INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 61 103 164 28.687704936152 54.56010477994 -25.872399843788 A:G G A 10 0.529709755145049 5.88186727047947e-05 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 909238 G/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000187583:ENST00000379410:exon_909213_909431:PLEKHN1;ENSG00000187583:ENST00000379407:exon_909213_909431:PLEKHN1;ENSG00000187583:ENST00000379409:exon_909213_909431:PLEKHN1;ENSG00000187583:ENST00000491024:exon_909213_909431:PLEKHN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 948921 T/C 1 1625 1273 2898 764.221647889295 674.320518299647 89.9011295896479 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.000862396776923617 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 2068 1846 3914 972.560226360039 977.84420799776 -5.28398163772181 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.872787879620808 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 984302 T/C 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 T:C T C 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 990280 C/T 1 52 37 89 24.4550927324575 19.5992609403668 4.85583179209064 T:C C T 10 0.529709755145049 0.33956516916984 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1139202 T/C 1 50 35 85 23.5145122427475 18.5398414300767 4.97467081267083 T:C T C 10 0.529709755145049 0.328160637464381 ENSG00000186891:ENST00000328596:exon_1138888_1139340:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1138891_1139348:TNFRSF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1164031 A/G 1 79 100 179 37.1529293435411 52.9709755145049 -15.8180461709638 A:G A G 10 0.529709755145049 0.020079854935521 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1164072 C/T 1 88 90 178 41.3855415472357 47.6738779630544 -6.28833641581873 T:C C T 10 0.529709755145049 0.367807109318746 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1164179 G/A 1 74 72 146 34.8014781192664 38.1391023704435 -3.33762425117716 A:G G A 10 0.529709755145049 0.619114253638953 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1178245 C/T 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000184163:ENST00000462849:exon_1178215_1178293:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000478606:exon_1178215_1178538:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000330388:exon_1178215_1178293:FAM132A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1178482 A/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000184163:ENST00000462849:exon_1178442_1178843:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000478606:exon_1178215_1178538:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000330388:exon_1178442_1178532:FAM132A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 122 114 236 57.375409872304 60.3869120865356 -3.01150221423157 T:C T C 10 0.529709755145049 0.696211219949045 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 71 76 147 33.3906073847015 40.2579413910237 -6.86733400632221 A:G G A 10 0.529709755145049 0.282810419272914 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1254777 T/C 1 63 34 97 29.6282854258619 18.0101316749317 11.6181537509302 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0191625643993403 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1254676_1254813:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526797:exon_1254676_1254813:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 71 53 124 33.3906073847015 28.0746170226876 5.31599036201392 C:G C G 10 0.529709755145049 0.368712151316432 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 A:G G A 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1274969 G/A 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1274962_1275029:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1274962_1275029:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1274962_1275029:DVL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1322654 C/T 1 148 102 250 69.6029562385327 54.030395024795 15.5725612137377 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0496230504787584 ENSG00000221978:ENST00000480479:exon_1321091_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000482621:exon_1321862_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000463260:exon_1321875_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000400809:exon_1321875_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000496007:exon_1321879_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000400810:exon_1321879_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000482365:exon_1321882_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000481223:exon_1322088_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000408952:exon_1322088_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000418865:exon_1322093_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000505849:exon_1322502_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000488340:exon_1322612_1322962:CCNL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1337539 T/A 1 374 376 750 175.888551575752 199.170867934538 -23.2823163587868 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0924154068088754 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1337288_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000493287:exon_1337293_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1337293_1337636:MRPL20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 20 3 23 9.40580489709902 1.58912926543515 7.81667563166387 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00115568681129318 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 33 31 64 15.5195780802134 16.4210024094965 -0.901424329283138 T:C T C 10 0.529709755145049 0.900491004480092 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 T:C T C 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1572458 G/A 1 29 28 57 13.6384171007936 14.8318731440614 -1.19345604326779 A:G G A 10 0.529709755145049 0.791547052727124 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572443_1572564:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572443_1572564:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572443_1572564:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572443_1572564:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572443_1572564:CDK11A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 33 25 58 15.5195780802134 13.2427438786262 2.27683420158716 T:C C T 10 0.529709755145049 0.599950416169728 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 1635619 T/C 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 10 16 26 4.70290244854951 8.47535608232078 -3.77245363377128 T:C C T 10 0.529709755145049 0.169393564329476 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 77 93 170 36.2123488538312 49.2630072284896 -13.0506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.045975911939646 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 3701795 G/A 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 3703698 A/G 1 51 40 91 23.9848024876025 21.188390205802 2.79641228180054 A:G A G 10 0.529709755145049 0.600202771463386 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 3807360 G/A 1 25 23 48 11.7572561213738 12.1833243683361 -0.426068246962354 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 6609659 G/A 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6609631_6609758:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000460777:exon_6609316_6609758:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464665:exon_6609422_6609758:NOL9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 6614535 G/A 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6614167_6614595:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464665:exon_6614167_6614560:NOL9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 18 18 36 8.46522440738912 9.53477559261088 -1.06955118522177 C:G G C 10 0.529709755145049 0.741182689376126 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 6711146 T/C 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:C T C 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6711077_6711240:DNAJC11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 7890117 T/C 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7889894_7890221:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7889897_7890221:PER3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 7895966 C/T 1 11 1 12 5.17319269340446 0.529709755145049 4.64348293825941 A:T:C C A 10 0.529709755145049 0.00738677532629672 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7895822_7896005:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7895822_7896005:PER3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 20 9 29 9.40580489709902 4.76738779630544 4.63841710079358 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0954179214299481 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 20 10 30 9.40580489709902 5.29709755145049 4.10870734564853 T:C T C 10 0.529709755145049 0.146473133160998 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 8421203 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 9129620 C/T 1 14 14 28 6.58406342796931 7.41593657203069 -0.831873144061372 T:C C T 10 0.529709755145049 0.850483860830919 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9129563_9129775:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000456780:exon_9129563_9129887:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9129563_9129663:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000473209:exon_9129563_9129653:SLC2A5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 9777122 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9777017_9777166:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9777122_9777166:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9777122_9777166:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000479223:exon_9777017_9777166:PIK3CD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 50 49 99 23.5145122427475 25.9557780021074 -2.44126575935985 T:C C T 10 0.529709755145049 0.687363826854723 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 21 21 42 9.87609514195397 11.123904858046 -1.24780971609206 A:G A G 10 0.529709755145049 0.758185523015664 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 10218439 T/C 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10218412_10218540:UBE4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 116 109 225 54.5536684031743 57.7383633108103 -3.18469490763603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.68894222868813 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 10521649 C/T 1 39 31 70 18.3413195493431 16.4210024094965 1.92031713984657 T:C C T 10 0.529709755145049 0.719813311900803 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 11718390 G/A 1 19 16 35 8.93551465224407 8.47535608232078 0.460158569923284 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132879:ENST00000251546:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000425796:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376770:exon_11718324_11718450:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376768:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000251547:exon_11718324_11718450:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376762:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000376760:exon_11718324_11718421:FBXO44;ENSG00000132879:ENST00000475435:exon_11718324_11718421:FBXO44 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 11854476 T/G 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 T:G T G 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 11883731 C/T 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.247772282984734 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 22 12 34 10.3463853868089 6.35651706174059 3.98986832506833 T:C C T 10 0.529709755145049 0.228650012076690 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 42 36 78 19.7521902839079 19.0695511852218 0.682639098686174 T:C T C 10 0.529709755145049 0.910062137981335 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 A:G A G 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 23 21 44 10.8166756316639 11.123904858046 -0.307229226382159 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 20 19 39 9.40580489709902 10.0644853477559 -0.658680450656913 A:G G A 10 0.529709755145049 0.873443340813217 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 40 33 73 18.811609794198 17.4804219197866 1.33118787441142 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.814991582331112 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 15546077 G/A 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.130404884079537 ENSG00000171729:ENST00000428417:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376014:exon_15545822_15546835:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000400796:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000434578:exon_15545822_15546973:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000376008:exon_15545822_15546974:TMEM51;ENSG00000171729:ENST00000303840:exon_15545822_15546872:TMEM51 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 165 137 302 77.5978904010669 72.5702364548717 5.02765394619519 T:C C T 10 0.529709755145049 0.565021639710886 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16042766 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16042732_16042838:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000462455:exon_16042732_16042838:PLEKHM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 21 22 43 9.87609514195397 11.6536146131911 -1.77751947123711 A:G G A 10 0.529709755145049 0.647821327723492 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 A:G A G 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16525056 G/T 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 T:G G T 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000142632:ENST00000478117:exon_16524349_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000270747:exon_16524599_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000421561:exon_16524599_16525139:ARHGEF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16641882 C/T 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 16641899 C/T 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16641664_16641930:FBXO42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 34 14 48 15.9898683250683 7.41593657203069 8.57393175303765 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0137421331454086 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 20 25 45 9.40580489709902 13.2427438786262 -3.83693898152721 A:G G A 10 0.529709755145049 0.296234181328756 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 17313391 G/C 1 31 21 52 14.5789975905035 11.123904858046 3.45509273245745 C:G G C 10 0.529709755145049 0.404872063718992 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 16 13 29 7.52464391767922 6.88622681688564 0.638417100793578 A:G G A 10 0.529709755145049 0.854345466479414 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 17380497 G/T 1 58 58 116 27.2768342015872 30.7231657984128 -3.44633159682569 T:G G T 10 0.529709755145049 0.57698780115986 ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17380443_17380665:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000485515:exon_17380443_17380502:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000466613:exon_17380443_17380526:SDHB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 19550002 G/A 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 A:G G A 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000494770:exon_19549890_19550063:KIAA0090 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 165 111 276 77.5978904010669 58.7977828211004 18.8001075799665 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0255316512814126 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 19635011 C/T 1 28 20 48 13.1681268559386 10.594195102901 2.57393175303765 T:C C T 10 0.529709755145049 0.473810628831918 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 19652874 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19652739_19652881:PQLC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 19950062 T/C 1 321 443 764 150.963168598439 234.661421529257 -83.6982529308175 A:T:C:G T C 10 0.529709755145049 1.54521871797412e-09 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 20009790 C/T 1 11 3 14 5.17319269340446 1.58912926543515 3.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0634340540694462 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20009781_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20009781_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 20827258 G/A 1 13 20 33 6.11377318311436 10.594195102901 -4.48042191978662 A:G G A 10 0.529709755145049 0.161986586127638 ENSG00000090432:ENST00000264198:exon_20825943_20827912:MUL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 21573722 G/A 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21573714_21573856:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000528294:exon_21573714_21573856:ECE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 22852715 G/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 C:G G C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000184677:ENST00000374651:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000404138:exon_22852695_22857650:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000375647:exon_22852695_22857647:ZBTB40;ENSG00000184677:ENST00000374649:exon_22852695_22857647:ZBTB40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 70 54 124 32.9203171398466 28.6043267778326 4.31599036201392 T:C C T 10 0.529709755145049 0.472168086135138 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 35 10 45 16.4601585699233 5.29709755145049 11.1630610184728 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000836622039791664 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 24 6 30 11.2869658765188 3.17825853087029 8.10870734564853 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0029698695183864 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 27 8 35 12.6978366110837 4.23767804116039 8.46015856992328 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00383433595261118 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 22 20 42 10.3463853868089 10.594195102901 -0.24780971609206 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 25 16 41 11.7572561213738 8.47535608232078 3.28190003905299 T:C C T 10 0.529709755145049 0.349362749891687 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 18 14 32 8.46522440738912 7.41593657203069 1.04928783535843 A:G A G 10 0.529709755145049 0.727553030410456 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 17 14 31 7.99493416253417 7.41593657203069 0.57899759050348 A:G A G 10 0.529709755145049 0.859395359335908 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 7 16 23 3.29203171398466 8.47535608232078 -5.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0361856200107406 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 9 13 22 4.23261220369456 6.88622681688564 -2.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.290050920028368 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 24978051 G/C 1 120 103 223 56.4348293825941 54.56010477994 1.87472460265407 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.840592476167146 ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24977900_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24977990_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000467454:exon_24977900_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000468822:exon_24977990_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000374389:exon_24977900_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000479034:exon_24977900_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000494934:exon_24977990_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000485441:exon_24977900_24978103:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000470243:exon_24978011_24978103:SRRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26161857 T/C 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127423:ENST00000374298:exon_26160497_26162337:C1orf135 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26582091 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26581662_26582356:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26581662_26582356:CCDC21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26596080 G/A 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000453146:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000469609:exon_26595951_26596105:CCDC21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 36 25 61 16.9304488147782 13.2427438786262 3.68770493615201 T:C C T 10 0.529709755145049 0.371150110228715 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26612460 G/A 1 3 11 14 1.41087073456485 5.82680730659554 -4.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0285508012529876 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374215:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000452980:exon_26612367_26612528:UBXN11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 1793 1390 3183 843.230409024927 736.296559651618 106.933849373309 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000144301883280431 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 1785 1387 3172 839.468087066087 734.707430386183 104.760656679905 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.000200258899582563 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 17 19 36 7.99493416253417 10.0644853477559 -2.06955118522177 A:G G A 10 0.529709755145049 0.508630438317214 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 55 36 91 25.8659634670223 19.0695511852218 6.79641228180054 T:C T C 10 0.529709755145049 0.172290406758722 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26900708 G/A 1 79 67 146 37.1529293435411 35.4905535947183 1.66237574882284 A:G G A 10 0.529709755145049 0.80403283749701 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 26900920 A/T 1 105 88 193 49.3804757097699 46.6144584527643 2.76601725700554 A:T A T 10 0.529709755145049 0.718732564288104 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26900868_26900934:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000438977:exon_26900868_26901225:RPS6KA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 27942176 T/C 0 18 0 18 8.46522440738912 0 8.46522440738912 T T 10 0.529709755145049 1.20480548160264e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28208705 C/T 1 55 50 105 25.8659634670223 26.4854877572525 -0.619524290230146 T:C C T 10 0.529709755145049 0.922362707902672 ENSG00000130775:ENST00000442118:exon_28208482_28208986:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28211835 C/T 1 112 123 235 52.6725074237545 65.154299882841 -12.4817924590865 T:C C T 10 0.529709755145049 0.116606063902515 ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373927:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28211806_28211928:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000492877:exon_28209909_28211962:C1orf38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28476520 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C:G T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000169403:ENST00000373857:exon_28473677_28477570:PTAFR;ENSG00000169403:ENST00000305392:exon_28476184_28477570:PTAFR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 573 487 1060 269.476310301887 257.968650755639 11.507659546248 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.498474358111777 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 31 26 57 14.5789975905035 13.7724536337713 0.806543956732206 A:G A G 10 0.529709755145049 0.89477448575595 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28800380 C/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:C C A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28800066_28800663:PHACTR4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 20 15 35 9.40580489709902 7.94564632717574 1.46015856992328 A:G G A 10 0.529709755145049 0.735488227131445 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 29475648 T/G 1 133 122 255 62.5486025657085 64.624590127696 -2.0759875619875 T:G T G 10 0.529709755145049 0.802162001537923 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000434636:exon_29475262_29475738:SRSF4;ENSG00000116350:ENST00000466448:exon_29475183_29475738:SRSF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 29529699 T/C 1 24 15 39 11.2869658765188 7.94564632717574 3.34131954934309 T:C T C 10 0.529709755145049 0.336707319671434 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475773:exon_29529643_29529713:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463412:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000453185:exon_29529643_29529745:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29529654_29529745:MECR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 29542637 A/G 1 20 19 39 9.40580489709902 10.0644853477559 -0.658680450656913 A:G A G 10 0.529709755145049 0.873443340813217 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29542513_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29542517_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29542549_29542648:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29542605_29542648:MECR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 700 725 1425 329.203171398466 384.039572480161 -54.8364010816949 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.00380787600007455 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 544 570 1114 255.837893201093 301.934560432678 -46.0966672315846 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00575065380253038 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 19 12 31 8.93551465224407 6.35651706174059 2.57899759050348 A:G A G 10 0.529709755145049 0.374617294226683 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 188 178 366 88.4145660327308 94.2883364158187 -5.87377038308796 A:G G A 10 0.529709755145049 0.564696728494971 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 8 11 19 3.76232195883961 5.82680730659554 -2.06448534775593 T:C T C 10 0.529709755145049 0.366887546614125 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 31907089 T/C 1 25 28 53 11.7572561213738 14.8318731440614 -3.0746170226876 T:C T C 10 0.529709755145049 0.41210460888 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31906911_31907524:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31906911_31907525:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31906911_31907524:SERINC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 100 130 230 47.0290244854951 68.8622681688564 -21.8332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00441939546988785 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 32667609 C/T 1 200 182 382 94.0580489709902 96.4071754363989 -2.34912646540873 T:C C T 10 0.529709755145049 0.837601971187417 ENSG00000160050:ENST00000373602:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000469003:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000421922:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000461819:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000483009:exon_32667297_32667700:CCDC28B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 36202585 G/A 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36202515_36202676:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000466308:exon_36202515_36202676:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36202515_36202676:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36202515_36202676:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36202515_36202676:CLSPN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 17 22 39 7.99493416253417 11.6536146131911 -3.65868045065691 T:C T C 10 0.529709755145049 0.263798401464573 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 61 61 122 28.687704936152 32.312295063848 -3.62459012769598 T:C C T 10 0.529709755145049 0.526508195493787 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 38 22 60 17.8710293044881 11.6536146131911 6.21741469129706 A:G G A 10 0.529709755145049 0.120983405969157 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 36807481 C/T 1 19 14 33 8.93551465224407 7.41593657203069 1.51957808021338 T:C C T 10 0.529709755145049 0.727862479978695 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 37948912 C/T 1 41 42 83 19.281900039053 22.2478097160921 -2.96590967703907 T:C C T 10 0.529709755145049 0.582727291379165 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 38019747 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000163877:ENST00000296215:exon_38019607_38019903:SNIP1;ENSG00000163877:ENST00000436196:exon_38019607_38019903:SNIP1;ENSG00000163877:ENST00000493916:exon_38019607_38019891:SNIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 38149076 G/A 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:G G A 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38148991_38149109:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38148991_38149148:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148991_38149113:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464085:exon_38148991_38149109:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000491981:exon_38148991_38149109:C1orf109 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 97 68 165 45.6181537509302 36.0202633498633 9.59789040106691 T:G G T 10 0.529709755145049 0.138969429312851 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 29 26 55 13.6384171007936 13.7724536337713 -0.134036532977696 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 38449910 T/C 1 32 38 70 15.0492878353584 20.1289706955119 -5.07968286015343 T:C T C 10 0.529709755145049 0.233117348469055 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 T:C:G C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 39494426 C/T 1 1242 1034 2276 584.100484109849 547.719886819981 36.3805972898683 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.130554023687611 ENSG00000168653:ENST00000372969:exon_39494395_39494612:NDUFS5;ENSG00000168653:ENST00000372967:exon_39494395_39494612:NDUFS5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 19 17 36 8.93551465224407 9.00506583746583 -0.0695511852217656 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 40027464 G/A 1 15 9 24 7.05435367282426 4.76738779630544 2.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.416155235770821 ENSG00000090621:ENST00000482028:exon_40027357_40027682:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000468476:exon_40026488_40027875:PABPC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 40226046 G/A 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000116985:ENST00000372827:exon_40222854_40226240:BMP8B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 40773123 G/C 1 17 22 39 7.99493416253417 11.6536146131911 -3.65868045065691 C:G G C 10 0.529709755145049 0.263798401464573 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 40881041 C/G 1 125 105 230 58.7862806068689 55.6195242902301 3.16675631663873 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.692283283131053 ENSG00000084070:ENST00000435168:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40880944_40881053:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000487871:exon_40880944_40881041:SMAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 40980668 T/C 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 T:C T C 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 34 30 64 15.9898683250683 15.8912926543515 0.0985756707168619 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 41 17 58 19.281900039053 9.00506583746583 10.2768342015872 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.00802445662580354 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 A:G G A 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 44415415 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 45269333 A/G 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 A:G A G 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45269272_45269696:PLK3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 45808659 C/T 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 T:C C T 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808515_45808674:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808407_45808674:TOE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 45809220 C/T 1 36 17 53 16.9304488147782 9.00506583746583 7.9253829773124 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0380172569386071 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808754_45809647:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808754_45809636:TOE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46501270 C/T 1 21 30 51 9.87609514195397 15.8912926543515 -6.0151975123975 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0943391450622945 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46501227_46501329:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46521517 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000117461:ENST00000372006:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000262741:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000340332:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000420542:exon_46521467_46521643:PIK3R3;ENSG00000117461:ENST00000488808:exon_46521467_46523106:PIK3R3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C T C 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46782192 A/G 1 27 23 50 12.6978366110837 12.1833243683361 0.514512242747548 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46806480 C/T 0 9 0 9 4.23261220369456 0 4.23261220369456 C C 10 0.529709755145049 0.0044089015254185 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 20 9 29 9.40580489709902 4.76738779630544 4.63841710079358 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0954179214299481 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 11 13 24 5.17319269340446 6.88622681688564 -1.71303412348118 A:G A G 10 0.529709755145049 0.542758508102984 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 21 21 42 9.87609514195397 11.123904858046 -1.24780971609206 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758185523015664 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46818479 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46818508 T/C 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C T C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 80 26 106 37.6232195883961 13.7724536337713 23.8507659546248 T:C C T 10 0.529709755145049 2.20442749899032e-06 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 47078637 T/C 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000142961:ENST00000396291:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000319928:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000271139:exon_47078576_47079043:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000371940:exon_47078576_47082137:MOBKL2C;ENSG00000142961:ENST00000477318:exon_47078576_47079043:MOBKL2C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 51873951 G/A 1 16 15 31 7.52464391767922 7.94564632717574 -0.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000493793:exon_51873807_51874004:EPS15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 111 111 222 52.2022171788996 58.7977828211004 -6.59556564220088 A:G G A 10 0.529709755145049 0.382760491288745 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 37 25 62 17.4007390596332 13.2427438786262 4.15799518100696 T:G T G 10 0.529709755145049 0.310794437042138 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 52828384 A/G 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G A G 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000460727:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371575:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52828274_52828418:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52828274_52828418:CC2D1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 66 71 137 31.0391561604268 37.6093926152985 -6.57023645487172 A:G A G 10 0.529709755145049 0.266983831341838 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 52991983 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000470626:exon_52991692_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000524582:exon_52991722_52992045:ZCCHC11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 36 41 77 16.9304488147782 21.718099960947 -4.78765114616878 T:C T C 10 0.529709755145049 0.304642161943015 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53453714 G/T 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:G G T 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53453701_53453752:SCP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 23 16 39 10.8166756316639 8.47535608232078 2.34131954934309 A:G G A 10 0.529709755145049 0.522369402448561 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 49 46 95 23.0442219978926 24.3666487366723 -1.32242673877966 A:G A G 10 0.529709755145049 0.837344355340482 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 77 59 136 36.2123488538312 31.2528755535579 4.95947330027333 T:G T G 10 0.529709755145049 0.439596868191508 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53712727 C/T 1 17 18 35 7.99493416253417 9.53477559261088 -1.53984143007672 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.615853463666398 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53711217_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53712628_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53712225_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53712240_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53712630_53712728:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53712690_53712728:LRP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 17 11 28 7.99493416253417 5.82680730659554 2.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.45357316422273 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 47 58 105 22.1036415081827 30.7231657984128 -8.61952429023015 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0969611405333157 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 62582235 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62582204_62582351:INADL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 62677118 A/G 1 2 9 11 0.940580489709902 4.76738779630544 -3.82680730659554 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0306192095736915 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 62910957 G/C 1 39 34 73 18.3413195493431 18.0101316749317 0.33118787441142 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162607:ENST00000371146:exon_62910409_62911100:USP1;ENSG00000162607:ENST00000433771:exon_62910409_62911100:USP1;ENSG00000162607:ENST00000339950:exon_62910409_62911100:USP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 28 29 57 13.1681268559386 15.3615828992064 -2.19345604326779 A:G A G 10 0.529709755145049 0.596982820105687 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 5 17 22 2.35145122427475 9.00506583746583 -6.65361461319108 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00492980502130005 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 70820664 T/G 1 16 16 32 7.52464391767922 8.47535608232078 -0.950712164641569 T:G T G 10 0.529709755145049 0.859803012181772 ENSG00000197568:ENST00000361764:exon_70820488_70820790:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000359875:exon_70820495_70820891:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000486110:exon_70820511_70820891:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000463058:exon_70820512_70820790:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000370940:exon_70820519_70820794:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000531950:exon_70820527_70820891:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000525653:exon_70820538_70820790:HHLA3;ENSG00000197568:ENST00000432224:exon_70820635_70820891:HHLA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 35 40 75 16.4601585699233 21.188390205802 -4.72823163587868 T:G G T 10 0.529709755145049 0.29862080967498 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 74648329 G/A 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000162620:ENST00000395089:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000354431:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000415760:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000388972:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000370911:exon_74648222_74648545:LRRIQ3;ENSG00000162620:ENST00000463724:exon_74645907_74649368:LRRIQ3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 74665493 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000254685:ENST00000467578:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000524915:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000482102:exon_74665348_74665529:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370898:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000529485:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000370894:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000534056:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000254685:ENST00000472069:exon_74665348_74665515:FPGT;ENSG00000116783:ENST00000370899:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370895:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000534632:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000533006:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370891:exon_74665348_74665515:TNNI3K;ENSG00000116783:ENST00000370893:exon_74665348_74665515:TNNI3K HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 75172001 T/A 1 138 87 225 64.9000537899832 46.0847486976193 18.815305092364 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0133143369913545 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75171170_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75171172_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75171174_75172141:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75171656_75172141:CRYZ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 54 32 86 25.3956732221674 16.9507121646416 8.44496105752578 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0833377814856829 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 141 141 282 66.3109245245481 74.6890754754519 -8.37815095090383 A:G A G 10 0.529709755145049 0.339890620035535 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 8 11 19 3.76232195883961 5.82680730659554 -2.06448534775593 C:G G C 10 0.529709755145049 0.366887546614125 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 78178976 T/A 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 A:T T A 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78178885_78179193:USP33 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 78178980 T/C 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 T:C T C 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000077254:ENST00000477949:exon_78178885_78179193:USP33 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 85 185 270 39.9746708126708 97.9963047018341 -58.0216338891632 A:G A G 10 0.529709755145049 1.15050679085129e-12 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 170 315 485 79.9493416253417 166.85857287069 -86.9092312453488 T:C:G T C 10 0.529709755145049 2.61909703115582e-15 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 86375654 C/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 C:G C G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000171502:ENST00000370571:exon_86375633_86375686:COL24A1;ENSG00000171502:ENST00000436319:exon_86375633_86375686:COL24A1;ENSG00000171502:ENST00000426639:exon_86375633_86375686:COL24A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 35 20 55 16.4601585699233 10.594195102901 5.8659634670223 T:C T C 10 0.529709755145049 0.136879014440085 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 35 41 76 16.4601585699233 21.718099960947 -5.25794139102373 T:C C T 10 0.529709755145049 0.250977212546314 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 86826169 G/A 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86826109_86826495:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472144:exon_86826109_86826604:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000463933:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000534092:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86826109_86826219:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486557:exon_86826115_86826219:ODF2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 86838158 C/T 1 16 5 21 7.52464391767922 2.64854877572525 4.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0467481096916324 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486557:exon_86838114_86838264:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86838114_86838223:ODF2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 59 31 90 27.7471244464421 16.4210024094965 11.3261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0197204259556084 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 89479063 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89478868_89479110:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000235878:exon_89478868_89479110:GBP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 C:G G C 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 89732237 G/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 92852626 A/G 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:G A G 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000122484:ENST00000370343:exon_92852568_92853730:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000477322:exon_92852568_92852790:RPAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 48 83 131 22.5739317530376 43.9659096770391 -21.3919779240014 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000212373573414218 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 36 10 46 16.9304488147782 5.29709755145049 11.6333512633277 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00054772657147081 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 36 12 48 16.9304488147782 6.35651706174059 10.5739317530376 C:G C G 10 0.529709755145049 0.00217474865999538 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 94343233 T/C 1 49 67 116 23.0442219978926 35.4905535947183 -12.4463315968257 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0251822857759452 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94343029_94343439:DNTTIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 T:G G T 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 104116413 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000240038:ENST00000477657:exon_104116330_104116560:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000361355:exon_104116330_104116560:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000491397:exon_104116330_104116560:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000338852:exon_104116330_104116560:AMY2B;ENSG00000240038:ENST00000456136:exon_104116330_104116560:AMY2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 C:G G C 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 11 22 33 5.17319269340446 11.6536146131911 -6.48042191978662 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0347531533720001 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 28 22 50 13.1681268559386 11.6536146131911 1.51451224274755 T:G G T 10 0.529709755145049 0.777253688146423 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 109486196 A/G 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 109779073 G/A 1 83 104 187 39.0340903229609 55.0898145350851 -16.0557242121242 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0191086260509050 ENSG00000031698:ENST00000234677:exon_109779013_109779170:SARS;ENSG00000031698:ENST00000369923:exon_109779013_109779170:SARS;ENSG00000031698:ENST00000468588:exon_109778853_109779995:SARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 26 18 44 12.2275463662287 9.53477559261088 2.69277077361784 T:C C T 10 0.529709755145049 0.452813649192105 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 7 11 18 3.29203171398466 5.82680730659554 -2.53477559261088 A:C C A 10 0.529709755145049 0.247451477742465 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 110882444 A/G 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 110950277 G/A 1 86 65 151 40.4449610575258 34.4311340844282 6.01382697309759 A:G G A 10 0.529709755145049 0.369901704593204 ENSG00000134248:ENST00000483260:exon_110950208_110950290:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000474861:exon_110949655_110950293:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000464240:exon_110948940_110950316:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000369775:exon_110950208_110950560:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000256644:exon_110950208_110950564:HBXIP;ENSG00000134248:ENST00000531779:exon_110950208_110950286:HBXIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 523 436 959 245.961798059139 230.953453243241 15.008344815898 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.34818915921032 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111726213 A/G 1 14 4 18 6.58406342796931 2.1188390205802 4.46522440738912 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0557962318234801 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111730901 C/T 1 101 96 197 47.4993147303501 50.8521364939247 -3.35282176357465 T:C C T 10 0.529709755145049 0.668628872671636 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111783981 G/A 1 75 81 156 35.2717683641213 42.906490166749 -7.63472180262765 A:G G A 10 0.529709755145049 0.22956135961224 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 14 13 27 6.58406342796931 6.88622681688564 -0.302163388916323 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 14 9 23 6.58406342796931 4.76738779630544 1.81667563166387 A:G G A 10 0.529709755145049 0.533407999946811 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111957693 A/G 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111992095 C/T 1 7 16 23 3.29203171398466 8.47535608232078 -5.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0361856200107406 ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 111992121 G/A 1 21 27 48 9.87609514195397 14.3021633889163 -4.42606824696235 A:G G A 10 0.529709755145049 0.247168572377601 ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000483994:exon_111992106_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000468818:exon_111992107_111992203:ATP5F1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 20 28 48 9.40580489709902 14.8318731440614 -5.42606824696235 T:C T C 10 0.529709755145049 0.147493092214535 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 18 24 42 8.46522440738912 12.7130341234812 -4.24780971609206 A:G G A 10 0.529709755145049 0.216989891297737 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 37 33 70 17.4007390596332 17.4804219197866 -0.079682860153433 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 25 21 46 11.7572561213738 11.123904858046 0.633351263327745 A:G A G 10 0.529709755145049 0.883571291105873 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 117078729 A/G 1 74 73 147 34.8014781192664 38.6688121255886 -3.86733400632221 A:G A G 10 0.529709755145049 0.56321886993645 ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117078587_117078850:CD58 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 118166195 C/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 118483460 C/T 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118483450_118483563:WDR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 118491052 T/G 1 11 20 31 5.17319269340446 10.594195102901 -5.42100240949652 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0703549698551275 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 119575818 C/G 1 11 16 27 5.17319269340446 8.47535608232078 -3.30216338891632 C:G C G 10 0.529709755145049 0.248064772367367 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 45 26 71 21.1630610184728 13.7724536337713 7.39060738470152 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0954431239929447 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 1 11 2 13 5.17319269340446 1.0594195102901 4.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.025445297925368 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144916676 C/T 1 10 2 12 4.70290244854951 1.0594195102901 3.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0425775668197683 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 1 21 2 23 9.87609514195397 1.0594195102901 8.81667563166387 C:G C G 10 0.529709755145049 0.000183168750855826 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 1 16 1 17 7.52464391767922 0.529709755145049 6.99493416253417 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000381811071785717 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144918957 T/A 0 9 0 9 4.23261220369456 0 4.23261220369456 T T 10 0.529709755145049 0.0044089015254185 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000525886:exon_144918833_144919011:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144918833_144918991:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144918833_144918991:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144921924 G/A 0 11 0 11 5.17319269340446 0 5.17319269340446 G G 10 0.529709755145049 0.00117023568139201 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144921835_144922065:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144921835_144922020:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144922583 G/A 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 G G 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144922519_144922638:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144922519_144922638:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 0 10 0 10 4.70290244854951 0 4.70290244854951 C C 10 0.529709755145049 0.00226856945961777 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 37 24 61 17.4007390596332 12.7130341234812 4.68770493615201 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.249817607900749 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 66 66 0 34.9608438395732 -34.9608438395732 C T C 10 0.529709755145049 2.37768349438583e-22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 50 50 0 26.4854877572525 -26.4854877572525 T G T 10 0.529709755145049 4.15239364206458e-17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 55 55 0 29.1340365329777 -29.1340365329777 A C A 10 0.529709755145049 9.5527490528436e-19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 92 1 93 43.2667025266555 0.529709755145049 42.7369927715104 C:G G C 10 0.529709755145049 3.46671438026651e-24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 1 1 59 60 0.470290244854951 31.2528755535579 -30.7825853087029 T:C T C 10 0.529709755145049 1.50716462244189e-18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 1 108 109 0.470290244854951 57.2086535556653 -56.7383633108103 T:C C T 10 0.529709755145049 2.40166456936019e-34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 124 0 124 58.3159903620139 0 58.3159903620139 C C 10 0.529709755145049 7.10558588834961e-35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 53 59 112 24.9253829773124 31.2528755535579 -6.32749257624549 C:G C G 10 0.529709755145049 0.25609872077259 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 146763171 T/A 1 54 24 78 25.3956732221674 12.7130341234812 12.6826390986862 A:T T A 10 0.529709755145049 0.00433700586813664 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146763164_146763234:CHD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 22 15 37 10.3463853868089 7.94564632717574 2.40073905963319 A:G G A 10 0.529709755145049 0.510967745319276 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 147124310 T/G 1 3 12 15 1.41087073456485 6.35651706174059 -4.94564632717574 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0167981910963281 ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147124252_147124352:ACP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 112 69 181 52.6725074237545 36.5499731050084 16.1225343187461 T:C:G G T 10 0.529709755145049 0.0170939501612178 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 150789884 C/T 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150789837_150789924:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150789837_150789909:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000510273:exon_150789870_150789909:ARNT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 93 65 158 43.7369927715104 34.4311340844282 9.30585868708225 A:G A G 10 0.529709755145049 0.151402848463251 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 152777574 G/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000197084:ENST00000368768:exon_152777311_152777974:LCE1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 153507105 A/T 1 8 31 39 3.76232195883961 16.4210024094965 -12.6586804506569 A:T A T 10 0.529709755145049 4.02912591541739e-05 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 153517172 T/C 1 222 322 544 104.404434357799 170.566541156706 -66.1621067989067 A:T:C T C 10 0.529709755145049 1.57437606114480e-08 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 153534027 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000196754:ENST00000368708:exon_153533584_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368711:exon_153533596_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000487430:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000497140:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368710:exon_153533816_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368709:exon_153533819_153534067:S100A2;ENSG00000196754:ENST00000368707:exon_153533825_153534067:S100A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 153631198 T/C 1 5 12 17 2.35145122427475 6.35651706174059 -4.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0859527586065674 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631130_153631362:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631188_153631660:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631190_153631362:SNAPIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 153662340 G/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000169418:ENST00000368680:exon_153662282_153662456:NPR1;ENSG00000169418:ENST00000428723:exon_153662282_153662456:NPR1;ENSG00000169418:ENST00000368677:exon_153662282_153662456:NPR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 153912084 G/T 1 12 5 17 5.64348293825941 2.64854877572525 2.99493416253417 T:G G T 10 0.529709755145049 0.223479807498147 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153912065_153912280:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153912065_153912280:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000485359:exon_153912064_153912732:DENND4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 154245917 T/C 1 140 137 277 65.8406342796931 72.5702364548717 -6.72960217517858 T:C T C 10 0.529709755145049 0.434188936365987 ENSG00000143575:ENST00000328703:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000483970:exon_154245812_154246074:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000447768:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000531435:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000477780:exon_154245812_154246437:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000453365:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000435087:exon_154245812_154246010:HAX1;ENSG00000143575:ENST00000471326:exon_154245344_154246074:HAX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 31 11 42 14.5789975905035 5.82680730659554 8.75219028390794 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00793462938152125 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 36 32 68 16.9304488147782 16.9507121646416 -0.0202633498633347 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 21 13 34 9.87609514195397 6.88622681688564 2.98986832506833 C:G C G 10 0.529709755145049 0.390699512482042 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 24 20 44 11.2869658765188 10.594195102901 0.692770773617843 A:G A G 10 0.529709755145049 0.880788070515154 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 82 95 177 38.563800078106 50.3224267387797 -11.7586266606737 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0832113370398589 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 4 26 30 1.8811609794198 13.7724536337713 -11.8912926543515 T:G T G 10 0.529709755145049 9.43540559328238e-06 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155640115 C/T 1 33 37 70 15.5195780802134 19.5992609403668 -4.07968286015343 T:C C T 10 0.529709755145049 0.34037440514708 ENSG00000163374:ENST00000359205:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000355499:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000311573:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000347088:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361831:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368340:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000295566:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000436865:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000442834:exon_155640111_155640882:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368330:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000407221:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000404643:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361140:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368339:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000405763:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000488784:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000493625:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000477470:exon_155640111_155640255:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000476093:exon_155640115_155640255:YY1AP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155691379 C/G 1 64 64 128 30.0985756707169 33.9014243292831 -3.80284865856628 C:G C G 10 0.529709755145049 0.535729747007369 ENSG00000132676:ENST00000471214:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000496863:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000465375:exon_155691308_155691780:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000462002:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000470830:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497826:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463575:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000471523:exon_155691308_155691409:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000479151:exon_155691327_155691409:DAP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 17 17 34 7.99493416253417 9.00506583746583 -1.01013167493167 T:C T C 10 0.529709755145049 0.734879131905574 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 155829511 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155829300_155829586:SYT11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 264 292 556 124.156624641707 154.675248502354 -30.5186238606473 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0107356212929249 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156106185 T/C 1 506 522 1028 237.966863896605 276.508492185716 -38.5416282891104 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0161439552262119 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156106863 C/T 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106712_156107023:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 6 13 19 2.82174146912971 6.88622681688564 -4.06448534775593 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0687326222682032 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 A:G G A 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156499969 T/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156499897_156500109:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156499897_156500109:IQGAP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156564998 T/G 1 279 237 516 131.210978314531 125.541211969377 5.66976634515471 T:G T G 10 0.529709755145049 0.627814565716404 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156564779_156565048:GPATCH4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 24 24 48 11.2869658765188 12.7130341234812 -1.42606824696235 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77281522357758 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:C C A 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 156784982 T/C 1 14 14 28 6.58406342796931 7.41593657203069 -0.831873144061372 T:C T C 10 0.529709755145049 0.850483860830919 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 157497597 C/T 1 27 11 38 12.6978366110837 5.82680730659554 6.87102930448814 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0333492960728545 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157497407_157497685:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157497407_157498459:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157497407_157497685:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157497407_157497641:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157497407_157497685:FCRL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 4 23 27 1.8811609794198 12.1833243683361 -10.3021633889163 T:C C T 10 0.529709755145049 5.75724743921085e-05 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 157509025 C/T 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 56 53 109 26.3362537118773 28.0746170226876 -1.73836331081034 A:G A G 10 0.529709755145049 0.77382890123783 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160063531 G/A 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000448417:exon_160063500_160063961:IGSF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160208439 C/T 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 T:C C T 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000132716:ENST00000368073:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000326837:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000368074:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000461888:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000466253:exon_160208397_160208775:DCAF8;ENSG00000162735:ENST00000527349:exon_160208397_160208537:PEX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160208472 T/C 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132716:ENST00000368073:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000326837:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000368074:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000461888:exon_160208397_160208537:DCAF8;ENSG00000132716:ENST00000466253:exon_160208397_160208775:DCAF8;ENSG00000162735:ENST00000527349:exon_160208397_160208537:PEX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160249362 A/G 1 19 22 41 8.93551465224407 11.6536146131911 -2.71809996094701 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435927385974224 ENSG00000162735:ENST00000368072:exon_160246602_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000472750:exon_160246657_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000429425:exon_160248271_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000532508:exon_160249086_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000495624:exon_160249185_160249635:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000462644:exon_160249274_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000532643:exon_160249283_160249424:PEX19;ENSG00000162735:ENST00000440949:exon_160249341_160249424:PEX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160265884 G/A 1 83 72 155 39.0340903229609 38.1391023704435 0.894987952517397 A:G G A 10 0.529709755145049 0.93591713535424 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160265851_160265939:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160265851_160265939:COPA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160267126 T/C 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160281729 A/G 1 22 17 39 10.3463853868089 9.00506583746583 1.34131954934309 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.749255609022721 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160281658_160281808:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160281658_160281808:COPA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160302298 T/C 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 T:C T C 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160302238_160302347:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160302238_160302347:COPA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160720074 C/T 1 12 3 15 5.64348293825941 1.58912926543515 4.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0398956902314144 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 17 12 29 7.99493416253417 6.35651706174059 1.63841710079358 A:G A G 10 0.529709755145049 0.58147925745253 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 25 22 47 11.7572561213738 11.6536146131911 0.103641508182696 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160797514 C/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 C:G C G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160990875 T/C 1 14 1 15 6.58406342796931 0.529709755145049 6.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00125644903414920 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160990876 C/A 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 C C 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 160990878 C/T 0 15 0 15 7.05435367282426 0 7.05435367282426 C C 10 0.529709755145049 8.4714243137928e-05 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 35 35 70 16.4601585699233 18.5398414300767 -2.07968286015343 T:C C T 10 0.529709755145049 0.633788419261118 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 157 175 332 73.8355684422273 92.6992071503836 -18.8636387081563 T:C C T 10 0.529709755145049 0.041792134286422 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 124 177 301 58.3159903620139 93.7586266606737 -35.4426362986598 T:C:G G C 10 0.529709755145049 4.94043602278839e-05 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 161039405 G/A 1 39 48 87 18.3413195493431 25.4260682469624 -7.08474869761926 A:G G A 10 0.529709755145049 0.133697459813506 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161039318_161039660:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161039318_161039456:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161039318_161039735:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161039318_161039760:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161039318_161039593:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000417117:exon_161039318_161039760:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368018:exon_161039318_161039465:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000471492:exon_161039318_161039705:ARHGAP30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 161182208 C/G 1 132 117 249 62.0783123208535 61.9760413519707 0.102270968882792 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000480762:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161182141_161182270:NDUFS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 15 16 31 7.05435367282426 8.47535608232078 -1.42100240949652 A:T A T 10 0.529709755145049 0.719657529859852 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 165697341 G/A 1 104 104 208 48.9101854649149 55.0898145350851 -6.17962907017019 A:G G A 10 0.529709755145049 0.405005982760942 ENSG00000143183:ENST00000367881:exon_165696032_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000464650:exon_165696775_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000392129:exon_165696779_165697358:TMCO1;ENSG00000143183:ENST00000476143:exon_165696828_165697358:TMCO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 169094216 G/A 1 8 35 43 3.76232195883961 18.5398414300767 -14.7775194712371 A:G G A 10 0.529709755145049 4.62732534642855e-06 ENSG00000143153:ENST00000367816:exon_169094122_169094277:ATP1B1;ENSG00000143153:ENST00000367815:exon_169094122_169094277:ATP1B1;ENSG00000143153:ENST00000367813:exon_169094122_169094277:ATP1B1;ENSG00000143153:ENST00000494797:exon_169094122_169094277:ATP1B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 169293721 G/A 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000143156:ENST00000367811:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000525440:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000528517:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000524967:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000485609:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000491225:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000527460:exon_169293631_169293738:NME7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 169773317 G/A 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000472795:exon_169773216_169773521:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000496973:exon_169773253_169773488:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000481744:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000466580:exon_169773253_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000456684:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169773216_169773381:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169773216_169773381:C1orf112 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 27 37 64 12.6978366110837 19.5992609403668 -6.90142432928314 T:C T C 10 0.529709755145049 0.102897144248858 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 32 30 62 15.0492878353584 15.8912926543515 -0.84200481899304 A:G A G 10 0.529709755145049 0.898949597126206 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 17 23 40 7.99493416253417 12.1833243683361 -4.18839020580196 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206547223036203 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 A:G G A 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 96 97 193 45.1478635060753 51.3818462490698 -6.23398274299446 T:C C T 10 0.529709755145049 0.387212136623445 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 179055020 C/T 1 54 45 99 25.3956732221674 23.8369389815272 1.55873424064015 T:C C T 10 0.529709755145049 0.763816534471795 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179054763_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000495145:exon_179054933_179055028:TOR3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 T:C C T 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 180062869 T/C 1 20 15 35 9.40580489709902 7.94564632717574 1.46015856992328 T:C T C 10 0.529709755145049 0.735488227131445 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180062849_180063751:CEP350 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 180144485 G/A 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180144456_180144501:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180144456_180144501:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180144456_180144501:QSOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 180145088 A/G 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G A G 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180145066_180145168:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180145066_180145168:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180145066_180145168:QSOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 180148012 G/C 1 1 11 12 0.470290244854951 5.82680730659554 -5.35651706174059 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00218723564175865 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180147929_180148019:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180147929_180148019:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180147929_180148019:QSOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 180159654 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 180159657 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180159568_180159715:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180159568_180159715:QSOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 181725110 T/C 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181725092_181725229:CACNA1E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 181727947 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181727894_181728004:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181727894_181728004:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181727894_181728004:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181727894_181728004:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181727894_181728004:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181727894_181728004:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181727894_181728004:CACNA1E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 181741301 C/T 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181741202_181741367:CACNA1E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 183895435 A/C 1 4 13 17 1.8811609794198 6.88622681688564 -5.00506583746583 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0256462949018431 ENSG00000143344:ENST00000304685:exon_183895239_183897666:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000367531:exon_183895239_183897665:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000360851:exon_183895239_183897665:RGL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 184020945 G/A 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 A:G G A 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184020811_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184020813_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184020860_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184020867_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184020880_184021024:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184020894_184021024:TSEN15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 22 26 48 10.3463853868089 13.7724536337713 -3.42606824696235 A:C A C 10 0.529709755145049 0.385903125973619 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 186321242 C/T 1 37 25 62 17.4007390596332 13.2427438786262 4.15799518100696 T:C C T 10 0.529709755145049 0.310794437042138 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000491783:exon_186321108_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000469463:exon_186321084_186321242:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186321147_186321242:TPR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 192778269 G/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000116741:ENST00000483295:exon_192778169_192778311:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192778171_192778311:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192778172_192778311:RGS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 197061086 A/C 1 27 31 58 12.6978366110837 16.4210024094965 -3.72316579841284 A:C A C 10 0.529709755145049 0.358357808505158 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367408:exon_197061037_197061186:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197061037_197061186:ASPM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 200635550 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 200635560 T/C 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 T:C T C 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 200635618 C/G 1 10 17 27 4.70290244854951 9.00506583746583 -4.30216338891632 C:G C G 10 0.529709755145049 0.122415412291815 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 200635721 C/G 1 14 37 51 6.58406342796931 19.5992609403668 -13.0151975123975 C:G C G 10 0.529709755145049 0.000347254490635243 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 24 50 74 11.2869658765188 26.4854877572525 -15.1985218807336 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000423966365708988 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 201355522 T/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 201355943 C/T 1 17 2 19 7.99493416253417 1.0594195102901 6.93551465224407 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00101439359816340 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 42 45 87 19.7521902839079 23.8369389815272 -4.08474869761927 A:G G A 10 0.529709755145049 0.392022214170261 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 27 31 58 12.6978366110837 16.4210024094965 -3.72316579841284 T:C T C 10 0.529709755145049 0.358357808505158 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 202705455 G/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 C:G G C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202705341_202705520:KDM5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 205744138 G/T 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:G G T 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000117280:ENST00000367139:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000235932:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000528078:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000367140:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000446390:exon_205743961_205744361:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000414729:exon_205743961_205744587:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000492534:exon_205743961_205744279:RAB7L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 206944233 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 207850879 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000197721:ENST00000531844:exon_207850734_207850913:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000508064:exon_207850734_207850913:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000430248:exon_207850734_207850913:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000530905:exon_207850734_207850913:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000294997:exon_207850805_207850913:CR1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 209933608 A/G 1 26 20 46 12.2275463662287 10.594195102901 1.63335126332774 A:G A G 10 0.529709755145049 0.66030616461623 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C T C 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 44 28 72 20.6927707736178 14.8318731440614 5.86089762955647 T:C T C 10 0.529709755145049 0.193993058596641 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 211848807 A/C 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:C A C 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211848726_211848960:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211848726_211848899:NEK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 35 27 62 16.4601585699233 14.3021633889163 2.15799518100696 T:C T C 10 0.529709755145049 0.612740003029451 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 213032568 T/A 0 0 8 8 0 4.23767804116039 -4.23767804116039 A T A 10 0.529709755145049 0.00239291770370972 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 28 24 52 13.1681268559386 12.7130341234812 0.455092732457452 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 A:G G A 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 214507580 A/G 1 28 29 57 13.1681268559386 15.3615828992064 -2.19345604326779 A:G A G 10 0.529709755145049 0.596982820105687 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214505361_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214504293_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214507543_214507651:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214507543_214507651:SMYD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 51 38 89 23.9848024876025 20.1289706955119 3.85583179209064 A:G G A 10 0.529709755145049 0.457768896814211 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 214828589 C/T 1 69 63 132 32.4500268949916 33.3717145741381 -0.921687679146473 T:C C T 10 0.529709755145049 0.930563934534817 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214828584_214828746:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214828491_214828746:CENPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 86 51 137 40.4449610575258 27.0151975123975 13.4297635451283 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0257060455324862 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 119 90 209 55.9645391377392 47.6738779630544 8.29066117468475 A:T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.267749392348072 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 236 248 484 110.988497785768 131.368019275972 -20.3795214902037 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.0684520727462773 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 220324715 T/C 1 56 44 100 26.3362537118773 23.3072292263822 3.0290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.549983623497837 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220321635_220324748:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000491005:exon_220324525_220325106:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000474966:exon_220324598_220324748:RAB3GAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 220330672 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220330612_220330830:RAB3GAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 220331205 C/G 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220331144_220331218:RAB3GAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 220935015 C/T 1 13 1 14 6.11377318311436 0.529709755145049 5.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00227318749986418 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000496078:exon_220935000_220935106:MOSC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 220955168 A/G 1 4 36 40 1.8811609794198 19.0695511852218 -17.188390205802 A:G A G 10 0.529709755145049 1.86905212025517e-08 ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220955120_220955274:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000472447:exon_220955120_220955274:MOSC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 27 23 50 12.6978366110837 12.1833243683361 0.514512242747548 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 222734803 G/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 C:G G C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000143498:ENST00000366890:exon_222734706_222734860:TAF1A;ENSG00000143498:ENST00000352967:exon_222734706_222734860:TAF1A;ENSG00000143498:ENST00000350027:exon_222734706_222734860:TAF1A;ENSG00000143498:ENST00000391882:exon_222734706_222734860:TAF1A;ENSG00000143498:ENST00000433270:exon_222734706_222734860:TAF1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 222833538 C/G 1 14 22 36 6.58406342796931 11.6536146131911 -5.06955118522177 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0970215350729815 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000475451:exon_222833519_222833656:MIA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 223954080 A/C 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000474026:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000487223:exon_223954069_223954133:CAPN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 226109284 G/A 1 130 110 240 61.1377318311436 58.2680730659554 2.86965876518823 A:G G A 10 0.529709755145049 0.746580084208416 ENSG00000143811:ENST00000419724:exon_226109252_226109344:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226109252_226109344:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226109252_226109344:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226109252_226109344:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000466127:exon_226108916_226109344:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000446534:exon_226109252_226109344:PYCR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 T:G T G 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:C A C 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 36 42 78 16.9304488147782 22.2478097160921 -5.31736090131383 T:C C T 10 0.529709755145049 0.256864369619893 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 227922452 T/A 1 27 24 51 12.6978366110837 12.7130341234812 -0.0151975123974992 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922352_227922517:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922352_227922517:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000480590:exon_227922352_227922517:JMJD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 24 14 38 11.2869658765188 7.41593657203069 3.87102930448814 A:G G A 10 0.529709755145049 0.255548794870674 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 227954677 C/T 1 30 41 71 14.1087073456485 21.718099960947 -7.60939261529848 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0750512837599498 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 228879367 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000116574:ENST00000366691:exon_228879032_228882416:RHOU HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229631651 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229631639_229631794:NUP133 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 T:G T G 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229771536 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229772932 A/G 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229773441 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 8 11 19 3.76232195883961 5.82680730659554 -2.06448534775593 A:G A G 10 0.529709755145049 0.366887546614125 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 16 22 38 7.52464391767922 11.6536146131911 -4.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.195922017737178 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 27 9 36 12.6978366110837 4.76738779630544 7.93044881477824 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0111819661216011 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 27 6 33 12.6978366110837 3.17825853087029 9.51957808021338 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000743984129690916 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 234565877 G/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234565833_234566047:TARBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 24 51 75 11.2869658765188 27.0151975123975 -15.7282316358787 A:C C A 10 0.529709755145049 0.000292301870918283 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:G A G 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236144951 A/G 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236144911_236145082:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236144911_236145082:NID1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236389999 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236389947_236390039:ERO1LB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236416750 T/C 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236416722_236416805:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236416722_236416805:ERO1LB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 24 7 31 11.2869658765188 3.70796828601534 7.57899759050348 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0064941377726499 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 17 5 22 7.99493416253417 2.64854877572525 5.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.030557015442086 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/C 1 20 19 39 9.40580489709902 10.0644853477559 -0.658680450656913 C:G G C 10 0.529709755145049 0.873443340813217 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236706278 G/T 1 11 3 14 5.17319269340446 1.58912926543515 3.58406342796931 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0634340540694462 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236706215_236706290:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236706300 T/A 1 12 2 14 5.64348293825941 1.0594195102901 4.58406342796931 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0150847280678921 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706215_236706340:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529796:exon_236706215_236706313:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706015_236706340:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236708037 T/C 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 39 38 77 18.3413195493431 20.1289706955119 -1.78765114616878 T:C T C 10 0.529709755145049 0.732456190867055 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236716888 G/A 1 90 78 168 42.3261220369456 41.3173609013138 1.00876113563176 A:G G A 10 0.529709755145049 0.93842471538879 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 55 40 95 25.8659634670223 21.188390205802 4.67757326122034 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.356216148160603 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 52 44 96 24.4550927324575 23.3072292263822 1.14786350607529 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.838589182440402 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 71 51 122 33.3906073847015 27.0151975123975 6.37540987230402 T:C T C 10 0.529709755145049 0.276537748530174 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 52 48 100 24.4550927324575 25.4260682469624 -0.9709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.842106460181009 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236723108 C/T 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 236748433 G/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 27 27 54 12.6978366110837 14.3021633889163 -1.60432677783265 T:C C T 10 0.529709755145049 0.684436345625405 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 A:G A G 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 14 8 22 6.58406342796931 4.23767804116039 2.34638538680892 A:G G A 10 0.529709755145049 0.394835426805311 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 242035465 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 7 20 27 3.29203171398466 10.594195102901 -7.30216338891632 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00607339916180989 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 243419429 T/A 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:T T A 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000391846:exon_243419320_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000490065:exon_243419336_243419542:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243419358_243419542:SDCCAG8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:G G A 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 244218402 G/A 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000179456:ENST00000366538:exon_244217090_244220774:ZNF238;ENSG00000179456:ENST00000358704:exon_244217090_244220778:ZNF238 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 245245402 C/T 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000203666:ENST00000391837:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366523:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366522:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000421886:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366520:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000497591:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000447569:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000473686:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366521:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000487845:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000391838:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000495271:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000425550:exon_245245385_245245464:EFCAB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 245850095 C/T 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 16 19 35 7.52464391767922 10.0644853477559 -2.53984143007672 T:C T C 10 0.529709755145049 0.402638282505094 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 52 54 106 24.4550927324575 28.6043267778326 -4.1492340453752 A:G A G 10 0.529709755145049 0.437396365606219 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 26 17 43 12.2275463662287 9.00506583746583 3.22248052876289 C:G G C 10 0.529709755145049 0.361505086251554 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 21 17 38 9.87609514195397 9.00506583746583 0.871029304488136 T:C C T 10 0.529709755145049 0.871352391104054 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 28 27 55 13.1681268559386 14.3021633889163 -1.1340365329777 C:G G C 10 0.529709755145049 0.788181991457276 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 52 52 104 24.4550927324575 27.5449072675425 -3.0898145350851 A:G G A 10 0.529709755145049 0.55692263243417 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 1065710 C/T 1 12 24 36 5.64348293825941 12.7130341234812 -7.06955118522176 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0195520817013433 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3167463 T/C 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 T:C T C 10 0.529709755145049 0.371396387099242 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 115 99 214 54.0833781583194 52.4412657593599 1.64211239895951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.83751353476567 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3178815 G/C 1 326 218 544 153.314619822714 115.476726621621 37.8378932010933 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00125588559323354 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 98 117 215 46.0884439957852 61.9760413519707 -15.8875973561855 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0339637093626659 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 55 67 122 25.8659634670223 35.4905535947183 -9.62459012769598 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0851470904750447 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 33 19 52 15.5195780802134 10.0644853477559 5.45509273245745 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.164187462358522 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3197856 C/G 1 13 16 29 6.11377318311436 8.47535608232078 -2.36158289920642 C:G C G 10 0.529709755145049 0.45783598473891 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 34 17 51 15.9898683250683 9.00506583746583 6.9848024876025 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0671486219379052 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 35 21 56 16.4601585699233 11.123904858046 5.33625371187725 T:C T C 10 0.529709755145049 0.180646105565848 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:G A G 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5799613 A/G 1 9 15 24 4.23261220369456 7.94564632717574 -3.71303412348118 A:G A G 10 0.529709755145049 0.153480735060501 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5799483_5799636:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5799483_5799636:C10orf18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5808086 G/A 1 425 291 716 199.873354063354 154.145538747209 45.7278153161449 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.00064781781904462 ENSG00000057608:ENST00000380191:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000435969:exon_5807186_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380131:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380153:exon_5807187_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000479928:exon_5807192_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000447751:exon_5807812_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380181:exon_5807917_5808115:GDI2;ENSG00000057608:ENST00000380132:exon_5807917_5808115:GDI2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 21 8 29 9.87609514195397 4.23767804116039 5.63841710079358 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0405720324927911 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5925971 C/A 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:C C A 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5925932_5926040:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000492368:exon_5925932_5926040:ANKRD16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5959602 C/T 1 26 23 49 12.2275463662287 12.1833243683361 0.0442219978925973 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5959553_5959639:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5959553_5959639:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5959553_5959639:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379994:exon_5959553_5959627:FBXO18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5978411 T/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C T C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 15 18 33 7.05435367282426 9.53477559261088 -2.48042191978662 T:C C T 10 0.529709755145049 0.39060695666354 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 6002368 T/G 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 T:G T G 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 6154315 A/G 1 115 113 228 54.0833781583194 59.8572023313905 -5.77382417307118 A:G A G 10 0.529709755145049 0.465757435682814 ENSG00000134453:ENST00000372795:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418869:exon_6154173_6154425:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000379888:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000429138:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000446108:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000447032:exon_6154173_6154424:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000481147:exon_6154173_6154386:RBM17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 6264883 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000170525:ENST00000379784:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379789:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379781:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000490474:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000467491:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000477914:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379785:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000461744:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000317350:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379782:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000360521:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379775:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000358499:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000444592:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000450232:exon_6264818_6264947:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000487989:exon_6264671_6264947:PFKFB3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 194 202 396 91.2363075018605 107.0013705393 -15.7650630374394 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.118611654127765 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 12212873 C/T 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12212716_12212907:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378927:exon_12212231_12212907:NUDT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 1 3 13 16 1.41087073456485 6.88622681688564 -5.47535608232078 C:G C G 10 0.529709755145049 0.009781446085491 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 217 247 464 102.052983133524 130.838309520827 -28.7853263873028 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00797815684125258 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 243 212 455 114.280529499753 112.29846809075 1.9820614090027 T:G G T 10 0.529709755145049 0.88797682667347 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 39 46 85 18.3413195493431 24.3666487366723 -6.02532918732917 A:G G A 10 0.529709755145049 0.194201480025639 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 13230950 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13230881_13231080:MCM10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 14974905 T/C 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 T:C T C 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14974853_14974954:DCLRE1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 17276695 G/A 1 975 904 1879 458.532988733577 478.857618651124 -20.3246299175471 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 0.355287867883512 ENSG00000026025:ENST00000224237:exon_17276692_17276817:VIM;ENSG00000026025:ENST00000487938:exon_17276692_17276817:VIM;ENSG00000026025:ENST00000469543:exon_17276692_17276817:VIM;ENSG00000026025:ENST00000421459:exon_17276692_17277084:VIM;ENSG00000026025:ENST00000495528:exon_17276692_17277033:VIM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 18828371 C/T 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000165995:ENST00000324631:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000352115:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377328:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000282343:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377331:exon_18828159_18828653:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000396576:exon_18828159_18830798:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000340194:exon_18828159_18830791:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377319:exon_18828159_18830056:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377329:exon_18828159_18830038:CACNB2;ENSG00000165995:ENST00000377315:exon_18828159_18830056:CACNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G G A 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 22830842 C/T 1 38 21 59 17.8710293044881 11.123904858046 6.74712444644211 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0898385911249797 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22830733_22830976:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22830733_22830976:PIP4K2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 30 29 59 14.1087073456485 15.3615828992064 -1.25287555355789 T:C C T 10 0.529709755145049 0.794804989289095 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 13 45 58 6.11377318311436 23.8369389815272 -17.7231657984128 T:C C T 10 0.529709755145049 2.39462363434525e-06 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 26800759 C/T 1 75 79 154 35.2717683641213 41.8470706564589 -6.57530229233755 T:C C T 10 0.529709755145049 0.294988776104389 ENSG00000077420:ENST00000445780:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000335513:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000376236:exon_26800676_26800835:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000490118:exon_26800676_26800835:APBB1IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 27400861 G/A 1 186 217 403 87.4739855430209 114.947016866476 -27.4730313234548 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00697246912701455 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27399383_27401049:YME1L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 27444329 T/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 27444344 T/G 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 T:G T G 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 18 19 37 8.46522440738912 10.0644853477559 -1.59926094036681 T:C C T 10 0.529709755145049 0.624452662761108 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 35 39 74 16.4601585699233 20.6586804506569 -4.19852188073363 T:C T C 10 0.529709755145049 0.352622893477527 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 32 45 77 15.0492878353584 23.8369389815272 -8.78765114616878 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0518704363385528 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 117 197 314 55.0239586480293 104.352821763575 -49.3288631155454 T:C T C 10 0.529709755145049 2.43164921709132e-08 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 31137611 C/T 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31137460_31138220:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31137460_31138372:ZNF438 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 32197103 T/G 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:G T G 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000165322:ENST00000311380:exon_32197100_32197802:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375250:exon_32197100_32197854:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000396144:exon_32197100_32197854:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000375245:exon_32197100_32197854:ARHGAP12;ENSG00000165322:ENST00000344936:exon_32197100_32197854:ARHGAP12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 32573963 T/C 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 T:C T C 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000479380:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32570787_32575943:EPC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 32580219 T/C 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32580091_32581572:EPC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 10 17 27 4.70290244854951 9.00506583746583 -4.30216338891632 T:G G T 10 0.529709755145049 0.122415412291815 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 T:G T G 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 33214802 A/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33214799_33215037:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33214799_33215037:ITGB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 33217110 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000480226:exon_33217078_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000474568:exon_33217102_33217192:ITGB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 34649146 G/C 1 11 19 30 5.17319269340446 10.0644853477559 -4.89129265435147 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0983679859127383 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34648999_34649187:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374768:exon_34648999_34649187:PARD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 14 13 27 6.58406342796931 6.88622681688564 -0.302163388916323 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 43089965 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 T:C T C 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 43292451 G/C 1 49 43 92 23.0442219978926 22.7775194712371 0.266702526655489 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 43882418 A/T 1 283 298 581 133.092139293951 157.853507033225 -24.7613677392735 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0416552370346726 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 150 114 264 70.5435367282426 60.3869120865356 10.1566246417071 A:T T A 10 0.529709755145049 0.217911670356578 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 44112214 C/T 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 44112763 C/G 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 C:G C G 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 45472785 C/T 1 1 21 22 0.470290244854951 11.123904858046 -10.6536146131911 T:C C T 10 0.529709755145049 2.44594312478004e-06 ENSG00000165507:ENST00000298295:exon_45471577_45473503:C10orf10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G A G 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 45479476 G/T 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:G G T 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45479389_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45479389_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45479470_45479561:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471941:exon_45478476_45480418:RASSF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 45480350 G/A 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471941:exon_45478476_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471808:exon_45480324_45480418:RASSF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 45920506 G/A 1 27 17 44 12.6978366110837 9.00506583746583 3.69277077361784 A:G G A 10 0.529709755145049 0.292676224552567 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45920408_45920580:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000483623:exon_45920408_45920580:ALOX5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G A G 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 46122199 G/A 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 50950976 G/A 1 1 9 10 0.470290244854951 4.76738779630544 -4.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00822974216294624 ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50950874_50951024:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50950874_50951024:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50950874_50951024:OGDHL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 50960209 G/A 0 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50960179_50960294:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50960179_50960294:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50960179_50960294:OGDHL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 51589246 T/C 1 45 56 101 21.1630610184728 29.6637462881227 -8.50068526964995 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0912479803318074 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51589225_51590732:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51589225_51590732:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51589225_51590734:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51589225_51590731:NCOA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 50 43 93 23.5145122427475 22.7775194712371 0.73699277151044 A:G A G 10 0.529709755145049 0.917489918456223 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 31 19 50 14.5789975905035 10.0644853477559 4.51451224274755 A:G A G 10 0.529709755145049 0.206341462306186 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 60 41 101 28.2174146912971 21.718099960947 6.49931473035005 T:C T C 10 0.529709755145049 0.231468674497767 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 52 51 103 24.4550927324575 27.0151975123975 -2.56010477994005 A:G A G 10 0.529709755145049 0.622993985165426 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 64573312 T/G 1 20 16 36 9.40580489709902 8.47535608232078 0.930448814778234 T:G T G 10 0.529709755145049 0.867774579333193 ENSG00000122877:ENST00000242480:exon_64571756_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000439032:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000437594:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000411732:exon_64571763_64574228:EGR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/G 1 21 9 30 9.87609514195397 4.76738779630544 5.10870734564853 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0683914908092486 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 45 42 87 21.1630610184728 22.2478097160921 -1.08474869761927 C:G C G 10 0.529709755145049 0.830644526373748 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 23 18 41 10.8166756316639 9.53477559261088 1.28190003905299 A:G G A 10 0.529709755145049 0.755500903078451 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 15 24 39 7.05435367282426 12.7130341234812 -5.65868045065691 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0780897809551959 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 2 9 11 0.940580489709902 4.76738779630544 -3.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0306192095736915 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 143 130 273 67.251505014258 68.8622681688564 -1.61076315459839 A:G G A 10 0.529709755145049 0.855846509913554 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 62 47 109 29.157995181007 24.8963584918173 4.26163668918965 A:G G A 10 0.529709755145049 0.443433102420393 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 71880858 A/G 1 38 26 64 17.8710293044881 13.7724536337713 4.09857567071686 A:G A G 10 0.529709755145049 0.319138886204072 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71880848_71880967:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71880848_71880967:AIFM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 71905695 A/G 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 22 12 34 10.3463853868089 6.35651706174059 3.98986832506833 T:C C T 10 0.529709755145049 0.228650012076690 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 88 82 170 41.3855415472357 43.436199921894 -2.05065837465834 T:C C T 10 0.529709755145049 0.7591819176949 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 14 6 20 6.58406342796931 3.17825853087029 3.40580489709902 A:G G A 10 0.529709755145049 0.178023707720634 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 45 33 78 21.1630610184728 17.4804219197866 3.68263909868617 A:C C A 10 0.529709755145049 0.428756616029867 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 T:C C T 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 76990646 G/A 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.105144579901353 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 79760818 A/G 1 15 3 18 7.05435367282426 1.58912926543515 5.46522440738912 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00938965043457943 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79760734_79760852:POLR3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 79762028 G/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79761955_79762066:POLR3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 81064950 G/C 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81064921_81064988:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81064921_81064988:ZMIZ1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C T C 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:T A T 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 88975783 C/T 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000237134:ENST00000449358:exon_88975751_88975928:AL157893.1;ENSG00000237134:ENST00000420863:exon_88975751_88975928:AL157893.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 89312046 T/C 1 17 25 42 7.99493416253417 13.2427438786262 -5.24780971609206 T:C T C 10 0.529709755145049 0.122206959251360 ENSG00000107789:ENST00000371996:exon_89311839_89313145:MINPP1;ENSG00000107789:ENST00000371994:exon_89311839_89313145:MINPP1;ENSG00000107789:ENST00000472891:exon_89311839_89312394:MINPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91007360 T/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:G T G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000107798:ENST00000336233:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000371829:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000456827:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000425287:exon_91007295_91007406:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000428800:exon_91007295_91007588:LIPA;ENSG00000107798:ENST00000282673:exon_91007295_91007406:LIPA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91468925 C/G 1 3 14 17 1.41087073456485 7.41593657203069 -6.00506583746583 C:G C G 10 0.529709755145049 0.00564502069059858 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91468924_91469010:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91468924_91469010:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91470834 A/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:C A C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91470718_91470902:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000447580:exon_91470718_91470847:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 27 20 47 12.6978366110837 10.594195102901 2.1036415081827 A:G G A 10 0.529709755145049 0.562318941515894 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 20 9 29 9.40580489709902 4.76738779630544 4.63841710079358 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0954179214299481 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 40 23 63 18.811609794198 12.1833243683361 6.62828542586191 A:T A T 10 0.529709755145049 0.101613756681237 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 26 28 54 12.2275463662287 14.8318731440614 -2.60432677783265 A:T T A 10 0.529709755145049 0.498017708653451 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 36 23 59 16.9304488147782 12.1833243683361 4.74712444644211 A:G A G 10 0.529709755145049 0.241394556185378 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 30 22 52 14.1087073456485 11.6536146131911 2.45509273245745 A:G A G 10 0.529709755145049 0.57893238011456 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 16 26 42 7.52464391767922 13.7724536337713 -6.24780971609206 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0631425160141748 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 92631778 G/A 1 17 14 31 7.99493416253417 7.41593657203069 0.57899759050348 A:G G A 10 0.529709755145049 0.859395359335908 ENSG00000148688:ENST00000371703:exon_92631473_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000371705:exon_92631709_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000413330:exon_92631709_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000487998:exon_92631730_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000277882:exon_92631740_92631891:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000458617:exon_92631744_92631891:RPP30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 35 23 58 16.4601585699233 12.1833243683361 4.27683420158715 A:T A T 10 0.529709755145049 0.293563430527675 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 95441272 G/A 1 38 56 94 17.8710293044881 29.6637462881227 -11.7927169836346 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0171408107944346 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95441237_95441355:FRA10AC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 96098373 C/T 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 T:C C T 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 487 365 852 229.031349244361 193.344060627943 35.6872886164182 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0147913067173370 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97371146 G/A 1 38 41 79 17.8710293044881 21.718099960947 -3.84707065645888 A:G G A 10 0.529709755145049 0.430517302021468 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97371013_97371199:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97371013_97371199:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000485428:exon_97371013_97371199:ALDH18A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97607165 G/A 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:G G A 10 0.529709755145049 0.867231390264526 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97919550 T/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97919742 A/G 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97919839 A/T 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 A:T A T 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 60 71 131 28.2174146912971 37.6093926152985 -9.39197792400142 A:G A G 10 0.529709755145049 0.114864178317745 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 T:C C T 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:C C A 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 33 32 65 15.5195780802134 16.9507121646416 -1.43113408442819 A:G G A 10 0.529709755145049 0.803983286139744 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 28 21 49 13.1681268559386 11.123904858046 2.0442219978926 T:C C T 10 0.529709755145049 0.571118271455057 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:C A C 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 A:G A G 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 27 14 41 12.6978366110837 7.41593657203069 5.28190003905299 T:C T C 10 0.529709755145049 0.117515260304257 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 16 11 27 7.52464391767922 5.82680730659554 1.69783661108368 C:G G C 10 0.529709755145049 0.566932775224758 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 100195130 G/A 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100195089_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100194843_100195171:HPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 A:C A C 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 102247408 C/A 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:C C A 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 102247526 G/C 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 C:G G C 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102246399_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102246403_102247855:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102246404_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102246405_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000469546:exon_102246542_102247552:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102246681_102247552:SEC31B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 124 70 194 58.3159903620139 37.0796828601534 21.2363075018605 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00244370668589948 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:C C A 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 28 14 42 13.1681268559386 7.41593657203069 5.75219028390794 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0888060117586107 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 103340056 G/A 1 13 24 37 6.11377318311436 12.7130341234812 -6.59926094036681 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0324999659804827 ENSG00000166171:ENST00000470165:exon_103339817_103340065:DPCD;ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 27 26 53 12.6978366110837 13.7724536337713 -1.0746170226876 A:G A G 10 0.529709755145049 0.784704843120088 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 103361088 C/T 1 9 17 26 4.23261220369456 9.00506583746583 -4.77245363377128 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0761857104955026 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000434727:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103360960_103361093:DPCD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 T:C T C 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 103906612 G/A 1 35 26 61 16.4601585699233 13.7724536337713 2.68770493615201 A:G G A 10 0.529709755145049 0.523209297887255 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103906429_103907149:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103906429_103907149:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000370012:exon_103906429_103907149:PPRC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 104161475 A/C 1 25 46 71 11.7572561213738 24.3666487366723 -12.6093926152985 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00285301175024250 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 104572963 T/C 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 39 36 75 18.3413195493431 19.0695511852218 -0.728231635878679 A:G G A 10 0.529709755145049 0.908153669638258 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 105174869 G/A 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 A:G G A 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174762_105174908:PDCD11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G G A 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 274 212 486 128.859527090257 112.29846809075 16.5610589995062 A:T:C C A 10 0.529709755145049 0.133964029854061 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 55 38 93 25.8659634670223 20.1289706955119 5.73699277151044 T:C C T 10 0.529709755145049 0.253847600570414 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 112349422 T/C 1 83 76 159 39.0340903229609 40.2579413910237 -1.2238510680628 T:C T C 10 0.529709755145049 0.873913920399398 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 114200355 G/A 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000023041:ENST00000369405:exon_114200292_114200453:ZDHHC6;ENSG00000023041:ENST00000369404:exon_114200292_114200453:ZDHHC6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 T:G G T 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 115922492 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 120446114 A/G 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000490610:exon_120446110_120446293:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000489169:exon_120446110_120446153:C10orf46 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 120795626 A/T 1 271 295 566 127.448656355692 156.264377767789 -28.8157214120977 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0163304926404932 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120794356_120795780:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120795334_120795780:EIF3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 43 48 91 20.2224805287629 25.4260682469624 -5.20358771819946 A:G A G 10 0.529709755145049 0.294424700520838 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 48 36 84 22.5739317530376 19.0695511852218 3.50438056781588 A:G G A 10 0.529709755145049 0.512188948071584 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 121652266 A/G 0 9 0 9 4.23261220369456 0 4.23261220369456 A A 10 0.529709755145049 0.0044089015254185 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121652223_121652457:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000470478:exon_121652257_121652457:SEC23IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.130404884079537 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 122633421 C/T 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122633351_122633435:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122633351_122633435:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122633351_122633435:WDR11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 24 15 39 11.2869658765188 7.94564632717574 3.34131954934309 A:G G A 10 0.529709755145049 0.336707319671434 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 25 15 40 11.7572561213738 7.94564632717574 3.81160979419804 A:G G A 10 0.529709755145049 0.268340127374197 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 7 14 21 3.29203171398466 7.41593657203069 -4.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0819766302290953 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 126517989 G/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126517962_126518046:FAM175B;ENSG00000165660:ENST00000486933:exon_126517962_126518046:FAM175B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 26 18 44 12.2275463662287 9.53477559261088 2.69277077361784 T:C T C 10 0.529709755145049 0.452813649192105 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129899543 C/T 1 277 232 509 130.270397824821 122.892663193651 7.37773463117006 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.534255903122678 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129899629 G/A 1 399 448 847 187.645807697125 237.309970304982 -49.6641626078565 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00064998784038973 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 334 276 610 157.076941781554 146.199892420034 10.8770493615201 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.394391460106446 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 192 145 337 90.2957270121506 76.8079144960321 13.4878125161185 T:C T C 10 0.529709755145049 0.155848095938159 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 96 65 161 45.1478635060753 34.4311340844282 10.7167294216471 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0973602313585109 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 133 106 239 62.5486025657085 56.1492340453752 6.39936852033328 T:C T C 10 0.529709755145049 0.436932332229339 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 109 96 205 51.2616366891897 50.8521364939247 0.409500195264954 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 109 117 226 51.2616366891897 61.9760413519707 -10.7144046627811 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.161833185285462 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129904474 G/A 1 47 25 72 22.1036415081827 13.2427438786262 8.86089762955647 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0440860490834432 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 44 25 69 20.6927707736178 13.2427438786262 7.45002689499162 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0906279595887984 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129905429 C/T 1 23 23 46 10.8166756316639 12.1833243683361 -1.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.768168914109342 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129906364 G/A 1 23 12 35 10.8166756316639 6.35651706174059 4.46015856992328 A:G G A 10 0.529709755145049 0.174742910219736 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129906427 C/A 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:C C A 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 23 14 37 10.8166756316639 7.41593657203069 3.40073905963319 T:C C T 10 0.529709755145049 0.323506120270236 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129906674 T/C 1 17 21 38 7.99493416253417 11.123904858046 -3.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.332717093828513 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129907489 G/A 1 20 24 44 9.40580489709902 12.7130341234812 -3.30722922638216 A:G G A 10 0.529709755145049 0.365674360174437 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 18 11 29 8.46522440738912 5.82680730659554 2.63841710079358 C:G G C 10 0.529709755145049 0.357377168018118 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129910475 T/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:G T G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000484853:exon_129910397_129910713:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 39 6 45 18.3413195493431 3.17825853087029 15.1630610184728 T:C T C 10 0.529709755145049 3.04994859229048e-06 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 36 11 47 16.9304488147782 5.82680730659554 11.1036415081827 T:G G T 10 0.529709755145049 0.00112449798405731 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 6 30 36 2.82174146912971 15.8912926543515 -13.0695511852218 A:G A G 10 0.529709755145049 1.25415859437965e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 134145336 G/T 1 13 2 15 6.11377318311436 1.0594195102901 5.05435367282426 T:G G T 10 0.529709755145049 0.00888198752701154 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 80 94 174 37.6232195883961 49.7927169836346 -12.1694973952385 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0684004988757207 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.617967869881185 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135098621 G/A 1 40 31 71 18.811609794198 16.4210024094965 2.39060738470152 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.634881674814586 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 18 23 41 8.46522440738912 12.1833243683361 -3.71809996094701 T:C C T 10 0.529709755145049 0.274894962106190 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135180430 A/G 1 180 166 346 84.6522440738912 87.9318193540781 -3.27957528018698 A:G A G 10 0.529709755145049 0.746698799753233 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135180393_135180497:ECHS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135184126 G/A 1 81 66 147 38.093509833251 34.9608438395732 3.13266599367779 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.620961549013893 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135204950 C/G 1 27 44 71 12.6978366110837 23.3072292263822 -10.6093926152985 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0124353109946426 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 28 42 70 13.1681268559386 22.2478097160921 -9.07968286015343 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0313308525022662 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 236091 G/A 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 237087 A/G 1 42 33 75 19.7521902839079 17.4804219197866 2.27176836412132 A:G A G 10 0.529709755145049 0.644449295100949 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 244197 T/C 1 99 30 129 46.5587342406401 15.8912926543515 30.6674415862887 T:C T C 10 0.529709755145049 4.10280201525144e-08 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 65 88 153 30.5688659155718 46.6144584527643 -16.0455925371925 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00955452537258393 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 172 57 229 80.8899221150516 30.1934560432678 50.6964660717838 A:G A G 10 0.529709755145049 6.75917930435735e-12 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 612 600 1212 287.81762985123 317.825853087029 -30.0082232357994 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0843380126226708 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 319898 G/T 1 4 75 79 1.8811609794198 39.7282316358787 -37.8470706564589 T:G G T 10 0.529709755145049 4.44330959269575e-20 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_319669_319990:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000452428:exon_319737_319940:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000270031:exon_319737_319940:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000531688:exon_319746_319990:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_319773_319990:IFITM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 320836 C/T 1 12 1 13 5.64348293825941 0.529709755145049 5.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00410340758101103 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 419557 G/A 1 41 35 76 19.281900039053 18.5398414300767 0.742058608976272 A:G G A 10 0.529709755145049 0.908811752144201 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 428385 A/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428358_428394:ANO9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 431834 A/G 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_431694_433459:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_431694_431906:ANO9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 490035 C/T 1 21 14 35 9.87609514195397 7.41593657203069 2.46015856992328 T:C C T 10 0.529709755145049 0.498888420364794 ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531411:exon_489883_490068:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000530029:exon_489791_490068:PTDSS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 494662 G/A 1 219 140 359 102.993563623234 74.1593657203069 28.8341979029274 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00253433034205936 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494512_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494513_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494513_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494515_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494515_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494516_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494523_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494546_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494548_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494552_494778:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494561_494778:RNH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 494873 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 153 122 275 71.9544074628075 64.624590127696 7.32981733511151 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.397872734357583 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 495057 G/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:G G T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 49 37 86 23.0442219978926 19.5992609403668 3.44496105752578 A:G A G 10 0.529709755145049 0.517193092168912 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 554003 T/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000161328:ENST00000270115:exon_553963_554916:LRRC56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 554018 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000161328:ENST00000270115:exon_553963_554916:LRRC56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 554166 C/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 C:G C G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000161328:ENST00000270115:exon_553963_554916:LRRC56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 555835 A/C 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 A:C A C 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000185522:ENST00000469990:exon_555305_555930:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_555734_555930:C11orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 556599 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 557584 G/A 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_557572_557640:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000441853:exon_557572_557640:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000486629:exon_557572_557640:C11orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 558884 C/T 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_558856_558979:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000441853:exon_558856_558979:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000486629:exon_558856_559062:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000492515:exon_558856_558979:C11orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 20 20 40 9.40580489709902 10.594195102901 -1.18839020580196 T:C T C 10 0.529709755145049 0.75281037212825 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 644614 G/C 1 56 52 108 26.3362537118773 27.5449072675425 -1.20865355566529 C:G G C 10 0.529709755145049 0.847425911717149 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527658:exon_644234_644654:DEAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 30 29 59 14.1087073456485 15.3615828992064 -1.25287555355789 A:G A G 10 0.529709755145049 0.794804989289095 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 772490 G/A 1 10 16 26 4.70290244854951 8.47535608232078 -3.77245363377128 A:G G A 10 0.529709755145049 0.169393564329476 ENSG00000177225:ENST00000528309:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526650:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_772427_772614:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532839:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_772427_772521:PDDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 792570 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177542:ENST00000320230:exon_792553_792727:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531214:exon_792553_792727:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000481290:exon_792553_792727:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531437:exon_792553_792727:SLC25A22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 793588 G/A 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000177542:ENST00000320230:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531214:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000481290:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531437:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529351:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000533385:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000526152:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528606:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527734:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000527723:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531514:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000528936:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000456706:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000532484:exon_793529_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000524891:exon_793478_793619:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000529066:exon_793587_793619:SLC25A22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 15 14 29 7.05435367282426 7.41593657203069 -0.361582899206422 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 804212 C/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_804094_804675:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_804094_805103:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_804094_804469:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_804094_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534649:exon_804094_804463:LRDD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 824789 T/C 0 0 63 63 0 33.3717145741381 -33.3717145741381 C T C 10 0.529709755145049 2.28589423276458e-21 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 5 23 28 2.35145122427475 12.1833243683361 -9.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000194052419806774 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 35 14 49 16.4601585699233 7.41593657203069 9.0442219978926 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00980449371660846 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 18 8 26 8.46522440738912 4.23767804116039 4.22754636622872 A:G A G 10 0.529709755145049 0.116491619827904 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 21 36 57 9.87609514195397 19.0695511852218 -9.1934560432678 A:C C A 10 0.529709755145049 0.016586674439969 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 187 134 321 87.9442757878758 70.9811071894366 16.9631685984393 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.0648495997049354 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 5653963 G/A 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 A:G G A 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5653467_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5653511_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5653485_5653984:TRIM34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 14 18 32 6.58406342796931 9.53477559261088 -2.95071216464157 T:C T C 10 0.529709755145049 0.3762394145446 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 167 151 318 78.5384708907768 79.9861730269024 -1.4477021361256 T:C T C 10 0.529709755145049 0.910566672783094 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 150 128 278 70.5435367282426 67.8028486585663 2.74068806967637 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.76406263202616 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 133 143 276 62.5486025657085 75.748494985742 -13.1998924200335 T:C T C 10 0.529709755145049 0.116999170792510 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 A:G A G 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6341365 C/T 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6341323_6341385:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6520015 G/T 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6623433 G/A 1 18 14 32 8.46522440738912 7.41593657203069 1.04928783535843 A:G G A 10 0.529709755145049 0.727553030410456 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6623082_6623445:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6623082_6623445:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6623082_6623494:RRP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 123 133 256 57.845700117159 70.4513974342915 -12.6056973171326 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.117780488024491 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 493 467 960 231.853090713491 247.374455652738 -15.5213649392471 T:C C T 10 0.529709755145049 0.316414885896665 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6640474 G/T 1 15 20 35 7.05435367282426 10.594195102901 -3.53984143007672 T:G G T 10 0.529709755145049 0.240735837360394 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6640427_6640585:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6640427_6640640:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000530040:exon_6640427_6640627:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528917:exon_6640007_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000531754:exon_6640427_6640498:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524903:exon_6640427_6640612:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528657:exon_6639960_6640498:TPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 398 408 806 187.17551745227 216.12158009918 -28.9460626469095 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.0442292668024751 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7656809 G/A 1 15 1 16 7.05435367282426 0.529709755145049 6.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000693170477792336 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532381:exon_7656783_7656824:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7656783_7656824:PPFIBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 18 5 23 8.46522440738912 2.64854877572525 5.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0197583414854022 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 41 25 66 19.281900039053 13.2427438786262 6.03915616042676 A:G G A 10 0.529709755145049 0.141004043100483 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 65 84 149 30.5688659155718 44.4956194321841 -13.9267535166123 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0263839792238066 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 41 46 87 19.281900039053 24.3666487366723 -5.08474869761927 T:C T C 10 0.529709755145049 0.284490230880265 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 44 39 83 20.6927707736178 20.6586804506569 0.0340903229609282 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 7689029 A/C 1 35 39 74 16.4601585699233 20.6586804506569 -4.19852188073363 A:C A C 10 0.529709755145049 0.352622893477527 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7688774_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689003_7689044:CYB5R2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 A:G A G 10 0.529709755145049 0.200137897636222 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 34 23 57 15.9898683250683 12.1833243683361 3.8065439567322 A:C A C 10 0.529709755145049 0.353867414334136 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 10327547 C/G 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 C:G C G 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000148926:ENST00000278175:exon_10327496_10327645:ADM;ENSG00000148926:ENST00000534464:exon_10327227_10327645:ADM;ENSG00000148926:ENST00000530439:exon_10327227_10328909:ADM;ENSG00000148926:ENST00000524948:exon_10327496_10327807:ADM;ENSG00000148926:ENST00000528655:exon_10327496_10327645:ADM;ENSG00000148926:ENST00000526492:exon_10327496_10327645:ADM;ENSG00000148926:ENST00000525063:exon_10327496_10327645:ADM;ENSG00000148926:ENST00000528544:exon_10327496_10327659:ADM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 10521764 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 8 17 25 3.76232195883961 9.00506583746583 -5.24274387862623 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0441524521276981 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 11 18 29 5.17319269340446 9.53477559261088 -4.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.135786850560934 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 10786175 C/T 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 T:C C T 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 10789384 A/G 1 24 21 45 11.2869658765188 11.123904858046 0.163061018472794 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10789353_10789538:CTR9;ENSG00000198730:ENST00000526874:exon_10789353_10789538:CTR9;ENSG00000198730:ENST00000529355:exon_10788598_10789538:CTR9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 10 23 33 4.70290244854951 12.1833243683361 -7.48042191978662 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0133688026353719 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 17809639 C/T 1 21 25 46 9.87609514195397 13.2427438786262 -3.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.375953294854275 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 17809724 T/C 1 48 36 84 22.5739317530376 19.0695511852218 3.50438056781588 T:C T C 10 0.529709755145049 0.512188948071584 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 19 21 40 8.93551465224407 11.123904858046 -2.18839020580196 T:C C T 10 0.529709755145049 0.528559104738777 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 18422487 C/A 1 557 571 1128 261.951666384208 302.464270187823 -40.5126038036153 A:T:C C A 10 0.529709755145049 0.0169858274952159 ENSG00000134333:ENST00000422447:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000396222:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000379412:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000445376:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000227157:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000478970:exon_18422384_18422517:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000486690:exon_18422384_18422557:LDHA;ENSG00000134333:ENST00000460405:exon_18422384_18422557:LDHA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 18424590 T/A 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:T T A 10 0.529709755145049 0.186626222993581 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 19251826 G/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000129173:ENST00000527884:exon_19251788_19251875:E2F8;ENSG00000129173:ENST00000396159:exon_19251788_19251875:E2F8;ENSG00000129173:ENST00000250024:exon_19251788_19251875:E2F8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 22696451 A/G 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:G A G 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000148935:ENST00000528582:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000533092:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000454584:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000533363:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000278187:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000524701:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000534801:exon_22696396_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000532398:exon_22696319_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000433790:exon_22696319_22696560:GAS2;ENSG00000148935:ENST00000432939:exon_22696416_22696565:GAS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 30 21 51 14.1087073456485 11.123904858046 2.9848024876025 T:C T C 10 0.529709755145049 0.483467107177551 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G A G 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34130342 A/G 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34130289_34130380:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531723:exon_34130289_34130380:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000529523:exon_34130289_34130380:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000527971:exon_34130289_34130380:NAT10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34154641 C/T 1 21 18 39 9.87609514195397 9.53477559261088 0.341319549343087 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34460541 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34460472_34460626:CAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 14 14 28 6.58406342796931 7.41593657203069 -0.831873144061372 T:C C T 10 0.529709755145049 0.850483860830919 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 0 15 0 15 7.05435367282426 0 7.05435367282426 C C 10 0.529709755145049 8.4714243137928e-05 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34938269 C/T 0 15 0 15 7.05435367282426 0 7.05435367282426 C C 10 0.529709755145049 8.4714243137928e-05 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34938310 T/C 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34969150 C/T 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 34988343 T/C 1 23 13 36 10.8166756316639 6.88622681688564 3.93044881477823 T:C T C 10 0.529709755145049 0.242322790947117 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34988187_34988361:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34988187_34988361:PDHX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 36680765 T/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000166352:ENST00000334307:exon_36680569_36680818:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000347206:exon_36680569_36680822:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000534635:exon_36680569_36680824:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000446510:exon_36680569_36680821:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000528092:exon_36680569_36680834:C11orf74 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 43413028 A/C 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:C A C 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000299240:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000534347:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000530469:exon_43413015_43413338:TTC17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 43427162 G/A 1 17 14 31 7.99493416253417 7.41593657203069 0.57899759050348 A:G G A 10 0.529709755145049 0.859395359335908 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43427064_43427179:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000299240:exon_43427064_43427179:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000526774:exon_43427064_43427179:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000530483:exon_43427064_43427426:TTC17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 43702530 A/G 1 33 46 79 15.5195780802134 24.3666487366723 -8.84707065645888 A:G A G 10 0.529709755145049 0.054821705993646 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 41 33 74 19.281900039053 17.4804219197866 1.80147811926637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.727443537864958 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 44089352 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000110455:ENST00000524990:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000526577:exon_44089178_44089465:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000533404:exon_44089178_44089409:ACCS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 37 43 80 17.4007390596332 22.7775194712371 -5.37678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 0.262714114679396 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 45936235 T/C 1 59 64 123 27.7471244464421 33.9014243292831 -6.15429988284103 T:C T C 10 0.529709755145049 0.27918159735652 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45936155_45936235:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45936155_45936235:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45936155_45936235:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000533151:exon_45936155_45936235:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532554:exon_45936155_45936235:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000525192:exon_45936155_45936235:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000527371:exon_45936155_45936235:PEX16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 46419411 G/A 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000452566:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46417965_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000526545:exon_46418934_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46419000_46419493:AMBRA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 46724289 C/G 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 C:G C G 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46724254_46724315:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000526410:exon_46724254_46724445:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000534481:exon_46724254_46724313:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000527008:exon_46724265_46724793:ZNF408 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 46784697 A/C 1 17 17 34 7.99493416253417 9.00506583746583 -1.01013167493167 A:C A C 10 0.529709755145049 0.734879131905574 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526943:exon_46784696_46784729:CKAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 53 52 105 24.9253829773124 27.5449072675425 -2.61952429023015 T:C C T 10 0.529709755145049 0.626001132737095 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 47203983 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000165912:ENST00000298838:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000415232:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000532457:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000528462:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000530513:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000528201:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000531226:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000525725:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000530405:exon_47203957_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000524509:exon_47203957_47204110:PACSIN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 47640429 G/C 1 143 181 324 67.251505014258 95.8774656812539 -28.6259606669959 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.00149395923371782 ENSG00000109919:ENST00000302503:exon_47638868_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000534074:exon_47640256_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000531669:exon_47640262_47640471:MTCH2;ENSG00000109919:ENST00000525649:exon_47640391_47640471:MTCH2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 57077109 C/A 1 26 14 40 12.2275463662287 7.41593657203069 4.81160979419804 A:C C A 10 0.529709755145049 0.153927937215706 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 57155001 G/A 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 A:G G A 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57154267_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57154288_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57154416_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57154916_57155006:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57154838_57155006:RP11-872D17.8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 A:G A G 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 57426996 A/C 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000172409:ENST00000529773:exon_57426927_57427224:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000529430:exon_57426927_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533682:exon_57426927_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533905:exon_57426902_57427345:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000525602:exon_57426936_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000302731:exon_57426927_57427362:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000438099:exon_57426949_57427362:CLP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 95 79 174 44.6775732612203 41.8470706564589 2.83050260476146 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.704394856616066 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 58338120 G/A 1 147 155 302 69.1326659936778 82.1050120474826 -12.9723460538048 A:G G A 10 0.529709755145049 0.149424624499662 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58338029_58338191:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000529915:exon_58338029_58338186:LPXN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60609972 A/G 1 42 44 86 19.7521902839079 23.3072292263822 -3.55503894247422 A:G A G 10 0.529709755145049 0.451599549282225 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 83 77 160 39.0340903229609 40.7876511461688 -1.75356082320785 A:C C A 10 0.529709755145049 0.812397207668255 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60666070 G/A 1 160 107 267 75.2464391767922 56.6789438005202 18.5674953762719 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0233021705606943 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666013_60666098:PRPF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 156 153 309 73.3652781973723 81.0455925371925 -7.68031433982016 A:G G A 10 0.529709755145049 0.392948997623595 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60689320 C/T 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60705518 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 60711251 G/A 1 38 28 66 17.8710293044881 14.8318731440614 3.03915616042676 A:G G A 10 0.529709755145049 0.462834558793025 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C T C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 16 6 22 7.52464391767922 3.17825853087029 4.34638538680892 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0858744960227817 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61108974 G/A 1 21 20 41 9.87609514195397 10.594195102901 -0.718099960947011 A:G G A 10 0.529709755145049 0.876303756882822 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61108908_61108986:DAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 30 12 42 14.1087073456485 6.35651706174059 7.75219028390794 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0195975010585981 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61131839 G/A 1 19 24 43 8.93551465224407 12.7130341234812 -3.77751947123711 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.285705319295368 ENSG00000149483:ENST00000278826:exon_61131724_61131990:TMEM138;ENSG00000149483:ENST00000451389:exon_61131724_61131990:TMEM138 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61165741 G/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 14 18 32 6.58406342796931 9.53477559261088 -2.95071216464157 A:G G A 10 0.529709755145049 0.3762394145446 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61257227 C/T 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154514551774692 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61895638 G/T 1 9 15 24 4.23261220369456 7.94564632717574 -3.71303412348118 T:G G T 10 0.529709755145049 0.153480735060501 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 32 35 67 15.0492878353584 18.5398414300767 -3.49055359471829 T:G G T 10 0.529709755145049 0.395107628414042 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 61916312 C/T 1 25 16 41 11.7572561213738 8.47535608232078 3.28190003905299 T:C C T 10 0.529709755145049 0.349362749891687 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61916211_61916318:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61916211_61916318:INCENP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62284888 G/A 1 87 88 175 40.9152513023807 46.6144584527643 -5.69920715038359 A:G G A 10 0.529709755145049 0.405330099953569 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 1507 683 2190 708.727398996411 361.791762764068 346.935636232343 A:C:G G C 10 0.529709755145049 2.48038906825144e-51 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62365619 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62365665 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62370155 G/A 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000149499:ENST00000439994:exon_62369690_62370251:EML3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 A:G G A 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 15 10 25 7.05435367282426 5.29709755145049 1.75725612137377 T:C T C 10 0.529709755145049 0.550990071693142 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62397114 T/C 1 40 25 65 18.811609794198 13.2427438786262 5.56886591557181 T:C T C 10 0.529709755145049 0.173805179327532 ENSG00000089597:ENST00000532402:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000346178:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000356638:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534779:exon_62397060_62397156:GANAB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62430659 T/A 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 A:T T A 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000162194:ENST00000525675:exon_62430587_62430805:C11orf48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62432903 C/T 1 45 27 72 21.1630610184728 14.3021633889163 6.86089762955647 T:C C T 10 0.529709755145049 0.124463619570375 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62439569 G/A 1 149 165 314 70.0732464833877 87.4021095989331 -17.3288631155454 A:G G A 10 0.529709755145049 0.054464127710427 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 45 48 93 21.1630610184728 25.4260682469624 -4.26300722848956 T:C T C 10 0.529709755145049 0.406548549348844 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 99 90 189 46.5587342406401 47.6738779630544 -1.11514372241427 T:C T C 10 0.529709755145049 0.884332559059098 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 93 66 159 43.7369927715104 34.9608438395732 8.7761489319372 T:C C T 10 0.529709755145049 0.176945431974461 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 25 32 57 11.7572561213738 16.9507121646416 -5.19345604326779 T:C T C 10 0.529709755145049 0.185396895953556 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 62655878 C/T 1 250 259 509 117.572561213738 137.194826582568 -19.6222653688299 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0833978312826084 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62655803_62656265:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62655803_62655883:SLC3A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 37 24 61 17.4007390596332 12.7130341234812 4.68770493615201 A:C C A 10 0.529709755145049 0.249817607900749 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 63719891 C/T 1 12 2 14 5.64348293825941 1.0594195102901 4.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0150847280678921 ENSG00000110583:ENST00000377793:exon_63719879_63720037:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000338447:exon_63719879_63720037:NAA40;ENSG00000110583:ENST00000456907:exon_63719879_63720037:NAA40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 63764302 G/C 1 34 14 48 15.9898683250683 7.41593657203069 8.57393175303765 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0137421331454086 ENSG00000167770:ENST00000428192:exon_63764002_63764413:OTUB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 149 171 320 70.0732464833877 90.5803681298034 -20.5071216464157 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0249358942451383 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 66 77 143 31.0391561604268 40.7876511461688 -9.74849498574201 T:C T C 10 0.529709755145049 0.111441097037804 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64117106 C/T 1 71 68 139 33.3906073847015 36.0202633498633 -2.62965596516182 T:C C T 10 0.529709755145049 0.671622235003603 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64117023_64118167:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64117023_64117140:CCDC88B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64575505 C/T 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64575468_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64575468_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000440873:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000450708:exon_64575363_64575571:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000413626:exon_64575363_64575571:MEN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 88 99 187 41.3855415472357 52.4412657593599 -11.0557242121242 T:C T C 10 0.529709755145049 0.1075170843452 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64847136 C/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000146670:ENST00000275517:exon_64846825_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000404147:exon_64846560_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000479032:exon_64846825_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000531401:exon_64846825_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000527430:exon_64846825_64847259:CDCA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64897453 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162298:ENST00000530451:exon_64897201_64897458:SYVN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64897636 G/A 1 20 22 42 9.40580489709902 11.6536146131911 -2.24780971609206 A:G G A 10 0.529709755145049 0.537869099245852 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64897474_64897644:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64897474_64897647:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64897474_64897644:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64897474_64897851:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64897474_64897644:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64897474_64897647:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000527765:exon_64897474_64897644:SYVN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64950331 G/A 1 76 64 140 35.7420586089763 33.9014243292831 1.84063427969313 A:G G A 10 0.529709755145049 0.79970767688039 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000532285:exon_64950172_64950361:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64949933_64950439:CAPN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 64950638 A/G 1 52 62 114 24.4550927324575 32.842004818993 -8.38691208653559 A:G A G 10 0.529709755145049 0.133022305859320 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950599_64950668:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950599_64950668:CAPN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65211979 G/A 1 19 12 31 8.93551465224407 6.35651706174059 2.57899759050348 A:G G A 10 0.529709755145049 0.374617294226683 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 24 23 47 11.2869658765188 12.1833243683361 -0.896358491817304 A:G G A 10 0.529709755145049 0.884053964985297 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 21 7 28 9.87609514195397 3.70796828601534 6.16812685593863 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0223010587578852 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 46 38 84 21.6333512633277 20.1289706955119 1.50438056781588 A:G G A 10 0.529709755145049 0.827122327699576 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 27 16 43 12.6978366110837 8.47535608232078 4.22248052876289 A:G G A 10 0.529709755145049 0.223065410524709 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65389890 G/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 C:G G C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 42 36 78 19.7521902839079 19.0695511852218 0.682639098686174 A:G G A 10 0.529709755145049 0.910062137981335 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 130 106 236 61.1377318311436 56.1492340453752 4.98849778576843 A:G G A 10 0.529709755145049 0.557374387686353 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65546522 G/A 0 24 0 24 11.2869658765188 0 11.2869658765188 G G 10 0.529709755145049 2.51885276281317e-07 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1988 2334 4322 934.937006771642 1236.34256850854 -301.405561736902 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 4.63986049863764e-20 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65628334 G/A 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G G A 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 21 8 29 9.87609514195397 4.23767804116039 5.63841710079358 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0405720324927911 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 21 6 27 9.87609514195397 3.17825853087029 6.69783661108368 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0112055521687356 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 T:C C T 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 25 14 39 11.7572561213738 7.41593657203069 4.34131954934309 A:G G A 10 0.529709755145049 0.199463472816165 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 39 30 69 18.3413195493431 15.8912926543515 2.45002689499162 T:G G T 10 0.529709755145049 0.629904649396151 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65636053 T/C 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C T C 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000172638:ENST00000531972:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526628:exon_65635981_65637393:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528176:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000307998:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000532084:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531005:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000527969:exon_65635951_65636311:EFEMP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65664346 T/C 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C T C 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000175592:ENST00000455710:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000312562:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000531493:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000532401:exon_65664280_65664477:FOSL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65685317 G/A 1 16 13 29 7.52464391767922 6.88622681688564 0.638417100793578 A:G G A 10 0.529709755145049 0.854345466479414 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 99 95 194 46.5587342406401 50.3224267387797 -3.76369249813951 C:G G C 10 0.529709755145049 0.614912520605226 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 14 36 50 6.58406342796931 19.0695511852218 -12.4854877572525 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0005319124832538 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 83 61 144 39.0340903229609 32.312295063848 6.72179525911294 T:C T C 10 0.529709755145049 0.278346547923761 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 31 57 88 14.5789975905035 30.1934560432678 -15.6144584527643 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00088079139393861 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67034266 C/A 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 A:C C A 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000173020:ENST00000308595:exon_67033881_67034283:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000526285:exon_67033952_67034283:ADRBK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67068859 T/C 1 34 36 70 15.9898683250683 19.0695511852218 -3.07968286015343 T:C T C 10 0.529709755145049 0.474734682008379 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 T:C:G T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 26 19 45 12.2275463662287 10.0644853477559 2.16306101847279 T:C C T 10 0.529709755145049 0.553084380083267 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67176898 A/G 1 116 101 217 54.5536684031743 53.5006852696499 1.05298313352436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.892079140836663 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67176878_67177560:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67176878_67177560:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67176878_67177557:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67176878_67177559:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000524662:exon_67176878_67176925:TBC1D10C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67196049 G/A 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:G G A 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 74 70 144 34.8014781192664 37.0796828601534 -2.27820474088706 T:C C T 10 0.529709755145049 0.738696598357721 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 234 247 481 110.047917296059 130.838309520827 -20.7903922247686 A:T:C C A 10 0.529709755145049 0.061039466307315 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67263767 A/G 1 15 6 21 7.05435367282426 3.17825853087029 3.87609514195397 A:G A G 10 0.529709755145049 0.124563644273288 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67263649_67263819:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67263649_67263816:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67263649_67264907:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67263649_67263819:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000526602:exon_67263649_67263910:PITPNM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67352256 C/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:C C A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67353844 C/T 1 26 21 47 12.2275463662287 11.123904858046 1.1036415081827 T:C C T 10 0.529709755145049 0.772162728348063 ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 2660 2592 5252 1250.97205131417 1373.00768533597 -122.035634021797 A:T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.000780658701695024 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 19 20 39 8.93551465224407 10.594195102901 -1.65868045065691 T:C C T 10 0.529709755145049 0.632626535198063 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 67941365 G/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:G G T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000110066:ENST00000304363:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000424360:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000441488:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000427752:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000401547:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000405515:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000402789:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000443482:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000451309:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000402185:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000323599:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000533271:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000524672:exon_67941271_67941380:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000453170:exon_67941350_67941380:SUV420H1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68171013 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68170951_68171167:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68170951_68171167:LRP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68192630 C/T 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68216325 C/T 1 19 25 44 8.93551465224407 13.2427438786262 -4.30722922638216 T:C C T 10 0.529709755145049 0.227243537746857 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68216277_68216743:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68216277_68216740:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529702:exon_68216277_68216606:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529481:exon_68216277_68216650:LRP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68575086 G/A 1 4 12 16 1.8811609794198 6.35651706174059 -4.47535608232078 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.0416130324707808 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68574935_68575106:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68574935_68575106:CPT1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 70200529 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530798:exon_70200428_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526347:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530294:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526074:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000528750:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000533894:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530390:exon_70200407_70200558:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000527612:exon_70200309_70200558:PPFIA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 70279759 G/A 1 17 3 20 7.99493416253417 1.58912926543515 6.40580489709902 A:G G A 10 0.529709755145049 0.005637963242879 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 46 48 94 21.6333512633277 25.4260682469624 -3.79271698363461 A:G G A 10 0.529709755145049 0.470014718356586 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 39 55 94 18.3413195493431 29.1340365329777 -10.7927169836346 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0296498746983589 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 15 10 25 7.05435367282426 5.29709755145049 1.75725612137377 T:C T C 10 0.529709755145049 0.550990071693142 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 71945332 A/G 1 32 38 70 15.0492878353584 20.1289706955119 -5.07968286015343 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.233117348469055 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71945325_71945438:INPPL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 71948536 C/G 1 47 57 104 22.1036415081827 30.1934560432678 -8.0898145350851 C:G C G 10 0.529709755145049 0.116740482256780 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 72040784 T/C 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72040751_72040848:CLPB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 63 61 124 29.6282854258619 32.312295063848 -2.68400963798608 C:G G C 10 0.529709755145049 0.653455606581416 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 73516109 C/G 1 28 16 44 13.1681268559386 8.47535608232078 4.69277077361784 C:G C G 10 0.529709755145049 0.175395806807994 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73516072_73516124:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73516072_73516124:MRPL48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 73686708 G/T 1 378 279 657 177.769712555171 147.789021685469 29.9806908697028 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0190495125380601 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73686536_73686716:UCP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:C T C 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 74556129 A/G 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74556118_74556316:XRRA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 75672550 A/G 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 A:G A G 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75672488_75672593:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75672488_75672593:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528264:exon_75672488_75672593:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75672488_75672593:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000530501:exon_75672507_75672593:UVRAG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 37 32 69 17.4007390596332 16.9507121646416 0.450026894991616 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 44 31 75 20.6927707736178 16.4210024094965 4.27176836412132 A:G A G 10 0.529709755145049 0.35563807872209 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 25 14 39 11.7572561213738 7.41593657203069 4.34131954934309 T:C T C 10 0.529709755145049 0.199463472816165 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 35 35 70 16.4601585699233 18.5398414300767 -2.07968286015343 A:G A G 10 0.529709755145049 0.633788419261118 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 25 23 48 11.7572561213738 12.1833243683361 -0.426068246962354 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 15 16 31 7.05435367282426 8.47535608232078 -1.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 0.719657529859852 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 243 97 340 114.280529499753 51.3818462490698 62.8986832506833 C:G G C 10 0.529709755145049 4.33721308217344e-12 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 17 15 32 7.99493416253417 7.94564632717574 0.049287835358431 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 78147712 C/T 1 45 65 110 21.1630610184728 34.4311340844282 -13.2680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0127696062695929 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78147007_78147860:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529771:exon_78147235_78147860:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78147269_78147860:NARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 78277277 A/G 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G A G 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78277178_78277313:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78277178_78277318:NARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 19 9 28 8.93551465224407 4.76738779630544 4.16812685593863 T:G T G 10 0.529709755145049 0.131607092593009 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 82564294 T/G 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 82888182 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82888127_82888246:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530906:exon_82888127_82888246:PCF11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 82972960 C/G 1 75 45 120 35.2717683641213 23.8369389815272 11.4348293825941 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0437893117136934 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 85345186 T/C 1 45 41 86 21.1630610184728 21.718099960947 -0.555038942474219 T:C T C 10 0.529709755145049 0.914400334529562 ENSG00000171204:ENST00000358867:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000531718:exon_85345130_85345220:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000531477:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000304524:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000418327:exon_85345130_85345349:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000528361:exon_85345130_85346131:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000530783:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000534341:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000526822:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000529197:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000393375:exon_85345130_85345323:TMEM126B;ENSG00000171204:ENST00000531274:exon_85345130_85345220:TMEM126B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 A:C A C 10 0.529709755145049 0.200137897636222 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 25 12 37 11.7572561213738 6.35651706174059 5.40073905963319 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0984470479563017 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G G A 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:C A C 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 95555088 G/A 1 30 33 63 14.1087073456485 17.4804219197866 -3.37171457413809 A:G G A 10 0.529709755145049 0.449305450991736 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95555035_95555142:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95555035_95555142:CEP57 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 95562327 G/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 76 61 137 35.7420586089763 32.312295063848 3.42976354512828 A:G A G 10 0.529709755145049 0.607796005512813 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 29 23 52 13.6384171007936 12.1833243683361 1.45509273245745 A:G G A 10 0.529709755145049 0.781499157629994 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 23 17 40 10.8166756316639 9.00506583746583 1.81160979419804 C:G G C 10 0.529709755145049 0.636001814544782 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 19 9 28 8.93551465224407 4.76738779630544 4.16812685593863 T:C T C 10 0.529709755145049 0.131607092593009 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117075048 C/T 1 13 16 29 6.11377318311436 8.47535608232078 -2.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.45783598473891 ENSG00000149591:ENST00000392951:exon_117074931_117075273:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000525531:exon_117074931_117075257:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000278968:exon_117074931_117075498:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000533863:exon_117074498_117075476:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000530649:exon_117074931_117075492:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000532870:exon_117074931_117075494:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000529622:exon_117074931_117075121:TAGLN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 38 31 69 17.8710293044881 16.4210024094965 1.45002689499162 A:G A G 10 0.529709755145049 0.809649784157574 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117097952 C/T 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:C C A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117864113 G/A 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G G A 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 117864846 A/G 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117864714_117864864:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117864714_117864922:IL10RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118067537 C/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 C:G C G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 110 103 213 51.7319269340446 54.56010477994 -2.82817784589544 T:C T C 10 0.529709755145049 0.731585493555007 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118920453 T/C 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C T C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 A:T:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 T:C C T 10 0.529709755145049 0.690704630834042 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 14 33 47 6.58406342796931 17.4804219197866 -10.8963584918173 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00184590793235652 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 61 65 126 28.687704936152 34.4311340844282 -5.74342914827618 T:C T C 10 0.529709755145049 0.326690434564684 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 14 18 32 6.58406342796931 9.53477559261088 -2.95071216464157 T:C C T 10 0.529709755145049 0.3762394145446 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 16 11 27 7.52464391767922 5.82680730659554 1.69783661108368 A:C C A 10 0.529709755145049 0.566932775224758 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 16 15 31 7.52464391767922 7.94564632717574 -0.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 120355791 G/T 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:G G T 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000196914:ENST00000397843:exon_120355776_120360645:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000356641:exon_120355776_120360645:ARHGEF12;ENSG00000196914:ENST00000532993:exon_120355776_120359743:ARHGEF12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:T T A 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2691 2781 5472 1265.55104890467 1473.12282905838 -207.571780153708 A:T:C:G A G 10 0.529709755145049 2.03422010338298e-08 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1823 1589 3412 857.339116370576 841.708800925483 15.6303154450927 A:T:G T G 10 0.529709755145049 0.595009330328454 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 124972114 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124971097_124974937:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124972028_124972247:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124972028_124972198:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124972028_124972247:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000524373:exon_124972028_124972705:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000533273:exon_124972028_124972705:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529530:exon_124972028_124972213:TMEM218 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 38 25 63 17.8710293044881 13.2427438786262 4.62828542586191 A:G A G 10 0.529709755145049 0.258103420561017 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 53 45 98 24.9253829773124 23.8369389815272 1.08844399578519 A:G G A 10 0.529709755145049 0.840366659642716 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 73 61 134 34.3311878744114 32.312295063848 2.01889281056343 C:G C G 10 0.529709755145049 0.795273522047654 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 126139100 T/C 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110074:ENST00000533839:exon_126138950_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126139028_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126139030_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126139041_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000529802:exon_126139052_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526525:exon_126139066_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126139085_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126139087_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126139089_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126139096_126139186:FOXRED1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 126162607 G/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 126162843 C/T 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 126176578 G/A 1 78 103 181 36.6826390986862 54.56010477994 -17.8774656812539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00898945011462632 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126176465_126176639:DCPS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 130750642 A/C 1 2 11 13 0.940580489709902 5.82680730659554 -4.88622681688564 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00955089478143411 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000527116:exon_130750517_130751036:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000426933:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530330:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130750517_130750701:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130750517_130750701:SNX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 130776613 A/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 130784971 C/G 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 C:G C G 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 11 134062764 C/T 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134062584_134062804:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134062584_134062804:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134062584_134062804:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134062584_134062804:NCAPD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 T:C T C 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 3 9 12 1.41087073456485 4.76738779630544 -3.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0793760846826338 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 1893170 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 2968078 G/A 1 48 56 104 22.5739317530376 29.6637462881227 -7.0898145350851 A:G G A 10 0.529709755145049 0.170059167383123 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 3788145 C/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 127 123 250 59.7268610965788 65.154299882841 -5.42743878626226 C:G C G 10 0.529709755145049 0.526446714323458 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 34 28 62 15.9898683250683 14.8318731440614 1.15799518100696 T:C C T 10 0.529709755145049 0.800262872795602 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 4791451 C/T 1 97 122 219 45.6181537509302 64.624590127696 -19.0064363767657 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0120819630340726 ENSG00000139180:ENST00000266544:exon_4791371_4791466:NDUFA9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 97 152 249 45.6181537509302 80.5158827820475 -34.8977290311172 A:G G A 10 0.529709755145049 1.05605452168962e-05 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 48 44 92 22.5739317530376 23.3072292263822 -0.733297473344511 A:G A G 10 0.529709755145049 0.916993753848321 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 17 19 36 7.99493416253417 10.0644853477559 -2.06955118522177 A:G A G 10 0.529709755145049 0.508630438317214 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 7047143 C/A 1 3 10 13 1.41087073456485 5.29709755145049 -3.88622681688564 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0479430770942021 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 A:G A G 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 9094548 A/G 1 12 18 30 5.64348293825941 9.53477559261088 -3.89129265435147 A:G A G 10 0.529709755145049 0.199932672074604 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 111 115 226 52.2022171788996 60.9166218416806 -8.71440466278108 A:C:G C G 10 0.529709755145049 0.257540571162663 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 10525740 C/T 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000213809:ENST00000240618:exon_10524953_10525830:KLRK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 11992168 G/A 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000139083:ENST00000266427:exon_11992074_11992238:ETV6;ENSG00000139083:ENST00000396373:exon_11992074_11992238:ETV6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 26 37 63 12.2275463662287 19.5992609403668 -7.37171457413809 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0765507260930877 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:T:C A T 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 14628919 T/C 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758220070035298 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 14656768 G/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 C:G G C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000121316:ENST00000240617:exon_14656597_14656888:PLBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 50 60 110 23.5145122427475 31.7825853087029 -8.26807306595539 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.126416039923321 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 14976063 A/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 14976178 T/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:T T A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 891 856 1747 419.028608165761 453.431550404162 -34.4029422384007 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.103122716645734 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 18 26 44 8.46522440738912 13.7724536337713 -5.30722922638216 A:G A G 10 0.529709755145049 0.130649453810797 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 16 11 27 7.52464391767922 5.82680730659554 1.69783661108368 A:G A G 10 0.529709755145049 0.566932775224758 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 94 110 204 44.2072830163654 58.2680730659554 -14.06079004959 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0497278789044196 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 A:G G A 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 76 82 158 35.7420586089763 43.436199921894 -7.69414131291775 T:C C T 10 0.529709755145049 0.232302924416572 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 33 14 47 15.5195780802134 7.41593657203069 8.1036415081827 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0191285004987792 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 15 28 43 7.05435367282426 14.8318731440614 -7.77751947123711 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0211918194049534 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 T:C T C 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 29521193 A/G 1 10 16 26 4.70290244854951 8.47535608232078 -3.77245363377128 A:G A G 10 0.529709755145049 0.169393564329476 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 C:G C G 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 23 5 28 10.8166756316639 2.64854877572525 8.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00196486538914067 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 23 28 51 10.8166756316639 14.8318731440614 -4.0151975123975 T:G G T 10 0.529709755145049 0.265660587057328 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 31944985 T/G 0 26 0 26 12.2275463662287 0 12.2275463662287 T T 10 0.529709755145049 6.98629355520537e-08 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32135186 T/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:T T A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32136251 G/A 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:G G A 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32137447 C/T 1 16 26 42 7.52464391767922 13.7724536337713 -6.24780971609206 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0631425160141748 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 23 15 38 10.8166756316639 7.94564632717574 2.87102930448814 C:G C G 10 0.529709755145049 0.417418246021853 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32137852 C/G 1 36 36 72 16.9304488147782 19.0695511852218 -2.13910237044353 C:G C G 10 0.529709755145049 0.638094191577077 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32897759 T/C 1 64 82 146 30.0985756707169 43.436199921894 -13.3376242511772 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0308356393232088 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000380998:exon_32897651_32898030:DNM1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 32900216 T/C 1 84 50 134 39.5043805678159 26.4854877572525 13.0188928105634 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0245375749874848 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32899479_32900297:YARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 38714937 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38713963_38723527:ALG10B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 T:C T C 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 A:G G A 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 11 16 27 5.17319269340446 8.47535608232078 -3.30216338891632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.248064772367367 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 54 47 101 25.3956732221674 24.8963584918173 0.499314730350047 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 50043687 A/G 1 26 12 38 12.2275463662287 6.35651706174059 5.87102930448814 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0726736561856985 ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50043474_50043708:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50043474_50043708:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50043474_50043708:FMNL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 153 158 311 71.9544074628075 83.6941413129178 -11.7397338501103 A:G G A 10 0.529709755145049 0.19146566475835 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 A:G G A 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 50848132 T/A 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 A:T T A 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000161813:ENST00000429001:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398464:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398473:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000293618:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000522085:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518444:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000441650:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518561:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000520064:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000347328:exon_50848097_50848200:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000521120:exon_50848097_50848745:LARP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 51189764 G/A 1 15 9 24 7.05435367282426 4.76738779630544 2.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.416155235770821 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51189692_51189792:ATF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 20 18 38 9.40580489709902 9.53477559261088 -0.128970695511864 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 46 28 74 21.6333512633277 14.8318731440614 6.80147811926637 T:C T C 10 0.529709755145049 0.129929724190342 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 11 18 29 5.17319269340446 9.53477559261088 -4.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.135786850560934 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 17 16 33 7.99493416253417 8.47535608232078 -0.480421919786618 A:G A G 10 0.529709755145049 0.863849861169677 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 54448106 A/G 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G A G 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000198353:ENST00000303406:exon_54447701_54448145:HOXC4;ENSG00000198353:ENST00000430889:exon_54447661_54448145:HOXC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 49 32 81 23.0442219978926 16.9507121646416 6.09350983325103 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.183193341662382 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 51 67 118 23.9848024876025 35.4905535947183 -11.5057511071158 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0420127908050034 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 54970454 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54970355_54970485:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54970355_54970485:PDE1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 55368291 C/T 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56295734 A/G 1 64 71 135 30.0985756707169 37.6093926152985 -7.51081694458162 A:G A G 10 0.529709755145049 0.197231384936904 ENSG00000170473:ENST00000408946:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000398213:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000302533:exon_56295198_56296139:WIBG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 30 22 52 14.1087073456485 11.6536146131911 2.45509273245745 A:G G A 10 0.529709755145049 0.57893238011456 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 33 35 68 15.5195780802134 18.5398414300767 -3.02026334986333 A:G G A 10 0.529709755145049 0.469027196452408 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56815717 T/C 1 24 13 37 11.2869658765188 6.88622681688564 4.40073905963319 T:C T C 10 0.529709755145049 0.187239652651067 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56815683_56815765:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815683_56815800:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815683_56815800:TIMELESS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56822690 C/T 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822667_56822884:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822667_56822884:TIMELESS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56992630 C/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 C:G C G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 56994539 C/T 1 14 18 32 6.58406342796931 9.53477559261088 -2.95071216464157 T:C C T 10 0.529709755145049 0.3762394145446 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56994465_56994616:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56994465_56994616:BAZ2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 4242 3760 8002 1994.9712186747 1991.70867934538 3.26253932931763 A:T:C:G A T 10 0.529709755145049 0.946430057026493 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:G G A 10 0.529709755145049 0.557679310444852 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2892 2756 5648 1360.07938812052 1459.88008517976 -99.8006970592369 A:T:C:G A G 10 0.529709755145049 0.00798281540890321 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 31 32 63 14.5789975905035 16.9507121646416 -2.37171457413809 T:G T G 10 0.529709755145049 0.614135151248096 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57627717 G/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 21 28 49 9.87609514195397 14.8318731440614 -4.9557780021074 A:G G A 10 0.529709755145049 0.197263930226233 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 48 53 101 22.5739317530376 28.0746170226876 -5.50068526964995 A:C A C 10 0.529709755145049 0.274990891928965 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 46 32 78 21.6333512633277 16.9507121646416 4.68263909868617 A:G G A 10 0.529709755145049 0.308711762235208 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 57994679 C/G 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 C:G C G 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57994594_57994861:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57994594_57994861:PIP4K2C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 58090051 T/C 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:C T C 10 0.529709755145049 0.817876940863517 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 58114063 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 58145156 C/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 62785663 T/C 1 39 33 72 18.3413195493431 17.4804219197866 0.860897629556469 T:C T C 10 0.529709755145049 0.906201326575647 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62785596_62785666:USP15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 64803798 A/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 19 14 33 8.93551465224407 7.41593657203069 1.51957808021338 A:T T A 10 0.529709755145049 0.727862479978695 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 18 39 57 8.46522440738912 20.6586804506569 -12.1934560432678 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.00131502831757597 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 158 179 337 74.3058586870822 94.8180461709638 -20.5121874838815 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0288998357269927 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 15 15 30 7.05435367282426 7.94564632717574 -0.891292654351471 T:G G T 10 0.529709755145049 0.855335073836957 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 68708761 C/T 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 69082805 G/A 1 20 13 33 9.40580489709902 6.88622681688564 2.51957808021338 A:G G A 10 0.529709755145049 0.486061760154252 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69082742_69082833:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69082742_69082833:NUP107 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 69115698 G/A 1 16 22 38 7.52464391767922 11.6536146131911 -4.12897069551186 A:G G A 10 0.529709755145049 0.195922017737178 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69115621_69115766:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69115621_69115766:NUP107 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 190 179 369 89.3551465224407 94.8180461709638 -5.46289964852311 A:G A G 10 0.529709755145049 0.602077082032481 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 18 10 28 8.46522440738912 5.29709755145049 3.16812685593863 A:C C A 10 0.529709755145049 0.259768489558292 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 72094627 C/G 1 15 19 34 7.05435367282426 10.0644853477559 -3.01013167493167 C:G C G 10 0.529709755145049 0.30883505629764 ENSG00000139291:ENST00000266673:exon_72094612_72097840:TMEM19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 88505633 A/G 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 A:G A G 10 0.529709755145049 0.200137897636222 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88505471_88505635:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88505471_88505635:CEP290 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 93205100 G/A 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93205055_93205210:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93205055_93205210:EEA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 93803838 G/A 1 177 171 348 83.2413733393263 90.5803681298034 -7.33899479047707 A:G G A 10 0.529709755145049 0.452261669444867 ENSG00000177889:ENST00000318066:exon_93802090_93803855:UBE2N;ENSG00000177889:ENST00000393133:exon_93802090_93803855:UBE2N HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 94673277 G/A 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94673248_94673425:PLXNC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 94761701 T/C 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94761570_94761719:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94761570_94761719:CCDC41 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 94772742 C/T 1 6 11 17 2.82174146912971 5.82680730659554 -3.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154003647189151 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94772567_94772818:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94772567_94772818:CCDC41 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G G A 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 95681554 C/T 1 22 35 57 10.3463853868089 18.5398414300767 -8.1934560432678 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0334784908193387 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 96416019 G/C 1 44 37 81 20.6927707736178 19.5992609403668 1.09350983325103 C:G G C 10 0.529709755145049 0.824811389092736 ENSG00000111144:ENST00000228740:exon_96415925_96416029:LTA4H;ENSG00000111144:ENST00000413268:exon_96415925_96416029:LTA4H;ENSG00000111144:ENST00000393070:exon_96415925_96416029:LTA4H HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 100452027 T/C 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 100550996 G/A 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000120853:ENST00000266746:exon_100550943_100551034:GOLGA2B;ENSG00000120853:ENST00000456437:exon_100550943_100551034:GOLGA2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 15 24 39 7.05435367282426 12.7130341234812 -5.65868045065691 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0780897809551959 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 30 31 61 14.1087073456485 16.4210024094965 -2.31229506384799 T:C C T 10 0.529709755145049 0.60857964574632 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 104341015 T/C 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.679225977809408 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 A:T T A 10 0.529709755145049 0.105144579901353 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 18 10 28 8.46522440738912 5.29709755145049 3.16812685593863 A:G A G 10 0.529709755145049 0.259768489558292 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 107 107 214 50.3210561994798 56.6789438005202 -6.35788760104049 A:T A T 10 0.529709755145049 0.411335822152333 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 T:G G T 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 111093020 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 112369505 G/T 1 17 17 34 7.99493416253417 9.00506583746583 -1.01013167493167 T:G G T 10 0.529709755145049 0.734879131905574 ENSG00000198270:ENST00000355445:exon_112369103_112369631:TMEM116;ENSG00000198270:ENST00000354825:exon_112369103_112369631:TMEM116;ENSG00000198270:ENST00000437003:exon_112369103_112369631:TMEM116 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113348849 C/T 1 5 15 20 2.35145122427475 7.94564632717574 -5.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0135106535895748 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113357209 G/A 1 183 200 383 86.063114808456 105.94195102901 -19.8788362205538 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.0457746931222719 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113357237 G/C 1 181 214 395 85.1225343187461 113.35788760104 -28.2353532822944 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00472179720756062 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113376320 C/T 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.130404884079537 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113376452 C/T 1 6 12 18 2.82174146912971 6.35651706174059 -3.53477559261088 T:C C T 10 0.529709755145049 0.103801735404631 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113376157_113376512:OAS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113386950 T/C 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C T C 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113425154 C/G 1 54 26 80 25.3956732221674 13.7724536337713 11.6232195883961 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.00976708470047426 ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113435450 A/T 1 29 16 45 13.6384171007936 8.47535608232078 5.16306101847279 A:T A T 10 0.529709755145049 0.13653333505866 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113435325_113435560:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113435325_113435560:OAS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 113448288 A/G 1 105 157 262 49.3804757097699 83.1644315577727 -33.7839558480028 A:T:G A G 10 0.529709755145049 3.1226063942057e-05 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113448179_113449528:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113446892_113448503:OAS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 C:G G C 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 120584910 C/T 1 18 14 32 8.46522440738912 7.41593657203069 1.04928783535843 T:C C T 10 0.529709755145049 0.727553030410456 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120584856_120585076:GCN1L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 9 15 24 4.23261220369456 7.94564632717574 -3.71303412348118 A:G A G 10 0.529709755145049 0.153480735060501 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 120907332 C/T 1 146 165 311 68.6623757488228 87.4021095989331 -18.7397338501103 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.0354909387626518 ENSG00000111786:ENST00000229390:exon_120907225_120907464:SRSF9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121018862 C/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 17 15 32 7.99493416253417 7.94564632717574 0.049287835358431 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 38 37 75 17.8710293044881 19.5992609403668 -1.72823163587868 A:G G A 10 0.529709755145049 0.729238035079637 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 38 29 67 17.8710293044881 15.3615828992064 2.50944640528171 T:C C T 10 0.529709755145049 0.624791682746408 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 35 32 67 16.4601585699233 16.9507121646416 -0.490553594718286 C:G G C 10 0.529709755145049 0.903371750816867 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121442241 C/T 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121454148 C/T 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121454133_121454300:C12orf43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 A:G G A 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 18 18 36 8.46522440738912 9.53477559261088 -1.06955118522177 A:G A G 10 0.529709755145049 0.741182689376126 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 122497001 T/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000110987:ENST00000261822:exon_122496998_122499950:BCL7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 122720310 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 123057792 A/G 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:G A G 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123057689_123057832:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123057689_123057832:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123057689_123057832:KNTC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 83 77 160 39.0340903229609 40.7876511461688 -1.75356082320785 T:C C T 10 0.529709755145049 0.812397207668255 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124097766 A/G 1 18 4 22 8.46522440738912 2.1188390205802 6.34638538680892 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0087878002799951 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124097717_124097799:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124097717_124097799:DDX55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124209332 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124209201_124209338:ATP6V0A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 T:C T C 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124241506 C/T 1 18 15 33 8.46522440738912 7.94564632717574 0.519578080213382 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124241362_124241533:ATP6V0A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124811982 G/A 1 35 28 63 16.4601585699233 14.8318731440614 1.62828542586191 A:G G A 10 0.529709755145049 0.706698616967917 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124811955_124812179:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124811955_124812179:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124811955_124812179:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124811955_124812179:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124811955_124812179:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000413172:exon_124811955_124812131:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000464377:exon_124811955_124812205:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124821666 G/A 1 21 18 39 9.87609514195397 9.53477559261088 0.341319549343087 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124829234 C/T 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 T:C C T 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124829255 A/G 1 7 14 21 3.29203171398466 7.41593657203069 -4.12390485804603 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0819766302290953 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 2 17 19 0.940580489709902 9.00506583746583 -8.06448534775593 A:T T A 10 0.529709755145049 0.000244601306732004 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124857033 C/T 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000448614:exon_124857006_124857156:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 124979789 T/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:G T G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124979693_124979798:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124979693_124979914:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000420698:exon_124979693_124979914:NCOR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 20 30 50 9.40580489709902 15.8912926543515 -6.48548775725245 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0880982352094725 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 T:C T C 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 24 6 30 11.2869658765188 3.17825853087029 8.10870734564853 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0029698695183864 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 21 3 24 9.87609514195397 1.58912926543515 8.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000673647997965203 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 30 58 88 14.1087073456485 30.7231657984128 -16.6144584527643 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000393074929206599 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132237848 T/C 1 15 23 38 7.05435367282426 12.1833243683361 -5.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.105371063170614 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132237668_132237908:SFSWAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 74 59 133 34.8014781192664 31.2528755535579 3.54860256570848 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.544692093008388 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132426432 C/T 1 74 52 126 34.8014781192664 27.5449072675425 7.25657085172382 T:C C T 10 0.529709755145049 0.211820255253393 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132425837_132426528:PUS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132522599 C/G 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 C:G C G 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132522498_132522641:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132522498_132522641:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132522498_132522641:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132522498_132522641:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132522498_132522641:EP400 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132549300 A/G 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 A:G A G 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132562126 G/A 1 29 36 65 13.6384171007936 19.0695511852218 -5.43113408442819 A:G G A 10 0.529709755145049 0.213756613643061 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132626097 C/G 1 25 18 43 11.7572561213738 9.53477559261088 2.22248052876289 C:G C G 10 0.529709755145049 0.543376988858855 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626043_132626151:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626043_132626151:DDX51 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132626427 C/T 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132633374 G/A 1 40 20 60 18.811609794198 10.594195102901 8.21741469129706 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.0380986838876644 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132633329_132633440:NOC4L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 132635989 A/G 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.352397947557492 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 22 24 46 10.3463853868089 12.7130341234812 -2.36664873667226 T:C T C 10 0.529709755145049 0.555319847357411 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 16 11 27 7.52464391767922 5.82680730659554 1.69783661108368 A:G G A 10 0.529709755145049 0.566932775224758 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 101 76 177 47.4993147303501 40.2579413910237 7.24137333932632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.292199752363599 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133331459 G/C 1 21 19 40 9.87609514195397 10.0644853477559 -0.188390205801962 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 A:G G A 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133393290 G/C 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 C:G G C 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133393291 A/G 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:G G A 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133438109 G/A 1 8 19 27 3.76232195883961 10.0644853477559 -6.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0194019843689358 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133438053_133438220:CHFR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 25 22 47 11.7572561213738 11.6536146131911 0.103641508182696 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133768086 A/G 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 A:G A G 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133768075_133768201:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133768075_133768201:ZNF268 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 12 133778798 G/C 1 27 21 48 12.6978366110837 11.123904858046 1.57393175303765 C:G G C 10 0.529709755145049 0.667572509427087 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 A A 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 20413088 A/C 1 5 15 20 2.35145122427475 7.94564632717574 -5.59419510290098 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0135106535895748 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 265 5 270 124.626914886562 2.64854877572525 121.978366110837 T:C:G T C 10 0.529709755145049 3.71916148128279e-65 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 244 198 442 114.750819744608 104.88253151872 9.86828822588834 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.36535292635622 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 21735998 T/C 1 12 5 17 5.64348293825941 2.64854877572525 2.99493416253417 T:C T C 10 0.529709755145049 0.223479807498147 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21735929_21736014:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21735929_21736014:SKA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 1 50 1 51 23.5145122427475 0.529709755145049 22.9848024876025 T:C C T 10 0.529709755145049 4.22960089402880e-13 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 24380114 T/C 1 19 7 26 8.93551465224407 3.70796828601534 5.22754636622872 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0485576299439573 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24380089_24380208:MIPEP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 25009288 C/T 1 52 23 75 24.4550927324575 12.1833243683361 12.2717683641213 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.0051862131398558 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 25027744 A/G 1 22 10 32 10.3463853868089 5.29709755145049 5.04928783535843 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0787056203172186 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25027725_25027792:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25027725_25027792:PARP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 25480616 T/A 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:T T A 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 25487001 G/C 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 C:G G C 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 214 274 488 100.64211239896 145.140472909743 -44.4983605107839 A:C:G G C 10 0.529709755145049 6.31642317269426e-05 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 28009851 G/A 1 147 121 268 69.1326659936778 64.0948803725509 5.03778562112686 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 0.541383609191692 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 31036642 C/G 1 20 9 29 9.40580489709902 4.76738779630544 4.63841710079358 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0954179214299481 ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 31725260 A/G 1 23 35 58 10.8166756316639 18.5398414300767 -7.72316579841285 A:G A G 10 0.529709755145049 0.048176011982289 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31725084_31725328:HSPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 31729729 A/G 1 16 17 33 7.52464391767922 9.00506583746583 -1.48042191978662 A:G A G 10 0.529709755145049 0.606794931813472 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 25 35 60 11.7572561213738 18.5398414300767 -6.78258530870294 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0923823523457976 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 35 44 79 16.4601585699233 23.3072292263822 -6.84707065645888 A:G A G 10 0.529709755145049 0.142588161058760 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 27 22 49 12.6978366110837 11.6536146131911 1.0442219978926 A:G A G 10 0.529709755145049 0.777129123416233 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 T:C T C 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 39622075 T/C 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 T:C T C 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000188811:ENST00000470258:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39621811_39624246:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39621811_39624246:NHLRC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 17 14 31 7.99493416253417 7.41593657203069 0.57899759050348 A:T T A 10 0.529709755145049 0.859395359335908 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 22 18 40 10.3463853868089 9.53477559261088 0.811609794198038 A:G A G 10 0.529709755145049 0.87469818476426 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 T:C T C 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 41835039 T/C 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 42032572 T/C 1 13 3 16 6.11377318311436 1.58912926543515 4.52464391767922 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0248398714532566 ENSG00000102760:ENST00000379359:exon_42032421_42032606:C13orf15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 42142416 G/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:G G T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000102763:ENST00000251030:exon_42140961_42142441:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000379310:exon_42140973_42142441:KIAA0564 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 42295687 A/G 1 4 13 17 1.8811609794198 6.88622681688564 -5.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0256462949018431 ENSG00000102763:ENST00000251030:exon_42295506_42295711:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000379310:exon_42295506_42295711:KIAA0564;ENSG00000102763:ENST00000281496:exon_42295506_42295711:KIAA0564 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 58 32 90 27.2768342015872 16.9507121646416 10.3261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0342074071196508 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 41 22 63 19.281900039053 11.6536146131911 7.62828542586191 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0585450608393608 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 43528125 T/C 1 34 32 66 15.9898683250683 16.9507121646416 -0.960843839573236 T:C T C 10 0.529709755145049 0.901984708091156 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43528084_43528157:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43528084_43528157:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43528084_43528157:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000476830:exon_43528084_43528157:EPSTI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 43544751 T/C 1 36 32 68 16.9304488147782 16.9507121646416 -0.0202633498633347 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43544748_43544806:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43544748_43544806:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43544748_43544806:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000476830:exon_43544748_43544806:EPSTI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 70 57 127 32.9203171398466 30.1934560432678 2.72686109657877 A:G A G 10 0.529709755145049 0.657333521398366 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 63 67 130 29.6282854258619 35.4905535947183 -5.86226816885637 A:C A C 10 0.529709755145049 0.333929043679396 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 1 42 1 43 19.7521902839079 0.529709755145049 19.2224805287629 A:G G A 10 0.529709755145049 6.30440825409018e-11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 46108854 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46108837_46110765:COG3;ENSG00000165837:ENST00000504261:exon_46108657_46109001:FAM194B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 46542156 C/T 1 57 43 100 26.8065439567322 22.7775194712371 4.0290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.42529220387846 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 46543342 T/C 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46542883_46544106:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46542883_46544106:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46542883_46544106:ZC3H13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 46727042 G/A 1 171 147 318 80.4196318701966 77.8673340063222 2.5522978638744 A:G G A 10 0.529709755145049 0.779160144198847 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46726915_46727080:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46726915_46727080:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000469227:exon_46726915_46727080:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000494531:exon_46726915_46727080:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000416500:exon_46726916_46727080:LCP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 9 21 30 4.23261220369456 11.123904858046 -6.89129265435147 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0160636292967540 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 47127813 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47127303_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47127305_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47127335_47127838:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47127395_47127838:LRCH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 49076915 G/A 1 6 12 18 2.82174146912971 6.35651706174059 -3.53477559261088 A:G G A 10 0.529709755145049 0.103801735404631 ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49076860_49077050:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49076860_49077022:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49076860_49077050:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49076860_49077050:RCBTB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50056903 A/T 1 15 22 37 7.05435367282426 11.6536146131911 -4.59926094036681 A:T A T 10 0.529709755145049 0.140528583823079 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 21 9 30 9.87609514195397 4.76738779630544 5.10870734564853 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0683914908092486 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50095127 A/G 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50095030_50095169:PHF11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 240 193 433 112.869658765188 102.233982742994 10.6356760221938 A:G G A 10 0.529709755145049 0.312352235111383 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C T C 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 50307126 T/C 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 T:C T C 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50307093_50307182:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50307093_50307182:KPNA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 51503663 A/G 1 14 9 23 6.58406342796931 4.76738779630544 1.81667563166387 A:G A G 10 0.529709755145049 0.533407999946811 ENSG00000136104:ENST00000336617:exon_51503611_51503718:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000422660:exon_51503611_51503718:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000459983:exon_51503611_51503718:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000495244:exon_51503611_51503718:RNASEH2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:G G T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 5 18 23 2.35145122427475 9.53477559261088 -7.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00293294074163999 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 60384954 T/C 1 16 17 33 7.52464391767922 9.00506583746583 -1.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.606794931813472 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267215:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000465066:exon_60384922_60385057:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267214:exon_60384922_60385057:DIAPH3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 73357700 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73357561_73357859:PIBF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 73539466 A/G 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 A:C:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73539412_73539542:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000326314:exon_73539412_73539542:PIBF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 1 3 9 12 1.41087073456485 4.76738779630544 -3.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0793760846826338 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 1 11 12 0.470290244854951 5.82680730659554 -5.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00218723564175865 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 95727780 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000467685:exon_95727686_95728273:ABCC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 5 15 20 2.35145122427475 7.94564632717574 -5.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0135106535895748 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 66 78 144 31.0391561604268 41.3173609013138 -10.2782047408871 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0948717483947417 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 81 110 191 38.093509833251 58.2680730659554 -20.1745632327044 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.00367818711834499 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 107 122 229 50.3210561994798 64.624590127696 -14.3035339282162 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0636572131317458 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 101020733 G/T 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:G G T 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000175198:ENST00000376285:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376286:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376279:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376277:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000424527:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376254:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000458283:exon_101020726_101020828:PCCA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 34 32 66 15.9898683250683 16.9507121646416 -0.960843839573236 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.901984708091156 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 35 54 89 16.4601585699233 28.6043267778326 -12.1441682079094 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0106797913806741 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 35 41 76 16.4601585699233 21.718099960947 -5.25794139102373 T:C T C 10 0.529709755145049 0.250977212546314 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 30 35 65 14.1087073456485 18.5398414300767 -4.43113408442819 A:G G A 10 0.529709755145049 0.32025112254985 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 14 3 17 6.58406342796931 1.58912926543515 4.99493416253417 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0153308858224054 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114542858 G/A 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.367831723277462 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 24 16 40 11.2869658765188 8.47535608232078 2.81160979419804 A:G G A 10 0.529709755145049 0.429791763866838 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 114782779 G/A 1 1 8 9 0.470290244854951 4.23767804116039 -3.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0158168681836475 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114782713_114782827:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114782713_114782827:RASA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 115064423 G/A 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000474056:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000493727:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115064315_115064475:UPF3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 115090193 G/A 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 A:G G A 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 13 115091399 T/C 1 38 46 84 17.8710293044881 24.3666487366723 -6.49561943218412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.157333409211144 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20779835 T/C 1 251 243 494 118.042851458593 128.719470500247 -10.6766190416542 T:C T C 10 0.529709755145049 0.344076699467881 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20779529_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20779571_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20779588_20779911:CCNB1IP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 51 53 104 23.9848024876025 28.0746170226876 -4.0898145350851 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.433414686363537 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 64 82 146 30.0985756707169 43.436199921894 -13.3376242511772 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0308356393232088 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 36 34 70 16.9304488147782 18.0101316749317 -1.07968286015343 C:G G C 10 0.529709755145049 0.811755583558065 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20847202 A/G 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20847140_20847264:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20847140_20847264:TEP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20850093 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 20916249 T/C 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.186626222993581 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 47 55 102 22.1036415081827 29.1340365329777 -7.030395024795 A:G G A 10 0.529709755145049 0.166363795923587 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 23020921 G/C 1 330 203 533 155.195780802134 107.531080294445 47.6647005076889 C:G G C 10 0.529709755145049 3.59540384993471e-05 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 136 133 269 63.9594733002733 70.4513974342915 -6.49192413401819 T:G G T 10 0.529709755145049 0.428039304248688 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 23375464 C/T 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 T:C C T 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23375404_23375577:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23375404_23375577:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23375404_23375577:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23375404_23375504:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23375404_23375577:RBM23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 23467664 G/A 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000100802:ENST00000299088:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000341470:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397382:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397380:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397379:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397377:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397376:exon_23467636_23467950:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000406429:exon_23467636_23468365:C14orf93 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 38 9 47 17.8710293044881 4.76738779630544 13.1036415081827 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000101125061575641 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 0 24 0 24 11.2869658765188 0 11.2869658765188 G G 10 0.529709755145049 2.51885276281317e-07 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24458119 G/A 0 11 0 11 5.17319269340446 0 5.17319269340446 G G 10 0.529709755145049 0.00117023568139201 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 0 20 0 20 9.40580489709902 0 9.40580489709902 G G 10 0.529709755145049 3.30534117574661e-06 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24458236 G/A 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 G G 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 97 84 181 45.6181537509302 44.4956194321841 1.12253431874613 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.881882592040053 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 36 30 66 16.9304488147782 15.8912926543515 1.03915616042676 A:G G A 10 0.529709755145049 0.80680597864153 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 1099 1084 2183 516.848979095591 574.205374577233 -57.356395481642 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0144991960878765 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 43 44 87 20.2224805287629 23.3072292263822 -3.08474869761927 T:C T C 10 0.529709755145049 0.520998297601779 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 92 114 206 43.2667025266555 60.3869120865356 -17.1202095598801 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0176082267852372 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 196 178 374 92.1768879915704 94.2883364158187 -2.11144842424834 T:C C T 10 0.529709755145049 0.835998681072245 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 31204838 A/G 1 147 155 302 69.1326659936778 82.1050120474826 -12.9723460538048 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.149424624499662 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31204792_31205017:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31204792_31205017:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31204792_31205018:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31204792_31205001:SCFD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 4 14 18 1.8811609794198 7.41593657203069 -5.53477559261088 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0156269541996837 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 T:C T C 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 31583512 C/T 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 T:C C T 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583492_31583546:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583492_31583546:HECTD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 31647448 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 34985658 C/T 1 30 22 52 14.1087073456485 11.6536146131911 2.45509273245745 T:C C T 10 0.529709755145049 0.57893238011456 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 34993982 G/C 1 26 18 44 12.2275463662287 9.53477559261088 2.69277077361784 C:G G C 10 0.529709755145049 0.452813649192105 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34993903_34994013:EAPP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35585868 C/G 1 45 21 66 21.1630610184728 11.123904858046 10.0391561604268 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0135736107897939 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35585816_35585943:PPP2R3C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 25 25 50 11.7572561213738 13.2427438786262 -1.48548775725245 T:C T C 10 0.529709755145049 0.674148150088013 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 C:G C G 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 42 27 69 19.7521902839079 14.3021633889163 5.45002689499162 A:G A G 10 0.529709755145049 0.227623011845026 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 187 128 315 87.9442757878758 67.8028486585663 20.1414271293095 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0239107801011605 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35782253 A/G 1 207 188 395 97.3500806849749 99.5854339672692 -2.23535328229437 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.840291116509098 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35782087_35782265:PSMA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 730 858 1588 343.311878744114 454.490969914452 -111.179091170338 A:T:G G A 10 0.529709755145049 2.63088767975364e-08 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 35872926 G/A 1 254 312 566 119.453722193158 165.269443605255 -45.8157214120978 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000123858040456945 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35872896_35873004:NFKBIA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 36789729 T/G 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 39517925 T/C 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C T C 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39517856_39517933:SEC23A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 50582566 G/A 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 A:G G A 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000358490:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582557_50582629:C14orf138 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 50583083 G/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:G G T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50583005_50583297:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50583005_50583318:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50583005_50583275:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582798_50583276:C14orf138 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 25 14 39 11.7572561213738 7.41593657203069 4.34131954934309 T:C C T 10 0.529709755145049 0.199463472816165 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 A:T T A 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 51225132 G/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:G G T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 A:G A G 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 51243721 C/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51243667_51243857:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51243667_51243857:NIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 65 81 146 30.5688659155718 42.906490166749 -12.3376242511772 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0463308132781753 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 55636259 G/A 1 31 34 65 14.5789975905035 18.0101316749317 -3.43113408442819 A:G G A 10 0.529709755145049 0.456241718926298 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55636117_55636277:DLGAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 55643857 T/G 1 33 32 65 15.5195780802134 16.9507121646416 -1.43113408442819 T:G T G 10 0.529709755145049 0.803983286139744 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 38 34 72 17.8710293044881 18.0101316749317 -0.139102370443531 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 27 32 59 12.6978366110837 16.9507121646416 -4.25287555355789 T:C C T 10 0.529709755145049 0.297577608346973 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 3 10 13 1.41087073456485 5.29709755145049 -3.88622681688564 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0479430770942021 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 57741550 A/G 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G A G 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 A:G A G 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 17 17 34 7.99493416253417 9.00506583746583 -1.01013167493167 T:C T C 10 0.529709755145049 0.734879131905574 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 61997226 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61997125_61997313:PRKCH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 62207557 C/T 1 46 36 82 21.6333512633277 19.0695511852218 2.56380007810598 T:C C T 10 0.529709755145049 0.582408883898875 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62207473_62207906:HIF1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 2 9 11 0.940580489709902 4.76738779630544 -3.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0306192095736915 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64494278 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64494202_64494511:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64494202_64494511:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64494202_64494511:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64496749 C/T 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64498037 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64519035 A/G 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64694235 C/T 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000140009:ENST00000353772:exon_64693753_64694332:ESR2;ENSG00000140009:ENST00000358599:exon_64693753_64694332:ESR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 56 39 95 26.3362537118773 20.6586804506569 5.67757326122034 A:G A G 10 0.529709755145049 0.259275513596969 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64935411 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000179841:ENST00000394718:exon_64934850_64935705:AKAP5;ENSG00000179841:ENST00000430028:exon_64934850_64941221:AKAP5;ENSG00000179841:ENST00000320636:exon_64934503_64936423:AKAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 A:G A G 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 34 17 51 15.9898683250683 9.00506583746583 6.9848024876025 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0671486219379052 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 65008251 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000126803:ENST00000394709:exon_65007563_65009955:HSPA2;ENSG00000126803:ENST00000247207:exon_65007460_65009950:HSPA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 68159269 C/T 1 32 42 74 15.0492878353584 22.2478097160921 -7.19852188073363 T:C C T 10 0.529709755145049 0.103209888657447 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68159155_68159310:RDH11;ENSG00000072042:ENST00000428130:exon_68159155_68159310:RDH11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 69259662 C/A 1 37 32 69 17.4007390596332 16.9507121646416 0.450026894991616 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 32 24 56 15.0492878353584 12.7130341234812 2.33625371187726 A:G G A 10 0.529709755145049 0.593203694548039 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 70839735 A/C 1 12 16 28 5.64348293825941 8.47535608232078 -2.83187314406137 A:C A C 10 0.529709755145049 0.344783466591536 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 73581011 A/G 1 127 103 230 59.7268610965788 54.56010477994 5.16675631663873 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.509462256640813 ENSG00000119707:ENST00000261973:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527432:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532683:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000528081:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532483:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527449:exon_73580994_73581041:RBM25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 24 17 41 11.2869658765188 9.00506583746583 2.28190003905299 T:C T C 10 0.529709755145049 0.533154532292635 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 76232470 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76232405_76232711:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76232405_76232711:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000418433:exon_76232405_76232711:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76232405_76232711:TTLL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 11 24 35 5.17319269340446 12.7130341234812 -7.53984143007672 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0111590059033031 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 103 139 242 48.43989522006 73.6296559651618 -25.1897607451019 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0012535977112046 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 140 122 262 65.8406342796931 64.624590127696 1.21604415199715 A:G A G 10 0.529709755145049 0.901594179889728 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 296 243 539 139.205912477065 128.719470500247 10.4864419768186 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.388165304941449 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 78140329 G/A 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 A:G G A 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 78140355 T/A 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 A:T T A 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 106 106 212 49.8507659546248 56.1492340453752 -6.29846809075039 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.409216455162881 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 78392115 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000063761:ENST00000341211:exon_78392107_78392304:ADCK1;ENSG00000063761:ENST00000238561:exon_78392107_78392304:ADCK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 83159092 C/A 0 133 0 133 62.5486025657085 0 62.5486025657085 C C 10 0.529709755145049 2.13038165168682e-37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 24 22 46 11.2869658765188 11.6536146131911 -0.366648736672255 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 89629053 G/A 1 36 35 71 16.9304488147782 18.5398414300767 -1.60939261529848 A:G G A 10 0.529709755145049 0.722596197527879 ENSG00000053254:ENST00000345097:exon_89622529_89629313:FOXN3;ENSG00000053254:ENST00000261302:exon_89622529_89629313:FOXN3;ENSG00000053254:ENST00000444927:exon_89627744_89629313:FOXN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 90420961 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90420930_90421033:C14orf143 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 23 20 43 10.8166756316639 10.594195102901 0.22248052876289 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 90429858 G/A 1 22 18 40 10.3463853868089 9.53477559261088 0.811609794198038 A:G G A 10 0.529709755145049 0.87469818476426 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 21 13 34 9.87609514195397 6.88622681688564 2.98986832506833 A:G G A 10 0.529709755145049 0.390699512482042 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 6 15 21 2.82174146912971 7.94564632717574 -5.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0287602099091276 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 91636395 C/T 1 9 15 24 4.23261220369456 7.94564632717574 -3.71303412348118 T:C C T 10 0.529709755145049 0.153480735060501 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518871:exon_91636347_91636416:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521064:exon_91636347_91636466:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 91636532 C/T 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 C C 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 91948043 T/C 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000100796:ENST00000337238:exon_91947920_91948537:SMEK1;ENSG00000100796:ENST00000417427:exon_91947920_91948537:SMEK1;ENSG00000100796:ENST00000417249:exon_91947920_91948537:SMEK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 92549586 G/A 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93170661 T/A 1 420 369 789 197.521902839079 195.462899648523 2.05900319055633 A:T:G T A 10 0.529709755145049 0.886636889820137 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170157_93170706:LGMN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 267 324 591 125.567495376272 171.625960666996 -46.058465290724 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000172084437945613 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93173010 C/T 1 15 3 18 7.05435367282426 1.58912926543515 5.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00938965043457943 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93178058 G/A 1 426 348 774 200.343644308209 184.338994790477 16.004649517732 A:G G A 10 0.529709755145049 0.264304330509232 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93178004_93178093:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93178004_93178093:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93178004_93178093:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93178004_93178093:LGMN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 23 22 45 10.8166756316639 11.6536146131911 -0.836938981527208 C:G C G 10 0.529709755145049 0.88159802129165 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 19 30 49 8.93551465224407 15.8912926543515 -6.9557780021074 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0617284894780159 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 93673655 G/A 1 8 14 22 3.76232195883961 7.41593657203069 -3.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.137191946239842 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93673401_93673786:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93673401_93673786:UBR7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 22 8 30 10.3463853868089 4.23767804116039 6.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0279523762532529 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 26 17 43 12.2275463662287 9.00506583746583 3.22248052876289 A:G G A 10 0.529709755145049 0.361505086251554 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 94582821 C/T 1 19 33 52 8.93551465224407 17.4804219197866 -8.54490726754255 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0183722585681658 ENSG00000165949:ENST00000448882:exon_94582779_94583033:IFI27;ENSG00000165949:ENST00000444961:exon_94582779_94583033:IFI27;ENSG00000165949:ENST00000298902:exon_94582779_94583033:IFI27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C T C 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 95918625 T/C 1 3 9 12 1.41087073456485 4.76738779630544 -3.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0793760846826338 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95918584_95918720:C14orf49 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 95921741 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95921714_95922061:C14orf49 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 95923670 A/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:C A C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95923514_95923675:C14orf49 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 100609972 G/A 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.701181858931601 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 203 155 358 95.4689197055551 82.1050120474826 13.3639076580724 A:G G A 10 0.529709755145049 0.1686049846771 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 102493761 A/G 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102493720_102493881:DYNC1H1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 11 20 31 5.17319269340446 10.594195102901 -5.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0703549698551275 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 102549839 A/G 1 3 11 14 1.41087073456485 5.82680730659554 -4.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0285508012529876 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 469 459 928 220.566124836972 243.136777611578 -22.5706527746055 A:G G A 10 0.529709755145049 0.139032223422080 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 134 105 239 63.0188928105634 55.6195242902301 7.39936852033328 T:C C T 10 0.529709755145049 0.364395615673555 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 77 86 163 36.2123488538312 45.5550389424742 -9.342690088643 T:C C T 10 0.529709755145049 0.157739158616927 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 103988180 G/T 1 19 16 35 8.93551465224407 8.47535608232078 0.460158569923284 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103988155_103988287:CKB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 50 39 89 23.5145122427475 20.6586804506569 2.85583179209064 A:G G A 10 0.529709755145049 0.595952249638834 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 104165753 G/A 1 11 22 33 5.17319269340446 11.6536146131911 -6.48042191978662 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0347531533720001 ENSG00000126215:ENST00000445556:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000352127:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000440302:exon_104165701_104165913:XRCC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 27 20 47 12.6978366110837 10.594195102901 2.1036415081827 T:C C T 10 0.529709755145049 0.562318941515894 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 236 196 432 110.988497785768 103.82311200843 7.16538577733883 T:C T C 10 0.529709755145049 0.500125148391468 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105179194 T/C 1 31 15 46 14.5789975905035 7.94564632717574 6.63335126332774 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0550248330828858 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105180565 T/C 1 26 21 47 12.2275463662287 11.123904858046 1.1036415081827 T:C T C 10 0.529709755145049 0.772162728348063 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/G 1 8 16 24 3.76232195883961 8.47535608232078 -4.71303412348118 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0653643193422349 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105180977 G/A 1 33 35 68 15.5195780802134 18.5398414300767 -3.02026334986333 A:G G A 10 0.529709755145049 0.469027196452408 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 111 93 204 52.2022171788996 49.2630072284896 2.93920995041 T:C C T 10 0.529709755145049 0.725935280328226 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 25 47 72 11.7572561213738 24.8963584918173 -13.1391023704435 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00203739201736376 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 33 54 87 15.5195780802134 28.6043267778326 -13.0847486976193 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00515747056787789 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 42 43 85 19.7521902839079 22.7775194712371 -3.02532918732917 T:C T C 10 0.529709755145049 0.51666239104086 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 58 72 130 27.2768342015872 38.1391023704435 -10.8622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0646902441769275 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 2959 1859 4818 1391.5888345258 984.730434814646 406.858399711154 T:C:G T C 10 0.529709755145049 3.68955949216281e-32 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106321913 G/A 1 3113 1741 4854 1464.01353223346 922.22468370753 541.788848525932 A:C:G G A 10 0.529709755145049 1.28606954365185e-55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106452766 T/A 0 0 10 10 0 5.29709755145049 -5.29709755145049 A T A 10 0.529709755145049 0.000529248582462547 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106452817 A/G 0 11 0 11 5.17319269340446 0 5.17319269340446 A A 10 0.529709755145049 0.00117023568139201 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106518848 T/C 1 20 32 52 9.40580489709902 16.9507121646416 -7.54490726754255 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0377676278386106 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 811 13 824 381.405388577365 6.88622681688564 374.51916176048 A:G A G 10 0.529709755145049 1.15487677379555e-200 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 106926388 T/C 1 3 48 51 1.41087073456485 25.4260682469624 -24.0151975123975 T:C T C 10 0.529709755145049 1.00407965751619e-12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 107034981 G/C 1 151 13 164 71.0138269730976 6.88622681688564 64.127600156212 T:C:G G C 10 0.529709755145049 1.35048602401834e-27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 107179063 T/C 0 9 0 9 4.23261220369456 0 4.23261220369456 T T 10 0.529709755145049 0.0044089015254185 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 107179218 G/A 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 G G 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 14 107179243 G/A 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 G G 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 22993121 C/T 1 19 12 31 8.93551465224407 6.35651706174059 2.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.374617294226683 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22993025_22993155:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22993025_22993155:CYFIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 25154490 A/G 0 196 0 196 92.1768879915704 0 92.1768879915704 A A 10 0.529709755145049 1.07374246993936e-54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 30337377 G/C 0 0 9 9 0 4.76738779630544 -4.76738779630544 C G C 10 0.529709755145049 0.00112536585279539 ENSG00000215315:ENST00000400005:exon_30336926_30337498:AC111152.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:C T C 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 31234064 C/T 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31233769_31235308:FAN1;ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31231144_31234275:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31231144_31234275:MTMR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 775 13 788 364.474939762587 6.88622681688564 357.588712945701 C:G C G 10 0.529709755145049 5.54371868551044e-191 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 848 72 920 398.806127636998 38.1391023704435 360.667025266555 A:C:G G A 10 0.529709755145049 7.63115053339447e-150 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 848 83 931 398.806127636998 43.9659096770391 354.840217959959 A:T:C T C 10 0.529709755145049 1.56397946673611e-141 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 35198879 G/A 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35198746_35198913:AQR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40259848 A/C 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 12 19 31 5.64348293825941 10.0644853477559 -4.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 0.148991251328343 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 866 723 1589 407.271352044388 382.98015296987 24.2911990745171 A:G G A 10 0.529709755145049 0.227728395045661 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 401 289 690 188.586388186835 153.086119236919 35.5002689499162 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.00676598207433615 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40675443 G/T 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 T:G G T 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40675493 C/T 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40683702 A/G 1 24 32 56 11.2869658765188 16.9507121646416 -5.66374628812274 A:G A G 10 0.529709755145049 0.141714121232101 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40683694_40683755:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40683694_40683755:C15orf23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 41046883 C/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:C C A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000137824:ENST00000260385:exon_41046795_41048049:FAM82A2;ENSG00000137824:ENST00000338376:exon_41046795_41046988:FAM82A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 41106428 C/T 1 29 29 58 13.6384171007936 15.3615828992064 -1.72316579841284 T:C C T 10 0.529709755145049 0.694097797673659 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41106346_41106767:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41106346_41106767:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41106346_41106767:ZFYVE19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 41679685 G/C 1 40 29 69 18.811609794198 15.3615828992064 3.45002689499162 C:G G C 10 0.529709755145049 0.469645878246962 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41679547_41679791:NDUFAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 42115747 G/C 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 C:G G C 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42115645_42116259:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42115645_42116259:MAPKBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 24 18 42 11.2869658765188 9.53477559261088 1.75219028390794 T:C C T 10 0.529709755145049 0.644560715625997 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 42740369 C/T 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 28 1 29 13.1681268559386 0.529709755145049 12.6384171007936 A:T A T 10 0.529709755145049 4.38663364824704e-07 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 63 72 135 29.6282854258619 38.1391023704435 -8.51081694458162 A:G A G 10 0.529709755145049 0.14381246051932 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 55 65 120 25.8659634670223 34.4311340844282 -8.56517061740588 A:T:C T A 10 0.529709755145049 0.120808540657494 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45695445 C/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 C:G C G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 52179886 T/C 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000138594:ENST00000308580:exon_52179786_52179908:TMOD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 104 134 238 48.9101854649149 70.9811071894366 -22.0709217245217 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00425236777287654 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 44 75 119 20.6927707736178 39.7282316358787 -19.0354608622608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000617649234364052 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 63 45 108 29.6282854258619 23.8369389815272 5.7913464443347 A:G G A 10 0.529709755145049 0.289400447490029 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 55632859 G/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:G G T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55632810_55633021:PIGB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 55647090 C/G 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 C:G C G 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55646996_55647176:PIGB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 19 20 39 8.93551465224407 10.594195102901 -1.65868045065691 A:G A G 10 0.529709755145049 0.632626535198063 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 56756420 C/T 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000138587:ENST00000260453:exon_56756224_56756445:MNS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 59175965 A/G 1 98 81 179 46.0884439957852 42.906490166749 3.18195382903622 A:G A G 10 0.529709755145049 0.653800098168219 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59175825_59175985:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59175825_59175985:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59175825_59175985:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000493062:exon_59175825_59175985:SLTM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 59179264 G/A 1 107 99 206 50.3210561994798 52.4412657593599 -2.1202095598801 A:G G A 10 0.529709755145049 0.780436809767978 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59179174_59179318:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59179174_59179318:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59179174_59179318:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000493062:exon_59179174_59179323:SLTM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 59408903 C/T 1 95 109 204 44.6775732612203 57.7383633108103 -13.06079004959 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0684822156939905 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 28 27 55 13.1681268559386 14.3021633889163 -1.1340365329777 A:G G A 10 0.529709755145049 0.788181991457276 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 60653190 A/G 1 8 26 34 3.76232195883961 13.7724536337713 -10.0101316749317 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000805296018119492 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60653140_60653253:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60653140_60653253:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60653140_60653253:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60653140_60653253:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000356292:exon_60653140_60653253:ANXA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 A:C A C 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 136 133 269 63.9594733002733 70.4513974342915 -6.49192413401819 A:G G A 10 0.529709755145049 0.428039304248688 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 63594660 G/T 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 T:G G T 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63594544_63594671:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63594544_63594671:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63594544_63594671:APH1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 63922752 T/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:T T A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 C:G G C 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 47 51 98 22.1036415081827 27.0151975123975 -4.91155600421481 A:G G A 10 0.529709755145049 0.362541391610339 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 27 10 37 12.6978366110837 5.29709755145049 7.40073905963319 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0198808829536829 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 64508763 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000169118:ENST00000303052:exon_64508761_64508912:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000447727:exon_64508761_64508912:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000303032:exon_64508761_64508912:CSNK1G1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 64710827 T/C 1 20 24 44 9.40580489709902 12.7130341234812 -3.30722922638216 T:C T C 10 0.529709755145049 0.365674360174437 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64710740_64710927:TRIP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 53 51 104 24.9253829773124 27.0151975123975 -2.0898145350851 A:T A T 10 0.529709755145049 0.69538081557435 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 65113493 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 65553246 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000138617:ENST00000261888:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000444347:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000432843:exon_65553223_65553364:PARP16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 65849087 A/G 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000074696:ENST00000261875:exon_65849077_65849241:PTPLAD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 66793677 G/C 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 C:G G C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 67457335 A/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000166949:ENST00000327367:exon_67457233_67457426:SMAD3;ENSG00000166949:ENST00000439724:exon_67457233_67457426:SMAD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 69238445 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000137808:ENST00000310673:exon_69237938_69239150:SPESP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 22 16 38 10.3463853868089 8.47535608232078 1.87102930448814 A:G A G 10 0.529709755145049 0.626922730070605 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 20 18 38 9.40580489709902 9.53477559261088 -0.128970695511864 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 69747673 T/C 1 16 10 26 7.52464391767922 5.29709755145049 2.22754636622872 T:C T C 10 0.529709755145049 0.435653149735385 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 25 24 49 11.7572561213738 12.7130341234812 -0.955778002107401 T:C C T 10 0.529709755145049 0.886395384409412 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 72640434 C/A 1 30 37 67 14.1087073456485 19.5992609403668 -5.49055359471829 A:C C A 10 0.529709755145049 0.181002406264086 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72640389_72640475:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72640389_72640475:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72640389_72640475:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72640389_72640475:HEXA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 63 34 97 29.6282854258619 18.0101316749317 11.6181537509302 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0191625643993403 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 T:C C T 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 817 818 1635 384.227130046495 433.30257970865 -49.0754496621552 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0151856151127520 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 78882726 C/T 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78882147_78882978:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78882147_78882978:CHRNA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 79277391 T/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:G T G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000058335:ENST00000419573:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394741:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000261752:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394745:exon_79277349_79277546:RASGRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 79277511 A/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000058335:ENST00000419573:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394741:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000261752:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394745:exon_79277349_79277546:RASGRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 20 8 28 9.40580489709902 4.23767804116039 5.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0583086814385549 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 323 379 702 151.903749088149 200.759997199974 -48.8562481118244 A:C:G A C 10 0.529709755145049 0.000240341632777329 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 81592746 T/A 1 104 91 195 48.9101854649149 48.2035877181995 0.706597746715438 A:T:G T A 10 0.529709755145049 0.9428954216676 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 117 125 242 55.0239586480293 66.2137193931311 -11.1897607451019 A:G A G 10 0.529709755145049 0.156729945968831 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 38 30 68 17.8710293044881 15.8912926543515 1.97973665013667 A:G G A 10 0.529709755145049 0.715834498630197 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 19 28 47 8.93551465224407 14.8318731440614 -5.8963584918173 A:G A G 10 0.529709755145049 0.107122688857526 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 83495214 T/A 1 18 11 29 8.46522440738912 5.82680730659554 2.63841710079358 A:T T A 10 0.529709755145049 0.357377168018118 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83495162_83495248:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83495162_83495248:WHAMM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 9 22 31 4.23261220369456 11.6536146131911 -7.42100240949652 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0105950949085367 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 83735926 C/G 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 C:G C G 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83735503_83736106:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83735503_83736106:BTBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 85188775 G/A 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 85327460 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85325885_85328126:ZNF592 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 85669452 C/T 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000073417:ENST00000310298:exon_85669438_85669605:PDE8A;ENSG00000073417:ENST00000394553:exon_85669438_85669605:PDE8A;ENSG00000073417:ENST00000339708:exon_85669438_85669605:PDE8A;ENSG00000073417:ENST00000478717:exon_85669438_85669605:PDE8A;ENSG00000073417:ENST00000485596:exon_85669438_85669605:PDE8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 86273702 T/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C T C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 86273831 C/G 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86273744_86273938:AKAP13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 86278309 G/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 89422286 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000140511:ENST00000359595:exon_89422198_89422500:HAPLN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 89442606 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000140545:ENST00000268150:exon_89441914_89442763:MFGE8;ENSG00000140545:ENST00000268151:exon_89441916_89442763:MFGE8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 89837139 G/T 1 21 15 36 9.87609514195397 7.94564632717574 1.93044881477823 T:G G T 10 0.529709755145049 0.617267640480481 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89837064_89837228:FANCI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 121 112 233 56.9051196274491 59.3274925762455 -2.42237294879642 T:C T C 10 0.529709755145049 0.792997204556007 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:C A C 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:C C T 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 40 37 77 18.811609794198 19.5992609403668 -0.787651146168777 A:C C A 10 0.529709755145049 0.909284037995788 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 39 37 76 18.3413195493431 19.5992609403668 -1.25794139102373 T:C C T 10 0.529709755145049 0.818627747639723 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 31 19 50 14.5789975905035 10.0644853477559 4.51451224274755 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206341462306186 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 21 19 40 9.87609514195397 10.0644853477559 -0.188390205801962 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 19 26 45 8.93551465224407 13.7724536337713 -4.83693898152721 T:C C T 10 0.529709755145049 0.178735515578988 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 20 19 39 9.40580489709902 10.0644853477559 -0.658680450656913 A:C A C 10 0.529709755145049 0.873443340813217 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 13 6 19 6.11377318311436 3.17825853087029 2.93551465224407 T:C T C 10 0.529709755145049 0.250274317508915 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 100269613 C/T 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 C:G G C 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 100269737 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 C:G C G 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 16 20 36 7.52464391767922 10.594195102901 -3.06955118522177 A:G G A 10 0.529709755145049 0.320976259820328 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 15 102264476 C/A 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:C C A 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 105808 G/A 1 118 106 224 55.4942488928842 56.1492340453752 -0.65498515249098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.94670144425946 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_105777_105882:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_105777_105882:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_105777_105882:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000417493:exon_105794_105882:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000493672:exon_105794_105871:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_105777_105882:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_105777_106613:SNRNP25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 138 190 328 64.9000537899832 100.644853477559 -35.7447996875761 C:G C G 10 0.529709755145049 8.20222210882163e-05 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 89 79 168 41.8558317920906 41.8470706564589 0.00876113563175807 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 348042 C/A 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000481769:exon_347844_348251:AXIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 419086 G/C 1 261 120 381 122.745753907142 63.5651706174059 59.1805832897363 C:G G C 10 0.529709755145049 7.73067261278454e-10 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 255 116 371 119.924012438012 61.4463315968257 58.4776808411868 A:G A G 10 0.529709755145049 8.50068180376762e-10 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 424288 G/A 1 39 26 65 18.3413195493431 13.7724536337713 4.56886591557181 A:G G A 10 0.529709755145049 0.266252134340771 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 426184 G/A 1 15 17 32 7.05435367282426 9.00506583746583 -1.95071216464157 A:G G A 10 0.529709755145049 0.595961045634878 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 20 14 34 9.40580489709902 7.41593657203069 1.98986832506833 T:C T C 10 0.529709755145049 0.606972054310593 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 449345 G/C 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 C:G G C 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 148 172 320 69.6029562385327 91.1100778849484 -21.5071216464157 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0185311278699022 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 450165 T/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_450109_450190:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 532705 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000413925:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000452814:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000483002:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000449879:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_532525_532736:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000412256:exon_532657_532736:RAB11FIP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 570557 T/C 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 A:C C A 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 602595 G/C 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 C:G G C 10 0.529709755145049 0.467272608400718 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 18 23 41 8.46522440738912 12.1833243683361 -3.71809996094701 A:G A G 10 0.529709755145049 0.274894962106190 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 705360 T/C 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_705307_705468:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000429287:exon_705307_705468:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_705307_705468:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000389495:exon_705307_705468:WDR90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 705844 T/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_705773_705889:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000429287:exon_705773_706050:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000420061:exon_705773_705889:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000389495:exon_705773_705888:WDR90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 711905 A/G 1 4 12 16 1.8811609794198 6.35651706174059 -4.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0416130324707808 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711891_712059:WDR90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:G G A 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 716273 T/C 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 T:C T C 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 716632 G/A 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 35 31 66 16.4601585699233 16.4210024094965 0.0391561604267636 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 720683 C/T 1 28 26 54 13.1681268559386 13.7724536337713 -0.604326777832647 T:C C T 10 0.529709755145049 0.892258271203089 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720675_720773:RHOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 721186 G/A 1 43 40 83 20.2224805287629 21.188390205802 -0.965909677039072 A:G G A 10 0.529709755145049 0.91252905290831 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_721083_721203:RHOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 32 39 71 15.0492878353584 20.6586804506569 -5.60939261529848 A:G A G 10 0.529709755145049 0.192368005176816 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 722688 C/T 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.129246611858996 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 722997 G/A 1 38 45 83 17.8710293044881 23.8369389815272 -5.96590967703907 A:G G A 10 0.529709755145049 0.226239436734604 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722928_723130:RHOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 58 59 117 27.2768342015872 31.2528755535579 -3.97604135197074 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.460805043310128 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 20 12 32 9.40580489709902 6.35651706174059 3.04928783535843 T:C T C 10 0.529709755145049 0.294479310623092 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 736078 G/T 1 6 13 19 2.82174146912971 6.88622681688564 -4.06448534775593 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0687326222682032 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_736068_736186:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_736068_736186:WDR24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 739248 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_739160_740400:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000456065:exon_739160_740400:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_739142_739642:WDR24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 772141 G/C 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 C:G G C 10 0.529709755145049 0.819181859619382 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G A G 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 25 32 57 11.7572561213738 16.9507121646416 -5.19345604326779 T:C T C 10 0.529709755145049 0.185396895953556 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 779103 T/C 1 12 26 38 5.64348293825941 13.7724536337713 -8.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00903375596040769 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 34 27 61 15.9898683250683 14.3021633889163 1.68770493615201 A:G A G 10 0.529709755145049 0.701804025445881 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 789693 C/T 1 5 18 23 2.35145122427475 9.53477559261088 -7.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00293294074163999 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_789643_789738:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_789643_789738:NARFL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 839269 G/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_839210_839362:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_839214_839360:CHTF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 840378 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840331_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000484349:exon_840347_840399:CHTF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 840599 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840531_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840525_840805:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840525_840666:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840525_840671:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840525_840666:CHTF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 841175 C/T 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_841161_841370:CHTF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 848013 G/A 1 80 84 164 37.6232195883961 44.4956194321841 -6.87239984378805 A:G G A 10 0.529709755145049 0.309246963589138 ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 920870 C/T 1 2 11 13 0.940580489709902 5.82680730659554 -4.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00955089478143411 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_920729_920882:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_920729_920882:LMF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 314 268 582 147.671136884455 141.962214378873 5.70892250558146 A:G A G 10 0.529709755145049 0.647986662696322 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 15 6 21 7.05435367282426 3.17825853087029 3.87609514195397 C:G G C 10 0.529709755145049 0.124563644273288 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 15 6 21 7.05435367282426 3.17825853087029 3.87609514195397 A:G A G 10 0.529709755145049 0.124563644273288 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1547477 T/C 1 11 15 26 5.17319269340446 7.94564632717574 -2.77245363377128 T:C T C 10 0.529709755145049 0.327633282444792 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 26 27 53 12.2275463662287 14.3021633889163 -2.0746170226876 A:G A G 10 0.529709755145049 0.584694781999119 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 46 34 80 21.6333512633277 18.0101316749317 3.62321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.435061347227106 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1560954 G/A 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1560428_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1560431_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1560431_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1560431_1561151:IFT140 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 21 12 33 9.87609514195397 6.35651706174059 3.51957808021338 C:G G C 10 0.529709755145049 0.228543602655958 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 145 147 292 68.1920855039679 77.8673340063222 -9.67524850235432 A:T T A 10 0.529709755145049 0.265615106108814 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 43 50 93 20.2224805287629 26.4854877572525 -6.26300722848956 A:C C A 10 0.529709755145049 0.212823217887905 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1838050 A/G 1 62 56 118 29.157995181007 29.6637462881227 -0.505751107115785 A:G A G 10 0.529709755145049 0.92684086760254 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 1838703 G/A 1 62 76 138 29.157995181007 40.2579413910237 -11.0999462100168 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0608651138043825 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2014424 C/G 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 93 100 193 43.7369927715104 52.9709755145049 -9.23398274299446 A:C A C 10 0.529709755145049 0.194462787142523 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 145 129 274 68.1920855039679 68.3325584137113 -0.140472909743437 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 25 27 52 11.7572561213738 14.3021633889163 -2.54490726754255 C:G C G 10 0.529709755145049 0.49074383009985 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2049003 A/T 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 A:T A T 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048966_2049122:ZNF598 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2114407 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2114273_2114428:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000490108:exon_2114273_2114428:TSC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2133727 G/A 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2133696_2133817:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2133696_2133817:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2133696_2133817:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2133696_2133817:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2133696_2133817:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2133696_2133817:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2133696_2133817:TSC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2147357 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000487932:exon_2147320_2147504:PKD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2203106 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2256461 C/G 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 C:G C G 10 0.529709755145049 0.030153697845537 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 35 68 103 16.4601585699233 36.0202633498633 -19.5601047799401 A:C:G C G 10 0.529709755145049 0.000149095735949375 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2499415 C/T 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2499283_2499463:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2499283_2499463:CCNF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 12 18 30 5.64348293825941 9.53477559261088 -3.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.199932672074604 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2808442 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 39 55 94 18.3413195493431 29.1340365329777 -10.7927169836346 A:C:G C A 10 0.529709755145049 0.0296498746983589 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2871555 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2871367_2871720:PRSS21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 17 42 59 7.99493416253417 22.2478097160921 -14.2528755535579 T:G G T 10 0.529709755145049 0.000212291729303468 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 2987315 G/A 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.130404884079537 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000344592:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000445831:exon_2986530_2987385:FLYWCH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 65 80 145 30.5688659155718 42.3767804116039 -11.8079144960321 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0554486563177862 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 3106994 A/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:T A T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 3109032 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000008516:ENST00000336577:exon_3108828_3110727:MMP25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 13 5 18 6.11377318311436 2.64854877572525 3.46522440738912 C:G G C 10 0.529709755145049 0.154758627526364 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 15 14 29 7.05435367282426 7.41593657203069 -0.361582899206422 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 3452193 T/G 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 22 22 44 10.3463853868089 11.6536146131911 -1.30722922638216 T:C T C 10 0.529709755145049 0.7632983770013 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 23 30 53 10.8166756316639 15.8912926543515 -5.0746170226876 A:T:C T A 10 0.529709755145049 0.170981235984758 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4519439 G/A 1 68 73 141 31.9797366501367 38.6688121255886 -6.68907547545192 A:G G A 10 0.529709755145049 0.273282700753295 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4519228_4519466:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4519228_4519466:NMRAL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4849705 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000067836:ENST00000322048:exon_4849687_4849782:ROGDI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 48 78 126 22.5739317530376 41.3173609013138 -18.7434291482762 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000905736891709278 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4920335 A/G 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4920213_4920342:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4920213_4920342:UBN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 10574796 C/T 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 10574813 G/A 1 11 3 14 5.17319269340446 1.58912926543515 3.58406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0634340540694462 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 11035888 C/A 1 2 13 15 0.940580489709902 6.88622681688564 -5.94564632717574 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00287834448456043 ENSG00000182108:ENST00000331808:exon_11035426_11036317:DEXI;ENSG00000182108:ENST00000469379:exon_11035426_11035988:DEXI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 11114006 G/A 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 21 14 35 9.87609514195397 7.41593657203069 2.46015856992328 A:C A C 10 0.529709755145049 0.498888420364794 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 82 94 176 38.563800078106 49.7927169836346 -11.2289169055286 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0966574526043745 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 11873158 T/C 1 17 10 27 7.99493416253417 5.29709755145049 2.69783661108368 T:C T C 10 0.529709755145049 0.33894228949908 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11873022_11873219:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11873022_11873219:ZC3H7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 11876203 T/C 1 17 8 25 7.99493416253417 4.23767804116039 3.75725612137377 T:C T C 10 0.529709755145049 0.161612507118830 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11876143_11876244:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11876143_11876408:ZC3H7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 18 3 21 8.46522440738912 1.58912926543515 6.87609514195397 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0033458997526964 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 14 5 19 6.58406342796931 2.64854877572525 3.93551465224407 C:G C G 10 0.529709755145049 0.105365114705801 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 17 13 30 7.99493416253417 6.88622681688564 1.10870734564853 T:G G T 10 0.529709755145049 0.718335261369696 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 29 28 57 13.6384171007936 14.8318731440614 -1.19345604326779 A:G A G 10 0.529709755145049 0.791547052727124 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 139 116 255 65.3703440348382 61.4463315968257 3.9240124380125 A:G A G 10 0.529709755145049 0.660675190565121 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 118 97 215 55.4942488928842 51.3818462490698 4.11240264381446 T:G G T 10 0.529709755145049 0.585381335159274 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 35 48 83 16.4601585699233 25.4260682469624 -8.96590967703907 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0609305625801689 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 T:C C T 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 12 20 32 5.64348293825941 10.594195102901 -4.95071216464157 T:C T C 10 0.529709755145049 0.109571966654361 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 20855309 A/G 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G A G 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 22262514 C/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000103319:ENST00000263026:exon_22262472_22262643:EEF2K HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 27 34 61 12.6978366110837 18.0101316749317 -5.31229506384799 C:G C G 10 0.529709755145049 0.199669984487342 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 A:C A C 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 20 12 32 9.40580489709902 6.35651706174059 3.04928783535843 T:C T C 10 0.529709755145049 0.294479310623092 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 104 108 212 48.9101854649149 57.2086535556653 -8.29846809075039 C:G G C 10 0.529709755145049 0.271081867257669 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23641340 G/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23640961_23641790:PALB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 21 26 47 9.87609514195397 13.7724536337713 -3.8963584918173 A:G A G 10 0.529709755145049 0.306487384795049 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 20 16 36 9.40580489709902 8.47535608232078 0.930448814778234 T:C T C 10 0.529709755145049 0.867774579333193 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24231248 C/T 1 90 94 184 42.3261220369456 49.7927169836346 -7.46659494668903 T:C C T 10 0.529709755145049 0.301157121335079 ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24834233 C/T 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834195_24834334:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834195_24834334:TNRC6A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24942328 C/T 1 112 75 187 52.6725074237545 39.7282316358787 12.9442757878758 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0667563977232633 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24942472 C/T 1 99 58 157 46.5587342406401 30.7231657984128 15.8355684422273 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0129633732449690 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24946807 C/T 1 67 66 133 31.5094464052817 34.9608438395732 -3.45139743429152 T:C C T 10 0.529709755145049 0.602403935698436 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24946791_24946960:ARHGAP17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 24980078 C/T 1 46 28 74 21.6333512633277 14.8318731440614 6.80147811926637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.129929724190342 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24980024_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24979982_24980093:ARHGAP17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 82 96 178 38.563800078106 50.8521364939247 -12.2883364158187 T:C C T 10 0.529709755145049 0.071381017700004 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 103 105 208 48.43989522006 55.6195242902301 -7.17962907017019 T:C T C 10 0.529709755145049 0.331257777340963 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 27475941 G/C 1 43 26 69 20.2224805287629 13.7724536337713 6.45002689499162 C:G G C 10 0.529709755145049 0.147344148119012 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27475716_27476157:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27475641_27476157:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27475641_27476157:GTF3C1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 36 25 61 16.9304488147782 13.2427438786262 3.68770493615201 A:G G A 10 0.529709755145049 0.371150110228715 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 28497769 C/A 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 A:C C A 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28497668_28497811:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28497668_28497811:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28497668_28497811:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28497668_28497811:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28497668_28497811:CLN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 28506428 C/T 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 T:C C T 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 13 20 33 6.11377318311436 10.594195102901 -4.48042191978662 A:G A G 10 0.529709755145049 0.161986586127638 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 28603012 A/G 1 38 32 70 17.8710293044881 16.9507121646416 0.920317139846567 A:G A G 10 0.529709755145049 0.904837811005335 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 65 60 125 30.5688659155718 31.7825853087029 -1.21371939313113 T:C C T 10 0.529709755145049 0.85801756038535 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 29755576 A/G 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000185905:ENST00000329410:exon_29753784_29756272:C16orf54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 9 13 22 4.23261220369456 6.88622681688564 -2.65361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.290050920028368 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 29999225 G/A 1 11 13 24 5.17319269340446 6.88622681688564 -1.71303412348118 A:G G A 10 0.529709755145049 0.542758508102984 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 18 31 49 8.46522440738912 16.4210024094965 -7.9557780021074 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0307741565468579 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 42 35 77 19.7521902839079 18.5398414300767 1.21234885383122 A:G G A 10 0.529709755145049 0.820036993597847 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30364805 C/T 1 92 69 161 43.2667025266555 36.5499731050084 6.7167294216471 T:C C T 10 0.529709755145049 0.305259389856347 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30364689_30365121:CD2BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 19 16 35 8.93551465224407 8.47535608232078 0.460158569923284 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30408765 C/T 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30409699 C/T 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 23 31 54 10.8166756316639 16.4210024094965 -5.60432677783265 C:G C G 10 0.529709755145049 0.135156601415527 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 30748624 C/A 1 19 24 43 8.93551465224407 12.7130341234812 -3.77751947123711 A:C C A 10 0.529709755145049 0.285705319295368 ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30748370_30751450:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30748370_30751449:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30748370_30751449:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30748370_30752028:SRCAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 31072909 G/A 1 14 14 28 6.58406342796931 7.41593657203069 -0.831873144061372 A:G G A 10 0.529709755145049 0.850483860830919 ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 31091209 T/C 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 31092011 T/G 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 31095171 C/T 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000151006:ENST00000486499:exon_31094758_31096581:PRSS53 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 31475823 G/A 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 46723598 T/C 1 5 12 17 2.35145122427475 6.35651706174059 -4.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0859527586065674 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46723558_46723682:ORC6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 47271876 T/C 1 18 14 32 8.46522440738912 7.41593657203069 1.04928783535843 T:C T C 10 0.529709755145049 0.727553030410456 ENSG00000129636:ENST00000320640:exon_47271876_47271919:ITFG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 47697618 A/G 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000102893:ENST00000455779:exon_47697588_47697645:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000299167:exon_47697588_47697645:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000323584:exon_47697588_47697645:PHKB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 50707782 C/T 1 18 20 38 8.46522440738912 10.594195102901 -2.12897069551186 T:C C T 10 0.529709755145049 0.518822860282873 ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 27 15 42 12.6978366110837 7.94564632717574 4.75219028390794 A:G G A 10 0.529709755145049 0.164738448020719 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 50828137 G/A 1 106 92 198 49.8507659546248 48.7332974733445 1.11746848128029 A:G G A 10 0.529709755145049 0.887014369796028 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50828123_50828339:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50828123_50828339:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50828123_50828339:CYLD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 53503934 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 53528079 T/C 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53528050_53528157:AKTIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 56508765 G/A 1 30 28 58 14.1087073456485 14.8318731440614 -0.723165798412843 A:G G A 10 0.529709755145049 0.895714163859897 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56508740_56508862:OGFOD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 24 7 31 11.2869658765188 3.70796828601534 7.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0064941377726499 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 56875731 G/A 1 141 142 283 66.3109245245481 75.218785230597 -8.90786070604888 A:G G A 10 0.529709755145049 0.311391257357335 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56875617_56875745:NUP93 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 56974078 G/A 1 227 180 407 106.755885582074 95.3477559261088 11.408129655965 A:G G A 10 0.529709755145049 0.274652408894298 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56973807_56974157:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56973807_56974157:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56973807_56974157:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000417714:exon_56973807_56974157:HERPUD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 57059427 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 57067595 A/T 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:T A T 10 0.529709755145049 0.206333354194794 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 57552088 T/C 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C T C 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 0 0 10 10 0 5.29709755145049 -5.29709755145049 T C T 10 0.529709755145049 0.000529248582462547 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 58201631 G/A 1 23 28 51 10.8166756316639 14.8318731440614 -4.0151975123975 A:G G A 10 0.529709755145049 0.265660587057328 ENSG00000070770:ENST00000262506:exon_58201589_58201699:CSNK2A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 58589187 G/A 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58589155_58589441:CNOT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 60 54 114 28.2174146912971 28.6043267778326 -0.386912086535588 A:C:G A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 52 51 103 24.4550927324575 27.0151975123975 -2.56010477994005 A:G G A 10 0.529709755145049 0.622993985165426 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 35 15 50 16.4601585699233 7.94564632717574 8.51451224274755 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0160540695729690 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 36 14 50 16.9304488147782 7.41593657203069 9.51451224274755 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00694949818762055 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74335510 T/C 1 122 143 265 57.375409872304 75.748494985742 -18.373085113438 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0265702756437903 ENSG00000103035:ENST00000219313:exon_74335453_74335550:PSMD7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 15 34 49 7.05435367282426 18.0101316749317 -10.9557780021074 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00230401722313161 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 5 23 28 2.35145122427475 12.1833243683361 -9.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000194052419806774 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:T A T 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 A:T:G G T 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74908146 G/A 1 35 34 69 16.4601585699233 18.0101316749317 -1.54997310500838 A:G G A 10 0.529709755145049 0.719169754282428 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74907474_74908342:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74907474_74908342:WDR59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74922106 A/G 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 A:G A G 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74922067_74922217:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74922067_74922217:WDR59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74942832 C/T 1 7 16 23 3.29203171398466 8.47535608232078 -5.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0361856200107406 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74942806_74942875:WDR59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 74949890 G/C 1 17 26 43 7.99493416253417 13.7724536337713 -5.77751947123711 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0924448598358786 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74949768_74949892:WDR59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 75018874 G/A 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 A:G G A 10 0.529709755145049 0.371396387099242 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_75018862_75019017:WDR59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 23 17 40 10.8166756316639 9.00506583746583 1.81160979419804 A:G G A 10 0.529709755145049 0.636001814544782 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 169 153 322 79.4790513804867 81.0455925371925 -1.5665411567058 A:G A G 10 0.529709755145049 0.867159354528473 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 75646685 G/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 81077429 A/G 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 81078158 C/A 1 47 36 83 22.1036415081827 19.0695511852218 3.03409032296093 A:C C A 10 0.529709755145049 0.512107714525190 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 81902879 C/G 1 34 26 60 15.9898683250683 13.7724536337713 2.21741469129706 C:G C G 10 0.529709755145049 0.606457964898076 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81902819_81902903:PLCG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 81942175 A/G 1 76 76 152 35.7420586089763 40.2579413910237 -4.51588278204746 A:G A G 10 0.529709755145049 0.465956211581793 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81942021_81942196:PLCG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 135 109 244 63.4891830554184 57.7383633108103 5.75081974460804 T:C T C 10 0.529709755145049 0.480875118780497 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 0 22 0 22 10.3463853868089 0 10.3463853868089 T T 10 0.529709755145049 9.10810048753098e-07 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 17 0 17 7.99493416253417 0 7.99493416253417 G G 10 0.529709755145049 2.30467080594205e-05 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 26 38 64 12.2275463662287 20.1289706955119 -7.90142432928314 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0595653634308256 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 8 11 19 3.76232195883961 5.82680730659554 -2.06448534775593 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.366887546614125 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84115483 G/A 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84212710 C/T 1 54 46 100 25.3956732221674 24.3666487366723 1.0290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.920269422322436 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84212853 G/C 1 44 45 89 20.6927707736178 23.8369389815272 -3.14416820790937 C:G G C 10 0.529709755145049 0.525287190933906 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 18 21 39 8.46522440738912 11.123904858046 -2.65868045065691 A:T A T 10 0.529709755145049 0.425273721287587 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84213684 C/T 1 10 18 28 4.70290244854951 9.53477559261088 -4.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0872157428627902 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84213552_84213689:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84213552_84213686:TAF1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84215390 T/C 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 T:C T C 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 84691433 C/T 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 T:C C T 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 85948098 G/A 1 79 70 149 37.1529293435411 37.0796828601534 0.0732464833876918 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85948079_85948126:IRF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 86565882 G/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 C:G G C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 8 22 30 3.76232195883961 11.6536146131911 -7.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00521751636128783 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 88052161 C/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:C C A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 88105725 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000466847:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000481948:exon_88105675_88105818:BANP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 88644005 A/G 1 50 39 89 23.5145122427475 20.6586804506569 2.85583179209064 A:G A G 10 0.529709755145049 0.595952249638834 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 53 45 98 24.9253829773124 23.8369389815272 1.08844399578519 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.840366659642716 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89628073 G/A 1 4199 3574 7773 1974.74873814594 1893.18266488841 81.5660732575338 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 0.0640190642777043 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627986_89628118:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627986_89628159:RPL13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 T:C T C 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 30 14 44 14.1087073456485 7.41593657203069 6.69277077361784 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0492938471483001 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 89 35 124 41.8558317920906 18.5398414300767 23.3159903620139 T:C T C 10 0.529709755145049 2.84468650840528e-05 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 108 56 164 50.7913464443347 29.6637462881227 21.127600156212 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000971349421024782 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89760652 C/T 1 26 12 38 12.2275463662287 6.35651706174059 5.87102930448814 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0726736561856985 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 89849480 C/T 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89849415_89849510:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89849415_89849510:FANCA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 14 9 23 6.58406342796931 4.76738779630544 1.81667563166387 A:G A G 10 0.529709755145049 0.533407999946811 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 113 105 218 53.1427976686095 55.6195242902301 -2.47672662162068 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.735086280078699 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 38 42 80 17.8710293044881 22.2478097160921 -4.37678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 0.370468700140024 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 29 27 56 13.6384171007936 14.3021633889163 -0.663746288122745 C:G G C 10 0.529709755145049 0.894015099851176 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 900476 C/T 1 21 25 46 9.87609514195397 13.2427438786262 -3.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.375953294854275 ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_900357_900620:TIMM22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 902110 T/G 1 30 25 55 14.1087073456485 13.2427438786262 0.865963467022304 T:G T G 10 0.529709755145049 0.892813706887124 ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_902019_902215:TIMM22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 910546 G/A 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 A:G G A 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_910405_910552:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_910405_910552:ABR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 84 85 169 39.5043805678159 45.0253291873292 -5.52094861951329 A:C C A 10 0.529709755145049 0.397860544721527 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 35 28 63 16.4601585699233 14.8318731440614 1.62828542586191 T:C T C 10 0.529709755145049 0.706698616967917 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 53 50 103 24.9253829773124 26.4854877572525 -1.56010477994005 A:G A G 10 0.529709755145049 0.768041676881607 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1496565 G/A 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:G G A 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1496481_1496573:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1496481_1496573:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1496481_1496573:SLC43A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1540106 G/A 1 3 9 12 1.41087073456485 4.76738779630544 -3.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0793760846826338 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1540003_1540149:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1540003_1540149:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1540003_1540112:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1540003_1540149:SCARF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1554770 A/G 1 229 251 480 107.696466071784 132.957148541407 -25.2606824696235 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0221809457405921 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1554708_1554847:PRPF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1578939 C/T 1 23 28 51 10.8166756316639 14.8318731440614 -4.0151975123975 T:C C T 10 0.529709755145049 0.265660587057328 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1580929 G/C 1 8 14 22 3.76232195883961 7.41593657203069 -3.65361461319108 C:G G C 10 0.529709755145049 0.137191946239842 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1580859_1580988:PRPF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1584324 A/G 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G A G 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1584223_1584348:PRPF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1585130 A/G 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 A:G A G 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585114_1585332:PRPF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 74 56 130 34.8014781192664 29.6637462881227 5.13773183114363 T:C C T 10 0.529709755145049 0.380764865993145 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 52 46 98 24.4550927324575 24.3666487366723 0.0884439957851946 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1943888 T/C 1 12 15 27 5.64348293825941 7.94564632717574 -2.30216338891632 T:C T C 10 0.529709755145049 0.442240172896858 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 1960974 C/T 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000177374:ENST00000399849:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000322941:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000416386:exon_1959965_1962980:HIC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:G T G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 C:G C G 10 0.529709755145049 0.105144579901353 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2203348 T/C 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G A G 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 104 91 195 48.9101854649149 48.2035877181995 0.706597746715438 T:C C T 10 0.529709755145049 0.9428954216676 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 43 46 89 20.2224805287629 24.3666487366723 -4.14416820790937 A:G G A 10 0.529709755145049 0.396903402192498 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G G A 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3627840 G/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 T:C T C 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 2 10 12 0.940580489709902 5.29709755145049 -4.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0171879827656164 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3832733 C/T 1 17 16 33 7.99493416253417 8.47535608232078 -0.480421919786618 T:C C T 10 0.529709755145049 0.863849861169677 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3832622_3832739:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3833680 C/T 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3833595_3833728:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3839733 G/A 1 24 22 46 11.2869658765188 11.6536146131911 -0.366648736672255 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3844311 G/C 1 22 18 40 10.3463853868089 9.53477559261088 0.811609794198038 C:G G C 10 0.529709755145049 0.87469818476426 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844265_3844600:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844265_3844600:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3844787 C/G 1 17 12 29 7.99493416253417 6.35651706174059 1.63841710079358 C:G C G 10 0.529709755145049 0.58147925745253 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 A:G A G 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 17 9 26 7.99493416253417 4.76738779630544 3.22754636622872 A:C A C 10 0.529709755145049 0.240962855945961 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 3912964 G/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3912898_3913051:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3912802_3913051:ZZEF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4391201 A/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4446227 T/G 1 40 48 88 18.811609794198 25.4260682469624 -6.61445845276431 T:G T G 10 0.529709755145049 0.166038838475685 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4586245 G/C 1 23 14 37 10.8166756316639 7.41593657203069 3.40073905963319 C:G G C 10 0.529709755145049 0.323506120270236 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4586098_4586247:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4586098_4586247:PELP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4701019 C/T 1 233 255 488 109.577627051204 135.075987561988 -25.4983605107839 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.0232674654399645 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4700977_4701106:PSMB6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 521 473 994 245.021217569429 250.552714183608 -5.53149661417874 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.726823166327992 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4712617 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4712593_4712658:PLD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4718776 G/A 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4718771_4718881:PLD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 T:C C T 10 0.529709755145049 0.371396387099242 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4844242 C/T 1 28 47 75 13.1681268559386 24.8963584918173 -11.7282316358787 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00754162655899749 ENSG00000108523:ENST00000262482:exon_4843782_4844288:RNF167;ENSG00000108523:ENST00000381350:exon_4843913_4844288:RNF167 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4856376 A/G 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856346_4856404:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856346_4856404:ENO3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 T:C T C 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 58 26 84 27.2768342015872 13.7724536337713 13.5043805678159 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00306958286097503 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 60 21 81 28.2174146912971 11.123904858046 17.093509833251 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000127281593245582 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5241493 C/G 1 26 26 52 12.2275463662287 13.7724536337713 -1.54490726754255 C:G C G 10 0.529709755145049 0.67937379301044 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5308377 C/T 1 57 38 95 26.8065439567322 20.1289706955119 6.67757326122034 T:C C T 10 0.529709755145049 0.182235639290717 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5308377_5308563:NUP88 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5392173 A/C 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:C A C 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 28 28 56 13.1681268559386 14.8318731440614 -1.66374628812274 T:C T C 10 0.529709755145049 0.689342218691078 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5436263 C/T 1 22 12 34 10.3463853868089 6.35651706174059 3.98986832506833 T:C C T 10 0.529709755145049 0.228650012076690 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5436142_5436304:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5436142_5436304:NLRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 5487164 C/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 C:G C G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5487007_5487832:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5487007_5487832:NLRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6350923 A/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000129195:ENST00000250056:exon_6350783_6351078:FAM64A;ENSG00000129195:ENST00000308855:exon_6350783_6351078:FAM64A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6493198 T/C 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C T C 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6493099_6493323:KIAA0753 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6511781 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6511668_6511784:KIAA0753 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6663729 A/G 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 A:G A G 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 12 18 30 5.64348293825941 9.53477559261088 -3.89129265435147 C:G C G 10 0.529709755145049 0.199932672074604 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6676408 A/G 0 0 32 32 0 16.9507121646416 -16.9507121646416 G A G 10 0.529709755145049 3.27877074288425e-11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6900102 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6902179 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 310 326 636 145.789975905035 172.685380177286 -26.8954042722512 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0351897471131888 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 6942111 G/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:G G T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7125284 C/T 1 139 135 274 65.3703440348382 71.5108169445816 -6.14047290974344 T:C C T 10 0.529709755145049 0.468125774891933 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7125271_7125400:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7125271_7125400:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7125271_7125400:ACADVL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 23 23 46 10.8166756316639 12.1833243683361 -1.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.768168914109342 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 51 40 91 23.9848024876025 21.188390205802 2.79641228180054 T:C T C 10 0.529709755145049 0.600202771463386 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 31 27 58 14.5789975905035 14.3021633889163 0.276834201587157 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 70 64 134 32.9203171398466 33.9014243292831 -0.981107189436571 A:G A G 10 0.529709755145049 0.863155261196681 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7367164 G/A 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7399866 G/A 1 19 25 44 8.93551465224407 13.2427438786262 -4.30722922638216 A:G G A 10 0.529709755145049 0.227243537746857 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7399759_7399932:POLR2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7402600 T/C 1 18 20 38 8.46522440738912 10.594195102901 -2.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.518822860282873 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7412349 G/A 1 26 28 54 12.2275463662287 14.8318731440614 -2.60432677783265 A:G G A 10 0.529709755145049 0.498017708653451 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 14 4 18 6.58406342796931 2.1188390205802 4.46522440738912 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0557962318234801 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 314 245 559 147.671136884455 129.778890010537 17.8922468739176 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.138031778235208 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7478498 G/A 1 445 378 823 209.279158960453 200.230287444829 9.04887151562463 A:G G A 10 0.529709755145049 0.529895762240322 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7478437_7478576:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7478437_7478720:EIF4A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7484750 T/C 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484696_7485431:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484696_7485428:CD68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7606350 T/C 1 29 43 72 13.6384171007936 22.7775194712371 -9.13910237044353 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0335514855606738 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 91 92 183 42.7964122818005 48.7332974733445 -5.93688519154398 A:G A G 10 0.529709755145049 0.4153891175326 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7761512 C/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:C C A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000182224:ENST00000332439:exon_7761064_7761612:CYB5D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7803900 G/A 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000170004:ENST00000380358:exon_7803876_7804049:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000403047:exon_7803876_7804049:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000358181:exon_7803876_7804049:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000330494:exon_7803876_7804049:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000412940:exon_7803876_7804049:CHD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7810512 C/G 1 57 59 116 26.8065439567322 31.2528755535579 -4.44633159682569 C:G C G 10 0.529709755145049 0.456968361438356 ENSG00000170004:ENST00000380358:exon_7810444_7810565:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000403047:exon_7810444_7810565:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000358181:exon_7810444_7810565:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000330494:exon_7810444_7810565:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000412940:exon_7810444_7810565:CHD3;ENSG00000170004:ENST00000470531:exon_7810444_7810565:CHD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 7851959 G/T 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 T:G G T 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7851805_7852003:CNTROB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:G T G 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 47 59 106 22.1036415081827 31.2528755535579 -9.1492340453752 A:T:G T G 10 0.529709755145049 0.0800868699411948 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 247 145 392 116.161690479173 76.8079144960321 39.3537759831408 A:G A G 10 0.529709755145049 7.52605998167403e-05 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 251 139 390 118.042851458593 73.6296559651618 44.4131954934309 A:G G A 10 0.529709755145049 5.90531387520789e-06 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8109993 G/A 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 A:G G A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8138547 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8138371_8138603:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8138371_8138603:C17orf68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 8706748 C/T 1 7 54 61 3.29203171398466 28.6043267778326 -25.312295063848 T:C C T 10 0.529709755145049 1.68092729190117e-11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 98 88 186 46.0884439957852 46.6144584527643 -0.526014456979119 A:G G A 10 0.529709755145049 0.941595102741678 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 34 35 69 15.9898683250683 18.5398414300767 -2.54997310500838 T:G T G 10 0.529709755145049 0.548897784835835 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 11881498 A/G 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:G A G 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000154957:ENST00000446124:exon_11880762_11882061:ZNF18;ENSG00000154957:ENST00000322748:exon_11880762_11882061:ZNF18;ENSG00000154957:ENST00000454073:exon_11880762_11882061:ZNF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 12898295 T/C 1 52 43 95 24.4550927324575 22.7775194712371 1.67757326122034 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758618013716412 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12898280_12898379:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12898081_12898379:ELAC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 20 36 56 9.40580489709902 19.0695511852218 -9.66374628812275 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0107099598777459 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 12915009 G/A 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12914980_12915099:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12914980_12915099:ELAC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 15961951 A/G 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 A:G A G 10 0.529709755145049 0.43903950278177 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16321176 G/A 1 31 23 54 14.5789975905035 12.1833243683361 2.39567322216735 A:G G A 10 0.529709755145049 0.586203018047629 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 33 23 56 15.5195780802134 12.1833243683361 3.33625371187725 A:G A G 10 0.529709755145049 0.422689843824957 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16342833 T/C 1 16 27 43 7.52464391767922 14.3021633889163 -6.77751947123711 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0463090900432951 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 20 31 51 9.40580489709902 16.4210024094965 -7.0151975123975 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0506698653461182 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 433 425 858 203.635676022194 225.126645936646 -21.4909699144521 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.150847249085767 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:G T G 10 0.529709755145049 0.397869571967858 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 105 117 222 49.3804757097699 61.9760413519707 -12.5955656422009 T:C C T 10 0.529709755145049 0.093043219044888 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17046024 C/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:C C A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17045941_17046079:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17045941_17046079:MPRIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 10 19 29 4.70290244854951 10.0644853477559 -5.36158289920642 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.061321851485527 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 46 39 85 21.6333512633277 20.6586804506569 0.97467081267083 A:G G A 10 0.529709755145049 0.913564235635658 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 T:C C T 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17720419 G/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 C:G G C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 6 13 19 2.82174146912971 6.88622681688564 -4.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0687326222682032 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 9 20 29 4.23261220369456 10.594195102901 -6.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0241131805458819 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 17 26 43 7.99493416253417 13.7724536337713 -5.77751947123711 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0924448598358786 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18194242 C/T 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18194156_18194341:TOP3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18194248 C/T 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C C T 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18194156_18194341:TOP3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 29 28 57 13.6384171007936 14.8318731440614 -1.19345604326779 A:G G A 10 0.529709755145049 0.791547052727124 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18243524 T/C 1 15 23 38 7.05435367282426 12.1833243683361 -5.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.105371063170614 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18243357_18243569:SHMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 44 48 92 20.6927707736178 25.4260682469624 -4.73329747334451 A:G A G 10 0.529709755145049 0.347912484408298 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 21 31 52 9.87609514195397 16.4210024094965 -6.54490726754255 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0721862612433516 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 40 0 40 18.811609794198 0 18.811609794198 T T 10 0.529709755145049 1.27653663860134e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 50 0 50 23.5145122427475 0 23.5145122427475 G G 10 0.529709755145049 1.82984092089705e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 1 48 1 49 22.5739317530376 0.529709755145049 22.0442219978926 T:C C T 10 0.529709755145049 1.47407049174842e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 39 0 39 18.3413195493431 0 18.3413195493431 C C 10 0.529709755145049 2.47727329884859e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 58 0 58 27.2768342015872 0 27.2768342015872 C C 10 0.529709755145049 1.05264487885624e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 56 0 56 26.3362537118773 0 26.3362537118773 C C 10 0.529709755145049 3.80449044716743e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 36 0 36 16.9304488147782 0 16.9304488147782 C C 10 0.529709755145049 1.82882273141085e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 54 0 54 25.3956732221674 0 25.3956732221674 C C 10 0.529709755145049 1.37886380124449e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 55 0 55 25.8659634670223 0 25.8659634670223 G G 10 0.529709755145049 7.24011847576828e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 83 1 84 39.0340903229609 0.529709755145049 38.5043805678159 A:G G A 10 0.529709755145049 5.4076395291685e-22 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 25909850 G/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 25932816 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25932460_25932839:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398988:exon_25932460_25932839:KSR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 21 32 53 9.87609514195397 16.9507121646416 -7.0746170226876 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0547249714179064 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 18 22 40 8.46522440738912 11.6536146131911 -3.18839020580196 T:C C T 10 0.529709755145049 0.344070881377803 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 39 55 94 18.3413195493431 29.1340365329777 -10.7927169836346 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0296498746983589 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 28505174 A/C 1 61 49 110 28.687704936152 25.9557780021074 2.73192693404461 A:C A C 10 0.529709755145049 0.633690099210957 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28505089_28505217:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28505089_28505217:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28505088_28505217:CCDC55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 58 49 107 27.2768342015872 25.9557780021074 1.32105619947976 T:C T C 10 0.529709755145049 0.846655323993927 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 19 27 46 8.93551465224407 14.3021633889163 -5.36664873667226 C:G G C 10 0.529709755145049 0.139083397135529 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 29161503 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 29623288 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000126861:ENST00000247271:exon_29621665_29623355:OMG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 33 18 51 15.5195780802134 9.53477559261088 5.9848024876025 T:C T C 10 0.529709755145049 0.121974105686614 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 30692396 G/T 1 50 50 100 23.5145122427475 26.4854877572525 -2.9709755145049 A:T:G G T 10 0.529709755145049 0.616672127691516 ENSG00000010244:ENST00000394670:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000394673:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000394679:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000341711:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000321233:exon_30692349_30692506:ZNF207;ENSG00000010244:ENST00000342555:exon_30692349_30692506:ZNF207 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 30696296 G/A 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.508665642734785 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 33288582 C/G 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 C:G C G 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 33328416 A/G 1 35 22 57 16.4601585699233 11.6536146131911 4.8065439567322 A:G A G 10 0.529709755145049 0.232834711833802 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33328276_33328422:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33328276_33328422:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33328276_33328422:LIG3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 33329049 G/A 1 21 8 29 9.87609514195397 4.23767804116039 5.63841710079358 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0405720324927911 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33328928_33329123:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33328928_33329123:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33328928_33329123:LIG3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 33463390 G/T 1 16 11 27 7.52464391767922 5.82680730659554 1.69783661108368 T:G G T 10 0.529709755145049 0.566932775224758 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000479807:exon_33463377_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000473567:exon_33463386_33463516:NLE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 1 10 11 0.470290244854951 5.29709755145049 -4.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00425406518869011 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 34252537 A/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:C A C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000419453:exon_34252519_34252554:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000431884:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000436836:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000425909:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34252519_34252641:RDM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G A G 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 15 19 34 7.05435367282426 10.0644853477559 -3.01013167493167 A:G G A 10 0.529709755145049 0.30883505629764 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 59 69 128 27.7471244464421 36.5499731050084 -8.80284865856628 A:G G A 10 0.529709755145049 0.132152620356408 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 34943719 C/T 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 20 15 35 9.40580489709902 7.94564632717574 1.46015856992328 T:C T C 10 0.529709755145049 0.735488227131445 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 27 24 51 12.6978366110837 12.7130341234812 -0.0151975123974992 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 36453208 T/C 1 38 36 74 17.8710293044881 19.0695511852218 -1.19852188073363 T:C T C 10 0.529709755145049 0.816386721740098 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36452990_36453215:MRPL45 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 36478450 G/T 1 61 93 154 28.687704936152 49.2630072284896 -20.5753022923376 T:G G T 10 0.529709755145049 0.00117058334325855 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36478392_36479101:MRPL45 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 37359216 C/T 1 21 10 31 9.87609514195397 5.29709755145049 4.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.107970909801454 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 C:G C G 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 25 29 54 11.7572561213738 15.3615828992064 -3.60432677783265 A:G A G 10 0.529709755145049 0.342526935277608 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 39987130 T/C 1 27 39 66 12.6978366110837 20.6586804506569 -7.96084383957324 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0635516873001001 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000521789:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000486304:exon_39987053_39987132:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000460893:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000481693:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000475053:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000495317:exon_39987053_39987142:NT5C3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 40048613 A/G 1 58 56 114 27.2768342015872 29.6637462881227 -2.38691208653559 A:G A G 10 0.529709755145049 0.707649159413375 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40048532_40048700:ACLY HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 40065774 T/G 1 27 13 40 12.6978366110837 6.88622681688564 5.81160979419804 T:G T G 10 0.529709755145049 0.080682908347193 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 41245471 C/T 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 41338439 C/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000188554:ENST00000389312:exon_41338267_41338461:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000422280:exon_41338267_41338461:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000341165:exon_41338267_41338461:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000389311:exon_41338267_41338461:NBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 100 92 192 47.0290244854951 48.7332974733445 -1.70427298784941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.82848869997199 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 159 138 297 74.7761489319372 73.0999462100168 1.67620272192043 A:G G A 10 0.529709755145049 0.861714448083195 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43226887 A/G 1 48 42 90 22.5739317530376 22.2478097160921 0.326122036945588 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43227214 T/C 1 76 63 139 35.7420586089763 33.3717145741381 2.37034403483818 T:C T C 10 0.529709755145049 0.734177179066803 ENSG00000186834:ENST00000332499:exon_43224684_43229468:HEXIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43311620 A/G 1 18 13 31 8.46522440738912 6.88622681688564 1.57899759050348 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594825033868625 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 37 32 69 17.4007390596332 16.9507121646416 0.450026894991616 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 13 19 32 6.11377318311436 10.0644853477559 -3.95071216464157 C:G G C 10 0.529709755145049 0.214521438123880 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 45759767 C/T 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.129246611858996 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 30 22 52 14.1087073456485 11.6536146131911 2.45509273245745 T:C C T 10 0.529709755145049 0.57893238011456 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 15 18 33 7.05435367282426 9.53477559261088 -2.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.39060695666354 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 93 87 180 43.7369927715104 46.0847486976193 -2.34775592610883 C:G C G 10 0.529709755145049 0.765325684908967 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 206 192 398 96.8797904401199 101.704272987849 -4.8244825477295 T:C C T 10 0.529709755145049 0.651410334469176 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 47300081 C/G 1 112 138 250 52.6725074237545 73.0999462100168 -20.4274387862623 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0111261282295136 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47299914_47300587:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47299914_47300398:ABI3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 47484228 G/C 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 C:G G C 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000167085:ENST00000511933:exon_47484121_47484835:PHB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 20 31 51 9.40580489709902 16.4210024094965 -7.0151975123975 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0506698653461182 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 19 21 40 8.93551465224407 11.123904858046 -2.18839020580196 C:G C G 10 0.529709755145049 0.528559104738777 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48625928 C/G 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505085:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000502911:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505456:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508598:exon_48625915_48625942:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515526:exon_48625644_48626064:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511845:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505336:exon_48625915_48626175:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512416:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48625915_48625979:SPATA20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48628092 A/G 1 26 4 30 12.2275463662287 2.1188390205802 10.1087073456485 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000152277756084014 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 9 2 11 4.23261220369456 1.0594195102901 3.17319269340446 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0705618130584992 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48940323 C/T 1 24 15 39 11.2869658765188 7.94564632717574 3.34131954934309 T:C C T 10 0.529709755145049 0.336707319671434 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 22 18 40 10.3463853868089 9.53477559261088 0.811609794198038 T:C T C 10 0.529709755145049 0.87469818476426 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 16 20 36 7.52464391767922 10.594195102901 -3.06955118522177 T:C T C 10 0.529709755145049 0.320976259820328 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 60 27 87 28.2174146912971 14.3021633889163 13.9152513023807 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00348702497718265 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 19 10 29 8.93551465224407 5.29709755145049 3.63841710079358 T:C T C 10 0.529709755145049 0.196329624889726 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 56584508 T/C 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584484_56584680:MTMR4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 57968208 A/G 1 9 2 11 4.23261220369456 1.0594195102901 3.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0705618130584992 ENSG00000108423:ENST00000325752:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000340993:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000394239:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000376094:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000346141:exon_57968192_57968402:TUBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 58121453 G/A 1 9 20 29 4.23261220369456 10.594195102901 -6.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0241131805458819 ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58120562_58121495:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58120562_58121495:HEATR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 11 15 26 5.17319269340446 7.94564632717574 -2.77245363377128 T:C C T 10 0.529709755145049 0.327633282444792 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 59763465 T/C 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 T:C T C 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59763197_59763526:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59763117_59763526:BRIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 61908316 G/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 354 338 692 166.482746678653 179.041897239027 -12.559150560374 T:C C T 10 0.529709755145049 0.341328534971352 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 215 186 401 101.112402643814 98.5260144569791 2.58638818683534 A:G A G 10 0.529709755145049 0.802713382086853 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 62496670 A/C 1 1017 813 1830 478.285179017485 430.654030932925 47.6311480845603 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0260961980710481 ENSG00000108654:ENST00000225792:exon_62496667_62496891:DDX5;ENSG00000108654:ENST00000450599:exon_62496667_62496891:DDX5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 65732093 A/G 1 21 19 40 9.87609514195397 10.0644853477559 -0.188390205801962 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65732016_65732139:NOL11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 38 48 86 17.8710293044881 25.4260682469624 -7.55503894247422 A:G A G 10 0.529709755145049 0.106187537408744 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 65 62 127 30.5688659155718 32.842004818993 -2.27313890342123 A:G A G 10 0.529709755145049 0.722478623877663 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 67081830 T/C 1 4 14 18 1.8811609794198 7.41593657203069 -5.53477559261088 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0156269541996837 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67081766_67081857:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67081766_67081857:ABCA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 67101718 C/T 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.130404884079537 ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67101603_67101769:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67101603_67101769:ABCA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 67149973 G/A 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000154263:ENST00000269081:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000522406:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000416101:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000519732:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000518929:exon_67149446_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000523419:exon_67149972_67150150:ABCA10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 67150118 C/T 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000154263:ENST00000269081:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000522406:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000416101:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000519732:exon_67149972_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000518929:exon_67149446_67150150:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000523419:exon_67149972_67150150:ABCA10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71196139 C/T 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196004_71196160:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196004_71196160:COG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 27 34 61 12.6978366110837 18.0101316749317 -5.31229506384799 A:G G A 10 0.529709755145049 0.199669984487342 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 10 2 12 4.70290244854951 1.0594195102901 3.64348293825941 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0425775668197683 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71233118 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 71238433 G/A 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71238383_71238490:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71238383_71238490:C17orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 99 83 182 46.5587342406401 43.9659096770391 2.59282456360108 T:C C T 10 0.529709755145049 0.711112743977654 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 15 20 35 7.05435367282426 10.594195102901 -3.53984143007672 C:G G C 10 0.529709755145049 0.240735837360394 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 C:G C G 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 10 21 31 4.70290244854951 11.123904858046 -6.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0292451614460846 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 21 29 50 9.87609514195397 15.3615828992064 -5.48548775725245 A:G G A 10 0.529709755145049 0.155864987179811 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:G G A 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 42 50 92 19.7521902839079 26.4854877572525 -6.73329747334451 T:C T C 10 0.529709755145049 0.174824564684162 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73830182 C/T 1 36 26 62 16.9304488147782 13.7724536337713 3.15799518100696 T:C C T 10 0.529709755145049 0.447475178407538 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73830156_73830224:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73830156_73830224:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73830156_73830224:UNC13D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 20 18 38 9.40580489709902 9.53477559261088 -0.128970695511864 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 20 16 36 9.40580489709902 8.47535608232078 0.930448814778234 A:G G A 10 0.529709755145049 0.867774579333193 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73839326 C/T 1 10 19 29 4.70290244854951 10.0644853477559 -5.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.061321851485527 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839240_73839347:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839240_73839347:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839240_73839347:UNC13D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73886888 A/G 1 23 22 45 10.8166756316639 11.6536146131911 -0.836938981527208 A:G A G 10 0.529709755145049 0.88159802129165 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73888534 G/A 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73914024 C/T 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 C C 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 ENSG00000188878:ENST00000337792:exon_73914012_73914151:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000319129:exon_73914012_73914151:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000389570:exon_73914012_73914151:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000427433:exon_73914012_73914151:FBF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 13 6 19 6.11377318311436 3.17825853087029 2.93551465224407 C:G G C 10 0.529709755145049 0.250274317508915 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 40 25 65 18.811609794198 13.2427438786262 5.56886591557181 T:C C T 10 0.529709755145049 0.173805179327532 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 72 79 151 33.8608976295565 41.8470706564589 -7.98617302690241 C:G G C 10 0.529709755145049 0.221259748013160 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 62 50 112 29.157995181007 26.4854877572525 2.67250742375451 T:C C T 10 0.529709755145049 0.636957640332638 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 223 197 420 104.874724602654 104.352821763575 0.521902839079416 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 22 29 51 10.3463853868089 15.3615828992064 -5.0151975123975 T:C T C 10 0.529709755145049 0.163736764261605 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74392365 C/G 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74392209_74392902:UBE2O HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 63 94 157 29.6282854258619 49.7927169836346 -20.1644315577727 C:G C G 10 0.529709755145049 0.00134075221970292 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74472998 G/A 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74472912_74473106:RHBDF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 74732205 G/A 1 8 19 27 3.76232195883961 10.0644853477559 -6.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0194019843689358 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74730201_74732546:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74732179_74732370:SRSF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 14 26 40 6.58406342796931 13.7724536337713 -7.18839020580196 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0261653765059387 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 25 25 50 11.7572561213738 13.2427438786262 -1.48548775725245 T:C C T 10 0.529709755145049 0.674148150088013 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 75398498 C/T 1 56 39 95 26.3362537118773 20.6586804506569 5.67757326122034 T:C C T 10 0.529709755145049 0.259275513596969 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75398134_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000407798:exon_75398140_75398550:SEPT9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 101 43 144 47.4993147303501 22.7775194712371 24.7217952591129 A:G A G 10 0.529709755145049 3.65199621201882e-05 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 75494780 A/T 1 133 74 207 62.5486025657085 39.1985218807336 23.3500806849748 A:T A T 10 0.529709755145049 0.00130490917391015 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 119 115 234 55.9645391377392 60.9166218416806 -4.95208270394147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.5556920374417 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 31 16 47 14.5789975905035 8.47535608232078 6.1036415081827 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0804294836193938 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 24 18 42 11.2869658765188 9.53477559261088 1.75219028390794 A:G G A 10 0.529709755145049 0.644560715625997 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 35 20 55 16.4601585699233 10.594195102901 5.8659634670223 A:C C A 10 0.529709755145049 0.136879014440085 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76137198 T/G 1 97 98 195 45.6181537509302 51.9115560042148 -6.29340225328455 T:G T G 10 0.529709755145049 0.389531648915909 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76136915_76139049:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76136915_76139049:TMC8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76170951 G/T 1 107 124 231 50.3210561994798 65.6840096379861 -15.3629534385063 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0478067432112624 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 51 49 100 23.9848024876025 25.9557780021074 -1.9709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.763945921779517 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 55 53 108 25.8659634670223 28.0746170226876 -2.20865355566529 A:G A G 10 0.529709755145049 0.700358600555136 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 17 16 33 7.99493416253417 8.47535608232078 -0.480421919786618 T:C C T 10 0.529709755145049 0.863849861169677 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 26 24 50 12.2275463662287 12.7130341234812 -0.48548775725245 T:C T C 10 0.529709755145049 0.888560234985484 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 41 25 66 19.281900039053 13.2427438786262 6.03915616042676 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.141004043100483 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 16 25 41 7.52464391767922 13.2427438786262 -5.71809996094701 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0852164457236708 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 76989782 G/A 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 A:C C A 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78092063 G/A 1 13 6 19 6.11377318311436 3.17825853087029 2.93551465224407 A:G G A 10 0.529709755145049 0.250274317508915 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78113832 G/A 1 59 54 113 27.7471244464421 28.6043267778326 -0.857202331390539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.924991122533292 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78113807_78113939:EIF4A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78261805 A/G 1 21 7 28 9.87609514195397 3.70796828601534 6.16812685593863 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0223010587578852 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78261961 G/C 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 C:G G C 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78272294 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78272121_78272318:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78272121_78272318:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78272121_78272318:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78272121_78272318:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78292945 G/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78333840 T/C 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C T C 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78337058 G/C 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 C:G G C 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78336902_78337114:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78336902_78337114:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78337584 A/G 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 A:G A G 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78337409_78337590:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78337409_78337590:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78346830 G/A 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78346775_78346965:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78346775_78346965:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78353463 C/T 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78353420_78353514:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78353420_78353514:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 85 102 187 39.9746708126708 54.030395024795 -14.0557242121242 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0404078259998364 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79165171 G/A 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.130404884079537 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79170576 C/T 1 10 15 25 4.70290244854951 7.94564632717574 -3.24274387862623 T:C C T 10 0.529709755145049 0.230835807253919 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 19 13 32 8.93551465224407 6.88622681688564 2.04928783535843 T:C T C 10 0.529709755145049 0.485452800730278 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 57 38 95 26.8065439567322 20.1289706955119 6.67757326122034 C:G G C 10 0.529709755145049 0.182235639290717 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79478007 G/A 1 4240 3686 7926 1994.03063818499 1952.51015746465 41.5204807203413 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.356170514571032 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 0 26 0 26 12.2275463662287 0 12.2275463662287 C C 10 0.529709755145049 6.98629355520537e-08 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 0 25 0 25 11.7572561213738 0 11.7572561213738 C C 10 0.529709755145049 1.32611923158720e-07 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 19 3 22 8.93551465224407 1.58912926543515 7.34638538680892 T:G G T 10 0.529709755145049 0.00197228167164944 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79508420 G/A 1 31 22 53 14.5789975905035 11.6536146131911 2.9253829773124 A:G G A 10 0.529709755145049 0.491971052991262 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 A:G G A 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 18 14 32 8.46522440738912 7.41593657203069 1.04928783535843 T:C C T 10 0.529709755145049 0.727553030410456 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 13 15 28 6.11377318311436 7.94564632717574 -1.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.571427095192413 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79634774 A/T 1 20 14 34 9.40580489709902 7.41593657203069 1.98986832506833 A:T A T 10 0.529709755145049 0.606972054310593 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79634813 T/C 1 21 11 32 9.87609514195397 5.82680730659554 4.04928783535843 T:C T C 10 0.529709755145049 0.161034976422528 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 35 34 69 16.4601585699233 18.0101316749317 -1.54997310500838 C:G C G 10 0.529709755145049 0.719169754282428 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79638805 C/T 1 36 43 79 16.9304488147782 22.7775194712371 -5.84707065645888 T:C C T 10 0.529709755145049 0.215014257684941 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79638774_79638856:CCDC137 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79639684 G/A 1 31 32 63 14.5789975905035 16.9507121646416 -2.37171457413809 A:G G A 10 0.529709755145049 0.614135151248096 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79661874 C/T 1 32 34 66 15.0492878353584 18.0101316749317 -2.96084383957324 T:C C T 10 0.529709755145049 0.537857813624754 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661845_79661883:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661845_79661883:HGS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 30 20 50 14.1087073456485 10.594195102901 3.51451224274755 T:C T C 10 0.529709755145049 0.395538102001317 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79941511 C/T 1 25 18 43 11.7572561213738 9.53477559261088 2.22248052876289 T:C C T 10 0.529709755145049 0.543376988858855 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79941430_79941544:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79941430_79941544:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79941430_79941544:ASPSCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 21 17 38 9.87609514195397 9.00506583746583 0.871029304488136 A:T:G T A 10 0.529709755145049 0.871352391104054 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 35 39 74 16.4601585699233 20.6586804506569 -4.19852188073363 T:C T C 10 0.529709755145049 0.352622893477527 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 58 56 114 27.2768342015872 29.6637462881227 -2.38691208653559 T:C C T 10 0.529709755145049 0.707649159413375 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 80352234 G/A 1 19 15 34 8.93551465224407 7.94564632717574 0.989868325068333 A:G G A 10 0.529709755145049 0.86393607547896 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 80352303 G/A 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 A:G G A 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 80543901 C/T 1 22 24 46 10.3463853868089 12.7130341234812 -2.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.555319847357411 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80543780_80544076:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80543780_80544076:FOXK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 17 81043039 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81042814_81043199:METRNL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 224184 C/G 1 13 8 21 6.11377318311436 4.23767804116039 1.87609514195397 C:G C G 10 0.529709755145049 0.513879879006915 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G A G 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 A:C A C 10 0.529709755145049 0.43903950278177 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 9255081 A/G 1 165 157 322 77.5978904010669 83.1644315577727 -5.5665411567058 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.539638473269408 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 10540014 C/G 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000134265:ENST00000322897:exon_10539985_10540051:NAPG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 12325703 G/A 1 52 42 94 24.4550927324575 22.2478097160921 2.20728301636539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.680271134172039 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12325066_12326568:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12325172_12326129:TUBB6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 13095591 G/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13095502_13095680:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13095502_13095680:CEP192 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 33 23 56 15.5195780802134 12.1833243683361 3.33625371187725 T:C C T 10 0.529709755145049 0.422689843824957 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 23866185 G/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23865846_23866463:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23865846_23866463:TAF4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 24035788 G/A 1 13 10 23 6.11377318311436 5.29709755145049 0.816675631663872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.835758435999101 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 7 17 24 3.29203171398466 9.00506583746583 -5.71303412348118 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0235588236717903 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 32887591 A/G 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 33283514 C/T 1 17 14 31 7.99493416253417 7.41593657203069 0.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.859395359335908 ENSG00000141429:ENST00000392829:exon_33283473_33283607:GALNT1;ENSG00000141429:ENST00000269195:exon_33283473_33283607:GALNT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 A:C A C 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 17 28 45 7.99493416253417 14.8318731440614 -6.83693898152721 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0512926240459147 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 71 112 183 33.3906073847015 59.3274925762455 -25.936885191544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000145332810700635 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 1 8 9 0.470290244854951 4.23767804116039 -3.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0158168681836475 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 1 9 10 0.470290244854951 4.76738779630544 -4.29709755145049 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00822974216294624 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 47318626 T/C 1 47 53 100 22.1036415081827 28.0746170226876 -5.9709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.270398269660922 ENSG00000167315:ENST00000285093:exon_47318522_47318697:ACAA2;ENSG00000167315:ENST00000398549:exon_47318522_47318697:ACAA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 47800179 G/C 1 21 18 39 9.87609514195397 9.53477559261088 0.341319549343087 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47799934_47800233:MBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 47803493 G/A 1 18 26 44 8.46522440738912 13.7724536337713 -5.30722922638216 A:G G A 10 0.529709755145049 0.130649453810797 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803460_47803574:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803460_47803574:MBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 47810251 C/G 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 C:G C G 10 0.529709755145049 0.43903950278177 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 74 81 155 34.8014781192664 42.906490166749 -8.1050120474826 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.198630276109057 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 54281790 T/C 1 151 167 318 71.0138269730976 88.4615291092232 -17.4477021361256 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0559661370467556 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54281655_54281827:TXNL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 T:C T C 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56202231 T/C 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C T C 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:C C A 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 13 10 23 6.11377318311436 5.29709755145049 0.816675631663872 C:G G C 10 0.529709755145049 0.835758435999101 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:G A G 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203837 G/A 1 21 9 30 9.87609514195397 4.76738779630544 5.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0683914908092486 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:G G T 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 6 12 18 2.82174146912971 6.35651706174059 -3.53477559261088 T:G T G 10 0.529709755145049 0.103801735404631 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 22 15 37 10.3463853868089 7.94564632717574 2.40073905963319 A:C A C 10 0.529709755145049 0.510967745319276 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 A:T A T 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204768 G/A 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204794 C/T 1 14 3 17 6.58406342796931 1.58912926543515 4.99493416253417 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0153308858224054 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204796 T/G 1 14 2 16 6.58406342796931 1.0594195102901 5.52464391767922 T:G T G 10 0.529709755145049 0.00519939892864728 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 24 4 28 11.2869658765188 2.1188390205802 9.16812685593863 T:G T G 10 0.529709755145049 0.000432613226929254 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 24 3 27 11.2869658765188 1.58912926543515 9.69783661108368 C:G C G 10 0.529709755145049 0.000130038607117703 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 26 4 30 12.2275463662287 2.1188390205802 10.1087073456485 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000152277756084014 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 28 4 32 13.1681268559386 2.1188390205802 11.0492878353584 T:C C T 10 0.529709755145049 5.28542706334708e-05 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 22 15 37 10.3463853868089 7.94564632717574 2.40073905963319 A:G G A 10 0.529709755145049 0.510967745319276 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 56823071 T/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:T T A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 57026361 A/G 1 19 20 39 8.93551465224407 10.594195102901 -1.65868045065691 A:G A G 10 0.529709755145049 0.632626535198063 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57026263_57026503:LMAN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 T:C C T 10 0.529709755145049 0.371396387099242 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 67718688 A/G 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67718647_67718784:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67718647_67718784:RTTN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 23 26 49 10.8166756316639 13.7724536337713 -2.9557780021074 A:G G A 10 0.529709755145049 0.474653509019484 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 39 49 88 18.3413195493431 25.9557780021074 -7.61445845276431 T:C T C 10 0.529709755145049 0.109838201296192 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 35 34 69 16.4601585699233 18.0101316749317 -1.54997310500838 T:C T C 10 0.529709755145049 0.719169754282428 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 72185688 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 72776121 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 72913920 C/T 1 17 25 42 7.99493416253417 13.2427438786262 -5.24780971609206 T:C C T 10 0.529709755145049 0.122206959251360 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 74091235 G/C 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 20 22 42 9.40580489709902 11.6536146131911 -2.24780971609206 A:G G A 10 0.529709755145049 0.537869099245852 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 77798609 G/A 1 33 42 75 15.5195780802134 22.2478097160921 -6.72823163587868 A:G G A 10 0.529709755145049 0.132818312987214 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77798505_77798617:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77798505_77798617:RBFA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 67 65 132 31.5094464052817 34.4311340844282 -2.92168767914647 A:C A C 10 0.529709755145049 0.663035691203389 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 18 77896242 C/T 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 T:C C T 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 613307 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000099822:ENST00000251287:exon_613248_613488:HCN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 23 16 39 10.8166756316639 8.47535608232078 2.34131954934309 C:G G C 10 0.529709755145049 0.522369402448561 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 T:G T G 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 799342 G/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 C:G G C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 799392 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 804327 C/T 1 66 76 142 31.0391561604268 40.2579413910237 -9.21878523059696 T:C C T 10 0.529709755145049 0.130342836336233 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 804612 C/T 1 94 84 178 44.2072830163654 44.4956194321841 -0.288336415818733 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 871222 G/A 1 49 46 95 23.0442219978926 24.3666487366723 -1.32242673877966 A:G G A 10 0.529709755145049 0.837344355340482 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 872089 A/G 1 29 25 54 13.6384171007936 13.2427438786262 0.395673222167353 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 50 27 77 23.5145122427475 14.3021633889163 9.21234885383123 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0395786169432715 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1011823 A/G 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 55 42 97 25.8659634670223 22.2478097160921 3.61815375093024 A:G A G 10 0.529709755145049 0.478151330723266 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 68 36 104 31.9797366501367 19.0695511852218 12.9101854649149 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0136716497205258 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1048898 G/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 C:G G C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1048894_1049004:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1048894_1049004:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1048894_1049004:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1051214 A/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1051154_1051293:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1051154_1051293:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1051154_1051293:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1051242 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1051154_1051293:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1051154_1051293:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1051154_1051293:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1053524 C/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 C:G C G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1053328_1053530:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1053328_1053530:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1053328_1053530:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1056065 A/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1056227 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 33 18 51 15.5195780802134 9.53477559261088 5.9848024876025 T:C T C 10 0.529709755145049 0.121974105686614 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 37 19 56 17.4007390596332 10.0644853477559 7.33625371187725 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.0601635404284201 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 131 105 236 61.6080220759986 55.6195242902301 5.98849778576843 A:G A G 10 0.529709755145049 0.47326438880182 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1105310 T/C 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C T C 10 0.529709755145049 0.797038290797778 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1251564 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1251561_1251648:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1251561_1251648:MIDN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1255563 C/T 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 T:C C T 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1255421_1255693:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1255421_1255693:MIDN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1271274 C/T 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271139_1271364:CIRBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1271529 C/T 1 13 8 21 6.11377318311436 4.23767804116039 1.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.513879879006915 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 519 451 970 244.08063707972 238.899099570417 5.18153750930244 T:C T C 10 0.529709755145049 0.747797864554677 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1478921 G/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 C:G G C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 78 61 139 36.6826390986862 32.312295063848 4.37034403483818 T:C T C 10 0.529709755145049 0.4969476925619 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 42 38 80 19.7521902839079 20.1289706955119 -0.376780411603924 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 26 25 51 12.2275463662287 13.2427438786262 -1.0151975123975 T:C T C 10 0.529709755145049 0.781110542573934 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1820006 G/A 1 21 23 44 9.87609514195397 12.1833243683361 -2.30722922638216 A:G G A 10 0.529709755145049 0.546780725832453 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819933_1820056:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819933_1820056:REXO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 35 19 54 16.4601585699233 10.0644853477559 6.39567322216735 A:G A G 10 0.529709755145049 0.101114196127223 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1918181 C/T 1 5 21 26 2.35145122427475 11.123904858046 -8.77245363377128 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000587237738510443 ENSG00000227500:ENST00000452128:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000460767:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000489554:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000414057:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000409472:exon_1918126_1918282:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000411971:exon_1918126_1918282:SCAMP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 74 65 139 34.8014781192664 34.4311340844282 0.370344034838183 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2102135 G/A 1 79 85 164 37.1529293435411 45.0253291873292 -7.87239984378805 A:G G A 10 0.529709755145049 0.240623662794943 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2100993_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2100994_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2100994_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2100994_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2100994_2102267:AP3D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 48 39 87 22.5739317530376 20.6586804506569 1.91525130238074 T:C T C 10 0.529709755145049 0.747581074659652 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 77 80 157 36.2123488538312 42.3767804116039 -6.1644315577727 A:G G A 10 0.529709755145049 0.337987161731184 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 32 28 60 15.0492878353584 14.8318731440614 0.217414691297058 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2118692 C/T 1 23 10 33 10.8166756316639 5.29709755145049 5.51957808021338 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0567804531217444 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2118600_2118831:AP3D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 26 26 52 12.2275463662287 13.7724536337713 -1.54490726754255 A:G G A 10 0.529709755145049 0.67937379301044 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 36 31 67 16.9304488147782 16.4210024094965 0.509446405281714 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 56 56 112 26.3362537118773 29.6637462881227 -3.32749257624549 A:G A G 10 0.529709755145049 0.570408857237686 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 25 28 53 11.7572561213738 14.8318731440614 -3.0746170226876 T:G G T 10 0.529709755145049 0.41210460888 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2853566 A/G 1 5 12 17 2.35145122427475 6.35651706174059 -4.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0859527586065674 ENSG00000186300:ENST00000334241:exon_2852378_2857682:ZNF555 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 2853803 G/A 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:G G A 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000186300:ENST00000334241:exon_2852378_2857682:ZNF555;ENSG00000186300:ENST00000382127:exon_2853681_2853950:ZNF555 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3054196 G/C 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 C:G G C 10 0.529709755145049 0.154514551774692 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 38 27 65 17.8710293044881 14.3021633889163 3.56886591557181 A:G G A 10 0.529709755145049 0.387572204951413 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3496833 G/A 1 30 17 47 14.1087073456485 9.00506583746583 5.1036415081827 A:G G A 10 0.529709755145049 0.145964510179764 ENSG00000129932:ENST00000250937:exon_3496539_3496884:DOHH;ENSG00000129932:ENST00000427575:exon_3496539_3496884:DOHH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3544892 C/T 1 49 28 77 23.0442219978926 14.8318731440614 8.21234885383123 T:C C T 10 0.529709755145049 0.067638490356854 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3611886 C/T 1 14 8 22 6.58406342796931 4.23767804116039 2.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.394835426805311 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3653525 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3653288_3653587:PIP5K1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3976705 C/T 1 3083 2948 6031 1449.90482488781 1561.5843581676 -111.679533279791 A:T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.00401794628105498 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3976055_3976745:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3976055_3976745:EEF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3977486 A/G 1 2229 2584 4813 1048.27695578169 1368.77000729481 -320.493051513121 A:T:C:G A G 10 0.529709755145049 2.46119530542314e-20 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3977426_3977608:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3977426_3977608:EEF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 3979408 A/G 1 1754 1732 3486 824.889089475584 917.457295911225 -92.5682064356409 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.00169464198170956 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3979327_3979434:EEF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C T C 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 44 42 86 20.6927707736178 22.2478097160921 -1.55503894247422 T:G G T 10 0.529709755145049 0.747079479776833 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4233095 T/C 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 T T 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4233096 G/A 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 G G 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4233107 C/T 1 12 1 13 5.64348293825941 0.529709755145049 5.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00410340758101103 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4234856 T/A 1 18 10 28 8.46522440738912 5.29709755145049 3.16812685593863 A:T T A 10 0.529709755145049 0.259768489558292 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 344 319 663 161.779844230103 168.977411891271 -7.19756766116751 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.58609407331485 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 404 374 778 189.9972589214 198.111448424248 -8.11418950284815 A:G A G 10 0.529709755145049 0.565689408020006 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 41 35 76 19.281900039053 18.5398414300767 0.742058608976272 T:C T C 10 0.529709755145049 0.908811752144201 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 39 43 82 18.3413195493431 22.7775194712371 -4.43619992189402 T:C C T 10 0.529709755145049 0.376273800771578 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 8 24 32 3.76232195883961 12.7130341234812 -8.95071216464157 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00207995793003437 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 30 14 44 14.1087073456485 7.41593657203069 6.69277077361784 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0492938471483001 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 27 50 77 12.6978366110837 26.4854877572525 -13.7876511461688 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00189911745072166 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 64 52 116 30.0985756707169 27.5449072675425 2.55366840317431 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.643361050960591 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 51 32 83 23.9848024876025 16.9507121646416 7.03409032296093 T:C C T 10 0.529709755145049 0.125212826921765 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 48 38 86 22.5739317530376 20.1289706955119 2.44496105752578 T:C T C 10 0.529709755145049 0.665971186192335 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 A:G A G 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 103 114 217 48.43989522006 60.3869120865356 -11.9470168664756 A:G G A 10 0.529709755145049 0.117593702805971 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 5696245 A/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 5707628 G/A 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:G G A 10 0.529709755145049 0.397869571967858 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 5785209 T/C 0 60 0 60 28.2174146912971 0 28.2174146912971 T T 10 0.529709755145049 2.91943149735508e-17 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5785151_5785286:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5785155_5785286:DUS3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 5908969 G/A 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000187650:ENST00000339485:exon_5908835_5910864:VMAC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6213104 G/A 1 25 28 53 11.7572561213738 14.8318731440614 -3.0746170226876 A:G G A 10 0.529709755145049 0.41210460888 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6212966_6213181:MLLT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 T:C T C 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6467910 T/C 1 156 125 281 73.3652781973723 66.2137193931311 7.15155880424122 T:C T C 10 0.529709755145049 0.403293142205742 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6467219_6468129:DENND1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 125 99 224 58.7862806068689 52.4412657593599 6.34501484750902 T:C T C 10 0.529709755145049 0.422049278669128 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G A G 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 902 855 1757 424.201800859166 452.901840649017 -28.7000397898512 A:G G A 10 0.529709755145049 0.173141897217732 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6667458 G/A 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:G G A 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6667424_6667460:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000366236:exon_6667424_6667460:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000326176:exon_6667424_6667460:TNFSF14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6743511 C/G 1 193 183 376 90.7660172570055 96.936885191544 -6.17086793453844 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.535546579332334 ENSG00000125733:ENST00000313285:exon_6743505_6743609:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000394404:exon_6743505_6743609:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000481339:exon_6743505_6743609:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000313244:exon_6743505_6743609:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000475024:exon_6743505_6743609:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000420690:exon_6743505_6743609:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000465190:exon_6743505_6743593:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000490384:exon_6743205_6743515:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000476297:exon_6743505_6743609:TRIP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6760974 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6772872 G/C 1 11 15 26 5.17319269340446 7.94564632717574 -2.77245363377128 C:G G C 10 0.529709755145049 0.327633282444792 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6772722_6773022:VAV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6847974 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 6848063 G/A 1 33 29 62 15.5195780802134 15.3615828992064 0.15799518100696 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6848009_6848125:VAV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7083629 A/G 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7083761 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7163140 T/G 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 T:G T G 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7163154 G/A 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7184518 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7184327_7184648:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7184327_7184648:INSR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7524846 C/T 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7528734 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7532252 G/C 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 C:G G C 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7532100_7532570:ARHGEF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7533850 A/G 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G A G 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7584223 A/G 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7703605 C/T 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.367831723277462 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 104 85 189 48.9101854649149 45.0253291873292 3.88485627758573 T:C T C 10 0.529709755145049 0.61019013403469 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 18 13 31 8.46522440738912 6.88622681688564 1.57899759050348 A:G G A 10 0.529709755145049 0.594825033868625 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 C:G G C 10 0.529709755145049 0.848789019043478 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7747293 T/G 1 326 346 672 153.314619822714 183.279575280187 -29.964955457473 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0225378917477971 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 749 571 1320 352.247393396358 302.464270187823 49.7831232085353 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00631992546164323 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7755285 A/G 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 A:G A G 10 0.529709755145049 0.819181859619382 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7761812 A/G 1 52 57 109 24.4550927324575 30.1934560432678 -5.73836331081034 A:G A G 10 0.529709755145049 0.29168755833699 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 7762440 C/T 1 1050 791 1841 493.804757097699 419.000416319734 74.8043407779647 A:T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.000500478010552544 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7762413_7762475:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7762413_7762475:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7762413_7762475:FCER2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 171 166 337 80.4196318701966 87.9318193540781 -7.51218748388153 A:G A G 10 0.529709755145049 0.413680861092714 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 9452698 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 39 72 111 18.3413195493431 38.1391023704435 -19.7977828211004 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000185011223771541 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 13 18 31 6.11377318311436 9.53477559261088 -3.42100240949652 A:T A T 10 0.529709755145049 0.280275685776745 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 188 158 346 88.4145660327308 83.6941413129178 4.72042471981302 T:C:G C G 10 0.529709755145049 0.62813972128427 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 44 46 90 20.6927707736178 24.3666487366723 -3.67387796305442 C:G C G 10 0.529709755145049 0.460897643519088 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 41 32 73 19.281900039053 16.9507121646416 2.33118787441142 T:C C T 10 0.529709755145049 0.639728165209837 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10225443 C/T 1 46 53 99 21.6333512633277 28.0746170226876 -6.44126575935985 T:C C T 10 0.529709755145049 0.226812982563754 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 464 549 1013 218.214673612697 290.810655574632 -72.5959819619347 A:G A G 10 0.529709755145049 5.63389929342739e-06 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10230550 T/C 1 133 114 247 62.5486025657085 60.3869120865356 2.16169047917289 T:C T C 10 0.529709755145049 0.799027460921032 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10230516_10230599:EIF3G;ENSG00000130811:ENST00000453552:exon_10230516_10230577:EIF3G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10421216 C/A 1 57 37 94 26.8065439567322 19.5992609403668 7.20728301636539 A:C C A 10 0.529709755145049 0.148417412958040 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10420233_10421281:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000493771:exon_10421099_10421318:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10420721_10421318:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10420893_10421318:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10421031_10421318:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10421149_10421318:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10421172_10421281:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10421185_10421318:FDX1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10433357 C/T 1 19 17 36 8.93551465224407 9.00506583746583 -0.0695511852217656 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10433321_10433415:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10433321_10433415:RAVER1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10449392 A/G 1 200 227 427 94.0580489709902 120.244114417926 -26.1860654469359 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0116644561591619 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 48 37 85 22.5739317530376 19.5992609403668 2.97467081267083 A:G A G 10 0.529709755145049 0.587216245807757 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 40 38 78 18.811609794198 20.1289706955119 -1.31736090131383 A:G A G 10 0.529709755145049 0.820820610799477 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 29 22 51 13.6384171007936 11.6536146131911 1.9848024876025 C:G G C 10 0.529709755145049 0.674323920913457 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 71 61 132 33.3906073847015 32.312295063848 1.07831232085353 A:G A G 10 0.529709755145049 0.86206708547485 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10668396 G/T 1 17 11 28 7.99493416253417 5.82680730659554 2.16812685593863 T:G G T 10 0.529709755145049 0.45357316422273 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 30 47 77 14.1087073456485 24.8963584918173 -10.7876511461688 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0161105316397452 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11221457 G/C 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 T:C T C 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11319491 G/A 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:G G A 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11461486 G/T 1 53 38 91 24.9253829773124 20.1289706955119 4.79641228180054 T:G G T 10 0.529709755145049 0.345176539819031 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11461484_11461679:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000418014:exon_11461484_11461791:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11461484_11461679:CCDC159 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11465533 C/T 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 T:C C T 10 0.529709755145049 0.371396387099242 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11547212 C/T 1 204 188 392 95.93920995041 99.5854339672692 -3.64622401685922 T:C C T 10 0.529709755145049 0.723396830753105 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11547210_11547326:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11547210_11547326:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11547210_11547326:PRKCSH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 T:C T C 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12060627 A/G 1 21 18 39 9.87609514195397 9.53477559261088 0.341319549343087 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12256358 T/G 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12501980 T/G 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:G T G 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000196466:ENST00000460935:exon_12500830_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000419318:exon_12500830_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000430385:exon_12501280_12503020:ZNF799;ENSG00000196466:ENST00000357979:exon_12501280_12503020:ZNF799 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12767849 C/A 1 55 39 94 25.8659634670223 20.6586804506569 5.20728301636539 A:C C A 10 0.529709755145049 0.302461084194699 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000433513:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000495617:exon_12767763_12767870:MAN2B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 77 95 172 36.2123488538312 50.3224267387797 -14.1100778849484 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0324855695506286 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 45 51 96 21.1630610184728 27.0151975123975 -5.85213649392471 A:G G A 10 0.529709755145049 0.260786751694869 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12779170 G/A 1 440 372 812 206.927707736178 197.052028913958 9.87567882222018 A:G G A 10 0.529709755145049 0.504213070653538 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12778881_12779239:C19orf56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12800597 T/C 1 12 16 28 5.64348293825941 8.47535608232078 -2.83187314406137 T:C T C 10 0.529709755145049 0.344783466591536 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800575_12800688:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800575_12800688:FBXW9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12805431 T/C 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12805525 G/C 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 C:G G C 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12807187 C/T 1 15 8 23 7.05435367282426 4.23767804116039 2.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.297928490380482 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12812169 A/G 1 13 24 37 6.11377318311436 12.7130341234812 -6.59926094036681 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0324999659804827 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12813683 T/C 1 21 17 38 9.87609514195397 9.00506583746583 0.871029304488136 T:C T C 10 0.529709755145049 0.871352391104054 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12826024 C/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:C C A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12917520 A/G 1 61 62 123 28.687704936152 32.842004818993 -4.15429988284103 A:G A G 10 0.529709755145049 0.470804328217039 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12920935 G/A 1 79 77 156 37.1529293435411 40.7876511461688 -3.63472180262765 A:G G A 10 0.529709755145049 0.575198122856394 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12921186 T/C 1 95 71 166 44.6775732612203 37.6093926152985 7.06818064592186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.277486462548406 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12921196 T/A 1 97 72 169 45.6181537509302 38.1391023704435 7.47905138048672 A:T T A 10 0.529709755145049 0.280631463805528 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 39 34 73 18.3413195493431 18.0101316749317 0.33118787441142 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 13010516 G/A 1 89 68 157 41.8558317920906 36.0202633498633 5.8355684422273 A:G G A 10 0.529709755145049 0.379424920952453 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 94 74 168 44.2072830163654 39.1985218807336 5.00876113563176 A:G A G 10 0.529709755145049 0.486794560836154 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 1102 1152 2254 518.259849830156 610.225637927096 -91.9657880969405 T:C:G G T 10 0.529709755145049 0.000111868136234340 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 13067792 G/C 1 181 222 403 85.1225343187461 117.595565642201 -32.4730313234548 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00137566061516469 ENSG00000179271:ENST00000316939:exon_13067677_13068050:GADD45GIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 39 31 70 18.3413195493431 16.4210024094965 1.92031713984657 A:G A G 10 0.529709755145049 0.719813311900803 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 13947292 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14038791 C/T 1 20 28 48 9.40580489709902 14.8318731440614 -5.42606824696235 T:C C T 10 0.529709755145049 0.147493092214535 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 50 47 97 23.5145122427475 24.8963584918173 -1.38184624906976 T:C T C 10 0.529709755145049 0.838956666380402 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14554346 G/A 1 20 24 44 9.40580489709902 12.7130341234812 -3.30722922638216 A:G G A 10 0.529709755145049 0.365674360174437 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14554282_14554433:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14554282_14554433:PKN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 241 218 459 113.339949010043 115.476726621621 -2.1367776115775 A:G A G 10 0.529709755145049 0.851730322607487 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 182 147 329 85.5928245636011 77.8673340063222 7.72549055727886 A:G A G 10 0.529709755145049 0.407709845302569 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14582539 C/T 1 144 119 263 67.7217952591129 63.0354608622608 4.6863343968521 T:C C T 10 0.529709755145049 0.578665011146355 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 T:C C T 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14627341 G/A 1 43 28 71 20.2224805287629 14.8318731440614 5.39060738470152 A:G G A 10 0.529709755145049 0.234465457458430 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14627278_14627858:DNAJB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 29 30 59 13.6384171007936 15.8912926543515 -2.25287555355789 A:G G A 10 0.529709755145049 0.60286434812681 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 117 111 228 55.0239586480293 58.7977828211004 -3.77382417307118 C:G G C 10 0.529709755145049 0.642565703508476 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 49 38 87 23.0442219978926 20.1289706955119 2.91525130238074 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.591623989470786 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 16 17 33 7.52464391767922 9.00506583746583 -1.48042191978662 A:C C A 10 0.529709755145049 0.606794931813472 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 44 35 79 20.6927707736178 18.5398414300767 2.15292934354112 A:G G A 10 0.529709755145049 0.653535030197 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 15565224 T/G 1 79 75 154 37.1529293435411 39.7282316358787 -2.57530229233755 T:G T G 10 0.529709755145049 0.68722754715922 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15565172_15565373:RASAL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 16197377 C/T 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.277880751215266 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 16633950 T/C 1 13 20 33 6.11377318311436 10.594195102901 -4.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.161986586127638 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16633863_16634101:CHERP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 16677289 C/A 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:C C A 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000127526:ENST00000488894:exon_16676039_16677468:SLC35E1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 16980668 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16980271_16980886:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16980271_16980886:SIN3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 26 31 57 12.2275463662287 16.4210024094965 -4.19345604326779 T:C C T 10 0.529709755145049 0.289777027507613 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 24 12 36 11.2869658765188 6.35651706174059 4.93044881477824 T:C C T 10 0.529709755145049 0.131919127220234 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17283657 C/T 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17283568_17283772:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17283568_17283772:MYO9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17305781 T/G 1 45 31 76 21.1630610184728 16.4210024094965 4.74205860897627 T:C:G T G 10 0.529709755145049 0.301986054225753 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 47 45 92 22.1036415081827 23.8369389815272 -1.73329747334451 T:C C T 10 0.529709755145049 0.754519519179753 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 41 40 81 19.281900039053 21.188390205802 -1.90649016674897 T:C T C 10 0.529709755145049 0.7386945368454 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 14 23 37 6.58406342796931 12.1833243683361 -5.59926094036681 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.0710883673689218 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17321669 A/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17322415 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17322769 G/A 1 68 59 127 31.9797366501367 31.2528755535579 0.726861096578773 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.929314788933301 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322704_17324103:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322704_17324103:MYO9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17322800 T/C 1 69 70 139 32.4500268949916 37.0796828601534 -4.62965596516182 T:C T C 10 0.529709755145049 0.445335471060602 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322704_17324103:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322704_17324103:MYO9B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 A:C C A 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17337557 G/T 1 11 22 33 5.17319269340446 11.6536146131911 -6.48042191978662 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0347531533720001 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 T:C C T 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17405510 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17405484_17405654:ABHD8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17516142 A/G 1 1000 958 1958 470.290244854951 507.461945428957 -37.171700574006 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.0938850913167952 ENSG00000130303:ENST00000416178:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000252593:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000446020:exon_17516100_17516427:BST2;ENSG00000130303:ENST00000527220:exon_17516100_17516339:BST2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 21 24 45 9.87609514195397 12.7130341234812 -2.83693898152721 A:G G A 10 0.529709755145049 0.456024691104992 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17664418 G/A 1 24 21 45 11.2869658765188 11.123904858046 0.163061018472794 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17688793 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17688766_17688898:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17688766_17688898:GLT25D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17836883 G/A 1 24 24 48 11.2869658765188 12.7130341234812 -1.42606824696235 A:G G A 10 0.529709755145049 0.77281522357758 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17941294 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 17942515 G/T 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17942483_17942607:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17942483_17942607:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000534444:exon_17942483_17942607:JAK3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18121154 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18121005_18121167:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18121005_18121167:ARRDC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18121466 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18121381_18121538:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18121381_18121538:ARRDC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C T C 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G G A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 1050 1042 2092 493.804757097699 551.957564861141 -58.1528077634426 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.0110582524020949 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 1046 1043 2089 491.923596118279 552.487274616286 -60.5636784980074 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00799860179930314 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 23 12 35 10.8166756316639 6.35651706174059 4.46015856992328 A:G A G 10 0.529709755145049 0.174742910219736 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 34 23 57 15.9898683250683 12.1833243683361 3.8065439567322 T:C C T 10 0.529709755145049 0.353867414334136 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 C:G G C 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18499151 C/T 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 40 60 100 18.811609794198 31.7825853087029 -12.9709755145049 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0118852348646988 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 18652521 G/A 1 267 232 499 125.567495376272 122.892663193651 2.67483218262053 A:G G A 10 0.529709755145049 0.822696066135459 ENSG00000105701:ENST00000222308:exon_18652489_18652805:FKBP8;ENSG00000105701:ENST00000453489:exon_18652489_18652805:FKBP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 175 211 386 82.3007928496164 111.768758335605 -29.4679654859889 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00305417839965254 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 19823270 T/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:T T A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 9 1 10 4.23261220369456 0.529709755145049 3.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0236718901176251 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G A G 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 21719719 T/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:T T A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 21909875 G/A 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:G G A 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 22 14 36 10.3463853868089 7.41593657203069 2.93044881477823 C:G G C 10 0.529709755145049 0.404405665752156 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 T:C T C 10 0.529709755145049 0.200137897636222 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 24310032 A/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 A:G G A 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 9 18 27 4.23261220369456 9.53477559261088 -5.30216338891632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0525611905584201 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 C:G G C 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 12 4 16 5.64348293825941 2.1188390205802 3.52464391767922 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0850631465658879 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 A:T T A 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:C A C 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33390796 G/A 1 7 14 21 3.29203171398466 7.41593657203069 -4.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0819766302290953 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33390763_33390904:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33390763_33390904:CCDC123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33467620 T/C 1 17 12 29 7.99493416253417 6.35651706174059 1.63841710079358 T:C T C 10 0.529709755145049 0.58147925745253 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33470874 A/G 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000131941:ENST00000254260:exon_33469499_33471162:RHPN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:C C A 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 23 23 46 10.8166756316639 12.1833243683361 -1.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.768168914109342 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33878198 A/G 1 28 37 65 13.1681268559386 19.5992609403668 -6.43113408442819 A:G A G 10 0.529709755145049 0.135371885595653 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33877865_33878387:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33877865_33878387:PEPD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 33878837 G/A 1 10 15 25 4.70290244854951 7.94564632717574 -3.24274387862623 A:G G A 10 0.529709755145049 0.230835807253919 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33878796_33878987:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33878796_33878987:PEPD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 88 108 196 41.3855415472357 57.2086535556653 -15.8231120084296 A:G A G 10 0.529709755145049 0.026345867450536 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 450 448 898 211.630610184728 237.309970304982 -25.679360120254 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0882280303414421 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 192 118 310 90.2957270121506 62.5057511071158 27.7899759050348 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.00171025862666668 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35175749 C/G 1 32 19 51 15.0492878353584 10.0644853477559 4.9848024876025 C:G C G 10 0.529709755145049 0.206350262551249 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 20 28 48 9.40580489709902 14.8318731440614 -5.42606824696235 T:C C T 10 0.529709755145049 0.147493092214535 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35233027 C/T 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 T:C C T 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35435006 G/A 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 26 32 58 12.2275463662287 16.9507121646416 -4.72316579841284 T:C T C 10 0.529709755145049 0.237304585368942 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 35 14 49 16.4601585699233 7.41593657203069 9.0442219978926 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00980449371660846 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 54 41 95 25.3956732221674 21.718099960947 3.67757326122034 C:G G C 10 0.529709755145049 0.473169800909706 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 165 156 321 77.5978904010669 82.6347218026277 -5.03683140156075 T:G T G 10 0.529709755145049 0.576591245841749 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 463 368 831 217.744383367842 194.933189893378 22.8111934744642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.117845070790121 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36038174 A/G 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 A:G A G 10 0.529709755145049 0.222987652351953 ENSG00000105677:ENST00000392205:exon_36038021_36038299:TMEM147 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 58 84 142 27.2768342015872 44.4956194321841 -17.218785230597 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00415683039362065 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 A:G A G 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36230174 T/C 1 132 96 228 62.0783123208535 50.8521364939247 11.2261758269288 T:C T C 10 0.529709755145049 0.144523755991569 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36530428 G/A 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.105144579901353 ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36594063 C/T 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594058_36594109:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594058_36594109:WDR62 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 36594853 G/A 1 15 8 23 7.05435367282426 4.23767804116039 2.81667563166387 A:G G A 10 0.529709755145049 0.297928490380482 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 T:C T C 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:C A C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 37118439 C/T 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 39 52 91 18.3413195493431 27.5449072675425 -9.20358771819946 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0586318618283591 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 38579544 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 71 72 143 33.3906073847015 38.1391023704435 -4.74849498574201 T:C T C 10 0.529709755145049 0.451318969933011 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 56 48 104 26.3362537118773 25.4260682469624 0.910185464914903 T:C C T 10 0.529709755145049 0.921831615553496 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 38817876 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000099337:ENST00000263372:exon_38817820_38819640:KCNK6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 38871622 C/T 1 216 203 419 101.582692888669 107.531080294445 -5.94838740577553 T:C C T 10 0.529709755145049 0.590397593844502 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38871539_38871639:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38871539_38871639:PSMD8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 194 183 377 91.2363075018605 96.936885191544 -5.70057768968348 A:T:G T G 10 0.529709755145049 0.570562425472918 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39360720 G/A 1 6 15 21 2.82174146912971 7.94564632717574 -5.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0287602099091276 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39907036 C/T 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000451354:exon_39906988_39907054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39906988_39907054:PLEKHG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 4436 3447 7883 2086.20752617656 1825.90952598498 260.298000191579 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 4.09575385754896e-09 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 4139 3522 7661 1946.53132345464 1865.63775762086 80.8935658337793 A:T:C:G A C 10 0.529709755145049 0.0653686283566818 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 3999 3415 7414 1880.69068917495 1808.95881382034 71.7318753546065 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 0.0961701775989328 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 48 41 89 22.5739317530376 21.718099960947 0.855831792090637 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.915568810958958 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 39976423 C/T 1 117 114 231 55.0239586480293 60.3869120865356 -5.36295343850632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.509951758515113 ENSG00000105197:ENST00000314349:exon_39976328_39976447:TIMM50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 40030615 G/A 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 A:G G A 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 40719410 C/T 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.435503028968305 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 69 67 136 32.4500268949916 35.4905535947183 -3.04052669972667 A:G A G 10 0.529709755145049 0.607417809401799 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 40964447 C/T 1 41 25 66 19.281900039053 13.2427438786262 6.03915616042676 T:C C T 10 0.529709755145049 0.141004043100483 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 41174013 G/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105245:ENST00000252891:exon_41171810_41174043:NUMBL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 15 8 23 7.05435367282426 4.23767804116039 2.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.297928490380482 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 41220529 C/T 1 13 5 18 6.11377318311436 2.64854877572525 3.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154758627526364 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41220436_41220540:ADCK4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 41313202 C/A 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:C C A 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44500701 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 13 16 29 6.11377318311436 8.47535608232078 -2.36158289920642 T:G T G 10 0.529709755145049 0.45783598473891 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 A:C C A 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44535999 G/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:G G T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44981375 T/C 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C T C 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 C:G C G 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 50 62 112 23.5145122427475 32.842004818993 -9.32749257624549 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.0881205782311005 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45476422 T/C 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 T:C T C 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 26 17 43 12.2275463662287 9.00506583746583 3.22248052876289 T:C T C 10 0.529709755145049 0.361505086251554 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 38 30 68 17.8710293044881 15.8912926543515 1.97973665013667 T:G T G 10 0.529709755145049 0.715834498630197 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 44 28 72 20.6927707736178 14.8318731440614 5.86089762955647 A:G G A 10 0.529709755145049 0.193993058596641 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45867259 C/T 1 30 19 49 14.1087073456485 10.0644853477559 4.0442219978926 T:C C T 10 0.529709755145049 0.256344236515444 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45867244_45867377:ERCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45895269 G/A 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 A:G G A 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000104881:ENST00000418234:exon_45895138_45895598:PPP1R13L;ENSG00000104881:ENST00000360957:exon_45895138_45895598:PPP1R13L;ENSG00000104881:ENST00000221478:exon_45895138_45895638:PPP1R13L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 37 25 62 17.4007390596332 13.2427438786262 4.15799518100696 A:C C A 10 0.529709755145049 0.310794437042138 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 45 44 89 21.1630610184728 23.3072292263822 -2.14416820790937 A:G A G 10 0.529709755145049 0.672001241590571 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46124531 G/A 1 38 34 72 17.8710293044881 18.0101316749317 -0.139102370443531 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46180150 A/G 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G A G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46205050 T/C 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 48 54 102 22.5739317530376 28.6043267778326 -6.030395024795 A:G G A 10 0.529709755145049 0.235667396326214 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46289503 C/T 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46289509 G/A 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46294136 G/A 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.43903950278177 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 164 118 282 77.127600156212 62.5057511071158 14.6218490490962 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.083764736604709 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 46850355 T/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46850251_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46850354_46850474:PPP5C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47127324 C/G 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 C:G C G 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47126715_47127494:PTGIR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 84 94 178 39.5043805678159 49.7927169836346 -10.2883364158187 A:G G A 10 0.529709755145049 0.133121765814711 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 C:G G C 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47589655 C/G 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 C:G C G 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47589641_47589795:ZC3H4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 20 27 47 9.40580489709902 14.3021633889163 -4.8963584918173 C:G G C 10 0.529709755145049 0.188056626509169 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 44 24 68 20.6927707736178 12.7130341234812 7.97973665013667 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0676228184454747 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47770032 C/T 1 51 25 76 23.9848024876025 13.2427438786262 10.7420586089763 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0153995612276248 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 35 16 51 16.4601585699233 8.47535608232078 7.9848024876025 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0252423905181161 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47858489 C/G 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 C:G C G 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47858296_47858607:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47858296_47858607:DHX34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 47987265 G/A 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 A:G G A 10 0.529709755145049 0.371396387099242 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47987192_47987521:KPTN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 288 289 577 135.443590518226 153.086119236919 -17.6425287186933 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.144490162198874 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48255828 C/T 1 365 413 778 171.655939372057 218.770128874905 -47.1141895028481 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000730428959831838 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48558286 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48558135_48558306:PLA2G4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48598823 A/G 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 A:G A G 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48598721_48598861:PLA2G4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 17 3 20 7.99493416253417 1.58912926543515 6.40580489709902 T:C T C 10 0.529709755145049 0.005637963242879 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48602933 T/C 1 7 20 27 3.29203171398466 10.594195102901 -7.30216338891632 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00607339916180989 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 C:G C G 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48836673 G/T 1 5 13 18 2.35145122427475 6.88622681688564 -4.53477559261088 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0352979763433676 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 22 19 41 10.3463853868089 10.0644853477559 0.281900039052989 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 27 21 48 12.6978366110837 11.123904858046 1.57393175303765 A:G G A 10 0.529709755145049 0.667572509427087 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49416456 G/A 0 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 16 10 26 7.52464391767922 5.29709755145049 2.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.435653149735385 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49838891 C/A 1 19 2 21 8.93551465224407 1.0594195102901 7.87609514195397 A:C C A 10 0.529709755145049 0.000585436573392631 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 920 683 1603 432.667025266555 361.791762764068 70.8752625024864 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000415493042494966 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49949652 G/A 1 126 66 192 59.2565708517238 34.9608438395732 24.2957270121506 A:G G A 10 0.529709755145049 0.000488761160835783 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 111 81 192 52.2022171788996 42.906490166749 9.29572701215059 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.193226205198126 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 109 80 189 51.2616366891897 42.3767804116039 8.88485627758573 T:G T G 10 0.529709755145049 0.215406921339058 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 C:G C G 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 18 18 36 8.46522440738912 9.53477559261088 -1.06955118522177 T:G T G 10 0.529709755145049 0.741182689376126 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 20 25 45 9.40580489709902 13.2427438786262 -3.83693898152721 T:C C T 10 0.529709755145049 0.296234181328756 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 20 22 42 9.40580489709902 11.6536146131911 -2.24780971609206 A:G G A 10 0.529709755145049 0.537869099245852 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50161091 A/G 1 98 111 209 46.0884439957852 58.7977828211004 -12.7093388253152 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0832135009272488 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50161018_50161146:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50161018_50161146:SCAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 187 152 339 87.9442757878758 80.5158827820475 7.42839300582837 A:C:G C G 10 0.529709755145049 0.44629648932622 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50166714 T/C 1 84 75 159 39.5043805678159 39.7282316358787 -0.2238510680628 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50166600_50166771:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50166600_50166771:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50166600_50166771:IRF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 32 23 55 15.0492878353584 12.1833243683361 2.8659634670223 T:C T C 10 0.529709755145049 0.500182086466259 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50434197 C/T 1 312 350 662 146.730556394745 185.398414300767 -38.6678579060225 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.00270309244984601 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50433989_50434285:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50433989_50434285:ATF5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50435755 C/A 1 128 75 203 60.1971513414337 39.7282316358787 20.468919705555 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00391476068471119 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50865535 A/G 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50865429_50865570:NAPSA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 20 14 34 9.40580489709902 7.41593657203069 1.98986832506833 A:G G A 10 0.529709755145049 0.606972054310593 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 21 16 37 9.87609514195397 8.47535608232078 1.40073905963319 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742600638199334 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50909765 C/T 1 50 57 107 23.5145122427475 30.1934560432678 -6.67894380052024 T:C C T 10 0.529709755145049 0.208630011106739 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50909664_50909774:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50909664_50909774:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50909664_50909774:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50909664_50909774:POLD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 115 90 205 54.0833781583194 47.6738779630544 6.40950019526495 T:C T C 10 0.529709755145049 0.401246683067896 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 288 245 533 135.443590518226 129.778890010537 5.66470050768885 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.633352653342568 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 302 201 503 142.027653946195 106.471660784155 35.5559931620403 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00150163075024319 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 146 129 275 68.6623757488228 68.3325584137113 0.329817335111514 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51323378 C/T 1 15 14 29 7.05435367282426 7.41593657203069 -0.361582899206422 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51323676 C/T 1 90 83 173 42.3261220369456 43.9659096770391 -1.63978764009349 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819570892396979 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51379893 C/T 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000167751:ENST00000325321:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000358049:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000423722:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000391810:exon_51379728_51380014:KLK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51917735 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51917676_51917769:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51917676_51917769:SIGLEC10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 51920850 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51920799_51921057:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51920799_51920965:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51920799_51921451:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51920799_51920890:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51920799_51920896:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51920799_51920896:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51920799_51920991:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51920799_51920952:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000529627:exon_51920799_51920965:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000524527:exon_51920799_51920885:SIGLEC10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 52448384 T/C 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G A G 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 52538278 A/C 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:C A C 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 52618044 C/T 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 0 0 15 15 0 7.94564632717574 -7.94564632717574 C T C 10 0.529709755145049 1.21755771023775e-05 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 53268810 G/A 1 27 41 68 12.6978366110837 21.718099960947 -9.02026334986333 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0291905920358446 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 53269614 G/A 1 24 22 46 11.2869658765188 11.6536146131911 -0.366648736672255 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 53572494 G/T 1 11 3 14 5.17319269340446 1.58912926543515 3.58406342796931 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0634340540694462 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 53572917 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 53577419 G/C 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 C:G G C 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 53959274 C/T 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.765199156248919 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 54705340 C/G 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 C:G C G 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 87 90 177 40.9152513023807 47.6738779630544 -6.75862666067368 T:G T G 10 0.529709755145049 0.327919657893 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 26 17 43 12.2275463662287 9.00506583746583 3.22248052876289 A:G G A 10 0.529709755145049 0.361505086251554 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 36 29 65 16.9304488147782 15.3615828992064 1.56886591557181 C:G C G 10 0.529709755145049 0.711420394461934 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 12 25 37 5.64348293825941 13.2427438786262 -7.59926094036681 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0133544486690547 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 54974068 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 62 66 128 29.157995181007 34.9608438395732 -5.80284865856628 A:G A G 10 0.529709755145049 0.330310704389257 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55493651 C/T 0 24 0 24 11.2869658765188 0 11.2869658765188 C C 10 0.529709755145049 2.51885276281317e-07 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55494632 A/G 1 28 2 30 13.1681268559386 1.0594195102901 12.1087073456485 A:G A G 10 0.529709755145049 2.89662267529314e-06 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55494651 A/G 1 2 24 26 0.940580489709902 12.7130341234812 -11.7724536337713 A:G A G 10 0.529709755145049 1.40812955931935e-06 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 1 35 36 0.470290244854951 18.5398414300767 -18.0695511852218 C:G C G 10 0.529709755145049 6.66392341315447e-11 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55501579 A/C 1 1 10 11 0.470290244854951 5.29709755145049 -4.82680730659554 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00425406518869011 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 2 51 53 0.940580489709902 27.0151975123975 -26.0746170226876 A:C C A 10 0.529709755145049 1.01788854421179e-14 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 3 69 72 1.41087073456485 36.5499731050084 -35.1391023704435 T:G T G 10 0.529709755145049 2.41297114511180e-19 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 9 12 21 4.23261220369456 6.35651706174059 -2.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.387997640442352 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55559740 G/A 1 16 10 26 7.52464391767922 5.29709755145049 2.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.435653149735385 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55568047 C/A 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 A:C C A 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55568021_55568176:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55568021_55568176:RDH13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 12 22 34 5.64348293825941 11.6536146131911 -6.01013167493167 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0571490571490677 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55739689 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55899620 C/T 1 3554 3739 7293 1671.4115302145 1980.58477448734 -309.173244272843 T:C:G C T 10 0.529709755145049 4.42888150073669e-13 ENSG00000108107:ENST00000344063:exon_55899611_55903449:RPL28;ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 55998262 C/T 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 T:C C T 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 23 30 53 10.8166756316639 15.8912926543515 -5.0746170226876 T:C C T 10 0.529709755145049 0.170981235984758 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 20 10 30 9.40580489709902 5.29709755145049 4.10870734564853 T:G G T 10 0.529709755145049 0.146473133160998 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 25 22 47 11.7572561213738 11.6536146131911 0.103641508182696 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 27 26 53 12.6978366110837 13.7724536337713 -1.0746170226876 A:G G A 10 0.529709755145049 0.784704843120088 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 34 23 57 15.9898683250683 12.1833243683361 3.8065439567322 A:G G A 10 0.529709755145049 0.353867414334136 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 65 56 121 30.5688659155718 29.6637462881227 0.905119627449068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.9275048121969 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 307 277 584 144.37910517047 146.729602175179 -2.35049700470861 T:C C T 10 0.529709755145049 0.868327549482206 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56599405 C/G 1 17 34 51 7.99493416253417 18.0101316749317 -10.0151975123975 C:G C G 10 0.529709755145049 0.00707562113124828 ENSG00000142409:ENST00000270459:exon_56598732_56600461:ZNF787 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56733460 C/T 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000131848:ENST00000254165:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A;ENSG00000131848:ENST00000391713:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 57705281 C/T 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57705243_57705369:ZNF264 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 57705425 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58058536 A/G 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58117399 C/T 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000183647:ENST00000332854:exon_58117054_58119637:ZNF530 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58131623 G/A 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 12 3 15 5.64348293825941 1.58912926543515 4.05435367282426 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0398956902314144 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 15 8 23 7.05435367282426 4.23767804116039 2.81667563166387 C:G G C 10 0.529709755145049 0.297928490380482 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 14 9 23 6.58406342796931 4.76738779630544 1.81667563166387 T:C T C 10 0.529709755145049 0.533407999946811 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 10 15 25 4.70290244854951 7.94564632717574 -3.24274387862623 T:C T C 10 0.529709755145049 0.230835807253919 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58213952 C/A 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:C C A 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000249233:ENST00000512439:exon_58213003_58214156:ZNF154 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58291082 T/C 1 25 35 60 11.7572561213738 18.5398414300767 -6.78258530870294 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0923823523457976 ENSG00000083828:ENST00000396154:exon_58290119_58291984:ZNF586 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 27 30 57 12.6978366110837 15.8912926543515 -3.19345604326779 A:G A G 10 0.529709755145049 0.42750593493581 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G G A 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 11 3 14 5.17319269340446 1.58912926543515 3.58406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0634340540694462 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 0 10 0 10 4.70290244854951 0 4.70290244854951 A A 10 0.529709755145049 0.00226856945961777 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 0 9 0 9 4.23261220369456 0 4.23261220369456 A A 10 0.529709755145049 0.0044089015254185 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 19 58945089 A/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000131849:ENST00000254166:exon_58944182_58946578:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000391695:exon_58944768_58945214:ZNF132;ENSG00000131849:ENST00000418193:exon_58944768_58945209:ZNF132 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 224919 A/G 1 9 1 10 4.23261220369456 0.529709755145049 3.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0236718901176251 ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_224868_224920:SH3YL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 16 23 39 7.52464391767922 12.1833243683361 -4.65868045065691 T:C C T 10 0.529709755145049 0.150191051412028 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 163 148 311 76.657309911357 78.3970437614673 -1.73973385011026 A:G A G 10 0.529709755145049 0.864763853099996 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 277314 G/A 1 244 218 462 114.750819744608 115.476726621621 -0.725906877012648 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.962843035208065 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_277227_278283:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_277227_278283:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_277227_277506:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_277227_277503:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_277227_277375:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_277227_277369:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_277227_277506:ACP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 23 12 35 10.8166756316639 6.35651706174059 4.46015856992328 T:C T C 10 0.529709755145049 0.174742910219736 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 10264936 T/C 1 61 46 107 28.687704936152 24.3666487366723 4.32105619947975 T:C T C 10 0.529709755145049 0.438976633187717 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10264844_10264977:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10264844_10264977:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498235:exon_10264844_10264977:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10264844_10264977:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10264844_10265005:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000474701:exon_10264844_10264977:RRM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 52 42 94 24.4550927324575 22.2478097160921 2.20728301636539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.680271134172039 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 143 163 306 67.251505014258 86.342690088643 -19.091185074385 T:C C T 10 0.529709755145049 0.029570309876544 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 59 49 108 27.7471244464421 25.9557780021074 1.79134644433471 T:C C T 10 0.529709755145049 0.772826025566379 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 11913845 G/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 C:G G C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000134324:ENST00000396099:exon_11913746_11913871:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000396098:exon_11913746_11913871:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000256720:exon_11913746_11913871:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000449576:exon_11913746_11913871:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000425416:exon_11913746_11913871:LPIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 11927238 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000134324:ENST00000396099:exon_11927200_11927293:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000256720:exon_11927200_11927293:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000449576:exon_11927200_11927293:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000425416:exon_11927200_11927293:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000396097:exon_11927200_11927293:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000464953:exon_11927173_11927293:LPIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 28 23 51 13.1681268559386 12.1833243683361 0.984802487602499 T:C T C 10 0.529709755145049 0.888630801952584 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 23 20 43 10.8166756316639 10.594195102901 0.22248052876289 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 17889918 C/T 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 T:C C T 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17889906_17890020:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17889906_17890020:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17889906_17890020:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17889906_17890020:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17889906_17890020:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000430591:exon_17889906_17890020:SMC6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 17962518 C/T 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 T:C C T 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 8 14 22 3.76232195883961 7.41593657203069 -3.65361461319108 T:C C T 10 0.529709755145049 0.137191946239842 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 12 24 36 5.64348293825941 12.7130341234812 -7.06955118522176 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0195520817013433 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 T:G T G 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 26357809 C/A 1 69 69 138 32.4500268949916 36.5499731050084 -4.09994621001677 A:C C A 10 0.529709755145049 0.496121486003218 ENSG00000084733:ENST00000495146:exon_26357807_26358216:RAB10;ENSG00000084733:ENST00000264710:exon_26357807_26360323:RAB10;ENSG00000084733:ENST00000462003:exon_26357807_26357905:RAB10;ENSG00000084733:ENST00000473035:exon_26357807_26357937:RAB10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27423913 G/A 1 34 22 56 15.9898683250683 11.6536146131911 4.33625371187725 A:G G A 10 0.529709755145049 0.284669432965892 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27423866_27423981:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27423866_27423981:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27423866_27423981:SLC5A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27424496 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27430237 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000445802:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000401463:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000432106:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000426119:exon_27430172_27430658:SLC5A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27439751 G/T 1 156 144 300 73.3652781973723 76.2782047408871 -2.91292654351471 T:G G T 10 0.529709755145049 0.772499703209259 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27445518 A/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27445387_27445528:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27445387_27445528:CAD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 38 15 53 17.8710293044881 7.94564632717574 9.9253829773124 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00830031397471741 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27462651 T/C 1 28 39 67 13.1681268559386 20.6586804506569 -7.49055359471829 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0858698884652683 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 51 49 100 23.9848024876025 25.9557780021074 -1.9709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.763945921779517 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27589810 T/C 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27676287 A/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000425023:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000450564:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000443889:exon_27676251_27676380:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000475909:exon_27676251_27676380:IFT172 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27865325 A/G 1 29 28 57 13.6384171007936 14.8318731440614 -1.19345604326779 A:G A G 10 0.529709755145049 0.791547052727124 ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27865296_27865386:ZNF512;ENSG00000198522:ENST00000515877:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000503738:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000424214:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000407583:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000461249:exon_27865296_27865386:GPN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27883958 C/T 1 31 27 58 14.5789975905035 14.3021633889163 0.276834201587157 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000119760:ENST00000337768:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000406540:exon_27883851_27885148:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000405491:exon_27883851_27884468:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000404798:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000464789:exon_27883629_27884468:SUPT7L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 27886820 G/T 1 17 10 27 7.99493416253417 5.29709755145049 2.69783661108368 T:G G T 10 0.529709755145049 0.33894228949908 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 29356669 A/G 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G A G 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 48 44 92 22.5739317530376 23.3072292263822 -0.733297473344511 T:C T C 10 0.529709755145049 0.916993753848321 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 38 29 67 17.8710293044881 15.3615828992064 2.50944640528171 T:C C T 10 0.529709755145049 0.624791682746408 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 T:C T C 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 37230734 C/T 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C C T 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 37323427 A/G 1 19 21 40 8.93551465224407 11.123904858046 -2.18839020580196 A:G A G 10 0.529709755145049 0.528559104738777 ENSG00000152133:ENST00000409774:exon_37323351_37326387:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000379187:exon_37323351_37323738:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000281932:exon_37323351_37326387:CCDC75;ENSG00000152133:ENST00000379184:exon_37323351_37323738:CCDC75 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 37456032 C/T 1 65 64 129 30.5688659155718 33.9014243292831 -3.33255841371133 T:C C T 10 0.529709755145049 0.596944732478649 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000446769:exon_37455751_37456179:CEBPZ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 38537579 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38537451_38537589:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38537451_38537589:ATL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 39006117 T/C 1 21 62 83 9.87609514195397 32.842004818993 -22.9659096770391 T:C T C 10 0.529709755145049 3.98069105621804e-07 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39006114_39006260:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39006114_39006260:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39006114_39006260:GEMIN6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 42515388 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 T:G T G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 14 2 16 6.58406342796931 1.0594195102901 5.52464391767922 A:T T A 10 0.529709755145049 0.00519939892864728 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 43797619 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43797527_43797654:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43797527_43797649:THADA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 46770155 G/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000119729:ENST00000238738:exon_46769867_46770327:RHOQ;ENSG00000119729:ENST00000432183:exon_46769875_46770327:RHOQ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 C:G G C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 47273511 C/T 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000496991:exon_47273453_47273570:TTC7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 47698179 A/G 1 15 27 42 7.05435367282426 14.3021633889163 -7.24780971609206 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0297985910156332 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000406134:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47698104_47698201:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47698104_47698201:MSH2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 48018081 A/G 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 A:G A G 10 0.529709755145049 0.222987652351953 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48018066_48018262:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48018066_48018262:MSH6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 48030838 A/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:T A T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:C T C 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 54849508 A/G 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 A:G A G 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54849437_54849624:SPTBN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 32 34 66 15.0492878353584 18.0101316749317 -2.96084383957324 T:C C T 10 0.529709755145049 0.537857813624754 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55277208 G/C 1 28 34 62 13.1681268559386 18.0101316749317 -4.84200481899304 C:G G C 10 0.529709755145049 0.252306270569055 ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55276881_55277680:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55276881_55277680:RTN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55461991 A/C 1 199 362 561 93.5877587261352 191.754931362508 -98.1671726363725 A:C A C 10 0.529709755145049 8.36725937466098e-17 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000449323:exon_55461967_55462095:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000497083:exon_55461967_55462003:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000478196:exon_55461967_55462320:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55461255_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000468810:exon_55461967_55462059:RPS27A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55462523 G/A 1 21 22 43 9.87609514195397 11.6536146131911 -1.77751947123711 A:G G A 10 0.529709755145049 0.647821327723492 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 61 21 82 28.687704936152 11.123904858046 17.563800078106 T:C C T 10 0.529709755145049 8.81093011552004e-05 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 T:C:G G T 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55561896 A/G 1 160 204 364 75.2464391767922 108.06079004959 -32.8143508727978 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.00062622869911577 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55561230_55562300:CCDC88A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 98 68 166 46.0884439957852 36.0202633498633 10.0681806459219 A:G A G 10 0.529709755145049 0.120526746055094 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 10 15 25 4.70290244854951 7.94564632717574 -3.24274387862623 T:C T C 10 0.529709755145049 0.230835807253919 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55874559 C/T 1 12 20 32 5.64348293825941 10.594195102901 -4.95071216464157 T:C C T 10 0.529709755145049 0.109571966654361 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55874482_55874588:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55874482_55874588:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55874482_55874588:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55874482_55874588:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55874478_55874588:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55874536_55874588:PNPT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:G G T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 T:C T C 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 44 31 75 20.6927707736178 16.4210024094965 4.27176836412132 A:G A G 10 0.529709755145049 0.35563807872209 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 58350340 T/C 1 38 29 67 17.8710293044881 15.3615828992064 2.50944640528171 T:C T C 10 0.529709755145049 0.624791682746408 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58350236_58350368:VRK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 70 70 140 32.9203171398466 37.0796828601534 -4.15936572030687 A:G A G 10 0.529709755145049 0.498950155237814 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 58688709 C/A 0 58 0 58 27.2768342015872 0 27.2768342015872 C C 10 0.529709755145049 1.05264487885624e-16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 61175312 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000162927:ENST00000316752:exon_61175178_61175320:PUS10;ENSG00000162927:ENST00000407787:exon_61175178_61175320:PUS10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 73 68 141 34.3311878744114 36.0202633498633 -1.68907547545192 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.800523977378525 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 11 20 31 5.17319269340446 10.594195102901 -5.42100240949652 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0703549698551275 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 61450454 A/G 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G A G 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000115464:ENST00000487547:exon_61450383_61450796:USP34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 61632918 T/C 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61632843_61633263:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61632908_61632940:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61632908_61632940:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61632843_61633263:USP34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 61647901 A/G 1 7 11 18 3.29203171398466 5.82680730659554 -2.53477559261088 A:G A G 10 0.529709755145049 0.247451477742465 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61647881_61647968:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453133:exon_61647881_61647968:USP34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 64321823 A/G 1 13 19 32 6.11377318311436 10.0644853477559 -3.95071216464157 A:G A G 10 0.529709755145049 0.214521438123880 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64319786_64322402:PELI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 64780144 A/G 1 40 41 81 18.811609794198 21.718099960947 -2.90649016674897 A:G A G 10 0.529709755145049 0.578155431350169 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409183:exon_64779646_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000487769:exon_64780010_64780543:AFTPH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 23 12 35 10.8166756316639 6.35651706174059 4.46015856992328 A:G G A 10 0.529709755145049 0.174742910219736 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 31 25 56 14.5789975905035 13.2427438786262 1.33625371187726 A:G G A 10 0.529709755145049 0.789463788375016 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 65299298 C/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:C C A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 65299300 G/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 C:G G C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C T C 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 67630476 T/C 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 67631129 G/A 1 15 3 18 7.05435367282426 1.58912926543515 5.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00938965043457943 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 67631395 G/A 1 12 5 17 5.64348293825941 2.64854877572525 2.99493416253417 A:G G A 10 0.529709755145049 0.223479807498147 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 67632214 C/T 1 24 16 40 11.2869658765188 8.47535608232078 2.81160979419804 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.429791763866838 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1;ENSG00000143971:ENST00000462772:exon_67632129_67632467:ETAA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 8 13 21 3.76232195883961 6.88622681688564 -3.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 0.194002803571841 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 52 46 98 24.4550927324575 24.3666487366723 0.0884439957851946 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 122 109 231 57.375409872304 57.7383633108103 -0.362953438506324 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 161 129 290 75.7167294216471 68.3325584137113 7.38417100793578 C:G G C 10 0.529709755145049 0.41029188746392 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 71417065 G/T 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:G G T 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 71429725 T/C 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71429582_71429730:PAIP2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 78 64 142 36.6826390986862 33.9014243292831 2.78121476940304 A:G G A 10 0.529709755145049 0.674652706220363 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 73455600 C/T 1 14 22 36 6.58406342796931 11.6536146131911 -5.06955118522177 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0970215350729815 ENSG00000135617:ENST00000258083:exon_73455134_73455702:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000480093:exon_73455459_73455702:C2orf7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 73826591 A/T 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:T A T 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73826528_73826648:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73826528_73826648:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73826528_73826648:ALMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 A:G G A 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 73829372 C/T 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 12 19 31 5.64348293825941 10.0644853477559 -4.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 0.148991251328343 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 96 82 178 45.1478635060753 43.436199921894 1.71166358418127 T:C T C 10 0.529709755145049 0.822054747074724 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 41 42 83 19.281900039053 22.2478097160921 -2.96590967703907 T:G T G 10 0.529709755145049 0.582727291379165 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85628983 C/T 1 99 81 180 46.5587342406401 42.906490166749 3.65224407389118 T:C C T 10 0.529709755145049 0.601891084752041 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 79 94 173 37.1529293435411 49.7927169836346 -12.6397876400935 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0569700826043637 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 A:G A G 10 0.529709755145049 0.832974819109744 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 422 320 742 198.462483328789 169.507121646416 28.9553616823736 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0359899812694989 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 387 339 726 182.002324758866 179.571606994172 2.43071776469441 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.881793361189232 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 441 342 783 207.397997981033 181.160736259607 26.2372617214266 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0626323056164452 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 587 449 1036 276.060373729856 237.839680060127 38.2206936697292 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0179828868230771 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 85843431 C/T 1 19 11 30 8.93551465224407 5.82680730659554 3.10870734564853 T:C C T 10 0.529709755145049 0.277585425247202 ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85843215_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85843266_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000455732:exon_85843275_85843579:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85843275_85843435:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85843292_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85843309_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85843310_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85843317_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85843413_85843586:USP39 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86259443 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86259395_86259505:POLR1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 181 132 313 85.1225343187461 69.9216876791465 15.2008466395996 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0893982101807597 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86400824 G/A 1 57 63 120 26.8065439567322 33.3717145741381 -6.56517061740588 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.235741255417972 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86400773_86400885:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86400773_86400884:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86400631_86400884:IMMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 88 125 213 41.3855415472357 66.2137193931311 -24.8281778458954 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000737787087759053 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86683642 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86683565_86683689:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000463013:exon_86683565_86683778:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86683556_86683689:KDM3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86691250 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86691176_86691339:KDM3A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 86979093 G/A 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_86979019_86979153:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000466417:exon_86979019_86979153:RMND5A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 16 20 36 7.52464391767922 10.594195102901 -3.06955118522177 A:C C A 10 0.529709755145049 0.320976259820328 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 89160785 T/C 0 18 0 18 8.46522440738912 0 8.46522440738912 T T 10 0.529709755145049 1.20480548160264e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 89160789 C/G 0 18 0 18 8.46522440738912 0 8.46522440738912 C C 10 0.529709755145049 1.20480548160264e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 96950323 C/T 1 68 40 108 31.9797366501367 21.188390205802 10.7913464443347 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0425866209507219 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96950096_96950323:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96950096_96950461:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480242:exon_96949551_96950612:SNRNP200 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 99224820 G/T 1 50 47 97 23.5145122427475 24.8963584918173 -1.38184624906976 T:G G T 10 0.529709755145049 0.838956666380402 ENSG00000183513:ENST00000328709:exon_99224770_99224955:C2orf64;ENSG00000183513:ENST00000483527:exon_99224726_99224970:C2orf64;ENSG00000183513:ENST00000409997:exon_99224770_99224978:C2orf64 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 99978048 G/A 1 435 353 788 204.576256511904 186.987543566202 17.5887129457014 A:G G A 10 0.529709755145049 0.211836866245680 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 136 130 266 63.9594733002733 68.8622681688564 -4.90279486858304 T:C T C 10 0.529709755145049 0.580494289777796 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 31 43 74 14.5789975905035 22.7775194712371 -8.19852188073363 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0623566955818107 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 13 5 18 6.11377318311436 2.64854877572525 3.46522440738912 T:C T C 10 0.529709755145049 0.154758627526364 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 9 13 22 4.23261220369456 6.88622681688564 -2.65361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.290050920028368 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 53 10 63 24.9253829773124 5.29709755145049 19.6282854258619 T:C C T 10 0.529709755145049 3.44878029504744e-07 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 109381438 A/G 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109379693_109384844:RANBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 109429146 T/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:T T A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109429087_109429164:CCDC138 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 110343382 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000186522:ENST00000334001:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000352314:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000397712:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000356688:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000397714:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000437928:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000415095:exon_110343298_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000411469:exon_110343297_110343415:SEPT10;ENSG00000186522:ENST00000442746:exon_110343303_110343415:SEPT10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 12 25 37 5.64348293825941 13.2427438786262 -7.59926094036681 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0133544486690547 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 15 23 38 7.05435367282426 12.1833243683361 -5.12897069551186 C:G G C 10 0.529709755145049 0.105371063170614 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:G A G 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 55 30 85 25.8659634670223 15.8912926543515 9.97467081267083 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.0383371171251729 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 114709476 A/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115091:ENST00000478928:exon_114709297_114713283:ACTR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 149 94 243 70.0732464833877 49.7927169836346 20.2805294997531 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0100287456473565 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 58 44 102 27.2768342015872 23.3072292263822 3.969604975205 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487685388239103 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 120078731 A/G 1 27 37 64 12.6978366110837 19.5992609403668 -6.90142432928314 A:G A G 10 0.529709755145049 0.102897144248858 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 122485389 G/A 1 210 292 502 98.7609514195397 154.675248502354 -55.9142970828146 A:G G A 10 0.529709755145049 6.32692767723599e-07 ENSG00000155438:ENST00000285814:exon_122484521_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000417799:exon_122484626_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000423105:exon_122484923_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000481978:exon_122485252_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000498570:exon_122485307_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000447132:exon_122485373_122485488:MKI67IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 128281281 C/T 1 23 27 50 10.8166756316639 14.3021633889163 -3.48548775725245 T:C C T 10 0.529709755145049 0.326075872724171 ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128281252_128281367:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128281252_128281367:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128281252_128281367:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000409725:exon_128281252_128281367:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000460511:exon_128281252_128281367:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000483889:exon_128281252_128281367:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000436740:exon_128281252_128281367:IWS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 128495645 G/A 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.190312819130244 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 20 23 43 9.40580489709902 12.1833243683361 -2.77751947123711 T:C C T 10 0.529709755145049 0.446170174078195 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 128939799 C/T 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 131103635 C/T 1 204 190 394 95.93920995041 100.644853477559 -4.70564352714932 T:C C T 10 0.529709755145049 0.649845676266147 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103591_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460100:exon_131103591_131103822:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103352_131103685:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000475074:exon_131103518_131103685:IMP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 144194565 C/T 1 55 47 102 25.8659634670223 24.8963584918173 0.969604975204998 T:C C T 10 0.529709755145049 0.921056677546572 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144194482_144194611:ARHGAP15;ENSG00000075884:ENST00000469117:exon_144194482_144194611:ARHGAP15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 148730367 G/C 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 C:G G C 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148730308_148730398:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148730308_148730398:ORC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 173 153 326 81.3602123599065 81.0455925371925 0.314619822714008 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 112 113 225 52.6725074237545 59.8572023313905 -7.18469490763603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.350187945351322 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 5 11 16 2.35145122427475 5.82680730659554 -3.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.130404884079537 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 152321618 G/A 1 22 13 35 10.3463853868089 6.88622681688564 3.46015856992328 A:G G A 10 0.529709755145049 0.309724657197588 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 6 15 21 2.82174146912971 7.94564632717574 -5.12390485804603 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0287602099091276 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 166740469 A/C 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 A:C A C 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000123607:ENST00000392695:exon_166740304_166740528:TTC21B;ENSG00000123607:ENST00000243344:exon_166740304_166740528:TTC21B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 393 361 754 184.824066227996 191.225221607363 -6.40115537936697 A:T T A 10 0.529709755145049 0.661572317016471 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 60 54 114 28.2174146912971 28.6043267778326 -0.386912086535588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 171871416 C/T 1 14 9 23 6.58406342796931 4.76738779630544 1.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.533407999946811 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171871361_171871458:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171871361_171871458:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171871361_171871458:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171871361_171871458:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171871361_171871458:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171871361_171871458:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171871361_171871458:TLK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 172188368 C/T 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000483284:exon_172188314_172189305:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000438609:exon_172188275_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172188318_172188377:METTL8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 14 13 27 6.58406342796931 6.88622681688564 -0.302163388916323 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 36 29 65 16.9304488147782 15.3615828992064 1.56886591557181 A:G G A 10 0.529709755145049 0.711420394461934 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 174946760 T/C 1 13 25 38 6.11377318311436 13.2427438786262 -7.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0227461962224540 ENSG00000138430:ENST00000284719:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000344357:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000409546:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000449400:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000392560:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000462000:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000429575:exon_174946738_174946792:OLA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 175289314 T/C 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 T:C T C 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000144306:ENST00000437944:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000456879:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000272732:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000409673:exon_175289203_175289377:SCRN3;ENSG00000144306:ENST00000475928:exon_175289203_175289377:SCRN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 176046092 G/A 1 495 503 998 232.793671203201 266.44400683796 -33.6503356347589 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0336148605196688 ENSG00000154518:ENST00000284727:exon_176046083_176046194:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000409194:exon_176046083_176046211:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000392541:exon_176046083_176046391:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000497075:exon_176046083_176046194:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000472782:exon_176046083_176046194:ATP5G3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 24 20 44 11.2869658765188 10.594195102901 0.692770773617843 A:G A G 10 0.529709755145049 0.880788070515154 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 182374553 A/T 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:T A T 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 182374567 A/G 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 182395345 G/A 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 25 36 61 11.7572561213738 19.0695511852218 -7.31229506384799 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0720031116204503 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 182780307 G/A 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 185801917 A/G 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:G A G 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 185803364 C/G 0 0 8 8 0 4.23767804116039 -4.23767804116039 G C G 10 0.529709755145049 0.00239291770370972 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 190708712 G/A 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190708690_190708806:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190708690_190708806:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190708690_190708806:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190708690_190708806:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190708690_190708806:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447734:exon_190708690_190708806:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424307:exon_190708690_190708806:PMS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 34 20 54 15.9898683250683 10.594195102901 5.39567322216735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.172450623287872 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 6 21 27 2.82174146912971 11.123904858046 -8.30216338891632 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00158607350359534 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:G G T 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 191235610 A/G 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000470892:exon_191235570_191235767:INPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 21 36 57 9.87609514195397 19.0695511852218 -9.1934560432678 A:G A G 10 0.529709755145049 0.016586674439969 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 20 24 44 9.40580489709902 12.7130341234812 -3.30722922638216 T:C T C 10 0.529709755145049 0.365674360174437 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 73 67 140 34.3311878744114 35.4905535947183 -1.15936572030687 A:T:G T A 10 0.529709755145049 0.865797433222857 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 197946392 C/T 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000065413:ENST00000424317:exon_197946369_197946449:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_197946369_197946449:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_197946369_197946449:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_197946369_197946449:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_197946369_197946449:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000422886:exon_197946369_197946449:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_197946369_197946449:ANKRD44 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 A:G A G 10 0.529709755145049 0.200137897636222 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 16 49 65 7.52464391767922 25.9557780021074 -18.4311340844282 A:C A C 10 0.529709755145049 4.50876239879946e-06 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 16 63 79 7.52464391767922 33.3717145741381 -25.8470706564589 A:G G A 10 0.529709755145049 2.88872774259274e-09 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 66 46 112 31.0391561604268 24.3666487366723 6.67250742375451 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.219276031917709 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 A:G A G 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 203157538 A/G 1 108 110 218 50.7913464443347 58.2680730659554 -7.47672662162068 A:G A G 10 0.529709755145049 0.342190443342315 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203157500_203157626:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203157500_203157626:NOP58 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 206991447 T/C 1 48 66 114 22.5739317530376 34.9608438395732 -12.3869120865356 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0239517201509723 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_206991434_206991568:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_206991434_206991568:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_206991434_206991568:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_206991434_206991568:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_206991434_206991568:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_206991434_206991568:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_206991434_206991568:NDUFS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 14 17 31 6.58406342796931 9.00506583746583 -2.42100240949652 A:G A G 10 0.529709755145049 0.472408092481563 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 A:C C A 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 26 18 44 12.2275463662287 9.53477559261088 2.69277077361784 A:T A T 10 0.529709755145049 0.452813649192105 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 93 83 176 43.7369927715104 43.9659096770391 -0.228916905528635 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 27 22 49 12.6978366110837 11.6536146131911 1.0442219978926 A:T A T 10 0.529709755145049 0.777129123416233 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 12 15 27 5.64348293825941 7.94564632717574 -2.30216338891632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.442240172896858 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 1 21 22 0.470290244854951 11.123904858046 -10.6536146131911 A:G A G 10 0.529709755145049 2.44594312478004e-06 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 C:G G C 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 C:G G C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219266385 G/A 1 27 22 49 12.6978366110837 11.6536146131911 1.0442219978926 A:G G A 10 0.529709755145049 0.777129123416233 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 30 39 69 14.1087073456485 20.6586804506569 -6.54997310500838 T:C C T 10 0.529709755145049 0.118391434180617 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219269183 A/G 1 27 41 68 12.6978366110837 21.718099960947 -9.02026334986333 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0291905920358446 ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219269020_219269399:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219269020_219270664:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219269020_219269202:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219269020_219269202:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219269020_219269496:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219269020_219269310:CTDSP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219508199 C/T 1 4 11 15 1.8811609794198 5.82680730659554 -3.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.066644853967573 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219526649 G/A 1 49 37 86 23.0442219978926 19.5992609403668 3.44496105752578 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.517193092168912 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000443791:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219526389_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526574_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219526641_219526676:BCS1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 39 32 71 18.3413195493431 16.9507121646416 1.39060738470152 T:C T C 10 0.529709755145049 0.812359429260467 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 53 47 100 24.9253829773124 24.8963584918173 0.0290244854950963 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 17 15 32 7.99493416253417 7.94564632717574 0.049287835358431 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219610433 A/G 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G A G 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000461181:exon_219610110_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219610276_219610524:TTLL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220037557 G/A 1 54 47 101 25.3956732221674 24.8963584918173 0.499314730350047 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 45 50 95 21.1630610184728 26.4854877572525 -5.32242673877966 A:G A G 10 0.529709755145049 0.304276278444765 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 59 50 109 27.7471244464421 26.4854877572525 1.26163668918966 A:G A G 10 0.529709755145049 0.848124877492378 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 35 31 66 16.4601585699233 16.4210024094965 0.0391561604267636 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 17 27 44 7.99493416253417 14.3021633889163 -6.30722922638216 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0692040070236173 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 21 21 42 9.87609514195397 11.123904858046 -1.24780971609206 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758185523015664 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220094985 G/A 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220094950_220095127:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220094950_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000464763:exon_220094950_220095478:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000474225:exon_220094950_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000461731:exon_220094950_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220094950_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000435521:exon_220094950_220095127:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220094950_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220094950_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220094950_220095127:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000416565:exon_220094607_220095072:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220094950_220095127:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220094950_220095127:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000436226:exon_220094681_220095127:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220094958_220095072:ANKZF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 39 29 68 18.3413195493431 15.3615828992064 2.97973665013667 T:C C T 10 0.529709755145049 0.543917918259008 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 27 24 51 12.6978366110837 12.7130341234812 -0.0151975123974992 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220404927 G/A 1 20 20 40 9.40580489709902 10.594195102901 -1.18839020580196 A:G G A 10 0.529709755145049 0.75281037212825 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 32 20 52 15.0492878353584 10.594195102901 4.45509273245745 A:G G A 10 0.529709755145049 0.266308469657261 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 220473355 G/A 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000473899:exon_220473305_220473510:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220473305_220473510:STK11IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 223783841 G/A 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123983:ENST00000357430:exon_223783782_223783920:ACSL3;ENSG00000123983:ENST00000392066:exon_223783782_223783920:ACSL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 224824617 A/G 1 69 78 147 32.4500268949916 41.3173609013138 -8.86733400632221 A:G A G 10 0.529709755145049 0.159986382350753 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 185 172 357 87.0036952981659 91.1100778849484 -4.10638258678252 A:G A G 10 0.529709755145049 0.67174371831617 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 228384735 A/G 1 17 20 37 7.99493416253417 10.594195102901 -2.59926094036681 A:G A G 10 0.529709755145049 0.414185523817946 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000456594:exon_228384664_228384779:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000486932:exon_228384664_228384779:AGFG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 39 27 66 18.3413195493431 14.3021633889163 4.03915616042676 A:G A G 10 0.529709755145049 0.32730796580257 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 13 10 23 6.11377318311436 5.29709755145049 0.816675631663872 T:C C T 10 0.529709755145049 0.835758435999101 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 29 18 47 13.6384171007936 9.53477559261088 4.1036415081827 T:C T C 10 0.529709755145049 0.245531276487518 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 206 146 352 96.8797904401199 77.3376242511772 19.5421661889427 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.03737029598931 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 280 230 510 131.681268559386 121.833243683361 9.84802487602499 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.399405145973332 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231333834 G/A 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.186626222993581 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231338211 T/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:G T G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 19 16 35 8.93551465224407 8.47535608232078 0.460158569923284 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 22 27 49 10.3463853868089 14.3021633889163 -3.9557780021074 A:G G A 10 0.529709755145049 0.316471584057354 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 60 20 80 28.2174146912971 10.594195102901 17.6232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 6.98422911879575e-05 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 0 56 0 56 26.3362537118773 0 26.3362537118773 G G 10 0.529709755145049 3.80449044716743e-16 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 196 215 411 92.1768879915704 113.887597356186 -21.7107093646151 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0335571343745447 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 232081369 G/A 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 A:G G A 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232081351_232081506:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000440107:exon_232081351_232081501:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232081351_232081506:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232081351_232081506:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000469789:exon_232081351_232081506:ARMC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 15 6 21 7.05435367282426 3.17825853087029 3.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.124563644273288 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 21 7 28 9.87609514195397 3.70796828601534 6.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0223010587578852 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 A:G A G 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234432017 A/G 1 10 1 11 4.70290244854951 0.529709755145049 4.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0132519072418753 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000427112:exon_234431816_234432135:USP40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234749258 T/C 1 133 104 237 62.5486025657085 55.0898145350851 7.45878803062338 T:C T C 10 0.529709755145049 0.362334452407583 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234749354 G/A 1 83 71 154 39.0340903229609 37.6093926152985 1.42469770766245 A:G G A 10 0.529709755145049 0.871823915127423 ENSG00000123485:ENST00000433484:exon_234749255_234749384:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 46 56 102 21.6333512633277 29.6637462881227 -8.030395024795 C:G G C 10 0.529709755145049 0.113584161189391 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 22 41 63 10.3463853868089 21.718099960947 -11.3717145741381 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00511642753449255 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 17 7 24 7.99493416253417 3.70796828601534 4.28696587651882 T:C T C 10 0.529709755145049 0.101208108806048 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 0 9 0 9 4.23261220369456 0 4.23261220369456 C C 10 0.529709755145049 0.0044089015254185 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 239040187 T/C 0 0 8 8 0 4.23767804116039 -4.23767804116039 C T C 10 0.529709755145049 0.00239291770370972 ENSG00000144488:ENST00000343063:exon_239038769_239041928:ESPNL;ENSG00000144488:ENST00000409169:exon_239038769_239041928:ESPNL;ENSG00000144488:ENST00000409506:exon_239038769_239041928:ESPNL;ENSG00000144488:ENST00000440690:exon_239038769_239040373:ESPNL;ENSG00000144488:ENST00000477241:exon_239038769_239041922:ESPNL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 239079542 A/G 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 241569692 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 26 17 43 12.2275463662287 9.00506583746583 3.22248052876289 T:C T C 10 0.529709755145049 0.361505086251554 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242077496 C/T 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000433589:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000415234:exon_242077368_242077502:PASK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242179134 G/A 1 123 147 270 57.845700117159 77.8673340063222 -20.0216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0172598827824395 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242179017_242179151:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427487:exon_242179017_242179235:HDLBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 47 44 91 22.1036415081827 23.3072292263822 -1.20358771819946 T:C T C 10 0.529709755145049 0.834044902847736 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 45 49 94 21.1630610184728 25.9557780021074 -4.79271698363461 T:C T C 10 0.529709755145049 0.352822777504098 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242610773 T/A 1 50 47 97 23.5145122427475 24.8963584918173 -1.38184624906976 A:T T A 10 0.529709755145049 0.838956666380402 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242690675 G/A 1 15 19 34 7.05435367282426 10.0644853477559 -3.01013167493167 A:G G A 10 0.529709755145049 0.30883505629764 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242690770 T/C 1 12 23 35 5.64348293825941 12.1833243683361 -6.53984143007672 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0283346359982096 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:G A G 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:T T A 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 256763 G/C 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 C:G G C 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 9 13 22 4.23261220369456 6.88622681688564 -2.65361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.290050920028368 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 C:G G C 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 37 35 72 17.4007390596332 18.5398414300767 -1.13910237044353 T:C C T 10 0.529709755145049 0.81409636898185 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 428553 T/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C T C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000125875:ENST00000461304:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000354200:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000494633:exon_428533_428718:TBC1D20;ENSG00000125875:ENST00000246077:exon_428533_428718:TBC1D20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 82 69 151 38.563800078106 36.5499731050084 2.01382697309759 T:C C T 10 0.529709755145049 0.80688879659824 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 311 296 607 146.26026614989 156.794087522935 -10.5338213730448 T:C T C 10 0.529709755145049 0.393500129744365 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 1071 1001 2072 503.680852239652 530.239464900194 -26.5586126605416 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.243526483228865 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2641132 C/T 1 154 133 287 72.4246977076624 70.4513974342915 1.97330027337092 T:C C T 10 0.529709755145049 0.859237776513883 ENSG00000101365:ENST00000474315:exon_2641103_2641236:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380851:exon_2641103_2641236:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380843:exon_2641103_2641236:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000488299:exon_2641103_2641475:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000435594:exon_2641103_2641311:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000479376:exon_2640909_2641199:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000462967:exon_2640942_2641475:IDH3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2816247 C/T 1 98 85 183 46.0884439957852 45.0253291873292 1.06311480845603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.882588337587841 ENSG00000132635:ENST00000356872:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000360652:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000474714:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000478539:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000487501:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000434800:exon_2815971_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000436952:exon_2815971_2816355:FAM113A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2818801 T/C 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 T:C T C 10 0.529709755145049 0.316616912980055 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2819513 G/A 1 20 25 45 9.40580489709902 13.2427438786262 -3.83693898152721 A:G G A 10 0.529709755145049 0.296234181328756 ENSG00000132635:ENST00000356872:exon_2819490_2819575:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000360652:exon_2819490_2819728:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000478539:exon_2819490_2819575:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000434800:exon_2819490_2819575:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000436952:exon_2819490_2819575:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000448755:exon_2819490_2819575:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000439542:exon_2819490_2819728:FAM113A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 2969015 C/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 C:G C G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2968984_2969120:PTPRA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 T:G T G 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 42 63 105 19.7521902839079 33.3717145741381 -13.6195242902301 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00820930700723142 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 81 105 186 38.093509833251 55.6195242902301 -17.5260144569791 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0123015722820890 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3838441 C/G 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 C:G C G 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3843027 C/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:C C A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3842901_3843060:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3842901_3843060:MAVS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3844929 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3844903_3845435:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3844903_3845435:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3844903_3845435:MAVS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 3846397 C/T 1 13 8 21 6.11377318311436 4.23767804116039 1.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.513879879006915 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3846330_3849280:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3846330_3848972:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3846330_3847950:MAVS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C T C 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 T:C C T 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:G A G 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 5939214 A/C 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 A:C A C 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5939174_5939372:MCM8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 A:G A G 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 6195833 G/A 0 35 0 35 16.4601585699233 0 16.4601585699233 G G 10 0.529709755145049 3.5730344043743e-10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 10620275 G/A 1 2 9 11 0.940580489709902 4.76738779630544 -3.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0306192095736915 ENSG00000101384:ENST00000254958:exon_10618332_10620603:JAG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 18143117 T/G 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C:G T G 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 18167977 T/C 1 10 17 27 4.70290244854951 9.00506583746583 -4.30216338891632 T:C T C 10 0.529709755145049 0.122415412291815 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18167930_18169031:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18167930_18169031:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18167930_18169016:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18167930_18169031:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18167930_18169016:CSRP2BP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 24939590 G/C 1 7 15 22 3.29203171398466 7.94564632717574 -4.65361461319108 C:G G C 10 0.529709755145049 0.054856205447933 ENSG00000077984:ENST00000480798:exon_24939564_24939680:CST7;ENSG00000077984:ENST00000376835:exon_24939564_24939680:CST7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 25003705 A/C 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:C A C 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25003576_25003728:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25003576_25003728:ACSS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 25011423 T/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25011395_25011594:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25011395_25011594:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25011395_25011594:ACSS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 25187213 G/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187158_25187226:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187158_25187226:ENTPD6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 30157026 A/G 1 236 129 365 110.988497785768 68.3325584137113 42.6559393720571 A:G A G 10 0.529709755145049 7.61039896828283e-06 ENSG00000101294:ENST00000335574:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000340852:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000398174:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000376127:exon_30156923_30157345:HM13;ENSG00000101294:ENST00000492709:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000469097:exon_30156923_30157221:HM13;ENSG00000101294:ENST00000460389:exon_30156923_30157111:HM13;ENSG00000101294:ENST00000468559:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000493364:exon_30156923_30157055:HM13;ENSG00000101294:ENST00000487281:exon_30156923_30157370:HM13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 30354417 G/A 1 33 19 52 15.5195780802134 10.0644853477559 5.45509273245745 A:G G A 10 0.529709755145049 0.164187462358522 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30354359_30354485:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30354359_30354485:TPX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 30753270 T/C 1 48 27 75 22.5739317530376 14.3021633889163 8.27176836412132 T:C T C 10 0.529709755145049 0.063831132955804 ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000495749:exon_30753098_30755061:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000479591:exon_30753098_30753390:TM9SF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 32379195 A/C 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 32441367 T/C 1 295 283 578 138.735622232211 149.907860706049 -11.1722384738383 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.359466949599231 ENSG00000101421:ENST00000217402:exon_32441302_32442172:CHMP4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 34515764 C/T 1 20 14 34 9.40580489709902 7.41593657203069 1.98986832506833 T:C C T 10 0.529709755145049 0.606972054310593 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34515702_34515801:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34515702_34515801:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34515702_34515801:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34515702_34515801:PHF20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 37168469 G/T 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:G G T 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000170471:ENST00000262879:exon_37168419_37168601:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397042:exon_37168419_37168601:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000304939:exon_37168419_37168601:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397038:exon_37168419_37168601:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397040:exon_37168419_37168601:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000438490:exon_37168419_37168601:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000461423:exon_37168419_37168601:RALGAPB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 40049998 A/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:T A T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 42088364 G/A 1 4 12 16 1.8811609794198 6.35651706174059 -4.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0416130324707808 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 42320881 C/T 1 39 67 106 18.3413195493431 35.4905535947183 -17.1492340453752 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000890376544725607 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42320797_42320959:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42320797_42320959:MYBL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 46 101 147 21.6333512633277 53.5006852696499 -31.8673340063222 A:G A G 10 0.529709755145049 1.31450522085208e-07 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 58 48 106 27.2768342015872 25.4260682469624 1.8507659546248 A:C A C 10 0.529709755145049 0.770655711794737 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 49 53 102 23.0442219978926 28.0746170226876 -5.030395024795 T:C C T 10 0.529709755145049 0.323168938027579 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 43561051 A/G 1 15 5 20 7.05435367282426 2.64854877572525 4.40580489709902 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0706586681691274 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43560983_43561073:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43560983_43561073:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43560983_43561073:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43560983_43561073:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43560203_43561826:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43560820_43561826:PABPC1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 43564137 G/A 1 29 9 38 13.6384171007936 4.76738779630544 8.87102930448814 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00502937525810266 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000490798:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000478877:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000465761:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43564032_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43564038_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43564072_43564138:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43564103_43564138:PABPC1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 27 8 35 12.6978366110837 4.23767804116039 8.46015856992328 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00383433595261118 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 65 80 145 30.5688659155718 42.3767804116039 -11.8079144960321 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0554486563177862 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 29 28 57 13.6384171007936 14.8318731440614 -1.19345604326779 A:G G A 10 0.529709755145049 0.791547052727124 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 25 27 52 11.7572561213738 14.3021633889163 -2.54490726754255 T:C T C 10 0.529709755145049 0.49074383009985 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44420637 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44511627 C/T 1 15 14 29 7.05435367282426 7.41593657203069 -0.361582899206422 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 16 7 23 7.52464391767922 3.70796828601534 3.81667563166387 T:G T G 10 0.529709755145049 0.143351676752243 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 44746982 T/C 1 81 89 170 38.093509833251 47.1441682079094 -9.05065837465834 T:C T C 10 0.529709755145049 0.167441380670712 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 45315346 C/T 1 61 50 111 28.687704936152 26.4854877572525 2.20221717889956 T:C C T 10 0.529709755145049 0.704417048159952 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 45315786 C/T 1 27 20 47 12.6978366110837 10.594195102901 2.1036415081827 T:C C T 10 0.529709755145049 0.562318941515894 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 45839579 C/G 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 C:G C G 10 0.529709755145049 0.655778470669091 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 17 16 33 7.99493416253417 8.47535608232078 -0.480421919786618 T:C C T 10 0.529709755145049 0.863849861169677 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 14 9 23 6.58406342796931 4.76738779630544 1.81667563166387 A:G G A 10 0.529709755145049 0.533407999946811 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 48252914 C/T 1 8 11 19 3.76232195883961 5.82680730659554 -2.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.366887546614125 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48249482_48252996:B4GALT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 44 37 81 20.6927707736178 19.5992609403668 1.09350983325103 T:C C T 10 0.529709755145049 0.824811389092736 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 49197873 C/T 1 24 34 58 11.2869658765188 18.0101316749317 -6.72316579841284 T:C C T 10 0.529709755145049 0.087217142601261 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49197802_49197997:PTPN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 30 39 69 14.1087073456485 20.6586804506569 -6.54997310500838 A:G G A 10 0.529709755145049 0.118391434180617 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 35 23 58 16.4601585699233 12.1833243683361 4.27683420158715 A:G G A 10 0.529709755145049 0.293563430527675 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 56185303 G/A 1 12 21 33 5.64348293825941 11.123904858046 -5.48042191978662 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0795915327422298 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 56227532 T/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 46 58 104 21.6333512633277 30.7231657984128 -9.0898145350851 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0774920135999263 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 57565943 G/C 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57565150_57567075:TH1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 127 134 261 59.7268610965788 70.9811071894366 -11.2542460928578 A:G A G 10 0.529709755145049 0.172573430532564 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 6 15 21 2.82174146912971 7.94564632717574 -5.12390485804603 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0287602099091276 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 539 383 922 253.486441976819 202.878836220554 50.6076057562648 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.000854515646492157 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 382 329 711 179.650873534591 174.274509442721 5.37636409187013 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.70719096488452 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60775932 C/T 1 33 34 67 15.5195780802134 18.0101316749317 -2.49055359471829 T:C C T 10 0.529709755145049 0.543705708385578 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60775739_60777808:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60775739_60777823:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60775739_60777823:GTPBP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 A:C A C 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60962624 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 3817 3259 7076 1795.09786461135 1726.32409201771 68.7737725936331 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.102777159625374 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 127 27 154 59.7268610965788 14.3021633889163 45.4246977076624 T:C C T 10 0.529709755145049 1.98833303684444e-14 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 60966374 G/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 C:G G C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61439696 C/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 C:G C G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61440971 G/A 1 28 31 59 13.1681268559386 16.4210024094965 -3.25287555355789 A:G G A 10 0.529709755145049 0.434941965691201 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61440937_61441015:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000450048:exon_61440937_61441015:OGFR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61444780 C/A 1 57 1 58 26.8065439567322 0.529709755145049 26.2768342015872 A:C C A 10 0.529709755145049 9.77583224906658e-15 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 73 7 80 34.3311878744114 3.70796828601534 30.6232195883961 A:C C A 10 0.529709755145049 1.67204279760623e-13 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61491494 T/C 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 T:C T C 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61491477_61491660:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61491477_61491660:TCFL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 23 24 47 10.8166756316639 12.7130341234812 -1.8963584918173 T:C C T 10 0.529709755145049 0.661658922636003 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 61598731 C/T 1 70 67 137 32.9203171398466 35.4905535947183 -2.57023645487172 T:C C T 10 0.529709755145049 0.669585127031244 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61598055_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61598689_61599949:SLC17A9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62127326 G/A 1 17 7 24 7.99493416253417 3.70796828601534 4.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.101208108806048 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62127209_62127388:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62127209_62127388:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62127209_62130101:EEF1A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62191937 G/A 1 28 24 52 13.1681268559386 12.7130341234812 0.455092732457452 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62194030 G/C 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 C:G G C 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62194103 A/G 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62194128 G/A 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62198236 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62200575 T/C 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 T:C T C 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62221610 T/C 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62321189 C/T 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 T:C C T 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321103_62321563:RTEL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62595169 A/G 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G A G 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595142_62595266:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595142_62595266:ZNF512B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62595547 C/T 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595424_62595570:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595424_62595570:ZNF512B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 20 62595990 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196700:ENST00000369888:exon_62595843_62596069:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000217130:exon_62595843_62596069:ZNF512B;ENSG00000196700:ENST00000450537:exon_62595843_62596069:ZNF512B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 15889304 C/G 1 110 69 179 51.7319269340446 36.5499731050084 15.1819538290362 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0245559885455814 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 50 82 132 23.5145122427475 43.436199921894 -19.9216876791465 C:G G C 10 0.529709755145049 0.000620338524997635 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 26 17 43 12.2275463662287 9.00506583746583 3.22248052876289 C:G G C 10 0.529709755145049 0.361505086251554 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 26965071 G/A 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808869693714969 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 26965100 C/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:C C A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 108 70 178 50.7913464443347 37.0796828601534 13.7116635841813 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0425051042848376 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 124 84 208 58.3159903620139 44.4956194321841 13.8203709298298 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0605470266344638 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 30257560 C/G 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000156239:ENST00000303775:exon_30257534_30257693:N6AMT1;ENSG00000156239:ENST00000351429:exon_30257534_30257693:N6AMT1;ENSG00000156239:ENST00000460212:exon_30257534_30257693:N6AMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C T C 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 33642789 C/T 1 15 21 36 7.05435367282426 11.123904858046 -4.06955118522177 T:C C T 10 0.529709755145049 0.185123406986533 ENSG00000159055:ENST00000290130:exon_33642718_33642840:C21orf45;ENSG00000159055:ENST00000486363:exon_33642718_33642889:C21orf45 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 34117130 T/G 1 12 5 17 5.64348293825941 2.64854877572525 2.99493416253417 T:G T G 10 0.529709755145049 0.223479807498147 ENSG00000159086:ENST00000331923:exon_34117103_34117224:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34117103_34117224:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000443785:exon_34117103_34117224:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000497873:exon_34117103_34117224:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000290178:exon_34117103_34117224:GCFC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 34897113 C/T 1 55 57 112 25.8659634670223 30.1934560432678 -4.32749257624549 T:C C T 10 0.529709755145049 0.449211126500778 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 34923808 G/A 1 39 33 72 18.3413195493431 17.4804219197866 0.860897629556469 A:G G A 10 0.529709755145049 0.906201326575647 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 52 29 81 24.4550927324575 15.3615828992064 9.09350983325103 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0452860473136349 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 11 38 49 5.17319269340446 20.1289706955119 -14.9557780021074 T:C T C 10 0.529709755145049 1.91557020469855e-05 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 47 44 91 22.1036415081827 23.3072292263822 -1.20358771819946 C:G G C 10 0.529709755145049 0.834044902847736 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 74 83 157 34.8014781192664 43.9659096770391 -9.1644315577727 T:C C T 10 0.529709755145049 0.150442815300747 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 40190427 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40190349_40190570:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40190349_40190570:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000456966:exon_40190349_40190570:ETS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 40720494 C/T 1 46 101 147 21.6333512633277 53.5006852696499 -31.8673340063222 T:C:G C T 10 0.529709755145049 1.31450522085208e-07 ENSG00000205581:ENST00000380749:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000431390:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000492280:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000288344:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000486741:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000436324:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380748:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000419378:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000489072:exon_40720471_40720788:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482192:exon_40720471_40720549:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380747:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000485550:exon_40720471_40720523:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000443046:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000464078:exon_40720348_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000491183:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000479586:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000471260:exon_40720471_40720546:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482733:exon_40719921_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000463631:exon_40720348_40720503:HMGN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 303 228 531 142.49794419105 120.773824173071 21.724120017979 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0615444329349177 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 635 623 1258 298.634305482894 330.009177455366 -31.3748719724717 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0798887102219632 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 606 569 1175 284.9958883821 301.404850677533 -16.4089622954326 T:C T C 10 0.529709755145049 0.349699051548181 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 42824733 G/A 1 565 519 1084 265.713988343047 274.91936292028 -9.20537457723316 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.583982292542812 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 16 62 78 7.52464391767922 32.842004818993 -25.3173609013138 T:C C T 10 0.529709755145049 7.99478244207686e-09 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 T:C C T 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44273858 G/A 1 7 22 29 3.29203171398466 11.6536146131911 -8.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0023451360256239 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 9 18 27 4.23261220369456 9.53477559261088 -5.30216338891632 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0525611905584201 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44299573 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44299517_44299641:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44299517_44299665:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44299517_44299625:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44299197_44299620:WDR4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44317156 A/C 1 156 86 242 73.3652781973723 45.5550389424742 27.8102392548981 A:C:G A C 10 0.529709755145049 0.000376641752858771 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44317037_44317157:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44317037_44317157:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000340344:exon_44317037_44317157:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000398198:exon_44317037_44317157:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000456957:exon_44317096_44317157:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000418336:exon_44317096_44317157:NDUFV3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 72 83 155 33.8608976295565 43.9659096770391 -10.1050120474826 T:G T G 10 0.529709755145049 0.107947539962417 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 46 46 92 21.6333512633277 24.3666487366723 -2.73329747334451 A:G G A 10 0.529709755145049 0.602216715419835 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 44430325 T/C 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160199:ENST00000291547:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000432907:exon_44430163_44430334:PKNOX1;ENSG00000160199:ENST00000480179:exon_44430163_44430334:PKNOX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 17 13 30 7.99493416253417 6.88622681688564 1.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.718335261369696 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45107875 G/A 1 28 22 50 13.1681268559386 11.6536146131911 1.51451224274755 A:G G A 10 0.529709755145049 0.777253688146423 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 109 97 206 51.2616366891897 51.3818462490698 -0.120209559880095 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 42 56 98 19.7521902839079 29.6637462881227 -9.91155600421481 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0540026571689034 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 77 67 144 36.2123488538312 35.4905535947183 0.721795259112938 T:C T C 10 0.529709755145049 0.933594426383187 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 100 53 153 47.0290244854951 28.0746170226876 18.9544074628075 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00205185718290218 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 19 9 28 8.93551465224407 4.76738779630544 4.16812685593863 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.131607092593009 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45528919 G/A 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45528865_45528977:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000456705:exon_45528865_45528977:PWP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 19 14 33 8.93551465224407 7.41593657203069 1.51957808021338 T:C T C 10 0.529709755145049 0.727862479978695 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 35 18 53 16.4601585699233 9.53477559261088 6.9253829773124 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0726833467418682 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 58 37 95 27.2768342015872 19.5992609403668 7.67757326122034 T:C T C 10 0.529709755145049 0.123548856506895 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 47 42 89 22.1036415081827 22.2478097160921 -0.144168207909367 T:C:G T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45557143 C/T 1 87 101 188 40.9152513023807 53.5006852696499 -12.5854339672692 T:C C T 10 0.529709755145049 0.067994879951558 ENSG00000248354:ENST00000433711:exon_45557059_45557178:AP001055.7;ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000389690:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45557059_45557259:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45557059_45557457:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000470545:exon_45557059_45557448:C21orf33 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 28 30 58 13.1681268559386 15.8912926543515 -2.72316579841284 T:C C T 10 0.529709755145049 0.511999063584022 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 46320313 C/T 1 60 29 89 28.2174146912971 15.3615828992064 12.8558317920906 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00759494178965091 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46320235_46320390:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000320216:exon_46320235_46320390:ITGB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 46396659 G/C 1 47 32 79 22.1036415081827 16.9507121646416 5.15292934354112 C:G G C 10 0.529709755145049 0.261177268368480 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46396595_46396904:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46396595_46396888:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000485207:exon_46396595_46396888:C21orf70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 12 28 40 5.64348293825941 14.8318731440614 -9.18839020580196 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00402453036559053 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47635176 T/C 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635094_47635212:LSS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47635627 C/G 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 C:G C G 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47641794 C/T 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 T:C C T 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47641768_47641889:LSS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47642609 G/A 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47642544_47642652:LSS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 50 39 89 23.5145122427475 20.6586804506569 2.85583179209064 A:G G A 10 0.529709755145049 0.595952249638834 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 A:G A G 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47703649 G/A 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703529_47703752:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703529_47703752:MCM3AP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47704896 G/A 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703982_47705236:MCM3AP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47734659 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000160298:ENST00000491666:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397683:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000417060:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397685:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397682:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000291691:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397680:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397679:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000423365:exon_47734630_47734963:C21orf58 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 22 13 35 10.3463853868089 6.88622681688564 3.46015856992328 A:G A G 10 0.529709755145049 0.309724657197588 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 18 13 31 8.46522440738912 6.88622681688564 1.57899759050348 A:C A C 10 0.529709755145049 0.594825033868625 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 47961711 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000457905:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000427143:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000473752:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000494435:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47961669_47961808:DIP2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 41 43 84 19.281900039053 22.7775194712371 -3.49561943218412 C:G C G 10 0.529709755145049 0.446885280191278 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 17581248 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000177663:ENST00000477874:exon_17581245_17581359:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17581245_17581371:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17581245_17581371:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17581245_17581371:IL17RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 17690409 G/A 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 A:G G A 10 0.529709755145049 0.200137897636222 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 55 42 97 25.8659634670223 22.2478097160921 3.61815375093024 T:C T C 10 0.529709755145049 0.478151330723266 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 18209920 C/T 1 16 15 31 7.52464391767922 7.94564632717574 -0.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 18609642 C/T 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000215193:ENST00000474897:exon_18609121_18609801:PEX26;ENSG00000183785:ENST00000316027:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000330423:exon_18609121_18609801:TUBA8;ENSG00000183785:ENST00000416740:exon_18609121_18609801:TUBA8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19132061 C/T 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 T:C C T 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19348847 G/A 1 16 10 26 7.52464391767922 5.29709755145049 2.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.435653149735385 ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19348760_19348864:HIRA;ENSG00000242259:ENST00000509549:exon_19348760_19348864:C22orf39 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19455430 G/C 1 64 56 120 30.0985756707169 29.6637462881227 0.434829382594117 T:C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000070010:ENST00000263202:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000360834:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000459854:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000399523:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000399525:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000432927:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000447868:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000421968:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000484101:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000489406:exon_19454926_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000494054:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000474226:exon_19455418_19455526:UFD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19483526 G/C 1 17 12 29 7.99493416253417 6.35651706174059 1.63841710079358 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.58147925745253 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000487669:exon_19483504_19483552:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000428937:exon_19483504_19483552:CDC45 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 47 37 84 22.1036415081827 19.5992609403668 2.50438056781588 A:C A C 10 0.529709755145049 0.662219814293182 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19867771 C/T 1 8 20 28 3.76232195883961 10.594195102901 -6.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0126466527808446 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19867702_19867794:TXNRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 16 5 21 7.52464391767922 2.64854877572525 4.87609514195397 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0467481096916324 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19903290 C/G 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 C:G C G 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19903288_19903889:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000484672:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471835:exon_19903288_19903360:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19903288_19903366:TXNRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 13 22 35 6.11377318311436 11.6536146131911 -5.53984143007672 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0642375426587449 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 73 52 125 34.3311878744114 27.5449072675425 6.78628060686887 C:G C G 10 0.529709755145049 0.244380613692736 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 19951237 C/T 1 89 98 187 41.8558317920906 51.9115560042148 -10.0557242121242 T:C C T 10 0.529709755145049 0.143492672557667 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 20761063 G/A 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 21354970 C/G 1 44 32 76 20.6927707736178 16.9507121646416 3.74205860897627 C:G C G 10 0.529709755145049 0.422327531537483 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354936_21355019:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21354936_21355018:THAP7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 21982809 G/T 1 51 40 91 23.9848024876025 21.188390205802 2.79641228180054 T:G G T 10 0.529709755145049 0.600202771463386 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 22037524 T/C 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000492445:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000484439:exon_22037471_22037546:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22037471_22037546:PPIL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 22040828 G/A 1 17 9 26 7.99493416253417 4.76738779630544 3.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.240962855945961 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22040772_22040847:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22040772_22040847:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22040772_22040847:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22040772_22040847:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22040772_22040847:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22040772_22040847:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22040772_22040847:PPIL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 22764329 C/T 1 20 4 24 9.40580489709902 2.1188390205802 7.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00330193608233128 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 23029526 G/C 0 13 0 13 6.11377318311436 0 6.11377318311436 G G 10 0.529709755145049 0.000313569724728597 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 23264864 T/A 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 T T 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24086107 A/G 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000187792:ENST00000341976:exon_24083769_24087406:ZNF70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24108438 G/T 1 204 302 506 95.93920995041 159.972346053805 -64.0331361033948 T:G G T 10 0.529709755145049 1.31650268196075e-08 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24143206 A/G 1 62 102 164 29.157995181007 54.030395024795 -24.872399843788 A:G A G 10 0.529709755145049 0.000114448935323431 ENSG00000099956:ENST00000417137:exon_24143131_24143322:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24143131_24143322:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24143131_24143268:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24143131_24143268:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000491967:exon_24143131_24143647:SMARCB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24237108 G/A 1 3346 4069 7415 1573.59115928467 2155.3889936852 -581.797834400539 A:T:C:G G A 10 0.529709755145049 1.16249982758633e-41 ENSG00000240972:ENST00000215754:exon_24236959_24237131:MIF;ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000240972:ENST00000498385:exon_24236885_24237131:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24472173 C/T 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24472118_24472233:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24472118_24472233:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24472118_24472233:CABIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 44 47 91 20.6927707736178 24.8963584918173 -4.20358771819946 T:C T C 10 0.529709755145049 0.40174594522496 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 24982137 C/T 1 1 13 14 0.470290244854951 6.88622681688564 -6.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000571077477913014 ENSG00000178026:ENST00000318753:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000446942:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000491910:exon_24981603_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000404045:exon_24981617_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000460524:exon_24981630_24982379:C22orf36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 20 14 34 9.40580489709902 7.41593657203069 1.98986832506833 C:G G C 10 0.529709755145049 0.606972054310593 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 26936897 G/A 1 11 19 30 5.17319269340446 10.0644853477559 -4.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0983679859127383 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 41 38 79 19.281900039053 20.1289706955119 -0.847070656458875 T:C C T 10 0.529709755145049 0.910389617462238 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 29737521 C/T 1 35 37 72 16.4601585699233 19.5992609403668 -3.13910237044353 T:C C T 10 0.529709755145049 0.480351918843036 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29737490_29737749:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29737490_29737749:AP1B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 29881828 C/T 1 1 10 11 0.470290244854951 5.29709755145049 -4.82680730659554 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00425406518869011 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29881712_29881836:NEFH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 29886043 A/C 1 2 23 25 0.940580489709902 12.1833243683361 -11.2427438786262 A:C A C 10 0.529709755145049 2.76659476935533e-06 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 591 573 1164 277.941534709276 303.523689698113 -25.5821549888371 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.134345686329659 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 107 124 231 50.3210561994798 65.6840096379861 -15.3629534385063 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0478067432112624 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 70 55 125 32.9203171398466 29.1340365329777 3.78628060686887 T:C C T 10 0.529709755145049 0.531066257895906 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30218270 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30218131_30218453:ASCC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 20 16 36 9.40580489709902 8.47535608232078 0.930448814778234 T:G T G 10 0.529709755145049 0.867774579333193 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 23 17 40 10.8166756316639 9.00506583746583 1.81160979419804 A:C C A 10 0.529709755145049 0.636001814544782 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 58 62 120 27.2768342015872 32.842004818993 -5.56517061740588 T:C T C 10 0.529709755145049 0.315831419379713 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31011610 G/C 1 16 6 22 7.52464391767922 3.17825853087029 4.34638538680892 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0858744960227817 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31019044 G/A 1 17 16 33 7.99493416253417 8.47535608232078 -0.480421919786618 A:G G A 10 0.529709755145049 0.863849861169677 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31302125 C/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 C:G C G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000184792:ENST00000382310:exon_31301824_31302220:OSBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31302233 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000184792:ENST00000437268:exon_31302184_31303811:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000403222:exon_31302184_31302357:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000407373:exon_31302184_31303619:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000332585:exon_31302184_31303811:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000446658:exon_31302184_31302393:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000445769:exon_31302181_31303800:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000401475:exon_31302184_31302759:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000431368:exon_31302184_31303610:OSBP2;ENSG00000184792:ENST00000452656:exon_31302184_31303630:OSBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 5 23 28 2.35145122427475 12.1833243683361 -9.83187314406137 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000194052419806774 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 C:G G C 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 31492746 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491520_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31492719_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491838_31492883:SMTN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 32015742 G/A 1 77 57 134 36.2123488538312 30.1934560432678 6.01889281056343 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.341155122908302 ENSG00000241878:ENST00000382151:exon_32014477_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000460723:exon_32014477_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000437808:exon_32014497_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000266095:exon_32014501_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000473770:exon_32014545_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397500:exon_32014600_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000435900:exon_32014963_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000439502:exon_32015089_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000336566:exon_32015089_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000422296:exon_32015089_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397503:exon_32015089_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397502:exon_32015089_32015822:PISD;ENSG00000241878:ENST00000474017:exon_32015430_32015822:PISD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 58 60 118 27.2768342015872 31.7825853087029 -4.50575110711578 A:G G A 10 0.529709755145049 0.408414772359033 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 97 75 172 45.6181537509302 39.7282316358787 5.88992211505157 T:C C T 10 0.529709755145049 0.400943546489618 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 18 26 44 8.46522440738912 13.7724536337713 -5.30722922638216 T:G T G 10 0.529709755145049 0.130649453810797 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 18 34 52 8.46522440738912 18.0101316749317 -9.54490726754255 C:G G C 10 0.529709755145049 0.00828791148450182 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 49 57 106 23.0442219978926 30.1934560432678 -7.1492340453752 A:T A T 10 0.529709755145049 0.173777371714190 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36538053 G/A 1 28 33 61 13.1681268559386 17.4804219197866 -4.31229506384799 A:G G A 10 0.529709755145049 0.305256990383226 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000534251:exon_36537911_36538106:APOL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36657740 G/A 1 46 40 86 21.6333512633277 21.188390205802 0.444961057525781 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000439680:exon_36657642_36657745:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36657642_36657768:APOL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 277 183 460 130.270397824821 96.936885191544 33.3335126332775 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00201931344366292 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 273 162 435 128.389236845402 85.8129803334979 42.5762565119037 A:C C A 10 0.529709755145049 4.24832586005205e-05 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 36912724 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 13 23 36 6.11377318311436 12.1833243683361 -6.06955118522177 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0459478094219627 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37333804 G/A 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37333936 C/T 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 13 3 16 6.11377318311436 1.58912926543515 4.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0248398714532566 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 1 13 8 21 6.11377318311436 4.23767804116039 1.87609514195397 A:G G A 10 0.529709755145049 0.513879879006915 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37603051 C/T 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 37603744 C/T 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 80 78 158 37.6232195883961 41.3173609013138 -3.69414131291775 T:C C T 10 0.529709755145049 0.577442021549834 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 38211728 A/G 1 9 21 30 4.23261220369456 11.123904858046 -6.89129265435147 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0160636292967540 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38211670_38211841:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38211670_38211841:GCAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 436 464 900 205.046546756759 245.785326387303 -40.7387796305441 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00681372517505829 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 38889772 G/A 1 28 21 49 13.1681268559386 11.123904858046 2.0442219978926 A:G G A 10 0.529709755145049 0.571118271455057 ENSG00000100201:ENST00000396821:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000532271:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000381633:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415456:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000216019:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000403230:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000404499:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000431312:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000475004:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000432525:exon_38889715_38889776:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000497196:exon_38889366_38889776:DDX17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 59 54 113 27.7471244464421 28.6043267778326 -0.857202331390539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.924991122533292 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39136274 C/T 1 35 57 92 16.4601585699233 30.1934560432678 -13.7332974733445 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00462684913913662 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000477262:exon_39136272_39136437:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000469086:exon_39136272_39137055:SUN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39147235 A/C 1 25 33 58 11.7572561213738 17.4804219197866 -5.72316579841284 A:C A C 10 0.529709755145049 0.14828245345079 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417595:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000438058:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000456894:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000480307:exon_39147215_39147446:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000420859:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000452294:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000494273:exon_39146903_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000433561:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000417332:exon_39147215_39147378:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000439339:exon_39147215_39147378:SUN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39414240 G/A 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.295993080845259 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 152 138 290 71.4841172179525 73.0999462100168 -1.61582899206422 T:C T C 10 0.529709755145049 0.860077120090118 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 366 375 741 172.126229616912 198.641158179393 -26.5149285624813 A:T:C:G A C 10 0.529709755145049 0.0512016634675728 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 39917960 A/T 1 1031 955 1986 484.869242445454 505.872816163522 -21.0035737180673 A:T:C:G A T 10 0.529709755145049 0.345219878223452 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917778_39918691:ATF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 40803793 A/G 1 76 79 155 35.7420586089763 41.8470706564589 -6.1050120474826 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.33515097086389 ENSG00000100359:ENST00000248929:exon_40803793_40803847:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000454798:exon_40803793_40803847:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40803793_40803847:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40802442_40804433:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000480830:exon_40803793_40803847:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000481408:exon_40803793_40803847:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000470518:exon_40803793_40803847:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000467915:exon_40803343_40803847:SGSM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 11 13 24 5.17319269340446 6.88622681688564 -1.71303412348118 C:G G C 10 0.529709755145049 0.542758508102984 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 41652250 C/T 1 28 30 58 13.1681268559386 15.8912926543515 -2.72316579841284 T:C C T 10 0.529709755145049 0.511999063584022 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652195_41652294:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652195_41652294:RANGAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 41911525 C/T 1 68 58 126 31.9797366501367 30.7231657984128 1.25657085172382 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.858593317388458 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41911381_41911539:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000481310:exon_41911517_41911539:ACO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 596 543 1139 280.292985933551 287.632397043762 -7.33941111021085 A:T:C:G G T 10 0.529709755145049 0.677759200294523 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 54 42 96 25.3956732221674 22.2478097160921 3.14786350607529 C:G G C 10 0.529709755145049 0.540999485538695 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42336172 G/A 1 39 35 74 18.3413195493431 18.5398414300767 -0.19852188073363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42336143_42336223:CENPM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 12 16 28 5.64348293825941 8.47535608232078 -2.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.344783466591536 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 251 324 575 118.042851458593 171.625960666996 -53.5831092084032 A:G G A 10 0.529709755145049 8.98105763928814e-06 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 20 26 46 9.40580489709902 13.7724536337713 -4.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.237303902553178 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42609148 T/C 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C T C 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 108 156 264 50.7913464443347 82.6347218026277 -31.8433753582929 T:G G T 10 0.529709755145049 9.63531822221273e-05 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 43032742 C/T 1 39 38 77 18.3413195493431 20.1289706955119 -1.78765114616878 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.732456190867055 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43032721_43032825:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43032721_43032896:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000466276:exon_43032721_43032852:CYB5R3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 37 18 55 17.4007390596332 9.53477559261088 7.8659634670223 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0418660028767604 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 43195114 G/C 1 17 16 33 7.99493416253417 8.47535608232078 -0.480421919786618 C:G G C 10 0.529709755145049 0.863849861169677 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 46 46 92 21.6333512633277 24.3666487366723 -2.73329747334451 C:G G C 10 0.529709755145049 0.602216715419835 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 43563209 G/A 1 131 92 223 61.6080220759986 48.7332974733445 12.8747246026541 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0933484078807482 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43562628_43564165:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000484711:exon_43562629_43564165:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43562664_43563212:TTLL12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 43575956 C/T 1 47 30 77 22.1036415081827 15.8912926543515 6.21234885383122 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.171291793029479 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 33 32 65 15.5195780802134 16.9507121646416 -1.43113408442819 A:G A G 10 0.529709755145049 0.803983286139744 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 58 70 128 27.2768342015872 37.0796828601534 -9.80284865856628 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0923030515822258 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 71 71 142 33.3906073847015 37.6093926152985 -4.21878523059696 A:G A G 10 0.529709755145049 0.501775069531696 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 62 70 132 29.157995181007 37.0796828601534 -7.92168767914647 C:G C G 10 0.529709755145049 0.190735958583355 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 153 119 272 71.9544074628075 63.0354608622608 8.91894660054666 A:C A C 10 0.529709755145049 0.301814957774106 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 45132848 C/T 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 45728482 A/G 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 46722400 T/C 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 47309247 C/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000054611:ENST00000380995:exon_47309230_47309330:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000441162:exon_47309230_47309342:TBC1D22A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 37 46 83 17.4007390596332 24.3666487366723 -6.96590967703907 A:C C A 10 0.529709755145049 0.152442202522201 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50635848 C/G 1 6 13 19 2.82174146912971 6.88622681688564 -4.06448534775593 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0687326222682032 ENSG00000170638:ENST00000472677:exon_50635322_50636615:TRABD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 156 115 271 73.3652781973723 60.9166218416806 12.4486563556917 C:G G C 10 0.529709755145049 0.144027871635530 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50648577 C/T 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 21 27 48 9.87609514195397 14.3021633889163 -4.42606824696235 T:C T C 10 0.529709755145049 0.247168572377601 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50684708 G/A 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 A:G G A 10 0.529709755145049 0.565934397483907 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50704028 C/T 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704011_50704089:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704011_50704089:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704011_50704089:MAPK11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C T C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 61 45 106 28.687704936152 23.8369389815272 4.8507659546248 A:G G A 10 0.529709755145049 0.381541449380778 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 37 33 70 17.4007390596332 17.4804219197866 -0.079682860153433 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 15 9 24 7.05435367282426 4.76738779630544 2.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.416155235770821 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 T:C T C 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 62 55 117 29.157995181007 29.1340365329777 0.0239586480292644 T:C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 72 56 128 33.8608976295565 29.6637462881227 4.19715134143372 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.479601879242661 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 38 29 67 17.8710293044881 15.3615828992064 2.50944640528171 C:G G C 10 0.529709755145049 0.624791682746408 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 28 19 47 13.1681268559386 10.0644853477559 3.1036415081827 A:G G A 10 0.529709755145049 0.384371471466367 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50882590 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 89 86 175 41.8558317920906 45.5550389424742 -3.69920715038359 A:G A G 10 0.529709755145049 0.596491157252988 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 53 42 95 24.9253829773124 22.2478097160921 2.67757326122034 T:C C T 10 0.529709755145049 0.608477600675412 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 20 10 30 9.40580489709902 5.29709755145049 4.10870734564853 A:C C A 10 0.529709755145049 0.146473133160998 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 A:G G A 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 38 28 66 17.8710293044881 14.8318731440614 3.03915616042676 A:G G A 10 0.529709755145049 0.462834558793025 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 19 14 33 8.93551465224407 7.41593657203069 1.51957808021338 A:G G A 10 0.529709755145049 0.727862479978695 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 15 15 30 7.05435367282426 7.94564632717574 -0.891292654351471 A:G G A 10 0.529709755145049 0.855335073836957 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50961169 A/G 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 A:G A G 10 0.529709755145049 0.222987652351953 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 177 139 316 83.2413733393263 73.6296559651618 9.6117173741645 T:G T G 10 0.529709755145049 0.284778297304024 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 74 92 166 34.8014781192664 48.7332974733445 -13.9318193540781 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0354842771159262 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 22 50964862 G/A 1 136 193 329 63.9594733002733 102.233982742994 -38.2745094427211 A:G G A 10 0.529709755145049 2.53258676921214e-05 ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50964675_50964868:SCO2;ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964430_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964675_50964905:TYMP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 13 19 32 6.11377318311436 10.0644853477559 -3.95071216464157 A:G A G 10 0.529709755145049 0.214521438123880 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 4354697 G/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000413809:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000430981:exon_4354582_4356086:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425863:exon_4354582_4354913:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000462115:exon_4354582_4354785:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4354582_4355445:SETMAR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 A:G G A 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 5164135 G/C 1 2 10 12 0.940580489709902 5.29709755145049 -4.35651706174059 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0171879827656164 ENSG00000134108:ENST00000256496:exon_5163905_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000429403:exon_5163934_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000455168:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000444332:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000438743:exon_5164112_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000419534:exon_5163981_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000451374:exon_5163982_5164273:ARL8B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 8578934 C/T 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8578871_8579126:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8578871_8579126:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000470776:exon_8578871_8579204:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8578871_8579126:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8578869_8579126:LMCD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 8809359 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 8955375 T/C 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 T:C C T 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 29 18 47 13.6384171007936 9.53477559261088 4.1036415081827 T:C T C 10 0.529709755145049 0.245531276487518 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 20 24 44 9.40580489709902 12.7130341234812 -3.30722922638216 T:C T C 10 0.529709755145049 0.365674360174437 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 47 49 96 22.1036415081827 25.9557780021074 -3.85213649392471 A:G G A 10 0.529709755145049 0.474503473364419 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9426330 A/G 1 83 88 171 39.0340903229609 46.6144584527643 -7.58036812980339 A:G A G 10 0.529709755145049 0.251336622392196 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 28 22 50 13.1681268559386 11.6536146131911 1.51451224274755 C:G C G 10 0.529709755145049 0.777253688146423 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 32 28 60 15.0492878353584 14.8318731440614 0.217414691297058 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 80 69 149 37.6232195883961 36.5499731050084 1.07324648338769 T:C T C 10 0.529709755145049 0.870053832819528 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9934912 G/A 1 82 88 170 38.563800078106 46.6144584527643 -8.05065837465834 A:G G A 10 0.529709755145049 0.219861875478143 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 9991429 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C T C 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 22 14 36 10.3463853868089 7.41593657203069 2.93044881477823 T:G T G 10 0.529709755145049 0.404405665752156 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 10280678 G/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 C:G G C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000134070:ENST00000256458:exon_10280432_10280723:IRAK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 16 13 29 7.52464391767922 6.88622681688564 0.638417100793578 A:G G A 10 0.529709755145049 0.854345466479414 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 11402163 G/A 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 A:G G A 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11402055_11402258:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11402055_11402258:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11402055_11402258:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11402055_11402258:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000467121:exon_11402055_11402258:ATG7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 11831953 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000498127:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11831920_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000486090:exon_11831922_11832055:C3orf31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 T:C T C 10 0.529709755145049 0.105144579901353 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 16 22 38 7.52464391767922 11.6536146131911 -4.12897069551186 T:C T C 10 0.529709755145049 0.195922017737178 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 12626792 A/G 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 A:G A G 10 0.529709755145049 0.845190735032854 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 34 26 60 15.9898683250683 13.7724536337713 2.21741469129706 A:G A G 10 0.529709755145049 0.606457964898076 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 0 0 23 23 0 12.1833243683361 -12.1833243683361 A C A 10 0.529709755145049 2.91351540011618e-08 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 14200250 C/T 1 24 20 44 11.2869658765188 10.594195102901 0.692770773617843 T:C C T 10 0.529709755145049 0.880788070515154 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 32571147 G/A 1 54 59 113 25.3956732221674 31.2528755535579 -5.85720233139054 A:G G A 10 0.529709755145049 0.300013183396426 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000432458:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000472985:exon_32571122_32571152:DYNC1LI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.128164554624033 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 14 17 31 6.58406342796931 9.00506583746583 -2.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 0.472408092481563 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 T:C T C 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 12 19 31 5.64348293825941 10.0644853477559 -4.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 0.148991251328343 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 45 40 85 21.1630610184728 21.188390205802 -0.0253291873291701 A:T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33906737 T/C 1 67 49 116 31.5094464052817 25.9557780021074 5.55366840317431 T:C T C 10 0.529709755145049 0.3080387249574 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33906735_33906922:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33906735_33906922:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33906735_33906809:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33906735_33906922:PDCD6IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 78 72 150 36.6826390986862 38.1391023704435 -1.45646327175736 A:G A G 10 0.529709755145049 0.870124845349264 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 39107361 C/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 C:G C G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000423296:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39107282_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39107302_39107380:WDR48 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 T:C C T 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 39185248 A/G 1 21 13 34 9.87609514195397 6.88622681688564 2.98986832506833 A:G A G 10 0.529709755145049 0.390699512482042 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 39431918 A/G 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39431914_39431998:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39431914_39431998:SLC25A38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 119 37 156 55.9645391377392 19.5992609403668 36.3652781973723 T:C T C 10 0.529709755145049 2.50745947698644e-09 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 42244201 C/T 1 3 9 12 1.41087073456485 4.76738779630544 -3.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0793760846826338 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42243928_42244398:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42243928_42245681:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42243928_42244246:TRAK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:G A G 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 43591327 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43591212_43591340:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000448045:exon_43591212_43591340:ANO10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 10 18 28 4.70290244854951 9.53477559261088 -4.83187314406137 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0872157428627902 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 139 223 362 65.3703440348382 118.125275397346 -52.7549313625077 C:G G C 10 0.529709755145049 3.51613200557046e-08 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45527218 T/C 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45527184_45527288:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45527184_45527288:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45527184_45527288:LARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45533224 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45533009_45533292:LARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45559519 T/C 1 18 10 28 8.46522440738912 5.29709755145049 3.16812685593863 T:C T C 10 0.529709755145049 0.259768489558292 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45559455_45559564:LARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45565554 A/G 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G A G 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45565489_45565600:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45565489_45565600:LARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 T:C C T 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45637439 T/C 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45637765 A/G 1 6 11 17 2.82174146912971 5.82680730659554 -3.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.154003647189151 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 A:T A T 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47043938 C/T 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 T:C C T 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47043861_47044010:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47043861_47044010:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47043861_47044010:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47043861_47044010:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47043861_47044010:NBEAL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47047081 C/T 1 36 53 89 16.9304488147782 28.0746170226876 -11.1441682079094 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0193689002012438 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000445550:exon_47046979_47047110:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000486870:exon_47046979_47047109:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000423436:exon_47046979_47047109:NBEAL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47163422 C/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47537515 G/A 1 86 45 131 40.4449610575258 23.8369389815272 16.6080220759986 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00376750778349258 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47537130_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47537436_47537687:C3orf75 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 53 57 110 24.9253829773124 30.1934560432678 -5.26807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.339924019193023 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 39 43 82 18.3413195493431 22.7775194712371 -4.43619992189402 T:G G T 10 0.529709755145049 0.376273800771578 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 12 23 35 5.64348293825941 12.1833243683361 -6.53984143007672 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0283346359982096 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 24 20 44 11.2869658765188 10.594195102901 0.692770773617843 A:G A G 10 0.529709755145049 0.880788070515154 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 138 134 272 64.9000537899832 70.9811071894366 -6.08105339945334 T:C C T 10 0.529709755145049 0.466639572993707 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49052422 G/A 1 93 86 179 43.7369927715104 45.5550389424742 -1.81804617096378 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.822391345170303 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49052258_49052791:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49052258_49052858:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49052258_49053022:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49052258_49052798:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49052258_49052780:WDR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49135961 C/G 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 C:G C G 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49151428 C/T 1 19 19 38 8.93551465224407 10.0644853477559 -1.12897069551186 T:C C T 10 0.529709755145049 0.747150865732143 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49154948 T/A 1 14 16 30 6.58406342796931 8.47535608232078 -1.89129265435147 A:T T A 10 0.529709755145049 0.584147049833183 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49154900_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000488993:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000480163:exon_49154900_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000491859:exon_49154870_49155003:USP19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49455330 C/T 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000145020:ENST00000465925:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000427987:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000458307:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476226:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000273588:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000454938:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000395338:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476127:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000399379:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000473163:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000430521:exon_49455328_49455406:AMT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 25 20 45 11.7572561213738 10.594195102901 1.16306101847279 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.766921233209028 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49723655 C/T 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49723029_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49723029_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49723029_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484269:exon_49723495_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000497359:exon_49723029_49724299:MST1;ENSG00000173531:ENST00000480268:exon_49723293_49723703:MST1;ENSG00000173531:ENST00000494809:exon_49723495_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484673:exon_49723318_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000432076:exon_49723455_49723914:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492370:exon_49723601_49724500:MST1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49846852 G/A 1 80 92 172 37.6232195883961 48.7332974733445 -11.1100778849484 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0931525186840539 ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49846823_49846897:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000488536:exon_49846823_49847138:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000483751:exon_49846441_49847158:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000478875:exon_49846617_49847158:UBA7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 49946812 G/A 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:G G A 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000455683:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000486107:exon_49946308_49948317:MON1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 50327662 G/A 1 40 51 91 18.811609794198 27.0151975123975 -8.20358771819946 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0929889756067876 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327601_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327601_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327601_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327601_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327601_50327682:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327601_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327601_50328110:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000484043:exon_50327601_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000462001:exon_50327440_50328110:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000468737:exon_50327612_50327725:IFRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 50390926 G/A 1 22 20 42 10.3463853868089 10.594195102901 -0.24780971609206 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000114395:ENST00000425346:exon_50390672_50391500:CYB561D2;ENSG00000114395:ENST00000424512:exon_50390672_50391483:CYB561D2;ENSG00000114395:ENST00000232508:exon_50390672_50391500:CYB561D2;ENSG00000114395:ENST00000418577:exon_50390672_50391463:CYB561D2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 2 19 21 0.940580489709902 10.0644853477559 -9.12390485804603 T:G T G 10 0.529709755145049 6.98228852164728e-05 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 50614965 G/A 1 14 5 19 6.58406342796931 2.64854877572525 3.93551465224407 A:G G A 10 0.529709755145049 0.105365114705801 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50614940_50615004:HEMK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 51977512 C/T 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.105144579901353 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51977373_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51977370_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51977370_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470601:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470749:exon_51977315_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51977327_51977554:PARP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 51994587 T/C 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000090097:ENST00000355852:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000492809:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000497390:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000461554:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000484633:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000322099:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000471308:exon_51994542_51994653:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000498822:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000395013:exon_51994542_51994694:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000395014:exon_51994542_51994694:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000428823:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000471622:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000294192:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000468324:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000466412:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000497653:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000489595:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000490063:exon_51994538_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000483411:exon_51994573_51994658:PCBP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 52156461 A/C 1 11 21 32 5.17319269340446 11.123904858046 -5.95071216464157 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0497230307339173 ENSG00000164087:ENST00000296484:exon_52156395_52156493:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000394970:exon_52156395_52156493:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000474012:exon_52156395_52156493:POC1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 52183854 C/G 1 13 7 20 6.11377318311436 3.70796828601534 2.40580489709902 C:G C G 10 0.529709755145049 0.371396387099242 ENSG00000164087:ENST00000296484:exon_52183832_52184003:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000394970:exon_52183832_52184003:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000474012:exon_52183832_52184003:POC1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 52183958 G/A 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G G A 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000164087:ENST00000296484:exon_52183832_52184003:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000394970:exon_52183832_52184003:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000474012:exon_52183832_52184003:POC1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 T:C C T 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 80 72 152 37.6232195883961 38.1391023704435 -0.515882782047456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.935449833790469 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53213657 T/C 1 27 29 56 12.6978366110837 15.3615828992064 -2.66374628812274 T:C T C 10 0.529709755145049 0.505100900677937 ENSG00000163932:ENST00000478843:exon_53213593_53213710:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000487897:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000464818:exon_53213593_53213792:PRKCD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 151 169 320 71.0138269730976 89.5209486195133 -18.5071216464157 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0436276836340517 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 99 85 184 46.5587342406401 45.0253291873292 1.53340505331098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.825194815949523 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 35 23 58 16.4601585699233 12.1833243683361 4.27683420158715 A:C A C 10 0.529709755145049 0.293563430527675 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53856653 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53856518_53856669:CHDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53892775 C/T 1 30 8 38 14.1087073456485 4.23767804116039 9.87102930448814 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00162701555114944 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53892746_53892845:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53891643_53892845:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53892746_53892845:IL17RB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 53906434 C/A 1 33 34 67 15.5195780802134 18.0101316749317 -2.49055359471829 A:C C A 10 0.529709755145049 0.543705708385578 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 56763619 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 C:G C G 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58109162 G/A 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 A:G G A 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58108820_58109417:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58108820_58109417:FLNB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58112488 C/T 1 6 14 20 2.82174146912971 7.41593657203069 -4.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0447858833698306 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58118555 G/A 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58118535_58118658:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58117805_58118658:FLNB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58133989 G/A 1 18 10 28 8.46522440738912 5.29709755145049 3.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.259768489558292 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58133933_58134091:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000491408:exon_58133933_58134091:FLNB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 62 52 114 29.157995181007 27.5449072675425 1.61308791346441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.779145174109525 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 58395842 A/T 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 A:T A T 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000459676:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000495557:exon_58395817_58395886:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58395817_58395886:PXK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 59997112 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59997097_59997126:FHIT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 23 23 46 10.8166756316639 12.1833243683361 -1.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.768168914109342 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 66430877 G/C 1 8 13 21 3.76232195883961 6.88622681688564 -3.12390485804603 C:G G C 10 0.529709755145049 0.194002803571841 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 66431187 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 41 35 76 19.281900039053 18.5398414300767 0.742058608976272 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.908811752144201 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 69079037 T/C 1 22 20 42 10.3463853868089 10.594195102901 -0.24780971609206 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69078966_69079158:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69078966_69079158:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69078966_69079128:TMF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 69113229 A/G 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000144744:ENST00000415609:exon_69113219_69113262:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000361055:exon_69113219_69113262:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000349511:exon_69113219_69113262:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000461522:exon_69113219_69113242:UBA3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 73111973 A/G 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 75471230 C/T 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.190312819130244 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 75471295 C/T 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C C T 10 0.529709755145049 0.819181859619382 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 75471341 G/A 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G G A 10 0.529709755145049 0.467293566928568 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 75472209 C/T 1 14 14 28 6.58406342796931 7.41593657203069 -0.831873144061372 T:C C T 10 0.529709755145049 0.850483860830919 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 81698119 C/T 1 16 15 31 7.52464391767922 7.94564632717574 -0.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 33 23 56 15.5195780802134 12.1833243683361 3.33625371187725 A:G G A 10 0.529709755145049 0.422689843824957 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 27 16 43 12.6978366110837 8.47535608232078 4.22248052876289 T:C C T 10 0.529709755145049 0.223065410524709 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 34 39 73 15.9898683250683 20.6586804506569 -4.66881212558858 T:C T C 10 0.529709755145049 0.292545821025389 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 22 19 41 10.3463853868089 10.0644853477559 0.281900039052989 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C T C 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 T:C T C 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 T:G T G 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 98512540 G/A 1 28 17 45 13.1681268559386 9.00506583746583 4.16306101847279 A:G G A 10 0.529709755145049 0.234439621392741 ENSG00000064225:ENST00000483910:exon_98512519_98513206:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000469105:exon_98512519_98514098:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000462152:exon_98512519_98512788:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000486249:exon_98512519_98514689:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000497621:exon_98512519_98513237:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000493584:exon_98512519_98512839:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000394162:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000265261:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000474595:exon_98512519_98512609:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000491912:exon_98512519_98512636:ST3GAL6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 45 56 101 21.1630610184728 29.6637462881227 -8.50068526964995 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0912479803318074 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 100119548 T/C 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 T:C T C 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100119470_100120242:TOMM70A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 52 53 105 24.4550927324575 28.0746170226876 -3.61952429023015 T:C T C 10 0.529709755145049 0.494979421471382 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 105266274 T/C 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105266234_105266367:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105266234_105266371:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105266234_105266371:ALCAM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 39 23 62 18.3413195493431 12.1833243683361 6.15799518100696 A:G A G 10 0.529709755145049 0.127652606516824 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:G T G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 14 6 20 6.58406342796931 3.17825853087029 3.40580489709902 A:G G A 10 0.529709755145049 0.178023707720634 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 107938272 G/A 1 17 18 35 7.99493416253417 9.53477559261088 -1.53984143007672 A:G G A 10 0.529709755145049 0.615853463666398 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107938257_107938419:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107938257_107938419:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107938257_107938419:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107938257_107938391:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000492106:exon_107938252_107938419:IFT57 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 123 95 218 57.845700117159 50.3224267387797 7.52327337837931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.309894777380043 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 119 127 246 55.9645391377392 67.2731389034212 -11.3085997656821 A:G G A 10 0.529709755145049 0.15994796297532 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 112299734 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 112738423 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112738389_112738686:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112738389_112738580:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112738389_112738553:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112738389_112738501:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112738389_112738505:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112738389_112738511:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112738389_112738708:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112738389_112738511:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112738389_112738517:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112738389_112738513:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112738389_112738518:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000496206:exon_112738389_112738491:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000460410:exon_112738389_112738679:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000494164:exon_112738389_112738698:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000491121:exon_112738389_112738568:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000494575:exon_112738389_112738518:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000494891:exon_112738389_112738450:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000470663:exon_112738389_112738528:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000496340:exon_112738389_112738518:C3orf17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 20 12 32 9.40580489709902 6.35651706174059 3.04928783535843 A:G G A 10 0.529709755145049 0.294479310623092 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 32 45 77 15.0492878353584 23.8369389815272 -8.78765114616878 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0518704363385528 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 76 75 151 35.7420586089763 39.7282316358787 -3.98617302690241 T:C C T 10 0.529709755145049 0.515742063316432 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 119301139 C/T 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119300981_119301314:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119300912_119301314:ADPRH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 19 9 28 8.93551465224407 4.76738779630544 4.16812685593863 T:C T C 10 0.529709755145049 0.131607092593009 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121155122 C/T 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:C C T 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121351257 C/T 1 309 298 607 145.31968566018 157.853507033225 -12.5338213730448 T:C C T 10 0.529709755145049 0.309700168373916 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 255 238 493 119.924012438012 126.070921724522 -6.14690928650917 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.58843069144528 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 265 262 527 124.626914886562 138.783955848003 -14.1570409614408 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.221913484956020 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121363680 C/T 1 283 235 518 133.092139293951 124.481792459087 8.61034683486461 T:C C T 10 0.529709755145049 0.454633992400641 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121363665_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121363077_121363775:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121363665_121363775:HCLS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 16 20 36 7.52464391767922 10.594195102901 -3.06955118522177 A:G G A 10 0.529709755145049 0.320976259820328 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121507231 A/T 1 41 59 100 19.281900039053 31.2528755535579 -11.9709755145049 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0207548449297559 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121507131_121507279:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121507131_121507279:IQCB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121563355 T/C 1 62 50 112 29.157995181007 26.4854877572525 2.67250742375451 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.636957640332638 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 67 104 171 31.5094464052817 55.0898145350851 -23.5803681298034 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.000393889037821556 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122128637 C/T 1 422 398 820 198.462483328789 210.82448254773 -12.3619992189402 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.401161535644647 ENSG00000114023:ENST00000232125:exon_122128586_122128764:FAM162A;ENSG00000114023:ENST00000477892:exon_122128586_122131181:FAM162A;ENSG00000114023:ENST00000440333:exon_122128603_122128698:FAM162A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 32 33 65 15.0492878353584 17.4804219197866 -2.43113408442819 T:C T C 10 0.529709755145049 0.619537137694349 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 37 39 76 17.4007390596332 20.6586804506569 -3.25794139102373 C:G G C 10 0.529709755145049 0.491316735900012 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122288210 G/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122287336_122288871:DTX3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122345870 C/T 1 13 5 18 6.11377318311436 2.64854877572525 3.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154758627526364 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000473627:exon_122345674_122345880:PARP15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 103 70 173 48.43989522006 37.0796828601534 11.3602123599065 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0936057471634836 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 95 69 164 44.6775732612203 36.5499731050084 8.12760015621195 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.211416112200533 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 T:G T G 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 124731485 C/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 124746347 T/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 51 27 78 23.9848024876025 14.3021633889163 9.68263909868618 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0308798490547119 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 30 12 42 14.1087073456485 6.35651706174059 7.75219028390794 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0195975010585981 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 28 16 44 13.1681268559386 8.47535608232078 4.69277077361784 T:C C T 10 0.529709755145049 0.175395806807994 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 17 15 32 7.99493416253417 7.94564632717574 0.049287835358431 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 126160641 G/A 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000070476:ENST00000514463:exon_126158475_126162252:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126160608_126160789:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126160608_126160789:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126160608_126160789:ZXDC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 T:G G T 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 127394820 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000114626:ENST00000483857:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127394813_127394903:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475265:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000493365:exon_127394813_127395278:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000479280:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000467179:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127394329_127395274:ABTB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 127441239 T/A 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 A:T T A 10 0.529709755145049 0.247772282984734 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 127783698 A/T 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000175792:ENST00000472125:exon_127783625_127784063:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127783628_127784063:RUVBL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 189 155 344 88.8848562775857 82.1050120474826 6.77984423010312 A:G A G 10 0.529709755145049 0.482789107732504 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 127980995 C/T 1 17 13 30 7.99493416253417 6.88622681688564 1.10870734564853 T:C C T 10 0.529709755145049 0.718335261369696 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127980971_127981067:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127980971_127981067:EEFSEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 113 84 197 53.1427976686095 44.4956194321841 8.64717823642534 T:C C T 10 0.529709755145049 0.225543250103574 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 131100956 C/G 1 46 48 94 21.6333512633277 25.4260682469624 -3.79271698363461 C:G C G 10 0.529709755145049 0.470014718356586 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131100890_131101159:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131100890_131101159:NUDT16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 133329943 G/A 1 37 25 62 17.4007390596332 13.2427438786262 4.15799518100696 A:G G A 10 0.529709755145049 0.310794437042138 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 133356790 G/A 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:G G A 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133356720_133357006:TOPBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 133362154 A/G 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133362044_133362216:TOPBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 133368362 T/G 1 14 6 20 6.58406342796931 3.17825853087029 3.40580489709902 T:G T G 10 0.529709755145049 0.178023707720634 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000511439:exon_133368227_133368477:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000509162:exon_133368227_133368786:TOPBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 134278270 C/T 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134277992_134278271:CEP63 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 A:T:G T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 138244400 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138244332_138244406:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138244332_138244406:CEP70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 53 38 91 24.9253829773124 20.1289706955119 4.79641228180054 T:C C T 10 0.529709755145049 0.345176539819031 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 18 25 43 8.46522440738912 13.2427438786262 -4.77751947123711 T:C C T 10 0.529709755145049 0.169309647806105 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 146234853 C/T 1 26 30 56 12.2275463662287 15.8912926543515 -3.66374628812274 T:C C T 10 0.529709755145049 0.350519465284021 ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 G G 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 46 45 91 21.6333512633277 23.8369389815272 -2.20358771819946 A:G A G 10 0.529709755145049 0.675159557946507 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 21 12 33 9.87609514195397 6.35651706174059 3.51957808021338 T:G T G 10 0.529709755145049 0.228543602655958 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 14 16 30 6.58406342796931 8.47535608232078 -1.89129265435147 T:C C T 10 0.529709755145049 0.584147049833183 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 89 0 89 41.8558317920906 0 41.8558317920906 T T 10 0.529709755145049 3.10146766821493e-25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 150262318 C/T 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 T:C C T 10 0.529709755145049 0.556736795064713 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 40 45 85 18.811609794198 23.8369389815272 -5.02532918732917 C:G C G 10 0.529709755145049 0.279497188195363 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 150460117 G/A 1 66 48 114 31.0391561604268 25.4260682469624 5.61308791346441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.303416971543025 ENSG00000181788:ENST00000312960:exon_150458914_150460485:SIAH2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 152018102 G/A 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000152601:ENST00000282486:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000324196:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000282488:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000357472:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000355460:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000461436:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000324210:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000498502:exon_152017194_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000485910:exon_152017472_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000463374:exon_152017472_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000465907:exon_152017983_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000492948:exon_152017983_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000485509:exon_152017983_152018156:MBNL1;ENSG00000152601:ENST00000464596:exon_152017987_152018156:MBNL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 29 26 55 13.6384171007936 13.7724536337713 -0.134036532977696 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 156877707 A/T 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 A:T A T 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000163660:ENST00000461804:exon_156877581_156878549:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295926:exon_156877581_156878002:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000475298:exon_156877581_156877944:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000470121:exon_156877581_156877883:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000476367:exon_156877581_156877899:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000477127:exon_156877581_156877967:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000417607:exon_156877581_156878482:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000479596:exon_156877581_156877924:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000465947:exon_156877581_156877925:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295925:exon_156877581_156878482:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000471044:exon_156877581_156877947:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000466101:exon_156877581_156877926:CCNL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 158546813 C/T 1 14 16 30 6.58406342796931 8.47535608232078 -1.89129265435147 T:C C T 10 0.529709755145049 0.584147049833183 ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158546768_158547508:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158546768_158547508:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158546768_158547505:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158546768_158547505:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158546768_158547504:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000437603:exon_158546768_158547504:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158546768_158547504:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000465624:exon_158546768_158546952:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000465235:exon_158546768_158547507:MFSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 159997061 T/A 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 A:T T A 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_159996981_159997152:RP11-432B6.3;ENSG00000068885:ENST00000326448:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000483465:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000496589:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000487943:exon_159996981_159997152:IFT80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 A:G G A 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 22 11 33 10.3463853868089 5.82680730659554 4.51957808021338 A:G A G 10 0.529709755145049 0.120482220197214 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 172241078 C/T 1 18 5 23 8.46522440738912 2.64854877572525 5.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0197583414854022 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172241043_172241297:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172241043_172241265:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172241043_172241269:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000430881:exon_172241043_172241100:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000494851:exon_172241043_172241257:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000472804:exon_172241043_172241255:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000466777:exon_172241043_172241257:TNFSF10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 178976777 C/T 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000171121:ENST00000392686:exon_178976736_178977679:KCNMB3;ENSG00000171121:ENST00000485523:exon_178976736_178976996:KCNMB3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 178978078 T/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:G T G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 38 44 82 17.8710293044881 23.3072292263822 -5.43619992189402 A:G A G 10 0.529709755145049 0.268524263635211 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 182631792 C/A 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182631649_182631891:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000491699:exon_182631649_182632393:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000484691:exon_182631649_182631884:ATP11B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 28 48 76 13.1681268559386 25.4260682469624 -12.2579413910237 T:C:G T G 10 0.529709755145049 0.00556578132013426 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 182790249 G/A 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 A:G G A 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000486226:exon_182790215_182790275:MCCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 38 20 58 17.8710293044881 10.594195102901 7.27683420158715 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0650527615141567 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 87 90 177 40.9152513023807 47.6738779630544 -6.75862666067368 C:G C G 10 0.529709755145049 0.327919657893 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 54 73 127 25.3956732221674 38.6688121255886 -13.2731389034212 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0205800143012152 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 183904049 A/G 1 25 27 52 11.7572561213738 14.3021633889163 -2.54490726754255 A:G A G 10 0.529709755145049 0.49074383009985 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 30 15 45 14.1087073456485 7.94564632717574 6.16306101847279 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0733869552416633 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 154 119 273 72.4246977076624 63.0354608622608 9.38923684540161 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.275152898236612 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 19 5 24 8.93551465224407 2.64854877572525 6.28696587651882 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0126521100153453 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 184717603 G/A 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184717484_184717649:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184717484_184717649:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184717484_184717649:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184717484_184717649:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184717484_184717649:VPS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 21 14 35 9.87609514195397 7.41593657203069 2.46015856992328 T:C T C 10 0.529709755145049 0.498888420364794 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 186268924 C/T 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 T:C C T 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186268918_186269068:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186268918_186269068:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186268918_186269068:TBCCD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 186272156 C/T 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000479590:exon_186272043_186272264:TBCCD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 19 9 28 8.93551465224407 4.76738779630544 4.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.131607092593009 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 15 15 30 7.05435367282426 7.94564632717574 -0.891292654351471 A:C C A 10 0.529709755145049 0.855335073836957 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 18 18 36 8.46522440738912 9.53477559261088 -1.06955118522177 A:G G A 10 0.529709755145049 0.741182689376126 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 21 25 46 9.87609514195397 13.2427438786262 -3.36664873667226 A:C C A 10 0.529709755145049 0.375953294854275 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 98 85 183 46.0884439957852 45.0253291873292 1.06311480845603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.882588337587841 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 T:C T C 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 A:T T A 10 0.529709755145049 0.360958604388602 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 6 11 17 2.82174146912971 5.82680730659554 -3.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.154003647189151 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 194373577 G/A 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 A:G G A 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000437613:exon_194373458_194373831:LSG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 194387300 C/T 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 T:C C T 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 194408716 G/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 C:G G C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 17 18 35 7.99493416253417 9.53477559261088 -1.53984143007672 A:G A G 10 0.529709755145049 0.615853463666398 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 22 17 39 10.3463853868089 9.00506583746583 1.34131954934309 T:C C T 10 0.529709755145049 0.749255609022721 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 195615376 A/G 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000438207:exon_195615297_195615455:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000433111:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000427576:exon_195615297_195615477:TNK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 23 19 42 10.8166756316639 10.0644853477559 0.75219028390794 T:G G T 10 0.529709755145049 0.877836413427248 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 196199274 A/G 1 18 11 29 8.46522440738912 5.82680730659554 2.63841710079358 A:G A G 10 0.529709755145049 0.357377168018118 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 196210590 A/G 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.159183095005099 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 39 37 76 18.3413195493431 19.5992609403668 -1.25794139102373 T:C T C 10 0.529709755145049 0.818627747639723 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 196281263 C/T 1 51 44 95 23.9848024876025 23.3072292263822 0.677573261220342 T:C C T 10 0.529709755145049 0.91842071428598 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 196733596 C/T 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196733420_196733607:MFI2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 15 18 33 7.05435367282426 9.53477559261088 -2.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.39060695666354 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197402272 G/A 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197403844 T/C 1 31 28 59 14.5789975905035 14.8318731440614 -0.252875553557892 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197403088_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197403711_197403909:KIAA0226 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197421203 T/C 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C T C 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 20 8 28 9.40580489709902 4.23767804116039 5.16812685593863 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0583086814385549 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197432000 C/T 1 14 3 17 6.58406342796931 1.58912926543515 4.99493416253417 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0153308858224054 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197432029 C/A 1 10 1 11 4.70290244854951 0.529709755145049 4.17319269340446 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0132519072418753 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 17 18 35 7.99493416253417 9.53477559261088 -1.53984143007672 A:G G A 10 0.529709755145049 0.615853463666398 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 6 13 19 2.82174146912971 6.88622681688564 -4.06448534775593 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0687326222682032 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 437221 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 437831 C/T 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000503157:exon_437736_438221:ZNF721 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 437886 G/A 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000503157:exon_437736_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000505900:exon_437872_438221:ZNF721 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 438067 C/T 1 16 10 26 7.52464391767922 5.29709755145049 2.22754636622872 T:C C T 10 0.529709755145049 0.435653149735385 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000503157:exon_437736_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000505900:exon_437872_438221:ZNF721 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 499568 C/T 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511448:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_499507_499716:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_499507_499716:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 8 15 23 3.76232195883961 7.94564632717574 -4.18332436833613 A:G G A 10 0.529709755145049 0.095420992781267 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 12 12 24 5.64348293825941 6.35651706174059 -0.713034123481176 T:C T C 10 0.529709755145049 0.839383953258665 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 7 11 18 3.29203171398466 5.82680730659554 -2.53477559261088 T:C T C 10 0.529709755145049 0.247451477742465 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 12 15 27 5.64348293825941 7.94564632717574 -2.30216338891632 T:C T C 10 0.529709755145049 0.442240172896858 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 37 47 84 17.4007390596332 24.8963584918173 -7.49561943218412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.125449516208697 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 17 13 30 7.99493416253417 6.88622681688564 1.10870734564853 A:G A G 10 0.529709755145049 0.718335261369696 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 675762 C/T 1 29 19 48 13.6384171007936 10.0644853477559 3.57393175303765 T:C C T 10 0.529709755145049 0.315454300069231 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 844781 G/A 1 90 77 167 42.3261220369456 40.7876511461688 1.53847089077681 A:G G A 10 0.529709755145049 0.816709304536345 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_844724_844805:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_844724_845762:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_844724_847616:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_844724_844872:GAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 860204 C/T 1 27 12 39 12.6978366110837 6.35651706174059 6.34131954934309 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0531017147074775 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 944210 A/C 1 14 3 17 6.58406342796931 1.58912926543515 4.99493416253417 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0153308858224054 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_944209_944279:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_944209_944306:TMEM175 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 951791 T/C 1 18 22 40 8.46522440738912 11.6536146131911 -3.18839020580196 T:C T C 10 0.529709755145049 0.344070881377803 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_951612_951867:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 995868 C/T 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000127415:ENST00000247933:exon_995770_995949:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000453894:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514698:exon_995467_996273:IDUA;ENSG00000127415:ENST00000514224:exon_995770_995949:IDUA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1161293 T/C 1 22 24 46 10.3463853868089 12.7130341234812 -2.36664873667226 T:C T C 10 0.529709755145049 0.555319847357411 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1160720_1161444:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1160725_1161444:SPON2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1165641 C/T 1 6 9 15 2.82174146912971 4.76738779630544 -1.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.43903950278177 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000503765:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000504909:exon_1165640_1166086:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000512888:exon_1165314_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000512150:exon_1165542_1165862:SPON2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1165764 C/T 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000503765:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000504909:exon_1165640_1166086:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000512888:exon_1165314_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000512150:exon_1165542_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000515004:exon_1165667_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000502483:exon_1165677_1165862:SPON2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1244416 A/G 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G A G 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1244624 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1309265 C/T 1 31 46 77 14.5789975905035 24.3666487366723 -9.78765114616878 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0296328534711720 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1309185_1309388:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1309185_1309388:MAEA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 32 19 51 15.0492878353584 10.0644853477559 4.9848024876025 T:C T C 10 0.529709755145049 0.206350262551249 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1389482 G/A 1 30 22 52 14.1087073456485 11.6536146131911 2.45509273245745 A:G G A 10 0.529709755145049 0.57893238011456 ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1725160 G/A 1 28 39 67 13.1681268559386 20.6586804506569 -7.49055359471829 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0858698884652683 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1725148_1725310:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1725148_1725310:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1725148_1725310:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1725148_1725310:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1725148_1725310:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000493975:exon_1725148_1725310:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1725148_1725310:TACC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 71 49 120 33.3906073847015 25.9557780021074 7.43482938259412 A:G G A 10 0.529709755145049 0.200289821322762 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 87 53 140 40.9152513023807 28.0746170226876 12.8406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0339687455407458 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G 1 79 96 175 37.1529293435411 50.8521364939247 -13.6992071503836 C:G C G 10 0.529709755145049 0.040810013419186 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 51 58 109 23.9848024876025 30.7231657984128 -6.73836331081034 A:G G A 10 0.529709755145049 0.212575851928635 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2233709 A/G 1 21 23 44 9.87609514195397 12.1833243683361 -2.30722922638216 A:G A G 10 0.529709755145049 0.546780725832453 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2252237 C/T 1 56 33 89 26.3362537118773 17.4804219197866 8.85583179209064 T:C C T 10 0.529709755145049 0.07056827694839 ENSG00000123933:ENST00000337190:exon_2249159_2252428:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513372:exon_2251191_2252428:MXD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2514846 C/T 1 28 22 50 13.1681268559386 11.6536146131911 1.51451224274755 T:C C T 10 0.529709755145049 0.777253688146423 ENSG00000063978:ENST00000314289:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000502316:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000509388:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000507247:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511859:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000506706:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511600:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000508235:exon_2514810_2514858:RNF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2698230 G/A 1 16 12 28 7.52464391767922 6.35651706174059 1.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.708257762313321 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000506120:exon_2698001_2698320:FAM193A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2743983 G/A 1 156 148 304 73.3652781973723 78.3970437614673 -5.03176556409491 A:G G A 10 0.529709755145049 0.56616250316364 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2744289 C/G 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 C:G C G 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2746400 G/A 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 A:G G A 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2746114_2746590:TNIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:G G T 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2826912 C/G 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826853_2826947:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826853_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2826478_2826923:SH3BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 30 17 47 14.1087073456485 9.00506583746583 5.1036415081827 T:G T G 10 0.529709755145049 0.145964510179764 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2896425 C/T 1 56 32 88 26.3362537118773 16.9507121646416 9.38554154723569 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0540181900102007 ENSG00000087274:ENST00000508684:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000509039:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000508277:exon_2896309_2896460:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000506157:exon_2896309_2896458:ADD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 66 80 146 31.0391561604268 42.3767804116039 -11.3376242511772 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0678922636677529 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 56 89 145 26.3362537118773 47.1441682079094 -20.8079144960321 A:C:G C G 10 0.529709755145049 0.00060666811237194 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2932589 C/T 1 263 216 479 123.686334396852 114.417307111331 9.26902728552152 T:C C T 10 0.529709755145049 0.410149817438564 ENSG00000109736:ENST00000514800:exon_2932288_2932877:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000355443:exon_2932292_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000514031:exon_2932292_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000329687:exon_2932295_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000503596:exon_2932310_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508221:exon_2932330_2932877:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507272:exon_2932332_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507555:exon_2932338_2932680:MFSD10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2934920 T/G 1 56 50 106 26.3362537118773 26.4854877572525 -0.149234045375195 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000109736:ENST00000514800:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000355443:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000329687:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000503596:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508221:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507555:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000509676:exon_2934327_2934936:MFSD10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 2943419 G/A 1 65 57 122 30.5688659155718 30.1934560432678 0.375409872304019 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 3156197 T/C 0 0 9 9 0 4.76738779630544 -4.76738779630544 C T C 10 0.529709755145049 0.00112536585279539 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 3231652 G/A 1 44 31 75 20.6927707736178 16.4210024094965 4.27176836412132 A:G G A 10 0.529709755145049 0.35563807872209 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3231614_3231769:HTT;ENSG00000197386:ENST00000513806:exon_3231614_3231769:HTT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 6619204 G/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000510427:exon_6619175_6619219:MAN2B2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 19 7 26 8.93551465224407 3.70796828601534 5.22754636622872 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0485576299439573 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 10445427 A/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 10586571 G/A 1 10 9 19 4.70290244854951 4.76738779630544 -0.064485347755932 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000429087:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000442825:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000507719:exon_10586551_10586579:CLNK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 13603981 T/C 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 16 17 33 7.52464391767922 9.00506583746583 -1.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.606794931813472 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 17 11 28 7.99493416253417 5.82680730659554 2.16812685593863 C:G G C 10 0.529709755145049 0.45357316422273 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 65 49 114 30.5688659155718 25.9557780021074 4.61308791346441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.399921556545931 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 22 13 35 10.3463853868089 6.88622681688564 3.46015856992328 T:C C T 10 0.529709755145049 0.309724657197588 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 17818885 T/C 1 6 20 26 2.82174146912971 10.594195102901 -7.77245363377128 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00263267478735918 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17818884_17819076:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000509719:exon_17818855_17819076:NCAPG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 25125703 C/G 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 C:G C G 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000503150:exon_25125703_25125847:SEPSECS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 36069805 G/A 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000047365:ENST00000303965:exon_36067620_36069900:ARAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 T:C T C 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38016395 T/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 119 91 210 55.9645391377392 48.2035877181995 7.7609514195397 A:G A G 10 0.529709755145049 0.300059470844163 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 55 42 97 25.8659634670223 22.2478097160921 3.61815375093024 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.478151330723266 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 29 5 34 13.6384171007936 2.64854877572525 10.9898683250683 T:G T G 10 0.529709755145049 0.000101637194467064 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38776129 T/C 1 25 4 29 11.7572561213738 2.1188390205802 9.63841710079358 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000257163158874644 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 23 6 29 10.8166756316639 3.17825853087029 7.63841710079358 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00465603548011418 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C C T 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 42 51 93 19.7521902839079 27.0151975123975 -7.26300722848956 A:T:G T G 10 0.529709755145049 0.145908347359215 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 55 47 102 25.8659634670223 24.8963584918173 0.969604975204998 A:C C A 10 0.529709755145049 0.921056677546572 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 23 36 59 10.8166756316639 19.0695511852218 -8.25287555355789 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0364438353444232 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 10 20 30 4.70290244854951 10.594195102901 -5.89129265435147 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0425900324354375 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 T:G T G 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 38830350 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 47 41 88 22.1036415081827 21.718099960947 0.385541547235682 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 39306471 C/G 1 16 15 31 7.52464391767922 7.94564632717574 -0.42100240949652 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39306434_39306548:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39306434_39306548:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000504554:exon_39306434_39306548:RFC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 40138676 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40138564_40138702:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40138564_40138702:N4BP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 42414945 G/A 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G G A 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000124406:ENST00000381668:exon_42410390_42415030:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000514372:exon_42410390_42415030:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000381662:exon_42410390_42415030:ATP8A1;ENSG00000124406:ENST00000264449:exon_42410394_42415030:ATP8A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 7 9 16 3.29203171398466 4.76738779630544 -1.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.467272608400718 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 32 33 65 15.0492878353584 17.4804219197866 -2.43113408442819 A:G A G 10 0.529709755145049 0.619537137694349 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 54011576 T/C 1 27 29 56 12.6978366110837 15.3615828992064 -2.66374628812274 T:C T C 10 0.529709755145049 0.505100900677937 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 15 10 25 7.05435367282426 5.29709755145049 1.75725612137377 T:C T C 10 0.529709755145049 0.550990071693142 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 56874517 A/C 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:C A C 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56874493_56874548:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56874493_56874548:CEP135 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 26 15 41 12.2275463662287 7.94564632717574 4.28190003905299 A:C A C 10 0.529709755145049 0.211406578254901 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 57219613 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57219570_57219762:AASDH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 73930552 G/A 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 A:G G A 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 30 22 52 14.1087073456485 11.6536146131911 2.45509273245745 A:G G A 10 0.529709755145049 0.57893238011456 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 74464386 G/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:G G T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74464357_74464435:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74464357_74464435:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74464357_74464435:RASSF6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G A G 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 76721584 G/A 1 31 22 53 14.5789975905035 11.6536146131911 2.9253829773124 A:G G A 10 0.529709755145049 0.491971052991262 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76721504_76721622:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76721504_76721622:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76721504_76721622:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76721504_76721622:USO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 70 78 148 32.9203171398466 41.3173609013138 -8.39704376146726 C:G G C 10 0.529709755145049 0.187527227804498 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 18 21 39 8.46522440738912 11.123904858046 -2.65868045065691 T:C T C 10 0.529709755145049 0.425273721287587 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 7 19 26 3.29203171398466 10.0644853477559 -6.77245363377128 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0096424501115564 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 T:C T C 10 0.529709755145049 0.222987652351953 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 80828555 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000163297:ENST00000403729:exon_80822303_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000482406:exon_80827916_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000491345:exon_80828324_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000404191:exon_80828507_80828621:ANTXR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 17 23 40 7.99493416253417 12.1833243683361 -4.18839020580196 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206547223036203 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 84374692 A/G 1 24 26 50 11.2869658765188 13.7724536337713 -2.48548775725245 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.483273875280016 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 84377203 C/T 1 5 12 17 2.35145122427475 6.35651706174059 -4.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0859527586065674 ENSG00000163319:ENST00000512375:exon_84377085_84377330:MRPS18C;ENSG00000163319:ENST00000295491:exon_84377118_84377330:MRPS18C;ENSG00000163319:ENST00000507019:exon_84377136_84377330:MRPS18C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 87968524 G/A 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000172493:ENST00000504956:exon_87967847_87969201:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000507468:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000395146:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000395142:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000503477:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000307808:exon_87967847_87968746:AFF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 89649659 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000138640:ENST00000395002:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000264344:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000341818:exon_89647106_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000511573:exon_89648220_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000509478:exon_89648220_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000503556:exon_89648577_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000511976:exon_89648580_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000508369:exon_89648806_89649810:FAM13A;ENSG00000138640:ENST00000513837:exon_89649330_89649810:FAM13A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 99808254 G/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000151247:ENST00000450253:exon_99808230_99808343:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000280892:exon_99808230_99808343:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000515638:exon_99808230_99808318:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000504432:exon_99808230_99808343:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000511644:exon_99808230_99808343:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000505992:exon_99808230_99808343:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000505194:exon_99808230_99808343:EIF4E;ENSG00000151247:ENST00000507665:exon_99807502_99808343:EIF4E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 100787233 C/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:C C A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000070190:ENST00000296414:exon_100787191_100787278:DAPP1;ENSG00000070190:ENST00000512369:exon_100787191_100787278:DAPP1;ENSG00000070190:ENST00000514301:exon_100786029_100787278:DAPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 103189036 G/A 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103189029_103189236:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103189029_103189236:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103189029_103189236:SLC39A8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 104066348 G/A 1 38 44 82 17.8710293044881 23.3072292263822 -5.43619992189402 A:G G A 10 0.529709755145049 0.268524263635211 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 11 23 34 5.17319269340446 12.1833243683361 -7.01013167493167 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0240399125577515 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 106320250 C/A 1 74 83 157 34.8014781192664 43.9659096770391 -9.1644315577727 A:T:C C A 10 0.529709755145049 0.150442815300747 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513605:exon_106320194_106320793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000503171:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106320194_106320321:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106320236_106320321:PPA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 A:G G A 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 108641300 T/C 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C T C 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 62 62 124 29.157995181007 32.842004818993 -3.68400963798608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.529595262057665 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 661 577 1238 310.861851849123 305.642528718693 5.2193231304293 A:T A T 10 0.529709755145049 0.775910999527807 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 110638810 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000123739:ENST00000243501:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502283:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000507961:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502772:exon_110638704_110638869:PLA2G12A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 113353052 C/T 1 13 8 21 6.11377318311436 4.23767804116039 1.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.513879879006915 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 119610606 A/G 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000145388:ENST00000388822:exon_119610525_119610612:METTL14;ENSG00000145388:ENST00000506780:exon_119610525_119610623:METTL14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:C A C 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 122617745 G/A 1 113 61 174 53.1427976686095 32.312295063848 20.8305026047615 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00176835522756138 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 122735142 A/G 1 188 194 382 88.4145660327308 102.76369249814 -14.3491264654087 A:G A G 10 0.529709755145049 0.151194050271077 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000509980:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122735021_122737602:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000511132:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503139:exon_122734910_122735782:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122734910_122735202:EXOSC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 325 316 641 152.844329577859 167.388282625836 -14.5439530479764 C:G G C 10 0.529709755145049 0.251458095812747 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 46 53 99 21.6333512633277 28.0746170226876 -6.44126575935985 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.226812982563754 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 123280860 T/C 1 34 24 58 15.9898683250683 12.7130341234812 3.27683420158716 T:C T C 10 0.529709755145049 0.431198760812769 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123280712_123280877:KIAA1109 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 123838758 A/G 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 124323738 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000164056:ENST00000339241:exon_124322692_124324907:SPRY1;ENSG00000164056:ENST00000394339:exon_124322692_124324910:SPRY1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 129867228 C/T 1 24 18 42 11.2869658765188 9.53477559261088 1.75219028390794 T:C C T 10 0.529709755145049 0.644560715625997 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 620 3 623 291.57995181007 1.58912926543515 289.990822544634 A:G G A 10 0.529709755145049 3.55870804855886e-165 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 30 40 70 14.1087073456485 21.188390205802 -7.07968286015343 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0946223528915093 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 148560210 G/A 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G G A 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000164169:ENST00000322396:exon_148560111_148560233:PRMT10;ENSG00000164169:ENST00000510269:exon_148560111_148560233:PRMT10;ENSG00000164169:ENST00000514886:exon_148560111_148560233:PRMT10;ENSG00000164169:ENST00000511687:exon_148560111_148560444:PRMT10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 5 12 17 2.35145122427475 6.35651706174059 -4.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0859527586065674 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 151207127 C/T 1 20 17 37 9.40580489709902 9.00506583746583 0.400739059633185 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151207085_151207186:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000508606:exon_151207085_151207186:LRBA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 154276856 A/G 1 26 9 35 12.2275463662287 4.76738779630544 7.46015856992328 A:G A G 10 0.529709755145049 0.016469458877892 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000503967:exon_154276806_154276961:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000508731:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154276806_154276863:MND1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 71 58 129 33.3906073847015 30.7231657984128 2.66744158628867 A:T A T 10 0.529709755145049 0.660016797771109 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 69 45 114 32.4500268949916 23.8369389815272 8.61308791346441 T:C T C 10 0.529709755145049 0.111267168594742 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 155471494 G/A 1 39 29 68 18.3413195493431 15.3615828992064 2.97973665013667 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.543917918259008 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155471452_155471587:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155471452_155471549:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506192:exon_155471452_155471544:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000505887:exon_155471452_155471555:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000512719:exon_155471452_155471535:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000509975:exon_155471452_155471546:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503751:exon_155471452_155471552:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000515520:exon_155471452_155471548:PLRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 17 25 42 7.99493416253417 13.2427438786262 -5.24780971609206 T:C T C 10 0.529709755145049 0.122206959251360 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 156289900 C/T 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 156721198 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 66 65 131 31.0391561604268 34.4311340844282 -3.39197792400142 T:G G T 10 0.529709755145049 0.599682471014667 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 160277276 C/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 169142892 G/T 1 11 13 24 5.17319269340446 6.88622681688564 -1.71303412348118 T:G G T 10 0.529709755145049 0.542758508102984 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169142881_169143032:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000393739:exon_169142881_169143032:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000511317:exon_169142881_169143032:DDX60 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 169146726 T/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169146680_169146827:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000393739:exon_169146680_169146827:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000511317:exon_169146680_169146827:DDX60 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 169158471 T/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:G T G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169158437_169158578:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000507815:exon_169158437_169158639:DDX60 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 169282355 T/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000181381:ENST00000510590:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000511577:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000260184:exon_169282300_169282362:DDX60L;ENSG00000181381:ENST00000513103:exon_169282300_169282590:DDX60L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 170483300 C/T 1 20 14 34 9.40580489709902 7.41593657203069 1.98986832506833 T:C C T 10 0.529709755145049 0.606972054310593 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000509912:exon_170483288_170483347:NEK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 170634408 A/G 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 A:G A G 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 19 31 50 8.93551465224407 16.4210024094965 -7.48548775725245 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0462225943146104 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 177241212 G/C 1 51 60 111 23.9848024876025 31.7825853087029 -7.79778282110044 C:G G C 10 0.529709755145049 0.153746542225480 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177241090_177241370:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177241115_177241370:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177241153_177241370:SPCS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 14 23 37 6.58406342796931 12.1833243683361 -5.59926094036681 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0710883673689218 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 178256913 C/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000109674:ENST00000264596:exon_178256842_178256976:NEIL3;ENSG00000109674:ENST00000513321:exon_178256842_178256976:NEIL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 178359960 G/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000038002:ENST00000264595:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000446519:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000502310:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000506853:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000510635:exon_178359899_178360011:AGA;ENSG00000038002:ENST00000510955:exon_178359899_178360011:AGA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 46 27 73 21.6333512633277 14.3021633889163 7.33118787441142 A:G A G 10 0.529709755145049 0.100309299869128 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 184572218 G/A 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:G G A 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510968:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000512740:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184572137_184572284:RWDD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 184577036 T/G 0 0 9 9 0 4.76738779630544 -4.76738779630544 G T G 10 0.529709755145049 0.00112536585279539 ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000506467:exon_184577034_184577249:RWDD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 T:C C T 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 185686032 C/T 1 22 9 31 10.3463853868089 4.76738779630544 5.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0485036073608517 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185686007_185686079:ACSL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 185701549 G/T 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 T:G G T 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504900:exon_185701486_185701587:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000509038:exon_185701486_185701587:ACSL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 14 19 33 6.58406342796931 10.0644853477559 -3.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295326882479969 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 186272616 A/C 1 54 23 77 25.3956732221674 12.1833243683361 13.2123488538312 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00278744134222052 ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186272599_186272763:SNX25 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 186329489 C/G 1 69 45 114 32.4500268949916 23.8369389815272 8.61308791346441 C:G C G 10 0.529709755145049 0.111267168594742 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186329425_186329589:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186329425_186329589:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186329425_186329589:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000511485:exon_186329425_186329544:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000509180:exon_186329425_186329589:UFSP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 186336465 T/C 1 33 25 58 15.5195780802134 13.2427438786262 2.27683420158716 T:C T C 10 0.529709755145049 0.599950416169728 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000511485:exon_186336309_186336501:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000502428:exon_186336438_186336501:UFSP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 190862126 A/G 0 30 0 30 14.1087073456485 0 14.1087073456485 A A 10 0.529709755145049 1.04193488141411e-08 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 190862142 C/T 0 46 0 46 21.6333512633277 0 21.6333512633277 C C 10 0.529709755145049 2.47013737829838e-13 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 190862154 T/C 1 44 3 47 20.6927707736178 1.58912926543515 19.1036415081827 T:C T C 10 0.529709755145049 2.5456782756795e-09 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 3 42 45 1.41087073456485 22.2478097160921 -20.8369389815272 T:G T G 10 0.529709755145049 5.45900534022898e-11 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 251178 G/A 1 208 171 379 97.8203709298298 90.5803681298034 7.24000280002642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.471511683277360 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_251107_251218:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507266:exon_250809_251218:SDHA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 434722 G/C 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 C:G G C 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 27 13 40 12.6978366110837 6.88622681688564 5.81160979419804 C:G G C 10 0.529709755145049 0.080682908347193 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 434998 C/T 1 22 15 37 10.3463853868089 7.94564632717574 2.40073905963319 T:C C T 10 0.529709755145049 0.510967745319276 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 442571 A/C 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 A:C A C 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 475104 A/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_474998_475247:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_474998_475247:SLC9A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 476353 C/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_476317_476493:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_476317_476493:SLC9A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 12 8 20 5.64348293825941 4.23767804116039 1.40580489709902 A:C A C 10 0.529709755145049 0.655778470669091 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 32 45 77 15.0492878353584 23.8369389815272 -8.78765114616878 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0518704363385528 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 1479678 G/C 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000153395:ENST00000513757:exon_1479591_1479790:LPCAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6599989 A/C 1 181 128 309 85.1225343187461 67.8028486585663 17.3196856601798 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0525385470788477 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 86 83 169 40.4449610575258 43.9659096770391 -3.52094861951329 T:C C T 10 0.529709755145049 0.590629228174326 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 C:G C G 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6656210 G/A 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:G G A 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6656191_6656292:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6656191_6656292:SRD5A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 C:G G C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 15 15 30 7.05435367282426 7.94564632717574 -0.891292654351471 A:G G A 10 0.529709755145049 0.855335073836957 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 33 12 45 15.5195780802134 6.35651706174059 9.16306101847279 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00672816206220922 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 51 25 76 23.9848024876025 13.2427438786262 10.7420586089763 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0153995612276248 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 151 140 291 71.0138269730976 74.1593657203069 -3.14553874720927 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.724835322554609 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 112 130 242 52.6725074237545 68.8622681688564 -16.1897607451019 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0392817457950694 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 10262740 C/A 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 A:C C A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 14681593 G/T 1 15 9 24 7.05435367282426 4.76738779630544 2.28696587651882 T:G G T 10 0.529709755145049 0.416155235770821 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 14769103 G/A 1 8 8 16 3.76232195883961 4.23767804116039 -0.475356082320785 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808869693714969 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14769084_14769300:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000513115:exon_14768725_14769300:ANKH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 41 43 84 19.281900039053 22.7775194712371 -3.49561943218412 A:G A G 10 0.529709755145049 0.446885280191278 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 22 24 46 10.3463853868089 12.7130341234812 -2.36664873667226 T:C T C 10 0.529709755145049 0.555319847357411 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 33989510 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 33998883 A/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 37299049 C/T 1 38 22 60 17.8710293044881 11.6536146131911 6.21741469129706 T:C C T 10 0.529709755145049 0.120983405969157 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37298970_37299080:NUP155 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 37721219 T/C 1 21 13 34 9.87609514195397 6.88622681688564 2.98986832506833 T:C T C 10 0.529709755145049 0.390699512482042 ENSG00000082068:ENST00000265107:exon_37721217_37721317:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000511906:exon_37721217_37725152:WDR70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 42801268 C/T 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 T:C C T 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000507920:exon_42800921_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000509276:exon_42801030_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000514218:exon_42801036_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000513303:exon_42801207_42801433:SEPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 43446316 C/T 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 T:C C T 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000151881:ENST00000500337:exon_43444354_43446659:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000397080:exon_43444772_43446659:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000512085:exon_43445340_43446659:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000511525:exon_43445995_43446373:C5orf28;ENSG00000151881:ENST00000510130:exon_43446081_43446659:C5orf28 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 50057729 G/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000151883:ENST00000505697:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000511363:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503888:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000510303:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000281631:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503707:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000514067:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000423185:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503193:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000515166:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505554:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505180:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503561:exon_50057655_50057732:PARP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 42 39 81 19.7521902839079 20.6586804506569 -0.906490166748974 A:C C A 10 0.529709755145049 0.911471067733384 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 54572163 T/C 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C T C 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54572094_54572234:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000513447:exon_54572094_54572188:DHX29 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 54585213 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54585098_54585256:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54585098_54585256:DHX29 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 54586170 A/G 1 11 6 17 5.17319269340446 3.17825853087029 1.99493416253417 A:G A G 10 0.529709755145049 0.467293566928568 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54586046_54586172:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54586046_54586172:DHX29 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 T:C T C 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 54 47 101 25.3956732221674 24.8963584918173 0.499314730350047 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 27 28 55 12.6978366110837 14.8318731440614 -2.1340365329777 A:G G A 10 0.529709755145049 0.5909285029795 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 53 58 111 24.9253829773124 30.7231657984128 -5.79778282110044 C:G C G 10 0.529709755145049 0.295853659816963 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 65084101 A/G 1 26 11 37 12.2275463662287 5.82680730659554 6.40073905963319 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0467224366816124 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65083945_65084311:NLN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 70800538 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:G G A 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 A:T T A 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G A G 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 30 30 60 14.1087073456485 15.8912926543515 -1.78258530870294 T:C C T 10 0.529709755145049 0.698709359337651 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 34 22 56 15.9898683250683 11.6536146131911 4.33625371187725 A:T:C A T 10 0.529709755145049 0.284669432965892 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 993 1018 2011 466.998213140966 539.24453073766 -72.2463175966936 A:T:C:G A G 10 0.529709755145049 0.00129216773381184 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 38 37 75 17.8710293044881 19.5992609403668 -1.72823163587868 T:C C T 10 0.529709755145049 0.729238035079637 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 74037386 T/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000513331:exon_74037354_74037673:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74037354_74037434:GFM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 181 307 488 85.1225343187461 162.62089482953 -77.4983605107839 C:G C G 10 0.529709755145049 1.97360561012456e-12 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 385 723 1108 181.061744269156 382.98015296987 -201.918408700714 A:T:C:G A G 10 0.529709755145049 4.20795287932307e-34 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 74656175 G/A 1 45 49 94 21.1630610184728 25.9557780021074 -4.79271698363461 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352822777504098 ENSG00000113161:ENST00000511206:exon_74656113_74656583:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000287936:exon_74656113_74657929:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000343975:exon_74656113_74657248:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000429286:exon_74656113_74657924:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000509085:exon_74656113_74656307:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000511986:exon_74656113_74656306:HMGCR;ENSG00000113161:ENST00000512053:exon_74656113_74656354:HMGCR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 20 13 33 9.40580489709902 6.88622681688564 2.51957808021338 A:G G A 10 0.529709755145049 0.486061760154252 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 75001590 T/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 75884734 G/A 1 14 5 19 6.58406342796931 2.64854877572525 3.93551465224407 A:G G A 10 0.529709755145049 0.105365114705801 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75884731_75884798:IQGAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 75948650 A/G 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75948575_75948658:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75948575_75948658:IQGAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 T:C T C 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 76349900 T/C 1 24 13 37 11.2869658765188 6.88622681688564 4.40073905963319 T:C T C 10 0.529709755145049 0.187239652651067 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76349790_76349955:AGGF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 77425028 A/T 1 13 5 18 6.11377318311436 2.64854877572525 3.46522440738912 A:T A T 10 0.529709755145049 0.154758627526364 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77424945_77425131:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517561:exon_77424945_77425131:AP3B1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 78181477 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000113273:ENST00000264914:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000341088:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000396151:exon_78181407_78181650:ARSB;ENSG00000113273:ENST00000521800:exon_78181407_78181653:ARSB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 41 39 80 19.281900039053 20.6586804506569 -1.37678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 0.82296651259921 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 A:G A G 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 26 37 63 12.2275463662287 19.5992609403668 -7.37171457413809 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0765507260930877 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 86708640 C/A 1 29 19 48 13.6384171007936 10.0644853477559 3.57393175303765 A:C C A 10 0.529709755145049 0.315454300069231 ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86708495_86708836:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86708252_86708721:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86708495_86708685:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000513499:exon_86708495_86708706:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510020:exon_86708495_86708688:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000505230:exon_86708495_86708667:CCNH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 80 52 132 37.6232195883961 27.5449072675425 10.0783123208535 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0816112693666261 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 12 4 16 5.64348293825941 2.1188390205802 3.52464391767922 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0850631465658879 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 24 1 25 11.2869658765188 0.529709755145049 10.7572561213738 T:G G T 10 0.529709755145049 5.56697680274535e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 13 1 14 6.11377318311436 0.529709755145049 5.58406342796931 A:T T A 10 0.529709755145049 0.00227318749986418 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 1 8 1 9 3.76232195883961 0.529709755145049 3.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0420537517301952 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 44 4 48 20.6927707736178 2.1188390205802 18.5739317530376 T:C C T 10 0.529709755145049 1.29489677180889e-08 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 60 14 74 28.2174146912971 7.41593657203069 20.8014781192664 T:C C T 10 0.529709755145049 5.68857313067802e-07 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 64 8 72 30.0985756707169 4.23767804116039 25.8608976295565 T:C C T 10 0.529709755145049 1.06276250772625e-10 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 96363459 A/G 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 A:G A G 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96363437_96363518:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96363437_96363518:LNPEP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 19 17 36 8.93551465224407 9.00506583746583 -0.0695511852217656 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 102433409 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000145723:ENST00000512248:exon_102433294_102433485:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000399004:exon_102433294_102433485:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000274384:exon_102433294_102433485:GIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 102520400 A/C 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 A:C A C 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 110439509 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505303:exon_110439485_110439617:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000504122:exon_110439485_110439559:WDR36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 23 29 52 10.8166756316639 15.3615828992064 -4.54490726754255 A:T:C A T 10 0.529709755145049 0.214202617040877 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 112178492 C/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 112222787 C/T 1 129 150 279 60.6674415862887 79.4564632717574 -18.7890216854687 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0263621608510924 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000497856:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000261482:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000474542:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112222712_112222880:REEP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 23 24 47 10.8166756316639 12.7130341234812 -1.8963584918173 T:C T C 10 0.529709755145049 0.661658922636003 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 112349070 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112349018_112355820:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112349018_112349546:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112349018_112356667:DCP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 118464964 C/T 1 32 32 64 15.0492878353584 16.9507121646416 -1.90142432928314 T:C C T 10 0.529709755145049 0.707524674180929 ENSG00000172869:ENST00000503802:exon_118464906_118465118:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118464906_118465118:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514151:exon_118464906_118465027:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000504031:exon_118464904_118465118:DMXL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 132 128 260 62.0783123208535 67.8028486585663 -5.72453633771275 C:G G C 10 0.529709755145049 0.49463585070577 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 41 31 72 19.281900039053 16.4210024094965 2.86089762955647 A:G A G 10 0.529709755145049 0.555591622848739 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:T T A 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 C:G C G 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 12 5 17 5.64348293825941 2.64854877572525 2.99493416253417 C:G G C 10 0.529709755145049 0.223479807498147 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 122727026 G/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000395431:exon_122726804_122727031:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000503049:exon_122726603_122727031:CEP120 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 131602166 T/C 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C T C 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000131435:ENST00000253754:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000463615:exon_131602157_131602454:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000379018:exon_131602157_131602238:PDLIM4;ENSG00000131435:ENST00000418373:exon_131602157_131602238:PDLIM4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 131819798 T/C 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 131819800 G/A 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 131819977 C/T 1 10 3 13 4.70290244854951 1.58912926543515 3.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0996851298011028 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 44 48 92 20.6927707736178 25.4260682469624 -4.73329747334451 T:C T C 10 0.529709755145049 0.347912484408298 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 131892979 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000453394:exon_131892923_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131892923_131893145:RAD50 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:G A G 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 132209649 G/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000164406:ENST00000296877:exon_132209642_132209781:LEAP2;ENSG00000164406:ENST00000378648:exon_132209642_132209781:LEAP2;ENSG00000164406:ENST00000483190:exon_132209136_132209781:LEAP2;ENSG00000164406:ENST00000485457:exon_132209642_132209781:LEAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 134724622 T/C 1 75 62 137 35.2717683641213 32.842004818993 2.42976354512828 T:C T C 10 0.529709755145049 0.732263534562416 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000507868:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000508785:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000513210:exon_134724612_134724749:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506532:exon_134724612_134724816:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000504567:exon_134724612_134724793:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506218:exon_134724612_134724986:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512122:exon_134724612_134724762:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000508962:exon_134724607_134724816:H2AFY HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 137717213 G/A 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 A:G G A 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137717205_137717279:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000512928:exon_137717205_137717437:KDM3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:C T C 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 94 75 169 44.2072830163654 39.7282316358787 4.47905138048671 A:G G A 10 0.529709755145049 0.537715534142187 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 138463538 G/C 1 29 17 46 13.6384171007936 9.00506583746583 4.63335126332774 C:G G C 10 0.529709755145049 0.185887617120155 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138463428_138463542:SIL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 135 125 260 63.4891830554184 66.2137193931311 -2.72453633771275 A:G G A 10 0.529709755145049 0.756255902459922 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 139931779 T/A 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 A:T T A 10 0.529709755145049 0.154514551774692 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 140021482 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000513002:exon_140021455_140021650:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000511410:exon_140021250_140021970:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000514449:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000505086:exon_140021455_140021922:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140021455_140021638:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140021455_140021638:TMCO6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 C:G C G 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 166 148 314 78.0681806459219 78.3970437614673 -0.328863115545403 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 17 17 34 7.99493416253417 9.00506583746583 -1.01013167493167 T:C C T 10 0.529709755145049 0.734879131905574 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 53 27 80 24.9253829773124 14.3021633889163 10.6232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0184730361527322 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 28 19 47 13.1681268559386 10.0644853477559 3.1036415081827 A:C:G C A 10 0.529709755145049 0.384371471466367 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 141019881 G/C 1 7 15 22 3.29203171398466 7.94564632717574 -4.65361461319108 C:G G C 10 0.529709755145049 0.054856205447933 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 141021096 G/A 1 26 34 60 12.2275463662287 18.0101316749317 -5.78258530870294 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.154853894132448 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141019979_141021179:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141020549_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141020554_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518160:exon_141020776_141021130:FCHSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 32 21 53 15.0492878353584 11.123904858046 3.9253829773124 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.335662228023530 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 141358149 T/C 1 16 7 23 7.52464391767922 3.70796828601534 3.81667563166387 T:C T C 10 0.529709755145049 0.143351676752243 ENSG00000013561:ENST00000511961:exon_141357868_141358395:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000356143:exon_141357868_141358395:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394520:exon_141357868_141358395:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000347642:exon_141357868_141358395:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000502341:exon_141357868_141358327:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394514:exon_141357868_141358395:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394515:exon_141357868_141358395:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394519:exon_141357868_141358395:RNF14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 148747902 G/C 1 3 9 12 1.41087073456485 4.76738779630544 -3.35651706174059 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0793760846826338 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 149751733 G/A 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149751569_149751799:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149751569_149751799:TCOF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 149772280 C/G 1 57 56 113 26.8065439567322 29.6637462881227 -2.85720233139054 C:G C G 10 0.529709755145049 0.637774295086853 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 114 81 195 53.6130879134644 42.906490166749 10.7065977467154 T:C C T 10 0.529709755145049 0.132085671091598 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 150413202 C/T 1 183 113 296 86.063114808456 59.8572023313905 26.2059124770655 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00241547266986428 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522574:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150413169_150413360:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150413169_150413360:TNIP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 150484889 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 210 201 411 98.7609514195397 106.471660784155 -7.71070936461514 A:G G A 10 0.529709755145049 0.458762971831881 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 21 25 46 9.87609514195397 13.2427438786262 -3.36664873667226 T:C C T 10 0.529709755145049 0.375953294854275 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 21 23 44 9.87609514195397 12.1833243683361 -2.30722922638216 A:G G A 10 0.529709755145049 0.546780725832453 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154278809 A/G 1 5 14 19 2.35145122427475 7.41593657203069 -5.06448534775593 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0219825437825116 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154278751_154278870:GEMIN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:C T C 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 2 8 10 0.940580489709902 4.23767804116039 -3.29709755145049 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0538864462437919 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154306972 T/C 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 203 175 378 95.4689197055551 92.6992071503836 2.76971255517147 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.796805801979543 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 57 46 103 26.8065439567322 24.3666487366723 2.43989522005995 A:G A G 10 0.529709755145049 0.693211931016977 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 37 40 77 17.4007390596332 21.188390205802 -3.78765114616878 T:C C T 10 0.529709755145049 0.424822126878799 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 38 28 66 17.8710293044881 14.8318731440614 3.03915616042676 A:G A G 10 0.529709755145049 0.462834558793025 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 8 29 37 3.76232195883961 15.3615828992064 -11.5992609403668 C:G C G 10 0.529709755145049 0.000185372713705032 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 162896650 C/T 1 13 18 31 6.11377318311436 9.53477559261088 -3.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 0.280275685776745 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000520345:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000522094:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162896647_162896712:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162896647_162896835:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000517936:exon_162896647_162896916:HMMR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 33 45 78 15.5195780802134 23.8369389815272 -8.31736090131383 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0691016965201034 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 162909716 C/T 1 38 28 66 17.8710293044881 14.8318731440614 3.03915616042676 T:C C T 10 0.529709755145049 0.462834558793025 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 162911075 C/A 1 56 49 105 26.3362537118773 25.9557780021074 0.380475709769854 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162911075_162911251:HMMR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 162940999 A/G 1 50 66 116 23.5145122427475 34.9608438395732 -11.4463315968257 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0402784888198343 ENSG00000038274:ENST00000280969:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000415433:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000321757:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000421814:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000518095:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000523606:exon_162940848_162941000:MAT2B;ENSG00000038274:ENST00000520449:exon_162940848_162941000:MAT2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 97 124 221 45.6181537509302 65.6840096379861 -20.0658558870558 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.00701122506825408 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 27 19 46 12.6978366110837 10.0644853477559 2.63335126332774 A:G A G 10 0.529709755145049 0.463546604032952 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 41 48 89 19.281900039053 25.4260682469624 -6.14416820790936 C:G C G 10 0.529709755145049 0.203499688655646 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 169805956 C/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 C:G C G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169805168_169805977:KCNMB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 20 8 28 9.40580489709902 4.23767804116039 5.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0583086814385549 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 48 40 88 22.5739317530376 21.188390205802 1.38554154723569 A:G G A 10 0.529709755145049 0.831105000147594 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 175811233 C/T 1 253 304 557 118.983431948303 161.031765564095 -42.0483336157923 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.000416962422140358 ENSG00000048162:ENST00000510123:exon_175810949_175811284:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175810949_175811375:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000507413:exon_175810961_175811287:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000451293:exon_175811099_175811287:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000341213:exon_175811099_175811365:NOP16;ENSG00000048162:ENST00000502663:exon_175811209_175811284:NOP16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 175815782 G/C 1 261 69 330 122.745753907142 36.5499731050084 86.1957808021338 C:G G C 10 0.529709755145049 7.9827888846486e-23 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 175815787 A/C 1 281 77 358 132.151558804241 40.7876511461688 91.3639076580725 A:C A C 10 0.529709755145049 1.90706023246697e-23 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 175815874 T/C 1 455 147 602 213.982061409003 77.8673340063222 136.11472740268 T:C T C 10 0.529709755145049 4.39001449185995e-30 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176721272 G/C 1 15 9 24 7.05435367282426 4.76738779630544 2.28696587651882 C:G G C 10 0.529709755145049 0.416155235770821 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176722277 C/T 1 29 23 52 13.6384171007936 12.1833243683361 1.45509273245745 T:C C T 10 0.529709755145049 0.781499157629994 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176728817 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 110 87 197 51.7319269340446 46.0847486976193 5.64717823642534 C:G G C 10 0.529709755145049 0.433128392731163 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 68 48 116 31.9797366501367 25.4260682469624 6.55366840317431 A:G A G 10 0.529709755145049 0.228158024152247 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 48 29 77 22.5739317530376 15.3615828992064 7.21234885383123 T:C T C 10 0.529709755145049 0.110171805194737 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 37 22 59 17.4007390596332 11.6536146131911 5.74712444644211 T:C C T 10 0.529709755145049 0.151742703418654 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 177652392 T/C 1 19 14 33 8.93551465224407 7.41593657203069 1.51957808021338 T:C T C 10 0.529709755145049 0.727862479978695 ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000481436:exon_177652356_177653080:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000510913:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000514424:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000506001:exon_177652356_177652430:AGXT2L2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 6 11 17 2.82174146912971 5.82680730659554 -3.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154003647189151 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 178311020 C/T 1 14 13 27 6.58406342796931 6.88622681688564 -0.302163388916323 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000522714:exon_178310866_178311519:ZNF354B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 66 75 141 31.0391561604268 39.7282316358787 -8.68907547545192 A:G A G 10 0.529709755145049 0.151788238778585 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 T:C C T 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 5 180687212 C/T 1 3 7 10 1.41087073456485 3.70796828601534 -2.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206333354194794 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 45 39 84 21.1630610184728 20.6586804506569 0.504380567815879 A:C:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 9 11 20 4.23261220369456 5.82680730659554 -1.59419510290098 A:G A G 10 0.529709755145049 0.508665642734785 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 125 129 254 58.7862806068689 68.3325584137113 -9.54627780684245 A:G A G 10 0.529709755145049 0.233010543098119 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 4044214 A/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4044047_4044257:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4044047_4044257:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000481109:exon_4044047_4044257:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000490399:exon_4044047_4044460:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000463634:exon_4044047_4044257:PRPF4B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 7247248 T/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 7889088 A/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000239264:ENST00000460138:exon_7888938_7889678:TXNDC5;ENSG00000239264:ENST00000475802:exon_7888938_7889194:TXNDC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 10751379 C/T 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C C T 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000137210:ENST00000472062:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000379542:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000491103:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000480194:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000475942:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000467317:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000478732:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000486421:exon_10751366_10751467:TMEM14B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 11190626 A/G 1 17 8 25 7.99493416253417 4.23767804116039 3.75725612137377 A:G A G 10 0.529709755145049 0.161612507118830 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11190197_11191438:NEDD9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 16 8 24 7.52464391767922 4.23767804116039 3.28696587651882 T:C T C 10 0.529709755145049 0.221104734362828 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 13321179 C/T 1 48 41 89 22.5739317530376 21.718099960947 0.855831792090637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.915568810958958 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321140_13321301:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 13599303 C/T 1 3 13 16 1.41087073456485 6.88622681688564 -5.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.009781446085491 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13599264_13599387:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13599264_13599387:SIRT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 13604710 A/T 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 A:T A T 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13604708_13605971:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13604708_13604750:SIRT5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 81 91 172 38.093509833251 48.2035877181995 -10.1100778849484 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.126993676479448 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 15513482 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000008083:ENST00000341776:exon_15513470_15513653:JARID2;ENSG00000008083:ENST00000397311:exon_15513470_15513653:JARID2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 16145473 C/T 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000007944:ENST00000356840:exon_16145128_16145548:MYLIP;ENSG00000007944:ENST00000349606:exon_16145128_16145548:MYLIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 16306751 G/A 1 13 5 18 6.11377318311436 2.64854877572525 3.46522440738912 A:G G A 10 0.529709755145049 0.154758627526364 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 17688798 G/A 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17688627_17688849:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17688627_17688849:NUP153 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 20109956 A/G 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000172197:ENST00000324607:exon_20109829_20109980:MBOAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 12 4 16 5.64348293825941 2.1188390205802 3.52464391767922 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0850631465658879 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24503590 C/T 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000112294:ENST00000357578:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000491546:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000348925:exon_24503491_24503661:ALDH5A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 30 15 45 14.1087073456485 7.94564632717574 6.16306101847279 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0733869552416633 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24666739 C/T 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24666347_24666819:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000480495:exon_24666215_24666839:TDP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 75 65 140 35.2717683641213 34.4311340844282 0.840634279693134 A:G G A 10 0.529709755145049 0.932601654691339 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24781719 G/C 1 30 21 51 14.1087073456485 11.123904858046 2.9848024876025 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.483467107177551 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24781735 C/T 1 30 25 55 14.1087073456485 13.2427438786262 0.865963467022304 T:C C T 10 0.529709755145049 0.892813706887124 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24843452 G/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24843655 G/C 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 C:G G C 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 24843740 C/T 1 9 19 28 4.23261220369456 10.0644853477559 -5.83187314406137 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0358086634942485 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 15 9 24 7.05435367282426 4.76738779630544 2.28696587651882 A:G A G 10 0.529709755145049 0.416155235770821 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26285683 T/C 1 19 18 37 8.93551465224407 9.53477559261088 -0.599260940366815 T:C T C 10 0.529709755145049 0.870423973870074 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 2 17 19 0.940580489709902 9.00506583746583 -8.06448534775593 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000244601306732004 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26370748 G/A 1 2 29 31 0.940580489709902 15.3615828992064 -14.4210024094965 A:G G A 10 0.529709755145049 4.64197226477351e-08 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26388405 G/A 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000124508:ENST00000469230:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000490025:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000467485:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000493275:exon_26388241_26388517:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000472507:exon_26388241_26388477:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000396910:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482842:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000483410:exon_26388241_26388522:BTN2A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26391005 C/A 0 0 9 9 0 4.76738779630544 -4.76738779630544 A C A 10 0.529709755145049 0.00112536585279539 ENSG00000124508:ENST00000467485:exon_26390233_26391136:BTN2A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26393058 C/T 1 17 26 43 7.99493416253417 13.7724536337713 -5.77751947123711 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0924448598358786 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26413744 C/A 1 13 24 37 6.11377318311436 12.7130341234812 -6.59926094036681 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0324999659804827 ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26413397_26415444:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26413397_26414301:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26413397_26415432:BTN3A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26463621 A/G 1 2 10 12 0.940580489709902 5.29709755145049 -4.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0171879827656164 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26463472_26463753:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26463472_26463753:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26463472_26463753:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26463472_26463753:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000469185:exon_26463472_26463753:BTN2A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26468660 G/A 1 11 16 27 5.17319269340446 8.47535608232078 -3.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.248064772367367 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26545418 C/T 1 95 106 201 44.6775732612203 56.1492340453752 -11.4716607841549 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.119844817161643 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 39 42 81 18.3413195493431 22.2478097160921 -3.90649016674897 A:G A G 10 0.529709755145049 0.436130050614532 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 27775674 A/G 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000185130:ENST00000377401:exon_27775257_27775709:HIST1H2BL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 27833174 A/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 28056829 A/T 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000197279:ENST00000252206:exon_28056341_28057338:ZNF165;ENSG00000197279:ENST00000377325:exon_28056341_28057341:ZNF165 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 28213239 T/C 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000187626:ENST00000423974:exon_28213169_28213699:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000377294:exon_28212401_28213753:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000449813:exon_28213169_28213649:ZKSCAN4;ENSG00000187626:ENST00000356796:exon_28213170_28213809:ZKSCAN4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 28251716 T/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:T T A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28251533_28251986:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28251553_28251986:PGBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 C:G C G 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 A:C C A 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 23 9 32 10.8166756316639 4.76738779630544 6.04928783535843 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0340636286495787 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 24 9 33 11.2869658765188 4.76738779630544 6.51957808021338 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0237064573112115 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 263 384 647 123.686334396852 203.408545975699 -79.7222115788467 A:T:G G A 10 0.529709755145049 4.02040758499261e-10 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 38 64 102 17.8710293044881 33.9014243292831 -16.030395024795 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00195565892994336 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 38 61 99 17.8710293044881 32.312295063848 -14.4412657593599 C:G C G 10 0.529709755145049 0.00457635778336288 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 23 7 30 10.8166756316639 3.70796828601534 7.10870734564853 A:C A C 10 0.529709755145049 0.00987520266251958 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 23 7 30 10.8166756316639 3.70796828601534 7.10870734564853 A:T A T 10 0.529709755145049 0.00987520266251958 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 0 61 0 61 28.687704936152 0 28.687704936152 C C 10 0.529709755145049 1.53865996106926e-17 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 0 13 0 13 6.11377318311436 0 6.11377318311436 C C 10 0.529709755145049 0.000313569724728597 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 1147 0 1147 539.422910848629 0 539.422910848629 A A 10 0.529709755145049 5.14020166771741e-317 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30030057 G/A 1 194 148 342 91.2363075018605 78.3970437614673 12.8392637403932 A:G G A 10 0.529709755145049 0.175646282921256 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30030001_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30030001_30030110:ZNRD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 575 536 1111 270.416890791597 283.924428757746 -13.5075379661495 A:T:C T C 10 0.529709755145049 0.417290001022923 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30458933 G/C 1 498 460 958 234.204541937766 243.666487366723 -9.46194542895697 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.56019626883194 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30458914_30459189:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458914_30459189:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458914_30459060:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458914_30459189:HLA-E HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 40 48 88 18.811609794198 25.4260682469624 -6.61445845276431 A:G G A 10 0.529709755145049 0.166038838475685 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 4 12 16 1.8811609794198 6.35651706174059 -4.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0416130324707808 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30593485 C/G 1 196 205 401 92.1768879915704 108.590499804735 -16.4136118131646 A:C:G C G 10 0.529709755145049 0.109309353140837 ENSG00000204568:ENST00000259873:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472267:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000376508:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472229:exon_30593279_30594172:MRPS18B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30596135 A/G 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 A:G A G 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000137343:ENST00000318999:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376485:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376478:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000319027:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376483:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000330083:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000329992:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000468713:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000493388:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000471782:exon_30596106_30596207:ATAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30656398 T/G 1 52 58 110 24.4550927324575 30.7231657984128 -6.26807306595539 T:C:G T G 10 0.529709755145049 0.252005260888523 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30668374 G/A 1 79 88 167 37.1529293435411 46.6144584527643 -9.46152910922319 A:G G A 10 0.529709755145049 0.162713150927893 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30667584_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30668092_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30668172_30668409:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 17 26 43 7.99493416253417 13.7724536337713 -5.77751947123711 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0924448598358786 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30673013 A/G 1 17 14 31 7.99493416253417 7.41593657203069 0.57899759050348 A:G A G 10 0.529709755145049 0.859395359335908 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30673422 A/G 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 A:G A G 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30673489 G/C 1 15 10 25 7.05435367282426 5.29709755145049 1.75725612137377 C:G G C 10 0.529709755145049 0.550990071693142 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30680562 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30680608 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 334 302 636 157.076941781554 159.972346053805 -2.8954042722512 T:C C T 10 0.529709755145049 0.842586920807156 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30698541 A/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30698459_30698877:FLOT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30709364 G/T 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 T:G G T 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000137312:ENST00000484168:exon_30708967_30709481:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000484693:exon_30709131_30709980:FLOT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 30892164 C/T 1 17 24 41 7.99493416253417 12.7130341234812 -4.71809996094701 T:C C T 10 0.529709755145049 0.159790252359139 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 149 160 309 70.0732464833877 84.7535608232078 -14.6803143398202 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0984584050618413 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 59 56 115 27.7471244464421 29.6637462881227 -1.91662184168064 T:C T C 10 0.529709755145049 0.779442577950075 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 44 46 90 20.6927707736178 24.3666487366723 -3.67387796305442 A:C C A 10 0.529709755145049 0.460897643519088 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 37 26 63 17.4007390596332 13.7724536337713 3.62828542586191 A:G G A 10 0.529709755145049 0.379464955397855 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 15 21 36 7.05435367282426 11.123904858046 -4.06955118522177 A:G G A 10 0.529709755145049 0.185123406986533 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 39 24 63 18.3413195493431 12.7130341234812 5.62828542586191 C:G C G 10 0.529709755145049 0.166491742848819 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 11 17 28 5.17319269340446 9.00506583746583 -3.83187314406137 C:G G C 10 0.529709755145049 0.184886055905802 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31122482 G/A 1 14 14 28 6.58406342796931 7.41593657203069 -0.831873144061372 A:G G A 10 0.529709755145049 0.850483860830919 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 1 17 13 30 7.99493416253417 6.88622681688564 1.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.718335261369696 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31122502 C/T 1 14 17 31 6.58406342796931 9.00506583746583 -2.42100240949652 T:C C T 10 0.529709755145049 0.472408092481563 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 23 35 58 10.8166756316639 18.5398414300767 -7.72316579841285 T:C C T 10 0.529709755145049 0.048176011982289 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 A:G A G 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C,G 0 0 20 20 0 10.594195102901 -10.594195102901 C:G A G 10 0.529709755145049 2.80104062038615e-07 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 29 28 57 13.6384171007936 14.8318731440614 -1.19345604326779 T:C T C 10 0.529709755145049 0.791547052727124 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31237275 G/A 1 1862 2036 3898 875.680435919919 1078.48906147532 -202.808625555401 A:T:G G A 10 0.529709755145049 8.69877958215557e-11 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237270_31237320:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237270_31237302:HLA-C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2590 1161 3751 1218.05173417432 614.993025723402 603.058708450921 T:C C T 10 0.529709755145049 2.69561430378483e-89 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 755 507 1262 355.069134865488 268.56284585854 86.5062890069481 A:G G A 10 0.529709755145049 1.03295631183920e-06 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31431403 C/T 1 23 13 36 10.8166756316639 6.88622681688564 3.93044881477823 T:C C T 10 0.529709755145049 0.242322790947117 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 36 27 63 16.9304488147782 14.3021633889163 2.62828542586191 A:G A G 10 0.529709755145049 0.530395420687795 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 27 31 58 12.6978366110837 16.4210024094965 -3.72316579841284 T:C C T 10 0.529709755145049 0.358357808505158 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 12 18 30 5.64348293825941 9.53477559261088 -3.89129265435147 A:G A G 10 0.529709755145049 0.199932672074604 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 49 31 80 23.0442219978926 16.4210024094965 6.62321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.146419531869844 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31503118 G/A 1 32 18 50 15.0492878353584 9.53477559261088 5.51451224274755 A:G G A 10 0.529709755145049 0.121855297329194 ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 56 81 137 26.3362537118773 42.906490166749 -16.5702364548717 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00469905696929033 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 92 66 158 43.2667025266555 34.9608438395732 8.30585868708225 A:C C A 10 0.529709755145049 0.202353906408372 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31557791 G/A 1 26 13 39 12.2275463662287 6.88622681688564 5.34131954934309 A:G G A 10 0.529709755145049 0.107973221257876 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31590898 C/T 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 19 16 35 8.93551465224407 8.47535608232078 0.460158569923284 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31599370 G/C 1 38 34 72 17.8710293044881 18.0101316749317 -0.139102370443531 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 86 64 150 40.4449610575258 33.9014243292831 6.54353672824264 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.289051103880106 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 163 167 330 76.657309911357 88.4615291092232 -11.8042191978662 A:G A G 10 0.529709755145049 0.204693054359047 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31604074 T/C 1 126 109 235 59.2565708517238 57.7383633108103 1.51820754091348 T:C T C 10 0.529709755145049 0.896051223926069 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604024_31604196:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 161 145 306 75.7167294216471 76.8079144960321 -1.09118507438501 T:C C T 10 0.529709755145049 0.908923431876324 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 28 33 61 13.1681268559386 17.4804219197866 -4.31229506384799 C:G G C 10 0.529709755145049 0.305256990383226 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31607421 C/T 1 184 168 352 86.533405053311 88.9912388643682 -2.45783381105727 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.830913479047887 ENSG00000204463:ENST00000464869:exon_31607277_31607565:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000464126:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31607277_31607423:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31607277_31607423:BAT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31609272 T/C 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 T:C T C 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000204463:ENST00000462875:exon_31608602_31609369:BAT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 40 36 76 18.811609794198 19.0695511852218 -0.257941391023728 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31612787 C/T 1 35 41 76 16.4601585699233 21.718099960947 -5.25794139102373 T:C C T 10 0.529709755145049 0.250977212546314 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31612723_31612818:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31612723_31612846:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31612723_31612818:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000469182:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000453833:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000435080:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000462682:exon_31612723_31612962:BAT3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 56 54 110 26.3362537118773 28.6043267778326 -2.26807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.702812634525169 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 49 58 107 23.0442219978926 30.7231657984128 -7.67894380052024 A:C C A 10 0.529709755145049 0.146700315696144 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 16 19 35 7.52464391767922 10.0644853477559 -2.53984143007672 A:G G A 10 0.529709755145049 0.402638282505094 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31727897 C/T 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000494646:exon_31727867_31727950:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31727867_31727993:MSH5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31747041 C/T 1 56 56 112 26.3362537118773 29.6637462881227 -3.32749257624549 T:C C T 10 0.529709755145049 0.570408857237686 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000463184:exon_31747007_31747069:VARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31760616 C/T 1 27 20 47 12.6978366110837 10.594195102901 2.1036415081827 T:C C T 10 0.529709755145049 0.562318941515894 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31760534_31760672:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31760534_31760672:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31760534_31760672:VARS;ENSG00000204394:ENST00000495010:exon_31760534_31760737:VARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31783506 C/A 1 6 12 18 2.82174146912971 6.35651706174059 -3.53477559261088 A:C C A 10 0.529709755145049 0.103801735404631 ENSG00000204389:ENST00000375652:exon_31783320_31783608:HSPA1A;ENSG00000204389:ENST00000375651:exon_31783342_31785689:HSPA1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31855606 C/A 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 A:C C A 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31855556_31855738:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31855556_31855738:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31855556_31855738:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31855556_31855738:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31855556_31855738:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31855556_31855738:EHMT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31868048 C/T 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 T:C C T 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000204366:ENST00000375527:exon_31867384_31869102:ZBTB12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31931696 G/A 1 29 17 46 13.6384171007936 9.00506583746583 4.63335126332774 A:G G A 10 0.529709755145049 0.185887617120155 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31931690_31931902:SKIV2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 72 56 128 33.8608976295565 29.6637462881227 4.19715134143372 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.479601879242661 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 20 22 42 9.40580489709902 11.6536146131911 -2.24780971609206 A:G A G 10 0.529709755145049 0.537869099245852 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32088661 C/T 1 50 31 81 23.5145122427475 16.4210024094965 7.09350983325103 T:C C T 10 0.529709755145049 0.120172645121271 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088548_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088548_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088548_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088219_32088679:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088286_32088679:ATF6B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32088726 C/T 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.352397947557492 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32093922 G/A 1 25 30 55 11.7572561213738 15.8912926543515 -4.1340365329777 A:G G A 10 0.529709755145049 0.281856169964524 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32714083 T/C 0 77 0 77 36.2123488538312 0 36.2123488538312 T T 10 0.529709755145049 7.88414369881175e-22 ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32784676 C/T 1 34 12 46 15.9898683250683 6.35651706174059 9.63335126332774 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00464602571910653 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 57 54 111 26.8065439567322 28.6043267778326 -1.79778282110044 T:C T C 10 0.529709755145049 0.775719711659055 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32797309 T/G 1 81 64 145 38.093509833251 33.9014243292831 4.19208550396789 T:G T G 10 0.529709755145049 0.506492311509035 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 52 64 116 24.4550927324575 33.9014243292831 -9.44633159682569 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0936716215246757 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32814820 G/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:G G T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32814942 C/T 1 165 148 313 77.5978904010669 78.3970437614673 -0.799153360400354 T:C C T 10 0.529709755145049 0.954865505093172 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 191 204 395 89.8254367672956 108.06079004959 -18.2353532822944 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0695563440308091 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 243 254 497 114.280529499753 134.546277806842 -20.2657483070894 A:C C A 10 0.529709755145049 0.072225505377639 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 118 102 220 55.4942488928842 54.030395024795 1.46385386808922 T:C T C 10 0.529709755145049 0.892593300835117 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32820000 C/A 1 62 74 136 29.157995181007 39.1985218807336 -10.0405266997267 A:C C A 10 0.529709755145049 0.0863904743783475 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32819886_32820016:TAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 546 512 1058 256.778473690803 271.211394634265 -14.4329209434619 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.388506145731052 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 13 11 24 6.11377318311436 5.82680730659554 0.286965876518823 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 11 18 29 5.17319269340446 9.53477559261088 -4.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.135786850560934 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 189 203 392 88.8848562775857 107.531080294445 -18.6462240168592 A:T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0612257607381994 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32948296 G/C 1 13 29 42 6.11377318311436 15.3615828992064 -9.24780971609206 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.00496499144337857 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 T:C C T 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33037474 A/G 1 1226 906 2132 576.57584019217 479.917038161414 96.6588020307554 A:G A G 10 0.529709755145049 2.79142398446219e-05 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 1096 14 1110 515.438108361026 7.41593657203069 508.022171788996 A:G G A 10 0.529709755145049 4.48843017624931e-276 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 1092 18 1110 513.556947381607 9.53477559261088 504.022171788996 T:C C T 10 0.529709755145049 9.60639754644874e-269 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 674 202 876 316.975625032237 107.0013705393 209.974254492937 A:G A G 10 0.529709755145049 1.2794844728703e-48 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33169392 G/C 1 70 52 122 32.9203171398466 27.5449072675425 5.37540987230402 C:G G C 10 0.529709755145049 0.364653078636023 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33172442 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000204228:ENST00000374662:exon_33172419_33172497:HSD17B8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.277880751215266 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33239423 C/G 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33238914_33239653:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33239363_33239671:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33239363_33239662:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000436044:exon_33239363_33239662:VPS52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33248414 T/G 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 14 16 30 6.58406342796931 8.47535608232078 -1.89129265435147 A:G G A 10 0.529709755145049 0.584147049833183 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33258619 C/A 1 128 63 191 60.1971513414337 33.3717145741381 26.8254367672956 A:C:G C A 10 0.529709755145049 0.000110896427698588 ENSG00000204220:ENST00000395131:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374606:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374610:exon_33258493_33258639:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374607:exon_33258493_33258698:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33261586 C/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000237441:ENST00000491168:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000483151:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000437840:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000466866:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000497454:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000421215:exon_33261572_33261693:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000471319:exon_33261572_33261707:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000476616:exon_33261572_33261843:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000444031:exon_33261568_33261843:RGL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33271780 T/C 1 14 26 40 6.58406342796931 13.7724536337713 -7.18839020580196 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0261653765059387 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33287183 T/C 1 140 125 265 65.8406342796931 66.2137193931311 -0.373085113437995 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33287520 C/G 1 115 106 221 54.0833781583194 56.1492340453752 -2.06585588705583 C:G C G 10 0.529709755145049 0.787889820172235 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33287310_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33287362_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000490173:exon_33287441_33287631:DAXX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33647871 C/T 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33647659_33647910:ITPR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33653970 C/T 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653830_33654030:ITPR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 19 24 43 8.93551465224407 12.7130341234812 -3.77751947123711 C:G C G 10 0.529709755145049 0.285705319295368 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33660597 C/T 1 48 25 73 22.5739317530376 13.2427438786262 9.33118787441142 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0342092407369602 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33660505_33660670:ITPR3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 20 26 46 9.40580489709902 13.7724536337713 -4.36664873667226 A:G G A 10 0.529709755145049 0.237303902553178 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 7 11 18 3.29203171398466 5.82680730659554 -2.53477559261088 T:C C T 10 0.529709755145049 0.247451477742465 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 34855748 G/C 1 51 49 100 23.9848024876025 25.9557780021074 -1.9709755145049 C:G G C 10 0.529709755145049 0.763945921779517 ENSG00000064995:ENST00000361288:exon_34855564_34855866:TAF11;ENSG00000064995:ENST00000420584:exon_34855564_34855819:TAF11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 14 8 22 6.58406342796931 4.23767804116039 2.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.394835426805311 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:C C T 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 35265711 C/T 1 42 34 76 19.7521902839079 18.0101316749317 1.74205860897627 T:C C T 10 0.529709755145049 0.73110415469919 ENSG00000023892:ENST00000394658:exon_35265595_35265729:DEF6;ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35265629_35265729:DEF6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 35436195 G/A 1 36 26 62 16.9304488147782 13.7724536337713 3.15799518100696 A:G G A 10 0.529709755145049 0.447475178407538 ENSG00000198755:ENST00000322203:exon_35436185_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35436185_35436216:RPL10A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 7 12 19 3.29203171398466 6.35651706174059 -3.06448534775593 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.17438664147782 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 12 14 26 5.64348293825941 7.41593657203069 -1.77245363377127 A:G A G 10 0.529709755145049 0.557679310444852 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 29 27 56 13.6384171007936 14.3021633889163 -0.663746288122745 A:G A G 10 0.529709755145049 0.894015099851176 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 19 19 38 8.93551465224407 10.0644853477559 -1.12897069551186 T:C C T 10 0.529709755145049 0.747150865732143 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 36993699 G/A 1 32 35 67 15.0492878353584 18.5398414300767 -3.49055359471829 A:G G A 10 0.529709755145049 0.395107628414042 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36993568_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36990015_36993714:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36993568_36993714:FGD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 37247185 C/T 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065491:ENST00000373491:exon_37247080_37247387:TBC1D22B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 37443932 C/T 1 14 23 37 6.58406342796931 12.1833243683361 -5.59926094036681 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0710883673689218 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 37443950 G/A 1 23 17 40 10.8166756316639 9.00506583746583 1.81160979419804 A:G G A 10 0.529709755145049 0.636001814544782 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 29 18 47 13.6384171007936 9.53477559261088 4.1036415081827 A:G G A 10 0.529709755145049 0.245531276487518 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C C T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 105 150 255 49.3804757097699 79.4564632717574 -30.0759875619875 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000201635611856752 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 20 21 41 9.40580489709902 11.123904858046 -1.71809996094701 A:C A C 10 0.529709755145049 0.640406481389319 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42903417 C/T 1 17 6 23 7.99493416253417 3.17825853087029 4.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0584153785651338 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 227 180 407 106.755885582074 95.3477559261088 11.408129655965 A:T:G G T 10 0.529709755145049 0.274652408894298 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42980218 G/T 1 234 226 460 110.047917296059 119.714404662781 -9.66648736672255 A:T:G G T 10 0.529709755145049 0.375057352069778 ENSG00000124733:ENST00000244711:exon_42979832_42980359:MEA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 51 31 82 23.9848024876025 16.4210024094965 7.56380007810598 T:C T C 10 0.529709755145049 0.098013982928384 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 46 28 74 21.6333512633277 14.8318731440614 6.80147811926637 C:G C G 10 0.529709755145049 0.129929724190342 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 101 119 220 47.4993147303501 63.0354608622608 -15.5361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0364328146623292 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 21 27 48 9.87609514195397 14.3021633889163 -4.42606824696235 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.247168572377601 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43020188 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43019947_43020534:CUL7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43023371 T/C 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000112651:ENST00000485654:exon_43023283_43023455:MRPL2;ENSG00000112651:ENST00000491898:exon_43023354_43023934:MRPL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43193784 C/T 1 365 308 673 171.655939372057 163.150604584675 8.505334787382 T:C C T 10 0.529709755145049 0.536707676804586 ENSG00000112667:ENST00000230431:exon_43193771_43193881:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000509253:exon_43193771_43193881:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000393987:exon_43193373_43193881:C6orf108 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43305008 G/A 1 97 108 205 45.6181537509302 57.2086535556653 -11.590499804735 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.107902095794016 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 33 34 67 15.5195780802134 18.0101316749317 -2.49055359471829 A:G G A 10 0.529709755145049 0.543705708385578 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43472975 C/T 1 19 12 31 8.93551465224407 6.35651706174059 2.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.374617294226683 ENSG00000137221:ENST00000259751:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372454:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372452:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372449:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372445:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000436109:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372444:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000483640:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000454762:exon_43471361_43474291:TJAP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43572467 C/G 1 27 18 45 12.6978366110837 9.53477559261088 3.16306101847279 C:G C G 10 0.529709755145049 0.373165067077193 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43572352_43572475:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43572352_43572475:POLH HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43738977 C/T 1 18 5 23 8.46522440738912 2.64854877572525 5.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0197583414854022 ENSG00000112715:ENST00000476772:exon_43737921_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000426830:exon_43737948_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372067:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000532514:exon_43737950_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372064:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000425836:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372055:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000324450:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000413642:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000482630:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000417285:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531362:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000530947:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000531781:exon_43738444_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000372077:exon_43738519_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000519767:exon_43738530_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000520948:exon_43738820_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000518538:exon_43738890_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523950:exon_43738946_43739049:VEGFA;ENSG00000112715:ENST00000523873:exon_43738946_43739049:VEGFA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 34 42 76 15.9898683250683 22.2478097160921 -6.25794139102373 A:G A G 10 0.529709755145049 0.168091502472916 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 238 135 373 111.929078275478 71.5108169445816 40.4182613308967 T:C:G C T 10 0.529709755145049 2.51950820505541e-05 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 566 384 950 266.184278587902 203.408545975699 62.7757326122035 A:G G A 10 0.529709755145049 4.73728040103813e-05 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 44268371 T/C 1 18 28 46 8.46522440738912 14.8318731440614 -6.36664873667226 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0753961215060989 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44267391_44268448:AARS2;ENSG00000124608:ENST00000491573:exon_44268309_44269003:AARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C C T 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 16 15 31 7.52464391767922 7.94564632717574 -0.42100240949652 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 49415448 C/T 1 24 14 38 11.2869658765188 7.41593657203069 3.87102930448814 T:C C T 10 0.529709755145049 0.255548794870674 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49415383_49415498:MUT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 49459978 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49459857_49460820:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49459857_49460820:CENPQ HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 54186147 T/C 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C T C 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54186095_54186184:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54186095_54186184:TINAG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 13 9 22 6.11377318311436 4.76738779630544 1.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.671204623354876 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 56484758 C/T 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57012930 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112200:ENST00000370706:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000357489:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000444273:exon_57011888_57013491:ZNF451;ENSG00000112200:ENST00000491832:exon_57011888_57013491:ZNF451 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 21 0 21 9.87609514195397 0 9.87609514195397 G G 10 0.529709755145049 1.73422781867899e-06 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57246847 C/T 1 8 13 21 3.76232195883961 6.88622681688564 -3.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.194002803571841 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57246878 T/C 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 T T 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 16 0 16 7.52464391767922 0 7.52464391767922 A A 10 0.529709755145049 4.41504941609673e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 17 17 0 9.00506583746583 -9.00506583746583 G A G 10 0.529709755145049 2.69290787230449e-06 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 16 16 0 8.47535608232078 -8.47535608232078 G A G 10 0.529709755145049 5.72605513672743e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 33 33 0 17.4804219197866 -17.4804219197866 A G A 10 0.529709755145049 1.54197389549428e-11 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 28 28 0 14.8318731440614 -14.8318731440614 G T G 10 0.529709755145049 6.70265968933207e-10 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 25 0 25 11.7572561213738 0 11.7572561213738 C C 10 0.529709755145049 1.32611923158720e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 25 25 0 13.2427438786262 -13.2427438786262 C T C 10 0.529709755145049 6.4439069220967e-09 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 10 10 0 5.29709755145049 -5.29709755145049 A G A 10 0.529709755145049 0.000529248582462547 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 71236216 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71234046_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71235567_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71234634_71236401:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505868:exon_71234046_71236401:FAM135A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 71269632 G/A 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G G A 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 41 47 88 19.281900039053 24.8963584918173 -5.61445845276432 A:G A G 10 0.529709755145049 0.241412726228188 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 73332040 C/G 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 C:G C G 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 73332121 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74125875 A/G 1 1 11 12 0.470290244854951 5.82680730659554 -5.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00218723564175865 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74125888 A/G 1 1 11 12 0.470290244854951 5.82680730659554 -5.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00218723564175865 ENSG00000080007:ENST00000370336:exon_74125836_74125974:DDX43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 6 11 17 2.82174146912971 5.82680730659554 -3.00506583746583 T:G G T 10 0.529709755145049 0.154003647189151 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74161762 G/T 1 10 15 25 4.70290244854951 7.94564632717574 -3.24274387862623 T:G G T 10 0.529709755145049 0.230835807253919 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 T:C T C 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 75 56 131 35.2717683641213 29.6637462881227 5.60802207599858 A:G A G 10 0.529709755145049 0.336938390306191 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 13 17 30 6.11377318311436 9.00506583746583 -2.89129265435147 T:G G T 10 0.529709755145049 0.360958604388602 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 74533192 T/G 1 3 14 17 1.41087073456485 7.41593657203069 -6.00506583746583 T:G T G 10 0.529709755145049 0.00564502069059858 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74533182_74538040:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74533182_74534789:CD109 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 76344431 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000493959:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000487548:exon_76344423_76344772:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76344423_76344527:SENP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 76376552 G/A 1 15 16 31 7.05435367282426 8.47535608232078 -1.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 0.719657529859852 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76376428_76376657:SENP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 76425288 A/G 1 102 84 186 47.969604975205 44.4956194321841 3.47398554302088 A:G A G 10 0.529709755145049 0.659539884587248 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76425101_76425620:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76425101_76427997:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76425101_76427994:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76425101_76425593:SENP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 76618265 G/A 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 A:G G A 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000430435:exon_76618213_76618277:MYO6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 76624741 C/T 1 26 30 56 12.2275463662287 15.8912926543515 -3.66374628812274 T:C C T 10 0.529709755145049 0.350519465284021 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76624530_76626329:MYO6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 17 5 22 7.99493416253417 2.64854877572525 5.34638538680892 A:T A T 10 0.529709755145049 0.030557015442086 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 12 13 25 5.64348293825941 6.88622681688564 -1.24274387862623 A:G G A 10 0.529709755145049 0.690704630834042 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 26 16 42 12.2275463662287 8.47535608232078 3.75219028390794 A:G A G 10 0.529709755145049 0.280710859475818 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 80736148 A/G 1 11 14 25 5.17319269340446 7.41593657203069 -2.24274387862623 A:G A G 10 0.529709755145049 0.425499151730159 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80736095_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000515751:exon_80736095_80736231:TTK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 80750397 A/C 1 29 37 66 13.6384171007936 19.5992609403668 -5.96084383957324 A:C A C 10 0.529709755145049 0.174519146034341 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80750323_80750420:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80750323_80750420:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80750323_80750420:TTK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 83667045 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000118420:ENST00000369747:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000237186:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000392921:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000509102:exon_83667031_83667169:UBE2CBP;ENSG00000118420:ENST00000430071:exon_83667031_83667169:UBE2CBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 26 31 57 12.2275463662287 16.4210024094965 -4.19345604326779 T:C C T 10 0.529709755145049 0.289777027507613 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 11 13 24 5.17319269340446 6.88622681688564 -1.71303412348118 T:C T C 10 0.529709755145049 0.542758508102984 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 7 16 23 3.29203171398466 8.47535608232078 -5.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0361856200107406 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 84644445 C/T 1 8 13 21 3.76232195883961 6.88622681688564 -3.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.194002803571841 ENSG00000065615:ENST00000369681:exon_84644314_84644454:CYB5R4;ENSG00000065615:ENST00000479164:exon_84644314_84644454:CYB5R4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 87968565 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 87969341 G/A 1 70 38 108 32.9203171398466 20.1289706955119 12.7913464443347 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0156253980894126 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 87969480 G/A 1 47 94 141 22.1036415081827 49.7927169836346 -27.6890754754519 A:T:G G A 10 0.529709755145049 3.98589712207684e-06 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 39 45 84 18.3413195493431 23.8369389815272 -5.49561943218412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.231685388862255 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 T:C T C 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 109 89 198 51.2616366891897 47.1441682079094 4.11746848128029 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.569750583009045 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 T:C T C 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 T:C T C 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 7 16 23 3.29203171398466 8.47535608232078 -5.18332436833613 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0361856200107406 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 22 6 28 10.3463853868089 3.17825853087029 7.16812685593863 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00725006983192772 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 106555347 C/A 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 18 15 33 8.46522440738912 7.94564632717574 0.519578080213382 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 111 23 134 52.2022171788996 12.1833243683361 40.0188928105634 T:C C T 10 0.529709755145049 4.93212812027251e-13 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 109770697 C/T 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 10 20 30 4.70290244854951 10.594195102901 -5.89129265435147 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0425900324354375 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 110081557 T/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110081453_110081586:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110081453_110081586:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110081453_110081586:FIG4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 10 13 23 4.70290244854951 6.88622681688564 -2.18332436833613 T:C C T 10 0.529709755145049 0.407472442054581 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111587266 T/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 T:C T C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111628597 C/G 1 19 10 29 8.93551465224407 5.29709755145049 3.63841710079358 C:G C G 10 0.529709755145049 0.196329624889726 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111628626 C/T 1 15 6 21 7.05435367282426 3.17825853087029 3.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.124563644273288 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111696129 T/A 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 A:T T A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 111901453 G/T 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 T:G G T 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 112397650 A/C 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:C A C 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000074935:ENST00000368658:exon_112397525_112397712:TUBE1;ENSG00000074935:ENST00000368662:exon_112397525_112397712:TUBE1;ENSG00000074935:ENST00000441191:exon_112397525_112397712:TUBE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:G G T 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 116892734 G/A 1 30 46 76 14.1087073456485 24.3666487366723 -10.2579413910237 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0211694748834928 ENSG00000111832:ENST00000466444:exon_116892530_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000368590:exon_116892572_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000392526:exon_116892583_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000487832:exon_116892652_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000517800:exon_116892672_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000518117:exon_116892726_116892818:RWDD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 826 0 826 388.459742250189 0 388.459742250189 C C 10 0.529709755145049 1.94218351523049e-228 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 119228768 G/A 1 60 45 105 28.2174146912971 23.8369389815272 4.38047570976985 A:G G A 10 0.529709755145049 0.434475527129634 ENSG00000111875:ENST00000229595:exon_119228567_119230332:ASF1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 125598199 T/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C T C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 17 9 26 7.99493416253417 4.76738779630544 3.22754636622872 A:G A G 10 0.529709755145049 0.240962855945961 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 133073844 C/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133073812_133073888:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133073600_133073888:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133073600_133073888:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133073812_133073888:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133073600_133073888:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133073600_133073888:VNN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C T C 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 26 20 46 12.2275463662287 10.594195102901 1.63335126332774 T:C T C 10 0.529709755145049 0.66030616461623 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 134308187 T/G 1 30 26 56 14.1087073456485 13.7724536337713 0.336253711877255 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000028839:ENST00000237264:exon_134308099_134308637:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000477527:exon_134308099_134308637:TBPL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 37 50 87 17.4007390596332 26.4854877572525 -9.08474869761926 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0535631139160854 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 136582549 G/A 0 182 0 182 85.5928245636011 0 85.5928245636011 G G 10 0.529709755145049 6.12585486845365e-51 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000533422:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529522:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534762:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529917:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136582403_136582615:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000526228:exon_136582439_136582615:BCLAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 183 0 183 86.063114808456 0 86.063114808456 T T 10 0.529709755145049 3.23657883025480e-51 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 194 0 194 91.2363075018605 0 91.2363075018605 A A 10 0.529709755145049 4.0152428602072e-54 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 193 0 193 90.7660172570055 0 90.7660172570055 A A 10 0.529709755145049 7.78406914005386e-54 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 47 0 47 22.1036415081827 0 22.1036415081827 G G 10 0.529709755145049 1.28631470160457e-13 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 61 0 61 28.687704936152 0 28.687704936152 T T 10 0.529709755145049 1.53865996106926e-17 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 137019636 G/C 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 C:G G C 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137019627_137019820:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137019627_137019820:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137019627_137019820:MAP3K5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 91 103 194 42.7964122818005 54.56010477994 -11.7636924981395 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0980178508029871 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 139266402 G/A 1 3 12 15 1.41087073456485 6.35651706174059 -4.94564632717574 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0167981910963281 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 83 87 170 39.0340903229609 46.0847486976193 -7.05065837465834 T:C C T 10 0.529709755145049 0.283097876458414 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 149887586 G/A 1 16 13 29 7.52464391767922 6.88622681688564 0.638417100793578 A:G G A 10 0.529709755145049 0.854345466479414 ENSG00000055211:ENST00000367423:exon_149887410_149887670:C6orf72;ENSG00000055211:ENST00000367419:exon_149887430_149887670:C6orf72 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 149983216 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_149982051_149983374:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_149982833_149983374:LATS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 150067126 G/A 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000120253:ENST00000460354:exon_150067076_150067198:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000367404:exon_150067076_150067198:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000340413:exon_150067076_150067198:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000367403:exon_150067076_150067198:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000403890:exon_150067076_150067198:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000367402:exon_150067076_150067198:NUP43;ENSG00000120253:ENST00000463048:exon_150067076_150067198:NUP43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 65 57 122 30.5688659155718 30.1934560432678 0.375409872304019 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 20 18 38 9.40580489709902 9.53477559261088 -0.128970695511864 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 C:G C G 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 22 29 51 10.3463853868089 15.3615828992064 -5.0151975123975 T:C C T 10 0.529709755145049 0.163736764261605 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 30 25 55 14.1087073456485 13.2427438786262 0.865963467022304 A:G A G 10 0.529709755145049 0.892813706887124 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 50 43 93 23.5145122427475 22.7775194712371 0.73699277151044 A:T T A 10 0.529709755145049 0.917489918456223 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 11 4 15 5.17319269340446 2.1188390205802 3.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.128164554624033 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 159188549 G/A 1 16 10 26 7.52464391767922 5.29709755145049 2.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.435653149735385 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 21 14 35 9.87609514195397 7.41593657203069 2.46015856992328 A:G A G 10 0.529709755145049 0.498888420364794 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 T:G T G 10 0.529709755145049 0.68490154255998 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 169 140 309 79.4790513804867 74.1593657203069 5.31968566017984 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.568930884473941 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 118 151 269 55.4942488928842 79.9861730269024 -24.4919241340182 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.00329580837884308 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 47 36 83 22.1036415081827 19.0695511852218 3.03409032296093 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.512107714525190 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160494409 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160494245_160494501:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160494245_160494501:IGF2R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160500628 G/A 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160500612_160500819:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160500612_160500819:IGF2R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160505050 G/A 1 12 31 43 5.64348293825941 16.4210024094965 -10.7775194712371 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00112731405475125 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160505199 C/G 1 23 30 53 10.8166756316639 15.8912926543515 -5.0746170226876 C:G C G 10 0.529709755145049 0.170981235984758 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160504982_160505216:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160504982_160505216:IGF2R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 33 39 72 15.5195780802134 20.6586804506569 -5.13910237044353 T:C C T 10 0.529709755145049 0.239100791805002 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 167549775 T/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 167550042 C/T 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 T:C C T 10 0.529709755145049 0.222987652351953 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 5 7 12 2.35145122427475 3.70796828601534 -1.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.565934397483907 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 T:C T C 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 A:G A G 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 810219 T/C 1 17 15 32 7.99493416253417 7.94564632717574 0.049287835358431 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 16 19 35 7.52464391767922 10.0644853477559 -2.53984143007672 A:G G A 10 0.529709755145049 0.402638282505094 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 897492 A/G 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G A G 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_897465_897594:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_897465_897594:SUN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 909048 G/A 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 A:G G A 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_908111_909153:SUN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 932053 C/T 1 91 99 190 42.7964122818005 52.4412657593599 -9.64485347755932 T:C C T 10 0.529709755145049 0.167687011190246 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 1131411 C/T 1 10 5 15 4.70290244854951 2.64854877572525 2.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.314609348142666 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 1132075 T/C 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 T:C T C 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 T:C C T 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 7 14 21 3.29203171398466 7.41593657203069 -4.12390485804603 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0819766302290953 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 22 20 42 10.3463853868089 10.594195102901 -0.24780971609206 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 2281754 C/T 1 1 9 10 0.470290244854951 4.76738779630544 -4.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00822974216294624 ENSG00000122687:ENST00000467199:exon_2281610_2281804:FTSJ2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 2752487 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 ENSG00000174945:ENST00000312371:exon_2751964_2756163:AMZ1;ENSG00000174945:ENST00000454653:exon_2751964_2755061:AMZ1;ENSG00000174945:ENST00000407112:exon_2751964_2752734:AMZ1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 97 94 191 45.6181537509302 49.7927169836346 -4.17456323270437 T:C T C 10 0.529709755145049 0.562470799913458 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 2954801 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 2963884 C/T 1 16 22 38 7.52464391767922 11.6536146131911 -4.12897069551186 T:C C T 10 0.529709755145049 0.195922017737178 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2963867_2963999:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2963867_2963999:CARD11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 2985586 C/G 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 C:G C G 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2985453_2985590:CARD11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:G G T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 17 11 28 7.99493416253417 5.82680730659554 2.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.45357316422273 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 33 12 45 15.5195780802134 6.35651706174059 9.16306101847279 A:T T A 10 0.529709755145049 0.00672816206220922 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 33 12 45 15.5195780802134 6.35651706174059 9.16306101847279 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00672816206220922 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 5105133 C/T 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000146587:ENST00000353796:exon_5103326_5106888:RBAK;ENSG00000146587:ENST00000396912:exon_5103326_5109119:RBAK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 34 24 58 15.9898683250683 12.7130341234812 3.27683420158716 C:G C G 10 0.529709755145049 0.431198760812769 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 5417623 C/T 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5417553_5417655:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5417553_5417655:TNRC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 5427452 C/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6098685 C/T 0 21 0 21 9.87609514195397 0 9.87609514195397 C C 10 0.529709755145049 1.73422781867899e-06 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6098597_6098861:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000431744:exon_6098597_6098795:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000463213:exon_6098597_6098687:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000446699:exon_6098597_6098795:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000461493:exon_6098597_6098806:EIF2AK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C T C 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 13 16 29 6.11377318311436 8.47535608232078 -2.36158289920642 A:G G A 10 0.529709755145049 0.45783598473891 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6452461 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6452442_6452514:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6452241_6452514:DAGLB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6505901 T/C 1 119 96 215 55.9645391377392 50.8521364939247 5.11240264381446 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.495251939492186 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6505702_6505954:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000454368:exon_6505702_6505954:KDELR2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 17 19 36 7.99493416253417 10.0644853477559 -2.06955118522177 T:C T C 10 0.529709755145049 0.508630438317214 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 3 13 16 1.41087073456485 6.88622681688564 -5.47535608232078 A:G A G 10 0.529709755145049 0.009781446085491 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 86 71 157 40.4449610575258 37.6093926152985 2.8355684422273 A:G A G 10 0.529709755145049 0.689610490470524 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 8125964 C/T 1 32 17 49 15.0492878353584 9.00506583746583 6.0442219978926 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0875690049810493 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 8198226 A/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:C A C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000003147:ENST00000402384:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000406470:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000265577:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000396675:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000339809:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000455539:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000401396:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000404556:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000422063:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000407906:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000317367:exon_8198157_8198282:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000490041:exon_8197961_8198282:ICA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 20180717 C/G 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 C:G C G 10 0.529709755145049 0.808990723098274 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20176020_20180781:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20180248_20180781:MACC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 23239133 C/T 1 21 22 43 9.87609514195397 11.6536146131911 -1.77751947123711 T:C C T 10 0.529709755145049 0.647821327723492 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239043_23239161:NUPL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 23352453 C/T 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000136231:ENST00000258729:exon_23352354_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000421467:exon_23352354_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000417854:exon_23352350_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000435131:exon_23352354_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000498363:exon_23352354_23352467:IGF2BP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 23357321 C/G 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 C:G C G 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000136231:ENST00000258729:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000421467:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000417854:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000435131:exon_23357258_23357332:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000498363:exon_23357258_23357452:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000467592:exon_23357312_23357332:IGF2BP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 66 48 114 31.0391561604268 25.4260682469624 5.61308791346441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.303416971543025 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 30655542 T/C 1 339 332 671 159.428393005828 175.863638708156 -16.4352457023279 T:C T C 10 0.529709755145049 0.215861528959444 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30655512_30655674:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30655512_30655674:GARS;ENSG00000106105:ENST00000484093:exon_30655512_30655674:GARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 30671087 T/C 1 338 291 629 158.958102760973 154.145538747209 4.81256401376416 T:C T C 10 0.529709755145049 0.719300076773773 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30671064_30671157:GARS;ENSG00000106105:ENST00000444666:exon_30671064_30671157:GARS;ENSG00000106105:ENST00000465748:exon_30671064_30671157:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30670765_30671157:GARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 30673401 A/G 1 553 659 1212 260.070505404788 349.078728640587 -89.0082232357994 A:C:G A G 10 0.529709755145049 3.36782485459945e-07 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30673351_30673649:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30673351_30673527:GARS;ENSG00000106105:ENST00000496643:exon_30673351_30673649:GARS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 62 73 135 29.157995181007 38.6688121255886 -9.51081694458162 C:G G C 10 0.529709755145049 0.102232861370392 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/C 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C T C 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 10 4 14 4.70290244854951 2.1188390205802 2.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.190312819130244 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 32612837 T/C 1 20 26 46 9.40580489709902 13.7724536337713 -4.36664873667226 T:C T C 10 0.529709755145049 0.237303902553178 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 29 35 64 13.6384171007936 18.5398414300767 -4.90142432928314 A:G A G 10 0.529709755145049 0.259677431864797 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 35937861 C/T 1 153 141 294 71.9544074628075 74.6890754754519 -2.73466801264442 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77033559556925 ENSG00000122545:ENST00000435235:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000399034:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000350320:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000399035:exon_35937858_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000425198:exon_35937858_35942825:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000492940:exon_35937858_35938137:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000485569:exon_35937825_35937993:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000462732:exon_35937858_35937993:SEPT7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 36895342 C/T 1 25 31 56 11.7572561213738 16.4210024094965 -4.66374628812274 T:C C T 10 0.529709755145049 0.229679916249775 ENSG00000155849:ENST00000341056:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396042:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396045:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396040:exon_36894067_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_36894600_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_36894896_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000497024:exon_36894972_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000487843:exon_36895103_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_36895128_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_36895156_36895356:ELMO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 25 12 37 11.7572561213738 6.35651706174059 5.40073905963319 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0984470479563017 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 37989978 A/C 1 3 5 8 1.41087073456485 2.64854877572525 -1.23767804116039 A:C A C 10 0.529709755145049 0.487476772479961 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37989802_37990014:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37989802_37991543:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37989802_37990407:EPDR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 38259242 C/G 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 C:G C G 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000010270:ENST00000009041:exon_38259166_38259261:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000434197:exon_38259166_38259261:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000471550:exon_38259166_38259261:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000396013:exon_38259166_38259261:STARD3NL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 14 27 41 6.58406342796931 14.3021633889163 -7.71809996094701 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0183757354889223 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 12 10 22 5.64348293825941 5.29709755145049 0.346385386808922 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 42957446 A/T 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 A:T A T 10 0.529709755145049 0.367831723277462 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 324 268 592 152.374039333004 141.962214378873 10.411824954131 A:G G A 10 0.529709755145049 0.410292147975888 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 85 60 145 39.9746708126708 31.7825853087029 8.19208550396789 T:C T C 10 0.529709755145049 0.183587354458975 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 158 173 331 74.3058586870822 91.6397876400935 -17.3339289530112 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0610714537018840 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 187 225 412 87.9442757878758 119.184694907636 -31.2404191197602 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00218692327442986 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 24 11 35 11.2869658765188 5.82680730659554 5.46015856992328 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0889723332333158 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 43917274 A/G 1 9 14 23 4.23261220369456 7.41593657203069 -3.18332436833613 A:G A G 10 0.529709755145049 0.212820248057841 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 109 120 229 51.2616366891897 63.5651706174059 -12.3035339282162 T:C T C 10 0.529709755145049 0.112026006493760 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44104788 A/C 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44100376_44109055:DBNL;ENSG00000164708:ENST00000297283:exon_44104715_44105186:PGAM2;ENSG00000164708:ENST00000425387:exon_44104715_44104789:PGAM2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 19 17 36 8.93551465224407 9.00506583746583 -0.0695511852217656 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44121936 C/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:C C A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44121850_44122063:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44121850_44122139:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44121850_44122089:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44121850_44122084:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44121850_44122113:POLM;ENSG00000122678:ENST00000434229:exon_44121850_44122082:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492605:exon_44121850_44122077:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492312:exon_44121850_44122083:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492321:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000497300:exon_44121850_44122076:POLM;ENSG00000122678:ENST00000445616:exon_44121850_44122099:POLM;ENSG00000122678:ENST00000414235:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000452049:exon_44121850_44122129:POLM;ENSG00000122678:ENST00000483644:exon_44121850_44122081:POLM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:G A G 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 27 30 57 12.6978366110837 15.8912926543515 -3.19345604326779 A:G A G 10 0.529709755145049 0.42750593493581 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 30 24 54 14.1087073456485 12.7130341234812 1.39567322216735 A:G G A 10 0.529709755145049 0.785565108490983 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 147 122 269 69.1326659936778 64.624590127696 4.50807586598181 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.625183839455313 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 128 125 253 60.1971513414337 66.2137193931311 -6.0165680516974 A:G G A 10 0.529709755145049 0.450607139719831 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 93 167 260 43.7369927715104 88.4615291092232 -44.7245363377128 A:G G A 10 0.529709755145049 3.38810544077338e-08 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 55459501 A/G 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 A:G A G 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 6 7 13 2.82174146912971 3.70796828601534 -0.886226816885637 A:G A G 10 0.529709755145049 0.782740436579309 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 8 16 24 3.76232195883961 8.47535608232078 -4.71303412348118 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0653643193422349 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 56022810 G/C 1 357 325 682 167.893617413217 172.155670422141 -4.26205300892343 C:G G C 10 0.529709755145049 0.758991734741992 ENSG00000249773:ENST00000426595:exon_56022602_56022932:RP11-15K19.2;ENSG00000239789:ENST00000285298:exon_56022602_56024192:MRPS17;ENSG00000239789:ENST00000443449:exon_56022602_56022865:MRPS17 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 52 38 90 24.4550927324575 20.1289706955119 4.32612203694559 T:C:G C T 10 0.529709755145049 0.398771827070466 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 487 394 881 229.031349244361 208.705643527149 20.3257057172118 A:C A C 10 0.529709755145049 0.177009409932865 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 205 190 395 96.409500195265 100.644853477559 -4.23535328229437 T:G G T 10 0.529709755145049 0.686910373645036 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 2 10 12 0.940580489709902 5.29709755145049 -4.35651706174059 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0171879827656164 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 16 21 37 7.52464391767922 11.123904858046 -3.59926094036681 A:G G A 10 0.529709755145049 0.252412437793815 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 A:C A C 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 A:G G A 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 17 15 32 7.99493416253417 7.94564632717574 0.049287835358431 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 81 66 147 38.093509833251 34.9608438395732 3.13266599367779 A:G G A 10 0.529709755145049 0.620961549013893 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 66483114 A/G 1 19 17 36 8.93551465224407 9.00506583746583 -0.0695511852217656 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198874:ENST00000359626:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000361660:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000475070:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000389196:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000427620:exon_66482840_66483130:TYW1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 48 20 68 22.5739317530376 10.594195102901 11.9797366501367 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00345109189134753 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 72718274 T/C 1 41 33 74 19.281900039053 17.4804219197866 1.80147811926637 T:C T C 10 0.529709755145049 0.727443537864958 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72718227_72718401:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72718227_72718700:NSUN5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 32 33 65 15.0492878353584 17.4804219197866 -2.43113408442819 T:C C T 10 0.529709755145049 0.619537137694349 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 7 8 15 3.29203171398466 4.23767804116039 -0.945646327175735 T:C T C 10 0.529709755145049 0.797038290797778 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 73814749 G/C 1 28 19 47 13.1681268559386 10.0644853477559 3.1036415081827 C:G G C 10 0.529709755145049 0.384371471466367 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 75051311 T/C 0 19 0 19 8.93551465224407 0 8.93551465224407 T T 10 0.529709755145049 6.30672042862098e-06 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 13 10 23 6.11377318311436 5.29709755145049 0.816675631663872 A:G A G 10 0.529709755145049 0.835758435999101 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 75583397 G/A 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75583394_75583498:POR HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 36 24 60 16.9304488147782 12.7130341234812 4.21741469129706 T:C T C 10 0.529709755145049 0.302270570288398 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 21 22 43 9.87609514195397 11.6536146131911 -1.77751947123711 A:G G A 10 0.529709755145049 0.647821327723492 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 76111938 G/A 1 6 10 16 2.82174146912971 5.29709755145049 -2.47535608232078 A:G G A 10 0.529709755145049 0.316616912980055 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 77247821 G/A 1 12 4 16 5.64348293825941 2.1188390205802 3.52464391767922 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0850631465658879 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77247797_77247882:PTPN12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 32 33 65 15.0492878353584 17.4804219197866 -2.43113408442819 A:G G A 10 0.529709755145049 0.619537137694349 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 20 20 40 9.40580489709902 10.594195102901 -1.18839020580196 T:C C T 10 0.529709755145049 0.75281037212825 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 91632306 C/T 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C C T 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 91708898 A/G 1 42 25 67 19.7521902839079 13.2427438786262 6.50944640528171 A:G A G 10 0.529709755145049 0.113562833148026 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91708393_91709466:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91708393_91709424:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91708393_91709466:AKAP9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 9 17 26 4.23261220369456 9.00506583746583 -4.77245363377128 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0761857104955026 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:C C A 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 92762000 T/C 1 40 35 75 18.811609794198 18.5398414300767 0.271768364121321 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 14 7 21 6.58406342796931 3.70796828601534 2.87609514195397 T:C C T 10 0.529709755145049 0.275023954715533 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 95041016 G/C 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 C:G G C 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95040965_95041055:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000469926:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000491069:exon_95040963_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000490778:exon_95040994_95041091:PON2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 97483921 G/C 1 130 145 275 61.1377318311436 76.8079144960321 -15.6701826648885 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0611261672357691 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97483892_97484066:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97483892_97483992:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000487714:exon_97483892_97484187:ASNS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99048404 G/A 1 24 11 35 11.2869658765188 5.82680730659554 5.46015856992328 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0889723332333158 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99048087_99048418:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99048325_99048702:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99048325_99048418:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99048389_99048418:CPSF4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 A:G A G 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99691740 G/A 1 10 7 17 4.70290244854951 3.70796828601534 0.994934162534166 A:G G A 10 0.529709755145049 0.808990723098274 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 224 184 408 105.345014847509 97.466594946689 7.87841990081999 A:G G A 10 0.529709755145049 0.457008804165445 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 54 31 85 25.3956732221674 16.4210024094965 8.97467081267083 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0640826730064588 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 57 36 93 26.8065439567322 19.0695511852218 7.73699277151044 A:G A G 10 0.529709755145049 0.119289823765741 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 255 176 431 119.924012438012 93.2289169055286 26.6950955324839 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0104872327114538 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 A:G A G 10 0.529709755145049 0.845190735032854 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99752566 G/A 1 25 20 45 11.7572561213738 10.594195102901 1.16306101847279 A:G G A 10 0.529709755145049 0.766921233209028 ENSG00000146826:ENST00000394035:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000457641:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419037:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000316937:exon_99752043_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000448720:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000456769:exon_99752047_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000470260:exon_99752098_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000419841:exon_99752447_99752787:C7orf43;ENSG00000146826:ENST00000275726:exon_99752489_99752758:C7orf43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 99817585 G/T 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 T:G G T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99816240_99817651:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817336_99817651:PVRIG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100033389 C/T 0 140 0 140 65.8406342796931 0 65.8406342796931 C C 10 0.529709755145049 2.40729368101106e-39 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100033254_100033759:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100033254_100033390:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100033254_100033390:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100033254_100033687:C7orf47 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 62 76 138 29.157995181007 40.2579413910237 -11.0999462100168 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0608651138043825 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 11 8 19 5.17319269340446 4.23767804116039 0.935514652244068 T:C T C 10 0.529709755145049 0.819181859619382 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 75 50 125 35.2717683641213 26.4854877572525 8.78628060686887 A:G A G 10 0.529709755145049 0.127662782306884 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100468398 T/C 1 21 11 32 9.87609514195397 5.82680730659554 4.04928783535843 T:C T C 10 0.529709755145049 0.161034976422528 ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 92 75 167 43.2667025266555 39.7282316358787 3.53847089077681 T:C T C 10 0.529709755145049 0.588577874053205 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100482526 C/G 1 5 13 18 2.35145122427475 6.88622681688564 -4.53477559261088 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0352979763433676 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100482537 C/T 1 15 7 22 7.05435367282426 3.70796828601534 3.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.200137897636222 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100484917 C/T 1 2 11 13 0.940580489709902 5.82680730659554 -4.88622681688564 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00955089478143411 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 53 57 110 24.9253829773124 30.1934560432678 -5.26807306595539 T:C C T 10 0.529709755145049 0.339924019193023 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 102098177 C/T 1 4 10 14 1.8811609794198 5.29709755145049 -3.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.105144579901353 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 102106306 A/G 1 18 16 34 8.46522440738912 8.47535608232078 -0.0101316749316673 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000464107:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000476270:exon_102105979_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102106264_102106498:LRWD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 102114090 T/C 1 190 143 333 89.3551465224407 75.748494985742 13.6066515366987 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.138547674979142 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 102760511 A/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:T:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000161048:ENST00000455523:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000341533:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000417955:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000422589:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000465647:exon_102760024_102760670:NAPEPLD;ENSG00000161048:ENST00000427257:exon_102760024_102760670:NAPEPLD HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 104753264 C/T 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 T:C C T 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104752272_104754532:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104752272_104754531:MLL5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 105902124 A/G 1 3 17 20 1.41087073456485 9.00506583746583 -7.59419510290098 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00104021367609110 ENSG00000105835:ENST00000222553:exon_105902034_105902153:NAMPT;ENSG00000105835:ENST00000354289:exon_105901947_105902153:NAMPT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 22 12 34 10.3463853868089 6.35651706174059 3.98986832506833 A:G G A 10 0.529709755145049 0.228650012076690 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 28 24 52 13.1681268559386 12.7130341234812 0.455092732457452 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 26 37 63 12.2275463662287 19.5992609403668 -7.37171457413809 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0765507260930877 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 112407236 C/T 1 16 18 34 7.52464391767922 9.53477559261088 -2.01013167493167 T:C C T 10 0.529709755145049 0.497949930109753 ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 44 48 92 20.6927707736178 25.4260682469624 -4.73329747334451 T:C C T 10 0.529709755145049 0.347912484408298 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 T:C T C 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 129479138 T/C 1 16 14 30 7.52464391767922 7.41593657203069 0.108707345648529 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000186591:ENST00000355621:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000473814:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000496698:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000483368:exon_129479047_129479581:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000480245:exon_129479065_129479175:UBE2H HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 21 14 35 9.87609514195397 7.41593657203069 2.46015856992328 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.498888420364794 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 131122693 A/G 1 15 15 30 7.05435367282426 7.94564632717574 -0.891292654351471 A:G A G 10 0.529709755145049 0.855335073836957 ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131122544_131122756:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131122544_131122756:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131122544_131122756:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131122544_131122756:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131122544_131122756:MKLN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 420 0 420 197.521902839079 0 197.521902839079 T T 10 0.529709755145049 1.28236813243468e-116 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 20 19 39 9.40580489709902 10.0644853477559 -0.658680450656913 A:G G A 10 0.529709755145049 0.873443340813217 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 133749340 G/A 1 28 31 59 13.1681268559386 16.4210024094965 -3.25287555355789 A:G G A 10 0.529709755145049 0.434941965691201 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 9 2 11 4.23261220369456 1.0594195102901 3.17319269340446 A:T A T 10 0.529709755145049 0.0705618130584992 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 10 2 12 4.70290244854951 1.0594195102901 3.64348293825941 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0425775668197683 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 A:G A G 10 0.529709755145049 0.222987652351953 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 134849209 C/T 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 T:C C T 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 135082953 G/C 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 C:G G C 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000080802:ENST00000451834:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000423368:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000262563:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000361528:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000414802:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000356162:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000428680:exon_135082921_135082978:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000315544:exon_135082921_135082978:CNOT4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 135279315 A/C 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:C A C 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135279295_135279477:NUP205 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 135307619 C/T 1 20 20 40 9.40580489709902 10.594195102901 -1.18839020580196 T:C C T 10 0.529709755145049 0.75281037212825 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135307525_135307673:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135307525_135307673:NUP205 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 57 62 119 26.8065439567322 32.842004818993 -6.03546086226083 T:C T C 10 0.529709755145049 0.272003683094349 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 13 12 25 6.11377318311436 6.35651706174059 -0.242743878626225 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 A:G G A 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/G 1 27 24 51 12.6978366110837 12.7130341234812 -0.0151975123974992 C:G C G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 139746793 C/T 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000493262:exon_139746684_139746807:PARP12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 42 28 70 19.7521902839079 14.8318731440614 4.92031713984657 T:C T C 10 0.529709755145049 0.281248688068862 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 140374049 T/C 1 11 5 16 5.17319269340446 2.64854877572525 2.52464391767922 T:C T C 10 0.529709755145049 0.222987652351953 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 140398083 G/A 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:G G A 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 142494606 C/G 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 C:G C G 10 0.529709755145049 0.129246611858996 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 142495126 G/A 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G G A 10 0.529709755145049 0.795649893443606 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 142495127 G/T 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:G G T 10 0.529709755145049 0.795649893443606 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 142495156 T/G 1 11 15 26 5.17319269340446 7.94564632717574 -2.77245363377128 T:G T G 10 0.529709755145049 0.327633282444792 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 72 99 171 33.8608976295565 52.4412657593599 -18.5803681298034 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00455488366084981 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 189 0 189 88.8848562775857 0 88.8848562775857 T T 10 0.529709755145049 1.11956675039497e-52 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 148701168 C/T 1 320 328 648 150.492878353584 173.744799687576 -23.2519213339918 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0702288603205647 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 149430367 C/T 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 A:G A G 10 0.529709755145049 0.321705591330502 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150034703 G/A 1 14 10 24 6.58406342796931 5.29709755145049 1.28696587651882 A:G G A 10 0.529709755145049 0.68490154255998 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 29 15 44 13.6384171007936 7.94564632717574 5.69277077361784 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0970108465002013 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 28 13 41 13.1681268559386 6.88622681688564 6.28190003905299 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0596941082611192 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 24 10 34 11.2869658765188 5.29709755145049 5.98986832506833 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0405696862634217 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 53 31 84 24.9253829773124 16.4210024094965 8.50438056781588 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0640306497718006 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 41 37 78 19.281900039053 19.5992609403668 -0.317360901313826 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 17 6 23 7.99493416253417 3.17825853087029 4.81667563166387 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0584153785651338 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 22 6 28 10.3463853868089 3.17825853087029 7.16812685593863 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00725006983192772 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 11 12 23 5.17319269340446 6.35651706174059 -1.18332436833613 A:T T A 10 0.529709755145049 0.679225977809408 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 15 20 35 7.05435367282426 10.594195102901 -3.53984143007672 A:G G A 10 0.529709755145049 0.240735837360394 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150773072 G/C 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 126 102 228 59.2565708517238 54.030395024795 5.22617582692882 A:T:G A T 10 0.529709755145049 0.507469439107944 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 20 13 33 9.40580489709902 6.88622681688564 2.51957808021338 T:C C T 10 0.529709755145049 0.486061760154252 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 34 29 63 15.9898683250683 15.3615828992064 0.628285425861911 A:G A G 10 0.529709755145049 0.90020166070856 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156742749 G/A 1 15 16 31 7.05435367282426 8.47535608232078 -1.42100240949652 A:G G A 10 0.529709755145049 0.719657529859852 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156742796 A/C 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:C A C 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 13 13 26 6.11377318311436 6.88622681688564 -0.772453633771274 C:G G C 10 0.529709755145049 0.845190735032854 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156752557 T/G 1 24 11 35 11.2869658765188 5.82680730659554 5.46015856992328 T:G T G 10 0.529709755145049 0.0889723332333158 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156752545_156752868:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000460332:exon_156752545_156752812:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 19 7 26 8.93551465224407 3.70796828601534 5.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0485576299439573 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 28 18 46 13.1681268559386 9.53477559261088 3.63335126332774 C:G G C 10 0.529709755145049 0.304252040768650 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 32 26 58 15.0492878353584 13.7724536337713 1.27683420158716 A:G G A 10 0.529709755145049 0.793206345795197 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 10 27 37 4.70290244854951 14.3021633889163 -9.59926094036681 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00159828794507696 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 157046707 G/A 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 A:G G A 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157046648_157046836:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157046648_157046836:UBE3C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 7 158531752 C/T 1 14 8 22 6.58406342796931 4.23767804116039 2.34638538680892 T:C C T 10 0.529709755145049 0.394835426805311 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158531749_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158531714_158531812:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158531714_158531812:ESYT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 34 36 70 15.9898683250683 19.0695511852218 -3.07968286015343 A:G A G 10 0.529709755145049 0.474734682008379 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 43 45 88 20.2224805287629 23.8369389815272 -3.61445845276432 A:G G A 10 0.529709755145049 0.456270747550831 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 623696 G/A 1 66 77 143 31.0391561604268 40.7876511461688 -9.74849498574201 A:G G A 10 0.529709755145049 0.111441097037804 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 1513989 A/G 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000198010:ENST00000421627:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000356067:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000357934:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000520901:exon_1513849_1514060:DLGAP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 33 33 66 15.5195780802134 17.4804219197866 -1.96084383957324 A:G G A 10 0.529709755145049 0.711740020130276 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 T:C C T 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 T:C C T 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 11 16 27 5.17319269340446 8.47535608232078 -3.30216338891632 A:C C A 10 0.529709755145049 0.248064772367367 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 13 22 35 6.11377318311436 11.6536146131911 -5.53984143007672 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0642375426587449 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 8176540 C/T 1 5 10 15 2.35145122427475 5.29709755145049 -2.94564632717574 T:C C T 10 0.529709755145049 0.194447971900205 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 9609331 G/A 1 9 2 11 4.23261220369456 1.0594195102901 3.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0705618130584992 ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9609119_9609356:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9609119_9609356:TNKS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 10285825 T/G 1 15 11 26 7.05435367282426 5.82680730659554 1.22754636622872 T:G T G 10 0.529709755145049 0.697174405207405 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 10622954 T/G 1 88 73 161 41.3855415472357 38.6688121255886 2.7167294216471 T:G T G 10 0.529709755145049 0.693502811417351 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 81 90 171 38.093509833251 47.6738779630544 -9.58036812980339 A:T:G T A 10 0.529709755145049 0.146096222553372 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 46 39 85 21.6333512633277 20.6586804506569 0.97467081267083 T:C T C 10 0.529709755145049 0.913564235635658 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 28 28 56 13.1681268559386 14.8318731440614 -1.66374628812274 T:C C T 10 0.529709755145049 0.689342218691078 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 213 193 406 100.171822154105 102.233982742994 -2.0621605888899 T:C C T 10 0.529709755145049 0.842524337539388 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 11687959 C/T 1 3 6 9 1.41087073456485 3.17825853087029 -1.76738779630544 T:C C T 10 0.529709755145049 0.321705591330502 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 11689119 G/C 1 410 368 778 192.81900039053 194.933189893378 -2.11418950284815 T:C:G G C 10 0.529709755145049 0.885817202544414 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 11710888 G/C 1 12 5 17 5.64348293825941 2.64854877572525 2.99493416253417 C:G G C 10 0.529709755145049 0.223479807498147 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 22 24 46 10.3463853868089 12.7130341234812 -2.36664873667226 T:G G T 10 0.529709755145049 0.555319847357411 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 24 18 42 11.2869658765188 9.53477559261088 1.75219028390794 T:C C T 10 0.529709755145049 0.644560715625997 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 C:G G C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 49 36 85 23.0442219978926 19.0695511852218 3.97467081267083 A:G A G 10 0.529709755145049 0.447110407813797 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 21959638 A/G 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G A G 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 21959639 C/T 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 T:C C T 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 12 17 29 5.64348293825941 9.00506583746583 -3.36158289920642 T:C T C 10 0.529709755145049 0.26453372586583 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 21997738 A/T 1 19 16 35 8.93551465224407 8.47535608232078 0.460158569923284 A:T A T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519875:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000521744:exon_21997719_21997761:REEP4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 18 17 35 8.46522440738912 9.00506583746583 -0.539841430076716 T:C C T 10 0.529709755145049 0.867231390264526 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 19 32 51 8.93551465224407 16.9507121646416 -8.0151975123975 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0343166497116899 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 23291835 T/C 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 T:C T C 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23291830_23292251:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23291830_23291991:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23291606_23291991:ENTPD4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 23423758 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000417331:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518300:exon_23423621_23424326:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520654:exon_23423621_23426478:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23423621_23423849:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23423621_23425891:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000517923:exon_23423621_23423898:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000520949:exon_23423621_23423891:SLC25A37 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 25287397 T/C 1 14 5 19 6.58406342796931 2.64854877572525 3.93551465224407 T:C T C 10 0.529709755145049 0.105365114705801 ENSG00000104756:ENST00000221200:exon_25285366_25287489:KCTD9;ENSG00000104756:ENST00000519665:exon_25286778_25287489:KCTD9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 48 41 89 22.5739317530376 21.718099960947 0.855831792090637 A:G G A 10 0.529709755145049 0.915568810958958 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 25364834 A/T 1 39 42 81 18.3413195493431 22.2478097160921 -3.90649016674897 A:T A T 10 0.529709755145049 0.436130050614532 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 25364960 A/G 1 42 49 91 19.7521902839079 25.9557780021074 -6.20358771819946 A:G A G 10 0.529709755145049 0.208159585015113 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 43 19 62 20.2224805287629 10.0644853477559 10.157995181007 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0105898729655072 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 15 18 33 7.05435367282426 9.53477559261088 -2.48042191978662 A:G A G 10 0.529709755145049 0.39060695666354 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 42 22 64 19.7521902839079 11.6536146131911 8.09857567071686 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0453036561113285 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 45 26 71 21.1630610184728 13.7724536337713 7.39060738470152 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0954431239929447 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 47 18 65 22.1036415081827 9.53477559261088 12.5688659155718 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00175108961109239 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 40 30 70 18.811609794198 15.8912926543515 2.92031713984657 A:G A G 10 0.529709755145049 0.549827403193178 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 17 22 39 7.99493416253417 11.6536146131911 -3.65868045065691 A:G G A 10 0.529709755145049 0.263798401464573 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 106 92 198 49.8507659546248 48.7332974733445 1.11746848128029 T:C C T 10 0.529709755145049 0.887014369796028 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 126 117 243 59.2565708517238 61.9760413519707 -2.71947050024691 C:G C G 10 0.529709755145049 0.748170760351014 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 172 148 320 80.8899221150516 78.3970437614673 2.4928783535843 A:C A C 10 0.529709755145049 0.822799404069564 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27308961 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27312040 C/T 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:C C T 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 21 10 31 9.87609514195397 5.29709755145049 4.57899759050348 A:C A C 10 0.529709755145049 0.107970909801454 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 4 12 16 1.8811609794198 6.35651706174059 -4.47535608232078 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0416130324707808 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 22 26 48 10.3463853868089 13.7724536337713 -3.42606824696235 C:G C G 10 0.529709755145049 0.385903125973619 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27685706 G/A 1 17 9 26 7.99493416253417 4.76738779630544 3.22754636622872 A:G G A 10 0.529709755145049 0.240962855945961 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27685622_27685715:PBK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 27880826 C/T 1 5 9 14 2.35145122427475 4.76738779630544 -2.41593657203069 T:C C T 10 0.529709755145049 0.284273825836667 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27879481_27880979:C8orf80 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 29961951 C/T 1 61 65 126 28.687704936152 34.4311340844282 -5.74342914827618 T:C C T 10 0.529709755145049 0.326690434564684 ENSG00000104660:ENST00000321250:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000397339:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518001:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520682:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000442880:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000523116:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000532394:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520739:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518192:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000519466:exon_29961816_29962002:LEPROTL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 12 11 23 5.64348293825941 5.82680730659554 -0.183324368336128 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 17 6 23 7.99493416253417 3.17825853087029 4.81667563166387 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0584153785651338 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 A:G A G 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 18 13 31 8.46522440738912 6.88622681688564 1.57899759050348 A:G A G 10 0.529709755145049 0.594825033868625 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 7 15 22 3.29203171398466 7.94564632717574 -4.65361461319108 T:C T C 10 0.529709755145049 0.054856205447933 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 48885436 T/A 1 74 97 171 34.8014781192664 51.3818462490698 -16.5803681298034 A:T T A 10 0.529709755145049 0.0114507429249925 ENSG00000104738:ENST00000523944:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000429229:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000262105:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000396826:exon_48885417_48885624:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000523853:exon_48885417_48885625:MCM4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 61765419 G/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:G G A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61765388_61766059:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61765388_61766059:CHD7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 61765560 G/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61765388_61766059:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61765388_61766059:CHD7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 20 13 33 9.40580489709902 6.88622681688564 2.51957808021338 T:C T C 10 0.529709755145049 0.486061760154252 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 103 90 193 48.43989522006 47.6738779630544 0.766017257005537 T:C T C 10 0.529709755145049 0.942580990243226 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 30 10 40 14.1087073456485 5.29709755145049 8.81160979419804 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00638512161768157 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 68102977 T/C 1 16 20 36 7.52464391767922 10.594195102901 -3.06955118522177 T:C T C 10 0.529709755145049 0.320976259820328 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68102885_68102994:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521324:exon_68102885_68102994:CSPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 72756258 G/T 1 41 46 87 19.281900039053 24.3666487366723 -5.08474869761927 T:G G T 10 0.529709755145049 0.284490230880265 ENSG00000178860:ENST00000325509:exon_72755880_72756703:MSC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G G A 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 74204653 A/T 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:T A T 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 77896391 C/T 1 48 61 109 22.5739317530376 32.312295063848 -9.73836331081034 T:C C T 10 0.529709755145049 0.06815073016445 ENSG00000164751:ENST00000357039:exon_77892494_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000419564:exon_77892496_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000520103:exon_77895170_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000522527:exon_77895193_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000518986:exon_77895876_77896431:PEX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 86049709 A/G 1 10 17 27 4.70290244854951 9.00506583746583 -4.30216338891632 A:G A G 10 0.529709755145049 0.122415412291815 ENSG00000133739:ENST00000399341:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000426019:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000360375:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000522567:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000517875:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000522770:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000414626:exon_86049699_86049862:LRRCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 40 45 85 18.811609794198 23.8369389815272 -5.02532918732917 A:G G A 10 0.529709755145049 0.279497188195363 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 36 49 85 16.9304488147782 25.9557780021074 -9.02532918732917 A:T:C:G T G 10 0.529709755145049 0.051115102395429 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 21 12 33 9.87609514195397 6.35651706174059 3.51957808021338 A:C C A 10 0.529709755145049 0.228543602655958 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 87540872 G/A 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 87567193 C/T 1 14 13 27 6.58406342796931 6.88622681688564 -0.302163388916323 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517354:exon_87567079_87567207:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87567079_87567212:CPNE3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 27 14 41 12.6978366110837 7.41593657203069 5.28190003905299 A:C A C 10 0.529709755145049 0.117515260304257 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 34 32 66 15.9898683250683 16.9507121646416 -0.960843839573236 T:C T C 10 0.529709755145049 0.901984708091156 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 34 37 71 15.9898683250683 19.5992609403668 -3.60939261529848 A:G A G 10 0.529709755145049 0.407240094018468 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 27 19 46 12.6978366110837 10.0644853477559 2.63335126332774 C:G C G 10 0.529709755145049 0.463546604032952 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C C T 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 92033502 T/C 1 11 2 13 5.17319269340446 1.0594195102901 4.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.025445297925368 ENSG00000155099:ENST00000285419:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518359:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000520014:exon_92033484_92033650:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518869:exon_92033484_92033632:TMEM55A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 17 3 20 7.99493416253417 1.58912926543515 6.40580489709902 A:G A G 10 0.529709755145049 0.005637963242879 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 14 15 29 6.58406342796931 7.94564632717574 -1.36158289920642 T:C T C 10 0.529709755145049 0.710795181065969 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 24 29 53 11.2869658765188 15.3615828992064 -4.0746170226876 A:C C A 10 0.529709755145049 0.273816593174826 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 17 6 23 7.99493416253417 3.17825853087029 4.81667563166387 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0584153785651338 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 1392 1215 2607 654.644020838092 643.597352501235 11.0466683368571 A:C:G G A 10 0.529709755145049 0.666068091106296 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 101153024 G/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 11 10 21 5.17319269340446 5.29709755145049 -0.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 102213785 G/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000120963:ENST00000519916:exon_102213448_102213971:ZNF706 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 103276753 T/G 1 50 58 108 23.5145122427475 30.7231657984128 -7.20865355566529 T:G T G 10 0.529709755145049 0.177516494451129 ENSG00000104517:ENST00000522784:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000518205:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103276702_103276786:UBR5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 103307533 T/C 1 9 5 14 4.23261220369456 2.64854877572525 1.58406342796931 T:C T C 10 0.529709755145049 0.435503028968305 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307432_103307558:UBR5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 120803637 C/G 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 C:G C G 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523904:exon_120803564_120803699:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000523734:exon_120803564_120804114:TAF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 18 10 28 8.46522440738912 5.29709755145049 3.16812685593863 T:C T C 10 0.529709755145049 0.259768489558292 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 121500554 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121500399_121500572:MTBP;ENSG00000172167:ENST00000519188:exon_121500401_121500572:MTBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 121530190 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121530091_121530340:MTBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 123964011 G/A 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G G A 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 123965193 C/T 1 10 6 16 4.70290244854951 3.17825853087029 1.52464391767922 T:C C T 10 0.529709755145049 0.617967869881185 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124031541 T/C 1 38 39 77 17.8710293044881 20.6586804506569 -2.78765114616878 T:C T C 10 0.529709755145049 0.568756487320679 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124121798 A/G 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000378080:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000519418:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124121768_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124121714_124121860:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518577:exon_124121714_124121860:WDR67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 12 6 18 5.64348293825941 3.17825853087029 2.46522440738912 A:G A G 10 0.529709755145049 0.345473359072363 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 20 5 25 9.40580489709902 2.64854877572525 6.75725612137377 A:T T A 10 0.529709755145049 0.00803105748712048 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 18 8 26 8.46522440738912 4.23767804116039 4.22754636622872 T:C C T 10 0.529709755145049 0.116491619827904 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 T:C C T 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 85 56 141 39.9746708126708 29.6637462881227 10.3109245245481 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0913583267446378 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 71 73 144 33.3906073847015 38.6688121255886 -5.27820474088706 T:G G T 10 0.529709755145049 0.404164901367084 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 29 8 37 13.6384171007936 4.23767804116039 9.40073905963319 A:G A G 10 0.529709755145049 0.00251600003025412 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 20 10 30 9.40580489709902 5.29709755145049 4.10870734564853 A:G A G 10 0.529709755145049 0.146473133160998 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 142146708 T/C 1 8 12 20 3.76232195883961 6.35651706174059 -2.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.269427147835994 ENSG00000105339:ENST00000519291:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518347:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518198:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395213:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395207:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142146608_142146890:DENND3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 142154291 G/A 1 8 4 12 3.76232195883961 2.1188390205802 1.64348293825941 A:G G A 10 0.529709755145049 0.397869571967858 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 142161873 C/T 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 142161888 G/A 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 51 65 116 23.9848024876025 34.4311340844282 -10.4463315968257 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0623958151067684 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144124609 T/C 1 4 7 11 1.8811609794198 3.70796828601534 -1.82680730659554 T:C T C 10 0.529709755145049 0.367831723277462 ENSG00000177335:ENST00000517653:exon_144124595_144124679:C8orf31;ENSG00000177335:ENST00000523099:exon_144124375_144124660:C8orf31;ENSG00000177335:ENST00000524181:exon_144124595_144124679:C8orf31;ENSG00000177335:ENST00000395172:exon_144124580_144124679:C8orf31;ENSG00000177335:ENST00000423769:exon_144124595_144124679:C8orf31;ENSG00000177335:ENST00000316682:exon_144124580_144124679:C8orf31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 16 16 32 7.52464391767922 8.47535608232078 -0.950712164641569 A:G G A 10 0.529709755145049 0.859803012181772 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 32 17 49 15.0492878353584 9.00506583746583 6.0442219978926 C:G G C 10 0.529709755145049 0.0875690049810493 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144403505 C/A 1 16 32 48 7.52464391767922 16.9507121646416 -9.42606824696235 A:C C A 10 0.529709755145049 0.00856903842627145 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 42 32 74 19.7521902839079 16.9507121646416 2.80147811926637 T:C C T 10 0.529709755145049 0.561215761318499 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144620485 G/A 1 15 8 23 7.05435367282426 4.23767804116039 2.81667563166387 A:G G A 10 0.529709755145049 0.297928490380482 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144620855 C/A 1 8 2 10 3.76232195883961 1.0594195102901 2.70290244854951 A:C C A 10 0.529709755145049 0.115581198180476 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 57 23 80 26.8065439567322 12.1833243683361 14.6232195883961 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00105898200533560 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 1 24 19 43 11.2869658765188 10.0644853477559 1.22248052876289 A:G G A 10 0.529709755145049 0.761377597977688 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144660257 G/T 1 9 3 12 4.23261220369456 1.58912926543515 2.64348293825941 T:G G T 10 0.529709755145049 0.154514551774692 ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144660318 G/T 1 36 16 52 16.9304488147782 8.47535608232078 8.45509273245745 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0252701464381787 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144660263_144660513:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144660263_144660783:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144660263_144660509:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144660263_144660513:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144660263_144660513:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144660263_144660513:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144660263_144660388:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660263_144660328:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144660263_144660363:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 15 12 27 7.05435367282426 6.35651706174059 0.697836611083677 A:C C A 10 0.529709755145049 0.848789019043478 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144671685 G/C 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 A:C:G G C 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144671848 T/C 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 T:C T C 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144671905 G/A 1 8 11 19 3.76232195883961 5.82680730659554 -2.06448534775593 A:G G A 10 0.529709755145049 0.366887546614125 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144672047 C/T 1 20 13 33 9.40580489709902 6.88622681688564 2.51957808021338 T:C C T 10 0.529709755145049 0.486061760154252 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530545:exon_144672000_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525261:exon_144672008_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534804:exon_144672047_144672251:EEF1D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:G G T 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 5 6 11 2.35145122427475 3.17825853087029 -0.826807306595539 A:C C A 10 0.529709755145049 0.765199156248919 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 13 16 29 6.11377318311436 8.47535608232078 -2.36158289920642 A:C A C 10 0.529709755145049 0.45783598473891 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 26 21 47 12.2275463662287 11.123904858046 1.1036415081827 A:G A G 10 0.529709755145049 0.772162728348063 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144889172 A/G 1 12 7 19 5.64348293825941 3.70796828601534 1.93551465224407 A:G A G 10 0.529709755145049 0.492012683308959 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144894496 G/A 1 10 10 20 4.70290244854951 5.29709755145049 -0.594195102900981 A:G G A 10 0.529709755145049 0.825852485696726 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144894436_144894554:SCRIB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144895669 G/A 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144895640_144895696:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144895640_144895696:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144895640_144895696:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144895640_144895696:SCRIB HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 14 17 31 6.58406342796931 9.00506583746583 -2.42100240949652 A:G A G 10 0.529709755145049 0.472408092481563 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 29 34 63 13.6384171007936 18.0101316749317 -4.37171457413809 T:C T C 10 0.529709755145049 0.312814798078631 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 15 18 33 7.05435367282426 9.53477559261088 -2.48042191978662 T:C T C 10 0.529709755145049 0.39060695666354 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 4 8 12 1.8811609794198 4.23767804116039 -2.35651706174059 T:C T C 10 0.529709755145049 0.247772282984734 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 A:G A G 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 18 13 31 8.46522440738912 6.88622681688564 1.57899759050348 T:C C T 10 0.529709755145049 0.594825033868625 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144993943 G/A 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 A:G G A 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144994023 G/A 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 T:C C T 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 16 6 22 7.52464391767922 3.17825853087029 4.34638538680892 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0858744960227817 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 22 12 34 10.3463853868089 6.35651706174059 3.98986832506833 T:G T G 10 0.529709755145049 0.228650012076690 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 T:C C T 10 0.529709755145049 0.470117017246042 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 26 11 37 12.2275463662287 5.82680730659554 6.40073905963319 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0467224366816124 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 18 7 25 8.46522440738912 3.70796828601534 4.75725612137377 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0705230145448465 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144999621 C/T 1 21 6 27 9.87609514195397 3.17825853087029 6.69783661108368 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0112055521687356 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 22 10 32 10.3463853868089 5.29709755145049 5.04928783535843 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0787056203172186 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 19 9 28 8.93551465224407 4.76738779630544 4.16812685593863 A:G A G 10 0.529709755145049 0.131607092593009 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145001588 C/T 1 22 16 38 10.3463853868089 8.47535608232078 1.87102930448814 T:C C T 10 0.529709755145049 0.626922730070605 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145001784 A/G 1 14 12 26 6.58406342796931 6.35651706174059 0.227546366228726 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145007187 G/A 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 A:G G A 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145006961_145007279:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000528025:exon_145006961_145007279:PLEC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145058260 C/T 1 39 44 83 18.3413195493431 23.3072292263822 -4.96590967703907 T:C C T 10 0.529709755145049 0.322368466662018 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058203_145058272:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058176_145058272:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058176_145058272:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058176_145058272:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145223288 C/T 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 T:C C T 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000179832:ENST00000532255:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000525287:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000534366:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000527552:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000528919:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000326134:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000398656:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000420663:exon_145223198_145223343:HEATR7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145245829 A/G 1 9 10 19 4.23261220369456 5.29709755145049 -1.06448534775593 A:G A G 10 0.529709755145049 0.652547781422325 ENSG00000179832:ENST00000532255:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000525287:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000534366:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000527552:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000528919:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000326134:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000398656:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000420663:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000534508:exon_145245687_145245838:HEATR7A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145512914 C/T 1 28 31 59 13.1681268559386 16.4210024094965 -3.25287555355789 T:C C T 10 0.529709755145049 0.434941965691201 ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145540349 G/A 1 32 23 55 15.0492878353584 12.1833243683361 2.8659634670223 A:G G A 10 0.529709755145049 0.500182086466259 ENSG00000185000:ENST00000527438:exon_145539954_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000332324:exon_145539954_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524965:exon_145539983_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000528718:exon_145539988_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000526479:exon_145539988_145540372:DGAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145617910 A/G 1 11 11 22 5.17319269340446 5.82680730659554 -0.653614613191079 A:G A G 10 0.529709755145049 0.832974819109744 ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 33 21 54 15.5195780802134 11.123904858046 4.39567322216735 A:G G A 10 0.529709755145049 0.275585358568802 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145655895 T/C 1 26 4 30 12.2275463662287 2.1188390205802 10.1087073456485 T:C T C 10 0.529709755145049 0.000152277756084014 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145655787_145655920:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145655787_145655920:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145655787_145655920:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145655787_145655920:NFKBIL2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145725548 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000160972:ENST00000526183:exon_145725479_145726144:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000292539:exon_145725479_145725582:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000435887:exon_145725479_145725582:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000532806:exon_145725479_145725774:PPP1R16A;ENSG00000160972:ENST00000526564:exon_145725479_145725582:PPP1R16A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145736002 G/A 1 21 20 41 9.87609514195397 10.594195102901 -0.718099960947011 A:G G A 10 0.529709755145049 0.876303756882822 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145736077 C/T 1 21 20 41 9.87609514195397 10.594195102901 -0.718099960947011 T:C C T 10 0.529709755145049 0.876303756882822 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145737514 G/A 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:G G A 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 17 23 40 7.99493416253417 12.1833243683361 -4.18839020580196 T:C C T 10 0.529709755145049 0.206547223036203 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 11 3 14 5.17319269340446 1.58912926543515 3.58406342796931 C:G C G 10 0.529709755145049 0.0634340540694462 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G G A 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 145747920 T/G 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:G T G 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 8 146171437 A/G 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532351:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000532811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527512:exon_146171299_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527811:exon_146171397_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000527427:exon_146169475_146171601:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000529378:exon_146171310_146171601:ZNF16 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 370244 A/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:G A G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_368018_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_370230_370300:DOCK8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 377111 G/C 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 C:G G C 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 T:C C T 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 A:G G A 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 439376 G/A 1 24 23 47 11.2869658765188 12.1833243683361 -0.896358491817304 A:G G A 10 0.529709755145049 0.884053964985297 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_439245_439388:DOCK8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 449874 G/C 1 24 19 43 11.2869658765188 10.0644853477559 1.22248052876289 C:G G C 10 0.529709755145049 0.761377597977688 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 2039983 A/C 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 A:C A C 10 0.529709755145049 0.730403775860341 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 147 121 268 69.1326659936778 64.0948803725509 5.03778562112686 A:G G A 10 0.529709755145049 0.541383609191692 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 5081780 G/A 1 2 6 8 0.940580489709902 3.17825853087029 -2.23767804116039 A:G G A 10 0.529709755145049 0.159183095005099 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5081725_5081861:JAK2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 5462844 C/T 1 56 42 98 26.3362537118773 22.2478097160921 4.08844399578519 T:C C T 10 0.529709755145049 0.420127620151013 ENSG00000120217:ENST00000381577:exon_5462834_5463121:CD274;ENSG00000120217:ENST00000381573:exon_5462834_5463121:CD274;ENSG00000120217:ENST00000498261:exon_5462834_5462968:CD274;ENSG00000120217:ENST00000474218:exon_5462834_5463238:CD274 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 5920886 G/A 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 A:G G A 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 23 25 48 10.8166756316639 13.2427438786262 -2.42606824696235 A:G A G 10 0.529709755145049 0.563510386998054 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 18 9 27 8.46522440738912 4.76738779630544 3.69783661108368 A:C A C 10 0.529709755145049 0.179281840198924 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 26 24 50 12.2275463662287 12.7130341234812 -0.48548775725245 T:C C T 10 0.529709755145049 0.888560234985484 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 6556242 C/T 1 6 11 17 2.82174146912971 5.82680730659554 -3.00506583746583 T:C C T 10 0.529709755145049 0.154003647189151 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6556153_6556302:GLDC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 7 2 9 3.29203171398466 1.0594195102901 2.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.186626222993581 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 36 22 58 16.9304488147782 11.6536146131911 5.27683420158715 A:G G A 10 0.529709755145049 0.188766894628661 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 142 120 262 66.781214769403 63.5651706174059 3.21604415199715 A:C C A 10 0.529709755145049 0.71066743883177 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 126 101 227 59.2565708517238 53.5006852696499 5.75588558207387 A:T:G G T 10 0.529709755145049 0.464901324555539 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 36 40 76 16.9304488147782 21.188390205802 -4.25794139102373 A:G A G 10 0.529709755145049 0.358642701162309 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 8 9 17 3.76232195883961 4.76738779630544 -1.00506583746583 T:C T C 10 0.529709755145049 0.636876623935103 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 32427396 A/G 1 4 9 13 1.8811609794198 4.76738779630544 -2.88622681688564 A:G A G 10 0.529709755145049 0.16303586493333 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32427299_32427434:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32427299_32427434:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32427299_32427434:ACO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 32434627 C/T 1 6 5 11 2.82174146912971 2.64854877572525 0.173192693404461 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32434557_32434699:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32434557_32434699:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32434557_32434699:ACO1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 32480251 A/T 1 14 5 19 6.58406342796931 2.64854877572525 3.93551465224407 A:T A T 10 0.529709755145049 0.105365114705801 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32480217_32480352:DDX58 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 32541532 A/G 1 32 24 56 15.0492878353584 12.7130341234812 2.33625371187726 A:G A G 10 0.529709755145049 0.593203694548039 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 291 264 555 136.854461252791 139.843375358293 -2.9889141055022 T:C T C 10 0.529709755145049 0.798810176530121 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 2 7 9 0.940580489709902 3.70796828601534 -2.76738779630544 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0934510434354242 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 35660990 A/G 1 105 81 186 49.3804757097699 42.906490166749 6.47398554302088 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.378137408292113 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 288 301 589 135.443590518226 159.44263629866 -23.9990457804339 T:C:G T C 10 0.529709755145049 0.0522831644196505 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 46 14 60 21.6333512633277 7.41593657203069 14.2174146912971 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000229982478560032 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 31 7 38 14.5789975905035 3.70796828601534 10.8710293044881 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00046014562661653 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 14 11 25 6.58406342796931 5.82680730659554 0.757256121373774 T:C C T 10 0.529709755145049 0.842633000104966 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 71851877 G/A 1 15 43 58 7.05435367282426 22.7775194712371 -15.7231657984128 A:G G A 10 0.529709755145049 3.29746903706882e-05 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71851865_71852052:TJP2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 7 3 10 3.29203171398466 1.58912926543515 1.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.352397947557492 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 25 10 35 11.7572561213738 5.29709755145049 6.46015856992328 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0405930113333366 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 15 21 36 7.05435367282426 11.123904858046 -4.06955118522177 A:G A G 10 0.529709755145049 0.185123406986533 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 80881589 A/C 1 83 58 141 39.0340903229609 30.7231657984128 8.31092452454808 A:C A C 10 0.529709755145049 0.177106314811980 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 16 23 39 7.52464391767922 12.1833243683361 -4.65868045065691 T:G T G 10 0.529709755145049 0.150191051412028 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 46 53 99 21.6333512633277 28.0746170226876 -6.44126575935985 A:C C A 10 0.529709755145049 0.226812982563754 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 9 8 17 4.23261220369456 4.23767804116039 -0.00506583746583367 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 8 5 13 3.76232195883961 2.64854877572525 1.11377318311436 T:C C T 10 0.529709755145049 0.589851685172005 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 92003679 C/T 1 15 13 28 7.05435367282426 6.88622681688564 0.168126855938628 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 6 6 12 2.82174146912971 3.17825853087029 -0.356517061740588 A:C C A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 11 13 24 5.17319269340446 6.88622681688564 -1.71303412348118 C:G G C 10 0.529709755145049 0.542758508102984 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 38 33 71 17.8710293044881 17.4804219197866 0.390607384701518 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 97863912 C/T 1 4 6 10 1.8811609794198 3.17825853087029 -1.29709755145049 T:C C T 10 0.529709755145049 0.531280095374738 ENSG00000158169:ENST00000289081:exon_97861336_97864132:FANCC;ENSG00000158169:ENST00000375305:exon_97861337_97864132:FANCC HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 98766861 G/T 1 9 1 10 4.23261220369456 0.529709755145049 3.70290244854951 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0236718901176251 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 99113342 A/G 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 A:G A G 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000130958:ENST00000375257:exon_99113032_99113453:SLC35D2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 100105735 T/C 1 7 1 8 3.29203171398466 0.529709755145049 2.76232195883961 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0741809675665031 ENSG00000197816:ENST00000357054:exon_100105622_100105845:C9orf174;ENSG00000197816:ENST00000395220:exon_100105622_100105845:C9orf174;ENSG00000197816:ENST00000375202:exon_100105622_100105845:C9orf174;ENSG00000197816:ENST00000494917:exon_100105622_100105925:C9orf174;ENSG00000197816:ENST00000460482:exon_100105622_100105845:C9orf174;ENSG00000197816:ENST00000529487:exon_100105622_100105845:C9orf174;ENSG00000197816:ENST00000528678:exon_100105622_100105845:C9orf174 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 100201585 A/G 1 1 7 8 0.470290244854951 3.70796828601534 -3.23767804116039 A:G A G 10 0.529709755145049 0.030153697845537 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100201527_100201600:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100201527_100201600:TDRD7 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 T:C C T 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 100675816 A/G 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100675683_100675840:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100675534_100675840:C9orf156 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 68 64 132 31.9797366501367 33.9014243292831 -1.92168767914647 T:C C T 10 0.529709755145049 0.793771843931437 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 101 83 184 47.4993147303501 43.9659096770391 3.53340505331098 C:G G C 10 0.529709755145049 0.606257980570668 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 103204577 C/G 1 5 3 8 2.35145122427475 1.58912926543515 0.762321958839608 C:G C G 10 0.529709755145049 0.730403775860341 ENSG00000066697:ENST00000395067:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000398977:exon_103204188_103204623:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374885:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374886:exon_103204188_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000374887:exon_103204185_103204638:C9orf30;ENSG00000066697:ENST00000489377:exon_103204431_103204638:C9orf30;ENSG00000251349:ENST00000502978:exon_103204553_103204638:RP11-61P7.3;ENSG00000241697:ENST00000334943:exon_103204560_103204638:TMEFF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 106875613 A/G 1 52 25 77 24.4550927324575 13.2427438786262 11.2123488538312 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0116649544873457 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106875597_106875756:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106875597_106875756:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106875597_106875756:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106875597_106875756:SMC2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 19 26 45 8.93551465224407 13.7724536337713 -4.83693898152721 A:G G A 10 0.529709755145049 0.178735515578988 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 22 14 36 10.3463853868089 7.41593657203069 2.93044881477823 A:T A T 10 0.529709755145049 0.404405665752156 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 13 14 27 6.11377318311436 7.41593657203069 -1.30216338891632 T:C T C 10 0.529709755145049 0.701181858931601 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114184259 G/C 1 7 4 11 3.29203171398466 2.1188390205802 1.17319269340446 C:G G C 10 0.529709755145049 0.556736795064713 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184201_114184323:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184201_114184323:KIAA0368 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114195587 G/A 1 6 8 14 2.82174146912971 4.23767804116039 -1.41593657203069 A:G G A 10 0.529709755145049 0.594252000694241 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114195513_114195652:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114195513_114195652:KIAA0368 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 0 8 0 8 3.76232195883961 0 3.76232195883961 C C 10 0.529709755145049 0.00859166265928258 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 A:G A G 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114804173 G/A 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G G A 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000106868:ENST00000355396:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374270:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374263:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374264:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000475283:exon_114804147_114804240:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000441934:exon_114804149_114804231:SUSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114820741 G/A 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000106868:ENST00000355396:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374270:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374263:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000374264:exon_114820708_114820966:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000475283:exon_114820708_114820751:SUSD1;ENSG00000106868:ENST00000441934:exon_114820708_114820966:SUSD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 75 73 148 35.2717683641213 38.6688121255886 -3.39704376146726 T:C T C 10 0.529709755145049 0.621431235119814 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 91 50 141 42.7964122818005 26.4854877572525 16.3109245245481 T:C C T 10 0.529709755145049 0.00674685406504534 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 26 36 62 12.2275463662287 19.0695511852218 -6.84200481899304 T:C C T 10 0.529709755145049 0.097611560190038 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 50 38 88 23.5145122427475 20.1289706955119 3.38554154723569 A:G A G 10 0.529709755145049 0.522114315137343 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 24 14 38 11.2869658765188 7.41593657203069 3.87102930448814 T:C C T 10 0.529709755145049 0.255548794870674 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 11 9 20 5.17319269340446 4.76738779630544 0.405804897099019 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 3 8 11 1.41087073456485 4.23767804116039 -2.82680730659554 A:G A G 10 0.529709755145049 0.129246611858996 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 96 90 186 45.1478635060753 47.6738779630544 -2.52601445697912 A:C:G A G 10 0.529709755145049 0.714109523328337 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 123877397 T/C 1 12 18 30 5.64348293825941 9.53477559261088 -3.89129265435147 T:C T C 10 0.529709755145049 0.199932672074604 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373851:exon_123877369_123877478:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123877369_123877478:CEP110 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 123903840 G/A 1 10 14 24 4.70290244854951 7.41593657203069 -2.71303412348118 A:G G A 10 0.529709755145049 0.309420366114583 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373851:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123903659_123903866:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123903659_123903866:CEP110 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 124751390 G/A 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 A:G G A 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000175764:ENST00000373776:exon_124751189_124752049:TTLL11;ENSG00000175764:ENST00000487468:exon_124751189_124752049:TTLL11 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 7 21 28 3.29203171398466 11.123904858046 -7.83187314406137 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00379009517944433 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 41 53 94 19.281900039053 28.0746170226876 -8.79271698363461 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0787164377004313 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130166017 C/T 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373352:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130166017_130166070:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130166017_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130165939_130166026:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000489239:exon_130165557_130166082:SLC2A8 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 22 16 38 10.3463853868089 8.47535608232078 1.87102930448814 A:G A G 10 0.529709755145049 0.626922730070605 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130259618 A/C 1 4 5 9 1.8811609794198 2.64854877572525 -0.767387796305441 A:C A C 10 0.529709755145049 0.742946050221313 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130536484 C/T 1 10 11 21 4.70290244854951 5.82680730659554 -1.12390485804603 T:C C T 10 0.529709755145049 0.666576892969373 ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130565267 A/G 1 18 20 38 8.46522440738912 10.594195102901 -2.12897069551186 A:G A G 10 0.529709755145049 0.518822860282873 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130565154_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488307:exon_130565172_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130565190_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000481552:exon_130565196_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130565197_130565341:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475765:exon_130565211_130565341:FPGS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130586688 G/A 1 7 11 18 3.29203171398466 5.82680730659554 -2.53477559261088 A:G G A 10 0.529709755145049 0.247451477742465 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130586583_130586725:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130586583_130586725:ENG HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 31 24 55 14.5789975905035 12.7130341234812 1.8659634670223 T:G G T 10 0.529709755145049 0.685970085942745 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130932373 T/G 1 46 40 86 21.6333512633277 21.188390205802 0.444961057525781 T:G T G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000465583:exon_130932322_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130932299_130932386:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000471839:exon_130932299_130932386:CIZ1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 130938661 C/T 1 35 24 59 16.4601585699233 12.7130341234812 3.74712444644211 T:C C T 10 0.529709755145049 0.362620157423327 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000465583:exon_130938630_130938707:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130938630_130938754:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000471839:exon_130938630_130938754:CIZ1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131020382 C/G 1 24 16 40 11.2869658765188 8.47535608232078 2.81160979419804 C:G C G 10 0.529709755145049 0.429791763866838 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131020400 C/G 1 22 16 38 10.3463853868089 8.47535608232078 1.87102930448814 C:G C G 10 0.529709755145049 0.626922730070605 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131115368 A/G 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000167114:ENST00000300456:exon_131115304_131115513:SLC27A4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 8 3 11 3.76232195883961 1.58912926543515 2.17319269340446 A:G G A 10 0.529709755145049 0.23563289183908 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131513506 G/A 1 16 9 25 7.52464391767922 4.76738779630544 2.75725612137377 A:G G A 10 0.529709755145049 0.319177216114926 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131513401_131513547:ZER1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131565554 T/C 1 9 2 11 4.23261220369456 1.0594195102901 3.17319269340446 T:C T C 10 0.529709755145049 0.0705618130584992 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131565529_131565739:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131565529_131565727:TBC1D13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 9 4 13 4.23261220369456 2.1188390205802 2.11377318311436 T:C T C 10 0.529709755145049 0.277880751215266 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 13 18 31 6.11377318311436 9.53477559261088 -3.42100240949652 A:G A G 10 0.529709755145049 0.280275685776745 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 15 14 29 7.05435367282426 7.41593657203069 -0.361582899206422 A:G G A 10 0.529709755145049 1 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 23 23 46 10.8166756316639 12.1833243683361 -1.36664873667226 C:G G C 10 0.529709755145049 0.768168914109342 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 5 4 9 2.35145122427475 2.1188390205802 0.232612203694559 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 36 37 73 16.9304488147782 19.5992609403668 -2.66881212558858 A:C A C 10 0.529709755145049 0.559007277277496 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131767741 A/G 1 45 43 88 21.1630610184728 22.7775194712371 -1.61445845276432 A:G A G 10 0.529709755145049 0.749595010335752 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 16 17 33 7.52464391767922 9.00506583746583 -1.48042191978662 T:C C T 10 0.529709755145049 0.606794931813472 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C C T 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131849063 C/T 1 6 2 8 2.82174146912971 1.0594195102901 1.76232195883961 T:C C T 10 0.529709755145049 0.295993080845259 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 131898801 C/T 1 21 11 32 9.87609514195397 5.82680730659554 4.04928783535843 T:C C T 10 0.529709755145049 0.161034976422528 ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000455292:exon_131898750_131898835:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000452489:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000445241:exon_131898750_131898845:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000417728:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000455240:exon_131898750_131898874:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000411917:exon_131898776_131898874:PPP2R4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 30 36 66 14.1087073456485 19.0695511852218 -4.96084383957324 A:G G A 10 0.529709755145049 0.266959200444824 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 106 25 131 49.8507659546248 13.2427438786262 36.6080220759986 C:G C G 10 0.529709755145049 3.04400660633037e-11 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 62 47 109 29.157995181007 24.8963584918173 4.26163668918965 A:T:G A G 10 0.529709755145049 0.443433102420393 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 41 41 82 19.281900039053 21.718099960947 -2.43619992189402 T:C C T 10 0.529709755145049 0.658394316205012 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 9 9 18 4.23261220369456 4.76738779630544 -0.534775592610883 A:T:G G A 10 0.529709755145049 0.817876940863517 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 168 129 297 79.0087611356318 68.3325584137113 10.6762027219204 T:C C T 10 0.529709755145049 0.222492695932731 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 133511400 G/A 1 13 8 21 6.11377318311436 4.23767804116039 1.87609514195397 A:G G A 10 0.529709755145049 0.513879879006915 ENSG00000107164:ENST00000319725:exon_133511386_133511513:FUBP3;ENSG00000107164:ENST00000372378:exon_133511386_133511513:FUBP3;ENSG00000107164:ENST00000472006:exon_133511386_133511513:FUBP3;ENSG00000107164:ENST00000492199:exon_133511251_133511513:FUBP3 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134073898 G/C 1 43 27 70 20.2224805287629 14.3021633889163 5.92031713984657 C:G G C 10 0.529709755145049 0.187531004456512 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 8 10 18 3.76232195883961 5.29709755145049 -1.53477559261088 C:G C G 10 0.529709755145049 0.4890292223975 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:C C T 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134350490 G/A 1 7 10 17 3.29203171398466 5.29709755145049 -2.00506583746583 A:G G A 10 0.529709755145049 0.343928044108047 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134350647 T/C 1 5 8 13 2.35145122427475 4.23767804116039 -1.88622681688564 T:C T C 10 0.529709755145049 0.406319529123367 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:G G T 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134351343 C/T 1 9 7 16 4.23261220369456 3.70796828601534 0.524643917679215 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 7 7 14 3.29203171398466 3.70796828601534 -0.415936572030686 T:C T C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 6 4 10 2.82174146912971 2.1188390205802 0.70290244854951 T:C T C 10 0.529709755145049 0.758220070035298 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 8 6 14 3.76232195883961 3.17825853087029 0.584063427969314 T:C C T 10 0.529709755145049 0.795649893443606 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 60 57 117 28.2174146912971 30.1934560432678 -1.97604135197074 T:C T C 10 0.529709755145049 0.712366487286925 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 43 46 89 20.2224805287629 24.3666487366723 -4.14416820790937 T:C T C 10 0.529709755145049 0.396903402192498 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135150616 T/C 1 6 3 9 2.82174146912971 1.58912926543515 1.23261220369456 T:C T C 10 0.529709755145049 0.514726796548614 ENSG00000107290:ENST00000464133:exon_135150310_135150807:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 10 12 22 4.70290244854951 6.35651706174059 -1.65361461319108 A:G A G 10 0.529709755145049 0.526490606294521 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 12 9 21 5.64348293825941 4.76738779630544 0.876095141953971 T:C T C 10 0.529709755145049 0.828010258000608 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 7 13 20 3.29203171398466 6.88622681688564 -3.59419510290098 T:C T C 10 0.529709755145049 0.120597361593551 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 11 7 18 5.17319269340446 3.70796828601534 1.46522440738912 T:C C T 10 0.529709755145049 0.638217341656156 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 8 7 15 3.76232195883961 3.70796828601534 0.0543536728242646 A:C A C 10 0.529709755145049 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135521303 C/T 1 9 6 15 4.23261220369456 3.17825853087029 1.05435367282426 T:C C T 10 0.529709755145049 0.616843550206763 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135554962 G/A 1 19 11 30 8.93551465224407 5.82680730659554 3.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.277585425247202 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135765261 C/T 1 4 4 8 1.8811609794198 2.1188390205802 -0.237678041160392 T:C C T 10 0.529709755145049 1 ENSG00000165698:ENST00000372136:exon_135763677_135765418:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000356311:exon_135763677_135765418:C9orf9 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 48 33 81 22.5739317530376 17.4804219197866 5.09350983325103 C:G G C 10 0.529709755145049 0.267682985034809 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 136198906 G/A 1 41 62 103 19.281900039053 32.842004818993 -13.5601047799401 A:G G A 10 0.529709755145049 0.00766728574750281 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 136217675 T/G 1 76 118 194 35.7420586089763 62.5057511071158 -26.7636924981395 T:G T G 10 0.529709755145049 0.000128302745099090 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 136219295 A/G 1 3 90 93 1.41087073456485 47.6738779630544 -46.2630072284896 A:G A G 10 0.529709755145049 8.63651826981278e-26 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 136221752 G/C 1 28 31 59 13.1681268559386 16.4210024094965 -3.25287555355789 C:G G C 10 0.529709755145049 0.434941965691201 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136221679_136221812:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136221679_136221812:SURF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 136227019 G/C 1 10 8 18 4.70290244854951 4.23767804116039 0.465224407389117 C:G G C 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 138378856 A/G 1 9 1 10 4.23261220369456 0.529709755145049 3.70290244854951 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0236718901176251 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 138392889 C/A 1 54 43 97 25.3956732221674 22.7775194712371 2.61815375093024 A:C C A 10 0.529709755145049 0.612505390932136 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000488610:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000485333:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000462948:exon_138392844_138393172:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472852:exon_138392844_138392969:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000453385:exon_138392759_138392969:MRPS2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 138830081 C/T 1 37 36 73 17.4007390596332 19.0695511852218 -1.66881212558858 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.725951849805365 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138830068_138830206:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000489050:exon_138830068_138830206:UBAC1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139272460 C/T 0 31 0 31 14.5789975905035 0 14.5789975905035 C C 10 0.529709755145049 5.29130178674612e-09 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139571430 G/A 1 13 15 28 6.11377318311436 7.94564632717574 -1.83187314406137 A:G G A 10 0.529709755145049 0.571427095192413 ENSG00000169692:ENST00000371694:exon_139571413_139571588:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000371696:exon_139571413_139571588:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000472820:exon_139571413_139571832:AGPAT2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139620695 C/T 1 7 6 13 3.29203171398466 3.17825853087029 0.113773183114363 T:C C T 10 0.529709755145049 1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 14 19 33 6.58406342796931 10.0644853477559 -3.48042191978662 A:G A G 10 0.529709755145049 0.295326882479969 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 18 12 30 8.46522440738912 6.35651706174059 2.10870734564853 A:G G A 10 0.529709755145049 0.470117017246042 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139756980 T/C 1 49 39 88 23.0442219978926 20.6586804506569 2.38554154723569 T:C T C 10 0.529709755145049 0.669650221220158 ENSG00000107223:ENST00000371648:exon_139756942_139757451:EDF1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139814931 G/T 1 16 29 45 7.52464391767922 15.3615828992064 -7.83693898152721 T:G G T 10 0.529709755145049 0.0242025042797779 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139814686_139814967:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139814686_139814967:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139814686_139814967:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139814929_139814967:TRAF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 35 37 72 16.4601585699233 19.5992609403668 -3.13910237044353 A:G G A 10 0.529709755145049 0.480351918843036 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 139837171 A/G 1 7 5 12 3.29203171398466 2.64854877572525 0.643482938259412 A:G A G 10 0.529709755145049 0.77915090740031 ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836999_139837178:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 140006096 A/C 1 12 2 14 5.64348293825941 1.0594195102901 4.58406342796931 A:C A C 10 0.529709755145049 0.0150847280678921 HGDP01262_parsed_pileup.txt . 9 140343886 C/A 1 43 41 84 20.2224805287629 21.718099960947 -1.49561943218412 A:C C A 10 0.529709755145049 0.744528546640354 ENSG00000165802:ENST00000339554:exon_140342022_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371474:exon_140342025_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000265663:exon_140342025_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371475:exon_140342025_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000437259:exon_140342025_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371482:exon_140342677_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371473:exon_140342677_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000392812:exon_140342677_140343943:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371472:exon_140343843_140343943:NELF HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 32 31 63 15.0492878353584 16.4210024094965 -1.37171457413809 T:C C T 10 0.529709755145049 0.80101856652309 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 215944 G/T 1 82 67 149 38.563800078106 35.4905535947183 3.07324648338769 A:T:G G T 10 0.529709755145049 0.623538481344738 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 189 172 361 88.8848562775857 91.1100778849484 -2.22522160736271 A:G G A 10 0.529709755145049 0.833057040669777 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 229557 C/T 1 22 25 47 10.3463853868089 13.2427438786262 -2.8963584918173 T:C C T 10 0.529709755145049 0.465512386285849 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 34 16 50 15.9898683250683 8.47535608232078 7.51451224274755 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0341159157482785 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 41 13 54 19.281900039053 6.88622681688564 12.3956732221674 T:C C T 10 0.529709755145049 0.000884823363508202 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 22 6 28 10.3463853868089 3.17825853087029 7.16812685593863 T:C T C 10 0.529709755145049 0.00725006983192772 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 39 19 58 18.3413195493431 10.0644853477559 8.27683420158715 A:G A G 10 0.529709755145049 0.0346824438766599 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 26 3 29 12.2275463662287 1.58912926543515 10.6384171007936 A:G G A 10 0.529709755145049 4.27145454650464e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1467404 A/C 1 6 29 35 2.82174146912971 15.3615828992064 -12.5398414300767 A:C A C 10 0.529709755145049 2.18864405463314e-05 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1467324_1467438:IL3RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1471305 C/T 1 6 35 41 2.82174146912971 18.5398414300767 -15.718099960947 T:C C T 10 0.529709755145049 7.40026104806767e-07 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1471215_1471399:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1471215_1471399:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000432757:exon_1471215_1471399:IL3RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 31 68 99 14.5789975905035 36.0202633498633 -21.4412657593599 C:G G C 10 0.529709755145049 1.79536576627835e-05 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1161 1128 2289 546.006974276598 597.512603803615 -51.5056295270173 A:G G A 10 0.529709755145049 0.0326791102043492 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 59 68 127 27.7471244464421 36.0202633498633 -8.27313890342123 C:G C G 10 0.529709755145049 0.154970810680948 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 51 70 121 23.9848024876025 37.0796828601534 -13.0948803725509 T:C C T 10 0.529709755145049 0.0178800348746486 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 53 33 86 24.9253829773124 17.4804219197866 7.44496105752578 T:C C T 10 0.529709755145049 0.129998715544466 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1540706 A/G 1 144 62 206 67.7217952591129 32.842004818993 34.8797904401199 A:G A G 10 0.529709755145049 8.4434129357102e-07 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1540551_1540735:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1540551_1540735:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1540551_1540735:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 85 81 166 39.9746708126708 42.906490166749 -2.93181935407814 A:G G A 10 0.529709755145049 0.697579326128295 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 125 102 227 58.7862806068689 54.030395024795 4.75588558207387 A:G A G 10 0.529709755145049 0.549917667508407 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 110 119 229 51.7319269340446 63.0354608622608 -11.3035339282162 A:G A G 10 0.529709755145049 0.145246901028614 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 28 33 61 13.1681268559386 17.4804219197866 -4.31229506384799 T:C T C 10 0.529709755145049 0.305256990383226 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 39 37 76 18.3413195493431 19.5992609403668 -1.25794139102373 T:C C T 10 0.529709755145049 0.818627747639723 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 45 31 76 21.1630610184728 16.4210024094965 4.74205860897627 C:G C G 10 0.529709755145049 0.301986054225753 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 2343343 A/G 1 5 5 10 2.35145122427475 2.64854877572525 -0.297097551450491 A:G A G 10 0.529709755145049 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000444280:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000441131:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000478825:exon_2343238_2343345:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000430536:exon_2343238_2343345:DHRSX HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 163 125 288 76.657309911357 66.2137193931311 10.4435905182259 T:C C T 10 0.529709755145049 0.237724529850491 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP01262_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 135 100 235 63.4891830554184 52.9709755145049 10.5182075409135 A:T:C C T 10 0.529709755145049 0.17071630390077 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99