INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 881602 C/T 1 22 49 71 10.1704136253041 26.3477151072772 -16.177301481973 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000119172245534990 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 45 24 69 20.8031187790312 12.90500331785 7.89811546118113 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0694403250120703 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 881918 G/A 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:G G A 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881782_882440:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881782_881925:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881782_881925:NOC2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 883918 G/A 1 12 22 34 5.54749834107498 11.8295863746959 -6.28208803362089 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0380617182695499 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_883870_883983:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_883870_883983:NOC2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 900427 G/A 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 A:G G A 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 948921 T/C 1 1100 886 1986 508.520681265206 476.409705817297 32.1109754479091 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.149852417014914 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 1433 1078 2511 662.463760230037 579.649732360098 82.8140278699395 A:G G A 10 0.537708471577085 0.000955736907327239 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 1238 1027 2265 572.316912187569 552.226600309666 20.0903118779024 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 0.399381998827486 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 982994 T/C 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000478677:exon_982855_983067:AGRN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 990385 G/A 0 26 0 26 12.0195797389958 0 12.0195797389958 G G 10 0.537708471577085 1.59288057340214e-07 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1164065 G/A 1 58 73 131 26.8129086485291 39.2527184251272 -12.4398097765981 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0350865819980701 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1203271 G/A 1 11 21 32 5.08520681265207 11.2918779031188 -6.20667109046672 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.0328191691109926 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1203113_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000360466:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400930:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000473215:exon_1203113_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000435198:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000466752:exon_1203113_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000503294:exon_1203113_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000477894:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000422076:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000502382:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000461142:exon_1203242_1203372:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000488418:exon_1203242_1203372:UBE2J2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1247494 T/C 1 73 75 148 33.7472815748728 40.3281353682814 -6.58085379340858 T:C T C 10 0.537708471577085 0.284857393367787 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247398_1247527:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247460_1247527:CPSF3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 11 6 17 5.08520681265207 3.22625082946251 1.85895598318956 A:G G A 10 0.537708471577085 0.468286092935019 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1309458 G/A 1 388 322 710 179.369113028091 173.142127847821 6.22698518026965 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.651646701254911 ENSG00000175756:ENST00000338370:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000338338:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000321751:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000470457:exon_1309380_1309706:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000378853:exon_1309380_1309825:AURKAIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:C C A 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 50 24 74 23.1145764211457 12.90500331785 10.2095731032957 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0193216670866508 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 70 44 114 32.3604069896041 23.6591727493917 8.70123424021231 A:G G A 10 0.537708471577085 0.110495812529769 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 2494330 G/A 1 108 136 244 49.9274850696748 73.1283521344836 -23.2008670648087 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00309849536445086 ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463835:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482602:exon_2494304_2494335:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000480305:exon_2494304_2494335:TNFRSF14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 16 8 24 7.39666445476664 4.30166777261668 3.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.225523458259253 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 3753136 A/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:T A T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3753059_3753256:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000443466:exon_3753059_3753256:KIAA0562 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 44 30 74 20.3408272506083 16.1312541473125 4.20957310329571 A:G A G 10 0.537708471577085 0.352388430312051 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 33 19 52 15.2556204379562 10.2164609599646 5.03915947799158 T:C T C 10 0.537708471577085 0.167356918267564 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 6659445 C/T 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 6659505 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000162413:ENST00000377658:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000377663:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000467612:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000496707:exon_6659107_6659512:KLHL21;ENSG00000162413:ENST00000463043:exon_6659107_6659512:KLHL21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:G A G 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 27 30 57 12.4818712674187 16.1312541473125 -3.64938287989385 A:G G A 10 0.537708471577085 0.354324561498909 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 T:C T C 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 9776575 A/G 1 11 10 21 5.08520681265207 5.37708471577085 -0.291877903118785 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000479223:exon_9776334_9776677:PIK3CD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 10218439 T/C 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C T C 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10218414_10218540:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10218412_10218540:UBE4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 118 113 231 54.550400353904 60.7610572882106 -6.21065693430664 T:C T C 10 0.537708471577085 0.428808105534495 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 10473200 G/A 1 116 94 210 53.6258172970581 50.544596328246 3.08122096881215 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.678676051887596 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 10479791 G/A 1 289 306 595 133.602251714222 164.538792302588 -30.9365405883656 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.0120838595317783 ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10479687_10480200:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10479687_10480201:PGD;ENSG00000142657:ENST00000498356:exon_10479687_10479887:PGD;ENSG00000142657:ENST00000496718:exon_10479474_10479865:PGD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 10521649 C/T 1 22 23 45 10.1704136253041 12.367294846273 -2.19688122096882 T:C C T 10 0.537708471577085 0.551606420592295 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 10684465 G/C 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 C:G G C 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10684397_10684494:PEX14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 59 31 90 27.275200176952 16.6689626188896 10.6062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0263282141680546 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 37 26 63 17.1047865516479 13.9804202610042 3.12436629064364 C:G C G 10 0.537708471577085 0.451026021793987 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 11147523 T/C 1 39 50 89 18.0293696084937 26.8854235788543 -8.85605397036057 T:C T C 10 0.537708471577085 0.070268940705676 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11147505_11147648:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11147505_11147648:EXOSC10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 11181327 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11181303_11181425:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11181303_11181425:MTOR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 11728952 C/T 1 21 15 36 9.70812209688122 8.06562707365627 1.64249502322494 T:C C T 10 0.537708471577085 0.619672042871282 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000474239:exon_11728713_11729001:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11728753_11729001:FBXO6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12009955 C/T 1 19 8 27 8.78353904003538 4.30166777261668 4.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.120980132312301 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 19 30 49 8.78353904003538 16.1312541473125 -7.34771510727717 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0440005388885353 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12172049 G/A 1 29 22 51 13.4064543242645 11.8295863746959 1.57686794956867 A:G G A 10 0.537708471577085 0.676477441591633 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12171955_12172071:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12171955_12172071:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12171955_12172071:TNFRSF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 A:G A G 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 24 27 51 11.09499668215 14.5181287325813 -3.42313205043134 T:G T G 10 0.537708471577085 0.399737325287697 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 138 113 251 63.7962309223623 60.7610572882106 3.03517363415166 T:C C T 10 0.537708471577085 0.751694486801027 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 14 19 33 6.47208139792081 10.2164609599646 -3.74437956204381 A:G G A 10 0.537708471577085 0.222694445595855 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 16268908 C/T 1 24 28 52 11.09499668215 15.0558372041584 -3.96084052200842 T:C C T 10 0.537708471577085 0.330348938683283 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16268826_16268915:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000440560:exon_16268826_16268936:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000462525:exon_16268826_16269217:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16268826_16268936:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16268826_16268915:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16268826_16268915:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444358:exon_16268902_16268915:ZBTB17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 52 56 108 24.0391594779916 30.1116744083168 -6.07251493032518 A:G A G 10 0.537708471577085 0.248186262910409 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 20 18 38 9.2458305684583 9.67875248838753 -0.432921919929232 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19565344 C/G 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 C:G C G 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19565289_19565348:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19565289_19565351:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19565121_19566479:KIAA0090 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19583636 C/T 1 78 96 174 36.0587392169874 51.6200132714002 -15.5612740544128 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0184745359916304 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583558_19583639:MRTO4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19634747 C/T 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:C C T 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634233_19634756:AKR7A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19634964 C/G 1 9 14 23 4.16062375580623 7.52791860207919 -3.36729484627296 C:G C G 10 0.537708471577085 0.209192911108316 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19652063 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19651989_19652076:PQLC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 19652874 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19652739_19652881:PQLC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 21560080 A/G 1 11 10 21 5.08520681265207 5.37708471577085 -0.291877903118785 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21559598_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000470394:exon_21560063_21560154:ECE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 23885498 T/C 1 55 49 104 25.4260340632603 26.3477151072772 -0.921681044016839 T:C T C 10 0.537708471577085 0.921727657483697 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 T:C T C 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 29 12 41 13.4064543242645 6.45250165892502 6.95395266533952 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0404092318919326 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 33 14 47 15.2556204379562 7.52791860207919 7.727701835877 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0275469523916643 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 C:G G C 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 17 13 30 7.85895598318955 6.99021013050211 0.868745852687449 T:C C T 10 0.537708471577085 0.8553876844794 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 12 26 38 5.54749834107498 13.9804202610042 -8.43292191992923 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00837943682694324 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 17 17 34 7.85895598318955 9.14104401681045 -1.28208803362089 A:G A G 10 0.537708471577085 0.731925963272471 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 19 24 43 8.78353904003538 12.90500331785 -4.12146427781466 T:C C T 10 0.537708471577085 0.223486633833446 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 20 18 38 9.2458305684583 9.67875248838753 -0.432921919929232 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C T C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C T C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26448849 T/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000175087:ENST00000374271:exon_26448328_26452034:PDIK1L;ENSG00000175087:ENST00000374269:exon_26448328_26450524:PDIK1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26496455 C/T 0 206 0 206 95.2320548551205 0 95.2320548551205 C C 10 0.537708471577085 3.89486003715619e-56 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 192 155 347 88.7599734571997 83.3448130944482 5.41516036275151 T:C T C 10 0.537708471577085 0.590419674246948 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26596080 G/A 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000130695:ENST00000476272:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000252992:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000451429:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000453146:exon_26595951_26596105:CCDC21;ENSG00000130695:ENST00000469609:exon_26595951_26596105:CCDC21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 2014 1698 3712 931.055138243751 913.02898473789 18.0261535058604 A:G A G 10 0.537708471577085 0.564548947437527 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 2012 1698 3710 930.130555186905 913.02898473789 17.1015704490146 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.575662270774262 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 A:G G A 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 65 32 97 30.0489493474895 17.2066710904667 12.8422782570228 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0105489401840160 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 27180246 C/T 1 30 34 64 13.8687458526875 18.2820880336209 -4.41334218093344 T:C C T 10 0.537708471577085 0.315979508256788 ENSG00000204160:ENST00000374142:exon_27180217_27182207:ZDHHC18;ENSG00000204160:ENST00000374141:exon_27180217_27180454:ZDHHC18;ENSG00000204160:ENST00000488397:exon_27180217_27180316:ZDHHC18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 27210721 T/C 1 32 37 69 14.7933289095333 19.8952134483521 -5.10188453881887 T:C T C 10 0.537708471577085 0.228992309324399 ENSG00000142751:ENST00000374135:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374133:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374131:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000477418:exon_27210651_27210781:GPN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 27223792 C/T 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000198746:ENST00000361720:exon_27223792_27224216:GPATCH3;ENSG00000198746:ENST00000374122:exon_27223792_27224216:GPATCH3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 18 21 39 8.32124751161247 11.2918779031188 -2.97063039150632 A:G G A 10 0.537708471577085 0.422380605990043 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 27677409 G/A 1 19 25 44 8.78353904003538 13.4427117894271 -4.65917274939174 A:G G A 10 0.537708471577085 0.175006445900507 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27677285_27677443:SYTL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 38 14 52 17.5670780800708 7.52791860207919 10.0391594779916 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00518595695229862 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 48 13 61 22.1899933642999 6.99021013050211 15.1997832337978 T:C T C 10 0.537708471577085 8.49780673653777e-05 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 52 20 72 24.0391594779916 10.7541694315417 13.2849900464499 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0019152179738577 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 453 388 841 209.41806237558 208.630886971909 0.787175403671512 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 0.972420465792123 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 20 21 41 9.2458305684583 11.2918779031188 -2.04604733466049 A:G A G 10 0.537708471577085 0.535027447953124 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 65 22 87 30.0489493474895 11.8295863746959 18.2193629727936 A:G A G 10 0.537708471577085 8.67690609471332e-05 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 28806965 G/C 1 10 14 24 4.62291528422915 7.52791860207919 -2.90500331785004 C:G G C 10 0.537708471577085 0.306214656238402 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28806963_28807116:PHACTR4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 20 13 33 9.2458305684583 6.99021013050211 2.25562043795619 A:G A G 10 0.537708471577085 0.487582164437403 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 131 156 287 60.5601902234019 83.8825215660253 -23.3223313426234 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00638829217201728 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 31898234 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31898177_31898256:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31898177_31898256:SERINC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 32557486 A/G 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 A:G A G 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000472503:exon_32557276_32557610:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000427288:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32557276_32557612:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000498613:exon_32557276_32557612:TMEM39B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 103 94 197 47.6160274275602 50.544596328246 -2.92856890068575 A:G A G 10 0.537708471577085 0.721002911170025 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 33134865 A/C 1 131 107 238 60.5601902234019 57.5348064587481 3.02538376465377 A:C A C 10 0.537708471577085 0.745236061759535 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000526193:exon_33134832_33134868:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33134857_33134958:RBBP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 33134922 T/C 1 37 29 66 17.1047865516479 15.5935456757355 1.51124087591239 T:C T C 10 0.537708471577085 0.805226567907308 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33134857_33134958:RBBP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 33245802 C/G 1 136 94 230 62.8716478655164 50.544596328246 12.3270515372704 T:C:G C G 10 0.537708471577085 0.112404131623401 ENSG00000134684:ENST00000469100:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000490826:exon_33244983_33246312:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33245686_33245879:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33245686_33245879:YARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 35320690 T/G 1 53 53 106 24.5014510064145 28.4985489935855 -3.99709798717101 T:C:G T G 10 0.537708471577085 0.437906536665513 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 35321291 T/C 1 46 55 101 21.2654103074541 29.5739659367397 -8.30855562928559 T:C T C 10 0.537708471577085 0.110133780761507 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000417239:exon_35321290_35321583:C1orf212 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 35452986 C/T 1 19 11 30 8.78353904003538 5.91479318734793 2.86874585268745 T:C C T 10 0.537708471577085 0.360993445768571 ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 35477551 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000163867:ENST00000487874:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000373340:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000472971:exon_35477491_35477606:ZMYM6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 21 17 38 9.70812209688122 9.14104401681045 0.56707808007077 A:G A G 10 0.537708471577085 0.872509084757722 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 35919979 A/G 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 A:G A G 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35919963_35920086:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000467109:exon_35919963_35920237:KIAA0319L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 28 29 57 12.9441627958416 15.5935456757355 -2.64938287989384 A:G G A 10 0.537708471577085 0.508439874517783 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 35 22 57 16.180203494802 11.8295863746959 4.35061712010616 T:C T C 10 0.537708471577085 0.288354862014085 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 45 44 89 20.8031187790312 23.6591727493917 -2.85605397036057 T:C C T 10 0.537708471577085 0.595407559292654 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 36807563 C/T 1 21 15 36 9.70812209688122 8.06562707365627 1.64249502322494 T:C C T 10 0.537708471577085 0.619672042871282 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 36809726 A/G 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36809721_36809865:STK40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 37949180 C/T 1 26 28 54 12.0195797389958 15.0558372041584 -3.03625746516259 T:C C T 10 0.537708471577085 0.416372193787875 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 39330330 C/A 1 61 52 113 28.1997832337978 27.9608405220084 0.238942711789392 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000214114:ENST00000397572:exon_39328636_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000494695:exon_39329908_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000495043:exon_39330008_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000489803:exon_39330173_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000489575:exon_39330175_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000465771:exon_39330258_39330386:MYCBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 39797756 A/G 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40029283 C/G 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C:G C G 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000090621:ENST00000492468:exon_40027995_40029710:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000468476:exon_40027995_40030198:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525045:exon_40029118_40029594:PABPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40539817 C/G 1 35 35 70 16.180203494802 18.819796505198 -2.63959301039595 C:G C G 10 0.537708471577085 0.550478294578422 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40538379_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40538385_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40538385_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40539345_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40539424_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372775:exon_40539488_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000449045:exon_40539510_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40539608_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530076:exon_40539706_40539855:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40539815_40539855:PPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40702570 C/T 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40704793 T/C 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 T:C T C 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40705238 C/T 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40705399 T/C 1 25 12 37 11.5572882105729 6.45250165892502 5.10478655164785 T:C T C 10 0.537708471577085 0.100837383444843 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40960619 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 13 7 20 6.00978986949789 3.76395930103959 2.2458305684583 T:G G T 10 0.537708471577085 0.373996220974877 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41013073 T/A 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:T T A 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000117010:ENST00000372699:exon_41012234_41013841:ZNF684;ENSG00000117010:ENST00000493756:exon_41012234_41013457:ZNF684 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 22 13 35 10.1704136253041 6.99021013050211 3.18020349480202 T:C C T 10 0.537708471577085 0.312377672013397 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41976217 G/A 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41976328 T/C 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 T:C T C 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41976345 T/C 1 11 3 14 5.08520681265207 1.61312541473126 3.47208139792081 T:C T C 10 0.537708471577085 0.104463576674659 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41976529 C/T 0 15 0 15 6.93437292634373 0 6.93437292634373 C C 10 0.537708471577085 0.000100237772540574 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41978825 C/G 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 41990461 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41990406_41990581:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41990406_41990581:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41990406_41990581:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41990406_41990581:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 42045747 T/C 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 42657196 T/G 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:G T G 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000198815:ENST00000372573:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372572:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361346:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361776:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000445886:exon_42657077_42657390:FOXJ3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 43394612 T/C 1 32 32 64 14.7933289095333 17.2066710904667 -2.41334218093344 T:C T C 10 0.537708471577085 0.6164428261979 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 43632536 C/T 1 234 250 484 108.176217650962 134.427117894271 -26.2509002433091 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0177155665951837 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 43636484 C/G 1 126 125 251 58.2487325812873 67.2135589471356 -8.96482636584834 C:G C G 10 0.537708471577085 0.281856438460659 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43636427_43636550:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43636427_43636792:EBNA1BP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 25 24 49 11.5572882105729 12.90500331785 -1.34771510727717 T:C T C 10 0.537708471577085 0.774934521009821 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 43917098 C/G 1 8 15 23 3.69833222738332 8.06562707365627 -4.36729484627296 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0926394618200481 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000483618:exon_43916824_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43916991_43917215:HYI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 22 15 37 10.1704136253041 8.06562707365627 2.10478655164786 A:G G A 10 0.537708471577085 0.514288152683863 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 44422367 A/G 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44422232_44422373:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000489773:exon_44422232_44422373:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000492152:exon_44422232_44422373:IPO13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 44433055 G/A 1 22 24 46 10.1704136253041 12.90500331785 -2.73458969254591 A:G G A 10 0.537708471577085 0.461153963958979 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44432987_44433168:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000483886:exon_44433020_44433168:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000372339:exon_44432987_44433168:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000486876:exon_44432832_44433168:IPO13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 44435820 C/T 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 T:C:G C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132768:ENST00000471934:exon_44435672_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000476260:exon_44435672_44435942:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000255108:exon_44435676_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000524776:exon_44435680_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000530988:exon_44435682_44435942:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000495421:exon_44435682_44435942:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000412950:exon_44435682_44435942:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000527567:exon_44435695_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000492306:exon_44435695_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000490861:exon_44435696_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000396758:exon_44435697_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000477294:exon_44435701_44435942:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000529729:exon_44435701_44435994:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000532140:exon_44435739_44435986:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000534786:exon_44435777_44435984:DPH2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 44437218 G/A 1 11 15 26 5.08520681265207 8.06562707365627 -2.98042026100421 A:G G A 10 0.537708471577085 0.246384011673615 ENSG00000132768:ENST00000255108:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000524776:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000495421:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000412950:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000490861:exon_44436638_44437297:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000529729:exon_44437059_44437396:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000534655:exon_44437059_44437296:DPH2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 44443698 G/A 1 226 240 466 104.477885423579 129.0500331785 -24.5721477549216 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0228431951532949 ENSG00000117410:ENST00000472174:exon_44443653_44443966:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000532642:exon_44442698_44443885:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000236067:exon_44443653_44443961:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000431876:exon_44443653_44443966:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000468183:exon_44442698_44443967:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000473485:exon_44443653_44443964:ATP6V0B;ENSG00000117410:ENST00000498664:exon_44443653_44443967:ATP6V0B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 T:C T C 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 22 15 37 10.1704136253041 8.06562707365627 2.10478655164786 A:T A T 10 0.537708471577085 0.514288152683863 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 23 21 44 10.632705153727 11.2918779031188 -0.65917274939174 A:G G A 10 0.537708471577085 0.880542656737778 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45469161 G/A 1 21 23 44 9.70812209688122 12.367294846273 -2.65917274939174 A:G G A 10 0.537708471577085 0.452031865340640 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45475278 G/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45475240_45475355:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45475240_45475286:HECTD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45810923 G/A 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 45974849 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45974468_45976739:MMACHC;ENSG00000132763:ENST00000474382:exon_45974805_45975180:MMACHC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 A:G G A 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 46500613 T/C 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 T:C T C 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 46655158 T/C 1 7 13 20 3.23604069896041 6.99021013050211 -3.7541694315417 T:C T C 10 0.537708471577085 0.116331864298699 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46655130_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46655156_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46655130_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000475642:exon_46655130_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46655156_46655239:POMGNT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 16 18 34 7.39666445476664 9.67875248838753 -2.28208803362089 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.492929469502856 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 68 31 99 31.4358239327582 16.6689626188896 14.7668613138686 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00327562734251091 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 10 17 27 4.62291528422915 9.14104401681045 -4.5181287325813 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0858171401501995 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 47842431 G/A 1 65 64 129 30.0489493474895 34.4133421809334 -4.36439283344397 A:G G A 10 0.537708471577085 0.480168669863051 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47842376_47844511:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47842376_47844510:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47842376_47842882:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47842376_47842795:CMPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 51121198 T/C 1 27 19 46 12.4818712674187 10.2164609599646 2.26541030745409 T:C T C 10 0.537708471577085 0.555921758468777 ENSG00000185104:ENST00000396153:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000494400:exon_51121114_51121200:FAF1;ENSG00000185104:ENST00000371778:exon_51121114_51121200:FAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 51912760 T/G 1 7 14 21 3.23604069896041 7.52791860207919 -4.29187790311878 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0787255321210082 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51912632_51912777:EPS15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 T:C C T 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 53453714 G/T 0 0 11 11 0 5.91479318734793 -5.91479318734793 T G T 10 0.537708471577085 0.000206098715388653 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53453701_53453752:SCP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 53675857 C/T 1 35 25 60 16.180203494802 13.4427117894271 2.7374917053749 T:C C T 10 0.537708471577085 0.518962772324876 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 24 24 48 11.09499668215 12.90500331785 -1.81000663570008 A:G G A 10 0.537708471577085 0.664865013052188 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 41 46 87 18.9539526653395 24.7345896925459 -5.7806370272064 A:G A G 10 0.537708471577085 0.237174033018065 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 52 57 109 24.0391594779916 30.6493828798938 -6.61022340190227 T:G T G 10 0.537708471577085 0.212724741395425 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 35 33 68 16.180203494802 17.7443795620438 -1.56417606724178 A:G G A 10 0.537708471577085 0.716788283112364 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 54681927 G/A 1 117 98 215 54.0881088254811 52.6954302145543 1.39267861092672 A:G G A 10 0.537708471577085 0.89125964063429 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 55541174 A/G 1 11 13 24 5.08520681265207 6.99021013050211 -1.90500331785004 A:G A G 10 0.537708471577085 0.540188574454526 ENSG00000162402:ENST00000294383:exon_55541130_55541196:USP24;ENSG00000162402:ENST00000407756:exon_55541130_55541196:USP24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 40 38 78 18.4916611369166 20.4329219199292 -1.94126078301263 T:C T C 10 0.537708471577085 0.73360880884395 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 59002282 A/C 1 21 18 39 9.70812209688122 9.67875248838753 0.0293696084936848 A:T:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 59004617 G/A 1 17 23 40 7.85895598318955 12.367294846273 -4.5083388630834 A:G G A 10 0.537708471577085 0.157417098618647 ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000453710:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000482274:exon_59004467_59004982:OMA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 59247993 C/T 1 38 27 65 17.5670780800708 14.5181287325813 3.04894934748947 T:C C T 10 0.537708471577085 0.458931784553351 ENSG00000177606:ENST00000371222:exon_59246465_59249785:JUN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 59248221 G/A 1 25 26 51 11.5572882105729 13.9804202610042 -2.42313205043134 A:G G A 10 0.537708471577085 0.574770711570601 ENSG00000177606:ENST00000371222:exon_59246465_59249785:JUN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 62916290 A/G 1 91 96 187 42.0685290864853 51.6200132714002 -9.5514841849149 A:G A G 10 0.537708471577085 0.164179608110213 ENSG00000162607:ENST00000371146:exon_62915917_62917473:USP1;ENSG00000162607:ENST00000433771:exon_62915917_62917473:USP1;ENSG00000162607:ENST00000339950:exon_62915917_62917475:USP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 62960101 A/G 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62959946_62960138:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000479983:exon_62959946_62960969:DOCK7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 63997633 A/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:T A T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000203965:ENST00000480886:exon_63997491_63997702:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63997491_63997702:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63997491_63997702:EFCAB7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 63999826 C/T 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_63999766_63999887:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_63999766_63999887:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000493605:exon_63999766_64000038:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000496956:exon_63999804_63999887:EFCAB7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 64095248 T/C 1 24 18 42 11.09499668215 9.67875248838753 1.41624419376243 T:C T C 10 0.537708471577085 0.757539726068538 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 64104470 C/T 1 32 38 70 14.7933289095333 20.4329219199292 -5.63959301039595 T:C C T 10 0.537708471577085 0.188440813663276 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64104356_64104471:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64104356_64104471:PGM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 T:C T C 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 A:G G A 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 49 40 89 22.6522848927228 21.5083388630834 1.14394602963943 T:C T C 10 0.537708471577085 0.832356631640032 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 67 43 110 30.9735324043353 23.1214642778147 7.85206812652065 T:C C T 10 0.537708471577085 0.151348802267494 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 50 37 87 23.1145764211457 19.8952134483521 3.2193629727936 A:G A G 10 0.537708471577085 0.520032982278057 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 272 230 502 125.743295731033 123.67294846273 2.07034726830332 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.858052103484651 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 76255228 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000137955:ENST00000496055:exon_76253182_76256202:RABGGTB;ENSG00000137955:ENST00000461653:exon_76254844_76256202:RABGGTB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 159 117 276 73.5043530192435 62.9118911745189 10.5924618447245 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.20542888731686 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 85724328 C/T 1 11 22 33 5.08520681265207 11.8295863746959 -6.7443795620438 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0224314831010516 ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 86172032 G/A 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000117174:ENST00000370574:exon_86171932_86172038:ZNHIT6;ENSG00000117174:ENST00000431532:exon_86171932_86172038:ZNHIT6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 8 32 40 3.69833222738332 17.2066710904667 -13.5083388630834 T:C T C 10 0.537708471577085 1.88355018325485e-05 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 14 19 33 6.47208139792081 10.2164609599646 -3.74437956204381 T:C C T 10 0.537708471577085 0.222694445595855 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 86822231 A/G 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86822196_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86822145_86822285:ODF2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 A:G G A 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 38 36 74 17.5670780800708 19.3575049767751 -1.79042689670429 A:G G A 10 0.537708471577085 0.727004725085914 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 89475135 C/T 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89475075_89475177:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89475075_89475177:GBP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 89524657 C/G 1 15 11 26 6.93437292634373 5.91479318734793 1.01957973899579 C:G C G 10 0.537708471577085 0.8445748718871 ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89524524_89524726:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000459831:exon_89524024_89524726:GBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 57 55 112 26.3506171201062 29.5739659367397 -3.22334881663352 T:C T C 10 0.537708471577085 0.57024836587765 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 39 41 80 18.0293696084937 22.0460473346605 -4.0166777261668 C:G G C 10 0.537708471577085 0.372305201240989 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 90398847 G/A 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000171492:ENST00000337338:exon_90398626_90402170:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000394593:exon_90398626_90401560:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000532201:exon_90398626_90398992:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000414841:exon_90398626_90398977:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000527156:exon_90398626_90399187:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000441269:exon_90398626_90399451:LRRC8D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 92852626 A/G 1 18 8 26 8.32124751161247 4.30166777261668 4.01957973899579 A:G A G 10 0.537708471577085 0.120662749572848 ENSG00000122484:ENST00000370343:exon_92852568_92853730:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000477322:exon_92852568_92852790:RPAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 54 50 104 24.9637425348374 26.8854235788543 -1.92168104401684 A:G G A 10 0.537708471577085 0.768153540564195 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 93646418 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C T C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 C:G C G 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 94048153 T/C 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000137936:ENST00000370247:exon_94047858_94048510:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000260502:exon_94047858_94048510:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000370244:exon_94047858_94048510:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000370243:exon_94047858_94048510:BCAR3;ENSG00000137936:ENST00000466632:exon_94047858_94048510:BCAR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 T:G T G 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 100356789 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000162688:ENST00000361915:exon_100356776_100356912:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370165:exon_100356776_100356912:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370163:exon_100356776_100356912:AGL;ENSG00000162688:ENST00000294724:exon_100356776_100356912:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361302:exon_100356776_100356912:AGL;ENSG00000162688:ENST00000370161:exon_100356776_100356912:AGL;ENSG00000162688:ENST00000361522:exon_100356776_100356912:AGL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:G G T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 C:G G C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 30 33 63 13.8687458526875 17.7443795620438 -3.87563370935635 A:G A G 10 0.537708471577085 0.376736108840903 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 109461341 C/T 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000431112:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000441735:exon_109461235_109461411:GPSM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 11 15 26 5.08520681265207 8.06562707365627 -2.98042026100421 T:G G T 10 0.537708471577085 0.246384011673615 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 110173775 G/T 1 21 25 46 9.70812209688122 13.4427117894271 -3.73458969254591 T:G G T 10 0.537708471577085 0.301806897507496 ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 A:C C A 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 110466455 G/A 1 14 7 21 6.47208139792081 3.76395930103959 2.70812209688122 A:G G A 10 0.537708471577085 0.278097360713847 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 13 7 20 6.00978986949789 3.76395930103959 2.2458305684583 T:C T C 10 0.537708471577085 0.373996220974877 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 94 65 159 43.455403671754 34.9510506525105 8.50435301924348 A:G G A 10 0.537708471577085 0.203041966845339 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 111490770 A/T 1 72 77 149 33.2849900464499 41.4035523114355 -8.11856226498567 A:T A T 10 0.537708471577085 0.189283940346540 ENSG00000121931:ENST00000369763:exon_111489807_111491021:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000494675:exon_111489813_111491021:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000443367:exon_111489813_111491021:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000485275:exon_111489844_111491021:C1orf103 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 36 20 56 16.6424950232249 10.7541694315417 5.88832559168324 T:C T C 10 0.537708471577085 0.139952584232215 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 30 17 47 13.8687458526875 9.14104401681045 4.727701835877 A:G G A 10 0.537708471577085 0.188990213894459 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 37 26 63 17.1047865516479 13.9804202610042 3.12436629064364 A:C C A 10 0.537708471577085 0.451026021793987 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 31 40 71 14.3310373811104 21.5083388630834 -7.17730148197304 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0959256204242827 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 113153536 T/C 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 T:C T C 10 0.537708471577085 0.194255499810311 ENSG00000007341:ENST00000358039:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000360743:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000490715:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000361846:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000369673:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000480988:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000369669:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000490067:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000369668:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000343210:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000369666:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000497457:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000463235:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000369665:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000497235:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000369664:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000466360:exon_113153463_113153584:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000479436:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000459630:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000470519:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000477332:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000473206:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000498383:exon_113153463_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000470683:exon_113153077_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000485753:exon_113153077_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000467335:exon_113153081_113153625:ST7L;ENSG00000007341:ENST00000492274:exon_113153280_113153625:ST7L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 63 70 133 29.1243662906436 37.6395930103959 -8.51522671975231 A:T A T 10 0.537708471577085 0.140375911653800 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 114301286 T/C 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 T:C T C 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 114301335 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114301281_114301355:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114301281_114301470:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114301281_114301777:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000446739:exon_114301281_114301780:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000493212:exon_114301281_114302111:PHTF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 114443899 G/A 1 16 4 20 7.39666445476664 2.15083388630834 5.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0231475639586451 ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000484201:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369564:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000489092:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369571:exon_114443858_114444005:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000472122:exon_114443858_114444005:AP4B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 114448389 C/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114447763_114448397:DCLRE1B;ENSG00000118655:ENST00000466480:exon_114448031_114448397:DCLRE1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 118165577 C/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 C:G C G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 118165973 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 C C 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 13 0 13 6.00978986949789 0 6.00978986949789 C C 10 0.537708471577085 0.000358176076528924 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 12 0 12 5.54749834107498 0 5.54749834107498 A A 10 0.537708471577085 0.000679479026243913 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 C C 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 94 94 0 50.544596328246 -50.544596328246 C T C 10 0.537708471577085 3.1775902085824e-32 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 73 73 0 39.2527184251272 -39.2527184251272 T G T 10 0.537708471577085 3.4583046920323e-25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 67 67 0 36.0264675956647 -36.0264675956647 A C A 10 0.537708471577085 3.54297137884826e-23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 131 0 131 60.5601902234019 0 60.5601902234019 G G 10 0.537708471577085 5.31078315190733e-36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 98 98 0 52.6954302145543 -52.6954302145543 C T C 10 0.537708471577085 1.45131481489079e-33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 124 124 0 66.6758504755585 -66.6758504755585 T C T 10 0.537708471577085 2.8156322966898e-42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 13 18 31 6.00978986949789 9.67875248838753 -3.66896261888964 A:G G A 10 0.537708471577085 0.209536006747994 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 147124310 T/G 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:G T G 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147124252_147124352:ACP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 150129593 G/A 1 122 108 230 56.3995664675956 58.0725149303252 -1.67294846272956 A:G G A 10 0.537708471577085 0.842915088680638 ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 150130983 G/T 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:G G T 10 0.537708471577085 0.15557289677717 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 150131342 G/A 1 166 145 311 76.7403937182039 77.9677283786773 -1.22733466047343 A:G G A 10 0.537708471577085 0.909504595674412 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 98 109 207 45.3045697854457 58.6102234019023 -13.3056536164566 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0697868480050754 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 44 45 89 20.3408272506083 24.1968812209688 -3.85605397036057 A:G G A 10 0.537708471577085 0.457118813840195 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 150784492 T/C 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 T:C T C 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150782181_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150782186_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150782186_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150782186_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150782186_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150782570_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150783335_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150784157_150784586:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150784437_150784586:ARNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151139822 A/G 1 134 99 233 61.9470648086706 53.2331386861314 8.71392612253919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.264387640930378 ENSG00000163156:ENST00000461862:exon_151139802_151140455:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368905:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368902:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000497147:exon_151139802_151139890:SCNM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151149487 A/G 1 48 38 86 22.1899933642999 20.4329219199292 1.75707144437069 A:G A G 10 0.537708471577085 0.746274793109029 ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151146867_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151148780_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151148938_151149540:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151149207_151149507:VPS72 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151237908 G/A 1 107 100 207 49.4651935412519 53.7708471577085 -4.3056536164566 A:G G A 10 0.537708471577085 0.577297487072571 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000462970:exon_151237870_151238064:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000437736:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000491857:exon_151237720_151238085:PSMD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151239720 G/A 1 437 351 788 202.021397920814 188.735673523557 13.285724397257 A:G G A 10 0.537708471577085 0.353040419000356 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151239649_151239955:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151239649_151239935:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151239649_151239942:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239649_151239936:PSMD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151262977 C/T 1 17 8 25 7.85895598318955 4.30166777261668 3.55728821057287 T:C C T 10 0.537708471577085 0.166016390582096 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000436614:exon_151262927_151263049:ZNF687 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 24 15 39 11.09499668215 8.06562707365627 3.02936960849368 A:G G A 10 0.537708471577085 0.341475003103099 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 151735576 T/C 1 49 58 107 22.6522848927228 31.1870913514709 -8.53480645874809 T:C T C 10 0.537708471577085 0.100220180739351 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 152777574 G/A 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000197084:ENST00000368768:exon_152777311_152777974:LCE1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 153588340 C/T 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000189334:ENST00000476873:exon_153588305_153588414:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368701:exon_153588305_153588412:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000368702:exon_153588305_153588412:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000344616:exon_153588305_153588412:S100A14;ENSG00000189334:ENST00000469571:exon_153588305_153588412:S100A14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 153631943 G/A 1 20 30 50 9.2458305684583 16.1312541473125 -6.88542357885425 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0642773795067971 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631924_153632042:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000478558:exon_153631203_153632042:SNAPIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 3 9 12 1.38687458526874 4.83937624419377 -3.45250165892502 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0780281383639108 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 90 74 164 41.6062375580623 39.7904268967043 1.81581066135806 A:G A G 10 0.537708471577085 0.81445858138556 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 16 12 28 7.39666445476664 6.45250165892502 0.94416279584162 T:C T C 10 0.537708471577085 0.850213996975682 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 14 7 21 6.47208139792081 3.76395930103959 2.70812209688122 C:G C G 10 0.537708471577085 0.278097360713847 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:G A G 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 155231927 C/T 1 49 50 99 22.6522848927228 26.8854235788543 -4.23313868613142 T:C C T 10 0.537708471577085 0.420715831614634 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155231877_155232050:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155231877_155232221:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155231877_155232018:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155231737_155232130:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000480219:exon_155231877_155232120:SCAMP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 2 22 24 0.92458305684583 11.8295863746959 -10.90500331785 T:G T G 10 0.537708471577085 3.99341825032565e-06 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 155582257 G/A 1 16 20 36 7.39666445476664 10.7541694315417 -3.35750497677506 A:G G A 10 0.537708471577085 0.316301305683294 ENSG00000125459:ENST00000460199:exon_155581973_155582269:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000490743:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000245564:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000368341:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000494995:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000491308:exon_155582209_155582273:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000483734:exon_155582209_155582361:MSTO1;ENSG00000125459:ENST00000475253:exon_155582257_155582361:MSTO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C T C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 155851185 G/C 1 3 10 13 1.38687458526874 5.37708471577085 -3.99021013050211 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0471169223811368 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155850989_155854990:SYT11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 156025096 C/T 1 74 69 143 34.2095731032957 37.1018845388189 -2.89231143552315 T:C C T 10 0.537708471577085 0.675152852173878 ENSG00000116586:ENST00000368305:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368304:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000489664:exon_156025054_156025784:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368302:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000487106:exon_156024876_156025216:ROBLD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 1 21 32 53 9.70812209688122 17.2066710904667 -7.4985489935855 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0527389805013425 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 156696999 T/C 1 35 34 69 16.180203494802 18.2820880336209 -2.10188453881887 T:C T C 10 0.537708471577085 0.630773778295348 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 156784982 T/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C T C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 51 35 86 23.5768679495687 18.819796505198 4.75707144437069 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.331256562672809 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 159752066 G/A 1 24 43 67 11.09499668215 23.1214642778147 -12.0264675956647 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00446349710836238 ENSG00000158716:ENST00000368109:exon_159751943_159752333:DUSP23;ENSG00000158716:ENST00000368108:exon_159751943_159752333:DUSP23;ENSG00000158716:ENST00000368107:exon_159751943_159752333:DUSP23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 160000435 A/T 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:T A T 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000143315:ENST00000368090:exon_159997462_160001783:PIGM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 160062472 C/T 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062072_160062485:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062376_160062485:IGSF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 160062727 A/G 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160062714_160063121:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160062714_160063121:IGSF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 19 25 44 8.78353904003538 13.4427117894271 -4.65917274939174 A:G G A 10 0.537708471577085 0.175006445900507 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1622 1409 3031 749.836859101968 757.631236452113 -7.79437735014471 A:T:C:G G A 10 0.537708471577085 0.78468149150557 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 176 157 333 81.363309002433 84.4202300376024 -3.05692103516931 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741901367261345 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161681848 C/T 1 94 85 179 43.455403671754 45.7052200840522 -2.24981641229822 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.764520360153436 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 353 307 660 163.188909533289 165.076500774165 -1.88759124087613 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.906787083722966 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161748056 C/T 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161748034_161748110:ATF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161753802 T/C 1 17 5 22 7.85895598318955 2.68854235788543 5.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0316144760056462 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161753841 G/A 1 24 10 34 11.09499668215 5.37708471577085 5.71791196637911 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0580134383272736 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161761276 G/C 1 11 10 21 5.08520681265207 5.37708471577085 -0.291877903118785 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 22 13 35 10.1704136253041 6.99021013050211 3.18020349480202 T:C C T 10 0.537708471577085 0.312377672013397 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 52 55 107 24.0391594779916 29.5739659367397 -5.5348064587481 A:G A G 10 0.537708471577085 0.287926573340074 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 11 17 28 5.08520681265207 9.14104401681045 -4.05583720415838 A:G A G 10 0.537708471577085 0.133221244184410 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 166826894 C/T 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 T:C C T 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 167381251 A/G 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000143190:ENST00000367866:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000367865:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000271411:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000429375:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000367862:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000420254:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000443275:exon_167381196_167381541:POU2F1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 74 65 139 34.2095731032957 34.9510506525105 -0.741477549214814 A:G G A 10 0.537708471577085 0.932299935495062 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 167962534 C/T 1 18 26 44 8.32124751161247 13.9804202610042 -5.65917274939174 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0969149678566885 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167962464_167962678:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167962464_167962678:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167962464_167962678:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167962464_167962678:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167962464_167962678:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167962464_167962678:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000455334:exon_167962464_167962568:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167962464_167962678:DCAF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 43 21 64 19.8785357221853 11.2918779031188 8.58665781906656 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0331198520249700 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 168014204 T/A 1 56 47 103 25.8883255916832 25.272298164123 0.616027427560244 A:T T A 10 0.537708471577085 0.921618036169856 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168014138_168014465:DCAF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 169660939 T/C 1 339 345 684 156.716828135368 185.509422694094 -28.7925945587261 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0287898025007174 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169659808_169660943:SELL;ENSG00000188404:ENST00000497295:exon_169660822_169660943:SELL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 18 20 38 8.32124751161247 10.7541694315417 -2.43292191992923 A:G G A 10 0.537708471577085 0.5157847888304 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 30 16 46 13.8687458526875 8.60333554523336 5.26541030745409 A:C A C 10 0.537708471577085 0.139419064316885 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 171509414 C/G 1 30 34 64 13.8687458526875 18.2820880336209 -4.41334218093344 C:G C G 10 0.537708471577085 0.315979508256788 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 171509671 A/G 1 21 10 31 9.70812209688122 5.37708471577085 4.33103738111036 A:G A G 10 0.537708471577085 0.149280507860683 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 171537444 A/G 1 18 5 23 8.32124751161247 2.68854235788543 5.63270515372704 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0206445330073281 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171537386_171537478:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171537386_171537478:BAT2L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 24 28 52 11.09499668215 15.0558372041584 -3.96084052200842 T:C T C 10 0.537708471577085 0.330348938683283 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 171753241 G/A 1 40 29 69 18.4916611369166 15.5935456757355 2.89811546118113 A:G G A 10 0.537708471577085 0.546597001605041 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 33 18 51 15.2556204379562 9.67875248838753 5.57686794956866 A:G G A 10 0.537708471577085 0.124312567692157 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 174606602 A/G 1 24 35 59 11.09499668215 18.819796505198 -7.72479982304801 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0498862082983297 ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174606513_174606626:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000407735:exon_174606513_174606626:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367692:exon_174606513_174606626:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000526253:exon_174606513_174606626:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000474375:exon_174606516_174606626:RABGAP1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 179310262 C/T 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 179310439 C/T 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 180962526 C/T 1 14 16 30 6.47208139792081 8.60333554523336 -2.13125414731255 T:C C T 10 0.537708471577085 0.467885000124991 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180962499_180962561:STX6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 27 25 52 12.4818712674187 13.4427117894271 -0.960840522008422 A:G G A 10 0.537708471577085 0.889567489190752 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 181058313 G/A 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000162783:ENST00000367577:exon_181057638_181059977:IER5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183072590 T/C 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 T T 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183072463_183072767:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000484114:exon_183072462_183072767:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183085755 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183085712_183085810:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000479499:exon_183085712_183085810:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183086757 A/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:C A C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183086669_183086858:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183093875 T/C 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183093766_183094011:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183094547 T/C 1 11 5 16 5.08520681265207 2.68854235788543 2.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 0.317076399536816 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183094532_183094685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000466964:exon_183094323_183094685:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183102632 G/A 1 8 18 26 3.69833222738332 9.67875248838753 -5.98042026100421 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0284876175984020 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183102541_183102685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183102541_183102673:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 22 20 42 10.1704136253041 10.7541694315417 -0.583755806237571 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.878081350508644 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 27 10 37 12.4818712674187 5.37708471577085 7.10478655164785 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0206436774039937 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 183532364 T/A 1 45 34 79 20.8031187790312 18.2820880336209 2.52103074541028 A:T T A 10 0.537708471577085 0.652031770778172 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183532330_183532441:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183532330_183532441:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183532330_183532441:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000418089:exon_183532330_183532441:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183532330_183532441:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000469280:exon_183532330_183532441:NCF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 114 136 250 52.7012342402123 73.1283521344836 -20.4271178942713 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0110394699584825 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 198719698 C/T 1 64 75 139 29.5866578190666 40.3281353682814 -10.7414775492148 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.0739521819807072 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198719621_198719755:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198719621_198719755:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198719621_198719755:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198719621_198719755:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198719621_198719755:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198719621_198719755:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198719621_198719755:PTPRC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 200377094 T/C 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000162702:ENST00000294740:exon_200375827_200378847:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367353:exon_200375836_200378851:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367352:exon_200375858_200378580:ZNF281 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 C:G G C 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 201926448 G/A 1 107 72 179 49.4651935412519 38.7150099535501 10.7501835877018 A:G G A 10 0.537708471577085 0.115478846680169 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201926409_201926508:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201926409_201926508:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000484647:exon_201926409_201926508:TIMM17A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 48 23 71 22.1899933642999 12.367294846273 9.82269851802696 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0231389487777564 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 33 40 73 15.2556204379562 21.5083388630834 -6.25271842512721 T:C T C 10 0.537708471577085 0.159134469679975 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 203787700 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000058673:ENST00000432282:exon_203787698_203787793:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000453771:exon_203787698_203787817:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203787698_203787817:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203787698_203787817:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203787698_203787817:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203787698_203787817:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203787698_203787817:ZC3H11A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 205744138 G/T 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000117280:ENST00000367139:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000235932:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000528078:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000367140:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000446390:exon_205743961_205744361:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000414729:exon_205743961_205744587:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000492534:exon_205743961_205744279:RAB7L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 A:G G A 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 206905040 C/T 1 62 33 95 28.6620747622207 17.7443795620438 10.9176952001769 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0301833701581625 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 206944233 A/G 1 3 9 12 1.38687458526874 4.83937624419377 -3.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0780281383639108 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 207504461 T/G 1 31 50 81 14.3310373811104 26.8854235788543 -12.5543861977439 T:G T G 10 0.537708471577085 0.00710465162762326 ENSG00000196352:ENST00000367064:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000367063:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000391921:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000488171:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000367065:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000391920:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000314754:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000482390:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000343420:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000367062:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000465534:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000476590:exon_207504453_207504641:CD55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 79 57 136 36.5210307454103 30.6493828798938 5.87164786551644 C:G C G 10 0.537708471577085 0.344378570496119 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 8 1 9 3.69833222738332 0.537708471577085 3.16062375580623 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0438932334623324 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 210006603 C/T 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 29 25 54 13.4064543242645 13.4427117894271 -0.0362574651625902 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 15 16 31 6.93437292634373 8.60333554523336 -1.66896261888964 A:G A G 10 0.537708471577085 0.591762951419813 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 55 35 90 25.4260340632603 18.819796505198 6.60623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 0.170598467617111 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 20 18 38 9.2458305684583 9.67875248838753 -0.432921919929232 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 49 43 92 22.6522848927228 23.1214642778147 -0.46917938509182 A:G G A 10 0.537708471577085 0.917239113780958 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 44 41 85 20.3408272506083 22.0460473346605 -1.70522008405223 A:G A G 10 0.537708471577085 0.74477912854593 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 72 69 141 33.2849900464499 37.1018845388189 -3.81689449236899 C:G C G 10 0.537708471577085 0.554668157663236 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 218458753 C/T 1 33 1 34 15.2556204379562 0.537708471577085 14.7179119663791 T:C C T 10 0.537708471577085 2.40830441820815e-08 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218458684_218458797:RRP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 219383905 A/G 1 84 64 148 38.8324883875249 34.4133421809334 4.41914620659142 A:G A G 10 0.537708471577085 0.509796194845402 ENSG00000143353:ENST00000366928:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000460522:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000366927:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000477938:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000463964:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000483635:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000474379:exon_219383857_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000469590:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000478794:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000475724:exon_219383874_219383989:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000481007:exon_219383684_219383989:LYPLAL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 45 50 95 20.8031187790312 26.8854235788543 -6.08230479982308 T:C C T 10 0.537708471577085 0.218275442005634 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 220197625 G/T 1 43 46 89 19.8785357221853 24.7345896925459 -4.85605397036057 A:T:G G T 10 0.537708471577085 0.338890622592092 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220197606_220197798:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220197606_220197798:EPRS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 22 31 53 10.1704136253041 16.6689626188896 -6.49854899358551 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0973868168321778 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:G T G 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 222833538 C/G 1 23 22 45 10.632705153727 11.8295863746959 -1.19688122096882 C:G C G 10 0.537708471577085 0.766042798882964 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000475451:exon_222833519_222833656:MIA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 223905532 G/A 1 9 1 10 4.16062375580623 0.537708471577085 3.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0250233828426948 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223905464_223905533:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223905464_223905533:CAPN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 223954080 A/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:C A C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000474026:exon_223954069_223954133:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000487223:exon_223954069_223954133:CAPN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 223980207 G/C 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223980091_223980224:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223980091_223980224:TP53BP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 224302047 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000143756:ENST00000366862:exon_224301789_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000424254:exon_224301813_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000523990:exon_224301821_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000483773:exon_224301873_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000519894:exon_224301920_224302098:FBXO28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 21 25 46 9.70812209688122 13.4427117894271 -3.73458969254591 T:C C T 10 0.537708471577085 0.301806897507496 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 226040404 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226040365_226040470:TMEM63A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 45 38 83 20.8031187790312 20.4329219199292 0.370196859101942 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 19 21 40 8.78353904003538 11.2918779031188 -2.5083388630834 T:G T G 10 0.537708471577085 0.433124807120697 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 227920061 T/G 1 34 39 73 15.7179119663791 20.9706303915063 -5.25271842512721 T:G T G 10 0.537708471577085 0.240948447045624 ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 43 19 62 19.8785357221853 10.2164609599646 9.66207476222073 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0151415812534061 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 227954677 C/T 1 32 32 64 14.7933289095333 17.2066710904667 -2.41334218093344 T:C C T 10 0.537708471577085 0.6164428261979 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 227954689 C/T 1 32 33 65 14.7933289095333 17.7443795620438 -2.95105065251052 T:C C T 10 0.537708471577085 0.534301833416498 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 228295527 G/A 1 56 31 87 25.8883255916832 16.6689626188896 9.2193629727936 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0527215003551611 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295525_228295570:MRPL55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 229631734 T/C 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229631639_229631794:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229631639_229631794:NUP133 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 229635521 A/G 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 A:G A G 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366678:exon_229635431_229635565:NUP133 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 229683264 G/A 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135776:ENST00000344517:exon_229683246_229683448:ABCB10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 17 18 35 7.85895598318955 9.67875248838753 -1.81979650519798 A:T T A 10 0.537708471577085 0.612142448554809 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 231488524 C/T 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000010072:ENST00000391858:exon_231487050_231488878:C1orf124;ENSG00000010072:ENST00000295050:exon_231488356_231490769:C1orf124 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 234569192 T/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C T C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234569156_234569317:TARBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 37 29 66 17.1047865516479 15.5935456757355 1.51124087591239 A:C C A 10 0.537708471577085 0.805226567907308 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 51 45 96 23.5768679495687 24.1968812209688 -0.620013271400161 T:C T C 10 0.537708471577085 0.91874281951298 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 235324545 T/A 1 26 24 50 12.0195797389958 12.90500331785 -0.885423578854251 A:T T A 10 0.537708471577085 0.887428128576512 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 235345346 C/T 1 18 10 28 8.32124751161247 5.37708471577085 2.94416279584162 T:C C T 10 0.537708471577085 0.343745041558555 ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000444620:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235343454_235346108:ARID4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236381825 G/C 1 7 15 22 3.23604069896041 8.06562707365627 -4.82958637469587 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0524787665296475 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236378855_236381876:ERO1LB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:T T A 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 A:T T A 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 T:C T C 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 15 2 17 6.93437292634373 1.07541694315417 5.85895598318955 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00561446816757043 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 11 3 14 5.08520681265207 1.61312541473126 3.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.104463576674659 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 11 3 14 5.08520681265207 1.61312541473126 3.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.104463576674659 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 18 23 41 8.32124751161247 12.367294846273 -4.04604733466049 C:G G C 10 0.537708471577085 0.213927594375255 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 49 49 98 22.6522848927228 26.3477151072772 -3.69543021455433 T:C T C 10 0.537708471577085 0.479097795437693 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 45 38 83 20.8031187790312 20.4329219199292 0.370196859101942 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 54 37 91 24.9637425348374 19.8952134483521 5.06852908648526 T:C T C 10 0.537708471577085 0.295286246155234 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 47 57 104 21.727701835877 30.6493828798938 -8.92168104401684 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0941265055574048 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 56 48 104 25.8883255916832 25.8100066357001 0.0783189559831605 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 49 47 96 22.6522848927228 25.272298164123 -2.62001327140016 A:G A G 10 0.537708471577085 0.609929112819261 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 41 26 67 18.9539526653395 13.9804202610042 4.9735324043353 A:G G A 10 0.537708471577085 0.270072958881626 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 29 20 49 13.4064543242645 10.7541694315417 2.65228489272283 T:C T C 10 0.537708471577085 0.476743971198836 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236729956 T/C 1 24 15 39 11.09499668215 8.06562707365627 3.02936960849368 T:C T C 10 0.537708471577085 0.341475003103099 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236729946_236730176:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236729946_236730176:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 12 7 19 5.54749834107498 3.76395930103959 1.78353904003538 T:C C T 10 0.537708471577085 0.493938110591303 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236748505 T/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236748325_236748516:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236748325_236748516:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236749649 T/C 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C T C 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236749541_236749752:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236749541_236749752:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236758887 T/C 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 T:C T C 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236758840_236758973:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236758840_236758973:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 9 16 25 4.16062375580623 8.60333554523336 -4.44271178942713 A:G A G 10 0.537708471577085 0.106767385755251 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 22 21 43 10.1704136253041 11.2918779031188 -1.12146427781465 A:G G A 10 0.537708471577085 0.761366051085368 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 18 24 42 8.32124751161247 12.90500331785 -4.58375580623757 A:G A G 10 0.537708471577085 0.166192807586473 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 245850095 C/T 1 3 10 13 1.38687458526874 5.37708471577085 -3.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0471169223811368 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 20 13 33 9.2458305684583 6.99021013050211 2.25562043795619 T:C T C 10 0.537708471577085 0.487582164437403 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 37 44 81 17.1047865516479 23.6591727493917 -6.55438619774388 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.148888318441043 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 246755124 T/C 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C T C 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366511:exon_246754814_246755243:CNST HGDP01274_parsed_pileup.txt . 1 246930564 G/C 1 71 66 137 32.822698518027 35.4887591240876 -2.66606060606065 C:G G C 10 0.537708471577085 0.668918688979278 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246930497_246931439:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246930497_246931437:SCCPDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 1065710 C/T 1 26 26 52 12.0195797389958 13.9804202610042 -1.96084052200842 T:C C T 10 0.537708471577085 0.676928655641189 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 66 70 136 30.5112408759124 37.6395930103959 -7.12835213448356 T:C C T 10 0.537708471577085 0.229339449642552 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 84 73 157 38.8324883875249 39.2527184251272 -0.420230037602344 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 49 52 101 22.6522848927228 27.9608405220084 -5.30855562928559 A:G A G 10 0.537708471577085 0.318599282789858 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 94 80 174 43.455403671754 43.0166777261668 0.438725945587201 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 73 52 125 33.7472815748728 27.9608405220084 5.78644105286437 T:C C T 10 0.537708471577085 0.324247774279147 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3172157 C/T 1 108 80 188 49.9274850696748 43.0166777261668 6.91080734350801 T:C C T 10 0.537708471577085 0.341775967840782 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3178815 G/C 1 302 150 452 139.61204158372 80.6562707365627 58.9557708471576 C:G G C 10 0.537708471577085 2.18179590588997e-08 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 64 70 134 29.5866578190666 37.6395930103959 -8.05293519132939 T:C T C 10 0.537708471577085 0.166650021385603 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 28 30 58 12.9441627958416 16.1312541473125 -3.18709135147093 T:C T C 10 0.537708471577085 0.430993443790634 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 31 26 57 14.3310373811104 13.9804202610042 0.350617120106154 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 16 13 29 7.39666445476664 6.99021013050211 0.406454324264534 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 19 26 45 8.78353904003538 13.9804202610042 -5.19688122096883 T:C T C 10 0.537708471577085 0.135519962163080 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 20 13 33 9.2458305684583 6.99021013050211 2.25562043795619 A:G A G 10 0.537708471577085 0.487582164437403 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 5781969 A/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:T A T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5781581_5782460:C10orf18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 5790420 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 5803368 A/G 1 17 11 28 7.85895598318955 5.91479318734793 1.94416279584162 A:G A G 10 0.537708471577085 0.570682901317659 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5803253_5803434:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5803253_5803434:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000487196:exon_5803253_5803764:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000459693:exon_5802803_5803434:C10orf18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 5957397 T/C 1 31 19 50 14.3310373811104 10.2164609599646 4.11457642114575 T:C T C 10 0.537708471577085 0.259478427796551 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5957366_5957534:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5957366_5957534:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5957366_5957534:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379994:exon_5957366_5957534:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000460453:exon_5957366_5957907:FBXO18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:T A T 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 12046546 T/C 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 T:C T C 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12046529_12046726:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12046529_12046726:UPF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 12131081 T/G 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12130985_12131254:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12130985_12131254:DHTKD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 13 6 19 6.00978986949789 3.22625082946251 2.78353904003538 C:G C G 10 0.537708471577085 0.252246477906020 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 C:G C G 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 167 192 359 77.2026852466268 103.2400265428 -26.0373412961735 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00686424059714549 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 185 160 345 85.5239327582393 86.0333554523336 -0.50942269409434 T:G G T 10 0.537708471577085 0.957003033125372 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 13151224 G/A 1 37 27 64 17.1047865516479 14.5181287325813 2.58665781906656 A:G G A 10 0.537708471577085 0.533670826960209 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000487935:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13151112_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13151097_13151288:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13151112_13151288:OPTN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 13230934 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13230881_13231080:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13230881_13231080:MCM10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 13234356 A/T 1 4 11 15 1.84916611369166 5.91479318734793 -4.06562707365627 A:T A T 10 0.537708471577085 0.0400794641262981 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13234255_13234365:MCM10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 5 16 21 2.31145764211457 8.60333554523336 -6.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00744572213960584 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 26 30 56 12.0195797389958 16.1312541473125 -4.11167440831676 T:C T C 10 0.537708471577085 0.285857156672404 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 13653631 T/C 1 33 23 56 15.2556204379562 12.367294846273 2.88832559168324 T:C T C 10 0.537708471577085 0.50348619769338 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000320054:exon_13653615_13653652:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 14968855 G/C 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14968842_14968896:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000492201:exon_14968842_14968896:DCLRE1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 60 57 117 27.7374917053749 30.6493828798938 -2.91189117451895 A:G G A 10 0.537708471577085 0.643154607309714 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 50 51 101 23.1145764211457 27.4231320504313 -4.30855562928559 C:G C G 10 0.537708471577085 0.425068555002742 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 16794623 C/T 1 40 20 60 18.4916611369166 10.7541694315417 7.7374917053749 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0517169809884196 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16794533_16794652:RSU1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 21827796 G/A 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 A:G G A 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 25 18 43 11.5572882105729 9.67875248838753 1.87853572218534 T:C C T 10 0.537708471577085 0.647261718349993 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 31137647 G/A 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31137460_31138220:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31137460_31138372:ZNF438 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 31812973 C/G 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 C:G C G 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31812861_31813041:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31812861_31813041:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31812861_31813041:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31812861_31813041:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31812861_31813041:ZEB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 35338673 C/T 1 19 9 28 8.78353904003538 4.83937624419377 3.94416279584162 T:C C T 10 0.537708471577085 0.183794076954982 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35338611_35338693:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35338611_35338693:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35338611_35338693:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35338611_35338693:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35338611_35338693:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35338611_35338693:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000421317:exon_35338611_35338693:CUL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 35468107 G/A 1 35 14 49 16.180203494802 7.52791860207919 8.65228489272284 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0144069032080759 ENSG00000095794:ENST00000489388:exon_35468062_35468697:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374726:exon_35468062_35468771:CREM;ENSG00000095794:ENST00000461968:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000482633:exon_35468062_35468232:CREM;ENSG00000095794:ENST00000495960:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000496019:exon_35468062_35468390:CREM;ENSG00000095794:ENST00000354759:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000489321:exon_35468062_35468426:CREM;ENSG00000095794:ENST00000427847:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000345491:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395895:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374728:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000487132:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000337656:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374734:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395897:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000439705:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000333809:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000362092:exon_35468062_35468257:CREM;ENSG00000095794:ENST00000479070:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000348787:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374722:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374721:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000429130:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000490263:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000462058:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000361599:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000497686:exon_35468062_35468513:CREM;ENSG00000095794:ENST00000484283:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395887:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000494479:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000342105:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374711:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000495301:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000463960:exon_35468062_35468204:CREM;ENSG00000095794:ENST00000472813:exon_35468062_35468771:CREM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 35484949 T/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000095794:ENST00000488741:exon_35484793_35485070:CREM;ENSG00000095794:ENST00000474931:exon_35484830_35485027:CREM;ENSG00000095794:ENST00000468236:exon_35484837_35485027:CREM;ENSG00000095794:ENST00000344351:exon_35484845_35485070:CREM;ENSG00000095794:ENST00000490511:exon_35484937_35485027:CREM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 20 14 34 9.2458305684583 7.52791860207919 1.71791196637911 A:G G A 10 0.537708471577085 0.608645173355244 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38120720 C/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:C C T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000198105:ENST00000395867:exon_38117693_38122044:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000357328:exon_38117899_38122044:ZNF248 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38120945 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000198105:ENST00000395867:exon_38117693_38122044:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000357328:exon_38117899_38122044:ZNF248 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38241067 A/C 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:C A C 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000175395:ENST00000302609:exon_38238500_38242123:ZNF25;ENSG00000175395:ENST00000374633:exon_38239495_38242123:ZNF25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38241132 C/T 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000175395:ENST00000302609:exon_38238500_38242123:ZNF25;ENSG00000175395:ENST00000374633:exon_38239495_38242123:ZNF25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38344700 C/G 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 C:G C G 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38345465 G/C 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 C:G G C 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38407519 A/G 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 38658896 A/G 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G A G 10 0.537708471577085 0.764222193284696 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 10 15 25 4.62291528422915 8.06562707365627 -3.44271178942713 T:C C T 10 0.537708471577085 0.228187819322191 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 151 117 268 69.8060207918602 62.9118911745189 6.89412961734121 A:T T A 10 0.537708471577085 0.425931005306298 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 45869748 C/T 1 20 1 21 9.2458305684583 0.537708471577085 8.70812209688121 T:C C T 10 0.537708471577085 7.02704293489853e-05 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45869675_45869877:ALOX5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 50396388 G/A 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50396339_50396424:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50396339_50396413:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50396339_50396404:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374149:exon_50396339_50396424:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50396339_50396436:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000470884:exon_50396339_50396630:C10orf128 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 51589245 G/A 1 70 82 152 32.3604069896041 44.092094669321 -11.7316876797169 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.0612603463295559 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51589225_51590731:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51589225_51590732:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51589225_51590732:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51589225_51590734:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51589225_51590731:NCOA4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 31 20 51 14.3310373811104 10.7541694315417 3.57686794956866 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.329460534055785 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 73 60 133 33.7472815748728 32.2625082946251 1.48477328024769 A:C C A 10 0.537708471577085 0.862018191617351 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 61552692 G/T 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 T:G G T 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552607_61552732:CCDC6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 75 72 147 34.6718646317186 38.7150099535501 -4.0431453218315 A:G A G 10 0.537708471577085 0.509328081429907 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 64565011 G/A 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 A:G G A 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000181915:ENST00000373783:exon_64564516_64568238:ADO HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 65380587 A/G 1 43 43 86 19.8785357221853 23.1214642778147 -3.24292855562931 A:G A G 10 0.537708471577085 0.517162059956147 ENSG00000165476:ENST00000373758:exon_65380573_65381969:REEP3;ENSG00000165476:ENST00000298249:exon_65380573_65384881:REEP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G G A 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 22 15 37 10.1704136253041 8.06562707365627 2.10478655164786 A:G G A 10 0.537708471577085 0.514288152683863 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 70513684 A/G 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 A:G A G 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70513609_70513834:CCAR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 34 23 57 15.7179119663791 12.367294846273 3.35061712010615 T:C C T 10 0.537708471577085 0.426227219655826 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 85 70 155 39.2947799159478 37.6395930103959 1.65518690555182 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.809494180288548 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 C:G C G 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 32 30 62 14.7933289095333 16.1312541473125 -1.33792523777927 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.799280569412512 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 20 15 35 9.2458305684583 8.06562707365627 1.18020349480202 T:C C T 10 0.537708471577085 0.736962690946534 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 72324143 A/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72324120_72324275:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72324120_72324275:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72324120_72324275:KIAA1274 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 72358049 C/T 1 3 10 13 1.38687458526874 5.37708471577085 -3.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0471169223811368 ENSG00000180644:ENST00000373209:exon_72357104_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000441259:exon_72357105_72358937:PRF1;ENSG00000180644:ENST00000318971:exon_72357105_72358937:PRF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:C A C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 73521578 G/A 1 17 12 29 7.85895598318955 6.45250165892502 1.40645432426453 A:G G A 10 0.537708471577085 0.710583412304497 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 73992862 C/G 1 161 111 272 74.4289360760893 59.6856403450564 14.7432957310329 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0777802323151857 ENSG00000166295:ENST00000478193:exon_73992759_73993373:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000299381:exon_73992759_73993587:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000470481:exon_73992759_73993584:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000468144:exon_73992759_73992969:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000496924:exon_73992759_73993223:ANAPC16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 75523634 A/G 1 23 16 39 10.632705153727 8.60333554523336 2.02936960849368 A:G A G 10 0.537708471577085 0.630551420389103 ENSG00000176986:ENST00000345254:exon_75523614_75523741:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000465076:exon_75523614_75523741:SEC24C;ENSG00000176986:ENST00000339365:exon_75523614_75523741:SEC24C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 T:C C T 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 25 20 45 11.5572882105729 10.7541694315417 0.803118779031173 T:C T C 10 0.537708471577085 0.8816626047185 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 88911841 A/G 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:G A G 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88911107_88912636:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88911107_88912636:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88911105_88912636:FAM35A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 90674382 A/C 1 27 18 45 12.4818712674187 9.67875248838753 2.80311877903117 A:C A C 10 0.537708471577085 0.456184384537351 ENSG00000138134:ENST00000371926:exon_90674291_90674415:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371927:exon_90674291_90674415:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371924:exon_90674291_90674415:STAMBPL1;ENSG00000138134:ENST00000371922:exon_90674291_90674415:STAMBPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 91065949 A/C 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 A:C A C 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 91066075 A/G 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 A:G A G 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 91066460 T/A 1 24 24 48 11.09499668215 12.90500331785 -1.81000663570008 A:T T A 10 0.537708471577085 0.664865013052188 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 146 157 303 67.4945631497456 84.4202300376024 -16.9256668878568 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0571031726170192 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 26 20 46 12.0195797389958 10.7541694315417 1.26541030745409 T:C C T 10 0.537708471577085 0.768532865779989 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 95259979 C/G 1 26 19 45 12.0195797389958 10.2164609599646 1.80311877903117 C:G C G 10 0.537708471577085 0.655053879538245 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 49 40 89 22.6522848927228 21.5083388630834 1.14394602963943 C:G G C 10 0.537708471577085 0.832356631640032 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 95279506 A/T 1 31 29 60 14.3310373811104 15.5935456757355 -1.2625082946251 A:T A T 10 0.537708471577085 0.796208752103225 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 20 21 41 9.2458305684583 11.2918779031188 -2.04604733466049 C:G G C 10 0.537708471577085 0.535027447953124 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 24 19 43 11.09499668215 10.2164609599646 0.878535722185344 A:G A G 10 0.537708471577085 0.878821788544274 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 25 17 42 11.5572882105729 9.14104401681045 2.41624419376243 T:C C T 10 0.537708471577085 0.536705056533733 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 96098373 C/T 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96098365_96098493:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96098365_96098493:NOC3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 452 428 880 208.955770847158 230.139225834992 -21.1834549878348 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.155693956875696 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 97515955 G/C 1 131 117 248 60.5601902234019 62.9118911745189 -2.35170095111709 T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.799015368390131 ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97515714_97516012:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97515916_97516012:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97515935_97516012:ENTPD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 98031181 G/A 1 73 84 157 33.7472815748728 45.1675116124751 -11.4202300376023 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0779577584485821 ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98031109_98031297:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98031109_98031297:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98031109_98031333:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_98031109_98031333:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98031109_98031265:BLNK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 28 28 56 12.9441627958416 15.0558372041584 -2.11167440831676 T:G G T 10 0.537708471577085 0.593964799394802 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 7 21 28 3.23604069896041 11.2918779031188 -8.05583720415838 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00360973312193304 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 98380137 T/C 1 15 37 52 6.93437292634373 19.8952134483521 -12.9608405220084 T:C T C 10 0.537708471577085 0.000398805972353678 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 29 12 41 13.4064543242645 6.45250165892502 6.95395266533952 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0404092318919326 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:C:G C A 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 30 45 75 13.8687458526875 24.1968812209688 -10.3281353682814 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0200720336599843 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 29 53 82 13.4064543242645 28.4985489935855 -15.092094669321 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00117967235163079 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99205731 A/G 1 30 21 51 13.8687458526875 11.2918779031188 2.57686794956867 A:G A G 10 0.537708471577085 0.486489837768018 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99219885 G/A 1 27 25 52 12.4818712674187 13.4427117894271 -0.960840522008422 A:G G A 10 0.537708471577085 0.889567489190752 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99219987 G/C 1 33 35 68 15.2556204379562 18.819796505198 -3.56417606724178 C:G G C 10 0.537708471577085 0.397060432777853 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99229412 G/T 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 T:G G T 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000437002:exon_99229403_99229480:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000441194:exon_99229410_99229480:MMS19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 99969568 A/G 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 A:G A G 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 34 26 60 15.7179119663791 13.9804202610042 1.7374917053749 T:C T C 10 0.537708471577085 0.698904992999328 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 20 16 36 9.2458305684583 8.60333554523336 0.642495023224939 C:G G C 10 0.537708471577085 0.868679174180134 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 A:G G A 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:G G A 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:C A C 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 101645498 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101645444_101645623:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101645444_101645623:DNMBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 101715899 G/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101714971_101716962:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101714971_101716962:DNMBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 101977883 C/T 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101977752_101977887:CHUK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 102763761 T/C 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 T:C T C 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102763264_102763972:LZTS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 103825747 G/A 1 14 8 22 6.47208139792081 4.30166777261668 2.17041362530413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.398447526729543 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 104140355 C/T 1 30 27 57 13.8687458526875 14.5181287325813 -0.649382879893846 T:C C T 10 0.537708471577085 0.894835211824984 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 104158628 G/T 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:G G T 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000077150:ENST00000423524:exon_104158496_104158716:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000467116:exon_104158496_104158975:NFKB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 34 25 59 15.7179119663791 13.4427117894271 2.27520017695198 C:G C G 10 0.537708471577085 0.602700724468211 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 A:G G A 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 14 10 24 6.47208139792081 5.37708471577085 1.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.687878182736171 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 243 187 430 112.336841406768 100.551484184915 11.7853572218534 A:G G A 10 0.537708471577085 0.266099028129351 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 112058426 T/C 1 48 50 98 22.1899933642999 26.8854235788543 -4.69543021455433 T:C T C 10 0.537708471577085 0.362726809837526 ENSG00000119953:ENST00000369603:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000369592:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000460483:exon_112058406_112058548:SMNDC1;ENSG00000119953:ENST00000471297:exon_112058406_112058568:SMNDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 43 25 68 19.8785357221853 13.4427117894271 6.43582393275822 T:C C T 10 0.537708471577085 0.143962906701399 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 C:G C G 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 116719543 G/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000165832:ENST00000298746:exon_116719485_116719566:TRUB1;ENSG00000165832:ENST00000485065:exon_116719485_116719759:TRUB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 14 10 24 6.47208139792081 5.37708471577085 1.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.687878182736171 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 121551581 A/C 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 A:C A C 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000198825:ENST00000453198:exon_121551381_121551596:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 122643400 G/A 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 A:G G A 10 0.537708471577085 0.194255499810311 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122643292_122643400:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122643292_122643400:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122643292_122643400:WDR11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 A:G G A 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 6 15 21 2.77374917053749 8.06562707365627 -5.29187790311878 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0269702412380432 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 126089434 G/A 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000065154:ENST00000368845:exon_126089409_126089553:OAT;ENSG00000065154:ENST00000471127:exon_126089409_126089553:OAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 126517989 G/A 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 A:G G A 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126517962_126518046:FAM175B;ENSG00000165660:ENST00000486933:exon_126517962_126518046:FAM175B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 257 268 525 118.808922804689 144.105870382659 -25.2969475779696 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.0285737717397548 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 215 257 472 99.3926786109267 138.191077195311 -38.7983985843841 C:G G C 10 0.537708471577085 0.000370647998510298 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 164 169 333 75.8158106613581 90.8727316965274 -15.0569210351693 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0994587225362983 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 147 147 294 67.9568546781685 79.0431453218315 -11.086290643663 C:G G C 10 0.537708471577085 0.198584709076616 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 93 96 189 42.9931121433311 51.6200132714002 -8.62690112806906 T:C C T 10 0.537708471577085 0.215438719885708 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 135 102 237 62.4093563370935 54.8462641008627 7.56309223623085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.329382872478209 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 74 94 168 34.2095731032957 50.544596328246 -16.3350232249503 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0130984878671284 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 72 72 144 33.2849900464499 38.7150099535501 -5.43001990710025 A:G A G 10 0.537708471577085 0.403404922328927 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 67 68 135 30.9735324043353 36.5641760672418 -5.59064366290648 A:G A G 10 0.537708471577085 0.343476256584892 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 46 41 87 21.2654103074541 22.0460473346605 -0.780637027206396 T:C C T 10 0.537708471577085 0.914523114984567 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 21 19 40 9.70812209688122 10.2164609599646 -0.5083388630834 T:C C T 10 0.537708471577085 0.87553259952279 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 19 62 81 8.78353904003538 33.3379252377793 -24.5543861977439 T:C T C 10 0.537708471577085 3.58497775863938e-08 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 135184126 G/A 1 88 73 161 40.6816545012165 39.2527184251272 1.42893607608931 A:G G A 10 0.537708471577085 0.874480091143432 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 135204950 C/G 1 34 24 58 15.7179119663791 12.90500331785 2.81290864852907 C:G C G 10 0.537708471577085 0.51132341898846 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 20 22 42 9.2458305684583 11.8295863746959 -2.58375580623757 C:G C G 10 0.537708471577085 0.442687948829403 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 16 32 48 7.39666445476664 17.2066710904667 -9.81000663570008 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00550358024628741 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 26 31 57 12.0195797389958 16.6689626188896 -4.64938287989385 A:C C A 10 0.537708471577085 0.233396259426483 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 237087 A/G 1 56 52 108 25.8883255916832 27.9608405220084 -2.07251493032518 A:G A G 10 0.537708471577085 0.700492547259796 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 244197 T/C 1 112 20 132 51.7766511833665 10.7541694315417 41.0224817518248 T:C T C 10 0.537708471577085 5.70632071085035e-14 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 406043 G/A 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 A:G G A 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000185187:ENST00000528845:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000526395:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000532587:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000431843:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000397632:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000332725:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527295:exon_405716_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527987:exon_405728_406059:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000531205:exon_405872_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000382520:exon_405903_406538:SIGIRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 406483 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000185187:ENST00000526395:exon_406349_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000532587:exon_406349_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000431843:exon_406349_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000397632:exon_406349_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000332725:exon_406349_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527295:exon_406349_407164:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527987:exon_406349_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000531205:exon_405872_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000382520:exon_405903_406538:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000534145:exon_406427_406993:SIGIRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 428385 A/G 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428358_428394:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428358_428394:ANO9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 428489 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428475_428639:ANO9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 494907 G/A 1 156 190 346 72.1174784339747 102.164609599646 -30.0471311656714 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00143264647151303 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 101 139 240 46.6914443707144 74.7414775492148 -28.0500331785004 T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.00035020466756786 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 96 117 213 44.3799867285998 62.9118911745189 -18.5319044459191 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0131835539177859 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 27 27 54 12.4818712674187 14.5181287325813 -2.03625746516259 A:G A G 10 0.537708471577085 0.588096224354422 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 43 66 109 19.8785357221853 35.4887591240876 -15.6102234019023 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00284403608316152 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 204 192 396 94.3074717982747 103.2400265428 -8.93255474452566 T:C C T 10 0.537708471577085 0.391626478630352 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 318 271 589 147.008706038487 145.71899579739 1.28971024109691 A:G A G 10 0.537708471577085 0.934157494197875 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 870467 C/T 1 35 31 66 16.180203494802 16.6689626188896 -0.488759124087611 T:C C T 10 0.537708471577085 0.902535905405674 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 1780205 A/G 1 27 22 49 12.4818712674187 11.8295863746959 0.652284892722834 A:G A G 10 0.537708471577085 0.886948386008516 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1780199_1780281:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780199_1780317:CTSD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 1780867 G/A 1 20 26 46 9.2458305684583 13.9804202610042 -4.73458969254591 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.183839001004972 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780746_1780869:CTSD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 1782594 G/A 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 A:G G A 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 42 32 74 19.4162441937624 17.2066710904667 2.20957310329571 C:G C G 10 0.537708471577085 0.64223321949395 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 7 13 20 3.23604069896041 6.99021013050211 -3.7541694315417 A:G A G 10 0.537708471577085 0.116331864298699 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 44 35 79 20.3408272506083 18.819796505198 1.52103074541029 A:C C A 10 0.537708471577085 0.821641713201075 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 156 124 280 72.1174784339747 66.6758504755585 5.44162795841619 A:G A G 10 0.537708471577085 0.549056788952559 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5632212 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000121236:ENST00000278302:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000507320:exon_5632007_5632930:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000515469:exon_5632007_5633659:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380107:exon_5632007_5633653:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000511284:exon_5632007_5632334:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380109:exon_5632007_5632572:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380097:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000396867:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000445329:exon_5632007_5634182:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000515022:exon_5632007_5632575:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000506134:exon_5632007_5632817:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000380090:exon_5632007_5634188:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000469187:exon_5632007_5632509:TRIM6;ENSG00000121236:ENST00000481603:exon_5632007_5634188:TRIM6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 22 25 47 10.1704136253041 13.4427117894271 -3.272298164123 A:C C A 10 0.537708471577085 0.38111269787031 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5688940 C/T 1 11 15 26 5.08520681265207 8.06562707365627 -2.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246384011673615 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5688919_5688941:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5688919_5688941:TRIM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 165 124 289 76.278102189781 66.6758504755585 9.60225171422242 T:C T C 10 0.537708471577085 0.262902698007713 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 135 107 242 62.4093563370935 57.5348064587481 4.87454987834543 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561952613312993 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 137 148 285 63.3339393939394 79.5808537934086 -16.2469143994692 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0572376101958995 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 208 165 373 96.1566379119663 88.721897810219 7.43474010174728 A:C:G G C 10 0.537708471577085 0.467315831747665 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 6232653 C/T 1 18 11 29 8.32124751161247 5.91479318734793 2.40645432426453 T:C C T 10 0.537708471577085 0.457421609041791 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6232565_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6232565_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000529360:exon_6232575_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6232575_6233097:FAM160A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 22 18 40 10.1704136253041 9.67875248838753 0.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 6624676 G/C 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 C:G G C 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6624634_6624850:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000534343:exon_6624634_6624809:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6624634_6624834:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6624634_6624827:RRP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 100 79 179 46.2291528422915 42.4789692545897 3.75018358770178 T:C C T 10 0.537708471577085 0.600242865985869 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 114 103 217 52.7012342402123 55.3839725724398 -2.68273833222745 A:G G A 10 0.537708471577085 0.733833920810069 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 17 5 22 7.85895598318955 2.68854235788543 5.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0316144760056462 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 27 3 30 12.4818712674187 1.61312541473126 10.8687458526874 A:G G A 10 0.537708471577085 2.92227311813515e-05 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 7673029 T/C 1 27 3 30 12.4818712674187 1.61312541473126 10.8687458526874 T:C T C 10 0.537708471577085 2.92227311813515e-05 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 7690873 C/T 1 15 23 38 6.93437292634373 12.367294846273 -5.43292191992923 T:C C T 10 0.537708471577085 0.102564456170447 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7689709_7693754:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7690856_7690962:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7690856_7690962:CYB5R2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 8009241 C/T 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 T:C C T 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 C:G C G 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 49 40 89 22.6522848927228 21.5083388630834 1.14394602963943 T:C C T 10 0.537708471577085 0.832356631640032 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 60 77 137 27.7374917053749 41.4035523114355 -13.6660606060606 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0206093156105893 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 98 65 163 45.3045697854457 34.9510506525105 10.3535191329351 C:G C G 10 0.537708471577085 0.116009952755583 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 10521749 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 20 32 52 9.2458305684583 17.2066710904667 -7.96084052200842 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0359551225990609 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 274 263 537 126.667878787879 141.417328024773 -14.7494492368946 A:G G A 10 0.537708471577085 0.209522507735767 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 10 15 25 4.62291528422915 8.06562707365627 -3.44271178942713 C:G G C 10 0.537708471577085 0.228187819322191 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 13443250 C/T 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 T:C C T 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13443189_13443385:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13443189_13443362:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13443189_13443385:BTBD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 17809639 C/T 1 46 36 82 21.2654103074541 19.3575049767751 1.90790533067903 T:C C T 10 0.537708471577085 0.740033942485195 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 17809724 T/C 1 45 36 81 20.8031187790312 19.3575049767751 1.44561380225611 T:C T C 10 0.537708471577085 0.823851497655995 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 1 12 3 15 5.54749834107498 1.61312541473126 3.93437292634373 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0663410983131874 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 76 55 131 35.1341561601415 29.5739659367397 5.56019022340186 T:G T G 10 0.537708471577085 0.336760600909931 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 127 105 232 58.7110241097102 56.4593895155939 2.25163459411628 T:C T C 10 0.537708471577085 0.79248025273506 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 22646532 C/T 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 22647366 G/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 33079580 A/G 1 16 7 23 7.39666445476664 3.76395930103959 3.63270515372704 A:G A G 10 0.537708471577085 0.146665846223693 ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33079465_33079642:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33079465_33079685:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33079465_33079685:TCP11L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 56 66 122 25.8883255916832 35.4887591240876 -9.60043353240437 T:C C T 10 0.537708471577085 0.084902797537584 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 73 62 135 33.7472815748728 33.3379252377793 0.40935633709352 T:C:G T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 A:G A G 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 44129386 A/G 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44129178_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000532479:exon_44129233_44129409:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000527014:exon_44129233_44129599:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44129233_44129798:EXT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 44640640 C/G 1 141 106 247 65.183105507631 56.997097987171 8.18600752046 T:C:G C G 10 0.537708471577085 0.307712900298444 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640599_44641913:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640599_44641313:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640599_44640676:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640599_44640884:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640599_44640933:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640599_44640825:CD82;ENSG00000085117:ENST00000524750:exon_44640599_44641259:CD82 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 45832509 A/G 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000181830:ENST00000442528:exon_45832327_45833109:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000456334:exon_45832327_45834561:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000530670:exon_45832327_45832642:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45832327_45834566:SLC35C1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 46419411 G/A 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000452566:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46417965_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000526545:exon_46418934_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46419000_46419493:AMBRA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 46625035 T/G 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 T:G T G 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000180423:ENST00000326737:exon_46624411_46625459:HARBI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 46701765 C/T 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000443332:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000528837:exon_46701755_46701832:ARHGAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 46702608 G/A 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46702561_46702659:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000443332:exon_46702561_46702659:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46702561_46702659:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000528837:exon_46702561_46702659:ARHGAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 46724289 C/G 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 C:G C G 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46724254_46724315:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000526410:exon_46724254_46724445:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000534481:exon_46724254_46724313:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000527008:exon_46724265_46724793:ZNF408 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 46784697 A/C 1 24 26 50 11.09499668215 13.9804202610042 -2.88542357885425 A:C A C 10 0.537708471577085 0.478733886212233 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526943:exon_46784696_46784729:CKAP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 48145166 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000527952:exon_48145165_48145252:PTPRJ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 48149572 C/T 0 0 8 8 0 4.30166777261668 -4.30166777261668 T C T 10 0.537708471577085 0.00208606328681067 ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48149332_48149595:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48149332_48149595:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48149332_48149595:PTPRJ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 57193130 C/T 1 29 27 56 13.4064543242645 14.5181287325813 -1.11167440831676 T:C C T 10 0.537708471577085 0.789866684974494 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193014_57193182:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193014_57193182:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529113:exon_57193014_57193329:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530232:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193014_57193182:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193014_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193023_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193035_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193093_57193143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193121_57193182:SLC43A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 57258731 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000149150:ENST00000278426:exon_57258697_57258835:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000528450:exon_57258697_57258835:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000534298:exon_57258697_57258835:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000529452:exon_57258726_57258835:SLC43A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 57297651 G/A 1 135 118 253 62.4093563370935 63.449599646096 -1.04024330900251 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.899827041047768 ENSG00000134809:ENST00000257245:exon_57297592_57297707:TIMM10;ENSG00000134809:ENST00000525587:exon_57297592_57297707:TIMM10;ENSG00000134809:ENST00000525158:exon_57297592_57297766:TIMM10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 90 70 160 41.6062375580623 37.6395930103959 3.9666445476664 C:G C G 10 0.537708471577085 0.579064404323021 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 32 25 57 14.7933289095333 13.4427117894271 1.35061712010615 T:C C T 10 0.537708471577085 0.791025654941082 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 59377858 C/T 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 T:C C T 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000110048:ENST00000263847:exon_59377854_59378062:OSBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60184191 G/A 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000166928:ENST00000531787:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000300187:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000395005:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000530662:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000527841:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000525397:exon_60182910_60185036:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000531783:exon_60182910_60185161:MS4A14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 22 33 55 10.1704136253041 17.7443795620438 -7.57396593673967 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0430041294784745 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 50 50 100 23.1145764211457 26.8854235788543 -3.7708471577085 A:C C A 10 0.537708471577085 0.483202464400625 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 173 117 290 79.9764344171643 62.9118911745189 17.0645432426453 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0453363072145667 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 55 43 98 25.4260340632603 23.1214642778147 2.30456978544567 T:C T C 10 0.537708471577085 0.685853739687992 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 29 31 60 13.4064543242645 16.6689626188896 -3.2625082946251 T:C T C 10 0.537708471577085 0.438176855943868 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 60705355 G/A 1 137 163 300 63.3339393939394 87.6464808670649 -24.3125414731255 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00538051777780166 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60705342_60705497:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60705342_60705497:SLC15A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61099072 G/A 1 26 21 47 12.0195797389958 11.2918779031188 0.727701835877005 A:G G A 10 0.537708471577085 0.884368057944362 ENSG00000167986:ENST00000301764:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000450997:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000422969:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000440736:exon_61099015_61099163:DDB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 18 3 21 8.32124751161247 1.61312541473126 6.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00346526982333689 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61165769 A/G 1 25 2 27 11.5572882105729 1.07541694315417 10.4818712674187 A:G A G 10 0.537708471577085 1.96338854832210e-05 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61213555 C/T 1 92 57 149 42.5308206149082 30.6493828798938 11.8814377350143 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0584818967612907 ENSG00000167985:ENST00000301761:exon_61213413_61214225:SDHAF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61560081 G/A 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61560028_61560085:C11orf10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61633182 C/T 0 114 1 115 52.7012342402123 0.537708471577085 52.1635257686352 C:G C G 10 0.537708471577085 1.12800009452307e-29 ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61633110_61634826:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61633110_61633429:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61633110_61634826:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000523235:exon_61633110_61634819:FADS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:G A G 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 11 15 26 5.08520681265207 8.06562707365627 -2.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246384011673615 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61897806 G/T 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 17 6 23 7.85895598318955 3.22625082946251 4.63270515372704 A:T:G G T 10 0.537708471577085 0.0603851077364703 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 1371 737 2108 633.801685467816 396.291143552312 237.510541915505 C:G G C 10 0.537708471577085 1.26383651165752e-25 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62378660 G/A 1 16 10 26 7.39666445476664 5.37708471577085 2.01957973899579 A:G G A 10 0.537708471577085 0.556045575489951 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62458275 T/C 1 40 51 91 18.4916611369166 27.4231320504313 -8.93147091351474 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0733495822381277 ENSG00000168000:ENST00000405837:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000433053:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403734:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000470529:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000278893:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000360796:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000463679:exon_62458259_62458814:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000403550:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000407022:exon_62458259_62458339:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000301781:exon_62458259_62458345:BSCL2;ENSG00000168000:ENST00000421906:exon_62458259_62458339:BSCL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62496519 T/C 1 59 86 145 27.275200176952 46.2429285556293 -18.9677283786773 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00195894933945571 ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62505764 C/T 1 61 73 134 28.1997832337978 39.2527184251272 -11.0529351913294 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0570178619400239 ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62505760_62506108:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62505760_62506075:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532276:exon_62505760_62505962:TTC9C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62559351 T/C 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 T:C T C 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000168569:ENST00000528367:exon_62559151_62559464:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000525631:exon_62559151_62559469:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000307366:exon_62559151_62559493:TMEM223 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 38 27 65 17.5670780800708 14.5181287325813 3.04894934748947 T:C T C 10 0.537708471577085 0.458931784553351 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 63974966 G/A 1 108 141 249 49.9274850696748 75.816894492369 -25.8894094226942 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.00115149733025164 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63974823_63974996:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63974823_63974996:FERMT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 63986713 C/A 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 212 182 394 98.005804025658 97.8629418270295 0.142862198628507 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 63991581 G/A 1 109 67 176 50.3897765980977 36.0264675956647 14.363309002433 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0340209839190253 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991572_63991682:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991572_63991682:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991572_63991685:TRPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 74 72 146 34.2095731032957 38.7150099535501 -4.50543685025441 T:C T C 10 0.537708471577085 0.456520610322817 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 63994230 G/T 1 60 49 109 27.7374917053749 26.3477151072772 1.38977659809774 T:G G T 10 0.537708471577085 0.84782401625578 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64009879 G/A 1 98 110 208 45.3045697854457 59.1479318734794 -13.8433620880337 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0602570271358388 ENSG00000173486:ENST00000309366:exon_64009856_64010030:FKBP2;ENSG00000173486:ENST00000449942:exon_64009856_64010030:FKBP2;ENSG00000173486:ENST00000394540:exon_64009856_64010030:FKBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64034866 G/A 1 14 6 20 6.47208139792081 3.22625082946251 3.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.180236988291815 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64037602 G/C 1 51 55 106 23.5768679495687 29.5739659367397 -5.99709798717101 C:G G C 10 0.537708471577085 0.244388343492937 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64037302_64037809:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64037306_64037809:BAD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64039175 G/A 1 16 10 26 7.39666445476664 5.37708471577085 2.01957973899579 A:G G A 10 0.537708471577085 0.556045575489951 ENSG00000002330:ENST00000394532:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000309032:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000394531:exon_64039085_64039275:BAD;ENSG00000002330:ENST00000493798:exon_64039085_64039340:BAD;ENSG00000002330:ENST00000492141:exon_64039085_64039275:BAD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64081445 G/A 1 10 14 24 4.62291528422915 7.52791860207919 -2.90500331785004 A:G G A 10 0.537708471577085 0.306214656238402 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000467987:exon_64081243_64081539:ESRRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64496357 G/T 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 T:G G T 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000068831:ENST00000464324:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377494:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000421556:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000394432:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377497:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000354024:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000488071:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000437237:exon_64496335_64496514:RASGRP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 83 64 147 38.3701968591019 34.4133421809334 3.9568546781685 C:G G C 10 0.537708471577085 0.562765241088616 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 56 42 98 25.8883255916832 22.5837558062376 3.30456978544567 A:G A G 10 0.537708471577085 0.543948692848499 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64789194 T/C 1 67 75 142 30.9735324043353 40.3281353682814 -9.35460296394607 T:C T C 10 0.537708471577085 0.129615798290596 ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64807236 G/A 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 A:G G A 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64854195 G/A 1 17 17 34 7.85895598318955 9.14104401681045 -1.28208803362089 A:G G A 10 0.537708471577085 0.731925963272471 ENSG00000162300:ENST00000531761:exon_64854192_64854256:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000453524:exon_64854192_64854261:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000526334:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000526945:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000532200:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530488:exon_64854178_64854261:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 15 19 34 6.93437292634373 10.2164609599646 -3.28208803362089 T:C C T 10 0.537708471577085 0.303099075262891 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 54 64 118 24.9637425348374 34.4133421809334 -9.44959964609603 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0961490706936514 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65046336 A/G 1 21 16 37 9.70812209688122 8.60333554523336 1.10478655164786 A:G A G 10 0.537708471577085 0.744577501703053 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65046201_65046394:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527850:exon_65046201_65046394:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000532469:exon_65046201_65046394:POLA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 31 16 47 14.3310373811104 8.60333554523336 5.727701835877 A:G G A 10 0.537708471577085 0.107754142000973 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65144075 T/C 1 18 6 24 8.32124751161247 3.22625082946251 5.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0409677026434019 ENSG00000162241:ENST00000534338:exon_65144007_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65142666_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65143665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65143699_65144115:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000533629:exon_65144028_65144146:SLC25A45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65268198 G/A 1 820 745 1565 379.07905330679 400.592811324928 -21.513758018138 A:T:C:G G A 10 0.537708471577085 0.275814329310166 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65270976 G/A 1 138 136 274 63.7962309223623 73.1283521344836 -9.33212121212129 A:G G A 10 0.537708471577085 0.275524834968698 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 20 12 32 9.2458305684583 6.45250165892502 2.79332890953328 T:G T G 10 0.537708471577085 0.377331249813687 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 18 21 39 8.32124751161247 11.2918779031188 -2.97063039150632 A:G G A 10 0.537708471577085 0.422380605990043 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 27 29 56 12.4818712674187 15.5935456757355 -3.11167440831676 T:C C T 10 0.537708471577085 0.423723078582135 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 34 26 60 15.7179119663791 13.9804202610042 1.7374917053749 A:G G A 10 0.537708471577085 0.698904992999328 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:C A C 10 0.537708471577085 0.564667164878158 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65547333 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65547455 C/A 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:C C A 10 0.537708471577085 0.300207155555316 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 2205 2398 4603 1019.35282017253 1289.42491484185 -270.072094669322 A:T:G G A 10 0.537708471577085 1.70158250161013e-15 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65628334 G/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 C:G G C 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 13 20 33 6.00978986949789 10.7541694315417 -4.74437956204381 T:C C T 10 0.537708471577085 0.116148498675437 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 22 20 42 10.1704136253041 10.7541694315417 -0.583755806237571 A:G G A 10 0.537708471577085 0.878081350508644 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 21 28 49 9.70812209688122 15.0558372041584 -5.34771510727716 T:G G T 10 0.537708471577085 0.151540851109148 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 65685225 T/C 1 33 21 54 15.2556204379562 11.2918779031188 3.96374253483741 T:C T C 10 0.537708471577085 0.339561232288088 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 66260338 C/T 1 33 32 65 15.2556204379562 17.2066710904667 -1.95105065251053 T:C C T 10 0.537708471577085 0.709331690371342 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260187_66260381:DPP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 27 28 55 12.4818712674187 15.0558372041584 -2.57396593673968 A:G A G 10 0.537708471577085 0.501722231924964 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 14 22 36 6.47208139792081 11.8295863746959 -5.35750497677506 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0935977510488975 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67034266 C/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:C C A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000173020:ENST00000308595:exon_67033881_67034283:ADRBK1;ENSG00000173020:ENST00000526285:exon_67033952_67034283:ADRBK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67068859 T/C 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 T:C T C 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 26 28 54 12.0195797389958 15.0558372041584 -3.03625746516259 T:C C T 10 0.537708471577085 0.416372193787875 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67196049 G/A 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 36 40 76 16.6424950232249 21.5083388630834 -4.86584383985846 T:C C T 10 0.537708471577085 0.300629595726322 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 171 167 338 79.0518513603185 89.7973147533732 -10.7454633930547 A:C C A 10 0.537708471577085 0.252111380256137 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67263767 A/G 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 A:G A G 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67263649_67263819:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67263649_67263816:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67263649_67264907:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67263649_67263819:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000526602:exon_67263649_67263910:PITPNM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67395624 T/C 1 31 41 72 14.3310373811104 22.0460473346605 -7.71500995355012 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0761941819143566 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67766704 G/A 1 28 15 43 12.9441627958416 8.06562707365627 4.87853572218535 A:G G A 10 0.537708471577085 0.168314533569141 ENSG00000110057:ENST00000530331:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000227471:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000525743:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000533424:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000524455:exon_67766643_67766845:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528423:exon_67766643_67766775:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528096:exon_67766646_67767150:UNC93B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67770499 G/T 1 37 41 78 17.1047865516479 22.0460473346605 -4.94126078301263 T:G G T 10 0.537708471577085 0.306785844829128 ENSG00000110057:ENST00000530331:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000227471:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000525743:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000533424:exon_67770492_67771268:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000524455:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528423:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000528096:exon_67770492_67770939:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000530138:exon_67770492_67770645:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000531152:exon_67770492_67770645:UNC93B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 67804074 C/T 1 181 166 347 83.6747666445476 89.2596062817961 -5.58483963724849 T:C C T 10 0.537708471577085 0.55411271045702 ENSG00000110717:ENST00000313468:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000528492:exon_67803929_67804106:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000524810:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000531282:exon_67803929_67804111:NDUFS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 29 27 56 13.4064543242645 14.5181287325813 -1.11167440831676 T:C C T 10 0.537708471577085 0.789866684974494 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 5 13 18 2.31145764211457 6.99021013050211 -4.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0327312480155932 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 68201295 C/T 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C C T 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68201070_68201306:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68201070_68201306:LRP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 68579964 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68579905_68580044:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68579905_68580044:CPT1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 33 38 71 15.2556204379562 20.4329219199292 -5.17730148197304 A:G G A 10 0.537708471577085 0.234954750675825 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 T:C C T 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 71155998 T/C 1 63 53 116 29.1243662906436 28.4985489935855 0.625817297058138 T:C T C 10 0.537708471577085 0.926081975517234 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155901_71156004:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155901_71156004:DHCR7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 14 17 31 6.47208139792081 9.14104401681045 -2.66896261888964 C:G G C 10 0.537708471577085 0.370890806424659 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 50 46 96 23.1145764211457 24.7345896925459 -1.62001327140016 C:G G C 10 0.537708471577085 0.759551465722888 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 73105728 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73105522_73105779:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73105522_73105779:RELT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 139 111 250 64.2585224507852 59.6856403450564 4.57288210572874 A:G G A 10 0.537708471577085 0.568854862964147 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 T:C T C 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 74329638 C/T 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 74340294 C/T 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74340262_74340368:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74340262_74340368:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74340262_74340368:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74340262_74340368:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74339908_74340368:POLD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 C:G C G 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 23 8 31 10.632705153727 4.30166777261668 6.33103738111036 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0291952217251338 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 21 27 48 9.70812209688122 14.5181287325813 -4.81000663570008 A:G G A 10 0.537708471577085 0.192673208197216 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75511469 G/A 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 A:G G A 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 21 14 35 9.70812209688122 7.52791860207919 2.18020349480203 T:C T C 10 0.537708471577085 0.50132532256255 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75852182 G/A 1 24 26 50 11.09499668215 13.9804202610042 -2.88542357885425 A:G G A 10 0.537708471577085 0.478733886212233 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 75852448 C/T 1 79 66 145 36.5210307454103 35.4887591240876 1.03227162132268 T:C C T 10 0.537708471577085 0.933664114102875 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 17 17 34 7.85895598318955 9.14104401681045 -1.28208803362089 A:G A G 10 0.537708471577085 0.731925963272471 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 16 22 38 7.39666445476664 11.8295863746959 -4.43292191992923 T:C T C 10 0.537708471577085 0.192469625497054 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 142 49 191 65.6453970360539 26.3477151072772 39.2976819287768 T:C:G G C 10 0.537708471577085 6.17768179679905e-09 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 22 24 46 10.1704136253041 12.90500331785 -2.73458969254591 T:C T C 10 0.537708471577085 0.461153963958979 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 78277277 A/G 1 14 5 19 6.47208139792081 2.68854235788543 3.78353904003538 A:G A G 10 0.537708471577085 0.10665894054281 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78277178_78277313:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78277178_78277318:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78277178_78277318:NARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 82644649 G/A 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:G G A 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 16 6 22 7.39666445476664 3.22625082946251 4.17041362530413 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.0880468261492587 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 82876726 C/A 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:C C A 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82876642_82877756:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530660:exon_82876642_82877756:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530304:exon_82876642_82877756:PCF11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 82877475 A/G 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:G A G 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82876642_82877756:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530660:exon_82876642_82877756:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530304:exon_82876642_82877756:PCF11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 82880341 G/A 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 A:G G A 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82879470_82881037:PCF11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 91 75 166 42.0685290864853 40.3281353682814 1.74039371820389 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.815642554689046 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 85365211 G/A 1 46 49 95 21.2654103074541 26.3477151072772 -5.08230479982307 A:G G A 10 0.537708471577085 0.305069685758996 ENSG00000171202:ENST00000525353:exon_85365085_85365278:TMEM126A;ENSG00000171202:ENST00000528105:exon_85365107_85365300:TMEM126A;ENSG00000171202:ENST00000531366:exon_85365107_85365278:TMEM126A;ENSG00000171202:ENST00000304511:exon_85365107_85365300:TMEM126A;ENSG00000171202:ENST00000532180:exon_85365107_85365300:TMEM126A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 85374993 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 38 35 73 17.5670780800708 18.819796505198 -1.25271842512721 T:G G T 10 0.537708471577085 0.81481700364325 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 93212245 C/T 1 21 33 54 9.70812209688122 17.7443795620438 -8.03625746516259 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0294700674029151 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 35 23 58 16.180203494802 12.367294846273 3.81290864852907 T:C C T 10 0.537708471577085 0.35751476363841 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G A G 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 96 101 197 44.3799867285998 54.3085556292856 -9.92856890068575 A:G A G 10 0.537708471577085 0.1744589612039 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 11 23 34 5.08520681265207 12.367294846273 -7.28208803362089 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0151717141564468 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 102248377 C/T 1 46 40 86 21.2654103074541 21.5083388630834 -0.242928555629312 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102248227_102248422:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000531259:exon_102248227_102248481:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102248227_102248481:BIRC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 102398593 C/T 1 23 38 61 10.632705153727 20.4329219199292 -9.80021676620219 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0142011455746275 ENSG00000137673:ENST00000260227:exon_102398488_102398714:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000533366:exon_102398488_102398714:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000531200:exon_102398488_102398714:MMP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 107299529 C/G 1 18 8 26 8.32124751161247 4.30166777261668 4.01957973899579 C:G C G 10 0.537708471577085 0.120662749572848 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 107299653 T/C 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 T:C T C 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 108043988 C/T 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108042926_108044578:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000533535:exon_108041859_108044578:NPAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 111747588 G/A 1 3 12 15 1.38687458526874 6.45250165892502 -5.06562707365627 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00951268129677044 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747532_111747735:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747532_111747735:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747532_111747735:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747532_111747735:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747532_111747735:AP001781.3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 116655600 G/A 1 55 58 113 25.4260340632603 31.1870913514709 -5.7610572882106 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.29974957779413 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 116729196 T/C 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 117063003 G/A 1 11 13 24 5.08520681265207 6.99021013050211 -1.90500331785004 A:G G A 10 0.537708471577085 0.540188574454526 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 23 23 46 10.632705153727 12.367294846273 -1.73458969254591 A:G A G 10 0.537708471577085 0.658540232792532 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 117097931 C/T 1 16 6 22 7.39666445476664 3.22625082946251 4.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0880468261492587 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 C:G C G 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118068752 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118068683_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118068324_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118068683_118068806:AMICA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118765267 G/C 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 C:G G C 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 21 30 51 9.70812209688122 16.1312541473125 -6.42313205043133 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0910349542741667 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118886603 G/A 1 38 164 202 17.5670780800708 88.1841893386419 -70.6171112585712 A:G G A 10 0.537708471577085 2.08431586273300e-24 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118886551_118886649:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118886551_118886649:RPS25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 A:G G A 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118889028 G/A 1 412 289 701 190.464109710241 155.397748285778 35.0663614244634 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.00799648282799623 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118890908 C/T 1 59 56 115 27.275200176952 30.1116744083168 -2.83647423136478 T:C C T 10 0.537708471577085 0.640364643973757 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118890860_118891459:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000528230:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118890860_118890963:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533149:exon_118890102_118890963:TRAPPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 T:C C T 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 30 20 50 13.8687458526875 10.7541694315417 3.11457642114575 A:G G A 10 0.537708471577085 0.398253588009758 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118948607 G/A 1 22 18 40 10.1704136253041 9.67875248838753 0.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 50 52 102 23.1145764211457 27.9608405220084 -4.84626410086267 A:G A G 10 0.537708471577085 0.371716994553934 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 21 14 35 9.70812209688122 7.52791860207919 2.18020349480203 T:C C T 10 0.537708471577085 0.50132532256255 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 33 27 60 15.2556204379562 14.5181287325813 0.737491705374898 T:C T C 10 0.537708471577085 0.897432780594124 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 119052975 G/T 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:G G T 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 20 11 31 9.2458305684583 5.91479318734793 3.33103738111036 A:G G A 10 0.537708471577085 0.280780991059551 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2889 3018 5907 1335.5602256138 1622.80416721964 -287.243941605841 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 7.3158067610437e-14 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1945 1804 3749 899.15702278257 970.026082725061 -70.8690599424916 A:T:C:G T G 10 0.537708471577085 0.0209104577839016 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 124502114 C/T 1 36 35 71 16.6424950232249 18.819796505198 -2.17730148197304 T:C C T 10 0.537708471577085 0.635118982794146 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124501989_124502330:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124501989_124502348:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124501989_124505287:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124501989_124504698:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124501989_124502331:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000529543:exon_124501989_124503320:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124501989_124502134:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124500284_124502339:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000531033:exon_124501989_124502301:TBRG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 12 7 19 5.54749834107498 3.76395930103959 1.78353904003538 A:T A T 10 0.537708471577085 0.493938110591303 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125465862 T/C 1 23 19 42 10.632705153727 10.2164609599646 0.416244193762429 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000134910:ENST00000527606:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525652:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529886:exon_125465776_125465898:STT3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125476252 C/G 1 34 35 69 15.7179119663791 18.819796505198 -3.10188453881887 C:G C G 10 0.537708471577085 0.470815994109602 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526213:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000527456:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525431:exon_125476105_125476360:STT3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 142 113 255 65.6453970360539 60.7610572882106 4.88433974784331 T:C C T 10 0.537708471577085 0.57208065860907 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 69 68 137 31.8981154611811 36.5641760672418 -4.66606060606065 C:G C G 10 0.537708471577085 0.441361805815197 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 A:C C A 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 26 17 43 12.0195797389958 9.14104401681045 2.87853572218534 T:C T C 10 0.537708471577085 0.445332200815161 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 126081403 T/C 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126081345_126081541:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126081345_126081524:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532674:exon_126081345_126081587:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000532800:exon_126081345_126081525:RPUSD4;ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126081309_126081725:FAM118B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 126277216 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000110080:ENST00000227495:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000531217:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000444328:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000239597:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000356132:exon_126277129_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530591:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534083:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528605:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526311:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528858:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534452:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000392669:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526756:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526727:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000449406:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000532243:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534457:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530531:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000524834:exon_126277147_126277244:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000524860:exon_126277147_126277244:ST3GAL4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 130010313 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000084234:ENST00000533616:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000528499:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000263574:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000345598:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000338167:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000278756:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000533860:exon_130010293_130010378:APLP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 130776524 T/C 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 T:C T C 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 130776613 A/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000534726:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130776520_130776616:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130776520_130776616:SNX19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 11 130780015 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130779913_130780032:SNX19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:C A C 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 663011 G/A 0 10 0 10 4.62291528422915 0 4.62291528422915 G G 10 0.537708471577085 0.00246636601179183 ENSG00000139044:ENST00000266383:exon_662360_663149:B4GALNT3;ENSG00000139044:ENST00000322843:exon_662357_663149:B4GALNT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 863505 A/C 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:C A C 10 0.537708471577085 0.15557289677717 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 1890199 G/A 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G G A 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1890055_1890242:ADIPOR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 1893077 C/A 1 18 14 32 8.32124751161247 7.52791860207919 0.79332890953328 A:C C A 10 0.537708471577085 0.860157369191954 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 1893170 C/T 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 87 90 177 40.2193629727936 48.3937624419377 -8.17439946914405 C:G C G 10 0.537708471577085 0.228181529593121 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 4076 3907 7983 1884.3002698518 2100.82699845167 -216.52672859987 A:T:C:G C G 10 0.537708471577085 1.23500798663500e-06 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 6657538 T/G 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 T T 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 34 29 63 15.7179119663791 15.5935456757355 0.124366290643644 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 3 21 24 1.38687458526874 11.2918779031188 -9.90500331785004 A:G A G 10 0.537708471577085 3.99480790579099e-05 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 7047143 C/A 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:C C A 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7047008_7047230:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7047008_7047230:ATN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 25 18 43 11.5572882105729 9.67875248838753 1.87853572218534 A:G G A 10 0.537708471577085 0.647261718349993 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 8758028 T/C 1 29 31 60 13.4064543242645 16.6689626188896 -3.2625082946251 T:C T C 10 0.537708471577085 0.438176855943868 ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8757811_8758081:AICDA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 9094982 A/G 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127220955139885 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 160 126 286 73.9666445476664 67.7512674187127 6.21537712895368 T:C:G C G 10 0.537708471577085 0.477081562822888 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 235 210 445 108.638509179385 112.918779031188 -4.28026985180283 T:C C T 10 0.537708471577085 0.70379545384472 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 93 104 197 42.9931121433311 55.9216810440168 -12.9285689006857 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0737999990087753 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 9906179 G/A 1 68 65 133 31.4358239327582 34.9510506525105 -3.51522671975231 A:G G A 10 0.537708471577085 0.544110267378073 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 12630028 G/A 1 15 22 37 6.93437292634373 11.8295863746959 -4.89521344835214 A:G G A 10 0.537708471577085 0.136963761437294 ENSG00000111266:ENST00000228862:exon_12628831_12630949:DUSP16;ENSG00000111266:ENST00000298573:exon_12628831_12630949:DUSP16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 14924028 A/G 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:G A G 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 14976553 G/C 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 C:G G C 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 54 48 102 24.9637425348374 25.8100066357001 -0.846264100862673 A:T T A 10 0.537708471577085 0.92098596907164 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 21624569 T/G 1 49 53 102 22.6522848927228 28.4985489935855 -5.84626410086267 T:G T G 10 0.537708471577085 0.274792992710522 ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21624362_21624581:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21624362_21624581:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21624362_21624581:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21624362_21624581:RECQL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 21654831 G/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:G G T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000111711:ENST00000229314:exon_21654699_21654882:GOLT1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 91 107 198 42.0685290864853 57.5348064587481 -15.4662773722628 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0322492858774142 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 16 18 34 7.39666445476664 9.67875248838753 -2.28208803362089 A:G A G 10 0.537708471577085 0.492929469502856 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 29617550 G/A 0 0 10 10 0 5.37708471577085 -5.37708471577085 A G A 10 0.537708471577085 0.000445819797069933 ENSG00000187950:ENST00000318184:exon_29617440_29617635:OVCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 31249861 C/G 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 C:G C G 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 32490764 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 42481732 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000151233:ENST00000398675:exon_42475650_42481749:GXYLT1;ENSG00000151233:ENST00000280876:exon_42475650_42481749:GXYLT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 26 26 52 12.0195797389958 13.9804202610042 -1.96084052200842 T:C C T 10 0.537708471577085 0.676928655641189 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 47629368 G/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:G G T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629207_47629770:FAM113B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 48174275 C/T 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000211584:ENST00000442218:exon_48173928_48176536:SLC48A1;ENSG00000211584:ENST00000390229:exon_48173928_48175452:SLC48A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 48177906 C/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000061273:ENST00000080059:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000354334:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000470668:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000459625:exon_48177862_48179254:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000419356:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000310824:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000380610:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000477203:exon_48177862_48178000:HDAC7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 8 19 27 3.69833222738332 10.2164609599646 -6.5181287325813 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0187865321423214 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49065727 T/C 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000357861:exon_49065582_49065745:C12orf41 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 55 55 110 25.4260340632603 29.5739659367397 -4.14793187347935 T:G T G 10 0.537708471577085 0.445298508253532 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49334762 G/C 1 66 72 138 30.5112408759124 38.7150099535501 -8.20376907763773 T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.172236509684656 ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49334731_49334971:ARF3;ENSG00000134287:ENST00000447318:exon_49334731_49334971:ARF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49390677 T/C 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 T:C T C 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49666815 C/T 1 505 510 1015 233.457221853572 274.231320504313 -40.7740986507413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0107567378864478 ENSG00000167553:ENST00000321665:exon_49666447_49666853:TUBA1C;ENSG00000167553:ENST00000301072:exon_49666036_49667114:TUBA1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49878411 G/A 1 27 13 40 12.4818712674187 6.99021013050211 5.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 0.111661360125155 ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49878373_49878452:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49878373_49878452:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49878372_49878452:SPATS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49952668 G/A 1 55 29 84 25.4260340632603 15.5935456757355 9.83248838752486 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0370801733933765 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49952626_49952753:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49952626_49952753:MCRS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 49960551 C/A 1 35 17 52 16.180203494802 9.14104401681045 7.03915947799158 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0523255071842428 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 50037745 G/A 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000110844:ENST00000261897:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000419405:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000380281:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000341308:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000395012:exon_50037644_50037787:PRPF40B;ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50031724_50039686:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50031724_50039686:FMNL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 162 154 316 74.8912276045122 82.8071046228711 -7.91587701835887 A:G G A 10 0.537708471577085 0.397468628679964 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:C C A 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 50189834 T/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:G T G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 30 21 51 13.8687458526875 11.2918779031188 2.57686794956867 A:G G A 10 0.537708471577085 0.486489837768018 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 40 31 71 18.4916611369166 16.6689626188896 1.82269851802696 T:C T C 10 0.537708471577085 0.721668706338363 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 52448409 C/T 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 C:G G C 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 53581376 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000139651:ENST00000416904:exon_53581285_53584654:ZNF740;ENSG00000139651:ENST00000267122:exon_53581285_53584654:ZNF740 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 14 7 21 6.47208139792081 3.76395930103959 2.70812209688122 A:G G A 10 0.537708471577085 0.278097360713847 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 A:G G A 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 53 49 102 24.5014510064145 26.3477151072772 -1.84626410086267 T:C T C 10 0.537708471577085 0.76601357387978 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 75 87 162 34.6718646317186 46.7806370272064 -12.1087723954878 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0587829102774077 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 33 36 69 15.2556204379562 19.3575049767751 -4.10188453881887 C:G C G 10 0.537708471577085 0.336099981753035 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 55368291 C/T 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C C T 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 133 120 253 61.4847732802477 64.5250165892502 -3.04024330900251 T:C T C 10 0.537708471577085 0.705689682892161 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56398454 G/C 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 C:G G C 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56435920 C/G 1 16 14 30 7.39666445476664 7.52791860207919 -0.13125414731255 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 275 222 497 127.130170316302 119.371280690113 7.75888962618875 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.499992887244282 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56531154 T/C 1 36 38 74 16.6424950232249 20.4329219199292 -3.79042689670429 T:C T C 10 0.537708471577085 0.415048086685288 ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56531002_56531157:ESYT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56718422 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000135473:ENST00000425394:exon_56718365_56718493:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000379495:exon_56718365_56718493:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000257931:exon_56718365_56718493:PAN2;ENSG00000135473:ENST00000440411:exon_56718365_56718493:PAN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56740682 C/G 1 14 25 39 6.47208139792081 13.4427117894271 -6.97063039150632 C:G C G 10 0.537708471577085 0.035460799190812 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740603_56740739:STAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 26 25 51 12.0195797389958 13.4427117894271 -1.42313205043134 A:G G A 10 0.537708471577085 0.779160209506102 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 22 10 32 10.1704136253041 5.37708471577085 4.79332890953328 T:C C T 10 0.537708471577085 0.110154772944342 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 A:T T A 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56827694 C/G 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 C:G C G 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 56865338 A/G 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000135423:ENST00000479952:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000390288:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000311966:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000424141:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000486433:exon_56864738_56865427:GLS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 4185 3809 7994 1934.6900464499 2048.13156823712 -113.441521787218 A:T:G A T 10 0.537708471577085 0.0112427356170525 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2660 2654 5314 1229.69546560495 1427.07828356558 -197.38281796063 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 5.88295884067712e-08 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 27 23 50 12.4818712674187 12.367294846273 0.114576421145749 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 57146069 T/G 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 57626582 G/A 1 153 163 316 70.730603848706 87.6464808670649 -16.9158770183589 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0624858476503172 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626487_57626626:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626487_57626626:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626487_57626626:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626487_57626626:SHMT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 57910091 C/A 1 362 313 675 167.349533289095 168.302751603628 -0.953218314532364 A:C:G C A 10 0.537708471577085 0.96921306680585 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57910028_57910120:MARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 31 30 61 14.3310373811104 16.1312541473125 -1.80021676620219 A:G A G 10 0.537708471577085 0.700664653091428 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 32 34 66 14.7933289095333 18.2820880336209 -3.48875912408761 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.391026348450609 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:T A T 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 47 25 72 21.727701835877 13.4427117894271 8.28499004644988 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.0581618552953287 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 62785663 T/C 1 35 17 52 16.180203494802 9.14104401681045 7.03915947799158 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0523255071842428 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62785596_62785666:USP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 62926398 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62926218_62926450:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62926218_62926450:MON2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 62928633 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62928625_62928706:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62928625_62928706:MON2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 64803798 A/C 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 A:C A C 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 21 13 34 9.70812209688122 6.99021013050211 2.71791196637911 A:T T A 10 0.537708471577085 0.392827901382920 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 39 28 67 18.0293696084937 15.0558372041584 2.97353240433531 A:G A G 10 0.537708471577085 0.540503172626601 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 66731864 C/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:C C A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66731781_66732003:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66731781_66732003:HELB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 160 195 355 73.9666445476664 104.853151957532 -30.8865074098652 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00114043211397573 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 68720534 A/G 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68720437_68720801:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000430606:exon_68718787_68720801:MDM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 82 98 180 37.907905330679 52.6954302145543 -14.7875248838753 A:T:C:G G A 10 0.537708471577085 0.0299954141086899 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 27 13 40 12.4818712674187 6.99021013050211 5.4916611369166 A:G A G 10 0.537708471577085 0.111661360125155 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 743 631 1374 343.482605618226 339.294045565141 4.18856005308515 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.828685200894527 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 T:G T G 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 94620432 G/T 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 T:G G T 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94620381_94620483:PLXNC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 94631496 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94631440_94631579:PLXNC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 94642023 C/T 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94642003_94642188:PLXNC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 100550947 A/T 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:T A T 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000120853:ENST00000266746:exon_100550943_100551034:GOLGA2B;ENSG00000120853:ENST00000456437:exon_100550943_100551034:GOLGA2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 100711589 A/G 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100711581_100711703:SCYL2;ENSG00000136021:ENST00000258506:exon_100711581_100711703:SCYL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102108345 T/C 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C T C 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 21 9 30 9.70812209688122 4.83937624419377 4.86874585268745 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0981514627220623 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 21 9 30 9.70812209688122 4.83937624419377 4.86874585268745 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0981514627220623 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102494849 T/C 1 51 46 97 23.5768679495687 24.7345896925459 -1.15772174297724 T:C T C 10 0.537708471577085 0.839061782134973 ENSG00000075188:ENST00000251074:exon_102494810_102494882:NUP37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102547741 G/A 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000185480:ENST00000417507:exon_102547647_102547754:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000378128:exon_102547647_102547754:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000358383:exon_102547647_102547754:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000392909:exon_102547647_102547754:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000327680:exon_102547647_102547754:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000392911:exon_102547647_102547754:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000457614:exon_102547647_102547754:C12orf48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 102558369 C/A 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:C C A 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000185480:ENST00000417507:exon_102558216_102558386:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000378128:exon_102558216_102558386:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000412715:exon_102558216_102558386:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000358383:exon_102558216_102558386:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000327680:exon_102558216_102558386:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000392911:exon_102558216_102558386:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000457614:exon_102558216_102558386:C12orf48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:G G A 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 104698186 A/G 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:G A G 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 109541374 C/G 1 41 31 72 18.9539526653395 16.6689626188896 2.28499004644988 C:G C G 10 0.537708471577085 0.637277448194929 ENSG00000076248:ENST00000242576:exon_109541238_109541416:UNG;ENSG00000076248:ENST00000336865:exon_109541238_109541416:UNG;ENSG00000076248:ENST00000446767:exon_109541238_109541416:UNG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 110 111 221 50.8520681265206 59.6856403450564 -8.83357221853579 A:T A T 10 0.537708471577085 0.251490702698977 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 16 9 25 7.39666445476664 4.83937624419377 2.55728821057287 T:G G T 10 0.537708471577085 0.324405864269745 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 16 9 25 7.39666445476664 4.83937624419377 2.55728821057287 T:C C T 10 0.537708471577085 0.324405864269745 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 110013879 G/A 1 37 36 73 17.1047865516479 19.3575049767751 -2.25271842512721 A:G G A 10 0.537708471577085 0.639420172102003 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110013803_110013950:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110013803_110013950:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110013803_110013950:MVK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 110340852 G/A 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110340832_110341019:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110340832_110341019:TCHP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 15 4 19 6.93437292634373 2.15083388630834 4.78353904003538 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0363034173949573 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 140 136 276 64.7208139792081 73.1283521344836 -8.40753815527546 A:G G A 10 0.537708471577085 0.334147686286574 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 113386841 C/T 1 2 9 11 0.92458305684583 4.83937624419377 -3.91479318734794 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0295399586643819 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 61 54 115 28.1997832337978 29.0362574651626 -0.836474231364779 C:G C G 10 0.537708471577085 0.925566200698476 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 11 26 37 5.08520681265207 13.9804202610042 -8.89521344835214 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00443936290073914 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120436408 G/A 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000135127:ENST00000397558:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000446727:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000257583:exon_120436325_120436540:CCDC64;ENSG00000135127:ENST00000357093:exon_120436325_120436540:CCDC64 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120584910 C/T 1 25 15 40 11.5572882105729 8.06562707365627 3.4916611369166 T:C C T 10 0.537708471577085 0.341538221709411 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120584856_120585076:GCN1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120589064 G/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 C:G G C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 3 12 15 1.38687458526874 6.45250165892502 -5.06562707365627 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00951268129677044 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120591143 A/G 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120591017_120591211:GCN1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 40 10 50 18.4916611369166 5.37708471577085 13.1145764211457 A:C C A 10 0.537708471577085 0.000166983338052826 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120884291 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 120907332 C/T 1 80 95 175 36.9833222738332 51.0823047998231 -14.0989825259899 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0338439518070460 ENSG00000111786:ENST00000229390:exon_120907225_120907464:SRSF9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 113 93 206 52.2389427117894 50.0068878566689 2.23205485512049 A:G A G 10 0.537708471577085 0.78014179855079 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121175678 C/T 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121175640_121175791:ACADS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 13 14 27 6.00978986949789 7.52791860207919 -1.5181287325813 A:G G A 10 0.537708471577085 0.569107461757469 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 21 15 36 9.70812209688122 8.06562707365627 1.64249502322494 T:C C T 10 0.537708471577085 0.619672042871282 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 17 8 25 7.85895598318955 4.30166777261668 3.55728821057287 C:G G C 10 0.537708471577085 0.166016390582096 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:T T A 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C T C 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121666646 A/G 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 A:G A G 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 A:G G A 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121712077 T/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:T T A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 27 27 54 12.4818712674187 14.5181287325813 -2.03625746516259 T:C C T 10 0.537708471577085 0.588096224354422 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 23 22 45 10.632705153727 11.8295863746959 -1.19688122096882 A:G G A 10 0.537708471577085 0.766042798882964 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 31 18 49 14.3310373811104 9.67875248838753 4.65228489272283 A:G G A 10 0.537708471577085 0.199203936516464 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 122326812 T/C 1 27 27 54 12.4818712674187 14.5181287325813 -2.03625746516259 T:C T C 10 0.537708471577085 0.588096224354422 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122326646_122326900:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122326646_122326900:PSMD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 50 67 117 23.1145764211457 36.0264675956647 -12.9118911745189 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.0200887723611704 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 122709236 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000184047:ENST00000464942:exon_122709192_122710397:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000342392:exon_122709192_122709295:DIABLO HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 22 25 47 10.1704136253041 13.4427117894271 -3.272298164123 C:G G C 10 0.537708471577085 0.38111269787031 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 27 21 48 12.4818712674187 11.2918779031188 1.18999336429992 T:C C T 10 0.537708471577085 0.773653377742187 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 123798209 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123798167_123798266:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123798167_123798266:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123798167_123798266:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123798167_123798266:SBNO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C C T 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 124242557 A/G 1 43 41 84 19.8785357221853 22.0460473346605 -2.16751161247514 A:G A G 10 0.537708471577085 0.662533504535434 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124242474_124244441:ATP6V0A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 124427306 T/A 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:T T A 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124427291_124427332:CCDC92 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 124856618 A/G 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 A:G A G 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 45 44 89 20.8031187790312 23.6591727493917 -2.85605397036057 A:G A G 10 0.537708471577085 0.595407559292654 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1571 1587 3158 726.259991152399 853.343344392834 -127.083353240434 A:T:C:G G C 10 0.537708471577085 6.26552912844261e-06 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125437064 C/A 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 A:C C A 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:C C T 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125587278 G/A 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125587225_125587339:AACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125609551 C/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125609448_125609570:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125609448_125609570:AACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 47 33 80 21.727701835877 17.7443795620438 3.9833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.432742304996322 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 66 54 120 30.5112408759124 29.0362574651626 1.4749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.854827667581094 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 58 41 99 26.8129086485291 22.0460473346605 4.76686131386858 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365071910563637 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 29 29 58 13.4064543242645 15.5935456757355 -2.18709135147093 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.599736300968694 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 129299446 A/G 1 23 32 55 10.632705153727 17.2066710904667 -6.57396593673968 A:G A G 10 0.537708471577085 0.079803533444548 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 T:C T C 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C T C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133220526 T/C 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:C T C 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133220423_133220563:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133220423_133220563:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133220423_133220563:POLE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133236000 C/T 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133235881_133236095:POLE;ENSG00000177084:ENST00000376577:exon_133235881_133236095:POLE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 37 54 91 17.1047865516479 29.0362574651626 -11.9314709135147 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0151652609121357 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:G G A 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 13 5 18 6.00978986949789 2.68854235788543 3.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.155917874781449 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 23 22 45 10.632705153727 11.8295863746959 -1.19688122096882 T:C T C 10 0.537708471577085 0.766042798882964 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 20224387 A/G 1 45 45 90 20.8031187790312 24.1968812209688 -3.39376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.526185333834959 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20224143_20224400:MPHOSPH8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 72 64 136 33.2849900464499 34.4133421809334 -1.12835213448356 A:T T A 10 0.537708471577085 0.86374796437392 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 20411701 C/T 1 17 13 30 7.85895598318955 6.99021013050211 0.868745852687449 T:C C T 10 0.537708471577085 0.8553876844794 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 20413021 T/C 1 13 3 16 6.00978986949789 1.61312541473126 4.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0415548831545558 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 A:C C A 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 20425948 T/C 1 20 8 28 9.2458305684583 4.30166777261668 4.94416279584162 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0862855602223982 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 23905418 T/C 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 T:C T C 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 23906327 C/T 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 23907194 G/T 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 T:G G T 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 23908034 A/G 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G A G 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 24243200 T/C 0 10 0 10 4.62291528422915 0 4.62291528422915 T T 10 0.537708471577085 0.00246636601179183 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 24436475 C/T 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24436441_24436501:MIPEP;ENSG00000027001:ENST00000494139:exon_24436441_24436501:MIPEP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25009532 T/C 1 34 27 61 15.7179119663791 14.5181287325813 1.19978323379781 T:C T C 10 0.537708471577085 0.798316714163481 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 18 20 38 8.32124751161247 10.7541694315417 -2.43292191992923 T:C C T 10 0.537708471577085 0.5157847888304 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25049676 G/A 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:G G A 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25049610_25049734:PARP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 8 16 24 3.69833222738332 8.60333554523336 -4.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0633340746147884 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25479714 G/A 1 19 26 45 8.78353904003538 13.9804202610042 -5.19688122096883 A:G G A 10 0.537708471577085 0.135519962163080 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25480616 T/A 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:T T A 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 25831943 G/A 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25831874_25831983:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25831874_25831983:MTMR6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 52 49 101 24.0391594779916 26.3477151072772 -2.30855562928559 A:G A G 10 0.537708471577085 0.690123979139918 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 251 252 503 116.035173634152 135.502534837425 -19.4673612032738 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0891854741613174 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 196 163 359 90.6091395708913 87.6464808670649 2.96265870382649 T:C C T 10 0.537708471577085 0.791333431556595 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 31036642 C/G 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 C:G C G 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 31231806 T/C 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 31233063 G/A 1 26 29 55 12.0195797389958 15.5935456757355 -3.57396593673968 A:G G A 10 0.537708471577085 0.346724666909935 ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 31725260 A/G 1 43 29 72 19.8785357221853 15.5935456757355 4.28499004644988 A:G A G 10 0.537708471577085 0.345243211585805 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31725084_31725328:HSPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 31729729 A/G 1 12 29 41 5.54749834107498 15.5935456757355 -10.0460473346605 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00246499861501347 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 30 50 80 13.8687458526875 26.8854235788543 -13.0166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0047454474805697 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 82 70 152 37.907905330679 37.6395930103959 0.26831232028308 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 28 35 63 12.9441627958416 18.819796505198 -5.87563370935635 C:G G C 10 0.537708471577085 0.164214827078403 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 31 37 68 14.3310373811104 19.8952134483521 -5.56417606724178 A:G A G 10 0.537708471577085 0.182826423786482 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 15 15 30 6.93437292634373 8.06562707365627 -1.13125414731255 A:G A G 10 0.537708471577085 0.716866773759721 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 A:C A C 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 T:C T C 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 41303685 G/A 1 188 172 360 86.910807343508 92.4858571112586 -5.57504976775061 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561359354546109 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41303432_41303737:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41303440_41303737:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41303510_41303737:MRPS31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 41835039 T/C 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 42876103 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 43148565 T/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C T C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43148289_43148658:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43148291_43148658:TNFSF11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 43174896 A/G 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43174888_43174933:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43174888_43174933:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43174888_43174933:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43174888_43174933:TNFSF11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 75 70 145 34.6718646317186 37.6395930103959 -2.96772837867732 A:T A T 10 0.537708471577085 0.618640074617083 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 55 26 81 25.4260340632603 13.9804202610042 11.4456138022561 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0137206768182903 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 C:G G C 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 71 66 137 32.822698518027 35.4887591240876 -2.66606060606065 A:G G A 10 0.537708471577085 0.668918688979278 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 46067593 G/A 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46067482_46067621:COG3;ENSG00000136152:ENST00000465942:exon_46067482_46067621:COG3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 46099171 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46099111_46099186:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46099111_46099186:COG3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 50296115 C/T 1 23 15 38 10.632705153727 8.06562707365627 2.56707808007077 T:C C T 10 0.537708471577085 0.421548678665716 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50296091_50296260:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50296091_50296260:KPNA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 52313195 C/T 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C C T 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52313185_52313311:WDFY2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 52365354 G/T 1 2 14 16 0.92458305684583 7.52791860207919 -6.60333554523336 T:G G T 10 0.537708471577085 0.00151244974005012 ENSG00000102796:ENST00000444610:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000218981:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000280056:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000490949:exon_52365301_52365393:DHRS12;ENSG00000102796:ENST00000497151:exon_52365301_52365393:DHRS12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 52709938 A/C 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:C A C 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000136098:ENST00000400357:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000378101:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000339406:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000258597:exon_52709865_52709999:NEK3;ENSG00000136098:ENST00000452082:exon_52709865_52709999:NEK3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 47 33 80 21.727701835877 17.7443795620438 3.9833222738332 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.432742304996322 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 42 41 83 19.4162441937624 22.0460473346605 -2.62980314089805 T:C C T 10 0.537708471577085 0.583339218622975 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 30 22 52 13.8687458526875 11.8295863746959 2.03915947799158 T:C T C 10 0.537708471577085 0.581989908197437 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 75861001 A/G 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75858808_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75858809_75861161:TBC1D4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 75876389 G/A 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 A:G G A 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75876379_75876537:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000478591:exon_75876379_75876537:TBC1D4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 1 11 3 14 5.08520681265207 1.61312541473126 3.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.104463576674659 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 76375006 G/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 C:G G C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000533305:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000534657:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465309:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76374820_76375018:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000497947:exon_76374820_76375018:LMO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 76427347 C/A 1 16 18 34 7.39666445476664 9.67875248838753 -2.28208803362089 A:C C A 10 0.537708471577085 0.492929469502856 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 76427410 C/G 1 17 24 41 7.85895598318955 12.90500331785 -5.04604733466049 C:G C G 10 0.537708471577085 0.119813029406086 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 24 13 37 11.09499668215 6.99021013050211 4.10478655164785 A:G A G 10 0.537708471577085 0.190516678636346 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 77651289 C/T 1 27 20 47 12.4818712674187 10.7541694315417 1.727701835877 T:C C T 10 0.537708471577085 0.662505380376758 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77651283_77651522:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77651283_77651522:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77651283_77651522:MYCBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 T:C T C 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 95696540 C/T 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:C:G C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95696520_95696692:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95696520_95696692:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000484109:exon_95696520_95696583:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000471041:exon_95696520_95696692:ABCC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 95839003 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95838955_95839146:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95838955_95839146:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95838955_95839146:ABCC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 95859035 C/A 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 C C 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 98642778 C/T 1 53 48 101 24.5014510064145 25.8100066357001 -1.30855562928559 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.842008069598214 ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98642687_98642791:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98642687_98642791:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98642687_98642791:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98642687_98642791:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98642687_98642791:IPO5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 133 109 242 61.4847732802477 58.6102234019023 2.87454987834543 A:G A G 10 0.537708471577085 0.747329569641662 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 100518580 A/G 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G A G 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000125246:ENST00000376360:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376355:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000444838:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000323941:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376354:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000339105:exon_100518494_100518661:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000419700:exon_100518571_100518661:CLYBL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 24 9 33 11.09499668215 4.83937624419377 6.25562043795619 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0351251030299587 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 83 74 157 38.3701968591019 39.7904268967043 -1.42023003760234 A:G A G 10 0.537708471577085 0.872890530602957 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 103492092 G/A 1 16 14 30 7.39666445476664 7.52791860207919 -0.13125414731255 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000134897:ENST00000257336:exon_103491922_103493881:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000448849:exon_103491901_103492215:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000419638:exon_103491922_103492168:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000418659:exon_103491922_103492240:BIVM;ENSG00000134897:ENST00000490317:exon_103491922_103492513:BIVM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 T:C T C 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 111176316 T/C 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C T C 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 76 104 180 35.1341561601415 55.9216810440168 -20.7875248838753 T:G T G 10 0.537708471577085 0.00211295761484462 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 111298323 C/T 1 26 20 46 12.0195797389958 10.7541694315417 1.26541030745409 T:C C T 10 0.537708471577085 0.768532865779989 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 33 29 62 15.2556204379562 15.5935456757355 -0.33792523777927 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 26 36 62 12.0195797389958 19.3575049767751 -7.33792523777927 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0739600957869698 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 111938511 T/C 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000478679:exon_111938494_111938587:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491688:exon_111938494_111938583:ARHGEF7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114150302 C/T 1 5 12 17 2.31145764211457 6.45250165892502 -4.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0522275164214068 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114150186_114150340:TMCO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 T:C C T 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114265331 C/T 1 16 26 42 7.39666445476664 13.9804202610042 -6.58375580623757 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0448382085968295 ENSG00000198176:ENST00000475254:exon_114265311_114265377:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114265311_114265377:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000465174:exon_114265311_114265377:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000408980:exon_114265311_114265377:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000453989:exon_114265311_114265377:TFDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 A:G G A 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20779835 T/C 1 215 261 476 99.3926786109267 140.341911081619 -40.9492324706925 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.000190578019735305 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20779529_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20779530_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20779571_20779911:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20779588_20779911:CCNB1IP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20823095 G/A 1 33 25 58 15.2556204379562 13.4427117894271 1.81290864852907 A:G G A 10 0.537708471577085 0.693662251193551 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 71 71 142 32.822698518027 38.177301481973 -5.35460296394608 A:C A C 10 0.537708471577085 0.40019076218809 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 19 26 45 8.78353904003538 13.9804202610042 -5.19688122096883 C:G G C 10 0.537708471577085 0.135519962163080 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C C T 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 275 303 578 127.130170316302 162.925666887857 -35.7954965715551 T:C:G T G 10 0.537708471577085 0.00303463453428729 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 20926699 A/G 1 34 45 79 15.7179119663791 24.1968812209688 -8.47896925458972 A:G A G 10 0.537708471577085 0.070347718921213 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20926012_20926861:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20926017_20926861:TMEM55B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 21829129 C/G 1 68 40 108 31.4358239327582 21.5083388630834 9.92748506967482 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0662460568480463 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 21831052 T/C 1 52 64 116 24.0391594779916 34.4133421809334 -10.3741827029419 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0621721248359815 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 18 9 27 8.32124751161247 4.83937624419377 3.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246443676672332 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 20 2 22 9.2458305684583 1.07541694315417 8.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.000342395746160382 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 19 0 19 8.78353904003538 0 8.78353904003538 A A 10 0.537708471577085 8.02253805923196e-06 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 20 0 20 9.2458305684583 0 9.2458305684583 T T 10 0.537708471577085 4.28136229728645e-06 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 79 81 160 36.5210307454103 43.5543861977439 -7.0333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.268139804951284 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 460 501 961 212.654103074541 269.39194426012 -56.7378411855787 T:G G T 10 0.537708471577085 0.000253847672757404 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23236524 C/T 1 66 49 115 30.5112408759124 26.3477151072772 4.16352576863522 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.455579188485062 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 51 53 104 23.5768679495687 28.4985489935855 -4.92168104401684 T:C T C 10 0.537708471577085 0.376234686656263 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23282152 G/A 1 14 6 20 6.47208139792081 3.22625082946251 3.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.180236988291815 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23282109_23282416:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 93 76 169 42.9931121433311 40.8658438398585 2.12726830347263 A:T:G G T 10 0.537708471577085 0.758216708446703 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 31 49 80 14.3310373811104 26.3477151072772 -12.0166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00947208573917374 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 80 50 130 36.9833222738332 26.8854235788543 10.0978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0788936365297976 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23745723 G/A 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 47 48 95 21.727701835877 25.8100066357001 -4.08230479982308 A:C C A 10 0.537708471577085 0.412050759971059 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24026493 A/G 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G A G 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24422995 T/G 1 17 4 21 7.85895598318955 2.15083388630834 5.70812209688121 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0146240755275989 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24423007 G/A 1 20 4 24 9.2458305684583 2.15083388630834 7.09499668214996 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00352792409502426 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24423074 G/A 1 25 6 31 11.5572882105729 3.22625082946251 8.33103738111036 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00324844872445358 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 27 9 36 12.4818712674187 4.83937624419377 7.64249502322494 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0115621649460074 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 1 5 11 16 2.31145764211457 5.91479318734793 -3.60333554523336 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0820210724393271 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:T A T 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24459407 G/A 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 A:G G A 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 982 1042 2024 453.970280911302 560.292227383323 -106.32194647202 T:C T C 10 0.537708471577085 2.25536792684289e-06 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24620810 G/C 1 18 14 32 8.32124751161247 7.52791860207919 0.79332890953328 C:G G C 10 0.537708471577085 0.860157369191954 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24620694_24620879:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24620694_24620879:RNF31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 25 28 53 11.5572882105729 15.0558372041584 -3.4985489935855 T:C T C 10 0.537708471577085 0.339073723053378 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24653965 C/T 1 18 11 29 8.32124751161247 5.91479318734793 2.40645432426453 T:C C T 10 0.537708471577085 0.457421609041791 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 T:C T C 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24659755 G/C 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 C:G G C 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24659586_24659859:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24659637_24659859:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24659586_24659797:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24659586_24659859:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24659248_24659859:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24659586_24659859:RP11-468E2.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 193 170 363 89.2222649856226 91.4104401681045 -2.18817518248187 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.833346043315102 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 37 39 76 17.1047865516479 20.9706303915063 -3.86584383985846 A:G G A 10 0.537708471577085 0.420985198335618 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 27 21 48 12.4818712674187 11.2918779031188 1.18999336429992 T:C T C 10 0.537708471577085 0.773653377742187 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 33 27 60 15.2556204379562 14.5181287325813 0.737491705374898 T:C C T 10 0.537708471577085 0.897432780594124 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24771285 G/A 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24773387 T/C 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24774338 G/A 0 25 0 25 11.5572882105729 0 11.5572882105729 G G 10 0.537708471577085 3.09742540939353e-07 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24774144_24778330:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24774144_24774422:C14orf21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 13 4 17 6.00978986949789 2.15083388630834 3.85895598318955 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0863743251363987 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 24909979 C/T 1 45 56 101 20.8031187790312 30.1116744083168 -9.30855562928559 T:C C T 10 0.537708471577085 0.072146172649248 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 16 12 28 7.39666445476664 6.45250165892502 0.94416279584162 A:G A G 10 0.537708471577085 0.850213996975682 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31204838 A/G 1 85 105 190 39.2947799159478 56.4593895155939 -17.1646095996462 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0133009370072011 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31204792_31205017:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31204792_31205017:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31204792_31205018:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31204792_31205001:SCFD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 0 0 19 19 0 10.2164609599646 -10.2164609599646 G C G 10 0.537708471577085 4.2993496363111e-07 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 1 25 26 0.462291528422915 13.4427117894271 -12.9804202610042 A:T A T 10 0.537708471577085 6.06103957106084e-08 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31582526 T/C 1 14 20 34 6.47208139792081 10.7541694315417 -4.28208803362089 T:C T C 10 0.537708471577085 0.168954691239917 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31582483_31582690:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31582483_31582690:HECTD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31583512 C/T 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583492_31583546:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583492_31583546:HECTD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31590599 A/G 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G A G 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31590589_31590711:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31590589_31590711:HECTD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 31647448 G/A 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 29 29 58 13.4064543242645 15.5935456757355 -2.18709135147093 T:C C T 10 0.537708471577085 0.599736300968694 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 30 22 52 13.8687458526875 11.8295863746959 2.03915947799158 A:G G A 10 0.537708471577085 0.581989908197437 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 35270335 T/C 1 67 16 83 30.9735324043353 8.60333554523336 22.3701968591019 T:C T C 10 0.537708471577085 3.96794760777649e-07 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35270300_35270399:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35270300_35270399:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35270300_35270399:BAZ1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 21 40 61 9.70812209688122 21.5083388630834 -11.8002167662022 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00289660044919445 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 28 20 48 12.9441627958416 10.7541694315417 2.18999336429992 C:G C G 10 0.537708471577085 0.564955928597578 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 50272841 G/T 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50272739_50272851:SDCCAG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 68 64 132 31.4358239327582 34.4133421809334 -2.97751824817522 T:C C T 10 0.537708471577085 0.601948887088039 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 51225097 T/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 28 44 72 12.9441627958416 23.6591727493917 -10.7150099535501 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0127830954148048 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 22 39 61 10.1704136253041 20.9706303915063 -10.8002167662022 T:G T G 10 0.537708471577085 0.00663445922842358 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 41 46 87 18.9539526653395 24.7345896925459 -5.7806370272064 A:G G A 10 0.537708471577085 0.237174033018065 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55529860 A/G 1 49 45 94 22.6522848927228 24.1968812209688 -1.54459632824599 A:G A G 10 0.537708471577085 0.757389766695096 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55529336_55530043:MAPK1IP1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 20 9 29 9.2458305684583 4.83937624419377 4.40645432426453 A:C C A 10 0.537708471577085 0.135176969911159 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 24 34 58 11.09499668215 18.2820880336209 -7.18709135147093 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0652530117329914 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55611839 A/T 1 362 289 651 167.349533289095 155.397748285778 11.9517850033177 A:T:C:G A T 10 0.537708471577085 0.366005344353796 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55611834_55612147:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55611834_55612126:LGALS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 73 71 144 33.7472815748728 38.177301481973 -4.43001990710025 A:G A G 10 0.537708471577085 0.503910795017805 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 36 44 80 16.6424950232249 23.6591727493917 -7.0166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.118004500565558 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 41 70 111 18.9539526653395 37.6395930103959 -18.6856403450564 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000398822460590475 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55817708 T/C 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55818403 T/C 1 11 12 23 5.08520681265207 6.45250165892502 -1.36729484627296 T:C T C 10 0.537708471577085 0.676984403272827 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 10 19 29 4.62291528422915 10.2164609599646 -5.59354567573547 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0411330412826733 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 56096731 A/G 1 38 43 81 17.5670780800708 23.1214642778147 -5.55438619774389 A:G A G 10 0.537708471577085 0.222143906598264 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 56146357 G/A 1 68 63 131 31.4358239327582 33.8756337093564 -2.43980977659814 A:G G A 10 0.537708471577085 0.726125666874584 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 17 12 29 7.85895598318955 6.45250165892502 1.40645432426453 A:G A G 10 0.537708471577085 0.710583412304497 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 T:C T C 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 59951278 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59951161_59951311:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59951244_59951311:JKAMP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 63881929 G/T 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 T:G G T 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000154001:ENST00000337537:exon_63881858_63881950:PPP2R5E;ENSG00000154001:ENST00000422769:exon_63881858_63881950:PPP2R5E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 64604634 T/C 1 1 8 9 0.462291528422915 4.30166777261668 -3.83937624419377 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0148173128089584 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64604505_64604701:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64604505_64604701:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64604505_64604701:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64604505_64604701:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64604505_64604701:SYNE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 64636978 C/T 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 T:C C T 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 10 16 26 4.62291528422915 8.60333554523336 -3.98042026100421 A:C C A 10 0.537708471577085 0.167367402399651 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 40 57 97 18.4916611369166 30.6493828798938 -12.1577217429772 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0144022787542043 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 105 100 205 48.5406104844061 53.7708471577085 -5.23023667330243 A:G G A 10 0.537708471577085 0.483991992050276 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 64916165 C/T 1 121 121 242 55.9372749391727 65.0627250608273 -9.12545012165457 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246321299359208 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64916163_64916340:MTHFD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 65550866 A/T 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:T A T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000125952:ENST00000246163:exon_65550462_65551017:MAX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 68159269 C/T 1 43 55 98 19.8785357221853 29.5739659367397 -9.69543021455433 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0541817141540706 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68159155_68159310:RDH11;ENSG00000072042:ENST00000428130:exon_68159155_68159310:RDH11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 69349196 G/A 1 9 1 10 4.16062375580623 0.537708471577085 3.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0250233828426948 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69349175_69349309:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69349175_69349309:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69349175_69349309:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69349175_69349309:ACTN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 71199452 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 12 16 28 5.54749834107498 8.60333554523336 -3.05583720415838 A:C A C 10 0.537708471577085 0.261133649980021 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 72117156 T/C 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72117052_72117226:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72117052_72117226:SIPA1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73404680 A/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:C A C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73404679_73404778:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73404679_73404778:DCAF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73406582 T/G 1 3 12 15 1.38687458526874 6.45250165892502 -5.06562707365627 T:G T G 10 0.537708471577085 0.00951268129677044 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514191:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000505361:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000510612:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000508412:exon_73406510_73406610:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000514486:exon_73406510_73406610:DCAF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73425364 C/T 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 T:C C T 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73490752 G/A 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73581011 A/G 1 84 65 149 38.8324883875249 34.9510506525105 3.88143773501434 A:G A G 10 0.537708471577085 0.565487331767946 ENSG00000119707:ENST00000261973:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527432:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532683:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000528081:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532483:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527449:exon_73580994_73581041:RBM25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73743367 A/G 1 37 46 83 17.1047865516479 24.7345896925459 -7.62980314089805 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0992112712306053 ENSG00000133961:ENST00000355058:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000359560:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000454166:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000356296:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000326018:exon_73741918_73744001:NUMB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 17 18 35 7.85895598318955 9.67875248838753 -1.81979650519798 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.612142448554809 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74062370 G/A 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 23 33 56 10.632705153727 17.7443795620438 -7.11167440831676 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0610995928051449 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 25 28 53 11.5572882105729 15.0558372041584 -3.4985489935855 A:G G A 10 0.537708471577085 0.339073723053378 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74754936 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74754910_74754962:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74754910_74754962:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481348:exon_74754910_74754962:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74754910_74754962:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74754910_74754962:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000484380:exon_74754910_74755136:ABCD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74757019 C/T 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74756994_74757202:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74756994_74757202:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481348:exon_74756994_74757155:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74756994_74757202:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74756994_74757202:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74756994_74757202:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000466822:exon_74756994_74757202:ABCD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74759529 G/A 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 74764675 G/A 1 2 9 11 0.92458305684583 4.83937624419377 -3.91479318734794 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0295399586643819 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74764633_74764772:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74764633_74764772:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74764633_74764772:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74764633_74764772:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000489678:exon_74763036_74764772:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000470637:exon_74764342_74764772:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000477803:exon_74764539_74764772:ABCD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 A:G A G 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 30 14 44 13.8687458526875 7.52791860207919 6.34082725060826 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0687118300982753 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 78028803 A/G 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 A:G A G 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_78028739_78028832:SPTLC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 53 56 109 24.5014510064145 30.1116744083168 -5.61022340190226 T:C C T 10 0.537708471577085 0.291826817864856 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 20 42 62 9.2458305684583 22.5837558062376 -13.3379252377793 A:C A C 10 0.537708471577085 0.000805763938269446 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 90263622 C/G 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 C:G C G 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90261313_90263668:C14orf143 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 90754926 A/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:C A C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90754561_90755489:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90754561_90755489:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90754561_90755489:C14orf102 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 28 24 52 12.9441627958416 12.90500331785 0.0391594779915803 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 T:C C T 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 92465664 A/G 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 A:G A G 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92465584_92465777:TRIP11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 93119232 G/C 1 19 20 39 8.78353904003538 10.7541694315417 -1.97063039150632 C:G G C 10 0.537708471577085 0.526390639453036 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 180 225 405 83.2124751161247 120.984406104844 -37.7719309887194 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000180363756733266 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 115 91 206 53.1635257686352 48.9314709135147 4.23205485512049 T:C T C 10 0.537708471577085 0.576618335685041 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 94563265 C/T 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 T:C C T 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000165948:ENST00000298901:exon_94563233_94563311:IFI27L1;ENSG00000165948:ENST00000393115:exon_94563187_94563311:IFI27L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 284 176 460 131.290794072108 94.636690997567 36.6541030745409 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.000628035040312505 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 102323093 T/C 1 47 31 78 21.727701835877 16.6689626188896 5.05873921698737 T:C T C 10 0.537708471577085 0.258631808391851 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000445439:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000422945:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102323023_102323222:PPP2R5C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 102508056 C/A 1 16 36 52 7.39666445476664 19.3575049767751 -11.9608405220084 A:C C A 10 0.537708471577085 0.00116428959556635 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 102807671 C/T 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 102808273 C/A 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 A:C C A 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 102909991 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102909984_102910164:TECPR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 103600063 C/G 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 C:G C G 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103600019_103600140:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103600019_103600140:TNFAIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 18 19 37 8.32124751161247 10.2164609599646 -1.89521344835215 T:C C T 10 0.537708471577085 0.621575328997597 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 105239894 C/T 1 34 39 73 15.7179119663791 20.9706303915063 -5.25271842512721 T:C C T 10 0.537708471577085 0.240948447045624 ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105239792_105239917:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105239792_105239917:AKT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 105643046 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000183828:ENST00000339418:exon_105642871_105643108:NUDT14;ENSG00000183828:ENST00000392568:exon_105642871_105643108:NUDT14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 105688082 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000185024:ENST00000327359:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000379937:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000446501:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000392557:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000440513:exon_105687985_105688251:BRF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106091329 G/C 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 G G 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106110137 C/T 1 17 1 18 7.85895598318955 0.537708471577085 7.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000445542644274459 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106110914 G/T 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 T:G G T 10 0.537708471577085 0.194255499810311 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106110966 C/T 1 2 11 13 0.92458305684583 5.91479318734793 -4.9902101305021 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00918308794289172 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 131 126 257 60.5601902234019 67.7512674187127 -7.19107719531085 C:G C G 10 0.537708471577085 0.381470333312336 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106306841 C/T 1 446 195 641 206.18202167662 104.853151957532 101.328869719089 T:C C T 10 0.537708471577085 3.71711912538596e-16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106330079 T/C 1 9 1 10 4.16062375580623 0.537708471577085 3.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0250233828426948 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106494269 T/C 0 0 112 112 0 60.2233488166335 -60.2233488166335 C T C 10 0.537708471577085 2.95518530357244e-38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106518848 T/C 1 2 53 55 0.92458305684583 28.4985489935855 -27.5739659367397 T:C T C 10 0.537708471577085 7.71236488463965e-16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 24 14 38 11.09499668215 7.52791860207919 3.56707808007077 A:G G A 10 0.537708471577085 0.259667359629290 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 29561291 C/T 1 53 44 97 24.5014510064145 23.6591727493917 0.842278257022755 T:C C T 10 0.537708471577085 0.919027620049331 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 29561811 C/G 1 10 2 12 4.62291528422915 1.07541694315417 3.54749834107498 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0450438793507606 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 29561840 T/C 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 29561866 G/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 31229420 T/C 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31229322_31229462:FAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 31234064 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000198690:ENST00000362065:exon_31233769_31235308:FAN1;ENSG00000166912:ENST00000435680:exon_31231144_31234275:MTMR10;ENSG00000166912:ENST00000425768:exon_31231144_31234275:MTMR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 34393927 C/T 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C C T 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000134153:ENST00000256545:exon_34393805_34394149:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000527822:exon_34393805_34394008:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000532113:exon_34393805_34394028:C15orf24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40308859 G/T 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40308703_40308873:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40308703_40308873:EIF2AK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 14 10 24 6.47208139792081 5.37708471577085 1.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.687878182736171 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 57 39 96 26.3506171201062 20.9706303915063 5.37998672859984 A:G A G 10 0.537708471577085 0.306241159864395 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 62 42 104 28.6620747622207 22.5837558062376 6.07831895598316 A:G G A 10 0.537708471577085 0.239595699402289 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 227 224 451 104.940176952002 120.446697633267 -15.5065206812653 T:G T G 10 0.537708471577085 0.143549836081807 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40462780 G/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40462738_40462831:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40462738_40462882:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40462738_40462882:BUB1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40582964 C/T 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40582962_40583038:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40582962_40583038:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40582962_40583038:PLCB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40675443 G/T 1 9 16 25 4.16062375580623 8.60333554523336 -4.44271178942713 T:G G T 10 0.537708471577085 0.106767385755251 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40675493 C/T 1 14 16 30 6.47208139792081 8.60333554523336 -2.13125414731255 T:C C T 10 0.537708471577085 0.467885000124991 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40683702 A/G 1 30 33 63 13.8687458526875 17.7443795620438 -3.87563370935635 A:G A G 10 0.537708471577085 0.376736108840903 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40683694_40683755:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40683694_40683755:C15orf23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 20 9 29 9.2458305684583 4.83937624419377 4.40645432426453 T:C C T 10 0.537708471577085 0.135176969911159 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40917393 A/G 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:G A G 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 40993318 T/C 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 T:C T C 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000051180:ENST00000527860:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000423169:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000267868:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000382642:exon_40993262_40993403:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000435604:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000450111:exon_40993262_40993373:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000532743:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000382643:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000525066:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000526763:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000531277:exon_40993262_40993399:RAD51 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41059544 G/A 1 42 57 99 19.4162441937624 30.6493828798938 -11.2331386861314 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0263498712203017 ENSG00000137880:ENST00000260447:exon_41059424_41060084:GCHFR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41067242 C/T 1 10 24 34 4.62291528422915 12.90500331785 -8.28208803362089 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00533055016921517 ENSG00000104129:ENST00000220496:exon_41067229_41067306:DNAJC17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41146880 T/C 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146837_41146887:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146837_41146887:SPINT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41148199 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 C:G G C 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41186990 C/T 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C C T 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000104142:ENST00000220509:exon_41186627_41187057:VPS18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 57 18 75 26.3506171201062 9.67875248838753 16.6718646317186 A:G A G 10 0.537708471577085 0.000104181883430069 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 57 18 75 26.3506171201062 9.67875248838753 16.6718646317186 A:C C A 10 0.537708471577085 0.000104181883430069 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41688732 C/T 1 37 42 79 17.1047865516479 22.5837558062376 -5.47896925458971 T:C C T 10 0.537708471577085 0.259048891730449 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41827757 T/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:T T A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41827710_41827830:RPAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 41829230 A/G 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41829143_41829399:RPAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 42041712 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000174197:ENST00000389936:exon_42041309_42042813:MGA;ENSG00000174197:ENST00000219905:exon_42041309_42042813:MGA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 42211484 C/G 1 39 22 61 18.0293696084937 11.8295863746959 6.19978323379781 C:G C G 10 0.537708471577085 0.123821720626835 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 27 23 50 12.4818712674187 12.367294846273 0.114576421145749 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 42570718 A/G 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000214013:ENST00000440615:exon_42570680_42570788:GANC;ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42570680_42570788:GANC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 42579948 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42579889_42580016:GANC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 51 73 124 23.5768679495687 39.2527184251272 -15.6758504755585 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00514065060619261 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 43023162 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023123_43023269:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023123_43023269:CDAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 17 7 24 7.85895598318955 3.76395930103959 4.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.104346466966581 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 43712639 G/A 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 A:G G A 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43712503_43712933:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43712503_43712933:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43712503_43712933:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43712503_43712933:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43712503_43712933:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43712503_43712933:TP53BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 43720253 A/G 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 A:G A G 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000417342:exon_43720214_43720366:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000467474:exon_43720214_43720314:TP53BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 44094013 T/G 1 136 154 290 62.8716478655164 82.8071046228711 -19.9354567573547 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0214807168819006 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 44912566 A/G 1 7 13 20 3.23604069896041 6.99021013050211 -3.7541694315417 A:G A G 10 0.537708471577085 0.116331864298699 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44912388_44912601:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44912388_44912601:SPG11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 23 17 40 10.632705153727 9.14104401681045 1.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 0.751626194880296 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45047402 A/G 1 21 27 48 9.70812209688122 14.5181287325813 -4.81000663570008 A:G A G 10 0.537708471577085 0.192673208197216 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 25 18 43 11.5572882105729 9.67875248838753 1.87853572218534 T:C C T 10 0.537708471577085 0.647261718349993 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45050956 T/A 1 19 14 33 8.78353904003538 7.52791860207919 1.25562043795619 A:T T A 10 0.537708471577085 0.728806662291829 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45050819_45051052:TRIM69;ENSG00000185880:ENST00000338264:exon_45050819_45051052:TRIM69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45059681 G/A 1 74 74 148 34.2095731032957 39.7904268967043 -5.58085379340858 A:G G A 10 0.537708471577085 0.365565511207642 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45059429_45060025:TRIM69;ENSG00000185880:ENST00000338264:exon_45059429_45060023:TRIM69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 A:T A T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 68 81 149 31.4358239327582 43.5543861977439 -12.1185622649857 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0487361596014097 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 104 100 204 48.0783189559832 53.7708471577085 -5.69252820172535 A:T T A 10 0.537708471577085 0.440322595654305 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 3 13 16 1.38687458526874 6.99021013050211 -5.60333554523336 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00534718881018855 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 49325289 A/C 0 9 0 9 4.16062375580623 0 4.16062375580623 A A 10 0.537708471577085 0.00472206769488212 ENSG00000138593:ENST00000261847:exon_49325162_49325297:SECISBP2L;ENSG00000138593:ENST00000380927:exon_49325162_49325297:SECISBP2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 15 18 33 6.93437292634373 9.67875248838753 -2.74437956204381 T:C T C 10 0.537708471577085 0.384513776129931 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 51041909 C/T 1 5 13 18 2.31145764211457 6.99021013050211 -4.67875248838753 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0327312480155932 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_51041833_51041943:AC012100.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 52402002 G/C 1 19 7 26 8.78353904003538 3.76395930103959 5.01957973899579 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0510246179623695 ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52401460_52402170:BCL2L10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 20 13 33 9.2458305684583 6.99021013050211 2.25562043795619 A:G A G 10 0.537708471577085 0.487582164437403 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 172 177 349 79.5141428887414 95.174399469144 -15.6602565804027 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0961606486572166 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 90 106 196 41.6062375580623 56.997097987171 -15.3908604291087 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.0313996476472004 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 91 52 143 42.0685290864853 27.9608405220084 14.1076885644768 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0187666335989877 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 25 15 40 11.5572882105729 8.06562707365627 3.4916611369166 A:G A G 10 0.537708471577085 0.341538221709411 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 5 12 17 2.31145764211457 6.45250165892502 -4.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0522275164214068 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59175965 A/G 1 84 90 174 38.8324883875249 48.3937624419377 -9.56127405441279 A:G A G 10 0.537708471577085 0.149238921555729 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59175825_59175985:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59175825_59175985:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59175825_59175985:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000493062:exon_59175825_59175985:SLTM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59179264 G/A 1 79 94 173 36.5210307454103 50.544596328246 -14.0235655828357 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0329681535251343 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59179174_59179318:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59179174_59179318:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59179174_59179318:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000493062:exon_59179174_59179323:SLTM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59408918 A/G 1 116 92 208 53.6258172970581 49.4691793850918 4.15663791196632 A:G A G 10 0.537708471577085 0.578640700203802 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59409495 G/A 1 121 114 235 55.9372749391727 61.2987657597877 -5.36149082061497 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.51311191689511 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59429565 G/C 1 93 82 175 42.9931121433311 44.092094669321 -1.09898252598988 A:C:G G C 10 0.537708471577085 0.879724086876204 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59428169_59429655:MYO1E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59455376 T/C 1 55 46 101 25.4260340632603 24.7345896925459 0.691444370714414 T:C T C 10 0.537708471577085 0.92076449011973 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59455356_59455502:MYO1E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 13 16 29 6.00978986949789 8.60333554523336 -2.59354567573547 A:G A G 10 0.537708471577085 0.356737441054378 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 59 59 118 27.275200176952 31.724799823048 -4.44959964609603 T:G T G 10 0.537708471577085 0.460315218684418 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 60734697 A/G 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60734615_60734744:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60734615_60734744:NARG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 62202482 C/T 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62202376_62202504:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62202376_62202504:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62202376_62202504:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62202376_62202504:VPS13C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 119 106 225 55.0126918823269 56.997097987171 -1.98440610484413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.789629024503694 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 63555809 G/A 1 21 26 47 9.70812209688122 13.9804202610042 -4.272298164123 A:G G A 10 0.537708471577085 0.242447065533164 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63555726_63559981:RAB8B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 63866584 C/A 1 17 12 29 7.85895598318955 6.45250165892502 1.40645432426453 A:C C A 10 0.537708471577085 0.710583412304497 ENSG00000140455:ENST00000380324:exon_63866522_63866602:USP3;ENSG00000140455:ENST00000268049:exon_63866522_63866602:USP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 63941948 A/G 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 A:G A G 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63941924_63942124:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63941924_63942124:HERC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 64385851 T/C 1 152 153 305 70.2683123202831 82.269396151294 -12.0010838310109 T:C T C 10 0.537708471577085 0.168706049962894 ENSG00000166797:ENST00000300030:exon_64385844_64386217:FAM96A;ENSG00000166797:ENST00000380290:exon_64385844_64386207:FAM96A;ENSG00000166797:ENST00000419657:exon_64385844_64386007:FAM96A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 64592522 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000169118:ENST00000303052:exon_64592518_64592922:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000447727:exon_64592518_64592922:CSNK1G1;ENSG00000169118:ENST00000303032:exon_64592518_64592922:CSNK1G1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 64962630 A/C 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:C A C 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 64967654 C/T 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 21 19 40 9.70812209688122 10.2164609599646 -0.5083388630834 T:C T C 10 0.537708471577085 0.87553259952279 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 65108795 C/T 1 18 17 35 8.32124751161247 9.14104401681045 -0.819796505197976 T:C C T 10 0.537708471577085 0.86585821201555 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65108773_65108964:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65108773_65108964:PIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 65114484 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 65153690 G/A 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G G A 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000249240:ENST00000502574:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000249240:ENST00000437723:exon_65153676_65153774:AC069368.3;ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65153676_65153774:PLEKHO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 T:C C T 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 65553246 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000138617:ENST00000261888:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000444347:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000432843:exon_65553223_65553364:PARP16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 66621346 A/G 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 A:G A G 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66621308_66621462:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66621308_66621462:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66621308_66621462:DIS3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 66629394 T/C 1 91 60 151 42.0685290864853 32.2625082946251 9.80602079186016 T:C T C 10 0.537708471577085 0.120901293410270 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 66641417 T/C 1 50 45 95 23.1145764211457 24.1968812209688 -1.08230479982308 T:C T C 10 0.537708471577085 0.837583219979141 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641398_66641461:TIPIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 17 25 42 7.85895598318955 13.4427117894271 -5.58375580623757 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0901463513991 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 66793613 T/G 1 10 2 12 4.62291528422915 1.07541694315417 3.54749834107498 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0450438793507606 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 68582359 G/A 1 6 11 17 2.77374917053749 5.91479318734793 -3.14104401681044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.148024861377178 ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 T:C C T 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 12 31 43 5.54749834107498 16.6689626188896 -11.1214642778147 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000679133550990672 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74326847 G/A 1 42 53 95 19.4162441937624 28.4985489935855 -9.08230479982307 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0644561612822732 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000395135:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000359928:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74326819_74326871:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74326819_74326871:PML HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 35 32 67 16.180203494802 17.2066710904667 -1.02646759566469 T:G G T 10 0.537708471577085 0.807719469724957 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 35 37 72 16.180203494802 19.8952134483521 -3.71500995355012 C:G G C 10 0.537708471577085 0.40907789554974 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74702894 C/T 1 98 108 206 45.3045697854457 58.0725149303252 -12.7679451448795 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0805751815765307 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 88 67 155 40.6816545012165 36.0264675956647 4.65518690555182 A:G G A 10 0.537708471577085 0.46939847602987 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 60 46 106 27.7374917053749 24.7345896925459 3.00290201282899 T:C T C 10 0.537708471577085 0.626448102845496 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 63 47 110 29.1243662906436 25.272298164123 3.85206812652065 A:G G A 10 0.537708471577085 0.503712311165757 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 41 33 74 18.9539526653395 17.7443795620438 1.20957310329571 A:G G A 10 0.537708471577085 0.816352498703669 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 74710638 A/T 1 31 25 56 14.3310373811104 13.4427117894271 0.888325591683239 A:T:G A T 10 0.537708471577085 0.893632167205424 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74710609_74710650:SEMA7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 A:G A G 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 18 10 28 8.32124751161247 5.37708471577085 2.94416279584162 A:G A G 10 0.537708471577085 0.343745041558555 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75498548 A/G 1 22 15 37 10.1704136253041 8.06562707365627 2.10478655164786 A:G A G 10 0.537708471577085 0.514288152683863 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 31 20 51 14.3310373811104 10.7541694315417 3.57686794956866 A:C C A 10 0.537708471577085 0.329460534055785 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75499619 T/C 1 31 26 57 14.3310373811104 13.9804202610042 0.350617120106154 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 26 17 43 12.0195797389958 9.14104401681045 2.87853572218534 A:G G A 10 0.537708471577085 0.445332200815161 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75499995 T/G 1 28 39 67 12.9441627958416 20.9706303915063 -8.02646759566469 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0507598266702557 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 75503147 G/A 1 78 61 139 36.0587392169874 32.8002167662022 3.25852245078519 A:G G A 10 0.537708471577085 0.610342588706271 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 77241542 T/C 1 10 22 32 4.62291528422915 11.8295863746959 -7.20667109046672 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0124504179244765 ENSG00000117906:ENST00000394885:exon_77241411_77242601:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000320963:exon_77241411_77242201:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000394883:exon_77241411_77242191:RCN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 60 82 142 27.7374917053749 44.092094669321 -16.3546029639461 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0068998894699744 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 807 780 1587 373.069263437292 419.412607830126 -46.3433443928339 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0205347327961704 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 112 77 189 51.7766511833665 41.4035523114355 10.3730988719309 A:T:C:G C A 10 0.537708471577085 0.144457899041730 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 6 12 18 2.77374917053749 6.45250165892502 -3.67875248838753 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0990890653716225 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G A G 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 13 7 20 6.00978986949789 3.76395930103959 2.2458305684583 T:C C T 10 0.537708471577085 0.373996220974877 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89002870 C/T 1 59 54 113 27.275200176952 29.0362574651626 -1.76105728821061 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.777461892337556 ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89002707_89003094:MRPL46 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89169484 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89169653 G/A 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 1 767 768 0.462291528422915 412.422397699624 -411.960106171201 A:G A G 10 0.537708471577085 4.04497772941034e-255 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 385 315 700 177.982238442822 169.378168546782 8.6040698960405 A:G A G 10 0.537708471577085 0.519580590397419 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 42 24 66 19.4162441937624 12.90500331785 6.51124087591239 C:G G C 10 0.537708471577085 0.110476463874366 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 98 98 196 45.3045697854457 52.6954302145543 -7.39086042910866 T:C T C 10 0.537708471577085 0.315959970942561 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 89866677 G/A 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 A:G G A 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89866635_89866742:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89866635_89866742:POLG;ENSG00000140521:ENST00000528881:exon_89866635_89866742:POLG;ENSG00000140521:ENST00000532584:exon_89866635_89866742:POLG;ENSG00000140521:ENST00000526398:exon_89866635_89866742:POLG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 90226848 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 90771750 T/G 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:G T G 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 C:G G C 10 0.537708471577085 0.203557386113131 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91326099 C/T 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 T:C C T 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91326052_91326158:BLM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 14 19 33 6.47208139792081 10.2164609599646 -3.74437956204381 A:G G A 10 0.537708471577085 0.222694445595855 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 46 38 84 21.2654103074541 20.4329219199292 0.832488387524858 A:C C A 10 0.537708471577085 0.913040297406282 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 27 35 62 12.4818712674187 18.819796505198 -6.33792523777927 T:C C T 10 0.537708471577085 0.126020162943472 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91354521 G/A 1 30 26 56 13.8687458526875 13.9804202610042 -0.111674408316761 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91436965 C/T 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91436884_91437041:FES HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91459475 G/A 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91459353_91459486:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91459353_91459486:MAN2A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 A:C A C 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 45 46 91 20.8031187790312 24.7345896925459 -3.93147091351474 T:C C T 10 0.537708471577085 0.461992626068766 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91543131 T/A 1 16 20 36 7.39666445476664 10.7541694315417 -3.35750497677506 A:T T A 10 0.537708471577085 0.316301305683294 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543130_91543205:VPS33B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 25 12 37 11.5572882105729 6.45250165892502 5.10478655164785 T:C C T 10 0.537708471577085 0.100837383444843 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 91561061 G/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:G G T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91561035_91561115:VPS33B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 20 16 36 9.2458305684583 8.60333554523336 0.642495023224939 A:C A C 10 0.537708471577085 0.868679174180134 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 28 19 47 12.9441627958416 10.2164609599646 2.727701835877 A:C C A 10 0.537708471577085 0.466648410699165 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 24 16 40 11.09499668215 8.60333554523336 2.4916611369166 C:G C G 10 0.537708471577085 0.526471697646376 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 21 15 36 9.70812209688122 8.06562707365627 1.64249502322494 A:G G A 10 0.537708471577085 0.619672042871282 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 18 13 31 8.32124751161247 6.99021013050211 1.33103738111036 A:C C A 10 0.537708471577085 0.720040722682083 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 14 17 31 6.47208139792081 9.14104401681045 -2.66896261888964 A:T T A 10 0.537708471577085 0.370890806424659 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 13 3 16 6.00978986949789 1.61312541473126 4.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0415548831545558 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101114418 G/A 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C T C 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 101718097 C/G 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 C:G C G 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 160 172 332 73.9666445476664 92.4858571112586 -18.5192125635922 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0418467965926027 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 24 20 44 11.09499668215 10.7541694315417 0.340827250608259 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 417757 T/C 1 99 112 211 45.7668613138686 60.2233488166335 -14.4564875027649 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0529680602821128 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_417724_417782:MRPL28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 449010 G/A 1 36 11 47 16.6424950232249 5.91479318734793 10.727701835877 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00182801166806709 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000454619:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_448208_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 79 96 175 36.5210307454103 51.6200132714002 -15.0989825259899 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0229639502691744 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 137 198 335 63.3339393939394 106.466277372263 -43.1323379783235 T:C C T 10 0.537708471577085 2.84563061846863e-06 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 570557 T/C 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 19 18 37 8.78353904003538 9.67875248838753 -0.895213448352147 A:G A G 10 0.537708471577085 0.869367207004994 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 624114 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000409439:exon_624066_624592:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000422307:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000439574:exon_624066_624409:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000470411:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_624066_624763:PIGQ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 677629 T/C 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 711905 A/G 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_711891_712059:WDR90 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 715990 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 T:G G T 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 25 39 64 11.5572882105729 20.9706303915063 -9.41334218093344 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0233322401541517 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 720986 G/A 1 10 19 29 4.62291528422915 10.2164609599646 -5.59354567573547 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0411330412826733 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 28 17 45 12.9441627958416 9.14104401681045 3.80311877903118 T:C C T 10 0.537708471577085 0.296310268066239 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 722548 A/G 1 30 32 62 13.8687458526875 17.2066710904667 -3.33792523777927 A:G A G 10 0.537708471577085 0.445268264204849 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 20 15 35 9.2458305684583 8.06562707365627 1.18020349480202 C:G C G 10 0.537708471577085 0.736962690946534 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 16 13 29 7.39666445476664 6.99021013050211 0.406454324264534 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 839084 A/C 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 A:C A C 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_838931_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_838931_839085:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_838931_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_838928_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_838931_839125:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_838931_839125:CHTF18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 30 27 57 13.8687458526875 14.5181287325813 -0.649382879893846 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.894835211824984 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 C:G G C 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 50 66 116 23.1145764211457 35.4887591240876 -12.3741827029419 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0250664287752168 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 77 77 154 35.5964476885645 41.4035523114355 -5.80710462287109 T:C C T 10 0.537708471577085 0.374256353074515 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 C:G C G 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2049003 A/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 A:T A T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048966_2049122:ZNF598 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 A:G A G 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2581081 C/G 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 C:G C G 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2757364 G/A 1 41 18 59 18.9539526653395 9.67875248838753 9.27520017695198 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0181441656718409 ENSG00000167977:ENST00000301738:exon_2757299_2759031:KCTD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 T:C C T 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 28 29 57 12.9441627958416 15.5935456757355 -2.64938287989384 A:G A G 10 0.537708471577085 0.508439874517783 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 27 30 57 12.4818712674187 16.1312541473125 -3.64938287989385 A:C C A 10 0.537708471577085 0.354324561498909 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 50 49 99 23.1145764211457 26.3477151072772 -3.23313868613142 A:G G A 10 0.537708471577085 0.54600255315142 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 266 217 483 122.969546560495 116.682738332227 6.28680822826794 T:G G T 10 0.537708471577085 0.584121089636114 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 10 3 13 4.62291528422915 1.61312541473126 3.00978986949789 C:G C G 10 0.537708471577085 0.104209891139548 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 T:C T C 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 18 14 32 8.32124751161247 7.52791860207919 0.79332890953328 C:G C G 10 0.537708471577085 0.860157369191954 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 3724352 G/A 1 205 185 390 94.7697633266976 99.4760672417607 -4.70630391506316 A:G G A 10 0.537708471577085 0.64781358350372 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 142 125 267 65.6453970360539 67.2135589471356 -1.5681619110817 C:G G C 10 0.537708471577085 0.85412977341823 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 36 27 63 16.6424950232249 14.5181287325813 2.12436629064364 T:G G T 10 0.537708471577085 0.615519334789099 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4411224 C/T 1 19 15 34 8.78353904003538 8.06562707365627 0.717911966379109 T:C C T 10 0.537708471577085 0.864573776289205 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4411163_4411249:CORO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 18 23 41 8.32124751161247 12.367294846273 -4.04604733466049 T:C T C 10 0.537708471577085 0.213927594375255 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 14 16 30 6.47208139792081 8.60333554523336 -2.13125414731255 A:T A T 10 0.537708471577085 0.467885000124991 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 18 22 40 8.32124751161247 11.8295863746959 -3.5083388630834 A:T T A 10 0.537708471577085 0.272050067856685 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4664792 C/T 1 21 9 30 9.70812209688122 4.83937624419377 4.86874585268745 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0981514627220623 ENSG00000153443:ENST00000283474:exon_4664679_4664927:FAM100A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4849705 C/T 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000067836:ENST00000322048:exon_4849687_4849782:ROGDI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C C T 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 5083435 C/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:C C A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5083274_5083729:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5083274_5083729:NAGPA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 5132636 C/T 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5132560_5132674:ALG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 C:G G C 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 C:G C G 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 10575824 C/A 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 A:C C A 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10575693_10577495:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10575693_10577494:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10575693_10577494:ATF7IP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 10837913 C/G 1 29 26 55 13.4064543242645 13.9804202610042 -0.573965936739675 C:G C G 10 0.537708471577085 0.893173328538969 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10837818_10837922:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10837818_10837922:NUBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11016045 C/T 1 22 12 34 10.1704136253041 6.45250165892502 3.71791196637911 T:C C T 10 0.537708471577085 0.23062606198749 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 4 10 14 1.84916611369166 5.37708471577085 -3.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0653916474415341 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 32 24 56 14.7933289095333 12.90500331785 1.88832559168324 A:C A C 10 0.537708471577085 0.688256589961454 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 68 75 143 31.4358239327582 40.3281353682814 -8.89231143552315 T:C T C 10 0.537708471577085 0.153761672010123 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 87 76 163 40.2193629727936 40.8658438398585 -0.646480867064859 C:G C G 10 0.537708471577085 0.937498534855857 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11850150 C/G 1 37 33 70 17.1047865516479 17.7443795620438 -0.639593010395949 C:G C G 10 0.537708471577085 0.904982383143758 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11850093_11850226:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11850093_11850226:ZC3H7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11933678 G/C 1 522 570 1092 241.316177836762 306.493828798938 -65.1776509621768 T:C:G G C 10 0.537708471577085 7.88205572885217e-05 ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 74 72 146 34.2095731032957 38.7150099535501 -4.50543685025441 C:G G C 10 0.537708471577085 0.456520610322817 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 79 69 148 36.5210307454103 37.1018845388189 -0.580853793408579 A:G G A 10 0.537708471577085 0.934466382650868 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 12 4 16 5.54749834107498 2.15083388630834 3.39666445476664 A:C C A 10 0.537708471577085 0.130583196467889 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 C:G C G 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 30 32 62 13.8687458526875 17.2066710904667 -3.33792523777927 A:G A G 10 0.537708471577085 0.445268264204849 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 108 88 196 49.9274850696748 47.3183454987835 2.60913957089134 A:G A G 10 0.537708471577085 0.720818417253066 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 117 78 195 54.0881088254811 41.9412607830126 12.1468480424684 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0849183082506577 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 34 37 71 15.7179119663791 19.8952134483521 -4.17730148197304 T:G T G 10 0.537708471577085 0.342270411298002 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 19548116 G/A 1 6 13 19 2.77374917053749 6.99021013050211 -4.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0651882753473269 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 4 14 18 1.84916611369166 7.52791860207919 -5.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0084453389165878 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 19621671 G/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19621644_19621737:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19621644_19621737:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19621644_19621737:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19621644_19621737:C16orf62 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 19726275 C/T 1 51 42 93 23.5768679495687 22.5837558062376 0.993112143331096 T:C C T 10 0.537708471577085 0.917252370644261 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23360199 T/C 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000168447:ENST00000343070:exon_23359913_23360231:SCNN1B;ENSG00000168447:ENST00000307331:exon_23359913_23360231:SCNN1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 20 35 55 9.2458305684583 18.819796505198 -9.57396593673968 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0101554505634803 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:C A C 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 T:C T C 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23546561 G/C 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 C:G G C 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23546209_23546681:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23546209_23546681:EARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23563501 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23563470_23563625:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23563470_23563625:EARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 58 80 138 26.8129086485291 43.0166777261668 -16.2037690776377 C:G G C 10 0.537708471577085 0.00618733023742287 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23647125 C/G 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 C:G C G 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23646183_23647655:PALB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23677006 A/G 1 26 41 67 12.0195797389958 22.0460473346605 -10.0264675956647 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0192255686855462 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23676947_23677049:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23676996_23677049:DCTN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 23701538 A/G 1 91 101 192 42.0685290864853 54.3085556292856 -12.2400265428003 A:G A G 10 0.537708471577085 0.082332048373134 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 54 45 99 24.9637425348374 24.1968812209688 0.766861313868581 T:C C T 10 0.537708471577085 0.91990096440892 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 84 88 172 38.8324883875249 47.3183454987835 -8.48585711125862 A:G A G 10 0.537708471577085 0.194757433399746 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 24955183 T/C 1 32 41 73 14.7933289095333 22.0460473346605 -7.25271842512721 T:C T C 10 0.537708471577085 0.100213797019117 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24955092_24955183:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24955092_24955183:ARHGAP17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 128 80 208 59.1733156381331 43.0166777261668 16.1566379119663 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0259793069024524 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27373872 A/C 1 22 13 35 10.1704136253041 6.99021013050211 3.18020349480202 A:C A C 10 0.537708471577085 0.312377672013397 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27373915 G/T 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 T:G G T 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 23 27 50 10.632705153727 14.5181287325813 -3.88542357885425 T:C T C 10 0.537708471577085 0.320982817100593 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 20 27 47 9.2458305684583 14.5181287325813 -5.272298164123 T:C T C 10 0.537708471577085 0.143500184220502 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 12 19 31 5.54749834107498 10.2164609599646 -4.66896261888964 A:G A G 10 0.537708471577085 0.105873621994045 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27375070 T/C 1 25 18 43 11.5572882105729 9.67875248838753 1.87853572218534 T:C T C 10 0.537708471577085 0.647261718349993 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27375159 T/C 1 16 23 39 7.39666445476664 12.367294846273 -4.97063039150632 T:C T C 10 0.537708471577085 0.147427831516741 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 11 18 29 5.08520681265207 9.67875248838753 -4.59354567573547 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0957464810231972 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27475887 C/T 1 11 23 34 5.08520681265207 12.367294846273 -7.28208803362089 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0151717141564468 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27475716_27476157:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27475641_27476157:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27475641_27476157:GTF3C1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 27481514 G/A 1 19 21 40 8.78353904003538 11.2918779031188 -2.5083388630834 A:G G A 10 0.537708471577085 0.433124807120697 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27481429_27481716:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27481429_27481716:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27481429_27481716:GTF3C1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 56 37 93 25.8883255916832 19.8952134483521 5.9931121433311 A:T:C:G G T 10 0.537708471577085 0.252533596528154 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 30094678 G/A 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 30532929 C/T 1 32 17 49 14.7933289095333 9.14104401681045 5.65228489272283 T:C C T 10 0.537708471577085 0.115998122201391 ENSG00000005844:ENST00000358164:exon_30532813_30534505:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30532813_30534505:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000433423:exon_30532813_30534505:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000315171:exon_30532813_30534505:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30532813_30532986:ITGAL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 31090094 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 31384687 C/T 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31384570_31384711:ITGAX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 31391120 T/C 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 T:C T C 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31391078_31391185:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31391078_31391185:ITGAX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 31926619 G/A 1 55 43 98 25.4260340632603 23.1214642778147 2.30456978544567 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.685853739687992 ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31925797_31928622:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31925797_31928622:ZNF267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 48595895 G/T 1 25 28 53 11.5572882105729 15.0558372041584 -3.4985489935855 T:G G T 10 0.537708471577085 0.339073723053378 ENSG00000102921:ENST00000262384:exon_48594665_48596355:N4BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 50106594 T/C 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 T:C T C 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000155393:ENST00000285767:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000483299:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000299192:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000405152:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000401635:exon_50106516_50106625:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000456734:exon_50106516_50106625:HEATR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 50112898 G/A 1 17 6 23 7.85895598318955 3.22625082946251 4.63270515372704 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0603851077364703 ENSG00000155393:ENST00000285767:exon_50112652_50112929:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000483299:exon_50112652_50112929:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000299192:exon_50112652_50112929:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000405152:exon_50112652_50112929:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000401635:exon_50112652_50112929:HEATR3;ENSG00000155393:ENST00000456734:exon_50112652_50112929:HEATR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 50709723 G/A 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50709681_50709832:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50709681_50709832:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50709681_50709832:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50709681_50709832:SNX20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 A:G G A 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 53358439 A/G 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G A G 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53357932_53361413:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000450543:exon_53357932_53358807:CHD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 53503943 C/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 C:G C G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53503828_53504097:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53503828_53504097:RBL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 53504390 A/C 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 A:C A C 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504295_53504575:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504295_53504575:RBL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 53528079 T/C 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53528050_53528157:AKTIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 24 24 48 11.09499668215 12.90500331785 -1.81000663570008 T:C C T 10 0.537708471577085 0.664865013052188 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 57060724 G/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 57552088 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 57595999 A/G 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 58035429 C/A 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58035305_58035485:C16orf57;ENSG00000103005:ENST00000423271:exon_58035305_58035485:C16orf57 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 58054099 C/G 1 17 23 40 7.85895598318955 12.367294846273 -4.5083388630834 C:G C G 10 0.537708471577085 0.157417098618647 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58054045_58055522:C16orf57 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 89 59 148 41.1439460296394 31.724799823048 9.41914620659142 A:C A C 10 0.537708471577085 0.137629078540414 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 51 34 85 23.5768679495687 18.2820880336209 5.29477991594777 A:G G A 10 0.537708471577085 0.277204876819696 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 43 27 70 19.8785357221853 14.5181287325813 5.36040698960405 A:C A C 10 0.537708471577085 0.230758470057374 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 37 28 65 17.1047865516479 15.0558372041584 2.04894934748948 A:G A G 10 0.537708471577085 0.621665983160248 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 66975744 C/T 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 T:C C T 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66975671_66975751:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66975671_66975751:CES2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 58 52 110 26.8129086485291 27.9608405220084 -1.14793187347935 A:G A G 10 0.537708471577085 0.848717213469436 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 67917958 G/A 1 56 62 118 25.8883255916832 33.3379252377793 -7.44959964609603 A:G G A 10 0.537708471577085 0.195978849574398 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67917859_67918406:EDC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 13 14 27 6.00978986949789 7.52791860207919 -1.5181287325813 T:C C T 10 0.537708471577085 0.569107461757469 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 69369234 C/T 1 18 30 48 8.32124751161247 16.1312541473125 -7.81000663570008 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0291387926426154 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 69752373 C/T 1 21 18 39 9.70812209688122 9.67875248838753 0.0293696084936848 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69752273_69752437:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69752273_69752437:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69752273_69752437:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69752273_69752437:NQO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 69786207 T/A 1 73 80 153 33.7472815748728 43.0166777261668 -9.26939615129401 A:T T A 10 0.537708471577085 0.144464896654850 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69786144_69786274:NOB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 70395387 C/T 1 27 17 44 12.4818712674187 9.14104401681045 3.34082725060826 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365273378821744 ENSG00000168872:ENST00000302243:exon_70395321_70395413:DDX19A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 15 6 21 6.93437292634373 3.22625082946251 3.70812209688121 A:C C A 10 0.537708471577085 0.126832789288604 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 70814787 G/A 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:G G A 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70814693_70814842:VAC14;ENSG00000103043:ENST00000254957:exon_70814693_70814842:VAC14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 70818733 G/A 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:G G A 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70818679_70818741:VAC14;ENSG00000103043:ENST00000254957:exon_70818679_70818741:VAC14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 10 16 26 4.62291528422915 8.60333554523336 -3.98042026100421 T:G G T 10 0.537708471577085 0.167367402399651 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 20 31 51 9.2458305684583 16.6689626188896 -7.42313205043134 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0482792957524112 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 A:C C A 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 15 23 38 6.93437292634373 12.367294846273 -5.43292191992923 T:C T C 10 0.537708471577085 0.102564456170447 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 24 18 42 11.09499668215 9.67875248838753 1.41624419376243 A:G G A 10 0.537708471577085 0.757539726068538 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 27 28 55 12.4818712674187 15.0558372041584 -2.57396593673968 A:C C A 10 0.537708471577085 0.501722231924964 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 74499589 G/A 1 21 11 32 9.70812209688122 5.91479318734793 3.79332890953328 A:G G A 10 0.537708471577085 0.215445146158884 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74499574_74499711:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74499574_74499711:GLG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 74537591 C/T 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:T A T 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 11 6 17 5.08520681265207 3.22625082946251 1.85895598318956 T:G G T 10 0.537708471577085 0.468286092935019 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 75269003 G/A 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:G G A 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 75269325 C/T 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 75573884 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75572017_75574072:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75572017_75574072:TMEM231 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 75675609 T/C 1 217 177 394 100.317261667773 95.174399469144 5.14286219862851 T:C T C 10 0.537708471577085 0.61372796802806 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75675462_75675621:KARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 78420775 G/A 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000186153:ENST00000408984:exon_78420757_78420845:WWOX;ENSG00000186153:ENST00000299644:exon_78420757_78420845:WWOX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 36 35 71 16.6424950232249 18.819796505198 -2.17730148197304 A:G A G 10 0.537708471577085 0.635118982794146 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 104 98 202 48.0783189559832 52.6954302145543 -4.61711125857117 T:C T C 10 0.537708471577085 0.526001332554148 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 82033022 A/G 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000184860:ENST00000328945:exon_82031257_82033829:SDR42E1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 82033626 T/C 1 3 9 12 1.38687458526874 4.83937624419377 -3.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0780281383639108 ENSG00000184860:ENST00000328945:exon_82031257_82033829:SDR42E1;ENSG00000184860:ENST00000532128:exon_82033304_82033829:SDR42E1;ENSG00000184860:ENST00000534209:exon_82033360_82033829:SDR42E1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 1 22 2 24 10.1704136253041 1.07541694315417 9.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.000109574213793172 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 19 0 19 8.78353904003538 0 8.78353904003538 G G 10 0.537708471577085 8.02253805923196e-06 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 12 19 31 5.54749834107498 10.2164609599646 -4.66896261888964 T:C T C 10 0.537708471577085 0.105873621994045 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84088041 G/C 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 20 10 30 9.2458305684583 5.37708471577085 3.86874585268745 T:C C T 10 0.537708471577085 0.199829421182043 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 A:C C A 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 15 8 23 6.93437292634373 4.30166777261668 2.63270515372704 T:C C T 10 0.537708471577085 0.302090609922214 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:T A T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 17 7 24 7.85895598318955 3.76395930103959 4.09499668214996 A:G A G 10 0.537708471577085 0.104346466966581 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 30 23 53 13.8687458526875 12.367294846273 1.5014510064145 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78324675333147 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 72 44 116 33.2849900464499 23.6591727493917 9.62581729705814 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0771234248877615 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 43 41 84 19.8785357221853 22.0460473346605 -2.16751161247514 T:C C T 10 0.537708471577085 0.662533504535434 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 28 32 60 12.9441627958416 17.2066710904667 -4.2625082946251 T:G T G 10 0.537708471577085 0.301000321854184 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84793028 G/A 1 29 37 66 13.4064543242645 19.8952134483521 -6.48875912408761 A:G G A 10 0.537708471577085 0.137914155864048 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84792969_84793078:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84792969_84793078:USP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 56 49 105 25.8883255916832 26.3477151072772 -0.459389515593923 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 85009970 A/G 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G A G 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85007787_85010125:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85008069_85010125:ZDHHC7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 87743072 C/T 1 7 18 25 3.23604069896041 9.67875248838753 -6.44271178942713 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0144006996689902 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87742871_87743273:KLHDC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 87760445 T/C 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87760371_87760530:KLHDC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88039696 C/T 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000172530:ENST00000439677:exon_88039696_88039871:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88039696_88039871:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88039696_88039871:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88039696_88039871:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88039696_88039871:BANP;ENSG00000172530:ENST00000459966:exon_88039696_88039789:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88039696_88039871:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88039696_88039871:BANP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 589 652 1241 272.289710241097 350.585923468259 -78.2962132271625 A:G A G 10 0.537708471577085 8.7743834756061e-06 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 29 57 86 13.4064543242645 30.6493828798938 -17.2429285556293 T:G G T 10 0.537708471577085 0.000207227860420163 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 17 22 39 7.85895598318955 11.8295863746959 -3.97063039150632 A:G A G 10 0.537708471577085 0.260706150734874 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 18 21 39 8.32124751161247 11.2918779031188 -2.97063039150632 A:G A G 10 0.537708471577085 0.422380605990043 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88781614 G/C 1 24 21 45 11.09499668215 11.2918779031188 -0.196881220968825 A:C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88870967 T/C 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 35 48 83 16.180203494802 25.8100066357001 -9.62980314089805 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0365249099471601 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88872511 T/C 1 34 43 77 15.7179119663791 23.1214642778147 -7.40355231143555 T:C T C 10 0.537708471577085 0.109061952333282 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 74 72 146 34.2095731032957 38.7150099535501 -4.50543685025441 A:C:G C G 10 0.537708471577085 0.456520610322817 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 88958850 T/C 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88958652_88958893:CBFA2T3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 16 1 17 7.39666445476664 0.537708471577085 6.85895598318955 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000822004208955811 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 15 1 16 6.93437292634373 0.537708471577085 6.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00080597263281317 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 13 0 13 6.00978986949789 0 6.00978986949789 G G 10 0.537708471577085 0.000358176076528924 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 20 4 24 9.2458305684583 2.15083388630834 7.09499668214996 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.00352792409502426 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 19 5 24 8.78353904003538 2.68854235788543 6.09499668214996 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0133674150296041 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89180765 A/T 1 17 24 41 7.85895598318955 12.90500331785 -5.04604733466049 A:T A T 10 0.537708471577085 0.119813029406086 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89628073 G/A 1 3510 3021 6531 1622.64326476443 1624.41729263437 -1.77402786994207 A:T:C:G G A 10 0.537708471577085 0.970303886126228 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627986_89628118:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627986_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627986_89628159:RPL13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:G G A 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89712379 C/T 1 29 26 55 13.4064543242645 13.9804202610042 -0.573965936739675 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.893173328538969 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:C T C 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 16 89866043 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:G G T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 84 96 180 38.8324883875249 51.6200132714002 -12.7875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0614969709317813 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 648498 C/T 1 44 38 82 20.3408272506083 20.4329219199292 -0.0920946693209714 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 39 35 74 18.0293696084937 18.819796505198 -0.79042689670429 T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.90736870598205 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 649935 G/C 1 22 19 41 10.1704136253041 10.2164609599646 -0.0460473346604857 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 63 37 100 29.1243662906436 19.8952134483521 9.2291528422915 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0709197482360009 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 22 27 49 10.1704136253041 14.5181287325813 -4.34771510727717 T:C T C 10 0.537708471577085 0.251819843788447 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 A:G G A 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1637164 C/T 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 16 20 36 7.39666445476664 10.7541694315417 -3.35750497677506 T:C C T 10 0.537708471577085 0.316301305683294 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1684575 G/A 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 A:G G A 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1684605 G/T 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 103 82 185 47.6160274275602 44.092094669321 3.52393275823927 T:C C T 10 0.537708471577085 0.658322142871049 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 61 51 112 28.1997832337978 27.4231320504313 0.776651183366479 T:C T C 10 0.537708471577085 0.924651128300748 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2091729 G/A 1 4 10 14 1.84916611369166 5.37708471577085 -3.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0653916474415341 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2091765 C/T 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2091693_2091809:SMG6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:G T G 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2203175 C/G 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 63 54 117 29.1243662906436 29.0362574651626 0.0881088254810507 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2238675 A/G 1 23 25 48 10.632705153727 13.4427117894271 -2.81000663570008 A:G A G 10 0.537708471577085 0.47005408359343 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2238554_2238688:TSR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 32 41 73 14.7933289095333 22.0460473346605 -7.25271842512721 A:G G A 10 0.537708471577085 0.100213797019117 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3567049 A/G 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 A:G A G 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3566196_3567179:TAX1BP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:C T C 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3631196 G/T 1 13 7 20 6.00978986949789 3.76395930103959 2.2458305684583 T:G G T 10 0.537708471577085 0.373996220974877 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 31 20 51 14.3310373811104 10.7541694315417 3.57686794956866 T:C T C 10 0.537708471577085 0.329460534055785 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 17 26 43 7.85895598318955 13.9804202610042 -6.12146427781466 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0670842321345652 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 38 33 71 17.5670780800708 17.7443795620438 -0.177301481973036 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 A:G A G 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 16 8 24 7.39666445476664 4.30166777261668 3.09499668214996 A:C A C 10 0.537708471577085 0.225523458259253 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 3850910 A/G 1 23 31 54 10.632705153727 16.6689626188896 -6.03625746516259 A:G A G 10 0.537708471577085 0.103293935008092 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3850685_3851149:ATP2A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4443205 G/A 1 42 48 90 19.4162441937624 25.8100066357001 -6.39376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.204426954804313 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4446457 G/A 1 25 34 59 11.5572882105729 18.2820880336209 -6.72479982304802 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0895952913594266 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4455213 C/T 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 T:C C T 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4455175_4455292:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4455175_4455292:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4455175_4455292:MYBBP1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4574751 T/A 1 47 66 113 21.727701835877 35.4887591240876 -13.7610572882106 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0106468680096653 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574680_4574826:PELP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 30 30 60 13.8687458526875 16.1312541473125 -2.2625082946251 T:C C T 10 0.537708471577085 0.605407620090964 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 30 34 64 13.8687458526875 18.2820880336209 -4.41334218093344 T:C C T 10 0.537708471577085 0.315979508256788 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 43 39 82 19.8785357221853 20.9706303915063 -1.09209466932097 A:G G A 10 0.537708471577085 0.82544854023104 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4722785 G/A 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4722876 G/A 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 5264916 C/T 1 28 20 48 12.9441627958416 10.7541694315417 2.18999336429992 T:C C T 10 0.537708471577085 0.564955928597578 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5264503_5264970:RABEP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 17 22 39 7.85895598318955 11.8295863746959 -3.97063039150632 T:C C T 10 0.537708471577085 0.260706150734874 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 5462240 C/T 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 T:C C T 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6531679 T/G 1 1 7 8 0.462291528422915 3.76395930103959 -3.30166777261668 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0284854418445818 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6531437_6532061:KIAA0753 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6538355 G/A 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6538331_6538491:KIAA0753 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6663894 G/A 1 15 4 19 6.93437292634373 2.15083388630834 4.78353904003538 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0363034173949573 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 15 4 19 6.93437292634373 2.15083388630834 4.78353904003538 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0363034173949573 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6942108 C/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 16 13 29 7.39666445476664 6.99021013050211 0.406454324264534 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 17 25 42 7.85895598318955 13.4427117894271 -5.58375580623757 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0901463513991 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 11 12 23 5.08520681265207 6.45250165892502 -1.36729484627296 A:G G A 10 0.537708471577085 0.676984403272827 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 80 61 141 36.9833222738332 32.8002167662022 4.18310550763101 A:G G A 10 0.537708471577085 0.500142487239016 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7214829 C/T 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.648694936874249 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7296233 G/A 1 18 13 31 8.32124751161247 6.99021013050211 1.33103738111036 A:G G A 10 0.537708471577085 0.720040722682083 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7296110_7296271:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7296110_7296271:PLSCR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7366619 T/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7402600 T/C 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7404991 T/C 1 35 44 79 16.180203494802 23.6591727493917 -7.47896925458971 T:C T C 10 0.537708471577085 0.113612085655311 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7404845_7405048:POLR2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7453505 C/A 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7453437_7453512:TNFSF12-TNFSF13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 C:G G C 10 0.537708471577085 0.194255499810311 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:C C A 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 50 70 120 23.1145764211457 37.6395930103959 -14.5250165892502 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.0100670793851711 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 240 215 455 110.9499668215 115.607321389073 -4.65735456757368 A:G G A 10 0.537708471577085 0.67237308577478 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 84 60 144 38.8324883875249 32.2625082946251 6.56998009289976 A:G A G 10 0.537708471577085 0.278610063160744 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8048139 G/A 1 6 11 17 2.77374917053749 5.91479318734793 -3.14104401681044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.148024861377178 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 T:C T C 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8064083 T/G 1 30 16 46 13.8687458526875 8.60333554523336 5.26541030745409 T:G T G 10 0.537708471577085 0.139419064316885 ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:T T A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 219 129 348 101.241844724618 69.364392833444 31.8774518911744 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.000685171829271111 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 218 119 337 100.779553196195 63.9873081176731 36.7922450785223 A:G G A 10 0.537708471577085 6.25669006003816e-05 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 8157310 C/T 1 12 1 13 5.54749834107498 0.537708471577085 5.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00453511442282378 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8157177_8157397:PFAS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 32 39 71 14.7933289095333 20.9706303915063 -6.17730148197304 T:G T G 10 0.537708471577085 0.153844645609919 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 9821372 C/T 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000007237:ENST00000323816:exon_9821318_9821416:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000396115:exon_9821318_9821416:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000437099:exon_9821318_9821416:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000432992:exon_9821318_9821416:GAS7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 54 51 105 24.9637425348374 27.4231320504313 -2.45938951559393 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 0.695638588323952 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 20 19 39 9.2458305684583 10.2164609599646 -0.970630391506317 A:G G A 10 0.537708471577085 0.75152935894848 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 26 31 57 12.0195797389958 16.6689626188896 -4.64938287989385 A:G A G 10 0.537708471577085 0.233396259426483 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 29 23 52 13.4064543242645 12.367294846273 1.03915947799158 A:C A C 10 0.537708471577085 0.783230581856869 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 16342687 T/A 1 766 747 1513 354.115310771953 401.668228268082 -47.5529174961296 A:T:G T A 10 0.537708471577085 0.0143166122104971 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 163 161 324 75.3535191329351 86.5710639239107 -11.2175447909755 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.220443053720938 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 93 113 206 42.9931121433311 60.7610572882106 -17.7679451448795 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0143335555941960 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 17700573 T/C 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 T:C T C 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 17700792 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17700698_17701668:RAI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 17719989 C/T 1 20 10 30 9.2458305684583 5.37708471577085 3.86874585268745 T:C C T 10 0.537708471577085 0.199829421182043 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17719839_17720032:SREBF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 17720391 A/G 1 17 11 28 7.85895598318955 5.91479318734793 1.94416279584162 A:G A G 10 0.537708471577085 0.570682901317659 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 97 96 193 44.8422782570228 51.6200132714002 -6.77773501437741 A:G G A 10 0.537708471577085 0.348234507149859 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18148944 C/G 1 125 115 240 57.7864410528644 61.8364742313648 -4.0500331785004 C:G C G 10 0.537708471577085 0.605158095760191 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18181592 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18194248 C/T 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 T:C C T 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18194156_18194341:TOP3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18217958 C/T 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000177302:ENST00000412083:exon_18217913_18218030:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18217913_18218288:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000461127:exon_18217913_18218258:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000472959:exon_18217913_18218274:TOP3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 21 16 37 9.70812209688122 8.60333554523336 1.10478655164786 A:G G A 10 0.537708471577085 0.744577501703053 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 18630995 G/A 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000108448:ENST00000395902:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000414850:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395672:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000424146:exon_18630838_18631071:TRIM16L;ENSG00000108448:ENST00000395671:exon_18630838_18631071:TRIM16L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 27 27 54 12.4818712674187 14.5181287325813 -2.03625746516259 A:T A T 10 0.537708471577085 0.588096224354422 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 25 0 25 11.5572882105729 0 11.5572882105729 T T 10 0.537708471577085 3.09742540939353e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 38 0 38 17.5670780800708 0 17.5670780800708 G G 10 0.537708471577085 6.60024284672928e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 38 0 38 17.5670780800708 0 17.5670780800708 C C 10 0.537708471577085 6.60024284672928e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 30 0 30 13.8687458526875 0 13.8687458526875 C C 10 0.537708471577085 1.14296394115534e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 39 0 39 18.0293696084937 0 18.0293696084937 C C 10 0.537708471577085 3.49593631735159e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 37 0 37 17.1047865516479 0 17.1047865516479 C C 10 0.537708471577085 1.24817328330573e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 25 0 25 11.5572882105729 0 11.5572882105729 C C 10 0.537708471577085 3.09742540939353e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 21 0 21 9.70812209688122 0 9.70812209688122 C C 10 0.537708471577085 2.28713526062406e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 23 0 23 10.632705153727 0 10.632705153727 G G 10 0.537708471577085 1.17967243883225e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 55 0 55 25.4260340632603 0 25.4260340632603 G G 10 0.537708471577085 2.28507076832654e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 126 103 229 58.2487325812873 55.3839725724398 2.86476000884753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.740522005069729 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 A:G G A 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 26961743 A/G 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 A:G A G 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26961535_26962129:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26961535_26962627:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26961535_26962627:KIAA0100 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 114 112 226 52.7012342402123 60.2233488166335 -7.52211457642121 T:C C T 10 0.537708471577085 0.317880777932829 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 90 57 147 41.6062375580623 30.6493828798938 10.9568546781685 T:C C T 10 0.537708471577085 0.082037983260717 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 69 46 115 31.8981154611811 24.7345896925459 7.16352576863522 T:C C T 10 0.537708471577085 0.191184257628802 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27228198 G/A 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 A:G G A 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27228008_27228319:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27228008_27228319:DHRS13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 17 11 28 7.85895598318955 5.91479318734793 1.94416279584162 A:G G A 10 0.537708471577085 0.570682901317659 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27889963 C/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 C:G C G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 A:G G A 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 28512333 C/G 1 103 99 202 47.6160274275602 53.2331386861314 -5.61711125857118 C:G C G 10 0.537708471577085 0.438287762738112 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 22 16 38 10.1704136253041 8.60333554523336 1.56707808007077 A:G A G 10 0.537708471577085 0.630025415688229 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 6 12 18 2.77374917053749 6.45250165892502 -3.67875248838753 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0990890653716225 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 36 30 66 16.6424950232249 16.1312541473125 0.511240875912389 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 13 18 31 6.00978986949789 9.67875248838753 -3.66896261888964 A:G G A 10 0.537708471577085 0.209536006747994 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 33289046 G/C 1 22 26 48 10.1704136253041 13.9804202610042 -3.81000663570008 C:G G C 10 0.537708471577085 0.311466911643396 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 1 20 21 0.462291528422915 10.7541694315417 -10.2918779031188 T:C C T 10 0.537708471577085 4.53145574438325e-06 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 21 1 22 9.70812209688122 0.537708471577085 9.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 3.7911135186935e-05 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 C:G G C 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 34252537 A/C 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:C A C 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000419453:exon_34252519_34252554:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000431884:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000436836:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000425909:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34252519_34252641:RDM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 34416577 A/G 1 575 524 1099 265.817628843176 281.759239106393 -15.9416102632164 A:G A G 10 0.537708471577085 0.348361329749036 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 554 470 1024 256.109506746295 252.72298164123 3.38652510506498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.850866704304652 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 34964853 G/A 1 16 7 23 7.39666445476664 3.76395930103959 3.63270515372704 A:G G A 10 0.537708471577085 0.146665846223693 ENSG00000129282:ENST00000250156:exon_34964679_34965397:MRM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 25 15 40 11.5572882105729 8.06562707365627 3.4916611369166 C:G C G 10 0.537708471577085 0.341538221709411 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 32 29 61 14.7933289095333 15.5935456757355 -0.800216766202185 T:C T C 10 0.537708471577085 0.898053726375173 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 17 17 34 7.85895598318955 9.14104401681045 -1.28208803362089 T:C C T 10 0.537708471577085 0.731925963272471 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 36453208 T/C 1 91 73 164 42.0685290864853 39.2527184251272 2.81581066135806 T:C T C 10 0.537708471577085 0.695684682777827 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36452990_36453215:MRPL45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 36474601 A/G 1 36 42 78 16.6424950232249 22.5837558062376 -5.94126078301263 A:G A G 10 0.537708471577085 0.211379980437652 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36474586_36474634:MRPL45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 36478450 G/T 1 62 59 121 28.6620747622207 31.724799823048 -3.06272506082729 T:G G T 10 0.537708471577085 0.585558084003515 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36478392_36479101:MRPL45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 36926767 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36926689_36926792:PIP4K2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 37071324 G/A 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:G G A 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37071296_37071388:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37071296_37071394:LASP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 6 11 17 2.77374917053749 5.91479318734793 -3.14104401681044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.148024861377178 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 38711222 T/C 1 136 83 219 62.8716478655164 44.6298031408981 18.2418447246184 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0145584748915010 ENSG00000126353:ENST00000246657:exon_38710021_38712070:CCR7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 38974686 G/A 1 157 154 311 72.5797699623976 82.8071046228711 -10.2273346604734 A:G G A 10 0.537708471577085 0.255551643760417 ENSG00000186395:ENST00000269576:exon_38974369_38974734:KRT10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 35 23 58 16.180203494802 12.367294846273 3.81290864852907 T:C T C 10 0.537708471577085 0.35751476363841 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 33 26 59 15.2556204379562 13.9804202610042 1.27520017695198 A:T:C T A 10 0.537708471577085 0.794729414690578 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 69 11 80 31.8981154611811 5.91479318734793 25.9833222738332 C:G G C 10 0.537708471577085 1.26813174970711e-09 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 84 13 97 38.8324883875249 6.99021013050211 31.8422782570228 A:G G A 10 0.537708471577085 1.06372046104917e-11 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 132 36 168 61.0224817518248 19.3575049767751 41.6649767750497 A:T:C:G G C 10 0.537708471577085 3.16550778121848e-11 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 39987130 T/C 1 59 33 92 27.275200176952 17.7443795620438 9.53082061490818 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0473881743056698 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000521789:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000486304:exon_39987053_39987132:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000460893:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000481693:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000475053:exon_39987053_39987142:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000495317:exon_39987053_39987142:NT5C3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40048613 A/G 1 85 59 144 39.2947799159478 31.724799823048 7.56998009289975 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.211120514800209 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40048532_40048700:ACLY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 16 8 24 7.39666445476664 4.30166777261668 3.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.225523458259253 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 18 11 29 8.32124751161247 5.91479318734793 2.40645432426453 T:C T C 10 0.537708471577085 0.457421609041791 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 45 47 92 20.8031187790312 25.272298164123 -4.46917938509182 A:G G A 10 0.537708471577085 0.403031256320176 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40353722 A/G 1 35 12 47 16.180203494802 6.45250165892502 9.72770183587701 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00496673846983327 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 A:C C A 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 35 57 92 16.180203494802 30.6493828798938 -14.4691793850918 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.00320089307949781 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40717957 A/G 1 91 91 182 42.0685290864853 48.9314709135147 -6.86294182702947 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.333932017884594 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40717924_40718292:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40717924_40718295:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40717924_40718295:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40717924_40718295:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40717924_40718295:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40717924_40718292:COASY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40722029 A/G 1 60 43 103 27.7374917053749 23.1214642778147 4.61602742756024 A:G A G 10 0.537708471577085 0.375479715926343 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000346833:exon_40722000_40722201:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40722000_40722201:MLX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 21 20 41 9.70812209688122 10.7541694315417 -1.04604733466049 A:G A G 10 0.537708471577085 0.756529286407691 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40822678 C/T 1 21 20 41 9.70812209688122 10.7541694315417 -1.04604733466049 T:C C T 10 0.537708471577085 0.756529286407691 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40822591_40822723:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000445882:exon_40822591_40822723:PLEKHH3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 40931054 T/C 1 110 89 199 50.8520681265206 47.8560539703606 2.99601415616009 T:C T C 10 0.537708471577085 0.722350289130019 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 41244936 G/A 1 4 10 14 1.84916611369166 5.37708471577085 -3.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0653916474415341 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 42288661 G/A 1 41 37 78 18.9539526653395 19.8952134483521 -0.94126078301263 A:G G A 10 0.537708471577085 0.909689166622464 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288658_42288699:UBTF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 42426587 C/T 1 245 227 472 113.261424463614 122.059823047998 -8.79839858438412 T:C C T 10 0.537708471577085 0.432702949623779 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 C:G G C 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 43216472 A/G 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G A G 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43216388_43216527:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43216388_43216527:ACBD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 36 27 63 16.6424950232249 14.5181287325813 2.12436629064364 T:C C T 10 0.537708471577085 0.615519334789099 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44108906 A/G 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 A:G A G 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44107334_44109069:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44107334_44109069:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44109474 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44109413_44109665:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44109413_44109665:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44111613 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44111527_44111651:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44111527_44111651:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44117119 A/G 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:G A G 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44117068_44117250:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44117068_44117250:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44248769 T/C 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44248814 G/A 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G G A 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44248837 T/C 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 T:C T C 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44249096 A/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:C A C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44249199 T/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:G T G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44248221_44249594:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44248221_44249598:KIAA1267 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 44833217 C/A 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000073969:ENST00000398238:exon_44833168_44834830:NSF;ENSG00000073969:ENST00000225282:exon_44833168_44834830:NSF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 45890707 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45890632_45890769:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45890632_45890769:OSBPL7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 33 41 74 15.2556204379562 22.0460473346605 -6.79042689670429 T:C C T 10 0.537708471577085 0.129485252162803 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 45915766 T/C 1 33 21 54 15.2556204379562 11.2918779031188 3.96374253483741 T:C T C 10 0.537708471577085 0.339561232288088 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915636_45915816:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 T:C C T 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 13 3 16 6.00978986949789 1.61312541473126 4.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0415548831545558 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 T:G G T 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46053291 C/T 1 80 76 156 36.9833222738332 40.8658438398585 -3.88252156602527 T:C C T 10 0.537708471577085 0.574253808712284 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46053235_46053379:CDK5RAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46054107 A/C 1 74 64 138 34.2095731032957 34.4133421809334 -0.20376907763773 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46054078_46054188:CDK5RAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 84 77 161 38.8324883875249 41.4035523114355 -2.57106392391069 C:G G C 10 0.537708471577085 0.693394946140611 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 42 27 69 19.4162441937624 14.5181287325813 4.89811546118113 T:C C T 10 0.537708471577085 0.277336594674233 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 64 62 126 29.5866578190666 33.3379252377793 -3.75126741871271 T:C T C 10 0.537708471577085 0.532180140443225 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 104 74 178 48.0783189559832 39.7904268967043 8.28789205927887 C:G C G 10 0.537708471577085 0.229282188304157 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 36 31 67 16.6424950232249 16.6689626188896 -0.0264675956646983 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 159 140 299 73.5043530192435 75.2791860207919 -1.77483300154842 T:C C T 10 0.537708471577085 0.861941941586115 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48187470 G/A 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000005882:ENST00000007708:exon_48187321_48188422:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48187321_48189516:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48187321_48188421:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000512204:exon_48187321_48187573:PDK2;ENSG00000167100:ENST00000330175:exon_48187404_48190412:SAMD14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48216944 C/T 1 130 112 242 60.097898694979 60.2233488166335 -0.125450121654566 T:C C T 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48447422 G/A 1 81 85 166 37.4456138022561 45.7052200840522 -8.25960628179612 A:G G A 10 0.537708471577085 0.213130865846825 ENSG00000108826:ENST00000507088:exon_48447393_48447460:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000508200:exon_48447393_48447460:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48447393_48447460:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48447393_48447460:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48447393_48447460:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48445229_48447460:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000511860:exon_48447393_48447460:MRPL27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48450539 A/G 1 17 20 37 7.85895598318955 10.7541694315417 -2.89521344835215 A:G A G 10 0.537708471577085 0.410238405685875 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48458184 C/T 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48458124_48458786:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48458124_48458818:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48458124_48458820:EME1;ENSG00000154920:ENST00000507616:exon_48458124_48458818:EME1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48503676 G/T 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:G G T 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48503519_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48503519_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504945:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503408:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48503580_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48503613_48503750:ACSF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48503677 G/T 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:G G T 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48503519_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48503519_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504945:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503408:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48503579_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48503580_48503750:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48503613_48503750:ACSF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48562277 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48562105_48563336:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48562105_48563335:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48562105_48562359:RSAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48628092 A/G 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:T T A 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 48774319 G/A 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 A:G G A 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000154945:ENST00000285243:exon_48774301_48774482:ANKRD40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 53471884 A/G 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000108960:ENST00000262065:exon_53469974_53471895:MMD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 A:G G A 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 55183203 T/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 11 20 31 5.08520681265207 10.7541694315417 -5.66896261888964 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0474794148830212 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 56283449 C/G 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 C:G C G 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000011143:ENST00000393119:exon_56282803_56283531:MKS1;ENSG00000011143:ENST00000313863:exon_56282814_56283531:MKS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 56772332 A/G 1 51 71 122 23.5768679495687 38.177301481973 -14.6004335324044 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0084118242248719 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56772292_56772694:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56772292_56772550:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000421782:exon_56772292_56772695:RAD51C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 27 29 56 12.4818712674187 15.5935456757355 -3.11167440831676 A:G G A 10 0.537708471577085 0.423723078582135 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 58031412 A/G 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000189050:ENST00000305783:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000482446:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000343124:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000442346:exon_58031406_58031507:RNFT1;ENSG00000189050:ENST00000466544:exon_58031406_58031507:RNFT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 15 20 35 6.93437292634373 10.7541694315417 -3.81979650519798 T:C C T 10 0.537708471577085 0.235619569821158 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 58529401 A/G 1 23 13 36 10.632705153727 6.99021013050211 3.64249502322494 A:G A G 10 0.537708471577085 0.245366448391152 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58529241_58529406:APPBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 59821814 T/C 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C T C 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59821793_59821952:BRIP1;ENSG00000136492:ENST00000416542:exon_59821793_59821952:BRIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 60042435 T/C 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60042367_60042829:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60042367_60042829:MED13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 61769687 G/A 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 A:G G A 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000198909:ENST00000361357:exon_61769602_61769779:MAP3K3;ENSG00000198909:ENST00000361733:exon_61769602_61769779:MAP3K3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 61888461 G/A 1 39 39 78 18.0293696084937 20.9706303915063 -2.94126078301263 A:G G A 10 0.537708471577085 0.570484117044915 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61888436_61888533:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61888436_61888533:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61888436_61888533:DDX42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 53 74 127 24.5014510064145 39.7904268967043 -15.2889758902898 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0074129868860691 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 18 34 52 8.32124751161247 18.2820880336209 -9.96084052200842 C:G G C 10 0.537708471577085 0.00762448848745997 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 223 199 422 103.09101083831 107.00398584384 -3.91297500552987 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732602687569842 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 62082686 C/T 1 76 70 146 35.1341561601415 37.6395930103959 -2.50543685025441 T:C C T 10 0.537708471577085 0.679170631835967 ENSG00000108622:ENST00000412356:exon_62082467_62082733:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000418105:exon_62082467_62082733:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000425257:exon_62082467_62082733:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000225760:exon_62082467_62082733:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000449662:exon_62082467_62082733:ICAM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 12 7 19 5.54749834107498 3.76395930103959 1.78353904003538 T:C C T 10 0.537708471577085 0.493938110591303 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 63010870 T/G 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 T:G T G 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000120063:ENST00000439174:exon_63005407_63010947:GNA13;ENSG00000120063:ENST00000239138:exon_63006834_63010947:GNA13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 65362552 T/A 1 38 21 59 17.5670780800708 11.2918779031188 6.27520017695198 A:T T A 10 0.537708471577085 0.117085323500013 ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 65732093 A/G 1 24 37 61 11.09499668215 19.8952134483521 -8.80021676620219 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0284654261870228 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65732016_65732139:NOL11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 46 56 102 21.2654103074541 30.1116744083168 -8.84626410086267 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0910481104611759 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 202 209 411 93.3828887414288 112.381070559611 -18.9981818181819 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0670744863874053 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 66431810 G/A 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66431761_66431853:WIPI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 71027833 A/G 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 71231762 T/C 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 71232044 C/T 1 5 13 18 2.31145764211457 6.99021013050211 -4.67875248838753 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0327312480155932 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 36 24 60 16.6424950232249 12.90500331785 3.7374917053749 T:C C T 10 0.537708471577085 0.366253866412203 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 72869078 A/G 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72868991_72869156:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72868991_72869102:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72868991_72869102:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72868991_72869102:FDXR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 74 66 140 34.2095731032957 35.4887591240876 -1.2791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.865532748362716 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73127206 G/C 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 C:G G C 10 0.537708471577085 0.15557289677717 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73487533 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73487384_73487536:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73487384_73487536:KIAA0195 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 C:G C G 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 23 18 41 10.632705153727 9.67875248838753 0.953952665339514 C:G G C 10 0.537708471577085 0.875834251735636 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:C C T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73625286 G/A 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 35 24 59 16.180203494802 12.90500331785 3.27520017695199 T:C T C 10 0.537708471577085 0.434677443177928 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 25 13 38 11.5572882105729 6.99021013050211 4.56707808007077 C:G C G 10 0.537708471577085 0.146334159198953 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 60 53 113 27.7374917053749 28.4985489935855 -0.761057288210605 T:C T C 10 0.537708471577085 0.924946276886552 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73944496 G/A 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73944332_73944538:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73944332_73944538:ACOX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 73945957 A/G 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:G A G 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73945799_73945978:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73945799_73945978:ACOX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 47 37 84 21.727701835877 19.8952134483521 1.83248838752486 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.743177576309387 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 40 45 85 18.4916611369166 24.1968812209688 -5.70522008405223 C:G G C 10 0.537708471577085 0.232120522435554 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 74387228 G/A 1 18 12 30 8.32124751161247 6.45250165892502 1.86874585268745 A:G G A 10 0.537708471577085 0.584248594892217 ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74385614_74387694:UBE2O HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 198 195 393 91.5337226277372 104.853151957532 -13.3194293297944 A:G G A 10 0.537708471577085 0.188408695226181 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 32 22 54 14.7933289095333 11.8295863746959 2.96374253483741 T:C C T 10 0.537708471577085 0.495445586716911 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 75398498 C/T 1 31 14 45 14.3310373811104 7.52791860207919 6.80311877903118 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0510933830276652 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75398134_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000407798:exon_75398140_75398550:SEPT9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 178 167 345 82.2878920592789 89.7973147533732 -7.50942269409433 T:C T C 10 0.537708471577085 0.418621918917024 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:T A T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 18 20 38 8.32124751161247 10.7541694315417 -2.43292191992923 A:G G A 10 0.537708471577085 0.5157847888304 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:C C A 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 108 99 207 49.9274850696748 53.2331386861314 -3.3056536164566 T:C C T 10 0.537708471577085 0.675960500808835 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 49 50 99 22.6522848927228 26.8854235788543 -4.23313868613142 T:C T C 10 0.537708471577085 0.420715831614634 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 45 38 83 20.8031187790312 20.4329219199292 0.370196859101942 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76198587 A/G 1 25 28 53 11.5572882105729 15.0558372041584 -3.4985489935855 A:G A G 10 0.537708471577085 0.339073723053378 ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000481282:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000475701:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000424020:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000458315:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000472544:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000484578:exon_76198580_76198684:AFMID HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76482435 C/T 0 10 0 10 4.62291528422915 0 4.62291528422915 C C 10 0.537708471577085 0.00246636601179183 ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76482306_76482588:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76482306_76482588:DNAH17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 A:G G A 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 12 16 28 5.54749834107498 8.60333554523336 -3.05583720415838 A:G A G 10 0.537708471577085 0.261133649980021 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 76831552 G/A 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76831362_76831583:USP36 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 77082314 C/T 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 78327358 G/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78327312_78327466:RNF213;ENSG00000234591:ENST00000434136:exon_78327100_78327744:AC124319.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 78354756 C/T 1 16 12 28 7.39666445476664 6.45250165892502 0.94416279584162 T:C C T 10 0.537708471577085 0.850213996975682 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79205736 G/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79205647_79205821:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79205647_79205821:C17orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79220224 G/C 1 21 24 45 9.70812209688122 12.90500331785 -3.19688122096882 C:G G C 10 0.537708471577085 0.371512230572139 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79224985 C/T 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79225000 A/G 1 10 3 13 4.62291528422915 1.61312541473126 3.00978986949789 A:G A G 10 0.537708471577085 0.104209891139548 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 11 17 28 5.08520681265207 9.14104401681045 -4.05583720415838 T:C T C 10 0.537708471577085 0.133221244184410 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79478007 G/A 1 4237 3691 7928 1958.72920592789 1984.68196859102 -25.9527626631298 A:T:C:G G A 10 0.537708471577085 0.565688606145734 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:G G T 10 0.537708471577085 0.592405089958251 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79508400 T/C 1 27 24 51 12.4818712674187 12.90500331785 -0.423132050431336 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 18 25 43 8.32124751161247 13.4427117894271 -5.12146427781466 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127617957773552 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:G G A 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 79655805 C/T 1 14 17 31 6.47208139792081 9.14104401681045 -2.66896261888964 T:C C T 10 0.537708471577085 0.370890806424659 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79655734_79655857:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79655734_79655857:HGS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80011773 C/T 1 36 47 83 16.6424950232249 25.272298164123 -8.62980314089806 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0615322885183248 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 29 26 55 13.4064543242645 13.9804202610042 -0.573965936739675 A:G G A 10 0.537708471577085 0.893173328538969 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80016263 G/A 1 104 79 183 48.0783189559832 42.4789692545897 5.59934970139344 A:G G A 10 0.537708471577085 0.415819478578987 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80016217_80016292:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80016217_80016284:DUS1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 40 36 76 18.4916611369166 19.3575049767751 -0.865843839858464 C:G G C 10 0.537708471577085 0.908537409154433 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 70 45 115 32.3604069896041 24.1968812209688 8.16352576863522 A:G G A 10 0.537708471577085 0.135044810374276 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 14 20 34 6.47208139792081 10.7541694315417 -4.28208803362089 C:G G C 10 0.537708471577085 0.168954691239917 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80851485 A/G 1 25 13 38 11.5572882105729 6.99021013050211 4.56707808007077 A:G A G 10 0.537708471577085 0.146334159198953 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80851423_80851508:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80851423_80851508:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80851423_80851508:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80851423_80851508:TBCD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 35 28 63 16.180203494802 15.0558372041584 1.12436629064365 A:G G A 10 0.537708471577085 0.80179280013145 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 32 47 79 14.7933289095333 25.272298164123 -10.4789692545897 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0234194586970024 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 9255785 C/G 1 90 72 162 41.6062375580623 38.7150099535501 2.89122760451222 C:G C G 10 0.537708471577085 0.693810797211898 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255630_9255795:ANKRD12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 17 13 30 7.85895598318955 6.99021013050211 0.868745852687449 C:G C G 10 0.537708471577085 0.8553876844794 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 12325991 G/A 1 20 55 75 9.2458305684583 29.5739659367397 -20.3281353682814 A:G G A 10 0.537708471577085 2.29965611768606e-06 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12325066_12326568:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12325172_12326129:TUBB6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 85 100 185 39.2947799159478 53.7708471577085 -14.4760672417607 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0386836987118118 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 39 32 71 18.0293696084937 17.2066710904667 0.822698518026964 T:C T C 10 0.537708471577085 0.905492891152309 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 31 37 68 14.3310373811104 19.8952134483521 -5.56417606724178 T:C C T 10 0.537708471577085 0.182826423786482 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 12674735 A/G 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 A:G A G 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000101624:ENST00000262127:exon_12674535_12674752:CEP76;ENSG00000101624:ENST00000423709:exon_12674535_12674752:CEP76 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 86 96 182 39.7570714443707 51.6200132714002 -11.8629418270295 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0870944382736482 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 13645161 A/C 1 17 22 39 7.85895598318955 11.8295863746959 -3.97063039150632 A:C A C 10 0.537708471577085 0.260706150734874 ENSG00000168675:ENST00000361205:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399848:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000359446:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399847:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000361303:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000435606:exon_13645126_13652753:C18orf1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 14106274 C/T 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C C T 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000175322:ENST00000309305:exon_14104724_14106408:ZNF519 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 21109145 G/A 1 30 35 65 13.8687458526875 18.819796505198 -4.95105065251052 A:G G A 10 0.537708471577085 0.262775988274422 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 29 32 61 13.4064543242645 17.2066710904667 -3.80021676620219 T:C T C 10 0.537708471577085 0.369337094322803 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 28 12 40 12.9441627958416 6.45250165892502 6.4916611369166 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0403421441224436 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 42 42 84 19.4162441937624 22.5837558062376 -3.16751161247514 T:C C T 10 0.537708471577085 0.51262642635052 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 33709977 G/C 1 14 24 38 6.47208139792081 12.90500331785 -6.43292191992923 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0495165495031339 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33709864_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33709884_33710034:ELP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 10 21 31 4.62291528422915 11.2918779031188 -6.66896261888964 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0187501239498112 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 28 22 50 12.9441627958416 11.8295863746959 1.11457642114575 A:G G A 10 0.537708471577085 0.778547288112343 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 33726295 A/G 1 45 39 84 20.8031187790312 20.9706303915063 -0.167511612475142 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33726213_33726344:ELP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 70 66 136 32.3604069896041 35.4887591240876 -3.12835213448356 T:C C T 10 0.537708471577085 0.606640631229479 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 26 12 38 12.0195797389958 6.45250165892502 5.56707808007077 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0749716343033366 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:G G T 10 0.537708471577085 0.404020719410774 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 71 44 115 32.822698518027 23.6591727493917 9.16352576863522 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0925311635973753 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 78 71 149 36.0587392169874 38.177301481973 -2.11856226498567 A:G G A 10 0.537708471577085 0.74295537208781 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 T:C T C 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 C:G G C 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 106 69 175 49.002902012829 37.1018845388189 11.9010174740101 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0809613619077093 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 59780424 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000197563:ENST00000400334:exon_59780367_59780549:PIGN;ENSG00000197563:ENST00000357637:exon_59780367_59780549:PIGN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 59936142 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000134444:ENST00000398130:exon_59936102_59936181:KIAA1468;ENSG00000134444:ENST00000256858:exon_59936102_59936181:KIAA1468 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 45 34 79 20.8031187790312 18.2820880336209 2.52103074541028 T:C T C 10 0.537708471577085 0.652031770778172 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 11 23 34 5.08520681265207 12.367294846273 -7.28208803362089 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0151717141564468 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 9 16 25 4.16062375580623 8.60333554523336 -4.44271178942713 A:G G A 10 0.537708471577085 0.106767385755251 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 10 16 26 4.62291528422915 8.60333554523336 -3.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.167367402399651 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 6 25 31 2.77374917053749 13.4427117894271 -10.6689626188896 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000106494328939181 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 17 58 75 7.85895598318955 31.1870913514709 -23.3281353682814 T:C C T 10 0.537708471577085 7.12105265178876e-08 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61647069 G/A 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61647035_61647172:HMSD;ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000448851:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61647042_61647172:SERPINB8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 29 24 53 13.4064543242645 12.90500331785 0.501451006414495 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 67534642 C/T 1 15 19 34 6.93437292634373 10.2164609599646 -3.28208803362089 T:C C T 10 0.537708471577085 0.303099075262891 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67534593_67534647:CD226 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 39 19 58 18.0293696084937 10.2164609599646 7.81290864852907 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0475287483727215 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 91 54 145 42.0685290864853 29.0362574651626 13.0322716213227 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0304642154994962 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 72 39 111 33.2849900464499 20.9706303915063 12.3143596549436 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0219713143680882 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 51 41 92 23.5768679495687 22.0460473346605 1.53082061490818 T:C T C 10 0.537708471577085 0.834502881931344 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 13 1 14 6.00978986949789 0.537708471577085 5.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00255392269121495 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 72998886 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 23 6 29 10.632705153727 3.22625082946251 7.40645432426454 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00793955851582415 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 84 87 171 38.8324883875249 46.7806370272064 -7.94814863968153 A:C A C 10 0.537708471577085 0.249923425232821 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 307282 T/C 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C T C 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_307119_307536:MIER2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 T:C C T 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 579627 C/T 1 180 368 548 83.2124751161247 197.876717540367 -114.664242424243 T:C:G C T 10 0.537708471577085 8.51204151616366e-23 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 223 412 635 103.09101083831 221.535890289759 -118.444879451449 A:C:G C G 10 0.537708471577085 4.39980812895169e-21 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 343 174 517 158.56599424906 93.5612740544128 65.004720194647 T:C:G T C 10 0.537708471577085 8.22735303008904e-09 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 26 28 54 12.0195797389958 15.0558372041584 -3.03625746516259 T:C C T 10 0.537708471577085 0.416372193787875 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 806469 G/A 1 32 20 52 14.7933289095333 10.7541694315417 4.03915947799158 A:G G A 10 0.537708471577085 0.270013403253802 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_806408_806556:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_806408_806556:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_806408_806556:PTBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 808373 C/T 1 96 112 208 44.3799867285998 60.2233488166335 -15.8433620880337 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0309164171247914 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808360_808452:PTBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 25 29 54 11.5572882105729 15.5935456757355 -4.03625746516259 A:G A G 10 0.537708471577085 0.278245762661761 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 182 159 341 84.1370581729705 85.4956469807565 -1.35858880778599 A:G G A 10 0.537708471577085 0.913533419266531 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 16 7 23 7.39666445476664 3.76395930103959 3.63270515372704 T:C T C 10 0.537708471577085 0.146665846223693 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 17 7 24 7.85895598318955 3.76395930103959 4.09499668214996 A:G G A 10 0.537708471577085 0.104346466966581 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 69 59 128 31.8981154611811 31.724799823048 0.173315638133118 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 T:C C T 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 88 85 173 40.6816545012165 45.7052200840522 -5.02356558283571 T:C C T 10 0.537708471577085 0.446923524897238 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 A:G A G 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 T:C T C 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 1969882 G/T 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1969507_1969958:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1969507_1969958:CSNK1G2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 18 32 50 8.32124751161247 17.2066710904667 -8.88542357885425 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0151395438611879 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 28 41 69 12.9441627958416 22.0460473346605 -9.10188453881887 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0298673961377338 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 36 28 64 16.6424950232249 15.0558372041584 1.58665781906656 T:C T C 10 0.537708471577085 0.708928559249432 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 50 46 96 23.1145764211457 24.7345896925459 -1.62001327140016 A:G G A 10 0.537708471577085 0.759551465722888 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 15 15 30 6.93437292634373 8.06562707365627 -1.13125414731255 A:G A G 10 0.537708471577085 0.716866773759721 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2118692 C/T 1 13 18 31 6.00978986949789 9.67875248838753 -3.66896261888964 T:C C T 10 0.537708471577085 0.209536006747994 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2118600_2118831:AP3D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:G T G 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 26 17 43 12.0195797389958 9.14104401681045 2.87853572218534 A:G G A 10 0.537708471577085 0.445332200815161 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2248152 T/C 1 26 1 27 12.0195797389958 0.537708471577085 11.4818712674187 T:C T C 10 0.537708471577085 1.73969631210685e-06 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2435150 C/T 1 34 25 59 15.7179119663791 13.4427117894271 2.27520017695198 T:C C T 10 0.537708471577085 0.602700724468211 ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2434999_2435169:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000527409:exon_2434999_2435169:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000534495:exon_2435001_2435169:LMNB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 53 51 104 24.5014510064145 27.4231320504313 -2.92168104401684 A:G G A 10 0.537708471577085 0.623159196165424 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 31 29 60 14.3310373811104 15.5935456757355 -1.2625082946251 T:C T C 10 0.537708471577085 0.796208752103225 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 21 26 47 9.70812209688122 13.9804202610042 -4.272298164123 A:C A C 10 0.537708471577085 0.242447065533164 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2767192 G/T 1 20 17 37 9.2458305684583 9.14104401681045 0.104786551647853 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 3641744 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3641703_3641807:PIP5K1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 13 14 27 6.00978986949789 7.52791860207919 -1.5181287325813 T:C C T 10 0.537708471577085 0.569107461757469 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 110 156 266 50.8520681265206 83.8825215660253 -33.0304534395046 A:T:C C T 10 0.537708471577085 5.93212080167248e-05 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 3982967 G/A 1 893 929 1822 412.826334881663 499.531170095112 -86.7048352134489 A:G G A 10 0.537708471577085 4.7731281320145e-05 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3982805_3983016:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3982805_3983016:EEF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 835 877 1712 386.013426233134 471.570329573104 -85.5569033399696 A:G A G 10 0.537708471577085 3.73111443165993e-05 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 225 180 405 104.015593895156 96.7875248838753 7.22806901128057 A:G G A 10 0.537708471577085 0.485638261795313 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 265 205 470 122.507255032072 110.230236673302 12.2770183587701 A:G A G 10 0.537708471577085 0.267014444280874 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 18 25 43 8.32124751161247 13.4427117894271 -5.12146427781466 T:C T C 10 0.537708471577085 0.127617957773552 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 22 25 47 10.1704136253041 13.4427117894271 -3.272298164123 T:C C T 10 0.537708471577085 0.38111269787031 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4267681 C/T 1 11 20 31 5.08520681265207 10.7541694315417 -5.66896261888964 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0474794148830212 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4267621_4267771:CCDC94 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 4 11 15 1.84916611369166 5.91479318734793 -4.06562707365627 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0400794641262981 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 18 24 42 8.32124751161247 12.90500331785 -4.58375580623757 C:G G C 10 0.537708471577085 0.166192807586473 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 16 20 36 7.39666445476664 10.7541694315417 -3.35750497677506 A:G G A 10 0.537708471577085 0.316301305683294 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C C T 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 18 25 43 8.32124751161247 13.4427117894271 -5.12146427781466 A:G G A 10 0.537708471577085 0.127617957773552 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 52 48 100 24.0391594779916 25.8100066357001 -1.7708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.763865407069295 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 15 6 21 6.93437292634373 3.22625082946251 3.70812209688121 A:G A G 10 0.537708471577085 0.126832789288604 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 82 75 157 37.907905330679 40.3281353682814 -2.42023003760234 A:G G A 10 0.537708471577085 0.748976858552892 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 61 64 125 28.1997832337978 34.4133421809334 -6.21355894713563 T:C T C 10 0.537708471577085 0.282237114899774 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 6665020 T/C 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000366236:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000326176:exon_6664568_6665361:TNFSF14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 7506808 C/T 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7506798_7506938:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7506798_7506938:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7506798_7506938:ARHGEF18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 59 42 101 27.275200176952 22.5837558062376 4.69144437071441 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.370283546559845 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 7998386 G/C 1 36 22 58 16.6424950232249 11.8295863746959 4.81290864852907 C:G G C 10 0.537708471577085 0.236385859284525 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7998370_7998455:TIMM44 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 8122767 T/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8122688_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8122685_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8122685_8122804:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000458625:exon_8122685_8122804:CCL25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 8551112 G/T 1 291 268 559 134.526834771068 144.105870382659 -9.57903561159054 T:G G T 10 0.537708471577085 0.42057364560836 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 6 13 19 2.77374917053749 6.99021013050211 -4.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0651882753473269 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 9452868 G/A 1 5 15 20 2.31145764211457 8.06562707365627 -5.7541694315417 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0123405034641124 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 9452879 C/A 1 5 18 23 2.31145764211457 9.67875248838753 -7.36729484627296 A:C C A 10 0.537708471577085 0.00263314174392549 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 35 26 61 16.180203494802 13.9804202610042 2.19978323379781 A:G A G 10 0.537708471577085 0.609199822605975 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 9524272 T/C 1 28 21 49 12.9441627958416 11.2918779031188 1.65228489272284 T:C T C 10 0.537708471577085 0.669639477256263 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 9524715 A/G 1 26 29 55 12.0195797389958 15.5935456757355 -3.57396593673968 A:G A G 10 0.537708471577085 0.346724666909935 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 117 119 236 54.0881088254811 63.9873081176731 -9.89919929219207 C:G C G 10 0.537708471577085 0.214789776555211 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 C:G C G 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 31 44 75 14.3310373811104 23.6591727493917 -9.32813536828137 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0365878370737275 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 370 406 776 171.047865516479 218.309639460297 -47.261773943818 A:G A G 10 0.537708471577085 0.000707042263179464 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 313 329 642 144.697248396372 176.906087148861 -32.2088387524886 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0112766971772862 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10265593 G/T 1 44 36 80 20.3408272506083 19.3575049767751 0.983322273833199 T:G G T 10 0.537708471577085 0.910823676752625 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C T C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 C:G C G 10 0.537708471577085 0.764222193284696 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 464 493 957 214.503269188233 265.090276487503 -50.5870072992704 C:G C G 10 0.537708471577085 0.00117662950610759 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10445165 C/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:C C A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10463118 G/C 1 79 94 173 36.5210307454103 50.544596328246 -14.0235655828357 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0329681535251343 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525976:exon_10463110_10463168:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463110_10463227:TYK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:C C A 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 9 24 33 4.16062375580623 12.90500331785 -8.74437956204381 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00260992442152392 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 21 20 41 9.70812209688122 10.7541694315417 -1.04604733466049 A:C C A 10 0.537708471577085 0.756529286407691 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10610236 A/G 1 42 26 68 19.4162441937624 13.9804202610042 5.43582393275822 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.223747201881790 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10610071_10610756:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10610071_10610756:KEAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 25 21 46 11.5572882105729 11.2918779031188 0.26541030745409 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 21 22 43 9.70812209688122 11.8295863746959 -2.12146427781465 T:C C T 10 0.537708471577085 0.543432694239044 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10738639 C/T 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 T:C C T 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10742170 A/G 1 26 13 39 12.0195797389958 6.99021013050211 5.02936960849368 A:G A G 10 0.537708471577085 0.111262902214625 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 126 108 234 58.2487325812873 58.0725149303252 0.176217650962101 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 38 60 98 17.5670780800708 32.2625082946251 -14.6954302145543 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00319048422071819 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 11034039 T/A 1 31 33 64 14.3310373811104 17.7443795620438 -3.41334218093344 A:T T A 10 0.537708471577085 0.452263781258314 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11033948_11034083:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11033948_11034083:YIPF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 11210912 C/T 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11210899_11211021:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11210899_11211021:LDLR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 T:C T C 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 11233941 A/G 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G A G 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11233850_11234020:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11233850_11234020:LDLR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12059543 G/A 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 A:G G A 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12059645 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12060786 A/G 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:G A G 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12541795 C/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180855:ENST00000301547:exon_12540521_12542794:ZNF443;ENSG00000180855:ENST00000411622:exon_12541336_12542794:ZNF443 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 39 46 85 18.0293696084937 24.7345896925459 -6.70522008405223 A:G G A 10 0.537708471577085 0.157706155728612 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12780179 G/A 1 142 154 296 65.6453970360539 82.8071046228711 -17.1617075868172 A:G G A 10 0.537708471577085 0.047494985129843 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12780168_12780465:C19orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12800851 G/A 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800776_12800924:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800776_12801014:FBXW9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12805431 T/C 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12805525 G/C 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 C:G G C 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12807066 G/C 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 C:G G C 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12807187 C/T 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12812169 A/G 1 18 12 30 8.32124751161247 6.45250165892502 1.86874585268745 A:G A G 10 0.537708471577085 0.584248594892217 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12813683 T/C 1 19 21 40 8.78353904003538 11.2918779031188 -2.5083388630834 T:C T C 10 0.537708471577085 0.433124807120697 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12814544 A/G 1 20 14 34 9.2458305684583 7.52791860207919 1.71791196637911 A:G A G 10 0.537708471577085 0.608645173355244 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12814528_12814615:TNPO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12874034 G/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000095066:ENST00000397668:exon_12873817_12874245:HOOK2;ENSG00000095066:ENST00000264827:exon_12873817_12874245:HOOK2;ENSG00000095066:ENST00000421850:exon_12873817_12874245:HOOK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12917520 A/G 1 39 51 90 18.0293696084937 27.4231320504313 -9.39376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0565263109114143 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12920935 G/A 1 74 103 177 34.2095731032957 55.3839725724398 -21.174399469144 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00150656905593356 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12921186 T/C 1 78 98 176 36.0587392169874 52.6954302145543 -16.636690997567 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0125545260251693 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 32 49 81 14.7933289095333 26.3477151072772 -11.5543861977439 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0103955696406641 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 13010520 A/G 1 30 62 92 13.8687458526875 33.3379252377793 -19.4691793850918 A:G A G 10 0.537708471577085 5.66265899053032e-05 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 13211843 C/T 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000104903:ENST00000264824:exon_13211651_13212009:LYL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 22 21 43 10.1704136253041 11.2918779031188 -1.12146427781465 A:G A G 10 0.537708471577085 0.761366051085368 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 13873707 A/C 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13873404_13874106:CCDC130 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14023191 G/A 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14023136_14023251:CC2D1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14029592 C/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14029559_14029630:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14029559_14029630:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14029559_14029630:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14029559_14029630:CC2D1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14038819 C/G 1 14 6 20 6.47208139792081 3.22625082946251 3.2458305684583 C:G C G 10 0.537708471577085 0.180236988291815 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14492297 T/G 1 22 10 32 10.1704136253041 5.37708471577085 4.79332890953328 T:G T G 10 0.537708471577085 0.110154772944342 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14520959 C/T 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 T:C C T 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14523988 T/C 1 270 282 552 124.818712674187 151.633788984738 -26.8150763105509 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0236155262843277 ENSG00000123136:ENST00000242776:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000451994:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000324340:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000454233:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000455481:exon_14523363_14524036:DDX39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14581045 G/A 1 114 129 243 52.7012342402123 69.364392833444 -16.6631585932317 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0337239758965058 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 29 22 51 13.4064543242645 11.8295863746959 1.57686794956867 A:G G A 10 0.537708471577085 0.676477441591633 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 93 93 186 42.9931121433311 50.0068878566689 -7.01377571333781 C:G G C 10 0.537708471577085 0.304358574254928 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14884751 G/A 1 20 1 21 9.2458305684583 0.537708471577085 8.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 7.02704293489853e-05 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 14884841 G/A 1 12 1 13 5.54749834107498 0.537708471577085 5.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00453511442282378 ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14884750_14884866:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392962:exon_14884750_14884866:EMR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 15 16 31 6.93437292634373 8.60333554523336 -1.66896261888964 A:G G A 10 0.537708471577085 0.591762951419813 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 16197320 T/C 1 109 70 179 50.3897765980977 37.6395930103959 12.7501835877018 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0608060638733373 ENSG00000167460:ENST00000344824:exon_16197233_16197350:TPM4;ENSG00000167460:ENST00000300933:exon_16197233_16197350:TPM4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 16259623 C/T 1 24 16 40 11.09499668215 8.60333554523336 2.4916611369166 T:C C T 10 0.537708471577085 0.526471697646376 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 33 43 76 15.2556204379562 23.1214642778147 -7.86584383985846 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0838915823599938 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 16976289 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16976221_16976459:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16976221_16976459:SIN3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17283657 C/T 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17283568_17283772:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17283568_17283772:MYO9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17305781 T/G 1 29 42 71 13.4064543242645 22.5837558062376 -9.17730148197303 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0320059160234622 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 40 50 90 18.4916611369166 26.8854235788543 -8.39376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0902782451321108 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 42 41 83 19.4162441937624 22.0460473346605 -2.62980314089805 T:C T C 10 0.537708471577085 0.583339218622975 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 33 33 66 15.2556204379562 17.7443795620438 -2.48875912408761 A:G A G 10 0.537708471577085 0.540214725719138 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17322800 T/C 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 T:C T C 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322704_17324103:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322704_17324103:MYO9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17412399 G/A 1 1 8 9 0.462291528422915 4.30166777261668 -3.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0148173128089584 ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17417080 C/T 1 83 71 154 38.3701968591019 38.177301481973 0.192895377128906 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000130312:ENST00000252602:exon_17416975_17417652:MRPL34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 108 91 199 49.9274850696748 48.9314709135147 0.996014156160079 A:G A G 10 0.537708471577085 0.943349860811933 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 7 15 22 3.23604069896041 8.06562707365627 -4.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0524787665296475 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 147 130 277 67.9568546781685 69.902101305021 -1.94524662685255 A:T:C:G T G 10 0.537708471577085 0.856591043556422 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18180451 A/G 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18180356_18180523:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18180356_18180523:IL12RB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18497137 G/A 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:T T A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18499238 G/T 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 13 6 19 6.00978986949789 3.22625082946251 2.78353904003538 A:C A C 10 0.537708471577085 0.252246477906020 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 21 33 54 9.70812209688122 17.7443795620438 -8.03625746516259 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0294700674029151 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18547209 G/A 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18547140_18547289:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18547140_18547289:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18547140_18547289:ISYNA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18652521 G/A 1 147 122 269 67.9568546781685 65.6004335324044 2.35642114576413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.806881195607144 ENSG00000105701:ENST00000222308:exon_18652489_18652805:FKBP8;ENSG00000105701:ENST00000453489:exon_18652489_18652805:FKBP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18679351 C/T 1 78 60 138 36.0587392169874 32.2625082946251 3.79623092236227 T:C C T 10 0.537708471577085 0.550596461589598 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18679379 C/G 1 61 67 128 28.1997832337978 36.0264675956647 -7.82668436186689 C:G C G 10 0.537708471577085 0.183591694797969 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 0 83 0 83 38.3701968591019 0 38.3701968591019 C C 10 0.537708471577085 6.6207220468281e-23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 170 175 345 78.5895598318955 94.0989825259899 -15.5094226940943 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0944912267293003 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19390185 G/A 1 49 34 83 22.6522848927228 18.2820880336209 4.37019685910195 A:G G A 10 0.537708471577085 0.37891329186374 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19413092 C/T 1 20 22 42 9.2458305684583 11.8295863746959 -2.58375580623757 T:C C T 10 0.537708471577085 0.442687948829403 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19413074_19413197:SUGP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 13 18 31 6.00978986949789 9.67875248838753 -3.66896261888964 A:G G A 10 0.537708471577085 0.209536006747994 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 114 68 182 52.7012342402123 36.5641760672418 16.1370581729705 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0172626300863533 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 19746266 G/A 1 38 12 50 17.5670780800708 6.45250165892502 11.1145764211457 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00159190002861207 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19746224_19746378:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19746224_19746378:GMIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 30308425 A/G 1 16 9 25 7.39666445476664 4.83937624419377 2.55728821057287 A:G A G 10 0.537708471577085 0.324405864269745 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30308313_30308448:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30308313_30308448:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30308313_30308448:CCNE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 30314666 C/T 1 27 23 50 12.4818712674187 12.367294846273 0.114576421145749 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105173:ENST00000262643:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000357943:exon_30314562_30315216:CCNE1;ENSG00000105173:ENST00000444983:exon_30314562_30315216:CCNE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 7 18 25 3.23604069896041 9.67875248838753 -6.44271178942713 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0144006996689902 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 16 8 24 7.39666445476664 4.30166777261668 3.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.225523458259253 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 12 3 15 5.54749834107498 1.61312541473126 3.93437292634373 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0663410983131874 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 13 5 18 6.00978986949789 2.68854235788543 3.32124751161247 T:C T C 10 0.537708471577085 0.155917874781449 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 T:C C T 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 72 62 134 33.2849900464499 33.3379252377793 -0.0529351913293965 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 306 295 601 141.461207697412 158.62399911524 -17.1627914178281 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.164362616946067 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35232677 G/A 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35233027 C/T 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 31 26 57 14.3310373811104 13.9804202610042 0.350617120106154 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 27 16 43 12.4818712674187 8.60333554523336 3.87853572218534 A:G G A 10 0.537708471577085 0.284716734596316 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 43 32 75 19.8785357221853 17.2066710904667 2.67186463171862 C:G G C 10 0.537708471577085 0.564236789942497 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 151 170 321 69.8060207918602 91.4104401681045 -21.6044193762443 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0160794289554525 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 222 184 406 102.628719309887 98.9383587701836 3.69036053970349 T:C T C 10 0.537708471577085 0.727743398428334 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 26 15 41 12.0195797389958 8.06562707365627 3.95395266533951 T:C T C 10 0.537708471577085 0.272848330107385 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 11 15 26 5.08520681265207 8.06562707365627 -2.98042026100421 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246384011673615 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 109 109 218 50.3897765980977 58.6102234019023 -8.22044680380453 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.277400939855079 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37005298 A/G 1 18 8 26 8.32124751161247 4.30166777261668 4.01957973899579 A:G A G 10 0.537708471577085 0.120662749572848 ENSG00000254004:ENST00000523638:exon_37001597_37006601:ZNF260 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37117302 A/G 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37118439 C/T 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 T:C C T 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37209866 T/C 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:G A G 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37733732 T/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C T C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000188283:ENST00000392155:exon_37733371_37734823:ZNF383;ENSG00000188283:ENST00000352998:exon_37733371_37734566:ZNF383 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 37854440 C/T 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 38782485 G/C 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167642:ENST00000301244:exon_38782480_38783108:SPINT2;ENSG00000167642:ENST00000454580:exon_38782480_38783086:SPINT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 55 49 104 25.4260340632603 26.3477151072772 -0.921681044016839 T:C T C 10 0.537708471577085 0.921727657483697 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 43 41 84 19.8785357221853 22.0460473346605 -2.16751161247514 A:G G A 10 0.537708471577085 0.662533504535434 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 38893856 G/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893775_38893858:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893775_38893858:FAM98C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 62 55 117 28.6620747622207 29.5739659367397 -0.911891174518946 T:C C T 10 0.537708471577085 0.926185353776267 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 39224413 A/G 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 A:G A G 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000182472:ENST00000328867:exon_39224343_39224421:CAPN12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 39421388 A/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421348_39421638:MRPS12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 39888390 G/C 1 29 51 80 13.4064543242645 27.4231320504313 -14.0166777261668 C:G G C 10 0.537708471577085 0.00225777744058902 ENSG00000063322:ENST00000315588:exon_39888097_39891201:MED29;ENSG00000063322:ENST00000435462:exon_39888167_39888397:MED29 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 40739513 A/G 1 36 36 72 16.6424950232249 19.3575049767751 -2.71500995355012 A:G A G 10 0.537708471577085 0.555551267500018 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 37 25 62 17.1047865516479 13.4427117894271 3.66207476222073 T:C T C 10 0.537708471577085 0.374834510208701 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 40947448 A/G 1 29 16 45 13.4064543242645 8.60333554523336 4.80311877903118 A:G A G 10 0.537708471577085 0.178688555057044 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 40947751 G/A 1 13 7 20 6.00978986949789 3.76395930103959 2.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.373996220974877 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41086309 G/C 1 30 36 66 13.8687458526875 19.3575049767751 -5.48875912408761 C:G G C 10 0.537708471577085 0.177274509313677 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41086230_41086391:SHKBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 24 22 46 11.09499668215 11.8295863746959 -0.73458969254591 A:G A G 10 0.537708471577085 0.882918923297102 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41209689 G/A 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209620_41209760:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209620_41209760:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209620_41209760:ADCK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41220029 G/A 1 17 9 26 7.85895598318955 4.83937624419377 3.01957973899579 A:G G A 10 0.537708471577085 0.325511582559439 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41219972_41220038:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41219972_41220038:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41219972_41220038:ADCK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41220529 C/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41220436_41220540:ADCK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41847860 G/A 1 194 202 396 89.6845565140455 108.617111258571 -18.9325547445257 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.0621019331061964 ENSG00000105329:ENST00000221930:exon_41847788_41847935:TGFB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C T C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 42383128 G/A 1 1124 1132 2256 519.615677947356 608.68598982526 -89.0703118779038 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.000184787132957150 ENSG00000105369:ENST00000221972:exon_42383060_42383359:CD79A;ENSG00000105369:ENST00000444740:exon_42383060_42383245:CD79A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 42407495 G/A 1 53 55 108 24.5014510064145 29.5739659367397 -5.07251493032518 A:G G A 10 0.537708471577085 0.336011152295479 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42407457_42407557:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42407457_42407557:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42407457_42407557:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42407457_42407557:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42407457_42407557:ARHGEF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44237525 C/T 1 16 29 45 7.39666445476664 15.5935456757355 -8.19688122096882 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0163422543504543 ENSG00000105771:ENST00000270066:exon_44237476_44237604:C19orf61 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44352665 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000159882:ENST00000324461:exon_44351091_44353307:ZNF230 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 17 22 39 7.85895598318955 11.8295863746959 -3.97063039150632 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.260706150734874 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 14 7 21 6.47208139792081 3.76395930103959 2.70812209688122 A:G A G 10 0.537708471577085 0.278097360713847 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 C:G G C 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:C T C 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44500701 C/T 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 7 15 22 3.23604069896041 8.06562707365627 -4.82958637469587 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0524787665296475 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:C C A 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44535999 G/T 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 T:G G T 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 T:C T C 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44660967 A/G 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000159905:ENST00000426739:exon_44660405_44664462:ZNF234;ENSG00000159905:ENST00000244316:exon_44660405_44664462:ZNF234 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44739303 T/C 1 11 10 21 5.08520681265207 5.37708471577085 -0.291877903118785 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 T:C T C 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 6 17 23 2.77374917053749 9.14104401681045 -6.36729484627296 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0106123451504064 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44981832 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 44981837 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 62 51 113 28.6620747622207 27.4231320504313 1.2389427117894 T:C T C 10 0.537708471577085 0.850679382696077 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45397229 G/A 1 23 49 72 10.632705153727 26.3477151072772 -15.7150099535501 A:G G A 10 0.537708471577085 0.000214796433923565 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45397218_45397323:TOMM40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45476422 T/C 1 14 6 20 6.47208139792081 3.22625082946251 3.2458305684583 T:C T C 10 0.537708471577085 0.180236988291815 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 22 20 42 10.1704136253041 10.7541694315417 -0.583755806237571 T:C T C 10 0.537708471577085 0.878081350508644 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45912113 C/T 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 T:C C T 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45912421 C/A 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 A:C C A 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 25 36 61 11.5572882105729 19.3575049767751 -7.80021676620219 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0535375612346371 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46124517 C/T 1 20 22 42 9.2458305684583 11.8295863746959 -2.58375580623757 T:C C T 10 0.537708471577085 0.442687948829403 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 15 24 39 6.93437292634373 12.90500331785 -5.97063039150632 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0759598920393636 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46268902 C/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 C:G G C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46289503 C/T 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 34 28 62 15.7179119663791 15.0558372041584 0.66207476222073 T:C C T 10 0.537708471577085 0.899241664952945 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 105 100 205 48.5406104844061 53.7708471577085 -5.23023667330243 A:G G A 10 0.537708471577085 0.483991992050276 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47584869 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47584770_47584879:ZC3H4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47585517 G/C 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47585441_47585552:ZC3H4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47764017 G/A 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47763845_47764096:CCDC9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 C:G G C 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 22 14 36 10.1704136253041 7.52791860207919 2.64249502322494 A:C A C 10 0.537708471577085 0.407547472378046 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 14 8 22 6.47208139792081 4.30166777261668 2.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.398447526729543 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 134 161 295 61.9470648086706 86.5710639239107 -24.6239991152401 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.00419508805569547 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49132575 C/T 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49132118_49133030:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131938_49132983:SPHK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49132581 G/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:G G T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131938_49133661:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49132118_49133030:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131938_49132983:SPHK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 38 46 84 17.5670780800708 24.7345896925459 -7.16751161247514 A:G G A 10 0.537708471577085 0.125988189666242 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 872 836 1708 403.118212784782 449.524282238443 -46.4060694536612 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0255584711685287 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49838891 C/A 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 A:C C A 10 0.537708471577085 0.357641264994696 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49842610 G/A 1 199 208 407 91.9960141561601 111.843362088034 -19.8473479318736 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.0524357336407564 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49842587_49842670:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49842587_49842670:CD37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49949652 G/A 1 41 21 62 18.9539526653395 11.2918779031188 7.66207476222073 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0560567290945694 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 70 57 127 32.3604069896041 30.6493828798938 1.71102410971021 T:C C T 10 0.537708471577085 0.789961750807687 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 62 71 133 28.6620747622207 38.177301481973 -9.51522671975231 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0993014607035919 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 89 72 161 41.1439460296394 38.7150099535501 2.42893607608931 T:C C T 10 0.537708471577085 0.752037447907984 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 86 68 154 39.7570714443707 36.5641760672418 3.19289537712891 T:G T G 10 0.537708471577085 0.62842805242768 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 C:G C G 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 18 13 31 8.32124751161247 6.99021013050211 1.33103738111036 T:G T G 10 0.537708471577085 0.720040722682083 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 134 132 266 61.9470648086706 70.9775182481752 -9.0304534395046 C:G C G 10 0.537708471577085 0.269065128104104 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 28 17 45 12.9441627958416 9.14104401681045 3.80311877903118 A:G G A 10 0.537708471577085 0.296310268066239 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 50865535 A/G 1 11 12 23 5.08520681265207 6.45250165892502 -1.36729484627296 A:G A G 10 0.537708471577085 0.676984403272827 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50865429_50865570:NAPSA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 41 34 75 18.9539526653395 18.2820880336209 0.671864631718623 T:C C T 10 0.537708471577085 0.90823715180425 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 265 237 502 122.507255032072 127.436907763769 -4.92965273169666 T:C C T 10 0.537708471577085 0.68710983578979 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 256 255 511 118.346631276266 137.115660252157 -18.7690289758904 A:G G A 10 0.537708471577085 0.100675533535889 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 52376507 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000161551:ENST00000301399:exon_52374535_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000440236:exon_52374555_52376959:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000420592:exon_52375252_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000451628:exon_52375710_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000342582:exon_52375785_52376782:ZNF577;ENSG00000161551:ENST00000458390:exon_52375803_52376959:ZNF577 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 52538428 A/G 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 52825032 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198464:ENST00000468240:exon_52824832_52826949:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000490272:exon_52824832_52826933:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000429434:exon_52824832_52829163:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000335090:exon_52824832_52827333:ZNF480;ENSG00000198464:ENST00000391790:exon_52824832_52829163:ZNF480 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 1 12 13 0.462291528422915 6.45250165892502 -5.99021013050211 A:C A C 10 0.537708471577085 0.00102418715137750 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 13 14 0.462291528422915 6.99021013050211 -6.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.000520847712963593 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53116811 C/T 1 17 31 48 7.85895598318955 16.6689626188896 -8.81000663570008 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0132202680164490 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53115620_53116929:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53115620_53116929:ZNF83 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 2 13 15 0.92458305684583 6.99021013050211 -6.06562707365627 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00277293959067293 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53384197 A/G 1 2 14 16 0.92458305684583 7.52791860207919 -6.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00151244974005012 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53454387 G/C 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53572917 G/A 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 A:G G A 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:G G A 10 0.537708471577085 0.310917325775001 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53959567 A/G 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.127220955139885 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 C:G G C 10 0.537708471577085 0.203557386113131 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 53959745 T/C 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:C T C 10 0.537708471577085 0.126520667746762 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 54080279 T/C 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 54080780 C/T 1 6 13 19 2.77374917053749 6.99021013050211 -4.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0651882753473269 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54080698_54080944:ZNF331 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 54080999 A/G 1 9 31 40 4.16062375580623 16.6689626188896 -12.5083388630834 A:G A G 10 0.537708471577085 8.67619585347494e-05 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 A:G A G 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55441902 T/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000167634:ENST00000340844:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000328092:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000446217:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000448121:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000427260:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000399724:exon_55441882_55441965:NLRP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 30 35 65 13.8687458526875 18.819796505198 -4.95105065251052 A:C C A 10 0.537708471577085 0.262775988274422 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 27 41 68 12.4818712674187 22.0460473346605 -9.56417606724178 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0209833976569985 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 37 28 65 17.1047865516479 15.0558372041584 2.04894934748948 T:G T G 10 0.537708471577085 0.621665983160248 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55899602 C/T 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 T:C C T 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55967848 C/T 1 63 85 148 29.1243662906436 45.7052200840522 -16.5808537934086 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00649044585772487 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55967716_55967856:ISOC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 55995118 C/A 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 A:C C A 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 T:G G T 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 T:C C T 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 A:G G A 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 75 58 133 34.6718646317186 31.1870913514709 3.4847732802477 A:G A G 10 0.537708471577085 0.602019372464866 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58083467 C/T 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:G A G 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 A:G A G 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58991638 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 A:G G A 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 3483181 C/T 1 65 59 124 30.0489493474895 31.724799823048 -1.67585047555854 T:C C T 10 0.537708471577085 0.787427989066621 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 11 21 32 5.08520681265207 11.2918779031188 -6.20667109046672 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0328191691109926 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 9634856 A/G 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9634831_9634989:IAH1;ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9634766_9634896:ADAM17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 10942702 G/A 1 74 72 146 34.2095731032957 38.7150099535501 -4.50543685025441 A:G G A 10 0.537708471577085 0.456520610322817 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 38 26 64 17.5670780800708 13.9804202610042 3.58665781906656 T:C C T 10 0.537708471577085 0.383257513389584 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 15763639 A/G 1 81 86 167 37.4456138022561 46.2429285556293 -8.7973147533732 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.187100250234808 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15763560_15763706:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15763560_15763706:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000470674:exon_15763560_15763706:DDX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 14 22 36 6.47208139792081 11.8295863746959 -5.35750497677506 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0935977510488975 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 17897488 T/C 1 18 28 46 8.32124751161247 15.0558372041584 -6.73458969254591 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0541715807823202 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17897353_17897531:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17897353_17897531:SMC6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 17962450 A/G 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 17962518 C/T 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 T:C C T 10 0.537708471577085 0.194255499810311 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 20403957 C/T 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000447124:exon_20403913_20404052:SDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 24253974 T/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C T C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000163026:ENST00000295148:exon_24252210_24254032:C2orf44;ENSG00000163026:ENST00000406895:exon_24252217_24254032:C2orf44 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:G T G 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 33 38 71 15.2556204379562 20.4329219199292 -5.17730148197304 T:C T C 10 0.537708471577085 0.234954750675825 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 16 29 45 7.39666445476664 15.5935456757355 -8.19688122096882 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0163422543504543 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 A:G G A 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 A:G A G 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27462076 C/T 1 24 15 39 11.09499668215 8.06562707365627 3.02936960849368 T:C C T 10 0.537708471577085 0.341475003103099 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461910_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27461986_27462100:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462020_27462100:CAD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 35 37 72 16.180203494802 19.8952134483521 -3.71500995355012 A:G A G 10 0.537708471577085 0.40907789554974 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27667297 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27667238_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27667244_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27667265_27667388:IFT172 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 A:C C A 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 18 10 28 8.32124751161247 5.37708471577085 2.94416279584162 A:C C A 10 0.537708471577085 0.343745041558555 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 22 23 45 10.1704136253041 12.367294846273 -2.19688122096882 T:C:G C G 10 0.537708471577085 0.551606420592295 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 55 57 112 25.4260340632603 30.6493828798938 -5.22334881663352 A:G A G 10 0.537708471577085 0.343900054377931 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 113 110 223 52.2389427117894 59.1479318734794 -6.90898916168996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.38270204620078 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 29356669 A/G 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 42 45 87 19.4162441937624 24.1968812209688 -4.7806370272064 T:C T C 10 0.537708471577085 0.333655790544249 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 32740138 T/C 1 13 4 17 6.00978986949789 2.15083388630834 3.85895598318955 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0863743251363987 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32740057_32740837:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32740057_32740837:BIRC6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 19 18 37 8.78353904003538 9.67875248838753 -0.895213448352147 T:C C T 10 0.537708471577085 0.869367207004994 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 122 113 235 56.3995664675956 60.7610572882106 -4.36149082061498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.600853874244237 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 37454998 A/G 1 51 31 82 23.5768679495687 16.6689626188896 6.90790533067903 A:G A G 10 0.537708471577085 0.149603197811526 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 37455232 C/A 1 36 44 80 16.6424950232249 23.6591727493917 -7.0166777261668 A:C C A 10 0.537708471577085 0.118004500565558 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 37459308 C/G 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 C:G C G 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000416653:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000469831:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37459249_37459409:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000432075:exon_37459249_37459409:C2orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 T:G T G 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 38604351 A/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38604285_38604427:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38604285_38604432:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38604285_38604403:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38604285_38604398:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000456736:exon_38604285_38604404:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000474535:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000472097:exon_38604285_38604415:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000451483:exon_38604285_38604421:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000416222:exon_38604285_38604415:ATL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:G A G 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 42556022 A/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:T A T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 A:C C A 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 C:G G C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:G T G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:T T A 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 43452183 A/G 1 4 14 18 1.84916611369166 7.52791860207919 -5.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0084453389165878 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 43797619 C/T 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43797527_43797652:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43797527_43797654:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43797527_43797649:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43797527_43797649:THADA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 9 14 23 4.16062375580623 7.52791860207919 -3.36729484627296 T:C T C 10 0.537708471577085 0.209192911108316 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 44028013 A/T 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:T A T 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 45 39 84 20.8031187790312 20.9706303915063 -0.167511612475142 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 48713777 C/T 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 T:C C T 10 0.537708471577085 0.194255499810311 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000442041:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48713770_48713897:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000455978:exon_48713770_48713897:KLRAQ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 53992593 A/T 1 11 16 27 5.08520681265207 8.60333554523336 -3.5181287325813 A:T A T 10 0.537708471577085 0.182622328871397 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53992514_53992686:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000446049:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000470916:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000480522:exon_53992514_53992698:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000489508:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000414369:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482134:exon_53992514_53992722:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000459916:exon_53992514_53992722:ASB3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 16 30 46 7.39666445476664 16.1312541473125 -8.73458969254591 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0114629543579611 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 17 22 39 7.85895598318955 11.8295863746959 -3.97063039150632 A:T A T 10 0.537708471577085 0.260706150734874 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 26 34 60 12.0195797389958 18.2820880336209 -6.2625082946251 A:G G A 10 0.537708471577085 0.120192290624851 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 16 13 29 7.39666445476664 6.99021013050211 0.406454324264534 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54135936 T/C 1 14 16 30 6.47208139792081 8.60333554523336 -2.13125414731255 T:C T C 10 0.537708471577085 0.467885000124991 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54135921_54135977:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54135921_54135938:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000461810:exon_54135921_54135980:PSME4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54849508 A/G 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54849437_54849624:SPTBN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 33 26 59 15.2556204379562 13.9804202610042 1.27520017695198 A:G G A 10 0.537708471577085 0.794729414690578 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 T:C T C 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 T:G G T 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 55912120 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 32 41 73 14.7933289095333 22.0460473346605 -7.25271842512721 A:G A G 10 0.537708471577085 0.100213797019117 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 51 56 107 23.5768679495687 30.1116744083168 -6.53480645874809 A:G A G 10 0.537708471577085 0.209037606080551 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 61275771 C/G 1 24 21 45 11.09499668215 11.2918779031188 -0.196881220968825 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000162928:ENST00000295030:exon_61275607_61276394:PEX13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 61468761 T/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000463046:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453734:exon_61468695_61468790:USP34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 62069358 T/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C T C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62069257_62069495:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62069257_62069495:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62069257_62069495:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62069257_62069495:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62069257_62069495:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62069257_62069495:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62069257_62069495:FAM161A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 63176075 G/A 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 A:G G A 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 63176179 A/G 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G A G 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 64780144 A/G 1 66 54 120 30.5112408759124 29.0362574651626 1.4749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.854827667581094 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409183:exon_64779646_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000487769:exon_64780010_64780543:AFTPH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 65216798 C/A 1 6 13 19 2.77374917053749 6.99021013050211 -4.21646095996462 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0651882753473269 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 19 22 41 8.78353904003538 11.8295863746959 -3.04604733466049 A:G G A 10 0.537708471577085 0.351754139410368 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 31 28 59 14.3310373811104 15.0558372041584 -0.724799823048015 A:G G A 10 0.537708471577085 0.896462081940595 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 282 233 515 130.366211015262 125.286073877461 5.08013713780122 A:G G A 10 0.537708471577085 0.658852390912503 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 14 10 24 6.47208139792081 5.37708471577085 1.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.687878182736171 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 35 35 70 16.180203494802 18.819796505198 -2.63959301039595 A:G A G 10 0.537708471577085 0.550478294578422 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 69040500 G/A 1 11 4 15 5.08520681265207 2.15083388630834 2.93437292634373 A:G G A 10 0.537708471577085 0.194255499810311 ENSG00000163219:ENST00000463483:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409202:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000295381:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000456116:exon_69040419_69040526:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000467265:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000488795:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409030:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409220:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000473986:exon_69040421_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497079:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000482106:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497259:exon_69040419_69040551:ARHGAP25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 26 12 38 12.0195797389958 6.45250165892502 5.56707808007077 A:T A T 10 0.537708471577085 0.0749716343033366 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 119 111 230 55.0126918823269 59.6856403450564 -4.67294846272955 A:G G A 10 0.537708471577085 0.552141480164584 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 92 105 197 42.5308206149082 56.4593895155939 -13.9285689006857 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0534461260337012 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 22 26 48 10.1704136253041 13.9804202610042 -3.81000663570008 A:C C A 10 0.537708471577085 0.311466911643396 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71351487 G/A 1 31 24 55 14.3310373811104 12.90500331785 1.42603406326032 A:G G A 10 0.537708471577085 0.7871999794463 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 81 48 129 37.4456138022561 25.8100066357001 11.635607166556 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0422460530977473 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71417134 C/T 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C C T 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71631109 A/G 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71631000_71631128:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71630980_71631128:ZNF638 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71633275 T/C 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 T:C T C 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 11 18 29 5.08520681265207 9.67875248838753 -4.59354567573547 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0957464810231972 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 67 62 129 30.9735324043353 33.3379252377793 -2.36439283344397 A:G G A 10 0.537708471577085 0.72413696649818 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 37 36 73 17.1047865516479 19.3575049767751 -2.25271842512721 A:G A G 10 0.537708471577085 0.639420172102003 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 38 37 75 17.5670780800708 19.8952134483521 -2.32813536828138 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.643674253902272 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74688563 C/T 1 59 65 124 27.275200176952 34.9510506525105 -7.67585047555854 T:C C T 10 0.537708471577085 0.177156679408648 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 37 28 65 17.1047865516479 15.0558372041584 2.04894934748948 A:G G A 10 0.537708471577085 0.621665983160248 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74719154 T/C 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74719131_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74719131_74719182:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74719131_74719182:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74719071_74719182:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74719131_74719182:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74718608_74719572:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74719131_74719182:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000487623:exon_74719071_74719182:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000414247:exon_74719131_74719182:TTC31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74719816 G/A 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 A:G G A 10 0.537708471577085 0.81556058669647 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74719131_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74719266_74720210:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74719266_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74719803_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74719773_74719874:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000487623:exon_74719773_74719940:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000414247:exon_74719803_74719874:TTC31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74720079 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74719131_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74720049_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74719266_74720210:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74720049_74720210:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74719266_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74720049_74720345:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74720052_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74720049_74722013:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000414247:exon_74720052_74720438:TTC31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74720098 T/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:T T A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74719131_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74720049_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74719266_74720210:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74720049_74720210:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74719266_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74720049_74720345:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74720052_74721686:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74720049_74722013:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000414247:exon_74720052_74720438:TTC31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 74755583 T/C 1 153 49 202 70.730603848706 26.3477151072772 44.3828887414288 T:C:G T C 10 0.537708471577085 1.69571596519756e-10 ENSG00000115307:ENST00000425118:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000377526:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000459792:exon_74755544_74756626:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000456927:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000258081:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000463900:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000466894:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000412627:exon_74755544_74755616:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000464887:exon_74755544_74755616:AUP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 75917161 G/C 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75917095_75917207:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75917095_75917207:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75917095_75917207:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75917095_75917207:C2orf3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 143 111 254 66.1076885644768 59.6856403450564 6.42204821942041 C:G C G 10 0.537708471577085 0.450293786991949 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85769975 A/G 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 A:G A G 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 402 288 690 185.841194426012 154.8600398142 30.9811546118113 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.017945577982764 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 403 335 738 186.303485954435 180.132337978323 6.17114797611126 A:G A G 10 0.537708471577085 0.657918604676702 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 362 316 678 167.349533289095 169.915877018359 -2.56634372926362 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.84738164185351 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 14 39 53 6.47208139792081 20.9706303915063 -14.4985489935855 T:C C T 10 0.537708471577085 7.90777903198468e-05 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 85824039 G/A 1 353 360 713 163.188909533289 193.575049767751 -30.3861402344616 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0241711473048674 ENSG00000168894:ENST00000461845:exon_85823642_85824139:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85823945_85824054:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85823945_85824054:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85823980_85824054:RNF181 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 86385728 C/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:C C T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86385715_86385793:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 86691250 G/A 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86691176_86691339:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86691176_86691339:KDM3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 16 14 30 7.39666445476664 7.52791860207919 -0.13125414731255 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 88913273 G/C 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 C:G G C 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88913242_88913371:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88913242_88913371:EIF2AK3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 89161069 G/C 1 1100 62 1162 508.520681265206 33.3379252377793 475.182756027427 C:G G C 10 0.537708471577085 5.41266025281221e-214 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 36 41 77 16.6424950232249 22.0460473346605 -5.40355231143555 A:G A G 10 0.537708471577085 0.253001852421747 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 26 29 55 12.0195797389958 15.5935456757355 -3.57396593673968 C:G C G 10 0.537708471577085 0.346724666909935 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 96919642 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96919538_96919853:TMEM127 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 97474305 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000158158:ENST00000377075:exon_97474298_97474479:CNNM4;ENSG00000158158:ENST00000496186:exon_97474298_97474423:CNNM4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 37 24 61 17.1047865516479 12.90500331785 4.19978323379781 A:C:G G C 10 0.537708471577085 0.305955447000313 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99149946 G/A 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99149840_99149958:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99149840_99149958:INPP4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 12 17 29 5.54749834107498 9.14104401681045 -3.59354567573547 T:C T C 10 0.537708471577085 0.196168114218119 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 11 18 29 5.08520681265207 9.67875248838753 -4.59354567573547 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0957464810231972 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99811314 G/A 1 58 51 109 26.8129086485291 27.4231320504313 -0.610223401902264 A:G G A 10 0.537708471577085 0.923706227828408 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99811214_99811360:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99811214_99811552:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99811214_99811360:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99811214_99811360:MRPL30 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 67 50 117 30.9735324043353 26.8854235788543 4.08810882548105 A:G G A 10 0.537708471577085 0.459909685951475 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 154 175 329 71.1928953771289 94.0989825259899 -22.906087148861 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0127362201317418 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 77 85 162 35.5964476885645 45.7052200840522 -10.1087723954878 T:C T C 10 0.537708471577085 0.115449048961745 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 22 19 41 10.1704136253041 10.2164609599646 -0.0460473346604857 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 21 36 57 9.70812209688122 19.3575049767751 -9.64938287989385 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0113995395868205 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 11 9 20 5.08520681265207 4.83937624419377 0.2458305684583 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 C:G G C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 101620766 C/G 1 17 13 30 7.85895598318955 6.99021013050211 0.868745852687449 C:G C G 10 0.537708471577085 0.8553876844794 ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 101869768 G/A 1 11 13 24 5.08520681265207 6.99021013050211 -1.90500331785004 A:G G A 10 0.537708471577085 0.540188574454526 ENSG00000158435:ENST00000289382:exon_101869264_101869940:C2orf29 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 28 15 43 12.9441627958416 8.06562707365627 4.87853572218535 C:G G C 10 0.537708471577085 0.168314533569141 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 105654588 C/T 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105654441_105654685:MRPS9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 109408208 G/A 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109408131_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109408011_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109408131_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000470608:exon_109408168_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000447782:exon_109408136_109408258:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109408172_109408258:CCDC138 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 109429146 T/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:T T A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109429087_109429164:CCDC138 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 60 33 93 27.7374917053749 17.7443795620438 9.9931121433311 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0379611772292276 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 1 9 1 10 4.16062375580623 0.537708471577085 3.62291528422915 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0250233828426948 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 76 92 168 35.1341561601415 49.4691793850918 -14.3350232249503 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0300406701608258 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 43 23 66 19.8785357221853 12.367294846273 7.51124087591239 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0651564936996939 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 50 35 85 23.1145764211457 18.819796505198 4.29477991594777 T:C T C 10 0.537708471577085 0.384912050209334 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 21 28 49 9.70812209688122 15.0558372041584 -5.34771510727716 T:C T C 10 0.537708471577085 0.151540851109148 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 120438515 G/C 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 C:G G C 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 16 9 25 7.39666445476664 4.83937624419377 2.55728821057287 C:G C G 10 0.537708471577085 0.324405864269745 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 305 292 597 140.998916168989 157.010873700509 -16.0119575315198 A:C A C 10 0.537708471577085 0.189329236390932 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 128464116 G/A 1 37 23 60 17.1047865516479 12.367294846273 4.7374917053749 A:G G A 10 0.537708471577085 0.244962040599708 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128458596_128464126:WDR33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 128477084 G/C 1 13 21 34 6.00978986949789 11.2918779031188 -5.28208803362089 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0847979933287368 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 128522383 T/C 1 80 53 133 36.9833222738332 28.4985489935855 8.48477328024769 T:C T C 10 0.537708471577085 0.163874019886272 ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 19 14 33 8.78353904003538 7.52791860207919 1.25562043795619 T:C C T 10 0.537708471577085 0.728806662291829 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 128610648 T/C 1 35 31 66 16.180203494802 16.6689626188896 -0.488759124087611 T:C T C 10 0.537708471577085 0.902535905405674 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 A:G G A 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 37 40 77 17.1047865516479 21.5083388630834 -4.40355231143555 T:C T C 10 0.537708471577085 0.360705712889676 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 159 150 309 73.5043530192435 80.6562707365627 -7.15191771731926 T:C C T 10 0.537708471577085 0.424808191112444 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 152311570 G/A 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:G G A 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 A:G G A 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160182302 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000474437:exon_160182275_160182429:BAZ2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160604372 A/G 1 34 32 66 15.7179119663791 17.2066710904667 -1.48875912408761 A:G A G 10 0.537708471577085 0.713309719053831 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160711045 G/C 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 C:G G C 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160737621 C/T 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160737594_160737751:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160737594_160737751:RP11-357L2.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 160738677 G/A 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 A:G G A 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160738635_160738826:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160738635_160738826:RP11-357L2.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 177 147 324 81.825600530856 79.0431453218315 2.78245520902445 T:C C T 10 0.537708471577085 0.780709341764098 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 84 83 167 38.8324883875249 44.6298031408981 -5.79731475337319 T:C T C 10 0.537708471577085 0.393538496334406 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 169952233 T/C 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000073737:ENST00000419279:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000327239:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000357546:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000428522:exon_169952054_169952672:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000421653:exon_169952054_169952277:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000432060:exon_169952054_169952430:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000436483:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000412271:exon_169952054_169952677:DHRS9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 170678476 G/A 1 125 108 233 57.7864410528644 58.0725149303252 -0.286073877460808 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000138382:ENST00000409837:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000260953:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000392640:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000409965:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000410097:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000308099:exon_170678453_170678567:METTL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 170917648 A/G 1 2 11 13 0.92458305684583 5.91479318734793 -4.9902101305021 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00918308794289172 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 75 66 141 34.6718646317186 35.4887591240876 -0.816894492368981 T:C C T 10 0.537708471577085 0.93275312678573 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 23 30 53 10.632705153727 16.1312541473125 -5.4985489935855 T:C C T 10 0.537708471577085 0.132447955865707 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 172188368 C/T 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000483284:exon_172188314_172189305:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000438609:exon_172188275_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172188318_172188377:METTL8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 173355958 G/A 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 A:G G A 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000091409:ENST00000409532:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264107:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264106:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000343713:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000375221:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000409080:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000442250:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000458358:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000416789:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000470259:exon_173355949_173355982:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000475302:exon_173355949_173356059:ITGA6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 174232434 T/G 1 20 17 37 9.2458305684583 9.14104401681045 0.104786551647853 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144354:ENST00000347703:exon_174232362_174233632:CDCA7;ENSG00000144354:ENST00000392567:exon_174232362_174233719:CDCA7;ENSG00000144354:ENST00000306721:exon_174232362_174233725:CDCA7;ENSG00000144354:ENST00000410101:exon_174232362_174232448:CDCA7;ENSG00000144354:ENST00000410019:exon_174232362_174232798:CDCA7;ENSG00000144354:ENST00000496441:exon_174232362_174233228:CDCA7;ENSG00000144354:ENST00000467411:exon_174232362_174233632:CDCA7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 T:C T C 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 79 76 155 36.5210307454103 40.8658438398585 -4.34481309444818 T:C C T 10 0.537708471577085 0.519518264583816 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 180810202 C/T 1 66 70 136 30.5112408759124 37.6395930103959 -7.12835213448356 T:C C T 10 0.537708471577085 0.229339449642552 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 183584755 G/A 1 17 4 21 7.85895598318955 2.15083388630834 5.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0146240755275989 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000469118:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183584734_183584896:DNAJC10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 184025875 G/T 1 18 11 29 8.32124751161247 5.91479318734793 2.40645432426453 T:G G T 10 0.537708471577085 0.457421609041791 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 184025876 A/T 1 17 11 28 7.85895598318955 5.91479318734793 1.94416279584162 A:T A T 10 0.537708471577085 0.570682901317659 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_184025782_184026166:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_184025782_184026408:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_184025782_184025972:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_184024216_184026408:NUP35 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 A:G A G 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 32 32 64 14.7933289095333 17.2066710904667 -2.41334218093344 T:C T C 10 0.537708471577085 0.6164428261979 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 190732545 A/G 1 13 22 35 6.00978986949789 11.8295863746959 -5.81979650519798 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0611722000368765 ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409593:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000483293:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000452382:exon_190732525_190732655:PMS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 191524211 A/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:T A T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000138386:ENST00000448811:exon_191523884_191524360:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000416973:exon_191523884_191524374:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000409581:exon_191523884_191524721:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000357215:exon_191523884_191524721:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000337386:exon_191523884_191524721:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000423076:exon_191524003_191524311:NAB1;ENSG00000138386:ENST00000409641:exon_191523785_191524721:NAB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 22 19 41 10.1704136253041 10.2164609599646 -0.0460473346604857 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 44 27 71 20.3408272506083 14.5181287325813 5.82269851802696 A:T T A 10 0.537708471577085 0.190562234841011 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 197863698 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000065413:ENST00000424317:exon_197863631_197863776:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000448801:exon_197863631_197863776:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_197863631_197863776:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_197863631_197863776:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_197863631_197863776:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_197863631_197863776:ANKRD44 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 198257795 T/C 1 139 121 260 64.2585224507852 65.0627250608273 -0.804202610042111 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.950433028998746 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198257696_198257912:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000479532:exon_198257696_198258075:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000424674:exon_198257776_198257912:SF3B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 94 88 182 43.455403671754 47.3183454987835 -3.86294182702947 A:G A G 10 0.537708471577085 0.602975672215306 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 198283305 T/C 1 48 60 108 22.1899933642999 32.2625082946251 -10.0725149303252 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0539484487675057 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198283233_198283312:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000470268:exon_198283233_198284839:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000482158:exon_198283233_198283686:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000409915:exon_198283233_198283312:SF3B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 198362018 T/C 1 496 480 976 229.296598097766 258.100066357001 -28.803468259235 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.0672564008043871 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:C A C 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 32 19 51 14.7933289095333 10.2164609599646 4.57686794956866 C:G C G 10 0.537708471577085 0.209316881598403 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201436097 A/C 1 14 22 36 6.47208139792081 11.8295863746959 -5.35750497677506 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0935977510488975 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 17 25 42 7.85895598318955 13.4427117894271 -5.58375580623757 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0901463513991 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201438143 A/C 1 34 40 74 15.7179119663791 21.5083388630834 -5.79042689670429 A:C A C 10 0.537708471577085 0.199827758577094 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 55 21 76 25.4260340632603 11.2918779031188 14.1341561601415 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00115616914865681 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 54 11 65 24.9637425348374 5.91479318734793 19.0489493474895 A:C A C 10 0.537708471577085 1.11076184930396e-06 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 48 44 92 22.1899933642999 23.6591727493917 -1.46917938509182 T:C C T 10 0.537708471577085 0.755228075427077 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 201785837 G/A 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 A:G G A 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000115942:ENST00000234296:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000464147:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000487853:exon_201785716_201786461:ORC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 6 103 109 2.77374917053749 55.3839725724398 -52.6102234019023 A:C:G G A 10 0.537708471577085 1.98106723544777e-27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 50 48 98 23.1145764211457 25.8100066357001 -2.69543021455433 A:G A G 10 0.537708471577085 0.613242371873598 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 202050677 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000003400:ENST00000286186:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000360132:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000460140:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000272879:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000438843:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000346817:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000313728:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000448480:exon_202050494_202050847:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000484926:exon_202050494_202051103:CASP10;ENSG00000003400:ENST00000492363:exon_202050501_202050847:CASP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 A:G A G 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 202245423 A/T 1 5 11 16 2.31145764211457 5.91479318734793 -3.60333554523336 A:T A T 10 0.537708471577085 0.0820210724393271 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 203847124 G/A 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000138380:ENST00000402905:exon_203846795_203847164:ALS2CR8;ENSG00000138380:ENST00000414439:exon_203846795_203847164:ALS2CR8;ENSG00000138380:ENST00000428585:exon_203846795_203847164:ALS2CR8;ENSG00000138380:ENST00000320443:exon_203846795_203847164:ALS2CR8;ENSG00000138380:ENST00000438828:exon_203846795_203847164:ALS2CR8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 204154552 C/T 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 T:C C T 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431075:exon_204154488_204154599:CYP20A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 207003230 C/T 1 40 36 76 18.4916611369166 19.3575049767751 -0.865843839858464 T:C C T 10 0.537708471577085 0.908537409154433 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207003209_207003338:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207003209_207003338:NDUFS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 207656535 T/C 1 46 48 94 21.2654103074541 25.8100066357001 -4.54459632824599 T:C T C 10 0.537708471577085 0.353825026603821 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207656407_207657233:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207656407_207656613:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207653543_207656670:FASTKD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 208477852 G/A 1 39 22 61 18.0293696084937 11.8295863746959 6.19978323379781 A:G G A 10 0.537708471577085 0.123821720626835 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 208477956 C/T 1 44 25 69 20.3408272506083 13.4427117894271 6.89811546118113 T:C C T 10 0.537708471577085 0.116001797858399 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 211306158 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115365:ENST00000443314:exon_211306032_211306167:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000450366:exon_211306032_211306167:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000233714:exon_211306032_211306167:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000441020:exon_211306032_211306167:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000431941:exon_211306032_211306167:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000419649:exon_211306032_211306167:LANCL1;ENSG00000115365:ENST00000448951:exon_211306032_211306167:LANCL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 24 23 47 11.09499668215 12.367294846273 -1.272298164123 A:T A T 10 0.537708471577085 0.770563908720813 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 215593522 T/C 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215590370_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000432456:exon_215593148_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471590:exon_215593262_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215593277_215593732:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215593428_215593732:BARD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 215645989 T/G 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 T:G T G 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471787:exon_215645621_215646233:BARD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 12 18 30 5.54749834107498 9.67875248838753 -4.13125414731255 A:T A T 10 0.537708471577085 0.145144278258607 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 216908679 C/T 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216908627_216908738:PECR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 19 17 36 8.78353904003538 9.14104401681045 -0.357504976775061 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 24 16 40 11.09499668215 8.60333554523336 2.4916611369166 A:C C A 10 0.537708471577085 0.526471697646376 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 39 33 72 18.0293696084937 17.7443795620438 0.284990046449881 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220037444 G/A 1 37 25 62 17.1047865516479 13.4427117894271 3.66207476222073 A:G G A 10 0.537708471577085 0.374834510208701 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 20 15 35 9.2458305684583 8.06562707365627 1.18020349480202 A:G A G 10 0.537708471577085 0.736962690946534 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 35 29 64 16.180203494802 15.5935456757355 0.586657819066561 A:G A G 10 0.537708471577085 0.900993399682061 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 41 44 85 18.9539526653395 23.6591727493917 -4.70522008405223 A:G A G 10 0.537708471577085 0.328431743973669 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220046840 G/A 1 24 31 55 11.09499668215 16.6689626188896 -5.57396593673968 A:G G A 10 0.537708471577085 0.138646423358031 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046735_220046842:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 16 21 37 7.39666445476664 11.2918779031188 -3.89521344835214 A:C C A 10 0.537708471577085 0.248294087829378 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 20 20 40 9.2458305684583 10.7541694315417 -1.5083388630834 T:C C T 10 0.537708471577085 0.638325849890511 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 20 23 43 9.2458305684583 12.367294846273 -3.12146427781466 T:C C T 10 0.537708471577085 0.361724000919424 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 23 13 36 10.632705153727 6.99021013050211 3.64249502322494 A:G G A 10 0.537708471577085 0.245366448391152 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 223389692 C/T 1 21 13 34 9.70812209688122 6.99021013050211 2.71791196637911 T:C C T 10 0.537708471577085 0.392827901382920 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223389663_223389752:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223389663_223389752:SGPP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 223436586 A/G 1 182 163 345 84.1370581729705 87.6464808670649 -3.50942269409433 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.705866750200401 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C C T 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 225670901 G/C 1 16 12 28 7.39666445476664 6.45250165892502 0.94416279584162 C:G G C 10 0.537708471577085 0.850213996975682 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225670843_225670954:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225670843_225670954:DOCK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 225672460 G/A 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000489831:exon_225671962_225672501:DOCK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 225684166 A/G 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:G A G 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225684163_225684246:DOCK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 225709926 A/G 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:G A G 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225709920_225710041:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225709920_225710041:DOCK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 225727431 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225727381_225727463:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225725297_225727463:DOCK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 159 173 332 73.5043530192435 93.0235655828357 -19.5192125635922 A:G A G 10 0.537708471577085 0.036324465770445 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 230723777 G/C 1 13 3 16 6.00978986949789 1.61312541473126 4.39666445476664 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0415548831545558 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000479037:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000409677:exon_230723488_230724290:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000453485:exon_230723635_230723998:TRIP12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231036866 G/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G G A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000135899:ENST00000477068:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000483067:exon_231036782_231037028:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231036782_231036890:SP110 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 216 218 434 99.8549701393496 117.220446803805 -17.3654766644549 A:G A G 10 0.537708471577085 0.101604867092555 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 83 67 150 38.3701968591019 36.0264675956647 2.34372926343725 A:G G A 10 0.537708471577085 0.743509825842828 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 3 11 14 1.38687458526874 5.91479318734793 -4.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0280854535870404 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 T:C T C 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 32 28 60 14.7933289095333 15.0558372041584 -0.2625082946251 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 86 50 136 39.7570714443707 26.8854235788543 12.8716478655164 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0312121887028312 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 72 6 78 33.2849900464499 3.22625082946251 30.0587392169874 A:G G A 10 0.537708471577085 1.57458976759742e-13 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 162 163 325 74.8912276045122 87.6464808670649 -12.7552532625526 A:G G A 10 0.537708471577085 0.164348683521833 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 234432017 A/G 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:G A G 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234431816_234432135:USP40;ENSG00000085982:ENST00000427112:exon_234431816_234432135:USP40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 31 43 74 14.3310373811104 23.1214642778147 -8.79042689670429 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0470460787664666 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 234761225 C/T 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 234763137 T/C 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234763030_234763212:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234763030_234763181:HJURP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 53 43 96 24.5014510064145 23.1214642778147 1.37998672859984 A:G A G 10 0.537708471577085 0.838015295059675 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 125 71 196 57.7864410528644 38.177301481973 19.6091395708913 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.00512989147151158 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 105 111 216 48.5406104844061 59.6856403450564 -11.1450298606504 C:G C G 10 0.537708471577085 0.133547361281419 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 241463595 T/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 74 69 143 34.2095731032957 37.1018845388189 -2.89231143552315 A:C A C 10 0.537708471577085 0.675152852173878 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 48 28 76 22.1899933642999 15.0558372041584 7.13415616014154 A:G G A 10 0.537708471577085 0.107950277504168 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 14 17 31 6.47208139792081 9.14104401681045 -2.66896261888964 T:C T C 10 0.537708471577085 0.370890806424659 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242179134 G/A 1 139 172 311 64.2585224507852 92.4858571112586 -28.2273346604734 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00142405653507874 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242179017_242179151:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427487:exon_242179017_242179235:HDLBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 44 68 112 20.3408272506083 36.5641760672418 -16.2233488166335 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00233153411784044 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242371101 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242371094_242371189:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000373287:exon_242371094_242371189:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000471447:exon_242371094_242371189:FARP2;ENSG00000006607:ENST00000485051:exon_242371094_242371189:FARP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 28 32 60 12.9441627958416 17.2066710904667 -4.2625082946251 T:C T C 10 0.537708471577085 0.301000321854184 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 15 5 20 6.93437292634373 2.68854235788543 4.2458305684583 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0719557705235852 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 23 20 43 10.632705153727 10.7541694315417 -0.121464277814656 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 66 73 139 30.5112408759124 39.2527184251272 -8.74147754921482 T:C:G T G 10 0.537708471577085 0.148252710633148 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 88 68 156 40.6816545012165 36.5641760672418 4.11747843397474 A:G A G 10 0.537708471577085 0.521701630659021 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 38 43 81 17.5670780800708 23.1214642778147 -5.55438619774389 T:C C T 10 0.537708471577085 0.222143906598264 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2464066 G/A 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000088876:ENST00000278772:exon_2462463_2465302:ZNF343;ENSG00000088876:ENST00000465019:exon_2462463_2465302:ZNF343 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2633296 G/C 1 18 9 27 8.32124751161247 4.83937624419377 3.4818712674187 C:G G C 10 0.537708471577085 0.246443676672332 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2632791_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633178_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633278_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633279_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633292_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633295_2633309:NOP56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 118 98 216 54.550400353904 52.6954302145543 1.85497013934964 A:G A G 10 0.537708471577085 0.83790839992661 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 210 222 432 97.0812209688121 119.371280690113 -22.2900597213007 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0336756290869811 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 18 17 35 8.32124751161247 9.14104401681045 -0.819796505197976 A:G G A 10 0.537708471577085 0.86585821201555 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 489 561 1050 226.060557398805 301.654452554745 -75.5938951559393 T:C T C 10 0.537708471577085 3.32238411196131e-06 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2774797 A/C 1 28 21 49 12.9441627958416 11.2918779031188 1.65228489272284 A:C A C 10 0.537708471577085 0.669639477256263 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2816076 T/C 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132635:ENST00000356872:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000360652:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000474714:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000478539:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000487501:exon_2815960_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000434800:exon_2815971_2816355:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000436952:exon_2815971_2816355:FAM113A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2820493 C/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:C C A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000132635:ENST00000356872:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000360652:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000478539:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000434800:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000436952:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000380531:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000448755:exon_2820435_2820579:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000439542:exon_2820435_2820579:FAM113A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2841495 G/A 1 17 12 29 7.85895598318955 6.45250165892502 1.40645432426453 A:G G A 10 0.537708471577085 0.710583412304497 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2841394_2841509:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2841394_2841509:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2841394_2841509:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000453689:exon_2841394_2841509:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000417508:exon_2841394_2841509:VPS16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2843961 C/T 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2843936_2844044:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2843936_2844044:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2843936_2844044:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000453689:exon_2843936_2844044:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000481812:exon_2843936_2844044:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2843936_2844044:VPS16 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 21 19 40 9.70812209688122 10.2164609599646 -0.5083388630834 T:C C T 10 0.537708471577085 0.87553259952279 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2969081 A/G 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 A:G A G 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2968984_2969120:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2968984_2969120:PTPRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 19 18 37 8.78353904003538 9.67875248838753 -0.895213448352147 T:C C T 10 0.537708471577085 0.869367207004994 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 3171337 C/T 1 60 50 110 27.7374917053749 26.8854235788543 0.852068126520649 T:C C T 10 0.537708471577085 0.923927527449038 ENSG00000198171:ENST00000354488:exon_3170996_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000496781:exon_3170996_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000470203:exon_3171166_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000449522:exon_3171167_3171465:DDRGK1;ENSG00000198171:ENST00000380213:exon_3171299_3171346:DDRGK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 3577062 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000088812:ENST00000379943:exon_3577024_3577076:ATRN;ENSG00000088812:ENST00000340500:exon_3577024_3577076:ATRN;ENSG00000088812:ENST00000262919:exon_3577024_3577076:ATRN;ENSG00000088812:ENST00000446916:exon_3577024_3577076:ATRN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 4680251 A/G 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G A G 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000171867:ENST00000420824:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000455665:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379440:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000531860:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000430350:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000525336:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000424424:exon_4679862_4680613:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000444805:exon_4680216_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379436:exon_4679857_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000457586:exon_4679857_4680517:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000431433:exon_4679857_4680516:PRNP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 22 32 54 10.1704136253041 17.2066710904667 -7.03625746516259 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0570870063150401 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 T:C T C 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5924828 A/G 1 13 14 27 6.00978986949789 7.52791860207919 -1.5181287325813 A:G A G 10 0.537708471577085 0.569107461757469 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5924808_5924899:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000493972:exon_5924808_5924899:TRMT6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5937833 A/G 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5937772_5937875:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5937772_5937875:MCM8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5939214 A/C 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:C A C 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5939174_5939372:MCM8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 A:G A G 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 5974265 A/G 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5974152_5974341:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5974152_5974341:MCM8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 6017821 C/T 1 108 105 213 49.9274850696748 56.4593895155939 -6.53190444591911 T:C C T 10 0.537708471577085 0.372610339917734 ENSG00000088766:ENST00000378863:exon_6017720_6020699:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000452938:exon_6017720_6018037:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000378868:exon_6017720_6020695:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000478846:exon_6017720_6018037:CRLS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 27 46 73 12.4818712674187 24.7345896925459 -12.2527184251272 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00461829863050333 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 47 54 101 21.727701835877 29.0362574651626 -7.30855562928559 T:C C T 10 0.537708471577085 0.162331765288011 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 38 39 77 17.5670780800708 20.9706303915063 -3.40355231143555 A:G A G 10 0.537708471577085 0.493183822441313 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 13756539 C/A 1 42 28 70 19.4162441937624 15.0558372041584 4.36040698960405 A:C C A 10 0.537708471577085 0.338026141049533 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13756519_13756916:ESF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 18162481 C/G 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 C:G C G 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18162354_18162490:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18162354_18162490:CSRP2BP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 18393312 C/G 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 C:G C G 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000089091:ENST00000377630:exon_18393290_18393497:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000262547:exon_18393290_18393479:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000329494:exon_18393290_18393479:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000377637:exon_18393290_18393479:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000357236:exon_18393290_18393479:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000414623:exon_18393290_18393479:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000487128:exon_18393290_18393497:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000358866:exon_18393290_18393479:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000480488:exon_18393290_18393497:C20orf12;ENSG00000089091:ENST00000460891:exon_18393290_18393497:C20orf12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G A G 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 18523002 C/G 1 64 68 132 29.5866578190666 36.5641760672418 -6.97751824817522 C:G C G 10 0.537708471577085 0.256393656067713 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 23350790 C/T 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23350728_23353700:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23350728_23353682:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000477239:exon_23350728_23351058:GZF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 25255278 G/A 0 0 8 8 0 4.30166777261668 -4.30166777261668 A G A 10 0.537708471577085 0.00208606328681067 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25255228_25255359:PYGB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 15 8 23 6.93437292634373 4.30166777261668 2.63270515372704 T:C T C 10 0.537708471577085 0.302090609922214 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 7 14 21 3.23604069896041 7.52791860207919 -4.29187790311878 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0787255321210082 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 16 18 34 7.39666445476664 9.67875248838753 -2.28208803362089 A:G A G 10 0.537708471577085 0.492929469502856 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 63 62 125 29.1243662906436 33.3379252377793 -4.21355894713563 C:G G C 10 0.537708471577085 0.473613581157192 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 30382315 A/G 1 58 42 100 26.8129086485291 22.5837558062376 4.2291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.423362048918849 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 30659537 C/T 1 14 42 56 6.47208139792081 22.5837558062376 -16.1116744083168 T:C C T 10 0.537708471577085 1.97528190062391e-05 ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000470092:exon_30659465_30660392:HCK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 30681681 G/A 1 33 64 97 15.2556204379562 34.4133421809334 -19.1577217429772 A:G G A 10 0.537708471577085 9.71026374721679e-05 ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30681666_30681819:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30681666_30681819:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30681666_30681819:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30681666_30681819:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30681666_30681819:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30681666_30681819:HCK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 30816111 A/G 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000101346:ENST00000375749:exon_30816066_30816258:POFUT1;ENSG00000101346:ENST00000486717:exon_30816066_30816258:POFUT1;ENSG00000101346:ENST00000465791:exon_30816066_30816258:POFUT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 30904029 G/A 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30904021_30904122:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30904021_30904122:KIF3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 31022480 C/T 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 31024488 C/T 1 73 55 128 33.7472815748728 29.5739659367397 4.17331563813312 T:C C T 10 0.537708471577085 0.479268352504344 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 85 90 175 39.2947799159478 48.3937624419377 -9.09898252598988 T:C C T 10 0.537708471577085 0.172948191313491 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 31967273 A/G 1 16 17 33 7.39666445476664 9.14104401681045 -1.74437956204381 A:G A G 10 0.537708471577085 0.602217507224218 ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000498525:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000496381:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000471264:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473791:exon_31967267_31967394:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 32000483 A/G 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000101400:ENST00000217381:exon_32000381_32000588:SNTA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 23 15 38 10.632705153727 8.06562707365627 2.56707808007077 T:C C T 10 0.537708471577085 0.421548678665716 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 33169405 C/T 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 T:C C T 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000101464:ENST00000217446:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000374820:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000438215:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000452740:exon_33169352_33169476:PIGU;ENSG00000101464:ENST00000480175:exon_33169352_33169476:PIGU HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 33328420 C/T 1 11 9 20 5.08520681265207 4.83937624419377 0.2458305684583 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 33470694 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000131069:ENST00000490046:exon_33470597_33470793:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481971:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000488172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000497927:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000475459:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000461051:exon_33470597_33470799:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000484354:exon_33470621_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000374693:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480274:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000477932:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000493805:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000473172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480978:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000467019:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000476922:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000464399:exon_33470630_33470792:ACSS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 54 44 98 24.9637425348374 23.6591727493917 1.30456978544567 T:C C T 10 0.537708471577085 0.839744700293355 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 C:G G C 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 7 17 24 3.23604069896041 9.14104401681045 -5.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0224165208121933 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 A:G G A 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 37383640 T/C 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 0 16 0 16 7.39666445476664 0 7.39666445476664 G G 10 0.537708471577085 5.31887818557344e-05 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 1 14 5 19 6.47208139792081 2.68854235788543 3.78353904003538 T:C C T 10 0.537708471577085 0.10665894054281 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 C:G G C 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 37601243 A/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000101452:ENST00000373325:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373323:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000252011:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000373321:exon_37601202_37601294:DHX35;ENSG00000101452:ENST00000484417:exon_37601202_37601294:DHX35 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 92 82 174 42.5308206149082 44.092094669321 -1.56127405441279 T:C C T 10 0.537708471577085 0.819992980423492 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 53 57 110 24.5014510064145 30.6493828798938 -6.14793187347935 A:C A C 10 0.537708471577085 0.252033983388028 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 62 59 121 28.6620747622207 31.724799823048 -3.06272506082729 T:C C T 10 0.537708471577085 0.585558084003515 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 127 92 219 58.7110241097102 49.4691793850918 9.24184472461838 A:C A C 10 0.537708471577085 0.222776775625198 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 A:G A G 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 59 82 141 27.275200176952 44.092094669321 -16.816894492369 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00517280528596006 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 43623854 A/G 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43623731_43623898:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43623731_43623898:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43623731_43623898:STK4;ENSG00000101109:ENST00000474717:exon_43623731_43623898:STK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 43629135 G/A 1 11 17 28 5.08520681265207 9.14104401681045 -4.05583720415838 A:G G A 10 0.537708471577085 0.133221244184410 ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 14 22 36 6.47208139792081 11.8295863746959 -5.35750497677506 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0935977510488975 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 20 13 33 9.2458305684583 6.99021013050211 2.25562043795619 T:C T C 10 0.537708471577085 0.487582164437403 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 44505973 T/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 44512638 G/T 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 T:G G T 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 5 12 17 2.31145764211457 6.45250165892502 -4.14104401681045 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0522275164214068 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 17 11 28 7.85895598318955 5.91479318734793 1.94416279584162 T:G T G 10 0.537708471577085 0.570682901317659 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 45853037 A/G 1 24 18 42 11.09499668215 9.67875248838753 1.41624419376243 A:G A G 10 0.537708471577085 0.757539726068538 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 45867852 A/G 1 15 8 23 6.93437292634373 4.30166777261668 2.63270515372704 A:G A G 10 0.537708471577085 0.302090609922214 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47253043 G/A 1 45 30 75 20.8031187790312 16.1312541473125 4.67186463171862 A:G G A 10 0.537708471577085 0.298873512136520 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 24 16 40 11.09499668215 8.60333554523336 2.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 0.526471697646376 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47685320 G/C 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 C:G G C 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47685252_47685359:CSE1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 A:T:C:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 39 48 87 18.0293696084937 25.8100066357001 -7.7806370272064 T:C C T 10 0.537708471577085 0.106620665516458 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 16 21 37 7.39666445476664 11.2918779031188 -3.89521344835214 A:G G A 10 0.537708471577085 0.248294087829378 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47865672 C/T 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 C:G C G 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 9 17 26 4.16062375580623 9.14104401681045 -4.98042026100421 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0746446391547611 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48252914 C/T 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48249482_48252996:B4GALT5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48257149 C/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48257015_48257202:B4GALT5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48259034 A/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000158470:ENST00000371711:exon_48259005_48259121:B4GALT5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48522124 T/G 1 18 24 42 8.32124751161247 12.90500331785 -4.58375580623757 T:G T G 10 0.537708471577085 0.166192807586473 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 12 4 16 5.54749834107498 2.15083388630834 3.39666445476664 A:G G A 10 0.537708471577085 0.130583196467889 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G A G 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48558197 C/T 1 56 44 100 25.8883255916832 23.6591727493917 2.2291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.689074456577235 ENSG00000124226:ENST00000449816:exon_48558098_48558248:RNF114;ENSG00000124226:ENST00000244061:exon_48558098_48558248:RNF114 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 48699332 C/T 1 202 244 446 93.3828887414288 131.200867064809 -37.8179783233799 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000359868666222415 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48697661_48699451:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000354374:exon_48697661_48699451:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000420027:exon_48697663_48699451:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48697661_48699451:TMEM189-UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000371657:exon_48697661_48699451:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000396059:exon_48697661_48699451:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000371674:exon_48697661_48699451:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000340309:exon_48697661_48699451:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000415862:exon_48697661_48699451:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000371677:exon_48697661_48699451:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000483534:exon_48699097_48699451:UBE2V1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 49493076 G/A 1 55 56 111 25.4260340632603 30.1116744083168 -4.68564034505643 A:G G A 10 0.537708471577085 0.392408637102694 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000445038:exon_49493023_49493109:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 59 61 120 27.275200176952 32.8002167662022 -5.5250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.315549550678778 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 46 61 107 21.2654103074541 32.8002167662022 -11.5348064587481 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0259642811100601 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 52192408 C/T 1 12 13 25 5.54749834107498 6.99021013050211 -1.44271178942713 T:C C T 10 0.537708471577085 0.689185254610132 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000437222:exon_52192266_52192566:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 13 3 16 6.00978986949789 1.61312541473126 4.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0415548831545558 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 52193368 C/T 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 52193660 G/A 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 52193698 G/A 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 A:G G A 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 15 2 17 6.93437292634373 1.07541694315417 5.85895598318955 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00561446816757043 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 54961541 A/T 1 24 26 50 11.09499668215 13.9804202610042 -2.88542357885425 A:T A T 10 0.537708471577085 0.478733886212233 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 55982858 G/C 1 56 58 114 25.8883255916832 31.1870913514709 -5.29876575978769 C:G G C 10 0.537708471577085 0.347891481096086 ENSG00000132819:ENST00000356208:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000344785:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000371219:exon_55982599_55982916:RBM38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 6 11 17 2.77374917053749 5.91479318734793 -3.14104401681044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.148024861377178 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 15 20 35 6.93437292634373 10.7541694315417 -3.81979650519798 C:G C G 10 0.537708471577085 0.235619569821158 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 478 490 968 220.975350586153 263.477151072772 -42.5018004866183 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.0067476377838575 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 60572663 C/A 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:C C A 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 337 338 675 155.792245078522 181.745463393055 -25.9532183145324 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0489201674768424 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 21 22 43 9.70812209688122 11.8295863746959 -2.12146427781465 T:C C T 10 0.537708471577085 0.543432694239044 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 3760 3428 7188 1738.21614687016 1843.26464056625 -105.048493696087 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0129917494543561 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 60966374 G/C 1 10 2 12 4.62291528422915 1.07541694315417 3.54749834107498 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0450438793507606 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61288355 G/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:G G T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 A:C C A 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 5 14 19 2.31145764211457 7.52791860207919 -5.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0202247263334817 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61491494 T/C 1 7 17 24 3.23604069896041 9.14104401681045 -5.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0224165208121933 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61491477_61491660:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61491477_61491660:TCFL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61537114 G/A 1 21 42 63 9.70812209688122 22.5837558062376 -12.8756337093564 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.00140468844100295 ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61536350_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61536355_61537452:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61536357_61537452:DIDO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 T:C C T 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 10 21 31 4.62291528422915 11.2918779031188 -6.66896261888964 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0187501239498112 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 19 16 35 8.78353904003538 8.60333554523336 0.180203494802024 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 20 62321189 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321103_62321218:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321103_62321563:RTEL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 19169155 G/C 1 15 31 46 6.93437292634373 16.6689626188896 -9.73458969254591 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0046158095839046 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 123 130 253 56.8618579960185 69.902101305021 -13.0402433090025 A:G G A 10 0.537708471577085 0.101527073112795 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 180 191 371 83.2124751161247 102.702318071223 -19.4898429550985 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0477252009917778 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 49 91 140 22.6522848927228 48.9314709135147 -26.2791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 8.75483869714313e-06 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 26978950 A/G 1 154 141 295 71.1928953771289 75.816894492369 -4.62399911524008 A:G A G 10 0.537708471577085 0.599600654406069 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 34713317 T/C 1 34 38 72 15.7179119663791 20.4329219199292 -4.71500995355012 T:C T C 10 0.537708471577085 0.28830703578442 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34713305_34713480:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34713305_34713480:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34713305_34713480:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442071:exon_34713305_34713480:IFNAR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 39 28 67 18.0293696084937 15.0558372041584 2.97353240433531 C:G G C 10 0.537708471577085 0.540503172626601 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 34897113 C/T 1 64 63 127 29.5866578190666 33.8756337093564 -4.2889758902898 T:C C T 10 0.537708471577085 0.476881813666089 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 434 439 873 200.634523335545 236.05401902234 -35.4194956867952 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.0174587185870957 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 38563639 C/T 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 12 22 34 5.54749834107498 11.8295863746959 -6.28208803362089 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0380617182695499 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 40720494 C/T 1 59 120 179 27.275200176952 64.5250165892502 -37.2498164122982 T:C C T 10 0.537708471577085 2.8548096571145e-08 ENSG00000205581:ENST00000380749:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000431390:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000492280:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000288344:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000486741:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000436324:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380748:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000419378:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000489072:exon_40720471_40720788:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482192:exon_40720471_40720549:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000380747:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000485550:exon_40720471_40720523:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000443046:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000464078:exon_40720348_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000491183:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000479586:exon_40720471_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000471260:exon_40720471_40720546:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000482733:exon_40719921_40720503:HMGN1;ENSG00000205581:ENST00000463631:exon_40720348_40720503:HMGN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 42749081 T/C 1 63 67 130 29.1243662906436 36.0264675956647 -6.90210130502106 T:C T C 10 0.537708471577085 0.252802853326188 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 43413651 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000173276:ENST00000398505:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000310826:exon_43406940_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000416434:exon_43412602_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398499:exon_43408746_43414217:ZNF295;ENSG00000173276:ENST00000398511:exon_43408746_43414217:ZNF295 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 32 20 52 14.7933289095333 10.7541694315417 4.03915947799158 T:G T G 10 0.537708471577085 0.270013403253802 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 35 29 64 16.180203494802 15.5935456757355 0.586657819066561 A:G G A 10 0.537708471577085 0.900993399682061 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 44473980 G/T 1 10 3 13 4.62291528422915 1.61312541473126 3.00978986949789 T:G G T 10 0.537708471577085 0.104209891139548 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44473972_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44473303_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000451248:exon_44473865_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000462349:exon_44473899_44474093:CBS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 93 85 178 42.9931121433311 45.7052200840522 -2.71210794072113 T:C T C 10 0.537708471577085 0.707348477515982 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 37 30 67 17.1047865516479 16.1312541473125 0.973532404335305 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.902619119607209 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 20 16 36 9.2458305684583 8.60333554523336 0.642495023224939 T:C T C 10 0.537708471577085 0.868679174180134 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 A:G A G 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 45557227 G/A 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:G G A 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45557059_45557259:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45557059_45557457:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000470545:exon_45557059_45557448:C21orf33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 T:C C T 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 20 22 42 9.2458305684583 11.8295863746959 -2.58375580623757 T:C C T 10 0.537708471577085 0.442687948829403 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 34 22 56 15.7179119663791 11.8295863746959 3.88832559168324 A:G A G 10 0.537708471577085 0.3486170203246 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 A:G A G 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 4 11 15 1.84916611369166 5.91479318734793 -4.06562707365627 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0400794641262981 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 1 37 38 75 17.1047865516479 20.4329219199292 -3.32813536828138 T:C C T 10 0.537708471577085 0.487656145781299 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47581835 C/T 1 23 29 52 10.632705153727 15.5935456757355 -4.96084052200842 T:C C T 10 0.537708471577085 0.210286382760523 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47581949 C/T 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47635176 T/C 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635094_47635212:LSS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47641794 C/T 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C C T 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47641768_47641889:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47641768_47641889:LSS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47642609 G/A 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:G G A 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47642544_47642652:LSS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47703649 G/A 1 22 12 34 10.1704136253041 6.45250165892502 3.71791196637911 A:G G A 10 0.537708471577085 0.23062606198749 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703529_47703752:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703529_47703752:MCM3AP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47704896 G/A 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703982_47705308:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703982_47705236:MCM3AP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47777063 G/A 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G G A 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000337772:exon_47776889_47777106:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47776889_47777106:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47786817 C/G 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 C:G C G 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 9 1 10 4.16062375580623 0.537708471577085 3.62291528422915 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0250233828426948 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47831845 G/A 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 G G 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47836653 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 A:G G A 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 11 5 16 5.08520681265207 2.68854235788543 2.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.317076399536816 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:C A C 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47961711 G/A 1 1 7 8 0.462291528422915 3.76395930103959 -3.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0284854418445818 ENSG00000160305:ENST00000400274:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000457905:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000318711:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000358985:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000427143:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000417564:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000473752:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000494435:exon_47961669_47961808:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47961669_47961808:DIP2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 21 47966977 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47966828_47967118:DIP2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 17590269 C/T 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 17669306 T/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C T C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 14 17 31 6.47208139792081 9.14104401681045 -2.66896261888964 T:G T G 10 0.537708471577085 0.370890806424659 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 18209496 A/G 1 13 22 35 6.00978986949789 11.8295863746959 -5.81979650519798 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0611722000368765 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 A:G A G 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19026613 A/G 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19122665 C/T 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19122573_19122688:DGCR14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19165478 A/G 1 58 67 125 26.8129086485291 36.0264675956647 -9.21355894713563 A:G A G 10 0.537708471577085 0.106468940332896 ENSG00000100075:ENST00000215882:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000451283:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000470922:exon_19165240_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000461267:exon_19165455_19165554:SLC25A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 130 149 279 60.097898694979 80.1185622649857 -20.0206635700067 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0190412591785502 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:G T G 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19906511 G/A 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:G G A 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19906383_19906527:TXNRD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 A:C C A 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 56 39 95 25.8883255916832 20.9706303915063 4.91769520017693 T:C C T 10 0.537708471577085 0.354613824222578 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 117 109 226 54.0881088254811 58.6102234019023 -4.52211457642122 A:G G A 10 0.537708471577085 0.549045816688488 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 36 20 56 16.6424950232249 10.7541694315417 5.88832559168324 A:G A G 10 0.537708471577085 0.139952584232215 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 21354158 C/G 1 62 82 144 28.6620747622207 44.092094669321 -15.4300199071002 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0119184823865900 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21353393_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354061_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354062_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354063_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354066_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354091_21354721:THAP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 21983853 G/A 1 29 30 59 13.4064543242645 16.1312541473125 -2.72479982304801 A:G G A 10 0.537708471577085 0.515060078318999 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21983299_21984050:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21983832_21984050:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21983597_21984050:YDJC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 37 31 68 17.1047865516479 16.6689626188896 0.435823932758218 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 22039199 C/T 1 6 14 20 2.77374917053749 7.52791860207919 -4.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0422235998601876 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22039042_22039202:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22039042_22039202:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22039042_22039202:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22039042_22039202:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22039042_22039202:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22039042_22039202:PPIL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 23223278 A/T 1 324 6 330 149.782455209024 3.22625082946251 146.556204379562 A:T A T 10 0.537708471577085 1.15907715558825e-77 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 23631801 T/C 1 13 4 17 6.00978986949789 2.15083388630834 3.85895598318955 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0863743251363987 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 97 87 184 44.8422782570228 46.7806370272064 -1.93835877018364 A:G G A 10 0.537708471577085 0.824548081618643 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 115 66 181 53.1635257686352 35.4887591240876 17.6747666445476 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00895339333686004 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24509645 G/C 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000467937:exon_24509533_24509715:CABIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24567891 C/G 1 16 13 29 7.39666445476664 6.99021013050211 0.406454324264534 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24567681_24567963:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24567681_24567963:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24567681_24567963:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24567681_24567963:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24567681_24567963:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24567681_24567963:CABIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24573593 C/T 1 25 14 39 11.5572882105729 7.52791860207919 4.02936960849368 T:C C T 10 0.537708471577085 0.203794985342094 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24573472_24573785:CABIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 33 20 53 15.2556204379562 10.7541694315417 4.50145100641449 T:C T C 10 0.537708471577085 0.270294714553727 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24837365 G/A 1 49 52 101 22.6522848927228 27.9608405220084 -5.30855562928559 A:G G A 10 0.537708471577085 0.318599282789858 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 572 578 1150 264.430754257907 310.795496571555 -46.3647423136478 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.00649309904322897 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 26117343 A/G 1 37 47 84 17.1047865516479 25.272298164123 -8.16751161247514 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0801684151786498 ENSG00000100077:ENST00000324198:exon_26117251_26117364:ADRBK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 26906089 G/C 1 16 14 30 7.39666445476664 7.52791860207919 -0.13125414731255 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000412662:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26906030_26906240:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000479489:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000472918:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000455080:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000418876:exon_26906030_26906247:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000420242:exon_26906030_26906247:TFIP11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 14 19 33 6.47208139792081 10.2164609599646 -3.74437956204381 T:G G T 10 0.537708471577085 0.222694445595855 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 33 27 60 15.2556204379562 14.5181287325813 0.737491705374898 T:C C T 10 0.537708471577085 0.897432780594124 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29886386 C/T 1 13 1 14 6.00978986949789 0.537708471577085 5.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00255392269121495 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29886413 A/G 1 2 10 12 0.92458305684583 5.37708471577085 -4.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0165438968231611 ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 15 27 42 6.93437292634373 14.5181287325813 -7.58375580623757 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0203707715236239 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 12 17 29 5.54749834107498 9.14104401681045 -3.59354567573547 T:C C T 10 0.537708471577085 0.196168114218119 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 30688339 G/A 1 36 35 71 16.6424950232249 18.819796505198 -2.17730148197304 A:G G A 10 0.537708471577085 0.635118982794146 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30687980_30688349:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 31006860 A/G 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000423350:exon_31006858_31007101:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31006858_31007050:TCN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 31011610 G/C 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 31850238 G/A 1 24 24 48 11.09499668215 12.90500331785 -1.81000663570008 A:G G A 10 0.537708471577085 0.664865013052188 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31850166_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000418321:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 31924798 G/A 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000198089:ENST00000465646:exon_31924676_31925053:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31924676_31924849:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31924676_31924849:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000465437:exon_31924676_31924852:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000411518:exon_31924676_31924849:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000444859:exon_31924676_31924821:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31924676_31924849:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31924676_31924849:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31924676_31924849:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000450787:exon_31924731_31924849:SFI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:G G A 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 20 12 32 9.2458305684583 6.45250165892502 2.79332890953328 T:C T C 10 0.537708471577085 0.377331249813687 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 32019696 G/A 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000241878:ENST00000382151:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000266095:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000473770:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397500:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397503:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000397502:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000451635:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000478893:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000422020:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000442379:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000431201:exon_32019670_32019835:PISD;ENSG00000241878:ENST00000429683:exon_32019670_32019835:PISD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 32435511 G/A 0 176 0 176 81.363309002433 0 81.363309002433 G G 10 0.537708471577085 4.79382599193501e-48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 32792223 A/G 1 67 64 131 30.9735324043353 34.4133421809334 -3.43980977659814 A:G A G 10 0.537708471577085 0.599251948635816 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32792061_32792236:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32792061_32792236:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32792061_32792236:C22orf28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 70 67 137 32.3604069896041 36.0264675956647 -3.66606060606065 T:C C T 10 0.537708471577085 0.549347665308743 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 32871383 T/G 1 25 11 36 11.5572882105729 5.91479318734793 5.64249502322494 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0663602614238916 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 33670584 G/A 0 10 0 10 4.62291528422915 0 4.62291528422915 G G 10 0.537708471577085 0.00246636601179183 ENSG00000133424:ENST00000354992:exon_33668847_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000337431:exon_33668847_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000397394:exon_33669062_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000402320:exon_33669075_33670610:LARGE;ENSG00000133424:ENST00000437602:exon_33670412_33670610:LARGE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 35660875 G/T 1 11 16 27 5.08520681265207 8.60333554523336 -3.5181287325813 T:G G T 10 0.537708471577085 0.182622328871397 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 17 8 25 7.85895598318955 4.30166777261668 3.55728821057287 T:G T G 10 0.537708471577085 0.166016390582096 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 54 56 110 24.9637425348374 30.1116744083168 -5.14793187347935 A:T A T 10 0.537708471577085 0.339938697839509 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 38 39 77 17.5670780800708 20.9706303915063 -3.40355231143555 A:G A G 10 0.537708471577085 0.493183822441313 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 22 13 35 10.1704136253041 6.99021013050211 3.18020349480202 A:G G A 10 0.537708471577085 0.312377672013397 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 30 33 63 13.8687458526875 17.7443795620438 -3.87563370935635 A:C C A 10 0.537708471577085 0.376736108840903 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 36 35 71 16.6424950232249 18.819796505198 -2.17730148197304 A:G G A 10 0.537708471577085 0.635118982794146 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 39 33 72 18.0293696084937 17.7443795620438 0.284990046449881 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 34 25 59 15.7179119663791 13.4427117894271 2.27520017695198 A:G G A 10 0.537708471577085 0.602700724468211 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36662064 G/A 1 21 25 46 9.70812209688122 13.4427117894271 -3.73458969254591 A:G G A 10 0.537708471577085 0.301806897507496 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 122 156 278 56.3995664675956 83.8825215660253 -27.4829550984296 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00112541736191324 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 123 136 259 56.8618579960185 73.1283521344836 -16.266494138465 A:C:G C A 10 0.537708471577085 0.0460358936239246 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36684980 G/A 1 338 244 582 156.254536606945 131.200867064809 25.0536695421365 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0376947117985072 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684773_36684985:MYH9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36691691 T/C 1 141 79 220 65.183105507631 42.4789692545897 22.7041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00228104527154347 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000459960:exon_36691558_36691763:MYH9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 272 286 558 125.743295731033 153.784622871046 -28.0413271400134 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.0174525361414336 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 200 192 392 92.458305684583 103.2400265428 -10.7817208582173 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.28754722094465 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 381 438 819 176.133072329131 235.516310550763 -59.3832382216326 A:G A G 10 0.537708471577085 3.45795330766400e-05 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 492 490 982 227.447431984074 263.477151072772 -36.0297190886975 T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.0212311346138792 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 65 65 130 30.0489493474895 34.9510506525105 -4.90210130502105 T:C C T 10 0.537708471577085 0.428729183692529 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 12 16 28 5.54749834107498 8.60333554523336 -3.05583720415838 T:C C T 10 0.537708471577085 0.261133649980021 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 38212624 C/T 1 39 20 59 18.0293696084937 10.7541694315417 7.27520017695198 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0671033430748046 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38212574_38212732:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 24 10 34 11.09499668215 5.37708471577085 5.71791196637911 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0580134383272736 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 603 630 1233 278.761791639018 338.756337093564 -59.9945454545458 T:C T C 10 0.537708471577085 0.000671381591687421 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 T:G G T 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 T:C C T 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 15 6 21 6.93437292634373 3.22625082946251 3.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.126832789288604 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 A:C C A 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 11 18 29 5.08520681265207 9.67875248838753 -4.59354567573547 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0957464810231972 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39482371 C/G 1 143 147 290 66.1076885644768 79.0431453218315 -12.9354567573547 C:G C G 10 0.537708471577085 0.140826464933655 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39482284_39482572:APOBEC3G HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:G G T 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 313 345 658 144.697248396372 185.509422694094 -40.8121742977219 A:C A C 10 0.537708471577085 0.00152624082657890 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 T:C T C 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 C:G G C 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 42 42 84 19.4162441937624 22.5837558062376 -3.16751161247514 C:G C G 10 0.537708471577085 0.51262642635052 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 41652733 G/A 1 30 34 64 13.8687458526875 18.2820880336209 -4.41334218093344 A:G G A 10 0.537708471577085 0.315979508256788 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652715_41652828:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652715_41652828:RANGAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 531 482 1013 245.476801592568 259.175483300155 -13.6986817075871 A:T:C:G G T 10 0.537708471577085 0.394992505419129 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 31 19 50 14.3310373811104 10.2164609599646 4.11457642114575 A:C C A 10 0.537708471577085 0.259478427796551 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 24 25 49 11.09499668215 13.4427117894271 -2.34771510727717 T:C C T 10 0.537708471577085 0.567270732976311 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 41 53 94 18.9539526653395 28.4985489935855 -9.54459632824599 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0498560102208102 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42343091 G/A 1 50 46 96 23.1145764211457 24.7345896925459 -1.62001327140016 A:G G A 10 0.537708471577085 0.759551465722888 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42343024_42343168:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42343024_42343140:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42343024_42343148:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42343024_42343155:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000460824:exon_42343024_42343137:CENPM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42482205 A/G 1 340 291 631 157.179119663791 156.473165228932 0.705954434859336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.968169722037344 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42481529_42482318:NDUFA6;ENSG00000184983:ENST00000470753:exon_42482120_42482318:NDUFA6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 24 14 38 11.09499668215 7.52791860207919 3.56707808007077 T:C C T 10 0.537708471577085 0.259667359629290 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42607817 C/T 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 141 33 174 65.183105507631 17.7443795620438 47.4387259455872 T:G G T 10 0.537708471577085 6.73404294980213e-14 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 188 164 352 86.910807343508 88.1841893386419 -1.27338199513393 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.914901236673249 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 42912136 G/T 1 369 111 480 170.585573988056 59.6856403450564 110.899933642999 T:G G T 10 0.537708471577085 1.41075705060461e-25 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43024271 G/C 1 47 53 100 21.727701835877 28.4985489935855 -6.7708471577085 C:G G C 10 0.537708471577085 0.192469048881067 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000470741:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43024158_43024287:CYB5R3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 17 28 45 7.85895598318955 15.0558372041584 -7.19688122096882 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0360218276494609 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 11 25 36 5.08520681265207 13.4427117894271 -8.35750497677506 A:C:G G C 10 0.537708471577085 0.00674492289909437 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 21 13 34 9.70812209688122 6.99021013050211 2.71791196637911 A:G A G 10 0.537708471577085 0.392827901382920 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43203137 C/T 1 25 20 45 11.5572882105729 10.7541694315417 0.803118779031173 T:C C T 10 0.537708471577085 0.8816626047185 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 14 22 36 6.47208139792081 11.8295863746959 -5.35750497677506 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0935977510488975 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43278220 C/T 1 26 22 48 12.0195797389958 11.8295863746959 0.189993364299919 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100266:ENST00000505238:exon_43278190_43278256:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43278190_43278310:PACSIN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43284734 T/C 1 30 33 63 13.8687458526875 17.7443795620438 -3.87563370935635 T:C T C 10 0.537708471577085 0.376736108840903 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43284649_43284804:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43284649_43284804:PACSIN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43289473 G/A 1 32 27 59 14.7933289095333 14.5181287325813 0.275200176951984 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43289463_43289619:PACSIN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 7 14 21 3.23604069896041 7.52791860207919 -4.29187790311878 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0787255321210082 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43455432 G/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 30 39 69 13.8687458526875 20.9706303915063 -7.10188453881887 C:G G C 10 0.537708471577085 0.091734411061485 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 43558926 A/G 1 117 80 197 54.0881088254811 43.0166777261668 11.0714310993142 A:G A G 10 0.537708471577085 0.116445962969965 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 39 41 80 18.0293696084937 22.0460473346605 -4.0166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.372305201240989 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 60 51 111 27.7374917053749 27.4231320504313 0.314359654943566 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 49 41 90 22.6522848927228 22.0460473346605 0.60623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 0.916233910871362 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 55 49 104 25.4260340632603 26.3477151072772 -0.921681044016839 A:G A G 10 0.537708471577085 0.921727657483697 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 145 122 267 67.0322716213227 65.6004335324044 1.43183808891831 T:C T C 10 0.537708471577085 0.902344499139652 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 130 165 295 60.097898694979 88.721897810219 -28.6239991152401 A:C:G A C 10 0.537708471577085 0.000860540744970503 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 47087670 G/A 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000471929:exon_47087469_47087674:CERK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 47116023 G/A 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47115983_47116105:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47115983_47116105:CERK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50216754 G/A 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50216599_50216861:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000459821:exon_50216599_50216949:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000494833:exon_50216599_50216853:BRD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50277523 G/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50280136 T/C 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 T:C T C 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50301476 T/C 1 10 13 23 4.62291528422915 6.99021013050211 -2.36729484627296 T:C T C 10 0.537708471577085 0.403909186715981 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50307315 C/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50307252_50307491:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50307252_50307491:ALG12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 38 20 58 17.5670780800708 10.7541694315417 6.81290864852907 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0864184173471415 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50315363 C/A 1 48 28 76 22.1899933642999 15.0558372041584 7.13415616014154 A:C C A 10 0.537708471577085 0.107950277504168 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000498354:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50315232_50315409:CRELD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50316901 C/T 1 23 12 35 10.632705153727 6.45250165892502 4.18020349480202 T:C C T 10 0.537708471577085 0.176988164687284 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50316882_50316965:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50316882_50316965:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50316882_50316965:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50316882_50316965:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50316882_50316965:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50316882_50317048:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50316882_50316912:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50316882_50316965:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 36 19 55 16.6424950232249 10.2164609599646 6.42603406326032 A:C C A 10 0.537708471577085 0.103854987830273 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.119372635940883 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 96 78 174 44.3799867285998 41.9412607830126 2.43872594558721 T:C T C 10 0.537708471577085 0.761172330242834 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 94 71 165 43.455403671754 38.177301481973 5.27810218978097 C:G G C 10 0.537708471577085 0.435407462642874 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 14 6 20 6.47208139792081 3.22625082946251 3.2458305684583 T:C T C 10 0.537708471577085 0.180236988291815 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50659481 G/A 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 T:C T C 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 12 20 32 5.54749834107498 10.7541694315417 -5.20667109046672 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0762053180275848 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 21 19 40 9.70812209688122 10.2164609599646 -0.5083388630834 A:G A G 10 0.537708471577085 0.87553259952279 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C T C 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 33 18 51 15.2556204379562 9.67875248838753 5.57686794956866 C:G G C 10 0.537708471577085 0.124312567692157 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 32 14 46 14.7933289095333 7.52791860207919 7.26541030745409 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0376680127179215 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 40 19 59 18.4916611369166 10.2164609599646 8.27520017695198 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0360738416943188 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50945256 A/G 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50945211_50945549:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50945224_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50945211_50945464:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000507607:exon_50945211_50945679:LMF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50969647 C/G 1 28 34 62 12.9441627958416 18.2820880336209 -5.33792523777927 C:G C G 10 0.537708471577085 0.202714420771171 ENSG00000177989:ENST00000468249:exon_50969620_50970251:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000401779:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000403326:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000456888:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000438960:exon_50969620_50969770:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000424610:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000329363:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000405135:exon_50969620_50969770:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000428989:exon_50969620_50969724:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000463472:exon_50969620_50969852:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000469660:exon_50969620_50969724:ODF3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 50987843 C/T 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 14 17 31 6.47208139792081 9.14104401681045 -2.66896261888964 C:G G C 10 0.537708471577085 0.370890806424659 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 4856180 T/C 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 4856234 G/A 1 17 14 31 7.85895598318955 7.52791860207919 0.331037381110365 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 4878595 C/A 1 20 15 35 9.2458305684583 8.06562707365627 1.18020349480202 A:C C A 10 0.537708471577085 0.736962690946534 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000478515:exon_4878458_4878632:ITPR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 5241309 C/A 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 A:C C A 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000134109:ENST00000256497:exon_5241277_5241380:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000465369:exon_5241277_5241380:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000445686:exon_5241277_5241380:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000492751:exon_5241277_5241380:EDEM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 7 13 20 3.23604069896041 6.99021013050211 -3.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.116331864298699 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9005078 C/T 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 11 18 29 5.08520681265207 9.67875248838753 -4.59354567573547 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0957464810231972 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 0 11 0 11 5.08520681265207 0 5.08520681265207 G G 10 0.537708471577085 0.00129256353225763 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 68 74 142 31.4358239327582 39.7904268967043 -8.35460296394607 T:C T C 10 0.537708471577085 0.178024404764372 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9934912 G/A 1 115 120 235 53.1635257686352 64.5250165892502 -11.361490820615 A:G G A 10 0.537708471577085 0.149985123689561 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 C:G G C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 11 3 14 5.08520681265207 1.61312541473126 3.47208139792081 C:G C G 10 0.537708471577085 0.104463576674659 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 A:G A G 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 51 25 76 23.5768679495687 13.4427117894271 10.1341561601415 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0211757940267545 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 24 17 41 11.09499668215 9.14104401681045 1.95395266533951 A:G G A 10 0.537708471577085 0.63910347998138 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 35 23 58 16.180203494802 12.367294846273 3.81290864852907 T:C T C 10 0.537708471577085 0.35751476363841 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 11831953 C/T 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000498127:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11831920_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000486090:exon_11831922_11832055:C3orf31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 26 30 56 12.0195797389958 16.1312541473125 -4.11167440831676 T:C T C 10 0.537708471577085 0.285857156672404 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 37 30 67 17.1047865516479 16.1312541473125 0.973532404335305 T:C C T 10 0.537708471577085 0.902619119607209 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 33 30 63 15.2556204379562 16.1312541473125 -0.875633709356356 A:G A G 10 0.537708471577085 0.89961022202298 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 25 18 43 11.5572882105729 9.67875248838753 1.87853572218534 T:G G T 10 0.537708471577085 0.647261718349993 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13367406 C/T 1 25 30 55 11.5572882105729 16.1312541473125 -4.57396593673968 T:C C T 10 0.537708471577085 0.226046327261391 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 28 37 65 12.9441627958416 19.8952134483521 -6.95105065251052 A:G G A 10 0.537708471577085 0.105148527685477 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13379400 C/T 1 12 20 32 5.54749834107498 10.7541694315417 -5.20667109046672 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0762053180275848 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 26 24 50 12.0195797389958 12.90500331785 -0.885423578854251 A:G A G 10 0.537708471577085 0.887428128576512 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13395579 C/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:C C A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13399786 G/A 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 A:G G A 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13399722_13399895:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13399722_13399895:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 15637914 G/A 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000421993:exon_15637891_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000469454:exon_15637422_15637931:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000460907:exon_15637659_15637931:HACL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 16327909 C/T 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 16364954 C/T 1 165 155 320 76.278102189781 83.3448130944482 -7.0667109046672 T:C C T 10 0.537708471577085 0.433049470213675 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 19 20 39 8.78353904003538 10.7541694315417 -1.97063039150632 T:G T G 10 0.537708471577085 0.526390639453036 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 18 17 35 8.32124751161247 9.14104401681045 -0.819796505197976 A:G G A 10 0.537708471577085 0.86585821201555 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 33879770 G/A 1 29 18 47 13.4064543242645 9.67875248838753 3.727701835877 A:G G A 10 0.537708471577085 0.307630017689061 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33879696_33879819:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33879696_33879819:PDCD6IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 33907915 A/G 1 80 52 132 36.9833222738332 27.9608405220084 9.02248175182477 A:G A G 10 0.537708471577085 0.117104547809774 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 37034446 G/C 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 ENSG00000178567:ENST00000322716:exon_37027357_37034795:EPM2AIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 38168125 A/C 1 51 41 92 23.5768679495687 22.0460473346605 1.53082061490818 A:C A C 10 0.537708471577085 0.834502881931344 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 38271881 C/T 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C C T 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000172939:ENST00000446845:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000311806:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000426620:exon_38271856_38272184:OXSR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 39185248 A/G 1 16 14 30 7.39666445476664 7.52791860207919 -0.13125414731255 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 180 105 285 83.2124751161247 56.4593895155939 26.7530856005308 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.00159834252086579 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 41952852 T/C 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000168038:ENST00000301831:exon_41952809_41952878:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000420927:exon_41952809_41952878:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000481226:exon_41952809_41952878:ULK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 41996136 T/C 1 15 3 18 6.93437292634373 1.61312541473126 5.32124751161247 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0157675314807417 ENSG00000168038:ENST00000301831:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000420927:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000497684:exon_41996114_41996290:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000453224:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000431379:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000414606:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000460978:exon_41996114_41996299:ULK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 42675110 T/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:G T G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42675072_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42675072_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42675072_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000383749:exon_42675072_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42675072_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000498730:exon_42675072_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000460807:exon_42674701_42675227:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000508351:exon_42674701_42675227:NKTR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 44683454 G/C 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 C:G G C 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000186448:ENST00000344387:exon_44683392_44685712:ZNF197;ENSG00000186448:ENST00000396058:exon_44683392_44686754:ZNF197 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 44775962 A/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000186446:ENST00000396048:exon_44775689_44778575:ZNF501;ENSG00000186446:ENST00000302420:exon_44775689_44777036:ZNF501;ENSG00000186446:ENST00000332489:exon_44775914_44776301:ZNF501 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 44871505 A/T 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 A:T A T 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44871463_44871567:KIF15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 21 10 31 9.70812209688122 5.37708471577085 4.33103738111036 A:C C A 10 0.537708471577085 0.149280507860683 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 45637253 C/T 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 45637765 A/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000144791:ENST00000440097:exon_45635816_45637779:LIMD1;ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45636351_45637779:LIMD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 25 13 38 11.5572882105729 6.99021013050211 4.56707808007077 T:C C T 10 0.537708471577085 0.146334159198953 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 66431104 G/A 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 66431280 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 54 26 80 24.9637425348374 13.9804202610042 10.9833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0136709945227606 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 72897467 T/C 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72897349_72897631:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72897349_72897566:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000471526:exon_72897349_72897623:SHQ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 24 15 39 11.09499668215 8.06562707365627 3.02936960849368 T:C T C 10 0.537708471577085 0.341475003103099 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 75471230 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 75471295 C/T 1 11 5 16 5.08520681265207 2.68854235788543 2.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.317076399536816 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 75471341 G/A 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 A:G G A 10 0.537708471577085 0.40524635486904 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 75472209 C/T 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:C C T 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 18 20 38 8.32124751161247 10.7541694315417 -2.43292191992923 T:C T C 10 0.537708471577085 0.5157847888304 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 36 30 66 16.6424950232249 16.1312541473125 0.511240875912389 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 21 18 39 9.70812209688122 9.67875248838753 0.0293696084936848 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 98304403 G/A 1 21 23 44 9.70812209688122 12.367294846273 -2.65917274939174 A:G G A 10 0.537708471577085 0.452031865340640 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 28 19 47 12.9441627958416 10.2164609599646 2.727701835877 T:G T G 10 0.537708471577085 0.466648410699165 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 69 60 129 31.8981154611811 32.2625082946251 -0.364392833443965 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 101177848 T/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000138468:ENST00000394095:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394094:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000314261:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394091:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000358203:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000348610:exon_101177799_101177896:SENP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 101520537 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000144815:ENST00000273347:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000491511:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000477909:exon_101520079_101520833:FAM55C;ENSG00000144815:ENST00000422132:exon_101520079_101520833:FAM55C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 101576175 T/C 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C T C 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000144802:ENST00000394054:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000483180:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326151:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000326172:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000477601:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495089:exon_101576136_101576303:NFKBIZ;ENSG00000144802:ENST00000495719:exon_101576044_101576303:NFKBIZ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 27 21 48 12.4818712674187 11.2918779031188 1.18999336429992 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.773653377742187 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 12 10 22 5.54749834107498 5.37708471577085 0.170413625304129 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 11 6 17 5.08520681265207 3.22625082946251 1.85895598318956 T:G T G 10 0.537708471577085 0.468286092935019 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:G G A 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 107937408 C/T 1 19 14 33 8.78353904003538 7.52791860207919 1.25562043795619 T:C C T 10 0.537708471577085 0.728806662291829 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107937240_107937500:IFT57 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 108288326 A/G 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 A:G A G 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108288236_108288454:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108288236_108288454:KIAA1524 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 108298260 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108298128_108298273:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108298128_108298273:KIAA1524 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 113286405 C/T 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113286387_113286557:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113286387_113286763:SIDT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 15 6 21 6.93437292634373 3.22625082946251 3.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.126832789288604 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119134391 C/T 1 19 19 38 8.78353904003538 10.2164609599646 -1.43292191992923 T:C C T 10 0.537708471577085 0.745403862879188 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119219573 A/G 1 41 33 74 18.9539526653395 17.7443795620438 1.20957310329571 A:G A G 10 0.537708471577085 0.816352498703669 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119236104 G/A 1 93 79 172 42.9931121433311 42.4789692545897 0.514142888741382 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000493694:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000486418:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000466984:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000498399:exon_119236052_119236162:C3orf1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119236179 G/A 1 31 26 57 14.3310373811104 13.9804202610042 0.350617120106154 A:G G A 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119242443 C/T 1 7 20 27 3.23604069896041 10.7541694315417 -7.5181287325813 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00577335168169104 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 4 16 20 1.84916611369166 8.60333554523336 -6.7541694315417 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.00282263278941624 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119305379 T/A 1 14 5 19 6.47208139792081 2.68854235788543 3.78353904003538 A:T T A 10 0.537708471577085 0.10665894054281 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 20 17 37 9.2458305684583 9.14104401681045 0.104786551647853 A:T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 17 14 31 7.85895598318955 7.52791860207919 0.331037381110365 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 20 14 34 9.2458305684583 7.52791860207919 1.71791196637911 C:G C G 10 0.537708471577085 0.608645173355244 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 18 14 32 8.32124751161247 7.52791860207919 0.79332890953328 T:C T C 10 0.537708471577085 0.860157369191954 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 215 161 376 99.3926786109267 86.5710639239107 12.821614687016 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.196047181466177 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 226 192 418 104.477885423579 103.2400265428 1.23785888077846 A:G G A 10 0.537708471577085 0.921899533148519 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 112 74 186 51.7766511833665 39.7904268967043 11.9862242866622 A:G G A 10 0.537708471577085 0.090513940308004 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121412892 A/G 1 25 23 48 11.5572882105729 12.367294846273 -0.810006635700081 A:G A G 10 0.537708471577085 0.885213031086349 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 27 18 45 12.4818712674187 9.67875248838753 2.80311877903117 T:C C T 10 0.537708471577085 0.456184384537351 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121414217 C/A 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:C C A 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 T:C T C 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121416623 G/C 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121415847_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121415874_121417776:GOLGB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 19 16 35 8.78353904003538 8.60333554523336 0.180203494802024 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:C A C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 121825197 G/A 1 58 49 107 26.8129086485291 26.3477151072772 0.465193541251907 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121825045_121825347:CD86 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 122290579 C/T 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122290525_122294050:DTX3L;ENSG00000163840:ENST00000383661:exon_122290525_122290594:DTX3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 122345870 C/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122345674_122345880:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000473627:exon_122345674_122345880:PARP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 74 51 125 34.2095731032957 27.4231320504313 6.78644105286438 A:G A G 10 0.537708471577085 0.243881078383931 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 60 36 96 27.7374917053749 19.3575049767751 8.37998672859984 T:C C T 10 0.537708471577085 0.101094495450136 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 122437321 T/C 1 61 60 121 28.1997832337978 32.2625082946251 -4.06272506082729 T:C T C 10 0.537708471577085 0.467144591535109 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000474669:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398157:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000475640:exon_122437231_122437805:PARP14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 125199103 A/G 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 A:G A G 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000114520:ENST00000251775:exon_125199091_125199163:SNX4;ENSG00000114520:ENST00000471751:exon_125199091_125199163:SNX4;ENSG00000114520:ENST00000465505:exon_125199091_125199163:SNX4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 24 21 45 11.09499668215 11.2918779031188 -0.196881220968825 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 126160641 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000070476:ENST00000514463:exon_126158475_126162252:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126160608_126160789:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126160608_126160789:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126160608_126160789:ZXDC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 45 30 75 20.8031187790312 16.1312541473125 4.67186463171862 A:G G A 10 0.537708471577085 0.298873512136520 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 56 53 109 25.8883255916832 28.4985489935855 -2.61022340190226 T:C C T 10 0.537708471577085 0.63201373803285 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 127783698 A/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:T A T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000175792:ENST00000472125:exon_127783625_127784063:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127783628_127784063:RUVBL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 136 146 282 62.8716478655164 78.5054368502544 -15.633788984738 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0641956116291151 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 154 170 324 71.1928953771289 91.4104401681045 -20.2175447909756 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0257763546880341 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 140 117 257 64.7208139792081 62.9118911745189 1.80892280468915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.851240979899113 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 20 11 31 9.2458305684583 5.91479318734793 3.33103738111036 A:T:C A C 10 0.537708471577085 0.280780991059551 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 335 246 581 154.867662021677 132.276284007963 22.5913780137136 A:G G A 10 0.537708471577085 0.061223241036452 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 54 41 95 24.9637425348374 22.0460473346605 2.91769520017692 T:C T C 10 0.537708471577085 0.607267224081911 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 63 35 98 29.1243662906436 18.819796505198 10.3045697854457 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0423394896058441 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 129034758 A/G 1 24 14 38 11.09499668215 7.52791860207919 3.56707808007077 A:G A G 10 0.537708471577085 0.259667359629290 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 133342218 C/T 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 T:C C T 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133342155_133342301:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133342155_133342301:TOPBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 22 21 43 10.1704136253041 11.2918779031188 -1.12146427781465 C:G G C 10 0.537708471577085 0.761366051085368 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 134278270 C/T 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134277992_134278271:CEP63 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 136062724 C/G 1 3 9 12 1.38687458526874 4.83937624419377 -3.45250165892502 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0780281383639108 ENSG00000118007:ENST00000383202:exon_136062674_136062848:STAG1;ENSG00000118007:ENST00000236698:exon_136062674_136062848:STAG1;ENSG00000118007:ENST00000483235:exon_136062674_136062848:STAG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 14 26 40 6.47208139792081 13.9804202610042 -7.5083388630834 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0251551750449216 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 19 24 43 8.78353904003538 12.90500331785 -4.12146427781466 A:G G A 10 0.537708471577085 0.223486633833446 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 148786108 C/T 1 4 10 14 1.84916611369166 5.37708471577085 -3.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0653916474415341 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148786027_148786122:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148786027_148786122:HLTF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 39 49 88 18.0293696084937 26.3477151072772 -8.31834549878348 A:G A G 10 0.537708471577085 0.086826221023796 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 T:G T G 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 121 0 121 55.9372749391727 0 55.9372749391727 T T 10 0.537708471577085 2.94617897541919e-33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 48 42 90 22.1899933642999 22.5837558062376 -0.39376244193765 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 150321162 C/T 0 16 0 16 7.39666445476664 0 7.39666445476664 C C 10 0.537708471577085 5.31887818557344e-05 ENSG00000198843:ENST00000471696:exon_150321075_150321286:RP11-392O18.1;ENSG00000198843:ENST00000477889:exon_150321078_150321286:RP11-392O18.1;ENSG00000198843:ENST00000492132:exon_150321115_150321286:RP11-392O18.1;ENSG00000198843:ENST00000485923:exon_150321123_150321473:RP11-392O18.1;ENSG00000198843:ENST00000361622:exon_150321123_150321286:RP11-392O18.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 158386891 G/A 1 16 10 26 7.39666445476664 5.37708471577085 2.01957973899579 A:G G A 10 0.537708471577085 0.556045575489951 ENSG00000079257:ENST00000482640:exon_158386785_158386921:LXN;ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158386785_158386921:LXN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 78 61 139 36.0587392169874 32.8002167662022 3.25852245078519 T:C C T 10 0.537708471577085 0.610342588706271 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 158538056 T/C 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000437603:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000361159:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000477743:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000465624:exon_158538004_158538115:MFSD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 159997061 T/A 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:T T A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_159996981_159997152:RP11-432B6.3;ENSG00000068885:ENST00000326448:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000483465:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000496589:exon_159996981_159997152:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000487943:exon_159996981_159997152:IFT80 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 160131347 A/G 1 32 48 80 14.7933289095333 25.8100066357001 -11.0166777261668 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.0179773729277338 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000487747:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465563:exon_160131261_160131401:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000494612:exon_160131261_160131371:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467263:exon_160131261_160131542:SMC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 160156318 A/G 1 7 16 23 3.23604069896041 8.60333554523336 -5.36729484627296 A:G A G 10 0.537708471577085 0.034509773593791 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 160227606 A/G 1 23 29 52 10.632705153727 15.5935456757355 -4.96084052200842 A:G A G 10 0.537708471577085 0.210286382760523 ENSG00000186432:ENST00000334256:exon_160227588_160227659:KPNA4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 170893070 G/A 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 178927410 A/G 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000121879:ENST00000263967:exon_178927383_178927488:PIK3CA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 51 35 86 23.5768679495687 18.819796505198 4.75707144437069 A:G A G 10 0.537708471577085 0.331256562672809 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 123 114 237 56.8618579960185 61.2987657597877 -4.43690776376915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.602362494235578 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 114 92 206 52.7012342402123 49.4691793850918 3.23205485512049 A:C A C 10 0.537708471577085 0.675420096851015 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 180325487 T/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180325436_180325553:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000470669:exon_180325436_180326059:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000382584:exon_180325436_180325553:TTC14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 182614493 T/C 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000058063:ENST00000323116:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000433285:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000498086:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000442545:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000466758:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000482070:exon_182614488_182614553:ATP11B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 182681740 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000043093:ENST00000292782:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000469954:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000492563:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000497606:exon_182681669_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000460412:exon_182681719_182681837:DCUN1D1;ENSG00000043093:ENST00000487822:exon_182681736_182681837:DCUN1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 182790249 G/A 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000486226:exon_182790215_182790275:MCCC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 182853554 G/A 1 73 59 132 33.7472815748728 31.724799823048 2.02248175182478 A:G G A 10 0.537708471577085 0.793545469902116 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 52 66 118 24.0391594779916 35.4887591240876 -11.449599646096 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0418019071177533 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 183474412 A/G 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183474316_183474477:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183474316_183474477:YEATS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 96 83 179 44.3799867285998 44.6298031408981 -0.249816412298216 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 54 54 108 24.9637425348374 29.0362574651626 -4.07251493032518 A:G A G 10 0.537708471577085 0.441589756337015 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 54 63 117 24.9637425348374 33.8756337093564 -8.91189117451895 A:G A G 10 0.537708471577085 0.114643005319629 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 183911516 A/G 1 46 36 82 21.2654103074541 19.3575049767751 1.90790533067903 A:G A G 10 0.537708471577085 0.740033942485195 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183911328_183911795:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183911328_183911793:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183911328_183911800:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000468892:exon_183911328_183911790:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480539:exon_183911328_183911557:ABCF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 183975444 T/C 1 17 8 25 7.85895598318955 4.30166777261668 3.55728821057287 T:C T C 10 0.537708471577085 0.166016390582096 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000351385:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000402825:exon_183975261_183975544:ECE2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 184428800 T/C 1 35 25 60 16.180203494802 13.4427117894271 2.7374917053749 T:C T C 10 0.537708471577085 0.518962772324876 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 5 12 17 2.31145764211457 6.45250165892502 -4.14104401681045 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0522275164214068 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 1094 12 1106 505.746932094669 6.45250165892502 499.294430435744 T:G G T 10 0.537708471577085 1.17002916337932e-271 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 A:C C A 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 95 86 181 43.9176952001769 46.2429285556293 -2.32523335545239 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.765717716703186 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 1 9 10 0.462291528422915 4.83937624419377 -4.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00765186189355883 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 4 17 21 1.84916611369166 9.14104401681045 -7.29187790311879 A:T T A 10 0.537708471577085 0.00160984541813254 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 108 107 215 49.9274850696748 57.5348064587481 -7.60732138907328 A:C C A 10 0.537708471577085 0.305531096959053 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:G G A 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 32 35 67 14.7933289095333 18.819796505198 -4.02646759566469 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.329928235697686 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 194387186 C/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 194387253 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 11 5 16 5.08520681265207 2.68854235788543 2.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.317076399536816 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 194408821 G/C 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 C:G G C 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 195595297 C/T 0 12 0 12 5.54749834107498 0 5.54749834107498 C C 10 0.537708471577085 0.000679479026243913 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 22 31 53 10.1704136253041 16.6689626188896 -6.49854899358551 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0973868168321778 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 19 16 35 8.78353904003538 8.60333554523336 0.180203494802024 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 30 24 54 13.8687458526875 12.90500331785 0.96374253483741 T:C C T 10 0.537708471577085 0.89163441417745 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 197409341 G/A 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197409341_197409486:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197409341_197409486:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197409341_197409486:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197409341_197409486:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197409341_197409486:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197409341_197409486:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197409341_197409486:KIAA0226 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 42 30 72 19.4162441937624 16.1312541473125 3.28499004644988 A:G G A 10 0.537708471577085 0.479240314058347 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 3 197665599 G/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000490748:exon_197665419_197665903:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197665419_197665651:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197665531_197665646:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197665537_197665646:IQCG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 436067 C/A 1 4 10 14 1.84916611369166 5.37708471577085 -3.52791860207919 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0653916474415341 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 674336 A/C 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_674298_674368:MYL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 674373 A/T 1 14 6 20 6.47208139792081 3.22625082946251 3.2458305684583 A:T:G A T 10 0.537708471577085 0.180236988291815 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_674298_674376:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_674298_674376:MYL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 844781 G/A 1 37 48 85 17.1047865516479 25.8100066357001 -8.70522008405223 A:G G A 10 0.537708471577085 0.064358555109585 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_844724_844805:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_844724_845762:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_844724_847616:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_844724_844872:GAK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 941518 C/T 1 8 1 9 3.69833222738332 0.537708471577085 3.16062375580623 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0438932334623324 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505734:exon_941497_942377:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_941497_941942:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_941497_941680:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504850:exon_941497_942298:TMEM175 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1244416 A/G 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 3 9 12 1.38687458526874 4.83937624419377 -3.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0780281383639108 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1305799 C/T 1 32 27 59 14.7933289095333 14.5181287325813 0.275200176951984 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000508634:exon_1305767_1306374:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1305767_1305949:MAEA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 133 115 248 61.4847732802477 61.8364742313648 -0.351700951117081 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 62 52 114 28.6620747622207 27.9608405220084 0.701234240212308 A:G G A 10 0.537708471577085 0.925369361464117 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 71 55 126 32.822698518027 29.5739659367397 3.24873258128729 A:G G A 10 0.537708471577085 0.592575994657293 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 88 75 163 40.6816545012165 40.3281353682814 0.353519132935148 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 39 49 88 18.0293696084937 26.3477151072772 -8.31834549878348 A:G G A 10 0.537708471577085 0.086826221023796 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 35 26 61 16.180203494802 13.9804202610042 2.19978323379781 T:C C T 10 0.537708471577085 0.609199822605975 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2743999 A/G 1 108 90 198 49.9274850696748 48.3937624419377 1.53372262773716 A:G A G 10 0.537708471577085 0.88669937737359 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2896425 C/T 1 38 44 82 17.5670780800708 23.6591727493917 -6.09209466932097 T:C C T 10 0.537708471577085 0.185165454411338 ENSG00000087274:ENST00000508684:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000509039:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000508277:exon_2896309_2896460:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000506157:exon_2896309_2896458:ADD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 62 53 115 28.6620747622207 28.4985489935855 0.163525768635225 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2932589 C/T 1 98 80 178 45.3045697854457 43.0166777261668 2.28789205927887 T:C C T 10 0.537708471577085 0.763922704645044 ENSG00000109736:ENST00000514800:exon_2932288_2932877:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000355443:exon_2932292_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000514031:exon_2932292_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000329687:exon_2932295_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000503596:exon_2932310_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508221:exon_2932330_2932877:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507272:exon_2932332_2932680:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507555:exon_2932338_2932680:MFSD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2934920 T/G 1 25 9 34 11.5572882105729 4.83937624419377 6.71791196637911 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0244543492366709 ENSG00000109736:ENST00000514800:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000355443:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000329687:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000503596:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508221:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507555:exon_2934833_2934936:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000509676:exon_2934327_2934936:MFSD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 2943419 G/A 1 36 39 75 16.6424950232249 20.9706303915063 -4.32813536828138 A:G G A 10 0.537708471577085 0.354579335819672 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 3174845 A/C 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:C A C 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3174635_3174858:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3174635_3174858:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509618:exon_3174635_3174954:HTT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 43 53 96 19.8785357221853 28.4985489935855 -8.62001327140016 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0822386052499963 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 6302519 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000506362:exon_6302384_6302644:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000513395:exon_6302384_6302534:WFS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 6602378 G/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G G A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6602350_6602483:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6602350_6602483:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6602350_6602483:MAN2B2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 6612964 C/T 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6612813_6613005:MAN2B2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 8418119 T/G 1 18 22 40 8.32124751161247 11.8295863746959 -3.5083388630834 T:G T G 10 0.537708471577085 0.272050067856685 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8418105_8418262:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8418105_8418262:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8418105_8418262:ACOX3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 10445436 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 193 150 343 89.2222649856226 80.6562707365627 8.56599424905984 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.357907187387707 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 25408838 G/A 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 A:G G A 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000503805:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000505842:exon_25408819_25408875:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25408819_25408875:ANAPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 37903669 A/G 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C T C 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 112 197 309 51.7766511833665 105.928568900686 -54.1519177173193 A:G A G 10 0.537708471577085 7.11448798510793e-10 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 71 136 207 32.822698518027 73.1283521344836 -40.3056536164566 T:C:G T C 10 0.537708471577085 2.46847086223475e-08 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 74 109 183 34.2095731032957 58.6102234019023 -24.4006502986066 A:G A G 10 0.537708471577085 0.000349045886713579 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38775794 A/G 1 43 85 128 19.8785357221853 45.7052200840522 -25.8266843618669 A:G A G 10 0.537708471577085 4.89054908106251e-06 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 43 47 90 19.8785357221853 25.272298164123 -5.39376244193765 A:T:G T G 10 0.537708471577085 0.29047901777573 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 36 40 76 16.6424950232249 21.5083388630834 -4.86584383985846 A:C C A 10 0.537708471577085 0.300629595726322 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 60 158 218 27.7374917053749 84.9579385091794 -57.2204468038045 T:G T G 10 0.537708471577085 6.59868370445681e-15 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C T C 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 9 2 11 4.16062375580623 1.07541694315417 3.08520681265206 C:G G C 10 0.537708471577085 0.073708847002719 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39000305 A/G 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:G A G 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 26 21 47 12.0195797389958 11.2918779031188 0.727701835877005 T:C T C 10 0.537708471577085 0.884368057944362 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39122697 C/T 1 21 5 26 9.70812209688122 2.68854235788543 7.01957973899579 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00548369520274452 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 49 23 72 22.6522848927228 12.367294846273 10.2849900464499 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0175722642893002 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 52 9 61 24.0391594779916 4.83937624419377 19.1997832337978 A:G A G 10 0.537708471577085 2.50026101428578e-07 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 39921942 A/G 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:G A G 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000121892:ENST00000303538:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000412404:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000399797:exon_39921939_39922019:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000503396:exon_39921939_39922019:PDS5A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 41956251 G/A 1 31 16 47 14.3310373811104 8.60333554523336 5.727701835877 A:G G A 10 0.537708471577085 0.107754142000973 ENSG00000109133:ENST00000504986:exon_41956087_41962589:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000264452:exon_41956087_41956874:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000513702:exon_41956087_41956412:TMEM33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 41956255 T/C 1 28 16 44 12.9441627958416 8.60333554523336 4.34082725060826 T:C T C 10 0.537708471577085 0.226744072022342 ENSG00000109133:ENST00000504986:exon_41956087_41962589:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000264452:exon_41956087_41956874:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000513702:exon_41956087_41956412:TMEM33 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 19 18 37 8.78353904003538 9.67875248838753 -0.895213448352147 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.869367207004994 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 7 15 22 3.23604069896041 8.06562707365627 -4.82958637469587 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0524787665296475 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 54011576 T/C 1 24 15 39 11.09499668215 8.06562707365627 3.02936960849368 T:C T C 10 0.537708471577085 0.341475003103099 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 54327235 T/C 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 T:C T C 10 0.537708471577085 0.518915017351894 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:G A G 10 0.537708471577085 0.809438857409755 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 56309992 A/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000134852:ENST00000511124:exon_56309854_56310063:CLOCK;ENSG00000134852:ENST00000309964:exon_56309854_56310063:CLOCK;ENSG00000134852:ENST00000381322:exon_56309854_56310063:CLOCK;ENSG00000134852:ENST00000513440:exon_56309854_56310063:CLOCK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 56874517 A/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56874493_56874548:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56874493_56874548:CEP135 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 A:G G A 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 57215851 G/A 1 13 16 29 6.00978986949789 8.60333554523336 -2.59354567573547 A:G G A 10 0.537708471577085 0.356737441054378 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 3 11 14 1.38687458526874 5.91479318734793 -4.52791860207919 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0280854535870404 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 57 63 120 26.3506171201062 33.8756337093564 -7.5250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.170935533871161 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 50 60 110 23.1145764211457 32.2625082946251 -9.14793187347935 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0854614054329972 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 143 106 249 66.1076885644768 56.997097987171 9.11059057730584 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.253233230152566 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 19 15 34 8.78353904003538 8.06562707365627 0.717911966379109 T:C C T 10 0.537708471577085 0.864573776289205 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 A:G G A 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 10 14 24 4.62291528422915 7.52791860207919 -2.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.306214656238402 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 56 49 105 25.8883255916832 26.3477151072772 -0.459389515593923 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 69203551 A/T 1 58 56 114 26.8129086485291 30.1116744083168 -3.29876575978769 A:T:G A T 10 0.537708471577085 0.573432786528749 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69203290_69203618:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69203290_69203618:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000505251:exon_69203484_69203618:YTHDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 83347266 A/G 1 146 208 354 67.4945631497456 111.843362088034 -44.3487989382881 A:C:G A G 10 0.537708471577085 2.47596852847479e-06 ENSG00000152795:ENST00000295470:exon_83347190_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000502762:exon_83347190_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000349655:exon_83347190_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000507721:exon_83345784_83347282:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000514511:exon_83346736_83347282:HNRPDL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 83348652 T/C 1 367 341 708 169.66099093121 183.358588807786 -13.6975978765762 T:C T C 10 0.537708471577085 0.308960965926565 ENSG00000152795:ENST00000295470:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000502762:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000349655:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000514511:exon_83348586_83348717:HNRPDL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 20 20 40 9.2458305684583 10.7541694315417 -1.5083388630834 A:G A G 10 0.537708471577085 0.638325849890511 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 88293887 G/A 1 24 20 44 11.09499668215 10.7541694315417 0.340827250608259 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88293861_88293967:HSD17B11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 89391771 C/T 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89391765_89391824:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89391765_89391824:HERC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 89397091 A/G 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89396992_89397181:HERC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 95170839 G/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95170805_95170906:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95170805_95170906:SMARCAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 95186055 A/G 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95185858_95186057:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000506089:exon_95185679_95186057:SMARCAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 95585225 A/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95585129_95589377:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95585129_95589374:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95585129_95586652:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95585129_95586632:PDLIM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 99993833 A/G 1 76 138 214 35.1341561601415 74.2037690776377 -39.0696129174962 A:G A G 10 0.537708471577085 9.63422266996944e-08 ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99993724_99993862:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99993337_99993862:ADH5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 103505961 C/T 1 45 47 92 20.8031187790312 25.272298164123 -4.46917938509182 T:C C T 10 0.537708471577085 0.403031256320176 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103505839_103505977:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103505839_103505977:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103505839_103505977:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000508584:exon_103505839_103505977:NFKB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 104070468 T/C 1 15 5 20 6.93437292634373 2.68854235788543 4.2458305684583 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0719557705235852 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104070275_104070565:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104070275_104070565:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104070275_104070565:CENPE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 106367535 G/C 0 13 0 13 6.00978986949789 0 6.00978986949789 G G 10 0.537708471577085 0.000358176076528924 ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106367359_106367659:PPA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 106395144 T/C 1 52 44 96 24.0391594779916 23.6591727493917 0.379986728599839 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000506815:exon_106395051_106395144:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 213 193 406 98.4680955540809 103.777735014377 -5.30963946029652 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.61878389340174 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113352075 A/G 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 A:G A G 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 8 14 22 3.69833222738332 7.52791860207919 -3.82958637469587 A:G G A 10 0.537708471577085 0.133549386810792 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113352832 C/T 1 10 4 14 4.62291528422915 2.15083388630834 2.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 0.283625605279598 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 6 11 17 2.77374917053749 5.91479318734793 -3.14104401681044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.148024861377178 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113359752 G/A 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.203557386113131 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 119659518 G/A 1 32 28 60 14.7933289095333 15.0558372041584 -0.2625082946251 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000505134:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511481:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119659416_119659534:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000502526:exon_119659259_119659534:SEC24D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 201 241 442 92.9205972130059 129.587741650077 -36.6671444370716 C:G G C 10 0.537708471577085 0.000489609210022474 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 47 58 105 21.727701835877 31.1870913514709 -9.45938951559393 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0776335005411422 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:T T A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 14 18 32 6.47208139792081 9.67875248838753 -3.20667109046672 T:G G T 10 0.537708471577085 0.289502042640737 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 3 13 16 1.38687458526874 6.99021013050211 -5.60333554523336 C:G C G 10 0.537708471577085 0.00534718881018855 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 6 13 19 2.77374917053749 6.99021013050211 -4.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0651882753473269 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 139964337 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 139964455 C/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:C C T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 142155072 T/A 1 133 121 254 61.4847732802477 65.0627250608273 -3.5779517805796 A:T T A 10 0.537708471577085 0.660053260523787 ENSG00000109445:ENST00000262990:exon_142154869_142155851:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000506302:exon_142154869_142155250:ZNF330 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 142651108 C/T 1 15 20 35 6.93437292634373 10.7541694315417 -3.81979650519798 T:C C T 10 0.537708471577085 0.235619569821158 ENSG00000164136:ENST00000320650:exon_142651000_142651137:IL15;ENSG00000164136:ENST00000296545:exon_142651000_142651137:IL15;ENSG00000164136:ENST00000514653:exon_142651000_142651137:IL15;ENSG00000164136:ENST00000529613:exon_142651000_142651137:IL15;ENSG00000164136:ENST00000394165:exon_142651000_142651137:IL15;ENSG00000164136:ENST00000477265:exon_142651000_142651137:IL15;ENSG00000164136:ENST00000394159:exon_142651000_142651137:IL15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 26 28 54 12.0195797389958 15.0558372041584 -3.03625746516259 T:C C T 10 0.537708471577085 0.416372193787875 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 146576318 G/A 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 A:G G A 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146576299_146581187:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000511969:exon_146576299_146576720:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000503730:exon_146576299_146576646:MMAA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 17 6 23 7.85895598318955 3.22625082946251 4.63270515372704 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0603851077364703 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 154513627 A/G 1 16 10 26 7.39666445476664 5.37708471577085 2.01957973899579 A:G A G 10 0.537708471577085 0.556045575489951 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 154513722 C/T 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 T:C C T 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 10 14 24 4.62291528422915 7.52791860207919 -2.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.306214656238402 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 155458570 G/A 1 52 60 112 24.0391594779916 32.2625082946251 -8.22334881663352 A:G G A 10 0.537708471577085 0.129590619487306 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155458438_155458631:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000512773:exon_155458438_155458694:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155458438_155458631:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155458438_155458631:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155458438_155458631:PLRG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 69 83 152 31.8981154611811 44.6298031408981 -12.7316876797169 A:T A T 10 0.537708471577085 0.0418551954103621 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 56 74 130 25.8883255916832 39.7904268967043 -13.902101305021 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0172465605044837 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 60 75 135 27.7374917053749 40.3281353682814 -12.5906436629065 A:T:C:G A C 10 0.537708471577085 0.0310232190851168 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 126 131 257 58.2487325812873 70.4398097765981 -12.1910771953109 T:C T C 10 0.537708471577085 0.133374960069658 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 165118652 C/T 0 12 0 12 5.54749834107498 0 5.54749834107498 C C 10 0.537708471577085 0.000679479026243913 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 177243366 G/T 1 29 24 53 13.4064543242645 12.90500331785 0.501451006414495 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177243321_177243396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177243321_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177243321_177243394:SPCS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 58 51 109 26.8129086485291 27.4231320504313 -0.610223401902264 A:G A G 10 0.537708471577085 0.923706227828408 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 184426387 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000168556:ENST00000302327:exon_184426147_184426520:ING2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 32 29 61 14.7933289095333 15.5935456757355 -0.800216766202185 A:C C A 10 0.537708471577085 0.898053726375173 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 31 30 61 14.3310373811104 16.1312541473125 -1.80021676620219 T:G T G 10 0.537708471577085 0.700664653091428 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 46 33 79 21.2654103074541 17.7443795620438 3.52103074541029 T:C T C 10 0.537708471577085 0.498662280559175 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 46 33 79 21.2654103074541 17.7443795620438 3.52103074541029 A:G A G 10 0.537708471577085 0.498662280559175 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 185638299 A/C 1 34 46 80 15.7179119663791 24.7345896925459 -9.0166777261668 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0441974374095794 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185638290_185638350:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185638290_185638350:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185638290_185638350:MLF1IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 185650154 G/A 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 A:G G A 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185650072_185650189:MLF1IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 186084055 G/A 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 A:G G A 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186080819_186084079:KIAA1430 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 190862155 T/G 1 52 21 73 24.0391594779916 11.2918779031188 12.7472815748728 T:G T G 10 0.537708471577085 0.00309191044887797 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 47 25 72 21.727701835877 13.4427117894271 8.28499004644988 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0581618552953287 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 125 116 241 57.7864410528644 62.3741827029419 -4.58774165007748 C:G C G 10 0.537708471577085 0.561527994294774 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 422882 C/T 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000514523:exon_422844_422889:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 653145 C/G 1 7 16 23 3.23604069896041 8.60333554523336 -5.36729484627296 C:G C G 10 0.537708471577085 0.034509773593791 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_653103_653668:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_653103_653664:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000512038:exon_653103_653358:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000499639:exon_653141_653306:CEP72 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 1335176 C/T 1 32 38 70 14.7933289095333 20.4329219199292 -5.63959301039595 T:C C T 10 0.537708471577085 0.188440813663276 ENSG00000049656:ENST00000320895:exon_1335172_1335289:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000507807:exon_1335172_1335289:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000320927:exon_1335172_1335289:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000503151:exon_1335172_1335236:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000508765:exon_1335172_1335270:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000509830:exon_1335172_1335265:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000511786:exon_1335172_1335289:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000513491:exon_1335171_1335289:CLPTM1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 31 32 63 14.3310373811104 17.2066710904667 -2.87563370935636 A:G G A 10 0.537708471577085 0.527993378282647 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 42 22 64 19.4162441937624 11.8295863746959 7.58665781906656 T:C C T 10 0.537708471577085 0.06053944048245 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 1815950 T/C 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.484033748659367 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 5461849 G/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 6604288 T/C 1 62 64 126 28.6620747622207 34.4133421809334 -5.75126741871271 T:C T C 10 0.537708471577085 0.326116270236927 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604251_6604389:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6603982_6604389:NSUN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 6748659 T/C 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 T:C T C 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7870973 A/G 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G A G 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508047:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000503550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000502550:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000506877:exon_7870883_7871030:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512217:exon_7870883_7871036:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7870883_7871036:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7878179 C/T 1 11 5 16 5.08520681265207 2.68854235788543 2.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.317076399536816 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508890:exon_7878057_7878188:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7878192 T/C 1 5 11 16 2.31145764211457 5.91479318734793 -3.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0820210724393271 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7885959 A/G 1 5 12 17 2.31145764211457 6.45250165892502 -4.14104401681045 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0522275164214068 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7885814_7885967:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7885898_7885967:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7897191 C/T 1 18 14 32 8.32124751161247 7.52791860207919 0.79332890953328 T:C C T 10 0.537708471577085 0.860157369191954 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508354:exon_7897178_7897213:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 24 31 55 11.09499668215 16.6689626188896 -5.57396593673968 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.138646423358031 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 24 14 38 11.09499668215 7.52791860207919 3.56707808007077 A:G G A 10 0.537708471577085 0.259667359629290 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 10236714 G/A 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G G A 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10236590_10236727:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10236590_10236727:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10236590_10236727:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10236590_10236727:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10236634_10236727:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10236590_10236727:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10236260_10236727:FAM173B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 10239261 G/A 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G G A 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 14769103 G/A 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 A:G G A 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14769084_14769300:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000513115:exon_14768725_14769300:ANKH HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 16465400 C/T 1 56 62 118 25.8883255916832 33.3379252377793 -7.44959964609603 T:C C T 10 0.537708471577085 0.195978849574398 ENSG00000173545:ENST00000308683:exon_16465150_16465901:ZNF622 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 33461355 G/A 1 181 172 353 83.6747666445476 92.4858571112586 -8.81109046671101 A:G G A 10 0.537708471577085 0.364282481629970 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33461263_33461400:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33461263_33461400:TARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 2 16 18 0.92458305684583 8.60333554523336 -7.67875248838753 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0002270255684939 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 43039652 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 61 50 111 28.1997832337978 26.8854235788543 1.31435965494356 A:G A G 10 0.537708471577085 0.849256668815795 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 43505993 A/G 1 11 2 13 5.08520681265207 1.07541694315417 4.0097898694979 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0272940758141243 ENSG00000172244:ENST00000306862:exon_43505850_43506496:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000503655:exon_43505850_43506024:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000509489:exon_43505850_43506496:C5orf34;ENSG00000172244:ENST00000514462:exon_43505652_43506496:C5orf34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 43609272 T/C 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112992:ENST00000505678:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512422:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43609245_43609448:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43609245_43609448:NNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 43656024 T/C 1 25 21 46 11.5572882105729 11.2918779031188 0.26541030745409 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 19 15 34 8.78353904003538 8.06562707365627 0.717911966379109 C:G G C 10 0.537708471577085 0.864573776289205 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 60200665 A/G 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000049167:ENST00000381118:exon_60200619_60200700:ERCC8;ENSG00000049167:ENST00000265038:exon_60200619_60200700:ERCC8;ENSG00000049167:ENST00000426742:exon_60200619_60200700:ERCC8;ENSG00000049167:ENST00000462279:exon_60200619_60200700:ERCC8;ENSG00000049167:ENST00000495985:exon_60200615_60200700:ERCC8;ENSG00000049167:ENST00000439176:exon_60200619_60200700:ERCC8;ENSG00000049167:ENST00000497892:exon_60200619_60200700:ERCC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 75 47 122 34.6718646317186 25.272298164123 9.39956646759563 A:G G A 10 0.537708471577085 0.101858845233704 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 22 29 51 10.1704136253041 15.5935456757355 -5.42313205043133 T:C T C 10 0.537708471577085 0.159625443303350 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 112 106 218 51.7766511833665 56.997097987171 -5.22044680380453 T:C T C 10 0.537708471577085 0.497326949848172 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 33 24 57 15.2556204379562 12.90500331785 2.35061712010615 A:G G A 10 0.537708471577085 0.596015183351359 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 54 49 103 24.9637425348374 26.3477151072772 -1.38397257243976 C:G C G 10 0.537708471577085 0.84347319828103 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 37 37 74 17.1047865516479 19.8952134483521 -2.79042689670429 T:C T C 10 0.537708471577085 0.560578869029697 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 64863361 A/G 1 23 22 45 10.632705153727 11.8295863746959 -1.19688122096882 A:G A G 10 0.537708471577085 0.766042798882964 ENSG00000113593:ENST00000508982:exon_64863340_64863906:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64863340_64863442:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000503435:exon_64863340_64863442:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000515447:exon_64863340_64863442:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64863340_64863442:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000502703:exon_64863340_64863442:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000505380:exon_64863340_64863442:PPWD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 32 39 71 14.7933289095333 20.9706303915063 -6.17730148197304 A:G A G 10 0.537708471577085 0.153844645609919 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 65054587 G/A 1 12 4 16 5.54749834107498 2.15083388630834 3.39666445476664 A:G G A 10 0.537708471577085 0.130583196467889 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65054394_65054653:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65054394_65054653:NLN;ENSG00000123213:ENST00000514991:exon_65054394_65054653:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65054394_65054653:NLN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 35 23 58 16.180203494802 12.367294846273 3.81290864852907 A:G A G 10 0.537708471577085 0.35751476363841 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 106 111 217 49.002902012829 59.6856403450564 -10.6827383322274 T:C T C 10 0.537708471577085 0.153004761140290 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 64 66 130 29.5866578190666 35.4887591240876 -5.90210130502105 T:G G T 10 0.537708471577085 0.333337764313872 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 37 24 61 17.1047865516479 12.90500331785 4.19978323379781 T:C C T 10 0.537708471577085 0.305955447000313 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 68616331 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000460090:exon_68616292_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68616292_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 70800538 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:T T A 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 C:G C G 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 70848958 A/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:T A T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70848943_70849147:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70848943_70849147:BDP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 51 23 74 23.5768679495687 12.367294846273 11.2095731032957 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.00996051918579096 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 31 30 61 14.3310373811104 16.1312541473125 -1.80021676620219 A:T A T 10 0.537708471577085 0.700664653091428 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 T:C C T 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 1082 1024 2106 500.199433753594 550.613474894935 -50.414041141341 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0288450691972030 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 74046464 C/T 1 10 7 17 4.62291528422915 3.76395930103959 0.858955983189555 T:C C T 10 0.537708471577085 0.809438857409755 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74046404_74046492:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74046404_74046492:GFM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 147 174 321 67.9568546781685 93.5612740544128 -25.6044193762443 C:G C G 10 0.537708471577085 0.00428703018364527 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 423 441 864 195.549316522893 237.129435965494 -41.5801194426014 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.00462322338942085 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 75001590 T/A 1 4 14 18 1.84916611369166 7.52791860207919 -5.67875248838753 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0084453389165878 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 T:C T C 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 77411985 T/C 1 38 28 66 17.5670780800708 15.0558372041584 2.51124087591239 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.621805390622734 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 77477451 G/A 1 20 16 36 9.2458305684583 8.60333554523336 0.642495023224939 A:G G A 10 0.537708471577085 0.868679174180134 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77477331_77477486:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77477331_77477486:AP3B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 78596521 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78596499_78596686:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78596499_78596686:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78596499_78596686:JMY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 80168969 C/T 1 28 15 43 12.9441627958416 8.06562707365627 4.87853572218535 T:C C T 10 0.537708471577085 0.168314533569141 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 39 30 69 18.0293696084937 16.1312541473125 1.89811546118113 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.71764344747437 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 87498849 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000164180:ENST00000514135:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511087:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000510089:exon_87493486_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000296595:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000506536:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511218:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000512429:exon_87498779_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000443393:exon_87498789_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000507872:exon_87498501_87498892:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000509387:exon_87498760_87498892:TMEM161B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 11 6 17 5.08520681265207 3.22625082946251 1.85895598318956 A:C C A 10 0.537708471577085 0.468286092935019 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 94861118 G/C 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 C:G G C 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94861102_94861205:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000513232:exon_94861102_94861168:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000514952:exon_94861102_94861205:TTC37 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 21 6 27 9.70812209688122 3.22625082946251 6.48187126741871 T:C C T 10 0.537708471577085 0.012116230995603 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 17 10 27 7.85895598318955 5.37708471577085 2.4818712674187 A:C A C 10 0.537708471577085 0.440807467476662 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 22 21 43 10.1704136253041 11.2918779031188 -1.12146427781465 A:G G A 10 0.537708471577085 0.761366051085368 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96116808 G/A 1 4 14 18 1.84916611369166 7.52791860207919 -5.67875248838753 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0084453389165878 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96116762_96116902:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96116762_96116902:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000512852:exon_96116762_96116885:ERAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96127833 G/A 1 20 8 28 9.2458305684583 4.30166777261668 4.94416279584162 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0862855602223982 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96127764_96127895:ERAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96129512 A/G 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 C:G C G 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96139595 G/A 1 13 11 24 6.00978986949789 5.91479318734793 0.0949966821499597 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96239258 T/A 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:T T A 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96239081_96239264:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96239081_96239264:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96239081_96239264:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96239081_96239264:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96239081_96239264:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96239081_96239264:ERAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96358125 G/T 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96358004_96358188:LNPEP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 12 18 30 5.54749834107498 9.67875248838753 -4.13125414731255 C:G G C 10 0.537708471577085 0.145144278258607 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 14 9 23 6.47208139792081 4.83937624419377 1.63270515372704 A:C A C 10 0.537708471577085 0.537022888786081 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 102520400 A/C 1 16 11 27 7.39666445476664 5.91479318734793 1.4818712674187 A:C A C 10 0.537708471577085 0.70033737000368 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 T:C T C 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 16 15 31 7.39666445476664 8.06562707365627 -0.668962618889635 T:C T C 10 0.537708471577085 0.85820368931506 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 108719151 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000511624:exon_108719104_108719221:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000512822:exon_108719097_108719221:PJA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 27 20 47 12.4818712674187 10.7541694315417 1.727701835877 C:G G C 10 0.537708471577085 0.662505380376758 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112176325 G/A 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112177171 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112178492 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112222787 C/T 1 95 129 224 43.9176952001769 69.364392833444 -25.446697633267 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000772126168045416 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000497856:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000261482:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000474542:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112222712_112222880:REEP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 22 37 59 10.1704136253041 19.8952134483521 -9.72479982304801 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0127470401902282 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112926755 G/A 1 19 19 38 8.78353904003538 10.2164609599646 -1.43292191992923 A:G G A 10 0.537708471577085 0.745403862879188 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112926738_112926941:YTHDC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 22 23 45 10.1704136253041 12.367294846273 -2.19688122096882 A:T T A 10 0.537708471577085 0.551606420592295 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 19 12 31 8.78353904003538 6.45250165892502 2.33103738111036 T:G G T 10 0.537708471577085 0.472978196497003 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 28 24 52 12.9441627958416 12.90500331785 0.0391594779915803 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 35 26 61 16.180203494802 13.9804202610042 2.19978323379781 A:G A G 10 0.537708471577085 0.609199822605975 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 121355961 G/A 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 14 22 36 6.47208139792081 11.8295863746959 -5.35750497677506 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0935977510488975 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 11 17 28 5.08520681265207 9.14104401681045 -4.05583720415838 A:G G A 10 0.537708471577085 0.133221244184410 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 49 36 85 22.6522848927228 19.3575049767751 3.29477991594777 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.514775743111478 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 131977963 T/C 1 48 58 106 22.1899933642999 31.1870913514709 -8.99709798717101 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0972727675598883 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131977870_131978168:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131977870_131979752:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131977870_131978168:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131977870_131979581:RAD50 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 7 10 17 3.23604069896041 5.37708471577085 -2.14104401681045 A:G A G 10 0.537708471577085 0.33703843036266 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 25 22 47 11.5572882105729 11.8295863746959 -0.272298164122995 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 132409749 A/C 1 60 51 111 27.7374917053749 27.4231320504313 0.314359654943566 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132409685_132409818:HSPA4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 133895605 G/A 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133895520_133895657:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133895520_133895680:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133895520_133895680:PHF15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 226 181 407 104.477885423579 97.3252333554524 7.1526520681264 A:G A G 10 0.537708471577085 0.486821932593625 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 134670741 C/T 1 177 147 324 81.825600530856 79.0431453218315 2.78245520902445 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.780709341764098 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 143 135 278 66.1076885644768 72.5906436629065 -6.48295509842963 A:G A G 10 0.537708471577085 0.435102155827968 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 137754695 T/C 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 T:C T C 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 88 67 155 40.6816545012165 36.0264675956647 4.65518690555182 A:G G A 10 0.537708471577085 0.46939847602987 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 26 22 48 12.0195797389958 11.8295863746959 0.189993364299919 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 138463538 G/C 1 19 13 32 8.78353904003538 6.99021013050211 1.79332890953328 C:G G C 10 0.537708471577085 0.59686742672636 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138463428_138463542:SIL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 140960448 A/G 1 24 20 44 11.09499668215 10.7541694315417 0.340827250608259 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140960311_140960450:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140960311_140960450:DIAPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 22 19 41 10.1704136253041 10.2164609599646 -0.0460473346604857 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 23 14 37 10.632705153727 7.52791860207919 3.10478655164786 T:C C T 10 0.537708471577085 0.327222868817901 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149755340 G/T 1 25 16 41 11.5572882105729 8.60333554523336 2.95395266533951 T:G G T 10 0.537708471577085 0.434071338093267 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 14 27 41 6.47208139792081 14.5181287325813 -8.04604733466049 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0123154132894395 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 31 30 61 14.3310373811104 16.1312541473125 -1.80021676620219 T:C T C 10 0.537708471577085 0.700664653091428 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149772280 C/G 1 21 19 40 9.70812209688122 10.2164609599646 -0.5083388630834 C:G C G 10 0.537708471577085 0.87553259952279 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149772271_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149772268_149772353:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149771520_149774479:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506630:exon_149772268_149772454:TCOF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149792109 G/A 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 A:G G A 10 0.537708471577085 0.618398040789407 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 149907533 T/G 1 8 1 9 3.69833222738332 0.537708471577085 3.16062375580623 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0438932334623324 ENSG00000070614:ENST00000523767:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000261797:exon_149907366_149907860:NDST1;ENSG00000070614:ENST00000424060:exon_149907366_149907860:NDST1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 150436503 G/C 1 123 107 230 56.8618579960185 57.5348064587481 -0.672948462729551 C:G G C 10 0.537708471577085 0.947334287902574 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150436327_150436518:TNIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 150563075 C/T 1 31 39 70 14.3310373811104 20.9706303915063 -6.63959301039595 T:C C T 10 0.537708471577085 0.119864514346472 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150560613_150563175:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150560613_150563175:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000519448:exon_150560796_150563175:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150560954_150563175:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150562697_150563175:CCDC69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 40 43 83 18.4916611369166 23.1214642778147 -4.62980314089806 T:C C T 10 0.537708471577085 0.323223696046085 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 150578592 C/T 1 12 25 37 5.54749834107498 13.4427117894271 -7.89521344835215 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0124038877059867 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 151055695 G/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:G G A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151055693_151055762:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151055693_151055762:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151055693_151055762:SPARC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 23 17 40 10.632705153727 9.14104401681045 1.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 0.751626194880296 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 153413390 C/T 1 5 13 18 2.31145764211457 6.99021013050211 -4.67875248838753 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0327312480155932 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153413351_153413426:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153413351_153413437:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413377_153413443:FAM114A2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 153709273 A/G 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 11 10 21 5.08520681265207 5.37708471577085 -0.291877903118785 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154282163 A/G 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154291369 T/C 1 8 8 16 3.69833222738332 4.30166777261668 -0.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.806018872737948 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:C A C 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154306972 T/C 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C T C 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 154346325 G/A 1 124 140 264 57.3241495244415 75.2791860207919 -17.9550364963504 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0305624701831305 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 156746775 C/T 1 54 39 93 24.9637425348374 20.9706303915063 3.99311214333109 T:C C T 10 0.537708471577085 0.466848809081939 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156746770_156746936:CYFIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 156810313 C/T 1 50 75 125 23.1145764211457 40.3281353682814 -17.2135589471356 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00221056530013367 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522892:exon_156810273_156810588:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523383:exon_156810240_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000524058:exon_156810246_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519663:exon_156810264_156810367:CYFIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 159492062 A/G 1 95 70 165 43.9176952001769 37.6395930103959 6.27810218978097 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.349215326492956 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159491939_159492518:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159491939_159492518:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522073:exon_159491939_159492518:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000520274:exon_159491939_159492137:TTC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 25 33 58 11.5572882105729 17.7443795620438 -6.18709135147093 C:G C G 10 0.537708471577085 0.114455837300648 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 167919726 A/G 1 55 60 115 25.4260340632603 32.2625082946251 -6.83647423136478 A:G A G 10 0.537708471577085 0.224093558442354 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000524082:exon_167919664_167920192:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521329:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000522834:exon_167919664_167919796:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521939:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000519346:exon_167919664_167919852:RARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 167919825 G/A 1 61 80 141 28.1997832337978 43.0166777261668 -14.816894492369 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0140930137767676 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000524082:exon_167919664_167920192:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521329:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521939:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167919664_167919852:RARS;ENSG00000113643:ENST00000519346:exon_167919664_167919852:RARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 167933060 A/G 1 70 52 122 32.3604069896041 27.9608405220084 4.39956646759563 A:G A G 10 0.537708471577085 0.467888054009551 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167933026_167933204:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167933026_167933204:RARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 167933156 A/G 1 70 38 108 32.3604069896041 20.4329219199292 11.9274850696748 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0259942934907829 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167933026_167933204:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167933026_167933204:RARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 167933158 T/A 1 72 42 114 33.2849900464499 22.5837558062376 10.7012342402123 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0484043435307322 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167933026_167933204:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167933026_167933204:RARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 61 49 110 28.1997832337978 26.3477151072772 1.85206812652065 C:G C G 10 0.537708471577085 0.77451014822939 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 70 80 150 32.3604069896041 43.0166777261668 -10.6562707365628 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.0856648257278255 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 35 37 72 16.180203494802 19.8952134483521 -3.71500995355012 A:G A G 10 0.537708471577085 0.40907789554974 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 171509487 G/A 1 58 57 115 26.8129086485291 30.6493828798938 -3.83647423136478 A:G G A 10 0.537708471577085 0.513010914212073 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171509330_171509509:STK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 20 26 46 9.2458305684583 13.9804202610042 -4.73458969254591 A:G A G 10 0.537708471577085 0.183839001004972 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 19 19 38 8.78353904003538 10.2164609599646 -1.43292191992923 T:C C T 10 0.537708471577085 0.745403862879188 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 22 15 37 10.1704136253041 8.06562707365627 2.10478655164786 T:C T C 10 0.537708471577085 0.514288152683863 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176078649 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000048140:ENST00000310032:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000405525:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000514705:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000503030:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000508164:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000504168:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000503045:exon_176078617_176078667:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000515708:exon_176078617_176078667:TSPAN17 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 27 26 53 12.4818712674187 13.9804202610042 -1.49854899358551 A:G A G 10 0.537708471577085 0.682265064919135 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176395667 C/T 1 24 31 55 11.09499668215 16.6689626188896 -5.57396593673968 T:C C T 10 0.537708471577085 0.138646423358031 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176395556_176395890:UIMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 C:G G C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 101 94 195 46.6914443707144 50.544596328246 -3.85315195753158 C:G G C 10 0.537708471577085 0.615322889143235 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 53 53 106 24.5014510064145 28.4985489935855 -3.99709798717101 A:G A G 10 0.537708471577085 0.437906536665513 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 24 16 40 11.09499668215 8.60333554523336 2.4916611369166 T:C T C 10 0.537708471577085 0.526471697646376 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 25 10 35 11.5572882105729 5.37708471577085 6.18020349480202 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0414731295622677 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 17 12 29 7.85895598318955 6.45250165892502 1.40645432426453 T:C C T 10 0.537708471577085 0.710583412304497 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 8 1 9 3.69833222738332 0.537708471577085 3.16062375580623 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0438932334623324 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179228623 G/A 1 20 19 39 9.2458305684583 10.2164609599646 -0.970630391506317 A:G G A 10 0.537708471577085 0.75152935894848 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 169 154 323 78.1272683034726 82.8071046228711 -4.67983631939846 A:G G A 10 0.537708471577085 0.61576968279692 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179269011 G/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 C:G G C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179269000_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521675:exon_179268458_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000524068:exon_179268908_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522157:exon_179269008_179269064:C5orf45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 34 38 72 15.7179119663791 20.4329219199292 -4.71500995355012 T:G T G 10 0.537708471577085 0.28830703578442 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179297262 T/C 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C T C 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179297352 A/G 1 14 11 25 6.47208139792081 5.91479318734793 0.557288210572875 A:G A G 10 0.537708471577085 0.844357197211731 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179300131 T/C 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 T:C T C 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521669:exon_179300119_179300135:TBC1D9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 179305405 G/A 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 A:G G A 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522472:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000518459:exon_179305309_179305523:TBC1D9B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 A:G G A 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 1 53 13 66 24.5014510064145 6.99021013050211 17.5112408759124 A:G G A 10 0.537708471577085 9.98139895224663e-06 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 43 155 198 19.8785357221853 83.3448130944482 -63.4662773722628 A:G G A 10 0.537708471577085 4.45171428443143e-20 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 18 12 30 8.32124751161247 6.45250165892502 1.86874585268745 A:G G A 10 0.537708471577085 0.584248594892217 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 3015865 C/T 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 T:C C T 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 3077042 G/A 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000137275:ENST00000490396:exon_3076998_3077054:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000259808:exon_3076998_3077221:RIPK1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 3152760 T/C 1 22 14 36 10.1704136253041 7.52791860207919 2.64249502322494 T:C T C 10 0.537708471577085 0.407547472378046 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3152722_3152809:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3152722_3152903:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3152722_3153429:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3152722_3152879:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3152722_3153812:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3152722_3153296:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000488487:exon_3152722_3152767:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000464040:exon_3152722_3153280:BPHL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 3850730 T/G 0 23 0 23 10.632705153727 0 10.632705153727 T T 10 0.537708471577085 1.17967243883225e-06 ENSG00000145945:ENST00000380274:exon_3849620_3851551:FAM50B;ENSG00000145945:ENST00000380272:exon_3850023_3851551:FAM50B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 110 102 212 50.8520681265206 54.8462641008627 -3.99419597434202 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.582521671136807 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 4133855 C/T 1 59 52 111 27.275200176952 27.9608405220084 -0.685640345056438 T:C C T 10 0.537708471577085 0.924326096052735 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 43 35 78 19.8785357221853 18.819796505198 1.05873921698737 A:G A G 10 0.537708471577085 0.821552530202226 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 7601720 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7601569_7601757:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7599906_7601757:SNRNP48 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 22 24 46 10.1704136253041 12.90500331785 -2.73458969254591 A:G A G 10 0.537708471577085 0.461153963958979 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 10709632 G/A 1 112 114 226 51.7766511833665 61.2987657597877 -9.52211457642121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.205735523837926 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10709471_10710015:PAK1IP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 26 22 48 12.0195797389958 11.8295863746959 0.189993364299919 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 11190215 G/A 1 17 21 38 7.85895598318955 11.2918779031188 -3.43292191992923 A:G G A 10 0.537708471577085 0.329112141439703 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11190197_11191438:NEDD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 T:C T C 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 13 10 23 6.00978986949789 5.37708471577085 0.632705153727044 C:G G C 10 0.537708471577085 0.837205556651616 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 17675246 T/C 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C T C 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17675136_17675264:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17675136_17675264:NUP153 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 A:G G A 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 29 19 48 13.4064543242645 10.2164609599646 3.18999336429992 A:G G A 10 0.537708471577085 0.387593715633124 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 24423918 G/A 1 30 23 53 13.8687458526875 12.367294846273 1.5014510064145 A:G G A 10 0.537708471577085 0.78324675333147 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24423812_24425809:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24423812_24425809:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24423812_24425810:MRS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 24653215 C/T 1 55 58 113 25.4260340632603 31.1870913514709 -5.7610572882106 T:C C T 10 0.537708471577085 0.29974957779413 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 24781719 G/C 1 38 26 64 17.5670780800708 13.9804202610042 3.58665781906656 C:G G C 10 0.537708471577085 0.383257513389584 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 24781735 C/T 1 33 27 60 15.2556204379562 14.5181287325813 0.737491705374898 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.897432780594124 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 T:C T C 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:C C A 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26199454 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26199822 A/G 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000197846:ENST00000359985:exon_26199748_26200942:HIST1H2BF HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26205052 G/A 1 1 7 8 0.462291528422915 3.76395930103959 -3.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0284854418445818 ENSG00000198518:ENST00000360441:exon_26204858_26206266:HIST1H4E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26216584 C/T 1 8 16 24 3.69833222738332 8.60333554523336 -4.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0633340746147884 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 5 15 20 2.31145764211457 8.06562707365627 -5.7541694315417 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0123405034641124 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 3 19 22 1.38687458526874 10.2164609599646 -8.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.000140846384805148 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26285503 C/T 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26468319 C/T 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 T:C C T 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 154 169 323 71.1928953771289 90.8727316965274 -19.6798363193985 A:G G A 10 0.537708471577085 0.029498995910725 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 54 41 95 24.9637425348374 22.0460473346605 2.91769520017692 A:G A G 10 0.537708471577085 0.607267224081911 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 27100536 G/A 1 15 9 24 6.93437292634373 4.83937624419377 2.09499668214996 A:G G A 10 0.537708471577085 0.420736840696131 ENSG00000124635:ENST00000244601:exon_27100095_27100563:HIST1H2BJ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 27782533 T/C 1 2 11 13 0.92458305684583 5.91479318734793 -4.9902101305021 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00918308794289172 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 18 12 30 8.32124751161247 6.45250165892502 1.86874585268745 A:G G A 10 0.537708471577085 0.584248594892217 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:C C A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 C:G G C 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29693938 G/A 1 16 27 43 7.39666445476664 14.5181287325813 -7.12146427781466 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0323373226573636 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29910330 G/A 1 67 175 242 30.9735324043353 94.0989825259899 -63.1254501216546 A:G G A 10 0.537708471577085 2.75034588621752e-16 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29910679 G/A 1 261 71 332 120.658088918381 38.177301481973 82.4807874364078 A:G G A 10 0.537708471577085 5.74181049355964e-21 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 133 686 819 61.4847732802477 368.86801150188 -307.383238221633 A:C C A 10 0.537708471577085 6.90002906972307e-110 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 29911326 A/G 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:G A G 10 0.537708471577085 0.365626586475337 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30153634 T/C 1 34 33 67 15.7179119663791 17.7443795620438 -2.02646759566469 T:C T C 10 0.537708471577085 0.626388393287133 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30164494 A/G 1 26 31 57 12.0195797389958 16.6689626188896 -4.64938287989385 A:G A G 10 0.537708471577085 0.233396259426483 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30166584 T/C 1 22 27 49 10.1704136253041 14.5181287325813 -4.34771510727717 T:C T C 10 0.537708471577085 0.251819843788447 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000487829:exon_30166541_30166767:TRIM26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30166821 A/G 1 6 16 22 2.77374917053749 8.60333554523336 -5.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0170131113847476 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166668_30166880:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 27 12 39 12.4818712674187 6.45250165892502 6.02936960849368 T:C C T 10 0.537708471577085 0.055231509373386 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30457283 G/T 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:G G T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457231_30457372:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457244_30457372:HLA-E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 426 392 818 196.936191108162 210.781720858217 -13.8455297500555 A:G G A 10 0.537708471577085 0.343800176602744 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30458933 G/C 1 468 463 931 216.352435301924 248.95902234019 -32.6065870382662 A:T:C:G G C 10 0.537708471577085 0.0326570206695264 ENSG00000204592:ENST00000427226:exon_30458914_30459189:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458914_30459189:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458914_30459060:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458914_30459189:HLA-E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30569951 G/A 1 23 14 37 10.632705153727 7.52791860207919 3.10478655164786 A:G G A 10 0.537708471577085 0.327222868817901 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30672326 T/C 1 12 16 28 5.54749834107498 8.60333554523336 -3.05583720415838 T:C T C 10 0.537708471577085 0.261133649980021 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 13 20 33 6.00978986949789 10.7541694315417 -4.74437956204381 A:G A G 10 0.537708471577085 0.116148498675437 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30680111 T/C 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 T:C T C 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 387 321 708 178.906821499668 172.604419376244 6.3024021234238 T:C C T 10 0.537708471577085 0.651150183872625 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30698541 A/G 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30698459_30698877:FLOT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30864829 T/C 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30864791_30864918:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000514434:exon_30864791_30864918:DDR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 12 21 33 5.54749834107498 11.2918779031188 -5.7443795620438 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0541710246106163 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 6 22 28 2.77374917053749 11.8295863746959 -9.05583720415838 A:C A C 10 0.537708471577085 0.000878686049219107 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:G G T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30887988 C/T 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 15 3 18 6.93437292634373 1.61312541473126 5.32124751161247 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0157675314807417 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C T C 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 25 17 42 11.5572882105729 9.14104401681045 2.41624419376243 T:G G T 10 0.537708471577085 0.536705056533733 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 6 10 16 2.77374917053749 5.37708471577085 -2.60333554523336 A:G G A 10 0.537708471577085 0.216874034602008 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 16 24 40 7.39666445476664 12.90500331785 -5.5083388630834 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0835388006534366 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31129310 C/T 1 27 18 45 12.4818712674187 9.67875248838753 2.80311877903117 T:C C T 10 0.537708471577085 0.456184384537351 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129261_31129354:TCF19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1938 1238 3176 895.920982083609 665.683087812431 230.237894271178 T:C:G T C 10 0.537708471577085 1.79871923281986e-16 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 2030 764 2794 938.451802698517 410.809272284893 527.642530413625 A:C:G C G 10 0.537708471577085 4.30850033654541e-93 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 9 0 9 4.16062375580623 0 4.16062375580623 T T 10 0.537708471577085 0.00472206769488212 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 868 598 1466 401.26904667109 321.549666003097 79.7193806679934 T:C C T 10 0.537708471577085 3.06737104391353e-05 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 830 970 1800 383.701968591019 521.577217429772 -137.875248838753 C:G C G 10 0.537708471577085 8.63940504100824e-11 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 823 466 1289 380.465927892059 250.572147754922 129.893780137137 C:G C G 10 0.537708471577085 2.61359493187766e-13 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 1 656 40 696 303.263242645432 21.5083388630834 281.754903782349 T:G G T 10 0.537708471577085 2.00015037102236e-125 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/T 1 1 13 14 0.462291528422915 6.99021013050211 -6.52791860207919 T:G G T 10 0.537708471577085 0.000520847712963593 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 40 5 45 18.4916611369166 2.68854235788543 15.8031187790312 T:C C T 10 0.537708471577085 6.26552739805266e-07 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 0 21 0 21 9.70812209688122 0 9.70812209688122 T T 10 0.537708471577085 2.28713526062406e-06 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1464 1006 2470 676.794797611147 540.934722406548 135.8600752046 T:C C T 10 0.537708471577085 3.93796103428492e-08 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 1015 376 1391 469.225901349259 202.178385312984 267.047516036275 A:G G A 10 0.537708471577085 8.04756158168026e-49 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31378928 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31378640_31379136:AL645933.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31431813 A/G 1 61 41 102 28.1997832337978 22.0460473346605 6.15373589913733 A:G A G 10 0.537708471577085 0.234499242769296 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 39 59 98 18.0293696084937 31.724799823048 -13.6954302145543 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00608364356754545 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 5 13 18 2.31145764211457 6.99021013050211 -4.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0327312480155932 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 13 5 18 6.00978986949789 2.68854235788543 3.32124751161247 C:G C G 10 0.537708471577085 0.155917874781449 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 12 3 15 5.54749834107498 1.61312541473126 3.93437292634373 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0663410983131874 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31474947 G/T 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 T:G G T 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31474799_31475077:MICB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31503219 G/A 1 242 178 420 111.874549878345 95.7121079407211 16.1624419376243 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.117472701348821 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31503144_31503262:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31503144_31503252:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000482195:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000431908:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31503165_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31503172_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31503184_31503262:BAT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31583312 G/A 1 1 8 9 0.462291528422915 4.30166777261668 -3.83937624419377 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0148173128089584 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000497362:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583298_31583359:AIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 18 16 34 8.32124751161247 8.60333554523336 -0.282088033620891 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31599556 A/C 1 23 25 48 10.632705153727 13.4427117894271 -2.81000663570008 A:C A C 10 0.537708471577085 0.47005408359343 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31600304 G/C 1 61 63 124 28.1997832337978 33.8756337093564 -5.67585047555854 C:G G C 10 0.537708471577085 0.322555575553702 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 101 89 190 46.6914443707144 47.8560539703606 -1.16460959964615 A:G A G 10 0.537708471577085 0.88446445830204 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 113 99 212 52.2389427117894 53.2331386861314 -0.994195974342027 T:C C T 10 0.537708471577085 0.890702513262447 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31605016 T/C 1 243 252 495 112.336841406768 135.502534837425 -23.1656934306571 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0381182449656427 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31605011_31605101:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000482441:exon_31605011_31605101:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31605167 G/A 1 10 15 25 4.62291528422915 8.06562707365627 -3.44271178942713 A:G G A 10 0.537708471577085 0.228187819322191 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31605278 C/T 1 120 155 275 55.4749834107498 83.3448130944482 -27.8698296836984 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000852646107422395 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31605223_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31605223_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31605223_31605363:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000482441:exon_31605223_31605548:BAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 39 33 72 18.0293696084937 17.7443795620438 0.284990046449881 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 28 24 52 12.9441627958416 12.90500331785 0.0391594779915803 A:T:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 254 264 518 117.42204821942 141.95503649635 -24.53298827693 A:T:C T C 10 0.537708471577085 0.0308986715785161 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31639757 G/A 1 14 8 22 6.47208139792081 4.30166777261668 2.17041362530413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.398447526729543 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31727897 C/T 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 T:C C T 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000494646:exon_31727867_31727950:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31727867_31727993:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31727867_31727993:MSH5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31732207 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31750509 G/A 1 28 20 48 12.9441627958416 10.7541694315417 2.18999336429992 A:G G A 10 0.537708471577085 0.564955928597578 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000474643:exon_31750307_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000461328:exon_31750189_31750622:VARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C T C 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 A:C A C 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 26 33 59 12.0195797389958 17.7443795620438 -5.72479982304801 T:C T C 10 0.537708471577085 0.151296151791541 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32093922 G/A 1 32 22 54 14.7933289095333 11.8295863746959 2.96374253483741 A:G G A 10 0.537708471577085 0.495445586716911 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 0 9 0 9 4.16062375580623 0 4.16062375580623 G G 10 0.537708471577085 0.00472206769488212 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 40 22 62 18.4916611369166 11.8295863746959 6.66207476222073 A:G A G 10 0.537708471577085 0.098254733992622 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32410987 A/G 1 4309 3598 7907 1992.01419597434 1934.67508073435 57.3391152399888 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 0.198550298944969 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32411526 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32411726 G/A 1 9 9 18 4.16062375580623 4.83937624419377 -0.678752488387531 A:G G A 10 0.537708471577085 0.81556058669647 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32784676 C/T 1 68 53 121 31.4358239327582 28.4985489935855 2.93727493917271 T:C C T 10 0.537708471577085 0.64873077324555 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32797283 G/A 1 55 27 82 25.4260340632603 14.5181287325813 10.907905330679 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0194794670682113 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32798548 G/A 1 82 60 142 37.907905330679 32.2625082946251 5.64539703605393 A:G G A 10 0.537708471577085 0.35560969531463 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32798395_32798583:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32798395_32798583:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32818678 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 286 348 634 132.215377128954 187.122548108826 -54.9071709798719 A:C:G G A 10 0.537708471577085 1.35857286089214e-05 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 200 182 382 92.458305684583 97.8629418270295 -5.40463614244648 A:G G A 10 0.537708471577085 0.607940433272297 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32940621 C/T 1 41 23 64 18.9539526653395 12.367294846273 6.58665781906656 T:C C T 10 0.537708471577085 0.104322888588688 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32939372_32940704:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32940507_32940704:BRD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 15 28 43 6.93437292634373 15.0558372041584 -8.12146427781465 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0142398299458561 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 32974551 G/T 1 71 65 136 32.822698518027 34.9510506525105 -2.12835213448356 T:G G T 10 0.537708471577085 0.731429129965163 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32971955_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32971959_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32973372_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000490305:exon_32974384_32974618:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32974523_32974618:HLA-DOA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 1166 597 1763 539.031922141119 321.01195753152 218.019964609599 A:C:G G C 10 0.537708471577085 7.27201486527856e-26 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 1571 64 1635 726.259991152399 34.4133421809334 691.846648971466 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1771 155 1926 818.718296836982 83.3448130944482 735.373483742534 T:C T C 10 0.537708471577085 4.7420343220682e-297 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037080 G/A 0 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:G G T 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 2574 220 2794 1189.93839416058 118.295863746959 1071.64253041362 A:G G A 10 0.537708471577085 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 2464 222 2686 1139.08632603406 119.371280690113 1019.71504534395 A:T:C:G T C 10 0.537708471577085 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 1352 160 1512 625.018146427781 86.0333554523336 538.984790975447 T:C T C 10 0.537708471577085 3.54480778723746e-198 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 1175 9 1184 543.192545896925 4.83937624419377 538.353169652731 T:C C T 10 0.537708471577085 4.78231614561458e-298 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 1184 0 1184 547.353169652731 0 547.353169652731 G G 10 0.537708471577085 1.35645723065714e-319 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 1 1111 2 1113 513.605888077859 1.07541694315417 512.530471134704 A:T A T 10 0.537708471577085 6.40573700580601e-295 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 643 281 924 297.253452775934 151.096080513161 146.157372262773 T:C T C 10 0.537708471577085 1.32083776727526e-22 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 731 350 1081 337.935107277151 188.19796505198 149.737142225171 A:T:C C T 10 0.537708471577085 2.43898772068279e-20 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 719 288 1007 332.387608936076 154.8600398142 177.527569121875 T:C T C 10 0.537708471577085 2.75777348498431e-30 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33169392 G/C 1 67 87 154 30.9735324043353 46.7806370272064 -15.8071046228711 C:G G C 10 0.537708471577085 0.0120501387805796 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 22 11 33 10.1704136253041 5.91479318734793 4.2556204379562 A:G G A 10 0.537708471577085 0.163232134883215 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G G A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33271780 T/C 1 11 15 26 5.08520681265207 8.06562707365627 -2.98042026100421 T:C T C 10 0.537708471577085 0.246384011673615 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33271953 G/A 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 A:G G A 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33271905_33271994:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000423872:exon_33271905_33271994:TAPBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 44 42 86 20.3408272506083 22.5837558062376 -2.24292855562931 C:G G C 10 0.537708471577085 0.665935537345426 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33287183 T/C 1 160 130 290 73.9666445476664 69.902101305021 4.06454324264534 T:C T C 10 0.537708471577085 0.638144921725867 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33371778 C/A 1 35 60 95 16.180203494802 32.2625082946251 -16.0823047998231 A:C C A 10 0.537708471577085 0.00129762960215009 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33371506_33371906:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33371506_33371906:KIFC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33653448 C/T 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 T:C C T 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33653420_33653604:ITPR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33659449 A/T 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 A:T A T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 10 16 26 4.62291528422915 8.60333554523336 -3.98042026100421 C:G C G 10 0.537708471577085 0.167367402399651 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 A:G G A 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 34855748 G/C 1 29 28 57 13.4064543242645 15.0558372041584 -1.64938287989384 C:G G C 10 0.537708471577085 0.691639780109439 ENSG00000064995:ENST00000361288:exon_34855564_34855866:TAF11;ENSG00000064995:ENST00000420584:exon_34855564_34855819:TAF11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 35285720 A/C 1 40 38 78 18.4916611369166 20.4329219199292 -1.94126078301263 A:C A C 10 0.537708471577085 0.73360880884395 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35285668_35285776:DEF6;ENSG00000023892:ENST00000468102:exon_35285385_35285776:DEF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 35287755 G/A 1 38 56 94 17.5670780800708 30.1116744083168 -12.544596328246 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0126237862682442 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35287596_35287794:DEF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 35288696 C/T 1 39 65 104 18.0293696084937 34.9510506525105 -16.9216810440168 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00107920454946647 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35288661_35288751:DEF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 35436195 G/A 1 41 19 60 18.9539526653395 10.2164609599646 8.7374917053749 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0271880487025174 ENSG00000198755:ENST00000322203:exon_35436185_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35436185_35436216:RPL10A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 35544942 G/A 1 25 31 56 11.5572882105729 16.6689626188896 -5.11167440831676 A:G G A 10 0.537708471577085 0.181857719384606 ENSG00000096060:ENST00000357266:exon_35544771_35545010:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000337746:exon_35544771_35545010:FKBP5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36068041 T/C 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112062:ENST00000229795:exon_36067965_36068044:MAPK14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36104468 C/G 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 C:G C G 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000156711:ENST00000373761:exon_36104433_36104547:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000211287:exon_36104433_36104547:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373770:exon_36104433_36104547:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373766:exon_36104433_36104547:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373759:exon_36104433_36104547:MAPK13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 11 11 22 5.08520681265207 5.91479318734793 -0.82958637469587 A:G A G 10 0.537708471577085 0.831582005619284 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 20 16 36 9.2458305684583 8.60333554523336 0.642495023224939 C:G G C 10 0.537708471577085 0.868679174180134 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36976838 G/A 1 6 7 13 2.77374917053749 3.76395930103959 -0.990210130502105 A:G G A 10 0.537708471577085 0.592405089958251 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36979583 C/T 1 8 13 21 3.69833222738332 6.99021013050211 -3.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.189468968379346 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36979482_36979630:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36979482_36979809:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36979482_36979630:FGD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 21 18 39 9.70812209688122 9.67875248838753 0.0293696084936848 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 37349066 G/A 1 23 22 45 10.632705153727 11.8295863746959 -1.19688122096882 A:G G A 10 0.537708471577085 0.766042798882964 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 37442317 A/G 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37442300_37442422:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37442300_37442422:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37442300_37442422:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37442300_37442422:FTSJD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 48 38 86 22.1899933642999 20.4329219199292 1.75707144437069 A:G G A 10 0.537708471577085 0.746274793109029 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 41558043 C/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000137166:ENST00000373063:exon_41558009_41558085:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000373060:exon_41558009_41558085:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000409208:exon_41558009_41558085:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000373057:exon_41558009_41558085:FOXP4;ENSG00000137166:ENST00000307972:exon_41558009_41558085:FOXP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 41658566 C/T 1 48 70 118 22.1899933642999 37.6395930103959 -15.449599646096 T:C C T 10 0.537708471577085 0.005394516374069 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658401_41658655:TFEB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 36 14 50 16.6424950232249 7.52791860207919 9.11457642114575 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0103121154344063 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 41903783 G/A 1 36 14 50 16.6424950232249 7.52791860207919 9.11457642114575 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0103121154344063 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 42044945 G/A 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:G G A 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000137413:ENST00000456846:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000494547:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372982:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000530512:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000320973:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000372977:exon_42044838_42044977:TAF8;ENSG00000137413:ENST00000465926:exon_42044838_42044977:TAF8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43188940 C/T 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 T:C C T 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000506830:exon_43188896_43189059:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000512423:exon_43188485_43189016:CUL9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 21 7 28 9.70812209688122 3.76395930103959 5.94416279584162 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0351551848442857 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43490502 G/A 1 55 42 97 25.4260340632603 22.5837558062376 2.84227825702276 A:G G A 10 0.537708471577085 0.611162700677824 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43490069_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43490072_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43490075_43491743:XPO5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43540302 C/T 1 17 13 30 7.85895598318955 6.99021013050211 0.868745852687449 T:C C T 10 0.537708471577085 0.8553876844794 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43540243_43540315:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43540243_43540315:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43540243_43540315:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372252:exon_43540243_43540315:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43540243_43540315:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43540243_43540315:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398799:exon_43540243_43540315:XPO5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43588007 T/C 1 11 12 23 5.08520681265207 6.45250165892502 -1.36729484627296 T:C T C 10 0.537708471577085 0.676984403272827 ENSG00000172432:ENST00000496137:exon_43587856_43588070:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43587987_43588070:GTPBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 17 17 34 7.85895598318955 9.14104401681045 -1.28208803362089 A:G G A 10 0.537708471577085 0.731925963272471 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 43608166 C/T 1 77 58 135 35.5964476885645 31.1870913514709 4.40935633709352 T:C C T 10 0.537708471577085 0.490115086624446 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43607758_43608689:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43607758_43608686:MAD2L1BP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 367 283 650 169.66099093121 152.171497456315 17.4894934748947 A:T:G G A 10 0.537708471577085 0.181047771340804 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 44200655 G/A 1 24 16 40 11.09499668215 8.60333554523336 2.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 0.526471697646376 ENSG00000112759:ENST00000393844:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000427851:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000313248:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371755:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371740:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371731:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000393841:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371724:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371713:exon_44200544_44200743:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371708:exon_44200544_44200743:SLC29A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 44268371 T/C 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44267391_44268448:AARS2;ENSG00000124608:ENST00000491573:exon_44268309_44269003:AARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 46107752 C/G 1 2 6 8 0.92458305684583 3.22625082946251 -2.30166777261668 C:G C G 10 0.537708471577085 0.15557289677717 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46107288_46108146:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46107287_46108146:ENPP4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 17 21 38 7.85895598318955 11.2918779031188 -3.43292191992923 T:C T C 10 0.537708471577085 0.329112141439703 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 15 12 27 6.93437292634373 6.45250165892502 0.481871267418705 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 49459978 A/G 1 6 13 19 2.77374917053749 6.99021013050211 -4.21646095996462 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0651882753473269 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49459857_49460820:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49459857_49460820:CENPQ HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 52268890 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:T:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 53133954 C/T 1 29 37 66 13.4064543242645 19.8952134483521 -6.48875912408761 T:C C T 10 0.537708471577085 0.137914155864048 ENSG00000012660:ENST00000370918:exon_53132196_53134068:ELOVL5;ENSG00000012660:ENST00000304434:exon_53132197_53134068:ELOVL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 56917520 T/C 1 16 12 28 7.39666445476664 6.45250165892502 0.94416279584162 T:C T C 10 0.537708471577085 0.850213996975682 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 13 0 13 6.00978986949789 0 6.00978986949789 G G 10 0.537708471577085 0.000358176076528924 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57246847 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 8 8 0 4.30166777261668 -4.30166777261668 G A G 10 0.537708471577085 0.00208606328681067 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 20 20 0 10.7541694315417 -10.7541694315417 G A G 10 0.537708471577085 1.98755291459476e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57499035 T/C 0 32 0 32 14.7933289095333 0 14.7933289095333 T T 10 0.537708471577085 3.10884189817403e-09 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57498967_57499035:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57498967_57499035:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 29 29 0 15.5935456757355 -15.5935456757355 A G A 10 0.537708471577085 1.91673518239290e-10 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 22 22 0 11.8295863746959 -11.8295863746959 G T G 10 0.537708471577085 4.24766804848531e-08 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 24 0 24 11.09499668215 0 11.09499668215 C C 10 0.537708471577085 6.03779550653503e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 1 1 20 21 0.462291528422915 10.7541694315417 -10.2918779031188 T:C T C 10 0.537708471577085 4.53145574438325e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 13 13 0 6.99021013050211 -6.99021013050211 A G A 10 0.537708471577085 4.40460690008215e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 64416052 T/C 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C T C 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000118482:ENST00000506783:exon_64415919_64416114:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000515594:exon_64415919_64416114:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000262043:exon_64415919_64416114:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000509876:exon_64415919_64416114:PHF3;ENSG00000118482:ENST00000393387:exon_64415919_64416114:PHF3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 72006512 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000119900:ENST00000370435:exon_72006375_72006520:OGFRL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 18 18 36 8.32124751161247 9.67875248838753 -1.35750497677506 T:C C T 10 0.537708471577085 0.738846657755007 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:G G T 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 T:C T C 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 37 19 56 17.1047865516479 10.2164609599646 6.88832559168324 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0806733647918868 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 1 7 8 0.462291528422915 3.76395930103959 -3.30166777261668 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0284854418445818 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 74229792 A/G 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000156508:ENST00000316292:exon_74229606_74230741:EEF1A1;ENSG00000156508:ENST00000456206:exon_74229606_74230741:EEF1A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 76344431 C/T 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000493959:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76344423_76344527:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000487548:exon_76344423_76344772:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76344423_76344527:SENP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 76376552 G/A 1 24 18 42 11.09499668215 9.67875248838753 1.41624419376243 A:G G A 10 0.537708471577085 0.757539726068538 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76376428_76376657:SENP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 76425288 A/G 1 102 77 179 47.1537358991373 41.4035523114355 5.75018358770178 A:G A G 10 0.537708471577085 0.410115345708307 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76425101_76425620:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76425101_76427997:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76425101_76427994:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76425101_76425593:SENP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 76624741 C/T 1 12 11 23 5.54749834107498 5.91479318734793 -0.367294846272955 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76624530_76626329:MYO6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 80741243 A/T 1 30 22 52 13.8687458526875 11.8295863746959 2.03915947799158 A:T A T 10 0.537708471577085 0.581989908197437 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80741184_80741276:TTK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 87969341 G/A 1 17 22 39 7.85895598318955 11.8295863746959 -3.97063039150632 A:G G A 10 0.537708471577085 0.260706150734874 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 51 38 89 23.5768679495687 20.4329219199292 3.14394602963943 C:G C G 10 0.537708471577085 0.525230888939262 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 90368380 G/A 1 15 10 25 6.93437292634373 5.37708471577085 1.55728821057287 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.555372318805009 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90368329_90368636:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90368329_90368636:MDN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 90577602 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C T C 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 T:C T C 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 100957344 T/C 1 45 72 117 20.8031187790312 38.7150099535501 -17.9118911745189 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.00109111836981977 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 100960621 T/A 1 47 35 82 21.727701835877 18.819796505198 2.90790533067903 A:T T A 10 0.537708471577085 0.580172422851762 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100960585_100960794:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 100964158 G/A 1 22 18 40 10.1704136253041 9.67875248838753 0.4916611369166 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 100966006 C/T 1 23 19 42 10.632705153727 10.2164609599646 0.416244193762429 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 101049748 C/T 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 T:C C T 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101049686_101049811:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 101090545 T/A 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 A:T T A 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101090457_101090625:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 101100745 C/T 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101100601_101100765:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101100601_101100765:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G G A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 41 41 82 18.9539526653395 22.0460473346605 -3.09209466932097 T:C C T 10 0.537708471577085 0.508080364773424 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 32 22 54 14.7933289095333 11.8295863746959 2.96374253483741 A:C:G A C 10 0.537708471577085 0.495445586716911 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 105821449 A/G 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105821244_105821453:PREP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 106555347 C/A 1 6 19 25 2.77374917053749 10.2164609599646 -7.44271178942713 A:C C A 10 0.537708471577085 0.00401061483372973 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 9 14 23 4.16062375580623 7.52791860207919 -3.36729484627296 A:G G A 10 0.537708471577085 0.209192911108316 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 15 11 26 6.93437292634373 5.91479318734793 1.01957973899579 T:C C T 10 0.537708471577085 0.8445748718871 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 109775149 C/A 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 A:C C A 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 109787476 C/T 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 110064928 A/T 1 4 10 14 1.84916611369166 5.37708471577085 -3.52791860207919 A:T A T 10 0.537708471577085 0.0653916474415341 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110064878_110064975:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110064878_110064975:FIG4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 110081557 T/C 1 11 10 21 5.08520681265207 5.37708471577085 -0.291877903118785 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112367:ENST00000368944:exon_110081453_110081586:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110081453_110081586:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110081453_110081586:FIG4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 44 32 76 20.3408272506083 17.2066710904667 3.13415616014154 A:G G A 10 0.537708471577085 0.492110940277602 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111498724 C/T 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112394:ENST00000368851:exon_111498415_111498868:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000368853:exon_111498415_111498868:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000419619:exon_111498415_111498868:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000439288:exon_111498415_111498915:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000465319:exon_111498415_111498915:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000368850:exon_111498415_111498868:SLC16A10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111588188 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000173214:ENST00000368847:exon_111587079_111592370:KIAA1919 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111628597 C/G 1 22 16 38 10.1704136253041 8.60333554523336 1.56707808007077 C:G C G 10 0.537708471577085 0.630025415688229 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111628626 C/T 1 16 15 31 7.39666445476664 8.06562707365627 -0.668962618889635 T:C C T 10 0.537708471577085 0.85820368931506 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000462119:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111628564_111628773:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111628564_111628773:REV3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111696129 T/A 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:T T A 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111901453 G/T 1 8 10 18 3.69833222738332 5.37708471577085 -1.67875248838753 T:G G T 10 0.537708471577085 0.483350370737889 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111901400_111901592:TRAF3IP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111913070 G/A 1 19 22 41 8.78353904003538 11.8295863746959 -3.04604733466049 A:G G A 10 0.537708471577085 0.351754139410368 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 111913262 C/T 1 20 24 44 9.2458305684583 12.90500331785 -3.65917274939174 T:C C T 10 0.537708471577085 0.292010384577340 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:G G A 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 116575116 G/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:G G T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 12 20 32 5.54749834107498 10.7541694315417 -5.20667109046672 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0762053180275848 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 116756773 T/C 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000111817:ENST00000452085:exon_116756750_116759445:DSE;ENSG00000111817:ENST00000331677:exon_116756750_116759442:DSE;ENSG00000111817:ENST00000359564:exon_116756750_116759440:DSE HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 116892734 G/A 1 39 38 77 18.0293696084937 20.4329219199292 -2.40355231143555 A:G G A 10 0.537708471577085 0.647878764119335 ENSG00000111832:ENST00000466444:exon_116892530_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000368590:exon_116892572_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000392526:exon_116892583_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000487832:exon_116892652_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000517800:exon_116892672_116892818:RWDD1;ENSG00000111832:ENST00000518117:exon_116892726_116892818:RWDD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 118028145 A/G 1 25 20 45 11.5572882105729 10.7541694315417 0.803118779031173 A:G A G 10 0.537708471577085 0.8816626047185 ENSG00000153989:ENST00000368494:exon_118028088_118031803:NUS1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 A:C C A 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C T C 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136597174 G/A 0 136 0 136 62.8716478655164 0 62.8716478655164 G G 10 0.537708471577085 4.3857225316289e-37 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 156 0 156 72.1174784339747 0 72.1174784339747 T T 10 0.537708471577085 1.00752291195154e-42 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 167 0 167 77.2026852466268 0 77.2026852466268 A A 10 0.537708471577085 1.77617814232252e-45 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 166 0 166 76.7403937182039 0 76.7403937182039 A A 10 0.537708471577085 3.47803503971374e-45 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 1 73 1 74 33.7472815748728 0.537708471577085 33.2095731032957 C:G G C 10 0.537708471577085 1.09635232664094e-18 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 77 1 78 35.5964476885645 0.537708471577085 35.0587392169874 T:G T G 10 0.537708471577085 8.53641626364235e-20 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 136599458 C/T 0 89 0 89 41.1439460296394 0 41.1439460296394 C C 10 0.537708471577085 1.32100005023466e-24 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 T:C T C 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 82 92 174 37.907905330679 49.4691793850918 -11.5612740544128 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0807325469673147 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 144183376 T/C 1 50 49 99 23.1145764211457 26.3477151072772 -3.23313868613142 T:C T C 10 0.537708471577085 0.54600255315142 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 24 14 38 11.09499668215 7.52791860207919 3.56707808007077 A:G G A 10 0.537708471577085 0.259667359629290 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 23 31 54 10.632705153727 16.6689626188896 -6.03625746516259 A:G G A 10 0.537708471577085 0.103293935008092 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 27 28 55 12.4818712674187 15.0558372041584 -2.57396593673968 T:C C T 10 0.537708471577085 0.501722231924964 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 23 20 43 10.632705153727 10.7541694315417 -0.121464277814656 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 157522360 G/A 1 25 17 42 11.5572882105729 9.14104401681045 2.41624419376243 A:G G A 10 0.537708471577085 0.536705056533733 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157521839_157522622:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000445852:exon_157522173_157522622:ARID1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 159457826 C/G 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 C:G C G 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000164691:ENST00000367066:exon_159455500_159458156:TAGAP;ENSG00000164691:ENST00000367061:exon_159456029_159458156:TAGAP;ENSG00000164691:ENST00000326965:exon_159456169_159458156:TAGAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 21 15 36 9.70812209688122 8.06562707365627 1.64249502322494 A:G A G 10 0.537708471577085 0.619672042871282 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 160174456 T/G 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:G T G 10 0.537708471577085 0.365626586475337 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 177 212 389 81.825600530856 113.994195974342 -32.1685954434861 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00112245387221814 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 100 149 249 46.2291528422915 80.1185622649857 -33.8894094226942 A:T:G G A 10 0.537708471577085 1.86902988920319e-05 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 14 10 24 6.47208139792081 5.37708471577085 1.09499668214996 T:G G T 10 0.537708471577085 0.687878182736171 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 T:C T C 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 17 17 34 7.85895598318955 9.14104401681045 -1.28208803362089 A:G A G 10 0.537708471577085 0.731925963272471 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 11 22 33 5.08520681265207 11.8295863746959 -6.7443795620438 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0224314831010516 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 22 29 51 10.1704136253041 15.5935456757355 -5.42313205043133 A:T A T 10 0.537708471577085 0.159625443303350 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 243 179 422 112.336841406768 96.2498164122982 16.0870249944701 C:G G C 10 0.537708471577085 0.118447212344596 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 T:C T C 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 11 6 17 5.08520681265207 3.22625082946251 1.85895598318956 T:C T C 10 0.537708471577085 0.468286092935019 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 16 3 19 7.39666445476664 1.61312541473126 5.78353904003538 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0095817644443415 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 796430 C/T 1 11 13 24 5.08520681265207 6.99021013050211 -1.90500331785004 T:C C T 10 0.537708471577085 0.540188574454526 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_796419_796631:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_796419_796631:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_796419_796631:HEATR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 909048 G/A 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_908986_909153:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_908111_909153:SUN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 930608 G/A 1 28 37 65 12.9441627958416 19.8952134483521 -6.95105065251052 A:G G A 10 0.537708471577085 0.105148527685477 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 52 39 91 24.0391594779916 20.9706303915063 3.06852908648526 T:C C T 10 0.537708471577085 0.530368497854083 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 932053 C/T 1 41 56 97 18.9539526653395 30.1116744083168 -11.1577217429772 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0249810616541004 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 943868 G/A 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453823:exon_943763_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000481406:exon_943594_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000463358:exon_943789_943909:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000477906:exon_943824_943909:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_943763_943909:COX19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 10 22 32 4.62291528422915 11.8295863746959 -7.20667109046672 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0124504179244765 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 2834577 T/C 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000146535:ENST00000275364:exon_2834562_2834777:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2834562_2834777:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000471281:exon_2834354_2834779:GNA12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 2834754 T/C 1 10 12 22 4.62291528422915 6.45250165892502 -1.82958637469587 T:C T C 10 0.537708471577085 0.522935272715333 ENSG00000146535:ENST00000275364:exon_2834562_2834777:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2834562_2834777:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000471281:exon_2834354_2834779:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000447791:exon_2834601_2834777:GNA12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 2963884 C/T 1 23 13 36 10.632705153727 6.99021013050211 3.64249502322494 T:C C T 10 0.537708471577085 0.245366448391152 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2963867_2963999:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2963867_2963999:CARD11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 2985586 C/G 1 32 20 52 14.7933289095333 10.7541694315417 4.03915947799158 C:G C G 10 0.537708471577085 0.270013403253802 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2985453_2985590:CARD11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 4 11 15 1.84916611369166 5.91479318734793 -4.06562707365627 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0400794641262981 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 5391702 C/G 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 C:G C G 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5390919_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5391633_5391725:TNRC18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 5528883 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5528809_5529843:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5528880_5528927:FBXL18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 39 31 70 18.0293696084937 16.6689626188896 1.36040698960405 A:G A G 10 0.537708471577085 0.810914180394854 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 163 186 349 75.3535191329351 100.013775713338 -24.6602565804027 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00849182017085574 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 6189843 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 6621277 G/A 1 36 26 62 16.6424950232249 13.9804202610042 2.66207476222073 A:G G A 10 0.537708471577085 0.526409972219743 ENSG00000136247:ENST00000405731:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396707:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396713:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000335965:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000493944:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396709:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000474097:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000483589:exon_6621238_6621311:ZDHHC4;ENSG00000136247:ENST00000396706:exon_6621238_6621311:ZDHHC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 6776956 A/G 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 A:G A G 10 0.537708471577085 0.246025491590504 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 6777043 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 7613039 C/T 1 50 38 88 23.1145764211457 20.4329219199292 2.68165450121652 T:C C T 10 0.537708471577085 0.594269718581428 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7612067_7613400:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000434746:exon_7612067_7613400:MIOS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 7628131 T/C 1 54 62 116 24.9637425348374 33.3379252377793 -8.37418270294187 T:C T C 10 0.537708471577085 0.136015397085092 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7628129_7628194:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7628129_7628194:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7628129_7628194:MIOS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 7645667 C/T 1 61 56 117 28.1997832337978 30.1116744083168 -1.91189117451895 T:C C T 10 0.537708471577085 0.78105140531574 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7644749_7645702:MIOS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 8110731 A/G 1 13 13 26 6.00978986949789 6.99021013050211 -0.980420261004211 A:G A G 10 0.537708471577085 0.699950273867981 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8110551_8110761:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8110551_8110761:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8110551_8110761:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000438949:exon_8110551_8110761:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000496617:exon_8110551_8110761:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8109705_8110761:GLCCI1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 11075308 A/T 1 11 8 19 5.08520681265207 4.30166777261668 0.783539040035385 A:T:C A T 10 0.537708471577085 0.819996579191913 ENSG00000106443:ENST00000521747:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000403050:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000399406:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000423760:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000303905:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000431704:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000445996:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000490957:exon_11075267_11075413:PHF14;ENSG00000106443:ENST00000497851:exon_11075212_11075413:PHF14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:G A G 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 21940888 C/T 1 100 85 185 46.2291528422915 45.7052200840522 0.523932758239269 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 31 13 44 14.3310373811104 6.99021013050211 7.34082725060826 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0332378217454861 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 23164701 C/T 1 10 2 12 4.62291528422915 1.07541694315417 3.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0450438793507606 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 23552609 T/C 1 80 71 151 36.9833222738332 38.177301481973 -1.19397920813984 T:C T C 10 0.537708471577085 0.870534064049614 ENSG00000164548:ENST00000297071:exon_23552513_23552701:TRA2A;ENSG00000164548:ENST00000494255:exon_23552513_23552701:TRA2A;ENSG00000164548:ENST00000474586:exon_23552513_23552701:TRA2A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 72 48 120 33.2849900464499 25.8100066357001 7.4749834107498 T:C T C 10 0.537708471577085 0.199764517592835 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 26778490 G/A 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000005020:ENST00000345317:exon_26778414_26778497:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000489977:exon_26778414_26778497:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000468712:exon_26778414_26778497:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000495802:exon_26778414_26778497:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000432747:exon_26778459_26778497:SKAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 26904014 G/A 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000005020:ENST00000345317:exon_26903982_26904362:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000497511:exon_26903982_26904206:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000487720:exon_26903982_26904204:SKAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 69 50 119 31.8981154611811 26.8854235788543 5.01269188232688 A:G G A 10 0.537708471577085 0.408120204531243 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 91 71 162 42.0685290864853 38.177301481973 3.89122760451222 C:G G C 10 0.537708471577085 0.581489481027907 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 83 68 151 38.3701968591019 36.5641760672418 1.80602079186016 C:G C G 10 0.537708471577085 0.806816239281686 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 118 104 222 54.550400353904 55.9216810440168 -1.37128069011288 C:G G C 10 0.537708471577085 0.892963166943573 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 32598630 T/A 1 9 3 12 4.16062375580623 1.61312541473126 2.54749834107498 A:T T A 10 0.537708471577085 0.159703749958594 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:C C T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 27 20 47 12.4818712674187 10.7541694315417 1.727701835877 A:G A G 10 0.537708471577085 0.662505380376758 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 19 28 47 8.78353904003538 15.0558372041584 -6.272298164123 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0787383525282749 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 36895342 C/T 1 27 34 61 12.4818712674187 18.2820880336209 -5.80021676620219 T:C C T 10 0.537708471577085 0.157726803261001 ENSG00000155849:ENST00000341056:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396042:exon_36893961_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396045:exon_36893966_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000396040:exon_36894067_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_36894600_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_36894896_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000497024:exon_36894972_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000487843:exon_36895103_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_36895128_36895356:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_36895156_36895356:ELMO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 22 31 53 10.1704136253041 16.6689626188896 -6.49854899358551 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0973868168321778 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 46 42 88 21.2654103074541 22.5837558062376 -1.31834549878348 T:C T C 10 0.537708471577085 0.830923786146366 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 183 133 316 84.5993497013934 71.5152267197523 13.0841229816411 A:G A G 10 0.537708471577085 0.142771175231266 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 43916491 G/A 1 18 19 37 8.32124751161247 10.2164609599646 -1.89521344835215 A:G G A 10 0.537708471577085 0.621575328997597 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 T:G T G 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 2 10 12 0.92458305684583 5.37708471577085 -4.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0165438968231611 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 115 100 215 53.1635257686352 53.7708471577085 -0.607321389073277 T:C T C 10 0.537708471577085 0.945556398115227 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 9 4 13 4.16062375580623 2.15083388630834 2.00978986949789 T:G G T 10 0.537708471577085 0.40524635486904 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 44156821 G/A 1 99 79 178 45.7668613138686 42.4789692545897 3.28789205927887 A:G G A 10 0.537708471577085 0.652329915293215 ENSG00000106628:ENST00000406581:exon_44156732_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000395803:exon_44156732_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000223361:exon_44156732_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000452185:exon_44156732_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000436844:exon_44156732_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000481104:exon_44156732_44157159:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000433715:exon_44156732_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000463464:exon_44156662_44156846:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000470867:exon_44156748_44156846:POLD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 44606098 C/T 1 54 53 107 24.9637425348374 28.4985489935855 -3.5348064587481 T:C C T 10 0.537708471577085 0.499045576246215 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000479602:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44606047_44606123:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44605737_44606123:DDX56 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 44620836 C/A 1 26 25 51 12.0195797389958 13.4427117894271 -1.42313205043134 A:C C A 10 0.537708471577085 0.779160209506102 ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44620692_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44619496_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44619503_44620838:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44620692_44620838:TMED4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 44800176 G/T 1 25 27 52 11.5572882105729 14.5181287325813 -2.96084052200842 T:G G T 10 0.537708471577085 0.487196386259669 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44800024_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44799333_44800192:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44799550_44800192:ZMIZ2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 50367292 C/A 1 5 8 13 2.31145764211457 4.30166777261668 -1.99021013050211 A:C C A 10 0.537708471577085 0.282533039082347 ENSG00000185811:ENST00000484847:exon_50367234_50367581:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000413698:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000331340:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000359197:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000343574:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000346667:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000349824:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000357364:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000438033:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000439701:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000440768:exon_50367234_50367556:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000492782:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000462201:exon_50367234_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000471793:exon_50366975_50367353:IKZF1;ENSG00000185811:ENST00000426121:exon_50367245_50367353:IKZF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 50514204 T/C 1 10 10 20 4.62291528422915 5.37708471577085 -0.754169431541701 T:C T C 10 0.537708471577085 0.824019337670248 ENSG00000132436:ENST00000395556:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000356889:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451252:exon_50511834_50515055:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451735:exon_50511834_50515078:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000433017:exon_50512175_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000419119:exon_50512840_50514995:FIGNL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 50514650 C/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:C C A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000132436:ENST00000395556:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000356889:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451252:exon_50511834_50515055:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451735:exon_50511834_50515078:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000433017:exon_50512175_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000419119:exon_50512840_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000435566:exon_50514485_50514714:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000436590:exon_50514610_50514995:FIGNL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 9 8 17 4.16062375580623 4.30166777261668 -0.141044016810445 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 13 15 28 6.00978986949789 8.06562707365627 -2.05583720415838 A:G G A 10 0.537708471577085 0.454460775736976 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 379 359 738 175.208489272285 193.037341296174 -17.8288520238887 T:C T C 10 0.537708471577085 0.196334548364546 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 63981563 A/G 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:G A G 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000173041:ENST00000309683:exon_63980262_63982878:ZNF680 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 64168806 T/C 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196247:ENST00000344930:exon_64166702_64171404:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000423627:exon_64166702_64171399:ZNF107;ENSG00000196247:ENST00000395391:exon_64166702_64171401:ZNF107 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:G G A 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 22 27 49 10.1704136253041 14.5181287325813 -4.34771510727717 A:G A G 10 0.537708471577085 0.251819843788447 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 165 149 314 76.278102189781 80.1185622649857 -3.8404600752047 A:G A G 10 0.537708471577085 0.692078720127227 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 62 57 119 28.6620747622207 30.6493828798938 -1.98730811767312 A:G G A 10 0.537708471577085 0.714285929148292 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 65447009 G/A 1 21 21 42 9.70812209688122 11.2918779031188 -1.58375580623757 A:G G A 10 0.537708471577085 0.645274967591958 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65446961_65447301:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65446961_65447183:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65446961_65447202:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65446961_65447198:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000475316:exon_65446961_65447075:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000446111:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000452642:exon_65446983_65447193:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000429291:exon_65446983_65447228:GUSB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 66453476 A/G 1 59 45 104 27.275200176952 24.1968812209688 3.07831895598316 A:G A G 10 0.537708471577085 0.556949176660648 ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66452664_66453486:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000420420:exon_66452706_66453486:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66452731_66453486:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66452733_66453486:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000496763:exon_66453425_66453486:SBDS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 38 15 53 17.5670780800708 8.06562707365627 9.50145100641449 A:C C A 10 0.537708471577085 0.0087450944740713 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 70255892 C/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70254734_70257489:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70254734_70258054:AUTS2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 A:G G A 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 72717686 C/T 1 43 44 87 19.8785357221853 23.6591727493917 -3.7806370272064 T:C C T 10 0.537708471577085 0.452230999909682 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72716514_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717227_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717597_72717737:NSUN5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 24 19 43 11.09499668215 10.2164609599646 0.878535722185344 T:C C T 10 0.537708471577085 0.878821788544274 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 72892269 T/C 1 24 21 45 11.09499668215 11.2918779031188 -0.196881220968825 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 72985148 C/T 1 24 23 47 11.09499668215 12.367294846273 -1.272298164123 T:C C T 10 0.537708471577085 0.770563908720813 ENSG00000106638:ENST00000459913:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72983993_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72984338_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000432538:exon_72984525_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72984741_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000488915:exon_72984801_72985302:TBL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 73151644 A/G 1 10 17 27 4.62291528422915 9.14104401681045 -4.5181287325813 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0858171401501995 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 73753250 T/C 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C T C 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 73771780 T/C 1 16 8 24 7.39666445476664 4.30166777261668 3.09499668214996 T:C T C 10 0.537708471577085 0.225523458259253 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73771610_73771807:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73771610_73771807:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73771610_73771807:CLIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 73814702 C/A 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 A:C C A 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73814700_73814885:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73814700_73814885:CLIP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75517386 A/G 1 12 14 26 5.54749834107498 7.52791860207919 -1.98042026100421 A:G A G 10 0.537708471577085 0.44039552913221 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 A:G A G 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 18 17 35 8.32124751161247 9.14104401681045 -0.819796505197976 A:G A G 10 0.537708471577085 0.86585821201555 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75621542 G/A 1 23 29 52 10.632705153727 15.5935456757355 -4.96084052200842 A:G G A 10 0.537708471577085 0.210286382760523 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 20 25 45 9.2458305684583 13.4427117894271 -4.19688122096883 T:C T C 10 0.537708471577085 0.232998269151083 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75695710 C/T 1 686 531 1217 317.13198849812 285.523198407432 31.6087900906875 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0701561204128166 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75695597_75696826:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75695597_75696824:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75695597_75696385:MDH2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75933501 C/T 1 408 371 779 188.614943596549 199.489842955099 -10.8748993585492 T:C C T 10 0.537708471577085 0.450548027113004 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75933301_75933612:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75933301_75933609:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000447574:exon_75933301_75933577:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000429938:exon_75933301_75933612:HSPB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 55 26 81 25.4260340632603 13.9804202610042 11.4456138022561 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0137206768182903 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 76111994 C/G 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 C:G C G 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 20 11 31 9.2458305684583 5.91479318734793 3.33103738111036 T:G T G 10 0.537708471577085 0.280780991059551 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 89984409 A/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 90001496 G/C 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 C:G G C 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90001469_90001542:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90001469_90001542:GTPBP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 73 49 122 33.7472815748728 26.3477151072772 7.39956646759563 A:G G A 10 0.537708471577085 0.203592813432347 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 95800820 T/C 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C T C 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000004864:ENST00000265631:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000416240:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000490072:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000484495:exon_95800784_95800836:SLC25A13;ENSG00000004864:ENST00000492869:exon_95800784_95800836:SLC25A13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 98985876 G/T 1 665 592 1257 307.423866401238 318.323415173634 -10.8995487723959 A:T:C:G G T 10 0.537708471577085 0.552527933379976 ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98985662_98985884:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98985662_98985884:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98985662_98985878:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98985662_98985890:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98985662_98985890:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98985662_98985890:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98985662_98985884:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98985662_98985884:ARPC1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 159 149 308 73.5043530192435 80.1185622649857 -6.61420924574219 T:C T C 10 0.537708471577085 0.457988387302052 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99702947 G/A 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:G G A 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000438383:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000445208:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000439416:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000446007:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000421755:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000463195:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000422582:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000479916:exon_99702863_99702969:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000450807:exon_99702880_99702969:AP4M1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 47 44 91 21.727701835877 23.6591727493917 -1.93147091351474 A:T A T 10 0.537708471577085 0.752671563276668 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 55 51 106 25.4260340632603 27.4231320504313 -1.99709798717101 A:G A G 10 0.537708471577085 0.698187246543044 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99725631 G/A 0 9 0 9 4.16062375580623 0 4.16062375580623 G G 10 0.537708471577085 0.00472206769488212 ENSG00000214309:ENST00000398075:exon_99724991_99726118:MBLAC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 184 140 324 85.0616412298164 75.2791860207919 9.78245520902446 A:G G A 10 0.537708471577085 0.289951867849356 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 8 7 15 3.69833222738332 3.76395930103959 -0.065627073656275 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 25 40 65 11.5572882105729 21.5083388630834 -9.95105065251053 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0174387773305396 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 36 46 82 16.6424950232249 24.7345896925459 -8.09209466932097 A:G A G 10 0.537708471577085 0.076967489612661 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 78 79 157 36.0587392169874 42.4789692545897 -6.42023003760234 T:C T C 10 0.537708471577085 0.33686705157394 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 23 12 35 10.632705153727 6.45250165892502 4.18020349480202 A:C C A 10 0.537708471577085 0.176988164687284 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 7 22 29 3.23604069896041 11.8295863746959 -8.59354567573546 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00224055861077154 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:G T G 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 14 12 26 6.47208139792081 6.45250165892502 0.0195797389957901 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 12 20 32 5.54749834107498 10.7541694315417 -5.20667109046672 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0762053180275848 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 19 11 30 8.78353904003538 5.91479318734793 2.86874585268745 A:G G A 10 0.537708471577085 0.360993445768571 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 26 24 50 12.0195797389958 12.90500331785 -0.885423578854251 T:C C T 10 0.537708471577085 0.887428128576512 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 27 10 37 12.4818712674187 5.37708471577085 7.10478655164785 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0206436774039937 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 107545910 A/T 1 53 32 85 24.5014510064145 17.2066710904667 7.29477991594777 A:T A T 10 0.537708471577085 0.127706973800593 ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000451081:exon_107545806_107545949:DLD;ENSG00000091140:ENST00000478414:exon_107545806_107546208:DLD;ENSG00000091140:ENST00000489184:exon_107545806_107545949:DLD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 108213362 T/C 1 35 15 50 16.180203494802 8.06562707365627 8.11457642114575 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0229959223279485 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108213343_108215294:DNAJB9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 112112892 G/A 1 40 52 92 18.4916611369166 27.9608405220084 -9.46917938509182 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0592451880015317 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112821_112112916:IFRD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 53 50 103 24.5014510064145 26.8854235788543 -2.38397257243976 A:C:G G C 10 0.537708471577085 0.692886150709719 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 117825681 A/G 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 A:G A G 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000128534:ENST00000422760:exon_117824210_117825748:NAA38 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 120610901 C/T 1 15 14 29 6.93437292634373 7.52791860207919 -0.593545675735465 T:C C T 10 0.537708471577085 0.854019070015903 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120610742_120610934:ING3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 19 7 26 8.78353904003538 3.76395930103959 5.01957973899579 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0510246179623695 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 128388648 G/A 1 21 20 41 9.70812209688122 10.7541694315417 -1.04604733466049 A:G G A 10 0.537708471577085 0.756529286407691 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128388627_128388858:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128388627_128388858:CALU HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 19 9 28 8.78353904003538 4.83937624419377 3.94416279584162 A:G A G 10 0.537708471577085 0.183794076954982 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 79 62 141 36.5210307454103 33.3379252377793 3.18310550763101 A:G G A 10 0.537708471577085 0.613118409696493 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 17 14 31 7.85895598318955 7.52791860207919 0.331037381110365 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 16 9 25 7.39666445476664 4.83937624419377 2.55728821057287 T:C T C 10 0.537708471577085 0.324405864269745 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 129668746 G/A 1 9 18 27 4.16062375580623 9.67875248838753 -5.5181287325813 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0515252893164555 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000481503:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129668742_129668869:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000483827:exon_129668742_129668869:ZC3HC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 554 0 554 256.109506746295 0 256.109506746295 T T 10 0.537708471577085 8.671418341425e-150 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 8 21 29 3.69833222738332 11.2918779031188 -7.59354567573546 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00499658930745552 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 0 8 0 8 3.69833222738332 0 3.69833222738332 A A 10 0.537708471577085 0.00907441944682105 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 8 1 9 3.69833222738332 0.537708471577085 3.16062375580623 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0438932334623324 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 33 16 49 15.2556204379562 8.60333554523336 6.65228489272283 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0626859022789077 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 134849280 T/A 1 24 18 42 11.09499668215 9.67875248838753 1.41624419376243 A:T T A 10 0.537708471577085 0.757539726068538 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 15 13 28 6.93437292634373 6.99021013050211 -0.0558372041583803 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 28 32 60 12.9441627958416 17.2066710904667 -4.2625082946251 T:C C T 10 0.537708471577085 0.301000321854184 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 15 26 41 6.93437292634373 13.9804202610042 -7.04604733466049 A:G G A 10 0.537708471577085 0.028863968472861 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 134889141 G/A 1 9 10 19 4.16062375580623 5.37708471577085 -1.21646095996462 A:G G A 10 0.537708471577085 0.648694936874249 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 135279315 A/C 1 11 14 25 5.08520681265207 7.52791860207919 -2.44271178942712 A:C A C 10 0.537708471577085 0.423015729576772 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135279295_135279477:NUP205 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 138265391 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000122779:ENST00000343526:exon_138265307_138265439:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000415680:exon_138265307_138265439:TRIM24 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 5 7 12 2.31145764211457 3.76395930103959 -1.45250165892502 A:G G A 10 0.537708471577085 0.564667164878158 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 139415943 G/A 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 139726121 G/A 1 8 3 11 3.69833222738332 1.61312541473126 2.08520681265207 A:G G A 10 0.537708471577085 0.241142739775988 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000484111:exon_139725997_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139725996_139726148:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139726004_139726148:PARP12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 140158851 C/G 1 47 34 81 21.727701835877 18.2820880336209 3.44561380225611 C:G C G 10 0.537708471577085 0.504088616023095 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140158807_140159033:MKRN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 142495156 T/G 1 11 9 20 5.08520681265207 4.83937624419377 0.2458305684583 T:G T G 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 167 0 167 77.2026852466268 0 77.2026852466268 T T 10 0.537708471577085 1.77617814232252e-45 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 143079422 C/T 1 23 25 48 10.632705153727 13.4427117894271 -2.81000663570008 T:C C T 10 0.537708471577085 0.47005408359343 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449630:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079341_143079778:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000457235:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079341_143079540:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079341_143079540:ZYX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 183 225 408 84.5993497013934 120.984406104844 -36.3850564034507 T:C C T 10 0.537708471577085 0.000340397580956717 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 148904547 A/G 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 A:G A G 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000170265:ENST00000262085:exon_148904443_148904562:ZNF282;ENSG00000170265:ENST00000479907:exon_148904443_148904562:ZNF282 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 149133916 C/T 1 19 8 27 8.78353904003538 4.30166777261668 4.4818712674187 T:C C T 10 0.537708471577085 0.120980132312301 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149133666_149133917:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149133666_149133917:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149133666_149133917:ZNF777 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 149152906 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 17 11 28 7.85895598318955 5.91479318734793 1.94416279584162 T:C T C 10 0.537708471577085 0.570682901317659 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 21 13 34 9.70812209688122 6.99021013050211 2.71791196637911 A:G A G 10 0.537708471577085 0.392827901382920 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150066900 A/G 1 18 14 32 8.32124751161247 7.52791860207919 0.79332890953328 A:G A G 10 0.537708471577085 0.860157369191954 ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 30 21 51 13.8687458526875 11.2918779031188 2.57686794956867 A:G G A 10 0.537708471577085 0.486489837768018 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 33 26 59 15.2556204379562 13.9804202610042 1.27520017695198 T:C C T 10 0.537708471577085 0.794729414690578 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150171710 T/C 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150217248 A/G 1 26 3 29 12.0195797389958 1.61312541473126 10.4064543242645 A:G A G 10 0.537708471577085 5.01714988955336e-05 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150324760 G/T 1 14 20 34 6.47208139792081 10.7541694315417 -4.28208803362089 T:C:G G T 10 0.537708471577085 0.168954691239917 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 22 23 45 10.1704136253041 12.367294846273 -2.19688122096882 T:C C T 10 0.537708471577085 0.551606420592295 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 53 60 113 24.5014510064145 32.2625082946251 -7.7610572882106 A:G G A 10 0.537708471577085 0.157099878046972 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 34 34 68 15.7179119663791 18.2820880336209 -2.56417606724178 A:G A G 10 0.537708471577085 0.545364347754942 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 25 25 50 11.5572882105729 13.4427117894271 -1.88542357885425 C:G C G 10 0.537708471577085 0.67099228071254 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 40 23 63 18.4916611369166 12.367294846273 6.12436629064364 C:G C G 10 0.537708471577085 0.130622987759755 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 151257695 C/T 1 3 9 12 1.38687458526874 4.83937624419377 -3.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0780281383639108 ENSG00000106617:ENST00000433631:exon_151257610_151257703:PRKAG2;ENSG00000106617:ENST00000418337:exon_151257610_151257703:PRKAG2;ENSG00000106617:ENST00000287878:exon_151257610_151257703:PRKAG2;ENSG00000106617:ENST00000492843:exon_151257610_151257703:PRKAG2;ENSG00000106617:ENST00000392801:exon_151257610_151257703:PRKAG2;ENSG00000106617:ENST00000479461:exon_151257610_151257703:PRKAG2;ENSG00000106617:ENST00000485183:exon_151257461_151257703:PRKAG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 151851392 C/T 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000485241:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000418061:exon_151851352_151851530:MLL3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 152345726 A/G 1 7 11 18 3.23604069896041 5.91479318734793 -2.67875248838753 A:G A G 10 0.537708471577085 0.241160772074431 ENSG00000196584:ENST00000495707:exon_152341864_152346448:XRCC2;ENSG00000196584:ENST00000359321:exon_152343589_152346448:XRCC2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 20 28 48 9.2458305684583 15.0558372041584 -5.81000663570008 T:C T C 10 0.537708471577085 0.110865480829978 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 158449304 C/T 1 28 18 46 12.9441627958416 9.67875248838753 3.26541030745409 T:C C T 10 0.537708471577085 0.376604432747268 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158449294_158449397:NCAPG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 7 158476043 G/A 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158475992_158476078:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158475992_158476078:NCAPG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 35 41 76 16.180203494802 22.0460473346605 -5.86584383985846 A:G G A 10 0.537708471577085 0.205586462259312 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 623906 C/T 1 57 51 108 26.3506171201062 27.4231320504313 -1.07251493032518 T:C C T 10 0.537708471577085 0.847495227849973 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000524138:exon_623767_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000518313:exon_623844_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000518277:exon_623865_624047:ERICH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 6479042 C/T 1 1 10 11 0.462291528422915 5.37708471577085 -4.91479318734794 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0039294954307517 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 6479160 C/T 1 12 4 16 5.54749834107498 2.15083388630834 3.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.130583196467889 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 A:C C A 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 4 17 21 1.84916611369166 9.14104401681045 -7.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00160984541813254 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 8175868 C/T 1 28 17 45 12.9441627958416 9.14104401681045 3.80311877903118 T:C C T 10 0.537708471577085 0.296310268066239 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 8176051 G/A 1 13 8 21 6.00978986949789 4.30166777261668 1.70812209688121 A:G G A 10 0.537708471577085 0.516677589657716 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 8176540 C/T 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 39 54 93 18.0293696084937 29.0362574651626 -11.0068878566689 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0284238648856342 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 11640784 A/G 1 12 12 24 5.54749834107498 6.45250165892502 -0.90500331785004 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.838395166804736 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 11643459 C/T 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 T:C C T 10 0.537708471577085 0.741316529281598 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 24 20 44 11.09499668215 10.7541694315417 0.340827250608259 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 11683622 T/C 1 215 209 424 99.3926786109267 112.381070559611 -12.988391948684 T:C T C 10 0.537708471577085 0.205882118902933 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/C,G 0 1 10 11 0.462291528422915 5.37708471577085 -4.91479318734794 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.0039294954307517 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 9 5 14 4.16062375580623 2.68854235788543 1.47208139792081 T:C T C 10 0.537708471577085 0.593881039934305 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 13 20 33 6.00978986949789 10.7541694315417 -4.74437956204381 T:C C T 10 0.537708471577085 0.116148498675437 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 34 23 57 15.7179119663791 12.367294846273 3.35061712010615 T:C C T 10 0.537708471577085 0.426227219655826 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 14 19 33 6.47208139792081 10.2164609599646 -3.74437956204381 A:T A T 10 0.537708471577085 0.222694445595855 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 17820758 G/T 1 21 23 44 9.70812209688122 12.367294846273 -2.65917274939174 T:G G T 10 0.537708471577085 0.452031865340640 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 17918934 A/G 1 38 29 67 17.5670780800708 15.5935456757355 1.9735324043353 A:G A G 10 0.537708471577085 0.713531534779643 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 C:G G C 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 45 37 82 20.8031187790312 19.8952134483521 0.907905330679029 A:G A G 10 0.537708471577085 0.911940751607644 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 T:C T C 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 25 39 64 11.5572882105729 20.9706303915063 -9.41334218093344 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0233322401541517 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 24 18 42 11.09499668215 9.67875248838753 1.41624419376243 A:G G A 10 0.537708471577085 0.757539726068538 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 25 34 59 11.5572882105729 18.2820880336209 -6.72479982304802 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0895952913594266 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 22864622 T/C 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 T:C T C 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22864241_22865259:RHOBTB2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 95 69 164 43.9176952001769 37.1018845388189 6.81581066135806 T:C C T 10 0.537708471577085 0.308909664057240 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 112 117 229 51.7766511833665 62.9118911745189 -11.1352399911525 A:C A C 10 0.537708471577085 0.145126641065430 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 27886903 C/T 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27886783_27886919:C8orf80;ENSG00000189233:ENST00000341513:exon_27886783_27886919:C8orf80 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 30469817 T/C 1 27 21 48 12.4818712674187 11.2918779031188 1.18999336429992 T:C T C 10 0.537708471577085 0.773653377742187 ENSG00000197265:ENST00000355904:exon_30469816_30469998:GTF2E2;ENSG00000197265:ENST00000522833:exon_30469816_30469882:GTF2E2;ENSG00000197265:ENST00000523499:exon_30469816_30469998:GTF2E2;ENSG00000197265:ENST00000518599:exon_30469816_30469998:GTF2E2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 37730456 G/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:G G T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 20 0 20 9.2458305684583 0 9.2458305684583 T T 10 0.537708471577085 4.28136229728645e-06 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:G A G 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 17 9 26 7.85895598318955 4.83937624419377 3.01957973899579 T:C T C 10 0.537708471577085 0.325511582559439 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 38961159 G/T 1 24 28 52 11.09499668215 15.0558372041584 -3.96084052200842 T:G G T 10 0.537708471577085 0.330348938683283 ENSG00000168615:ENST00000487273:exon_38961126_38962520:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481873:exon_38961126_38962656:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000468065:exon_38961126_38962663:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000379917:exon_38961126_38962663:ADAM9 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 10 11 21 4.62291528422915 5.91479318734793 -1.29187790311879 A:G A G 10 0.537708471577085 0.663559811646481 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 14 16 30 6.47208139792081 8.60333554523336 -2.13125414731255 A:G A G 10 0.537708471577085 0.467885000124991 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 13 30 43 6.00978986949789 16.1312541473125 -10.1214642778147 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00207226296559139 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 14 5 19 6.47208139792081 2.68854235788543 3.78353904003538 A:G G A 10 0.537708471577085 0.10665894054281 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 74527996 C/T 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:C C T 10 0.537708471577085 1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 224 166 390 103.553302366733 89.2596062817961 14.2936960849369 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 0.155068920257881 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 149 124 273 68.8814377350143 66.6758504755585 2.20558725945578 C:G C G 10 0.537708471577085 0.808378743440958 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 75274141 T/G 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000104381:ENST00000521096:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000520797:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000220822:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000434412:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000524366:exon_75274119_75274213:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000522568:exon_75274119_75274213:GDAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 81897200 C/T 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 T:C C T 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000076641:ENST00000220597:exon_81897011_81897612:PAG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 86049709 A/G 1 11 16 27 5.08520681265207 8.60333554523336 -3.5181287325813 A:G A G 10 0.537708471577085 0.182622328871397 ENSG00000133739:ENST00000399341:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000426019:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000360375:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000522567:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000517875:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000522770:exon_86049699_86049862:LRRCC1;ENSG00000133739:ENST00000414626:exon_86049699_86049862:LRRCC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 30 62 92 13.8687458526875 33.3379252377793 -19.4691793850918 A:G G A 10 0.537708471577085 5.66265899053032e-05 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 36 47 83 16.6424950232249 25.272298164123 -8.62980314089806 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0615322885183248 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 87520894 C/A 1 17 15 32 7.85895598318955 8.06562707365627 -0.20667109046672 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87520721_87521009:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87520721_87520910:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87520721_87520904:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87520721_87520913:FAM82B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90785005 C/G 1 13 21 34 6.00978986949789 11.2918779031188 -5.28208803362089 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0847979933287368 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90784895_90785056:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90784895_90785056:RIPK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90802491 A/G 1 111 106 217 51.3143596549436 56.997097987171 -5.68273833222744 A:G A G 10 0.537708471577085 0.454356432355896 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90802307_90803291:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90802307_90802836:RIPK2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 35 33 68 16.180203494802 17.7443795620438 -1.56417606724178 T:C T C 10 0.537708471577085 0.716788283112364 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90965828 T/C 1 58 36 94 26.8129086485291 19.3575049767751 7.45540367175401 T:C T C 10 0.537708471577085 0.147209334072233 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90965472_90965919:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90965472_90965919:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90965472_90965919:NBN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 44 47 91 20.3408272506083 25.272298164123 -4.93147091351474 A:G A G 10 0.537708471577085 0.344131446677122 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 18 22 40 8.32124751161247 11.8295863746959 -3.5083388630834 C:G C G 10 0.537708471577085 0.272050067856685 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 10 5 15 4.62291528422915 2.68854235788543 1.93437292634372 A:G A G 10 0.537708471577085 0.439033451025233 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 95500924 A/G 1 86 81 167 39.7570714443707 43.5543861977439 -3.7973147533732 A:G A G 10 0.537708471577085 0.587232269716547 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95499921_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522196:exon_95500749_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000517624:exon_95500843_95501088:KIAA1429 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 9 15 24 4.16062375580623 8.06562707365627 -3.90500331785004 T:C T C 10 0.537708471577085 0.150595638795879 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 38 44 82 17.5670780800708 23.6591727493917 -6.09209466932097 T:C C T 10 0.537708471577085 0.185165454411338 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 32 16 48 14.7933289095333 8.60333554523336 6.18999336429992 A:C C A 10 0.537708471577085 0.08253675084243 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 4 11 15 1.84916611369166 5.91479318734793 -4.06562707365627 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0400794641262981 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 100865836 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000132549:ENST00000357162:exon_100865679_100866484:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000358544:exon_100865679_100866484:VPS13B;ENSG00000132549:ENST00000395996:exon_100865679_100866484:VPS13B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 1576 1274 2850 728.571448794514 685.040592789206 43.5308560053077 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.102230140774085 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 24 12 36 11.09499668215 6.45250165892502 4.64249502322494 A:G G A 10 0.537708471577085 0.134299102187395 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 42 18 60 19.4162441937624 9.67875248838753 9.7374917053749 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0133740860256258 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 15 4 19 6.93437292634373 2.15083388630834 4.78353904003538 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0363034173949573 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 110302047 T/G 1 17 19 36 7.85895598318955 10.2164609599646 -2.35750497677506 T:G T G 10 0.537708471577085 0.504614496999849 ENSG00000120526:ENST00000239690:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000427660:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000519607:exon_110301980_110302162:NUDCD1;ENSG00000120526:ENST00000521439:exon_110301980_110302162:NUDCD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 117783914 A/C 1 41 59 100 18.9539526653395 31.724799823048 -12.7708471577085 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0119125973009341 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 45 49 94 20.8031187790312 26.3477151072772 -5.54459632824599 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.256981812917587 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 120793296 C/T 1 7 1 8 3.23604069896041 0.537708471577085 2.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0765510092833757 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120793293_120793433:TAF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 121706036 G/C 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 C:G G C 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000172164:ENST00000395601:exon_121705932_121706148:SNTB1;ENSG00000172164:ENST00000517992:exon_121705932_121706148:SNTB1;ENSG00000172164:ENST00000519177:exon_121705932_121706148:SNTB1;ENSG00000172164:ENST00000519298:exon_121705932_121706148:SNTB1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 123964011 G/A 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 A:G G A 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 123965193 C/T 1 12 9 21 5.54749834107498 4.83937624419377 0.708122096881215 T:C C T 10 0.537708471577085 0.829155824341275 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 124031541 T/C 1 36 30 66 16.6424950232249 16.1312541473125 0.511240875912389 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 9 7 16 4.16062375580623 3.76395930103959 0.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 11 5 16 5.08520681265207 2.68854235788543 2.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.317076399536816 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 26 7 33 12.0195797389958 3.76395930103959 8.25562043795619 A:T T A 10 0.537708471577085 0.00451216971409483 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 23 7 30 10.632705153727 3.76395930103959 6.86874585268745 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0158676672410805 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 132982824 A/G 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000132294:ENST00000254624:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000407309:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000377917:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000334503:exon_132982723_132982890:EFR3A;ENSG00000132294:ENST00000519656:exon_132982723_132982890:EFR3A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 20 10 30 9.2458305684583 5.37708471577085 3.86874585268745 A:G A G 10 0.537708471577085 0.199829421182043 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 141525327 A/G 1 34 44 78 15.7179119663791 23.6591727493917 -7.94126078301263 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.0878844752208988 ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 40 32 72 18.4916611369166 17.2066710904667 1.28499004644988 C:G C G 10 0.537708471577085 0.813663843630681 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144550421 C/T 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144550379_144550448:ZC3H3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144641514 G/T 1 51 12 63 23.5768679495687 6.45250165892502 17.1243662906436 T:G G T 10 0.537708471577085 1.06350243859487e-05 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144641502_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000529854:exon_144641502_144641649:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144641502_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144641502_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144641502_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144641502_144642139:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525721:exon_144641505_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144641502_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533888:exon_144641502_144641722:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144640859_144641722:GSDMD HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 8 2 10 3.69833222738332 1.07541694315417 2.62291528422915 A:G G A 10 0.537708471577085 0.119372635940883 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 T:C T C 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 28 28 56 12.9441627958416 15.0558372041584 -2.11167440831676 A:G A G 10 0.537708471577085 0.593964799394802 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:C A C 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144893425 C/T 1 10 9 19 4.62291528422915 4.83937624419377 -0.216460959964616 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893316_144893515:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893316_144893515:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893316_144893515:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893316_144893515:SCRIB HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 18 15 33 8.32124751161247 8.06562707365627 0.255620437956194 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 14 30 44 6.47208139792081 16.1312541473125 -9.65917274939174 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00383481548234684 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 18 13 31 8.32124751161247 6.99021013050211 1.33103738111036 T:C T C 10 0.537708471577085 0.720040722682083 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144992361 T/C 1 5 4 9 2.31145764211457 2.15083388630834 0.160623755806235 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144993377 A/G 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144994094 G/A 1 10 1 11 4.62291528422915 0.537708471577085 4.08520681265206 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0142043908071338 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144994212 A/T 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:T A T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144994916 C/T 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 T:C C T 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144995964 G/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 144996029 A/G 1 5 6 11 2.31145764211457 3.22625082946251 -0.914793187347935 A:G A G 10 0.537708471577085 0.764222193284696 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145001031 T/C 1 2 9 11 0.92458305684583 4.83937624419377 -3.91479318734794 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0295399586643819 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145000952_145001050:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_145000952_145001050:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145001617 G/A 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 A:G G A 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145001578_145001934:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145001578_145001934:PLEC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 36 19 55 16.6424950232249 10.2164609599646 6.42603406326032 A:G A G 10 0.537708471577085 0.103854987830273 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145058539 T/C 1 25 31 56 11.5572882105729 16.6689626188896 -5.11167440831676 T:C T C 10 0.537708471577085 0.181857719384606 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058378_145058599:PARP10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145139049 C/T 1 27 30 57 12.4818712674187 16.1312541473125 -3.64938287989385 T:C C T 10 0.537708471577085 0.354324561498909 ENSG00000197858:ENST00000529503:exon_145139037_145139233:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139037_145139233:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000525087:exon_145139037_145139233:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000532758:exon_145139037_145139177:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530633:exon_145139037_145139233:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139037_145139233:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000524418:exon_145139037_145139242:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000528073:exon_145139014_145139233:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000525308:exon_145139037_145139228:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139031_145139512:GPAA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145139727 C/T 1 32 19 51 14.7933289095333 10.2164609599646 4.57686794956866 T:C C T 10 0.537708471577085 0.209316881598403 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139625_145139752:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139625_145139998:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139625_145140382:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000531593:exon_145139640_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145139696_145139778:GPAA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145139748 C/T 1 26 16 42 12.0195797389958 8.60333554523336 3.41624419376243 T:C C T 10 0.537708471577085 0.353588472379797 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139625_145139752:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139625_145139998:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139625_145140382:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000531593:exon_145139640_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145139696_145139778:GPAA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145140472 A/G 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145140501 A/G 1 68 74 142 31.4358239327582 39.7904268967043 -8.35460296394607 A:G A G 10 0.537708471577085 0.178024404764372 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000534072:exon_145140476_145141087:GPAA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145223288 C/T 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.300207155555316 ENSG00000179832:ENST00000532255:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000525287:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000534366:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000527552:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000528919:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000326134:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000398656:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145223198_145223343:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000420663:exon_145223198_145223343:HEATR7A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145512914 C/T 1 18 25 43 8.32124751161247 13.4427117894271 -5.12146427781466 T:C C T 10 0.537708471577085 0.127617957773552 ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145581387 G/A 1 7 6 13 3.23604069896041 3.22625082946251 0.00978986949789507 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145580468_145581633:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145581288_145581446:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145581288_145581446:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145581288_145582889:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000529279:exon_145581288_145581586:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530687:exon_145581090_145581446:FBXL6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 145736289 G/T 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:G G T 10 0.537708471577085 0.760825645887691 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 146017171 A/G 1 3823 3878 7701 1767.3405131608 2085.23345277594 -317.892939615132 A:T:C:G A G 10 0.537708471577085 4.19149721500825e-13 ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146017158_146017257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146017158_146017344:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000444860:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146017158_146017197:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000525232:exon_146016498_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531767:exon_146016892_146017257:RPL8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 10 8 18 4.62291528422915 4.30166777261668 0.321247511612469 A:G G A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 4 14 18 1.84916611369166 7.52791860207919 -5.67875248838753 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0084453389165878 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 334337 A/G 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 A:G A G 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_334225_334384:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_334225_334384:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 370244 A/G 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_368018_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_370230_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_370230_370300:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 377111 G/C 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 C:G G C 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 T:C C T 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 9 20 29 4.16062375580623 10.7541694315417 -6.59354567573547 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0154193894139613 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 441952 G/A 1 24 40 64 11.09499668215 21.5083388630834 -10.4133421809334 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0116098365649990 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_441875_442009:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 449798 G/A 1 54 61 115 24.9637425348374 32.8002167662022 -7.83647423136478 A:G G A 10 0.537708471577085 0.160555404083085 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 2804393 A/G 1 148 114 262 68.4191462065914 61.2987657597877 7.12038044680373 A:G A G 10 0.537708471577085 0.386367040916803 ENSG00000080608:ENST00000490444:exon_2804257_2804465:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2804164_2804463:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000382032:exon_2804167_2804463:KIAA0020 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 83 74 157 38.3701968591019 39.7904268967043 -1.42023003760234 A:G G A 10 0.537708471577085 0.872890530602957 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 76 57 133 35.1341561601415 30.6493828798938 4.48477328024769 C:G C G 10 0.537708471577085 0.486787730925065 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 75 54 129 34.6718646317186 29.0362574651626 5.63560716655603 A:G A G 10 0.537708471577085 0.332577053346598 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 5335470 C/T 1 2 9 11 0.92458305684583 4.83937624419377 -3.91479318734794 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0295399586643819 ENSG00000107018:ENST00000223862:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000487557:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000223858:exon_5334969_5335597:RLN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 6606645 G/A 1 3 10 13 1.38687458526874 5.37708471577085 -3.99021013050211 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0471169223811368 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 17 0 17 7.85895598318955 0 7.85895598318955 G G 10 0.537708471577085 2.82718696990889e-05 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 78 54 132 36.0587392169874 29.0362574651626 7.02248175182478 A:C C A 10 0.537708471577085 0.22328455386124 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 77 48 125 35.5964476885645 25.8100066357001 9.78644105286437 T:G G T 10 0.537708471577085 0.0881566825186196 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 20413813 G/A 1 16 12 28 7.39666445476664 6.45250165892502 0.94416279584162 A:G G A 10 0.537708471577085 0.850213996975682 ENSG00000171843:ENST00000380338:exon_20413719_20414423:MLLT3;ENSG00000171843:ENST00000475957:exon_20413719_20414423:MLLT3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 18 13 31 8.32124751161247 6.99021013050211 1.33103738111036 A:G G A 10 0.537708471577085 0.720040722682083 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 32431728 A/C 1 3 7 10 1.38687458526874 3.76395930103959 -2.37708471577085 A:C A C 10 0.537708471577085 0.203557386113131 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32431717_32431841:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32431717_32431841:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32431717_32431841:ACO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 7 15 22 3.23604069896041 8.06562707365627 -4.82958637469587 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0524787665296475 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 4 18 22 1.84916611369166 9.67875248838753 -7.82958637469587 T:G T G 10 0.537708471577085 0.000911102879252506 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 32480251 A/T 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 A:T A T 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32480217_32480352:DDX58 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 34 27 61 15.7179119663791 14.5181287325813 1.19978323379781 A:G A G 10 0.537708471577085 0.798316714163481 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 33442952 G/A 1 6 3 9 2.77374917053749 1.61312541473126 1.16062375580623 A:G G A 10 0.537708471577085 0.518915017351894 ENSG00000165272:ENST00000297991:exon_33442850_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000493581:exon_33441154_33443890:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494193:exon_33442883_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000494313:exon_33442850_33443107:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000343952:exon_33442850_33442968:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000463983:exon_33442850_33443456:AQP3;ENSG00000165272:ENST00000473153:exon_33442850_33442968:AQP3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 5 13 18 2.31145764211457 6.99021013050211 -4.67875248838753 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0327312480155932 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 11 12 23 5.08520681265207 6.45250165892502 -1.36729484627296 A:G A G 10 0.537708471577085 0.676984403272827 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 6 6 12 2.77374917053749 3.22625082946251 -0.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 35077267 G/A 1 9 12 21 4.16062375580623 6.45250165892502 -2.29187790311879 A:G G A 10 0.537708471577085 0.383331594644524 ENSG00000221829:ENST00000425676:exon_35077261_35077396:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000378643:exon_35077261_35077396:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000448890:exon_35077262_35077396:FANCG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:G G A 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 15 16 31 6.93437292634373 8.60333554523336 -1.66896261888964 T:C T C 10 0.537708471577085 0.591762951419813 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 35722198 A/C 1 13 14 27 6.00978986949789 7.52791860207919 -1.5181287325813 A:C A C 10 0.537708471577085 0.569107461757469 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35722116_35722220:TLN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 35736099 C/T 1 44 34 78 20.3408272506083 18.2820880336209 2.05873921698737 T:C C T 10 0.537708471577085 0.65185165040436 ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35736045_35736129:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35736045_35736129:CREB3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 35740559 C/T 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 T:C C T 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000070610:ENST00000378103:exon_35740523_35740625:GBA2;ENSG00000070610:ENST00000378094:exon_35740523_35740625:GBA2;ENSG00000070610:ENST00000467252:exon_35740523_35740625:GBA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 36162369 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000122694:ENST00000396613:exon_36162359_36163887:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000377949:exon_36162359_36163887:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000377959:exon_36162359_36162907:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000377960:exon_36162359_36163910:GLIPR2;ENSG00000122694:ENST00000474050:exon_36162359_36163899:GLIPR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 36674842 C/T 1 30 28 58 13.8687458526875 15.0558372041584 -1.18709135147093 T:C C T 10 0.537708471577085 0.793070685678277 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 37126682 G/A 1 64 62 126 29.5866578190666 33.3379252377793 -3.75126741871271 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.532180140443225 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 37304280 T/C 1 31 41 72 14.3310373811104 22.0460473346605 -7.71500995355012 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0761941819143566 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37304185_37304310:ZCCHC7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 37305603 C/A 1 33 25 58 15.2556204379562 13.4427117894271 1.81290864852907 A:C C A 10 0.537708471577085 0.693662251193551 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37305541_37305711:ZCCHC7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 37430575 C/T 1 122 130 252 56.3995664675956 69.902101305021 -13.5025348374254 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.0884856952770751 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37430508_37430643:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37430508_37432011:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37430508_37430643:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37430508_37430643:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37430508_37430643:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37430508_37431097:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37430508_37431148:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37430508_37430643:GRHPR HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 37501728 G/A 1 47 43 90 21.727701835877 23.1214642778147 -1.39376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.832721236071282 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37501710_37501841:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37501710_37501841:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37501710_37501841:POLR1E HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 37531990 G/A 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G G A 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37531912_37532055:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37531906_37532055:FBXO10 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 71549957 A/G 1 20 24 44 9.2458305684583 12.90500331785 -3.65917274939174 A:G A G 10 0.537708471577085 0.292010384577340 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71549806_71549961:PIP5K1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 71835842 C/A 1 8 6 14 3.69833222738332 3.22625082946251 0.47208139792081 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119139:ENST00000423935:exon_71835803_71836012:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71835803_71836412:TJP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 A:G A G 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 71844124 G/A 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:G G A 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71844100_71844166:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71844100_71844166:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71844100_71844166:TJP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 74975136 T/C 1 34 9 43 15.7179119663791 4.83937624419377 10.8785357221853 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00105415519114856 ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 9 13 22 4.16062375580623 6.99021013050211 -2.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.285774100606092 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 7 8 15 3.23604069896041 4.30166777261668 -1.06562707365627 A:C A C 10 0.537708471577085 0.613496791167758 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 9 11 20 4.16062375580623 5.91479318734793 -1.7541694315417 A:G A G 10 0.537708471577085 0.504073984168009 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 80020886 T/C 1 6 4 10 2.77374917053749 2.15083388630834 0.62291528422915 T:C T C 10 0.537708471577085 0.760825645887691 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_80020780_80020903:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_80020780_80020903:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_80020780_80020903:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000484581:exon_80020780_80020903:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000467124:exon_80020884_80020903:VPS13A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 1 11 9 20 5.08520681265207 4.83937624419377 0.2458305684583 C:G G C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 67 56 123 30.9735324043353 30.1116744083168 0.861857996018546 A:C C A 10 0.537708471577085 0.928033783187739 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 93606309 G/A 1 17 23 40 7.85895598318955 12.367294846273 -4.5083388630834 A:G G A 10 0.537708471577085 0.157417098618647 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93606140_93606597:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93606140_93606597:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93606140_93606597:SYK;ENSG00000165025:ENST00000476708:exon_93606140_93606528:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93606140_93606597:SYK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 94830356 C/A 1 4 9 13 1.84916611369166 4.83937624419377 -2.99021013050211 A:C C A 10 0.537708471577085 0.161851616514755 ENSG00000090054:ENST00000262554:exon_94830248_94830380:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000415466:exon_94830248_94830380:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000482632:exon_94830248_94830380:SPTLC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 49 39 88 22.6522848927228 20.9706303915063 1.68165450121652 T:C C T 10 0.537708471577085 0.749325495485465 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 95375468 G/A 1 47 31 78 21.727701835877 16.6689626188896 5.05873921698737 A:G G A 10 0.537708471577085 0.258631808391851 ENSG00000188312:ENST00000375587:exon_95375301_95382815:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000375579:exon_95375301_95377446:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000375576:exon_95375301_95377446:CENPP;ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95375466_95378339:IPPK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 95396712 G/A 1 7 2 9 3.23604069896041 1.07541694315417 2.16062375580624 A:G G A 10 0.537708471577085 0.190853224657027 ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95396668_95396770:IPPK;ENSG00000127080:ENST00000375522:exon_95396668_95396770:IPPK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 5 5 10 2.31145764211457 2.68854235788543 -0.377084715770851 A:C C A 10 0.537708471577085 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 24 35 59 11.09499668215 18.819796505198 -7.72479982304801 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0498862082983297 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 95887320 G/T 1 22 40 62 10.1704136253041 21.5083388630834 -11.3379252377793 T:C:G G T 10 0.537708471577085 0.00473806611893478 ENSG00000131669:ENST00000375446:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000489274:exon_95887181_95888472:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000470314:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000461162:exon_95887181_95887344:NINJ1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 96209943 T/C 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C T C 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 13 12 25 6.00978986949789 6.45250165892502 -0.442711789427126 T:C T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 7 15 22 3.23604069896041 8.06562707365627 -4.82958637469587 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0524787665296475 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 100684719 A/C 1 4 4 8 1.84916611369166 2.15083388630834 -0.30166777261668 A:C A C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100684700_100684754:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100684700_100684772:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100684700_100684750:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100684700_100684769:C9orf156 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 57 80 137 26.3506171201062 43.0166777261668 -16.6660606060607 C:G G C 10 0.537708471577085 0.00460985781215683 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 100862339 C/A 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 A:C C A 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000106785:ENST00000375098:exon_100862213_100862446:TRIM14;ENSG00000106785:ENST00000341469:exon_100862213_100862446:TRIM14;ENSG00000106785:ENST00000342043:exon_100862213_100862446:TRIM14;ENSG00000106785:ENST00000311688:exon_100862213_100862446:TRIM14;ENSG00000106785:ENST00000375084:exon_100862213_100862446:TRIM14;ENSG00000106785:ENST00000375092:exon_100862213_100862446:TRIM14;ENSG00000106785:ENST00000478401:exon_100862213_100862446:TRIM14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 104170350 A/G 1 7 7 14 3.23604069896041 3.76395930103959 -0.52791860207919 A:G A G 10 0.537708471577085 0.795154714708545 ENSG00000136870:ENST00000374861:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000339664:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000259395:exon_104170211_104172942:ZNF189 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 104171523 A/G 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 A:G A G 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000136870:ENST00000374861:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000339664:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000259395:exon_104170211_104172942:ZNF189 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 104171856 C/T 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000136870:ENST00000374861:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000339664:exon_104170211_104172942:ZNF189;ENSG00000136870:ENST00000259395:exon_104170211_104172942:ZNF189 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 17 16 33 7.85895598318955 8.60333554523336 -0.744379562043806 A:G G A 10 0.537708471577085 0.862143293332627 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 15 7 22 6.93437292634373 3.76395930103959 3.17041362530413 A:T A T 10 0.537708471577085 0.203445201635553 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 1 10 11 0.462291528422915 5.37708471577085 -4.91479318734794 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0039294954307517 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 111705122 G/T 1 4 36 40 1.84916611369166 19.3575049767751 -17.5083388630834 T:G G T 10 0.537708471577085 7.85544190920367e-09 ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111704851_111705151:CTNNAL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 112898802 C/T 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 T:C C T 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 5 12 17 2.31145764211457 6.45250165892502 -4.14104401681045 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0522275164214068 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 15 17 32 6.93437292634373 9.14104401681045 -2.20667109046672 A:G A G 10 0.537708471577085 0.48069724681436 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 677 566 1243 312.971364742313 304.34299491263 8.62836982968332 A:C:G A G 10 0.537708471577085 0.628805718571427 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114146832 C/T 1 26 23 49 12.0195797389958 12.367294846273 -0.347715107277166 T:C C T 10 0.537708471577085 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 21 10 31 9.70812209688122 5.37708471577085 4.33103738111036 T:C T C 10 0.537708471577085 0.149280507860683 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114182353 C/T 1 8 4 12 3.69833222738332 2.15083388630834 1.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.404020719410774 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114182297_114182400:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114182297_114182400:KIAA0368 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114184477 C/T 1 14 14 28 6.47208139792081 7.52791860207919 -1.05583720415838 T:C C T 10 0.537708471577085 0.708658888973822 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 11 13 24 5.08520681265207 6.99021013050211 -1.90500331785004 A:G A G 10 0.537708471577085 0.540188574454526 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 95 81 176 43.9176952001769 43.5543861977439 0.363309002433034 T:C:G T C 10 0.537708471577085 1 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 125 67 192 57.7864410528644 36.0264675956647 21.7599734571997 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00178803190059684 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 115950156 G/A 1 2 7 9 0.92458305684583 3.76395930103959 -2.83937624419376 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0908618537959508 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115948716_115950179:FKBP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 3 6 9 1.38687458526874 3.22625082946251 -1.83937624419377 A:C A C 10 0.537708471577085 0.318325439693301 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 11 28 39 5.08520681265207 15.0558372041584 -9.97063039150632 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00187961832419643 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 12 8 20 5.54749834107498 4.30166777261668 1.2458305684583 T:C C T 10 0.537708471577085 0.657591224616801 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 117103838 T/C 1 32 36 68 14.7933289095333 19.3575049767751 -4.56417606724178 T:C T C 10 0.537708471577085 0.276013866977239 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 41 39 80 18.9539526653395 20.9706303915063 -2.0166777261668 A:G A G 10 0.537708471577085 0.65568260224347 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 117113207 G/A 1 5 9 14 2.31145764211457 4.83937624419377 -2.52791860207919 A:G G A 10 0.537708471577085 0.191248020016251 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117113139_117113301:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117113139_117113301:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117113139_117113301:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117113139_117113301:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117113139_117113301:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117113139_117113301:AKNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 21 15 36 9.70812209688122 8.06562707365627 1.64249502322494 T:C C T 10 0.537708471577085 0.619672042871282 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 7 5 12 3.23604069896041 2.68854235788543 0.54749834107498 A:G G A 10 0.537708471577085 0.78200383473076 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 117130776 G/A 1 15 11 26 6.93437292634373 5.91479318734793 1.01957973899579 A:G G A 10 0.537708471577085 0.8445748718871 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117130719_117130875:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117130719_117130875:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117130719_117130875:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117130719_117130875:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117130719_117130875:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117130719_117130875:AKNA HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123169432 C/G 1 15 8 23 6.93437292634373 4.30166777261668 2.63270515372704 C:G C G 10 0.537708471577085 0.302090609922214 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 20 10 30 9.2458305684583 5.37708471577085 3.86874585268745 C:G C G 10 0.537708471577085 0.199829421182043 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123182202 C/T 1 19 12 31 8.78353904003538 6.45250165892502 2.33103738111036 T:C C T 10 0.537708471577085 0.472978196497003 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 A:G A G 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 12 5 17 5.54749834107498 2.68854235788543 2.85895598318955 C:G C G 10 0.537708471577085 0.224354380415310 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123583192 A/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 A:G A G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000095261:ENST00000373920:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123583117_123583257:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123583117_123583257:PSMD5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 63 95 158 29.1243662906436 51.0823047998231 -21.9579385091794 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00056113066918471 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123675895 A/G 1 35 62 97 16.180203494802 33.3379252377793 -17.1577217429772 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.000500233361733687 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123675606_123676016:TRAF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 3 8 11 1.38687458526874 4.30166777261668 -2.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.127220955139885 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 13 5 18 6.00978986949789 2.68854235788543 3.32124751161247 A:T T A 10 0.537708471577085 0.155917874781449 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 124083614 C/T 1 7 3 10 3.23604069896041 1.61312541473126 1.62291528422915 T:C C T 10 0.537708471577085 0.357641264994696 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373807:exon_124083546_124083679:GSN HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 125895238 C/T 1 41 57 98 18.9539526653395 30.6493828798938 -11.6954302145543 T:C:G C T 10 0.537708471577085 0.0196206554928656 ENSG00000165209:ENST00000478973:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000471564:exon_125895124_125895246:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000496533:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125895124_125895247:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125895124_125895247:STRBP HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 126146138 T/C 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C T C 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126145934_126146192:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126145934_126146192:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126145934_126146192:DENND1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 7 9 16 3.23604069896041 4.83937624419377 -1.60333554523336 T:C T C 10 0.537708471577085 0.460459375835936 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 127635986 G/C 1 122 125 247 56.3995664675956 67.2135589471356 -10.81399247954 C:G G C 10 0.537708471577085 0.18022336837766 ENSG00000136950:ENST00000353214:exon_127635971_127636043:ARPC5L;ENSG00000136950:ENST00000259477:exon_127635971_127636043:ARPC5L;ENSG00000136950:ENST00000465124:exon_127634868_127636043:ARPC5L HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 127639149 C/T 1 2 10 12 0.92458305684583 5.37708471577085 -4.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0165438968231611 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 127915872 A/G 1 99 116 215 45.7668613138686 62.3741827029419 -16.6073213890733 A:T:G A G 10 0.537708471577085 0.0240129791003598 ENSG00000119414:ENST00000373547:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000373546:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000415905:exon_127915812_127916021:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000451402:exon_127915812_127916021:PPP6C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 130 141 271 60.097898694979 75.816894492369 -15.71899579739 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0589129036843901 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130206516 C/T 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 4 7 11 1.84916611369166 3.76395930103959 -1.91479318734793 T:C C T 10 0.537708471577085 0.365626586475337 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130230038 C/T 1 8 12 20 3.69833222738332 6.45250165892502 -2.7541694315417 T:C C T 10 0.537708471577085 0.26411215179447 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130230019_130230109:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130230019_130230109:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130230019_130230109:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130230019_130230109:LRSAM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 10 6 16 4.62291528422915 3.22625082946251 1.39666445476664 A:G A G 10 0.537708471577085 0.618398040789407 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130513469 A/G 1 13 22 35 6.00978986949789 11.8295863746959 -5.81979650519798 A:G A G 10 0.537708471577085 0.0611722000368765 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130513451_130513579:SH2D3C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130523904 T/C 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 T:C T C 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130523890_130523931:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130523890_130523929:SH2D3C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 20 24 44 9.2458305684583 12.90500331785 -3.65917274939174 A:G G A 10 0.537708471577085 0.292010384577340 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130825742 C/A 1 6 9 15 2.77374917053749 4.83937624419377 -2.06562707365628 A:C C A 10 0.537708471577085 0.310917325775001 ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000470245:exon_130825653_130826021:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 130884753 C/T 1 28 41 69 12.9441627958416 22.0460473346605 -9.10188453881887 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0298673961377338 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130884641_130884925:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130884725_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130884727_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130884745_130884758:PTGES2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131023505 T/C 1 14 15 29 6.47208139792081 8.06562707365627 -1.59354567573546 T:C T C 10 0.537708471577085 0.580739527465633 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000470630:exon_131023400_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131023471_131023538:GOLGA2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131038643 C/A 1 9 6 15 4.16062375580623 3.22625082946251 0.934372926343725 A:C C A 10 0.537708471577085 0.797075199940825 ENSG00000175854:ENST00000320188:exon_131038425_131038681:C9orf119;ENSG00000175854:ENST00000419867:exon_131038521_131038681:C9orf119;ENSG00000175854:ENST00000418976:exon_131038523_131038681:C9orf119 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131085196 G/A 1 26 25 51 12.0195797389958 13.4427117894271 -1.42313205043134 A:G G A 10 0.537708471577085 0.779160209506102 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131085131_131085207:COQ4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 2 9 11 0.92458305684583 4.83937624419377 -3.91479318734794 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0295399586643819 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 24 12 36 11.09499668215 6.45250165892502 4.64249502322494 T:C C T 10 0.537708471577085 0.134299102187395 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131362361 T/C 1 21 24 45 9.70812209688122 12.90500331785 -3.19688122096882 T:C T C 10 0.537708471577085 0.371512230572139 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131362359_131362394:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131362359_131362394:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131362359_131362394:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131362359_131362394:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131362359_131362394:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000461855:exon_131362243_131362394:SPTAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 39 41 80 18.0293696084937 22.0460473346605 -4.0166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.372305201240989 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 17 23 40 7.85895598318955 12.367294846273 -4.5083388630834 A:T:C C T 10 0.537708471577085 0.157417098618647 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 A:G G A 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132569553 C/T 1 14 8 22 6.47208139792081 4.30166777261668 2.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.398447526729543 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000488169:exon_132569467_132569642:TOR1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132571864 C/T 1 5 3 8 2.31145764211457 1.61312541473126 0.69833222738332 T:C C T 10 0.537708471577085 0.732730565195497 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132571621_132573560:TOR1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132571891 C/G 1 4 5 9 1.84916611369166 2.68854235788543 -0.839376244193765 C:G C G 10 0.537708471577085 0.741316529281598 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132571621_132573560:TOR1B HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 52 22 74 24.0391594779916 11.8295863746959 12.2095731032957 A:G G A 10 0.537708471577085 0.00485800940339537 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 64 39 103 29.5866578190666 20.9706303915063 8.61602742756024 C:G C G 10 0.537708471577085 0.0934532803999583 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 53 46 99 24.5014510064145 24.7345896925459 -0.233138686131415 A:G A G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 34 41 75 15.7179119663791 22.0460473346605 -6.32813536828138 T:C C T 10 0.537708471577085 0.164487767533668 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 80 85 165 36.9833222738332 45.7052200840522 -8.72189781021903 T:C C T 10 0.537708471577085 0.184627607907180 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 3 11 14 1.38687458526874 5.91479318734793 -4.52791860207919 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0280854535870404 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 8 5 13 3.69833222738332 2.68854235788543 1.00978986949789 A:G A G 10 0.537708471577085 0.782308713874905 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 134357947 A/C 1 8 11 19 3.69833222738332 5.91479318734793 -2.21646095996462 A:C A C 10 0.537708471577085 0.361106569444522 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134357758_134357949:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134357761_134357949:BAT2L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135203334 C/A 1 16 19 35 7.39666445476664 10.2164609599646 -2.81979650519798 A:C C A 10 0.537708471577085 0.397623132135994 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 14 23 37 6.47208139792081 12.367294846273 -5.89521344835214 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0684469007033731 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135203530 A/C 1 19 12 31 8.78353904003538 6.45250165892502 2.33103738111036 A:C A C 10 0.537708471577085 0.472978196497003 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135205006 G/C 1 6 8 14 2.77374917053749 4.30166777261668 -1.52791860207919 C:G G C 10 0.537708471577085 0.435038926258256 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135263573 G/T 1 7 12 19 3.23604069896041 6.45250165892502 -3.21646095996462 T:G G T 10 0.537708471577085 0.169053466897696 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135263526_135263615:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135263526_135263615:TTF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135277130 C/A 1 24 29 53 11.09499668215 15.5935456757355 -4.4985489935855 A:C C A 10 0.537708471577085 0.218714913954680 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135470281 C/T 1 24 24 48 11.09499668215 12.90500331785 -1.81000663570008 T:C C T 10 0.537708471577085 0.664865013052188 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135521303 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 135919278 G/T 1 15 20 35 6.93437292634373 10.7541694315417 -3.81979650519798 T:G G T 10 0.537708471577085 0.235619569821158 ENSG00000148308:ENST00000372097:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000440319:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372095:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372089:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372108:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000342018:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000372099:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000439697:exon_135919115_135919313:GTF3C5;ENSG00000148308:ENST00000485692:exon_135919115_135919794:GTF3C5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 136198906 G/A 1 32 41 73 14.7933289095333 22.0460473346605 -7.25271842512721 A:G G A 10 0.537708471577085 0.100213797019117 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 12 24 36 5.54749834107498 12.90500331785 -7.35750497677506 T:G T G 10 0.537708471577085 0.0182001688027913 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 4 11 15 1.84916611369166 5.91479318734793 -4.06562707365627 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0400794641262981 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 138831573 G/A 1 37 29 66 17.1047865516479 15.5935456757355 1.51124087591239 A:G G A 10 0.537708471577085 0.805226567907308 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138831519_138831605:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000489050:exon_138831519_138831605:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000465873:exon_138831519_138831605:UBAC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 138852904 C/G 1 14 13 27 6.47208139792081 6.99021013050211 -0.518128732581295 C:G C G 10 0.537708471577085 0.849567865451932 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138852871_138853226:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138852871_138853058:UBAC1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139272439 C/T 1 11 7 18 5.08520681265207 3.76395930103959 1.32124751161247 T:C C T 10 0.537708471577085 0.639370982964346 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139273402 C/T 1 8 9 17 3.69833222738332 4.83937624419377 -1.14104401681045 T:C C T 10 0.537708471577085 0.632119855136462 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139289277 A/G 1 4 6 10 1.84916611369166 3.22625082946251 -1.37708471577085 A:G A G 10 0.537708471577085 0.528998489783946 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289252_139289330:SNAPC4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139391900 C/T 1 4 8 12 1.84916611369166 4.30166777261668 -2.45250165892502 T:C C T 10 0.537708471577085 0.246025491590504 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 32 41 73 14.7933289095333 22.0460473346605 -7.25271842512721 A:G A G 10 0.537708471577085 0.100213797019117 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139820363 A/G 1 23 22 45 10.632705153727 11.8295863746959 -1.19688122096882 A:G A G 10 0.537708471577085 0.766042798882964 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139975195 C/T 1 7 4 11 3.23604069896041 2.15083388630834 1.08520681265207 T:C C T 10 0.537708471577085 0.561513684127435 ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139975141_139975326:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139975141_139975326:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 139994291 A/G 1 12 15 27 5.54749834107498 8.06562707365627 -2.5181287325813 A:G A G 10 0.537708471577085 0.342041452126621 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139994148_139994333:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139994148_139994333:MAN1B1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 134 139 273 61.9470648086706 74.7414775492148 -12.7944127405442 A:G G A 10 0.537708471577085 0.12912168810476 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 T:C C T 10 0.537708471577085 0.484033748659367 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 17 18 35 7.85895598318955 9.67875248838753 -1.81979650519798 A:G A G 10 0.537708471577085 0.612142448554809 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 25 18 43 11.5572882105729 9.67875248838753 1.87853572218534 T:C T C 10 0.537708471577085 0.647261718349993 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 215944 G/T 1 22 21 43 10.1704136253041 11.2918779031188 -1.12146427781465 T:G G T 10 0.537708471577085 0.761366051085368 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 16 3 19 7.39666445476664 1.61312541473126 5.78353904003538 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0095817644443415 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 295135 G/A 1 3 5 8 1.38687458526874 2.68854235788543 -1.30166777261668 A:G G A 10 0.537708471577085 0.484033748659367 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 15 4 19 6.93437292634373 2.15083388630834 4.78353904003538 A:C:G G A 10 0.537708471577085 0.0363034173949573 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 19 21 40 8.78353904003538 11.2918779031188 -2.5083388630834 C:G G C 10 0.537708471577085 0.433124807120697 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 54 46 100 24.9637425348374 24.7345896925459 0.229152842291498 C:G C G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 32 31 63 14.7933289095333 16.6689626188896 -1.87563370935636 T:C C T 10 0.537708471577085 0.70504292991106 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1584693 G/A 1 12 6 18 5.54749834107498 3.22625082946251 2.32124751161247 A:G G A 10 0.537708471577085 0.347020242134203 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1585079 C/T 1 13 9 22 6.00978986949789 4.83937624419377 1.17041362530413 T:C C T 10 0.537708471577085 0.673622375444433 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 28 32 60 12.9441627958416 17.2066710904667 -4.2625082946251 T:C C T 10 0.537708471577085 0.301000321854184 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 14 21 35 6.47208139792081 11.2918779031188 -4.81979650519797 C:G C G 10 0.537708471577085 0.126525440875721 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 70 63 133 32.3604069896041 33.8756337093564 -1.51522671975231 T:C C T 10 0.537708471577085 0.794910131189468 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 2656258 G/A 1 143 101 244 66.1076885644768 54.3085556292856 11.7991329351913 A:G G A 10 0.537708471577085 0.139757168118185 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 13397003 C/T 0 50 0 50 23.1145764211457 0 23.1145764211457 C C 10 0.537708471577085 6.39070136679061e-14 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 0 103 0 103 47.6160274275602 0 47.6160274275602 C C 10 0.537708471577085 1.85080307891497e-28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 15838366 C/T 1 5 10 15 2.31145764211457 5.37708471577085 -3.06562707365628 T:C C T 10 0.537708471577085 0.126520667746762 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15838330_15838439:ZRSR2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 22 8 30 10.1704136253041 4.30166777261668 5.86874585268745 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0423458221005208 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 23689717 G/A 1 18 73 91 8.32124751161247 39.2527184251272 -30.9314709135147 A:G G A 10 0.537708471577085 4.77749098569401e-11 ENSG00000123131:ENST00000379349:exon_23689646_23689763:PRDX4;ENSG00000123131:ENST00000418872:exon_23689646_23689763:PRDX4;ENSG00000123131:ENST00000379341:exon_23689646_23689763:PRDX4;ENSG00000123131:ENST00000495599:exon_23689646_23689763:PRDX4;ENSG00000123131:ENST00000379331:exon_23689646_23689763:PRDX4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 1 5 77 82 2.31145764211457 41.4035523114355 -39.092094669321 A:G G A 10 0.537708471577085 2.62314652964221e-20 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 23874484 A/C 1 1 27 28 0.462291528422915 14.5181287325813 -14.0558372041584 A:C A C 10 0.537708471577085 1.39177680662497e-08 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23874419_23874499:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23874419_23874499:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23874419_23874499:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23874419_23874499:APOO HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 24075862 A/G 1 75 23 98 34.6718646317186 12.367294846273 22.3045697854457 A:G A G 10 0.537708471577085 3.82122002806138e-06 ENSG00000130741:ENST00000253039:exon_24075750_24075871:EIF2S3;ENSG00000130741:ENST00000423068:exon_24075750_24075871:EIF2S3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 47444985 T/C 1 153 22 175 70.730603848706 11.8295863746959 58.9010174740101 T:C T C 10 0.537708471577085 1.90026241062165e-21 ENSG00000102265:ENST00000218388:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377018:exon_47444335_47445482:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000456754:exon_47444604_47445422:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377017:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000377013:exon_47444942_47445066:TIMP1;ENSG00000102265:ENST00000445623:exon_47444741_47445066:TIMP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 47662972 T/G 0 0 11 11 0 5.91479318734793 -5.91479318734793 G T G 10 0.537708471577085 0.000206098715388653 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 0 17 0 17 7.85895598318955 0 7.85895598318955 A A 10 0.537708471577085 2.82718696990889e-05 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 48418199 C/T 1 4 23 27 1.84916611369166 12.367294846273 -10.5181287325813 T:C C T 10 0.537708471577085 4.8443081648268e-05 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 17 5 22 7.85895598318955 2.68854235788543 5.17041362530413 A:G G A 10 0.537708471577085 0.0316144760056462 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 16 120 136 7.39666445476664 64.5250165892502 -57.1283521344836 A:G A G 10 0.537708471577085 1.05810578129676e-24 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 1 22 11 33 10.1704136253041 5.91479318734793 4.2556204379562 T:C T C 10 0.537708471577085 0.163232134883215 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 1 27 6 33 12.4818712674187 3.22625082946251 9.25562043795619 T:C:G T C 10 0.537708471577085 0.00129433209113691 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 1 1 16 17 0.462291528422915 8.60333554523336 -8.14104401681045 A:G G A 10 0.537708471577085 6.80505856396555e-05 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 69550098 T/C 1 1 7 8 0.462291528422915 3.76395930103959 -3.30166777261668 T:C T C 10 0.537708471577085 0.0284854418445818 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69550007_69550182:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69550007_69550182:KIF4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 69606492 C/T 1 11 2 13 5.08520681265207 1.07541694315417 4.0097898694979 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0272940758141243 ENSG00000090889:ENST00000374388:exon_69606468_69606551:KIF4A;ENSG00000090889:ENST00000374403:exon_69606468_69606551:KIF4A HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 70324157 C/T 1 1 10 11 0.462291528422915 5.37708471577085 -4.91479318734794 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0039294954307517 ENSG00000204165:ENST00000374251:exon_70324148_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000485951:exon_70324088_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000466160:exon_70324148_70324298:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000438526:exon_70324088_70324254:CXorf65 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 70349947 A/C 1 2 8 10 0.92458305684583 4.30166777261668 -3.37708471577085 A:C A C 10 0.537708471577085 0.0521648769451248 ENSG00000184634:ENST00000333646:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374102:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374080:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000430072:exon_70349885_70350064:MED12;ENSG00000184634:ENST00000439750:exon_70349885_70350064:MED12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 1 119 13 132 55.0126918823269 6.99021013050211 48.0224817518248 T:C C T 10 0.537708471577085 1.72632197874734e-19 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 1 2 23 25 0.92458305684583 12.367294846273 -11.4427117894271 T:C C T 10 0.537708471577085 2.01300477493163e-06 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73041771 G/A 1 367 38 405 169.66099093121 20.4329219199292 149.228069011281 A:G G A 10 0.537708471577085 1.48912716105445e-58 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73042607 C/T 1 189 24 213 87.3730988719309 12.90500331785 74.4680955540809 T:C C T 10 0.537708471577085 4.92692363781645e-28 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73045740 A/C 1 5 53 58 2.31145764211457 28.4985489935855 -26.1870913514709 A:C A C 10 0.537708471577085 6.88311019332364e-13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73045807 C/T 1 6 28 34 2.77374917053749 15.0558372041584 -12.2820880336209 T:C C T 10 0.537708471577085 1.91892270366067e-05 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73046038 C/T 1 48 5 53 22.1899933642999 2.68854235788543 19.5014510064145 T:C C T 10 0.537708471577085 1.40282704048871e-08 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73046557 G/T 1 104 20 124 48.0783189559832 10.7541694315417 37.3241495244415 T:C:G G T 10 0.537708471577085 2.72621817184069e-12 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73062694 A/T 1 6 2 8 2.77374917053749 1.07541694315417 1.69833222738332 A:T A T 10 0.537708471577085 0.300207155555316 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 73071996 T/A 1 10 83 93 4.62291528422915 44.6298031408981 -40.0068878566689 A:T T A 10 0.537708471577085 5.07713419002233e-18 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 100265552 T/A 1 2 10 12 0.92458305684583 5.37708471577085 -4.45250165892502 A:T T A 10 0.537708471577085 0.0165438968231611 ENSG00000188917:ENST00000490509:exon_100265374_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372939:exon_100264339_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372935:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000372936:exon_100264531_100265696:TRMT2B;ENSG00000188917:ENST00000338687:exon_100264548_100265696:TRMT2B HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 102884943 C/A 1 15 1 16 6.93437292634373 0.537708471577085 6.39666445476664 A:C:G C A 10 0.537708471577085 0.00080597263281317 ENSG00000172465:ENST00000372626:exon_102884813_102885375:TCEAL1;ENSG00000172465:ENST00000372625:exon_102884813_102885881:TCEAL1;ENSG00000172465:ENST00000469820:exon_102884422_102885145:TCEAL1;ENSG00000172465:ENST00000372624:exon_102884813_102885881:TCEAL1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 106375295 A/G 1 59 2 61 27.275200176952 1.07541694315417 26.1997832337978 A:G A G 10 0.537708471577085 1.01101572019404e-13 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 117788708 C/T 1 2 48 50 0.92458305684583 25.8100066357001 -24.8854235788543 T:C C T 10 0.537708471577085 3.02291960083944e-14 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117788565_117788780:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117788565_117788780:DOCK11 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 119005587 T/C 1 11 83 94 5.08520681265207 44.6298031408981 -39.544596328246 T:C T C 10 0.537708471577085 1.43040897878144e-17 ENSG00000125352:ENST00000371442:exon_119004497_119005791:RNF113A;ENSG00000125356:ENST00000371437:exon_119005450_119005976:NDUFA1 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 1 37 4 41 17.1047865516479 2.15083388630834 14.9539526653395 A:T T A 10 0.537708471577085 7.9853201440626e-07 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 123164851 A/G 1 19 4 23 8.78353904003538 2.15083388630834 6.63270515372704 A:G A G 10 0.537708471577085 0.00570388143924187 ENSG00000101972:ENST00000394477:exon_123164811_123164898:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000218089:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000371166:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000455404:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000434713:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000371160:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000533702:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000435103:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000371157:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000371145:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000530268:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000458176:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000371144:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000354548:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000428941:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000435215:exon_123164811_123164975:STAG2;ENSG00000101972:ENST00000394478:exon_123164811_123164975:STAG2 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 1 23 9 32 10.632705153727 4.83937624419377 5.79332890953328 A:T T A 10 0.537708471577085 0.049987809875724 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 134421270 T/G 0 0 15 15 0 8.06562707365627 -8.06562707365627 G T G 10 0.537708471577085 9.41323768450787e-06 ENSG00000186376:ENST00000370766:exon_134419720_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000439821:exon_134419720_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000370764:exon_134419724_134421778:ZNF75D;ENSG00000186376:ENST00000469456:exon_134420812_134421778:ZNF75D HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 34 9 43 15.7179119663791 4.83937624419377 10.8785357221853 T:C T C 10 0.537708471577085 0.00105415519114856 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 6 5 11 2.77374917053749 2.68854235788543 0.0852068126520646 T:G T G 10 0.537708471577085 1 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 152018832 T/G 1 58 11 69 26.8129086485291 5.91479318734793 20.8981154611811 T:G T G 10 0.537708471577085 1.6582471376241e-07 ENSG00000147383:ENST00000370274:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000440023:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000432467:exon_152018809_152018967:NSDHL HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 152721198 A/G 1 4 41 45 1.84916611369166 22.0460473346605 -20.1968812209688 A:G A G 10 0.537708471577085 2.76985820133473e-10 ENSG00000183479:ENST00000330912:exon_152721000_152721224:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000338525:exon_152721000_152721224:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000334497:exon_152721000_152721224:TREX2;ENSG00000213397:ENST00000370211:exon_152721000_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000370212:exon_152721000_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000474022:exon_152721000_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000435662:exon_152721000_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000484394:exon_152719852_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000491286:exon_152721000_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000421080:exon_152721000_152721224:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000370219:exon_152721000_152721224:HAUS7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 152735959 C/T 1 15 1 16 6.93437292634373 0.537708471577085 6.39666445476664 T:C C T 10 0.537708471577085 0.00080597263281317 ENSG00000183479:ENST00000330912:exon_152735908_152736045:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000338525:exon_152735908_152736045:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000334497:exon_152735908_152736045:TREX2;ENSG00000183479:ENST00000370232:exon_152735908_152736045:TREX2;ENSG00000213397:ENST00000370211:exon_152735908_152736089:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000370212:exon_152735908_152736089:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000421080:exon_152735908_152736603:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000370219:exon_152735908_152736603:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000490165:exon_152735908_152736011:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000453918:exon_152735908_152736020:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000490453:exon_152735908_152736023:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000464993:exon_152735908_152736013:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000492596:exon_152735908_152736028:HAUS7;ENSG00000213397:ENST00000370210:exon_152735908_152736603:HAUS7 HGDP01274_parsed_pileup.txt . X 153640406 C/T 1 10 2 12 4.62291528422915 1.07541694315417 3.54749834107498 T:C C T 10 0.537708471577085 0.0450438793507606 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153640228_153640427:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153640228_153640427:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153640228_153640449:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000451865:exon_153640228_153640420:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000424626:exon_153640228_153640428:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000432135:exon_153640228_153640426:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000488225:exon_153640228_153640417:DNASE1L1