INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 25 31 56 11.7242734732619 16.4619008931553 -4.7376274198934 A:G G A 10 0.531029061069525 0.228899994115268 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 887801 A/G 1 19 30 49 8.91044783967903 15.9308718320857 -7.02042399240672 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0461008843303938 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_887792_887980:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_887792_887980:NOC2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 888639 T/C 1 13 17 30 6.09662220609618 9.02749403818192 -2.93087183208575 T:C T C 10 0.531029061069525 0.360707760476209 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 888659 T/C 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 T:C T C 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 889238 G/A 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_889162_889272:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_889162_889272:NOC2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 2883 2452 5335 1352.04321693656 1302.08325774248 49.9599591940841 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.174452245840198 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 990380 C/T 1 78 35 113 36.5797332365771 18.5860171374334 17.9937160991437 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.000650312189442847 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 24 21 45 11.2553025343314 11.15161028246 0.103692251871376 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1231656 G/A 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000131584:ENST00000354700:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000353662:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000492936:exon_1231591_1231660:ACAP3;ENSG00000131584:ENST00000467278:exon_1231591_1231660:ACAP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 113 91 204 52.9937160991437 48.3236445573268 4.6700715418169 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.528432072691469 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 62 53 115 29.0761982136895 28.1445402366848 0.93165797700463 A:G G A 10 0.531029061069525 0.925627395733061 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 39 35 74 18.2898666182885 18.5860171374334 -0.296150519144845 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 25 23 48 11.7242734732619 12.2136684045991 -0.489394931337198 T:C C T 10 0.531029061069525 0.886287248267494 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 15 19 34 7.03456408395713 10.089552160321 -3.05498807636385 A:G G A 10 0.531029061069525 0.307602642125318 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 255 284 539 119.587589427271 150.812253343745 -31.2246639164739 C:G G C 10 0.531029061069525 0.00742305937881122 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 13 0 13 6.09662220609618 0 6.09662220609618 C C 10 0.531029061069525 0.000320092157226576 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 21 27 48 9.84838971753998 14.3377846488772 -4.4893949313372 T:C C T 10 0.531029061069525 0.197129510897693 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 92 85 177 43.1453263816037 45.1374701909096 -1.99214380930592 A:G A G 10 0.531029061069525 0.763921235110745 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 A:G G A 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 31 17 48 14.5380991068447 9.02749403818192 5.5106050686628 T:C C T 10 0.531029061069525 0.114386883094421 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 58 42 100 27.2003144579676 22.30322056492 4.8970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367420824801451 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 103 116 219 48.3040067098389 61.5993710840649 -13.295364374226 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0782298670047955 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 2494330 G/A 1 216 227 443 101.297722808983 120.543596862782 -19.2458740537996 A:G G A 10 0.531029061069525 0.070425935853137 ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463835:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482602:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000480305:exon_2494304_2494335:TNFRSF14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 3551792 G/A 1 13 4 17 6.09662220609618 2.1241162442781 3.97250596181808 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0859287884724819 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000497940:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000469643:exon_3551724_3552014:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000494884:exon_3551724_3551997:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000465916:exon_3551724_3551858:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000419924:exon_3551724_3551858:WDR8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 6324747 G/A 1 139 113 252 65.186960511336 60.0062839008563 5.1806766104797 A:G G A 10 0.531029061069525 0.528411641944877 ENSG00000097021:ENST00000377855:exon_6324333_6324755:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377860:exon_6324333_6324755:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000418124:exon_6324333_6324755:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377845:exon_6324333_6324755:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377842:exon_6324333_6324755:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000361521:exon_6324333_6324755:ACOT7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 6614535 G/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6614167_6614595:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464665:exon_6614167_6614560:NOL9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 34 22 56 15.9450119236362 11.6826393435295 4.2623725801066 A:G A G 10 0.531029061069525 0.285156124192367 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 64 73 137 30.0141400915504 38.7651214580753 -8.75098136652492 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.145672135693780 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 8716453 T/C 1 11 4 15 5.15868032823523 2.1241162442781 3.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.12904355932744 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8716032_8716500:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8716032_8716500:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8716032_8716500:RERE;ENSG00000142599:ENST00000480342:exon_8716032_8716500:RERE;ENSG00000142599:ENST00000468247:exon_8716252_8716500:RERE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 10238770 A/G 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10238702_10238876:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10238702_10238888:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10238702_10238876:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10238702_10238876:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000487244:exon_10238702_10238876:UBE4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 68 52 120 31.8900238472723 27.6135111756153 4.27651267165701 T:C C T 10 0.531029061069525 0.464952160614454 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 10473200 G/A 1 58 44 102 27.2003144579676 23.3652786870591 3.83503577090845 A:G G A 10 0.531029061069525 0.487900360811525 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 10479791 G/A 1 433 438 871 203.064416556896 232.590728748452 -29.5263121915563 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.0452310682274554 ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10479687_10480200:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10479687_10480201:PGD;ENSG00000142657:ENST00000498356:exon_10479687_10479887:PGD;ENSG00000142657:ENST00000496718:exon_10479474_10479865:PGD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 10521649 C/T 1 26 29 55 12.1932444121924 15.3998427710162 -3.20659835882387 T:C C T 10 0.531029061069525 0.419061473241431 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 6 13 19 2.81382563358285 6.90337779390382 -4.08955216032097 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0680604357891647 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 329 364 693 154.291438908126 193.294578229307 -39.0031393211808 T:G G T 10 0.531029061069525 0.00335368234796312 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 11137661 A/G 1 29 24 53 13.6001572289838 12.7446974656686 0.855459763315176 A:G A G 10 0.531029061069525 0.890831301513509 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 24 21 45 11.2553025343314 11.15161028246 0.103692251871376 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 11150682 C/T 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 T:C C T 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 11159823 T/C 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 T:C T C 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 23 22 45 10.7863315954009 11.6826393435295 -0.896307748128624 A:G A G 10 0.531029061069525 0.881514345877086 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 A:G G A 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 55 60 115 25.7934016411761 31.8617436641715 -6.06834202299537 A:G A G 10 0.531029061069525 0.263547310057764 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 14 29 43 6.56559314502665 15.3998427710162 -8.83424962598957 A:T T A 10 0.531029061069525 0.00872293486612511 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 40 51 91 18.758837557219 27.0824821145458 -8.32364455732677 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0925276585169994 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 A:G A G 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19583636 C/T 1 48 31 79 22.5106050686628 16.4619008931553 6.04870417550753 T:C C T 10 0.531029061069525 0.178128956814994 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583558_19583639:MRTO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19652063 G/A 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 A:G G A 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19651989_19652076:PQLC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 19950062 T/C 1 116 160 276 54.4006289159351 84.964649771124 -30.5640208551889 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000281229277319299 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 20009471 G/A 1 14 16 30 6.56559314502665 8.4964649771124 -1.93087183208575 A:G G A 10 0.531029061069525 0.583962242482046 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 20009837 G/C 1 4 12 16 1.8758837557219 6.3723487328343 -4.4964649771124 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0415470826185352 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20008706_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20009781_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20008735_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20009781_20009937:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20008754_20009937:TMCO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 20827216 C/T 1 19 22 41 8.91044783967903 11.6826393435295 -2.77219150385052 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.435287250272125 ENSG00000090432:ENST00000264198:exon_20825943_20827912:MUL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 16 14 30 7.5035350228876 7.43440685497335 0.0691281679142506 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 450 434 884 211.036922518714 230.466612504174 -19.4296899854601 T:C T C 10 0.531029061069525 0.200328290070428 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 96 86 182 45.0212101373256 45.6684992519791 -0.647289114653546 A:G G A 10 0.531029061069525 0.940890907711477 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 21267993 G/C 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 C:G G C 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000356916:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374927:exon_21267984_21268823:EIF4G3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 22063108 G/A 1 32 17 49 15.0070700457752 9.02749403818192 5.97957600759328 A:G G A 10 0.531029061069525 0.114462488059404 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22062939_22063118:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22062939_22063118:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22062939_22063118:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22062939_22063118:USP48;ENSG00000090686:ENST00000374730:exon_22062923_22063118:USP48 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 17 24 41 7.97250596181808 12.7446974656686 -4.77219150385052 A:G G A 10 0.531029061069525 0.159175262557064 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 T:C T C 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 23640112 G/A 1 52 67 119 24.3864888243847 35.5789470916582 -11.1924582672735 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0432204700592297 ENSG00000125944:ENST00000478691:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000374616:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000427764:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000414299:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000426846:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000374612:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000302271:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000463552:exon_23640046_23640195:HNRNPR;ENSG00000125944:ENST00000470941:exon_23640092_23640195:HNRNPR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24077554 T/C 1 31 32 63 14.5380991068447 16.9929299542248 -2.45483084738007 T:C T C 10 0.531029061069525 0.613966851502148 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 43 21 64 20.1657503740104 11.15161028246 9.0141400915504 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0243742151877231 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24113824 T/C 1 53 47 100 24.8554597633152 24.9583658702677 -0.102906106952496 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000057757:ENST00000246151:exon_24113765_24114722:C1orf128;ENSG00000057757:ENST00000374524:exon_24113765_24114722:C1orf128 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 15 7 22 7.03456408395713 3.71720342748667 3.31736065647045 T:C T C 10 0.531029061069525 0.200508636918786 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 18 10 28 8.44147690074855 5.31029061069525 3.1311862900533 T:C T C 10 0.531029061069525 0.260630838316877 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 22 11 33 10.3173606564705 5.84131967176477 4.47604098470568 T:C C T 10 0.531029061069525 0.161946884964285 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 C:G G C 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 T:C C T 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 A:G A G 10 0.531029061069525 0.155286387026531 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 10 14 24 4.68970938930475 7.43440685497335 -2.7446974656686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.308686848417513 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 15 21 36 7.03456408395713 11.15161028246 -4.1170461985029 A:G G A 10 0.531029061069525 0.184129144905387 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 T:C T C 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 13 11 24 6.09662220609618 5.84131967176477 0.255302534331401 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 25554663 C/T 1 53 51 104 24.8554597633152 27.0824821145458 -2.22702235123059 T:C C T 10 0.531029061069525 0.694852921792066 ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25554609_25554726:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25554609_25554726:SYF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 138 160 298 64.7179895724056 84.964649771124 -20.2466601987184 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0201641045846101 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 5 18 23 2.34485469465238 9.55852309925145 -7.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00287306870011992 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 27480757 A/G 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000090020:ENST00000263980:exon_27480474_27481401:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374086:exon_27480474_27481089:SLC9A1;ENSG00000090020:ENST00000374084:exon_27480473_27480852:SLC9A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 27679797 A/G 1 24 27 51 11.2553025343314 14.3377846488772 -3.08248211454577 A:G A G 10 0.531029061069525 0.402984965069796 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 36 30 66 16.8829538014971 15.9308718320857 0.952081969411353 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.90198698370149 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 25 13 38 11.7242734732619 6.90337779390382 4.82089567935805 A:G A G 10 0.531029061069525 0.143265968186043 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 27873788 G/A 1 20 23 43 9.3794187786095 12.2136684045991 -2.83424962598957 A:G G A 10 0.531029061069525 0.44568428015896 ENSG00000126705:ENST00000247087:exon_27873772_27878700:AHDC1;ENSG00000126705:ENST00000374011:exon_27873772_27878700:AHDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 28531815 G/A 1 45 46 91 21.1036922518714 24.4273368091981 -3.32364455732677 A:G G A 10 0.531029061069525 0.529002002414757 ENSG00000126698:ENST00000263697:exon_28531769_28531860:DNAJC8;ENSG00000126698:ENST00000489277:exon_28531769_28531860:DNAJC8;ENSG00000126698:ENST00000470967:exon_28531769_28531860:DNAJC8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 409 370 779 191.809114022564 196.480752595724 -4.67163857315992 A:G A G 10 0.531029061069525 0.746712924726625 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 19 11 30 8.91044783967903 5.84131967176477 3.06912816791425 A:G A G 10 0.531029061069525 0.278610279576009 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 29543155 G/A 1 9 13 22 4.22073845037428 6.90337779390382 -2.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.289159904606614 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000484012:exon_29543113_29543324:MECR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 31206637 C/T 1 665 668 1333 311.865674388766 354.727412794443 -42.8617384056768 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0196394037577924 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 31208042 C/T 1 521 538 1059 244.333859182778 285.693634855404 -41.3597756726269 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.0115502895727168 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31208020_31208112:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31208020_31208112:LAPTM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 44 46 90 20.6347213129409 24.4273368091981 -3.79261549625725 T:C T C 10 0.531029061069525 0.46024845212492 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 114 102 216 53.4626870380742 54.1649642290915 -0.702277191017394 A:G A G 10 0.531029061069525 0.945704480222294 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 32669645 C/T 1 229 240 469 107.394345015079 127.446974656686 -20.0526296416072 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.0643447813177976 ENSG00000160050:ENST00000373602:exon_32669480_32669646:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000421922:exon_32669480_32669646:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000461819:exon_32669480_32669646:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000483009:exon_32669480_32669646:CCDC28B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 A:G G A 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 33790496 G/A 1 14 25 39 6.56559314502665 13.2757265267381 -6.71013338171147 A:G G A 10 0.531029061069525 0.036532555309882 ENSG00000134686:ENST00000431992:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000419414:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000307890:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000361167:exon_33789224_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000257118:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373422:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000373418:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000485928:exon_33789227_33790620:PHC2;ENSG00000134686:ENST00000467894:exon_33790290_33790620:PHC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 36068863 T/C 1 231 170 401 108.33228689294 90.2749403818192 18.0573465111205 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0718090142430791 ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36067185_36068975:PSMB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 111 104 215 52.0557742212827 55.2270223512306 -3.17124812994786 T:C T C 10 0.531029061069525 0.682162394454179 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 38329999 C/G 1 21 25 46 9.84838971753998 13.2757265267381 -3.42733680919815 A:C:G C G 10 0.531029061069525 0.375670422400274 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38329984_38330095:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000487328:exon_38329984_38330521:INPP5B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 177 176 353 83.0078561906941 93.4611147482364 -10.4532585575423 C:G G C 10 0.531029061069525 0.28616056436014 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 4 12 16 1.8758837557219 6.3723487328343 -4.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0415470826185352 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 C:G G C 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 39917888 C/A 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 A:C C A 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39917828_39918022:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39917828_39918022:MACF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 40705156 C/T 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 T:C C T 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 40773123 G/C 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 C:G G C 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 40960619 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 13 17 30 6.09662220609618 9.02749403818192 -2.93087183208575 T:G G T 10 0.531029061069525 0.360707760476209 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 15 16 31 7.03456408395713 8.4964649771124 -1.46190089315527 T:C C T 10 0.531029061069525 0.719571891946296 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 43396414 G/A 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000475162:exon_43396297_43396537:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43396297_43396611:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43395990_43396537:SLC2A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 43630460 G/A 1 165 213 378 77.3802049235284 113.109190007809 -35.7289850842804 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000246161728780481 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43630314_43630476:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43630314_43630476:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43630314_43630476:EBNA1BP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 49 38 87 22.9795760075933 20.1791043206419 2.80047168695133 T:C C T 10 0.531029061069525 0.591898658096461 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 25 14 39 11.7242734732619 7.43440685497335 4.28986661828853 T:C T C 10 0.531029061069525 0.199868686457106 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 19 5 24 8.91044783967903 2.65514530534762 6.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0127334158201771 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 44137257 C/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:C C A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 45224901 G/A 1 13 26 39 6.09662220609618 13.8067555878076 -7.71013338171147 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0155524007213624 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 46500993 A/G 1 14 12 26 6.56559314502665 6.3723487328343 0.19324441219235 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000456625:exon_46500755_46501265:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46500751_46501259:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 51121198 T/C 1 7 14 21 3.28279657251333 7.43440685497335 -4.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0813314038736254 ENSG00000185104:ENST00000396153:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000494400:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000371778:exon_51121114_51121200:FAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 51826921 T/C 1 13 24 37 6.09662220609618 12.7446974656686 -6.64807525957242 T:C T C 10 0.531029061069525 0.032110920966929 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 51873951 G/A 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000493793:exon_51873807_51874004:EPS15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 41 47 88 19.2278084961495 24.9583658702677 -5.7305573741182 A:G A G 10 0.531029061069525 0.240558439209987 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 52498370 C/T 1 62 69 131 29.0761982136895 36.6410052137972 -7.56480700010777 T:C C T 10 0.531029061069525 0.190153263787063 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 42 36 78 19.69677943508 19.1170461985029 0.579733236577052 A:T A T 10 0.531029061069525 0.91023766331101 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 T:C C T 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 53442376 A/G 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528809:exon_53442355_53442384:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53442355_53442441:SCP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 54417796 A/G 1 12 12 24 5.6276512671657 6.3723487328343 -0.744697465668599 A:G A G 10 0.531029061069525 0.839153121959338 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54417659_54418145:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000371368:exon_54417659_54418145:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54417659_54418145:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000444987:exon_54417659_54418145:LRRC42 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 61 68 129 28.607227274759 36.1099761527277 -7.50274887796872 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.187148445276371 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 269 204 473 126.153182572298 108.329928458183 17.8232541141147 A:C:G C G 10 0.531029061069525 0.106821376275709 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 96 74 170 45.0212101373256 39.2961505191448 5.72505961818076 A:G G A 10 0.531029061069525 0.398508525399632 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:T T A 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:G A G 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 11 4 15 5.15868032823523 2.1241162442781 3.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.12904355932744 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62380270 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62380259_62380336:INADL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62456014 G/A 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62675619 C/T 0 0 10 10 0 5.31029061069525 -5.31029061069525 T C T 10 0.531029061069525 0.000514587595485234 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62675892 A/G 0 0 16 16 0 8.4964649771124 -8.4964649771124 G A G 10 0.531029061069525 5.47437950170834e-06 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62677048 G/T 0 0 22 22 0 11.6826393435295 -11.6826393435295 T G T 10 0.531029061069525 5.82385412933732e-08 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62677050 C/T 0 0 23 23 0 12.2136684045991 -12.2136684045991 T C T 10 0.531029061069525 2.73121833922944e-08 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 62677118 A/G 0 0 39 39 0 20.7101333817115 -20.7101333817115 G A G 10 0.531029061069525 1.49517256909676e-13 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 63300478 C/T 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 T:C C T 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000125703:ENST00000317868:exon_63300447_63300523:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371120:exon_63300447_63300523:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000414558:exon_63300447_63300523:ATG4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 2 19 21 0.93794187786095 10.089552160321 -9.15161028246002 A:C C A 10 0.531029061069525 6.95161216938143e-05 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 70819912 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000118454:ENST00000370944:exon_70819662_70820405:ANKRD13C;ENSG00000118454:ENST00000262346:exon_70819662_70820417:ANKRD13C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 182 199 381 85.3527108853465 105.674783152835 -20.322072267489 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0399480274477628 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 84961108 G/A 1 36 34 70 16.8829538014971 18.0549880763638 -1.17203427486675 A:G G A 10 0.531029061069525 0.811387022598975 ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 7 12 19 3.28279657251333 6.3723487328343 -3.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.173367796352208 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 85405253 T/C 1 23 24 47 10.7863315954009 12.7446974656686 -1.95836587026767 T:C T C 10 0.531029061069525 0.661532956137026 ENSG00000153898:ENST00000370608:exon_85405236_85405385:MCOLN2;ENSG00000153898:ENST00000284027:exon_85405236_85405385:MCOLN2;ENSG00000153898:ENST00000531325:exon_85405236_85405385:MCOLN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 86196210 C/T 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171502:ENST00000370571:exon_86194916_86196375:COL24A1;ENSG00000171502:ENST00000436319:exon_86194916_86196375:COL24A1;ENSG00000171502:ENST00000426639:exon_86195765_86196375:COL24A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 T:C T C 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 41 27 68 19.2278084961495 14.3377846488772 4.8900238472723 A:G G A 10 0.531029061069525 0.274286047749019 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 6 12 18 2.81382563358285 6.3723487328343 -3.55852309925145 A:C A C 10 0.531029061069525 0.102920868968033 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 93744055 G/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 12 20 32 5.6276512671657 10.6205812213905 -4.9929299542248 T:G G T 10 0.531029061069525 0.109467775564270 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 C:G G C 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 12 30 42 5.6276512671657 15.9308718320857 -10.30322056492 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00170319235554884 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 2 11 13 0.93794187786095 5.84131967176477 -4.90337779390383 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00947500294686673 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 110561188 T/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:G T G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000168710:ENST00000369799:exon_110561174_110561272:AHCYL1;ENSG00000168710:ENST00000393614:exon_110561174_110561272:AHCYL1;ENSG00000168710:ENST00000359172:exon_110561174_110561272:AHCYL1;ENSG00000168710:ENST00000469401:exon_110561174_110561712:AHCYL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 111726213 A/G 1 4 18 22 1.8758837557219 9.55852309925145 -7.68263934352955 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00102917081822040 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 111726869 G/A 1 112 67 179 52.5247451602132 35.5789470916582 16.945798068555 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.0132392597644650 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726813_111727430:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726813_111727724:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726813_111726953:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726813_111727722:CEPT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 111741322 G/A 1 3 15 18 1.40691281679143 7.96543591604287 -6.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00322429940701626 ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111741252_111741364:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111741252_111741364:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473682:exon_111741252_111741364:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000463713:exon_111741252_111741364:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000477586:exon_111741252_111741364:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473822:exon_111741252_111741364:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000488786:exon_111741252_111741364:DENND2D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 111783982 C/A,T 0 0 99 99 0 52.571877045883 -52.571877045883 A:T C T 10 0.531029061069525 2.77617730005120e-33 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 113245326 A/G 0 0 11 11 0 5.84131967176477 -5.84131967176477 G A G 10 0.531029061069525 0.000241326627816686 ENSG00000155366:ENST00000473074:exon_113245185_113245741:RHOC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 48 45 93 22.5106050686628 23.8963077481286 -1.38570267946582 A:T A T 10 0.531029061069525 0.835555605469241 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 114354654 T/C 1 13 11 24 6.09662220609618 5.84131967176477 0.255302534331401 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000081019:ENST00000261441:exon_114354332_114355098:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000434941:exon_114354332_114354662:RSBN1;ENSG00000081019:ENST00000476412:exon_114354332_114354915:RSBN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 A:G A G 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 30 36 66 14.0691281679143 19.1170461985029 -5.04791803058865 A:G G A 10 0.531029061069525 0.219826317656688 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 16 0 16 7.5035350228876 0 7.5035350228876 C C 10 0.531029061069525 4.54589672380085e-05 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 A A 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 144931087 T/C 0 10 0 10 4.68970938930475 0 4.68970938930475 T T 10 0.531029061069525 0.00229771711226017 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 34 34 0 18.0549880763638 -18.0549880763638 A G A 10 0.531029061069525 6.59115711637332e-12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 41 41 0 21.7721915038505 -21.7721915038505 C T C 10 0.531029061069525 3.28838897401318e-14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 26 26 0 13.8067555878076 -13.8067555878076 T G T 10 0.531029061069525 2.81704778455775e-09 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 30 30 0 15.9308718320857 -15.9308718320857 A C A 10 0.531029061069525 1.36262997737285e-10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 86 0 86 40.3315007480209 0 40.3315007480209 G G 10 0.531029061069525 2.54204738537253e-24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 60 60 0 31.8617436641715 -31.8617436641715 C T C 10 0.531029061069525 1.85676045523513e-20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 124 124 0 65.8476035726211 -65.8476035726211 T C T 10 0.531029061069525 1.66761380363659e-41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 146740502 C/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 C:G C G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146740441_146740537:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146740441_146740537:CHD1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 29 30 59 13.6001572289838 15.9308718320857 -2.33071460310197 C:G C G 10 0.531029061069525 0.602456865908122 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 23 21 44 10.7863315954009 11.15161028246 -0.365278687059099 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 150923099 T/C 1 14 6 20 6.56559314502665 3.18617436641715 3.3794187786095 T:C T C 10 0.531029061069525 0.178235221525341 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150922934_150923566:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000534805:exon_150922934_150923259:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150922934_150923566:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150922934_150923566:SETDB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 150940625 T/G 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:G T G 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150940559_150940648:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000361419:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000421609:exon_150940559_150940677:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000457392:exon_150940583_150940677:LASS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 328 333 661 153.822467969196 176.832677336152 -23.010209366956 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.0731593342126963 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 23 13 36 10.7863315954009 6.90337779390382 3.8829538014971 A:G G A 10 0.531029061069525 0.242524480159383 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:G G A 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 152883680 A/G 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 A:G A G 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 C:G G C 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 153517172 T/C 1 46 61 107 21.5726631908019 32.392772725241 -10.8201095344392 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0415786887392436 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 153631943 G/A 1 18 19 37 8.44147690074855 10.089552160321 -1.64807525957242 A:G G A 10 0.531029061069525 0.623751217534118 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000478558:exon_153631203_153632042:SNAPIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 43 39 82 20.1657503740104 20.7101333817115 -0.544383007701047 C:G G C 10 0.531029061069525 0.912369179497303 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 25 32 57 11.7242734732619 16.9929299542248 -5.26865648096292 T:C C T 10 0.531029061069525 0.184724210117777 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 21 18 39 9.84838971753998 9.55852309925145 0.289866618288526 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 49 41 90 22.9795760075933 21.7721915038505 1.20738450374275 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.83323802151454 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 156206158 C/T 1 43 43 86 20.1657503740104 22.8342496259896 -2.66849925197915 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.590105411859374 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156206140_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156206140_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 156693135 C/T 1 28 32 60 13.1311862900533 16.9929299542248 -3.8617436641715 T:C C T 10 0.531029061069525 0.365567802779541 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156691683_156693254:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000472824:exon_156691687_156693254:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156692395_156693254:ISG20L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 35 16 51 16.4139828625666 8.4964649771124 7.91751788545423 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0343197148536177 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 156784982 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 157504466 T/C 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 4 24 28 1.8758837557219 12.7446974656686 -10.8688137099467 A:G A G 10 0.531029061069525 3.05663963583916e-05 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 221 194 415 103.642577503635 103.019637847488 0.622939656147139 C:G G C 10 0.531029061069525 0.960812832121483 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 158988270 T/C 1 225 226 451 105.518461259357 120.012567801713 -14.4941065423558 T:C T C 10 0.531029061069525 0.171646547093039 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158988019_158988441:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158988019_158988441:IFI16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 130 117 247 60.9662220609618 62.1304001451344 -1.16417808417267 A:C C A 10 0.531029061069525 0.898651683166524 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 122 104 226 57.214454549518 55.2270223512306 1.98743219828736 A:T T A 10 0.531029061069525 0.84158303833398 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 159021506 C/T 1 190 205 395 89.1044783967903 108.860957519253 -19.7564791224624 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.0492229056493017 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159021469_159023514:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159021469_159023514:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159021469_159021888:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159021469_159021888:IFI16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 159752066 G/A 1 27 13 40 12.6622153511228 6.90337779390382 5.758837557219 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0809833176403588 ENSG00000158716:ENST00000368109:exon_159751943_159752333:DUSP23;ENSG00000158716:ENST00000368108:exon_159751943_159752333:DUSP23;ENSG00000158716:ENST00000368107:exon_159751943_159752333:DUSP23 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:G A G 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 160321065 A/G 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321012_160321162:NCSTN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 160321499 C/T 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000459963:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424645:exon_160321486_160321595:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000424754:exon_160321486_160321595:NCSTN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1253 1049 2302 587.620586479885 557.049485061932 30.5711014179535 A:T:C:G G A 10 0.531029061069525 0.202786778862487 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 160808796 G/A 1 19 6 25 8.91044783967903 3.18617436641715 5.72427347326188 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0262689112085459 ENSG00000122223:ENST00000368034:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368033:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000492063:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000322302:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000481677:exon_160808610_160808955:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368032:exon_160808729_160808839:CD244 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 161090467 A/G 1 51 52 103 23.9175178854542 27.6135111756153 -3.69599329016107 A:G A G 10 0.531029061069525 0.490358610879655 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161090289_161090857:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161090289_161090857:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368007:exon_161090289_161090857:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161090289_161090594:NIT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 161577446 C/A 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:C C A 10 0.531029061069525 0.296620249790405 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 63 23 86 29.5451691526199 12.2136684045991 17.3315007480209 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000198805250346997 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 77 170 247 36.1107622976466 90.2749403818192 -54.1641780841727 A:G G A 10 0.531029061069525 4.25353964002032e-12 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 36 42 78 16.8829538014971 22.30322056492 -5.42026676342295 T:C C T 10 0.531029061069525 0.256498816207194 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 163313568 A/C 1 8 16 24 3.7517675114438 8.4964649771124 -4.7446974656686 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0649184187279779 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 167905028 C/T 1 79 63 142 37.0487041755075 33.4548308473801 3.59387332812746 T:C C T 10 0.531029061069525 0.557350710054636 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167904971_167905278:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167904971_167905136:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167904971_167905136:BRP44;ENSG00000143164:ENST00000450548:exon_167905021_167905350:DCAF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 38 30 68 17.8208956793581 15.9308718320857 1.8900238472723 T:C C T 10 0.531029061069525 0.715927006954574 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 168034974 G/A 1 28 13 41 13.1311862900533 6.90337779390382 6.22780849614948 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0599817538323409 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168034828_168034984:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168034828_168034984:DCAF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 17 25 42 7.97250596181808 13.2757265267381 -5.30322056492005 A:G G A 10 0.531029061069525 0.121708488715885 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 42 48 90 19.69677943508 25.4893949313372 -5.79261549625725 A:C A C 10 0.531029061069525 0.245565308655564 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171509414 C/G 1 65 54 119 30.4831110304809 28.6755692977543 1.80754173272653 C:G C G 10 0.531029061069525 0.783213609076653 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171509671 A/G 1 33 34 67 15.4760409847057 18.0549880763638 -2.57894709165817 A:G A G 10 0.531029061069525 0.542699843136460 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 22 25 47 10.3173606564705 13.2757265267381 -2.95836587026767 T:C T C 10 0.531029061069525 0.46532677882094 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171755071 A/G 1 19 16 35 8.91044783967903 8.4964649771124 0.413982862566627 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171755182 G/A 1 26 20 46 12.1932444121924 10.6205812213905 1.57266319080185 A:G G A 10 0.531029061069525 0.660976740627122 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 171763549 C/T 1 23 29 52 10.7863315954009 15.3998427710162 -4.6135111756153 T:C C T 10 0.531029061069525 0.213139105146865 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000466643:exon_171763536_171763667:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000476386:exon_171763534_171763667:METTL13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 61 97 158 28.607227274759 51.5098189237439 -22.9025916489849 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000308308902879617 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 36 28 64 16.8829538014971 14.8688137099467 2.0141400915504 T:C T C 10 0.531029061069525 0.707439027541832 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 173772506 T/G 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:G T G 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000120334:ENST00000356198:exon_173772101_173772643:CENPL;ENSG00000120334:ENST00000367709:exon_173772101_173772643:CENPL;ENSG00000120334:ENST00000345664:exon_173772101_173772643:CENPL;ENSG00000120334:ENST00000367710:exon_173772101_173772643:CENPL;ENSG00000120334:ENST00000496683:exon_173772101_173772643:CENPL;ENSG00000120334:ENST00000484920:exon_173772101_173772643:CENPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 173835758 C/A 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:C C A 10 0.531029061069525 0.321071456058558 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 181058313 G/A 1 28 23 51 13.1311862900533 12.2136684045991 0.917517885454226 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888659609738321 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 197070464 T/C 1 14 6 20 6.56559314502665 3.18617436641715 3.3794187786095 T:C T C 10 0.531029061069525 0.178235221525341 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 197071028 C/T 1 9 2 11 4.22073845037428 1.06205812213905 3.15868032823523 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0710289055589968 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 C:G G C 10 0.531029061069525 0.457534991859192 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 200818980 C/G 1 12 23 35 5.6276512671657 12.2136684045991 -6.58601713743337 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0279314733529459 ENSG00000118200:ENST00000358823:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000413307:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000236925:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 56 29 85 26.2623725801066 15.3998427710162 10.8625298090904 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0219563895553676 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 201974712 G/C 1 55 57 112 25.7934016411761 30.2686564809629 -4.4752548397868 C:G G C 10 0.531029061069525 0.448959534245253 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201974686_201975275:RNPEP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 16 18 34 7.5035350228876 9.55852309925145 -2.05498807636385 T:C C T 10 0.531029061069525 0.496865948303442 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 206776460 G/A 1 40 22 62 18.758837557219 11.6826393435295 7.07619821368945 A:G G A 10 0.531029061069525 0.07567072469582 ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206776437_206776558:LGTN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 70 83 153 32.8279657251333 44.0754120687706 -11.2474463436373 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0746429748334291 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 207646163 C/T 1 32 31 63 15.0070700457752 16.4619008931553 -1.45483084738007 T:C C T 10 0.531029061069525 0.800928072930545 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646117_207646213:CR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 35 44 79 16.4139828625666 23.3652786870591 -6.95129582449247 A:G G A 10 0.531029061069525 0.142326822573277 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 40 39 79 18.758837557219 20.7101333817115 -1.95129582449247 C:G C G 10 0.531029061069525 0.735469907730184 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 14 6 20 6.56559314502665 3.18617436641715 3.3794187786095 A:G A G 10 0.531029061069525 0.178235221525341 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 212273606 G/A 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 A:G G A 10 0.531029061069525 0.825489956938963 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 212870410 G/A 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000123685:ENST00000478275:exon_212870303_212872097:BATF3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 218458753 C/T 1 24 2 26 11.2553025343314 1.06205812213905 10.1932444121924 T:C C T 10 0.531029061069525 3.16740672344857e-05 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218458684_218458797:RRP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 35 36 71 16.4139828625666 19.1170461985029 -2.70306333593627 T:C T C 10 0.531029061069525 0.553265268509742 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 103 107 210 48.3040067098389 56.8201095344392 -8.51610282460024 T:C C T 10 0.531029061069525 0.240750012320148 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227069677 T/C 1 9 1 10 4.22073845037428 0.531029061069525 3.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0238719986684543 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 T:C C T 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 23 10 33 10.7863315954009 5.31029061069525 5.47604098470568 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0795440102419332 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 T T 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 36 32 68 16.8829538014971 16.9929299542248 -0.109976152727697 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 26 20 46 12.1932444121924 10.6205812213905 1.57266319080185 T:C C T 10 0.531029061069525 0.660976740627122 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 13 14 27 6.09662220609618 7.43440685497335 -1.33778464887717 A:C A C 10 0.531029061069525 0.700905289249009 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 20 11 31 9.3794187786095 5.84131967176477 3.53809910684473 A:G A G 10 0.531029061069525 0.213786149384365 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227954677 C/T 1 39 30 69 18.2898666182885 15.9308718320857 2.35899478620278 T:C C T 10 0.531029061069525 0.630074658473757 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 227954689 C/T 1 40 30 70 18.758837557219 15.9308718320857 2.82796572513325 T:C C T 10 0.531029061069525 0.55008740441527 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 10 3 13 4.68970938930475 1.59308718320857 3.09662220609618 A:C A C 10 0.531029061069525 0.100357328720842 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 229622162 A/G 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 229623338 T/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229623213_229623360:NUP133 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 18 18 36 8.44147690074855 9.55852309925145 -1.1170461985029 A:T T A 10 0.531029061069525 0.740638587627158 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C T C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 233120192 G/A 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000135749:ENST00000496675:exon_233119881_233120223:PCNXL2;ENSG00000135749:ENST00000344698:exon_233119882_233122286:PCNXL2;ENSG00000135749:ENST00000462233:exon_233119882_233120223:PCNXL2;ENSG00000135749:ENST00000258229:exon_233119882_233120223:PCNXL2;ENSG00000135749:ENST00000462762:exon_233119883_233120223:PCNXL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 A:C:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 16 7 23 7.5035350228876 3.71720342748667 3.78633159540093 T:C C T 10 0.531029061069525 0.143736519391274 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 18 8 26 8.44147690074855 4.2482324885562 4.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 0.117013771715704 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G A G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 52 65 117 24.3864888243847 34.5168889695191 -10.1304001451344 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0641180200692852 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 235324212 G/A 1 107 41 148 50.1798904655608 21.7721915038505 28.4076989617103 A:T:G G A 10 0.531029061069525 2.10308180848721e-06 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000475960:exon_235323826_235324277:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 235324219 G/A 1 108 37 145 50.6488614044913 19.6480752595724 31.0007861449189 A:G G A 10 0.531029061069525 1.64126882161521e-07 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000475960:exon_235323826_235324277:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 235420493 G/A 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235420475_235420540:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235420475_235420540:ARID4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236141174 T/C 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236139130_236141288:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236139130_236141288:NID1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 11 2 13 5.15868032823523 1.06205812213905 4.09662220609617 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0257188033078452 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 11 2 13 5.15868032823523 1.06205812213905 4.09662220609617 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0257188033078452 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 6 13 19 2.81382563358285 6.90337779390382 -4.08955216032097 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0680604357891647 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 14 28 42 6.56559314502665 14.8688137099467 -8.30322056492005 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0126474560378001 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 20 18 38 9.3794187786095 9.55852309925145 -0.179104320641947 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 26 24 50 12.1932444121924 12.7446974656686 -0.551453053476248 T:C T C 10 0.531029061069525 0.888275640512622 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 38 42 80 17.8208956793581 22.30322056492 -4.482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.316348679258656 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 43 35 78 20.1657503740104 18.5860171374334 1.57973323657705 T:C T C 10 0.531029061069525 0.735166576659577 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 51 42 93 23.9175178854542 22.30322056492 1.61429732053418 A:G A G 10 0.531029061069525 0.756347051438695 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 19 12 31 8.91044783967903 6.3723487328343 2.53809910684473 A:G G A 10 0.531029061069525 0.375722831482458 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C T C 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 236729956 T/C 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236729946_236730176:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236729946_236730176:HEATR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 26 18 44 12.1932444121924 9.55852309925145 2.6347213129409 T:C C T 10 0.531029061069525 0.453610964491796 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 42 24 66 19.69677943508 12.7446974656686 6.95208196941135 C:G G C 10 0.531029061069525 0.108190722325305 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 1 247486528 C/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000162714:ENST00000461277:exon_247486456_247486532:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000294753:exon_247486456_247486532:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000366498:exon_247486456_247486532:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000465126:exon_247486456_247486684:ZNF496 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 38 46 84 17.8208956793581 24.4273368091981 -6.6064411298401 A:G G A 10 0.531029061069525 0.156301102848189 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 1065457 T/A 1 25 42 67 11.7242734732619 22.30322056492 -10.5789470916582 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0100982697692391 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 22 24 46 10.3173606564705 12.7446974656686 -2.42733680919815 T:C C T 10 0.531029061069525 0.555095215867205 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 32 28 60 15.0070700457752 14.8688137099467 0.138256335828501 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 39 36 75 18.2898666182885 19.1170461985029 -0.82717958021437 T:C C T 10 0.531029061069525 0.908045463535023 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 19 27 46 8.91044783967903 14.3377846488772 -5.42733680919815 A:G A G 10 0.531029061069525 0.138817667828542 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 50 44 94 23.4485469465238 23.3652786870591 0.0832682594646528 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 61 30 91 28.607227274759 15.9308718320857 12.6763554426732 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00839784789062984 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 60 38 98 28.1382563358285 20.1791043206419 7.95915201518655 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128562783746316 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 65 70 135 30.4831110304809 37.1720342748667 -6.68892324438587 A:G G A 10 0.531029061069525 0.262808022682677 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 5791052 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 6060053 C/T 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6060016_6060082:IL2RA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 6268205 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000170525:ENST00000379789:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379781:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000490474:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000467491:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000477914:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379785:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000461744:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000317350:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379782:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000360521:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379775:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000358499:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000444592:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000487989:exon_6268155_6268410:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000475881:exon_6268155_6268328:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000414237:exon_6268155_6268328:PFKFB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 8100647 C/T 1 14 7 21 6.56559314502665 3.71720342748667 2.84838971753998 T:C C T 10 0.531029061069525 0.275352070578657 ENSG00000107485:ENST00000379328:exon_8100268_8100804:GATA3;ENSG00000107485:ENST00000346208:exon_8100268_8100804:GATA3;ENSG00000107485:ENST00000461472:exon_8100362_8100804:GATA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 78 72 150 36.5797332365771 38.2340923970058 -1.65435916042874 C:G C G 10 0.531029061069525 0.80647944924662 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 15177280 T/C 1 7 12 19 3.28279657251333 6.3723487328343 -3.08955216032097 T:C T C 10 0.531029061069525 0.173367796352208 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 14 19 33 6.56559314502665 10.089552160321 -3.52395901529432 A:C C A 10 0.531029061069525 0.22750273500789 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 10 40 50 4.68970938930475 21.241162442781 -16.5514530534762 T:C C T 10 0.531029061069525 2.53694503503330e-06 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 27009267 T/C 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_27009064_27009288:PDSS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 32573963 T/C 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000479380:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32570787_32575943:EPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 32580219 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32580091_32581572:EPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 43088919 T/G 1 8 13 21 3.7517675114438 6.90337779390382 -3.15161028246002 T:G T G 10 0.531029061069525 0.193093229428768 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 43281089 T/C 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 34 14 48 15.9450119236362 7.43440685497335 8.5106050686628 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0139406220600663 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 146 107 253 68.4697570838494 56.8201095344392 11.6496475494102 A:T T A 10 0.531029061069525 0.147663199952457 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 50678717 T/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 A:G A G 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 60148009 T/G 1 15 17 32 7.03456408395713 9.02749403818192 -1.9929299542248 T:G T G 10 0.531029061069525 0.485507554942917 ENSG00000108064:ENST00000487519:exon_60147950_60148020:TFAM;ENSG00000108064:ENST00000373899:exon_60147950_60148020:TFAM;ENSG00000108064:ENST00000373895:exon_60147950_60148020:TFAM;ENSG00000108064:ENST00000395377:exon_60147950_60148020:TFAM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 14 7 21 6.56559314502665 3.71720342748667 2.84838971753998 T:G G T 10 0.531029061069525 0.275352070578657 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/C 1 21 9 30 9.84838971753998 4.77926154962572 5.06912816791425 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0689479697692445 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 A:G G A 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 64975376 A/G 1 5 13 18 2.34485469465238 6.90337779390382 -4.55852309925145 A:G A G 10 0.531029061069525 0.034821244804787 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000469152:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000489372:exon_64975313_64975376:JMJD1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 65225450 C/T 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:C C T 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_65225255_65225641:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_65225255_65225722:JMJD1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 70549579 G/A 1 21 19 40 9.84838971753998 10.089552160321 -0.241162442780999 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70549467_70549672:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000480627:exon_70549467_70549629:CCAR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 22 21 43 10.3173606564705 11.15161028246 -0.834249625989575 T:C C T 10 0.531029061069525 0.878893655227225 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 106 115 221 49.7109195266304 61.0683420229954 -11.357422496365 A:G A G 10 0.531029061069525 0.138027573341338 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G G A 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 71151885 C/T 1 15 15 30 7.03456408395713 7.96543591604287 -0.930871832085749 T:C C T 10 0.531029061069525 0.85526692479372 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000467710:exon_71151881_71151918:HK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 23 9 32 10.7863315954009 4.77926154962572 6.0070700457752 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0344669896601002 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 73521578 G/A 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 73972957 C/T 1 5 13 18 2.34485469465238 6.90337779390382 -4.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.034821244804787 ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000531048:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530461:exon_73972945_73973035:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000527593:exon_73972945_73973109:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000524829:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000532011:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000526751:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000492502:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000533958:exon_73972945_73973089:ASCC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 81841692 G/T 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:G G T 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000133678:ENST00000472622:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372281:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000528687:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372277:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372275:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372274:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000411627:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000372273:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000467529:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463029:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000476173:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000483732:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000463209:exon_81841597_81841700:C10orf57;ENSG00000133678:ENST00000450179:exon_81841597_81841700:C10orf57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 T:C T C 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 34 18 52 15.9450119236362 9.55852309925145 6.3864888243847 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0946648207597967 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 A:T A T 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 1 10 11 0.468970938930475 5.31029061069525 -4.84131967176477 C:G C G 10 0.531029061069525 0.00419409086522907 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 12 21 33 5.6276512671657 11.15161028246 -5.52395901529432 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0568658309974287 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 91498127 T/C 1 19 15 34 8.91044783967903 7.96543591604287 0.945011923636152 T:C T C 10 0.531029061069525 0.863959540191866 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 91522548 A/G 1 16 12 28 7.5035350228876 6.3723487328343 1.1311862900533 A:G A G 10 0.531029061069525 0.708778352037643 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91522395_91522592:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91522395_91522592:KIF20B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 95720490 C/T 0 10 0 10 4.68970938930475 0 4.68970938930475 C C 10 0.531029061069525 0.00229771711226017 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 95720501 T/C 0 11 0 11 5.15868032823523 0 5.15868032823523 T T 10 0.531029061069525 0.00118822022087503 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 96098373 C/T 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 96098493 T/A 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 A:T T A 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 46 50 96 21.5726631908019 26.5514530534762 -4.9787898626744 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.357461464354577 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 52 52 104 24.3864888243847 27.6135111756153 -3.22702235123059 T:C C T 10 0.531029061069525 0.556199087325585 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 36 43 79 16.8829538014971 22.8342496259896 -5.95129582449247 T:C C T 10 0.531029061069525 0.214729654348857 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 47 32 79 22.0416341297323 16.9929299542248 5.04870417550753 A:G G A 10 0.531029061069525 0.262156890658401 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 A:G G A 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99220707 C/T 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 A:C A C 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 11 12 23 5.15868032823523 6.3723487328343 -1.21366840459907 T:C T C 10 0.531029061069525 0.678732618130644 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 15 6 21 7.03456408395713 3.18617436641715 3.84838971753998 C:G G C 10 0.531029061069525 0.124798609888677 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 100195130 G/A 1 9 1 10 4.22073845037428 0.531029061069525 3.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0238719986684543 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100195089_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100194843_100195171:HPS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 12 12 24 5.6276512671657 6.3723487328343 -0.744697465668599 A:G G A 10 0.531029061069525 0.839153121959338 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 7 13 20 3.28279657251333 6.90337779390382 -3.6205812213905 A:C A C 10 0.531029061069525 0.119767603512246 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C T C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 102107251 C/G 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102107233_102107288:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102106881_102107288:SCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 A:C A C 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 104184081 G/A 1 119 130 249 55.8075417327265 69.0337779390382 -13.2262362063117 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0987686090971915 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 60 52 112 28.1382563358285 27.6135111756153 0.524745160213204 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 T:C C T 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 66 59 125 30.9520819694114 31.330714603102 -0.378632633690621 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 29 29 58 13.6001572289838 15.3998427710162 -1.79968554203245 T:C T C 10 0.531029061069525 0.693726192526832 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105344756 T/C 1 19 3 22 8.91044783967903 1.59308718320857 7.31736065647045 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00198022663041946 ENSG00000107954:ENST00000369780:exon_105344293_105344982:NEURL;ENSG00000107954:ENST00000369777:exon_105344293_105344982:NEURL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105657316 G/C 1 26 22 48 12.1932444121924 11.6826393435295 0.510605068662802 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105659826 T/C 1 18 28 46 8.44147690074855 14.8688137099467 -6.42733680919815 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0751834668325928 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105659718_105659911:OBFC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105677392 T/C 1 10 5 15 4.68970938930475 2.65514530534762 2.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.315767079054389 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105677220_105677414:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105677220_105677427:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105677220_105677414:OBFC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 20 23 43 9.3794187786095 12.2136684045991 -2.83424962598957 A:G G A 10 0.531029061069525 0.44568428015896 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 128 88 216 60.0282801831008 46.7305573741182 13.2977228089826 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0761773488508959 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 45 29 74 21.1036922518714 15.3998427710162 5.70384948085515 T:C C T 10 0.531029061069525 0.200974513037281 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 112349422 T/C 1 32 24 56 15.0070700457752 12.7446974656686 2.2623725801066 T:C T C 10 0.531029061069525 0.593593559347322 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 112641053 A/G 1 88 101 189 41.2694426258818 53.633935168022 -12.3644925421402 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0800527673129061 ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112641033_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112640991_112641293:PDCD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 112645088 G/A 1 63 51 114 29.5451691526199 27.0824821145458 2.46268703807415 A:G G A 10 0.531029061069525 0.707591033460492 ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112645011_112645097:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000481353:exon_112644529_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000462577:exon_112645011_112645124:PDCD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 120446114 A/G 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000490610:exon_120446110_120446293:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000489169:exon_120446110_120446153:C10orf46 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 41 39 80 19.2278084961495 20.7101333817115 -1.482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.738557439829844 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 121336248 T/C 1 92 83 175 43.1453263816037 44.0754120687706 -0.930085687166873 T:C T C 10 0.531029061069525 0.93965620274980 ENSG00000151923:ENST00000369093:exon_121336123_121336262:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000463089:exon_121336123_121336262:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000489822:exon_121336123_121336715:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000497671:exon_121336123_121336262:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000470781:exon_121336123_121336715:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000436547:exon_121336123_121336262:TIAL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 121662335 G/T 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 T:G G T 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121662311_121662521:SEC23IP;ENSG00000107651:ENST00000442952:exon_121662319_121662521:SEC23IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:T A T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 21 14 35 9.84838971753998 7.43440685497335 2.41398286256663 A:G G A 10 0.531029061069525 0.499023115258447 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 C:G C G 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 123549691 T/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:G T G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123549684_123549804:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000485281:exon_123549684_123549741:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000470613:exon_123549378_123549804:ATE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 124755534 T/C 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000095574:ENST00000368886:exon_124755510_124755692:IKZF5;ENSG00000095574:ENST00000496605:exon_124755510_124755692:IKZF5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 15 6 21 7.03456408395713 3.18617436641715 3.84838971753998 A:G A G 10 0.531029061069525 0.124798609888677 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 12 16 28 5.6276512671657 8.4964649771124 -2.8688137099467 A:G G A 10 0.531029061069525 0.344371932689015 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 41 23 64 19.2278084961495 12.2136684045991 7.0141400915504 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.0809518053000428 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 210 169 379 98.4838971753998 89.7439113207497 8.73998585465004 T:C T C 10 0.531029061069525 0.381843847292097 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 195 181 376 91.4493330914426 96.116260053584 -4.66692696214139 C:G G C 10 0.531029061069525 0.642126983738609 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 177 152 329 83.0078561906941 80.7164172825678 2.2914389081263 T:C C T 10 0.531029061069525 0.825229879607731 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 94 129 223 44.0832682594647 68.5027488779687 -24.4194806185041 C:G G C 10 0.531029061069525 0.00123224513023020 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 104 97 201 48.7729776487694 51.5098189237439 -2.73684127497452 T:C C T 10 0.531029061069525 0.724061843617676 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 124 108 232 58.1523964273789 57.3511385955087 0.80125783187021 A:G G A 10 0.531029061069525 0.947595383807964 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 88 67 155 41.2694426258818 35.5789470916582 5.69049553422363 T:C T C 10 0.531029061069525 0.376758694463380 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 60 77 137 28.1382563358285 40.8892377023534 -12.7509813665249 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0321511595385315 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 29 35 64 13.6001572289838 18.5860171374334 -4.9858599084496 T:C C T 10 0.531029061069525 0.213640070418359 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 A:T T A 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 7 16 23 3.28279657251333 8.4964649771124 -5.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0358368209699659 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 131959150 C/T 1 56 64 120 26.2623725801066 33.9858599084496 -7.723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.17031450919034 ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 10 52 62 4.68970938930475 27.6135111756153 -22.9238017863105 T:C T C 10 0.531029061069525 2.11684828174684e-09 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 134036193 A/G 1 6 20 26 2.81382563358285 10.6205812213905 -7.80675558780765 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00258898156526648 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134036145_134036276:STK32C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 134040319 G/A 1 17 9 26 7.97250596181808 4.77926154962572 3.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 0.24166113324983 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134040299_134040472:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134040299_134040472:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134040299_134040472:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134040299_134040472:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134040299_134040472:STK32C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 8 15 23 3.7517675114438 7.96543591604287 -4.21366840459907 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0948309364563758 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 10 134540331 T/C 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C T C 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000487614:exon_134540325_134540853:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000498337:exon_134540325_134540409:INPP5A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 83 52 135 38.9245879312294 27.6135111756153 11.3110767556141 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0575305205220662 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 429 488 917 201.188532801174 259.142181801928 -57.9536490007544 A:C:G A G 10 0.531029061069525 0.000139279786243785 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 A:G G A 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 28 23 51 13.1311862900533 12.2136684045991 0.917517885454226 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888659609738321 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 T:C C T 10 0.531029061069525 0.316197821820389 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 24 23 47 11.2553025343314 12.2136684045991 -0.958365870267674 A:G G A 10 0.531029061069525 0.884009347691094 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 A:G A G 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 823809 C/G 1 36 27 63 16.8829538014971 14.3377846488772 2.54516915261993 C:G C G 10 0.531029061069525 0.531290716576407 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_823694_823855:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_823527_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_823694_824130:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000526083:exon_823648_823855:PNPLA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 7 15 22 3.28279657251333 7.96543591604287 -4.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0543736988605008 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 1501670 G/C 1 19 5 24 8.91044783967903 2.65514530534762 6.2553025343314 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0127334158201771 ENSG00000182208:ENST00000399693:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000329957:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000526462:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000427202:exon_1501623_1501716:AC091196.1;ENSG00000182208:ENST00000526698:exon_1501623_1502115:AC091196.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 2417893 C/T 1 317 240 557 148.663787640961 127.446974656686 21.2168129842746 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0745679630010977 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 2417935 T/C 1 337 257 594 158.04320641957 136.474468694868 21.5687377247022 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.0772037354285953 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 2424647 G/A 1 54 65 119 25.3244307022457 34.5168889695191 -9.19245826727347 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0983958557585166 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 5 17 22 2.34485469465238 9.02749403818192 -6.68263934352955 A:C C A 10 0.531029061069525 0.00483511484583023 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 128 104 232 60.0282801831008 55.2270223512306 4.80125783187021 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.554103386054807 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 4621485 C/G 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 C:G C G 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4619902_4622056:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4620010_4622056:TRIM68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 5653960 G/A 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5653467_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5653511_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5653485_5653984:TRIM34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 5701001 C/T 1 14 10 24 6.56559314502665 5.31029061069525 1.2553025343314 T:C C T 10 0.531029061069525 0.685265962050597 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700991_5701037:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700991_5701063:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 5701081 G/A 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 99 95 194 46.428122954117 50.4477608016049 -4.01963784748784 T:C T C 10 0.531029061069525 0.565902038997161 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 5719756 C/T 1 109 77 186 51.1178323434218 40.8892377023534 10.2285946410684 T:C C T 10 0.531029061069525 0.141878443924649 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6340416 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 A:T A T 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6412854 C/T 1 10 18 28 4.68970938930475 9.55852309925145 -4.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0869074224724432 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6412931 T/C 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6415297 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000532367:exon_6415126_6415358:SMPD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 60 50 110 28.1382563358285 26.5514530534762 1.58680328235225 T:C C T 10 0.531029061069525 0.77535911814255 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 129 133 262 60.4972511220313 70.6268651222468 -10.1296140002155 A:G G A 10 0.531029061069525 0.216083264561375 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 247 279 526 115.835821915827 148.157108038397 -32.3212861225701 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00513547282357840 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 29 46 75 13.6001572289838 24.4273368091981 -10.8271795802144 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0146689504744641 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 47 25 72 22.0416341297323 13.2757265267381 8.7659076029942 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0442512102565843 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 37 20 57 17.3519247404276 10.6205812213905 6.73134351903708 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0843746840668952 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 8009241 C/T 1 21 26 47 9.84838971753998 13.8067555878076 -3.95836587026767 T:C C T 10 0.531029061069525 0.306272271668692 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9304939 T/C 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166471:ENST00000299596:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000524543:exon_9302201_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000429086:exon_9304918_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000528080:exon_9302218_9305140:TMEM41B;ENSG00000166471:ENST00000533867:exon_9304686_9305140:TMEM41B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9549142 G/A 1 19 28 47 8.91044783967903 14.8688137099467 -5.95836587026767 A:G G A 10 0.531029061069525 0.106935788927788 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9549077_9549601:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9549077_9550071:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9549077_9549160:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9549077_9549193:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9549077_9549828:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000532305:exon_9549077_9549499:ZNF143 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 A:G A G 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 15 7 22 7.03456408395713 3.71720342748667 3.31736065647045 A:C A C 10 0.531029061069525 0.200508636918786 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 10 3 13 4.68970938930475 1.59308718320857 3.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.100357328720842 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 25 13 38 11.7242734732619 6.90337779390382 4.82089567935805 C:G C G 10 0.531029061069525 0.143265968186043 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 9771457 C/T 1 30 22 52 14.0691281679143 11.6826393435295 2.3864888243847 T:C C T 10 0.531029061069525 0.579086842425757 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9771411_9773368:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9771411_9774538:SWAP70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 10521749 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 10 18 28 4.68970938930475 9.55852309925145 -4.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0869074224724432 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 179 199 378 83.945798068555 105.674783152835 -21.7289850842804 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0266309901076295 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 C:G G C 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C T C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 39 31 70 18.2898666182885 16.4619008931553 1.82796572513325 A:G A G 10 0.531029061069525 0.719991410125492 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 23 32 55 10.7863315954009 16.9929299542248 -6.20659835882387 T:C C T 10 0.531029061069525 0.105173161910239 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 18108492 T/C 1 26 19 45 12.1932444121924 10.089552160321 2.10369225187138 T:C T C 10 0.531029061069525 0.553853047746523 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18108413_18108507:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 18267027 C/T 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 C C 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000134339:ENST00000256733:exon_18266775_18267062:SAA2;ENSG00000134339:ENST00000529528:exon_18266785_18267062:SAA2;ENSG00000134339:ENST00000526900:exon_18266790_18267062:SAA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 T:C T C 10 0.531029061069525 0.457534991859192 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 11 33 44 5.15868032823523 17.5239590152943 -12.3652786870591 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000209439721961671 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 32956620 A/G 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 A:G A G 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 29 26 55 13.6001572289838 13.8067555878076 -0.206598358823873 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 33777334 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000110429:ENST00000526785:exon_33777317_33777521:FBXO3;ENSG00000110429:ENST00000321458:exon_33777317_33777521:FBXO3;ENSG00000110429:ENST00000265651:exon_33777317_33777521:FBXO3;ENSG00000110429:ENST00000530013:exon_33777317_33777521:FBXO3;ENSG00000110429:ENST00000530401:exon_33777317_33777521:FBXO3;ENSG00000110429:ENST00000534136:exon_33777317_33777521:FBXO3;ENSG00000110429:ENST00000448981:exon_33777317_33777521:FBXO3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 49 16 65 22.9795760075933 8.4964649771124 14.4831110304809 T:C C T 10 0.531029061069525 0.000268594202567289 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 43940602 C/G 1 47 55 102 22.0416341297323 29.2065983588239 -7.16496422909155 C:G C G 10 0.531029061069525 0.165415793896072 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 65 56 121 30.4831110304809 29.7376274198934 0.745483610587478 T:G G T 10 0.531029061069525 0.927571865271945 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 186 142 328 87.2285946410684 75.4061266718725 11.8224679691958 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.203254522040662 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 45827350 A/G 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 46419411 G/A 1 25 27 52 11.7242734732619 14.3377846488772 -2.6135111756153 A:G G A 10 0.531029061069525 0.489760226625303 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000452566:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46417965_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000526545:exon_46418934_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46419000_46419493:AMBRA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 46701765 C/T 1 11 12 23 5.15868032823523 6.3723487328343 -1.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.678732618130644 ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000443332:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000528837:exon_46701755_46701832:ARHGAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 46784697 A/C 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 A:C A C 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526943:exon_46784696_46784729:CKAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 36 53 89 16.8829538014971 28.1445402366848 -11.2615864351877 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0191420717583596 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 47203983 G/A 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000165912:ENST00000298838:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000415232:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000532457:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000528462:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000530513:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000528201:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000531226:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000525725:exon_47203954_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000530405:exon_47203957_47204110:PACSIN3;ENSG00000165912:ENST00000524509:exon_47203957_47204110:PACSIN3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 47306585 G/A 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000110514:ENST00000342922:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395342:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395344:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395349:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402799:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000406482:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000349238:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000311027:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000407859:exon_47306492_47306616:MADD;ENSG00000110514:ENST00000418413:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000395336:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000402192:exon_47306492_47306745:MADD;ENSG00000110514:ENST00000524530:exon_47306497_47306616:MADD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 T:C T C 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 C:G G C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 58 70 128 27.2003144579676 37.1720342748667 -9.9717198168992 A:G A G 10 0.531029061069525 0.092057807376007 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57155001 G/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57154267_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57154288_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57154416_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57154916_57155006:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57154838_57155006:RP11-872D17.8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57155288 T/C 1 4 15 19 1.8758837557219 7.96543591604287 -6.08955216032097 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00543373679417547 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57155227_57155338:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57155227_57155338:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57155227_57155338:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57155227_57155338:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57155227_57155338:RP11-872D17.8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 31 20 51 14.5380991068447 10.6205812213905 3.91751788545423 A:G A G 10 0.531029061069525 0.326295507425925 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 57258731 C/T 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:C C T 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000149150:ENST00000278426:exon_57258697_57258835:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000528450:exon_57258697_57258835:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000534298:exon_57258697_57258835:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000529452:exon_57258726_57258835:SLC43A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 46 32 78 21.5726631908019 16.9929299542248 4.57973323657705 C:G C G 10 0.531029061069525 0.309633768602327 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 60609972 A/G 1 52 50 102 24.3864888243847 26.5514530534762 -2.16496422909155 A:G A G 10 0.531029061069525 0.692232028699691 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 50 58 108 23.4485469465238 30.7996855420324 -7.3511385955087 C:G G C 10 0.531029061069525 0.176966563097519 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 60705355 G/A 1 130 148 278 60.9662220609618 78.5923010382897 -17.6260789773279 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0354574312628553 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60705342_60705497:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60705342_60705497:SLC15A3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61099072 G/A 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000167986:ENST00000301764:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000450997:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000422969:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000440736:exon_61099015_61099163:DDB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61111346 C/G 1 20 18 38 9.3794187786095 9.55852309925145 -0.179104320641947 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61111328_61111437:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534370:exon_61111328_61111438:DAK;ENSG00000149476:ENST00000528061:exon_61111088_61111447:DAK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61165769 A/G 1 24 4 28 11.2553025343314 2.1241162442781 9.1311862900533 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000439688114532193 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61213555 C/T 1 89 72 161 41.7384135648123 38.2340923970058 3.50432116780648 T:C C T 10 0.531029061069525 0.635794150824532 ENSG00000167985:ENST00000301761:exon_61213413_61214225:SDHAF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61560081 G/A 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61560028_61560085:C11orf10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 4 14 18 1.8758837557219 7.43440685497335 -5.55852309925145 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0092810211291724 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 T:C C T 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 58 55 113 27.2003144579676 29.2065983588239 -2.00628390085632 A:C A C 10 0.531029061069525 0.707402889822543 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 25 33 58 11.7242734732619 17.5239590152943 -5.79968554203245 A:G A G 10 0.531029061069525 0.147719591350810 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 28 24 52 13.1311862900533 12.7446974656686 0.386488824384701 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 12 13 25 5.6276512671657 6.90337779390382 -1.27572652673812 T:C T C 10 0.531029061069525 0.690323279862282 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62384066 G/T 1 24 31 55 11.2553025343314 16.4619008931553 -5.20659835882387 T:G G T 10 0.531029061069525 0.177398609785283 ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62415143 G/A 1 35 60 95 16.4139828625666 31.8617436641715 -15.4477608016049 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00189082377867896 ENSG00000185085:ENST00000330574:exon_62414320_62417471:INTS5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 35 41 76 16.4139828625666 21.7721915038505 -5.3582086412839 T:C T C 10 0.531029061069525 0.250458827197880 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 142 162 304 66.5938733281275 86.0267078932631 -19.4328345651356 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.0288276180936288 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 62656054 C/G 1 401 345 746 188.05734651112 183.205026068986 4.85232044213438 C:G C G 10 0.531029061069525 0.741332404853732 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62655803_62656265:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62655803_62656352:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62656007_62656330:SLC3A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 25 21 46 11.7242734732619 11.15161028246 0.572663190801851 A:C C A 10 0.531029061069525 0.883815858666568 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 63594418 G/A 1 12 27 39 5.6276512671657 14.3377846488772 -8.71013338171147 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00594993788690006 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63594400_63595151:C11orf84 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64003467 C/G 1 66 66 132 30.9520819694114 35.0479180305886 -4.09583606117729 C:G C G 10 0.531029061069525 0.4864771843772 ENSG00000173511:ENST00000426086:exon_64003285_64003481:VEGFB;ENSG00000173511:ENST00000309422:exon_64003285_64003481:VEGFB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64088202 C/T 1 231 218 449 108.33228689294 115.764335313156 -7.4320484202167 T:C C T 10 0.531029061069525 0.508032535460156 ENSG00000126432:ENST00000265462:exon_64088133_64088264:PRDX5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64111336 C/T 1 22 20 42 10.3173606564705 10.6205812213905 -0.303220564920048 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111250_64111386:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111250_64111386:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111250_64111386:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111250_64111386:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111250_64111386:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111250_64111386:CCDC88B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64132904 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64132773_64132937:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000532885:exon_64132773_64132937:RPS6KA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 62 40 102 29.0761982136895 21.241162442781 7.83503577090845 T:C T C 10 0.531029061069525 0.136564669804158 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 19 10 29 8.91044783967903 5.31029061069525 3.60015722898378 A:G G A 10 0.531029061069525 0.197200860318155 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 71 58 129 33.2969366640637 30.7996855420324 2.49725112203128 C:G G C 10 0.531029061069525 0.724346255699389 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64627444 G/A 1 102 132 234 47.8350357709085 70.0958360611773 -22.2608002902688 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00388467901123619 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64627396_64627517:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64627098_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000455148:exon_64627417_64627808:EHD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 70 55 125 32.8279657251333 29.2065983588239 3.62136736630938 A:G A G 10 0.531029061069525 0.531703611923257 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 158 176 334 74.0974083510151 93.4611147482364 -19.3637063972213 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.0370914700129226 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64802388 A/C 1 6 14 20 2.81382563358285 7.43440685497335 -4.6205812213905 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0442922401162171 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802319_64802434:SNX15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 14 10 24 6.56559314502665 5.31029061069525 1.2553025343314 T:C C T 10 0.531029061069525 0.685265962050597 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 21 22 43 9.84838971753998 11.6826393435295 -1.83424962598957 T:C C T 10 0.531029061069525 0.647477448802669 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64854812 G/A 1 26 21 47 12.1932444121924 11.15161028246 1.04163412973233 A:G G A 10 0.531029061069525 0.772666376606373 ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854788_64854905:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854788_64854882:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854788_64854888:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 40 32 72 18.758837557219 16.9929299542248 1.7659076029942 T:C C T 10 0.531029061069525 0.723942889928092 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 64888955 A/G 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000149806:ENST00000531357:exon_64888106_64889589:FAU;ENSG00000149806:ENST00000529259:exon_64888169_64889116:FAU;ENSG00000149806:ENST00000434372:exon_64888755_64889116:FAU HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 26 24 50 12.1932444121924 12.7446974656686 -0.551453053476248 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888275640512622 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65172414 C/T 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 T:C C T 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65172335_65172539:FRMD8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 A:G A G 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 33 25 58 15.4760409847057 13.2757265267381 2.20031445796755 A:G G A 10 0.531029061069525 0.600453109286377 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 22 29 51 10.3173606564705 15.3998427710162 -5.08248211454577 A:G G A 10 0.531029061069525 0.162684141191458 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65380916 G/A 1 20 20 40 9.3794187786095 10.6205812213905 -1.241162442781 A:G G A 10 0.531029061069525 0.752444833741799 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65380489_65381713:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524856:exon_65380489_65382853:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000527304:exon_65376103_65381707:MAP3K11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65386206 C/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 C:G C G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65385411_65386538:PCNXL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65403666 C/T 1 31 37 68 14.5380991068447 19.6480752595724 -5.1099761527277 T:C C T 10 0.531029061069525 0.225998385599362 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403645_65403778:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403645_65403778:PCNXL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 25 29 54 11.7242734732619 15.3998427710162 -3.67556929775435 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.341577306573665 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 76 74 150 35.6417913587161 39.2961505191448 -3.65435916042874 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.56754649924903 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 A:C A C 10 0.531029061069525 0.155286387026531 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1399 1633 3032 656.090343563735 867.170456726534 -211.0801131628 A:T:C:G G A 10 0.531029061069525 1.70044542673018e-14 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65628334 G/A 1 20 14 34 9.3794187786095 7.43440685497335 1.94501192363615 A:G G A 10 0.531029061069525 0.607030139795934 ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 C:G G C 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 T:C C T 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 25 26 51 11.7242734732619 13.8067555878076 -2.08248211454577 A:G G A 10 0.531029061069525 0.577354633027695 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 30 48 78 14.0691281679143 25.4893949313372 -11.4202667634229 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0120943700658203 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65636053 T/C 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000172638:ENST00000531972:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526628:exon_65635981_65637393:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528176:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000307998:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000532084:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531005:exon_65635981_65636100:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000527969:exon_65635951_65636311:EFEMP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65684929 C/T 1 83 78 161 38.9245879312294 41.4202667634229 -2.49567883219352 T:C C T 10 0.531029061069525 0.69391974526095 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65685225 T/C 1 35 40 75 16.4139828625666 21.241162442781 -4.82717958021437 T:C T C 10 0.531029061069525 0.298020515810917 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 33 35 68 15.4760409847057 18.5860171374334 -3.1099761527277 A:G G A 10 0.531029061069525 0.467985914109814 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 67 50 117 31.4210529083418 26.5514530534762 4.86959985486558 T:C C T 10 0.531029061069525 0.40476631879884 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 14 19 33 6.56559314502665 10.089552160321 -3.52395901529432 T:C C T 10 0.531029061069525 0.22750273500789 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 125 87 212 58.6213673663094 46.1995283130487 12.4218390532607 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0984235131751678 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 66254137 C/A 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 A:C C A 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 23 26 49 10.7863315954009 13.8067555878076 -3.02042399240672 A:G A G 10 0.531029061069525 0.394668817409587 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 66288725 C/T 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 66299515 A/G 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66299422_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66299127_66301084:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66299422_66301098:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66299422_66299551:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66299127_66299676:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66299127_66299690:BBS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67164791 T/C 1 10 1 11 4.68970938930475 0.531029061069525 4.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0133926860261115 ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 13 18 31 6.09662220609618 9.55852309925145 -3.46190089315527 T:C C T 10 0.531029061069525 0.28009400014822 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67196049 G/A 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 70 74 144 32.8279657251333 39.2961505191448 -6.46818479401159 T:C C T 10 0.531029061069525 0.316374037729598 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 100 122 222 46.8970938930475 64.785545450482 -17.8884515574345 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0184111767161683 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67263767 A/G 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67263649_67263819:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67263649_67263816:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67263649_67264907:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67263649_67263819:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000526602:exon_67263649_67263910:PITPNM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 1707 1226 2933 800.533392754321 651.041628871238 149.491763883083 A:T:C:G A G 10 0.531029061069525 3.09235016306304e-08 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 67804074 C/T 1 231 245 476 108.33228689294 130.102119962034 -21.7698330690939 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.0482406399810076 ENSG00000110717:ENST00000313468:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000528492:exon_67803929_67804106:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000524810:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000531282:exon_67803929_67804111:NDUFS8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 41 68 109 19.2278084961495 36.1099761527277 -16.8821676565782 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00143563974805096 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 68193582 G/A 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 A:G G A 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68193446_68193655:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68193446_68193655:LRP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 68377475 A/G 1 27 21 48 12.6622153511228 11.15161028246 1.5106050686628 A:G A G 10 0.531029061069525 0.772764649755218 ENSG00000110075:ENST00000393800:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000534534:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000524845:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000265637:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000393799:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000524904:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000393801:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000265636:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000529710:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000527403:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000534190:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000526307:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000526593:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000525152:exon_68377243_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000530734:exon_68377419_68377491:PPP6R3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 68529027 A/G 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68529003_68529155:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68529003_68529155:CPT1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 68529090 G/C 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68529003_68529155:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68529003_68529155:CPT1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 30 34 64 14.0691281679143 18.0549880763638 -3.9858599084496 A:G A G 10 0.531029061069525 0.320049893988123 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 70279766 C/T 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 T:C C T 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 59 52 111 27.669285396898 27.6135111756153 0.0557742212827286 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 54 54 108 25.3244307022457 28.6755692977543 -3.35113859550869 A:G A G 10 0.531029061069525 0.563255611628033 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71152461 A/G 1 38 28 66 17.8208956793581 14.8688137099467 2.95208196941135 A:G A G 10 0.531029061069525 0.537859294556646 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71152406_71152486:DHCR7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71155153 A/G 1 15 12 27 7.03456408395713 6.3723487328343 0.662215351122826 A:G A G 10 0.531029061069525 0.849045079367674 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155039_71155165:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 11 12 23 5.15868032823523 6.3723487328343 -1.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.678732618130644 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 C:G G C 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71185479 T/C 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 T:C T C 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71185531 A/G 1 8 14 22 3.7517675114438 7.43440685497335 -3.68263934352955 A:G A G 10 0.531029061069525 0.136441945320730 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71208651 G/A 1 57 44 101 26.7313435190371 23.3652786870591 3.36606483197798 A:G G A 10 0.531029061069525 0.550139581489967 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530831:exon_71207481_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525593:exon_71208551_71208657:NADSYN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71507205 C/T 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000158483:ENST00000346333:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000526393:exon_71507063_71507986:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000426628:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000416039:exon_71507063_71507281:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000510443:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000359244:exon_71507063_71507212:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000528685:exon_71507063_71507354:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000393714:exon_71507063_71507354:FAM86C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71712898 G/T 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:G G T 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000137496:ENST00000393703:exon_71712830_71713573:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000393705:exon_71712830_71713573:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000337131:exon_71712830_71713573:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000343898:exon_71712830_71713850:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000404792:exon_71712830_71713572:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000534583:exon_71712830_71712994:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000260049:exon_71712830_71713572:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000393707:exon_71712830_71713573:IL18BP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 71949064 C/G 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 C:G C G 10 0.531029061069525 1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 41 27 68 19.2278084961495 14.3377846488772 4.8900238472723 C:G G C 10 0.531029061069525 0.274286047749019 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 73638359 A/T 1 49 55 104 22.9795760075933 29.2065983588239 -6.22702235123059 A:T A T 10 0.531029061069525 0.238854894184791 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73638330_73638779:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73638330_73638779:PAAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 109 75 184 51.1178323434218 39.8271795802144 11.2906527632074 A:G G A 10 0.531029061069525 0.104075009239502 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 77790653 T/C 1 206 163 369 96.6080134196779 86.5577369543326 10.0502764653453 T:C T C 10 0.531029061069525 0.297437809451070 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 78 44 122 36.5797332365771 23.3652786870591 13.214454549518 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0181109597972459 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 18 7 25 8.44147690074855 3.71720342748667 4.72427347326188 A:C A C 10 0.531029061069525 0.070868394864509 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 22 18 40 10.3173606564705 9.55852309925145 0.758837557219001 T:G G T 10 0.531029061069525 0.87484065053893 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 24 22 46 11.2553025343314 11.6826393435295 -0.427336809198149 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 28 16 44 13.1311862900533 8.4964649771124 4.6347213129409 T:C C T 10 0.531029061069525 0.176128671490261 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 23 21 44 10.7863315954009 11.15161028246 -0.365278687059099 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 93529655 G/A 1 13 14 27 6.09662220609618 7.43440685497335 -1.33778464887717 A:G G A 10 0.531029061069525 0.700905289249009 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525026:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93529576_93529706:MED17 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 18 15 33 8.44147690074855 7.96543591604287 0.476040984705676 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 86 83 169 40.3315007480209 44.0754120687706 -3.74391132074972 A:G A G 10 0.531029061069525 0.589898564575432 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G G A 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 190 153 343 89.1044783967903 81.2474463436373 7.85703205315293 A:G G A 10 0.531029061069525 0.417198857697723 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 102248377 C/T 1 27 32 59 12.6622153511228 16.9929299542248 -4.33071460310197 T:C C T 10 0.531029061069525 0.297012623684573 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102248227_102248422:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000531259:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102248227_102248481:BIRC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 25 9 34 11.7242734732619 4.77926154962572 6.94501192363615 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0240246143122599 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 104912221 T/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:T T A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000204397:ENST00000375706:exon_104912053_104912446:CARD16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 10 5 15 4.68970938930475 2.65514530534762 2.03456408395713 A:C A C 10 0.531029061069525 0.315767079054389 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 113679119 C/T 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113679020_113679159:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113679020_113679159:USP28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 116655600 G/A 1 37 36 73 17.3519247404276 19.1170461985029 -1.76512145807532 A:G G A 10 0.531029061069525 0.725553896371942 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 1 11 12 0.468970938930475 5.84131967176477 -5.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00215382062185747 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 117869591 C/T 1 14 6 20 6.56559314502665 3.18617436641715 3.3794187786095 T:C C T 10 0.531029061069525 0.178235221525341 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117869430_117869660:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 117869670 A/G 1 11 4 15 5.15868032823523 2.1241162442781 3.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.12904355932744 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 118074337 A/G 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118071189_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118074143_118076105:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118074143_118074380:AMICA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 34 51 85 15.9450119236362 27.0824821145458 -11.1374701909096 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0166931695243429 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 61 64 125 28.607227274759 33.9858599084496 -5.37863263369062 T:C C T 10 0.531029061069525 0.370305390778101 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 46 47 93 21.5726631908019 24.9583658702677 -3.38570267946582 T:C T C 10 0.531029061069525 0.533330523750079 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 13 14 27 6.09662220609618 7.43440685497335 -1.33778464887717 A:C C A 10 0.531029061069525 0.700905289249009 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 32 21 53 15.0070700457752 11.15161028246 3.85545976331518 A:G G A 10 0.531029061069525 0.335921355775253 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 121489563 G/A 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000528339:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534754:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000524633:exon_121489483_121489602:SORL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2749 3035 5784 1289.20111111988 1611.67320034601 -322.472089226133 A:T:G A G 10 0.531029061069525 2.26110221654771e-17 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 124506967 C/T 1 1 10 11 0.468970938930475 5.31029061069525 -4.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00419409086522907 ENSG00000110013:ENST00000263593:exon_124503009_124507098:SIAE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 140 83 223 65.6559314502665 44.0754120687706 21.5805193814959 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00385725567576802 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 124624150 G/A 1 32 27 59 15.0070700457752 14.3377846488772 0.669285396898028 A:G G A 10 0.531029061069525 0.896815600616257 ENSG00000149564:ENST00000442070:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000444566:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000435477:exon_124624141_124624236:ESAM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 125765528 G/A 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 A:G G A 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765119_125765684:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765119_125765684:PUS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 6 16 22 2.81382563358285 8.4964649771124 -5.68263934352955 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0179839291822002 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 126162607 G/A 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 33 42 75 15.4760409847057 22.30322056492 -6.82717958021437 T:C T C 10 0.531029061069525 0.132311595144181 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 126278075 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000110080:ENST00000227495:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000531217:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000444328:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000356132:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530591:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534083:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528605:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528858:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000392669:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526756:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526727:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000449406:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000532243:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534457:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530531:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000524860:exon_126277994_126278089:ST3GAL4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 14 18 32 6.56559314502665 9.55852309925145 -2.9929299542248 T:C T C 10 0.531029061069525 0.294896781552893 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C T C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 130784683 G/A 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 130784754 C/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 C:G C G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 T:C T C 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 993930 C/T 1 5 15 20 2.34485469465238 7.96543591604287 -5.6205812213905 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0132875954363033 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 994487 G/C 1 12 11 23 5.6276512671657 5.84131967176477 -0.213668404599074 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 1017197 C/T 1 40 43 83 18.758837557219 22.8342496259896 -4.07541206877057 T:C C T 10 0.531029061069525 0.38091846954385 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_1017013_1017200:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_1017013_1017200:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_1017013_1017200:WNK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 1702549 C/G 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 C:G C G 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 1755223 C/T 1 22 6 28 10.3173606564705 3.18617436641715 7.1311862900533 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00733758058028388 ENSG00000111186:ENST00000310594:exon_1754960_1756379:WNT5B;ENSG00000111186:ENST00000397196:exon_1754960_1756409:WNT5B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 1890199 G/A 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1890055_1890242:ADIPOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 1893077 C/A 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 A:C C A 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 43 34 77 20.1657503740104 18.0549880763638 2.11076229764658 A:G A G 10 0.531029061069525 0.649635576401052 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 2973495 A/G 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 2983636 A/G 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2983143_2983691:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2983143_2983691:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2983143_2983691:FOXM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 74 82 156 34.7038494808552 43.5443830077011 -8.8405335268459 C:G C G 10 0.531029061069525 0.172576005499095 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 18 5 23 8.44147690074855 2.65514530534762 5.78633159540093 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0198557006447477 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6500105 T/G 0 14 0 14 6.56559314502665 0 6.56559314502665 T T 10 0.531029061069525 0.000166684448996722 ENSG00000111321:ENST00000228918:exon_6499826_6500733:LTBR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 204 225 429 95.6700715418169 119.481538740643 -23.8114671988262 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0229090104455690 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6562285 C/T 1 24 35 59 11.2553025343314 18.5860171374334 -7.33071460310197 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0671839208797929 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6562293 C/T 1 25 30 55 11.7242734732619 15.9308718320857 -4.20659835882387 T:C C T 10 0.531029061069525 0.280980394332724 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 A:G A G 10 0.531029061069525 0.457534991859192 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 21 3 24 9.84838971753998 1.59308718320857 8.2553025343314 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000678796791366068 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 28 3 31 13.1311862900533 1.59308718320857 11.5380991068447 T:C C T 10 0.531029061069525 1.42616517580466e-05 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6562836 G/A 1 24 15 39 11.2553025343314 7.96543591604287 3.28986661828853 A:G G A 10 0.531029061069525 0.337160909631348 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 16 20 36 7.5035350228876 10.6205812213905 -3.1170461985029 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.319899751859219 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:G G T 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6619284 C/G 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 C:G C G 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6619241_6619299:NCAPD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 23 26 49 10.7863315954009 13.8067555878076 -3.02042399240672 A:C C A 10 0.531029061069525 0.394668817409587 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6637845 T/C 1 80 102 182 37.517675114438 54.1649642290915 -16.6472891146535 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0141855017122561 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6637845_6638022:NCAPD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 54 62 116 25.3244307022457 32.9238017863105 -7.5993710840649 T:C C T 10 0.531029061069525 0.163709483094076 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6639088 A/G 1 73 89 162 34.2348785419247 47.2615864351877 -13.026707893263 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0409438417115005 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 6787622 C/T 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000126746:ENST00000319770:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000361959:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396795:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000436774:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396799:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000417772:exon_6787293_6787626:ZNF384;ENSG00000126746:ENST00000396801:exon_6787293_6787626:ZNF384 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 7092665 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7092593_7092700:LPCAT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 A:G G A 10 0.531029061069525 0.825489956938963 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 42 53 95 19.69677943508 28.1445402366848 -8.44776080160487 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0995266621577222 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 76 87 163 35.6417913587161 46.1995283130487 -10.5577369543326 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0998527220846642 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 10525740 C/T 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 C C 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000213809:ENST00000240618:exon_10524953_10525830:KLRK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 10659584 C/T 0 533 0 533 249.961510449943 0 249.961510449943 C C 10 0.531029061069525 3.51883878864254e-147 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 25 20 45 11.7242734732619 10.6205812213905 1.10369225187138 T:G T G 10 0.531029061069525 0.767362753594117 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:G A G 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 25 28 53 11.7242734732619 14.8688137099467 -3.14454023668482 T:G T G 10 0.531029061069525 0.411114987295134 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 65 58 123 30.4831110304809 30.7996855420324 -0.316574511551572 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 38 43 81 17.8208956793581 22.8342496259896 -5.01335394663152 C:G G C 10 0.531029061069525 0.26806966590743 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 0 20 0 20 9.3794187786095 0 9.3794187786095 T T 10 0.531029061069525 3.44435126702128e-06 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 32135938 A/G 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 A:G A G 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 14 8 22 6.56559314502665 4.2482324885562 2.31736065647045 C:G C G 10 0.531029061069525 0.395246671022453 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 32138410 A/G 1 19 38 57 8.91044783967903 20.1791043206419 -11.2686564809629 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00323581144598563 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 40757330 A/G 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40757204_40757356:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40757204_40757356:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40757204_40757356:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40757204_40757356:LRRK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 A:T A T 10 0.531029061069525 0.316197821820389 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 47629926 C/T 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629880_47630155:FAM113B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 T:C C T 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 48526712 G/A 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 A:G G A 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48526651_48526840:PFKM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 15 27 42 7.03456408395713 14.3377846488772 -7.30322056492005 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0295583753405583 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 49666815 C/T 1 376 375 751 176.333073037859 199.135897901072 -22.8028248632133 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0998885042792486 ENSG00000167553:ENST00000321665:exon_49666447_49666853:TUBA1C;ENSG00000167553:ENST00000301072:exon_49666036_49667114:TUBA1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 49960551 C/A 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 50043687 A/G 1 26 16 42 12.1932444121924 8.4964649771124 3.69677943507995 A:G A G 10 0.531029061069525 0.281389688068275 ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50043474_50043708:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50043474_50043708:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50043474_50043708:FMNL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:C C A 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 50571069 G/A 1 44 50 94 20.6347213129409 26.5514530534762 -5.91673174053535 A:G G A 10 0.531029061069525 0.255558382358265 ENSG00000050405:ENST00000394943:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000341247:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000420992:exon_50569573_50571852:LIMA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 51213433 A/G 1 36 28 64 16.8829538014971 14.8688137099467 2.0141400915504 A:G A G 10 0.531029061069525 0.707439027541832 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51213418_51214907:ATF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 52450384 A/G 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 A A 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52450278_52450429:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52450278_52450429:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52450278_52450429:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52450278_52450429:NR4A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 52452606 C/T 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52452472_52453285:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52452472_52453285:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52452472_52453285:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52452472_52453291:NR4A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 52642430 C/T 1 36 25 61 16.8829538014971 13.2757265267381 3.60722727475898 T:C C T 10 0.531029061069525 0.372027575293289 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52642375_52642709:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52642375_52642709:KRT7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 23 31 54 10.7863315954009 16.4619008931553 -5.67556929775435 T:C T C 10 0.531029061069525 0.134361203593637 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 53680135 C/T 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.155286387026531 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 53681883 A/T 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 49 44 93 22.9795760075933 23.3652786870591 -0.385702679465822 T:C:G T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 32 33 65 15.0070700457752 17.5239590152943 -2.51688896951912 A:G A G 10 0.531029061069525 0.537276039959489 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 55368188 T/C 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 T:C T C 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 A:G G A 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 56117700 C/G 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000135437:ENST00000257895:exon_56117670_56117833:RDH5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 59 46 105 27.669285396898 24.4273368091981 3.24194858769988 T:C T C 10 0.531029061069525 0.558240758470477 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 56814656 A/G 1 14 6 20 6.56559314502665 3.18617436641715 3.3794187786095 A:G A G 10 0.531029061069525 0.178235221525341 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 10 14 24 4.68970938930475 7.43440685497335 -2.7446974656686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.308686848417513 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 56862886 T/C 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000176422:ENST00000338146:exon_56862823_56864763:SPRYD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 247 183 430 115.835821915827 97.1783181757231 18.6575037401043 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0738494275502438 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 32 33 65 15.0070700457752 17.5239590152943 -2.51688896951912 T:C C T 10 0.531029061069525 0.537276039959489 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 C:G C G 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 7 16 23 3.28279657251333 8.4964649771124 -5.21366840459907 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0358368209699659 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 32 30 62 15.0070700457752 15.9308718320857 -0.923801786310548 A:G A G 10 0.531029061069525 0.898886903964453 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 69136252 T/C 1 10 15 25 4.68970938930475 7.96543591604287 -3.27572652673812 T:C T C 10 0.531029061069525 0.230193716561202 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69136135_69136472:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69136135_69136472:NUP107 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 69233215 A/G 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:G A G 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69233054_69233629:MDM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 89 109 198 41.7384135648123 57.8821676565782 -16.1437540917659 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0226511399515932 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:C C A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 72013832 A/G 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 72018028 A/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G A G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72017884_72018072:ZFC3H1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 368 357 725 172.581305526415 189.57737480182 -16.9960692754056 A:G G A 10 0.531029061069525 0.206080043278638 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 82752543 T/G 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 T:G T G 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 82752559 T/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:G T G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 82792666 C/T 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 T:C C T 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 82792942 A/G 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 C:G G C 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 88505633 A/G 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88505471_88505635:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88505471_88505635:CEP290 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 T:G T G 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 94653394 C/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94653386_94653510:PLXNC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 103 122 225 48.3040067098389 64.785545450482 -16.4815387406431 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0323309555972212 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 100452027 T/C 1 3 12 15 1.40691281679143 6.3723487328343 -4.96543591604287 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0167315617211413 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 100550996 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000120853:ENST00000266746:exon_100550943_100551034:GOLGA2B;ENSG00000120853:ENST00000456437:exon_100550943_100551034:GOLGA2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 26 8 34 12.1932444121924 4.2482324885562 7.94501192363615 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00889835358447288 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 105151192 G/C 1 73 81 154 34.2348785419247 43.0133539466315 -8.77847540470685 C:G G C 10 0.531029061069525 0.169931505649351 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_105150727_105151883:CHST11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 15 13 28 7.03456408395713 6.90337779390382 0.131186290053301 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 108096769 G/C 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 C:G G C 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 108127965 A/G 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 A:G A G 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108126644_108128299:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108126644_108128299:PRDM4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 109042612 T/C 1 62 66 128 29.0761982136895 35.0479180305886 -5.9717198168992 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.329996386570841 ENSG00000110880:ENST00000420959:exon_109042381_109042626:CORO1C;ENSG00000110880:ENST00000261401:exon_109042381_109042626:CORO1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 110386611 G/A 1 30 23 53 14.0691281679143 12.2136684045991 1.85545976331518 A:G G A 10 0.531029061069525 0.680439777376759 ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110385871_110386651:GIT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 110474070 T/C 1 3 10 13 1.40691281679143 5.31029061069525 -3.90337779390382 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0477572109989804 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110474066_110474133:ANKRD13A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 29 18 47 13.6001572289838 9.55852309925145 4.04163412973233 T:G G T 10 0.531029061069525 0.246571094671566 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 61 71 132 28.607227274759 37.7030633359363 -9.09583606117729 A:G G A 10 0.531029061069525 0.117021408788142 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 6 13 19 2.81382563358285 6.90337779390382 -4.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0680604357891647 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 113348849 C/T 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 0.594097550650578 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 189 159 348 88.6355074578598 84.4336207100545 4.20188674780532 A:G G A 10 0.531029061069525 0.667686320917733 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 2 51 53 0.93794187786095 27.0824821145458 -26.1445402366848 A:G G A 10 0.531029061069525 9.50197534021974e-15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 113388530 G/A 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113388498_113388780:OAS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 113405785 C/T 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113405741_113405979:OAS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 54 36 90 25.3244307022457 19.1170461985029 6.20738450374276 C:G C G 10 0.531029061069525 0.205725098257544 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 12 13 25 5.6276512671657 6.90337779390382 -1.27572652673812 T:C C T 10 0.531029061069525 0.690323279862282 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 C:G G C 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 117160873 G/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:G G T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000111412:ENST00000261318:exon_117160872_117161028:C12orf49 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 117290433 G/A 1 27 26 53 12.6622153511228 13.8067555878076 -1.14454023668482 A:G G A 10 0.531029061069525 0.784266813913472 ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117290143_117291434:RNFT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 117476896 C/A 1 36 59 95 16.8829538014971 31.330714603102 -14.4477608016049 A:C C A 10 0.531029061069525 0.00377202904447238 ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117476728_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117476729_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117476729_117477015:TESC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 117584066 G/A 1 12 4 16 5.6276512671657 2.1241162442781 3.5035350228876 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0858135209465032 ENSG00000135108:ENST00000330622:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000427718:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000257563:exon_117581586_117584082:FBXO21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 120635244 C/T 1 1082 1740 2822 507.426555922774 923.990566260973 -416.564010338199 T:C C T 10 0.531029061069525 9.42964420262453e-56 ENSG00000089157:ENST00000313104:exon_120635125_120635265:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000228306:exon_120635125_120635265:RPLP0;ENSG00000089157:ENST00000392514:exon_120635125_120635265:RPLP0 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 28 3 31 13.1311862900533 1.59308718320857 11.5380991068447 A:C C A 10 0.531029061069525 1.42616517580466e-05 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 11 3 14 5.15868032823523 1.59308718320857 3.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0639863671812761 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 44 31 75 20.6347213129409 16.4619008931553 4.17282041978563 A:G G A 10 0.531029061069525 0.356327313562627 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 56 59 115 26.2623725801066 31.330714603102 -5.06834202299537 C:G G C 10 0.531029061069525 0.351594783215114 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121221518 C/T 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121221477_121221555:AC069214.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 A:T T A 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121747624 T/C 1 167 149 316 78.3181468013893 79.1233300993592 -0.80518329796989 T:C T C 10 0.531029061069525 0.955071910872262 ENSG00000089053:ENST00000261819:exon_121747504_121747666:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000441917:exon_121747504_121747666:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000344395:exon_121747504_121747666:ANAPC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121758206 A/T 1 37 56 93 17.3519247404276 29.7376274198934 -12.3857026794658 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0122702813911512 ENSG00000089053:ENST00000261819:exon_121758188_121758262:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000441917:exon_121758188_121758262:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000344395:exon_121758188_121758262:ANAPC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 25 38 63 11.7242734732619 20.1791043206419 -8.45483084738007 T:C C T 10 0.531029061069525 0.042565602839436 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 38 41 79 17.8208956793581 21.7721915038505 -3.95129582449247 A:G G A 10 0.531029061069525 0.430254583474097 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 26 15 41 12.1932444121924 7.96543591604287 4.22780849614948 A:G G A 10 0.531029061069525 0.211968071259909 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 154 129 283 72.2215245952932 68.5027488779687 3.71877571732443 T:C C T 10 0.531029061069525 0.677025256680969 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122217559 C/T 1 146 128 274 68.4697570838494 67.9717198168992 0.498037266950163 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122213515_122219974:TMEM120B;ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122215662_122217568:RHOF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122231573 C/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122231402_122231594:RHOF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122618290 C/T 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C C T 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122723139 G/T 1 10 17 27 4.68970938930475 9.02749403818192 -4.33778464887717 T:G G T 10 0.531029061069525 0.122001633726372 ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122723134_122723271:VPS33A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 15 6 21 7.03456408395713 3.18617436641715 3.84838971753998 C:G G C 10 0.531029061069525 0.124798609888677 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 18 19 37 8.44147690074855 10.089552160321 -1.64807525957242 T:C C T 10 0.531029061069525 0.623751217534118 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123463812 C/T 1 16 10 26 7.5035350228876 5.31029061069525 2.19324441219235 T:C C T 10 0.531029061069525 0.436352332176201 ENSG00000111325:ENST00000406539:exon_123463630_123463996:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000397389:exon_123463630_123464588:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000228922:exon_123463630_123463996:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000454694:exon_123463630_123463996:OGFOD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123741333 C/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 14 7 21 6.56559314502665 3.71720342748667 2.84838971753998 T:C T C 10 0.531029061069525 0.275352070578657 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 15 14 29 7.03456408395713 7.43440685497335 -0.399842771016225 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 123950471 G/A 1 127 81 208 59.5593092441703 43.0133539466315 16.5459552975388 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0218830217327415 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 24 31 55 11.2553025343314 16.4619008931553 -5.20659835882387 A:G A G 10 0.531029061069525 0.177398609785283 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 46 67 113 21.5726631908019 35.5789470916582 -14.0062839008563 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0106079179788281 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124422163 G/A 1 24 8 32 11.2553025343314 4.2482324885562 7.0070700457752 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0131138616862746 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124420983_124422377:CCDC92 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124817806 T/G 1 8 22 30 3.7517675114438 11.6826393435295 -7.93087183208575 T:G T G 10 0.531029061069525 0.00517480891410796 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124817676_124817825:NCOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124821666 G/A 1 38 29 67 17.8208956793581 15.3998427710162 2.42105290834183 A:G G A 10 0.531029061069525 0.624851568410142 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 29 50 79 13.6001572289838 26.5514530534762 -12.9512958244925 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00452700745865492 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124826598 T/C 1 20 20 40 9.3794187786095 10.6205812213905 -1.241162442781 T:C T C 10 0.531029061069525 0.752444833741799 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:T T A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1919 2068 3987 899.955231807582 1098.16809829178 -198.212866484196 A:T:C:G G C 10 0.531029061069525 3.54801446373965e-10 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 12 12 24 5.6276512671657 6.3723487328343 -0.744697465668599 A:G G A 10 0.531029061069525 0.839153121959338 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 T:C C T 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 34 28 62 15.9450119236362 14.8688137099467 1.07619821368945 T:C C T 10 0.531029061069525 0.800660615106556 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 132209985 C/A 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:C C A 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132209950_132210175:SFSWAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 132284043 A/G 1 30 35 65 14.0691281679143 18.5860171374334 -4.51688896951912 A:G A G 10 0.531029061069525 0.266389260165018 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 132426147 G/A 1 70 91 161 32.8279657251333 48.3236445573268 -15.4956788321935 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0175667531953036 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132425837_132426528:PUS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 15 6 21 7.03456408395713 3.18617436641715 3.84838971753998 T:C T C 10 0.531029061069525 0.124798609888677 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 70 69 139 32.8279657251333 36.6410052137972 -3.81303948866397 T:C C T 10 0.531029061069525 0.552222568049828 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 5 15 20 2.34485469465238 7.96543591604287 -5.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0132875954363033 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133393296 G/T 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 T:G G T 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133732624 C/T 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000090612:ENST00000248211:exon_133732089_133736047:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000426665:exon_133732089_133733554:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000402932:exon_133732533_133733497:ZNF268 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 77 67 144 36.1107622976466 35.5789470916582 0.531815205988408 A:T T A 10 0.531029061069525 0.933725564141079 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 20398669 T/C 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20397622_20399375:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20397624_20399375:ZMYM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 384 5 389 180.084840549302 2.65514530534762 177.429695243955 A:T:C:G T C 10 0.531029061069525 4.86070442749604e-97 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 128 152 280 60.0282801831008 80.7164172825678 -20.688137099467 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.0140265875485733 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 123 79 202 57.6834254884484 41.9512958244925 15.732129663956 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0287092206284782 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 87 68 155 40.8004716869513 36.1099761527277 4.69049553422363 T:G G T 10 0.531029061069525 0.469642443134728 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 49 36 85 22.9795760075933 19.1170461985029 3.86252980909038 C:G C G 10 0.531029061069525 0.447293366505411 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 30 47 77 14.0691281679143 24.9583658702677 -10.8892377023534 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0159851467960352 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 T:C T C 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 41 39 80 19.2278084961495 20.7101333817115 -1.482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.738557439829844 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 247 184 431 115.835821915827 97.7093472367926 18.1264746790347 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0823933801144964 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 31231806 T/C 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 19 24 43 8.91044783967903 12.7446974656686 -3.83424962598957 A:G G A 10 0.531029061069525 0.285175097746435 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 32972884 A/G 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 9 16 25 4.22073845037428 8.4964649771124 -4.27572652673812 A:G G A 10 0.531029061069525 0.108422944068912 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 49 42 91 22.9795760075933 22.30322056492 0.676355442673227 A:G G A 10 0.531029061069525 0.916655943024268 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 41827092 A/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:T A T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000480434:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41827085_41827166:MTRF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 41835039 T/C 1 3 13 16 1.40691281679143 6.90337779390382 -5.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00974495579100687 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 43462352 T/C 1 127 74 201 59.5593092441703 39.2961505191448 20.2631587250255 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0045939957631119 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 43528125 T/C 1 12 17 29 5.6276512671657 9.02749403818192 -3.39984277101622 T:C T C 10 0.531029061069525 0.264194510317464 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43528084_43528157:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43528084_43528157:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43528084_43528157:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000476830:exon_43528084_43528157:EPSTI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 17 15 32 7.97250596181808 7.96543591604287 0.00707004577520109 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 43643126 A/C 1 26 33 59 12.1932444121924 17.5239590152943 -5.33071460310197 A:C A C 10 0.531029061069525 0.192018750709929 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43643066_43643139:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43643066_43643139:DNAJC15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 48 0 48 22.5106050686628 0 22.5106050686628 G G 10 0.531029061069525 7.30071007550368e-14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 46708291 T/C 1 201 211 412 94.2631587250255 112.04713188567 -17.7839731606443 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0839943604627443 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46708262_46708385:LCP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50050620 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50050612_50051175:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50050612_50051175:SETDB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 A:G A G 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 26 17 43 12.1932444121924 9.02749403818192 3.16575037401043 A:G A G 10 0.531029061069525 0.362268191208422 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 233 176 409 109.270228770801 93.4611147482364 15.8091140225643 A:G G A 10 0.531029061069525 0.124550914055528 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50123622 G/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 C:G G C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50123594_50123784:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50123594_50123784:RCBTB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 5 23 28 2.34485469465238 12.2136684045991 -9.8688137099467 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000189281054406056 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 52343391 C/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52343292_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52342131_52343429:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000469957:exon_52343292_52343429:DHRS12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 52602919 A/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:C A C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:C C T 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 53216666 G/A 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:G G A 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000139675:ENST00000398039:exon_53216541_53217919:HNRNPA1L2;ENSG00000139675:ENST00000342657:exon_53216541_53217919:HNRNPA1L2;ENSG00000139675:ENST00000357495:exon_53216568_53217915:HNRNPA1L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 73320856 A/G 1 33 21 54 15.4760409847057 11.15161028246 4.32443070224565 A:G A G 10 0.531029061069525 0.275913999308995 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73320639_73321249:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73320639_73321249:C13orf34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 26 20 46 12.1932444121924 10.6205812213905 1.57266319080185 A:G G A 10 0.531029061069525 0.660976740627122 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 20 7 27 9.3794187786095 3.71720342748667 5.66221535112283 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0333315110955642 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 17 13 30 7.97250596181808 6.90337779390382 1.06912816791425 C:G G C 10 0.531029061069525 0.718926652870465 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 14 14 28 6.56559314502665 7.43440685497335 -0.8688137099467 A:G G A 10 0.531029061069525 0.850365293767878 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 76378459 T/C 1 6 12 18 2.81382563358285 6.3723487328343 -3.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.102920868968033 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000533305:exon_76378425_76378471:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000534657:exon_76378425_76378499:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000497947:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526371:exon_76378310_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526528:exon_76378314_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000489941:exon_76378363_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525373:exon_76378366_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76378456_76378677:LMO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 76427347 C/A 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 A:C C A 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 76427403 G/A 1 14 4 18 6.56559314502665 2.1241162442781 4.44147690074855 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0558087683526188 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 76427410 C/G 1 13 5 18 6.09662220609618 2.65514530534762 3.44147690074855 C:G C G 10 0.531029061069525 0.154818420661043 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 20 28 48 9.3794187786095 14.8688137099467 -5.4893949313372 A:G A G 10 0.531029061069525 0.147355080619299 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 98645253 A/G 1 15 9 24 7.03456408395713 4.77926154962572 2.2553025343314 A:G A G 10 0.531029061069525 0.416713456894239 ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98645146_98645268:IPO5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 99105389 A/C 1 51 78 129 23.9175178854542 41.4202667634229 -17.5027488779687 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0025689028505035 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 81 50 131 37.9866460533685 26.5514530534762 11.4351929998922 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0537137970290793 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 99907341 G/A 1 14 16 30 6.56559314502665 8.4964649771124 -1.93087183208575 A:G G A 10 0.531029061069525 0.583962242482046 ENSG00000125245:ENST00000397470:exon_99906968_99908160:GPR18;ENSG00000125245:ENST00000397473:exon_99906968_99908160:GPR18;ENSG00000125245:ENST00000340807:exon_99906986_99908160:GPR18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 127 286 413 59.5593092441703 151.874311465884 -92.3150022217138 A:C C A 10 0.531029061069525 6.9401362510651e-20 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 118 112 230 55.3385707937961 59.4752548397868 -4.13668404599075 C:G G C 10 0.531029061069525 0.597589215733127 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 108861913 A/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 36 13 49 16.8829538014971 6.90337779390382 9.97957600759328 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00406206352158008 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 50 91 141 23.4485469465238 48.3236445573268 -24.875097610803 T:G T G 10 0.531029061069525 3.03171534038779e-05 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 31 25 56 14.5380991068447 13.2757265267381 1.2623725801066 A:G A G 10 0.531029061069525 0.789682939685218 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 T:C T C 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 111938511 T/C 1 11 15 26 5.15868032823523 7.96543591604287 -2.80675558780765 T:C T C 10 0.531029061069525 0.32706034167233 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000478679:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491688:exon_111938494_111938583:ARHGEF7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 12 3 15 5.6276512671657 1.59308718320857 4.03456408395713 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0403292064008527 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 16 4 20 7.5035350228876 2.1241162442781 5.3794187786095 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0226582543291755 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 196 213 409 91.9183040303731 113.109190007809 -21.1908859774357 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0374214680461174 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 20823052 G/A 1 28 16 44 13.1311862900533 8.4964649771124 4.6347213129409 A:G G A 10 0.531029061069525 0.176128671490261 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 42 29 71 19.69677943508 15.3998427710162 4.29693666406373 T:C T C 10 0.531029061069525 0.342216404610972 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 14 23 37 6.56559314502665 12.2136684045991 -5.64807525957242 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0704727836063179 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 21162053 T/G 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:G T G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 22961854 A/G 1 4 12 16 1.8758837557219 6.3723487328343 -4.4964649771124 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0415470826185352 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 248 208 456 116.304792854758 110.454044702461 5.85074815229662 T:C T C 10 0.531029061069525 0.605870149535232 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 170 176 346 79.7250596181808 93.4611147482364 -13.7360551300556 T:C C T 10 0.531029061069525 0.145895964236321 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 377 383 760 176.802043976789 203.384130389628 -26.582086412839 T:G G T 10 0.531029061069525 0.054119098079399 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 437 439 876 204.940300312618 233.121757809521 -28.1814574969039 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0579953916844592 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23282449 C/T 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23299286 T/C 1 76 71 147 35.6417913587161 37.7030633359363 -2.06127197722017 T:C T C 10 0.531029061069525 0.74167505244666 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299259_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299262_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 23302585 T/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:T T A 10 0.531029061069525 1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 A:G A G 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 23 11 34 10.7863315954009 5.84131967176477 4.94501192363615 A:G G A 10 0.531029061069525 0.120787344314522 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 T:C C T 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 406 487 893 190.402201205773 258.611152740859 -68.2089515350858 T:C T C 10 0.531029061069525 4.97040065342497e-06 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 18 17 35 8.44147690074855 9.02749403818192 -0.586017137433373 T:C T C 10 0.531029061069525 0.866923667506405 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 24 24 48 11.2553025343314 12.7446974656686 -1.4893949313372 C:G G C 10 0.531029061069525 0.667848959221384 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 9 17 26 4.22073845037428 9.02749403818192 -4.80675558780765 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0757988827772547 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 15 14 29 7.03456408395713 7.43440685497335 -0.399842771016225 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 33 21 54 15.4760409847057 11.15161028246 4.32443070224565 T:C C T 10 0.531029061069525 0.275913999308995 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 13 14 27 6.09662220609618 7.43440685497335 -1.33778464887717 A:T A T 10 0.531029061069525 0.700905289249009 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 31583512 C/T 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583492_31583546:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583492_31583546:HECTD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 53 47 100 24.8554597633152 24.9583658702677 -0.102906106952496 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35546373 T/C 1 15 14 29 7.03456408395713 7.43440685497335 -0.399842771016225 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000151327:ENST00000396472:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000382406:exon_35546356_35546422:FAM177A1;ENSG00000151327:ENST00000280987:exon_35546356_35546422:FAM177A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 9 18 27 4.22073845037428 9.55852309925145 -5.33778464887717 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0522798045219031 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35761640 T/G 1 23 12 35 10.7863315954009 6.3723487328343 4.41398286256663 T:G T G 10 0.531029061069525 0.174846173121857 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 58 44 102 27.2003144579676 23.3652786870591 3.83503577090845 C:G C G 10 0.531029061069525 0.487900360811525 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35782253 A/G 1 165 148 313 77.3802049235284 78.5923010382897 -1.21209611476131 A:G A G 10 0.531029061069525 0.909881736529068 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35782087_35782265:PSMA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35783656 A/G 1 235 345 580 110.208170648662 183.205026068986 -72.9968554203245 A:G A G 10 0.531029061069525 1.35101492813624e-09 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35783567_35783661:PSMA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 913 1157 2070 428.170467243524 614.40062365744 -186.230156413917 A:T:G G A 10 0.531029061069525 2.60122460613396e-16 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 39685339 C/T 0 22 0 22 10.3173606564705 0 10.3173606564705 C C 10 0.531029061069525 9.54846017868322e-07 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 45711594 T/C 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 50074241 A/G 1 9 21 30 4.22073845037428 11.15161028246 -6.93087183208575 A:G A G 10 0.531029061069525 0.015976695293008 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 50074502 A/G 1 50 37 87 23.4485469465238 19.6480752595724 3.80047168695133 A:G A G 10 0.531029061069525 0.452807833913259 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 50099989 T/C 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 50472405 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000214900:ENST00000399206:exon_50472312_50474238:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000530176:exon_50472082_50474238:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000528300:exon_50472312_50474238:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000529902:exon_50469467_50473237:C14orf182;ENSG00000214900:ENST00000439658:exon_50472312_50474238:C14orf182 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 50582566 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000100483:ENST00000395859:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000358490:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000491402:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000395860:exon_50582557_50582629:C14orf138;ENSG00000100483:ENST00000484763:exon_50582557_50582629:C14orf138 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 50626553 C/T 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:C C T 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50626149_50626804:SOS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 51224289 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:G T G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 53529669 A/T 1 20 20 40 9.3794187786095 10.6205812213905 -1.241162442781 A:T A T 10 0.531029061069525 0.752444833741799 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53529661_53529923:DDHD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 53619544 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53618979_53620000:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53618979_53619922:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53618979_53619816:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53619424_53619816:DDHD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 55529860 A/G 1 38 49 87 17.8208956793581 26.0204239924067 -8.19952831304867 A:G A G 10 0.531029061069525 0.085728919413729 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55529336_55530043:MAPK1IP1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 27 38 65 12.6622153511228 20.1791043206419 -7.51688896951912 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0634025239742041 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 55636259 G/A 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55636117_55636277:DLGAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 55643857 T/G 1 17 11 28 7.97250596181808 5.84131967176477 2.1311862900533 T:G T G 10 0.531029061069525 0.454407413349679 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 23 11 34 10.7863315954009 5.84131967176477 4.94501192363615 A:G A G 10 0.531029061069525 0.120787344314522 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 18 21 39 8.44147690074855 11.15161028246 -2.71013338171147 T:C C T 10 0.531029061069525 0.424476923797125 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 57876265 G/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000139977:ENST00000298406:exon_57876097_57879466:NAA30;ENSG00000139977:ENST00000395257:exon_57876097_57879466:NAA30 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 17 13 30 7.97250596181808 6.90337779390382 1.06912816791425 A:G A G 10 0.531029061069525 0.718926652870465 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 19 12 31 8.91044783967903 6.3723487328343 2.53809910684473 T:C C T 10 0.531029061069525 0.375722831482458 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60581935 C/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 3 10 13 1.40691281679143 5.31029061069525 -3.90337779390382 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0477572109989804 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60585226 C/T 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 T:C T C 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 97 26 123 45.4901810762561 13.8067555878076 31.6834254884484 T:C:G C T 10 0.531029061069525 3.64097520890698e-09 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 60622705 C/T 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 64520020 A/G 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 65009220 C/T 1 12 4 16 5.6276512671657 2.1241162442781 3.5035350228876 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0858135209465032 ENSG00000126803:ENST00000394709:exon_65007563_65009955:HSPA2;ENSG00000126803:ENST00000247207:exon_65007460_65009950:HSPA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 66028446 A/G 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66028055_66028484:FUT8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 31 49 80 14.5380991068447 26.0204239924067 -11.482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0132225758318356 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 73404752 G/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73404679_73404778:DCAF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 73422259 C/G 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73422231_73422404:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73422231_73422404:DCAF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 73459917 C/T 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73459851_73460065:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73459851_73460065:ZFYVE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 73581011 A/G 1 111 88 199 52.0557742212827 46.7305573741182 5.32521684716453 A:G A G 10 0.531029061069525 0.477817187250047 ENSG00000119707:ENST00000261973:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527432:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532683:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000528081:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532483:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527449:exon_73580994_73581041:RBM25 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 74062370 G/A 1 9 9 18 4.22073845037428 4.77926154962572 -0.558523099251449 A:G G A 10 0.531029061069525 0.817439085135691 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 16 19 35 7.5035350228876 10.089552160321 -2.58601713743337 T:C T C 10 0.531029061069525 0.401522469972212 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 26 26 52 12.1932444121924 13.8067555878076 -1.6135111756153 A:G G A 10 0.531029061069525 0.678691595707079 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 A:T T A 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 15 7 22 7.03456408395713 3.71720342748667 3.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.200508636918786 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 17 11 28 7.97250596181808 5.84131967176477 2.1311862900533 T:C C T 10 0.531029061069525 0.454407413349679 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 11 19 30 5.15868032823523 10.089552160321 -4.93087183208575 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0981547449978678 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 75573228 T/C 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75573205_75573405:NEK9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C T C 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 162 138 300 75.9732921067369 73.2820104275944 2.69128167914251 A:C C A 10 0.531029061069525 0.77262873889127 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 23 37 60 10.7863315954009 19.6480752595724 -8.8617436641715 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0271643452150233 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 78217698 A/G 1 24 21 45 11.2553025343314 11.15161028246 0.103692251871376 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78217662_78217823:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78217662_78217823:SNW1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 91636395 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133943:ENST00000521334:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518871:exon_91636347_91636416:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522170:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519950:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523894:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521064:exon_91636347_91636466:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91636347_91636530:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91636347_91636545:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91636385_91636545:C14orf159 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 91642395 G/A 1 18 6 24 8.44147690074855 3.18617436641715 5.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0394591007645588 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519994:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91642278_91642400:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520130:exon_91642093_91642400:C14orf159 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 10 3 13 4.68970938930475 1.59308718320857 3.09662220609618 A:G A G 10 0.531029061069525 0.100357328720842 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 27 33 60 12.6622153511228 17.5239590152943 -4.8617436641715 A:G G A 10 0.531029061069525 0.244365299674055 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 7 20 27 3.28279657251333 10.6205812213905 -7.33778464887717 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00600104013226446 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 9 16 25 4.22073845037428 8.4964649771124 -4.27572652673812 A:G G A 10 0.531029061069525 0.108422944068912 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 12 14 26 5.6276512671657 7.43440685497335 -1.80675558780765 T:C T C 10 0.531029061069525 0.557227256665403 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 94582821 C/T 1 3 20 23 1.40691281679143 10.6205812213905 -9.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 8.99706519404229e-05 ENSG00000165949:ENST00000448882:exon_94582779_94583033:IFI27;ENSG00000165949:ENST00000444961:exon_94582779_94583033:IFI27;ENSG00000165949:ENST00000298902:exon_94582779_94583033:IFI27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 14 7 21 6.56559314502665 3.71720342748667 2.84838971753998 A:C C A 10 0.531029061069525 0.275352070578657 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 100759277 C/T 1 12 3 15 5.6276512671657 1.59308718320857 4.03456408395713 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0403292064008527 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 138 84 222 64.7179895724056 44.6064411298401 20.1115484425655 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00707503843950751 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102508056 C/A 1 14 16 30 6.56559314502665 8.4964649771124 -1.93087183208575 A:C C A 10 0.531029061069525 0.583962242482046 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 308 318 626 144.443049190586 168.867241420109 -24.4241922295226 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0545020047813027 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102675350 G/C 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102807671 C/T 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102808273 C/A 1 16 19 35 7.5035350228876 10.089552160321 -2.58601713743337 A:C C A 10 0.531029061069525 0.401522469972212 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 22 22 44 10.3173606564705 11.6826393435295 -1.3652786870591 T:C C T 10 0.531029061069525 0.763096727002207 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 102814945 G/A 1 144 120 264 67.5318152059884 63.723487328343 3.80832787764541 A:G G A 10 0.531029061069525 0.66618985661346 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 103593950 C/G 1 18 14 32 8.44147690074855 7.43440685497335 1.0070700457752 C:G C G 10 0.531029061069525 0.859782086036622 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 20 13 33 9.3794187786095 6.90337779390382 2.47604098470568 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486056052297342 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 113 61 174 52.9937160991437 32.392772725241 20.6009433739027 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0017869686777369 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105180706 A/C,G 0 0 13 13 0 6.90337779390382 -6.90337779390382 C:G A C 10 0.531029061069525 5.30758681941025e-05 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105180785 C/T 1 23 33 56 10.7863315954009 17.5239590152943 -6.7376274198934 T:C C T 10 0.531029061069525 0.081585191300911 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 31 38 69 14.5380991068447 20.1791043206419 -5.64100521379722 T:C C T 10 0.531029061069525 0.185697314577702 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 24 32 56 11.2553025343314 16.9929299542248 -5.7376274198934 T:C C T 10 0.531029061069525 0.141031719992449 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105477507 G/A 1 61 57 118 28.607227274759 30.2686564809629 -1.66142920620395 A:G G A 10 0.531029061069525 0.782485230917825 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 65 62 127 30.4831110304809 32.9238017863105 -2.44069075582967 T:C T C 10 0.531029061069525 0.722274673510737 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105477990 C/T 1 39 41 80 18.2898666182885 21.7721915038505 -3.482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.435930073490224 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 29 25 54 13.6001572289838 13.2757265267381 0.324430702245651 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105860943 G/A 1 18 11 29 8.44147690074855 5.84131967176477 2.60015722898378 A:G G A 10 0.531029061069525 0.358335015951210 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105860891_105861542:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105860891_105864484:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105860891_105864484:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105860891_105861542:PACS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 105954705 C/T 1 369 351 720 173.050276465345 186.391200435403 -13.340923970058 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.331658831748064 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954668_105954725:C14orf80 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 C:G C G 10 0.531029061069525 0.809007193926637 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 106330067 C/G 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 C C 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 106733593 G/T 0 0 9 9 0 4.77926154962572 -4.77926154962572 A G A 10 0.531029061069525 0.00109726968724073 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 107013129 A/C 1 1 26 27 0.468970938930475 13.8067555878076 -13.3377846488772 A:C A C 10 0.531029061069525 7.95724879737036e-08 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 107035142 G/A 1 224 2 226 105.049490320426 1.06205812213905 103.987432198287 A:G G A 10 0.531029061069525 2.0550075667909e-58 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 4 40 44 1.8758837557219 21.241162442781 -19.3652786870591 T:C T C 10 0.531029061069525 1.45160253545235e-09 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 0 44 0 44 20.6347213129409 0 20.6347213129409 C C 10 0.531029061069525 9.76280860231006e-13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 14 107170398 C/T 1 1 15 16 0.468970938930475 7.96543591604287 -7.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.000144639683667396 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 22863001 A/G 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 A:G A G 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22862935_22863123:TUBGCP5;ENSG00000153575:ENST00000453949:exon_22862935_22863123:TUBGCP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 18 7 25 8.44147690074855 3.71720342748667 4.72427347326188 A:G G A 10 0.531029061069525 0.070868394864509 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 17 18 35 7.97250596181808 9.55852309925145 -1.58601713743337 T:C C T 10 0.531029061069525 0.615023862763492 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 31197564 G/A 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31196715_31198100:FAN1;ENSG00000198690:ENST00000441675:exon_31196715_31198100:FAN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 32921843 A/G 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32921796_32921963:ARHGAP11A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 32929908 C/T 1 22 18 40 10.3173606564705 9.55852309925145 0.758837557219001 T:C C T 10 0.531029061069525 0.87484065053893 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:G G A 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 35273620 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 10 17 27 4.68970938930475 9.02749403818192 -4.33778464887717 A:G G A 10 0.531029061069525 0.122001633726372 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 40705225 C/T 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000128928:ENST00000249760:exon_40705190_40705286:IVD;ENSG00000128928:ENST00000479013:exon_40705190_40705286:IVD;ENSG00000128928:ENST00000487418:exon_40705190_40705286:IVD;ENSG00000128928:ENST00000473112:exon_40705190_40705286:IVD;ENSG00000128928:ENST00000484250:exon_40705190_40705377:IVD;ENSG00000128928:ENST00000466756:exon_40705190_40705286:IVD;ENSG00000128928:ENST00000497252:exon_40705190_40705286:IVD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41099819 C/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41099274_41100066:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41099313_41100066:ZFYVE19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41146880 T/C 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:C T C 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146837_41146887:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146837_41146887:SPINT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41148199 C/T 1 9 9 18 4.22073845037428 4.77926154962572 -0.558523099251449 T:C C T 10 0.531029061069525 0.817439085135691 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 17 14 31 7.97250596181808 7.43440685497335 0.538099106844726 C:G G C 10 0.531029061069525 0.859723747240846 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 29 16 45 13.6001572289838 8.4964649771124 5.10369225187138 A:G A G 10 0.531029061069525 0.137253846795144 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 27 16 43 12.6622153511228 8.4964649771124 4.16575037401043 A:C C A 10 0.531029061069525 0.223785297537490 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 15 20 35 7.03456408395713 10.6205812213905 -3.58601713743337 T:C C T 10 0.531029061069525 0.239605358947035 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41819367 T/C 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819365_41819499:RPAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 18 20 38 8.44147690074855 10.6205812213905 -2.17910432064195 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51804053336918 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 6 13 19 2.81382563358285 6.90337779390382 -4.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0680604357891647 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 21 16 37 9.84838971753998 8.4964649771124 1.35192474042758 A:T A T 10 0.531029061069525 0.742763651093692 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 43724646 T/G 1 15 10 25 7.03456408395713 5.31029061069525 1.72427347326188 T:G T G 10 0.531029061069525 0.551537499339693 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43724392_43724875:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43724392_43724875:TP53BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 43748304 A/G 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 A:G A G 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43748090_43748529:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000480860:exon_43748090_43748350:TP53BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 32 68 100 15.0070700457752 36.1099761527277 -21.1029061069525 A:T:C:G C T 10 0.531029061069525 3.10102252287835e-05 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 89 142 231 41.7384135648123 75.4061266718725 -33.6677131070603 T:C C T 10 0.531029061069525 1.18685193870860e-05 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 44120559 T/G 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:G T G 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44120273_44120564:WDR76 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 A:G A G 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 16 8 24 7.5035350228876 4.2482324885562 3.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.221638564753188 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 27 20 47 12.6622153511228 10.6205812213905 2.04163412973233 A:T T A 10 0.531029061069525 0.563201957852784 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 49429410 A/G 1 9 15 24 4.22073845037428 7.96543591604287 -3.7446974656686 A:G A G 10 0.531029061069525 0.152832673309424 ENSG00000166200:ENST00000388901:exon_49429347_49429424:COPS2;ENSG00000166200:ENST00000299259:exon_49429347_49429424:COPS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 49620200 C/T 1 20 13 33 9.3794187786095 6.90337779390382 2.47604098470568 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486056052297342 ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 49917341 G/A 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 A:G G A 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 T:C T C 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 51000006 G/C 1 32 40 72 15.0070700457752 21.241162442781 -6.2340923970058 T:C:G G C 10 0.531029061069525 0.156765534270973 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_50999506_51000071:AC012100.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 51040384 T/C 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:C T C 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51040310_51040399:AC012100.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 52404862 A/C 0 33 0 33 15.4760409847057 0 15.4760409847057 A A 10 0.531029061069525 1.38821895076758e-09 ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52404435_52404972:BCL2L10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 T:C T C 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 54919047 A/G 1 1 13 14 0.468970938930475 6.90337779390382 -6.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00056127204733262 ENSG00000137766:ENST00000260323:exon_54919026_54920806:UNC13C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 T:C C T 10 0.531029061069525 0.825489956938963 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 9 2 11 4.22073845037428 1.06205812213905 3.15868032823523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0710289055589968 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 51 46 97 23.9175178854542 24.4273368091981 -0.509818923743921 T:G T G 10 0.531029061069525 0.919387931927711 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 63414083 A/C 1 20 33 53 9.3794187786095 17.5239590152943 -8.14454023668482 A:T:C A C 10 0.531029061069525 0.0275402531764545 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63413999_63414427:LACTB;ENSG00000103642:ENST00000413507:exon_63414032_63414427:LACTB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 153 159 312 71.7525536563627 84.4336207100545 -12.6810670536918 A:G G A 10 0.531029061069525 0.156307603470899 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 64385851 T/C 1 80 71 151 37.517675114438 37.7030633359363 -0.185388221498265 A:T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166797:ENST00000300030:exon_64385844_64386217:FAM96A;ENSG00000166797:ENST00000380290:exon_64385844_64386207:FAM96A;ENSG00000166797:ENST00000419657:exon_64385844_64386007:FAM96A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 64706332 A/G 1 8 23 31 3.7517675114438 12.2136684045991 -8.46190089315527 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00328122298253319 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64706284_64706410:TRIP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 64967654 C/T 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 T:C C T 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 16 17 33 7.5035350228876 9.02749403818192 -1.52395901529432 T:C T C 10 0.531029061069525 0.60583239076914 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 22 19 41 10.3173606564705 10.089552160321 0.227808496149477 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 66180118 T/G 1 266 275 541 124.746269755506 146.032991794119 -21.286722038613 T:G T G 10 0.531029061069525 0.070367905425615 ENSG00000103769:ENST00000435304:exon_66180039_66181792:RAB11A;ENSG00000103769:ENST00000261890:exon_66180039_66184329:RAB11A;ENSG00000103769:ENST00000445947:exon_66180039_66181792:RAB11A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 66621346 A/G 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 A:G A G 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66621308_66621462:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66621308_66621462:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66621308_66621462:DIS3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 66641417 T/C 1 28 30 58 13.1311862900533 15.9308718320857 -2.79968554203245 T:C T C 10 0.531029061069525 0.511452692975594 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641398_66641461:TIPIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 66793613 T/G 1 9 2 11 4.22073845037428 1.06205812213905 3.15868032823523 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0710289055589968 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 T:G T G 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 67546934 G/C 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 C:G G C 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67546897_67547074:AAGAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 5 11 16 2.34485469465238 5.84131967176477 -3.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.130325747480968 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 70959354 T/C 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 T:C T C 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 70960068 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 71633839 C/T 0 63 0 63 29.5451691526199 0 29.5451691526199 C C 10 0.531029061069525 9.74750980235681e-18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 74290522 G/A 1 21 19 40 9.84838971753998 10.089552160321 -0.241162442780999 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000395135:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000359928:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000395132:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74290345_74290817:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74290345_74290817:PML HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 72 55 127 33.7659076029942 29.2065983588239 4.55930924417033 T:C T C 10 0.531029061069525 0.425303421663616 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 74740892 G/A 1 148 131 279 69.4076989617103 69.5648070001078 -0.157108038397467 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000138629:ENST00000361351:exon_74740819_74740941:UBL7;ENSG00000138629:ENST00000395081:exon_74740819_74740941:UBL7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:G A G 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75137868 C/A 1 49 60 109 22.9795760075933 31.8617436641715 -8.88216765657822 A:C C A 10 0.531029061069525 0.102435196955854 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75137814_75137934:SCAMP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 16 17 33 7.5035350228876 9.02749403818192 -1.52395901529432 A:G A G 10 0.531029061069525 0.60583239076914 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75498681 G/T 1 40 28 68 18.758837557219 14.8688137099467 3.8900238472723 T:G G T 10 0.531029061069525 0.395450399059179 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75498682 C/T 1 41 28 69 19.2278084961495 14.8688137099467 4.35899478620277 T:C C T 10 0.531029061069525 0.334983755199103 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75499257 C/T 1 23 21 44 10.7863315954009 11.15161028246 -0.365278687059099 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 63 60 123 29.5451691526199 31.8617436641715 -2.31657451155157 T:G T G 10 0.531029061069525 0.718088876158124 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75650836 G/A 1 22 23 45 10.3173606564705 12.2136684045991 -1.89630774812862 A:G G A 10 0.531029061069525 0.654664440828348 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75650803_75650959:MAN2C1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75650972 G/A 0 12 0 12 5.6276512671657 0 5.6276512671657 G G 10 0.531029061069525 0.00061600319089064 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 98 105 203 45.9591520151866 55.7580514123001 -9.79889939711357 T:G G T 10 0.531029061069525 0.181521841696696 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 670 680 1350 314.210529083418 361.099761527277 -46.8892324438587 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.0111869799751583 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 33 51 84 15.4760409847057 27.0824821145458 -11.6064411298401 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0118440170698986 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 37 104 141 17.3519247404276 55.2270223512306 -37.875097610803 T:C T C 10 0.531029061069525 1.5434703939205e-10 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 837 763 1600 392.528675884808 405.175173596048 -12.6464977112399 A:T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.531246773790166 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 465 438 903 218.071486602671 232.590728748452 -14.519242145781 A:C A C 10 0.531029061069525 0.333811287326169 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 555 460 1015 260.278871106414 244.273368091981 16.0055030144322 T:C C T 10 0.531029061069525 0.329604175265569 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 80472561 C/T 1 24 12 36 11.2553025343314 6.3723487328343 4.8829538014971 T:C C T 10 0.531029061069525 0.13206598573829 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80472466_80472567:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80472466_80472567:FAH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 151 119 270 70.8146117785017 63.1924582672735 7.62215351122826 A:G A G 10 0.531029061069525 0.360977786547299 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 33 48 81 15.4760409847057 25.4893949313372 -10.0133539466315 T:C C T 10 0.531029061069525 0.033759012101325 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 48 50 98 22.5106050686628 26.5514530534762 -4.04084798481345 A:G A G 10 0.531029061069525 0.420050986446312 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G A G 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 83735926 C/G 1 4 11 15 1.8758837557219 5.84131967176477 -3.96543591604287 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0665237629925474 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83735503_83736106:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83735503_83736106:BTBD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 85147389 C/T 1 5 11 16 2.34485469465238 5.84131967176477 -3.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.130325747480968 ENSG00000176371:ENST00000334141:exon_85147051_85147564:ZSCAN2;ENSG00000176371:ENST00000379358:exon_85147051_85147564:ZSCAN2;ENSG00000176371:ENST00000327179:exon_85147051_85147564:ZSCAN2;ENSG00000176371:ENST00000379353:exon_85147357_85147564:ZSCAN2;ENSG00000176371:ENST00000448803:exon_85147159_85147561:ZSCAN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:G T G 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 14 12 26 6.56559314502665 6.3723487328343 0.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 86287910 C/T 1 11 21 32 5.15868032823523 11.15161028246 -5.9929299542248 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0496388156413672 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89169484 C/T 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C C T 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89169954 G/C 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 C:G G C 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89173556 C/T 1 4 15 19 1.8758837557219 7.96543591604287 -6.08955216032097 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.00543373679417547 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89173289_89175513:AEN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 522 560 1082 244.802830121708 297.376274198934 -52.573444077226 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00152428072002060 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89182693 C/T 1 339 312 651 158.981148297431 165.681067053692 -6.69991875626073 T:C C T 10 0.531029061069525 0.60981986762795 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89442606 C/T 1 12 4 16 5.6276512671657 2.1241162442781 3.5035350228876 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0858135209465032 ENSG00000140545:ENST00000268150:exon_89441914_89442763:MFGE8;ENSG00000140545:ENST00000268151:exon_89441916_89442763:MFGE8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 44 52 96 20.6347213129409 27.6135111756153 -6.9787898626744 T:C T C 10 0.531029061069525 0.183430240099316 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:C A C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 89862465 G/A 1 18 6 24 8.44147690074855 3.18617436641715 5.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0394591007645588 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89862459_89862581:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89862459_89862581:POLG;ENSG00000140521:ENST00000530292:exon_89862459_89862581:POLG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C C T 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 90622936 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:G T G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 90784930 C/A 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:C C A 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000183208:ENST00000448438:exon_90784132_90785312:C15orf58;ENSG00000183208:ENST00000329600:exon_90784132_90785312:C15orf58 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 8 16 24 3.7517675114438 8.4964649771124 -4.7446974656686 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0649184187279779 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 91436965 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91436884_91437041:FES HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 91496242 C/T 1 37 22 59 17.3519247404276 11.6826393435295 5.66928539689803 T:C C T 10 0.531029061069525 0.152335236015806 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91496159_91496276:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91496159_91496276:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91496159_91496276:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000487875:exon_91496159_91496276:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000471780:exon_91496159_91496276:UNC45A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 11 19 30 5.15868032823523 10.089552160321 -4.93087183208575 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0981547449978678 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 100246936 T/C 1 14 1 15 6.56559314502665 0.531029061069525 6.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00128269240129442 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 100246942 G/A 1 13 1 14 6.09662220609618 0.531029061069525 5.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00231439236421468 ENSG00000068305:ENST00000354410:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000346108:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000449277:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000338042:exon_100246934_100247060:MEF2A;ENSG00000068305:ENST00000453228:exon_100246934_100247060:MEF2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 100269613 C/T 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 C:G G C 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 25 36 61 11.7242734732619 19.1170461985029 -7.39277272524102 A:C:G C A 10 0.531029061069525 0.0717280674249688 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 20 17 37 9.3794187786095 9.02749403818192 0.351924740427577 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 37 32 69 17.3519247404276 16.9929299542248 0.358994786202778 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101110096 T/C 1 31 17 48 14.5380991068447 9.02749403818192 5.5106050686628 T:C T C 10 0.531029061069525 0.114386883094421 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 A:T T A 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 20 24 44 9.3794187786095 12.7446974656686 -3.3652786870591 C:G C G 10 0.531029061069525 0.365233492339541 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101114418 G/A 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:G G A 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101718097 C/G 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 C:G C G 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 15 101835306 G/C 1 18 17 35 8.44147690074855 9.02749403818192 -0.586017137433373 C:G G C 10 0.531029061069525 0.866923667506405 ENSG00000131876:ENST00000254193:exon_101835302_101835487:SNRPA1;ENSG00000131876:ENST00000394082:exon_101835302_101835456:SNRPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 417691 C/G 1 152 186 338 71.2835827174322 98.7714053589316 -27.4878226414994 C:G C G 10 0.531029061069525 0.003193897617776 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 418597 G/C 1 145 107 252 68.0007861449189 56.8201095344392 11.1806766104797 C:G G C 10 0.531029061069525 0.165206553432868 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_418501_418635:MRPL28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 122 68 190 57.214454549518 36.1099761527277 21.1044783967903 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00220815039922804 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 91 91 182 42.6763554426732 48.3236445573268 -5.64728911465355 A:G G A 10 0.531029061069525 0.414581167862532 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 422158 G/A 1 15 52 67 7.03456408395713 27.6135111756153 -20.5789470916582 A:G G A 10 0.531029061069525 4.32294614404178e-07 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_420773_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_421862_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_421864_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_421864_422283:TMEM8A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 24 8 32 11.2553025343314 4.2482324885562 7.0070700457752 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0131138616862746 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 12 6 18 5.6276512671657 3.18617436641715 2.44147690074855 T:C T C 10 0.531029061069525 0.345573301643562 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 10 1 11 4.68970938930475 0.531029061069525 4.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0133926860261115 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 570557 T/C 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 16 6 22 7.5035350228876 3.18617436641715 4.31736065647045 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0861119295570477 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 T:C T C 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 23 26 49 10.7863315954009 13.8067555878076 -3.02042399240672 T:C T C 10 0.531029061069525 0.394668817409587 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 A:G G A 10 0.531029061069525 0.316197821820389 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:G G T 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 12 25 37 5.6276512671657 13.2757265267381 -7.64807525957242 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0131404164293457 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 A:G G A 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 10 24 34 4.68970938930475 12.7446974656686 -8.05498807636385 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00586957158311944 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 15 23 38 7.03456408395713 12.2136684045991 -5.17910432064195 A:G A G 10 0.531029061069525 0.104678276112586 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 36 29 65 16.8829538014971 15.3998427710162 1.48311103048088 C:G C G 10 0.531029061069525 0.803956234771484 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 T:C T C 10 0.531029061069525 0.457534991859192 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 T:C C T 10 0.531029061069525 0.371654719502381 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 10 16 26 4.68970938930475 8.4964649771124 -3.80675558780765 T:C T C 10 0.531029061069525 0.168864419923253 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 19 27 46 8.91044783967903 14.3377846488772 -5.42733680919815 A:G G A 10 0.531029061069525 0.138817667828542 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 34 38 72 15.9450119236362 20.1791043206419 -4.2340923970058 A:G A G 10 0.531029061069525 0.345705420809567 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 7 15 22 3.28279657251333 7.96543591604287 -4.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0543736988605008 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1503879 T/A 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:T T A 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1503835_1503895:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1503835_1503895:CLCN7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1545448 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 A:G A G 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 A:G A G 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 42 29 71 19.69677943508 15.3998427710162 4.29693666406373 T:C T C 10 0.531029061069525 0.342216404610972 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 27 29 56 12.6622153511228 15.3998427710162 -2.7376274198934 A:C C A 10 0.531029061069525 0.504411208284081 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 119 109 228 55.8075417327265 57.8821676565782 -2.07462592385169 T:C T C 10 0.531029061069525 0.791036047361487 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 15 18 33 7.03456408395713 9.55852309925145 -2.52395901529432 A:C A C 10 0.531029061069525 0.389329960885102 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2025411 G/C 1 25 25 50 11.7242734732619 13.2757265267381 -1.55145305347625 C:G G C 10 0.531029061069525 0.673356525342349 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2025602 A/G 1 30 41 71 14.0691281679143 21.7721915038505 -7.70306333593627 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0744695995316403 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2026292 T/C 1 49 67 116 22.9795760075933 35.5789470916582 -12.5993710840649 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0200287894122333 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026212_2026315:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2026891 T/C 1 37 71 108 17.3519247404276 37.7030633359363 -20.3511385955087 T:C T C 10 0.531029061069525 9.85177968248229e-05 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 52 70 122 24.3864888243847 37.1720342748667 -12.785545450482 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0230751891104480 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2028677 A/G 1 28 58 86 13.1311862900533 30.7996855420324 -17.6684992519791 A:C:G A G 10 0.531029061069525 0.000136664195866433 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2035907 T/C 1 46 57 103 21.5726631908019 30.2686564809629 -8.69599329016107 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0933860252399468 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2035999 C/T 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 T:C C T 10 0.531029061069525 0.316197821820389 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 28 20 48 13.1311862900533 10.6205812213905 2.5106050686628 C:G C G 10 0.531029061069525 0.563415723835564 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 28 41 69 13.1311862900533 21.7721915038505 -8.64100521379723 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.0403371105311782 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2052340 G/A 1 7 15 22 3.28279657251333 7.96543591604287 -4.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0543736988605008 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2052207_2052424:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2052207_2052424:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2052207_2052424:ZNF598 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2140554 G/A 0 13 0 13 6.09662220609618 0 6.09662220609618 G G 10 0.531029061069525 0.000320092157226576 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2140286_2140591:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2140286_2140591:PKD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 23 32 55 10.7863315954009 16.9929299542248 -6.20659835882387 A:C C A 10 0.531029061069525 0.105173161910239 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2881827 C/T 1 21 38 59 9.84838971753998 20.1791043206419 -10.330714603102 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0086115307694015 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 100 42 142 46.8970938930475 22.30322056492 24.5938733281275 T:G G T 10 0.531029061069525 3.23284990905117e-05 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 2987144 G/A 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000344592:exon_2987122_2987385:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000445831:exon_2986530_2987385:FLYWCH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3025552 G/A 1 22 13 35 10.3173606564705 6.90337779390382 3.41398286256663 A:G G A 10 0.531029061069525 0.309861647334678 ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3025320_3025813:PKMYT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3073240 G/T 1 78 60 138 36.5797332365771 31.8617436641715 4.71798957240556 T:G G T 10 0.531029061069525 0.443453806127592 ENSG00000103145:ENST00000354679:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000396916:exon_3073234_3073362:HCFC1R1;ENSG00000103145:ENST00000248089:exon_3073234_3073362:HCFC1R1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3076393 C/T 1 36 36 72 16.8829538014971 19.1170461985029 -2.2340923970058 T:C C T 10 0.531029061069525 0.637529623140775 ENSG00000131652:ENST00000253952:exon_3076366_3076414:THOC6;ENSG00000131652:ENST00000326266:exon_3076366_3076414:THOC6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 T:C C T 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 16 10 26 7.5035350228876 5.31029061069525 2.19324441219235 C:G G C 10 0.531029061069525 0.436352332176201 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3340106 G/A 1 23 38 61 10.7863315954009 20.1791043206419 -9.39277272524102 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0202379225815594 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3486736 G/A 0 0 11 11 0 5.84131967176477 -5.84131967176477 A G A 10 0.531029061069525 0.000241326627816686 ENSG00000167981:ENST00000301744:exon_3486104_3487538:ZNF597 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3534892 G/A 1 18 22 40 8.44147690074855 11.6826393435295 -3.241162442781 A:G G A 10 0.531029061069525 0.343311635147083 ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3534699_3535061:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3534699_3535083:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000421765:exon_3534691_3534926:NAT15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 3708193 G/A 1 50 51 101 23.4485469465238 27.0824821145458 -3.63393516802202 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486438686750498 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 T:G G T 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4410488 C/G 1 36 24 60 16.8829538014971 12.7446974656686 4.1382563358285 C:G C G 10 0.531029061069525 0.303072961254678 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4410445_4410549:CORO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 16 6 22 7.5035350228876 3.18617436641715 4.31736065647045 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0861119295570477 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 14 4 18 6.56559314502665 2.1241162442781 4.44147690074855 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0558087683526188 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4751045 C/T 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4802386 G/T 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 T:G G T 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 4849705 C/T 1 4 13 17 1.8758837557219 6.90337779390382 -5.02749403818192 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0256163398466810 ENSG00000067836:ENST00000322048:exon_4849687_4849782:ROGDI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 5128857 G/C 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 C:G G C 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5128758_5128879:ALG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 20 18 38 9.3794187786095 9.55852309925145 -0.179104320641947 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:C C A 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11001421 C/A 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11001821 C/T 1 10 5 15 4.68970938930475 2.65514530534762 2.03456408395713 T:C C T 10 0.531029061069525 0.315767079054389 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 T:C C T 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 15 15 30 7.03456408395713 7.96543591604287 -0.930871832085749 T:C C T 10 0.531029061069525 0.85526692479372 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 10 15 25 4.68970938930475 7.96543591604287 -3.27572652673812 A:C A C 10 0.531029061069525 0.230193716561202 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11873158 T/C 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11873022_11873219:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11873022_11873219:ZC3H7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 11876203 T/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C T C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11876143_11876244:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11876143_11876408:ZC3H7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 41 23 64 19.2278084961495 12.2136684045991 7.0141400915504 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0809518053000428 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 15129940 C/T 1 21 16 37 9.84838971753998 8.4964649771124 1.35192474042758 T:C C T 10 0.531029061069525 0.742763651093692 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 27 33 60 12.6622153511228 17.5239590152943 -4.8617436641715 A:C A C 10 0.531029061069525 0.244365299674055 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 30 17 47 14.0691281679143 9.02749403818192 5.04163412973233 A:G G A 10 0.531029061069525 0.146835381414607 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 9 9 18 4.22073845037428 4.77926154962572 -0.558523099251449 T:C T C 10 0.531029061069525 0.817439085135691 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 C:G G C 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 18 25 43 8.44147690074855 13.2757265267381 -4.83424962598957 C:G C G 10 0.531029061069525 0.168821973797197 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:C A C 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 54 69 123 25.3244307022457 36.6410052137972 -11.3165745115516 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0465555439733589 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23641340 G/A 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 A:G G A 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23640961_23641790:PALB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 22 25 47 10.3173606564705 13.2757265267381 -2.95836587026767 A:G A G 10 0.531029061069525 0.46532677882094 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 145 147 292 68.0007861449189 78.0612719772202 -10.0604858323013 A:G A G 10 0.531029061069525 0.241452657949743 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 24046861 T/C 1 16 17 33 7.5035350228876 9.02749403818192 -1.52395901529432 T:C T C 10 0.531029061069525 0.60583239076914 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24046740_24046868:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24046740_24046868:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000486868:exon_24046740_24046868:PRKCB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 32 22 54 15.0070700457752 11.6826393435295 3.32443070224565 T:C C T 10 0.531029061069525 0.414250696008264 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 24231248 C/T 1 202 236 438 94.732129663956 125.322858412408 -30.5907287484519 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00348215973122359 ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 24570844 G/A 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24570826_24570998:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24570826_24570998:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24570826_24570998:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24570826_24570998:RBBP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 155 136 291 72.6904955342236 72.2199523054554 0.470543228768236 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 34 28 62 15.9450119236362 14.8688137099467 1.07619821368945 T:C T C 10 0.531029061069525 0.800660615106556 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 27 20 47 12.6622153511228 10.6205812213905 2.04163412973233 A:G G A 10 0.531029061069525 0.563201957852784 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 29974560 C/T 1 90 84 174 42.2073845037428 44.6064411298401 -2.39905662609735 T:C C T 10 0.531029061069525 0.761374482184437 ENSG00000149932:ENST00000414689:exon_29974431_29974629:TMEM219;ENSG00000149932:ENST00000279396:exon_29974428_29974629:TMEM219 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 29994398 C/T 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 T:C C T 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994393_29994653:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994393_29994653:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994393_29994653:TAOK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 682 638 1320 319.838180350584 338.796540962357 -18.9583606117729 A:G A G 10 0.531029061069525 0.307557172379911 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:C T C 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 27 41 68 12.6622153511228 21.7721915038505 -9.1099761527277 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.0287805242664859 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31072909 G/A 1 18 15 33 8.44147690074855 7.96543591604287 0.476040984705676 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 6 14 20 2.81382563358285 7.43440685497335 -4.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0442922401162171 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 35 40 75 16.4139828625666 21.241162442781 -4.82717958021437 A:G G A 10 0.531029061069525 0.298020515810917 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31473275 A/G 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 A:G A G 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31473243_31473350:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31473243_31473350:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31473243_31473350:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31473243_31473350:ARMC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31488916 C/G 1 34 13 47 15.9450119236362 6.90337779390382 9.04163412973233 C:G C G 10 0.531029061069525 0.00830543268640923 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31488631_31489281:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31488631_31489279:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31488631_31489281:TGFB1I1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31896561 A/G 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 A:G A G 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31896482_31896577:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31896482_31896577:ZNF267 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 31927690 G/A 1 89 88 177 41.7384135648123 46.7305573741182 -4.99214380930592 A:G G A 10 0.531029061069525 0.45267316795292 ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31925797_31928622:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31925797_31928622:ZNF267 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 T:C C T 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57015545 C/T 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.187254933265688 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 13 20 33 6.09662220609618 10.6205812213905 -4.52395901529432 A:G G A 10 0.531029061069525 0.120070327087551 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57091977 T/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C T C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57091977_57092060:NLRC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57464236 G/A 1 20 15 35 9.3794187786095 7.96543591604287 1.41398286256663 A:G G A 10 0.531029061069525 0.73557273951191 ENSG00000005194:ENST00000394391:exon_57464170_57464251:CIAPIN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57484980 G/A 1 5 13 18 2.34485469465238 6.90337779390382 -4.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.034821244804787 ENSG00000088682:ENST00000433906:exon_57484952_57485120:COQ9;ENSG00000088682:ENST00000262507:exon_57484952_57485120:COQ9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57507242 C/G 1 18 8 26 8.44147690074855 4.2482324885562 4.19324441219235 C:G C G 10 0.531029061069525 0.117013771715704 ENSG00000125170:ENST00000340099:exon_57505834_57507407:DOK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 57552088 T/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 58589187 G/A 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58589155_58589441:CNOT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 44 21 65 20.6347213129409 11.15161028246 9.48311103048088 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0183902019309536 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 13 15 28 6.09662220609618 7.96543591604287 -1.8688137099467 A:C A C 10 0.531029061069525 0.571111918143577 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 13 15 28 6.09662220609618 7.96543591604287 -1.8688137099467 A:G A G 10 0.531029061069525 0.571111918143577 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 66974356 G/A 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66974340_66974598:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66974340_66974598:CES2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 35 52 87 16.4139828625666 27.6135111756153 -11.1995283130487 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0178901154358969 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 67904759 C/T 1 295 268 563 138.34642698449 142.315788366633 -3.96936138214255 T:C C T 10 0.531029061069525 0.767577429607164 ENSG00000102898:ENST00000219169:exon_67904703_67906470:NUTF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 69191012 G/A 1 19 23 42 8.91044783967903 12.2136684045991 -3.30322056492005 A:G G A 10 0.531029061069525 0.354451943510727 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69190987_69191143:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69190987_69191143:CIRH1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 37 42 79 17.3519247404276 22.30322056492 -4.95129582449247 A:G A G 10 0.531029061069525 0.310321545385514 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 69364992 G/A 1 15 21 36 7.03456408395713 11.15161028246 -4.1170461985029 A:G G A 10 0.531029061069525 0.184129144905387 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69364716_69364998:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69364742_69364998:COG8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 69401085 G/T 1 20 23 43 9.3794187786095 12.2136684045991 -2.83424962598957 T:G G T 10 0.531029061069525 0.44568428015896 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69400710_69401102:TERF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 25 48 73 11.7242734732619 25.4893949313372 -13.7651214580753 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00141401768798601 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 14 18 32 6.56559314502665 9.55852309925145 -2.9929299542248 T:C C T 10 0.531029061069525 0.294896781552893 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 A:T A T 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 71 62 133 33.2969366640637 32.9238017863105 0.373134877753181 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 71894383 A/G 1 15 18 33 7.03456408395713 9.55852309925145 -2.52395901529432 A:G A G 10 0.531029061069525 0.389329960885102 ENSG00000102984:ENST00000446827:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000425432:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000313565:exon_71893589_71894575:ZNF821 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 72042682 A/C 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 A:C A C 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 72141362 G/A 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 A:G G A 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72141239_72141447:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72141239_72141447:DHX38 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 12 11 23 5.6276512671657 5.84131967176477 -0.213668404599074 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 75263661 G/A 1 52 24 76 24.3864888243847 12.7446974656686 11.6417913587161 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0079503567918957 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75262928_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75262929_75263921:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75262929_75263921:BCAR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 14 8 22 6.56559314502665 4.2482324885562 2.31736065647045 T:C C T 10 0.531029061069525 0.395246671022453 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81076821 T/C 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81077204 T/A 1 14 16 30 6.56559314502665 8.4964649771124 -1.93087183208575 A:T T A 10 0.531029061069525 0.583962242482046 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 69 55 124 32.3589947862028 29.2065983588239 3.15239642737891 T:C T C 10 0.531029061069525 0.590318693194266 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81124275 G/A 1 1 20 21 0.468970938930475 10.6205812213905 -10.15161028246 A:G G A 10 0.531029061069525 4.76556839430522e-06 ENSG00000140905:ENST00000315467:exon_81124206_81124285:GCSH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 22 20 42 10.3173606564705 10.6205812213905 -0.303220564920048 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 6 12 18 2.81382563358285 6.3723487328343 -3.55852309925145 A:G A G 10 0.531029061069525 0.102920868968033 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 32 29 61 15.0070700457752 15.3998427710162 -0.392772725241024 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 79 61 140 37.0487041755075 32.392772725241 4.65593145026651 T:C T C 10 0.531029061069525 0.446993381299496 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 44 23 67 20.6347213129409 12.2136684045991 8.42105290834183 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0493828180113472 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 33 17 50 15.4760409847057 9.02749403818192 6.44854694652375 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0880793434096489 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 83949076 A/G 1 14 19 33 6.56559314502665 10.089552160321 -3.52395901529432 A:G A G 10 0.531029061069525 0.22750273500789 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83948561_83949785:MLYCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 30 26 56 14.0691281679143 13.8067555878076 0.262372580106602 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84213439 G/A 1 13 13 26 6.09662220609618 6.90337779390382 -0.806755587807649 A:G G A 10 0.531029061069525 0.84501811777777 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 11 16 27 5.15868032823523 8.4964649771124 -3.33778464887717 T:C C T 10 0.531029061069525 0.247571337207832 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 4 16 20 1.8758837557219 8.4964649771124 -6.6205812213905 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00314866743205313 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 22 41 63 10.3173606564705 21.7721915038505 -11.4548308473801 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00507630490895718 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 61 4 65 28.607227274759 2.1241162442781 26.4831110304809 T:C C T 10 0.531029061069525 6.82425614195259e-13 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 56 2 58 26.2623725801066 1.06205812213905 25.2003144579676 C:G G C 10 0.531029061069525 2.15759566957947e-13 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 85697117 C/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85695897_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85696972_85697220:KIAA0182 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 85945231 C/T 1 25 31 56 11.7242734732619 16.4619008931553 -4.7376274198934 T:C C T 10 0.531029061069525 0.228899994115268 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85945176_85945264:IRF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 85948098 G/A 1 56 39 95 26.2623725801066 20.7101333817115 5.55223919839513 A:G G A 10 0.531029061069525 0.260217792419944 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85948079_85948126:IRF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88105725 G/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000466847:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000481948:exon_88105675_88105818:BANP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88599023 A/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599022_88599117:ZFPM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 21 31 52 9.84838971753998 16.4619008931553 -6.6135111756153 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0715020049177712 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 C:G G C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 21 20 41 9.84838971753998 10.6205812213905 -0.772191503850523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.876136667047102 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 45 32 77 21.1036922518714 16.9929299542248 4.11076229764658 A:G A G 10 0.531029061069525 0.363208439787782 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 24 31 55 11.2553025343314 16.4619008931553 -5.20659835882387 C:G G C 10 0.531029061069525 0.177398609785283 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 35 43 78 16.4139828625666 22.8342496259896 -6.42026676342295 A:G A G 10 0.531029061069525 0.173054560202547 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88873790 C/T 1 32 28 60 15.0070700457752 14.8688137099467 0.138256335828501 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 80 95 175 37.517675114438 50.4477608016049 -12.9300856871669 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0579982201342766 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 88876059 A/G 1 87 148 235 40.8004716869513 78.5923010382897 -37.7918293513384 A:G A G 10 0.531029061069525 7.99545731243112e-07 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 22 9 31 10.3173606564705 4.77926154962572 5.53809910684473 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0489838224478622 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 89628073 G/A 1 3478 2990 6468 1631.08092560019 1587.77689259788 43.3040330023125 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.283995834642504 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627986_89628118:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627986_89628159:RPL13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 A:G A G 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 8 12 20 3.7517675114438 6.3723487328343 -2.6205812213905 A:G A G 10 0.531029061069525 0.268384990115425 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 649703 T/C 1 29 31 60 13.6001572289838 16.4619008931553 -2.8617436641715 T:C T C 10 0.531029061069525 0.518312436012606 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 900476 C/T 1 16 14 30 7.5035350228876 7.43440685497335 0.0691281679142506 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_900357_900620:TIMM22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 902110 T/G 1 13 25 38 6.09662220609618 13.2757265267381 -7.17910432064195 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0224581875608432 ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_902019_902215:TIMM22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 910546 G/A 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_910405_910552:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_910405_910552:ABR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 916363 G/A 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_916345_916404:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_916345_916404:ABR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 24 23 47 11.2553025343314 12.2136684045991 -0.958365870267674 A:G A G 10 0.531029061069525 0.884009347691094 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1387472 C/T 1 11 16 27 5.15868032823523 8.4964649771124 -3.33778464887717 T:C C T 10 0.531029061069525 0.247571337207832 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1387442_1387597:MYO1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1578939 C/T 1 14 5 19 6.56559314502665 2.65514530534762 3.91044783967903 T:C C T 10 0.531029061069525 0.105462082560563 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1580929 G/C 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 C:G G C 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1580859_1580988:PRPF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1584324 A/G 1 14 4 18 6.56559314502665 2.1241162442781 4.44147690074855 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0558087683526188 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1584223_1584348:PRPF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1585130 A/G 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585114_1585332:PRPF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 9 16 25 4.22073845037428 8.4964649771124 -4.27572652673812 A:G A G 10 0.531029061069525 0.108422944068912 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 17 10 27 7.97250596181808 5.31029061069525 2.66221535112283 A:G A G 10 0.531029061069525 0.339748103307339 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 1680002 T/C 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000132386:ENST00000254722:exon_1679826_1680036:SERPINF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 37 36 73 17.3519247404276 19.1170461985029 -1.76512145807532 T:C T C 10 0.531029061069525 0.725553896371942 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 2238675 A/G 1 10 11 21 4.68970938930475 5.84131967176477 -1.15161028246002 A:G A G 10 0.531029061069525 0.66596337608169 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2238554_2238688:TSR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 2323517 C/T 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000127804:ENST00000263092:exon_2319352_2323890:METT10D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 2570480 T/C 1 26 29 55 12.1932444121924 15.3998427710162 -3.20659835882387 T:C T C 10 0.531029061069525 0.419061473241431 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2570286_2570492:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2570286_2570492:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2570286_2570492:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2570286_2570492:PAFAH1B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 23 40 63 10.7863315954009 21.241162442781 -10.4548308473801 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0109973679895955 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 23 15 38 10.7863315954009 7.96543591604287 2.82089567935805 A:G G A 10 0.531029061069525 0.41778631414771 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 3631196 G/T 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 T:G G T 10 0.531029061069525 0.796990490622274 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 29 26 55 13.6001572289838 13.8067555878076 -0.206598358823873 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 220 181 401 103.173606564705 96.116260053584 7.0573465111205 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.484154833426832 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4577950 C/A 1 30 28 58 14.0691281679143 14.8688137099467 -0.799685542032449 A:C:G C A 10 0.531029061069525 0.895582298519762 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4577855_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4577805_4577964:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4577805_4577964:PELP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 23 19 42 10.7863315954009 10.089552160321 0.696779435079952 T:C C T 10 0.531029061069525 0.878014562536644 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4721376 A/G 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4721297_4721401:PLD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4844242 C/T 1 35 54 89 16.4139828625666 28.6755692977543 -12.2615864351877 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0105290257431272 ENSG00000108523:ENST00000262482:exon_4843782_4844288:RNF167;ENSG00000108523:ENST00000381350:exon_4843913_4844288:RNF167 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4864114 T/C 1 101 133 234 47.366064831978 70.6268651222468 -23.2608002902688 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00253323345998966 ENSG00000091640:ENST00000206020:exon_4864081_4864148:SPAG7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 6 14 20 2.81382563358285 7.43440685497335 -4.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0442922401162171 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4883450 T/C 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4882979_4883916:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4882979_4883916:CAMTA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 4892176 C/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 C:G C G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000196388:ENST00000355025:exon_4892074_4892239:INCA1;ENSG00000196388:ENST00000396829:exon_4892074_4892239:INCA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 26 12 38 12.1932444121924 6.3723487328343 5.82089567935805 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0728614258700353 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 16 8 24 7.5035350228876 4.2482324885562 3.2553025343314 A:G A G 10 0.531029061069525 0.221638564753188 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 19 7 26 8.91044783967903 3.71720342748667 5.19324441219235 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0488628947043731 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 35 22 57 16.4139828625666 11.6826393435295 4.73134351903708 A:G G A 10 0.531029061069525 0.233375566582122 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 176 166 342 82.5388852517636 88.1508241375412 -5.61193888577755 A:G A G 10 0.531029061069525 0.551566404380056 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 138 110 248 64.7179895724056 58.4131967176477 6.30479285475781 T:C T C 10 0.531029061069525 0.445422359405676 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 25 31 56 11.7242734732619 16.4619008931553 -4.7376274198934 A:T:G T A 10 0.531029061069525 0.228899994115268 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 92 103 195 43.1453263816037 54.6959932901611 -11.5506669085574 T:C C T 10 0.531029061069525 0.099334641245698 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 92 134 226 43.1453263816037 71.1578941833163 -28.0125678017126 C:G C G 10 0.531029061069525 0.000230917172333329 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5424936 C/T 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 T:C C T 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 T:C T C 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 14 10 24 6.56559314502665 5.31029061069525 1.2553025343314 C:G C G 10 0.531029061069525 0.685265962050597 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 T:C T C 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 138 130 268 64.7179895724056 69.0337779390382 -4.31578836663269 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.624545235268083 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7155861 G/A 1 48 17 65 22.5106050686628 9.02749403818192 13.4831110304809 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000718477983327351 ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7155745_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7155551_7155915:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7155745_7155915:C17orf81 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7359154 T/C 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 T:C T C 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000170175:ENST00000306071:exon_7359113_7359260:CHRNB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7402600 T/C 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:C T C 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7404991 T/C 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 T:C T C 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7404845_7405048:POLR2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7412349 G/A 1 12 11 23 5.6276512671657 5.84131967176477 -0.213668404599074 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7412403 T/C 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 T:C T C 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7478498 G/A 1 268 241 509 125.684211633367 127.978003717756 -2.2937920843882 A:G G A 10 0.531029061069525 0.859045026244065 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7478437_7478576:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7478437_7478720:EIF4A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7530147 G/C 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 C:G G C 10 0.531029061069525 0.278876768214331 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 59 38 97 27.669285396898 20.1791043206419 7.49018107625608 T:C C T 10 0.531029061069525 0.154013770781920 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 72 68 140 33.7659076029942 36.1099761527277 -2.34406854973349 C:G G C 10 0.531029061069525 0.735016191367799 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7591997 C/T 1 25 25 50 11.7242734732619 13.2757265267381 -1.55145305347625 T:C C T 10 0.531029061069525 0.673356525342349 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7589619_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7591795_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000451908:exon_7591967_7592033:WRAP53 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7606350 T/C 1 17 24 41 7.97250596181808 12.7446974656686 -4.77219150385052 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.159175262557064 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 17 5 22 7.97250596181808 2.65514530534762 5.31736065647045 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0306679632318544 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 108 128 236 50.6488614044913 67.9717198168992 -17.3228584124079 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0264284919291784 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 67 45 112 31.4210529083418 23.8963077481286 7.5247451602132 A:G A G 10 0.531029061069525 0.157009986024185 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 8139463 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8139376_8139660:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8139376_8139660:C17orf68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 34 56 90 15.9450119236362 29.7376274198934 -13.7926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00414960255864783 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G G A 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 14110236 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14110127_14111994:COX10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 45 38 83 21.1036922518714 20.1791043206419 0.924587931229429 A:C:G C G 10 0.531029061069525 0.912538626201461 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 12 17 29 5.6276512671657 9.02749403818192 -3.39984277101622 T:C T C 10 0.531029061069525 0.264194510317464 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 16456614 T/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:G T G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000141040:ENST00000268727:exon_16453631_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395825:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395824:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000498796:exon_16456424_16456740:ZNF287 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 10 14 24 4.68970938930475 7.43440685497335 -2.7446974656686 C:G C G 10 0.531029061069525 0.308686848417513 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 1 10 11 0.468970938930475 5.31029061069525 -4.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00419409086522907 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 17720391 A/G 1 14 8 22 6.56559314502665 4.2482324885562 2.31736065647045 A:G A G 10 0.531029061069525 0.395246671022453 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 5 11 16 2.34485469465238 5.84131967176477 -3.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.130325747480968 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18004845 T/A 1 33 15 48 15.4760409847057 7.96543591604287 7.5106050686628 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0305343819929924 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_18004807_18004904:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_18004807_18004904:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_18004807_18004904:DRG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 16 27 43 7.5035350228876 14.3377846488772 -6.83424962598957 T:C C T 10 0.531029061069525 0.046033118194267 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18154176 G/A 1 21 16 37 9.84838971753998 8.4964649771124 1.35192474042758 A:G G A 10 0.531029061069525 0.742763651093692 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18154152_18154331:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18154152_18154331:FLII;ENSG00000177731:ENST00000496727:exon_18154152_18154785:FLII HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18178075 G/A 1 19 25 44 8.91044783967903 13.2757265267381 -4.3652786870591 A:G G A 10 0.531029061069525 0.226799128241008 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18177532_18178294:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18177532_18178294:TOP3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18181592 C/T 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 10 19 29 4.68970938930475 10.089552160321 -5.39984277101622 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0611026478740739 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 14 25 39 6.56559314502665 13.2757265267381 -6.71013338171147 A:G A G 10 0.531029061069525 0.036532555309882 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 12 6 18 5.6276512671657 3.18617436641715 2.44147690074855 A:T A T 10 0.531029061069525 0.345573301643562 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 24 0 24 11.2553025343314 0 11.2553025343314 T T 10 0.531029061069525 2.65644633616791e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 22 0 22 10.3173606564705 0 10.3173606564705 T T 10 0.531029061069525 9.54846017868322e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 21 0 21 9.84838971753998 0 9.84838971753998 G G 10 0.531029061069525 1.81261760416216e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 21 0 21 9.84838971753998 0 9.84838971753998 G G 10 0.531029061069525 1.81261760416216e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 22 0 22 10.3173606564705 0 10.3173606564705 C C 10 0.531029061069525 9.54846017868322e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 36 0 36 16.8829538014971 0 16.8829538014971 C C 10 0.531029061069525 1.87674607357598e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 19 0 19 8.91044783967903 0 8.91044783967903 C C 10 0.531029061069525 6.55216843145094e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 20 0 20 9.3794187786095 0 9.3794187786095 C C 10 0.531029061069525 3.44435126702128e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 27 0 27 12.6622153511228 0 12.6622153511228 G G 10 0.531029061069525 3.9182263493118e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 63 0 63 29.5451691526199 0 29.5451691526199 G G 10 0.531029061069525 9.74750980235681e-18 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 157 127 284 73.6284374120846 67.4406907558297 6.18774665625492 A:G G A 10 0.531029061069525 0.475989011906926 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 15 21 36 7.03456408395713 11.15161028246 -4.1170461985029 A:G G A 10 0.531029061069525 0.184129144905387 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 25974258 T/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25974056_25974458:LGALS9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 26875677 G/C 1 128 132 260 60.0282801831008 70.0958360611773 -10.0675558780765 C:G G C 10 0.531029061069525 0.214496456299172 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26875610_26875723:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26875610_26878820:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26875610_26875723:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26875610_26876417:UNC119 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 26919497 T/G 1 31 23 54 14.5380991068447 12.2136684045991 2.32443070224565 T:G T G 10 0.531029061069525 0.586476842730886 ENSG00000076382:ENST00000321765:exon_26919000_26920084:SPAG5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 26976071 A/G 1 80 66 146 37.517675114438 35.0479180305886 2.46975708384936 A:G A G 10 0.531029061069525 0.740268523073773 ENSG00000132581:ENST00000247020:exon_26975374_26976294:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000491945:exon_26975607_26976294:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000480857:exon_26975607_26976294:SDF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 13 17 30 6.09662220609618 9.02749403818192 -2.93087183208575 T:C C T 10 0.531029061069525 0.360707760476209 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 48 62 110 22.5106050686628 32.9238017863105 -10.4131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0555939407933376 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 27225586 A/T 1 9 9 18 4.22073845037428 4.77926154962572 -0.558523099251449 A:T A T 10 0.531029061069525 0.817439085135691 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 27889643 C/T 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:C C T 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 28576076 T/C 1 52 59 111 24.3864888243847 31.330714603102 -6.94422577871727 T:C T C 10 0.531029061069525 0.216179029542782 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 14 16 30 6.56559314502665 8.4964649771124 -1.93087183208575 C:G G C 10 0.531029061069525 0.583962242482046 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 29096011 C/T 1 2 14 16 0.93794187786095 7.43440685497335 -6.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00155191749794743 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 29221584 A/G 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29221582_29221740:ATAD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 8 15 23 3.7517675114438 7.96543591604287 -4.21366840459907 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0948309364563758 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 186 170 356 87.2285946410684 90.2749403818192 -3.04634574075089 A:G A G 10 0.531029061069525 0.750313775276134 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 30696292 C/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 36 4 40 16.8829538014971 2.1241162442781 14.758837557219 T:C C T 10 0.531029061069525 7.34821934002646e-07 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 1 33 34 0.468970938930475 17.5239590152943 -17.0549880763638 T:C C T 10 0.531029061069525 2.60345181655627e-10 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 2 10 12 0.93794187786095 5.31029061069525 -4.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.01705983554651 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 35 55 90 16.4139828625666 29.2065983588239 -12.7926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00801063766009154 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 8 13 21 3.7517675114438 6.90337779390382 -3.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.193093229428768 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 38031674 C/T 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 C C 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 ENSG00000186075:ENST00000348931:exon_38031507_38031687:ZPBP2;ENSG00000186075:ENST00000377940:exon_38031507_38031687:ZPBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 14 12 26 6.56559314502665 6.3723487328343 0.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 T:C C T 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 20 37 57 9.3794187786095 19.6480752595724 -10.2686564809629 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0075535568245917 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 40342230 C/T 1 37 30 67 17.3519247404276 15.9308718320857 1.42105290834183 T:C C T 10 0.531029061069525 0.806893580184646 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40342203_40342288:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40342203_40342288:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40342203_40342288:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40342203_40342288:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40342203_40342377:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40342203_40342288:GHDC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 40822308 C/A 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 A:C C A 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40821936_40822394:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40821961_40822394:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40821738_40822394:PLEKHH3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 41215368 T/C 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41215350_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41215361_41215390:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41215361_41215390:BRCA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 41584374 G/A 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:G G A 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000067596:ENST00000262415:exon_41584371_41584565:DHX8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 41611332 G/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000175832:ENST00000393664:exon_41611227_41611353:ETV4;ENSG00000175832:ENST00000319349:exon_41611227_41611353:ETV4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 42288661 G/A 1 28 47 75 13.1311862900533 24.9583658702677 -11.8271795802144 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0074470315369128 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288658_42288699:UBTF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 42400868 C/T 1 16 19 35 7.5035350228876 10.089552160321 -2.58601713743337 T:C C T 10 0.531029061069525 0.401522469972212 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42400846_42400945:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42400846_42400945:SLC25A39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 C:G G C 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 22 18 40 10.3173606564705 9.55852309925145 0.758837557219001 A:G G A 10 0.531029061069525 0.87484065053893 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 43176804 C/T 1 53 67 120 24.8554597633152 35.5789470916582 -10.723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0546345545672533 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43176773_43176881:NMT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 112 127 239 52.5247451602132 67.4406907558297 -14.9159455956165 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0599676592025431 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 33 39 72 15.4760409847057 20.7101333817115 -5.2340923970058 T:C C T 10 0.531029061069525 0.238281989388155 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 26 17 43 12.1932444121924 9.02749403818192 3.16575037401043 C:G G C 10 0.531029061069525 0.362268191208422 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 43507008 G/C 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 C:G G C 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000159314:ENST00000531735:exon_43506989_43507663:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000532891:exon_43506989_43507663:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000442348:exon_43506989_43507645:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000428638:exon_43506989_43507645:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000528273:exon_43506718_43507663:ARHGAP27;ENSG00000159314:ENST00000290470:exon_43506719_43507663:ARHGAP27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 A:G G A 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 45890707 C/T 1 3 10 13 1.40691281679143 5.31029061069525 -3.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0477572109989804 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45890632_45890769:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45890632_45890769:OSBPL7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 24 20 44 11.2553025343314 10.6205812213905 0.634721312940902 T:C C T 10 0.531029061069525 0.881000206018328 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 45916018 C/G 1 47 44 91 22.0416341297323 23.3652786870591 -1.32364455732677 C:G C G 10 0.531029061069525 0.83383896671462 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915897_45916062:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915897_45916062:SCRN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 106 101 207 49.7109195266304 53.633935168022 -3.92301564139166 T:C C T 10 0.531029061069525 0.626035566397048 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 49338257 C/T 1 23 43 66 10.7863315954009 22.8342496259896 -12.0479180305886 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00419520850265179 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 55027850 T/C 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 T:C T C 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 21 28 49 9.84838971753998 14.8688137099467 -5.02042399240672 T:C T C 10 0.531029061069525 0.155312320338582 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 11 14 25 5.15868032823523 7.43440685497335 -2.27572652673812 T:C T C 10 0.531029061069525 0.424884149322681 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 55335664 A/G 1 9 13 22 4.22073845037428 6.90337779390382 -2.68263934352955 A:G A G 10 0.531029061069525 0.289159904606614 ENSG00000153944:ENST00000284073:exon_55335631_55335715:MSI2;ENSG00000153944:ENST00000416426:exon_55335631_55335715:MSI2;ENSG00000153944:ENST00000322684:exon_55335631_55335715:MSI2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 56798128 A/G 1 12 16 28 5.6276512671657 8.4964649771124 -2.8688137099467 A:G A G 10 0.531029061069525 0.344371932689015 ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56798107_56798173:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56798107_56798173:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56798107_56798173:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000413590:exon_56798107_56798173:RAD51C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 57093035 C/T 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000108395:ENST00000393066:exon_57092971_57093160:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000262294:exon_57092971_57093160:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000393065:exon_57092971_57093160:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000376149:exon_57092971_57093160:TRIM37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 49 58 107 22.9795760075933 30.7996855420324 -7.82010953443917 A:G G A 10 0.531029061069525 0.146116429965155 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 58524990 C/T 1 12 31 43 5.6276512671657 16.4619008931553 -10.8342496259896 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00110604744471878 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 34 59 93 15.9450119236362 31.330714603102 -15.3857026794658 A:T T A 10 0.531029061069525 0.00169046796498239 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 11 17 28 5.15868032823523 9.02749403818192 -3.8688137099467 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.184488662565826 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 226 198 424 105.987432198287 105.143754091766 0.843678106521409 T:C C T 10 0.531029061069525 0.96120572974986 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 13 19 32 6.09662220609618 10.089552160321 -3.9929299542248 A:T T A 10 0.531029061069525 0.161840752458901 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 70118935 C/T 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 T:C C T 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70118860_70119113:SOX9;ENSG00000125398:ENST00000455872:exon_70118860_70119113:SOX9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 70645032 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70644942_70645100:SLC39A11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 A:G G A 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 A:G A G 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71197439 C/T 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 T:C C T 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 14 38 52 6.56559314502665 20.1791043206419 -13.6135111756153 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000224354575659945 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 4 25 29 1.8758837557219 13.2757265267381 -11.3998427710162 T:C T C 10 0.531029061069525 1.67123141543262e-05 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 5 11 16 2.34485469465238 5.84131967176477 -3.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.130325747480968 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 3 29 32 1.40691281679143 15.3998427710162 -13.9929299542248 C:G G C 10 0.531029061069525 2.82763703381099e-07 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 3 11 14 1.40691281679143 5.84131967176477 -4.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0284363057482022 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 72480288 G/A 1 249 203 452 116.773763793688 107.798899397114 8.97486439657472 A:G G A 10 0.531029061069525 0.423075284136891 ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72480140_72480927:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72480140_72480933:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72480140_72480929:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72480140_72480306:CD300A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 A:G A G 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 C:G G C 10 0.531029061069525 0.825489956938963 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 31 46 77 14.5380991068447 24.4273368091981 -9.88923770235342 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0294499394505562 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73205976 T/C 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73205918_73206080:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73205918_73206080:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73205918_73206080:NUP85 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 25 24 49 11.7242734732619 12.7446974656686 -1.02042399240672 T:C C T 10 0.531029061069525 0.776801039471156 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73257986 C/T 1 30 35 65 14.0691281679143 18.5860171374334 -4.51688896951912 T:C C T 10 0.531029061069525 0.266389260165018 ENSG00000125445:ENST00000245539:exon_73257749_73258064:MRPS7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73269676 C/T 1 48 36 84 22.5106050686628 19.1170461985029 3.3935588701599 T:C C T 10 0.531029061069525 0.512294006282323 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 73625430 G/A 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 74039976 A/G 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 A:G A G 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74039910_74040039:SRP68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 23 16 39 10.7863315954009 8.4964649771124 2.28986661828853 T:C C T 10 0.531029061069525 0.522770831369259 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 63 78 141 29.5451691526199 41.4202667634229 -11.875097610803 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0519651282531938 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 212 216 428 99.4218390532607 114.702277191017 -15.2804381377567 T:C T C 10 0.531029061069525 0.146245032056653 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 75494780 A/T 1 161 137 298 75.5043211678065 72.7509813665249 2.75333980128156 A:T A T 10 0.531029061069525 0.77183257954837 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 76167047 C/T 1 297 333 630 139.284368862351 176.832677336152 -37.5483084738007 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00310676805420444 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 17 16 33 7.97250596181808 8.4964649771124 -0.523959015294324 A:G A G 10 0.531029061069525 0.86349039013865 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 76482432 A/G 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 A:G A G 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76482306_76482588:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76482306_76482588:DNAH17 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 20 18 38 9.3794187786095 9.55852309925145 -0.179104320641947 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 21 20 41 9.84838971753998 10.6205812213905 -0.772191503850523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.876136667047102 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 76831414 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76831362_76831583:USP36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 77081788 G/A 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77081702_77081816:ENGASE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 78348319 A/C 1 3 13 16 1.40691281679143 6.90337779390382 -5.4964649771124 A:C A C 10 0.531029061069525 0.00974495579100687 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78348258_78348389:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78348258_78348389:RNF213 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79478007 G/A 1 4388 3587 7975 2057.84448002692 1904.80124205639 153.043237970538 A:T:C:G G A 10 0.531029061069525 0.000595990552956191 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:C C A 10 0.531029061069525 0.565641303351698 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 0 0 31 31 0 16.4619008931553 -16.4619008931553 G A G 10 0.531029061069525 6.39033859903358e-11 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 22 16 38 10.3173606564705 8.4964649771124 1.82089567935805 A:G G A 10 0.531029061069525 0.627202547562459 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79517566 G/A 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79517274_79518229:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79517274_79518229:C17orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79536062 C/G 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 C:G C G 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79536042_79536137:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79536042_79536137:NPLOC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 12 56 68 5.6276512671657 29.7376274198934 -24.1099761527277 T:C C T 10 0.531029061069525 2.36846354798650e-09 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 80545076 A/G 1 24 15 39 11.2553025343314 7.96543591604287 3.28986661828853 A:G A G 10 0.531029061069525 0.337160909631348 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80544939_80545148:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80544939_80545148:FOXK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 80559272 C/T 1 25 20 45 11.7242734732619 10.6205812213905 1.10369225187138 T:C C T 10 0.531029061069525 0.767362753594117 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80559179_80560262:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80559179_80562483:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000529652:exon_80559179_80560281:FOXK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 80763847 C/T 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80763751_80763887:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80763751_80763887:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80763751_80763887:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80763751_80763887:TBCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 80895933 A/G 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 A:G A G 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80895925_80896012:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80895925_80896012:TBCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 A:G G A 10 0.531029061069525 0.316197821820389 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 T:C C T 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 81006387 G/A 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006347_81006446:B3GNTL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 17 81006620 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006545_81006661:B3GNTL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 T T 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 672836 A/G 1 4 14 18 1.8758837557219 7.43440685497335 -5.55852309925145 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0092810211291724 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 197 244 441 92.3872749693036 129.571090900964 -37.1838159316605 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.000406884189171688 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 2595443 G/T 1 24 27 51 11.2553025343314 14.3377846488772 -3.08248211454577 T:G G T 10 0.531029061069525 0.402984965069796 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2595415_2595620:NDC80 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 3457539 A/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 3457607 C/T 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 9119489 A/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:T A T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9119472_9119523:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9119472_9119564:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000465096:exon_9119471_9119588:NDUFV2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 152 190 342 71.2835827174322 100.89552160321 -29.6119388857775 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00137553189456428 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 127 132 259 59.5593092441703 70.0958360611773 -10.536526817007 C:G C G 10 0.531029061069525 0.191671379895539 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 26 18 44 12.1932444121924 9.55852309925145 2.6347213129409 T:C T C 10 0.531029061069525 0.453610964491796 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 35 31 66 16.4139828625666 16.4619008931553 -0.0479180305886473 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 77 55 132 36.1107622976466 29.2065983588239 6.90416393882271 A:G A G 10 0.531029061069525 0.256929482503237 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 13731574 G/C 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 C:G G C 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000101654:ENST00000383314:exon_13731475_13731933:RNMT;ENSG00000101654:ENST00000262173:exon_13731473_13731933:RNMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 19153494 C/T 1 13 15 28 6.09662220609618 7.96543591604287 -1.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.571111918143577 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 28 21 49 13.1311862900533 11.15161028246 1.97957600759328 T:C T C 10 0.531029061069525 0.668105156925642 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 7 15 22 3.28279657251333 7.96543591604287 -4.68263934352955 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0543736988605008 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 T:C T C 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 28 37 65 13.1311862900533 19.6480752595724 -6.51688896951912 T:C C T 10 0.531029061069525 0.107946113492358 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 11 23 34 5.15868032823523 12.2136684045991 -7.05498807636385 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0162973370267881 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 64 73 137 30.0141400915504 38.7651214580753 -8.75098136652492 T:C C T 10 0.531029061069525 0.145672135693780 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 10 13 23 4.68970938930475 6.90337779390382 -2.21366840459907 A:C A C 10 0.531029061069525 0.406694379844076 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 48604810 G/A 1 12 16 28 5.6276512671657 8.4964649771124 -2.8688137099467 A:G G A 10 0.531029061069525 0.344371932689015 ENSG00000141646:ENST00000342988:exon_48604626_48611409:SMAD4;ENSG00000141646:ENST00000398417:exon_48604626_48611415:SMAD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56149099 T/C 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 T:C T C 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 T:C C T 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56202120 G/A 1 12 14 26 5.6276512671657 7.43440685497335 -1.80675558780765 A:G G A 10 0.531029061069525 0.557227256665403 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56202394 C/T 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.155286387026531 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56202470 G/A 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 A:G G A 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56202683 T/C 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 T:C T C 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 25 14 39 11.7242734732619 7.43440685497335 4.28986661828853 A:C C A 10 0.531029061069525 0.199868686457106 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 15 12 27 7.03456408395713 6.3723487328343 0.662215351122826 A:T A T 10 0.531029061069525 0.849045079367674 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 15 16 31 7.03456408395713 8.4964649771124 -1.46190089315527 A:G G A 10 0.531029061069525 0.719571891946296 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 15 7 22 7.03456408395713 3.71720342748667 3.31736065647045 T:C C T 10 0.531029061069525 0.200508636918786 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 35 14 49 16.4139828625666 7.43440685497335 8.97957600759328 C:G G C 10 0.531029061069525 0.00996747814217636 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 21 12 33 9.84838971753998 6.3723487328343 3.47604098470568 A:G A G 10 0.531029061069525 0.295304352398917 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 21 15 36 9.84838971753998 7.96543591604287 1.8829538014971 T:G G T 10 0.531029061069525 0.617439051565223 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 19 14 33 8.91044783967903 7.43440685497335 1.47604098470568 T:G T G 10 0.531029061069525 0.727864253683201 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 27 7 34 12.6622153511228 3.71720342748667 8.94501192363615 A:C A C 10 0.531029061069525 0.00181672090387229 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 10 31 41 4.68970938930475 16.4619008931553 -11.7721915038505 T:G T G 10 0.531029061069525 0.000238177345173650 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 30 17 47 14.0691281679143 9.02749403818192 5.04163412973233 A:T A T 10 0.531029061069525 0.146835381414607 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 41 6 47 19.2278084961495 3.18617436641715 16.0416341297323 T:G T G 10 0.531029061069525 1.0857953914716e-06 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 49 6 55 22.9795760075933 3.18617436641715 19.7934016411761 C:G C G 10 0.531029061069525 1.52100132813912e-08 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 47 3 50 22.0416341297323 1.59308718320857 20.4485469465238 T:C C T 10 0.531029061069525 4.18457260054674e-10 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 45 4 49 21.1036922518714 2.1241162442781 18.9795760075933 T:C C T 10 0.531029061069525 7.40844811335486e-09 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 29 22 51 13.6001572289838 11.6826393435295 1.91751788545423 A:C A C 10 0.531029061069525 0.674401272876237 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 23 12 35 10.7863315954009 6.3723487328343 4.41398286256663 A:G G A 10 0.531029061069525 0.174846173121857 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:C C T 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 5 18 23 2.34485469465238 9.55852309925145 -7.21366840459907 T:G T G 10 0.531029061069525 0.00287306870011992 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 5 23 28 2.34485469465238 12.2136684045991 -9.8688137099467 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000189281054406056 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 2 30 32 0.93794187786095 15.9308718320857 -14.9929299542248 T:C T C 10 0.531029061069525 2.17734699652697e-08 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 3 24 27 1.40691281679143 12.7446974656686 -11.3377846488772 T:C C T 10 0.531029061069525 7.18717551105113e-06 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 7 67 74 3.28279657251333 35.5789470916582 -32.2961505191448 T:C C T 10 0.531029061069525 2.39372293774845e-15 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 A:G G A 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 49 30 79 22.9795760075933 15.9308718320857 7.04870417550753 A:G G A 10 0.531029061069525 0.115880406339902 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 50 23 73 23.4485469465238 12.2136684045991 11.2348785419247 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.00950329709258497 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 62 34 96 29.0761982136895 18.0549880763638 11.0212101373256 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0245857991288277 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 27 19 46 12.6622153511228 10.089552160321 2.57266319080185 T:C T C 10 0.531029061069525 0.464479789669299 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 72776121 G/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72775106_72777628:ZNF407 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 72913537 C/A 1 37 41 78 17.3519247404276 21.7721915038505 -4.42026676342295 A:C C A 10 0.531029061069525 0.364235286889062 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 16 17 33 7.5035350228876 9.02749403818192 -1.52395901529432 T:C C T 10 0.531029061069525 0.60583239076914 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 54 45 99 25.3244307022457 23.8963077481286 1.42812295411703 A:C A C 10 0.531029061069525 0.840549604219979 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 77893683 A/G 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G A G 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 18 77895192 G/A 1 15 8 23 7.03456408395713 4.2482324885562 2.78633159540093 A:G G A 10 0.531029061069525 0.298418661125429 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 52 66 118 24.3864888243847 35.0479180305886 -10.6614292062039 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0527717856720469 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 133 265 398 62.3731348777532 140.722701183424 -78.3495663056709 T:C C T 10 0.531029061069525 3.15743063466466e-15 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 181 323 504 84.883739946416 171.522386725457 -86.6386467790406 A:C:G C G 10 0.531029061069525 9.4420777653636e-15 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 16 6 22 7.5035350228876 3.18617436641715 4.31736065647045 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0861119295570477 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 T:G T G 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 804079 T/C 1 37 53 90 17.3519247404276 28.1445402366848 -10.7926154962572 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0261818936953226 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804036_804208:PTBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 871222 G/A 1 42 34 76 19.69677943508 18.0549880763638 1.6417913587161 A:G G A 10 0.531029061069525 0.731526027959435 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 872089 A/G 1 22 7 29 10.3173606564705 3.71720342748667 6.60015722898378 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0150747519832241 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 33 28 61 15.4760409847057 14.8688137099467 0.607227274758976 A:G A G 10 0.531029061069525 0.898652889759515 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 965043 T/C 1 37 28 65 17.3519247404276 14.8688137099467 2.48311103048088 T:C T C 10 0.531029061069525 0.619484275057129 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_964833_965080:ARID3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 16 14 30 7.5035350228876 7.43440685497335 0.0691281679142506 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 42 32 74 19.69677943508 16.9929299542248 2.70384948085515 C:G C G 10 0.531029061069525 0.561724176100123 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 991968 T/C 1 53 79 132 24.8554597633152 41.9512958244925 -17.0958360611773 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00297726584179615 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 31 38 69 14.5380991068447 20.1791043206419 -5.64100521379722 A:G A G 10 0.531029061069525 0.185697314577702 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 134 78 212 62.8421058166837 41.4202667634229 21.4218390532607 C:G C G 10 0.531029061069525 0.00374780114855074 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 135 78 213 63.3110767556141 41.4202667634229 21.8908099921912 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00306623325738993 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1058848 G/A 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1058819_1058939:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1058819_1058939:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1058819_1058939:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000532194:exon_1058819_1058939:ABCA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1059056 G/A 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 A:G G A 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1059022_1059084:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1059022_1059084:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1059022_1059084:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000532194:exon_1059022_1059262:ABCA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G G A 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 21 9 30 9.84838971753998 4.77926154962572 5.06912816791425 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0689479697692445 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 21 9 30 9.84838971753998 4.77926154962572 5.06912816791425 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0689479697692445 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 130 138 268 60.9662220609618 73.2820104275944 -12.3157883666327 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.141815656709877 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1104874 C/T 1 19 15 34 8.91044783967903 7.96543591604287 0.945011923636152 T:C C T 10 0.531029061069525 0.863959540191866 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 12 8 20 5.6276512671657 4.2482324885562 1.3794187786095 A:G G A 10 0.531029061069525 0.655962224425547 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 448 470 918 210.098980640853 249.583658702677 -39.4846780618239 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.00986076960006635 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 36 48 84 16.8829538014971 25.4893949313372 -8.6064411298401 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.0634614966748603 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 36 52 88 16.8829538014971 27.6135111756153 -10.7305573741182 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0246210166456367 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 46 48 94 21.5726631908019 25.4893949313372 -3.91673174053535 A:G G A 10 0.531029061069525 0.46965922962455 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 60 78 138 28.1382563358285 41.4202667634229 -13.2820104275944 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0263487257603878 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 88 89 177 41.2694426258818 47.2615864351877 -5.99214380930592 A:G G A 10 0.531029061069525 0.367461315215727 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 22 12 34 10.3173606564705 6.3723487328343 3.94501192363615 A:G A G 10 0.531029061069525 0.228695302733772 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 41 52 93 19.2278084961495 27.6135111756153 -8.38570267946582 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0960033407055634 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 43 32 75 20.1657503740104 16.9929299542248 3.17282041978563 T:C T C 10 0.531029061069525 0.489279978917432 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 39 23 62 18.2898666182885 12.2136684045991 6.07619821368945 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128381663238238 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 55 46 101 25.7934016411761 24.4273368091981 1.36606483197798 A:G G A 10 0.531029061069525 0.84216322627404 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 17 8 25 7.97250596181808 4.2482324885562 3.72427347326188 A:G A G 10 0.531029061069525 0.162155191023961 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2118692 C/T 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2118600_2118831:AP3D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2129347 G/A 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 A:G G A 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2129317_2129456:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2129317_2129456:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2129317_2129456:AP3D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:G T G 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 32 52 84 15.0070700457752 27.6135111756153 -12.6064411298401 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00617913014601715 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2273146 C/T 1 1227 1378 2605 575.427342067693 731.758046153805 -156.330704086113 A:T:C C T 10 0.531029061069525 9.8228109020789e-10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2344637 C/T 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 T:C C T 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2344551_2344650:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2344551_2344650:AC004410.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2353148 T/C 1 18 24 42 8.44147690074855 12.7446974656686 -4.30322056492005 T:C T C 10 0.531029061069525 0.216399168769630 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2834595 C/T 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000172006:ENST00000317243:exon_2833679_2836733:ZNF554 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 2852744 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000186300:ENST00000334241:exon_2852378_2857682:ZNF555;ENSG00000186300:ENST00000382127:exon_2852381_2853428:ZNF555 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 16 22 38 7.5035350228876 11.6826393435295 -4.17910432064195 A:G G A 10 0.531029061069525 0.195054952625508 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:G G T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 3614538 C/T 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3614395_3614587:C19orf29 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 74 71 145 34.7038494808552 37.7030633359363 -2.99921385508112 A:G G A 10 0.531029061069525 0.61884424719634 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 947 827 1774 444.11547916716 439.161033504497 4.95444566266269 A:G G A 10 0.531029061069525 0.830482562408693 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 999 929 1928 468.501967991545 493.325997733589 -24.8240297420441 A:C:G A G 10 0.531029061069525 0.263531347818008 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 16 15 31 7.5035350228876 7.96543591604287 -0.461900893155274 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 A:G A G 10 0.531029061069525 0.825489956938963 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 21 17 38 9.84838971753998 9.02749403818192 0.820895679358051 A:G A G 10 0.531029061069525 0.871457312909828 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 17 18 35 7.97250596181808 9.55852309925145 -1.58601713743337 A:G G A 10 0.531029061069525 0.615023862763492 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 48 43 91 22.5106050686628 22.8342496259896 -0.323644557326773 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 58 48 106 27.2003144579676 25.4893949313372 1.71091952663035 A:G G A 10 0.531029061069525 0.770914274210604 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 14 16 30 6.56559314502665 8.4964649771124 -1.93087183208575 T:C T C 10 0.531029061069525 0.583962242482046 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 13 18 31 6.09662220609618 9.55852309925145 -3.46190089315527 T:C C T 10 0.531029061069525 0.28009400014822 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 A:G A G 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 47 53 100 22.0416341297323 28.1445402366848 -6.1029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.230419534009374 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6737481 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6737509 G/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6737468_6737633:GPR108 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:C T C 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6759631 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6759605_6759681:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6759605_6759681:SH2D3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6760974 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7125297 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7125518 C/T 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 C C 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7166376 C/T 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7533767 T/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 T:G T G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7606908 G/C 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 C:G G C 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7606870_7606953:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7606870_7606953:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7606870_7606953:PNPLA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 27 42 69 12.6622153511228 22.30322056492 -9.64100521379722 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0217965160506929 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 86 68 154 40.3315007480209 36.1099761527277 4.22152459529315 T:C T C 10 0.531029061069525 0.518978826558758 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G A G 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 7975658 C/T 1 16 14 30 7.5035350228876 7.43440685497335 0.0691281679142506 T:C:G C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 108 111 219 50.6488614044913 58.9442257787173 -8.29536437422596 A:G A G 10 0.531029061069525 0.27880729664048 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 8376431 G/A 1 60 71 131 28.1382563358285 37.7030633359363 -9.56480700010777 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0968424573869498 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8376234_8376479:NDUFA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 A:T A T 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 116 120 236 54.4006289159351 63.723487328343 -9.3228584124079 C:G C G 10 0.531029061069525 0.240447429390577 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 29 53 82 13.6001572289838 28.1445402366848 -14.544383007701 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00176956740183844 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 401 424 825 188.05734651112 225.156321893479 -37.0989753823581 A:T:C:G A G 10 0.531029061069525 0.00983433861199823 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 242 249 491 113.490967221175 132.226236206312 -18.7352689851368 A:G A G 10 0.531029061069525 0.094316180512608 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 22 16 38 10.3173606564705 8.4964649771124 1.82089567935805 T:G T G 10 0.531029061069525 0.627202547562459 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 223 237 460 104.580519381496 125.853887473477 -21.2733680919815 A:T:G T A 10 0.531029061069525 0.0496938184996931 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 C:G C G 10 0.531029061069525 0.758608684310008 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10395769 G/A 1 13 2 15 6.09662220609618 1.06205812213905 5.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0090204421231964 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:C A C 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10431799 G/T 1 35 47 82 16.4139828625666 24.9583658702677 -8.54438300770105 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0606483462478244 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10431724_10431935:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10431766_10431935:RAVER1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10445805 T/C 1 204 133 337 95.6700715418169 70.6268651222468 25.0432064195701 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00632230312243576 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10445742_10446029:ICAM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10446568 T/C 1 154 120 274 72.2215245952932 63.723487328343 8.49803726695016 T:C T C 10 0.531029061069525 0.332822821403674 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10446347_10446652:ICAM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10449358 T/C 1 241 143 384 113.021996282244 75.9371557329421 37.0848405493024 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000148872892670711 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10449358_10449624:ICAM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 14 8 22 6.56559314502665 4.2482324885562 2.31736065647045 A:G A G 10 0.531029061069525 0.395246671022453 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 A:G A G 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 47 53 100 22.0416341297323 28.1445402366848 -6.1029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.230419534009374 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 18 15 33 8.44147690074855 7.96543591604287 0.476040984705676 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 10679240 C/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 C:G C G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000129355:ENST00000393599:exon_10679189_10679631:CDKN2D;ENSG00000129355:ENST00000335766:exon_10679189_10679344:CDKN2D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 65 77 142 30.4831110304809 40.8892377023534 -10.4061266718725 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0923299412760615 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 45 37 82 21.1036922518714 19.6480752595724 1.45561699229895 C:G C G 10 0.531029061069525 0.825057450201814 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 46 35 81 21.5726631908019 18.5860171374334 2.98664605336848 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.578068256840754 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 32 25 57 15.0070700457752 13.2757265267381 1.73134351903708 A:G G A 10 0.531029061069525 0.691810045489915 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14518951 C/T 0 288 0 288 135.063630411977 0 135.063630411977 C C 10 0.531029061069525 1.25769110175171e-79 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14582539 C/T 1 137 114 251 64.2490186334751 60.5373129619258 3.71170567154923 T:C C T 10 0.531029061069525 0.65833213551946 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 17 9 26 7.97250596181808 4.77926154962572 3.19324441219235 T:C C T 10 0.531029061069525 0.24166113324983 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 15 14 29 7.03456408395713 7.43440685497335 -0.399842771016225 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 17 9 26 7.97250596181808 4.77926154962572 3.19324441219235 A:G A G 10 0.531029061069525 0.24166113324983 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 22 19 41 10.3173606564705 10.089552160321 0.227808496149477 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 15565646 G/A 1 63 47 110 29.5451691526199 24.9583658702677 4.58680328235225 A:G G A 10 0.531029061069525 0.391649538318637 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15565468_15565704:RASAL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 16259623 C/T 1 11 16 27 5.15868032823523 8.4964649771124 -3.33778464887717 T:C C T 10 0.531029061069525 0.247571337207832 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 25 13 38 11.7242734732619 6.90337779390382 4.82089567935805 T:C C T 10 0.531029061069525 0.143265968186043 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 C:G G C 10 0.531029061069525 0.155286387026531 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 22 20 42 10.3173606564705 10.6205812213905 -0.303220564920048 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17337557 G/T 1 20 23 43 9.3794187786095 12.2136684045991 -2.83424962598957 T:G G T 10 0.531029061069525 0.44568428015896 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 18 13 31 8.44147690074855 6.90337779390382 1.53809910684473 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.595688867854144 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17387421 G/A 1 47 27 74 22.0416341297323 14.3377846488772 7.70384948085515 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0806357376259078 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17387304_17387433:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17387304_17387433:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17387304_17387433:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000448635:exon_17387304_17387475:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17387304_17387433:C19orf62 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17412218 C/T 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 T:C C T 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 A:C A C 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 72 91 163 33.7659076029942 48.3236445573268 -14.5577369543326 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0229250522020253 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17664090 C/T 1 25 26 51 11.7242734732619 13.8067555878076 -2.08248211454577 T:C C T 10 0.531029061069525 0.577354633027695 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 23 25 48 10.7863315954009 13.2757265267381 -2.4893949313372 T:C C T 10 0.531029061069525 0.474316470538493 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 45 43 88 21.1036922518714 22.8342496259896 -1.7305573741182 A:G G A 10 0.531029061069525 0.749172074288311 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 66 82 148 30.9520819694114 43.5443830077011 -12.5923010382897 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0396093991122018 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 56 57 113 26.2623725801066 30.2686564809629 -4.00628390085632 C:G C G 10 0.531029061069525 0.45273000071716 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 88 3 91 41.2694426258818 1.59308718320857 39.6763554426732 T:C C T 10 0.531029061069525 1.01900303208690e-20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 2894 2768 5662 1357.20189726479 1469.88844104045 -112.68654377565 T:C:G G T 10 0.531029061069525 0.00273402750378601 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 14 17 31 6.56559314502665 9.02749403818192 -2.46190089315527 T:C C T 10 0.531029061069525 0.472257159636515 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 19230816 T/C 1 37 49 86 17.3519247404276 26.0204239924067 -8.66849925197915 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0663376285285945 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 36 28 64 16.8829538014971 14.8688137099467 2.0141400915504 A:G A G 10 0.531029061069525 0.707439027541832 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 19745479 C/T 1 43 36 79 20.1657503740104 19.1170461985029 1.04870417550753 T:C C T 10 0.531029061069525 0.82282653648326 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19745316_19745512:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19745316_19745512:GMIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 20116963 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000397162:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20115227_20118084:ZNF682 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 21300462 A/G 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 21990916 C/G 1 18 14 32 8.44147690074855 7.43440685497335 1.0070700457752 C:G C G 10 0.531029061069525 0.859782086036622 ENSG00000198521:ENST00000397148:exon_21990085_21992609:ZNF43;ENSG00000198521:ENST00000354959:exon_21990128_21992609:ZNF43 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 21992247 T/C 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:C T C 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000198521:ENST00000397148:exon_21990085_21992609:ZNF43;ENSG00000198521:ENST00000354959:exon_21990128_21992609:ZNF43 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 14 23 37 6.56559314502665 12.2136684045991 -5.64807525957242 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0704727836063179 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 23836322 C/T 1 12 8 20 5.6276512671657 4.2482324885562 1.3794187786095 T:C C T 10 0.531029061069525 0.655962224425547 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23836028_23837080:ZNF675 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 0 60 0 60 28.1382563358285 0 28.1382563358285 C C 10 0.531029061069525 3.34238537253042e-17 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 30314666 C/T 1 38 26 64 17.8208956793581 13.8067555878076 4.0141400915504 T:C C T 10 0.531029061069525 0.38080273517839 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30314562_30315216:CCNE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 11 2 13 5.15868032823523 1.06205812213905 4.09662220609617 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0257188033078452 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33183291 G/A 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33183316 A/G 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G A G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 5 11 16 2.34485469465238 5.84131967176477 -3.4964649771124 A:T T A 10 0.531029061069525 0.130325747480968 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33390796 G/A 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33390763_33390904:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33390763_33390904:CCDC123 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 15 7 22 7.03456408395713 3.71720342748667 3.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.200508636918786 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 13 13 26 6.09662220609618 6.90337779390382 -0.806755587807649 A:G G A 10 0.531029061069525 0.84501811777777 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 33467620 T/C 1 14 7 21 6.56559314502665 3.71720342748667 2.84838971753998 T:C T C 10 0.531029061069525 0.275352070578657 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 34895647 G/A 1 15 16 31 7.03456408395713 8.4964649771124 -1.46190089315527 A:G G A 10 0.531029061069525 0.719571891946296 ENSG00000126249:ENST00000246535:exon_34895554_34895720:PDCD2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35175306 G/A 1 20 13 33 9.3794187786095 6.90337779390382 2.47604098470568 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486056052297342 ENSG00000089335:ENST00000509528:exon_35175157_35175446:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505163:exon_35175157_35175369:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000507959:exon_35174897_35175310:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 T:C C T 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 252 216 468 118.18067661048 114.702277191017 3.47839941946232 A:G A G 10 0.531029061069525 0.78113712570484 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35660508 G/A 1 476 342 818 223.230166930906 181.611938885778 41.6182280451286 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00362470198828809 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35660469_35660536:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 16 7 23 7.5035350228876 3.71720342748667 3.78633159540093 A:G G A 10 0.531029061069525 0.143736519391274 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 11 14 25 5.15868032823523 7.43440685497335 -2.27572652673812 T:C C T 10 0.531029061069525 0.424884149322681 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 35827226 G/C 1 182 219 401 85.3527108853465 116.295364374226 -30.9426534888795 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.00223425110265458 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35826939_35827244:CD22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36207510 G/A 1 163 192 355 76.4422630456674 101.957579725349 -25.5153166796814 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0077522438734902 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36207380_36207940:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36207380_36207940:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36207380_36207654:ZBTB32 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36224674 G/A 1 4 10 14 1.8758837557219 5.31029061069525 -3.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 0.104946989484194 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 A:G A G 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36234727 C/A 1 14 4 18 6.56559314502665 2.1241162442781 4.44147690074855 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0558087683526188 ENSG00000161265:ENST00000292879:exon_36234710_36234805:U2AF1L4;ENSG00000161265:ENST00000378975:exon_36234710_36234805:U2AF1L4;ENSG00000161265:ENST00000412391:exon_36234710_36234805:U2AF1L4;ENSG00000161265:ENST00000392196:exon_36234611_36234805:U2AF1L4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36501788 G/T 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:G G T 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000239382:ENST00000471323:exon_36501469_36504324:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000392183:exon_36501192_36501947:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000468004:exon_36501446_36501979:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000466196:exon_36501640_36501947:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000475223:exon_36501640_36501979:ALKBH6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36594063 C/T 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594058_36594109:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594058_36594109:WDR62 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 48 47 95 22.5106050686628 24.9583658702677 -2.44776080160487 A:G G A 10 0.531029061069525 0.681160596122415 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 37118439 C/T 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 6 19 25 2.81382563358285 10.089552160321 -7.27572652673812 T:G G T 10 0.531029061069525 0.00426423964625518 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 17 24 41 7.97250596181808 12.7446974656686 -4.77219150385052 T:C C T 10 0.531029061069525 0.159175262557064 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39215172 T/C 1 93 67 160 43.6142973205342 35.5789470916582 8.03535022887601 T:C T C 10 0.531029061069525 0.206187639126827 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39215071_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39215099_39215205:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39215071_39215205:ACTN4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 171 171 342 80.1940305571112 90.8059694428888 -10.6119388857775 T:C T C 10 0.531029061069525 0.255574520587092 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39329205 C/T 1 212 243 455 99.4218390532607 129.040061839895 -29.6182227866339 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00556352034817244 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39329037_39329238:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39329037_39329238:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388749:exon_39329037_39329238:HNRNPL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39360597 C/T 1 21 21 42 9.84838971753998 11.15161028246 -1.30322056492005 T:C C T 10 0.531029061069525 0.757903639286444 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39360720 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39360583_39360900:RINL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 39908574 C/T 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000378550:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000409797:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39908545_39908745:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000478523:exon_39908485_39908745:PLEKHG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40023308 A/G 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 4 12 16 1.8758837557219 6.3723487328343 -4.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0415470826185352 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 24 16 40 11.2553025343314 8.4964649771124 2.758837557219 T:C T C 10 0.531029061069525 0.430306504225225 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 51 36 87 23.9175178854542 19.1170461985029 4.80047168695133 C:G C G 10 0.531029061069525 0.334234804987653 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 56 48 104 26.2623725801066 25.4893949313372 0.772977648769402 A:G A G 10 0.531029061069525 0.921897181099898 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40739770 G/A 1 46 36 82 21.5726631908019 19.1170461985029 2.45561699229895 A:G G A 10 0.531029061069525 0.65837463052384 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000489375:exon_40739575_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000496089:exon_40739662_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000311278:exon_40739728_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000424901:exon_40739728_40739858:AKT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 40928944 A/G 1 20 32 52 9.3794187786095 16.9929299542248 -7.6135111756153 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0372980922097737 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C T C 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41884337 C/T 1 11 12 23 5.15868032823523 6.3723487328343 -1.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.678732618130644 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000342187:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000413014:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000436170:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000447302:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41884186_41884424:TMEM91 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 16 13 29 7.5035350228876 6.90337779390382 0.600157228983776 T:C T C 10 0.531029061069525 0.854638890595023 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41892607 G/A 1 74 77 151 34.7038494808552 40.8892377023534 -6.18538822149826 A:G G A 10 0.531029061069525 0.328422192577966 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41892281_41892630:EXOSC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 23 16 39 10.7863315954009 8.4964649771124 2.28986661828853 A:G G A 10 0.531029061069525 0.522770831369259 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41916547 C/T 1 35 30 65 16.4139828625666 15.9308718320857 0.483111030480877 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 67 53 120 31.4210529083418 28.1445402366848 3.27651267165701 T:C C T 10 0.531029061069525 0.583734750230164 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 112 94 206 52.5247451602132 49.9167317405353 2.60801341967785 A:G A G 10 0.531029061069525 0.727604572468245 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 14 13 27 6.56559314502665 6.90337779390382 -0.337784648877174 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 29 29 58 13.6001572289838 15.3998427710162 -1.79968554203245 T:C C T 10 0.531029061069525 0.693726192526832 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 42408426 G/A 1 39 34 73 18.2898666182885 18.0549880763638 0.234878541924679 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42408368_42408535:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42408368_42408535:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42408368_42408535:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42408368_42408535:ARHGEF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 78 76 154 36.5797332365771 40.3582086412839 -3.77847540470684 T:C C T 10 0.531029061069525 0.57228867539837 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 A:G A G 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 42730217 C/T 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 T:C C T 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000167625:ENST00000301215:exon_42728539_42732353:ZNF526;ENSG00000167625:ENST00000437878:exon_42729112_42731204:ZNF526 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 6 11 17 2.81382563358285 5.84131967176477 -3.02749403818192 T:G G T 10 0.531029061069525 0.152901098416829 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 9 23 32 4.22073845037428 12.2136684045991 -7.9929299542248 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00689154748057816 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44610843 C/T 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44662381 C/T 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44792969 G/A 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44981375 T/C 1 9 7 16 4.22073845037428 3.71720342748667 0.503535022887601 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 44981883 C/G 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 C:G C G 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 5 11 16 2.34485469465238 5.84131967176477 -3.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.130325747480968 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 18 12 30 8.44147690074855 6.3723487328343 2.06912816791425 T:G T G 10 0.531029061069525 0.471080663772328 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 23 18 41 10.7863315954009 9.55852309925145 1.22780849614948 A:G G A 10 0.531029061069525 0.755809666900097 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 T:G T G 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 31 30 61 14.5380991068447 15.9308718320857 -1.39277272524102 A:C A C 10 0.531029061069525 0.797804774628347 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 29 40 69 13.6001572289838 21.241162442781 -7.64100521379722 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0707020639635386 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 20 28 48 9.3794187786095 14.8688137099467 -5.4893949313372 A:G G A 10 0.531029061069525 0.147355080619299 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45912750 G/A 1 25 11 36 11.7242734732619 5.84131967176477 5.8829538014971 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0649003087310837 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 42 30 72 19.69677943508 15.9308718320857 3.7659076029942 A:G A G 10 0.531029061069525 0.409532307893651 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 25 22 47 11.7242734732619 11.6826393435295 0.0416341297323264 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 8 14 22 3.7517675114438 7.43440685497335 -3.68263934352955 A:C C A 10 0.531029061069525 0.136441945320730 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 26 5 31 12.1932444121924 2.65514530534762 9.53809910684473 T:C C T 10 0.531029061069525 0.000466078949121455 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 27 5 32 12.6622153511228 2.65514530534762 10.0070700457752 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000284538052329100 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46141845 T/C 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 T:C T C 10 0.531029061069525 0.155286387026531 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46141763_46141892:EML2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46216642 G/T 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 T:G G T 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46281876 C/T 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46281751_46281899:DMPK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 84 97 181 39.3935588701599 51.5098189237439 -12.116260053584 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0740630934278855 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 41 25 66 19.2278084961495 13.2757265267381 5.95208196941135 T:C C T 10 0.531029061069525 0.174486354841983 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 48 17 65 22.5106050686628 9.02749403818192 13.4831110304809 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000718477983327351 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 16 13 29 7.5035350228876 6.90337779390382 0.600157228983776 C:G C G 10 0.531029061069525 0.854638890595023 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 144 147 291 67.5318152059884 78.0612719772202 -10.5294567712318 C:G C G 10 0.531029061069525 0.218006047921706 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 47548678 G/A 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000130751:ENST00000253050:exon_47548449_47549033:NPAS1;ENSG00000130751:ENST00000439365:exon_47548449_47549033:NPAS1;ENSG00000130751:ENST00000449844:exon_47548449_47549016:NPAS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 47588325 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47588313_47588452:ZC3H4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48248924 G/A 1 548 489 1037 256.9960745339 259.673210862998 -2.67713632909744 A:G G A 10 0.531029061069525 0.876403758089664 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48248925 C/A 1 486 432 918 227.919876320211 229.404554382035 -1.4846780618239 A:T:C C A 10 0.531029061069525 0.921022090662236 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 331 406 737 155.229380785987 215.597798794227 -60.3684180082399 A:T:C:G A G 10 0.531029061069525 9.11769953970095e-06 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 57 2 59 26.7313435190371 1.06205812213905 25.669285396898 A:T A T 10 0.531029061069525 1.15572219302814e-13 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48558286 G/A 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48558135_48558306:PLA2G4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48598823 A/G 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48598721_48598861:PLA2G4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 T:C T C 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 19 12 31 8.91044783967903 6.3723487328343 2.53809910684473 C:G C G 10 0.531029061069525 0.375722831482458 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 15 15 30 7.03456408395713 7.96543591604287 -0.930871832085749 A:G A G 10 0.531029061069525 0.85526692479372 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 48668830 G/A 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G G A 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49132634 G/A 1 14 26 40 6.56559314502665 13.8067555878076 -7.241162442781 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0258961500444562 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49132118_49133030:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131938_49132983:SPHK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49303070 G/C 1 40 34 74 18.758837557219 18.0549880763638 0.703849480855155 C:G G C 10 0.531029061069525 0.907646449048922 ENSG00000105552:ENST00000316273:exon_49302932_49303095:BCAT2;ENSG00000105552:ENST00000402551:exon_49302932_49303095:BCAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1453 1811 3264 681.41477426598 961.69362959691 -280.278855330929 A:T:C T C 10 0.531029061069525 1.02378586469964e-22 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49611319 C/T 1 403 317 720 188.995288388981 168.336212359039 20.659076029942 A:T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.125854413676695 ENSG00000104852:ENST00000221448:exon_49611052_49611869:SNRNP70;ENSG00000104852:ENST00000438617:exon_49611079_49611700:SNRNP70;ENSG00000104852:ENST00000401730:exon_49611052_49611860:SNRNP70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 A:T A T 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:G T G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 T:C C T 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 151 176 327 70.8146117785017 93.4611147482364 -22.6465029697347 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0126184042032349 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50191507 C/T 1 368 299 667 172.581305526415 158.777689259788 13.8036162666268 A:T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.294947037902328 ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50191419_50191704:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50191419_50191585:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50191419_50191585:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000530361:exon_50191419_50191676:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000527866:exon_50191419_50192286:PRMT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50412417 G/A 1 110 114 224 51.5868032823523 60.5373129619258 -8.95050967957359 A:G G A 10 0.531029061069525 0.255047686084855 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50436371 G/A 1 340 128 468 159.450119236362 67.9717198168992 91.4783994194623 A:G G A 10 0.531029061069525 5.89326116183635e-18 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50496183 C/T 1 18 25 43 8.44147690074855 13.2757265267381 -4.83424962598957 T:C C T 10 0.531029061069525 0.168821973797197 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50496117_50496209:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50496117_50496209:VRK3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50965272 T/C 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50965157_50965293:MYBPC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 5 15 20 2.34485469465238 7.96543591604287 -5.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0132875954363033 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 29 32 61 13.6001572289838 16.9929299542248 -3.39277272524102 T:C C T 10 0.531029061069525 0.441833823500697 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 31 90 121 14.5380991068447 47.7926154962572 -33.2545163894125 C:G C G 10 0.531029061069525 1.23441664616371e-09 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 35 101 136 16.4139828625666 53.633935168022 -37.2199523054554 A:G A G 10 0.531029061069525 1.24424701724541e-10 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 51379893 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000167751:ENST00000325321:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000358049:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000423722:exon_51379728_51380014:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000391810:exon_51379728_51380014:KLK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 51916979 G/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51916966_51917077:SIGLEC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 52619065 T/C 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C T C 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 52793328 G/A 1 14 3 17 6.56559314502665 1.59308718320857 4.97250596181807 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0155714027927555 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 52793332 A/G 1 14 2 16 6.56559314502665 1.06205812213905 5.5035350228876 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00529413610109498 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 52869534 G/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000167554:ENST00000403906:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000321287:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000327920:exon_52868951_52870111:ZNF610 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53117549 G/C 1 6 14 20 2.81382563358285 7.43440685497335 -4.6205812213905 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0442922401162171 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53270543 A/G 1 23 12 35 10.7863315954009 6.3723487328343 4.41398286256663 A:G A G 10 0.531029061069525 0.174846173121857 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53270623 G/C 1 12 22 34 5.6276512671657 11.6826393435295 -6.05498807636385 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0400825976529851 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53270729 G/A 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53270971 G/C 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 C:G G C 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 53572494 G/T 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 T:G G T 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 54080279 T/C 1 11 1 12 5.15868032823523 0.531029061069525 4.6276512671657 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00748260755070337 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 54080780 C/T 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54080698_54080944:ZNF331 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 54080999 A/G 1 23 5 28 10.7863315954009 2.65514530534762 8.1311862900533 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00199317342988995 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 A:G G A 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 54968038 A/G 1 26 26 52 12.1932444121924 13.8067555878076 -1.6135111756153 A:G A G 10 0.531029061069525 0.678691595707079 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55174519 G/C 1 10 1 11 4.68970938930475 0.531029061069525 4.15868032823523 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0133926860261115 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 17 2 19 7.97250596181808 1.06205812213905 6.91044783967903 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00183586326186059 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55481398 G/A 1 1 10 11 0.468970938930475 5.31029061069525 -4.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00419409086522907 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55481367_55481663:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55481367_55481663:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55481367_55481663:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55481367_55481663:NLRP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55494651 A/G 1 1 25 26 0.468970938930475 13.2757265267381 -12.8067555878076 A:G A G 10 0.531029061069525 1.57050141770321e-07 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55494740 T/C 0 0 23 23 0 12.2136684045991 -12.2136684045991 C T C 10 0.531029061069525 2.73121833922944e-08 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 114 3 117 53.4626870380742 1.59308718320857 51.8695998548656 A:C C A 10 0.531029061069525 1.69228169422917e-27 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 74 3 77 34.7038494808552 1.59308718320857 33.1107622976466 A:C C A 10 0.531029061069525 6.16797391432444e-17 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 0 46 0 46 21.5726631908019 0 21.5726631908019 T T 10 0.531029061069525 2.66295267756004e-13 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 A:G G A 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55624113 G/A 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 A:G A G 10 0.531029061069525 0.316197821820389 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55995110 A/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 55995113 A/G 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 A:G A G 10 0.531029061069525 0.187254933265688 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 T:G G T 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 26 19 45 12.1932444121924 10.089552160321 2.10369225187138 T:C C T 10 0.531029061069525 0.553853047746523 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 40 31 71 18.758837557219 16.4619008931553 2.29693666406373 A:G G A 10 0.531029061069525 0.635159247777426 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 45 45 90 21.1036922518714 23.8963077481286 -2.79261549625725 T:C C T 10 0.531029061069525 0.5979598935856 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 92 86 178 43.1453263816037 45.6684992519791 -2.52317287037545 T:C C T 10 0.531029061069525 0.708034442107145 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56181031 C/T 1 170 183 353 79.7250596181808 97.1783181757231 -17.4532585575423 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0696626328760548 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 58058536 A/G 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 58084930 G/A 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416;ENSG00000083817:ENST00000359489:exon_58084378_58085069:ZNF416;ENSG00000083817:ENST00000428052:exon_58084378_58085069:ZNF416 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 58718269 G/A 1 8 14 22 3.7517675114438 7.43440685497335 -3.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.136441945320730 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58718087_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58718087_58718361:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58718087_58718361:ZNF274 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 19 58991638 C/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 135 123 258 63.3110767556141 65.3165745115516 -2.00549775593743 A:G A G 10 0.531029061069525 0.803346366188996 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 30 32 62 14.0691281679143 16.9929299542248 -2.92380178631055 A:G A G 10 0.531029061069525 0.524996251435255 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 51 76 127 23.9175178854542 40.3582086412839 -16.4406907558297 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00426249683374851 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 3504615 C/A 1 39 17 56 18.2898666182885 9.02749403818192 9.2623725801066 A:C:G C A 10 0.531029061069525 0.0153470992785117 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 17 14 31 7.97250596181808 7.43440685497335 0.538099106844726 A:G A G 10 0.531029061069525 0.859723747240846 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 6990020 C/T 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 7003680 T/C 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 T:C T C 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000134326:ENST00000458098:exon_7003595_7003709:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_7003595_7003709:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_7003595_7003709:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000465619:exon_7003595_7003709:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000404168:exon_7003595_7003709:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000470479:exon_7003595_7003709:CMPK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 A:C C A 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 10059868 A/G 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 42 41 83 19.69677943508 21.7721915038505 -2.07541206877058 T:C C T 10 0.531029061069525 0.661458152511297 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 17962117 T/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:T T A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 17962450 A/G 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G A G 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:G T G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 26 25 51 12.1932444121924 13.2757265267381 -1.08248211454577 T:C T C 10 0.531029061069525 0.780596289467753 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 7 16 23 3.28279657251333 8.4964649771124 -5.21366840459907 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0358368209699659 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 26357809 C/A 1 54 70 124 25.3244307022457 37.1720342748667 -11.8476035726211 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0381567493787389 ENSG00000084733:ENST00000495146:exon_26357807_26358216:RAB10;ENSG00000084733:ENST00000264710:exon_26357807_26360323:RAB10;ENSG00000084733:ENST00000462003:exon_26357807_26357905:RAB10;ENSG00000084733:ENST00000473035:exon_26357807_26357937:RAB10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 26414292 A/C 1 3 17 20 1.40691281679143 9.02749403818192 -7.6205812213905 A:C A C 10 0.531029061069525 0.000568377989825176 ENSG00000084754:ENST00000492433:exon_26414204_26414497:HADHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 70 96 166 32.8279657251333 50.9787898626744 -18.1508241375411 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00504956473468623 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 29356669 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 74 54 128 34.7038494808552 28.6755692977543 6.02828018310081 T:C T C 10 0.531029061069525 0.289691759378616 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 4 11 15 1.8758837557219 5.84131967176477 -3.96543591604287 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0665237629925474 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 37230734 C/T 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 37365483 C/T 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37365413_37365506:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37365413_37365506:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37365413_37365506:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37365413_37365506:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000379156:exon_37365413_37365506:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000496059:exon_37365413_37365506:EIF2AK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 37454811 C/T 1 84 76 160 39.3935588701599 40.3582086412839 -0.964649771123995 T:C C T 10 0.531029061069525 0.936898305226972 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 13 13 26 6.09662220609618 6.90337779390382 -0.806755587807649 A:G G A 10 0.531029061069525 0.84501811777777 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 A:C A C 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 A:C C A 10 0.531029061069525 0.457534991859192 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:G T G 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 A:T T A 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 43625184 T/A 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:T T A 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43625110_43625197:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 22 25 47 10.3173606564705 13.2757265267381 -2.95836587026767 T:C T C 10 0.531029061069525 0.46532677882094 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 45171842 A/G 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:G A G 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000138083:ENST00000260653:exon_45171707_45173216:SIX3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 46739489 A/G 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 A:G A G 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 46808168 C/T 1 41 75 116 19.2278084961495 39.8271795802144 -20.5993710840649 T:C C T 10 0.531029061069525 0.000171875535364364 ENSG00000119729:ENST00000238738:exon_46808067_46810260:RHOQ;ENSG00000119729:ENST00000489471:exon_46808067_46808409:RHOQ;ENSG00000119729:ENST00000473428:exon_46808067_46808457:RHOQ;ENSG00000119729:ENST00000489448:exon_46808067_46808185:RHOQ;ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46808076_46808730:PIGF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 47177617 C/T 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47177502_47177665:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47177560_47177665:TTC7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 28 25 53 13.1311862900533 13.2757265267381 -0.144540236684824 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 T:C T C 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 48025764 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48025750_48028294:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48025750_48028294:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48025750_48025869:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48025750_48026059:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48025750_48025766:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48025750_48025872:MSH6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 48681868 C/G 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 C:G C G 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48681734_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48681695_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48681734_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000442041:exon_48681734_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48681695_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48681734_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48681734_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48681734_48681880:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48681734_48681880:KLRAQ1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 T:C C T 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 14 19 33 6.56559314502665 10.089552160321 -3.52395901529432 A:G A G 10 0.531029061069525 0.22750273500789 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 54844790 C/T 1 9 1 10 4.22073845037428 0.531029061069525 3.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0238719986684543 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54844745_54844825:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54844745_54844825:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54844745_54844825:SPTBN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 54858154 C/T 1 31 30 61 14.5380991068447 15.9308718320857 -1.39277272524102 T:C C T 10 0.531029061069525 0.797804774628347 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 35 23 58 16.4139828625666 12.2136684045991 4.20031445796755 T:C C T 10 0.531029061069525 0.29420815610518 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 T:G G T 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 55764682 T/C 1 22 23 45 10.3173606564705 12.2136684045991 -1.89630774812862 T:C T C 10 0.531029061069525 0.654664440828348 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55764619_55764721:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000406691:exon_55764619_55764721:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55764619_55764721:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55764619_55764721:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55764619_55764721:CCDC104 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 105 108 213 49.2419485876999 57.3511385955087 -8.10919000780881 A:G A G 10 0.531029061069525 0.272605831771605 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 62998485 G/A 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G G A 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000426940:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000413434:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405482:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000494958:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000472809:exon_62998474_62999269:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_62998474_62998527:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_62998474_62998527:EHBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 64124722 C/A 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 A:C C A 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 65296798 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65296533_65296935:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65296533_65296935:CEP68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 15 5 20 7.03456408395713 2.65514530534762 4.3794187786095 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0707740552728433 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 68361859 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68361834_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68361216_68361931:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68361222_68361931:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68361834_68361931:PPP3R1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 21 25 46 9.84838971753998 13.2757265267381 -3.42733680919815 A:G A G 10 0.531029061069525 0.375670422400274 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 52 44 96 24.3864888243847 23.3652786870591 1.0212101373256 T:G G T 10 0.531029061069525 0.91862080614252 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 27 20 47 12.6622153511228 10.6205812213905 2.04163412973233 A:G G A 10 0.531029061069525 0.563201957852784 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 255 185 440 119.587589427271 98.2403762978621 21.347213129409 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0447374632190892 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 70315448 A/T 1 750 742 1492 351.728204197856 394.023563313588 -42.2953591157313 A:T:C:G A T 10 0.531029061069525 0.0293174424365184 ENSG00000169564:ENST00000303577:exon_70314585_70316332:PCBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 193 145 338 90.5113912135817 76.9992138550811 13.5121773585006 T:C C T 10 0.531029061069525 0.141638038013269 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 10 11 21 4.68970938930475 5.84131967176477 -1.15161028246002 A:C C A 10 0.531029061069525 0.66596337608169 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 43 26 69 20.1657503740104 13.8067555878076 6.35899478620278 A:C A C 10 0.531029061069525 0.14750490116076 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 64 88 152 30.0141400915504 46.7305573741182 -16.7164172825678 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00720409147606544 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 88 57 145 41.2694426258818 30.2686564809629 11.0007861449189 T:G G T 10 0.531029061069525 0.067730560988341 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 27 31 58 12.6622153511228 16.4619008931553 -3.79968554203245 A:G G A 10 0.531029061069525 0.357724384037014 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 68 40 108 31.8900238472723 21.241162442781 10.6488614044913 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0428498422247792 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 133 90 223 62.3731348777532 47.7926154962572 14.5805193814959 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0517977048973247 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 49 48 97 22.9795760075933 25.4893949313372 -2.50981892374392 A:G A G 10 0.531029061069525 0.61278261143464 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 27 34 61 12.6622153511228 18.0549880763638 -5.39277272524102 T:C C T 10 0.531029061069525 0.199275751958522 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 73800058 G/A 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 A:G G A 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73799389_73800707:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73799389_73800551:ALMS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 73829372 C/T 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 39 66 105 18.2898666182885 35.0479180305886 -16.7580514123001 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00117381524006867 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 74650634 G/T 1 71 42 113 33.2969366640637 22.30322056492 10.9937160991437 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0384793973402858 ENSG00000005448:ENST00000461531:exon_74650605_74650658:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000409791:exon_74650605_74650658:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000493982:exon_74650446_74650635:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000348227:exon_74650605_74650658:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000465134:exon_74650605_74650658:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000480089:exon_74650605_74650658:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000482880:exon_74650605_74650658:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000468778:exon_74650446_74651109:WDR54;ENSG00000005448:ENST00000469321:exon_74650605_74650658:WDR54 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 23 29 52 10.7863315954009 15.3998427710162 -4.6135111756153 A:G G A 10 0.531029061069525 0.213139105146865 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 17 17 34 7.97250596181808 9.02749403818192 -1.05498807636385 T:C C T 10 0.531029061069525 0.734239572909984 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 370 237 607 173.519247404276 125.853887473477 47.6653599307984 A:C C A 10 0.531029061069525 0.000108707576419169 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 74757613 C/G 1 59 63 122 27.669285396898 33.4548308473801 -5.78554545048205 C:G C G 10 0.531029061069525 0.318665262304031 ENSG00000115317:ENST00000258080:exon_74756504_74757639:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000462909:exon_74757572_74757639:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000467961:exon_74757588_74757639:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000352222:exon_74757117_74757639:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000437202:exon_74757173_74757639:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000484352:exon_74757296_74757639:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000465521:exon_74757553_74757639:HTRA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 C:G C G 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 75874015 C/G 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 C:G C G 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000115364:ENST00000493686:exon_75873909_75874036:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75873909_75874036:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000358788:exon_75873920_75874035:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75873929_75874036:MRPL19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 85628792 G/A 1 68 90 158 31.8900238472723 47.7926154962572 -15.9025916489849 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0132404489465801 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85628652_85628794:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628774_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 342 281 623 160.388061114222 149.219166160537 11.168894953686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.377380663993209 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 36 20 56 16.8829538014971 10.6205812213905 6.2623725801066 T:C C T 10 0.531029061069525 0.108032774919555 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 86074998 G/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000115525:ENST00000393808:exon_86074984_86075327:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393805:exon_86074984_86075327:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000377332:exon_86074984_86075327:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000525834:exon_86074984_86075327:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000393806:exon_86074984_86075327:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000461206:exon_86074984_86076699:ST3GAL5;ENSG00000115525:ENST00000306262:exon_86074984_86075504:ST3GAL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 210 171 381 98.4838971753998 90.8059694428888 7.67792773251099 T:C T C 10 0.531029061069525 0.441654032169368 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 62 91 153 29.0761982136895 48.3236445573268 -19.2474463436373 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00201248503338923 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 11 18 29 5.15868032823523 9.55852309925145 -4.39984277101622 A:C C A 10 0.531029061069525 0.135486253222931 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 89161069 G/C 1 5 1146 1151 2.34485469465238 608.559303985676 -606.214449291023 T:C:G G C 10 0.531029061069525 0 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 97749481 T/G 1 44 43 87 20.6347213129409 22.8342496259896 -2.19952831304867 T:G T G 10 0.531029061069525 0.668203894388543 ENSG00000144199:ENST00000414820:exon_97749320_97749554:FAHD2B;ENSG00000144199:ENST00000272610:exon_97749320_97749554:FAHD2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 183 1 184 85.8216818242769 0.531029061069525 85.2906527632074 T:C C T 10 0.531029061069525 4.65171922397599e-49 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 24 17 41 11.2553025343314 9.02749403818192 2.22780849614948 T:C C T 10 0.531029061069525 0.533682584553425 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 50 35 85 23.4485469465238 18.5860171374334 4.86252980909038 A:G A G 10 0.531029061069525 0.328345666272570 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 T:C T C 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 105977776 G/A 1 2 9 11 0.93794187786095 4.77926154962572 -3.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0304108478508937 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 113325679 T/C 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113325544_113325714:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113325544_113325714:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113325544_113325714:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000448770:exon_113325544_113325714:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113325544_113325714:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000484574:exon_113325544_113325714:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000458012:exon_113325544_113325714:POLR1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 113332898 G/A 1 73 73 146 34.2348785419247 38.7651214580753 -4.53024291615064 A:G G A 10 0.531029061069525 0.456827431925744 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113332424_113333876:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113332424_113333876:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113332424_113334635:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000448770:exon_113332424_113333606:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113332424_113333872:POLR1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 113346508 C/T 1 105 69 174 49.2419485876999 36.6410052137972 12.6009433739027 T:C C T 10 0.531029061069525 0.057707555148423 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 70 46 116 32.8279657251333 24.4273368091981 8.4006289159351 A:C:G A C 10 0.531029061069525 0.136368210995096 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 66 33 99 30.9520819694114 17.5239590152943 13.428122954117 C:G C G 10 0.531029061069525 0.00850363942729987 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 11 20 31 5.15868032823523 10.6205812213905 -5.46190089315527 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0702143720911154 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 18 27 45 8.44147690074855 14.3377846488772 -5.89630774812862 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0994602064115828 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 122485435 C/T 1 92 59 151 43.1453263816037 31.330714603102 11.8146117785017 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0604963043092425 ENSG00000155438:ENST00000285814:exon_122484521_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000417799:exon_122484626_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000423105:exon_122484923_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000481978:exon_122485252_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000498570:exon_122485307_122485488:MKI67IP;ENSG00000155438:ENST00000447132:exon_122485373_122485488:MKI67IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 240 250 490 112.553025343314 132.757265267381 -20.2042399240672 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0702101358978723 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 13 13 26 6.09662220609618 6.90337779390382 -0.806755587807649 A:G A G 10 0.531029061069525 0.84501811777777 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 128047304 G/A 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000163161:ENST00000426778:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000285398:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000445889:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000494464:exon_128046913_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000456257:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000460485:exon_128046952_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000462306:exon_128047272_128047849:ERCC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 13 15 28 6.09662220609618 7.96543591604287 -1.8688137099467 C:G G C 10 0.531029061069525 0.571111918143577 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 52 53 105 24.3864888243847 28.1445402366848 -3.75805141230012 T:C T C 10 0.531029061069525 0.494254950684384 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 10 17 27 4.68970938930475 9.02749403818192 -4.33778464887717 T:C C T 10 0.531029061069525 0.122001633726372 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 17 9 26 7.97250596181808 4.77926154962572 3.19324441219235 T:C T C 10 0.531029061069525 0.24166113324983 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:C A C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 131103479 C/T 1 153 170 323 71.7525536563627 90.2749403818192 -18.5223867254566 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.0392677263970236 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103140_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460100:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103352_131103685:IMP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 144966208 T/C 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000417450:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000484303:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000429978:exon_144966170_144966371:GTDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 103 83 186 48.3040067098389 44.0754120687706 4.22859464106836 T:C C T 10 0.531029061069525 0.557213030143889 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 150443660 A/G 1 34 34 68 15.9450119236362 18.0549880763638 -2.1099761527277 A:G A G 10 0.531029061069525 0.628599657685498 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150443603_150443663:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150443603_150444116:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150443603_150443663:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150443603_150443663:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000460311:exon_150443403_150443663:MMADHC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 102 130 232 47.8350357709085 69.0337779390382 -21.1987421681298 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00566624458874117 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 51 41 92 23.9175178854542 21.7721915038505 2.1453263816037 T:C T C 10 0.531029061069525 0.677271994487251 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 14 11 25 6.56559314502665 5.84131967176477 0.724273473261875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.84284893454424 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 160114315 G/A 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 A:G G A 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 160139284 A/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 A:C A C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160139183_160139604:WDSUB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 160139350 G/A 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160139183_160139604:WDSUB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 160676427 C/A 1 13 11 24 6.09662220609618 5.84131967176477 0.255302534331401 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 160690646 T/C 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:C T C 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160690555_160690722:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160690555_160690722:RP11-357L2.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 290 305 595 136.001572289838 161.963863626205 -25.9622913363674 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0360982634636368 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 118 109 227 55.3385707937961 57.8821676565782 -2.54359686278217 T:C T C 10 0.531029061069525 0.73999320563743 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 169732622 C/G 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 C:G C G 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000152253:ENST00000479309:exon_169732582_169732686:SPC25;ENSG00000152253:ENST00000282074:exon_169732582_169732686:SPC25 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 16 22 38 7.5035350228876 11.6826393435295 -4.17910432064195 A:G G A 10 0.531029061069525 0.195054952625508 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 170428406 T/G 1 25 19 44 11.7242734732619 10.089552160321 1.6347213129409 T:G T G 10 0.531029061069525 0.653226756704645 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000438035:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000445210:exon_170428163_170428681:FASTKD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 292 305 597 136.939514167699 161.963863626205 -25.0243494585064 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0404037620013676 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 T:C T C 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 0 0 349 349 0 185.329142313264 -185.329142313264 A G A 10 0.531029061069525 1.69797004409859e-115 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 174131392 T/C 1 12 2 14 5.6276512671657 1.06205812213905 4.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0152821949787277 ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 198281489 T/C 1 5 15 20 2.34485469465238 7.96543591604287 -5.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0132875954363033 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198281465_198281635:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198281465_198281635:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198281318_198281635:SF3B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 200828526 T/A 1 15 19 34 7.03456408395713 10.089552160321 -3.05498807636385 A:T T A 10 0.531029061069525 0.307602642125318 ENSG00000162972:ENST00000295079:exon_200828456_200828831:C2orf47;ENSG00000162972:ENST00000392290:exon_200828456_200828848:C2orf47;ENSG00000162972:ENST00000469156:exon_200828456_200828559:C2orf47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 11 3 14 5.15868032823523 1.59308718320857 3.56559314502665 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0639863671812761 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 16 28 44 7.5035350228876 14.8688137099467 -7.3652786870591 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0334326852302723 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 34 35 69 15.9450119236362 18.5860171374334 -2.64100521379722 C:G C G 10 0.531029061069525 0.548029482579519 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 56 46 102 26.2623725801066 24.4273368091981 1.83503577090845 A:G A G 10 0.531029061069525 0.766332980799103 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:G A G 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 30 42 72 14.0691281679143 22.30322056492 -8.2340923970058 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0586171940634213 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 59 55 114 27.669285396898 29.2065983588239 -1.53731296192585 A:T:C A C 10 0.531029061069525 0.779162991434146 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 203421199 G/A 1 8 12 20 3.7517675114438 6.3723487328343 -2.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.268384990115425 ENSG00000204217:ENST00000374580:exon_203419975_203421254:BMPR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 204116690 C/T 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000463131:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000489360:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000428265:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000443941:exon_204116690_204116832:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204116690_204116832:CYP20A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 207003230 C/T 1 15 13 28 7.03456408395713 6.90337779390382 0.131186290053301 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207003209_207003338:NDUFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 207006676 T/C 1 25 30 55 11.7242734732619 15.9308718320857 -4.20659835882387 T:C T C 10 0.531029061069525 0.280980394332724 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207006665_207006793:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207006665_207006793:NDUFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 A:C C A 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 21 12 33 9.84838971753998 6.3723487328343 3.47604098470568 A:G A G 10 0.531029061069525 0.295304352398917 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 216176824 C/T 1 16 24 40 7.5035350228876 12.7446974656686 -5.241162442781 T:C C T 10 0.531029061069525 0.113172858195278 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216176540_216176884:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216176679_216176884:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216176715_216176884:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216176795_216177113:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216176814_216177347:ATIC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 20 17 37 9.3794187786095 9.02749403818192 0.351924740427577 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 216908679 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216908627_216908738:PECR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 0 0 10 10 0 5.31029061069525 -5.31029061069525 C:G A G 10 0.531029061069525 0.000514587595485234 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 18 10 28 8.44147690074855 5.31029061069525 3.1311862900533 C:G G C 10 0.531029061069525 0.260630838316877 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 219146868 T/C 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C T C 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 C:G G C 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 219610433 A/G 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219610414_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000461181:exon_219610110_219610524:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219610276_219610524:TTLL4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 220367115 G/A 1 55 41 96 25.7934016411761 21.7721915038505 4.0212101373256 A:G G A 10 0.531029061069525 0.474292793485802 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000480506:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000455657:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000435316:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000493655:exon_220367104_220367163:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373924:exon_220367104_220367163:GMPPA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 37 60 97 17.3519247404276 31.8617436641715 -14.5098189237439 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00415201235018902 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 33 42 75 15.4760409847057 22.30322056492 -6.82717958021437 A:G G A 10 0.531029061069525 0.132311595144181 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 11 15 26 5.15868032823523 7.96543591604287 -2.80675558780765 A:G G A 10 0.531029061069525 0.32706034167233 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 223423362 A/G 1 83 46 129 38.9245879312294 24.4273368091981 14.4972511220313 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.0105018644788807 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 164 190 354 76.9112339845979 100.89552160321 -23.9842876186118 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0122122909868958 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 228194480 A/T 0 15 0 15 7.03456408395713 0 7.03456408395713 A A 10 0.531029061069525 8.69695952611721e-05 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 228194481 G/T 0 15 0 15 7.03456408395713 0 7.03456408395713 G G 10 0.531029061069525 8.69695952611721e-05 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 23 24 47 10.7863315954009 12.7446974656686 -1.95836587026767 A:G A G 10 0.531029061069525 0.661532956137026 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 75 80 155 35.1728204197856 42.482324885562 -7.30950446577636 A:G A G 10 0.531029061069525 0.259989957627343 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 47 62 109 22.0416341297323 32.9238017863105 -10.8821676565782 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.0434349887583916 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231077676 G/A 1 46 65 111 21.5726631908019 34.5168889695191 -12.9442257787173 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0170479037361714 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231090532 G/T 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:G G T 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231090445_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231090445_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231090446_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231090457_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231090460_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231090460_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000373645:exon_231090479_231090618:SP140;ENSG00000079263:ENST00000473711:exon_231090507_231090618:SP140 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 24 6 30 11.2553025343314 3.18617436641715 8.06912816791425 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00301939958150823 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 14 22 36 6.56559314502665 11.6826393435295 -5.1170461985029 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0962495286123815 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 71 16 87 33.2969366640637 8.4964649771124 24.8004716869513 T:C C T 10 0.531029061069525 3.55473719398466e-08 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 68 2 70 31.8900238472723 1.06205812213905 30.8279657251333 A:G G A 10 0.531029061069525 1.26749797200641e-16 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 232196564 C/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 234113057 G/A 1 60 56 116 28.1382563358285 29.7376274198934 -1.5993710840649 A:G G A 10 0.531029061069525 0.780828685854547 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 234113301 C/T 1 47 44 91 22.0416341297323 23.3652786870591 -1.32364455732677 T:C C T 10 0.531029061069525 0.83383896671462 ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234112772_234113363:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000491070:exon_234113288_234113760:INPP5D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 19 21 40 8.91044783967903 11.15161028246 -2.241162442781 C:G G C 10 0.531029061069525 0.527921959001615 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 234758500 G/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234758409_234758505:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234758409_234758505:HJURP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 7 15 22 3.28279657251333 7.96543591604287 -4.68263934352955 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0543736988605008 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 4 10 14 1.8758837557219 5.31029061069525 -3.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 0.104946989484194 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 239006891 G/A 1 11 4 15 5.15868032823523 2.1241162442781 3.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.12904355932744 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 239079542 A/G 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 30 39 69 14.0691281679143 20.7101333817115 -6.64100521379722 T:C T C 10 0.531029061069525 0.117553169586653 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 29 30 59 13.6001572289838 15.9308718320857 -2.33071460310197 T:C T C 10 0.531029061069525 0.602456865908122 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:C A C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242072306 T/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:G T G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242072289_242074184:PASK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242173247 G/A 1 231 189 420 108.33228689294 100.36449254214 7.96779435079952 A:G G A 10 0.531029061069525 0.463398913013735 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242173235_242173378:HDLBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242433513 G/A 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:G G A 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242433423_242434256:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000470617:exon_242433423_242434255:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000444371:exon_242433423_242433534:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000412332:exon_242433423_242433556:FARP2;ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242432089_242435116:STK25 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242610172 A/G 1 33 20 53 15.4760409847057 10.6205812213905 4.85545976331518 A:G A G 10 0.531029061069525 0.215541334365091 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242617882 C/T 1 95 106 201 44.5522391983951 56.2890804733696 -11.7368412749745 T:C C T 10 0.531029061069525 0.104065577758053 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 40 25 65 18.758837557219 13.2757265267381 5.48311103048088 A:G A G 10 0.531029061069525 0.213654886337032 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 2 242707213 G/A 1 10 15 25 4.68970938930475 7.96543591604287 -3.27572652673812 A:G G A 10 0.531029061069525 0.230193716561202 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242707128_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242707125_242707363:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242707125_242708231:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000468064:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000445308:exon_242707125_242707377:D2HGDH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 A:T T A 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 259969 G/C 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 18 20 38 8.44147690074855 10.6205812213905 -2.17910432064195 A:G A G 10 0.531029061069525 0.51804053336918 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 21 25 46 9.84838971753998 13.2757265267381 -3.42733680919815 T:C T C 10 0.531029061069525 0.375670422400274 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 50 40 90 23.4485469465238 21.241162442781 2.20738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 0.673637527789277 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 82 75 157 38.4556169922989 39.8271795802144 -1.37156258791542 T:C C T 10 0.531029061069525 0.87301965001116 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 826127 C/T 1 15 9 24 7.03456408395713 4.77926154962572 2.2553025343314 T:C C T 10 0.531029061069525 0.416713456894239 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 1291076 G/C 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 C:G G C 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000125775:ENST00000381812:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000381808:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000360779:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000339987:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000467129:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000245974:exon_1290627_1291139:SDCBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 74 76 150 34.7038494808552 40.3582086412839 -5.65435916042874 A:G A G 10 0.531029061069525 0.368898819868213 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 121 157 278 56.7454836105875 83.3715625879154 -26.6260789773279 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00142733477139515 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 22 26 48 10.3173606564705 13.8067555878076 -3.4893949313372 A:G G A 10 0.531029061069525 0.316197821820389 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 631 586 1217 295.92066246513 311.183029786742 -15.2623673216119 A:T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.388942501353962 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2774910 G/A 1 29 11 40 13.6001572289838 5.84131967176477 7.758837557219 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0166264016191701 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2840773 C/T 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2840700_2840797:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2840700_2840797:VPS16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:G T G 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 3128578 A/C 1 34 26 60 15.9450119236362 13.8067555878076 2.1382563358285 A:C A C 10 0.531029061069525 0.607070384450667 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 3175976 G/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000198171:ENST00000354488:exon_3175877_3175999:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000449522:exon_3175877_3175999:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000380213:exon_3175877_3175999:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000380201:exon_3175877_3175999:DDRGK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 21 34 55 9.84838971753998 18.0549880763638 -8.20659835882387 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0302961600873947 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 3766885 G/A 1 8 14 22 3.7517675114438 7.43440685497335 -3.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.136441945320730 ENSG00000125817:ENST00000379751:exon_3764500_3767337:CENPB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 3844929 C/T 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3844903_3845435:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3844903_3845435:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3844903_3845435:MAVS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 36 30 66 16.8829538014971 15.9308718320857 0.952081969411353 T:C C T 10 0.531029061069525 0.90198698370149 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 34 25 59 15.9450119236362 13.2757265267381 2.66928539689803 T:C T C 10 0.531029061069525 0.516430213907164 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 34 23 57 15.9450119236362 12.2136684045991 3.73134351903708 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.354438638223357 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 51 41 92 23.9175178854542 21.7721915038505 2.1453263816037 T:C C T 10 0.531029061069525 0.677271994487251 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 39 31 70 18.2898666182885 16.4619008931553 1.82796572513325 A:G A G 10 0.531029061069525 0.719991410125492 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17597482 G/A 1 18 25 43 8.44147690074855 13.2757265267381 -4.83424962598957 A:G G A 10 0.531029061069525 0.168821973797197 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17597377_17597484:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17597377_17597484:RRBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 21 14 35 9.84838971753998 7.43440685497335 2.41398286256663 A:G G A 10 0.531029061069525 0.499023115258447 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17602374 C/T 1 24 25 49 11.2553025343314 13.2757265267381 -2.02042399240672 T:C C T 10 0.531029061069525 0.570606915813268 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17602335_17602418:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17602335_17602418:RRBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17608170 C/T 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17608149_17608327:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17608149_17608327:RRBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17932210 C/T 1 75 88 163 35.1728204197856 46.7305573741182 -11.5577369543326 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0714386390319373 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000431277:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000419004:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000494401:exon_17932144_17932239:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000474883:exon_17932170_17932239:SNX5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17950545 A/T 1 13 9 22 6.09662220609618 4.77926154962572 1.31736065647045 A:T A T 10 0.531029061069525 0.671482239474886 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17950444_17950773:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377704:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17950503_17950773:C20orf72 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 12 15 27 5.6276512671657 7.96543591604287 -2.33778464887717 T:C T C 10 0.531029061069525 0.441784391602871 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 18162481 C/G 1 6 12 18 2.81382563358285 6.3723487328343 -3.55852309925145 C:G C G 10 0.531029061069525 0.102920868968033 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18162354_18162490:CSRP2BP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 19 16 35 8.91044783967903 8.4964649771124 0.413982862566627 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 42 32 74 19.69677943508 16.9929299542248 2.70384948085515 C:G C G 10 0.531029061069525 0.561724176100123 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 25288632 G/A 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:G G A 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 30354417 G/A 1 20 7 27 9.3794187786095 3.71720342748667 5.66221535112283 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0333315110955642 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30354359_30354485:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30354359_30354485:TPX2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 15 18 33 7.03456408395713 9.55852309925145 -2.52395901529432 T:C C T 10 0.531029061069525 0.389329960885102 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 61 63 124 28.607227274759 33.4548308473801 -4.8476035726211 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.418292954319067 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 33169405 C/T 1 11 3 14 5.15868032823523 1.59308718320857 3.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0639863671812761 ENSG00000101464:ENST00000217446:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000374820:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000438215:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000452740:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000480175:exon_33169352_33169476:PIGU HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 33328420 C/T 1 16 25 41 7.5035350228876 13.2757265267381 -5.77219150385052 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0847391266871018 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 53 48 101 24.8554597633152 25.4893949313372 -0.63393516802202 T:C C T 10 0.531029061069525 0.920825409029424 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 4 19 23 1.8758837557219 10.089552160321 -8.21366840459907 C:G G C 10 0.531029061069525 0.000581509630606458 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 292 333 625 136.939514167699 176.832677336152 -39.8931631684531 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0015263829697637 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 147 115 262 68.9387280227798 61.0683420229954 7.87038599978445 T:C T C 10 0.531029061069525 0.353256175838336 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 25 18 43 11.7242734732619 9.55852309925145 2.16575037401043 T:C C T 10 0.531029061069525 0.544027394603868 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 35521290 G/A 1 20 26 46 9.3794187786095 13.8067555878076 -4.42733680919815 A:G G A 10 0.531029061069525 0.237009693071016 ENSG00000101342:ENST00000217320:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101342:ENST00000436941:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101347:ENST00000262878:exon_35518632_35521469:SAMHD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 172 160 332 80.6630014960417 84.964649771124 -4.30164827508229 T:C C T 10 0.531029061069525 0.660124630248652 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 11 2 13 5.15868032823523 1.06205812213905 4.09662220609617 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0257188033078452 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:G G A 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 37667182 C/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37667142_37668363:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37667142_37668364:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000449559:exon_37667142_37667289:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000493450:exon_37667142_37668366:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000482619:exon_37667142_37667279:DHX35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G G A 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 86 30 116 40.3315007480209 15.9308718320857 24.4006289159351 T:C T C 10 0.531029061069525 3.95284143851224e-06 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 84 58 142 39.3935588701599 30.7996855420324 8.59387332812745 T:C C T 10 0.531029061069525 0.153651271813451 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 93 74 167 43.6142973205342 39.2961505191448 4.31814680138933 A:C A C 10 0.531029061069525 0.535428076032028 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 20 15 35 9.3794187786095 7.96543591604287 1.41398286256663 A:G G A 10 0.531029061069525 0.73557273951191 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 34 35 69 15.9450119236362 18.5860171374334 -2.64100521379722 T:C T C 10 0.531029061069525 0.548029482579519 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 44511533 G/A 1 15 10 25 7.03456408395713 5.31029061069525 1.72427347326188 A:G G A 10 0.531029061069525 0.551537499339693 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 44699131 C/T 1 12 6 18 5.6276512671657 3.18617436641715 2.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.345573301643562 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44698849_44699175:NCOA5;ENSG00000124160:ENST00000372291:exon_44698849_44699175:NCOA5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 45000555 G/T 1 4 10 14 1.8758837557219 5.31029061069525 -3.43440685497335 T:G G T 10 0.531029061069525 0.104946989484194 ENSG00000062598:ENST00000290246:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000372176:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000467800:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000445496:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000439931:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000454865:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000452857:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000461126:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000396391:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000352077:exon_45000445_45000608:ELMO2;ENSG00000062598:ENST00000464448:exon_45000445_45000608:ELMO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 45130454 C/T 1 11 4 15 5.15868032823523 2.1241162442781 3.03456408395713 T:C C T 10 0.531029061069525 0.12904355932744 ENSG00000198185:ENST00000396380:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000331711:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000418827:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000457685:exon_45129709_45131736:ZNF334;ENSG00000198185:ENST00000347606:exon_45129731_45131736:ZNF334 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 16 15 31 7.5035350228876 7.96543591604287 -0.461900893155274 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 24 22 46 11.2553025343314 11.6826393435295 -0.427336809198149 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 14 1 15 6.56559314502665 0.531029061069525 6.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00128269240129442 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 15 9 24 7.03456408395713 4.77926154962572 2.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.416713456894239 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47685320 G/C 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 C:G G C 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47685252_47685359:CSE1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 31 23 54 14.5380991068447 12.2136684045991 2.32443070224565 T:C C T 10 0.531029061069525 0.586476842730886 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47865306 C/T 1 12 17 29 5.6276512671657 9.02749403818192 -3.39984277101622 T:C C T 10 0.531029061069525 0.264194510317464 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 19 10 29 8.91044783967903 5.31029061069525 3.60015722898378 A:G G A 10 0.531029061069525 0.197200860318155 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47865672 C/T 1 8 13 21 3.7517675114438 6.90337779390382 -3.15161028246002 T:C C T 10 0.531029061069525 0.193093229428768 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 12 8 20 5.6276512671657 4.2482324885562 1.3794187786095 C:G C G 10 0.531029061069525 0.655962224425547 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 26 26 52 12.1932444121924 13.8067555878076 -1.6135111756153 A:G G A 10 0.531029061069525 0.678691595707079 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 12 22 34 5.6276512671657 11.6826393435295 -6.05498807636385 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0400825976529851 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 49197886 G/A 1 16 18 34 7.5035350228876 9.55852309925145 -2.05498807636385 A:G G A 10 0.531029061069525 0.496865948303442 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49197802_49197997:PTPN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 45 39 84 21.1036922518714 20.7101333817115 0.393558870159904 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 43 41 84 20.1657503740104 21.7721915038505 -1.6064411298401 A:G G A 10 0.531029061069525 0.743938058419408 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 A:G G A 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 7 12 19 3.28279657251333 6.3723487328343 -3.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.173367796352208 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 10 19 29 4.68970938930475 10.089552160321 -5.39984277101622 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0611026478740739 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 54972514 T/C 1 38 28 66 17.8208956793581 14.8688137099467 2.95208196941135 T:C T C 10 0.531029061069525 0.537859294556646 ENSG00000101138:ENST00000415828:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000451236:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000217109:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000428552:exon_54972263_54972519:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000452950:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000425890:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000493039:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000490539:exon_54972263_54972540:CSTF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 54978813 G/C 1 72 65 137 33.7659076029942 34.5168889695191 -0.750981366524918 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.931871767518761 ENSG00000101138:ENST00000451236:exon_54978524_54979582:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000217109:exon_54978524_54979518:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000425890:exon_54978524_54979582:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000493039:exon_54978524_54979518:CSTF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 87 79 166 40.8004716869513 41.9512958244925 -1.15082413754114 A:C C A 10 0.531029061069525 0.876612713296335 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 170 172 342 79.7250596181808 91.3369985039583 -11.6119388857775 A:G G A 10 0.531029061069525 0.213038136707166 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 T:C C T 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 28 1 29 13.1311862900533 0.531029061069525 12.6001572289838 A:C C A 10 0.531029061069525 4.45197053057892e-07 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 28 21 49 13.1311862900533 11.15161028246 1.97957600759328 T:C T C 10 0.531029061069525 0.668105156925642 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61491494 T/C 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61491477_61491660:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61491477_61491660:TCFL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61537114 G/A 1 36 45 81 16.8829538014971 23.8963077481286 -7.01335394663152 A:G G A 10 0.531029061069525 0.120671359389308 ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61536350_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61536355_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61536357_61537452:DIDO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61538601 C/T 1 10 13 23 4.68970938930475 6.90337779390382 -2.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.406694379844076 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61538499_61538711:DIDO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61542863 G/A 1 3 10 13 1.40691281679143 5.31029061069525 -3.90337779390382 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0477572109989804 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 61598731 C/T 1 22 19 41 10.3173606564705 10.089552160321 0.227808496149477 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61598055_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61598689_61599949:SLC17A9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 23 25 48 10.7863315954009 13.2757265267381 -2.4893949313372 A:G A G 10 0.531029061069525 0.474316470538493 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62192244 C/T 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 T:C C T 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000478861:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62321189 C/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321103_62321563:RTEL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62326110 A/C 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 A:C A C 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326094_62326331:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326094_62326327:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326094_62326327:RTEL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 45 40 85 21.1036922518714 21.241162442781 -0.137470190909621 T:G T G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 29 22 51 13.6001572289838 11.6826393435295 1.91751788545423 T:G G T 10 0.531029061069525 0.674401272876237 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62493384 C/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000183260:ENST00000369916:exon_62492851_62494341:C20orf135 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62577613 T/C 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000198276:ENST00000354216:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369892:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369908:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000358711:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000492660:exon_62577158_62577620:UCKL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 9 41 50 4.22073845037428 21.7721915038505 -17.5514530534763 T:C C T 10 0.531029061069525 4.98177795072821e-07 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62641575 G/A 1 48 83 131 22.5106050686628 44.0754120687706 -21.5648070001078 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000209675626237258 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62641553_62641671:PRPF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62701627 G/A 1 18 18 36 8.44147690074855 9.55852309925145 -1.1170461985029 A:G G A 10 0.531029061069525 0.740638587627158 ENSG00000171703:ENST00000395050:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000361317:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000395053:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000343484:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000339217:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000440819:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465111:exon_62701118_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000458442:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465433:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000477783:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000495168:exon_62701567_62701988:TCEA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 20 62705344 C/T 1 63 80 143 29.5451691526199 42.482324885562 -12.9371557329421 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0358458853659207 ENSG00000171700:ENST00000395042:exon_62704534_62705397:RGS19;ENSG00000171700:ENST00000332298:exon_62704537_62705397:RGS19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 15889304 C/G 1 25 26 51 11.7242734732619 13.8067555878076 -2.08248211454577 C:G C G 10 0.531029061069525 0.577354633027695 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 22 23 45 10.3173606564705 12.2136684045991 -1.89630774812862 C:G G C 10 0.531029061069525 0.654664440828348 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 17 14 31 7.97250596181808 7.43440685497335 0.538099106844726 C:G G C 10 0.531029061069525 0.859723747240846 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 26965071 G/A 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.296620249790405 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 38 16 54 17.8208956793581 8.4964649771124 9.32443070224565 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0134301426315307 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 48 25 73 22.5106050686628 13.2757265267381 9.23487854192468 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0343743153028248 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 26978803 C/T 1 53 34 87 24.8554597633152 18.0549880763638 6.80047168695133 T:C C T 10 0.531029061069525 0.162625911821712 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 33686957 C/T 1 33 42 75 15.4760409847057 22.30322056492 -6.82717958021437 T:C C T 10 0.531029061069525 0.132311595144181 ENSG00000170262:ENST00000399786:exon_33686862_33686964:MRAP;ENSG00000170262:ENST00000339944:exon_33686862_33687095:MRAP;ENSG00000142207:ENST00000382751:exon_33683329_33687410:URB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 27 12 39 12.6622153511228 6.3723487328343 6.28986661828853 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0532900965921941 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 26 9 35 12.1932444121924 4.77926154962572 7.41398286256663 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0164716705980744 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34625037 C/G 1 21 34 55 9.84838971753998 18.0549880763638 -8.20659835882387 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0302961600873947 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000413881:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000443073:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000417007:exon_34624967_34625135:IFNAR2;ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34624967_34625135:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000435704:exon_34624967_34625135:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000451624:exon_34624967_34625135:AP000295.9;ENSG00000249624:ENST00000432231:exon_34624967_34625135:AP000295.9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34713317 T/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C T C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34713305_34713480:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34713305_34713480:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34713305_34713480:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442071:exon_34713305_34713480:IFNAR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 16 8 24 7.5035350228876 4.2482324885562 3.2553025343314 C:G G C 10 0.531029061069525 0.221638564753188 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34721782 C/T 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 T:C C T 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721695_34721849:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721695_34721849:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721695_34721849:IFNAR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 65 69 134 30.4831110304809 36.6410052137972 -6.15789418331634 A:G A G 10 0.531029061069525 0.299693984787927 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 34924145 A/G 1 14 13 27 6.56559314502665 6.90337779390382 -0.337784648877174 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 35275907 T/C 1 158 136 294 74.0974083510151 72.2199523054554 1.87745604555967 T:C T C 10 0.531029061069525 0.860902261893774 ENSG00000241837:ENST00000431254:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000417181:exon_35275760_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35275760_35275960:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000429064:exon_35275761_35275943:ATP5O HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 38538291 G/A 1 23 16 39 10.7863315954009 8.4964649771124 2.28986661828853 A:G G A 10 0.531029061069525 0.522770831369259 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:G T G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 40549466 T/C 1 70 114 184 32.8279657251333 60.5373129619258 -27.7093472367926 T:C T C 10 0.531029061069525 4.43747230985973e-05 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000481921:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40549361_40549497:PSMG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 22 25 47 10.3173606564705 13.2757265267381 -2.95836587026767 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.46532677882094 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 40555351 G/C 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 C:G G C 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40555178_40555777:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40555178_40555414:PSMG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 C:G G C 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 40720494 C/T 1 40 40 80 18.758837557219 21.241162442781 -2.48232488556199 T:C C T 10 0.531029061069525 0.577964932044901 ENSG00000205581:ENST00000380749:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000431390:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000492280:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000288344:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000486741:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000436324:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380748:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000419378:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000489072:exon_40720471_40720788:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482192:exon_40720471_40720549:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380747:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000485550:exon_40720471_40720523:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000443046:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000464078:exon_40720348_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000491183:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000479586:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000471260:exon_40720471_40720546:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482733:exon_40719921_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000463631:exon_40720348_40720503:HMGN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 42808996 A/G 1 305 81 386 143.036136373795 43.0133539466315 100.022782427163 A:C:G A G 10 0.531029061069525 4.72781238068084e-26 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42808942_42809079:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42808942_42809079:MX1;ENSG00000157601:ENST00000424365:exon_42808942_42809079:MX1;ENSG00000157601:ENST00000417963:exon_42808942_42809079:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42808942_42809079:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42808942_42809079:MX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 51 29 80 23.9175178854542 15.3998427710162 8.517675114438 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0575986527110457 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 63 63 126 29.5451691526199 33.4548308473801 -3.90966169476015 T:G T G 10 0.531029061069525 0.532283264567476 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 62 68 130 29.0761982136895 36.1099761527277 -7.03377793903825 A:G G A 10 0.531029061069525 0.219891895186513 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 73 59 132 34.2348785419247 31.330714603102 2.90416393882271 T:C T C 10 0.531029061069525 0.663047309213998 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 33 26 59 15.4760409847057 13.8067555878076 1.66928539689803 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.697171401267577 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 42 36 78 19.69677943508 19.1170461985029 0.579733236577052 T:C T C 10 0.531029061069525 0.91023766331101 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 33 46 79 15.4760409847057 24.4273368091981 -8.95129582449247 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0546422783593664 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 A:G G A 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45506819 T/C 1 2 14 16 0.93794187786095 7.43440685497335 -6.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00155191749794743 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45506683_45506841:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45506683_45506841:TRAPPC10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 14 3 17 6.56559314502665 1.59308718320857 4.97250596181807 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0155714027927555 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 13 18 31 6.09662220609618 9.55852309925145 -3.46190089315527 A:G A G 10 0.531029061069525 0.28009400014822 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 22 11 33 10.3173606564705 5.84131967176477 4.47604098470568 T:C T C 10 0.531029061069525 0.161946884964285 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 15 17 32 7.03456408395713 9.02749403818192 -1.9929299542248 T:C T C 10 0.531029061069525 0.485507554942917 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45557143 C/T 1 45 53 98 21.1036922518714 28.1445402366848 -7.04084798481345 T:C C T 10 0.531029061069525 0.157850782479585 ENSG00000248354:ENST00000433711:exon_45557059_45557178:AP001055.7;ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000389690:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45557059_45557259:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45557059_45557457:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000470545:exon_45557059_45557448:C21orf33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 15 16 31 7.03456408395713 8.4964649771124 -1.46190089315527 T:C C T 10 0.531029061069525 0.719571891946296 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 46330667 G/A 1 7 13 20 3.28279657251333 6.90337779390382 -3.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.119767603512246 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 46387078 G/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:G G T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46386949_46387096:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000479127:exon_46386949_46387096:C21orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C T C 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:C A C 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47666564 G/A 1 24 13 37 11.2553025343314 6.90337779390382 4.35192474042758 A:G G A 10 0.531029061069525 0.187491714427340 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47666221_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47666542_47666800:MCM3AP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47666744 G/T 1 35 36 71 16.4139828625666 19.1170461985029 -2.70306333593627 T:G G T 10 0.531029061069525 0.553265268509742 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47666221_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47666542_47666800:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47666542_47666800:MCM3AP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 17 25 42 7.97250596181808 13.2757265267381 -5.30322056492005 A:G G A 10 0.531029061069525 0.121708488715885 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47734659 G/A 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:G G A 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000160298:ENST00000491666:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397683:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000417060:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397685:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397682:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000291691:exon_47734630_47734794:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397680:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000397679:exon_47734630_47734963:C21orf58;ENSG00000160298:ENST00000423365:exon_47734630_47734963:C21orf58 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47831618 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47831621 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47836122 T/C 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47836206 A/C 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 A:C A C 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47836216 A/G 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47836395 T/G 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 T:G T G 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47836547 T/C 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 T:C T C 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47838182 C/G 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 C C 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47838118_47838220:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47838118_47838220:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47848350 G/A 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47848470 C/T 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:C C T 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47851636 G/A 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 14 8 22 6.56559314502665 4.2482324885562 2.31736065647045 A:G A G 10 0.531029061069525 0.395246671022453 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 47855989 T/C 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 20 18 38 9.3794187786095 9.55852309925145 -0.179104320641947 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 17625915 G/A 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 A:G G A 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17625914_17626007:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17625914_17626007:CECR5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 11 14 25 5.15868032823523 7.43440685497335 -2.27572652673812 A:C C A 10 0.531029061069525 0.424884149322681 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 17662793 A/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17662710_17662912:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17662710_17662912:CECR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 19121872 G/A 1 30 32 62 14.0691281679143 16.9929299542248 -2.92380178631055 A:G G A 10 0.531029061069525 0.524996251435255 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 19455430 G/C 1 46 37 83 21.5726631908019 19.6480752595724 1.92458793122943 C:G G C 10 0.531029061069525 0.741743976345473 ENSG00000070010:ENST00000263202:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000360834:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000459854:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000399523:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000399525:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000432927:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000447868:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000421968:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000484101:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000489406:exon_19454926_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000494054:exon_19455396_19455526:UFD1L;ENSG00000070010:ENST00000474226:exon_19455418_19455526:UFD1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 49 50 99 22.9795760075933 26.5514530534762 -3.57187704588297 T:C C T 10 0.531029061069525 0.482496654935332 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 43 43 86 20.1657503740104 22.8342496259896 -2.66849925197915 C:G C G 10 0.531029061069525 0.590105411859374 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 122 91 213 57.214454549518 48.3236445573268 8.89080999219118 A:G G A 10 0.531029061069525 0.24318344328392 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 13 9 22 6.09662220609618 4.77926154962572 1.31736065647045 A:G A G 10 0.531029061069525 0.671482239474886 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 21348473 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21348393_21348558:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21348393_21348558:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21348393_21348558:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000492480:exon_21348393_21348589:LZTR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 21355501 G/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 17 9 26 7.97250596181808 4.77926154962572 3.19324441219235 T:C C T 10 0.531029061069525 0.24166113324983 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 C:G C G 10 0.531029061069525 0.457534991859192 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 20 33 53 9.3794187786095 17.5239590152943 -8.14454023668482 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0275402531764545 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 10 15 25 4.68970938930475 7.96543591604287 -3.27572652673812 A:G G A 10 0.531029061069525 0.230193716561202 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 24179922 G/C 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 C:G G C 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24179846_24180041:DERL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 24224655 G/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 24224659 C/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 24226890 G/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24226836_24227120:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24226836_24227738:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24226836_24227740:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24226836_24227054:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24226836_24226971:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000486907:exon_24226836_24227723:SLC2A11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 26422980 A/G 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000133454:ENST00000335473:exon_26422411_26423656:MYO18B;ENSG00000133454:ENST00000407587:exon_26422411_26423656:MYO18B;ENSG00000133454:ENST00000418374:exon_26422411_26423656:MYO18B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 26829916 A/C 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 A:C A C 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000128203:ENST00000215906:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000382701:exon_26829358_26830467:ASPHD2;ENSG00000128203:ENST00000456021:exon_26829581_26830467:ASPHD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 26849364 G/A 1 17 27 44 7.97250596181808 14.3377846488772 -6.3652786870591 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0689083965910232 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26847446_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26847446_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26848049_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26848049_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26848049_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26848049_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26848049_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26848049_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26849078_26849370:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26849197_26849370:HPS4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 20 20 40 9.3794187786095 10.6205812213905 -1.241162442781 C:G G C 10 0.531029061069525 0.752444833741799 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 26936897 G/A 1 28 13 41 13.1311862900533 6.90337779390382 6.22780849614948 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0599817538323409 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 26937321 G/A 1 20 12 32 9.3794187786095 6.3723487328343 3.0070700457752 A:G G A 10 0.531029061069525 0.376147483176247 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000442495:exon_26937172_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000454778:exon_26937237_26937684:TPST2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 33 22 55 15.4760409847057 11.6826393435295 3.79340164117613 T:G G T 10 0.531029061069525 0.345299863926382 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 34 25 59 15.9450119236362 13.2757265267381 2.66928539689803 T:C C T 10 0.531029061069525 0.516430213907164 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 34 28 62 15.9450119236362 14.8688137099467 1.07619821368945 T:C C T 10 0.531029061069525 0.800660615106556 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 379 363 742 177.73998585465 192.763549168238 -15.0235633135875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.270085919550234 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 145 149 294 68.0007861449189 79.1233300993592 -11.1225439544403 A:G A G 10 0.531029061069525 0.198922167150467 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31019044 G/A 1 18 26 44 8.44147690074855 13.8067555878076 -5.3652786870591 A:G G A 10 0.531029061069525 0.130263193748867 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 14 13 27 6.56559314502665 6.90337779390382 -0.337784648877174 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 C:G G C 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31491332 C/T 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 40 33 73 18.758837557219 17.5239590152943 1.23487854192468 A:G G A 10 0.531029061069525 0.815200796156025 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:G A G 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 17 13 30 7.97250596181808 6.90337779390382 1.06912816791425 T:C T C 10 0.531029061069525 0.718926652870465 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32017755 C/T 1 19 10 29 8.91044783967903 5.31029061069525 3.60015722898378 T:C C T 10 0.531029061069525 0.197200860318155 ENSG00000241878:ENST00000382151:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000460723:exon_32017320_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000437808:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000266095:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000473770:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397500:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000435900:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000439502:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000336566:exon_32017638_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000422296:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397503:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397502:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000474017:exon_32016982_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000451635:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000478893:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000491342:exon_32017635_32017871:PISD;ENSG00000241878:ENST00000422020:exon_32017635_32017871:PISD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 291 302 593 136.470543228768 160.370776442997 -23.9002332142283 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.0530562498174138 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32435511 G/A 0 196 0 196 91.9183040303731 0 91.9183040303731 G G 10 0.531029061069525 1.48081754943427e-54 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32871383 T/G 1 18 14 32 8.44147690074855 7.43440685497335 1.0070700457752 T:G T G 10 0.531029061069525 0.859782086036622 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 43 48 91 20.1657503740104 25.4893949313372 -5.32364455732677 A:G G A 10 0.531029061069525 0.293788826697781 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 103 64 167 48.3040067098389 33.9858599084496 14.3181468013893 T:C C T 10 0.531029061069525 0.029685053595387 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 35661227 T/C 1 8 12 20 3.7517675114438 6.3723487328343 -2.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.268384990115425 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 23 21 44 10.7863315954009 11.15161028246 -0.365278687059099 T:G T G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 28 24 52 13.1311862900533 12.7446974656686 0.386488824384701 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 47 52 99 22.0416341297323 27.6135111756153 -5.57187704588297 A:T A T 10 0.531029061069525 0.269532908030899 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36623980 C/T 1 51 65 116 23.9175178854542 34.5168889695191 -10.5993710840649 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0509512978129972 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 41 76 117 19.2278084961495 40.3582086412839 -21.1304001451344 A:C C A 10 0.531029061069525 9.06959174100612e-05 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 44 64 108 20.6347213129409 33.9858599084496 -13.3511385955087 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0118841955979813 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 38 62 100 17.8208956793581 32.9238017863105 -15.1029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00258279270479236 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36661691 G/A 1 54 71 125 25.3244307022457 37.7030633359363 -12.3786326336906 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0311306320431921 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 38 48 86 17.8208956793581 25.4893949313372 -7.66849925197915 A:G G A 10 0.531029061069525 0.105418860381096 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36661891 G/A 1 34 37 71 15.9450119236362 19.6480752595724 -3.70306333593627 A:G G A 10 0.531029061069525 0.40636441461824 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36681918 C/T 1 127 161 288 59.5593092441703 85.4956788321935 -25.9363695880232 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00254612085540982 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36681911_36681999:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36681911_36681999:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36681911_36681999:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36681911_36681999:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000475726:exon_36681911_36682090:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000486218:exon_36681911_36682067:MYH9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 164 88 252 76.9112339845979 46.7305573741182 30.1806766104797 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000143052797204584 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 163 70 233 76.4422630456674 37.1720342748667 39.2702287708007 A:C C A 10 0.531029061069525 1.73965505019425e-07 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 36700151 T/C 1 19 17 36 8.91044783967903 9.02749403818192 -0.117046198502898 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36700041_36700201:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36700041_36700201:MYH9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 37260117 C/T 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 T:C C T 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37260087_37260171:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37260087_37260171:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37260087_37260171:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37260087_37260171:NCF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 37273805 C/T 1 63 38 101 29.5451691526199 20.1791043206419 9.36606483197798 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0722964835854862 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 364 483 847 170.705421770693 256.487036496581 -85.7816147258877 A:G A G 10 0.531029061069525 4.30529172404933e-09 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 297 308 605 139.284368862351 163.556950809414 -24.2725819470626 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0505060870570139 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 115 137 252 53.9316579770046 72.7509813665249 -18.8193233895203 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0193887569978417 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 T:C C T 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38205989 T/C 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 35 32 67 16.4139828625666 16.9929299542248 -0.578947091658172 A:G A G 10 0.531029061069525 0.90313333552282 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38251629 C/G 1 89 102 191 41.7384135648123 54.1649642290915 -12.4265506642793 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0816144793686416 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000439997:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000414316:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000436452:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38251572_38251651:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000451427:exon_38251572_38251651:EIF3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 14 9 23 6.56559314502665 4.77926154962572 1.78633159540093 T:G G T 10 0.531029061069525 0.533837384337975 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38323700 C/T 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 38694860 G/A 1 25 20 45 11.7242734732619 10.6205812213905 1.10369225187138 A:G G A 10 0.531029061069525 0.767362753594117 ENSG00000213923:ENST00000359867:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000396832:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000402865:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000400206:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000403904:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000431611:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000438038:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000498529:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000442216:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000451964:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000398519:exon_38694791_38694939:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000467976:exon_38694586_38694939:CSNK1E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 7 13 20 3.28279657251333 6.90337779390382 -3.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.119767603512246 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 15 30 45 7.03456408395713 15.9308718320857 -8.89630774812862 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0103528069286123 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 18 20 38 8.44147690074855 10.6205812213905 -2.17910432064195 T:C T C 10 0.531029061069525 0.51804053336918 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 87 73 160 40.8004716869513 38.7651214580753 2.03535022887601 T:C T C 10 0.531029061069525 0.752212132104584 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 64 30 94 30.0141400915504 15.9308718320857 14.0832682594647 C:G G C 10 0.531029061069525 0.00367378966469123 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 22 10 32 10.3173606564705 5.31029061069525 5.0070700457752 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.079403671982812 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 16 0 16 7.5035350228876 0 7.5035350228876 A A 10 0.531029061069525 4.54589672380085e-05 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 16 1 17 7.5035350228876 0.531029061069525 6.97250596181808 C:G G C 10 0.531029061069525 0.000391997595400746 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 67 17 84 31.4210529083418 9.02749403818192 22.3935588701599 C:G G C 10 0.531029061069525 4.94126700321604e-07 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 39709605 G/A 1 16 17 33 7.5035350228876 9.02749403818192 -1.52395901529432 A:G G A 10 0.531029061069525 0.60583239076914 ENSG00000100316:ENST00000464182:exon_39709196_39709710:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000467105:exon_39709196_39710213:RPL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 40802179 G/C 1 18 4 22 8.44147690074855 2.1241162442781 6.31736065647045 C:G G C 10 0.531029061069525 0.00882469556206987 ENSG00000100359:ENST00000457767:exon_40802082_40802227:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000248929:exon_40802082_40802227:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000454798:exon_40802082_40802227:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40802082_40802227:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40802082_40802227:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000480830:exon_40802117_40802227:SGSM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 15 13 28 7.03456408395713 6.90337779390382 0.131186290053301 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 41551039 T/A 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:T T A 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41550999_41551117:EP300 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 41926757 G/A 1 18 13 31 8.44147690074855 6.90337779390382 1.53809910684473 A:G G A 10 0.531029061069525 0.595688867854144 ENSG00000100413:ENST00000396504:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000355209:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000337566:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000431534:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000432789:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000407461:exon_41926691_41926892:POLR3H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 26 21 47 12.1932444121924 11.15161028246 1.04163412973233 A:C C A 10 0.531029061069525 0.772666376606373 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 21 19 40 9.84838971753998 10.089552160321 -0.241162442780999 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 42 43 85 19.69677943508 22.8342496259896 -3.13747019090962 C:G G C 10 0.531029061069525 0.515719372632672 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 29 12 41 13.6001572289838 6.3723487328343 7.22780849614948 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0277243446664477 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C C T 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 99 121 220 46.428122954117 64.2545163894125 -17.8263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0179062220149157 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 42 30 72 19.69677943508 15.9308718320857 3.7659076029942 T:G G T 10 0.531029061069525 0.409532307893651 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 12 19 31 5.6276512671657 10.089552160321 -4.46190089315527 A:G G A 10 0.531029061069525 0.148816210781677 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43010817 G/A 1 18 8 26 8.44147690074855 4.2482324885562 4.19324441219235 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.117013771715704 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43032742 C/T 1 27 23 50 12.6622153511228 12.2136684045991 0.448546946523752 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43032721_43032825:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43032721_43032896:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000466276:exon_43032721_43032852:CYB5R3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 23 71 94 10.7863315954009 37.7030633359363 -26.9167317405353 T:C C T 10 0.531029061069525 1.94421057795767e-08 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 25 60 85 11.7242734732619 31.8617436641715 -20.1374701909096 C:G G C 10 0.531029061069525 1.59546850771202e-05 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43089164 C/T 1 9 67 76 4.22073845037428 35.5789470916582 -31.3582086412839 T:C C T 10 0.531029061069525 6.39002962343166e-14 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 11 28 39 5.15868032823523 14.8688137099467 -9.71013338171148 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00203369326395108 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 12 15 27 5.6276512671657 7.96543591604287 -2.33778464887717 A:G A G 10 0.531029061069525 0.441784391602871 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43203137 C/T 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 A:C A C 10 0.531029061069525 0.825489956938963 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43278220 C/T 1 19 20 39 8.91044783967903 10.6205812213905 -1.71013338171147 T:C C T 10 0.531029061069525 0.632048634114311 ENSG00000100266:ENST00000505238:exon_43278190_43278256:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43278190_43278310:PACSIN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43289473 G/A 1 17 25 42 7.97250596181808 13.2757265267381 -5.30322056492005 A:G G A 10 0.531029061069525 0.121708488715885 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43289463_43289619:PACSIN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 59 52 111 27.669285396898 27.6135111756153 0.0557742212827286 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 44547415 C/T 1 59 65 124 27.669285396898 34.5168889695191 -6.8476035726211 T:C C T 10 0.531029061069525 0.242146064378388 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44547363_44547431:PARVB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 10 29 39 4.68970938930475 15.3998427710162 -10.7101333817115 T:C C T 10 0.531029061069525 0.000617028158502076 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 41 52 93 19.2278084961495 27.6135111756153 -8.38570267946582 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0960033407055634 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 46640967 G/A 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 A:G G A 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000205643:ENST00000404583:exon_46639908_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000314567:exon_46639910_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000381037:exon_46639918_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000444576:exon_46639919_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000404744:exon_46639948_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000475605:exon_46640520_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000474256:exon_46640806_46641135:C22orf40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 46725288 G/A 1 28 23 51 13.1311862900533 12.2136684045991 0.917517885454226 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888659609738321 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000491863:exon_46724820_46725464:GTSE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 46752813 G/A 1 21 35 56 9.84838971753998 18.5860171374334 -8.7376274198934 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0223759422464107 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50187853 C/T 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C C T 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50187682_50187942:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50187682_50187942:BRD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50297888 T/C 1 10 21 31 4.68970938930475 11.15161028246 -6.46190089315527 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0291499333205011 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50319079 T/G 1 26 42 68 12.1932444121924 22.30322056492 -10.1099761527277 A:T:G T G 10 0.531029061069525 0.015010023783215 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50319170 A/G 1 45 47 92 21.1036922518714 24.9583658702677 -3.8546736183963 A:G A G 10 0.531029061069525 0.464977554713626 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50319065_50320153:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50319065_50319205:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 55 37 92 25.7934016411761 19.6480752595724 6.14532638160371 T:C C T 10 0.531029061069525 0.211143048606911 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128839343763674 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 119 103 222 55.8075417327265 54.6959932901611 1.11154844256546 T:C T C 10 0.531029061069525 0.893222044837347 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 131 92 223 61.4351929998922 48.8546736183963 12.5805193814959 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0937729279101249 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50647086 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000073169:ENST00000380903:exon_50646965_50647145:RP3-402G11.5;ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 A:T T A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50885534 C/T 1 77 55 132 36.1107622976466 29.2065983588239 6.90416393882271 T:C C T 10 0.531029061069525 0.256929482503237 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885184_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885235_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885236_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885239_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885255_50885669:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885512_50885669:SBF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 T:C C T 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 17 7 24 7.97250596181808 3.71720342748667 4.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.101582351603710 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 13 5 18 6.09662220609618 2.65514530534762 3.44147690074855 A:G G A 10 0.531029061069525 0.154818420661043 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50944835 T/C 0 19 0 19 8.91044783967903 0 8.91044783967903 T T 10 0.531029061069525 6.55216843145094e-06 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000507607:exon_50944825_50944931:LMF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 91 93 184 42.6763554426732 49.3857026794658 -6.7093472367926 T:G T G 10 0.531029061069525 0.33733859034606 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50962259 G/A 1 119 117 236 55.8075417327265 62.1304001451344 -6.3228584124079 A:G G A 10 0.531029061069525 0.433989141797791 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 53 42 95 24.8554597633152 22.30322056492 2.55223919839513 C:G C G 10 0.531029061069525 0.609205804952759 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 50964255 C/T 1 320 282 602 150.070700457752 149.750195221606 0.320505236145976 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 2 11 13 0.93794187786095 5.84131967176477 -4.90337779390383 C:G G C 10 0.531029061069525 0.00947500294686673 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 22 51015838 T/C 0 0 9 9 0 4.77926154962572 -4.77926154962572 C T C 10 0.531029061069525 0.00109726968724073 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000460853:exon_51015785_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000461117:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000417176:exon_51015753_51015892:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51015753_51015892:CTA-384D8.32 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 4829732 A/G 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:G A G 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 4856180 T/C 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 14 8 22 6.56559314502665 4.2482324885562 2.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.395246671022453 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 5021403 C/T 1 73 54 127 34.2348785419247 28.6755692977543 5.55930924417033 T:C C T 10 0.531029061069525 0.329724738823197 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5020801_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000457655:exon_5021097_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5021122_5021483:BHLHE40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 51 87 138 23.9175178854542 46.1995283130487 -22.2820104275944 T:C T C 10 0.531029061069525 0.000158585529816882 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 8809703 G/A 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR;ENSG00000180914:ENST00000449615:exon_8809598_8810015:OXTR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 T:C T C 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 31 25 56 14.5380991068447 13.2757265267381 1.2623725801066 A:G G A 10 0.531029061069525 0.789682939685218 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 27 19 46 12.6622153511228 10.089552160321 2.57266319080185 C:G G C 10 0.531029061069525 0.464479789669299 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 18 23 41 8.44147690074855 12.2136684045991 -3.77219150385052 C:G C G 10 0.531029061069525 0.274209434535938 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 20 20 40 9.3794187786095 10.6205812213905 -1.241162442781 A:G A G 10 0.531029061069525 0.752444833741799 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.353179015193061 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:G T G 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 10 15 25 4.68970938930475 7.96543591604287 -3.27572652673812 T:C C T 10 0.531029061069525 0.230193716561202 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 21 11 32 9.84838971753998 5.84131967176477 4.0070700457752 A:G A G 10 0.531029061069525 0.214413591306794 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 25 10 35 11.7242734732619 5.31029061069525 6.41398286256663 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0406150130467493 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 11871215 T/C 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 T:C T C 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11871188_11871338:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000460246:exon_11871188_11871384:C3orf31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 13 11 24 6.09662220609618 5.84131967176477 0.255302534331401 C:G C G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 12877704 G/A 1 1007 6600 7607 472.253735502988 3504.79180305886 -3032.53806755588 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0 ENSG00000144713:ENST00000429711:exon_12875984_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12876445_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000273223:exon_12877546_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12877549_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12877559_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12877601_12877722:RPL32 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 46 71 117 21.5726631908019 37.7030633359363 -16.1304001451344 T:G G T 10 0.531029061069525 0.00296446219878232 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 14193889 C/T 1 17 16 33 7.97250596181808 8.4964649771124 -0.523959015294324 T:C C T 10 0.531029061069525 0.86349039013865 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 29 20 49 13.6001572289838 10.6205812213905 2.97957600759328 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.474613657002575 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 15467794 C/T 1 10 1 11 4.68970938930475 0.531029061069525 4.15868032823523 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0133926860261115 ENSG00000206562:ENST00000443029:exon_15467794_15468142:METTL6;ENSG00000206562:ENST00000383790:exon_15467794_15468142:METTL6;ENSG00000206562:ENST00000450816:exon_15467794_15468142:METTL6;ENSG00000206562:ENST00000383789:exon_15467794_15468142:METTL6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 15731536 A/T 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 A:T A T 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15731347_15731727:ANKRD28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 30 22 52 14.0691281679143 11.6826393435295 2.3864888243847 C:G C G 10 0.531029061069525 0.579086842425757 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 192 230 422 90.0424202746512 122.136684045991 -32.0942637713395 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00178678289825157 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 149 169 318 69.8766699006408 89.7439113207497 -19.8672414201089 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0282983716340068 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 25640934 T/C 1 223 158 381 104.580519381496 83.9025916489849 20.677927732511 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.0352829976970159 ENSG00000077097:ENST00000413971:exon_25640926_25641020:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000435706:exon_25640926_25641020:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000264331:exon_25640926_25641020:TOP2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 25650812 T/C 1 46 33 79 21.5726631908019 17.5239590152943 4.04870417550753 T:C T C 10 0.531029061069525 0.369975519102696 ENSG00000077097:ENST00000413971:exon_25650674_25650835:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000435706:exon_25650674_25650835:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000264331:exon_25650674_25650835:TOP2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 32586521 C/T 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000413350:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000424991:exon_32586481_32586598:DYNC1LI1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 32769189 A/T 1 15 14 29 7.03456408395713 7.43440685497335 -0.399842771016225 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000182973:ENST00000331889:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000328834:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000454516:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000435630:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000416457:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000455381:exon_32769160_32769366:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000463697:exon_32769160_32769300:CNOT10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 T:G T G 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33434831 G/A 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G G A 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 16 6 22 7.5035350228876 3.18617436641715 4.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0861119295570477 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 12 14 26 5.6276512671657 7.43440685497335 -1.80675558780765 A:G G A 10 0.531029061069525 0.557227256665403 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33887008 G/A 1 21 12 33 9.84838971753998 6.3723487328343 3.47604098470568 A:G G A 10 0.531029061069525 0.295304352398917 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000462070:exon_33886911_33887080:PDCD6IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 35 25 60 16.4139828625666 13.2757265267381 3.1382563358285 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.440227275183055 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 77 79 156 36.1107622976466 41.9512958244925 -5.84053352684589 A:G A G 10 0.531029061069525 0.377725638668568 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 37367989 A/G 1 27 25 52 12.6622153511228 13.2757265267381 -0.613511175615297 A:G A G 10 0.531029061069525 0.890196460328992 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 38168125 A/C 1 44 26 70 20.6347213129409 13.8067555878076 6.82796572513325 A:C A C 10 0.531029061069525 0.119221355856599 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 5 13 18 2.34485469465238 6.90337779390382 -4.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.034821244804787 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 27 16 43 12.6622153511228 8.4964649771124 4.16575037401043 T:C C T 10 0.531029061069525 0.223785297537490 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 27 27 54 12.6622153511228 14.3377846488772 -1.67556929775435 A:G G A 10 0.531029061069525 0.683860568352869 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 12 11 23 5.6276512671657 5.84131967176477 -0.213668404599074 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 44871505 A/T 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 A:T A T 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44871463_44871567:KIF15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:C C A 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 73 51 124 34.2348785419247 27.0824821145458 7.15239642737891 C:G G C 10 0.531029061069525 0.208574114035437 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 45637765 A/G 1 2 10 12 0.93794187786095 5.31029061069525 -4.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.01705983554651 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 31 26 57 14.5380991068447 13.8067555878076 0.731343519037077 C:G C G 10 0.531029061069525 0.89490318849295 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 20 34 54 9.3794187786095 18.0549880763638 -8.67556929775435 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0201654317535976 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 15 24 39 7.03456408395713 12.7446974656686 -5.71013338171147 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0775370110567906 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 51 53 104 23.9175178854542 28.1445402366848 -4.22702235123059 T:C C T 10 0.531029061069525 0.432564522140066 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 47958037 G/T 1 47 41 88 22.0416341297323 21.7721915038505 0.269442625881801 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47957441_47958664:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47957441_47958664:MAP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 C:G C G 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 48725707 C/T 1 41 44 85 19.2278084961495 23.3652786870591 -4.13747019090962 T:C C T 10 0.531029061069525 0.386028348699061 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48725436_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48725437_48726206:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48725437_48726206:IP6K2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 5 15 20 2.34485469465238 7.96543591604287 -5.6205812213905 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0132875954363033 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49067904 T/C 1 95 113 208 44.5522391983951 60.0062839008563 -15.4540447024612 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0368969902937192 ENSG00000198218:ENST00000395443:exon_49067140_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000498392:exon_49067364_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000357496:exon_49067365_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000424300:exon_49067645_49068077:QRICH1;ENSG00000198218:ENST00000489642:exon_49067808_49068077:QRICH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49141116 G/A 1 27 18 45 12.6622153511228 9.55852309925145 3.10369225187138 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.374079365215399 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494838:exon_49141064_49141301:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49140778_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141064_49141139:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141064_49141139:QARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49154948 T/A 1 12 4 16 5.6276512671657 2.1241162442781 3.5035350228876 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0858135209465032 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49154900_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000488993:exon_49154870_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000480163:exon_49154900_49155003:USP19;ENSG00000172046:ENST00000491859:exon_49154870_49155003:USP19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49313978 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000188315:ENST00000343010:exon_49313860_49315342:C3orf62;ENSG00000188315:ENST00000436325:exon_49313860_49314274:C3orf62 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49343175 G/A 1 14 9 23 6.56559314502665 4.77926154962572 1.78633159540093 A:G G A 10 0.531029061069525 0.533837384337975 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000486549:exon_49343148_49343321:USP4;ENSG00000114316:ENST00000488520:exon_49343148_49343321:USP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49362369 C/T 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000416417:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000415188:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000464168:exon_49362327_49362472:USP4;ENSG00000114316:ENST00000491791:exon_49362327_49362472:USP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 49846852 G/A 1 55 50 105 25.7934016411761 26.5514530534762 -0.758051412300119 A:G G A 10 0.531029061069525 0.922234625148617 ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49846823_49846897:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000488536:exon_49846823_49847138:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000483751:exon_49846441_49847158:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000478875:exon_49846617_49847158:UBA7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 50103917 G/A 1 74 65 139 34.7038494808552 34.5168889695191 0.186960511336032 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50103675_50103935:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50103825_50103935:RBM6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52183854 C/G 1 13 2 15 6.09662220609618 1.06205812213905 5.03456408395713 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0090204421231964 ENSG00000164087:ENST00000296484:exon_52183832_52184003:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000394970:exon_52183832_52184003:POC1A;ENSG00000164087:ENST00000474012:exon_52183832_52184003:POC1A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 37 34 71 17.3519247404276 18.0549880763638 -0.703063335936271 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.905644343833106 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 16 19 35 7.5035350228876 10.089552160321 -2.58601713743337 T:C C T 10 0.531029061069525 0.401522469972212 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 7 16 23 3.28279657251333 8.4964649771124 -5.21366840459907 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0358368209699659 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 115 89 204 53.9316579770046 47.2615864351877 6.6700715418169 A:G G A 10 0.531029061069525 0.362417258938606 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 269 232 501 126.153182572298 123.19874216813 2.95444040416798 A:G G A 10 0.531029061069525 0.82293250657611 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 12 7 19 5.6276512671657 3.71720342748667 1.91044783967903 T:C C T 10 0.531029061069525 0.492182997022296 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53213657 T/C 1 14 12 26 6.56559314502665 6.3723487328343 0.19324441219235 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000163932:ENST00000478843:exon_53213593_53213710:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000487897:exon_53213593_53213792:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000464818:exon_53213593_53213792:PRKCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 49 49 98 22.9795760075933 26.0204239924067 -3.04084798481345 A:G G A 10 0.531029061069525 0.545421209708639 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 42 46 88 19.69677943508 24.4273368091981 -4.7305573741182 T:C C T 10 0.531029061069525 0.337131721462828 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 15 10 25 7.03456408395713 5.31029061069525 1.72427347326188 A:C A C 10 0.531029061069525 0.551537499339693 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53899057 A/G 1 18 14 32 8.44147690074855 7.43440685497335 1.0070700457752 A:G A G 10 0.531029061069525 0.859782086036622 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 36 37 73 16.8829538014971 19.6480752595724 -2.76512145807532 T:C T C 10 0.531029061069525 0.558407862586112 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 8 14 22 3.7517675114438 7.43440685497335 -3.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.136441945320730 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 56653424 A/T 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:T A T 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 56653427 T/C 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 57301815 G/C 1 14 9 23 6.56559314502665 4.77926154962572 1.78633159540093 C:G G C 10 0.531029061069525 0.533837384337975 ENSG00000157500:ENST00000288266:exon_57301770_57301820:APPL1;ENSG00000157500:ENST00000482800:exon_57301770_57302049:APPL1;ENSG00000157500:ENST00000488530:exon_57301770_57301820:APPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 58196639 C/T 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58196493_58196696:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58196493_58196950:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58196493_58196730:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58196493_58196659:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000463694:exon_58196493_58196647:DNASE1L3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 58382846 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58382766_58382927:PXK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 58410554 C/T 1 6 12 18 2.81382563358285 6.3723487328343 -3.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.102920868968033 ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 58416535 C/T 1 49 24 73 22.9795760075933 12.7446974656686 10.2348785419247 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0185729207854362 ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 12 18 30 5.6276512671657 9.55852309925145 -3.93087183208575 T:C C T 10 0.531029061069525 0.199676578025538 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 66431280 C/T 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 66433458 G/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 66433676 A/G 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 16 21 37 7.5035350228876 11.15161028246 -3.64807525957242 T:C T C 10 0.531029061069525 0.251425518775229 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 67451197 G/A 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 A:G G A 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000172340:ENST00000493112:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67451155_67451275:SUCLG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 30 28 58 14.0691281679143 14.8688137099467 -0.799685542032449 T:C C T 10 0.531029061069525 0.895582298519762 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 14 17 31 6.56559314502665 9.02749403818192 -2.46190089315527 T:C T C 10 0.531029061069525 0.472257159636515 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 19 20 39 8.91044783967903 10.6205812213905 -1.71013338171147 T:C T C 10 0.531029061069525 0.632048634114311 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 81698119 C/T 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 A:G G A 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 87276699 C/T 1 17 13 30 7.97250596181808 6.90337779390382 1.06912816791425 T:C C T 10 0.531029061069525 0.718926652870465 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87276421_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87276435_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87276452_87276706:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87276459_87276706:CHMP2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 25 31 56 11.7242734732619 16.4619008931553 -4.7376274198934 T:C T C 10 0.531029061069525 0.228899994115268 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:C A C 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 16 21 37 7.5035350228876 11.15161028246 -3.64807525957242 T:C C T 10 0.531029061069525 0.251425518775229 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 97677897 T/G 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 T:G T G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000514314:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000330299:exon_97677895_97678023:MINA;ENSG00000170854:ENST00000507612:exon_97677895_97678023:MINA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:G T G 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 87 67 154 40.8004716869513 35.5789470916582 5.22152459529315 T:C T C 10 0.531029061069525 0.420088365875999 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 101576175 T/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000477601:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495089:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495719:exon_101576044_101576303:NFKBIZ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 105264176 G/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000170017:ENST00000389926:exon_105264067_105264179:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000389927:exon_105264067_105264179:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000306107:exon_105264067_105264179:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000472644:exon_105264067_105264179:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000486979:exon_105264067_105264179:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000465413:exon_105264067_105264179:ALCAM;ENSG00000170017:ENST00000491388:exon_105263446_105264179:ALCAM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 107937408 C/T 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107937240_107937500:IFT57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 111710398 A/G 1 16 16 32 7.5035350228876 8.4964649771124 -0.992929954224799 A:G A G 10 0.531029061069525 0.727471493815791 ENSG00000144827:ENST00000491580:exon_111710224_111711118:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000273359:exon_111710224_111712210:ABHD10;ENSG00000144827:ENST00000493784:exon_111710224_111710823:ABHD10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 58 72 130 27.2003144579676 38.2340923970058 -11.0337779390382 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0536108080181055 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 96 139 235 45.0212101373256 73.813039488664 -28.7918293513384 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000184382725224408 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 112256630 A/G 1 24 37 61 11.2553025343314 19.6480752595724 -8.39277272524102 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0393202191711091 ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 112299732 A/G 1 4 16 20 1.8758837557219 8.4964649771124 -6.6205812213905 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00314866743205313 ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 18 13 31 8.44147690074855 6.90337779390382 1.53809910684473 A:T A T 10 0.531029061069525 0.595688867854144 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 118931389 C/T 1 21 27 48 9.84838971753998 14.3377846488772 -4.4893949313372 T:C C T 10 0.531029061069525 0.197129510897693 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118930579_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118930587_118935191:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118930589_118931528:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118930626_118931528:B4GALT4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 118945796 G/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 C:G G C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000460321:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000491906:exon_118945656_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118945733_118945888:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118945786_118945888:B4GALT4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 119150836 C/T 1 16 21 37 7.5035350228876 11.15161028246 -3.64807525957242 T:C C T 10 0.531029061069525 0.251425518775229 ENSG00000176142:ENST00000438581:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000319172:exon_119148347_119151061:TMEM39A;ENSG00000176142:ENST00000473684:exon_119148347_119151061:TMEM39A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 119222456 G/C 1 13 17 30 6.09662220609618 9.02749403818192 -2.93087183208575 C:G G C 10 0.531029061069525 0.360707760476209 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121351338 C/T 1 65 146 211 30.4831110304809 77.5302429161506 -47.0471318856698 T:C C T 10 0.531029061069525 7.24247725935872e-11 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121351179_121351410:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121351253_121351410:HCLS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 135 117 252 63.3110767556141 62.1304001451344 1.18067661047971 A:G G A 10 0.531029061069525 0.899678222968302 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 123 105 228 57.6834254884484 55.7580514123001 1.92537407614831 A:G G A 10 0.531029061069525 0.842282337681704 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 28 30 58 13.1311862900533 15.9308718320857 -2.79968554203245 T:C C T 10 0.531029061069525 0.511452692975594 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121415610 G/A 1 11 12 23 5.15868032823523 6.3723487328343 -1.21366840459907 A:G G A 10 0.531029061069525 0.678732618130644 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121415719 A/G 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 121416623 G/C 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 C:G G C 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121415847_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121415874_121417776:GOLGB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 27 18 45 12.6622153511228 9.55852309925145 3.10369225187138 A:G A G 10 0.531029061069525 0.374079365215399 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 29 20 49 13.6001572289838 10.6205812213905 2.97957600759328 A:G G A 10 0.531029061069525 0.474613657002575 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 122880191 T/C 1 10 13 23 4.68970938930475 6.90337779390382 -2.21366840459907 T:C T C 10 0.531029061069525 0.406694379844076 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 123665902 T/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:G T G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123665650_123666166:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000426152:exon_123665651_123665904:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000435910:exon_123665860_123666166:CCDC14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 125648343 G/A 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 26 23 49 12.1932444121924 12.2136684045991 -0.0204239924067231 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 127338035 G/A 1 38 44 82 17.8208956793581 23.3652786870591 -5.54438300770105 A:G G A 10 0.531029061069525 0.225529462676853 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127337870_127338121:MCM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 127872506 C/T 1 9 13 22 4.22073845037428 6.90337779390382 -2.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.289159904606614 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 127983495 T/C 1 10 5 15 4.68970938930475 2.65514530534762 2.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.315767079054389 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127983460_127983624:EEFSEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 130743812 G/A 1 13 9 22 6.09662220609618 4.77926154962572 1.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.671482239474886 ENSG00000034533:ENST00000514044:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000264992:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000507978:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000446270:exon_130743068_130744175:ASTE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 132218623 G/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132218578_132218652:DNAJC13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 133342913 C/T 1 14 10 24 6.56559314502665 5.31029061069525 1.2553025343314 T:C C T 10 0.531029061069525 0.685265962050597 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342896_133343019:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342896_133343019:TOPBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 23 24 47 10.7863315954009 12.7446974656686 -1.95836587026767 A:G G A 10 0.531029061069525 0.661532956137026 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:T T A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 141724328 T/C 1 14 10 24 6.56559314502665 5.31029061069525 1.2553025343314 T:C T C 10 0.531029061069525 0.685265962050597 ENSG00000114126:ENST00000489671:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000486111:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000495310:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000467072:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000310282:exon_141724283_141724377:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000487734:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000397991:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000317104:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000467667:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000497579:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000464782:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000488107:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000475734:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000471095:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000494358:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000467634:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000476617:exon_141724283_141724386:TFDP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 146234909 G/A 1 42 47 89 19.69677943508 24.9583658702677 -5.26158643518772 A:G G A 10 0.531029061069525 0.288675483213016 ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000462666:exon_146234876_146234954:PLSCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 148704081 G/A 0 22 0 22 10.3173606564705 0 10.3173606564705 G G 10 0.531029061069525 9.54846017868322e-07 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:C T C 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 148863151 A/G 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:G A G 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000462030:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000486530:exon_148863141_148863333:HPS3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 24 17 41 11.2553025343314 9.02749403818192 2.22780849614948 C:G C G 10 0.531029061069525 0.533682584553425 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 C:G G C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 156266765 A/G 1 89 83 172 41.7384135648123 44.0754120687706 -2.3369985039583 A:G A G 10 0.531029061069525 0.7600688887451 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 170802910 C/T 1 15 13 28 7.03456408395713 6.90337779390382 0.131186290053301 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170802907_170803018:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170802907_170803018:TNIK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 170811667 G/A 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170811628_170811757:TNIK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 20 24 44 9.3794187786095 12.7446974656686 -3.3652786870591 A:G G A 10 0.531029061069525 0.365233492339541 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 36 44 80 16.8829538014971 23.3652786870591 -6.482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.178503459791908 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 T:C T C 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 34 46 80 15.9450119236362 24.4273368091981 -8.482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0724145544306598 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 37 62 99 17.3519247404276 32.9238017863105 -15.571877045883 T:G T G 10 0.531029061069525 0.00175247885013771 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 36 49 85 16.8829538014971 26.0204239924067 -9.13747019090962 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0505542096450212 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 60 53 113 28.1382563358285 28.1445402366848 -0.00628390085632091 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 183901281 G/A 1 182 198 380 85.3527108853465 105.143754091766 -19.7910432064195 A:G G A 10 0.531029061069525 0.044925498692489 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183901270_183901450:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183901270_183901836:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183901270_183901853:AP2M1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 51 48 99 23.9175178854542 25.4893949313372 -1.57187704588297 T:C T C 10 0.531029061069525 0.763489732513003 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 27 38 65 12.6622153511228 20.1791043206419 -7.51688896951912 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0634025239742041 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 184019681 G/A 1 30 28 58 14.0691281679143 14.8688137099467 -0.799685542032449 A:G G A 10 0.531029061069525 0.895582298519762 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184019635_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000459910:exon_184019559_184019723:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000487475:exon_184019325_184019849:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000433010:exon_184019635_184019852:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000445558:exon_184019582_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184019646_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184019635_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000463602:exon_184019559_184019859:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000485937:exon_184019510_184019859:PSMD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 78 83 161 36.5797332365771 44.0754120687706 -7.49567883219352 T:C C T 10 0.531029061069525 0.237523717893434 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 56 32 88 26.2623725801066 16.9929299542248 9.2694426258818 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0541915420364697 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 2234 11 2245 1047.68107757068 5.84131967176477 1041.83975789892 T:C:G G T 10 0.531029061069525 0 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 122 98 220 57.214454549518 52.0408479848134 5.17360656470451 A:G G A 10 0.531029061069525 0.499929733581876 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 23 9 32 10.7863315954009 4.77926154962572 6.0070700457752 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0344669896601002 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 49 40 89 22.9795760075933 21.241162442781 1.73841356481228 A:G G A 10 0.531029061069525 0.750683088306213 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 24 28 52 11.2553025343314 14.8688137099467 -3.6135111756153 T:C C T 10 0.531029061069525 0.333271838489867 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 2 13 15 0.93794187786095 6.90337779390382 -5.96543591604287 A:T T A 10 0.531029061069525 0.00285422351519935 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 60 69 129 28.1382563358285 36.6410052137972 -8.50274887796872 A:C C A 10 0.531029061069525 0.134836326941545 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 T:C T C 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 A:G G A 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 194387300 C/T 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 30 17 47 14.0691281679143 9.02749403818192 5.04163412973233 A:G A G 10 0.531029061069525 0.146835381414607 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 28 28 56 13.1311862900533 14.8688137099467 -1.7376274198934 A:G G A 10 0.531029061069525 0.688869941876216 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 17 18 35 7.97250596181808 9.55852309925145 -1.58601713743337 T:C C T 10 0.531029061069525 0.615023862763492 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 27 20 47 12.6622153511228 10.6205812213905 2.04163412973233 T:C T C 10 0.531029061069525 0.563201957852784 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 196388099 G/C 1 78 88 166 36.5797332365771 46.7305573741182 -10.1508241375411 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.120135410318879 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 196434443 T/C 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 T:C T C 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000174007:ENST00000409690:exon_196433148_196434783:C3orf34;ENSG00000174007:ENST00000311566:exon_196433148_196434783:C3orf34;ENSG00000174007:ENST00000399942:exon_196433932_196434783:C3orf34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 22 21 43 10.3173606564705 11.15161028246 -0.834249625989575 T:C C T 10 0.531029061069525 0.878893655227225 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 196735808 G/A 1 15 11 26 7.03456408395713 5.84131967176477 1.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 0.697619552336346 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196735680_196735836:MFI2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 3 197665599 G/T 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000490748:exon_197665419_197665903:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197665531_197665646:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197665537_197665646:IQCG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 437831 C/T 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 T:C C T 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000503157:exon_437736_438221:ZNF721 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 4 10 14 1.8758837557219 5.31029061069525 -3.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 0.104946989484194 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 8 16 24 3.7517675114438 8.4964649771124 -4.7446974656686 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0649184187279779 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 4 12 16 1.8758837557219 6.3723487328343 -4.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0415470826185352 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 11 16 27 5.15868032823523 8.4964649771124 -3.33778464887717 T:C T C 10 0.531029061069525 0.247571337207832 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 26 29 55 12.1932444121924 15.3998427710162 -3.20659835882387 A:G A G 10 0.531029061069525 0.419061473241431 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 36 23 59 16.8829538014971 12.2136684045991 4.66928539689803 A:G A G 10 0.531029061069525 0.242092353747688 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 944210 A/C 1 4 6 10 1.8758837557219 3.18617436641715 -1.31029061069525 A:C A C 10 0.531029061069525 0.530830171328778 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_944209_944279:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_944209_944306:TMEM175 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 22 28 50 10.3173606564705 14.8688137099467 -4.55145305347625 T:C T C 10 0.531029061069525 0.205161879229890 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 63 75 138 29.5451691526199 39.8271795802144 -10.2820104275944 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0878920354498862 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1729556 G/A 1 26 24 50 12.1932444121924 12.7446974656686 -0.551453053476248 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888275640512622 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000493975:exon_1729435_1729821:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G 1 92 80 172 43.1453263816037 42.482324885562 0.663001496041709 A:C:G C G 10 0.531029061069525 0.939228304294478 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 70 61 131 32.8279657251333 32.392772725241 0.43519299989223 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 17 13 30 7.97250596181808 6.90337779390382 1.06912816791425 T:C C T 10 0.531029061069525 0.718926652870465 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1834666 T/C 1 10 11 21 4.68970938930475 5.84131967176477 -1.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.66596337608169 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1834471_1834674:LETM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 1843324 C/T 1 12 16 28 5.6276512671657 8.4964649771124 -2.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.344371932689015 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000505551:exon_1843074_1843524:LETM1;ENSG00000168924:ENST00000466175:exon_1843074_1843524:LETM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 82 78 160 38.4556169922989 41.4202667634229 -2.96464977112399 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.692196965220952 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 2826400 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2826340_2826644:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2826340_2826641:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2826340_2826923:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2826340_2826429:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2826340_2826828:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2826340_2826457:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2826340_2826509:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2826392_2826486:SH3BP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 35 25 60 16.4139828625666 13.2757265267381 3.1382563358285 T:C T C 10 0.531029061069525 0.440227275183055 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 43 51 94 20.1657503740104 27.0824821145458 -6.91673174053535 A:G A G 10 0.531029061069525 0.178862035732591 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 3189547 C/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3189378_3189613:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3189378_3190820:HTT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 13 13 26 6.09662220609618 6.90337779390382 -0.806755587807649 T:C T C 10 0.531029061069525 0.84501811777777 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 112 97 209 52.5247451602132 51.5098189237439 1.01492623646928 A:G A G 10 0.531029061069525 0.944768660905448 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/T 1 146 161 307 68.4697570838494 85.4956788321935 -17.0259217483442 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0520459264883229 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 6 31 37 2.81382563358285 16.4619008931553 -13.6480752595724 T:C C T 10 0.531029061069525 7.07592237798488e-06 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 5830393 C/T 1 3 10 13 1.40691281679143 5.31029061069525 -3.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0477572109989804 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 6303022 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 6303646 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 6303844 G/A 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 A:G G A 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 6303955 G/A 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 8375342 G/A 1 12 11 23 5.6276512671657 5.84131967176477 -0.213668404599074 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 57 55 112 26.7313435190371 29.2065983588239 -2.4752548397868 T:C T C 10 0.531029061069525 0.63762249846371 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 10586571 G/A 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000429087:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000442825:exon_10586551_10586579:CLNK;ENSG00000109684:ENST00000507719:exon_10586551_10586579:CLNK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 10669522 A/C 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 A:C A C 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000109684:ENST00000226951:exon_10669483_10669535:CLNK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 T:C T C 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 C:G G C 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 28 23 51 13.1311862900533 12.2136684045991 0.917517885454226 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888659609738321 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 15640168 C/T 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 T:C C T 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000118564:ENST00000422585:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000382358:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000341285:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000412094:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000511441:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000513163:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000507700:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000504837:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000512066:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000503196:exon_15640162_15640317:FBXL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 13 5 18 6.09662220609618 2.65514530534762 3.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.154818420661043 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 17609125 A/G 1 362 334 696 169.767479892832 177.363706397221 -7.59622650438936 A:G A G 10 0.531029061069525 0.569088603060392 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17609023_17609591:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000503467:exon_17609023_17609595:LAP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 17805379 G/A 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000163257:ENST00000382247:exon_17802278_17806394:DCAF16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 15 9 24 7.03456408395713 4.77926154962572 2.2553025343314 C:G G C 10 0.531029061069525 0.416713456894239 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 28 20 48 13.1311862900533 10.6205812213905 2.5106050686628 T:C T C 10 0.531029061069525 0.563415723835564 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 187 237 424 87.6975655799988 125.853887473477 -38.1563218934786 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000212474926803009 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 155 175 330 72.6904955342236 92.9300856871669 -20.2395901529432 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0272928398502008 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 92 137 229 43.1453263816037 72.7509813665249 -29.6056549849212 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000113438539693237 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38775794 A/G 1 39 87 126 18.2898666182885 46.1995283130487 -27.9096616947601 A:G A G 10 0.531029061069525 6.31264244475221e-07 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 43 51 94 20.1657503740104 27.0824821145458 -6.91673174053535 T:G T G 10 0.531029061069525 0.178862035732591 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 41 58 99 19.2278084961495 30.7996855420324 -11.571877045883 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0206130011794039 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 67 133 200 31.4210529083418 70.6268651222468 -39.205812213905 T:G T G 10 0.531029061069525 3.30907457952778e-08 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38799710 T/C 1 9 13 22 4.22073845037428 6.90337779390382 -2.68263934352955 T:C T C 10 0.531029061069525 0.289159904606614 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 38830350 A/G 1 11 8 19 5.15868032823523 4.2482324885562 0.910447839679025 A:G A G 10 0.531029061069525 0.819255610059721 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:C C T 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 40440215 T/C 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40439788_40440941:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40439788_40440814:RBM47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 42003671 A/G 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42003633_42003797:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42003633_42003797:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42003633_42003797:SLC30A9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 42020142 A/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G A G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42020128_42020187:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42020128_42020187:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42020128_42020187:SLC30A9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 42022464 C/A 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 A:C C A 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42022433_42022792:SLC30A9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 11 4 15 5.15868032823523 2.1241162442781 3.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.12904355932744 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 19 22 41 8.91044783967903 11.6826393435295 -2.77219150385052 A:G A G 10 0.531029061069525 0.435287250272125 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 54 45 99 25.3244307022457 23.8963077481286 1.42812295411703 A:G A G 10 0.531029061069525 0.840549604219979 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 15 7 22 7.03456408395713 3.71720342748667 3.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.200508636918786 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 15 2 17 7.03456408395713 1.06205812213905 5.97250596181808 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00309186466716774 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 48 34 82 22.5106050686628 18.0549880763638 4.45561699229895 T:C C T 10 0.531029061069525 0.376229229151722 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 40 34 74 18.758837557219 18.0549880763638 0.703849480855155 A:G G A 10 0.531029061069525 0.907646449048922 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 38 37 75 17.8208956793581 19.6480752595724 -1.82717958021437 A:G G A 10 0.531029061069525 0.728928688245585 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 45 50 95 21.1036922518714 26.5514530534762 -5.44776080160487 C:G G C 10 0.531029061069525 0.303953106481283 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 13 15 28 6.09662220609618 7.96543591604287 -1.8688137099467 T:C T C 10 0.531029061069525 0.571111918143577 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:G A G 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 17 17 34 7.97250596181808 9.02749403818192 -1.05498807636385 T:C C T 10 0.531029061069525 0.734239572909984 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 84380955 G/T 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 T:G G T 10 0.531029061069525 1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 87968524 G/A 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000172493:ENST00000504956:exon_87967847_87969201:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000507468:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000395146:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000395142:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000503477:exon_87967847_87968746:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000307808:exon_87967847_87968746:AFF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 88293887 G/A 1 6 13 19 2.81382563358285 6.90337779390382 -4.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0680604357891647 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88293861_88293967:HSD17B11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 88356173 G/C 1 19 21 40 8.91044783967903 11.15161028246 -2.241162442781 C:G G C 10 0.531029061069525 0.527921959001615 ENSG00000170502:ENST00000302174:exon_88356133_88356372:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000358033:exon_88356133_88356372:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000512216:exon_88356133_88356372:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000473942:exon_88356133_88356372:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000514227:exon_88356133_88356183:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000440591:exon_88356133_88356372:NUDT9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C T C 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 106395144 T/C 1 25 20 45 11.7242734732619 10.6205812213905 1.10369225187138 T:C T C 10 0.531029061069525 0.767362753594117 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000506815:exon_106395051_106395144:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 106395181 G/A 1 19 18 37 8.91044783967903 9.55852309925145 -0.648075259572423 A:G G A 10 0.531029061069525 0.870165427751023 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 108641317 G/A 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 96 102 198 45.0212101373256 54.1649642290915 -9.14375409176594 A:T A T 10 0.531029061069525 0.200366212278408 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 196 189 385 91.9183040303731 100.36449254214 -8.4461885117671 A:G A G 10 0.531029061069525 0.413956938251657 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 113352075 A/G 1 3 10 13 1.40691281679143 5.31029061069525 -3.90337779390382 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0477572109989804 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 12 6 18 5.6276512671657 3.18617436641715 2.44147690074855 A:G G A 10 0.531029061069525 0.345573301643562 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 113352832 C/T 1 13 14 27 6.09662220609618 7.43440685497335 -1.33778464887717 T:C C T 10 0.531029061069525 0.700905289249009 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:C A C 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 123280860 T/C 1 15 13 28 7.03456408395713 6.90337779390382 0.131186290053301 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123280712_123280877:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123280712_123280877:KIAA1109 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 128751804 T/C 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 T:C T C 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000164070:ENST00000508776:exon_128751793_128751954:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000296464:exon_128751793_128751954:HSPA4L;ENSG00000164070:ENST00000505726:exon_128751793_128751954:HSPA4L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 12 6 18 5.6276512671657 3.18617436641715 2.44147690074855 T:G G T 10 0.531029061069525 0.345573301643562 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 C:G C G 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 130030763 C/T 1 19 6 25 8.91044783967903 3.18617436641715 5.72427347326188 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0262689112085459 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 769 7 776 360.638652037535 3.71720342748667 356.921448610049 A:G G A 10 0.531029061069525 7.61680739744765e-198 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 144135718 G/A 1 14 23 37 6.56559314502665 12.2136684045991 -5.64807525957242 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0704727836063179 ENSG00000170185:ENST00000510377:exon_144134734_144136730:USP38;ENSG00000170185:ENST00000307017:exon_144134734_144136096:USP38;ENSG00000170185:ENST00000511739:exon_144134734_144136096:USP38 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 T:C C T 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 156721198 C/T 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 T:C C T 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 27 39 66 12.6622153511228 20.7101333817115 -8.04791803058865 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0490978020002542 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 159640428 T/C 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159640332_159640438:PPID HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 159642576 G/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159642495_159642635:PPID HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 33 34 67 15.4760409847057 18.0549880763638 -2.57894709165817 A:T:C:G A C 10 0.531029061069525 0.542699843136460 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 62 62 124 29.0761982136895 32.9238017863105 -3.8476035726211 T:C T C 10 0.531029061069525 0.529074305878637 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 165878335 A/G 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000250486:ENST00000513876:exon_165878100_165880274:C4orf39 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 16 26 42 7.5035350228876 13.8067555878076 -6.30322056492005 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0627743880211074 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 16 27 43 7.5035350228876 14.3377846488772 -6.83424962598957 T:G T G 10 0.531029061069525 0.046033118194267 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 16 10 26 7.5035350228876 5.31029061069525 2.19324441219235 T:C T C 10 0.531029061069525 0.436352332176201 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 14 9 23 6.56559314502665 4.77926154962572 1.78633159540093 A:G A G 10 0.531029061069525 0.533837384337975 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 185655171 C/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185655170_185655287:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185655170_185655284:MLF1IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 185686032 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185686007_185686079:ACSL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 186112208 G/T 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 T:G G T 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 C:G G C 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 190862151 A/C 1 47 28 75 22.0416341297323 14.8688137099467 7.17282041978563 A:C A C 10 0.531029061069525 0.105687155842314 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 37 21 58 17.3519247404276 11.15161028246 6.20031445796755 T:C C T 10 0.531029061069525 0.114787965145736 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 41 41 82 19.2278084961495 21.7721915038505 -2.54438300770105 A:G G A 10 0.531029061069525 0.582058460212343 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 206016 C/T 1 19 19 38 8.91044783967903 10.089552160321 -1.17910432064195 T:C C T 10 0.531029061069525 0.746698009203257 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127;ENSG00000164366:ENST00000441693:exon_205988_206073:CCDC127 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 226090 C/T 1 46 27 73 21.5726631908019 14.3377846488772 7.23487854192468 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.100653769900970 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 231042 C/T 1 35 54 89 16.4139828625666 28.6755692977543 -12.2615864351877 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0105290257431272 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 251565 T/C 1 70 59 129 32.8279657251333 31.330714603102 1.49725112203128 T:C T C 10 0.531029061069525 0.860044723873835 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_251453_251979:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_251285_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_251452_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_251456_251583:SDHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 1057615 A/G 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 24 18 42 11.2553025343314 9.55852309925145 1.69677943507995 A:G A G 10 0.531029061069525 0.64504390681119 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 5464237 A/C 1 19 12 31 8.91044783967903 6.3723487328343 2.53809910684473 A:C A C 10 0.531029061069525 0.375722831482458 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:C C A 10 0.531029061069525 0.764992693177811 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 C:G C G 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 17 3 20 7.97250596181808 1.59308718320857 6.3794187786095 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00564529382145500 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 6652009 G/A 1 10 1 11 4.68970938930475 0.531029061069525 4.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0133926860261115 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 2 10 12 0.93794187786095 5.31029061069525 -4.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 0.01705983554651 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 14681653 G/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 C:G G C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 14693034 G/A 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G G A 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14692963_14699820:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000506417:exon_14692963_14693509:FAM105B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 14713016 G/A 1 2 31 33 0.93794187786095 16.4619008931553 -15.5239590152943 A:G G A 10 0.531029061069525 1.09029029843984e-08 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14712983_14713082:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000502585:exon_14712983_14713082:ANKH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 14769103 G/A 0 0 8 8 0 4.2482324885562 -4.2482324885562 A G A 10 0.531029061069525 0.00233973919523274 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14769084_14769300:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000513115:exon_14768725_14769300:ANKH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 A:G A G 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 31552895 T/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:T T A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000082213:ENST00000325366:exon_31552880_31555165:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000355907:exon_31552880_31555154:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000510659:exon_31552880_31554915:C5orf22;ENSG00000082213:ENST00000504866:exon_31552880_31554946:C5orf22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 170 136 306 79.7250596181808 72.2199523054554 7.50510731272536 A:G G A 10 0.531029061069525 0.422671492446728 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 35861068 T/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000168685:ENST00000511031:exon_35860954_35861092:IL7R;ENSG00000168685:ENST00000303115:exon_35860954_35861092:IL7R;ENSG00000168685:ENST00000514217:exon_35860954_35861092:IL7R;ENSG00000168685:ENST00000343305:exon_35860954_35861092:IL7R;ENSG00000168685:ENST00000426051:exon_35860954_35861092:IL7R;ENSG00000168685:ENST00000506850:exon_35860954_35861092:IL7R;ENSG00000168685:ENST00000511982:exon_35860954_35861092:IL7R HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 41850216 C/A 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 A:C C A 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000083720:ENST00000196371:exon_41850132_41850281:OXCT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 41929895 G/A 1 9 2 11 4.22073845037428 1.06205812213905 3.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0710289055589968 ENSG00000151876:ENST00000281623:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000296812:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000513496:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000504463:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000509134:exon_41929799_41930019:FBXO4;ENSG00000151876:ENST00000506496:exon_41929799_41930257:FBXO4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 10 20 30 4.68970938930475 10.6205812213905 -5.93087183208575 A:G A G 10 0.531029061069525 0.042441580037341 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 56526783 G/A 1 52 39 91 24.3864888243847 20.7101333817115 3.67635544267323 A:G G A 10 0.531029061069525 0.463593912137126 ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526673_56526796:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526673_56526796:GPBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 82 85 167 38.4556169922989 45.1374701909096 -6.68185319861067 T:C T C 10 0.531029061069525 0.314004190436721 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 6 13 19 2.81382563358285 6.90337779390382 -4.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0680604357891647 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 37 44 81 17.3519247404276 23.3652786870591 -6.01335394663152 C:G C G 10 0.531029061069525 0.183654589821798 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 11 20 31 5.15868032823523 10.6205812213905 -5.46190089315527 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0702143720911154 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 65108119 G/A 1 11 2 13 5.15868032823523 1.06205812213905 4.09662220609617 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0257188033078452 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 65118738 C/T 1 16 22 38 7.5035350228876 11.6826393435295 -4.17910432064195 T:C C T 10 0.531029061069525 0.195054952625508 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65118609_65119153:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65118609_65119156:NLN;ENSG00000123213:ENST00000515595:exon_65118609_65119065:NLN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 65350412 G/T 1 11 20 31 5.15868032823523 10.6205812213905 -5.46190089315527 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0702143720911154 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 66480191 A/G 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C C T 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 25 27 52 11.7242734732619 14.3377846488772 -2.6135111756153 A:T A T 10 0.531029061069525 0.489760226625303 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 68524133 A/G 1 31 25 56 14.5380991068447 13.2757265267381 1.2623725801066 A:G A G 10 0.531029061069525 0.789682939685218 ENSG00000134056:ENST00000256441:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000507022:exon_68524027_68524214:MRPS36;ENSG00000134056:ENST00000512880:exon_68524027_68524214:MRPS36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 68687792 G/A 1 14 6 20 6.56559314502665 3.18617436641715 3.3794187786095 A:G G A 10 0.531029061069525 0.178235221525341 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000508320:exon_68687658_68687840:RAD17 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 C:G C G 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 25 28 53 11.7242734732619 14.8688137099467 -3.14454023668482 T:C C T 10 0.531029061069525 0.411114987295134 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 72865470 A/G 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 A:G A G 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72865322_72865500:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72865322_72865500:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72865322_72865500:UTP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 72868447 T/C 1 3 8 11 1.40691281679143 4.2482324885562 -2.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.128839343763674 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000512550:exon_72868314_72868449:UTP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 290 252 542 136.001572289838 133.81932338952 2.18224890031746 C:G C G 10 0.531029061069525 0.863403057157967 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 229 212 441 107.394345015079 112.578160946739 -5.1838159316605 A:G A G 10 0.531029061069525 0.633460114765101 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 75969841 A/G 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75969777_75969861:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75969777_75969861:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75969777_75969861:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75969777_75969861:IQGAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 23 35 58 10.7863315954009 18.5860171374334 -7.79968554203245 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0478428161410489 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 76758930 C/T 1 13 1 14 6.09662220609618 0.531029061069525 5.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00231439236421468 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000505129:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000506307:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509710:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507452:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509892:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515321:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000513417:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000514559:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000503035:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511036:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000504895:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509971:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000506474:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507239:exon_76758920_76759051:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509858:exon_76758918_76759051:WDR41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 19 15 34 8.91044783967903 7.96543591604287 0.945011923636152 A:G A G 10 0.531029061069525 0.863959540191866 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:C C A 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 1539 2270 3809 721.746275014001 1205.43596862782 -483.689693613821 A:T:G A G 10 0.531029061069525 1.47621633820666e-55 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 6 14 20 2.81382563358285 7.43440685497335 -4.6205812213905 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0442922401162171 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 81608521 G/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000205464:ENST00000380167:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000439350:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000508366:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L;ENSG00000205464:ENST00000514672:exon_81608430_81608670:ATP6AP1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 94856458 G/A 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 A:G G A 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94856420_94856522:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000507805:exon_94856420_94856522:TTC37 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 109 148 257 51.1178323434218 78.5923010382897 -27.4744686948679 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000708699601081394 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 95236680 T/A 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 A:T T A 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236660_95236784:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236660_95236784:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236660_95236784:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95236660_95236836:ELL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96031569 A/G 1 10 7 17 4.68970938930475 3.71720342748667 0.972505961818076 A:G A G 10 0.531029061069525 0.809007193926637 ENSG00000153113:ENST00000505143:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515160:exon_96031540_96031998:CAST;ENSG00000153113:ENST00000507487:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000421689:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512620:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514845:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000506811:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000514055:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96031540_96031611:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96031489_96031611:CAST HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 14 14 28 6.56559314502665 7.43440685497335 -0.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.850365293767878 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96126308 A/G 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 20 1 21 9.3794187786095 0.531029061069525 8.84838971753998 T:G G T 10 0.531029061069525 3.60790245242037e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 1 13 1 14 6.09662220609618 0.531029061069525 5.56559314502665 A:T T A 10 0.531029061069525 0.00231439236421468 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 31 3 34 14.5380991068447 1.59308718320857 12.9450119236362 T:C C T 10 0.531029061069525 2.63423851159756e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 76 3 79 35.6417913587161 1.59308718320857 34.0487041755075 T:C C T 10 0.531029061069525 1.75687203782899e-17 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 31 7 38 14.5380991068447 3.71720342748667 10.8208956793581 T:C C T 10 0.531029061069525 0.000461004229667696 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 16 15 31 7.5035350228876 7.96543591604287 -0.461900893155274 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 60 35 95 28.1382563358285 18.5860171374334 9.55223919839513 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0511754722410889 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 A:G G A 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 102612166 T/C 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000181751:ENST00000319933:exon_102611598_102614361:C5orf30;ENSG00000181751:ENST00000515669:exon_102611598_102612929:C5orf30;ENSG00000181751:ENST00000510890:exon_102611598_102614072:C5orf30 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 9 18 27 4.22073845037428 9.55852309925145 -5.33778464887717 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0522798045219031 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 110456263 C/G 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 C:G C G 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 110820116 T/G 1 32 35 67 15.0070700457752 18.5860171374334 -3.57894709165817 T:G T G 10 0.531029061069525 0.393919783437837 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 112178492 C/T 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 112222787 C/T 1 88 73 161 41.2694426258818 38.7651214580753 2.50432116780648 T:C C T 10 0.531029061069525 0.752226988817126 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000497856:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000261482:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000474542:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112222712_112222880:REEP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 9 9 18 4.22073845037428 4.77926154962572 -0.558523099251449 T:C T C 10 0.531029061069525 0.817439085135691 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 115426832 A/G 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115426776_115426886:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115426776_115426886:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115426776_115426886:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115426776_115426886:COMMD10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 5 13 18 2.34485469465238 6.90337779390382 -4.55852309925145 T:C C T 10 0.531029061069525 0.034821244804787 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 212 205 417 99.4218390532607 108.860957519253 -9.43911846599191 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.377169476403474 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 16 7 23 7.5035350228876 3.71720342748667 3.78633159540093 A:G A G 10 0.531029061069525 0.143736519391274 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 118877695 A/G 1 87 81 168 40.8004716869513 43.0133539466315 -2.2128822596802 A:G A G 10 0.531029061069525 0.757456816243877 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 24 23 47 11.2553025343314 12.2136684045991 -0.958365870267674 T:C T C 10 0.531029061069525 0.884009347691094 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 0 0 10 10 0 5.31029061069525 -5.31029061069525 T:G C G 10 0.531029061069525 0.000514587595485234 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 232 229 461 108.80125783187 121.605654984921 -12.804397153051 A:G A G 10 0.531029061069525 0.243399316542463 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 134670741 C/T 1 131 106 237 61.4351929998922 56.2890804733696 5.14611252652259 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51575789885495 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 107 95 202 50.1798904655608 50.4477608016049 -0.267870336044041 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 137500665 G/A 1 16 15 31 7.5035350228876 7.96543591604287 -0.461900893155274 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000112983:ENST00000254900:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000230901:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000454473:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000418329:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000441656:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000402931:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000411594:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000239899:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000455658:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000512140:exon_137500403_137500855:BRD8;ENSG00000112983:ENST00000506167:exon_137500403_137500855:BRD8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C T C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 C:G C G 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 139060486 G/A 1 90 84 174 42.2073845037428 44.6064411298401 -2.39905662609735 A:G G A 10 0.531029061069525 0.761374482184437 ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 139918962 G/A 1 26 63 89 12.1932444121924 33.4548308473801 -21.2615864351877 A:G G A 10 0.531029061069525 5.98416068341057e-06 ENSG00000131503:ENST00000360839:exon_139918944_139919441:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000310356:exon_139918944_139919003:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000431508:exon_139918944_139919434:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000433049:exon_139918944_139919433:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000435794:exon_139918944_139919441:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000432301:exon_139918944_139919434:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000474060:exon_139918504_139921866:ANKHD1-EIF4EBP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 139946888 G/A 1 55 58 113 25.7934016411761 30.7996855420324 -5.00628390085632 A:G G A 10 0.531029061069525 0.347855587329739 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 41 40 81 19.2278084961495 21.241162442781 -2.01335394663152 T:G T G 10 0.531029061069525 0.658019615007751 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 140048707 A/G 1 3 11 14 1.40691281679143 5.84131967176477 -4.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0284363057482022 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048664_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048664_140048833:WDR55 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 140057509 C/T 1 33 29 62 15.4760409847057 15.3998427710162 0.0761982136894517 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 140080460 C/T 1 38 28 66 17.8208956793581 14.8688137099467 2.95208196941135 T:C C T 10 0.531029061069525 0.537859294556646 ENSG00000146007:ENST00000519913:exon_140079747_140080497:ZMAT2;ENSG00000146007:ENST00000274712:exon_140080404_140080497:ZMAT2;ENSG00000146007:ENST00000515493:exon_140080404_140080497:ZMAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 30 21 51 14.0691281679143 11.15161028246 2.91751788545423 T:C T C 10 0.531029061069525 0.483569979245553 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 141019881 G/C 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 141021096 G/A 1 25 18 43 11.7242734732619 9.55852309925145 2.16575037401043 A:G G A 10 0.531029061069525 0.544027394603868 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141019979_141021179:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141020549_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141020554_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518160:exon_141020776_141021130:FCHSD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 145506100 G/A 1 20 12 32 9.3794187786095 6.3723487328343 3.0070700457752 A:G G A 10 0.531029061069525 0.376147483176247 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145505998_145506108:LARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 145650597 A/G 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000091009:ENST00000506502:exon_145650517_145650621:RBM27;ENSG00000091009:ENST00000265271:exon_145650517_145650621:RBM27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 149748403 C/T 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149748279_149748465:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149747136_149748465:TCOF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 149772280 C/G 1 24 30 54 11.2553025343314 15.9308718320857 -4.67556929775435 C:G C G 10 0.531029061069525 0.221053909478828 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 59 62 121 27.669285396898 32.9238017863105 -5.25451638941252 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.362825125472162 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 193 254 447 90.5113912135817 134.881381511659 -44.3699902980777 A:T:G A G 10 0.531029061069525 2.89251289287399e-05 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 42 34 76 19.69677943508 18.0549880763638 1.6417913587161 T:C T C 10 0.531029061069525 0.731526027959435 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 153382518 G/A 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 A:G G A 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153382407_153382529:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153382407_153382529:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153382407_153382529:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153382407_153382529:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153382407_153382529:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153382407_153382529:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153382407_153382529:FAM114A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 14 21 35 6.56559314502665 11.15161028246 -4.58601713743337 A:G A G 10 0.531029061069525 0.129881330640641 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 157162854 G/T 1 25 15 40 11.7242734732619 7.96543591604287 3.758837557219 T:G G T 10 0.531029061069525 0.268859502152553 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157162854_157162942:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157162854_157162942:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157162854_157162942:THG1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169021233 G/A 1 6 17 23 2.81382563358285 9.02749403818192 -6.21366840459907 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0112491125383521 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021176_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000513941:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021149_169021298:CCDC99 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 17 12 29 7.97250596181808 6.3723487328343 1.60015722898378 T:C C T 10 0.531029061069525 0.582243311671845 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 16 25 41 7.5035350228876 13.2757265267381 -5.77219150385052 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0847391266871018 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 31 53 84 14.5380991068447 28.1445402366848 -13.6064411298401 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00307522803302659 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 27 30 57 12.6622153511228 15.9308718320857 -3.26865648096292 T:C:G G T 10 0.531029061069525 0.426827619936401 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:C:G A G 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 29 18 47 13.6001572289838 9.55852309925145 4.04163412973233 C:G C G 10 0.531029061069525 0.246571094671566 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 36 29 65 16.8829538014971 15.3998427710162 1.48311103048088 T:C C T 10 0.531029061069525 0.803956234771484 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169805956 C/G 1 20 13 33 9.3794187786095 6.90337779390382 2.47604098470568 C:G C G 10 0.531029061069525 0.486056052297342 ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169805168_169805977:KCNMB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 169810796 C/T 1 4 8 12 1.8758837557219 4.2482324885562 -2.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.247383455186074 ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169810683_169810854:KCNMB1;ENSG00000145936:ENST00000521859:exon_169809656_169810854:KCNMB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 31 48 79 14.5380991068447 25.4893949313372 -10.9512958244925 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0173719174556335 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 20 20 40 9.3794187786095 10.6205812213905 -1.241162442781 A:G A G 10 0.531029061069525 0.752444833741799 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 19 14 33 8.91044783967903 7.43440685497335 1.47604098470568 T:C C T 10 0.531029061069525 0.727864253683201 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 22 14 36 10.3173606564705 7.43440685497335 2.8829538014971 A:G G A 10 0.531029061069525 0.404623585510165 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176721272 G/C 1 19 23 42 8.91044783967903 12.2136684045991 -3.30322056492005 C:G G C 10 0.531029061069525 0.354451943510727 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 22 9 31 10.3173606564705 4.77926154962572 5.53809910684473 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0489838224478622 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176830627 G/A 1 18 4 22 8.44147690074855 2.1241162442781 6.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00882469556206987 ENSG00000131187:ENST00000502854:exon_176830482_176831091:F12;ENSG00000131187:ENST00000504406:exon_176830255_176830751:F12;ENSG00000131187:ENST00000510358:exon_176830482_176831473:F12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 19 16 35 8.91044783967903 8.4964649771124 0.413982862566627 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 61 46 107 28.607227274759 24.4273368091981 4.17989046556083 A:G G A 10 0.531029061069525 0.439568974175346 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 4330 1 4331 2030.64416556896 0.531029061069525 2030.11313650789 A:T:C T A 10 0.531029061069525 0 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179020622 T/C 1 18 18 36 8.44147690074855 9.55852309925145 -1.1170461985029 T:C T C 10 0.531029061069525 0.740638587627158 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508609:exon_179020479_179020646:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179020479_179020646:RUFY1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179025789 G/A 1 15 20 35 7.03456408395713 10.6205812213905 -3.58601713743337 A:G G A 10 0.531029061069525 0.239605358947035 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179025693_179025822:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502531:exon_179025693_179025822:RUFY1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 42 31 73 19.69677943508 16.4619008931553 3.23487854192468 A:G G A 10 0.531029061069525 0.482949986397125 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 123 89 212 57.6834254884484 47.2615864351877 10.4218390532607 T:C C T 10 0.531029061069525 0.168621542585258 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 183 141 324 85.8216818242769 74.875097610803 10.9465842134739 A:G G A 10 0.531029061069525 0.242404153285139 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 25 68 93 11.7242734732619 36.1099761527277 -24.3857026794658 T:C T C 10 0.531029061069525 3.57861619247153e-07 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 19 11 30 8.91044783967903 5.84131967176477 3.06912816791425 T:G G T 10 0.531029061069525 0.278610279576009 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 53 40 93 24.8554597633152 21.241162442781 3.61429732053418 T:C C T 10 0.531029061069525 0.46886748475498 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 180661256 G/C 1 8 11 19 3.7517675114438 5.84131967176477 -2.08955216032097 A:C:G G C 10 0.531029061069525 0.3657768753567 ENSG00000146063:ENST00000515499:exon_180661174_180661326:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180661174_180661349:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180661174_180662809:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180661174_180662806:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180661174_180661775:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180661174_180661349:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000514219:exon_180661174_180661349:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000510072:exon_180661125_180661818:TRIM41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 5 180668646 G/A 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:G G A 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502890:exon_180668492_180668880:GNB2L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 277 187 464 129.904950083742 99.3024344200012 30.6025156637404 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00451864646828673 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 23 16 39 10.7863315954009 8.4964649771124 2.28986661828853 A:G A G 10 0.531029061069525 0.522770831369259 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 20 19 39 9.3794187786095 10.089552160321 -0.710133381711472 A:G G A 10 0.531029061069525 0.873231609767569 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 66 67 133 30.9520819694114 35.5789470916582 -4.62686512224682 A:G A G 10 0.531029061069525 0.435218447007685 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 45 32 77 21.1036922518714 16.9929299542248 4.11076229764658 A:G G A 10 0.531029061069525 0.363208439787782 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 10 17 27 4.68970938930475 9.02749403818192 -4.33778464887717 T:C C T 10 0.531029061069525 0.122001633726372 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 12 5 17 5.6276512671657 2.65514530534762 2.97250596181808 A:G A G 10 0.531029061069525 0.223483987112464 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 30 27 57 14.0691281679143 14.3377846488772 -0.268656480962923 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 13470415 G/A 1 10 5 15 4.68970938930475 2.65514530534762 2.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.315767079054389 ENSG00000187461:ENST00000379278:exon_13469507_13470862:C6orf114 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 14118034 G/A 1 26 5 31 12.1932444121924 2.65514530534762 9.53809910684473 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000466078949121455 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14117872_14118079:CD83 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 27 64 91 12.6622153511228 33.9858599084496 -21.3236445573268 A:G G A 10 0.531029061069525 7.50541624752614e-06 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 15663118 T/C 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 T:C T C 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15663045_15663273:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15663045_15663238:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15663045_15663261:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15663045_15663289:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15663045_15663251:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15663045_15663206:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15663045_15663151:DTNBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 16290761 T/A 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 A:T T A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16290693_16290852:GMPR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 16327330 T/C 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 17637958 G/A 1 9 14 23 4.22073845037428 7.43440685497335 -3.21366840459907 A:G G A 10 0.531029061069525 0.212038088650814 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 17637979 A/C 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:C A C 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 17675553 T/C 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:C T C 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675460_17675599:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675460_17675599:NUP153 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 A:G A G 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 12 8 20 5.6276512671657 4.2482324885562 1.3794187786095 A:G G A 10 0.531029061069525 0.655962224425547 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 A:G G A 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 11 15 26 5.15868032823523 7.96543591604287 -2.80675558780765 A:G G A 10 0.531029061069525 0.32706034167233 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 35 35 70 16.4139828625666 18.5860171374334 -2.17203427486675 A:G G A 10 0.531029061069525 0.63310830618457 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 24780944 A/C 1 15 10 25 7.03456408395713 5.31029061069525 1.72427347326188 A:C A C 10 0.531029061069525 0.551537499339693 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24780891_24780968:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24780891_24780968:GMNN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26027433 G/A 1 10 3 13 4.68970938930475 1.59308718320857 3.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.100357328720842 ENSG00000124529:ENST00000377364:exon_26027124_26027480:HIST1H4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26045737 C/G 1 4 11 15 1.8758837557219 5.84131967176477 -3.96543591604287 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0665237629925474 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26056399 G/A 1 182 129 311 85.3527108853465 68.5027488779687 16.8499620073777 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.0606694092006952 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26056477 A/C 1 199 184 383 93.3252168471645 97.7093472367926 -4.38413038962807 A:C A C 10 0.531029061069525 0.682186559450052 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26285503 C/T 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 26 19 45 12.1932444121924 10.089552160321 2.10369225187138 A:G G A 10 0.531029061069525 0.553853047746523 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 15 25 40 7.03456408395713 13.2757265267381 -6.241162442781 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0568023949654907 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 27839746 T/C 1 4 14 18 1.8758837557219 7.43440685497335 -5.55852309925145 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0092810211291724 ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 27840049 T/C 1 5 12 17 2.34485469465238 6.3723487328343 -4.02749403818192 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0551891724649989 ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 28093263 G/A 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 A:G G A 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000196812:ENST00000340487:exon_28093191_28093608:ZSCAN16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 28264692 C/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 C:G C G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 8 9 17 3.7517675114438 4.77926154962572 -1.02749403818192 C:G C G 10 0.531029061069525 0.6359939480117 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 28270064 T/A 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 A:T T A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 22 10 32 10.3173606564705 5.31029061069525 5.0070700457752 A:C C A 10 0.531029061069525 0.079403671982812 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 40 32 72 18.758837557219 16.9929299542248 1.7659076029942 T:C:G G C 10 0.531029061069525 0.723942889928092 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 32 27 59 15.0070700457752 14.3377846488772 0.669285396898028 A:G A G 10 0.531029061069525 0.896815600616257 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 13 42 55 6.09662220609618 22.30322056492 -16.2065983588239 A:G A G 10 0.531029061069525 1.00588420536234e-05 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 27 19 46 12.6622153511228 10.089552160321 2.57266319080185 A:G A G 10 0.531029061069525 0.464479789669299 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29691390 C/G 1 11 6 17 5.15868032823523 3.18617436641715 1.97250596181808 C:G C G 10 0.531029061069525 0.467321304347357 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29691391 T/C 1 11 5 16 5.15868032823523 2.65514530534762 2.5035350228876 T:C T C 10 0.531029061069525 0.316554141537720 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29693011 C/T 1 497 327 824 233.078556648446 173.646502969735 59.4320536787114 T:C C T 10 0.531029061069525 3.20101093554081e-05 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000489502:exon_29692897_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29692808_29693076:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000429294:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000465459:exon_29692831_29693083:HLA-F HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29910820 G/C 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 G G 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29910834 G/C 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 639 1 640 299.672429976574 0.531029061069525 299.141400915504 A:G A G 10 0.531029061069525 1.15918814195731e-173 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 62 79 141 29.0761982136895 41.9512958244925 -12.875097610803 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0345814235323473 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 38 45 83 17.8208956793581 23.8963077481286 -6.07541206877057 A:C C A 10 0.531029061069525 0.188403326697107 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 18 19 37 8.44147690074855 10.089552160321 -1.64807525957242 T:C C T 10 0.531029061069525 0.623751217534118 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30231108 G/T 1 7 2 9 3.28279657251333 1.06205812213905 2.22073845037428 T:G G T 10 0.531029061069525 0.187254933265688 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 28 14 42 13.1311862900533 7.43440685497335 5.69677943507995 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0892279506342553 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 28 12 40 13.1311862900533 6.3723487328343 6.758837557219 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0386086377772848 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30314598 C/T 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 C C 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30457283 G/T 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457244_30457372:HLA-E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 453 435 888 212.443835335505 230.997641565243 -18.5538062297382 T:C T C 10 0.531029061069525 0.213654220077500 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 359 388 747 168.360567076041 206.039275694976 -37.6787086189352 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00595174757602229 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30520367 C/T 1 41 28 69 19.2278084961495 14.8688137099467 4.35899478620277 T:C C T 10 0.531029061069525 0.334983755199103 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30520244_30520438:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30520244_30520441:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30520244_30520438:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30520244_30520438:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30520244_30520438:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000487166:exon_30519954_30520438:GNL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 25 31 56 11.7242734732619 16.4619008931553 -4.7376274198934 A:G G A 10 0.531029061069525 0.228899994115268 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 8 7 15 3.7517675114438 3.71720342748667 0.0345640839571253 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30593485 C/G 1 167 140 307 78.3181468013893 74.3440685497335 3.97407825165584 C:G C G 10 0.531029061069525 0.68902056523852 ENSG00000204568:ENST00000259873:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472267:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000376508:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472229:exon_30593279_30594172:MRPS18B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30596135 A/G 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000137343:ENST00000318999:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376485:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376478:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000319027:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376483:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000330083:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000329992:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000468713:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000493388:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000471782:exon_30596106_30596207:ATAT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30656398 T/G 1 114 92 206 53.4626870380742 48.8546736183963 4.60801341967785 T:G T G 10 0.531029061069525 0.530627765426231 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30668226 A/G 1 70 52 122 32.8279657251333 27.6135111756153 5.21445454951796 A:G A G 10 0.531029061069525 0.365154697684501 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30667584_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30668092_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30668172_30668409:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30668374 G/A 1 63 59 122 29.5451691526199 31.330714603102 -1.78554545048205 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.785768423829698 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30667584_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30668092_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30668172_30668409:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30671312 A/C 1 48 34 82 22.5106050686628 18.0549880763638 4.45561699229895 A:C A C 10 0.531029061069525 0.376229229151722 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671195_30671314:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671195_30671314:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30671588 A/T 1 32 44 76 15.0070700457752 23.3652786870591 -8.3582086412839 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0653691142536811 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671398_30671598:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30671726 G/C 1 40 25 65 18.758837557219 13.2757265267381 5.48311103048088 C:G G C 10 0.531029061069525 0.213654886337032 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 24 23 47 11.2553025343314 12.2136684045991 -0.958365870267674 A:G A G 10 0.531029061069525 0.884009347691094 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30672757 G/A 1 18 17 35 8.44147690074855 9.02749403818192 -0.586017137433373 A:G G A 10 0.531029061069525 0.866923667506405 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673013 A/G 1 7 18 25 3.28279657251333 9.55852309925145 -6.27572652673812 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0149880660457703 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673064 C/T 1 19 4 23 8.91044783967903 2.1241162442781 6.78633159540093 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00543766953914801 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673113 G/T 1 19 1 20 8.91044783967903 0.531029061069525 8.3794187786095 T:G G T 10 0.531029061069525 6.56006945556145e-05 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673351 C/G 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 C C 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673359 T/G 0 8 0 8 3.7517675114438 0 3.7517675114438 T T 10 0.531029061069525 0.00866307595174825 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673422 A/G 1 4 10 14 1.8758837557219 5.31029061069525 -3.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 0.104946989484194 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30673489 G/C 0 0 16 16 0 8.4964649771124 -8.4964649771124 C G C 10 0.531029061069525 5.47437950170834e-06 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30680608 C/T 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 518 506 1024 242.926946365986 268.70070490118 -25.7737585351936 T:C C T 10 0.531029061069525 0.110292829279797 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 30708944 T/A 0 9 0 9 4.22073845037428 0 4.22073845037428 T T 10 0.531029061069525 0.00445514526787958 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 42 41 83 19.69677943508 21.7721915038505 -2.07541206877058 T:C:G G C 10 0.531029061069525 0.661458152511297 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 T:C T C 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 29 17 46 13.6001572289838 9.02749403818192 4.57266319080185 A:C C A 10 0.531029061069525 0.186777048696122 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 18 11 29 8.44147690074855 5.84131967176477 2.60015722898378 A:G G A 10 0.531029061069525 0.358335015951210 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 13 4 17 6.09662220609618 2.1241162442781 3.97250596181808 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0859287884724819 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 18 5 23 8.44147690074855 2.65514530534762 5.78633159540093 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0198557006447477 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 8 10 18 3.7517675114438 5.31029061069525 -1.55852309925145 C:G G C 10 0.531029061069525 0.487957924171637 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31122482 G/A 1 10 2 12 4.68970938930475 1.06205812213905 3.6276512671657 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0429430784031521 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 1 16 6 22 7.5035350228876 3.18617436641715 4.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0861119295570477 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31122502 C/T 1 6 17 23 2.81382563358285 9.02749403818192 -6.21366840459907 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0112491125383521 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31239501 G/T 1 496 33 529 232.609585709516 17.5239590152943 215.085626694221 T:G G T 10 0.531029061069525 2.45125127750694e-95 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 33 463 496 15.4760409847057 245.86645527519 -230.390414290484 T:C:G C G 10 0.531029061069525 2.15593954923739e-110 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31239518 C/T 1 474 29 503 222.292225053045 15.3998427710162 206.892382282029 A:T:C C T 10 0.531029061069525 2.42226195870830e-93 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/T 1 13 18 31 6.09662220609618 9.55852309925145 -3.46190089315527 T:G G T 10 0.531029061069525 0.28009400014822 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 369 280 649 173.050276465345 148.688137099467 24.3621393658783 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0589816883387094 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31378928 C/T 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31378640_31379136:AL645933.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31474947 G/T 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:G G T 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31474799_31475077:MICB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31503219 G/A 1 140 139 279 65.6559314502665 73.813039488664 -8.15710803839747 A:G G A 10 0.531029061069525 0.337551772985513 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31503144_31503262:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31503144_31503252:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000482195:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000431908:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31503165_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31503172_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31503184_31503262:BAT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 77 89 166 36.1107622976466 47.2615864351877 -11.1508241375411 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0872679987699582 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31599556 A/C 1 21 33 54 9.84838971753998 17.5239590152943 -7.67556929775435 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0406859795118843 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31600304 G/C 1 59 61 120 27.669285396898 32.392772725241 -4.723487328343 C:G G C 10 0.531029061069525 0.411011082351004 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 79 86 165 37.0487041755075 45.6684992519791 -8.61979507647162 A:G G A 10 0.531029061069525 0.185388022244647 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31604010 C/G 1 143 163 306 67.0628442670579 86.5577369543326 -19.4948926872746 T:C:G C G 10 0.531029061069525 0.0293505890984003 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603986_31604196:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603986_31604027:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603986_31604196:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31605016 T/C 1 303 323 626 142.098194495934 171.522386725457 -29.4241922295226 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0201298356092911 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000482441:exon_31605011_31605101:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31605167 G/A 1 13 10 23 6.09662220609618 5.31029061069525 0.786331595400926 A:G G A 10 0.531029061069525 0.835931027773604 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31605278 C/T 1 239 231 470 112.084054404384 122.66771310706 -10.5836587026767 T:C C T 10 0.531029061069525 0.332108931913007 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31605223_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31605223_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000482441:exon_31605223_31605548:BAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 44 45 89 20.6347213129409 23.8963077481286 -3.26158643518772 A:C:G A G 10 0.531029061069525 0.524623549269082 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 45 64 109 21.1036922518714 33.9858599084496 -12.8821676565782 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0160773811841854 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 141 151 292 66.124902389197 80.1853882214983 -14.0604858323013 T:C T C 10 0.531029061069525 0.100923035889703 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31639757 G/A 1 7 15 22 3.28279657251333 7.96543591604287 -4.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0543736988605008 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 13 9 22 6.09662220609618 4.77926154962572 1.31736065647045 A:G A G 10 0.531029061069525 0.671482239474886 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31732207 C/T 1 7 17 24 3.28279657251333 9.02749403818192 -5.7446974656686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.023314141943582 ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31747011 G/A 1 99 57 156 46.428122954117 30.2686564809629 16.1594664731541 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0101189769326511 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000463184:exon_31747007_31747069:VARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31750509 G/A 1 29 22 51 13.6001572289838 11.6826393435295 1.91751788545423 A:G G A 10 0.531029061069525 0.674401272876237 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000474643:exon_31750307_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000461328:exon_31750189_31750622:VARS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31777946 C/T 1 11 10 21 5.15868032823523 5.31029061069525 -0.151610282460024 T:C:G C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31847835 C/T 1 105 71 176 49.2419485876999 37.7030633359363 11.5388852517636 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0828291518614892 ENSG00000204371:ENST00000478491:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000461880:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000494816:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31847536_31848041:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31847542_31848041:EHMT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 31864547 G/T 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 T:G G T 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31864383_31864601:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000465429:exon_31864383_31864601:EHMT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32088854 G/C 1 36 31 67 16.8829538014971 16.4619008931553 0.421052908341828 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32088766_32088901:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32088766_32088901:ATF6B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32122472 C/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:C C A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000221988:ENST00000414204:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000361568:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000478521:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000395523:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000428388:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000445576:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000324816:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000437001:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000375137:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000375143:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000424499:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000493548:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000422437:exon_32122364_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000436118:exon_32122243_32122554:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000453656:exon_32122255_32122554:PPT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 11 3 14 5.15868032823523 1.59308718320857 3.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0639863671812761 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32605284 G/A 1 1600 138 1738 750.35350228876 73.2820104275944 677.071491861166 A:G G A 10 0.531029061069525 6.06138891393718e-278 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 1 1642 186 1828 770.05028172384 98.7714053589316 671.278876364908 A:T:C C T 10 0.531029061069525 1.97586341650941e-253 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32605309 A/G 1 1428 157 1585 669.690500792718 83.3715625879154 586.318938204803 A:G A G 10 0.531029061069525 8.37818224894191e-224 ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32627988 A/G 0 2430 0 2430 1139.59938160105 0 1139.59938160105 A A 10 0.531029061069525 0 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32627991 C/T 0 2506 0 2506 1175.24117295977 0 1175.24117295977 C C 10 0.531029061069525 0 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32628001 T/C 1 2555 3 2558 1198.22074896736 1.59308718320857 1196.62766178416 T:C T C 10 0.531029061069525 0 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32627244_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000460185:exon_32627663_32628026:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32627884_32628026:HLA-DQB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32628045 C/G 1 27 10 37 12.6622153511228 5.31029061069525 7.35192474042758 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0199268900125876 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32629155 C/A 1 1646 97 1743 771.926165479562 51.5098189237439 720.416346555818 A:T:C C A 10 0.531029061069525 1.48219693752374e-323 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32629124_32629234:HLA-DQB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32634369 C/A 0 185 0 185 86.7596237021379 0 86.7596237021379 C C 10 0.531029061069525 1.87617717310225e-51 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32634276_32634415:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399082:exon_32634276_32634429:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32634276_32634441:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32634276_32634461:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32634276_32634471:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32634276_32634447:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32634276_32634415:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32634276_32634431:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000447884:exon_32634334_32634434:HLA-DQB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32796685 A/G 1 32 20 52 15.0070700457752 10.6205812213905 4.3864888243847 A:G A G 10 0.531029061069525 0.266479459854853 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32796751 T/C 1 40 38 78 18.758837557219 20.1791043206419 -1.42026676342294 T:C T C 10 0.531029061069525 0.820697281719526 ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 19 33 52 8.91044783967903 17.5239590152943 -8.6135111756153 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0180798701828163 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32798548 G/A 1 34 42 76 15.9450119236362 22.30322056492 -6.3582086412839 A:G G A 10 0.531029061069525 0.167612507478285 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32798395_32798583:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 32 26 58 15.0070700457752 13.8067555878076 1.20031445796755 A:C C A 10 0.531029061069525 0.79348707275114 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 130 182 312 60.9662220609618 96.6472891146535 -35.6810670536918 A:G G A 10 0.531029061069525 5.37803528519349e-05 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32940621 C/T 1 14 18 32 6.56559314502665 9.55852309925145 -2.9929299542248 T:C C T 10 0.531029061069525 0.294896781552893 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32940507_32940704:BRD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 8 16 24 3.7517675114438 8.4964649771124 -4.7446974656686 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0649184187279779 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 106 133 239 49.7109195266304 70.6268651222468 -20.9159455956165 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00775545707805433 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 2089 503 2592 979.680291425762 267.107617717971 712.572673707791 T:C:G G C 10 0.531029061069525 7.53419465496381e-188 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 817 33 850 383.149257106198 17.5239590152943 365.625298090904 T:C C T 10 0.531029061069525 1.47337320543824e-176 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1092 92 1184 512.116265312079 48.8546736183963 463.261591693682 T:C T C 10 0.531029061069525 6.75223102261653e-192 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 1861 355 2216 872.754917349614 188.515316679681 684.239600669933 A:G G A 10 0.531029061069525 8.13497150579365e-207 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 1797 351 2148 842.740777258064 186.391200435403 656.34957682266 A:T:C:G T C 10 0.531029061069525 3.72263209878592e-196 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 693 144 837 324.996860678819 76.4681847940116 248.528675884808 T:C T C 10 0.531029061069525 6.73685240756654e-73 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 592 6 598 277.630795846841 3.18617436641715 274.444621480424 T:C C T 10 0.531029061069525 1.76306830190032e-151 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 596 0 596 279.506679602563 0 279.506679602563 G G 10 0.531029061069525 2.22609214118424e-164 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 605 0 605 283.727418052937 0 283.727418052937 A A 10 0.531029061069525 6.01455243366704e-167 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 0 673 1 674 315.61744190021 0.531029061069525 315.08641283914 A:T A T 10 0.531029061069525 6.41440859602823e-183 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 413 110 523 193.684997778286 58.4131967176477 135.271801060638 T:C:G T C 10 0.531029061069525 1.44771569077345e-34 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 495 140 635 232.140614770585 74.3440685497335 157.796546220852 T:C C T 10 0.531029061069525 1.81798938611744e-38 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 525 129 654 246.209742938499 68.5027488779687 177.706994060531 T:C T C 10 0.531029061069525 2.02930169315944e-47 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33169392 G/C 1 57 33 90 26.7313435190371 17.5239590152943 9.20738450374275 C:G G C 10 0.531029061069525 0.0571442604401134 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33172442 C/T 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000204228:ENST00000374662:exon_33172419_33172497:HSD17B8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33218589 C/T 1 58 86 144 27.2003144579676 45.6684992519791 -18.4681847940116 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00252968621405763 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33218050_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495981:exon_33218383_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000493674:exon_33218588_33218764:VPS52 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33271953 G/A 1 43 27 70 20.1657503740104 14.3377846488772 5.82796572513325 A:G G A 10 0.531029061069525 0.187786371740658 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33271905_33271994:TAPBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33371778 C/A 1 32 25 57 15.0070700457752 13.2757265267381 1.73134351903708 A:C C A 10 0.531029061069525 0.691810045489915 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33371506_33371906:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33371506_33371906:KIFC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 17 21 38 7.97250596181808 11.15161028246 -3.17910432064195 A:G G A 10 0.531029061069525 0.331798671155193 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 34214348 C/T 1 53 36 89 24.8554597633152 19.1170461985029 5.73841356481228 T:C C T 10 0.531029061069525 0.243367532445884 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 35423662 A/C 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:C A C 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000112039:ENST00000229769:exon_35423524_35424130:FANCE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 10 21 31 4.68970938930475 11.15161028246 -6.46190089315527 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0291499333205011 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 36867376 C/T 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36867202_36867409:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000416621:exon_36867202_36867409:C6orf89 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 A:G A G 10 0.531029061069525 1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 37443950 G/A 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 A:G G A 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 37619830 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000112139:ENST00000434837:exon_37619787_37620116:MDGA1;ENSG00000112139:ENST00000297153:exon_37619787_37620116:MDGA1;ENSG00000112139:ENST00000505425:exon_37619787_37620116:MDGA1;ENSG00000112139:ENST00000478143:exon_37619787_37620116:MDGA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 44 37 81 20.6347213129409 19.6480752595724 0.986646053368478 T:G T G 10 0.531029061069525 0.911452273845819 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 20 10 30 9.3794187786095 5.31029061069525 4.06912816791425 A:G G A 10 0.531029061069525 0.147313119787945 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 39082831 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000112167:ENST00000229903:exon_39082659_39082965:C6orf64;ENSG00000112167:ENST00000481599:exon_39082659_39082847:C6orf64 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 41555212 C/T 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000137166:ENST00000373063:exon_41555040_41555250:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000373060:exon_41555037_41555250:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000409208:exon_41555037_41555250:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000373057:exon_41555037_41555250:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000307972:exon_41555037_41555250:FOXP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 24 36 60 11.2553025343314 19.1170461985029 -7.8617436641715 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0515997220773952 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 13 5 18 6.09662220609618 2.65514530534762 3.44147690074855 A:C A C 10 0.531029061069525 0.154818420661043 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42906384 G/T 1 211 186 397 98.9528681143302 98.7714053589316 0.181462755398584 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 31 28 59 14.5380991068447 14.8688137099467 -0.330714603101974 T:G G T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 32 29 61 15.0070700457752 15.3998427710162 -0.392772725241024 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 30 20 50 14.0691281679143 10.6205812213905 3.44854694652375 T:C C T 10 0.531029061069525 0.395566728624823 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 13 18 31 6.09662220609618 9.55852309925145 -3.46190089315527 T:C T C 10 0.531029061069525 0.28009400014822 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 10 17 27 4.68970938930475 9.02749403818192 -4.33778464887717 C:G C G 10 0.531029061069525 0.122001633726372 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 88 106 194 41.2694426258818 56.2890804733696 -15.0196378474878 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0310899334468643 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43005522 G/A 1 26 24 50 12.1932444121924 12.7446974656686 -0.551453053476248 A:G G A 10 0.531029061069525 0.888275640512622 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43005355_43005749:CUL7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 15 12 27 7.03456408395713 6.3723487328343 0.662215351122826 T:C C T 10 0.531029061069525 0.849045079367674 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 14 9 23 6.56559314502665 4.77926154962572 1.78633159540093 A:G A G 10 0.531029061069525 0.533837384337975 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43472708 T/C 1 36 26 62 16.8829538014971 13.8067555878076 3.07619821368945 T:C T C 10 0.531029061069525 0.448386682121032 ENSG00000137221:ENST00000259751:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372454:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372452:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372449:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372445:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000436109:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372444:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000483640:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000454762:exon_43471361_43474291:TJAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 36 34 70 16.8829538014971 18.0549880763638 -1.17203427486675 A:C A C 10 0.531029061069525 0.811387022598975 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43581586 G/A 1 17 32 49 7.97250596181808 16.9929299542248 -9.02042399240672 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0141031428232492 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43582091 A/T 1 38 36 74 17.8208956793581 19.1170461985029 -1.29615051914485 A:T A T 10 0.531029061069525 0.816143727974447 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 A:G G A 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 44221404 G/C 1 3440 3323 6763 1613.26002992083 1764.60956993403 -151.349540013197 A:T:C:G G C 10 0.531029061069525 0.000233342149351246 ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44221226_44221620:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44221226_44221620:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44221226_44221620:HSP90AB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 82 69 151 38.4556169922989 36.6410052137972 1.81461177850173 T:G G T 10 0.531029061069525 0.806974445830956 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 44268371 T/C 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 T:C T C 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44267391_44268448:AARS2;ENSG00000124608:ENST00000491573:exon_44268309_44269003:AARS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 10 11 21 4.68970938930475 5.84131967176477 -1.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.66596337608169 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 A:G G A 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 49459978 A/G 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49459857_49460820:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49459857_49460820:CENPQ HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 52129484 C/T 1 147 118 265 68.9387280227798 62.6614292062039 6.27729881657588 T:C C T 10 0.531029061069525 0.460434933035534 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52129419_52129584:MCM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 52144221 C/T 1 14 24 38 6.56559314502665 12.7446974656686 -6.17910432064195 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0510144581908228 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52144159_52144397:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52144159_52144397:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52144159_52144397:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000476448:exon_52144159_52144250:MCM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 52268890 G/A 1 9 18 27 4.22073845037428 9.55852309925145 -5.33778464887717 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0522798045219031 ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 T:C C T 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57055354 C/T 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000112210:ENST00000344445:exon_57053581_57055398:RAB23;ENSG00000112210:ENST00000317483:exon_57053607_57055398:RAB23;ENSG00000112210:ENST00000468148:exon_57054597_57055398:RAB23 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 10 0 10 4.68970938930475 0 4.68970938930475 G G 10 0.531029061069525 0.00229771711226017 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 10 10 0 5.31029061069525 -5.31029061069525 G A G 10 0.531029061069525 0.000514587595485234 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 17 17 0 9.02749403818192 -9.02749403818192 A G A 10 0.531029061069525 2.56732489497791e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 15 0 15 7.03456408395713 0 7.03456408395713 C C 10 0.531029061069525 8.69695952611721e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 11 11 0 5.84131967176477 -5.84131967176477 C T C 10 0.531029061069525 0.000241326627816686 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 20 20 0 10.6205812213905 -10.6205812213905 A G A 10 0.531029061069525 2.64800393427275e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 71269459 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 19 17 36 8.91044783967903 9.02749403818192 -0.117046198502898 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 12 10 22 5.6276512671657 5.31029061069525 0.317360656470451 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 13 15 28 6.09662220609618 7.96543591604287 -1.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.571111918143577 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 A:T A T 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 79657391 G/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79657340_79657492:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79657340_79657492:PHIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 A:G A G 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 79680560 G/A 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79680498_79680605:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79680498_79680605:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79680498_79680605:PHIP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 8 13 21 3.7517675114438 6.90337779390382 -3.15161028246002 T:C C T 10 0.531029061069525 0.193093229428768 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 86159899 C/T 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 T:C C T 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000135318:ENST00000369651:exon_86159302_86160196:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369647:exon_86159302_86160196:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000257770:exon_86159809_86160196:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369646:exon_86159809_86160196:NT5E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 86176882 G/A 1 12 4 16 5.6276512671657 2.1241162442781 3.5035350228876 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0858135209465032 ENSG00000135318:ENST00000369651:exon_86176778_86177000:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369647:exon_86176778_86177000:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000257770:exon_86176778_86177000:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369646:exon_86176778_86177000:NT5E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 90039670 G/C 1 144 123 267 67.5318152059884 65.3165745115516 2.21524069443684 C:G G C 10 0.531029061069525 0.806444897245308 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:C A C 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 49 55 104 22.9795760075933 29.2065983588239 -6.22702235123059 A:G A G 10 0.531029061069525 0.238854894184791 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 87 66 153 40.8004716869513 35.0479180305886 5.75255365636268 T:C C T 10 0.531029061069525 0.373430387063698 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G G A 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 105821449 A/G 1 11 9 20 5.15868032823523 4.77926154962572 0.379418778609501 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105821244_105821453:PREP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 106553257 G/C 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 C:G G C 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106552700_106553808:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106552700_106553808:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106552700_106553808:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106552700_106553808:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106552700_106553808:PRDM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 106975277 T/G 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:G T G 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106975180_106975345:AIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 14 10 24 6.56559314502665 5.31029061069525 1.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.685265962050597 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 107001414 A/T 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 A:T A T 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_107001330_107001442:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_107001330_107001442:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_107001330_107001442:AIM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 109775231 A/G 1 7 11 18 3.28279657251333 5.84131967176477 -2.55852309925145 A:G A G 10 0.531029061069525 0.24626933089151 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 32 32 64 15.0070700457752 16.9929299542248 -1.9858599084496 A:G G A 10 0.531029061069525 0.619316812897903 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:C C T 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:G G A 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 A:G G A 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 33 27 60 15.4760409847057 14.3377846488772 1.1382563358285 T:C T C 10 0.531029061069525 0.797143165768462 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 2259 1 2260 1059.40535104394 0.531029061069525 1058.87432198287 T:C C T 10 0.531029061069525 0 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 119669877 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119669628_119670452:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119669628_119670452:MAN1A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 10 15 25 4.68970938930475 7.96543591604287 -3.27572652673812 A:G A G 10 0.531029061069525 0.230193716561202 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 767 357 1124 359.700710159674 189.57737480182 170.123335357854 A:G A G 10 0.531029061069525 7.01889754071091e-25 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 134308187 T/G 1 60 48 108 28.1382563358285 25.4893949313372 2.6488614044913 T:G T G 10 0.531029061069525 0.630882103865286 ENSG00000028839:ENST00000237264:exon_134308099_134308637:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000477527:exon_134308099_134308637:TBPL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 107 0 107 50.1798904655608 0 50.1798904655608 T T 10 0.531029061069525 5.78934185337784e-30 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 121 0 121 56.7454836105875 0 56.7454836105875 A A 10 0.531029061069525 6.17798029581104e-34 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 122 0 122 57.214454549518 0 57.214454549518 A A 10 0.531029061069525 3.24589941225223e-34 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 65 0 65 30.4831110304809 0 30.4831110304809 G G 10 0.531029061069525 2.51205666675581e-18 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 80 0 80 37.517675114438 0 37.517675114438 T T 10 0.531029061069525 1.22573956280977e-22 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 137026266 T/G 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:G T G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137026248_137026271:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137026248_137026271:MAP3K5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 1 66 1 67 30.9520819694114 0.531029061069525 30.4210529083418 A:C A C 10 0.531029061069525 2.9743191954003e-17 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 139695061 G/T 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 T:G G T 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 144183376 T/C 1 45 35 80 21.1036922518714 18.5860171374334 2.517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.65436852980639 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 20 12 32 9.3794187786095 6.3723487328343 3.0070700457752 A:G G A 10 0.531029061069525 0.376147483176247 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 149772190 G/A 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149770857_149772201:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149770878_149772211:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149771792_149772615:ZC3H12D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 32 29 61 15.0070700457752 15.3998427710162 -0.392772725241024 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 151766500 T/C 1 13 16 29 6.09662220609618 8.4964649771124 -2.39984277101622 T:C T C 10 0.531029061069525 0.457534991859192 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 155577823 C/T 1 16 10 26 7.5035350228876 5.31029061069525 2.19324441219235 T:C C T 10 0.531029061069525 0.436352332176201 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 20 16 36 9.3794187786095 8.4964649771124 0.882953801497102 T:C C T 10 0.531029061069525 0.867839907437527 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 A:C A C 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 157522090 G/A 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 A:G G A 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157521839_157522622:ARID1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 157713975 G/T 1 39 49 88 18.2898666182885 26.0204239924067 -7.7305573741182 T:G G T 10 0.531029061069525 0.109170996908318 ENSG00000215712:ENST00000400788:exon_157712662_157714031:C6orf35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C C T 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 42 51 93 19.69677943508 27.0824821145458 -7.38570267946582 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.145485162512304 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 51 71 122 23.9175178854542 37.7030633359363 -13.785545450482 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0140784394367115 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 160496967 C/T 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 T:C C T 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160496879_160497028:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160496879_160497028:IGF2R HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 160499260 G/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160499233_160499394:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160499233_160499394:IGF2R HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 160499381 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160499233_160499394:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160499233_160499394:IGF2R HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 16 15 31 7.5035350228876 7.96543591604287 -0.461900893155274 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 22 24 46 10.3173606564705 12.7446974656686 -2.42733680919815 T:C T C 10 0.531029061069525 0.555095215867205 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 168281191 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168281040_168281197:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000423229:exon_168281161_168281197:MLLT4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 10 3 13 4.68970938930475 1.59308718320857 3.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.100357328720842 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 A:G A G 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 18 13 31 8.44147690074855 6.90337779390382 1.53809910684473 A:G G A 10 0.531029061069525 0.595688867854144 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 112 86 198 52.5247451602132 45.6684992519791 6.85624590823405 A:T:C:G G C 10 0.531029061069525 0.354786993467522 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 T:C T C 10 0.531029061069525 0.321071456058558 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 538191 C/T 1 48 26 74 22.5106050686628 13.8067555878076 8.70384948085515 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0474562178400739 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_536895_538211:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_536895_538211:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_537946_538211:PDGFA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 12 25 37 5.6276512671657 13.2757265267381 -7.64807525957242 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0131404164293457 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 7 10 17 3.28279657251333 5.31029061069525 -2.02749403818192 A:G A G 10 0.531029061069525 0.342652708932449 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 751025 T/C 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 T:C T C 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000417852:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000488474:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000456696:exon_750967_751164:PRKAR1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 931960 G/A 1 29 29 58 13.6001572289838 15.3998427710162 -1.79968554203245 A:G G A 10 0.531029061069525 0.693726192526832 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 940181 C/T 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 T:C C T 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_940170_941036:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_940170_940253:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_940170_940253:COX19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 1097895 A/G 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:G A G 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 1131356 T/C 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 1131412 A/G 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 25 23 48 11.7242734732619 12.2136684045991 -0.489394931337198 A:G G A 10 0.531029061069525 0.886287248267494 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 94 92 186 44.0832682594647 48.8546736183963 -4.77140535893164 T:C T C 10 0.531029061069525 0.508784206766762 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 19 41 60 8.91044783967903 21.7721915038505 -12.8617436641715 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00106183355016239 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6026942 G/T 1 16 5 21 7.5035350228876 2.65514530534762 4.84838971753998 T:G G T 10 0.531029061069525 0.0468665783945728 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 6 25 31 2.81382563358285 13.2757265267381 -10.4619008931553 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000191272662246859 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 143 110 253 67.0628442670579 58.4131967176477 8.64964754941018 T:C C T 10 0.531029061069525 0.284735446338153 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6098685 C/T 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6098597_6098861:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000431744:exon_6098597_6098795:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000463213:exon_6098597_6098687:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000446699:exon_6098597_6098795:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000461493:exon_6098597_6098806:EIF2AK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 9 9 18 4.22073845037428 4.77926154962572 -0.558523099251449 T:C T C 10 0.531029061069525 0.817439085135691 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6194266 G/C 1 17 20 37 7.97250596181808 10.6205812213905 -2.64807525957242 C:G G C 10 0.531029061069525 0.413230002493989 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 16 22 38 7.5035350228876 11.6826393435295 -4.17910432064195 T:C T C 10 0.531029061069525 0.195054952625508 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 11 14 25 5.15868032823523 7.43440685497335 -2.27572652673812 A:G G A 10 0.531029061069525 0.424884149322681 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6370194 C/T 1 12 16 28 5.6276512671657 8.4964649771124 -2.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.344371932689015 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6370305 C/G 1 16 8 24 7.5035350228876 4.2482324885562 3.2553025343314 C:G C G 10 0.531029061069525 0.221638564753188 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6370406 C/T 1 5 10 15 2.34485469465238 5.31029061069525 -2.96543591604287 T:C C T 10 0.531029061069525 0.194297401734466 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 14 23 37 6.56559314502665 12.2136684045991 -5.64807525957242 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0704727836063179 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 12727826 G/C 1 9 3 12 4.22073845037428 1.59308718320857 2.6276512671657 C:G G C 10 0.531029061069525 0.155286387026531 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000439721:exon_12727791_12728031:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000399303:exon_12727722_12728432:ARL4A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 20198440 G/A 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 27 23 50 12.6622153511228 12.2136684045991 0.448546946523752 C:G G C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 36895342 C/T 1 37 40 77 17.3519247404276 21.241162442781 -3.88923770235342 T:C C T 10 0.531029061069525 0.424407963449633 ENSG00000155849:ENST00000341056:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396042:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396045:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396040:exon_36894067_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_36894600_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_36894896_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000497024:exon_36894972_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000487843:exon_36895103_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_36895128_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_36895156_36895356:ELMO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 38398269 C/G 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 C:G C G 10 0.531029061069525 0.205796127209076 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 62 59 121 29.0761982136895 31.330714603102 -2.25451638941252 T:C T C 10 0.531029061069525 0.715975672251483 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 43906544 C/T 1 161 177 338 75.5043211678065 93.9921438093059 -18.4878226414994 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0496098066304692 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 43908661 G/T 1 43 32 75 20.1657503740104 16.9929299542248 3.17282041978563 T:G G T 10 0.531029061069525 0.489279978917432 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43908562_43908673:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43908648_43908673:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43908562_43908673:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43908562_43908748:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43908562_43908673:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000414932:exon_43907147_43908673:MRPS24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 16 31 47 7.5035350228876 16.4619008931553 -8.95836587026767 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0121464183049697 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 10 14 24 4.68970938930475 7.43440685497335 -2.7446974656686 A:G G A 10 0.531029061069525 0.308686848417513 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 44098033 C/T 1 88 73 161 41.2694426258818 38.7651214580753 2.50432116780648 T:C C T 10 0.531029061069525 0.752226988817126 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000439815:exon_44098028_44098092:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000441904:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44098028_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44098031_44098079:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44098031_44098582:DBNL HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 1 22 21 43 10.3173606564705 11.15161028246 -0.834249625989575 A:G A G 10 0.531029061069525 0.878893655227225 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 44156491 G/A 1 102 76 178 47.8350357709085 40.3582086412839 7.47682712962456 A:G G A 10 0.531029061069525 0.293071938102263 ENSG00000106628:ENST00000406581:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000395803:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000223361:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000452185:exon_44156416_44156614:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000436844:exon_44156416_44156614:POLD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 44611235 T/C 1 28 35 63 13.1311862900533 18.5860171374334 -5.45483084738007 T:C T C 10 0.531029061069525 0.206489478367564 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44611091_44611335:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44611091_44611335:DDX56 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 13 21 34 6.09662220609618 11.15161028246 -5.05498807636385 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0879142680908875 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 16 11 27 7.5035350228876 5.84131967176477 1.66221535112283 A:G G A 10 0.531029061069525 0.567591547958588 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 183 190 373 85.8216818242769 100.89552160321 -15.0738397789328 T:C T C 10 0.531029061069525 0.119859508144838 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 18 24 42 8.44147690074855 12.7446974656686 -4.30322056492005 T:C C T 10 0.531029061069525 0.216399168769630 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 64169019 G/A 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 0.565641303351698 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 A:C A C 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 104 101 205 48.7729776487694 53.633935168022 -4.86095751925262 A:G A G 10 0.531029061069525 0.528974702841813 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 26 10 36 12.1932444121924 5.31029061069525 6.8829538014971 A:C C A 10 0.531029061069525 0.028581313230623 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 44 27 71 20.6347213129409 14.3377846488772 6.29693666406373 T:C C T 10 0.531029061069525 0.153636315834878 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 33 34 67 15.4760409847057 18.0549880763638 -2.57894709165817 T:C C T 10 0.531029061069525 0.542699843136460 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 73151643 C/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 9 16 25 4.22073845037428 8.4964649771124 -4.27572652673812 T:C T C 10 0.531029061069525 0.108422944068912 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 73969541 A/G 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000006704:ENST00000265755:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000455841:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000424337:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000476977:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000489094:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000470715:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 75517386 A/G 1 21 26 47 9.84838971753998 13.8067555878076 -3.95836587026767 A:G A G 10 0.531029061069525 0.306272271668692 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 11 15 26 5.15868032823523 7.96543591604287 -2.80675558780765 A:G A G 10 0.531029061069525 0.32706034167233 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 45 78 123 21.1036922518714 41.4202667634229 -20.3165745115516 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.000273441925132009 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 75695613 A/G 1 668 699 1367 313.272587205557 371.189313687598 -57.9167264820406 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00182115319264577 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75695597_75696826:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75695597_75696824:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75695597_75696385:MDH2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 75933501 C/T 1 818 746 1564 383.618228045129 396.147679557866 -12.529451512737 A:T:C C T 10 0.531029061069525 0.526607401350457 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75933301_75933612:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75933301_75933609:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000447574:exon_75933301_75933577:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000429938:exon_75933301_75933612:HSPB1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 47 29 76 22.0416341297323 15.3998427710162 6.6417913587161 A:G G A 10 0.531029061069525 0.136009134645875 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 76111994 C/G 1 28 21 49 13.1311862900533 11.15161028246 1.97957600759328 C:G C G 10 0.531029061069525 0.668105156925642 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 77247821 G/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:G G A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77247797_77247882:PTPN12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 77569559 C/T 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000006576:ENST00000427986:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000422959:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000307305:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000424760:exon_77569347_77569776:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000275575:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000416283:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000248550:exon_77569347_77569619:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000479515:exon_77569347_77569776:PHTF2;ENSG00000006576:ENST00000470215:exon_77569516_77569619:PHTF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 92734451 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 144 133 277 67.5318152059884 70.6268651222468 -3.09504991625842 A:G G A 10 0.531029061069525 0.718293492750663 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 26 31 57 12.1932444121924 16.4619008931553 -4.26865648096292 A:G A G 10 0.531029061069525 0.289055945260636 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 25 27 52 11.7242734732619 14.3377846488772 -2.6135111756153 T:C C T 10 0.531029061069525 0.489760226625303 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 98984354 G/C 1 178 171 349 83.4768271296246 90.8059694428888 -7.32914231326421 C:G G C 10 0.531029061069525 0.452843647108453 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 5 5 10 2.34485469465238 2.65514530534762 -0.310290610695249 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99050039 G/A 1 17 16 33 7.97250596181808 8.4964649771124 -0.523959015294324 A:G G A 10 0.531029061069525 0.86349039013865 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 400 176 576 187.58837557219 93.4611147482364 94.1272608239536 T:C T C 10 0.531029061069525 1.69900545591865e-15 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 8 3 11 3.7517675114438 1.59308718320857 2.15868032823523 A:G A G 10 0.531029061069525 0.236453164121469 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99084282 A/G 1 20 12 32 9.3794187786095 6.3723487328343 3.0070700457752 A:G A G 10 0.531029061069525 0.376147483176247 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99084099_99085217:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99084099_99084423:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99084099_99084627:ZNF789;ENSG00000160908:ENST00000462024:exon_99084142_99084586:ZNF394 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 5 16 21 2.34485469465238 8.4964649771124 -6.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.00805846596336388 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 81 102 183 37.9866460533685 54.1649642290915 -16.1783181757231 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0176947980628484 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 72 35 107 33.7659076029942 18.5860171374334 15.1798904655608 A:T A T 10 0.531029061069525 0.00350774943756081 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 88 39 127 41.2694426258818 20.7101333817115 20.5593092441703 A:G A G 10 0.531029061069525 0.000243269750365524 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 100 100 200 46.8970938930475 53.1029061069525 -6.20581221390499 A:G G A 10 0.531029061069525 0.395631512180986 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 3 6 9 1.40691281679143 3.18617436641715 -1.77926154962572 A:G A G 10 0.531029061069525 0.321071456058558 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99757612 G/A 1 10 17 27 4.68970938930475 9.02749403818192 -4.33778464887717 A:G G A 10 0.531029061069525 0.122001633726372 ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99799845 T/A 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:T T A 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000066923:ENST00000426455:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000394018:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000379577:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000317296:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000491498:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000440830:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99798283_99800226:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99798283_99800226:GATS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 26 16 42 12.1932444121924 8.4964649771124 3.69677943507995 A:G A G 10 0.531029061069525 0.281389688068275 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 44 48 92 20.6347213129409 25.4893949313372 -4.8546736183963 T:C T C 10 0.531029061069525 0.347361204148141 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 29 45 74 13.6001572289838 23.8963077481286 -10.2961505191448 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0193875399192336 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 26 38 64 12.1932444121924 20.1791043206419 -7.9858599084496 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0594388631569784 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 68 75 143 31.8900238472723 39.8271795802144 -7.93715573294207 T:C T C 10 0.531029061069525 0.208688878256604 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 11 22 33 5.15868032823523 11.6826393435295 -6.52395901529432 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0240103163108455 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 19 22 41 8.91044783967903 11.6826393435295 -2.77219150385052 T:C C T 10 0.531029061069525 0.435287250272125 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100488658 G/C 1 28 30 58 13.1311862900533 15.9308718320857 -2.79968554203245 C:G G C 10 0.531029061069525 0.511452692975594 ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100488337_100488709:ACHE HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 106897237 A/C 0 0 11 11 0 5.84131967176477 -5.84131967176477 C A C 10 0.531029061069525 0.000241326627816686 ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_106897177_106897239:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_106897177_106897239:COG5;ENSG00000164597:ENST00000468350:exon_106897177_106897239:COG5;ENSG00000164597:ENST00000462342:exon_106897177_106897239:COG5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 15 29 44 7.03456408395713 15.3998427710162 -8.3652786870591 T:C:G T C 10 0.531029061069525 0.0148135487542405 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 111981007 G/A 1 53 37 90 24.8554597633152 19.6480752595724 5.20738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 0.291903963797018 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 28 29 57 13.1311862900533 15.3998427710162 -2.26865648096292 C:G G C 10 0.531029061069525 0.596451483005641 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G A G 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 127979373 T/A 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:T T A 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127979281_127979375:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000478061:exon_127979281_127979375:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000459726:exon_127979281_127979375:RBM28 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 128034629 C/T 1 30 30 60 14.0691281679143 15.9308718320857 -1.8617436641715 T:C C T 10 0.531029061069525 0.698435688928714 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128034510_128034653:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000460045:exon_128034510_128035052:IMPDH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 128038555 C/G 1 12 4 16 5.6276512671657 2.1241162442781 3.5035350228876 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0858135209465032 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000497868:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000468842:exon_128038544_128038667:IMPDH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 129394920 G/A 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 A:G G A 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129394858_129396920:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129394858_129396920:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129394858_129396920:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129394858_129395855:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129394858_129395855:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129394858_129396922:NRF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 0 0 8 8 0 4.2482324885562 -4.2482324885562 A G A 10 0.531029061069525 0.00233973919523274 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 0 12 0 12 5.6276512671657 0 5.6276512671657 A A 10 0.531029061069525 0.00061600319089064 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 13 3 16 6.09662220609618 1.59308718320857 4.5035350228876 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0251677682189692 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 137600690 C/T 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000458726:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000420629:exon_137600583_137600758:CREB3L2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 138252360 C/T 1 9 1 10 4.22073845037428 0.531029061069525 3.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0238719986684543 ENSG00000122779:ENST00000343526:exon_138252226_138252399:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000415680:exon_138252226_138252399:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000476785:exon_138252226_138252399:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000497516:exon_138252226_138252399:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000378381:exon_138252226_138252399:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000493595:exon_138252226_138252399:TRIM24 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 A:G G A 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:G G A 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 72 51 123 33.7659076029942 27.0824821145458 6.68342548844843 A:G G A 10 0.531029061069525 0.240950304662860 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 23 23 46 10.7863315954009 12.2136684045991 -1.42733680919815 T:C C T 10 0.531029061069525 0.768044299453826 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 16 12 28 7.5035350228876 6.3723487328343 1.1311862900533 A:G G A 10 0.531029061069525 0.708778352037643 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 139757712 C/A 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139757699_139757834:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139757699_139757834:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000467638:exon_139757699_139757834:PARP12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 140373326 A/G 1 4 9 13 1.8758837557219 4.77926154962572 -2.90337779390382 A:G A G 10 0.531029061069525 0.162744109927267 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 140374049 T/C 1 11 7 18 5.15868032823523 3.71720342748667 1.44147690074855 T:C T C 10 0.531029061069525 0.638298933949309 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 142494606 C/G 1 5 7 12 2.34485469465238 3.71720342748667 -1.3723487328343 C:G C G 10 0.531029061069525 0.565641303351698 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 142494785 C/A 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 A:C C A 10 0.531029061069525 0.367373953327978 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 142494796 G/A 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 A:G G A 10 0.531029061069525 0.782619344663003 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 191 249 440 89.5734493357207 132.226236206312 -42.652786870591 A:T:C T C 10 0.531029061069525 4.74826900725613e-05 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 143080060 A/T 1 158 151 309 74.0974083510151 80.1853882214983 -6.08797987048321 A:T A T 10 0.531029061069525 0.494468736955047 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079894_143080328:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000477373:exon_143079894_143080333:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000436448:exon_143079943_143080415:ZYX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 144077171 G/A 1 10 10 20 4.68970938930475 5.31029061069525 -0.620581221390498 A:G G A 10 0.531029061069525 0.825489956938963 ENSG00000050327:ENST00000056217:exon_144076992_144077725:ARHGEF5;ENSG00000050327:ENST00000344879:exon_144076992_144077721:ARHGEF5;ENSG00000050327:ENST00000474817:exon_144076992_144077724:ARHGEF5;ENSG00000050327:ENST00000471847:exon_144076992_144077725:ARHGEF5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 148506396 A/C 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 A:C A C 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 148709425 G/A 1 48 55 103 22.5106050686628 29.2065983588239 -6.69599329016107 A:G G A 10 0.531029061069525 0.199848382582296 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148709247_148709452:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148709247_148709452:PDIA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 148712092 G/A 1 35 30 65 16.4139828625666 15.9308718320857 0.483111030480877 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 149133916 C/T 1 16 25 41 7.5035350228876 13.2757265267381 -5.77219150385052 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0847391266871018 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149133666_149133917:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149133666_149133917:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149133666_149133917:ZNF777 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 149153084 C/T 1 9 10 19 4.22073845037428 5.31029061069525 -1.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.651804894336143 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 17 13 30 7.97250596181808 6.90337779390382 1.06912816791425 A:C A C 10 0.531029061069525 0.718926652870465 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 29 24 53 13.6001572289838 12.7446974656686 0.855459763315176 A:G G A 10 0.531029061069525 0.890831301513509 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 28 43 71 13.1311862900533 22.8342496259896 -9.70306333593627 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0235871008684029 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 32 38 70 15.0070700457752 20.1791043206419 -5.17203427486675 C:G G C 10 0.531029061069525 0.232151674883610 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 67 55 122 31.4210529083418 29.2065983588239 2.21445454951796 A:G A G 10 0.531029061069525 0.717323589925293 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150437979 G/A 1 8 73 81 3.7517675114438 38.7651214580753 -35.0133539466315 A:G G A 10 0.531029061069525 2.79521334536785e-16 ENSG00000196329:ENST00000498181:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150434698_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000466347:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150437967_150438015:GIMAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 13 99 112 6.09662220609618 52.571877045883 -46.4752548397868 T:C C T 10 0.531029061069525 3.10906216292746e-20 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 22 175 197 10.3173606564705 92.9300856871669 -82.6127250306964 T:C C T 10 0.531029061069525 3.34799055971112e-35 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:T T A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150767654 T/C 1 10 4 14 4.68970938930475 2.1241162442781 2.56559314502665 T:C T C 10 0.531029061069525 0.191284732569757 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469355:exon_150767441_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494298:exon_150767604_150767658:SLC4A2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 84 89 173 39.3935588701599 47.2615864351877 -7.86802756502782 A:T:C:G A T 10 0.531029061069525 0.253191014019949 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150774308 G/A 1 66 69 135 30.9520819694114 36.6410052137972 -5.68892324438587 A:G G A 10 0.531029061069525 0.343472340891104 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774245_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774188_150774488:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000459800:exon_150774188_150774599:FASTK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150905167 G/A 1 8 13 21 3.7517675114438 6.90337779390382 -3.15161028246002 A:G G A 10 0.531029061069525 0.193093229428768 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150904923_150905193:ABCF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 44 38 82 20.6347213129409 20.1791043206419 0.455616992298953 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 34 31 65 15.9450119236362 16.4619008931553 -0.516888969519123 C:G C G 10 0.531029061069525 0.901835246228136 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 89 77 166 41.7384135648123 40.8892377023534 0.849175862458857 A:C:G C G 10 0.531029061069525 0.938070330352164 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 150935124 C/T 1 85 101 186 39.8625298090904 53.633935168022 -13.7714053589316 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0471465754701781 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 28 26 54 13.1311862900533 13.8067555878076 -0.675569297754349 T:C T C 10 0.531029061069525 0.892052600738102 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 155094520 C/T 1 122 84 206 57.214454549518 44.6064411298401 12.6080134196779 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0811510657978798 ENSG00000186480:ENST00000340368:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000344756:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000342407:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000476756:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000468307:exon_155093961_155094728:INSIG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 6 9 15 2.81382563358285 4.77926154962572 -1.96543591604287 T:C T C 10 0.531029061069525 0.438915031973063 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 60 46 106 28.1382563358285 24.4273368091981 3.71091952663035 A:G G A 10 0.531029061069525 0.496725619182077 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 12 1 13 5.6276512671657 0.531029061069525 5.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0041669355948594 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 13 6 19 6.09662220609618 3.18617436641715 2.91044783967903 A:C C A 10 0.531029061069525 0.250439534246809 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 20 7 27 9.3794187786095 3.71720342748667 5.66221535112283 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0333315110955642 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 8234113 G/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 10285810 T/C 1 12 3 15 5.6276512671657 1.59308718320857 4.03456408395713 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0403292064008527 ENSG00000175806:ENST00000317173:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000527408:exon_10285658_10286401:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000441698:exon_10285658_10285875:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000528246:exon_10285658_10286395:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000425987:exon_10285658_10286399:MSRA;ENSG00000175806:ENST00000382490:exon_10285658_10286399:MSRA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 10692242 G/A 1 8 13 21 3.7517675114438 6.90337779390382 -3.15161028246002 A:G G A 10 0.531029061069525 0.193093229428768 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000520018:exon_10692176_10692285:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524026:exon_10691862_10692285:PINX1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11405542 C/G 1 36 20 56 16.8829538014971 10.6205812213905 6.2623725801066 C:G C G 10 0.531029061069525 0.108032774919555 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11405541_11405634:BLK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11405588 C/G 1 21 29 50 9.84838971753998 15.3998427710162 -5.55145305347625 C:G C G 10 0.531029061069525 0.121109316166750 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11405541_11405634:BLK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 38 24 62 17.8208956793581 12.7446974656686 5.07619821368945 T:C T C 10 0.531029061069525 0.205645925528585 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 T:C C T 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11637331 C/T 1 9 5 14 4.22073845037428 2.65514530534762 1.56559314502665 T:C C T 10 0.531029061069525 0.436542432374564 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11640784 A/G 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 A:G A G 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 37 31 68 17.3519247404276 16.4619008931553 0.890023847272303 T:C C T 10 0.531029061069525 0.903466242494282 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:G A G 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C C T 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 13 13 26 6.09662220609618 6.90337779390382 -0.806755587807649 T:C C T 10 0.531029061069525 0.84501811777777 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 19 15 34 8.91044783967903 7.96543591604287 0.945011923636152 A:C:G G A 10 0.531029061069525 0.863959540191866 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 14 25 39 6.56559314502665 13.2757265267381 -6.71013338171147 T:C:G C G 10 0.531029061069525 0.036532555309882 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 21894018 A/G 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000158806:ENST00000521157:exon_21894004_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000397940:exon_21894004_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000518119:exon_21894004_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000289820:exon_21894004_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000381530:exon_21894004_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000522953:exon_21894004_21894051:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000520456:exon_21894004_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000519373:exon_21893869_21894037:NPM2;ENSG00000158806:ENST00000524322:exon_21894002_21894037:NPM2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 21955611 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000158863:ENST00000427751:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000450006:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000289921:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000464226:exon_21955579_21955821:FAM160B2;ENSG00000158863:ENST00000474579:exon_21955446_21955821:FAM160B2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 23 29 52 10.7863315954009 15.3998427710162 -4.6135111756153 T:C T C 10 0.531029061069525 0.213139105146865 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 21997738 A/T 1 14 15 29 6.56559314502665 7.96543591604287 -1.39984277101622 A:T A T 10 0.531029061069525 0.710616956278655 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519875:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000521744:exon_21997719_21997761:REEP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 22368614 C/T 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000120910:ENST00000518852:exon_22368599_22368744:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000240139:exon_22368599_22368744:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000289963:exon_22368599_22368744:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000397775:exon_22368599_22368744:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000522034:exon_22368599_22368744:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000521651:exon_22368599_22368744:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000523620:exon_22368421_22368744:PPP3CC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 40 46 86 18.758837557219 24.4273368091981 -5.66849925197915 A:G G A 10 0.531029061069525 0.235548214968546 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 37 12 49 17.3519247404276 6.3723487328343 10.9795760075933 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00150819445766936 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 30 11 41 14.0691281679143 5.84131967176477 8.22780849614947 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0115788825356762 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 28 12 40 13.1311862900533 6.3723487328343 6.758837557219 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0386086377772848 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 41 28 69 19.2278084961495 14.8688137099467 4.35899478620277 A:G A G 10 0.531029061069525 0.334983755199103 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 11 18 29 5.15868032823523 9.55852309925145 -4.39984277101622 A:G G A 10 0.531029061069525 0.135486253222931 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 55 69 124 25.7934016411761 36.6410052137972 -10.8476035726211 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0584852951916324 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 51 90 141 23.9175178854542 47.7926154962572 -23.875097610803 T:C T C 10 0.531029061069525 6.39270034718369e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 227 194 421 106.456403137218 103.019637847488 3.43676528972999 A:G A G 10 0.531029061069525 0.769581507090597 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 220 220 440 103.173606564705 116.826393435295 -13.652786870591 A:G A G 10 0.531029061069525 0.197338035471490 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 15 3 18 7.03456408395713 1.59308718320857 5.44147690074855 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0156182922326921 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:C C T 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 25 20 45 11.7242734732619 10.6205812213905 1.10369225187138 C:G C G 10 0.531029061069525 0.767362753594117 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C T C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 28384712 A/G 1 5 15 20 2.34485469465238 7.96543591604287 -5.6205812213905 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0132875954363033 ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 A:G A G 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 15 14 29 7.03456408395713 7.43440685497335 -0.399842771016225 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 17 14 31 7.97250596181808 7.43440685497335 0.538099106844726 A:G A G 10 0.531029061069525 0.859723747240846 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 37728017 A/G 1 7 1 8 3.28279657251333 0.531029061069525 2.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0745328351655844 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 65 0 65 30.4831110304809 0 30.4831110304809 T T 10 0.531029061069525 2.51205666675581e-18 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 38678044 C/A 1 31 29 60 14.5380991068447 15.3998427710162 -0.861743664171499 A:C C A 10 0.531029061069525 0.897261409896677 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 38961159 G/T 1 7 17 24 3.28279657251333 9.02749403818192 -5.7446974656686 T:G G T 10 0.531029061069525 0.023314141943582 ENSG00000168615:ENST00000487273:exon_38961126_38962520:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481873:exon_38961126_38962656:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000468065:exon_38961126_38962663:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000379917:exon_38961126_38962663:ADAM9 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 48719844 G/A 1 20 11 31 9.3794187786095 5.84131967176477 3.53809910684473 A:G G A 10 0.531029061069525 0.213786149384365 ENSG00000121031:ENST00000338368:exon_48719698_48719887:AC103686.1;ENSG00000121031:ENST00000314191:exon_48719698_48719887:AC103686.1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 56985814 T/C 1 3508 4321 7829 1645.15005376811 2294.57657288142 -649.426519113311 T:C T C 10 0.531029061069525 7.90194901118457e-49 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56985676_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56985506_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56985601_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56985613_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56985632_56986327:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56985634_56985831:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56985686_56985831:RPS20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 56986417 A/G 1 10 3 13 4.68970938930475 1.59308718320857 3.09662220609618 A:G A G 10 0.531029061069525 0.100357328720842 ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986254_56986718:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986021_56986718:RPS20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 59512334 G/A 1 9 4 13 4.22073845037428 2.1241162442781 2.09662220609618 A:G G A 10 0.531029061069525 0.278876768214331 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59512309_59512429:NSMAF HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 9 11 20 4.22073845037428 5.84131967176477 -1.6205812213905 T:C T C 10 0.531029061069525 0.50776023051536 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 38 31 69 17.8208956793581 16.4619008931553 1.35899478620278 A:G G A 10 0.531029061069525 0.809744220095168 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 61 41 102 28.607227274759 21.7721915038505 6.83503577090845 A:G G A 10 0.531029061069525 0.197198465299921 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 67380528 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000147576:ENST00000396623:exon_67380504_67381142:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000415254:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000424777:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000447940:exon_67380504_67381038:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000435418:exon_67380504_67381038:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000276576:exon_67380504_67381042:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000426810:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000496501:exon_67380504_67380769:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000419955:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000466739:exon_67380504_67380899:ADHFE1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 17 9 26 7.97250596181808 4.77926154962572 3.19324441219235 T:C T C 10 0.531029061069525 0.24166113324983 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 74893653 G/A 1 114 135 249 53.4626870380742 71.6889232443859 -18.2262362063117 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0221694160164540 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 2 7 9 0.93794187786095 3.71720342748667 -2.77926154962572 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0929743228380336 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 16 14 30 7.5035350228876 7.43440685497335 0.0691281679142506 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 29 31 60 13.6001572289838 16.4619008931553 -2.8617436641715 T:C T C 10 0.531029061069525 0.518312436012606 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 38 42 80 17.8208956793581 22.30322056492 -4.482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.316348679258656 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 10 28 38 4.68970938930475 14.8688137099467 -10.1791043206419 C:G C G 10 0.531029061069525 0.000983262805535687 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 1 7 8 0.468970938930475 3.71720342748667 -3.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0298578989968701 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 94738629 G/A 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000188343:ENST00000452913:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000518322:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000341186:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000523577:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000359421:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000423990:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000518116:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000517718:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000521641:exon_94738622_94738741:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000519679:exon_94738622_94738932:FAM92A1;ENSG00000188343:ENST00000520363:exon_94738622_94738741:FAM92A1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 98863677 C/T 1 40 7 47 18.758837557219 3.71720342748667 15.0416341297323 A:T:C C T 10 0.531029061069525 5.71667612412482e-06 ENSG00000104341:ENST00000445593:exon_98863625_98865241:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000220781:exon_98863625_98865241:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000378722:exon_98863625_98863702:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000521545:exon_98863625_98863702:LAPTM4B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 18 12 30 8.44147690074855 6.3723487328343 2.06912816791425 A:C C A 10 0.531029061069525 0.471080663772328 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 12 12 24 5.6276512671657 6.3723487328343 -0.744697465668599 A:G G A 10 0.531029061069525 0.839153121959338 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 99102105 A/G 0 20 0 20 9.3794187786095 0 9.3794187786095 A A 10 0.531029061069525 3.44435126702128e-06 ENSG00000177459:ENST00000318528:exon_99101304_99102257:C8orf47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 99146809 C/T 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 T:C C T 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99146700_99146887:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99146700_99146887:POP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 5 6 11 2.34485469465238 3.18617436641715 -0.841319671764774 A:C A C 10 0.531029061069525 0.764992693177811 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 101153024 G/A 1 8 2 10 3.7517675114438 1.06205812213905 2.68970938930475 A:G G A 10 0.531029061069525 0.116144612439671 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:C T C 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 103307533 T/C 1 9 1 10 4.22073845037428 0.531029061069525 3.68970938930475 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0238719986684543 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103307432_103307558:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103307432_103307558:UBR5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 105263979 C/T 1 2 10 12 0.93794187786095 5.31029061069525 -4.3723487328343 T:C C T 10 0.531029061069525 0.01705983554651 ENSG00000176406:ENST00000262231:exon_105263830_105264087:RIMS2;ENSG00000176406:ENST00000507740:exon_105263830_105268322:RIMS2;ENSG00000176406:ENST00000436393:exon_105263830_105264087:RIMS2;ENSG00000176406:ENST00000339750:exon_105263830_105264087:RIMS2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 110355728 T/G 1 35 38 73 16.4139828625666 20.1791043206419 -3.76512145807532 T:G T G 10 0.531029061069525 0.41246270487994 ENSG00000120533:ENST00000522766:exon_110355634_110355853:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000521662:exon_110355634_110355893:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000521688:exon_110355634_110358181:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000517311:exon_110355634_110358182:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000339942:exon_110355634_110355899:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000520147:exon_110355634_110356084:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000522407:exon_110355634_110355900:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000523335:exon_110355634_110356828:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000517756:exon_110355634_110355894:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000517350:exon_110355634_110355813:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000523707:exon_110355634_110355900:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000521619:exon_110355634_110355893:ENY2;ENSG00000120533:ENST00000518118:exon_110355634_110358181:ENY2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 17 18 35 7.97250596181808 9.55852309925145 -1.58601713743337 A:G A G 10 0.531029061069525 0.615023862763492 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 120569748 G/T 1 6 7 13 2.81382563358285 3.71720342748667 -0.903377793903825 T:G G T 10 0.531029061069525 0.782619344663003 ENSG00000136960:ENST00000524146:exon_120569326_120569793:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120569326_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120569326_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000523861:exon_120569327_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120569649_120569931:ENPP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 120569877 T/G 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 T:G T G 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120569326_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120569326_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000523861:exon_120569327_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120569649_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522826:exon_120569761_120569931:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000075322:exon_120569761_120569931:ENPP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 C:G G C 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 124238872 C/T 1 79 59 138 37.0487041755075 31.330714603102 5.71798957240556 T:C C T 10 0.531029061069525 0.348826200070588 ENSG00000189376:ENST00000276704:exon_124238740_124238872:C8orf76;ENSG00000189376:ENST00000519791:exon_124238740_124238872:C8orf76;ENSG00000189376:ENST00000357082:exon_124238431_124238872:C8orf76;ENSG00000189376:ENST00000517760:exon_124238740_124238872:C8orf76;ENSG00000189376:ENST00000521310:exon_124238738_124238872:C8orf76 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 8 6 14 3.7517675114438 3.18617436641715 0.56559314502665 A:C A C 10 0.531029061069525 0.796109579922573 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 142161873 C/T 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 142161888 G/A 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 A:G G A 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 32 43 75 15.0070700457752 22.8342496259896 -7.82717958021437 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0822206187598092 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 18 12 30 8.44147690074855 6.3723487328343 2.06912816791425 T:C T C 10 0.531029061069525 0.471080663772328 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 12 13 25 5.6276512671657 6.90337779390382 -1.27572652673812 T:C T C 10 0.531029061069525 0.690323279862282 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144620871 A/G 1 7 6 13 3.28279657251333 3.18617436641715 0.0966222060961752 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144621035 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 7 4 11 3.28279657251333 2.1241162442781 1.15868032823523 T:G T G 10 0.531029061069525 0.557449254568348 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144621091 A/T 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:T A T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 41 3 44 19.2278084961495 1.59308718320857 17.6347213129409 A:G G A 10 0.531029061069525 1.56417369292631e-08 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 23 23 0 12.2136684045991 -12.2136684045991 A G A 10 0.531029061069525 2.73121833922944e-08 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 777 740 1517 364.390419548979 392.961505191448 -28.5710856424694 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.142636823701132 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 12 12 24 5.6276512671657 6.3723487328343 -0.744697465668599 T:G G T 10 0.531029061069525 0.839153121959338 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144874078 C/T 1 69 60 129 32.3589947862028 31.8617436641715 0.49725112203128 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874046_144874083:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874046_144874083:SCRIB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144877654 T/G 1 12 13 25 5.6276512671657 6.90337779390382 -1.27572652673812 T:C:G T G 10 0.531029061069525 0.690323279862282 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144877590_144877700:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144877590_144877700:SCRIB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 24 22 46 11.2553025343314 11.6826393435295 -0.427336809198149 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144889172 A/G 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G A G 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144894496 G/A 1 6 6 12 2.81382563358285 3.18617436641715 -0.3723487328343 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144894436_144894554:SCRIB HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 29 25 54 13.6001572289838 13.2757265267381 0.324430702245651 A:G A G 10 0.531029061069525 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 34 29 63 15.9450119236362 15.3998427710162 0.545169152619927 A:T:C T C 10 0.531029061069525 0.900419882469488 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 9 17 26 4.22073845037428 9.02749403818192 -4.80675558780765 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0757988827772547 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:C T C 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144992388 G/A 1 5 12 17 2.34485469465238 6.3723487328343 -4.02749403818192 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0551891724649989 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 T:C C T 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 6 4 10 2.81382563358285 2.1241162442781 0.68970938930475 T:C C T 10 0.531029061069525 0.758608684310008 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 7 5 12 3.28279657251333 2.65514530534762 0.6276512671657 T:G T G 10 0.531029061069525 0.779576805328152 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 10 9 19 4.68970938930475 4.77926154962572 -0.0895521603209737 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 15 12 27 7.03456408395713 6.3723487328343 0.662215351122826 A:G G A 10 0.531029061069525 0.849045079367674 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 6 5 11 2.81382563358285 2.65514530534762 0.158680328235226 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 8 4 12 3.7517675114438 2.1241162442781 1.6276512671657 A:G A G 10 0.531029061069525 0.398786718311345 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 144999684 A/G 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:G A G 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 43 59 102 20.1657503740104 31.330714603102 -11.1649642290915 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0289662621915082 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 3 7 10 1.40691281679143 3.71720342748667 -2.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.205796127209076 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 21 37 58 9.84838971753998 19.6480752595724 -9.79968554203245 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0119258892828815 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 20 25 45 9.3794187786095 13.2757265267381 -3.89630774812862 A:G G A 10 0.531029061069525 0.295861021787549 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 2116037 G/A 1 23 59 82 10.7863315954009 31.330714603102 -20.5443830077011 A:G G A 10 0.531029061069525 6.31511532572749e-06 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2115822_2116049:SMARCA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 12 17 29 5.6276512671657 9.02749403818192 -3.39984277101622 T:G T G 10 0.531029061069525 0.264194510317464 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 5921340 C/T 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 53 61 114 24.8554597633152 32.392772725241 -7.53731296192585 A:G A G 10 0.531029061069525 0.160450781950604 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 6007767 C/A 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 A:C C A 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 7046917 A/G 1 8 1 9 3.7517675114438 0.531029061069525 3.22073845037428 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0423265214226976 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 15 15 30 7.03456408395713 7.96543591604287 -0.930871832085749 A:G G A 10 0.531029061069525 0.85526692479372 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 171 0 171 80.1940305571112 0 80.1940305571112 G G 10 0.531029061069525 1.02275707871135e-47 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 15459821 A/C 1 21 22 43 9.84838971753998 11.6826393435295 -1.83424962598957 A:C A C 10 0.531029061069525 0.647477448802669 ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15459717_15464132:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15459717_15460311:SNAPC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 17135259 C/T 1 7 3 10 3.28279657251333 1.59308718320857 1.68970938930475 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.353179015193061 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 20413813 G/A 1 22 20 42 10.3173606564705 10.6205812213905 -0.303220564920048 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000171843:ENST00000380338:exon_20413719_20414423:MLLT3;ENSG00000171843:ENST00000475957:exon_20413719_20414423:MLLT3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 9 6 15 4.22073845037428 3.18617436641715 1.03456408395713 A:G G A 10 0.531029061069525 0.617705462354825 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 27062721 C/T 1 3 11 14 1.40691281679143 5.84131967176477 -4.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0284363057482022 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27062616_27062923:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27062616_27062923:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27062616_27062928:IFT74 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 19 21 40 8.91044783967903 11.15161028246 -2.241162442781 T:C T C 10 0.531029061069525 0.527921959001615 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 22 5 27 10.3173606564705 2.65514530534762 7.66221535112283 T:G T G 10 0.531029061069525 0.00320093533245392 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 32541532 A/G 1 60 68 128 28.1382563358285 36.1099761527277 -7.9717198168992 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.183830002575903 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 182 127 309 85.3527108853465 67.4406907558297 17.9120201295168 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0458828319899219 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 9 12 21 4.22073845037428 6.3723487328343 -2.15161028246002 A:C A C 10 0.531029061069525 0.387053746842053 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 6 10 16 2.81382563358285 5.31029061069525 -2.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.222730245253186 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 34648418 C/T 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 T:C C T 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000213930:ENST00000473506:exon_34648331_34648454:GALT;ENSG00000213930:ENST00000473529:exon_34648331_34648453:GALT;ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34648331_34648453:GALT;ENSG00000213930:ENST00000472111:exon_34648331_34648483:GALT;ENSG00000213930:ENST00000378846:exon_34648331_34648510:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34648331_34648453:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648331_34648891:GALT;ENSG00000213930:ENST00000487381:exon_34648331_34648823:GALT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 34649442 A/G 1 21 16 37 9.84838971753998 8.4964649771124 1.35192474042758 A:G A G 10 0.531029061069525 0.742763651093692 ENSG00000213930:ENST00000378842:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000450095:exon_34649407_34649561:GALT;ENSG00000213930:ENST00000489643:exon_34648995_34650279:GALT;ENSG00000213930:ENST00000488412:exon_34649174_34649561:GALT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 35107765 C/A 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 A:C C A 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35107378_35108271:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378554:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000408010:exon_35107378_35108346:KIAA1539 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 35660901 C/T 1 45 48 93 21.1036922518714 25.4893949313372 -4.38570267946582 T:C C T 10 0.531029061069525 0.406092705743272 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35660091_35660964:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 35971564 C/T 0 74 0 74 34.7038494808552 0 34.7038494808552 C C 10 0.531029061069525 6.19751462240828e-21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 36651864 C/T 1 5 3 8 2.34485469465238 1.59308718320857 0.7517675114438 T:C C T 10 0.531029061069525 0.730750490466578 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36651743_36651874:MELK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 36657267 C/T 1 6 8 14 2.81382563358285 4.2482324885562 -1.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 0.594097550650578 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36657238_36657360:MELK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 36674842 C/T 1 15 26 41 7.03456408395713 13.8067555878076 -6.77219150385052 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0411791938603041 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 37489378 C/T 1 7 12 19 3.28279657251333 6.3723487328343 -3.08955216032097 T:C C T 10 0.531029061069525 0.173367796352208 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37489312_37489397:POLR1E HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 33 17 50 15.4760409847057 9.02749403818192 6.44854694652375 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0880793434096489 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 28 23 51 13.1311862900533 12.2136684045991 0.917517885454226 T:G G T 10 0.531029061069525 0.888659609738321 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 13 17 30 6.09662220609618 9.02749403818192 -2.93087183208575 A:C C A 10 0.531029061069525 0.360707760476209 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 71862975 C/T 1 16 24 40 7.5035350228876 12.7446974656686 -5.241162442781 T:C C T 10 0.531029061069525 0.113172858195278 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 71862987 G/A 1 12 23 35 5.6276512671657 12.2136684045991 -6.58601713743337 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0279314733529459 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 79985181 C/T 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 T:C C T 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985173_79985248:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985173_79985248:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985173_79985248:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985173_79985248:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985173_79985248:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985173_79985248:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985173_79985248:VPS13A HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 10 5 15 4.68970938930475 2.65514530534762 2.03456408395713 T:G T G 10 0.531029061069525 0.315767079054389 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 86258685 A/C 1 52 46 98 24.3864888243847 24.4273368091981 -0.0408479848134462 A:C A C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000148057:ENST00000533522:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000277124:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000405990:exon_86258344_86259038:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000376419:exon_86258344_86258819:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000454393:exon_86258344_86259038:C9orf103 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 33 47 80 15.4760409847057 24.9583658702677 -9.482324885562 A:C C A 10 0.531029061069525 0.043083934934551 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 86278913 C/T 1 19 17 36 8.91044783967903 9.02749403818192 -0.117046198502898 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 90283514 C/T 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90283512_90283589:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90283512_90283589:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90283512_90283589:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90283512_90283589:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90283512_90283589:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90283512_90283589:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000466188:exon_90283512_90283863:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000497743:exon_90283368_90283589:DAPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 91 45 136 42.6763554426732 23.8963077481286 18.7800476945446 A:G G A 10 0.531029061069525 0.00139279873015547 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 92006275 G/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 34 38 72 15.9450119236362 20.1791043206419 -4.2340923970058 T:C C T 10 0.531029061069525 0.345705420809567 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 19 11 30 8.91044783967903 5.84131967176477 3.06912816791425 C:G G C 10 0.531029061069525 0.278610279576009 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 37 22 59 17.3519247404276 11.6826393435295 5.66928539689803 A:G A G 10 0.531029061069525 0.152335236015806 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 95875381 G/C 1 17 7 24 7.97250596181808 3.71720342748667 4.2553025343314 C:G G C 10 0.531029061069525 0.101582351603710 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 95887320 G/T 1 24 58 82 11.2553025343314 30.7996855420324 -19.5443830077011 T:G G T 10 0.531029061069525 1.86295794517655e-05 ENSG00000131669:ENST00000375446:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000489274:exon_95887181_95888472:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000470314:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000461162:exon_95887181_95887344:NINJ1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 98766902 C/A 1 5 4 9 2.34485469465238 2.1241162442781 0.220738450374276 A:C C A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 99250463 C/T 1 10 12 22 4.68970938930475 6.3723487328343 -1.68263934352955 T:C C T 10 0.531029061069525 0.525743710807748 ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 100819070 T/G 1 24 11 35 11.2553025343314 5.84131967176477 5.41398286256663 T:G T G 10 0.531029061069525 0.0890304910602246 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 54 47 101 25.3244307022457 24.9583658702677 0.36606483197798 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 44 28 72 20.6347213129409 14.8688137099467 5.7659076029942 C:G G C 10 0.531029061069525 0.194396598416638 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 101980367 A/G 1 97 121 218 45.4901810762561 64.2545163894125 -18.7643353131564 A:G A G 10 0.531029061069525 0.0119282100962164 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000319033:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101979649_101981118:ALG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 101980992 T/C 1 45 31 76 21.1036922518714 16.4619008931553 4.6417913587161 T:C T C 10 0.531029061069525 0.302751225172739 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000319033:exon_101978708_101981118:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101979649_101981118:ALG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 101984146 A/G 1 2 14 16 0.93794187786095 7.43440685497335 -6.4964649771124 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00155191749794743 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 102595685 C/T 1 6 3 9 2.81382563358285 1.59308718320857 1.22073845037428 T:C C T 10 0.531029061069525 0.51535088283984 ENSG00000119508:ENST00000395097:exon_102595564_102595736:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000338488:exon_102595564_102596341:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000238459:exon_102595564_102595736:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000395096:exon_102595564_102595806:NR4A3;ENSG00000119508:ENST00000330847:exon_102595564_102595736:NR4A3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 1 10 8 18 4.68970938930475 4.2482324885562 0.441476900748551 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 17 15 32 7.97250596181808 7.96543591604287 0.00707004577520109 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 104323199 T/C 1 20 12 32 9.3794187786095 6.3723487328343 3.0070700457752 T:C T C 10 0.531029061069525 0.376147483176247 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104323083_104323208:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478072:exon_104322963_104323208:RNF20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 104323459 G/A 1 14 12 26 6.56559314502665 6.3723487328343 0.19324441219235 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104323372_104323512:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478072:exon_104323372_104323734:RNF20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 110084328 C/T 1 35 36 71 16.4139828625666 19.1170461985029 -2.70306333593627 T:C C T 10 0.531029061069525 0.553265268509742 ENSG00000119318:ENST00000416373:exon_110084264_110084399:RAD23B;ENSG00000119318:ENST00000358015:exon_110084264_110084399:RAD23B HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 3 9 12 1.40691281679143 4.77926154962572 -3.3723487328343 A:T A T 10 0.531029061069525 0.0790916323829253 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 24 24 48 11.2553025343314 12.7446974656686 -1.4893949313372 C:G C G 10 0.531029061069525 0.667848959221384 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 114125854 T/A 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 A:T T A 10 0.531029061069525 0.486847421219619 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 7 14 21 3.28279657251333 7.43440685497335 -4.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0813314038736254 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 1 8 9 0.468970938930475 4.2482324885562 -3.77926154962572 A:C C A 10 0.531029061069525 0.0156373708398076 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 115181168 T/C 1 4 4 8 1.8758837557219 2.1241162442781 -0.2482324885562 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000119471:ENST00000398805:exon_115181140_115181238:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000262542:exon_115181140_115181238:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000398803:exon_115181140_115181238:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000488101:exon_115181140_115181238:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000467434:exon_115181140_115181238:HSDL2;ENSG00000119471:ENST00000480881:exon_115181140_115181238:HSDL2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 23 23 46 10.7863315954009 12.2136684045991 -1.42733680919815 A:G A G 10 0.531029061069525 0.768044299453826 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 20 23 43 9.3794187786095 12.2136684045991 -2.83424962598957 A:G G A 10 0.531029061069525 0.44568428015896 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 5 9 14 2.34485469465238 4.77926154962572 -2.43440685497335 A:C A C 10 0.531029061069525 0.28404647534191 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 22 23 45 10.3173606564705 12.2136684045991 -1.89630774812862 T:C C T 10 0.531029061069525 0.654664440828348 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 117103900 T/C 1 24 16 40 11.2553025343314 8.4964649771124 2.758837557219 T:C T C 10 0.531029061069525 0.430306504225225 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 117110180 G/A 1 24 26 50 11.2553025343314 13.8067555878076 -2.55145305347625 A:G G A 10 0.531029061069525 0.482139899231452 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000491133:exon_117110053_117110180:AKNA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 117120333 G/A 1 16 8 24 7.5035350228876 4.2482324885562 3.2553025343314 A:G G A 10 0.531029061069525 0.221638564753188 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000490767:exon_117120201_117120617:AKNA HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 14 4 18 6.56559314502665 2.1241162442781 4.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0558087683526188 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 22 7 29 10.3173606564705 3.71720342748667 6.60015722898378 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0150747519832241 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 32 37 69 15.0070700457752 19.6480752595724 -4.64100521379722 A:G A G 10 0.531029061069525 0.279178747779865 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 63 54 117 29.5451691526199 28.6755692977543 0.86959985486558 A:G A G 10 0.531029061069525 0.926283164880202 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 127620224 C/T 1 1998 1892 3890 937.003935983089 1004.70698354354 -67.7030475604521 T:C:G C T 10 0.531029061069525 0.0301017060192544 ENSG00000136942:ENST00000373570:exon_127620159_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000493018:exon_127620162_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000487431:exon_127620162_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000348462:exon_127620163_127620346:RPL35 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130165973 T/C 1 6 2 8 2.81382563358285 1.06205812213905 1.7517675114438 T:C T C 10 0.531029061069525 0.296620249790405 ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130165936_130165997:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373352:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130165939_130166082:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130165939_130166026:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000489239:exon_130165557_130166082:SLC2A8 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 17 16 33 7.97250596181808 8.4964649771124 -0.523959015294324 T:C C T 10 0.531029061069525 0.86349039013865 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 A:G A G 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 13 12 25 6.09662220609618 6.3723487328343 -0.275726526738124 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130536484 C/T 1 11 13 24 5.15868032823523 6.90337779390382 -1.7446974656686 T:C C T 10 0.531029061069525 0.542162663980329 ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 16 19 35 7.5035350228876 10.089552160321 -2.58601713743337 A:G G A 10 0.531029061069525 0.401522469972212 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 8 8 16 3.7517675114438 4.2482324885562 -0.496464977112399 T:G G T 10 0.531029061069525 0.808348534839043 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 130884753 C/T 1 41 39 80 19.2278084961495 20.7101333817115 -1.482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.738557439829844 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130884641_130884925:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130884725_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130884727_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130884745_130884758:PTGES2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131020382 C/G 1 8 12 20 3.7517675114438 6.3723487328343 -2.6205812213905 C:G C G 10 0.531029061069525 0.268384990115425 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131020400 C/G 1 8 16 24 3.7517675114438 8.4964649771124 -4.7446974656686 C:G C G 10 0.531029061069525 0.0649184187279779 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131020259_131020477:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131020259_131020477:GOLGA2 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131095112 A/C 1 4 5 9 1.8758837557219 2.65514530534762 -0.779261549625724 A:C A C 10 0.531029061069525 0.742637234366266 ENSG00000167113:ENST00000461102:exon_131092691_131095222:COQ4 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 12 11 23 5.6276512671657 5.84131967176477 -0.213668404599074 T:C C T 10 0.531029061069525 1 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 39 58 97 18.2898666182885 30.7996855420324 -12.5098189237439 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0141982536594576 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 17 24 41 7.97250596181808 12.7446974656686 -4.77219150385052 A:G G A 10 0.531029061069525 0.159175262557064 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 16 19 35 7.5035350228876 10.089552160321 -2.58601713743337 T:C C T 10 0.531029061069525 0.401522469972212 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 A:G A G 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131484072 G/A 1 35 42 77 16.4139828625666 22.30322056492 -5.88923770235342 A:G G A 10 0.531029061069525 0.208941381697139 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372672:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372664:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000406904:exon_131483947_131484096:ZDHHC12 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131749113 T/C 1 4 7 11 1.8758837557219 3.71720342748667 -1.84131967176477 T:C T C 10 0.531029061069525 0.367373953327978 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131749088_131749154:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131749088_131749154:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131749088_131749154:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000477069:exon_131749088_131749154:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000491502:exon_131749088_131749154:NUP188 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 55 41 96 25.7934016411761 21.7721915038505 4.0212101373256 A:C A C 10 0.531029061069525 0.474292793485802 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 131857687 C/G 1 12 9 21 5.6276512671657 4.77926154962572 0.848389717539976 C:G C G 10 0.531029061069525 0.828135708631023 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131857075_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131857089_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000455396:exon_131857485_131857891:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131857676_131857891:CRAT HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 20 24 44 9.3794187786095 12.7446974656686 -3.3652786870591 A:G G A 10 0.531029061069525 0.365233492339541 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 7 7 14 3.28279657251333 3.71720342748667 -0.43440685497335 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 11 11 22 5.15868032823523 5.84131967176477 -0.68263934352955 A:G A G 10 0.531029061069525 0.832680955658746 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 1 9 10 0.468970938930475 4.77926154962572 -4.31029061069525 A:G A G 10 0.531029061069525 0.00812453802981514 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 134473655 C/T 1 3 5 8 1.40691281679143 2.65514530534762 -1.2482324885562 T:C C T 10 0.531029061069525 0.486847421219619 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000414781:exon_134473586_134473697:RAPGEF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 134497321 C/T 1 20 4 24 9.3794187786095 2.1241162442781 7.2553025343314 T:C C T 10 0.531029061069525 0.00332648031572789 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 27 38 65 12.6622153511228 20.1791043206419 -7.51688896951912 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0634025239742041 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 31 35 66 14.5380991068447 18.5860171374334 -4.04791803058865 T:C T C 10 0.531029061069525 0.326559109611346 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135172412 A/G 1 5 8 13 2.34485469465238 4.2482324885562 -1.90337779390382 A:G A G 10 0.531029061069525 0.406032939257578 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135172274_135172441:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135172274_135172441:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135173685 T/C 1 8 5 13 3.7517675114438 2.65514530534762 1.09662220609618 T:C T C 10 0.531029061069525 0.590642638466568 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135173467_135173699:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135173467_135173699:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135202829 T/C 1 10 6 16 4.68970938930475 3.18617436641715 1.5035350228876 T:C T C 10 0.531029061069525 0.617937414389669 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135203231 C/T 1 8 20 28 3.7517675114438 10.6205812213905 -6.8688137099467 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0125418601598727 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 5 12 17 2.34485469465238 6.3723487328343 -4.02749403818192 A:C A C 10 0.531029061069525 0.0551891724649989 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 31 35 66 14.5380991068447 18.5860171374334 -4.04791803058865 C:G C G 10 0.531029061069525 0.326559109611346 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 22 20 42 10.3173606564705 10.6205812213905 -0.303220564920048 T:C T C 10 0.531029061069525 1 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135470473 C/T 1 17 27 44 7.97250596181808 14.3377846488772 -6.3652786870591 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0689083965910232 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 32 25 57 15.0070700457752 13.2757265267381 1.73134351903708 C:G G C 10 0.531029061069525 0.691810045489915 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 135983504 T/C 1 7 9 16 3.28279657251333 4.77926154962572 -1.4964649771124 T:C T C 10 0.531029061069525 0.466028751391520 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 136217675 T/G 1 18 35 53 8.44147690074855 18.5860171374334 -10.1445402366848 T:G T G 10 0.531029061069525 0.00569802929725 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 136219295 A/G 1 2 72 74 0.93794187786095 38.2340923970058 -37.2961505191448 A:G A G 10 0.531029061069525 1.63973440228005e-21 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 136221752 G/C 1 23 19 42 10.7863315954009 10.089552160321 0.696779435079952 C:G G C 10 0.531029061069525 0.878014562536644 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136221679_136221812:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136221679_136221812:SURF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 138378856 A/G 1 7 8 15 3.28279657251333 4.2482324885562 -0.965435916042875 A:G A G 10 0.531029061069525 0.796990490622274 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 139390676 A/C 1 21 25 46 9.84838971753998 13.2757265267381 -3.42733680919815 A:C A C 10 0.531029061069525 0.375670422400274 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 13 8 21 6.09662220609618 4.2482324885562 1.84838971753998 A:G G A 10 0.531029061069525 0.514183814470507 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 139395259 G/A 1 9 8 17 4.22073845037428 4.2482324885562 -0.0274940381819242 A:G G A 10 0.531029061069525 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139395004_139395299:NOTCH1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 139756980 T/C 1 23 19 42 10.7863315954009 10.089552160321 0.696779435079952 T:C T C 10 0.531029061069525 0.878014562536644 ENSG00000107223:ENST00000371648:exon_139756942_139757451:EDF1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 29 24 53 13.6001572289838 12.7446974656686 0.855459763315176 C:G G C 10 0.531029061069525 0.890831301513509 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 51 67 118 23.9175178854542 35.5789470916582 -11.6614292062039 A:G G A 10 0.531029061069525 0.0338229252979037 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 14 5 19 6.56559314502665 2.65514530534762 3.91044783967903 T:C C T 10 0.531029061069525 0.105462082560563 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 140267455 C/A 0 12 0 12 5.6276512671657 0 5.6276512671657 C C 10 0.531029061069525 0.00061600319089064 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 140611518 C/T 1 13 5 18 6.09662220609618 2.65514530534762 3.44147690074855 T:C C T 10 0.531029061069525 0.154818420661043 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 2 8 10 0.93794187786095 4.2482324885562 -3.31029061069525 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0535624323990972 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 5 12 17 2.34485469465238 6.3723487328343 -4.02749403818192 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0551891724649989 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 215944 G/T 1 16 22 38 7.5035350228876 11.6826393435295 -4.17910432064195 T:C:G G T 10 0.531029061069525 0.195054952625508 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 13 7 20 6.09662220609618 3.71720342748667 2.3794187786095 A:G G A 10 0.531029061069525 0.371654719502381 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 16 9 25 7.5035350228876 4.77926154962572 2.72427347326188 T:C C T 10 0.531029061069525 0.319826948545454 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 12 8 20 5.6276512671657 4.2482324885562 1.3794187786095 T:C T C 10 0.531029061069525 0.655962224425547 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 18 5 23 8.44147690074855 2.65514530534762 5.78633159540093 A:T:G A G 10 0.531029061069525 0.0198557006447477 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 20 2 22 9.3794187786095 1.06205812213905 8.31736065647045 A:G G A 10 0.531029061069525 0.000328822242911950 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 322257 G/A 1 2 6 8 0.93794187786095 3.18617436641715 -2.2482324885562 A:G G A 10 0.531029061069525 0.158531077197358 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 18 44 62 8.44147690074855 23.3652786870591 -14.9238017863105 C:G G C 10 0.531029061069525 0.000174370085922949 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1116 994 2110 523.37156784641 527.842886703108 -4.47131885669774 A:T:G G A 10 0.531029061069525 0.844410674530802 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 20 29 49 9.3794187786095 15.3998427710162 -6.02042399240672 T:C C T 10 0.531029061069525 0.0877858753884706 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 6 15 21 2.81382563358285 7.96543591604287 -5.15161028246002 T:C T C 10 0.531029061069525 0.0284093982571455 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 14 9 23 6.56559314502665 4.77926154962572 1.78633159540093 C:G C G 10 0.531029061069525 0.533837384337975 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 2644314 C/T 1 48 30 78 22.5106050686628 15.9308718320857 6.57973323657705 T:C C T 10 0.531029061069525 0.141646111778654 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP01264_parsed_pileup.txt . X 64743967 G/A 0 107 0 107 50.1798904655608 0 50.1798904655608 G G 10 0.531029061069525 5.78934185337784e-30 ENSG00000001497:ENST00000374807:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000374811:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000374804:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000484069:exon_64743936_64744142:LAS1L;ENSG00000001497:ENST00000312391:exon_64743936_64744142:LAS1L