726:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517614:exon_74888454_74888726:TMEM70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 43 56 99 20.518803666744 29.2778370851706 -8.75903341842656 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0870563092119122 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 18 46 64 8.58926665119517 24.0496518913901 -15.4603852401949 C:G C G 10 0.522818519378046 0.000132618616494457 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 22 37 59 10.497992573683 19.3442852169877 -8.84629264330472 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0260195090660107 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 A:C C A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 12 5 17 5.72617776746345 2.61409259689023 3.11208517057322 A:C A C 10 0.522818519378046 0.150530374415023 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 90784979 T/C 1 8 8 16 3.81745184497563 4.18254815502437 -0.365096310048736 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90784895_90785056:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90784895_90785056:RIPK2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 25 14 39 11.9295370155488 7.31945927129264 4.6100777442562 T:C T C 10 0.522818519378046 0.151495580239124 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 32 27 59 15.2698073799025 14.1161000232072 1.15370735669529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.79554759003875 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 97299350 C/T 1 10 11 21 4.77181480621954 5.75100371315851 -0.979188906938966 T:C C T 10 0.522818519378046 0.670508772586239 ENSG00000156471:ENST00000517309:exon_97299250_97299374:PTDSS1;ENSG00000156471:ENST00000455950:exon_97299250_97299374:PTDSS1;ENSG00000156471:ENST00000517557:exon_97299250_97299616:PTDSS1;ENSG00000156471:ENST00000518776:exon_97299250_97299374:PTDSS1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 13 19 32 6.2033592480854 9.93355186818287 -3.73019262009747 A:C C A 10 0.522818519378046 0.216750311379198 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 15 9 24 7.15772220932931 4.70536667440241 2.4523555349269 A:G G A 10 0.522818519378046 0.414517478089946 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 10 18 28 4.77181480621954 9.41073334880483 -4.63891854258529 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0898195633773977 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 886 768 1654 422.782791831051 401.524622882339 21.2581689487118 A:G G A 10 0.522818519378046 0.301268831104097 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 101960857 C/T 1 88 252 340 41.9919702947319 131.750266883268 -89.7582965885356 T:C C T 10 0.522818519378046 4.48312581078331e-23 ENSG00000164924:ENST00000395957:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395958:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000457309:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395956:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000353245:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000517797:exon_101960824_101961014:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395953:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395948:exon_101960824_101960960:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000395951:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000419477:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000521607:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000480304:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000518736:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000517727:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000521328:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000418997:exon_101960824_101961128:YWHAZ;ENSG00000164924:ENST00000437293:exon_101960842_101961128:YWHAZ HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 103276753 T/G 1 23 17 40 10.9751740543049 8.88791482942678 2.08725922487816 T:G T G 10 0.522818519378046 0.531014279535613 ENSG00000104517:ENST00000522784:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000518205:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103276702_103276786:UBR5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 104412635 G/A 1 9 14 23 4.29463332559759 7.31945927129264 -3.02482594569506 A:G G A 10 0.522818519378046 0.21807391097219 ENSG00000164933:ENST00000297578:exon_104410863_104412774:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000521645:exon_104410863_104412774:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523256:exon_104412169_104412774:SLC25A32;ENSG00000164933:ENST00000523866:exon_104412286_104412774:SLC25A32 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 3 8 11 1.43154444186586 4.18254815502437 -2.75100371315851 T:C T C 10 0.522818519378046 0.131842010035085 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 123964011 G/A 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 A:G G A 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 123965193 C/T 1 14 17 31 6.68054072870736 8.88791482942678 -2.20737410071943 T:C C T 10 0.522818519378046 0.474760861326864 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 12 17 29 5.72617776746345 8.88791482942678 -3.16173706196333 C:G G C 10 0.522818519378046 0.267874636611497 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:C C T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 125562029 C/T 1 413 350 763 197.075951496867 182.986481782316 14.0894697145509 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.310464840719185 ENSG00000147684:ENST00000276689:exon_125562002_125562220:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517367:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000518657:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000524241:exon_125562002_125562219:NDUFB9;ENSG00000147684:ENST00000517830:exon_125562015_125562074:NDUFB9 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 3 10 13 1.43154444186586 5.22818519378046 -3.7966407519146 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0492332397122063 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 163 129 292 77.7805813413785 67.4435889997679 10.3369923416106 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.241393219282606 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 21 17 38 10.020811093061 8.88791482942678 1.13289626363425 A:G G A 10 0.522818519378046 0.747768058032766 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 44 34 78 20.995985147366 17.7758296588536 3.22015548851241 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.497693309426213 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 11 22 33 5.24899628684149 11.502007426317 -6.25301113947552 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0356505564478941 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 16 11 27 7.63490368995126 5.75100371315851 1.88389997679276 A:G G A 10 0.522818519378046 0.564684921071908 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 26 15 41 12.4067184961708 7.84227779067069 4.56444070550011 T:C T C 10 0.522818519378046 0.162621725579825 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 74 92 166 35.3114295660246 48.0993037827802 -12.7878742167556 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.0518941701915318 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144644666 A/G 1 116 103 219 55.3530517521467 53.8503074959387 1.50274425620792 A:G A G 10 0.522818519378046 0.892424100706381 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644618_144644691:GSDMD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144649968 C/T 1 3 7 10 1.43154444186586 3.65972963564632 -2.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 0.209645408646015 ENSG00000204839:ENST00000398882:exon_144649956_144650058:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000533210:exon_144649956_144650927:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000533679:exon_144649956_144650058:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000532704:exon_144649956_144650056:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000524906:exon_144649956_144650058:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000534459:exon_144649956_144650058:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000533083:exon_144649781_144650058:C8orf73;ENSG00000204839:ENST00000532862:exon_144649956_144650058:C8orf73 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 0 117 0 117 55.8302332327686 0 55.8302332327686 G G 10 0.522818519378046 1.32520210907941e-33 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144658664 G/A 1 45 18 63 21.4731666279879 9.41073334880483 12.0624332791831 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00231903907873773 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 38 47 85 18.1328962636343 24.5724704107682 -6.43957414713391 A:G G A 10 0.522818519378046 0.192317100793059 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 1645 1790 3435 784.963535623114 935.845149686702 -150.881614063588 A:T:C:G G A 10 0.522818519378046 2.6892306523503e-07 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144671955 C/T 1 12 10 22 5.72617776746345 5.22818519378046 0.497992573682987 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 11 10 21 5.24899628684149 5.22818519378046 0.0208110930610337 T:G G T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144688736 C/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 C:G C G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144688637_144688789:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144688637_144688849:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 61 59 120 29.1080703179392 30.8462926433047 -1.73822232536552 A:G A G 10 0.522818519378046 0.784307959663534 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144873348 G/A 1 87 85 172 41.51478881411 44.4395741471339 -2.92478533302391 A:G G A 10 0.522818519378046 0.702851952301635 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144873090_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144873090_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144873090_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531163:exon_144873095_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144873095_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144873095_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144873096_144873478:SCRIB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144877654 T/G 1 28 17 45 13.3610814574147 8.88791482942678 4.47316662798793 T:G T G 10 0.522818519378046 0.232226545545648 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144877590_144877700:SCRIB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145058763 C/G 1 43 40 83 20.518803666744 20.9127407751218 -0.39393710837782 C:G C G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058712_145058807:PARP10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145139727 C/T 1 62 59 121 29.5852517985611 30.8462926433047 -1.26104084474357 T:C C T 10 0.522818519378046 0.855782001586454 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139625_145139752:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139625_145139998:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139625_145140382:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000531593:exon_145139640_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145139696_145139778:GPAA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145140472 A/G 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 A:G A G 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145161823 G/A 1 250 220 470 119.295370155488 115.02007426317 4.27529589231837 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.711944678893736 ENSG00000179632:ENST00000322428:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534585:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000532522:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145161896 T/C 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145736254 C/T 1 33 19 52 15.7469888605245 9.93355186818287 5.81343699234161 T:C C T 10 0.522818519378046 0.126484131026525 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145736177_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 32 31 63 15.2698073799025 16.2073741007194 -0.9375667208169 T:C C T 10 0.522818519378046 0.89977401180023 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 8 12 20 3.81745184497563 6.27382223253655 -2.45637038756092 A:G G A 10 0.522818519378046 0.371143970102355 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145742468 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145742434_145742574:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534270:exon_145742217_145742574:RECQL4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 145947521 C/G 1 8 19 27 3.81745184497563 9.93355186818287 -6.11610002320724 C:G C G 10 0.522818519378046 0.020587003967958 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 8 146068594 T/C 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 T:C T C 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 2 11 13 0.954362961243908 5.75100371315851 -4.7966407519146 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0100466661678204 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 370244 A/G 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_368018_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_370230_370300:DOCK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 377111 G/C 1 4 8 12 1.90872592248782 4.18254815502437 -2.27382223253655 C:G G C 10 0.522818519378046 0.250445696561260 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 0 0 8 8 0 4.18254815502437 -4.18254815502437 T C T 10 0.522818519378046 0.00268824373972287 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 8 9 17 3.81745184497563 4.70536667440241 -0.887914829426783 C:G C G 10 0.522818519378046 0.809272960537847 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 449798 G/A 1 50 28 78 23.8590740310977 14.6389185425853 9.22015548851241 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0410188846228275 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 2029199 G/A 1 2 6 8 0.954362961243908 3.13691111626828 -2.18254815502437 A:G G A 10 0.522818519378046 0.162949786723774 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 83 54 137 39.6060628916222 28.2322000464145 11.3738628452077 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0595548100166699 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 57 60 117 27.1993443954514 31.3691111626828 -4.16976676723138 A:G G A 10 0.522818519378046 0.459963297108369 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 70 66 136 33.4027036435368 34.506022278951 -1.10331863541425 C:G C G 10 0.522818519378046 0.864048011629647 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 9 14 23 4.29463332559759 7.31945927129264 -3.02482594569506 T:G T G 10 0.522818519378046 0.21807391097219 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 43 52 95 20.518803666744 27.1865630076584 -6.66775934091437 A:G A G 10 0.522818519378046 0.182483872406745 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 14 8 22 6.68054072870736 4.18254815502437 2.49799257368299 T:C C T 10 0.522818519378046 0.393878100948442 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 7046917 A/G 1 5 8 13 2.38590740310977 4.18254815502437 -1.7966407519146 A:G A G 10 0.522818519378046 0.408515060546492 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 15591372 T/A 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 A:T T A 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15591364_15591554:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15591364_15591554:C9orf93 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 10 8 18 4.77181480621954 4.18254815502437 0.589266651195172 A:G A G 10 0.522818519378046 0.817977177829616 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 24 40 64 11.4523555349269 20.9127407751218 -9.46038524019495 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0235478859070732 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 32425910 A/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 33264540 C/G 0 0 267 267 0 139.592544673938 -139.592544673938 G C G 10 0.522818519378046 1.61627763597235e-86 ENSG00000107262:ENST00000379700:exon_33264222_33264737:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379707:exon_33264222_33264675:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379704:exon_33264222_33264761:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000473781:exon_33264204_33264557:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000488499:exon_33264274_33264668:AL161445.1;ENSG00000254882:ENST00000472232:exon_33264222_33264672:BAG1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 33442952 G/A 1 26 20 46 12.4067184961708 10.4563703875609 1.95034810860988 A:G G A 10 0.522818519378046 0.658469545429212 ENSG00000165272:ENST00000297991:exon_33442850_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000493581:exon_33441154_33443890:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494193:exon_33442883_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494313:exon_33442850_33443107:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000343952:exon_33442850_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000463983:exon_33442850_33443456:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000473153:exon_33442850_33442968:AQP3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 33462792 C/T 1 44 27 71 20.995985147366 14.1161000232072 6.87988512415873 T:C C T 10 0.522818519378046 0.122038729578658 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33461354_33462811:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000353159:exon_33461439_33462811:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379470:exon_33461450_33462811:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33461450_33462811:NOL6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 13 7 20 6.2033592480854 3.65972963564632 2.54362961243908 T:C T C 10 0.522818519378046 0.273132298373759 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 34107504 C/T 1 6 13 19 2.86308888373172 6.7966407519146 -3.93355186818287 T:C C T 10 0.522818519378046 0.105605407671991 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 T:C C T 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 34635602 C/T 1 44 40 84 20.995985147366 20.9127407751218 0.0832443722441347 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000476705:exon_34635392_34635805:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34635480_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34635494_34635855:SIGMAR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 8 11 19 3.81745184497563 5.75100371315851 -1.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.492069850622471 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 8 14 22 3.81745184497563 7.31945927129264 -3.50200742631701 A:G G A 10 0.522818519378046 0.142061348999446 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35660901 C/T 1 59 27 86 28.1537073566953 14.1161000232072 14.037607333488 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00240773338129670 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35660091_35660964:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35661057 C/G 1 69 39 108 32.9255221629148 20.3899222557438 12.535599907171 C:G C G 10 0.522818519378046 0.0160252253791804 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35661088 G/A 1 57 31 88 27.1993443954514 16.2073741007194 10.9919702947319 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0190293049952857 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 13 7 20 6.2033592480854 3.65972963564632 2.54362961243908 T:C T C 10 0.522818519378046 0.273132298373759 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 103 99 202 49.1496925040613 51.7590334184266 -2.6093409143653 A:C:G G A 10 0.522818519378046 0.725164131264644 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 18 34 52 8.58926665119517 17.7758296588536 -9.18656300765839 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0121022720389202 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 37489378 C/T 1 12 9 21 5.72617776746345 4.70536667440241 1.02081109306103 T:C C T 10 0.522818519378046 0.82776494190798 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37489312_37489397:POLR1E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 37801271 G/C 1 4 5 9 1.90872592248782 2.61409259689023 -0.705366674402414 C:G G C 10 0.522818519378046 0.744812333345895 ENSG00000122741:ENST00000377724:exon_37800499_37801402:DCAF10;ENSG00000122741:ENST00000242323:exon_37800790_37801402:DCAF10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 37948724 T/C 1 19 20 39 9.06644813181713 10.4563703875609 -1.38992225574379 T:C T C 10 0.522818519378046 0.749095693569684 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37948632_37948751:SHB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 37974743 T/C 1 8 13 21 3.81745184497563 6.7966407519146 -2.97918890693897 T:C T C 10 0.522818519378046 0.274460962299708 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37974619_37974834:SHB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 38016078 G/T 1 10 7 17 4.77181480621954 3.65972963564632 1.11208517057322 T:G G T 10 0.522818519378046 0.635194561032296 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_38016008_38016128:SHB;ENSG00000107338:ENST00000377700:exon_38016008_38016128:SHB HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 15 16 31 7.15772220932931 8.36509631004874 -1.20737410071943 T:C C T 10 0.522818519378046 0.72105496133213 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 16 21 37 7.63490368995126 10.979188906939 -3.3442852169877 T:C C T 10 0.522818519378046 0.324001381499262 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 71549957 A/G 1 21 23 44 10.020811093061 12.0248259456951 -2.00401485263403 A:G A G 10 0.522818519378046 0.550647233196772 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71549806_71549961:PIP5K1B HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 71835842 C/A 1 14 10 24 6.68054072870736 5.22818519378046 1.4523555349269 A:C C A 10 0.522818519378046 0.683818962617994 ENSG00000119139:ENST00000423935:exon_71835803_71836012:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71835803_71836412:TJP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 71869212 G/A 1 81 66 147 38.6516999303783 34.506022278951 4.14567765142723 A:G G A 10 0.522818519378046 0.509862129785499 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71869125_71870120:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71869125_71870120:TJP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 10 13 23 4.77181480621954 6.7966407519146 -2.02482594569506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.412738997944088 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 20 9 29 9.54362961243908 4.70536667440241 4.83826293803667 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0932207570937154 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 8 5 13 3.81745184497563 2.61409259689023 1.2033592480854 A:G A G 10 0.522818519378046 0.586262826765089 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 48 40 88 22.9047110698538 20.9127407751218 1.99197029473195 A:C C A 10 0.522818519378046 0.749079375470838 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 91993833 G/A 1 65 81 146 31.016796240427 42.3483000696217 -11.3315038291947 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.0681010923378836 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 93641199 T/C 1 30 19 49 14.3154444186586 9.93355186818287 4.38189255047575 T:C T C 10 0.522818519378046 0.252698826748261 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 23 27 50 10.9751740543049 14.1161000232072 -3.1409259689023 T:C C T 10 0.522818519378046 0.398075894512748 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 16 8 24 7.63490368995126 4.18254815502437 3.4523555349269 A:C C A 10 0.522818519378046 0.21957374400876 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 13 7 20 6.2033592480854 3.65972963564632 2.54362961243908 T:C C T 10 0.522818519378046 0.273132298373759 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 22 24 46 10.497992573683 12.5476444650731 -2.04965189139012 C:G G C 10 0.522818519378046 0.558556386350767 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 52 51 103 24.8134369923416 26.6637444882803 -1.85030749593874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.76753975474298 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 95841858 G/T 1 56 47 103 26.7221629148294 24.5724704107682 2.14969250406126 T:G G T 10 0.522818519378046 0.69415908827059 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95841753_95841884:SUSD3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100234702 A/G 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 A:G A G 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100234575_100234777:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100234575_100234777:TDRD7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100286431 C/A 1 15 4 19 7.15772220932931 2.09127407751218 5.06644813181713 A:C C A 10 0.522818519378046 0.0215396178358077 ENSG00000136842:ENST00000259365:exon_100286423_100286590:TMOD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100405627 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100405486_100405642:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100405486_100405642:NCBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 11 16 27 5.24899628684149 8.36509631004874 -3.11610002320724 A:G G A 10 0.522818519378046 0.252081759495933 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 14 12 26 6.68054072870736 6.27382223253655 0.406718496170803 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100675816 A/G 1 11 1 12 5.24899628684149 0.522818519378046 4.72617776746345 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0069569782863362 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100675534_100675840:C9orf156 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 38 32 70 18.1328962636343 16.7301926200975 1.40270364353678 T:G T G 10 0.522818519378046 0.811163276196086 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 90 111 201 42.9463332559759 58.0328556509631 -15.0865223949872 T:C T C 10 0.522818519378046 0.0342168821376657 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 97 98 195 46.2866036203295 51.2362148990485 -4.94961127871898 C:G G C 10 0.522818519378046 0.518921462417916 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 101984147 G/C 1 13 11 24 6.2033592480854 5.75100371315851 0.452355534926896 C:G G C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 1 13 12 25 6.2033592480854 6.27382223253655 -0.0704629844511508 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 19 20 39 9.06644813181713 10.4563703875609 -1.38992225574379 A:G G A 10 0.522818519378046 0.749095693569684 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 103204577 C/G 1 17 8 25 8.11208517057322 4.18254815502437 3.92953701554885 C:G C G 10 0.522818519378046 0.159960831497985 ENSG00000066697:ENST00000395067:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000398977:exon_103204188_103204623:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374885:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374886:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374887:exon_103204185_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000489377:exon_103204431_103204638:C9orf30;ENSG00000251349:ENST00000502978:exon_103204553_103204638:RP11-61P7.3;ENSG00000241697:ENST00000334943:exon_103204560_103204638:TMEFF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 104170350 A/G 1 5 7 12 2.38590740310977 3.65972963564632 -1.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.568000070744065 ENSG00000136870:ENST00000374861:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000339664:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000259395:exon_104170211_104172942:ZNF189 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 104171523 A/G 1 4 7 11 1.90872592248782 3.65972963564632 -1.75100371315851 A:G A G 10 0.522818519378046 0.370821073431422 ENSG00000136870:ENST00000374861:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000339664:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000259395:exon_104170211_104172942:ZNF189 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 3 9 12 1.43154444186586 4.70536667440241 -3.27382223253655 A:G G A 10 0.522818519378046 0.08126068111218 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 32 5 37 15.2698073799025 2.61409259689023 12.6557147830123 T:G T G 10 0.522818519378046 1.86795525978695e-05 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 3 5 8 1.43154444186586 2.61409259689023 -1.18254815502437 T:G T G 10 0.522818519378046 0.491152872875426 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114146832 C/T 1 34 30 64 16.2241703411464 15.6845555813414 0.539614759805056 T:C C T 10 0.522818519378046 0.901262481659945 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114174384 C/T 1 15 13 28 7.15772220932931 6.7966407519146 0.361081457414712 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 11 12 23 5.24899628684149 6.27382223253655 -1.02482594569506 T:C T C 10 0.522818519378046 0.682581532973703 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114182353 C/T 1 8 7 15 3.81745184497563 3.65972963564632 0.15772220932931 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114182297_114182400:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114182297_114182400:KIAA0368 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114184477 C/T 1 9 4 13 4.29463332559759 2.09127407751218 2.2033592480854 T:C C T 10 0.522818519378046 0.273369431451006 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 15 8 23 7.15772220932931 4.18254815502437 2.97517405430494 A:C C A 10 0.522818519378046 0.296634979118446 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 39 25 64 18.6100777442562 13.0704629844512 5.53961475980505 T:C T C 10 0.522818519378046 0.171130598681427 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 53 42 95 25.2906184729636 21.9583778138779 3.33224065908563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.53826795627977 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 37 33 70 17.6557147830123 17.2530111394755 0.402703643536778 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 13 9 22 6.2033592480854 4.70536667440241 1.49799257368299 A:G A G 10 0.522818519378046 0.670537830158736 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 116152891 A/G 1 6 11 17 2.86308888373172 5.75100371315851 -2.88791482942678 A:G A G 10 0.522818519378046 0.224355715478700 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 116152940 G/A 1 7 6 13 3.34027036435368 3.13691111626828 0.203359248085401 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000464749:exon_116152908_116153213:ALAD HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 117103838 T/C 1 49 54 103 23.3818925504757 28.2322000464145 -4.85030749593874 T:C T C 10 0.522818519378046 0.374937408982424 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 69 62 131 32.9255221629148 32.4147482014389 0.510773961475969 A:G A G 10 0.522818519378046 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 117118245 T/C 1 22 18 40 10.497992573683 9.41073334880483 1.08725922487816 T:C T C 10 0.522818519378046 0.754272363653691 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 117118379 C/T 1 20 12 32 9.54362961243908 6.27382223253655 3.26980737990253 T:C C T 10 0.522818519378046 0.290021356735681 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 117121881 G/A 1 23 21 44 10.9751740543049 10.979188906939 -0.00401485263402535 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117121874_117122074:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117121874_117122074:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117121874_117122074:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117121874_117122074:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117121874_117122074:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117121367_117122074:AKNA HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 5 9 14 2.38590740310977 4.70536667440241 -2.31945927129264 A:G A G 10 0.522818519378046 0.286230742866175 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 9 10 19 4.29463332559759 5.22818519378046 -0.933551868182875 C:G C G 10 0.522818519378046 0.819186685477746 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123342259 C/A 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:C C A 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123342198_123342436:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123342198_123342436:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123342198_123342283:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123342198_123342283:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123342198_123342339:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000491334:exon_123342198_123342448:CDK5RAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123342275 A/G 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 A:G A G 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123342198_123342436:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123342198_123342436:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123342198_123342283:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123342198_123342283:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123342198_123342437:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123342198_123342339:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000491334:exon_123342198_123342448:CDK5RAP2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:G A G 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 98 94 192 46.7637851009515 49.1449408215363 -2.38115572058484 A:G A G 10 0.522818519378046 0.772708904639227 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123675895 A/G 1 106 100 206 50.5812369459271 52.2818519378046 -1.70061499187748 A:C:G A G 10 0.522818519378046 0.834446917437934 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123675606_123676016:TRAF1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 25 31 56 11.9295370155488 16.2073741007194 -4.27783708517058 T:C C T 10 0.522818519378046 0.285194367807866 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 124103523 A/G 1 12 13 25 5.72617776746345 6.7966407519146 -1.07046298445115 A:G A G 10 0.522818519378046 0.693522691443741 ENSG00000148175:ENST00000286713:exon_124101355_124103686:STOM;ENSG00000148175:ENST00000347359:exon_124103048_124103686:STOM;ENSG00000148175:ENST00000442659:exon_124103480_124103651:STOM HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 64 75 139 30.5396147598051 39.2113889533534 -8.67177419354839 T:C C T 10 0.522818519378046 0.149240265797467 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 7 12 19 3.34027036435368 6.27382223253655 -2.93355186818287 A:G G A 10 0.522818519378046 0.250439240184576 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 127818276 C/T 1 6 2 8 2.86308888373172 1.04563703875609 1.81745184497563 T:C C T 10 0.522818519378046 0.293155778280834 ENSG00000173611:ENST00000414134:exon_127818155_127818286:SCAI;ENSG00000173611:ENST00000336505:exon_127818155_127818286:SCAI;ENSG00000173611:ENST00000373549:exon_127818155_127818286:SCAI;ENSG00000173611:ENST00000477186:exon_127818155_127818286:SCAI HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 43 50 93 20.518803666744 26.1409259689023 -5.62212230215828 A:G A G 10 0.522818519378046 0.254753684344942 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130494875 A/T 1 12 25 37 5.72617776746345 13.0704629844512 -7.3442852169877 A:T A T 10 0.522818519378046 0.0201511669315974 ENSG00000160404:ENST00000373284:exon_130494843_130494970:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373281:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463577:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000472723:exon_130494843_130497586:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000496460:exon_130494843_130494970:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000494135:exon_130494843_130495153:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000493439:exon_130494448_130494970:TOR2A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 42 24 66 20.0416221861221 12.5476444650731 7.49397772104896 A:G G A 10 0.522818519378046 0.083729885649699 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 13 8 21 6.2033592480854 4.18254815502437 2.02081109306103 A:G G A 10 0.522818519378046 0.393742775407513 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130670652 A/G 1 275 276 551 131.224907171037 144.297911348341 -13.0730041773033 A:G A G 10 0.522818519378046 0.267799999433676 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 78 66 144 37.2201554885124 34.506022278951 2.71413320956137 C:G G C 10 0.522818519378046 0.677149796388208 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 82 57 139 39.1288814110002 29.8006556045486 9.32822580645161 A:G A G 10 0.522818519378046 0.126295507733055 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 A:G A G 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130925911 A/C 1 305 302 607 145.540351589696 157.89119285217 -12.3508412624739 A:C A C 10 0.522818519378046 0.329519092499868 ENSG00000171159:ENST00000372994:exon_130925722_130926207:C9orf16;ENSG00000171159:ENST00000492588:exon_130925722_130926169:C9orf16;ENSG00000171159:ENST00000486420:exon_130925722_130926016:C9orf16 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130938650 G/A 1 56 38 94 26.7221629148294 19.8671037363657 6.85505917846367 A:G G A 10 0.522818519378046 0.179426816859369 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000465583:exon_130938630_130938707:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000471839:exon_130938630_130938754:CIZ1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130941451 C/T 1 38 34 72 18.1328962636343 17.7758296588536 0.357066604780687 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130941352_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130941268_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130941352_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130941268_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130941330_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130941396_130941694:CIZ1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 130948018 G/A 1 24 24 48 11.4523555349269 12.5476444650731 -1.09528893014621 A:G G A 10 0.522818519378046 0.774285689678662 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000474442:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000420484:exon_130947908_130948055:CIZ1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131020382 C/G 1 26 19 45 12.4067184961708 9.93355186818287 2.47316662798793 C:G C G 10 0.522818519378046 0.55110155824902 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131020400 C/G 1 29 19 48 13.8382629380367 9.93355186818287 3.90471106985379 C:G C G 10 0.522818519378046 0.312058822937422 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 30 19 49 14.3154444186586 9.93355186818287 4.38189255047575 A:G G A 10 0.522818519378046 0.252698826748261 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131346710 C/A 1 26 19 45 12.4067184961708 9.93355186818287 2.47316662798793 A:C C A 10 0.522818519378046 0.55110155824902 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131346561_131346804:SPTAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 32 27 59 15.2698073799025 14.1161000232072 1.15370735669529 T:C C T 10 0.522818519378046 0.79554759003875 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 74 98 172 35.3114295660246 51.2362148990485 -15.9247853330239 A:T:C C T 10 0.522818519378046 0.0177261887101424 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 34 41 75 16.2241703411464 21.4355592944999 -5.21138895335345 T:C C T 10 0.522818519378046 0.248506065400619 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131483551 T/A 1 182 152 334 86.8470294731956 79.468414945463 7.37861452773262 A:T T A 10 0.522818519378046 0.443273446838912 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:C C T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131849063 C/T 1 7 8 15 3.34027036435368 4.18254815502437 -0.84227779067069 T:C C T 10 0.522818519378046 0.797632243641906 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 131898801 C/T 1 30 39 69 14.3154444186586 20.3899222557438 -6.07447783708517 T:C C T 10 0.522818519378046 0.149670888481381 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000455292:exon_131898750_131898835:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000452489:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000445241:exon_131898750_131898845:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000417728:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000455240:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000411917:exon_131898776_131898874:PPP2R4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 132400086 C/T 1 19 16 35 9.06644813181713 8.36509631004874 0.701351821768389 T:C C T 10 0.522818519378046 0.86672112730153 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 132597462 G/A 1 24 13 37 11.4523555349269 6.7966407519146 4.6557147830123 A:G G A 10 0.522818519378046 0.140158336005414 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132597418_132597572:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132597418_132597554:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132597418_132597533:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132597418_132597572:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000492991:exon_132597418_132597560:C9orf78 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 185 178 363 88.2785739150615 93.0616964492922 -4.7831225342307 T:C C T 10 0.522818519378046 0.636436804971851 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 132662825 G/C 1 213 220 433 101.639655372476 115.02007426317 -13.3804188906939 C:G G C 10 0.522818519378046 0.210988100944056 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 133760029 C/G 1 3 6 9 1.43154444186586 3.13691111626828 -1.70536667440241 C:G C G 10 0.522818519378046 0.325504437201279 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 133760592 C/T 1 14 8 22 6.68054072870736 4.18254815502437 2.49799257368299 T:C C T 10 0.522818519378046 0.393878100948442 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 7 2 9 3.34027036435368 1.04563703875609 2.29463332559759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.18378361706504 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 5 3 8 2.38590740310977 1.56845555813414 0.817451844975632 T:G G T 10 0.522818519378046 0.728833389284679 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 2 8 10 0.954362961243908 4.18254815502437 -3.22818519378046 A:G A G 10 0.522818519378046 0.0558371898362823 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 30 12 42 14.3154444186586 6.27382223253655 8.04162218612207 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0133387985266028 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 8 4 12 3.81745184497563 2.09127407751218 1.72617776746345 T:C T C 10 0.522818519378046 0.393713045033345 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 18 14 32 8.58926665119517 7.31945927129264 1.26980737990253 T:C C T 10 0.522818519378046 0.725061426809395 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 135158690 C/T 1 6 5 11 2.86308888373172 2.61409259689023 0.248996286841494 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135158651_135158800:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135158651_135158800:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135158651_135158800:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135158651_135158800:SETX;ENSG00000107290:ENST00000474172:exon_135158157_135158800:SETX HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 61 48 109 29.1080703179392 25.0952889301462 4.01278138779298 A:G G A 10 0.522818519378046 0.502288760640825 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 58 47 105 27.6765258760733 24.5724704107682 3.10405546530517 A:T:G G A 10 0.522818519378046 0.55927516401541 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 70 65 135 33.4027036435368 33.983203759573 -0.580500116036212 A:G A G 10 0.522818519378046 0.931543322697511 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 4 6 10 1.90872592248782 3.13691111626828 -1.22818519378046 A:C C A 10 0.522818519378046 0.534096946039669 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 136629183 G/A 1 20 23 43 9.54362961243908 12.0248259456951 -2.48119633325598 A:G G A 10 0.522818519378046 0.541955536584154 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136627017_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136627017_136629231:VAV2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 136633606 G/A 1 19 18 37 9.06644813181713 9.41073334880483 -0.344285216987704 A:G G A 10 0.522818519378046 1 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 138377301 C/T 1 5 5 10 2.38590740310977 2.61409259689023 -0.22818519378046 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 138392889 C/A 1 88 74 162 41.9919702947319 38.6885704339754 3.30339986075654 A:C C A 10 0.522818519378046 0.637332556566952 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000488610:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000485333:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000462948:exon_138392844_138393172:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472852:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000453385:exon_138392759_138392969:MRPS2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139100805 T/C 1 5 4 9 2.38590740310977 2.09127407751218 0.294633325597586 T:C T C 10 0.522818519378046 1 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139270806 G/A 1 46 34 80 21.9503481086099 17.7758296588536 4.17451844975632 A:G G A 10 0.522818519378046 0.372096278980983 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 14 3 17 6.68054072870736 1.56845555813414 5.11208517057322 A:C A C 10 0.522818519378046 0.0142527225324668 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 C:G G C 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139297266 C/T 1 59 27 86 28.1537073566953 14.1161000232072 14.037607333488 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00240773338129670 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139296932_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139297096_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139297117_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139297134_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139297240_139297339:SDCCAG3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 41 15 56 19.5644407055001 7.84227779067069 11.7221629148294 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00185821736477340 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 7 9 16 3.34027036435368 4.70536667440241 -1.36509631004874 A:C C A 10 0.522818519378046 0.618775956339144 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139336261 G/A 1 28 35 63 13.3610814574147 18.2986481782316 -4.9375667208169 A:G G A 10 0.522818519378046 0.256203680448994 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139334549_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000467838:exon_139334553_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313084:exon_139334555_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000433860:exon_139334557_139336275:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139336131_139336275:SEC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139360719 G/T 1 5 6 11 2.38590740310977 3.13691111626828 -0.751003713158506 T:G G T 10 0.522818519378046 0.766565170835604 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000433860:exon_139360716_139360914:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139360716_139360914:SEC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 T:C C T 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139369200 A/G 1 1 11 12 0.477181480621954 5.75100371315851 -5.27382223253655 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00238898541265340 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139371405 G/C 1 8 1 9 3.81745184497563 0.522818519378046 3.29463332559759 C:G G C 10 0.522818519378046 0.0408240753817743 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 6 8 14 2.86308888373172 4.18254815502437 -1.31945927129264 A:G G A 10 0.522818519378046 0.59565373477581 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 4 4 8 1.90872592248782 2.09127407751218 -0.182548155024368 A:G G A 10 0.522818519378046 1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139717981 G/A 1 32 35 67 15.2698073799025 18.2986481782316 -3.02884079832908 A:G G A 10 0.522818519378046 0.4660586533216 ENSG00000196642:ENST00000471502:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139717977_139718111:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139717978_139718111:C9orf86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 70 60 130 33.4027036435368 31.3691111626828 2.03359248085402 T:C C T 10 0.522818519378046 0.726556946842726 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139815612 C/T 1 10 10 20 4.77181480621954 5.22818519378046 -0.45637038756092 T:C C T 10 0.522818519378046 1 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139815490_139815667:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139815490_139815667:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139815490_139815667:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139815490_139815667:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000466107:exon_139815577_139815667:TRAF2 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139836576 C/T 1 58 77 135 27.6765258760733 40.2570259921095 -12.5805001160362 T:C C T 10 0.522818519378046 0.0313351105177822 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836498_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836552_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836207_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836498_139836918:FBXW5 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 139925927 G/C 1 69 49 118 32.9255221629148 25.6181074495243 7.30741471339057 C:G G C 10 0.522818519378046 0.197101121745956 ENSG00000180549:ENST00000314412:exon_139924626_139926177:FUT7 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 140476980 T/C 1 91 78 169 43.4235147365978 40.7798445114876 2.64367022511022 T:C T C 10 0.522818519378046 0.700826305054016 ENSG00000165724:ENST00000298585:exon_140476531_140477138:ZMYND19 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 140509302 G/T 1 50 36 86 23.8590740310977 18.8214666976097 5.03760733348804 T:G G T 10 0.522818519378046 0.282849368013439 ENSG00000197070:ENST00000371421:exon_140509011_140509452:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000424603:exon_140509011_140509452:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000405007:exon_140509011_140509452:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000491911:exon_140509011_140509811:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000475658:exon_140509011_140509350:ARRDC1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 13 5 18 6.2033592480854 2.61409259689023 3.58926665119517 T:C T C 10 0.522818519378046 0.10244697097803 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . 9 140648742 C/T 1 31 10 41 14.7926258992806 5.22818519378046 9.56444070550011 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00271934517072894 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000462942:exon_140648623_140648743:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000465566:exon_140648683_140648743:EHMT1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 14 6 20 6.68054072870736 3.13691111626828 3.54362961243908 T:C T C 10 0.522818519378046 0.122855061020348 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 230877 A/G 1 6 3 9 2.86308888373172 1.56845555813414 1.29463332559759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.511900100712421 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_230817_230884:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_230817_230886:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_230817_230884:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_230817_230886:GTPBP6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 295079 C/T 1 29 10 39 13.8382629380367 5.22818519378046 8.61007774425621 T:C C T 10 0.522818519378046 0.00602822739034047 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 33 15 48 15.7469888605245 7.84227779067069 7.90471106985379 T:C T C 10 0.522818519378046 0.029176154509891 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 295135 G/A 1 36 14 50 17.1785333023903 7.31945927129264 9.8590740310977 A:G G A 10 0.522818519378046 0.00656720866510604 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 41 15 56 19.5644407055001 7.84227779067069 11.7221629148294 A:G A G 10 0.522818519378046 0.00185821736477340 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 322161 A/G 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 A:G A G 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 322193 C/T 1 11 5 16 5.24899628684149 2.61409259689023 2.63490368995126 T:C C T 10 0.522818519378046 0.217724522020312 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 1467404 A/C 1 65 2 67 31.016796240427 1.04563703875609 29.9711592016709 A:C A C 10 0.522818519378046 2.7603587430772e-16 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1467324_1467438:IL3RA HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 2084 2017 4101 994.446205616152 1054.52495358552 -60.0787479693669 A:G G A 10 0.522818519378046 0.0606907383285032 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 119 50 169 56.7845961940125 26.1409259689023 30.6436702251102 C:G C G 10 0.522818519378046 2.07449077832806e-06 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 115 53 168 54.8758702715247 27.7093815270364 27.1664887444883 T:C C T 10 0.522818519378046 2.63047416321419e-05 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 76 65 141 36.2657925272685 33.983203759573 2.28258876769551 A:G G A 10 0.522818519378046 0.736296526211072 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 82 83 165 39.1288814110002 43.3939371083778 -4.26505569737759 A:G A G 10 0.522818519378046 0.533345333563731 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 12994365 C/T 1 1238 485 1723 590.750673009979 253.566981898352 337.183691111627 T:C C T 10 0.522818519378046 1.08108413517825e-61 ENSG00000205542:ENST00000380638:exon_12994365_12994480:TMSB4X;ENSG00000205542:ENST00000451311:exon_12994365_12994480:TMSB4X;ENSG00000205542:ENST00000380636:exon_12993229_12994480:TMSB4X;ENSG00000205542:ENST00000380635:exon_12994365_12994480:TMSB4X;ENSG00000205542:ENST00000380633:exon_12994365_12994480:TMSB4X HGDP01259_parsed_pileup.txt . X 153284483 G/A 0 0 18 18 0 9.41073334880483 -9.41073334880483 A G A 10 0.522818519378046 1.64552485677543e-06 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444230:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284426_153284529:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284426_153284529:IRAK1