INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 38 65 103 18.0498442961308 34.1252663355657 -16.0754220394348 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00154588864713849 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 900427 G/A 1 12 3 15 5.69995083035711 1.57501229241072 4.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0385064590919159 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 948921 T/C 1 2357 1932 4289 1119.56534226264 1014.30791631251 105.257425950136 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00132216699674014 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 2793 2699 5492 1326.66355576562 1416.98605907218 -90.3225033065637 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0150125819428742 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 982994 T/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000478677:exon_982855_983067:AGRN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 985900 C/T 1 10 14 24 4.74995902529759 7.35005736458337 -2.60009833928578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.312688523843871 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985807_985971:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985807_985971:AGRN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 986737 T/C 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 T:C T C 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_986633_986749:AGRN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1247979 C/T 1 136 117 253 64.5994427440472 61.4254794040182 3.17396334002903 T:C C T 10 0.525004097470241 0.706011657726386 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000497304:exon_1247606_1248081:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247973_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000461514:exon_1247640_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525164:exon_1247973_1248504:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1247973_1248080:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525769:exon_1247973_1248329:CPSF3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1421531 C/A 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:C C A 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1425700 T/C 1 17 21 38 8.0749303430059 11.0250860468751 -2.95015570386916 T:C T C 10 0.525004097470241 0.417117826524397 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1425634_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1425637_1425804:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1424584_1426051:ATAD3B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1430985 C/T 1 41 34 75 19.4748320037201 17.8501393139882 1.62469268973192 T:C C T 10 0.525004097470241 0.730065242664392 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 109 103 212 51.7745533757437 54.0754220394348 -2.3008686636911 A:G A G 10 0.525004097470241 0.78340336188661 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1562548 A/G 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 A:G A G 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 13 15 28 6.17494673288687 7.87506146205362 -1.70011472916675 T:C C T 10 0.525004097470241 0.573165273231675 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 67 28 95 31.8247254694939 14.7001147291667 17.1246107403271 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000428399307178663 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 30 20 50 14.2498770758928 10.5000819494048 3.74979512648795 T:C C T 10 0.525004097470241 0.322999631243944 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 T:C T C 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 2444414 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2444327_2444478:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000471361:exon_2444327_2444452:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000487804:exon_2443845_2444478:PANK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 33 46 79 15.674864783482 24.1501884836311 -8.47532370014904 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0708079862798463 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 3548136 T/C 1 22 14 36 10.4499098556547 7.35005736458337 3.09985249107132 T:C T C 10 0.525004097470241 0.321383593781034 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548030_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548030_3548221:WDR8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 23 33 56 10.9249057581845 17.325135216518 -6.4002294583335 A:G A G 10 0.525004097470241 0.107647319921173 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 52 56 108 24.6997869315475 29.4002294583335 -4.70044252678603 A:G G A 10 0.525004097470241 0.386665602390268 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 C:G G C 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 12 4 16 5.69995083035711 2.10001638988096 3.59993444047614 A:C C A 10 0.525004097470241 0.08265372637292 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 13 3 16 6.17494673288687 1.57501229241072 4.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0237907033315813 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 9129620 C/T 1 20 15 35 9.49991805059518 7.87506146205362 1.62485658854157 T:C C T 10 0.525004097470241 0.615470018039268 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9129563_9129775:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000456780:exon_9129563_9129887:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9129563_9129663:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000473209:exon_9129563_9129653:SLC2A5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 18 8 26 8.54992624553566 4.20003277976193 4.34989346577373 T:C T C 10 0.525004097470241 0.115163241075540 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 8 13 21 3.79996722023807 6.82505326711313 -3.02508604687506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.197762713297050 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 12082926 A/G 1 23 28 51 10.9249057581845 14.7001147291667 -3.77520897098229 A:G A G 10 0.525004097470241 0.327239411413660 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082890_12082974:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12082921_12082974:MIIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 19201956 A/G 0 8 0 8 3.79996722023807 0 3.79996722023807 A A 10 0.525004097470241 0.00836297791075555 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19201876_19201997:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19201876_19201997:ALDH4A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 101 79 180 47.9745861555057 41.475323700149 6.49926245535661 A:G A G 10 0.525004097470241 0.370539382693460 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 39 28 67 18.5248401986606 14.7001147291667 3.82472546949385 A:T T A 10 0.525004097470241 0.392551247474431 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 38 44 82 18.0498442961308 23.1001802886906 -5.05033599255976 T:C C T 10 0.525004097470241 0.270956680881888 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 19652063 G/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19651989_19652076:PQLC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 20977221 A/T 1 11 19 30 5.22495492782735 9.97507785193458 -4.75012292410723 A:T A T 10 0.525004097470241 0.0996988732909661 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 553 544 1097 262.672734098957 285.602229023811 -22.9294949248544 T:C T C 10 0.525004097470241 0.173691656574249 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 90 86 176 42.7496312276783 45.1503523824407 -2.40072115476242 A:G G A 10 0.525004097470241 0.762850123754289 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 21267993 G/C 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 C:G G C 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000356916:exon_21267984_21268823:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374927:exon_21267984_21268823:EIF4G3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 23419855 T/C 1 25 24 49 11.874897563244 12.6000983392858 -0.72520077604181 T:C T C 10 0.525004097470241 0.886736941622127 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 23885480 A/C 1 16 12 28 7.59993444047614 6.30004916964289 1.29988527083325 A:C A C 10 0.525004097470241 0.706845049695895 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24077554 T/C 1 31 14 45 14.7248729784225 7.35005736458337 7.37481561383915 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0355661418256007 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24078234 T/C 1 58 65 123 27.549762346726 34.1252663355657 -6.57550398883965 T:C T C 10 0.525004097470241 0.241711403296053 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 69 79 148 32.7747172745534 41.475323700149 -8.70060642559567 T:C C T 10 0.525004097470241 0.162022620216436 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 24 24 48 11.3999016607142 12.6000983392858 -1.20019667857157 T:C T C 10 0.525004097470241 0.773601261802514 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 0 13 0 13 6.17494673288687 0 6.17494673288687 T T 10 0.525004097470241 0.000292861937361077 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 13 1 14 6.17494673288687 0.525004097470241 5.64994263541663 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00214200239684583 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201002 G/C 1 12 2 14 5.69995083035711 1.05000819494048 4.64994263541663 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0144533226354855 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G G A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 21 14 35 9.97491395312494 7.35005736458337 2.62485658854156 A:T:G A T 10 0.525004097470241 0.401942910298358 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 25558970 T/C 1 52 45 97 24.6997869315475 23.6251843861608 1.07460254538662 T:C T C 10 0.525004097470241 0.839672929954413 ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25558935_25558984:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25558935_25558977:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000476231:exon_25558935_25558993:SYF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 25570081 T/C 1 98 81 179 46.5495984479164 42.5253318950895 4.02426655282686 T:C T C 10 0.525004097470241 0.550597527133282 ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25570041_25570124:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25570041_25570715:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25570041_25570124:C1orf63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 26496651 T/C 1 194 220 414 92.1492050907732 115.500901443453 -23.3516963526798 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0235004052749884 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26496362_26496674:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496433_26496674:ZNF593 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 19 24 43 9.02492214806542 12.6000983392858 -3.57517619122036 T:C C T 10 0.525004097470241 0.288768991270959 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 26 31 57 12.3498934657737 16.2751270215775 -3.92523355580374 T:C T C 10 0.525004097470241 0.353394461675554 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 26900708 G/A 1 60 71 131 28.4997541517855 37.2752909203871 -8.77553676860158 A:G G A 10 0.525004097470241 0.136953454759854 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 73 67 140 34.6747008846724 35.1752745305062 -0.500573645833747 C:G C G 10 0.525004097470241 0.932817588041548 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27180246 C/T 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000204160:ENST00000374142:exon_27180217_27182207:ZDHHC18;ENSG00000204160:ENST00000374141:exon_27180217_27180454:ZDHHC18;ENSG00000204160:ENST00000488397:exon_27180217_27180316:ZDHHC18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27210721 T/C 1 43 50 93 20.4248238087796 26.2502048735121 -5.82538106473242 T:C T C 10 0.525004097470241 0.253555922088373 ENSG00000142751:ENST00000374135:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374133:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374131:exon_27210651_27210781:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000477418:exon_27210651_27210781:GPN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27223792 C/T 1 19 12 31 9.02492214806542 6.30004916964289 2.72487297842253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.371508072375509 ENSG00000198746:ENST00000361720:exon_27223792_27224216:GPATCH3;ENSG00000198746:ENST00000374122:exon_27223792_27224216:GPATCH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27674366 G/T 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:G G T 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27674299_27674371:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27674299_27674371:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27674299_27674371:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27674299_27674371:SYTL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 19 22 41 9.02492214806542 11.5500901443453 -2.52516799627988 A:G G A 10 0.525004097470241 0.439272768938261 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27677409 G/A 1 29 33 62 13.774881173363 17.325135216518 -3.55025404315494 A:G G A 10 0.525004097470241 0.376398081775706 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27677285_27677443:SYTL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 52 56 108 24.6997869315475 29.4002294583335 -4.70044252678603 A:G G A 10 0.525004097470241 0.386665602390268 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 30 43 73 14.2498770758928 22.5751761912204 -8.3252991153276 A:G A G 10 0.525004097470241 0.060270252126029 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 28806965 G/C 1 7 1 8 3.32497131770831 0.525004097470241 2.79996722023807 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0730511813390402 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28806963_28807116:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28806963_28807116:PHACTR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 A:G G A 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 31896681 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31896540_31896701:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31896540_31896701:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31896540_31896701:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31896540_31896701:SERINC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 32849533 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000160058:ENST00000455895:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000413080:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000444377:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000341071:exon_32849431_32849649:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000441541:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000325745:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000446293:exon_32849431_32849649:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000373520:exon_32849431_32849540:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000449308:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000527163:exon_32849431_32849540:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000530485:exon_32849431_32849598:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000530876:exon_32849498_32849598:BSDC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 33116103 C/A 1 86 85 171 40.8496476175593 44.6253482849705 -3.77570066741121 A:C C A 10 0.525004097470241 0.592280744659542 ENSG00000176261:ENST00000341885:exon_33116034_33116533:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33116034_33116185:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000492007:exon_33116034_33116150:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33116030_33116155:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33116034_33116136:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33116034_33116126:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33116034_33116161:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33116034_33116161:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33116030_33116151:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33116003_33116126:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33116034_33116136:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33116034_33116504:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000466361:exon_33116034_33116136:ZBTB8OS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 33138116 C/G 1 145 17 162 68.8744058668151 8.9250696569941 59.949336209821 C:G C G 10 0.525004097470241 6.60363351634753e-24 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33138051_33138127:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33138051_33138127:RBBP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 33502376 G/A 0 85 0 85 40.3746517150295 0 40.3746517150295 G G 10 0.525004097470241 3.10714843232340e-24 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33502337_33502471:AK2;ENSG00000004455:ENST00000467905:exon_33502337_33502487:AK2;ENSG00000004455:ENST00000354858:exon_33502337_33502593:AK2;ENSG00000004455:ENST00000480134:exon_33502337_33502478:AK2;ENSG00000004455:ENST00000398192:exon_33502337_33502467:AK2;ENSG00000004455:ENST00000487289:exon_33502337_33502445:AK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 35320690 T/G 1 102 118 220 48.4495820580354 61.9504835014884 -13.500901443453 T:G T G 10 0.525004097470241 0.0790008989441275 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 36230196 C/T 1 33 34 67 15.674864783482 17.8501393139882 -2.17527453050615 T:C C T 10 0.525004097470241 0.625901631429529 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36229867_36230315:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36229867_36230315:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36229867_36230315:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36229867_36230315:CLSPN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 43 49 92 20.4248238087796 25.7252007760418 -5.30037696726217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.296857301984470 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 36645634 C/T 1 155 146 301 73.6243648921126 76.6505982306552 -3.02623333854255 T:C C T 10 0.525004097470241 0.72955425998707 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36645475_36645668:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36645475_36645668:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36645475_36645668:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373153:exon_36645475_36645668:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36645475_36645668:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36645475_36645668:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487114:exon_36645475_36645668:MAP7D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 38148765 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000116922:ENST00000358011:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000494120:exon_38147242_38148832:C1orf109;ENSG00000116922:ENST00000464178:exon_38148408_38148832:C1orf109 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 38464670 C/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000483132:exon_38464390_38464820:FHL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 C:G G C 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 40961449 T/C 1 14 19 33 6.64994263541663 9.97507785193458 -3.32513521651795 T:C T C 10 0.525004097470241 0.296317161691652 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 15 13 28 7.12493853794638 6.82505326711313 0.299885270833252 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 40981230 G/A 1 28 23 51 13.2998852708333 12.0750942418155 1.22479102901771 A:G G A 10 0.525004097470241 0.780244102616645 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 42657196 T/G 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:G T G 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000198815:ENST00000372573:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372572:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361346:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361776:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000445886:exon_42657077_42657390:FOXJ3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 43632536 C/T 1 393 373 766 186.673389694195 195.8265283564 -9.15313866220461 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.515071846939552 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 43636484 C/G 1 133 148 281 63.1744550364579 77.7006064255957 -14.5261513891377 T:C:G C G 10 0.525004097470241 0.0835549594879555 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43636427_43636550:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43636427_43636792:EBNA1BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 43825644 T/C 1 44 24 68 20.8998197113094 12.6000983392858 8.29972137202361 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0515028352558192 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43825640_43825768:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000478882:exon_43825438_43825768:CDC20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 43917637 G/A 1 24 26 50 11.3999016607142 13.6501065342263 -2.25020487351205 A:G G A 10 0.525004097470241 0.572360723487627 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000372433:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000487366:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372432:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372427:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43917606_43917684:HYI;ENSG00000178922:ENST00000496142:exon_43917606_43917890:HYI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 44684736 G/A 1 88 62 150 41.7996394226188 32.5502540431549 9.24938537946385 A:G G A 10 0.525004097470241 0.141240097301665 ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44684728_44684786:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000488433:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000483741:exon_44684728_44684913:DMAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45140038 G/A 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000126106:ENST00000372243:exon_45140003_45140134:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372244:exon_45140003_45140149:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372242:exon_45140003_45140131:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000495630:exon_45140003_45140138:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372237:exon_45140003_45140227:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000476724:exon_45140003_45140114:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000468117:exon_45140003_45140149:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372235:exon_45140003_45140115:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000420706:exon_45140003_45140074:TMEM53 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 11 11 22 5.22495492782735 5.77504507217265 -0.550090144345303 A:T A T 10 0.525004097470241 0.834225569957072 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 51 53 104 24.2247910290177 27.8252171659228 -3.60042613690506 A:C A C 10 0.525004097470241 0.493287620415974 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 66 58 124 31.3497295669641 30.450237653274 0.899491913690113 A:G G A 10 0.525004097470241 0.928420449686534 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 15 22 37 7.12493853794638 11.5500901443453 -4.42515160639892 A:G G A 10 0.525004097470241 0.187269652464798 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 45469161 G/A 1 15 25 40 7.12493853794638 13.125102436756 -6.00016389880964 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0802963674302318 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 46500613 T/C 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 T:C T C 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 46655158 T/C 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46655130_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46655156_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46655130_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000475642:exon_46655130_46655239:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46655156_46655239:POMGNT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 15 9 24 7.12493853794638 4.72503687723217 2.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.414804146453808 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 39 14 53 18.5248401986606 7.35005736458337 11.1747828340772 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00222740715528501 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 91 58 149 43.2246271302081 30.450237653274 12.7743894769341 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0400651033934745 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 52264064 A/G 1 114 119 233 54.1495328883925 62.4754875989587 -8.32595471056616 A:G A G 10 0.525004097470241 0.294029583305383 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52263921_52264083:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52263921_52264083:NRD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 52266350 C/T 1 93 83 176 44.1746189352676 43.57534009003 0.599278845237585 T:C C T 10 0.525004097470241 0.939990514530431 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 118 144 262 56.0495164985116 75.6005900357147 -19.5510735372031 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0158634892973368 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:T T A 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 8 14 22 3.79996722023807 7.35005736458337 -3.5500901443453 A:G A G 10 0.525004097470241 0.140344488198196 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 11 3 14 5.22495492782735 1.57501229241072 3.64994263541663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0616618009545916 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 62456014 G/A 0 0 8 8 0 4.20003277976193 -4.20003277976193 A G A 10 0.525004097470241 0.00259130722660422 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 62579823 G/A 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 63881552 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000088035:ENST00000371108:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000431147:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000405765:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000263440:exon_63881544_63881628:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000465969:exon_63881544_63881628:ALG6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 34 21 55 16.1498606860118 11.0250860468751 5.12477463913674 T:C C T 10 0.525004097470241 0.178796877162726 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 64100654 A/G 1 35 43 78 16.6248565885416 22.5751761912204 -5.9503196026788 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.212118712824915 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64100500_64100690:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64100500_64100690:PGM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 66 35 101 31.3497295669641 18.3751434114584 12.9745861555057 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00959526406203165 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 75190452 C/T 1 32 19 51 15.1998688809523 9.97507785193458 5.22479102901771 T:C C T 10 0.525004097470241 0.161577290059920 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 44 37 81 20.8998197113094 19.4251516063989 1.47466810491048 A:G A G 10 0.525004097470241 0.82410559093814 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 76205685 T/G 1 54 53 107 25.649778736607 27.8252171659228 -2.17543842931579 T:C:G T G 10 0.525004097470241 0.699296371549577 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000532509:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000530953:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000534334:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526930:exon_76205665_76205795:ACADM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 130 139 269 61.7494673288687 72.9755695483635 -11.2261022194948 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.179373839422268 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 19 15 34 9.02492214806542 7.87506146205362 1.14986068601181 C:G G C 10 0.525004097470241 0.7339423545076 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 A:G A G 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 84961108 G/A 1 80 80 160 37.9996722023807 42.0003277976193 -4.00065559523856 A:G G A 10 0.525004097470241 0.527877248167654 ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 85016112 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 14 15 29 6.64994263541663 7.87506146205362 -1.22511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 0.711888598190345 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 85113229 A/G 1 9 15 24 4.27496312276783 7.87506146205362 -3.60009833928578 A:G A G 10 0.525004097470241 0.156343128579509 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 86173943 C/T 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117174:ENST00000370574:exon_86173312_86174101:ZNHIT6;ENSG00000117174:ENST00000431532:exon_86173737_86173967:ZNHIT6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 48 29 77 22.7998033214284 15.225118826637 7.57468449479144 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0878145942841503 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 18 4 22 8.54992624553566 2.10001638988096 6.4499098556547 C:G G C 10 0.525004097470241 0.00873721085378874 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 89524618 C/T 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89524524_89524726:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000459831:exon_89524024_89524726:GBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 89732237 G/A 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 38 34 72 18.0498442961308 17.8501393139882 0.199704982142649 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 38 35 73 18.0498442961308 18.3751434114584 -0.325299115327592 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 93744055 G/A 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 A:G G A 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 111 98 209 52.7245451808032 51.4504015520836 1.27414362871963 A:G A G 10 0.525004097470241 0.88994092047926 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 168 154 322 79.7993116249995 80.8506310104171 -1.05131938541761 A:C:G C A 10 0.525004097470241 0.911265464122195 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 94343023 A/G 1 73 94 167 34.6747008846724 49.3503851622027 -14.6756842775303 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0245554567275104 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 25 21 46 11.874897563244 11.0250860468751 0.849811516368913 T:C C T 10 0.525004097470241 0.883001834376828 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 94930345 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94930331_94930429:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94930331_94930429:ABCD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 94941244 T/C 1 24 20 44 11.3999016607142 10.5000819494048 0.899819711309396 T:C T C 10 0.525004097470241 0.88032868218007 ENSG00000117528:ENST00000454898:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000394233:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000370214:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94941170_94941293:ABCD3;ENSG00000117528:ENST00000468860:exon_94941170_94941250:ABCD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 T:G G T 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 14 20 34 6.64994263541663 10.5000819494048 -3.85013931398819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.22939073204673 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 28 16 44 13.2998852708333 8.40006555952386 4.89981971130939 T:C C T 10 0.525004097470241 0.173856624475153 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 110596569 G/A 1 34 39 73 16.1498606860118 20.4751598013394 -4.32529911532759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.348895203246714 ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110596287_110597261:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110596287_110597263:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110596287_110597263:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000473429:exon_110596287_110597424:FAM40A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:T A T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 111494194 C/T 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000121931:ENST00000369763:exon_111493910_111495437:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000443367:exon_111493910_111495437:C1orf103 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 111730901 C/T 1 27 44 71 12.8248893683035 23.1001802886906 -10.2752909203871 T:C C T 10 0.525004097470241 0.017047870117752 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 111737183 C/T 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.349883865038242 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 C:G C G 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 24 20 44 11.3999016607142 10.5000819494048 0.899819711309396 A:G A G 10 0.525004097470241 0.88032868218007 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 115260738 G/C 1 603 575 1178 286.422529225445 301.877356045389 -15.4548268199439 T:C:G G C 10 0.525004097470241 0.381489622136163 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115259534_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115259537_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115259916_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115259926_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115259933_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000483407:exon_115260423_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115260578_115260837:CSDE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 116937809 A/G 1 35 79 114 16.6248565885416 41.475323700149 -24.8504671116075 A:G A G 10 0.525004097470241 3.17333996171828e-06 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116937732_116937907:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116937732_116937907:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116937732_116937907:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116937732_116937907:ATP1A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 A:G A G 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 T:C C T 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 118165973 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000183508:ENST00000369448:exon_118165464_118170994:FAM46C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 118491102 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 19 14 33 9.02492214806542 7.35005736458337 1.67486478348205 T:G T G 10 0.525004097470241 0.604377533937855 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 144906508 C/T 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:C C T 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144906421_144906537:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144906421_144906537:PDE4DIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 18 0 18 8.54992624553566 0 8.54992624553566 C C 10 0.525004097470241 1.06968307334339e-05 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 144916676 C/T 0 16 0 16 7.59993444047614 0 7.59993444047614 C C 10 0.525004097470241 4.00270556289432e-05 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 13 0 13 6.17494673288687 0 6.17494673288687 C C 10 0.525004097470241 0.000292861937361077 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 A A 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 1 31 23 54 14.7248729784225 12.0750942418155 2.64977873660698 A:G G A 10 0.525004097470241 0.498256691713121 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 63 63 0 33.0752581406252 -33.0752581406252 A:C T C 10 0.525004097470241 4.28017362299378e-21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 46 46 0 24.1501884836311 -24.1501884836311 T G T 10 0.525004097470241 1.34194189188038e-15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 50 50 0 26.2502048735121 -26.2502048735121 A C A 10 0.525004097470241 6.83113964931606e-17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 123 0 123 58.4244960111604 0 58.4244960111604 G G 10 0.525004097470241 3.96102064534378e-35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 89 89 0 46.7253646748514 -46.7253646748514 C T C 10 0.525004097470241 1.68034257557366e-29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 3 120 123 1.42498770758928 63.0004916964289 -61.5755039888396 T:C C T 10 0.525004097470241 1.09460901804488e-34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 149916185 C/A 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:C C A 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 150129593 G/A 1 225 212 437 106.874078069196 111.300868663691 -4.42679059449532 A:G G A 10 0.525004097470241 0.701641761151663 ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 150130983 G/T 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.293975731308556 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 150131342 G/A 1 354 319 673 168.148549495535 167.476307093007 0.672242402527786 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.96922809226375 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 150199123 G/T 1 111 97 208 52.7245451808032 50.9253974546134 1.79914772618987 T:G G T 10 0.525004097470241 0.835157261355307 ENSG00000143401:ENST00000314136:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369116:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000421169:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369119:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000436748:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000369115:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000533654:exon_150198940_150199127:ANP32E;ENSG00000143401:ENST00000534220:exon_150198940_150199127:ANP32E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 46 33 79 21.8498115163689 17.325135216518 4.52467629985096 C:G G C 10 0.525004097470241 0.313603652429152 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 76 88 164 36.0996885922617 46.2003605773812 -10.1006719851195 T:C C T 10 0.525004097470241 0.118318053954215 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 155289545 T/G 1 4 21 25 1.89998361011904 11.0250860468751 -9.12510243675603 T:G T G 10 0.525004097470241 0.000212143269387047 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 155735012 T/C 1 21 18 39 9.97491395312494 9.45007375446434 0.5248401986606 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156025096 C/T 1 196 216 412 93.0991968958328 113.400885053572 -20.3016881577393 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0483949651551871 ENSG00000116586:ENST00000368305:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368304:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000489664:exon_156025054_156025784:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000368302:exon_156025054_156025216:ROBLD3;ENSG00000116586:ENST00000487106:exon_156024876_156025216:ROBLD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156107534 C/T 1 59 91 150 28.0247582492558 47.7753728697919 -19.7506146205362 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00137052107172102 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156107499_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156107445_156107555:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156107445_156107534:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156107445_156107656:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156107445_156108548:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156107445_156107952:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000506981:exon_156107253_156107534:LMNA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 18 26 44 8.54992624553566 13.6501065342263 -5.1001802886906 T:C C T 10 0.525004097470241 0.132984035701500 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 110 109 219 52.2495492782735 57.2254466242563 -4.97589734598278 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.542669859343629 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 150 85 235 71.2493853794638 44.6253482849705 26.6240370944934 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000515208197271768 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156233189 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156233186_156233361:SMG5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C T C 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 16 20 36 7.59993444047614 10.5000819494048 -2.90014750892868 A:G G A 10 0.525004097470241 0.404596615121924 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 156737969 C/T 1 14 14 28 6.64994263541663 7.35005736458337 -0.700114729166749 T:C C T 10 0.525004097470241 0.851142914584854 ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156737274_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156737292_156738031:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156737346_156738031:PRCC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 20 24 44 9.49991805059518 12.6000983392858 -3.1001802886906 T:C C T 10 0.525004097470241 0.36844363520959 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 157509025 C/T 1 7 13 20 3.32497131770831 6.82505326711313 -3.50008194940482 T:C C T 10 0.525004097470241 0.123961209300371 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 8 12 20 3.79996722023807 6.30004916964289 -2.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.273669762374101 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 160648875 C/T 1 3510 2636 6146 1667.23561787945 1383.91080093156 283.324816947899 A:T:C:G C T 10 0.525004097470241 4.27850225848422e-13 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160648536_160648921:CD48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 13 13 26 6.17494673288687 6.82505326711313 -0.650106534226266 A:G A G 10 0.525004097470241 0.84603224725779 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 23 9 32 10.9249057581845 4.72503687723217 6.19986888095229 A:G A G 10 0.525004097470241 0.032938493383476 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 184 144 328 87.3992460654757 75.6005900357147 11.7986560297609 T:C C T 10 0.525004097470241 0.203585115191105 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 161182208 C/G 1 171 143 314 81.2242993325888 75.0755859382445 6.14871339434433 A:C:G C G 10 0.525004097470241 0.498182691883296 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000480762:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161182141_161182270:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161182141_161182270:NDUFS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 120 62 182 56.9995083035711 32.5502540431549 24.4492542604161 A:G A G 10 0.525004097470241 0.000263494550208109 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 274 284 558 130.148877293154 149.101163681548 -18.9522863883945 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.116733745030107 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:T A T 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C C T 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 166826894 C/T 1 17 11 28 8.0749303430059 5.77504507217265 2.29988527083325 T:C C T 10 0.525004097470241 0.451315745002794 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 103 89 192 48.9245779605652 46.7253646748514 2.19921328571372 A:G G A 10 0.525004097470241 0.77288416759849 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 28 32 60 13.2998852708333 16.8001311190477 -3.50024584821446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.369370045464667 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 168013850 T/C 1 44 36 80 20.8998197113094 18.9001475089287 1.99967220238072 T:C T C 10 0.525004097470241 0.737238736176166 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 169293721 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000143156:ENST00000367811:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000525440:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000528517:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000524967:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000485609:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000491225:exon_169293631_169293738:NME7;ENSG00000143156:ENST00000527460:exon_169293631_169293738:NME7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 169676486 A/G 1 58 34 92 27.549762346726 17.8501393139882 9.69962303273783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0471464361142404 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169676483_169676590:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169676483_169676590:SELL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 23 25 48 10.9249057581845 13.125102436756 -2.20019667857157 T:G T G 10 0.525004097470241 0.564916502546702 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 169821979 A/C 1 42 38 80 19.9498279062499 19.9501557038692 -0.000327797619281256 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169821931_169822226:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169821931_169822229:C1orf112;ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169821804_169822913:SCYL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 169823660 C/T 1 17 8 25 8.0749303430059 4.20003277976193 3.87489756324397 T:C C T 10 0.525004097470241 0.160269496067833 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 170521376 G/A 1 14 20 34 6.64994263541663 10.5000819494048 -3.85013931398819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.22939073204673 ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 93 74 167 44.1746189352676 38.8503032127978 5.32431572246976 A:C A C 10 0.525004097470241 0.438763192172528 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 95 56 151 45.1246107403271 29.4002294583335 15.7243812819936 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0113589015633447 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 171751097 G/T 1 18 11 29 8.54992624553566 5.77504507217265 2.77488117336301 T:G G T 10 0.525004097470241 0.354749309262073 ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 13 20 33 6.17494673288687 10.5000819494048 -4.32513521651795 A:G A G 10 0.525004097470241 0.162915745529303 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 59 44 103 28.0247582492558 23.1001802886906 4.92457796056517 A:G G A 10 0.525004097470241 0.374755216966836 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 172558524 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000094975:ENST00000367723:exon_172557900_172559066:C1orf9;ENSG00000094975:ENST00000392073:exon_172557900_172559066:C1orf9;ENSG00000094975:ENST00000263688:exon_172557900_172559066:C1orf9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 356 361 717 169.098541300594 189.526479186757 -20.4279378861628 T:C C T 10 0.525004097470241 0.134680201582698 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 69 64 133 32.7747172745534 33.6002622380954 -0.825544963542058 T:C C T 10 0.525004097470241 0.930880918779402 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 26 35 61 12.3498934657737 18.3751434114584 -6.0252499456847 T:C T C 10 0.525004097470241 0.125985689916133 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 C:G C G 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 179320578 A/G 1 23 22 45 10.9249057581845 11.5500901443453 -0.625184386160846 A:G A G 10 0.525004097470241 0.882197627115388 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179320452_179320597:SOAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 180163390 A/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180163348_180163527:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180163348_180163527:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180163348_180163527:QSOX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 A:G A G 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 26 28 54 12.3498934657737 14.7001147291667 -2.35022126339302 T:C T C 10 0.525004097470241 0.586382753061085 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 183895435 A/C 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 A:C A C 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000143344:ENST00000304685:exon_183895239_183897666:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000367531:exon_183895239_183897665:RGL1;ENSG00000143344:ENST00000360851:exon_183895239_183897665:RGL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 186368092 A/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186368086_186368176:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000367470:exon_186368086_186368176:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186368086_186368176:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000432021:exon_186368086_186368176:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000478571:exon_186368086_186368176:C1orf27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 200522566 G/C 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 C:G G C 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 200558363 T/C 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C T C 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200558345_200558497:KIF14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 200818980 C/G 1 20 19 39 9.49991805059518 9.97507785193458 -0.475159801339398 C:G C G 10 0.525004097470241 0.874473842292273 ENSG00000118200:ENST00000358823:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000413307:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1;ENSG00000118200:ENST00000236925:exon_200817160_200819362:CAMSAP1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 29 51 80 13.774881173363 26.7752089709823 -13.0003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00481482207898636 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 92 76 168 43.6996230327378 39.9003114077383 3.79931162499951 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.589039622110723 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 201969082 G/A 1 43 28 71 20.4248238087796 14.7001147291667 5.72470907961289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.191839404104432 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 201974712 G/C 1 65 55 120 30.8747336644343 28.8752253608633 1.99950830357108 C:G G C 10 0.525004097470241 0.784065368424064 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201974686_201975275:RNPEP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 37 30 67 17.5748483936011 15.7501229241072 1.82472546949385 T:C T C 10 0.525004097470241 0.714264047238112 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 24 17 41 11.3999016607142 8.9250696569941 2.47483200372012 A:C C A 10 0.525004097470241 0.532230827662744 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 205052723 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000174529:ENST00000367167:exon_205052258_205053588:TMEM81 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 26 19 45 12.3498934657737 9.97507785193458 2.37481561383916 T:C C T 10 0.525004097470241 0.55135961932194 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 207087435 C/T 1 55 73 128 26.1247746391367 38.3252991153276 -12.2005244761909 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0335340264762801 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207087207_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207087104_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207086977_207087439:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207087146_207087439:FAIM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 207095231 A/G 1 45 45 90 21.3748156138392 23.6251843861608 -2.25036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.673488313847328 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207095163_207095235:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207095163_207095343:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000442471:exon_207095163_207095343:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000528654:exon_207095163_207095300:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207095163_207095286:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000525793:exon_207095163_207095290:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000529560:exon_207095163_207095235:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000533312:exon_207095163_207095286:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000530505:exon_207095163_207095342:FAIM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 6 20 26 2.84997541517855 10.5000819494048 -7.65010653422627 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00282525422513554 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 207812791 A/G 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G A G 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000203710:ENST00000367052:exon_207812742_207813992:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367051:exon_207812742_207813992:CR1;ENSG00000203710:ENST00000367053:exon_207812742_207813992:CR1;ENSG00000203710:ENST00000400960:exon_207812742_207813553:CR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 207851611 A/G 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000197721:ENST00000531844:exon_207851543_207851642:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000508064:exon_207851543_207851642:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000430248:exon_207851543_207851612:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000530905:exon_207851543_207851642:CR1L;ENSG00000197721:ENST00000294997:exon_207851543_207851642:CR1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 5 15 20 2.3749795126488 7.87506146205362 -5.50008194940482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0226214496010046 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 22 13 35 10.4499098556547 6.82505326711313 3.62485658854156 A:G A G 10 0.525004097470241 0.239759358776754 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 22 17 39 10.4499098556547 8.9250696569941 1.5248401986606 T:C C T 10 0.525004097470241 0.635382193648771 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 88 66 154 41.7996394226188 34.6502704330359 7.14936898958288 A:C A C 10 0.525004097470241 0.259412914576147 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 210003489 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210003453_210003492:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210003453_210003492:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210003453_210003492:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210003453_210003492:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210003453_210003492:C1orf107 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 35 19 54 16.6248565885416 9.97507785193458 6.64977873660699 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0768739323786076 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 212538572 C/T 1 24 26 50 11.3999016607142 13.6501065342263 -2.25020487351205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.572360723487627 ENSG00000065600:ENST00000261455:exon_212537273_212538718:TMEM206 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 212965095 G/A 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000487995:exon_212964872_212965124:NSL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 218458753 C/T 1 40 11 51 18.9998361011904 5.77504507217265 13.2247910290177 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000198313790443099 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218458684_218458797:RRP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 52 31 83 24.6997869315475 16.2751270215775 8.42465990997 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0780799261006275 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 300 281 581 142.498770758928 147.526151389138 -5.02738063021005 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.678103690206283 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 220324715 T/C 1 54 48 102 25.649778736607 25.2001966785716 0.449582058035418 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220321635_220324748:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000491005:exon_220324525_220325106:RAB3GAP2;ENSG00000118873:ENST00000474966:exon_220324598_220324748:RAB3GAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 34 31 65 16.1498606860118 16.2751270215775 -0.125266335565666 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 18 22 40 8.54992624553566 11.5500901443453 -3.00016389880964 T:C T C 10 0.525004097470241 0.34786509808383 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 222833538 C/G 1 16 22 38 7.59993444047614 11.5500901443453 -3.95015570386916 T:C:G C G 10 0.525004097470241 0.255294680918394 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222833519_222833656:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000475451:exon_222833519_222833656:MIA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 223983538 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223983517_223984292:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223983517_223984292:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223983517_223984292:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223983517_223984292:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223983517_223984292:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223983517_223984292:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223983517_223984292:TP53BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 224488315 T/C 1 11 3 14 5.22495492782735 1.57501229241072 3.64994263541663 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0616618009545916 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224488264_224488365:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224488264_224488365:NVL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 224495852 C/T 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224495693_224495919:NVL;ENSG00000143748:ENST00000470903:exon_224495688_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000461466:exon_224495695_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000498767:exon_224495710_224495965:NVL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 226108200 C/T 1 55 62 117 26.1247746391367 32.5502540431549 -6.4254794040182 T:C C T 10 0.525004097470241 0.266607458974609 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 92 84 176 43.6996230327378 44.1003441875002 -0.400721154762422 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C T C 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 16 11 27 7.59993444047614 5.77504507217265 1.82488936830349 A:C A C 10 0.525004097470241 0.565180073022297 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 228295527 G/A 1 79 84 163 37.524676299851 44.1003441875002 -6.57566788764929 A:G G A 10 0.525004097470241 0.308936702924728 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295525_228295570:MRPL55 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 228582643 C/T 1 17 16 33 8.0749303430059 8.40006555952386 -0.325135216517953 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228581377_228582953:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000493030:exon_228581817_228582714:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228582157_228582953:TRIM11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:C A C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 229622162 A/G 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 A:G A G 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 229787055 G/A 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 A:G G A 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229786982_229787069:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229786594_229787069:URB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 230810756 T/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:T T A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230810744_230810870:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230810744_230810870:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230810744_230810870:COG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 3 9 12 1.42498770758928 4.72503687723217 -3.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0805904843052766 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 234603386 G/T 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:G G T 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234603248_234603396:TARBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 235345813 G/A 1 59 62 121 28.0247582492558 32.5502540431549 -4.52549579389916 A:G G A 10 0.525004097470241 0.414370812259815 ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000444620:exon_235344900_235346108:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235343454_235346108:ARID4B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 236381825 G/C 1 14 16 30 6.64994263541663 8.40006555952386 -1.75012292410723 C:G G C 10 0.525004097470241 0.585451127292195 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236378855_236381876:ERO1LB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 A:T T A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 241725512 A/T 1 17 15 32 8.0749303430059 7.87506146205362 0.199868880952287 A:T A T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241725467_241725632:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241725467_241725632:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241725467_241725564:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241725467_241725583:KMO;ENSG00000117009:ENST00000477907:exon_241725467_241725632:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241725467_241725632:KMO;ENSG00000117009:ENST00000431245:exon_241725353_241725632:KMO HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G A G 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 24 21 45 11.3999016607142 11.0250860468751 0.374815613839154 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 245245402 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000203666:ENST00000391837:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366523:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366522:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000421886:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366520:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000497591:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000447569:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000473686:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000366521:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000487845:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000391838:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000495271:exon_245245385_245245464:EFCAB2;ENSG00000203666:ENST00000425550:exon_245245385_245245464:EFCAB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 245861571 C/T 1 1 11 12 0.474995902529759 5.77504507217265 -5.30004916964289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00231996722343116 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 22 19 41 10.4499098556547 9.97507785193458 0.474832003720119 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 246707858 A/G 1 55 68 123 26.1247746391367 35.7002786279764 -9.57550398883964 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0867935535051969 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 247151557 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000135747:ENST00000465049:exon_247151423_247151557:ZNF670;ENSG00000135747:ENST00000474541:exon_247151423_247151557:ZNF670;ENSG00000197472:ENST00000479214:exon_247151423_247151557:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000366504:exon_247151423_247151557:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000487338:exon_247151427_247151557:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000498046:exon_247151423_247151557:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000339986:exon_247148625_247151557:ZNF695 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 1 247162658 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000135747:ENST00000465049:exon_247162650_247162742:ZNF670;ENSG00000135747:ENST00000474541:exon_247162650_247162742:ZNF670;ENSG00000197472:ENST00000479214:exon_247162650_247162742:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000366504:exon_247162650_247162742:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000491337:exon_247162650_247162742:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000487338:exon_247162650_247162742:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000339986:exon_247162650_247162742:ZNF695 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 1034412 C/T 1 14 15 29 6.64994263541663 7.87506146205362 -1.22511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 0.711888598190345 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1034338_1034467:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1034402_1034467:GTPBP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 38 38 76 18.0498442961308 19.9501557038692 -1.90031140773831 A:G G A 10 0.525004097470241 0.730720594437391 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 1065457 T/A 1 29 38 67 13.774881173363 19.9501557038692 -6.17527453050615 A:T T A 10 0.525004097470241 0.142770652594291 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 63 34 97 29.9247418593748 17.8501393139882 12.0746025453866 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0145950599755219 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 64 66 130 30.3997377619046 34.6502704330359 -4.25053267113133 T:C C T 10 0.525004097470241 0.4828450635789 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 89 93 182 42.2746353251486 48.8253810647324 -6.55074573958386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.335635242226527 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3159006 C/T 1 68 75 143 32.2997213720236 39.3753073102681 -7.07558593824447 T:C C T 10 0.525004097470241 0.242123083752867 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3158968_3159038:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3158968_3159038:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3158968_3159038:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3158968_3159038:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3158968_3159038:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3158968_3159038:PFKP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 144 153 297 68.3994099642853 80.3256269129469 -11.9262169486616 T:C T C 10 0.525004097470241 0.181376326506647 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 79 106 185 37.524676299851 55.6504343318455 -18.1257580319946 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00798851558609172 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 31 17 48 14.7248729784225 8.9250696569941 5.79980332142843 T:C C T 10 0.525004097470241 0.11157295319663 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 5803368 A/G 1 18 14 32 8.54992624553566 7.35005736458337 1.19986888095229 A:G A G 10 0.525004097470241 0.725678409930913 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5803253_5803434:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5803253_5803434:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000487196:exon_5803253_5803764:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000459693:exon_5802803_5803434:C10orf18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 17 14 31 8.0749303430059 7.35005736458337 0.724872978422528 A:G A G 10 0.525004097470241 0.858468340181549 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 A:T A T 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 11504752 T/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 11505175 A/G 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 118 102 220 56.0495164985116 53.5504179419646 2.49909855654698 A:G G A 10 0.525004097470241 0.787220450931341 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 360 314 674 170.998524910713 164.851286605656 6.14723830505756 T:C T C 10 0.525004097470241 0.643677723122741 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 0 0 10 10 0 5.25004097470241 -5.25004097470241 G C G 10 0.525004097470241 0.00058465360613205 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 C:G C G 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 13239651 A/G 1 13 15 28 6.17494673288687 7.87506146205362 -1.70011472916675 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.573165273231675 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13239623_13239767:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000481292:exon_13239623_13239767:MCM10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 10 21 31 4.74995902529759 11.0250860468751 -6.27512702157747 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0298654161561693 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 49 18 67 23.2747992239582 9.45007375446434 13.8247254694939 T:C T C 10 0.525004097470241 0.000823074194958173 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 72 80 152 34.1997049821426 42.0003277976193 -7.80062281547663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.223242135185559 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 100 99 199 47.4995902529759 51.9754056495539 -4.47581539657796 C:G C G 10 0.525004097470241 0.570269228334549 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 23408278 C/T 1 30 34 64 14.2498770758928 17.8501393139882 -3.60026223809543 T:C C T 10 0.525004097470241 0.383279514557757 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23408233_23408380:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23408073_23408380:MSRB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 11 18 29 5.22495492782735 9.45007375446434 -4.22511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 0.137500629603524 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 157 268 425 74.5743566971722 140.701098122025 -66.1267414248524 T:C T C 10 0.525004097470241 1.4330465956535e-10 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 73 66 139 34.6747008846724 34.6502704330359 0.0244304516364977 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 35426755 A/G 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000095794:ENST00000482646:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000466251:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000496019:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000354759:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000427847:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000345491:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395895:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374728:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000337656:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374734:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395897:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000439705:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000333809:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000362092:exon_35426710_35426807:CREM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 38120720 C/T 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000198105:ENST00000395867:exon_38117693_38122044:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000357328:exon_38117899_38122044:ZNF248 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 38120945 A/G 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198105:ENST00000395867:exon_38117693_38122044:ZNF248;ENSG00000198105:ENST00000357328:exon_38117899_38122044:ZNF248 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 38345455 A/G 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 38345465 G/C 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 38658896 A/G 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 A:G A G 10 0.525004097470241 0.349883865038242 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 6 16 22 2.84997541517855 8.40006555952386 -5.5500901443453 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0192284907141501 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 44112245 G/A 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 50396388 G/A 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 A:G G A 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50396339_50396424:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50396339_50396413:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50396339_50396404:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374149:exon_50396339_50396424:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50396339_50396436:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000470884:exon_50396339_50396630:C10orf128 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 50678369 T/C 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 93 0 93 44.1746189352676 0 44.1746189352676 G G 10 0.525004097470241 1.40025978596443e-26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 56 68 124 26.5997705416665 35.7002786279764 -9.10050808630989 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.106065407807716 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/C 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 A:C A C 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 64975376 A/G 1 14 15 29 6.64994263541663 7.87506146205362 -1.22511882663699 A:G A G 10 0.525004097470241 0.711888598190345 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000469152:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000489372:exon_64975313_64975376:JMJD1C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 64975436 G/A 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 A:G G A 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000469152:exon_64975313_64975456:JMJD1C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 70513684 A/G 1 13 10 23 6.17494673288687 5.25004097470241 0.924905758184457 A:G A G 10 0.525004097470241 0.835357270424024 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70513609_70513834:CCAR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 40 31 71 18.9998361011904 16.2751270215775 2.72470907961289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.553713907714828 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 120 99 219 56.9995083035711 51.9754056495539 5.02410265401721 T:C C T 10 0.525004097470241 0.499726543390597 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 79793614 C/G 1 189 603 792 89.7742255781244 316.577470774555 -226.803245196431 A:C:G C G 10 0.525004097470241 1.30212875722991e-60 ENSG00000138326:ENST00000440692:exon_79793518_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79793518_79793662:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79793602_79793662:RPS24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 81109458 C/T 1 10 17 27 4.74995902529759 8.9250696569941 -4.17511063169651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.124459143737652 ENSG00000108179:ENST00000498681:exon_81109421_81109509:PPIF;ENSG00000108179:ENST00000225174:exon_81109421_81109509:PPIF;ENSG00000108179:ENST00000394579:exon_81109421_81109509:PPIF;ENSG00000108179:ENST00000472580:exon_81109421_81109509:PPIF;ENSG00000108179:ENST00000492149:exon_81109421_81109791:PPIF;ENSG00000108179:ENST00000448165:exon_81109421_81109509:PPIF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 156 178 334 74.0993607946424 93.4507293497029 -19.3513685550605 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0372239534698387 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 A:T A T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 C:G C G 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91066769 C/A 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 22 18 40 10.4499098556547 9.45007375446434 0.999836101190359 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.874474925112685 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91487649 A/T 1 19 11 30 9.02492214806542 5.77504507217265 3.24987707589277 A:T A T 10 0.525004097470241 0.274741464175757 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000439656:exon_91487613_91487653:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91487613_91487653:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91488979 A/T 1 31 29 60 14.7248729784225 15.225118826637 -0.500245848214462 A:T A T 10 0.525004097470241 0.898050611415441 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91488885_91489004:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91488885_91489004:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 22 20 42 10.4499098556547 10.5000819494048 -0.0501720937501222 A:T T A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 17 20 37 8.0749303430059 10.5000819494048 -2.42515160639892 A:G A G 10 0.525004097470241 0.5108991695235 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 21 25 46 9.97491395312494 13.125102436756 -3.15018848363109 A:G A G 10 0.525004097470241 0.378211437553437 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 21 29 50 9.97491395312494 15.225118826637 -5.25020487351205 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.157055549987230 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 92631778 G/A 1 18 18 36 8.54992624553566 9.45007375446434 -0.900147508928676 A:G G A 10 0.525004097470241 0.86781235843956 ENSG00000148688:ENST00000371703:exon_92631473_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000371705:exon_92631709_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000413330:exon_92631709_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000487998:exon_92631730_92631825:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000277882:exon_92631740_92631891:RPP30;ENSG00000148688:ENST00000458617:exon_92631744_92631891:RPP30 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 94393483 G/A 1 14 9 23 6.64994263541663 4.72503687723217 1.92490575818446 A:G G A 10 0.525004097470241 0.532417104873035 ENSG00000138160:ENST00000260731:exon_94393380_94393552:KIF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 94413508 G/C 1 53 51 104 25.1747828340772 26.7752089709823 -1.60042613690506 C:G G C 10 0.525004097470241 0.769114359179103 ENSG00000138160:ENST00000260731:exon_94413422_94415150:KIF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 41 51 92 19.4748320037201 26.7752089709823 -7.30037696726217 C:G G C 10 0.525004097470241 0.143805872075016 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 42 28 70 19.9498279062499 14.7001147291667 5.24971317708313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.232103223044712 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 96106240 G/C 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 C:G G C 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96106233_96106313:NOC3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 30 25 55 14.2498770758928 13.125102436756 1.12477463913674 A:C A C 10 0.525004097470241 0.788635215043384 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1523 1499 3022 723.418759552823 786.981142107891 -63.5623825550683 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.0207177549914268 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 1039 958 1997 493.52074272842 502.953925376491 -9.43318264807129 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.686739042446052 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 77 61 138 36.5746844947914 32.0252499456847 4.54943454910674 A:G A G 10 0.525004097470241 0.44460321654661 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 98006805 C/T 1 68 92 160 32.2997213720236 48.3003769672622 -16.0006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0138804400552895 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000495266:exon_98006740_98006805:BLNK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 T:G G T 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 98369536 A/G 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 99116903 C/T 1 66 77 143 31.3497295669641 40.4253155052086 -9.07558593824447 T:C C T 10 0.525004097470241 0.132439924767905 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99116115_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99116458_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99116459_99116953:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000465394:exon_99116863_99116953:RRP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 37 50 87 17.5748483936011 26.2502048735121 -8.67535647991097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0680824623119697 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 99141484 C/T 1 2 8 10 0.949991805059518 4.20003277976193 -3.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0551714633384594 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141472_99141583:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141472_99141583:RRP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 100179851 T/C 1 19 24 43 9.02492214806542 12.6000983392858 -3.57517619122036 T:C T C 10 0.525004097470241 0.288768991270959 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100179802_100179915:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100179802_100180126:HPS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 100183570 G/C 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 C:G G C 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100183510_100183644:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100183510_100183644:HPS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 100190920 G/A 1 16 9 25 7.59993444047614 4.72503687723217 2.87489756324397 A:G G A 10 0.525004097470241 0.317548816463159 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100190888_100191039:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000414009:exon_100190888_100191048:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100190888_100191048:HPS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 101473147 A/G 1 19 36 55 9.02492214806542 18.9001475089287 -9.87522536086325 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00972413724999882 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101471601_101473236:COX15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 101486759 C/T 1 7 13 20 3.32497131770831 6.82505326711313 -3.50008194940482 T:C C T 10 0.525004097470241 0.123961209300371 ENSG00000014919:ENST00000370483:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000016171:exon_101486725_101486911:COX15;ENSG00000014919:ENST00000485884:exon_101486725_101486911:COX15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 101912064 T/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000107566:ENST00000370410:exon_101909848_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000421367:exon_101909851_101912109:ERLIN1;ENSG00000107566:ENST00000407654:exon_101911565_101912109:ERLIN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 159 83 242 75.5243485022317 43.57534009003 31.9490084122017 A:T:C C T 10 0.525004097470241 3.53469370536348e-05 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:C C A 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 102763761 T/C 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 T:C T C 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102763264_102763923:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102763264_102763972:LZTS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 10 12 22 4.74995902529759 6.30004916964289 -1.5500901443453 A:G A G 10 0.525004097470241 0.529662604084724 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103340056 G/A 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000166171:ENST00000470165:exon_103339817_103340065:DPCD;ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103361088 C/T 1 19 26 45 9.02492214806542 13.6501065342263 -4.62518438616084 T:C C T 10 0.525004097470241 0.181103939887917 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000434727:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103360960_103361093:DPCD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103558701 G/A 1 42 50 92 19.9498279062499 26.2502048735121 -6.30037696726217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.210445390701329 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103577726 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103577581_103578222:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000419011:exon_103577581_103578180:MGEA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103900729 G/A 1 23 15 38 10.9249057581845 7.87506146205362 3.04984429613084 A:G G A 10 0.525004097470241 0.335391693227016 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 60 43 103 28.4997541517855 22.5751761912204 5.92457796056517 T:C T C 10 0.525004097470241 0.277832044833248 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 103922063 G/C 1 131 117 248 62.2244632313984 61.4254794040182 0.798983827380226 C:G G C 10 0.525004097470241 0.949342682152963 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103921868_103923623:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103921868_103922356:NOLC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 104159196 A/G 1 149 112 261 70.7743894769341 58.800458916667 11.9739305602671 A:G A G 10 0.525004097470241 0.153894325452600 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104159045_104159254:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104159045_104159254:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104159045_104159254:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104159045_104159254:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104159045_104159254:NFKB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 104160434 A/G 1 383 345 728 181.923430668898 181.126413627233 0.797017041664532 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.970405765115634 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104160412_104160581:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104160412_104160581:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104160412_104160581:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104160412_104160581:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104160412_104160581:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000473400:exon_104160335_104160581:NFKB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 105657316 G/C 1 51 46 97 24.2247910290177 24.1501884836311 0.0746025453866217 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 105657363 C/G 1 40 39 79 18.9998361011904 20.4751598013394 -1.47532370014904 C:G C G 10 0.525004097470241 0.821923291744223 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 105659826 T/C 1 13 42 55 6.17494673288687 22.0501720937501 -15.8752253608633 T:C T C 10 0.525004097470241 1.76610580452319e-05 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105659718_105659911:OBFC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 105763026 C/T 1 35 24 59 16.6248565885416 12.6000983392858 4.02475824925578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.30092603334815 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 113913222 T/C 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119927:ENST00000348367:exon_113909624_113913424:GPAM;ENSG00000119927:ENST00000423155:exon_113909637_113913424:GPAM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 114169276 A/G 1 17 14 31 8.0749303430059 7.35005736458337 0.724872978422528 A:G A G 10 0.525004097470241 0.858468340181549 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114169265_114169443:ACSL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 10 14 24 4.74995902529759 7.35005736458337 -2.60009833928578 T:G G T 10 0.525004097470241 0.312688523843871 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 119042766 A/G 1 21 16 37 9.97491395312494 8.40006555952386 1.57484839360108 A:G A G 10 0.525004097470241 0.62577475340014 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119040000_119044982:PDZD8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 119043827 A/G 1 11 15 26 5.22495492782735 7.87506146205362 -2.65010653422627 A:G A G 10 0.525004097470241 0.330387936784344 ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119040000_119044982:PDZD8;ENSG00000165650:ENST00000482496:exon_119043818_119044982:PDZD8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 120446114 A/G 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120446110_120446153:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000490610:exon_120446110_120446293:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000489169:exon_120446110_120446153:C10orf46 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 120820747 G/T 1 30 27 57 14.2498770758928 14.1751106316965 0.0747664441962623 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120820736_120820840:EIF3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 120840191 T/C 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 T:C T C 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120840140_120840316:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000478852:exon_120840140_120840396:EIF3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 4 10 14 1.89998361011904 5.25004097470241 -3.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.106123236614285 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 124800853 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 126186935 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126186897_126187083:LHPP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 13 16 29 6.17494673288687 8.40006555952386 -2.22511882663699 A:G G A 10 0.525004097470241 0.459653232536022 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 34 32 66 16.1498606860118 16.8001311190477 -0.650270433035907 T:C T C 10 0.525004097470241 0.902343807739442 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129871690 A/G 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000132334:ENST00000254667:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000419012:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000439034:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000306042:exon_129871601_129871735:PTPRE;ENSG00000132334:ENST00000479896:exon_129871601_129871735:PTPRE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 577 576 1153 274.072635759671 302.402360142859 -28.3297243831879 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.0986583491463107 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 506 449 955 240.347926680058 235.726839764138 4.62108691591982 C:G G C 10 0.525004097470241 0.77068768002264 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 249 312 561 118.27397972991 163.801278410715 -45.5272986808052 T:C T C 10 0.525004097470241 0.000137733018374905 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 174 211 385 82.6492870401781 110.775864566221 -28.1265775260428 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.00424340870892033 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129901570 C/T 1 187 195 382 88.8242337730649 102.375799006697 -13.5515652336321 T:C C T 10 0.525004097470241 0.166956696426913 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 105 90 195 49.8745697656247 47.2503687723217 2.624200993303 A:G G A 10 0.525004097470241 0.720503257381263 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 108 121 229 51.299557473214 63.5254957938992 -12.2259383206852 T:C T C 10 0.525004097470241 0.112326235160455 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 115 100 215 54.6245287909223 52.5004097470241 2.12411904389818 A:T:G T G 10 0.525004097470241 0.785133546230163 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 107 123 230 50.8245615706842 64.5755039888396 -13.7509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.074586474103894 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 71 103 174 33.7247090796129 54.0754220394348 -20.3507129598219 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0023117810489485 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 61 53 114 28.9747500543153 27.8252171659228 1.14953288839252 T:C T C 10 0.525004097470241 0.851693418652834 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129903094 G/T 1 48 50 98 22.7998033214284 26.2502048735121 -3.45040155208362 T:G G T 10 0.525004097470241 0.544173975711427 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129903802 A/G 1 33 33 66 15.674864783482 17.325135216518 -1.65027043303591 A:G A G 10 0.525004097470241 0.71276021885517 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 29 20 49 13.774881173363 10.5000819494048 3.27479922395819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.392148990278443 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129904560 C/T 1 11 29 40 5.22495492782735 15.225118826637 -10.0001638988096 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00219414536015545 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 12 16 28 5.69995083035711 8.40006555952386 -2.70011472916675 T:C C T 10 0.525004097470241 0.347018973521548 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 23 27 50 10.9249057581845 14.1751106316965 -3.25020487351205 C:G G C 10 0.525004097470241 0.396784260415126 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 A:T A T 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 83 68 151 39.42465990997 35.7002786279764 3.72438128199361 T:C C T 10 0.525004097470241 0.569027840251559 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 54 67 121 25.649778736607 35.1752745305062 -9.52549579389916 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0844604712937157 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 27 83 110 12.8248893683035 43.57534009003 -30.7504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 4.00555780283809e-09 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 32 3 35 15.1998688809523 1.57501229241072 13.6248565885416 A:G A G 10 0.525004097470241 1.28583725182051e-06 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 30 2 32 14.2498770758928 1.05000819494048 13.1998688809523 C:G C G 10 0.525004097470241 8.14726440561965e-07 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 28 1 29 13.2998852708333 0.525004097470241 12.774881173363 T:C T C 10 0.525004097470241 2.22782254805964e-07 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 20 1 21 9.49991805059518 0.525004097470241 8.97491395312494 T:G G T 10 0.525004097470241 3.05039060292817e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 2 19 21 0.949991805059518 9.97507785193458 -9.02508604687506 A:G A G 10 0.525004097470241 7.21574619714523e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 134540331 T/C 1 2 12 14 0.949991805059518 6.30004916964289 -5.35005736458337 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00545060904059613 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000487614:exon_134540325_134540853:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000498337:exon_134540325_134540409:INPP5A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 10 135122941 G/C 1 38 42 80 18.0498442961308 22.0501720937501 -4.00032779761928 C:G G C 10 0.525004097470241 0.373357371315945 ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135122894_135122967:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122894_135122967:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122894_135122967:ZNF511 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 237087 A/G 1 72 58 130 34.1997049821426 30.450237653274 3.74946732886867 A:G A G 10 0.525004097470241 0.539371505445252 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 244197 T/C 1 157 23 180 74.5743566971722 12.0750942418155 62.4992624553566 T:C T C 10 0.525004097470241 5.4277713385786e-23 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 406954 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000185187:ENST00000431843:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000397632:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000332725:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527295:exon_406349_407164:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527987:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000531205:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000382520:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000534145:exon_406427_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000528209:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000525299:exon_406876_406993:SIGIRR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 498911 A/G 1 176 128 304 83.5992788452376 67.2005244761909 16.3987543690467 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0659569156056986 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_498763_498929:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_498763_498933:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_498788_498933:RNH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 562311 G/T 1 18 8 26 8.54992624553566 4.20003277976193 4.34989346577373 T:G G T 10 0.525004097470241 0.115163241075540 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 25 14 39 11.874897563244 7.35005736458337 4.5248401986606 A:G G A 10 0.525004097470241 0.152996291905085 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 25 31 56 11.874897563244 16.2751270215775 -4.4002294583335 T:C C T 10 0.525004097470241 0.284470696539779 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 587452 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_587259_588497:PHRF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 608871 C/T 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 15 16 31 7.12493853794638 8.40006555952386 -1.27512702157747 T:C T C 10 0.525004097470241 0.720439840547225 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 114 99 213 54.1495328883925 51.9754056495539 2.17412723883866 T:C C T 10 0.525004097470241 0.784081424056544 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 653968 T/C 1 32 16 48 15.1998688809523 8.40006555952386 6.79980332142843 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0595497785878823 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 654043 G/A 1 11 15 26 5.22495492782735 7.87506146205362 -2.65010653422627 A:G G A 10 0.525004097470241 0.330387936784344 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 674458 G/A 0 12 0 12 5.69995083035711 0 5.69995083035711 G G 10 0.525004097470241 0.000570392744559241 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 674499 G/A 0 10 0 10 4.74995902529759 0 4.74995902529759 G G 10 0.525004097470241 0.00217549517025948 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 755962 C/G 1 258 234 492 122.548942852678 122.850958808036 -0.302015955358584 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528070:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000532685:exon_755879_756284:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530440:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530119:exon_755879_756002:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000533796:exon_755744_756002:TALDO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 763910 C/T 1 280 233 513 132.998852708333 122.325954710566 10.6728979977664 T:C C T 10 0.525004097470241 0.353468116271559 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_763747_763944:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_763747_763940:TALDO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 792579 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000177542:ENST00000320230:exon_792553_792727:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531214:exon_792553_792727:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000481290:exon_792553_792727:SLC25A22;ENSG00000177542:ENST00000531437:exon_792553_792727:SLC25A22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 799358 G/C 1 38 43 81 18.0498442961308 22.5751761912204 -4.52533189508952 C:G G C 10 0.525004097470241 0.319207006498129 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_799184_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_799184_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_799185_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_799185_800244:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_799185_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527812:exon_799326_799474:LRDD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 800556 G/A 1 19 17 36 9.02492214806542 8.9250696569941 0.0998524910713243 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_800543_800666:LRDD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 865560 C/T 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000214063:ENST00000397397:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397411:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000399778:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397396:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000421676:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397408:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525334:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397406:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409543:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525201:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397404:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000532375:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000464987:exon_864437_865825:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409531:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000527644:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000468468:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000529566:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000494815:exon_865513_865825:TSPAN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 24 14 38 11.3999016607142 7.35005736458337 4.04984429613084 T:C C T 10 0.525004097470241 0.198158084984322 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 0 1042 0 1042 494.945730436009 0 494.945730436009 C C 10 0.525004097470241 2.97561261318565e-292 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 573 508 1081 272.172652149552 266.702081514882 5.47057063466946 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 0.760741019886569 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 2924591 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 2943671 G/C 1 12 10 22 5.69995083035711 5.25004097470241 0.449909855654698 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 4621485 C/G 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4619902_4622056:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4620010_4622056:TRIM68 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5653960 G/A 1 21 12 33 9.97491395312494 6.30004916964289 3.67486478348205 A:G G A 10 0.525004097470241 0.225102762124189 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5653467_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5653511_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5653485_5653984:TRIM34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 20 16 36 9.49991805059518 8.40006555952386 1.09985249107132 A:C C A 10 0.525004097470241 0.741571737994055 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 13 6 19 6.17494673288687 3.15002458482145 3.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.177129332411914 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5701081 G/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 A:G G A 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5701409 G/C 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 C:G G C 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 151 155 306 71.7243812819936 81.3756351078874 -9.65125382589376 T:C T C 10 0.525004097470241 0.277132809627093 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 270 209 479 128.248893683035 109.72585637128 18.5230373117546 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0907175603181032 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 5719756 C/T 1 188 184 372 89.2992296755947 96.6007539345243 -7.30152425892966 T:C C T 10 0.525004097470241 0.467485649992989 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 14 21 35 6.64994263541663 11.0250860468751 -4.37514341145844 A:T A T 10 0.525004097470241 0.175233587164930 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 6340706 A/G 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 A:G A G 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 33 24 57 15.674864783482 12.6000983392858 3.07476644419626 A:G G A 10 0.525004097470241 0.429651129150401 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 537 583 1120 255.072799658481 306.077388825151 -51.00458916667 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.00249819234355095 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 8707083 G/A 1 13 2 15 6.17494673288687 1.05000819494048 5.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00844003852137795 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 8707233 C/T 1 3545 4244 7789 1683.860474468 2228.1173896637 -544.256915195707 A:T:C:G C T 10 0.525004097470241 5.52172375924246e-35 ENSG00000166441:ENST00000314138:exon_8707225_8711419:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000524496:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000534599:exon_8707225_8707392:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000532359:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530022:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000526562:exon_8707225_8707395:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000525981:exon_8707225_8707394:RPL27A;ENSG00000166441:ENST00000530913:exon_8707225_8707395:RPL27A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 8933064 G/A 1 38 39 77 18.0498442961308 20.4751598013394 -2.42531550520856 A:G G A 10 0.525004097470241 0.64839919748902 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8932736_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8932739_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8932991_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8932885_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8932990_8933218:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8933012_8933218:C11orf17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 13 10 23 6.17494673288687 5.25004097470241 0.924905758184457 A:G A G 10 0.525004097470241 0.835357270424024 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 10521749 C/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 10786142 C/T 1 8 20 28 3.79996722023807 10.5000819494048 -6.70011472916675 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0131580685328847 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 10786175 C/T 1 21 6 27 9.97491395312494 3.15002458482145 6.82488936830349 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0109237616307856 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 15 11 26 7.12493853794638 5.77504507217265 1.34989346577373 C:G G C 10 0.525004097470241 0.696014850562397 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 13441126 A/G 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 17111272 A/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000011405:ENST00000265970:exon_17108119_17111467:PIK3C2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 19 31 50 9.02492214806542 16.2751270215775 -7.25020487351205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0469317454068294 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 18503317 C/T 1 160 142 302 75.9993444047614 74.5505818407742 1.44876256398722 T:C C T 10 0.525004097470241 0.908290079294629 ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18503177_18503416:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18503177_18503416:TSG101 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 22647366 G/A 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 27362257 T/C 1 21 64 85 9.97491395312494 33.6002622380954 -23.6253482849705 T:C T C 10 0.525004097470241 2.93995320317999e-07 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 27384585 G/A 1 14 35 49 6.64994263541663 18.3751434114584 -11.7252007760418 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000861691437788602 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 32979628 T/C 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32979415_32979632:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32979415_32979632:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32979415_32979632:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32979415_32979632:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32979415_32979632:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000528034:exon_32979352_32979632:QSER1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 33053107 C/T 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 ENSG00000121690:ENST00000241051:exon_33052924_33053135:DEPDC7;ENSG00000121690:ENST00000311388:exon_33052924_33053135:DEPDC7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 1 11 12 0.474995902529759 5.77504507217265 -5.30004916964289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00231996722343116 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 67 56 123 31.8247254694939 29.4002294583335 2.42449601116035 T:C C T 10 0.525004097470241 0.718212684353293 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 92 67 159 43.6996230327378 35.1752745305062 8.52434850223167 T:G T G 10 0.525004097470241 0.178155359686141 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 26 36 62 12.3498934657737 18.9001475089287 -6.55025404315494 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0997164867521586 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 28 17 45 13.2998852708333 8.9250696569941 4.37481561383915 A:G G A 10 0.525004097470241 0.232494766281864 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 193 164 357 91.6742091882435 86.1006719851195 5.57353720312395 T:C C T 10 0.525004097470241 0.560455840227909 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 A:G A G 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 100 81 181 47.4995902529759 42.5253318950895 4.97425835788638 T:G G T 10 0.525004097470241 0.503101865545815 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 44105301 C/T 1 7 17 24 3.32497131770831 8.9250696569941 -5.60009833928578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0246148340315966 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44105245_44105569:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44105245_44105569:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44105245_44105764:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44105245_44105772:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000534035:exon_44105245_44105443:ACCS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 167 214 381 79.3243157224697 112.350876858632 -33.0265611361618 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00083276182638669 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 58 49 107 27.549762346726 25.7252007760418 1.82456157068421 A:G A G 10 0.525004097470241 0.771846425772536 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 45937310 G/A 1 46 38 84 21.8498115163689 19.9501557038692 1.89965581249976 A:G G A 10 0.525004097470241 0.743422933161169 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000525192:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000525229:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000528674:exon_45937254_45937387:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000529030:exon_45937254_45937387:PEX16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 47444462 T/C 1 256 212 468 121.598951047618 111.300868663691 10.2980823839272 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.354734568769162 ENSG00000165916:ENST00000298852:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530912:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000524447:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000531051:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530887:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530651:exon_47444381_47444524:PSMC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 47774577 T/C 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000109920:ENST00000263773:exon_47774468_47774654:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000526109:exon_47774468_47774654:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000532646:exon_47774468_47774654:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000534003:exon_47774468_47774654:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000533707:exon_47774272_47774654:FNBP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 57076524 C/T 1 13 14 27 6.17494673288687 7.35005736458337 -1.17511063169651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.702605538446534 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 58978684 G/A 1 11 5 16 5.22495492782735 2.6250204873512 2.59993444047614 A:G G A 10 0.525004097470241 0.219246573425815 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 60609972 A/G 1 27 27 54 12.8248893683035 14.1751106316965 -1.35022126339301 A:G A G 10 0.525004097470241 0.78565734780956 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 48 48 96 22.7998033214284 25.2001966785716 -2.40039335714314 A:C C A 10 0.525004097470241 0.682969959917721 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 258 242 500 122.548942852678 127.050991587798 -4.50204873512051 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.687258810935729 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 23 20 43 10.9249057581845 10.5000819494048 0.424823808779637 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 5 14 19 2.3749795126488 7.35005736458337 -4.97507785193458 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0358147977157251 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61099072 G/A 1 12 6 18 5.69995083035711 3.15002458482145 2.54992624553566 A:G G A 10 0.525004097470241 0.248457334165905 ENSG00000167986:ENST00000301764:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000450997:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000422969:exon_61099015_61099163:DDB1;ENSG00000167986:ENST00000440736:exon_61099015_61099163:DDB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61165769 A/G 1 12 5 17 5.69995083035711 2.6250204873512 3.0749303430059 A:G A G 10 0.525004097470241 0.151946029965317 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61213555 C/T 1 131 111 242 62.2244632313984 58.2754548191968 3.94900841220167 T:C C T 10 0.525004097470241 0.652424077552695 ENSG00000167985:ENST00000301761:exon_61213413_61214225:SDHAF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61560081 G/A 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 A:G G A 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61560028_61560085:C11orf10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 A:G A G 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 15 16 31 7.12493853794638 8.40006555952386 -1.27512702157747 T:C T C 10 0.525004097470241 0.720439840547225 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 61913196 G/T 1 16 21 37 7.59993444047614 11.0250860468751 -3.42515160639892 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.323473613831152 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61913101_61913223:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61913101_61913223:INCENP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 62105441 T/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000162174:ENST00000415229:exon_62105362_62105639:ASRGL1;ENSG00000162174:ENST00000534183:exon_62105439_62105639:ASRGL1;ENSG00000162174:ENST00000301776:exon_62105439_62105639:ASRGL1;ENSG00000162174:ENST00000525496:exon_62105362_62105810:ASRGL1;ENSG00000162174:ENST00000529226:exon_62105362_62105639:ASRGL1;ENSG00000162174:ENST00000534571:exon_62105439_62105639:ASRGL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 62346131 C/T 1 17 16 33 8.0749303430059 8.40006555952386 -0.325135216517953 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62346033_62346502:TUT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 62564009 T/C 1 33 28 61 15.674864783482 14.7001147291667 0.974750054315297 T:C T C 10 0.525004097470241 0.898139377502489 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563932_62564039:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563932_62564035:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563932_62564039:NXF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 63449125 C/A 1 10 5 15 4.74995902529759 2.6250204873512 2.12493853794639 A:C C A 10 0.525004097470241 0.310879488899670 ENSG00000133318:ENST00000341307:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000339997:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000356000:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000377819:exon_63448990_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000354497:exon_63448990_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000338850:exon_63448990_63449250:RTN3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 63585804 C/A 1 15 25 40 7.12493853794638 13.125102436756 -6.00016389880964 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0802963674302318 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585688_63585837:C11orf84 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 A:G A G 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 63999929 C/T 1 100 103 203 47.4995902529759 54.0754220394348 -6.57583178645893 T:C C T 10 0.525004097470241 0.361758185276647 ENSG00000110011:ENST00000321685:exon_63999902_64000086:DNAJC4;ENSG00000110011:ENST00000321460:exon_63999902_64000086:DNAJC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 64138805 T/C 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 T:C T C 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000530504:exon_64138755_64138813:RPS6KA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 64496357 G/T 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000068831:ENST00000464324:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377494:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000421556:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000394432:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377497:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000354024:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000488071:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000437237:exon_64496335_64496514:RASGRP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 29 25 54 13.774881173363 13.125102436756 0.649778736606985 T:C C T 10 0.525004097470241 0.892341079755901 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 64898226 C/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 14 13 27 6.64994263541663 6.82505326711313 -0.175110631696508 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 T:G T G 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 28 20 48 13.2998852708333 10.5000819494048 2.79980332142843 A:G G A 10 0.525004097470241 0.47121270323275 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65404018 G/A 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403862_65404160:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403862_65404160:PCNXL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 106 71 177 50.3495656681545 37.2752909203871 13.0742747477673 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0505291459558262 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 0 202 0 202 95.9491723110113 0 95.9491723110113 G G 10 0.525004097470241 3.47353652384042e-57 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66055685 G/A 1 59 58 117 28.0247582492558 30.450237653274 -2.4254794040182 A:G G A 10 0.525004097470241 0.711368208623689 ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66055552_66055763:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66055405_66055763:YIF1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66109033 T/C 1 88 76 164 41.7996394226188 39.9003114077383 1.89932801488047 T:C T C 10 0.525004097470241 0.814676930807197 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66109004_66109094:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66109004_66109094:BRMS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 49 62 111 23.2747992239582 32.5502540431549 -9.27545481919675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0869760980400478 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 103 100 203 48.9245779605652 52.5004097470241 -3.57583178645893 A:G G A 10 0.525004097470241 0.623434885093901 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66288733 G/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 C:G G C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 1 11 13 24 5.22495492782735 6.82505326711313 -1.60009833928578 T:C T C 10 0.525004097470241 0.545429500501973 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66373305 G/A 1 104 78 182 49.3995738630949 40.9503196026788 8.44925426041614 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.234968355535800 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66373173_66373490:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66373173_66373383:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66373173_66373469:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66373173_66373390:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66373173_66373488:CCS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 66392880 C/T 1 27 25 52 12.8248893683035 13.125102436756 -0.300213068452532 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67166310 G/A 1 555 540 1095 263.622725904016 283.50221263393 -19.8794867299139 A:G G A 10 0.525004097470241 0.237974825997912 ENSG00000172531:ENST00000312989:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000451458:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532446:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000526510:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000376745:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000358239:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532279:exon_67166193_67166634:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000527663:exon_67166211_67166327:PPP1CA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67171736 C/T 1 22 7 29 10.4499098556547 3.67502868229169 6.77488117336301 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0144446286950366 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 62 49 111 29.4497459568451 25.7252007760418 3.72454518080325 T:C C T 10 0.525004097470241 0.506748031507784 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 72 72 144 34.1997049821426 37.8002950178574 -3.6005900357147 T:C C T 10 0.525004097470241 0.560101610108726 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67353579 C/T 1 2204 1897 4101 1046.89096917559 995.932772901047 50.9581962745417 A:T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.114293577292988 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353575_67353682:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000495996:exon_67353575_67353744:GSTP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 53 31 84 25.1747828340772 16.2751270215775 8.89965581249976 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0626957312148245 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 67818269 G/A 1 331 346 677 157.22364373735 181.651417724703 -24.4277739873532 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.0646570205040923 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67818208_67818362:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67818208_67818362:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67818208_67818345:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67818208_67818335:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000530063:exon_67818208_67818288:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000530802:exon_67818208_67818288:TCIRG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 68030173 C/A 1 14 14 28 6.64994263541663 7.35005736458337 -0.700114729166749 A:C C A 10 0.525004097470241 0.851142914584854 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 49 52 101 23.2747992239582 27.3002130684525 -4.02541384449434 C:G G C 10 0.525004097470241 0.427466185641008 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 72408657 C/T 1 32 21 53 15.1998688809523 11.0250860468751 4.17478283407723 T:C C T 10 0.525004097470241 0.273163338694129 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408643_72408694:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408643_72408694:ARAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 82 68 150 38.9496640074402 35.7002786279764 3.24938537946385 A:G G A 10 0.525004097470241 0.624264120635490 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 77790655 G/C 1 263 81 344 124.923922365327 42.5253318950895 82.3985904702371 C:G G C 10 0.525004097470241 6.22027428296377e-20 ENSG00000151366:ENST00000528251:exon_77790625_77790890:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000530054:exon_77790625_77790911:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000281031:exon_77790625_77791265:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000527806:exon_77790625_77790887:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000534029:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000525085:exon_77790625_77790865:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000528164:exon_77790625_77790907:NDUFC2;ENSG00000151366:ENST00000324742:exon_77790625_77790931:NDUFC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 77825320 T/C 1 24 23 47 11.3999016607142 12.0750942418155 -0.675192581101328 T:C T C 10 0.525004097470241 0.884521909264506 ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532306:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77825312_77825422:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000530454:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525870:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532050:exon_77825312_77825438:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000527099:exon_77825312_77825438:ALG8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 77924870 C/T 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 T:C C T 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000118369:ENST00000530267:exon_77924692_77925072:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530535:exon_77924692_77925184:USP35;ENSG00000118369:ENST00000529308:exon_77924692_77925757:USP35;ENSG00000118369:ENST00000263311:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000530546:exon_77924692_77925465:USP35;ENSG00000118369:ENST00000526425:exon_77924692_77925753:USP35;ENSG00000118369:ENST00000441408:exon_77924692_77925753:USP35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 82550387 A/G 1 9 19 28 4.27496312276783 9.97507785193458 -5.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0368015667258374 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82550303_82551885:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000525772:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000524642:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000526918:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531283:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532476:exon_82550324_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82550373_82550467:PRCP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 82644764 C/G 1 13 12 25 6.17494673288687 6.30004916964289 -0.125102436756025 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 82880341 G/A 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82879470_82881037:PCF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 12 20 32 5.69995083035711 10.5000819494048 -4.80013111904771 A:C A C 10 0.525004097470241 0.110587139099520 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 A:C A C 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 88045583 A/G 1 36 58 94 17.0998524910713 30.450237653274 -13.3503851622027 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0069703633862974 ENSG00000109861:ENST00000227266:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000527018:exon_88045556_88045722:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000533865:exon_88045556_88045722:CTSC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 24 27 51 11.3999016607142 14.1751106316965 -2.77520897098229 T:G G T 10 0.525004097470241 0.484374527649928 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 9 26 35 4.27496312276783 13.6501065342263 -9.37514341145843 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00189296423779766 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 13 32 45 6.17494673288687 16.8001311190477 -10.6251843861608 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00156977590028977 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 20 26 46 9.49991805059518 13.6501065342263 -4.15018848363109 A:C A C 10 0.525004097470241 0.239578627728506 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 93913036 A/G 1 13 4 17 6.17494673288687 2.10001638988096 4.0749303430059 A:G A G 10 0.525004097470241 0.053781933209421 ENSG00000110218:ENST00000227638:exon_93912768_93913423:PANX1;ENSG00000110218:ENST00000436171:exon_93912768_93913423:PANX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 25 19 44 11.874897563244 9.97507785193458 1.8998197113094 C:G C G 10 0.525004097470241 0.651398281956876 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 203 154 357 96.4241682135411 80.8506310104171 15.573537203124 A:G G A 10 0.525004097470241 0.100650665005436 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 31 29 60 14.7248729784225 15.225118826637 -0.500245848214462 T:C T C 10 0.525004097470241 0.898050611415441 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 108032707 G/T 1 10 3 13 4.74995902529759 1.57501229241072 3.17494673288687 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0975258074488578 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530859:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000527296:exon_108031911_108032762:NPAT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 110035262 A/G 1 9 2 11 4.27496312276783 1.05000819494048 3.22495492782735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0690623754843889 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110035066_110042566:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110035066_110036659:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110035066_110042564:ZC3H12C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 113604503 C/T 1 25 18 43 11.874897563244 9.45007375446434 2.42482380877964 T:C C T 10 0.525004097470241 0.542046263819895 ENSG00000086827:ENST00000200135:exon_113603913_113604536:ZW10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 116728956 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 A:G A G 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 117163765 C/A 1 13 6 19 6.17494673288687 3.15002458482145 3.02492214806542 A:C C A 10 0.525004097470241 0.177129332411914 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 17 11 28 8.0749303430059 5.77504507217265 2.29988527083325 C:G C G 10 0.525004097470241 0.451315745002794 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118068752 T/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118068683_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118068324_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118068683_118068806:AMICA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118074337 A/G 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118071189_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118074143_118076105:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118074143_118074380:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118074143_118074380:AMICA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118765267 G/C 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 C:G G C 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118765282 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 31 45 76 14.7248729784225 23.6251843861608 -8.90031140773832 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0502275806206687 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 A:G G A 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 29 25 54 13.774881173363 13.125102436756 0.649778736606985 T:C C T 10 0.525004097470241 0.892341079755901 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 69 31 100 32.7747172745534 16.2751270215775 16.4995902529759 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.000901081928374992 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 C:G C G 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 19 19 38 9.02492214806542 9.97507785193458 -0.950155703869157 T:C C T 10 0.525004097470241 0.871256227671061 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 63 61 124 29.9247418593748 32.0252499456847 -2.10050808630988 A:G A G 10 0.525004097470241 0.71986782799615 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 41 30 71 19.4748320037201 15.7501229241072 3.72470907961289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.406849028180994 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 118986972 C/T 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C C T 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118986755_118989252:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118986755_118987826:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118984790_118987831:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118986735_118987831:C2CD2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 10 12 22 4.74995902529759 6.30004916964289 -1.5500901443453 A:G G A 10 0.525004097470241 0.529662604084724 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 4010 3721 7731 1904.73356914433 1953.54024668677 -48.8066775424331 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.269343885423193 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 78 24 102 37.0496803973212 12.6000983392858 24.4495820580354 T:C T C 10 0.525004097470241 7.7392962862398e-07 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 8 17 25 3.79996722023807 8.9250696569941 -5.12510243675603 A:T A T 10 0.525004097470241 0.0456059116156226 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 125525195 A/G 1 46 40 86 21.8498115163689 21.0001638988096 0.849647617559274 A:G A G 10 0.525004097470241 0.914164658485524 ENSG00000149554:ENST00000438015:exon_125525120_125525640:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000427383:exon_125525120_125525371:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000428830:exon_125525120_125525242:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000532449:exon_125525120_125525605:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000534070:exon_125525120_125527031:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000524737:exon_125525120_125525242:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000278916:exon_125525120_125525608:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000528276:exon_125525120_125525481:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000498122:exon_125525120_125525242:CHEK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 26 4 30 12.3498934657737 2.10001638988096 10.2498770758928 T:C T C 10 0.525004097470241 0.000143942427605195 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 126176578 G/A 1 80 103 183 37.9996722023807 54.0754220394348 -16.0757498370541 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0178697593920038 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126176465_126176639:DCPS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 15 21 36 7.12493853794638 11.0250860468751 -3.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.242570652607124 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G G A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 1890199 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1890055_1890242:ADIPOR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 1893077 C/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:C C A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 1893170 C/T 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C C T 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 339 276 615 161.023610957588 144.901130901787 16.1224800558018 A:C:G C G 10 0.525004097470241 0.196542784161338 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 4662210 T/C 1 18 21 39 8.54992624553566 11.0250860468751 -2.4751598013394 T:C T C 10 0.525004097470241 0.521866243287664 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4662149_4662313:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4662149_4662313:RAD51AP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 67 90 157 31.8247254694939 47.2503687723217 -15.4256433028278 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0162565312473798 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 6707526 G/A 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 A:G G A 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6707388_6707591:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6707388_6707591:CHD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 6709059 G/A 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6708939_6709178:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6708939_6709178:CHD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 6961397 C/T 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 T:C C T 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6961285_6961454:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6961291_6961454:USP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 18 10 28 8.54992624553566 5.25004097470241 3.29988527083325 A:G A G 10 0.525004097470241 0.257446536150787 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 6981991 A/G 1 2 10 12 0.949991805059518 5.25004097470241 -4.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0177163026210360 ENSG00000111671:ENST00000523102:exon_6981402_6982150:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000524270:exon_6981402_6982161:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000519357:exon_6980757_6982161:SPSB2;ENSG00000111671:ENST00000432205:exon_6981819_6982161:SPSB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:T T A 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 17 23 40 8.0749303430059 12.0750942418155 -4.00016389880964 A:G A G 10 0.525004097470241 0.210178107722630 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 7069342 C/T 1 1748 1480 3228 830.292837622019 777.006064255957 53.286773366062 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.0617487325412711 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7069251_7069402:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7069251_7069402:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7069251_7069402:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7069251_7069402:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7069251_7069402:PTPN6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 7 13 20 3.32497131770831 6.82505326711313 -3.50008194940482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.123961209300371 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 12 14 26 5.69995083035711 7.35005736458337 -1.65010653422627 T:C C T 10 0.525004097470241 0.559872705946098 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 125 198 323 59.3744878162199 103.950811299108 -44.5763234828879 T:C:G C G 10 0.525004097470241 8.12799940186367e-07 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 9833524 C/G 1 198 110 308 94.0491887008923 57.7504507217265 36.2987379791658 C:G C G 10 0.525004097470241 3.69813714944291e-05 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 9875218 A/C 1 716 139 855 340.097066211307 72.9755695483635 267.121496662944 A:C:G A C 10 0.525004097470241 2.62869813372057e-82 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9875094_9875409:CLECL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 66 54 120 31.3497295669641 28.350221263393 2.99950830357108 T:C T C 10 0.525004097470241 0.64784983006414 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 10659799 T/C 0 407 0 407 193.323332329612 0 193.323332329612 T T 10 0.525004097470241 1.37931853499525e-114 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 10853951 G/C 1 339 328 667 161.023610957588 172.201343970239 -11.1777330126508 C:G G C 10 0.525004097470241 0.393855203680667 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10853853_10853952:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10853853_10853952:CSDA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 163 128 291 77.4243321123507 67.2005244761909 10.2238076361599 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.240659230251845 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 10862631 G/A 1 30 17 47 14.2498770758928 8.9250696569941 5.32480741889867 A:G G A 10 0.525004097470241 0.143924545616891 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10862507_10862713:CSDA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 10862632 C/A 1 31 17 48 14.7248729784225 8.9250696569941 5.79980332142843 A:C C A 10 0.525004097470241 0.11157295319663 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10862507_10862713:CSDA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 10999780 C/T 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 T:C C T 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 12630346 G/A 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000111266:ENST00000228862:exon_12628831_12630949:DUSP16;ENSG00000111266:ENST00000298573:exon_12628831_12630949:DUSP16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 6 13 19 2.84997541517855 6.82505326711313 -3.97507785193458 T:G T G 10 0.525004097470241 0.105393524114168 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 32 20 52 15.1998688809523 10.5000819494048 4.69978693154747 T:C C T 10 0.525004097470241 0.212745559260976 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 14924028 A/G 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 58 70 128 27.549762346726 36.7502868229169 -9.20052447619085 C:G C G 10 0.525004097470241 0.111293186182671 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 14943517 C/T 1 62 82 144 29.4497459568451 43.0503359925598 -13.6005900357147 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0242773119104997 ENSG00000084463:ENST00000261167:exon_14943390_14943683:WBP11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 14976063 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 14976178 T/A 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:T T A 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 21654831 G/T 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:G G T 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000111711:ENST00000229314:exon_21654699_21654882:GOLT1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 27867727 G/A 1 24 17 41 11.3999016607142 8.9250696569941 2.47483200372012 A:G G A 10 0.525004097470241 0.532230827662744 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 37 23 60 17.5748483936011 12.0750942418155 5.49975415178554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.195731549537337 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 60 56 116 28.4997541517855 29.4002294583335 -0.90047530654796 A:G G A 10 0.525004097470241 0.92599192224569 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 14 14 28 6.64994263541663 7.35005736458337 -0.700114729166749 T:C T C 10 0.525004097470241 0.851142914584854 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 29521193 A/G 1 18 5 23 8.54992624553566 2.6250204873512 5.92490575818446 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0195670078465095 ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 30789960 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000133704:ENST00000256079:exon_30789916_30790121:IPO8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32135938 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32137512 C/G 1 16 19 35 7.59993444047614 9.97507785193458 -2.37514341145843 C:G C G 10 0.525004097470241 0.499268921016099 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32138410 A/G 1 34 39 73 16.1498606860118 20.4751598013394 -4.32529911532759 A:G A G 10 0.525004097470241 0.348895203246714 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32854366 A/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32854349_32854496:DNM1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32860302 G/A 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32860301_32860347:DNM1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32875406 A/G 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32875361_32875567:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32875361_32875567:DNM1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 65 76 141 30.8747336644343 39.9003114077383 -9.02557774330398 C:G G C 10 0.525004097470241 0.129971256946408 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 65 77 142 30.8747336644343 40.4253155052086 -9.55058184077422 A:T A T 10 0.525004097470241 0.111064427691650 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32908237 C/A 1 9 18 27 4.27496312276783 9.45007375446434 -5.17511063169651 A:C C A 10 0.525004097470241 0.053921247170162 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 32908518 G/A 1 11 11 22 5.22495492782735 5.77504507217265 -0.550090144345303 A:G G A 10 0.525004097470241 0.834225569957072 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 38715000 A/G 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38713963_38723527:ALG10B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 39695445 G/A 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 A:G G A 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39695282_39695481:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39695282_39695481:KIF21A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 46321047 G/A 1 35 32 67 16.6248565885416 16.8001311190477 -0.175274530506147 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 46321417 G/A 1 36 24 60 17.0998524910713 12.6000983392858 4.49975415178554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.301058626448927 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 48174275 C/T 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000211584:ENST00000442218:exon_48173928_48176536:SLC48A1;ENSG00000211584:ENST00000390229:exon_48173928_48175452:SLC48A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 48177906 C/T 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000061273:ENST00000080059:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000354334:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000470668:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000459625:exon_48177862_48179254:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000419356:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000310824:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000380610:exon_48177862_48178000:HDAC7;ENSG00000061273:ENST00000477203:exon_48177862_48178000:HDAC7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 48358057 C/T 1 30 18 48 14.2498770758928 9.45007375446434 4.79980332142843 T:C C T 10 0.525004097470241 0.193675452087076 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48357992_48358206:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48357992_48358098:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48357992_48358206:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000449758:exon_48357992_48358206:TMEM106C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 48539482 T/G 1 115 83 198 54.6245287909223 43.57534009003 11.0491887008923 A:T:G T G 10 0.525004097470241 0.118027804465220 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48539347_48539887:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000312352:exon_48539347_48539488:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000443538:exon_48539347_48539887:PFKM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 49047785 G/A 1 35 33 68 16.6248565885416 17.325135216518 -0.700278627976388 A:G G A 10 0.525004097470241 0.903687295297579 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49046997_49047958:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49047200_49047958:C12orf41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 49048757 G/A 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 49065727 T/C 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 T:C T C 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000357861:exon_49065582_49065745:C12orf41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 49878411 G/A 1 16 25 41 7.59993444047614 13.125102436756 -5.52516799627988 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0876373046277684 ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49878373_49878452:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49878373_49878452:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49878372_49878452:SPATS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 49952668 G/A 1 91 81 172 43.2246271302081 42.5253318950895 0.699295235118548 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.939248735651475 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49952626_49952753:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49952626_49952753:MCRS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 49960551 C/A 1 9 18 27 4.27496312276783 9.45007375446434 -5.17511063169651 A:C C A 10 0.525004097470241 0.053921247170162 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 267 228 495 126.823905975446 119.700934223215 7.1229717522307 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.52897387702948 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 17 18 35 8.0749303430059 9.45007375446434 -1.37514341145843 A:G G A 10 0.525004097470241 0.735698242022473 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 20 15 35 9.49991805059518 7.87506146205362 1.62485658854157 T:C C T 10 0.525004097470241 0.615470018039268 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 11 7 18 5.22495492782735 3.67502868229169 1.54992624553566 A:G G A 10 0.525004097470241 0.490617940005165 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 14 22 36 6.64994263541663 11.5500901443453 -4.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.132185565685893 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 52639302 G/C 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 C:G G C 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000135480:ENST00000331817:exon_52639196_52639416:KRT7;ENSG00000135480:ENST00000422319:exon_52639196_52639416:KRT7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 53605496 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000172819:ENST00000425354:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000327550:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000394426:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000338561:exon_53604354_53605647:RARG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 6 13 19 2.84997541517855 6.82505326711313 -3.97507785193458 T:C C T 10 0.525004097470241 0.105393524114168 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 55368291 C/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 10 14 24 4.74995902529759 7.35005736458337 -2.60009833928578 A:G G A 10 0.525004097470241 0.312688523843871 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56733531 G/A 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000110944:ENST00000228534:exon_56733475_56733621:IL23A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56740682 C/G 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 C:G C G 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740603_56740739:STAT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 14 19 33 6.64994263541663 9.97507785193458 -3.32513521651795 A:G G A 10 0.525004097470241 0.296317161691652 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56862886 T/C 1 5 16 21 2.3749795126488 8.40006555952386 -6.02508604687506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0141293938533866 ENSG00000176422:ENST00000338146:exon_56862823_56864763:SPRYD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 56865338 A/G 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 ENSG00000135423:ENST00000479952:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000390288:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000311966:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000424141:exon_56864736_56865427:GLS2;ENSG00000135423:ENST00000486433:exon_56864738_56865427:GLS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 57146069 T/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:G T G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 237 214 451 112.574028899553 112.350876858632 0.223152040921306 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 57910091 C/A 1 707 677 1384 335.82210308854 355.427773987353 -19.6056708988136 A:C C A 10 0.525004097470241 0.293980656302208 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57910028_57910120:MARS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 59 30 89 28.0247582492558 15.7501229241072 12.2746353251485 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0105157833150515 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 62696599 C/T 1 14 4 18 6.64994263541663 2.10001638988096 4.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0345863775726509 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 62749124 A/T 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:T A T 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62749112_62749256:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62749112_62749256:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62749112_62749256:USP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 6 11 17 2.84997541517855 5.77504507217265 -2.9250696569941 A:T T A 10 0.525004097470241 0.223914944795774 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 332 297 629 157.69863963988 155.926216948662 1.7724226912184 A:G G A 10 0.525004097470241 0.904698727787633 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 231 234 465 109.724053484374 122.850958808036 -13.1269053236621 A:G A G 10 0.525004097470241 0.227564019428725 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 72008421 T/C 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72008315_72008480:ZFC3H1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 76449900 T/C 1 819 872 1691 389.021644171873 457.80357299405 -68.7819288221776 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.000846601066905426 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76449813_76449941:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76449813_76449941:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76449813_76449941:NAP1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 692 521 1213 328.697164550593 273.527134781996 55.1700297685977 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.00155669384087022 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 88505633 A/G 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 A:G A G 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88505471_88505635:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88505471_88505635:CEP290 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 89985004 C/A 1 22 35 57 10.4499098556547 18.3751434114584 -7.92523355580374 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0457583233429046 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_89981828_89985072:ATP2B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 13 11 24 6.17494673288687 5.77504507217265 0.399901660714216 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 94769769 G/A 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94769662_94769793:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94769662_94769793:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397807:exon_94769662_94769793:CCDC41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 95906603 C/A 1 53 84 137 25.1747828340772 44.1003441875002 -18.925561353423 A:C C A 10 0.525004097470241 0.00146209846884551 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95906577_95906692:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95906577_95906692:METAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 102108301 T/C 1 11 7 18 5.22495492782735 3.67502868229169 1.54992624553566 T:C T C 10 0.525004097470241 0.490617940005165 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102108282_102108423:CHPT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 102117589 C/T 1 25 38 63 11.874897563244 19.9501557038692 -8.07525814062518 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0439591863311458 ENSG00000111666:ENST00000229266:exon_102117500_102117625:CHPT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 102158763 T/C 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 102295218 T/C 1 22 78 100 10.4499098556547 40.9503196026788 -30.5004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 5.72472749112950e-10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 102494849 T/C 1 62 33 95 29.4497459568451 17.325135216518 12.1246107403271 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0135036287208454 ENSG00000075188:ENST00000251074:exon_102494810_102494882:NUP37 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 102590771 A/G 1 22 40 62 10.4499098556547 21.0001638988096 -10.5502540431549 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00753269048261992 ENSG00000185480:ENST00000417507:exon_102589729_102591298:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000378128:exon_102589729_102591298:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000412715:exon_102589729_102591298:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000327680:exon_102589729_102591298:C12orf48;ENSG00000185480:ENST00000457614:exon_102589729_102591298:C12orf48;ENSG00000183395:ENST00000329406:exon_102590751_102590949:PMCH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 105546172 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000136051:ENST00000332180:exon_105546121_105546229:KIAA1033 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 105568122 G/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105567075_105568226:APPL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 105568176 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105567075_105568226:APPL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 108086594 C/T 1 47 62 109 22.3248074188987 32.5502540431549 -10.2254466242563 T:C C T 10 0.525004097470241 0.054953882168331 ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108086591_108086676:PWP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 108917318 C/T 1 54 61 115 25.649778736607 32.0252499456847 -6.37547120907771 T:C C T 10 0.525004097470241 0.262551447969137 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108915992_108917411:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108915992_108917411:SART3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 108918146 C/T 1 33 47 80 15.674864783482 24.6751925811013 -9.00032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0563487732977311 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 108923950 A/G 1 62 50 112 29.4497459568451 26.2502048735121 3.19954108333301 A:G A G 10 0.525004097470241 0.57117861585125 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 108956418 T/G 1 29 10 39 13.774881173363 5.25004097470241 8.5248401986606 T:G T G 10 0.525004097470241 0.00619428815663294 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108956294_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000431221:exon_108956382_108956512:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108956382_108956512:ISCU HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 A:G A G 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 55 79 134 26.1247746391367 41.475323700149 -15.3505490610123 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00924116432466553 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 18 19 37 8.54992624553566 9.97507785193458 -1.42515160639892 T:C C T 10 0.525004097470241 0.742546320002449 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 113435450 A/T 1 9 16 25 4.27496312276783 8.40006555952386 -4.12510243675603 A:T A T 10 0.525004097470241 0.111253105674096 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113435325_113435560:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113435325_113435560:OAS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 113448288 A/G 1 104 96 200 49.3995738630949 50.4003933571431 -1.0008194940482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.887693712840748 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113448179_113449528:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113446892_113448503:OAS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 120110201 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000111725:ENST00000229328:exon_120110106_120110269:PRKAB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 120145987 G/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 C:G G C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120145984_120146123:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120145984_120146123:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120145984_120146123:CIT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 120720564 C/T 0 133 0 133 63.1744550364579 0 63.1744550364579 C C 10 0.525004097470241 1.13297051048606e-37 ENSG00000123009:ENST00000242630:exon_120719940_120720632:NME2P1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 120884164 C/T 1 18 7 25 8.54992624553566 3.67502868229169 4.87489756324397 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0696845341074594 ENSG00000170855:ENST00000302432:exon_120884029_120884175:TRIAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 16 11 27 7.59993444047614 5.77504507217265 1.82488936830349 T:C T C 10 0.525004097470241 0.565180073022297 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 24 19 43 11.3999016607142 9.97507785193458 1.42482380877964 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.760602724661103 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121176679 C/T 1 27 29 56 12.8248893683035 15.225118826637 -2.4002294583335 T:C C T 10 0.525004097470241 0.59299606293733 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176623_121176718:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176623_121176718:ACADS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 29 46 75 13.774881173363 24.1501884836311 -10.3753073102681 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0202089018290242 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 A:T T A 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 A:G G A 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 21 14 35 9.97491395312494 7.35005736458337 2.62485658854156 T:C C T 10 0.525004097470241 0.401942910298358 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 4 10 14 1.89998361011904 5.25004097470241 -3.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.106123236614285 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 A:G G A 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 122231573 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122231402_122231594:RHOF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 122468687 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000110987:ENST00000261822:exon_122468606_122468687:BCL7A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 17 10 27 8.0749303430059 5.25004097470241 2.82488936830349 C:G G C 10 0.525004097470241 0.336808455248746 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 48 36 84 22.7998033214284 18.9001475089287 3.89965581249976 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.444786632891558 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 123345736 C/G 1 14 5 19 6.64994263541663 2.6250204873512 4.02492214806542 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0697954757664585 ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123345678_123345739:HIP1R HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 15 10 25 7.12493853794638 5.25004097470241 1.87489756324397 T:C T C 10 0.525004097470241 0.549607407879178 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 123806219 C/T 1 57 57 114 27.0747664441963 29.9252335558037 -2.85046711160748 T:C C T 10 0.525004097470241 0.63944086590312 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123806082_123806279:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123806082_123806279:SBNO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 32 53 85 15.1998688809523 27.8252171659228 -12.6253482849705 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00650102447313276 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 72 75 147 34.1997049821426 39.3753073102681 -5.17560232812543 A:G G A 10 0.525004097470241 0.409583361670071 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 124229429 T/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124229429_124229519:ATP6V0A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 17 27 44 8.0749303430059 14.1751106316965 -6.1001802886906 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0709483733009313 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1998 2142 4140 949.041813254458 1124.55877678126 -175.516963526798 A:T:C:G G C 10 0.525004097470241 5.05198624473026e-08 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 14 5 19 6.64994263541663 2.6250204873512 4.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0697954757664585 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 125465109 G/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 C:G G C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125465036_125465384:DHX37 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 2 7 9 0.949991805059518 3.67502868229169 -2.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0953110686449535 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 30 34 64 14.2498770758928 17.8501393139882 -3.60026223809543 A:G A G 10 0.525004097470241 0.383279514557757 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 132237848 T/C 1 17 5 22 8.0749303430059 2.6250204873512 5.4499098556547 T:C T C 10 0.525004097470241 0.030364560079947 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132237668_132237908:SFSWAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 60 42 102 28.4997541517855 22.0501720937501 6.44958205803541 A:G G A 10 0.525004097470241 0.23405577942658 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 132549300 A/G 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 132562126 G/A 1 24 20 44 11.3999016607142 10.5000819494048 0.899819711309396 A:G G A 10 0.525004097470241 0.88032868218007 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132561946_132565005:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132561946_132565005:EP400 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 A:G G A 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:G G A 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 T T 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 133294371 A/G 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 A:G A G 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294296_133294384:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294296_133294384:PGAM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 133331459 G/C 1 13 2 15 6.17494673288687 1.05000819494048 5.12493853794638 C:G G C 10 0.525004097470241 0.00844003852137795 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 24 21 45 11.3999016607142 11.0250860468751 0.374815613839154 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 12 133768553 A/T 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 A:T A T 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133768494_133768589:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133768494_133768589:ZNF268 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 83 0 83 39.42465990997 0 39.42465990997 A A 10 0.525004097470241 6.07181218586805e-24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 20637071 A/G 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20636986_20637111:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20636986_20637111:ZMYM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 21720956 C/T 1 460 429 889 218.498115163689 225.226757814733 -6.72864265104425 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.662503755047612 ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 23909162 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 25008588 A/G 1 68 68 136 32.2997213720236 35.7002786279764 -3.40055725595278 A:G A G 10 0.525004097470241 0.606648033437566 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 25008630 A/G 1 45 66 111 21.3748156138392 34.6502704330359 -13.2754548191968 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0132225161648883 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 25009099 A/C 1 37 37 74 17.5748483936011 19.4251516063989 -1.85030321279783 A:C A C 10 0.525004097470241 0.727327097352604 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 25020863 G/A 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25020819_25020899:PARP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 T:C T C 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 346 294 640 164.348582275297 154.351204656251 9.99737761904575 C:G G C 10 0.525004097470241 0.452087811441311 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 208 243 451 98.7991477261899 127.575995685269 -28.7768479590787 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.00715158937457881 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 33016603 G/T 1 16 4 20 7.59993444047614 2.10001638988096 5.49991805059518 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0138795629007411 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33016525_33016685:N4BP2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C T C 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 33017937 T/A 1 12 4 16 5.69995083035711 2.10001638988096 3.59993444047614 A:T T A 10 0.525004097470241 0.08265372637292 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33017792_33018267:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33017834_33018263:N4BP2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 33110351 A/G 1 46 38 84 21.8498115163689 19.9501557038692 1.89965581249976 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.743422933161169 ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000267068:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000512755:exon_33109906_33110520:N4BP2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 33110898 A/G 1 37 24 61 17.5748483936011 12.6000983392858 4.9747500543153 A:G A G 10 0.525004097470241 0.248406255361201 ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000267068:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000483088:exon_33110564_33111164:N4BP2L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 63 55 118 29.9247418593748 28.8752253608633 1.04951649851156 A:G G A 10 0.525004097470241 0.854391825489272 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 125 127 252 59.3744878162199 66.6755203787206 -7.30103256250073 A:G G A 10 0.525004097470241 0.377381633608414 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 41382711 A/T 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:T A T 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 42882620 C/T 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42882590_42882745:AKAP11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 68 80 148 32.2997213720236 42.0003277976193 -9.70060642559567 A:G A G 10 0.525004097470241 0.118008486161972 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 85 78 163 40.3746517150295 40.9503196026788 -0.575667887649281 A:C A C 10 0.525004097470241 0.937643976884699 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 15 0 15 7.12493853794638 0 7.12493853794638 G G 10 0.525004097470241 7.75879779297092e-05 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 110 99 209 52.2495492782735 51.9754056495539 0.274143628719628 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 46541673 T/A 1 12 18 30 5.69995083035711 9.45007375446434 -3.75012292410723 A:T T A 10 0.525004097470241 0.201612504132499 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46541639_46542163:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46541639_46542163:ZC3H13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 46562935 A/G 1 21 28 49 9.97491395312494 14.7001147291667 -4.72520077604181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.198758133251434 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46562922_46563232:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46562922_46563232:ZC3H13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 46705032 G/A 1 261 275 536 123.973930560267 144.376126804316 -20.4021962440492 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0835624264963425 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46704949_46705073:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46704949_46705073:LCP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 46708291 T/C 1 224 248 472 106.399082166666 130.20101617262 -23.8019340059538 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0302296927460731 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46708262_46708385:LCP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 330 318 648 156.74864783482 166.951302995537 -10.2026551607162 T:C C T 10 0.525004097470241 0.431613541053909 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 50057097 G/A 1 17 18 35 8.0749303430059 9.45007375446434 -1.37514341145843 A:G G A 10 0.525004097470241 0.735698242022473 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 50080847 A/G 1 29 27 56 13.774881173363 14.1751106316965 -0.400229458333497 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000496623:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000467763:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000485919:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000442195:exon_50080771_50080892:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50080771_50080892:PHF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 518 303 821 246.047877510415 159.076241533483 86.9716359769321 A:G G A 10 0.525004097470241 1.04765314457537e-09 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 19 14 33 9.02492214806542 7.35005736458337 1.67486478348205 T:C T C 10 0.525004097470241 0.604377533937855 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 52313253 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52313185_52313311:WDFY2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 18 19 37 8.54992624553566 9.97507785193458 -1.42515160639892 C:G G C 10 0.525004097470241 0.742546320002449 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 75861001 A/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75858808_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75858809_75861161:TBC1D4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 11 7 18 5.22495492782735 3.67502868229169 1.54992624553566 A:G G A 10 0.525004097470241 0.490617940005165 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 76427347 C/A 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 A:C:G C A 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 80094993 C/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000102471:ENST00000218652:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000377116:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000415404:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000487865:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000465762:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000494647:exon_80094945_80095113:NDFIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 96638636 A/C 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:C A C 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000465196:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376714:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000461329:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000467305:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000397618:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376712:exon_96638587_96638686:UGGT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 71 57 128 33.7247090796129 29.9252335558037 3.79947552380915 A:G G A 10 0.525004097470241 0.536070071328989 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 103524637 T/C 1 33 31 64 15.674864783482 16.2751270215775 -0.600262238095425 T:C T C 10 0.525004097470241 0.900957937352811 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103524548_103524748:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103524548_103524748:ERCC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111176316 T/C 1 13 3 16 6.17494673288687 1.57501229241072 4.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0237907033315813 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111176393 A/G 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:G G T 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 16 13 29 7.59993444047614 6.82505326711313 0.774881173363011 A:G G A 10 0.525004097470241 0.853536524042373 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 196 228 424 93.0991968958328 119.700934223215 -26.6017373273822 T:G T G 10 0.525004097470241 0.00994417179809265 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 62 54 116 29.4497459568451 28.350221263393 1.09952469345204 A:G A G 10 0.525004097470241 0.85305488758851 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 27 29 56 12.8248893683035 15.225118826637 -2.4002294583335 T:C T C 10 0.525004097470241 0.59299606293733 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 31 32 63 14.7248729784225 16.8001311190477 -2.07525814062518 A:G G A 10 0.525004097470241 0.616005441391278 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 113838672 C/T 1 27 14 41 12.8248893683035 7.35005736458337 5.47483200372012 T:C C T 10 0.525004097470241 0.116817525636443 ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000493650:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000463208:exon_113838660_113838797:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000473462:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000475433:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000484641:exon_113838660_113838801:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000480971:exon_113838660_113838801:PCID2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 113851548 A/G 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 A:G A G 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113851333_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113851487_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113851486_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000475433:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000484641:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000480971:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000477095:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000491548:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000462853:exon_113851492_113851557:PCID2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 30 34 64 14.2498770758928 17.8501393139882 -3.60026223809543 A:G A G 10 0.525004097470241 0.383279514557757 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 13 13 26 6.17494673288687 6.82505326711313 -0.650106534226266 T:C C T 10 0.525004097470241 0.84603224725779 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 114157846 G/A 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114157811_114157903:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114157811_114157903:TMCO3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 9 1 10 4.27496312276783 0.525004097470241 3.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0230306542002755 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 114175013 G/A 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 114748709 G/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114747194_114748833:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114747201_114748833:RASA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 17 22 39 8.0749303430059 11.5500901443453 -3.4751598013394 T:C C T 10 0.525004097470241 0.336165519021401 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 22 24 46 10.4499098556547 12.6000983392858 -2.15018848363109 T:C T C 10 0.525004097470241 0.557157218919631 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 163 227 390 77.4243321123507 119.175930125745 -41.751598013394 T:C T C 10 0.525004097470241 2.43888234654255e-05 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115064423 G/A 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000474056:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000493727:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115064315_115064475:UPF3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115090193 G/A 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 13 115091399 T/C 1 26 34 60 12.3498934657737 17.8501393139882 -5.50024584821446 T:C T C 10 0.525004097470241 0.157814892388286 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 50 44 94 23.7497951264879 23.1001802886906 0.649614837797344 T:C T C 10 0.525004097470241 0.918063976384914 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 20915362 G/A 1 77 91 168 36.5746844947914 47.7753728697919 -11.2006883750005 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0892702799982576 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20915207_20915438:OSGEP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 20940515 C/T 1 66 21 87 31.3497295669641 11.0250860468751 20.324643520089 T:C C T 10 0.525004097470241 1.23250091147447e-05 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 20940606 G/A 1 106 31 137 50.3495656681545 16.2751270215775 34.074438646577 A:G G A 10 0.525004097470241 2.79621900207031e-09 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 112 37 149 53.199541083333 19.4251516063989 33.7743894769341 T:C C T 10 0.525004097470241 1.5036382938669e-08 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 60 49 109 28.4997541517855 25.7252007760418 2.77455337574373 A:G G A 10 0.525004097470241 0.632160829088920 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21250212 T/C 1 107 70 177 50.8245615706842 36.7502868229169 14.0742747477673 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0351531487974655 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 19 12 31 9.02492214806542 6.30004916964289 2.72487297842253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.371508072375509 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 17 4 21 8.0749303430059 2.10001638988096 5.97491395312494 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0086794208769431 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 14 1 15 6.64994263541663 0.525004097470241 6.12493853794638 A:C A C 10 0.525004097470241 0.00117307376230243 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 15 0 15 7.12493853794638 0 7.12493853794638 T T 10 0.525004097470241 7.75879779297092e-05 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 21967438 G/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:G G A 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 22963863 C/T 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.184604821888191 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 23020706 C/A 1 287 172 459 136.323824026041 90.3007047648815 46.0231192611594 A:C C A 10 0.525004097470241 1.62399023842337e-05 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 226 257 483 107.349073971726 134.926053049852 -27.5769790781264 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.0122138606185463 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 378 387 765 179.548451156249 203.176585720983 -23.6281345647344 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0889134313784271 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 23237212 G/A 1 63 96 159 29.9247418593748 50.4003933571431 -20.4756514977683 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00141578318077352 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23237167_23237831:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000442110:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23237167_23237380:OXA1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 44 16 60 20.8998197113094 8.40006555952386 12.4997541517855 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00113388469762680 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 24 13 37 11.3999016607142 6.82505326711313 4.57484839360108 C:G G C 10 0.525004097470241 0.141446173765439 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 0 35 0 35 16.6248565885416 0 16.6248565885416 G G 10 0.525004097470241 1.65413238450165e-10 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24435564 C/T 1 16 9 25 7.59993444047614 4.72503687723217 2.87489756324397 T:C C T 10 0.525004097470241 0.317548816463159 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24435492_24435626:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24435492_24435626:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24435492_24435626:DHRS4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24458119 G/A 0 15 0 15 7.12493853794638 0 7.12493853794638 G G 10 0.525004097470241 7.75879779297092e-05 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24458162 G/C 0 20 0 20 9.49991805059518 0 9.49991805059518 G G 10 0.525004097470241 2.87259672131860e-06 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24458236 G/A 0 11 0 11 5.22495492782735 0 5.22495492782735 G G 10 0.525004097470241 0.00111290640690484 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 11 15 26 5.22495492782735 7.87506146205362 -2.65010653422627 A:G G A 10 0.525004097470241 0.330387936784344 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 1606 1504 3110 762.843419462793 789.606162595242 -26.7627431324496 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.341332706459978 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24662177 C/T 1 40 36 76 18.9998361011904 18.9001475089287 0.0996885922616855 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24661854_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000531406:exon_24661854_24662319:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24661919_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24661937_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24662049_24662475:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24662094_24662475:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24661854_24662475:RP11-468E2.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 76 76 152 36.0996885922617 39.9003114077383 -3.80062281547663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.570006648200605 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 58 56 114 27.549762346726 29.4002294583335 -1.85046711160748 T:C T C 10 0.525004097470241 0.778663634437206 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 24901249 A/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:C A C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 25100282 A/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000100453:ENST00000415355:exon_25100160_25100420:GZMB;ENSG00000100453:ENST00000216341:exon_25100161_25100420:GZMB;ENSG00000100453:ENST00000382542:exon_25100177_25100420:GZMB;ENSG00000100453:ENST00000382539:exon_25100177_25100420:GZMB;ENSG00000100453:ENST00000382540:exon_25100177_25100420:GZMB;ENSG00000100453:ENST00000532263:exon_25100220_25100420:GZMB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 41 25 66 19.4748320037201 13.125102436756 6.34972956696409 A:T A T 10 0.525004097470241 0.138855653976948 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 16 9 25 7.59993444047614 4.72503687723217 2.87489756324397 T:C C T 10 0.525004097470241 0.317548816463159 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 31583512 C/T 1 6 16 22 2.84997541517855 8.40006555952386 -5.5500901443453 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0192284907141501 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31583492_31583546:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31583492_31583546:HECTD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 31619392 T/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 31647448 G/A 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 48 56 104 22.7998033214284 29.4002294583335 -6.60042613690507 A:G G A 10 0.525004097470241 0.202911755367035 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 18 8 26 8.54992624553566 4.20003277976193 4.34989346577373 A:G G A 10 0.525004097470241 0.115163241075540 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 35735967 A/G 1 32 38 70 15.1998688809523 19.9501557038692 -4.75028682291687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.282122083939160 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35735933_35736081:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35735933_35736081:KIAA0391 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 996 1075 2071 473.09591891964 564.379404780509 -91.2834858608691 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 6.16749428754443e-05 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 39644498 G/A 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39644425_39644596:PNN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 50081221 A/C 1 204 258 462 96.8991641160708 135.451057147322 -38.5518930312514 A:C A C 10 0.525004097470241 0.000388588028695673 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50080974_50081389:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50080974_50081390:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50080974_50081390:PPIL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 91 75 166 43.2246271302081 39.3753073102681 3.84931981993999 T:C C T 10 0.525004097470241 0.586718448992489 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 C:G G C 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 51225097 T/C 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 30 25 55 14.2498770758928 13.125102436756 1.12477463913674 A:G A G 10 0.525004097470241 0.788635215043384 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 20 19 39 9.49991805059518 9.97507785193458 -0.475159801339398 T:G T G 10 0.525004097470241 0.874473842292273 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 23 23 46 10.9249057581845 12.0750942418155 -1.15018848363109 A:G G A 10 0.525004097470241 0.769203854017533 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 55255673 C/T 1 17 3 20 8.0749303430059 1.57501229241072 6.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00319201685496427 ENSG00000020577:ENST00000305831:exon_55255634_55255730:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000357634:exon_55255634_55255845:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000251091:exon_55255634_55255730:SAMD4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 55529911 C/G 1 71 69 140 33.7247090796129 36.2252827254466 -2.50057364583375 C:G C G 10 0.525004097470241 0.67336336850233 ENSG00000168175:ENST00000395468:exon_55529336_55530043:MAPK1IP1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 57741448 A/G 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 A:G A G 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 57741550 A/G 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 57938124 C/T 1 18 16 34 8.54992624553566 8.40006555952386 0.149860686011806 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 40 44 84 18.9998361011904 23.1001802886906 -4.10034418750024 A:G A G 10 0.525004097470241 0.383891248861043 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 A:G A G 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 16 5 21 7.59993444047614 2.6250204873512 4.97491395312494 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0465833595573011 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C T C 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 60585131 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60585047_60585410:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60585095_60585410:C14orf135 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 60591829 T/C 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 T:C T C 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 60591887 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 125 73 198 59.3744878162199 38.3252991153276 21.0491887008923 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00275549389739547 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64491695 T/C 1 17 10 27 8.0749303430059 5.25004097470241 2.82488936830349 T:C T C 10 0.525004097470241 0.336808455248746 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64496749 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64496763 T/C 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C T C 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64496613_64496777:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64496613_64496777:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:C:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64519455 A/G 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 A:G A G 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64520020 A/G 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 A:G A G 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 11 2 13 5.22495492782735 1.05000819494048 4.17494673288687 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0245694251324368 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64522843 A/G 0 8 0 8 3.79996722023807 0 3.79996722023807 A A 10 0.525004097470241 0.00836297791075555 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 56 32 88 26.5997705416665 16.8001311190477 9.79963942261879 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0421211501114715 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 66028446 A/G 1 5 12 17 2.3749795126488 6.30004916964289 -3.9250696569941 A:G A G 10 0.525004097470241 0.086338764497693 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66028055_66028484:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66028055_66028484:FUT8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 69259662 C/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 69341653 T/A 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 A:T T A 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69340843_69341734:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69340843_69341734:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69340843_69341734:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69341576_69341863:ACTN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 69521345 G/A 1 21 20 41 9.97491395312494 10.5000819494048 -0.525167996279881 A:G G A 10 0.525004097470241 0.877184167059315 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 72055468 A/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 73581011 A/G 1 108 98 206 51.299557473214 51.4504015520836 -0.150844078869646 A:C:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119707:ENST00000261973:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527432:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532683:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000528081:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000532483:exon_73580994_73581041:RBM25;ENSG00000119707:ENST00000527449:exon_73580994_73581041:RBM25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 73678538 A/G 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 A:G A G 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000080815:ENST00000324501:exon_73678477_73678650:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000357710:exon_73678477_73678650:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000344094:exon_73678477_73678650:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000394164:exon_73678477_73678650:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000406768:exon_73678477_73678650:PSEN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 73743367 A/G 1 37 58 95 17.5748483936011 30.450237653274 -12.8753892596729 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0098864513420191 ENSG00000133961:ENST00000355058:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000359560:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000454166:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000356296:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000326018:exon_73741918_73744001:NUMB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 74188164 T/C 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000476562:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000478847:exon_74188000_74188327:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74188000_74188212:C14orf43 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 31 45 76 14.7248729784225 23.6251843861608 -8.90031140773832 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0502275806206687 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 74424938 T/C 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74424850_74424980:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74424850_74424980:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74424850_74424980:COQ6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 39 30 69 18.5248401986606 15.7501229241072 2.77471727455337 A:T T A 10 0.525004097470241 0.547740719162649 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 75359670 G/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G G A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75359537_75359689:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75359537_75359689:DLST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 25 16 41 11.874897563244 8.40006555952386 3.47483200372012 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.348315823129575 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 32 30 62 15.1998688809523 15.7501229241072 -0.550254043154943 T:C T C 10 0.525004097470241 0.899527601839762 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 22 28 50 10.4499098556547 14.7001147291667 -4.25020487351205 A:G G A 10 0.525004097470241 0.258140932058970 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 26 34 60 12.3498934657737 17.8501393139882 -5.50024584821446 T:C T C 10 0.525004097470241 0.157814892388286 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 77926011 C/T 1 98 108 206 46.5495984479164 56.700442526786 -10.1508440788696 T:C C T 10 0.525004097470241 0.163263703395167 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77925959_77926149:AHSA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 77935520 G/A 1 398 374 772 189.048369206844 196.35153245387 -7.30316324702605 A:G G A 10 0.525004097470241 0.613964498472285 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 78140329 G/A 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 A:G G A 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 78140355 T/A 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 A:T T A 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 330 341 671 156.74864783482 179.026397237352 -22.2777494025317 A:C:G A C 10 0.525004097470241 0.0889649628280059 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 12 19 31 5.69995083035711 9.97507785193458 -4.27512702157747 A:G G A 10 0.525004097470241 0.150330566680353 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 90420298 C/T 1 7 22 29 3.32497131770831 11.5500901443453 -8.22511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0024849444019195 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90420250_90420345:C14orf143 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 19 15 34 9.02492214806542 7.87506146205362 1.14986068601181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.7339423545076 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 23 12 35 10.9249057581845 6.30004916964289 4.62485658854156 A:G G A 10 0.525004097470241 0.129709084030044 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 10 12 22 4.74995902529759 6.30004916964289 -1.5500901443453 T:C T C 10 0.525004097470241 0.529662604084724 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 91655458 T/G 1 16 13 29 7.59993444047614 6.82505326711313 0.774881173363011 T:G T G 10 0.525004097470241 0.853536524042373 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91655332_91655514:C14orf159 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 T:C T C 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 182 150 332 86.4492542604161 78.7506146205362 7.69863963987999 T:C T C 10 0.525004097470241 0.410117423645964 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 94526812 C/T 1 228 219 447 108.299065776785 114.975897345983 -6.67683156919774 T:C C T 10 0.525004097470241 0.538337828694679 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94526444_94526959:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94526444_94526959:DDX24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 94563265 C/T 1 21 12 33 9.97491395312494 6.30004916964289 3.67486478348205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.225102762124189 ENSG00000165948:ENST00000298901:exon_94563233_94563311:IFI27L1;ENSG00000165948:ENST00000393115:exon_94563187_94563311:IFI27L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 96180373 C/T 1 125 66 191 59.3744878162199 34.6502704330359 24.724217383184 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000361137994304684 ENSG00000100721:ENST00000216612:exon_96180284_96180533:TCL1A;ENSG00000100721:ENST00000402399:exon_96180284_96180533:TCL1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 24 39 63 11.3999016607142 20.4751598013394 -9.07525814062518 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0232678888034899 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 99876486 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 99927643 A/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99927529_99927677:SETD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 100759046 C/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:C C A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000197119:ENST00000359232:exon_100757448_100759369:SLC25A29;ENSG00000197119:ENST00000392908:exon_100757448_100759369:SLC25A29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 100808726 A/G 1 7 32 39 3.32497131770831 16.8001311190477 -13.4751598013394 A:G A G 10 0.525004097470241 1.43754556536095e-05 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 296 241 537 140.598787148809 126.525987490328 14.0727996584806 A:G G A 10 0.525004097470241 0.226656037242880 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 100847707 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 12 24 36 5.69995083035711 12.6000983392858 -6.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0287271841567151 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 102508439 G/T 1 41 37 78 19.4748320037201 19.4251516063989 0.0496803973212003 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102508350_102508461:DYNC1H1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 60 83 143 28.4997541517855 43.57534009003 -15.0755859382445 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0119882006817309 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 400 485 885 189.998361011904 254.626987273067 -64.6286262611633 A:C:G G A 10 0.525004097470241 1.59416809241645e-05 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 126 164 290 59.8494837187496 86.1006719851195 -26.2511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00219236363721999 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 75 58 133 35.6246926897319 30.450237653274 5.17445503645794 T:C C T 10 0.525004097470241 0.386207177902437 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 341 236 577 161.973602762648 123.900967002977 38.0726357596709 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00152149515119757 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 41 36 77 19.4748320037201 18.9001475089287 0.574684494791441 A:G G A 10 0.525004097470241 0.909725153493828 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 105639473 G/A 1 29 46 75 13.774881173363 24.1501884836311 -10.3753073102681 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0202089018290242 ENSG00000183828:ENST00000339418:exon_105639275_105639598:NUDT14;ENSG00000183828:ENST00000392568:exon_105639276_105639598:NUDT14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106054108 G/A 1 343 9 352 162.923594567707 4.72503687723217 158.198557690475 A:G G A 10 0.525004097470241 4.05371736428023e-82 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 5871 2 5873 2788.70094375222 1.05000819494048 2787.65093555727 C:G C G 10 0.525004097470241 0 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106306841 C/T 1 533 891 1424 253.172816048362 467.778650845985 -214.605834797623 T:C:G C T 10 0.525004097470241 3.57899310856699e-30 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 2355 533 2888 1118.61535045758 279.827183951638 838.788166505944 T:C:G T C 10 0.525004097470241 9.98256529902354e-234 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106494186 T/A 0 0 13 13 0 6.82505326711313 -6.82505326711313 A T A 10 0.525004097470241 6.26568016864116e-05 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106539280 A/G 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.274674059283919 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106586231 C/T 0 55 0 55 26.1247746391367 0 26.1247746391367 C C 10 0.525004097470241 5.08456752653191e-16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106586354 G/C 0 63 0 63 29.9247418593748 0 29.9247418593748 G G 10 0.525004097470241 2.64789710413174e-18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 1 5082 1 5083 2413.92917665624 0.525004097470241 2413.40417255876 A:T:G A T 10 0.525004097470241 0 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 14 107034981 G/C 1 1 22 23 0.474995902529759 11.5500901443453 -11.0750942418155 C:G G C 10 0.525004097470241 1.33410507185776e-06 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 22846932 G/A 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 A:G G A 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22846863_22846952:TUBGCP5;ENSG00000153575:ENST00000453949:exon_22846863_22846952:TUBGCP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 10 14 24 4.74995902529759 7.35005736458337 -2.60009833928578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.312688523843871 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 25154490 A/G 0 238 0 238 113.049024802083 0 113.049024802083 A A 10 0.525004097470241 3.66150482765971e-67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 29561291 C/T 1 42 39 81 19.9498279062499 20.4751598013394 -0.525331895089522 T:C C T 10 0.525004097470241 0.911944558021468 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 34393927 C/T 1 17 21 38 8.0749303430059 11.0250860468751 -2.95015570386916 T:C C T 10 0.525004097470241 0.417117826524397 ENSG00000134153:ENST00000256545:exon_34393805_34394149:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000527822:exon_34393805_34394008:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000532113:exon_34393805_34394028:C15orf24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 948 9 957 450.296115598212 4.72503687723217 445.571078720979 A:C:G C G 10 0.525004097470241 1.20575656429411e-247 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 1046 87 1133 496.845714046128 45.675356479911 451.170357566217 A:G G A 10 0.525004097470241 1.64181438476865e-189 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 1017 100 1117 483.070832872765 52.5004097470241 430.570423125741 T:C:G T C 10 0.525004097470241 1.29180200623238e-172 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40308859 G/T 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 T:G G T 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40308703_40308873:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40308703_40308873:EIF2AK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 136 99 235 64.5994427440472 51.9754056495539 12.6240370944934 A:G G A 10 0.525004097470241 0.102714210279597 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 359 289 648 170.523529008183 151.7261841689 18.7973448392838 A:T:G T G 10 0.525004097470241 0.145577623765222 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40462780 G/A 1 11 3 14 5.22495492782735 1.57501229241072 3.64994263541663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0616618009545916 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40462738_40462831:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40462738_40462882:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40462738_40462882:BUB1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 19 17 36 9.02492214806542 8.9250696569941 0.0998524910713243 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40488917 C/T 1 23 25 48 10.9249057581845 13.125102436756 -2.20019667857157 T:C C T 10 0.525004097470241 0.564916502546702 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40675443 G/T 1 19 13 32 9.02492214806542 6.82505326711313 2.19986888095229 T:G G T 10 0.525004097470241 0.482359714707828 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40675493 C/T 1 16 17 33 7.59993444047614 8.9250696569941 -1.32513521651795 T:C C T 10 0.525004097470241 0.728350885016309 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40675429_40675523:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40675429_40675523:C15orf23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40683702 A/G 1 20 30 50 9.49991805059518 15.7501229241072 -6.25020487351205 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0890666780699122 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40683694_40683755:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40683694_40683755:C15orf23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 75 32 107 35.6246926897319 16.8001311190477 18.8245615706842 A:T T A 10 0.525004097470241 0.000299861121324557 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 41145919 C/T 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41145909_41146127:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41145909_41146079:SPINT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 18 18 36 8.54992624553566 9.45007375446434 -0.900147508928676 C:G G C 10 0.525004097470241 0.86781235843956 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 41679685 G/C 1 43 41 84 20.4248238087796 21.5251679962799 -1.10034418750025 C:G G C 10 0.525004097470241 0.827773609046209 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41679547_41679791:NDUFAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 16 19 35 7.59993444047614 9.97507785193458 -2.37514341145843 A:G A G 10 0.525004097470241 0.499268921016099 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 42235316 C/T 1 14 9 23 6.64994263541663 4.72503687723217 1.92490575818446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.532417104873035 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42235265_42235362:EHD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 42643529 T/C 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42643527_42643630:GANC;ENSG00000092529:ENST00000495723:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000356316:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000466369:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000483208:exon_42643527_42643630:CAPN3;ENSG00000092529:ENST00000337522:exon_42643527_42643630:CAPN3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 27 13 40 12.8248893683035 6.82505326711313 5.99983610119036 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0592010165191699 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 43237572 T/C 1 24 18 42 11.3999016607142 9.45007375446434 1.94982790624988 T:C T C 10 0.525004097470241 0.643631803164977 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43235095_43237668:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43235106_43237668:UBR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 43653322 G/A 1 17 14 31 8.0749303430059 7.35005736458337 0.724872978422528 A:G G A 10 0.525004097470241 0.858468340181549 ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 24 22 46 11.3999016607142 11.5500901443453 -0.150188483631087 A:T A T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 44092928 G/A 1 296 216 512 140.598787148809 113.400885053572 27.1979020952366 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0168214504297469 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44091556_44092982:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44092693_44092982:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44092693_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44092509_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44092621_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44092797_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44092825_44092982:C15orf63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 336 365 701 159.598623249999 191.626495576638 -32.027872326639 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0155215434555522 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 66 66 132 31.3497295669641 34.6502704330359 -3.30054086607181 A:C A C 10 0.525004097470241 0.601391443285792 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 44120559 T/G 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 T:G T G 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44120163_44120564:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44120273_44120564:WDR76 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 A:T A T 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 19 28 47 9.02492214806542 14.7001147291667 -5.67519258110133 A:G A G 10 0.525004097470241 0.108724159744575 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 51000006 G/C 1 200 160 360 94.9991805059518 84.0006555952386 10.9985249107132 A:T:C:G G C 10 0.525004097470241 0.267756942378402 ENSG00000138600:ENST00000261854:exon_50999506_51000071:AC012100.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 90 121 211 42.7496312276783 63.5254957938992 -20.7758645662209 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.00462449929330802 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 56 69 125 26.5997705416665 36.2252827254466 -9.62551218378013 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0891513568486114 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 197 73 270 93.5741927983625 38.3252991153276 55.2488936830349 A:G G A 10 0.525004097470241 7.0906548168651e-12 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 59466359 C/T 1 25 27 52 11.874897563244 14.1751106316965 -2.30021306845253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.579509977985152 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59466325_59466439:MYO1E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 47 51 98 22.3248074188987 26.7752089709823 -4.45040155208362 T:G T G 10 0.525004097470241 0.418584323633201 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 16 26 42 7.59993444047614 13.6501065342263 -6.05017209375012 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0650777886403642 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 40 32 72 18.9998361011904 16.8001311190477 2.19970498214265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.638210318028023 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 17 7 24 8.0749303430059 3.67502868229169 4.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.100334464797444 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 49 32 81 23.2747992239582 16.8001311190477 6.47466810491048 A:G G A 10 0.525004097470241 0.181535632668486 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 23 23 46 10.9249057581845 12.0750942418155 -1.15018848363109 A:T A T 10 0.525004097470241 0.769203854017533 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 65157482 C/T 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 16 19 35 7.59993444047614 9.97507785193458 -2.37514341145843 T:C C T 10 0.525004097470241 0.499268921016099 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 22 20 42 10.4499098556547 10.5000819494048 -0.0501720937501222 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 72502141 G/A 1 1182 1080 2262 561.445156790175 567.00442526786 -5.55926847768512 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 0.816902586920245 ENSG00000067225:ENST00000319622:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000335181:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000419739:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000449901:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000438234:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000434220:exon_72502014_72502187:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000389093:exon_72502014_72502200:PKM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 73027478 T/C 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 60 48 108 28.4997541517855 25.2001966785716 3.29955747321397 T:G G T 10 0.525004097470241 0.563773630551273 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 66 81 147 31.3497295669641 42.5253318950895 -11.1756023281254 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0692879217315842 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 36 33 69 17.0998524910713 17.325135216518 -0.225282725446629 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 8 17 25 3.79996722023807 8.9250696569941 -5.12510243675603 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0456059116156226 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 75012987 G/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140465:ENST00000379727:exon_75011883_75013115:CYP1A1;ENSG00000140465:ENST00000395049:exon_75011883_75013115:CYP1A1;ENSG00000140465:ENST00000395048:exon_75011883_75013115:CYP1A1;ENSG00000140465:ENST00000268062:exon_75011883_75013115:CYP1A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 75182424 C/T 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75182363_75182430:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75182397_75182430:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75182397_75182430:MPI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 74 95 169 35.1496967872022 49.8753892596729 -14.7256924724707 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0253680657306966 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 77241542 T/C 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000117906:ENST00000394885:exon_77241411_77242601:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000320963:exon_77241411_77242201:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000394883:exon_77241411_77242191:RCN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 78295765 T/C 1 10 3 13 4.74995902529759 1.57501229241072 3.17494673288687 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0975258074488578 ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78295647_78295832:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78295647_78295832:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78295647_78295832:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78295647_78295832:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000497942:exon_78295647_78295921:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000472786:exon_78294824_78295832:TBC1D2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 78458638 C/T 1 86 85 171 40.8496476175593 44.6253482849705 -3.77570066741121 T:C C T 10 0.525004097470241 0.592280744659542 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78458492_78458644:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78458492_78458644:IDH3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 14 16 30 6.64994263541663 8.40006555952386 -1.75012292410723 T:C C T 10 0.525004097470241 0.585451127292195 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 1524 1478 3002 723.893755455353 775.956056061016 -52.0623006056635 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.0573797827195842 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 79051759 G/A 1 13 2 15 6.17494673288687 1.05000819494048 5.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00844003852137795 ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79051546_79051920:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79051546_79051920:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79051546_79051920:ADAMTS7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 115 268 383 54.6245287909223 140.701098122025 -86.0765693311023 T:C T C 10 0.525004097470241 8.74878723959618e-19 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 963 941 1904 457.421054136158 494.028855719497 -36.6078015833389 A:T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.093946996232812 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 565 544 1109 268.372684929314 285.602229023811 -17.2295440944973 A:C A C 10 0.525004097470241 0.306717322924677 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 479 405 884 227.523037311755 212.626659475448 14.896377836307 T:C C T 10 0.525004097470241 0.32878610057737 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 81591866 T/C 1 30 41 71 14.2498770758928 21.5251679962799 -7.27529092038711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.095968293220733 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 99 87 186 47.0245943504461 45.675356479911 1.34923787053517 A:G A G 10 0.525004097470241 0.883354631083044 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 82 82 164 38.9496640074402 43.0503359925598 -4.10067198511953 T:G T G 10 0.525004097470241 0.53249648526578 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 92 86 178 43.6996230327378 45.1503523824407 -1.4507293497029 A:G G A 10 0.525004097470241 0.880745214310786 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 33 37 70 15.674864783482 19.4251516063989 -3.75028682291687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.403078104172367 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 82512429 C/G 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 C:G C G 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 83499766 G/A 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83499351_83499831:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83499351_83499831:WHAMM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 83686759 T/C 1 61 40 101 28.9747500543153 21.0001638988096 7.97458615550566 T:C T C 10 0.525004097470241 0.134671633366206 ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 85186837 T/C 1 18 26 44 8.54992624553566 13.6501065342263 -5.1001802886906 T:C T C 10 0.525004097470241 0.132984035701500 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85186014_85186954:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85186014_85186954:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85186719_85186954:WDR73 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 85188839 C/T 1 13 12 25 6.17494673288687 6.30004916964289 -0.125102436756025 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 T:G T G 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 86270398 A/G 1 17 13 30 8.0749303430059 6.82505326711313 1.24987707589277 A:G A G 10 0.525004097470241 0.716684788710682 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86270297_86270478:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86270297_86270478:AKAP13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 86278309 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 86278323 G/A 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 A:G G A 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 18 9 27 8.54992624553566 4.72503687723217 3.82488936830349 T:C C T 10 0.525004097470241 0.177427437087291 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 788 645 1433 374.29677119345 338.627642868305 35.6691283251446 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0603913225492988 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 89182819 G/C 1 671 589 1260 318.722250597468 309.227413409972 9.49483718749633 C:G G C 10 0.525004097470241 0.611661944260576 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 T:C C T 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 22 20 42 10.4499098556547 10.5000819494048 -0.0501720937501222 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 182 229 411 86.4492542604161 120.225938320685 -33.776684060269 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.00091842997583735 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 90226848 G/A 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000166821:ENST00000300056:exon_90224762_90227179:PEX11A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 T:C C T 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 C:G G C 10 0.525004097470241 0.638276163881484 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 68 70 138 32.2997213720236 36.7502868229169 -4.45056545089326 T:C C T 10 0.525004097470241 0.49547275073598 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91346923 C/A 1 35 32 67 16.6248565885416 16.8001311190477 -0.175274530506147 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91346751_91346950:BLM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91354505 C/T 1 56 65 121 26.5997705416665 34.1252663355657 -7.52549579389917 T:C C T 10 0.525004097470241 0.173424955929997 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 C:G G C 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 C:G G C 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 26 22 48 12.3498934657737 11.5500901443453 0.799803321428431 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.885527054056377 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 91543761 C/T 1 21 21 42 9.97491395312494 11.0250860468751 -1.05017209375012 T:C C T 10 0.525004097470241 0.759748339425732 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543720_91543821:VPS33B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 A:C A C 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 44 40 84 20.8998197113094 21.0001638988096 -0.100344187500244 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 36 31 67 17.0998524910713 16.2751270215775 0.824725469493853 C:G C G 10 0.525004097470241 0.902878702840988 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 24 21 45 11.3999016607142 11.0250860468751 0.374815613839154 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 12 14 26 5.69995083035711 7.35005736458337 -1.65010653422627 A:T T A 10 0.525004097470241 0.559872705946098 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 15 9 24 7.12493853794638 4.72503687723217 2.39990166071422 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.414804146453808 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101569467 T/C 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 T:G G T 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 101816795 C/A 1 48 39 87 22.7998033214284 20.4751598013394 2.32464352008903 A:C C A 10 0.525004097470241 0.668174055462244 ENSG00000131871:ENST00000398226:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000531964:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526049:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526043:exon_101816746_101817676:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000528346:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000527833:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000529968:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000524890:exon_101816746_101816880:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000534014:exon_101816638_101816880:AC023024.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 15 6 21 7.12493853794638 3.15002458482145 3.97491395312494 A:G G A 10 0.525004097470241 0.124173724060978 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 15 102264476 C/A 1 8 1 9 3.79996722023807 0.525004097470241 3.27496312276783 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0411787126107114 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 319 448 767 151.523692906993 235.201835666668 -83.6781427596749 C:G C G 10 0.525004097470241 1.69596245016145e-09 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 417691 C/G 1 328 372 700 155.798656029761 195.30152425893 -39.5028682291687 C:G C G 10 0.525004097470241 0.00313145483772532 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 418597 G/C 1 205 163 368 97.3741600186006 85.5756678876493 11.7984921309513 A:C:G G C 10 0.525004097470241 0.230030082624666 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_418501_418626:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_418501_418635:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_418501_418635:MRPL28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 419154 G/A 1 194 128 322 92.1492050907732 67.2005244761909 24.9486806145824 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.00616795686350073 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 420140 G/A 1 200 163 363 94.9991805059518 85.5756678876493 9.42351261830251 A:G G A 10 0.525004097470241 0.344214298451263 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 420179 G/A 1 170 148 318 80.749303430059 77.7006064255957 3.04869700446336 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.736623240876704 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 422158 G/A 1 58 70 128 27.549762346726 36.7502868229169 -9.20052447619085 A:G G A 10 0.525004097470241 0.111293186182671 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_420773_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_421862_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_421864_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_421864_422283:TMEM8A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 13 6 19 6.17494673288687 3.15002458482145 3.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.177129332411914 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 A:G A G 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 735581 G/A 1 20 19 39 9.49991805059518 9.97507785193458 -0.475159801339398 A:G G A 10 0.525004097470241 0.874473842292273 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735257_735597:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735257_735597:WDR24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2025411 G/C 1 27 25 52 12.8248893683035 13.125102436756 -0.300213068452532 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2025602 A/G 1 30 25 55 14.2498770758928 13.125102436756 1.12477463913674 A:G A G 10 0.525004097470241 0.788635215043384 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2026292 T/C 1 46 51 97 21.8498115163689 26.7752089709823 -4.92539745461338 T:C T C 10 0.525004097470241 0.360314392403483 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026212_2026315:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2026891 T/C 1 57 87 144 27.0747664441963 45.675356479911 -18.6005900357147 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00197639336159223 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2027120 G/A 1 53 57 110 25.1747828340772 29.9252335558037 -4.75045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.390787235989436 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2027055_2027285:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 98 91 189 46.5495984479164 47.7753728697919 -1.22577442187555 A:C A C 10 0.525004097470241 0.884314147602307 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2028677 A/G 1 46 61 107 21.8498115163689 32.0252499456847 -10.1754384293158 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0528563112718144 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2048826 C/G 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 C:G C G 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2049640 A/G 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 A:G A G 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2052650 G/A 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2052522_2052733:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2052522_2052733:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2052522_2052733:ZNF598 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2285437 G/A 1 71 85 156 33.7247090796129 44.6253482849705 -10.9006392053576 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0920058320987972 ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2512523 G/A 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512416_2512527:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512416_2512527:C16orf59 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 2514631 C/T 1 30 13 43 14.2498770758928 6.82505326711313 7.42482380877964 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.0313480489900739 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2514523_2514964:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2514523_2514964:C16orf59 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 12 13 25 5.69995083035711 6.82505326711313 -1.12510243675603 T:C C T 10 0.525004097470241 0.692480003939152 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 C:G G C 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 3367229 T/C 1 17 6 23 8.0749303430059 3.15002458482145 4.92490575818446 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0579413582406119 ENSG00000162086:ENST00000293995:exon_3367190_3368574:ZNF75A;ENSG00000162086:ENST00000498240:exon_3367190_3368574:ZNF75A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 C:G C G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G G A 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 3721773 G/C 1 171 182 353 81.2242993325888 95.5507457395839 -14.3264464069951 C:G G C 10 0.525004097470241 0.135605725305489 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3721723_3721792:TRAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 70 56 126 33.2497131770831 29.4002294583335 3.84948371874963 T:G G T 10 0.525004097470241 0.532729752104573 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4411224 C/T 1 25 18 43 11.874897563244 9.45007375446434 2.42482380877964 T:C C T 10 0.525004097470241 0.542046263819895 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4411163_4411249:CORO7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:T A T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 15 6 21 7.12493853794638 3.15002458482145 3.97491395312494 A:T T A 10 0.525004097470241 0.124173724060978 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4748011 C/T 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 T:C C T 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4752134 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4752103_4752243:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4752103_4752243:ANKS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 T:C C T 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 5123201 A/C 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 A:C A C 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5123154_5123257:ALG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 5127460 T/G 1 14 7 21 6.64994263541663 3.67502868229169 2.97491395312494 T:G T G 10 0.525004097470241 0.274430295423959 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127446_5127535:ALG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 5139186 G/C 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 C:G G C 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 C:G C G 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 14 16 30 6.64994263541663 8.40006555952386 -1.75012292410723 A:G G A 10 0.525004097470241 0.585451127292195 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 77 78 155 36.5746844947914 40.9503196026788 -4.37563510788735 C:G C G 10 0.525004097470241 0.520165253728534 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 10837913 C/G 1 44 53 97 20.8998197113094 27.8252171659228 -6.92539745461338 C:G C G 10 0.525004097470241 0.186053245997491 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10837818_10837922:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10837818_10837922:NUBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 278 275 553 132.048860903273 144.376126804316 -12.3272659010433 A:G A G 10 0.525004097470241 0.306885026142 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 11154770 G/A 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.125338991076950 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11154759_11154879:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11154759_11154879:CLEC16A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 42 43 85 19.9498279062499 22.5751761912204 -2.62534828497049 T:C T C 10 0.525004097470241 0.588470618507203 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 49 72 121 23.2747992239582 37.8002950178574 -14.5254957938992 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0105122234106531 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 51 43 94 24.2247910290177 22.5751761912204 1.64961483779734 A:G G A 10 0.525004097470241 0.757591826177601 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 11 18 29 5.22495492782735 9.45007375446434 -4.22511882663699 T:G G T 10 0.525004097470241 0.137500629603524 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 17228368 G/A 1 3 12 15 1.42498770758928 6.30004916964289 -4.87506146205362 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0171251987458088 ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17228330_17228592:XYLT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 15 8 23 7.12493853794638 4.20003277976193 2.92490575818446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.296814718785059 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 7 1 8 3.32497131770831 0.525004097470241 2.79996722023807 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0730511813390402 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 21273412 G/A 1 17 10 27 8.0749303430059 5.25004097470241 2.82488936830349 A:G G A 10 0.525004097470241 0.336808455248746 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21273358_21273479:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21273358_21273479:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21273358_21273479:CRYM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 23480294 C/T 1 36 24 60 17.0998524910713 12.6000983392858 4.49975415178554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.301058626448927 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23480207_23480317:GGA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 85 97 182 40.3746517150295 50.9253974546134 -10.5507457395839 C:G C G 10 0.525004097470241 0.119658150560529 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 187 185 372 88.8242337730649 97.1257580319946 -8.30152425892966 A:G A G 10 0.525004097470241 0.406312271409613 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 25251202 G/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000155592:ENST00000328086:exon_25247326_25252059:ZKSCAN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 27231740 G/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 C:G G C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000155666:ENST00000286096:exon_27231714_27231806:JMJD5;ENSG00000155666:ENST00000441782:exon_27231714_27231806:JMJD5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 120 119 239 56.9995083035711 62.4754875989587 -5.4759792953876 T:C T C 10 0.525004097470241 0.517291262767596 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28123226 G/A 1 19 11 30 9.02492214806542 5.77504507217265 3.24987707589277 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274741464175757 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28123138_28123327:XPO6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 47 47 94 22.3248074188987 24.6751925811013 -2.35038516220266 T:C T C 10 0.525004097470241 0.6798695424969 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28506872 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28507644 C/G 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28508048 A/G 1 7 14 21 3.32497131770831 7.35005736458337 -4.02508604687506 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0846287424702238 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 T:C C T 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28844448 C/A 1 25 29 54 11.874897563244 15.225118826637 -3.35022126339302 A:C:G C A 10 0.525004097470241 0.414172924603392 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28845448 G/A 1 42 36 78 19.9498279062499 18.9001475089287 1.0496803973212 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.821817324982536 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28925731 G/A 1 23 14 37 10.9249057581845 7.35005736458337 3.57484839360108 A:G G A 10 0.525004097470241 0.253832840762598 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28936427 C/A 1 14 2 16 6.64994263541663 1.05000819494048 5.59993444047614 A:C C A 10 0.525004097470241 0.00489757741133102 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28936424_28937073:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28936424_28937073:RABEP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 39 40 79 18.5248401986606 21.0001638988096 -2.47532370014904 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.652554504213172 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 29675114 C/T 1 65 60 125 30.8747336644343 31.5002458482145 -0.625512183780128 T:C C T 10 0.525004097470241 0.92882659619385 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 68 63 131 32.2997213720236 33.0752581406252 -0.775536768601569 T:C C T 10 0.525004097470241 0.930376088632652 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 29755576 A/G 0 0 8 8 0 4.20003277976193 -4.20003277976193 G A G 10 0.525004097470241 0.00259130722660422 ENSG00000185905:ENST00000329410:exon_29753784_29756272:C16orf54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 14 6 20 6.64994263541663 3.15002458482145 3.49991805059518 A:G A G 10 0.525004097470241 0.177763485431309 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 29999225 G/A 1 15 13 28 7.12493853794638 6.82505326711313 0.299885270833252 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30364593 C/T 1 149 132 281 70.7743894769341 69.3005408660718 1.47384861086228 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.904940637556949 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30364502_30364608:CD2BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30364709 G/A 1 150 123 273 71.2493853794638 64.5755039888396 6.6738813906242 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.431281655314952 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30364689_30365121:CD2BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30364805 C/T 1 104 97 201 49.3995738630949 50.9253974546134 -1.52582359151845 T:C C T 10 0.525004097470241 0.832606289410409 ENSG00000169217:ENST00000305596:exon_30364689_30365121:CD2BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 16 15 31 7.59993444047614 7.87506146205362 -0.275127021577472 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30408765 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30409699 C/T 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30536513 G/A 1 19 24 43 9.02492214806542 12.6000983392858 -3.57517619122036 A:G G A 10 0.525004097470241 0.288768991270959 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 8 23 31 3.79996722023807 12.0750942418155 -8.27512702157747 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00345383896646536 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 29 23 52 13.774881173363 12.0750942418155 1.69978693154747 T:C C T 10 0.525004097470241 0.678638833918216 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 31075175 G/A 1 9 2 11 4.27496312276783 1.05000819494048 3.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0690623754843889 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 31092075 G/A 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 31095171 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000151006:ENST00000486499:exon_31094758_31096581:PRSS53 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 31 42 73 14.7248729784225 22.0501720937501 -7.3252991153276 A:G G A 10 0.525004097470241 0.100488131143644 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 31476186 C/G 1 5 16 21 2.3749795126488 8.40006555952386 -6.02508604687506 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0141293938533866 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 46723598 T/C 1 8 1 9 3.79996722023807 0.525004097470241 3.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0411787126107114 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46723558_46723682:ORC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 46731413 T/C 1 28 39 67 13.2998852708333 20.4751598013394 -7.17527453050615 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0870328897540688 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46731370_46732306:ORC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 50261811 A/G 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000121274:ENST00000436909:exon_50261750_50261914:PAPD5;ENSG00000121274:ENST00000357464:exon_50261750_50261914:PAPD5;ENSG00000121274:ENST00000440979:exon_50261750_50261914:PAPD5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 50357569 C/T 1 26 31 57 12.3498934657737 16.2751270215775 -3.92523355580374 T:C C T 10 0.525004097470241 0.353394461675554 ENSG00000166164:ENST00000394688:exon_50357498_50357609:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000394689:exon_50357498_50357609:BRD7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 85 74 159 40.3746517150295 38.8503032127978 1.52434850223168 T:C C T 10 0.525004097470241 0.873883200365738 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 56508765 G/A 1 18 31 49 8.54992624553566 16.2751270215775 -7.72520077604181 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0314288709807922 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56508740_56508862:OGFOD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 T:C C T 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 56855496 C/G 1 18 14 32 8.54992624553566 7.35005736458337 1.19986888095229 C:G C G 10 0.525004097470241 0.725678409930913 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56855416_56855505:NUP93 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 57181471 A/G 1 10 18 28 4.74995902529759 9.45007375446434 -4.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0888132751837173 ENSG00000140848:ENST00000290776:exon_57181463_57181878:CPNE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 57188397 G/A 1 70 74 144 33.2497131770831 38.8503032127978 -5.6005900357147 A:G G A 10 0.525004097470241 0.359729623244947 ENSG00000172775:ENST00000309137:exon_57186387_57188419:FAM192A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 57201130 G/A 1 7 27 34 3.32497131770831 14.1751106316965 -10.8501393139882 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000203298904624002 ENSG00000172775:ENST00000309137:exon_57201005_57201138:FAM192A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 57449006 T/C 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000102970:ENST00000219244:exon_57448993_57449110:CCL17;ENSG00000102970:ENST00000454860:exon_57448993_57449110:CCL17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 57599077 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67696365 G/A 1 27 19 46 12.8248893683035 9.97507785193458 2.84981151636891 A:G G A 10 0.525004097470241 0.46138635759268 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67867739 G/T 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 T:G G T 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67867653_67867799:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67867653_67868003:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67867653_67867799:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67867653_67867799:CENPT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67917958 G/A 1 99 111 210 47.0245943504461 58.2754548191968 -11.2508604687506 A:G G A 10 0.525004097470241 0.128515071972308 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67917859_67918406:EDC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67964203 T/C 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C T C 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964088_67964221:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67963848_67964221:CTRL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 436 328 764 207.098213502975 172.201343970239 34.8968695327358 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0123891503559452 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 537 482 1019 255.072799658481 253.051974980656 2.02082467782438 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.925037748436284 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 68021468 G/C 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 C:G G C 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000167261:ENST00000322384:exon_68021296_68021663:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000268795:exon_68021296_68021663:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000393847:exon_68021297_68021663:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000412757:exon_68021300_68021663:DPEP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 68072004 A/G 1 14 7 21 6.64994263541663 3.67502868229169 2.97491395312494 A:G A G 10 0.525004097470241 0.274430295423959 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68071909_68072052:DUS2L;ENSG00000167264:ENST00000432752:exon_68071909_68072052:DUS2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 68390697 C/T 1 90 96 186 42.7496312276783 50.4003933571431 -7.65076212946483 T:C C T 10 0.525004097470241 0.271325836037845 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 31 34 65 14.7248729784225 17.8501393139882 -3.12526633556567 A:G A G 10 0.525004097470241 0.458178728432291 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 69373414 T/C 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 T:C T C 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 70726795 C/A 1 17 12 29 8.0749303430059 6.30004916964289 1.77488117336301 A:C C A 10 0.525004097470241 0.579376202029318 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 70815838 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70815772_70815906:VAC14;ENSG00000103043:ENST00000254957:exon_70815772_70815906:VAC14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 71318001 G/T 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 T:G G T 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 14 10 24 6.64994263541663 5.25004097470241 1.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.684012711255136 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 C:G C G 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 14 11 25 6.64994263541663 5.77504507217265 0.874897563243974 A:C C A 10 0.525004097470241 0.842085588637267 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 12 3 15 5.69995083035711 1.57501229241072 4.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0385064590919159 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 19 23 42 9.02492214806542 12.0750942418155 -3.05017209375012 A:C C A 10 0.525004097470241 0.358333713723525 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 61 0 61 28.9747500543153 0 28.9747500543153 C C 10 0.525004097470241 9.80790752884472e-18 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 74664825 A/G 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 75269003 G/A 1 24 24 48 11.3999016607142 12.6000983392858 -1.20019667857157 A:G G A 10 0.525004097470241 0.773601261802514 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 75269325 C/T 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 T:C C T 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 270 212 482 128.248893683035 111.300868663691 16.9480250193438 A:G A G 10 0.525004097470241 0.132246100568203 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 75675609 T/C 1 122 125 247 57.9495001086306 65.6255121837801 -7.67601207514954 T:C T C 10 0.525004097470241 0.339643939120514 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75675462_75675621:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75675462_75675621:KARS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 81969847 C/T 1 114 131 245 54.1495328883925 68.7755367686016 -14.626003880209 T:C C T 10 0.525004097470241 0.063675303957582 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81969774_81969983:PLCG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 151 109 260 71.7243812819936 57.2254466242563 14.4989346577373 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0720820003992891 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 82033022 A/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000184860:ENST00000328945:exon_82031257_82033829:SDR42E1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 1 15 10 25 7.12493853794638 5.25004097470241 1.87489756324397 T:C C T 10 0.525004097470241 0.549607407879178 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84088041 G/C 1 17 34 51 8.0749303430059 17.8501393139882 -9.77520897098229 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0072677250883088 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84516309 G/A 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84516198_84516316:KIAA1609 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84522897 G/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84522884_84523028:KIAA1609 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 12 19 31 5.69995083035711 9.97507785193458 -4.27512702157747 A:G A G 10 0.525004097470241 0.150330566680353 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 29 48 77 13.774881173363 25.2001966785716 -11.4253155052086 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0115885265413299 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 23 25 48 10.9249057581845 13.125102436756 -2.20019667857157 T:C C T 10 0.525004097470241 0.564916502546702 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 19 21 40 9.02492214806542 11.0250860468751 -2.00016389880964 T:G T G 10 0.525004097470241 0.531760897822857 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84792371 C/G 1 22 17 39 10.4499098556547 8.9250696569941 1.5248401986606 C:G C G 10 0.525004097470241 0.635382193648771 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84792322_84792413:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84792322_84792413:USP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 84796603 A/G 1 29 35 64 13.774881173363 18.3751434114584 -4.60026223809543 A:G A G 10 0.525004097470241 0.262038420987785 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 A:C A C 10 0.525004097470241 0.125338991076950 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 87782396 C/A 1 27 10 37 12.8248893683035 5.25004097470241 7.57484839360108 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0132589909025670 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87782279_87782415:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87782279_87782415:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87782279_87782415:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87782279_87782415:KLHDC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 87788836 G/A 1 22 8 30 10.4499098556547 4.20003277976193 6.24987707589277 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0271302618884822 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 13 6 19 6.17494673288687 3.15002458482145 3.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.177129332411914 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 87795580 G/C 1 25 20 45 11.874897563244 10.5000819494048 1.37481561383916 C:G G C 10 0.525004097470241 0.765927065630563 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87795555_87795646:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87795555_87795646:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87795555_87795646:KLHDC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88105725 G/A 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000466847:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000481948:exon_88105675_88105818:BANP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88709737 C/T 1 1046 802 1848 496.845714046128 421.053286171133 75.7924278749946 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.000433623330760835 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88709698_88709979:CYBA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88779132 C/T 1 15 18 33 7.12493853794638 9.45007375446434 -2.32513521651795 T:C C T 10 0.525004097470241 0.486906182454096 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 12 23 35 5.69995083035711 12.0750942418155 -6.37514341145844 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0409102305335458 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88779753 C/T 1 24 9 33 11.3999016607142 4.72503687723217 6.67486478348205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0227775539978300 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88780090 G/A 1 19 19 38 9.02492214806542 9.97507785193458 -0.950155703869157 A:G G A 10 0.525004097470241 0.871256227671061 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780055_88780186:CTU2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 50 49 99 23.7497951264879 25.7252007760418 -1.97540564955386 A:G A G 10 0.525004097470241 0.762913560662481 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88871908 A/G 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88873543 C/T 1 30 31 61 14.2498770758928 16.2751270215775 -2.0252499456847 T:C C T 10 0.525004097470241 0.610842868753614 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873459_88873611:CDT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88873790 C/T 1 26 34 60 12.3498934657737 17.8501393139882 -5.50024584821446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.157814892388286 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 88874655 C/T 0 195 0 195 92.624200993303 0 92.624200993303 C C 10 0.525004097470241 3.50230666543934e-55 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89293890 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89294044 A/G 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89294184 G/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G G A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89294381 T/C 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C T C 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89294439 G/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:G G T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89294511 C/T 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89347862 G/C 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 C:G G C 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 A:G A G 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 89866043 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 90102835 A/G 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 16 90109711 A/G 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 A:G G A 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 165 136 301 78.3743239174102 71.4005572559528 6.97376666145746 A:G G A 10 0.525004097470241 0.453166843185316 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 146 160 306 69.3494017693448 84.0006555952386 -14.6512538258937 A:G G A 10 0.525004097470241 0.097037586163532 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 649164 G/A 1 15 9 24 7.12493853794638 4.72503687723217 2.39990166071422 A:G G A 10 0.525004097470241 0.414804146453808 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 15 21 36 7.12493853794638 11.0250860468751 -3.90014750892868 A:T T A 10 0.525004097470241 0.242570652607124 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 19 15 34 9.02492214806542 7.87506146205362 1.14986068601181 C:G G C 10 0.525004097470241 0.7339423545076 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 685752 G/A 1 20 14 34 9.49991805059518 7.35005736458337 2.14986068601181 A:G G A 10 0.525004097470241 0.496235271064969 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685696_685794:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1494567 G/A 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 A:G G A 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1538714 T/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1637074 A/G 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G A G 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1733399 A/G 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1733266_1733420:RPA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 50 56 106 23.7497951264879 29.4002294583335 -5.65043433184555 T:C C T 10 0.525004097470241 0.28569014216378 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 1943888 T/C 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C T C 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 2597278 G/A 1 21 22 43 9.97491395312494 11.5500901443453 -1.57517619122036 A:G G A 10 0.525004097470241 0.649848981747698 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2597194_2597333:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2597194_2597333:KIAA0664 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 3631241 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000083457:ENST00000263087:exon_3631213_3631320:ITGAE;ENSG00000083457:ENST00000397107:exon_3631213_3631320:ITGAE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4574751 T/A 1 164 126 290 77.8993280148805 66.1505162812504 11.7488117336301 A:T T A 10 0.525004097470241 0.176379327339150 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574680_4574826:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574680_4574826:PELP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 47 52 99 22.3248074188987 27.3002130684525 -4.97540564955386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.365186000344031 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4585821 G/A 1 12 9 21 5.69995083035711 4.72503687723217 0.974913953124939 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827768170148087 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4585797_4585868:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4585797_4585868:PELP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 38 33 71 18.0498442961308 17.325135216518 0.724709079612889 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.905759648546088 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4796274 T/C 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 4844242 C/T 1 38 32 70 18.0498442961308 16.8001311190477 1.24971317708313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.81144602154692 ENSG00000108523:ENST00000262482:exon_4843782_4844288:RNF167;ENSG00000108523:ENST00000381350:exon_4843913_4844288:RNF167 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 54 39 93 25.649778736607 20.4751598013394 5.17461893526759 A:G A G 10 0.525004097470241 0.30033320003889 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 53 38 91 25.1747828340772 19.9501557038692 5.22462713020807 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.294760196274403 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 36 15 51 17.0998524910713 7.87506146205362 9.22479102901771 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0110680014739877 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 35 10 45 16.6248565885416 5.25004097470241 11.3748156138392 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00081198317714082 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 41 9 50 19.4748320037201 4.72503687723217 14.7497951264879 T:C T C 10 0.525004097470241 2.35367578940132e-05 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 38 15 53 18.0498442961308 7.87506146205362 10.1747828340772 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0055775670012944 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 485 399 884 230.373012726933 209.476634890626 20.8963778363069 A:G A G 10 0.525004097470241 0.167344604504317 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 396 291 687 188.098377401785 152.77619236384 35.3221850379444 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00745375505869903 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 73 42 115 34.6747008846724 22.0501720937501 12.6245287909223 A:T T A 10 0.525004097470241 0.0194573839698405 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 133 109 242 63.1744550364579 57.2254466242563 5.94900841220167 T:C C T 10 0.525004097470241 0.479043413592837 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 155 144 299 73.6243648921126 75.6005900357147 -1.97622514360206 C:G C G 10 0.525004097470241 0.817183315429087 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5338269 T/C 1 183 204 387 86.9242501629459 107.100835883929 -20.1765857209833 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0417424510823578 ENSG00000108561:ENST00000225698:exon_5338193_5338286:C1QBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5392173 A/C 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 A:C A C 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 5462240 C/T 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 6483046 T/C 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6481646_6483184:KIAA0753 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 8 16 24 3.79996722023807 8.40006555952386 -4.60009833928578 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.0673126116773261 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7139412 G/A 1 111 77 188 52.7245451808032 40.4253155052086 12.2992296755947 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0795254617408274 ENSG00000040633:ENST00000320316:exon_7139249_7140086:PHF23;ENSG00000040633:ENST00000454255:exon_7139249_7139885:PHF23;ENSG00000040633:ENST00000043410:exon_7139407_7139431:PHF23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7161956 G/A 1 50 56 106 23.7497951264879 29.4002294583335 -5.65043433184555 A:G G A 10 0.525004097470241 0.28569014216378 ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7161907_7163250:C17orf81 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 53 43 96 25.1747828340772 22.5751761912204 2.59960664285686 A:G A G 10 0.525004097470241 0.61094620291174 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7251605 G/C 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 C:G G C 10 0.525004097470241 0.293975731308556 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 26 27 53 12.3498934657737 14.1751106316965 -1.82521716592277 T:C C T 10 0.525004097470241 0.680560997846566 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7411770 C/T 1 18 20 38 8.54992624553566 10.5000819494048 -1.95015570386916 T:C C T 10 0.525004097470241 0.626675337426101 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7411570_7411794:POLR2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 19 20 39 9.02492214806542 10.5000819494048 -1.4751598013394 C:G G C 10 0.525004097470241 0.74894974708352 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 34 14 48 16.1498606860118 7.35005736458337 8.79980332142843 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0132840268600707 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7754993 G/A 1 10 5 15 4.74995902529759 2.6250204873512 2.12493853794639 A:G G A 10 0.525004097470241 0.310879488899670 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754966_7755114:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754966_7755114:KDM6B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 177 135 312 84.0742747477673 70.8755531584825 13.1987215892848 A:G A G 10 0.525004097470241 0.140651285849068 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 7850976 A/G 1 38 29 67 18.0498442961308 15.225118826637 2.82472546949385 A:G A G 10 0.525004097470241 0.541583122222804 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7850889_7851040:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7850889_7851040:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7850889_7851040:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7850889_7851040:CNTROB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8046680 G/A 0 11 0 11 5.22495492782735 0 5.22495492782735 G G 10 0.525004097470241 0.00111290640690484 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8046737 C/T 1 11 5 16 5.22495492782735 2.6250204873512 2.59993444047614 T:C C T 10 0.525004097470241 0.219246573425815 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 T:C T C 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:T T A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8135444 C/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 C:G C G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8135221_8135545:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8135221_8135545:C17orf68 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8138569 C/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 C:G C G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8138371_8138603:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8138371_8138603:C17orf68 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 46 32 78 21.8498115163689 16.8001311190477 5.0496803973212 T:C C T 10 0.525004097470241 0.259415180203576 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 69 59 128 32.7747172745534 30.9752417507442 1.79947552380915 T:G T G 10 0.525004097470241 0.790911649074572 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 9846521 G/C 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 C:G G C 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000007237:ENST00000323816:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000396115:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000437099:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000432992:exon_9846438_9846553:GAS7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 78 68 146 37.0496803973212 35.7002786279764 1.34940176934482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.868497839903801 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 11 11 22 5.22495492782735 5.77504507217265 -0.550090144345303 A:G G A 10 0.525004097470241 0.834225569957072 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 T:C T C 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 34 24 58 16.1498606860118 12.6000983392858 3.54976234672602 A:G A G 10 0.525004097470241 0.361153408463016 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 33 20 53 15.674864783482 10.5000819494048 5.17478283407723 A:C A C 10 0.525004097470241 0.170244798038353 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16336828 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 88 67 155 41.7996394226188 35.1752745305062 6.62436489211264 C:G C G 10 0.525004097470241 0.296726747792767 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.567248179936242 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.840421955114944 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 12 14 26 5.69995083035711 7.35005736458337 -1.65010653422627 C:G G C 10 0.525004097470241 0.559872705946098 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 501 530 1031 237.972947167409 278.252171659228 -40.2792244918185 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.0125821955265136 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 16855878 C/T 1 115 109 224 54.6245287909223 57.2254466242563 -2.60091783333399 T:C C T 10 0.525004097470241 0.738405479221934 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16855760_16855897:TNFRSF13B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 C:G C G 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 17394611 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000141026:ENST00000268711:exon_17394593_17396535:MED9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 15 10 25 7.12493853794638 5.25004097470241 1.87489756324397 T:C C T 10 0.525004097470241 0.549607407879178 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 17720419 G/C 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 C:G G C 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 9 18 27 4.27496312276783 9.45007375446434 -5.17511063169651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.053921247170162 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 10 12 22 4.74995902529759 6.30004916964289 -1.5500901443453 T:C C T 10 0.525004097470241 0.529662604084724 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 192 181 373 91.1992132857137 95.0257416421136 -3.8265283563999 A:G G A 10 0.525004097470241 0.716764075232209 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 18148965 G/A 1 179 154 333 85.0242665528269 80.8506310104171 4.17363554240974 A:G G A 10 0.525004097470241 0.660997898242124 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 18181592 C/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 18194248 C/T 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18194156_18194341:TOP3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 34 38 72 16.1498606860118 19.9501557038692 -3.80029501785735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.409407318508903 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 38 27 65 18.0498442961308 14.1751106316965 3.87473366443434 A:T:G A T 10 0.525004097470241 0.38512494488967 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 13 5 18 6.17494673288687 2.6250204873512 3.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.103690377865023 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 20911204 G/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20911183_20911309:USP22;ENSG00000124422:ENST00000478443:exon_20911183_20911309:USP22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 23 0 23 10.9249057581845 0 10.9249057581845 T T 10 0.525004097470241 4.02852423161511e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 1 22 1 23 10.4499098556547 0.525004097470241 9.92490575818446 T:C T C 10 0.525004097470241 8.95484154394984e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 22 0 22 10.4499098556547 0 10.4499098556547 G G 10 0.525004097470241 7.7467803710883e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 22 0 22 10.4499098556547 0 10.4499098556547 G G 10 0.525004097470241 7.7467803710883e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 22 1 23 10.4499098556547 0.525004097470241 9.92490575818446 A:C C A 10 0.525004097470241 8.95484154394984e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 53 0 53 25.1747828340772 0 25.1747828340772 C C 10 0.525004097470241 1.91060196745239e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 50 0 50 23.7497951264879 0 23.7497951264879 C C 10 0.525004097470241 1.40325492798787e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 35 0 35 16.6248565885416 0 16.6248565885416 C C 10 0.525004097470241 1.65413238450165e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 45 0 45 21.3748156138392 0 21.3748156138392 C C 10 0.525004097470241 3.98801254089475e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 47 0 47 22.3248074188987 0 22.3248074188987 G G 10 0.525004097470241 1.04162073284275e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 71 0 71 33.7247090796129 0 33.7247090796129 G G 10 0.525004097470241 1.44193731638393e-20 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 16 45 61 7.59993444047614 23.6251843861608 -16.0252499456847 A:G G A 10 0.525004097470241 4.86307717719599e-05 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 26519204 C/T 1 14 5 19 6.64994263541663 2.6250204873512 4.02492214806542 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0697954757664585 ENSG00000087095:ENST00000407008:exon_26519146_26519239:NLK;ENSG00000087095:ENST00000262393:exon_26519146_26519239:NLK;ENSG00000087095:ENST00000496808:exon_26519146_26519239:NLK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27009749 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27009745_27009874:SUPT6H;ENSG00000109111:ENST00000347486:exon_27009745_27009874:SUPT6H HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 95 89 184 45.1246107403271 46.7253646748514 -1.60075393452434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.825086303696532 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 92 86 178 43.6996230327378 45.1503523824407 -1.4507293497029 T:C C T 10 0.525004097470241 0.880745214310786 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27401010 G/A 1 94 67 161 44.6496148377973 35.1752745305062 9.47434030729119 A:G G A 10 0.525004097470241 0.155284378275238 ENSG00000196535:ENST00000529578:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000221995:ENST00000408971:exon_27400870_27401217:TIAF1;ENSG00000221995:ENST00000511177:exon_27400873_27401217:TIAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 27424316 G/A 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 A:G G A 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424241_27424368:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533652:exon_27423915_27424371:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424164_27424368:MYO18A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 29161503 A/G 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 26 23 49 12.3498934657737 12.0750942418155 0.27479922395819 A:T T A 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33269648 C/G 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 C:G C G 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000132141:ENST00000436961:exon_33269503_33269662:CCT6B;ENSG00000132141:ENST00000314144:exon_33269503_33269662:CCT6B;ENSG00000132141:ENST00000421975:exon_33269503_33269662:CCT6B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33328416 A/G 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 A:G A G 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33328276_33328422:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33328276_33328422:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33328276_33328422:LIG3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33329049 G/A 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33328928_33329123:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33328928_33329123:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33328928_33329123:LIG3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33592323 C/G 1 3 25 28 1.42498770758928 13.125102436756 -11.7001147291667 C:G C G 10 0.525004097470241 4.74009405722883e-06 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33772550 C/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33771634_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33772392_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33771634_33773029:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000524511:exon_33772381_33772712:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000531588:exon_33772467_33772712:SLFN13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33951487 G/A 1 11 15 26 5.22495492782735 7.87506146205362 -2.65010653422627 A:G G A 10 0.525004097470241 0.330387936784344 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33951416_33951606:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33951416_33951606:AP2B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 33998802 G/C 1 17 7 24 8.0749303430059 3.67502868229169 4.39990166071422 C:G G C 10 0.525004097470241 0.100334464797444 ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:G A G 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 135 126 261 64.1244468415175 66.1505162812504 -2.02606943973289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.804562472588884 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 35346641 T/C 1 79 78 157 37.524676299851 40.9503196026788 -3.42564330282784 T:C T C 10 0.525004097470241 0.631767654923071 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35346546_35346710:AATF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 35771437 C/A 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:C C A 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000108264:ENST00000394395:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000490992:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000225396:exon_35771356_35771477:TADA2A;ENSG00000108264:ENST00000417170:exon_35771356_35771477:TADA2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 25 29 54 11.874897563244 15.225118826637 -3.35022126339302 C:G C G 10 0.525004097470241 0.414172924603392 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 36453208 T/C 1 26 39 65 12.3498934657737 20.4751598013394 -8.12526633556566 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0470768756376417 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36452990_36453215:MRPL45 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 36478450 G/T 1 72 74 146 34.1997049821426 38.8503032127978 -4.65059823065518 T:G G T 10 0.525004097470241 0.45658239056546 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36478392_36479101:MRPL45 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 15 13 28 7.12493853794638 6.82505326711313 0.299885270833252 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 404 400 804 191.898344622023 210.001638988096 -18.1032943660738 A:T A T 10 0.525004097470241 0.203790862690999 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 37074932 C/T 1 15 18 33 7.12493853794638 9.45007375446434 -2.32513521651795 T:C C T 10 0.525004097470241 0.486906182454096 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 38556799 G/A 1 49 57 106 23.2747992239582 29.9252335558037 -6.65043433184555 A:G G A 10 0.525004097470241 0.206903396291169 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38556781_38556915:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38556781_38556915:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38556781_38556915:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38556781_38556915:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38556781_38556915:TOP2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 72 35 107 34.1997049821426 18.3751434114584 15.8245615706842 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00253540465838397 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 69 38 107 32.7747172745534 19.9501557038692 12.8245615706842 A:T:C T A 10 0.525004097470241 0.0151753134089358 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 40043953 G/A 1 32 28 60 15.1998688809523 14.7001147291667 0.499754151785538 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40043852_40043956:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40043852_40043956:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40043852_40043956:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40043852_40043956:ACLY HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 40125864 G/A 1 49 45 94 23.2747992239582 23.6251843861608 -0.350385162202656 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 T:C T C 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 40263400 C/T 0 8 0 8 3.79996722023807 0 3.79996722023807 C C 10 0.525004097470241 0.00836297791075555 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40263314_40263515:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40263396_40263515:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000413196:exon_40263314_40263515:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000430773:exon_40263314_40263515:DHX58 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 40820246 G/A 1 79 81 160 37.524676299851 42.5253318950895 -5.00065559523856 A:G G A 10 0.525004097470241 0.430032309849283 ENSG00000068137:ENST00000293349:exon_40819937_40820321:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000412503:exon_40819937_40820321:PLEKHH3;ENSG00000068137:ENST00000456950:exon_40819937_40820321:PLEKHH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 C:G C G 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C C T 10 0.525004097470241 0.614062975057572 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 42235239 C/G 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42235201_42235309:C17orf53 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 54 64 118 25.649778736607 33.6002622380954 -7.95048350148844 T:C C T 10 0.525004097470241 0.166526365195303 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 42398052 A/G 1 142 115 257 67.4494181592258 60.3754712090777 7.07394695014806 A:G A G 10 0.525004097470241 0.382674620531547 ENSG00000013306:ENST00000225308:exon_42397990_42398099:SLC25A39;ENSG00000013306:ENST00000377095:exon_42397990_42398099:SLC25A39 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 42927721 G/A 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000131097:ENST00000253410:exon_42927700_42927840:HIGD1B;ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42927655_42928737:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42927655_42928737:EFTUD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 44108906 A/G 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:G A G 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000120071:ENST00000432791:exon_44107334_44109069:KIAA1267;ENSG00000120071:ENST00000262419:exon_44107334_44109069:KIAA1267 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 26 28 54 12.3498934657737 14.7001147291667 -2.35022126339302 A:G G A 10 0.525004097470241 0.586382753061085 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 73 78 151 34.6747008846724 40.9503196026788 -6.27561871800639 T:C T C 10 0.525004097470241 0.328474726726319 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45822579 G/A 1 14 16 30 6.64994263541663 8.40006555952386 -1.75012292410723 A:G G A 10 0.525004097470241 0.585451127292195 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45915288 G/A 1 71 20 91 33.7247090796129 10.5000819494048 23.2246271302081 A:G G A 10 0.525004097470241 7.95026589801935e-07 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915049_45915368:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45917703 C/T 1 26 12 38 12.3498934657737 6.30004916964289 6.04984429613084 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0522834085115929 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45917557_45917738:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45917557_45917738:SCRN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 10 24 34 4.74995902529759 12.6000983392858 -7.85013931398819 T:G G T 10 0.525004097470241 0.00909353495788888 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 64 39 103 30.3997377619046 20.4751598013394 9.92457796056518 A:T:C:G G C 10 0.525004097470241 0.0603602134323479 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 39 40 79 18.5248401986606 21.0001638988096 -2.47532370014904 T:C C T 10 0.525004097470241 0.652554504213172 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 284 224 508 134.898836318452 117.600917833334 17.2979184851175 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.130926514913749 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 47788755 G/A 1 29 32 61 13.774881173363 16.8001311190477 -3.0252499456847 A:G G A 10 0.525004097470241 0.445118158842925 ENSG00000121104:ENST00000240364:exon_47787694_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000513602:exon_47788357_47788917:FAM117A;ENSG00000121104:ENST00000503573:exon_47788707_47788917:FAM117A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 48626811 C/T 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 T:C C T 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48626647_48626848:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48626647_48626848:SPATA20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 22 12 34 10.4499098556547 6.30004916964289 4.14986068601181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.171885600454105 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 23 26 49 10.9249057581845 13.6501065342263 -2.72520077604181 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.476031187030533 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 49043640 T/C 1 21 27 48 9.97491395312494 14.1751106316965 -4.20019667857157 T:C T C 10 0.525004097470241 0.248962696608899 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 55028170 C/T 1 32 39 71 15.1998688809523 20.4751598013394 -5.27529092038711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.235092520313634 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 30 30 60 14.2498770758928 15.7501229241072 -1.50024584821446 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.700660689771694 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 61888461 G/A 1 18 19 37 8.54992624553566 9.97507785193458 -1.42515160639892 A:G G A 10 0.525004097470241 0.742546320002449 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61888436_61888533:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61888436_61888533:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61888436_61888533:DDX42 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 191 183 374 90.724217383184 96.0757498370541 -5.35153245387013 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.604731768002796 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 62476451 C/G 1 34 25 59 16.1498606860118 13.125102436756 3.02475824925578 C:G C G 10 0.525004097470241 0.438204975624076 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 65528944 C/T 1 13 5 18 6.17494673288687 2.6250204873512 3.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.103690377865023 ENSG00000154217:ENST00000299954:exon_65528918_65529066:PITPNC1;ENSG00000154217:ENST00000335257:exon_65528918_65529066:PITPNC1;ENSG00000154217:ENST00000423236:exon_65528918_65529066:PITPNC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 323 295 618 153.423676517112 154.876208753721 -1.45253223660896 A:T T A 10 0.525004097470241 0.935806395743919 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 66416357 C/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000141337:ENST00000452479:exon_66416330_66417000:ARSG;ENSG00000141337:ENST00000355179:exon_66416330_66418872:ARSG;ENSG00000141337:ENST00000448504:exon_66416330_66418872:ARSG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 71197439 C/T 1 9 11 20 4.27496312276783 5.77504507217265 -1.50008194940482 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512362550711290 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 71243508 C/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71243380_71245091:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71243380_71245091:C17orf80 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 72480288 G/A 1 155 177 332 73.6243648921126 92.9257252522327 -19.30136036012 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.0366760475999898 ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72480140_72480927:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72480140_72480933:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72480140_72480929:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72480140_72480306:CD300A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 24 28 52 11.3999016607142 14.7001147291667 -3.30021306845253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.405619485745815 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73008804 G/T 1 35 26 61 16.6248565885416 13.6501065342263 2.9747500543153 T:G G T 10 0.525004097470241 0.521904452782834 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73008776_73008967:ICT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 116 111 227 55.099524693452 58.2754548191968 -3.17593012574471 T:C C T 10 0.525004097470241 0.69041367686899 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73016637 C/A 1 117 106 223 55.5745205959818 55.6504343318455 -0.0759137358637432 A:C:G C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73035107 A/G 1 888 955 1843 421.796361446426 501.37891308408 -79.5825516376542 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.000226813138118268 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73034955_73035158:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73034955_73035158:ATP5H HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 216 265 481 102.599114946428 139.126085829614 -36.5269708831859 T:C T C 10 0.525004097470241 0.000992462611722157 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 A:G A G 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73230796 T/C 1 82 81 163 38.9496640074402 42.5253318950895 -3.57566788764929 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.583905672786996 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73234828 A/G 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G A G 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73234733_73234843:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73234733_73234843:GGA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73263012 C/T 1 35 46 81 16.6248565885416 24.1501884836311 -7.52533189508952 T:C C T 10 0.525004097470241 0.096392190504462 ENSG00000125457:ENST00000245551:exon_73262313_73263048:MIF4GD;ENSG00000125457:ENST00000325102:exon_73263000_73263035:MIF4GD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73279624 A/G 1 19 22 41 9.02492214806542 11.5500901443453 -2.52516799627988 A:G A G 10 0.525004097470241 0.439272768938261 ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73279504_73279674:SLC25A19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 C:G C G 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73513677 A/C 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:C A C 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513638_73513736:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513638_73513736:TSEN54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 18 6 24 8.54992624553566 3.15002458482145 5.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.038808670782203 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73520485 G/C 1 50 51 101 23.7497951264879 26.7752089709823 -3.02541384449434 C:G G C 10 0.525004097470241 0.551815866352563 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73520343_73520820:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73520454_73520656:TSEN54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73625210 C/T 1 13 4 17 6.17494673288687 2.10001638988096 4.0749303430059 T:C C T 10 0.525004097470241 0.053781933209421 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73625231 G/A 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73831594 G/A 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831490_73831610:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831490_73831610:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831490_73831610:UNC13D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73843040 G/A 1 45 46 91 21.3748156138392 24.1501884836311 -2.77537286979193 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.600291880482344 ENSG00000132471:ENST00000254806:exon_73842989_73843065:WBP2;ENSG00000132471:ENST00000433525:exon_73842989_73843065:WBP2;ENSG00000132471:ENST00000431190:exon_73843013_73843065:WBP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73843629 C/T 1 21 25 46 9.97491395312494 13.125102436756 -3.15018848363109 T:C C T 10 0.525004097470241 0.378211437553437 ENSG00000132471:ENST00000254806:exon_73843568_73843690:WBP2;ENSG00000132471:ENST00000433525:exon_73843568_73843690:WBP2;ENSG00000132471:ENST00000416574:exon_73843476_73843690:WBP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 73897344 G/A 1 56 47 103 26.5997705416665 24.6751925811013 1.92457796056517 A:G G A 10 0.525004097470241 0.767464817080585 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477371:exon_73897282_73897505:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000471434:exon_73897282_73897598:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73897264_73898001:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000494179:exon_73897318_73898001:MRPL38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 74261677 T/C 1 83 76 159 39.42465990997 39.9003114077383 -0.475651497768318 T:C T C 10 0.525004097470241 0.936941082127686 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74261283_74261706:FAM100B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 22 18 40 10.4499098556547 9.45007375446434 0.999836101190359 T:C T C 10 0.525004097470241 0.874474925112685 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 32 32 64 15.1998688809523 16.8001311190477 -1.60026223809543 C:G C G 10 0.525004097470241 0.70884731704868 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 74474902 C/T 1 2 7 9 0.949991805059518 3.67502868229169 -2.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0953110686449535 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 74732507 A/G 1 212 177 389 100.699131336309 92.9257252522327 7.77340608407624 A:G A G 10 0.525004097470241 0.446551457011384 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74730201_74732546:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732236_74732546:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732236_74732546:SRSF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 20 13 33 9.49991805059518 6.82505326711313 2.67486478348205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.387204384876348 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 75398498 C/T 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75398134_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000407798:exon_75398140_75398550:SEPT9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 75483528 C/T 1 53 45 98 25.1747828340772 23.6251843861608 1.54959844791638 T:C C T 10 0.525004097470241 0.762801353965666 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 154 102 256 73.1493689895829 53.5504179419646 19.5989510476183 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0146138278234230 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76120638 G/A 1 24 13 37 11.3999016607142 6.82505326711313 4.57484839360108 A:G G A 10 0.525004097470241 0.141446173765439 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120605_76120862:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120605_76120862:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120605_76120862:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120605_76120862:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120605_76120862:TMC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76121864 A/G 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121807_76121965:TMC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76171215 G/A 1 87 95 182 41.324643520089 49.8753892596729 -8.55074573958386 A:G G A 10 0.525004097470241 0.207888622433539 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76171131_76171250:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76171131_76171250:TK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 0 0 154 154 0 80.8506310104171 -80.8506310104171 C T C 10 0.525004097470241 1.62270264583300e-50 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76219611 C/T 1 61 53 114 28.9747500543153 27.8252171659228 1.14953288839252 T:C C T 10 0.525004097470241 0.851693418652834 ENSG00000089685:ENST00000374948:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000301633:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000350051:exon_76219546_76221715:BIRC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76798460 C/T 1 20 29 49 9.49991805059518 15.225118826637 -5.72520077604181 T:C C T 10 0.525004097470241 0.115800890546695 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76798406_76798617:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76798406_76798617:USP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 17 15 32 8.0749303430059 7.87506146205362 0.199868880952287 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76803613 T/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 76831552 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76831362_76831583:USP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 77082390 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 78293189 A/T 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 A:T A T 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78292990_78295258:RNF213 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 78353464 G/A 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78353420_78353514:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78353420_78353514:RNF213 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 29 31 60 13.774881173363 16.2751270215775 -2.50024584821446 A:G G A 10 0.525004097470241 0.521586947720975 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 78367235 C/T 1 49 48 97 23.2747992239582 25.2001966785716 -1.92539745461338 T:C C T 10 0.525004097470241 0.760571194651367 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78367145_78369112:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78367145_78370085:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78367145_78370085:RNF213 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 78972902 C/T 1 23 19 42 10.9249057581845 9.97507785193458 0.949827906249878 T:C C T 10 0.525004097470241 0.877492263433531 ENSG00000176108:ENST00000325167:exon_78972898_78973932:CHMP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79172746 G/A 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 G G 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79172677_79172771:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79172677_79172771:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79172677_79172771:AZI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79244802 T/C 1 14 7 21 6.64994263541663 3.67502868229169 2.97491395312494 T:C T C 10 0.525004097470241 0.274430295423959 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79254530 C/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79254409_79254533:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79254409_79254533:SLC38A10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 21 20 41 9.97491395312494 10.5000819494048 -0.525167996279881 A:G A G 10 0.525004097470241 0.877184167059315 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79514028 C/G 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 C:G C G 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79513935_79514112:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 23 3 26 10.9249057581845 1.57501229241072 9.34989346577373 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000220492199823902 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79671332 T/C 1 177 222 399 84.0742747477673 116.550909638394 -32.4766348906262 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00130805552109979 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671274_79671460:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671274_79671460:MRPL12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79862741 G/A 1 44 35 79 20.8998197113094 18.3751434114584 2.52467629985096 A:G G A 10 0.525004097470241 0.575933622396122 ENSG00000185813:ENST00000331285:exon_79862092_79862820:PCYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 20 17 37 9.49991805059518 8.9250696569941 0.574848393601084 A:T T A 10 0.525004097470241 0.870934568892643 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 25 28 53 11.874897563244 14.7001147291667 -2.82521716592277 T:C T C 10 0.525004097470241 0.492417447539888 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79980756 C/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000169689:ENST00000306704:exon_79980702_79980794:STRA13;ENSG00000169689:ENST00000392359:exon_79980702_79980794:STRA13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79994026 G/A 1 1 22 23 0.474995902529759 11.5500901443453 -11.0750942418155 A:G G A 10 0.525004097470241 1.33410507185776e-06 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 79994600 C/T 1 127 197 324 60.3244796212794 103.425807201637 -43.1013275803581 A:T:C C T 10 0.525004097470241 1.98722606464074e-06 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79994597_79994639:DCXR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 51 36 87 24.2247910290177 18.9001475089287 5.32464352008903 A:G G A 10 0.525004097470241 0.283401463209768 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80016263 G/A 1 165 127 292 78.3743239174102 66.6755203787206 11.6988035386896 A:G G A 10 0.525004097470241 0.177954001439312 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80016217_80016292:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80016217_80016284:DUS1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 33 42 75 15.674864783482 22.0501720937501 -6.37530731026808 T:C:G G C 10 0.525004097470241 0.165041501397508 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 28 26 54 13.2998852708333 13.6501065342263 -0.350221263393015 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 139 122 261 66.0244304516365 64.0504998913694 1.97393056026711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.85254886773695 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 58 51 109 27.549762346726 26.7752089709823 0.774553375743729 A:G G A 10 0.525004097470241 0.923743062276557 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80373377 G/T 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:G G T 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 T:G T G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80391684 A/G 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:G A G 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80391534_80391698:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80391534_80391698:HEXDC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 A:G A G 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 73 53 126 34.6747008846724 27.8252171659228 6.84948371874963 T:C T C 10 0.525004097470241 0.246313115548879 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 10 11 21 4.74995902529759 5.77504507217265 -1.02508604687506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.669130983480659 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80885793 C/T 1 36 33 69 17.0998524910713 17.325135216518 -0.225282725446629 T:C:G C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80885781_80885864:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80885781_80885864:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80885781_80885864:TBCD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 68 77 145 32.2997213720236 40.4253155052086 -8.12559413318495 T:C T C 10 0.525004097470241 0.183996756668654 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 0 15 0 15 7.12493853794638 0 7.12493853794638 T T 10 0.525004097470241 7.75879779297092e-05 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 224184 C/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G C G 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 79 67 146 37.524676299851 35.1752745305062 2.34940176934481 C:G G C 10 0.525004097470241 0.740530936587214 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 9570320 T/C 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C T C 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9570155_9570681:PPP4R1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 19153494 C/T 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:C C T 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 T:C T C 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 T:C T C 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 33694120 G/A 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:C A C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 15 20 35 7.12493853794638 10.5000819494048 -3.37514341145843 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.310203694770706 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 153 140 293 72.6743730870531 73.5005736458337 -0.826200558780613 T:C C T 10 0.525004097470241 0.953375467960336 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 34378445 G/A 1 69 67 136 32.7747172745534 35.1752745305062 -2.40055725595278 A:G G A 10 0.525004097470241 0.731438530604144 ENSG00000134779:ENST00000334295:exon_34378412_34378572:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000383056:exon_34378412_34378572:C18orf10;ENSG00000134779:ENST00000415958:exon_34378385_34378572:C18orf10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 43668207 T/C 1 623 663 1286 295.92244727604 348.07771662277 -52.1552693467299 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.00367901379241894 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43668075_43668223:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43668075_43668223:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43668075_43668223:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000490226:exon_43668102_43668223:ATP5A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 47803066 C/T 1 11 7 18 5.22495492782735 3.67502868229169 1.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.490617940005165 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803032_47803114:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803032_47803114:MBD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 59 59 118 28.0247582492558 30.9752417507442 -2.95048350148844 A:G G A 10 0.525004097470241 0.645084445968263 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 47908556 G/A 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47908499_47908596:SKA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 20 13 33 9.49991805059518 6.82505326711313 2.67486478348205 A:C A C 10 0.525004097470241 0.387204384876348 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 22 23 45 10.4499098556547 12.0750942418155 -1.62518438616085 A:G G A 10 0.525004097470241 0.65655506552178 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C T C 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 C:G G C 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 2 8 10 0.949991805059518 4.20003277976193 -3.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0551714633384594 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56202231 T/C 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 T:C T C 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 C:G G C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56203837 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:G T G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:C A C 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:G T G 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 3 10 13 1.42498770758928 5.25004097470241 -3.82505326711313 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0487659359645473 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 56807231 T/C 1 115 94 209 54.6245287909223 49.3503851622027 5.27414362871963 T:C T C 10 0.525004097470241 0.488915788814303 ENSG00000166562:ENST00000299714:exon_56807087_56807267:SEC11C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 57569986 C/T 1 48 73 121 22.7998033214284 38.3252991153276 -15.5254957938992 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.00608550863470716 ENSG00000141682:ENST00000316660:exon_57569879_57571538:PMAIP1;ENSG00000141682:ENST00000269518:exon_57569879_57570769:PMAIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 46 36 82 21.8498115163689 18.9001475089287 2.94966400744024 T:C T C 10 0.525004097470241 0.580685575672348 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 6 24 30 2.84997541517855 12.6000983392858 -9.75012292410723 T:G T G 10 0.525004097470241 0.000360291373982924 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 4 19 23 1.89998361011904 9.97507785193458 -8.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00114816581989630 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 12 46 58 5.69995083035711 24.1501884836311 -18.450237653274 T:C C T 10 0.525004097470241 9.91867094858025e-07 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61650865 G/A 1 15 31 46 7.12493853794638 16.2751270215775 -9.15018848363109 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00758401530336549 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61650813_61650955:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61650813_61650881:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61650813_61650955:SERPINB8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 105 70 175 49.8745697656247 36.7502868229169 13.1242829427078 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0491230171617763 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 61654329 C/T 1 71 87 158 33.7247090796129 45.675356479911 -11.9506474002981 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0666074637493545 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 24 32 56 11.3999016607142 16.8001311190477 -5.4002294583335 T:C T C 10 0.525004097470241 0.180515522574597 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 67534632 C/T 1 11 21 32 5.22495492782735 11.0250860468751 -5.80013111904771 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0504349002140162 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67534593_67534647:CD226 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 67718688 A/G 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:G A G 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67718647_67718784:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67718647_67718784:RTTN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 29 21 50 13.774881173363 11.0250860468751 2.74979512648795 A:G G A 10 0.525004097470241 0.480613854738352 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 77211764 T/C 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 T:C T C 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77211676_77211816:NFATC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 17 27 44 8.0749303430059 14.1751106316965 -6.1001802886906 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0709483733009313 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 77513721 T/C 1 33 22 55 15.674864783482 11.5500901443453 4.12477463913674 T:C T C 10 0.525004097470241 0.282665138583804 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 18 77733860 C/T 1 2 7 9 0.949991805059518 3.67502868229169 -2.72503687723217 A:T:C C A 10 0.525004097470241 0.0953110686449535 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 307282 T/C 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_307119_307536:MIER2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 238 189 427 113.049024802083 99.2257744218756 13.8232503802071 T:C T C 10 0.525004097470241 0.190796375739734 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 652238 A/G 1 39 27 66 18.5248401986606 14.1751106316965 4.3497295669641 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324582943515499 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_652233_652296:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_652233_652296:RNF126 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 804396 C/T 1 39 42 81 18.5248401986606 22.0501720937501 -3.52533189508952 T:C C T 10 0.525004097470241 0.438645638861482 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804292_804438:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804292_804438:PTBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 804642 C/T 1 33 41 74 15.674864783482 21.5251679962799 -5.85030321279784 T:C C T 10 0.525004097470241 0.200339151606439 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 808586 C/G 1 63 60 123 29.9247418593748 31.5002458482145 -1.57550398883965 C:G C G 10 0.525004097470241 0.787184846127935 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 808742 G/T 1 66 48 114 31.3497295669641 25.2001966785716 6.14953288839252 A:T:G G T 10 0.525004097470241 0.261479923635289 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 136 120 256 64.5994427440472 63.0004916964289 1.5989510476183 T:C C T 10 0.525004097470241 0.85133873356135 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 871987 G/A 1 63 59 122 29.9247418593748 30.9752417507442 -1.05049989136941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.856646231243081 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 37 29 66 17.5748483936011 15.225118826637 2.34972956696409 A:G A G 10 0.525004097470241 0.62267839502996 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 897479 C/T 1 77 59 136 36.5746844947914 30.9752417507442 5.59944274404722 T:C C T 10 0.525004097470241 0.346225490869296 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_896503_897540:C19orf22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 899444 C/T 1 46 63 109 21.8498115163689 33.0752581406252 -11.2254466242563 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0346618146559346 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_899440_899495:C19orf22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 968475 G/A 1 58 37 95 27.549762346726 19.4251516063989 8.1246107403271 A:G G A 10 0.525004097470241 0.100771356719702 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_968405_968503:ARID3A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 102 59 161 48.4495820580354 30.9752417507442 17.4743403072912 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00572297884999965 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 101 62 163 47.9745861555057 32.5502540431549 15.4243321123507 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0183648175368012 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 127 61 188 60.3244796212794 32.0252499456847 28.2992296755947 T:G G T 10 0.525004097470241 3.81260427027991e-05 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 T:G G T 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 15 16 31 7.12493853794638 8.40006555952386 -1.27512702157747 A:T A T 10 0.525004097470241 0.720439840547225 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 40 38 78 18.9998361011904 19.9501557038692 -0.950319602678796 C:G G C 10 0.525004097470241 0.909834541060719 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 46 45 91 21.8498115163689 23.6251843861608 -1.77537286979193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.753261311065181 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 100 83 183 47.4995902529759 43.57534009003 3.9242501629459 A:G A G 10 0.525004097470241 0.604544715673662 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 46 58 104 21.8498115163689 30.450237653274 -8.60042613690507 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0956371544575712 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1256998 C/T 1 20 13 33 9.49991805059518 6.82505326711313 2.67486478348205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.387204384876348 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 33 53 86 15.674864783482 27.8252171659228 -12.1503523824407 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00940416464566004 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 5 13 18 2.3749795126488 6.82505326711313 -4.45007375446434 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0559985703651949 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 18 9 27 8.54992624553566 4.72503687723217 3.82488936830349 T:C T C 10 0.525004097470241 0.177427437087291 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 32 14 46 15.1998688809523 7.35005736458337 7.84981151636891 T:C C T 10 0.525004097470241 0.025821892887164 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1924189 C/T 1 2 12 14 0.949991805059518 6.30004916964289 -5.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00545060904059613 ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1924107_1926012:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000414057:exon_1924107_1925015:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000409472:exon_1924107_1926011:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000472442:exon_1924107_1926005:SCAMP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 58 38 96 27.549762346726 19.9501557038692 7.59960664285686 A:G A G 10 0.525004097470241 0.126171173334309 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 11 32 43 5.22495492782735 16.8001311190477 -11.5751761912204 A:G A G 10 0.525004097470241 0.000595533349662431 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 16 26 42 7.59993444047614 13.6501065342263 -6.05017209375012 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0650777886403642 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2099250 G/A 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 44 33 77 20.8998197113094 17.325135216518 3.57468449479144 T:C T C 10 0.525004097470241 0.427010661830064 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 51 60 111 24.2247910290177 31.5002458482145 -7.27545481919675 A:G G A 10 0.525004097470241 0.183466327306086 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 20 14 34 9.49991805059518 7.35005736458337 2.14986068601181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.496235271064969 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2118692 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2118600_2118831:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2118600_2118831:AP3D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2226676 G/A 1 17 15 32 8.0749303430059 7.87506146205362 0.199868880952287 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 22 22 44 10.4499098556547 11.5500901443453 -1.10018028869061 A:G A G 10 0.525004097470241 0.764592019217927 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 50 59 109 23.7497951264879 30.9752417507442 -7.22544662425627 T:C T C 10 0.525004097470241 0.179680877671628 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 28 20 48 13.2998852708333 10.5000819494048 2.79980332142843 A:C A C 10 0.525004097470241 0.47121270323275 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 14 17 31 6.64994263541663 8.9250696569941 -2.27512702157747 T:C C T 10 0.525004097470241 0.473731462150969 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 17 20 37 8.0749303430059 10.5000819494048 -2.42515160639892 A:G G A 10 0.525004097470241 0.5108991695235 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 35 38 73 16.6248565885416 19.9501557038692 -3.32529911532759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.482516380347037 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3544665 G/A 1 51 25 76 24.2247910290177 13.125102436756 11.0996885922617 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0113198152014504 ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544198_3544730:C19orf28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3613158 G/C 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 A:C:G G C 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3613057_3613370:C19orf29OS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 8 12 20 3.79996722023807 6.30004916964289 -2.50008194940482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.273669762374101 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 T:C C T 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3753874 G/A 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3977486 A/G 1 1917 1885 3802 910.567145149548 989.632723731404 -79.0655785818564 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0102980364967997 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3977426_3977608:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3977426_3977608:EEF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 3979408 A/G 1 921 840 1761 437.471226229908 441.003441875002 -3.53221564509442 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.867391583051546 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3979327_3979434:EEF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 10 5 15 4.74995902529759 2.6250204873512 2.12493853794639 T:C T C 10 0.525004097470241 0.310879488899670 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4102449 G/A 1 72 99 171 34.1997049821426 51.9754056495539 -17.7757006674112 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00723267452737685 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 334 317 651 158.648631444939 166.426298898066 -7.7776674531269 A:G G A 10 0.525004097470241 0.556188921680071 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 500 554 1054 237.49795126488 290.852269998514 -53.354318733634 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0010703425679802 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 25 23 48 11.874897563244 12.0750942418155 -0.200196678571569 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 45 35 80 21.3748156138392 18.3751434114584 2.99967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.575953536806043 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 12 25 37 5.69995083035711 13.125102436756 -7.42515160639892 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0199725548090906 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4333711 C/T 1 2 9 11 0.949991805059518 4.72503687723217 -3.77504507217265 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0314607471472406 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4333691_4333813:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4333691_4333813:STAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4352959 A/G 1 12 8 20 5.69995083035711 4.20003277976193 1.49991805059518 A:G A G 10 0.525004097470241 0.655495081650022 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 24 18 42 11.3999016607142 9.45007375446434 1.94982790624988 C:G G C 10 0.525004097470241 0.643631803164977 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4454000 G/A 1 37 22 59 17.5748483936011 11.5500901443453 6.02475824925578 A:G G A 10 0.525004097470241 0.119901044753437 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4457650 C/T 1 11 18 29 5.22495492782735 9.45007375446434 -4.22511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 0.137500629603524 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4457612_4457694:UBXN6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 194 162 356 92.1492050907732 85.050663790179 7.09854130059419 A:G A G 10 0.525004097470241 0.458021935122684 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 5273571 T/G 1 12 5 17 5.69995083035711 2.6250204873512 3.0749303430059 T:G T G 10 0.525004097470241 0.151946029965317 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5273453_5273594:PTPRS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 119 105 224 56.5245124010413 55.1254302343753 1.39908216666601 A:G G A 10 0.525004097470241 0.893615747714273 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 5908969 G/A 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000187650:ENST00000339485:exon_5908835_5910864:VMAC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 6213104 G/A 1 2 8 10 0.949991805059518 4.20003277976193 -3.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0551714633384594 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6212966_6213181:MLLT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:G A G 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 1811 1691 3502 860.217579481393 887.781928822178 -27.564349340784 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.35212636254108 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 106 94 200 50.3495656681545 49.3503851622027 0.999180505951799 T:C T C 10 0.525004097470241 0.943581189092645 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 108 69 177 51.299557473214 36.2252827254466 15.0742747477673 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0239530213456490 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 7755056 G/A 1 569 411 980 270.272668539433 215.776684060269 54.4959844791638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000486175056291707 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 761 474 1235 361.471881825147 248.851942200894 112.619939624252 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 1.29238192772896e-10 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 241 188 429 114.474012509672 98.7007703244053 15.7732421852666 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.133989166821788 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 8486884 G/A 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 A:G G A 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8486673_8486900:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8486607_8486900:MARCH2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 8551112 G/T 1 463 427 890 219.923102871278 224.176749619793 -4.25364674851448 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.78835782927862 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 9453103 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 28 44 72 13.2998852708333 23.1001802886906 -9.80029501785735 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.0244684001101746 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 9524968 G/C 1 11 11 22 5.22495492782735 5.77504507217265 -0.550090144345303 C:G G C 10 0.525004097470241 0.834225569957072 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 33 19 52 15.674864783482 9.97507785193458 5.69978693154747 A:T A T 10 0.525004097470241 0.127240027903754 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 135 150 285 64.1244468415175 78.7506146205362 -14.6261677790187 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0855657530259932 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 7 13 20 3.32497131770831 6.82505326711313 -3.50008194940482 C:G C G 10 0.525004097470241 0.123961209300371 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 15 29 44 7.12493853794638 15.225118826637 -8.10018028869061 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0156185260943727 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 760 725 1485 360.996885922617 380.627970665925 -19.6310847433079 A:G A G 10 0.525004097470241 0.310989138054547 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 622 575 1197 295.44745137351 301.877356045389 -6.42990467187849 A:G A G 10 0.525004097470241 0.728398836346914 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10265593 G/T 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 T:G G T 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10265581_10265732:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10265581_10265732:DNMT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 T:G T G 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 63 74 137 29.9247418593748 38.8503032127978 -8.92556135342302 A:G A G 10 0.525004097470241 0.145633865433331 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 14 11 25 6.64994263541663 5.77504507217265 0.874897563243974 A:C A C 10 0.525004097470241 0.842085588637267 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 10 16 26 4.74995902529759 8.40006555952386 -3.65010653422627 T:C T C 10 0.525004097470241 0.171904784111560 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10444166 G/A 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10443965_10444314:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10443965_10444314:RAVER1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10463118 G/C 1 126 127 253 59.8494837187496 66.6755203787206 -6.82603665997097 C:G G C 10 0.525004097470241 0.413308755544443 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525976:exon_10463110_10463168:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463110_10463227:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463110_10463227:TYK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:C C A 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 12 25 37 5.69995083035711 13.125102436756 -7.42515160639892 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0199725548090906 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10610236 A/G 1 20 23 43 9.49991805059518 12.0750942418155 -2.57517619122036 A:G A G 10 0.525004097470241 0.449011591135732 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10610071_10610756:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10610071_10610756:KEAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 26 36 62 12.3498934657737 18.9001475089287 -6.55025404315494 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0997164867521586 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 20 26 46 9.49991805059518 13.6501065342263 -4.15018848363109 A:G A G 10 0.525004097470241 0.239578627728506 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 13 28 41 6.17494673288687 14.7001147291667 -8.52516799627988 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0113977048176831 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 32 39 71 15.1998688809523 20.4751598013394 -5.27529092038711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.235092520313634 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 11227602 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 11558275 G/A 1 137 109 246 65.074438646577 57.2254466242563 7.84899202232071 A:G G A 10 0.525004097470241 0.338407273499253 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11558254_11558433:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11558254_11558412:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11558254_11558433:PRKCSH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 11618630 G/A 1 31 27 58 14.7248729784225 14.1751106316965 0.549762346726022 A:G G A 10 0.525004097470241 0.896350395372129 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 31 48 79 14.7248729784225 25.2001966785716 -10.475323700149 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0236463199580502 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 13 28 41 6.17494673288687 14.7001147291667 -8.52516799627988 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0113977048176831 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 181 159 340 85.9742583578864 83.4756514977683 2.49860686011804 A:G G A 10 0.525004097470241 0.828090716494627 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 13216269 C/G 1 17 19 36 8.0749303430059 9.97507785193458 -1.90014750892868 C:G C G 10 0.525004097470241 0.617382886844251 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 14038791 C/T 1 18 15 33 8.54992624553566 7.87506146205362 0.674864783482047 T:C C T 10 0.525004097470241 0.862974571050688 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 14040896 G/A 1 39 32 71 18.5248401986606 16.8001311190477 1.72470907961289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.722426091063354 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14040891_14040967:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14040891_14040967:CC2D1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 14231255 C/G 1 51 40 91 24.2247910290177 21.0001638988096 3.22462713020807 C:G C G 10 0.525004097470241 0.529879257781798 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 14628979 G/T 1 26 18 44 12.3498934657737 9.45007375446434 2.8998197113094 T:G G T 10 0.525004097470241 0.451102008752031 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 23 22 45 10.9249057581845 11.5500901443453 -0.625184386160846 A:G G A 10 0.525004097470241 0.882197627115388 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 32 57 89 15.1998688809523 29.9252335558037 -14.7253646748515 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00196549285313021 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 31 25 56 14.7248729784225 13.125102436756 1.5997705416665 A:G A G 10 0.525004097470241 0.690380902547581 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 15565046 G/A 1 62 48 110 29.4497459568451 25.2001966785716 4.24954927827349 A:G G A 10 0.525004097470241 0.445780928608473 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15564960_15565078:RASAL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 15565646 G/A 1 27 36 63 12.8248893683035 18.9001475089287 -6.07525814062518 A:G G A 10 0.525004097470241 0.131579652228349 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15565468_15565704:RASAL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 55 60 115 26.1247746391367 31.5002458482145 -5.37547120907772 T:C C T 10 0.525004097470241 0.350612807195113 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 16631322 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 55 50 105 26.1247746391367 26.2502048735121 -0.125430234375305 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 33 9 42 15.674864783482 4.72503687723217 10.9498279062499 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000586211744778125 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 19 31 50 9.02492214806542 16.2751270215775 -7.25020487351205 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0469317454068294 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 37 40 77 17.5748483936011 21.0001638988096 -3.42531550520856 A:G A G 10 0.525004097470241 0.493867874983641 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17337557 G/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:G G T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 141 125 266 66.974422256696 65.6255121837801 1.34891007291588 A:G G A 10 0.525004097470241 0.902332633705838 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17516142 A/G 1 1312 1369 2681 623.194624119044 718.73060943676 -95.5359853177163 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00023737566366245 ENSG00000130303:ENST00000416178:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000252593:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000446020:exon_17516100_17516427:BST2;ENSG00000130303:ENST00000527220:exon_17516100_17516339:BST2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 16 16 32 7.59993444047614 8.40006555952386 -0.800131119047713 T:C C T 10 0.525004097470241 0.860132326914915 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 16 20 36 7.59993444047614 10.5000819494048 -2.90014750892868 A:G G A 10 0.525004097470241 0.404596615121924 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 157 183 340 74.5743566971722 96.0757498370541 -21.5013931398819 T:G T G 10 0.525004097470241 0.0224309542037402 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 15 10 25 7.12493853794638 5.25004097470241 1.87489756324397 A:G G A 10 0.525004097470241 0.549607407879178 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 7 27 34 3.32497131770831 14.1751106316965 -10.8501393139882 C:G G C 10 0.525004097470241 0.000203298904624002 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18499422 C/G 1 8 17 25 3.79996722023807 8.9250696569941 -5.12510243675603 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0456059116156226 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18499780 A/G 1 22 32 54 10.4499098556547 16.8001311190477 -6.35022126339302 A:G A G 10 0.525004097470241 0.101422974520840 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18679351 C/T 1 44 62 106 20.8998197113094 32.5502540431549 -11.6504343318455 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0252100090410976 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 18685964 G/T 1 4048 3631 7679 1922.78341344046 1906.28987791445 16.4935355260193 A:T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.714644071105562 ENSG00000221983:ENST00000430157:exon_18685867_18688269:UBA52;ENSG00000221983:ENST00000442744:exon_18685867_18688269:UBA52 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 19105259 G/A 1 57 40 97 27.0747664441963 21.0001638988096 6.07460254538662 A:G G A 10 0.525004097470241 0.224126653806818 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19105175_19106089:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19105175_19105295:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19105175_19105295:SUGP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 19307797 C/T 1 93 106 199 44.1746189352676 55.6504343318455 -11.475815396578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.118185169837145 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19307775_19307855:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19307772_19307855:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19307772_19307855:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19307772_19307855:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19307775_19307855:RFXANK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 21131571 A/G 1 3 51 54 1.42498770758928 26.7752089709823 -25.350221263393 A:G A G 10 0.525004097470241 1.61347166169580e-13 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 21131664 G/T 1 5 26 31 2.3749795126488 13.6501065342263 -11.2751270215775 T:G G T 10 0.525004097470241 3.95989669260397e-05 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 21132211 A/T 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:T A T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 21132394 C/T 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 21132751 A/T 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 A:T A T 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 21133129 T/C 1 19 15 34 9.02492214806542 7.87506146205362 1.14986068601181 T:C T C 10 0.525004097470241 0.7339423545076 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 16 10 26 7.59993444047614 5.25004097470241 2.34989346577373 C:G G C 10 0.525004097470241 0.433839753051869 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 A:G A G 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 30106275 G/A 1 154 168 322 73.1493689895829 88.2006883750005 -15.0513193854176 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0943996640207305 ENSG00000105171:ENST00000221770:exon_30106151_30106706:POP4;ENSG00000105171:ENST00000392279:exon_30106151_30106677:POP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 T:C C T 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 C:G G C 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 13 2 15 6.17494673288687 1.05000819494048 5.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00844003852137795 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33372814 G/A 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33372750_33372919:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33372750_33372919:CCDC123 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 18 7 25 8.54992624553566 3.67502868229169 4.87489756324397 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0696845341074594 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33467413 C/T 1 7 18 25 3.32497131770831 9.45007375446434 -6.12510243675603 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0158902127618526 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33467515 T/C 1 24 18 42 11.3999016607142 9.45007375446434 1.94982790624988 T:C T C 10 0.525004097470241 0.643631803164977 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 24 23 47 11.3999016607142 12.0750942418155 -0.675192581101328 A:G G A 10 0.525004097470241 0.884521909264506 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 18 23 41 8.54992624553566 12.0750942418155 -3.52516799627988 T:C T C 10 0.525004097470241 0.278449355239952 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 18 22 40 8.54992624553566 11.5500901443453 -3.00016389880964 A:C C A 10 0.525004097470241 0.34786509808383 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35233027 C/T 1 20 13 33 9.49991805059518 6.82505326711313 2.67486478348205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.387204384876348 ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 21 15 36 9.97491395312494 7.87506146205362 2.09985249107132 A:G G A 10 0.525004097470241 0.509178418666553 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 36 41 77 17.0998524910713 21.5251679962799 -4.42531550520856 C:G G C 10 0.525004097470241 0.3614633350779 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 30 49 79 14.2498770758928 25.7252007760418 -11.475323700149 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0127031057519781 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 80 77 157 37.9996722023807 40.4253155052086 -2.42564330282784 A:G G A 10 0.525004097470241 0.749368378476944 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 12 14 26 5.69995083035711 7.35005736458337 -1.65010653422627 T:C C T 10 0.525004097470241 0.559872705946098 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 133 124 257 63.1744550364579 65.1005080863099 -1.92605304985194 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.851419605711362 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 35827226 G/C 1 62 77 139 29.4497459568451 40.4253155052086 -10.9755695483635 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0741364711033629 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35826939_35827244:CD22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36206050 A/C 1 59 59 118 28.0247582492558 30.9752417507442 -2.95048350148844 A:C A C 10 0.525004097470241 0.645084445968263 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36207336 G/C 1 13 6 19 6.17494673288687 3.15002458482145 3.02492214806542 C:G G C 10 0.525004097470241 0.177129332411914 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36230767 A/G 1 72 69 141 34.1997049821426 36.2252827254466 -2.02557774330398 A:G A G 10 0.525004097470241 0.736765426588077 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230611_36230989:TMEM149 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36594063 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594058_36594109:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594058_36594109:WDR62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 21 25 46 9.97491395312494 13.125102436756 -3.15018848363109 A:T A T 10 0.525004097470241 0.378211437553437 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36594853 G/A 1 17 11 28 8.0749303430059 5.77504507217265 2.29988527083325 A:G G A 10 0.525004097470241 0.451315745002794 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 13 11 24 6.17494673288687 5.77504507217265 0.399901660714216 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.394915481182600 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 37038092 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C:G T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 37118439 C/T 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 5 11 16 2.3749795126488 5.77504507217265 -3.40006555952386 A:G A G 10 0.525004097470241 0.131035812516567 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 37441111 C/T 1 16 18 34 7.59993444047614 9.45007375446434 -1.85013931398819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.607465957103586 ENSG00000198453:ENST00000333987:exon_37440414_37441990:ZNF568;ENSG00000198453:ENST00000415168:exon_37440414_37443645:ZNF568 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 37854440 C/T 1 17 10 27 8.0749303430059 5.25004097470241 2.82488936830349 T:C C T 10 0.525004097470241 0.336808455248746 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 38782485 G/C 1 21 41 62 9.97491395312494 21.5251679962799 -11.5502540431549 C:G G C 10 0.525004097470241 0.00337279575263983 ENSG00000167642:ENST00000301244:exon_38782480_38783108:SPINT2;ENSG00000167642:ENST00000454580:exon_38782480_38783086:SPINT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 112 107 219 53.199541083333 56.1754384293158 -2.97589734598279 T:C T C 10 0.525004097470241 0.735228733181581 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 38800176 G/A 1 61 73 134 28.9747500543153 38.3252991153276 -9.3505490610123 A:G G A 10 0.525004097470241 0.119277027655852 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 38871622 C/T 1 316 312 628 150.098705199404 163.801278410715 -13.7025732113113 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.280802685949024 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38871539_38871639:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38871539_38871639:PSMD8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 17 20 37 8.0749303430059 10.5000819494048 -2.42515160639892 T:C C T 10 0.525004097470241 0.5108991695235 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 15 16 31 7.12493853794638 8.40006555952386 -1.27512702157747 A:G G A 10 0.525004097470241 0.720439840547225 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 20 22 42 9.49991805059518 11.5500901443453 -2.05017209375012 C:G C G 10 0.525004097470241 0.540604176828727 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 3971 3923 7894 1886.20872894567 2059.59107437576 -173.382345430083 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 9.6311696502942e-05 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 39924129 T/C 1 13 12 25 6.17494673288687 6.30004916964289 -0.125102436756025 T:C T C 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 15 1 16 7.12493853794638 0.525004097470241 6.59993444047614 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0006410018124412 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 40964447 C/T 1 60 70 130 28.4997541517855 36.7502868229169 -8.25053267113133 T:C C T 10 0.525004097470241 0.160117157800794 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 T:C T C 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 41822622 G/A 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000142039:ENST00000269967:exon_41822289_41822744:CCDC97 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 41847860 G/A 1 330 296 626 156.74864783482 155.401212851191 1.34743498362914 A:G G A 10 0.525004097470241 0.93622322345404 ENSG00000105329:ENST00000221930:exon_41847788_41847935:TGFB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 41863821 G/A 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 A:G G A 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41863802_41863927:B9D2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 T:C T C 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 42799049 C/T 1 21 19 40 9.97491395312494 9.97507785193458 -0.000163898809640628 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42798976_42799949:CIC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 17 18 35 8.0749303430059 9.45007375446434 -1.37514341145843 T:G G T 10 0.525004097470241 0.735698242022473 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44001345 C/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_44001270_44001431:PHLDB3;ENSG00000176531:ENST00000314735:exon_44000186_44001431:PHLDB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44047825 T/G 1 64 13 77 30.3997377619046 6.82505326711313 23.5746844947914 T:G T G 10 0.525004097470241 2.92727075277954e-08 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44047764_44047839:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44047764_44047839:XRCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 20 22 42 9.49991805059518 11.5500901443453 -2.05017209375012 T:C T C 10 0.525004097470241 0.540604176828727 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 35 27 62 16.6248565885416 14.1751106316965 2.44974595684506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.611429877602611 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44079611 G/A 1 12 9 21 5.69995083035711 4.72503687723217 0.974913953124939 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827768170148087 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44079560_44079730:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44079560_44079730:XRCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44153003 C/T 1 43 50 93 20.4248238087796 26.2502048735121 -5.82538106473242 T:C C T 10 0.525004097470241 0.253555922088373 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44153248 T/C 1 39 30 69 18.5248401986606 15.7501229241072 2.77471727455337 T:C T C 10 0.525004097470241 0.547740719162649 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44352639 G/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000159882:ENST00000324461:exon_44351091_44353307:ZNF230 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44500701 C/T 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:C C T 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 24 16 40 11.3999016607142 8.40006555952386 2.99983610119036 A:T:G T G 10 0.525004097470241 0.429010188219362 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 19 22 41 9.02492214806542 11.5500901443453 -2.52516799627988 A:C C A 10 0.525004097470241 0.439272768938261 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44570551 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44571154 T/C 1 18 9 27 8.54992624553566 4.72503687723217 3.82488936830349 T:C T C 10 0.525004097470241 0.177427437087291 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 T:G G T 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 6 11 17 2.84997541517855 5.77504507217265 -2.9250696569941 A:G A G 10 0.525004097470241 0.223914944795774 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 T:C T C 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 17 13 30 8.0749303430059 6.82505326711313 1.24987707589277 A:T A T 10 0.525004097470241 0.716684788710682 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 31 23 54 14.7248729784225 12.0750942418155 2.64977873660698 A:G A G 10 0.525004097470241 0.498256691713121 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 11 11 22 5.22495492782735 5.77504507217265 -0.550090144345303 A:G G A 10 0.525004097470241 0.834225569957072 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 11 13 24 5.22495492782735 6.82505326711313 -1.60009833928578 C:G C G 10 0.525004097470241 0.545429500501973 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 T:C T C 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 24 22 46 11.3999016607142 11.5500901443453 -0.150188483631087 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 44792967 T/C 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45493804 C/T 1 21 17 38 9.97491395312494 8.9250696569941 1.04984429613084 T:C C T 10 0.525004097470241 0.748645125802599 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45493653_45493843:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45493653_45493843:CLPTM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45561110 C/G 1 14 22 36 6.64994263541663 11.5500901443453 -4.90014750892868 C:G C G 10 0.525004097470241 0.132185565685893 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45561008_45561156:CLASRP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45563695 G/A 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 A:G G A 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45563647_45563725:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45563647_45563725:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45563647_45563725:CLASRP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45575381 G/T 1 43 30 73 20.4248238087796 15.7501229241072 4.6747008846724 T:G G T 10 0.525004097470241 0.293047503828535 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45579515 G/T 1 20 20 40 9.49991805059518 10.5000819494048 -1.00016389880964 T:G G T 10 0.525004097470241 0.754653566683135 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45579334_45579688:ZNF296 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 68 17 85 32.2997213720236 8.9250696569941 23.3746517150295 T:G T G 10 0.525004097470241 1.76611053922785e-07 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 78 26 104 37.0496803973212 13.6501065342263 23.3995738630949 A:G G A 10 0.525004097470241 2.90873776499111e-06 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 10 14 24 4.74995902529759 7.35005736458337 -2.60009833928578 A:C A C 10 0.525004097470241 0.312688523843871 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 23 16 39 10.9249057581845 8.40006555952386 2.5248401986606 A:G A G 10 0.525004097470241 0.428902041109362 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 22 17 39 10.4499098556547 8.9250696569941 1.5248401986606 A:G G A 10 0.525004097470241 0.635382193648771 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 13 16 29 6.17494673288687 8.40006555952386 -2.22511882663699 A:C C A 10 0.525004097470241 0.459653232536022 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 9 18 27 4.27496312276783 9.45007375446434 -5.17511063169651 A:G A G 10 0.525004097470241 0.053921247170162 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46124531 G/A 1 23 20 43 10.9249057581845 10.5000819494048 0.424823808779637 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46124465_46124590:EML2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 28 15 43 13.2998852708333 7.87506146205362 5.42482380877964 T:C C T 10 0.525004097470241 0.12591748915561 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 29 14 43 13.774881173363 7.35005736458337 6.42482380877964 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0657096585310837 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46206262 G/A 1 41 30 71 19.4748320037201 15.7501229241072 3.72470907961289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.406849028180994 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46294136 G/A 1 14 3 17 6.64994263541663 1.57501229241072 5.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0145626325999383 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 59 91 150 28.0247582492558 47.7753728697919 -19.7506146205362 C:G G C 10 0.525004097470241 0.00137052107172102 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 51 40 91 24.2247910290177 21.0001638988096 3.22462713020807 T:C C T 10 0.525004097470241 0.529879257781798 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46511548 T/C 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 T:C T C 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46511398_46511559:CCDC61 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 46521569 C/T 1 27 30 57 12.8248893683035 15.7501229241072 -2.92523355580374 T:C C T 10 0.525004097470241 0.507668145145634 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46521548_46521874:CCDC61 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 83 90 173 39.42465990997 47.2503687723217 -7.8257088623517 A:G G A 10 0.525004097470241 0.253583366094486 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 29 13 42 13.774881173363 6.82505326711313 6.94982790624988 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0433017375516399 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 47761646 G/C 1 21 24 45 9.97491395312494 12.6000983392858 -2.62518438616085 C:G G C 10 0.525004097470241 0.458369751247753 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47761587_47761660:CCDC9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 47984058 G/C 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 C:G G C 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47984017_47984090:KPTN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 174 248 422 82.6492870401781 130.20101617262 -47.5517291324417 A:C:G A G 10 0.525004097470241 4.22859964814101e-06 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48626550 C/A 1 61 50 111 28.9747500543153 26.2502048735121 2.72454518080325 A:C:G C A 10 0.525004097470241 0.635403299304319 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48626431_48626575:LIG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48640325 A/G 1 19 23 42 9.02492214806542 12.0750942418155 -3.05017209375012 A:G A G 10 0.525004097470241 0.358333713723525 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48640265_48640341:LIG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48654556 C/T 1 20 5 25 9.49991805059518 2.6250204873512 6.87489756324398 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0078839376068969 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48665555 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48665519_48665608:LIG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 12 8 20 5.69995083035711 4.20003277976193 1.49991805059518 T:C T C 10 0.525004097470241 0.655495081650022 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48733863 A/G 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48733695_48733954:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48733695_48733957:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523668:exon_48733695_48733904:CARD8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 10 15 25 4.74995902529759 7.87506146205362 -3.12510243675603 T:G G T 10 0.525004097470241 0.233781441016375 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 48977479 C/T 1 49 32 81 23.2747992239582 16.8001311190477 6.47466810491048 T:C C T 10 0.525004097470241 0.181535632668486 ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48977439_48977532:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48977439_48977587:CYTH2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 A:G A G 10 0.525004097470241 0.125338991076950 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 65 32 97 30.8747336644343 16.8001311190477 14.0746025453866 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00429521987844077 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49513137 C/T 1 150 164 314 71.2493853794638 86.1006719851195 -14.8512866056557 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.101185976414455 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513033_49513139:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513033_49513139:RUVBL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 205 202 407 97.3741600186006 106.050827688989 -8.6766676703881 T:C C T 10 0.525004097470241 0.399070921253196 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49842610 G/A 1 290 358 648 137.74881173363 187.951466894346 -50.2026551607162 A:G G A 10 0.525004097470241 8.19214859895952e-05 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49842587_49842670:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49842587_49842670:CD37 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49949652 G/A 1 25 27 52 11.874897563244 14.1751106316965 -2.30021306845253 A:G G A 10 0.525004097470241 0.579509977985152 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49951330 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 75 98 173 35.6246926897319 51.4504015520836 -15.8257088623517 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0180765167802209 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 65 96 161 30.8747336644343 50.4003933571431 -19.5256596927088 T:C:G T G 10 0.525004097470241 0.00260180151153668 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 C:G C G 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49967402 G/A 0 25 0 25 11.874897563244 0 11.874897563244 G G 10 0.525004097470241 1.09206005896166e-07 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967384_49967520:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967384_49967520:ALDH16A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 17 14 31 8.0749303430059 7.35005736458337 0.724872978422528 T:C:G T G 10 0.525004097470241 0.858468340181549 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 15 7 22 7.12493853794638 3.67502868229169 3.4499098556547 T:C C T 10 0.525004097470241 0.199378987179183 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50154813 G/A 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50154125_50156962:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50154125_50156962:SCAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50156329 A/G 1 84 101 185 39.8996558124998 53.0254138444943 -13.1257580319946 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0557136470515905 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50154125_50156962:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50154125_50156962:SCAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50312653 C/T 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529634:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000527973:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529004:exon_50312635_50312832:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528043:exon_50312652_50312832:FUZ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50361856 C/T 1 131 96 227 62.2244632313984 50.4003933571431 11.8240698742553 T:C C T 10 0.525004097470241 0.126317060925450 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361806_50361910:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361806_50361910:PTOV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50381785 G/A 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50381755_50381829:TBC1D17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50387729 C/T 1 26 20 46 12.3498934657737 10.5000819494048 1.84981151636891 T:C C T 10 0.525004097470241 0.65874777343728 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 30 38 68 14.2498770758928 19.9501557038692 -5.70027862797639 C:G C G 10 0.525004097470241 0.182334384526123 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 33 5 38 15.674864783482 2.6250204873512 13.0498442961308 T:C T C 10 0.525004097470241 1.14782842797648e-05 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50435755 C/A 1 30 4 34 14.2498770758928 2.10001638988096 12.1498606860118 A:C C A 10 0.525004097470241 1.64733868657175e-05 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 77 36 113 36.5746844947914 18.9001475089287 17.6745369858628 T:C T C 10 0.525004097470241 0.000908267416912612 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 14 39 53 6.64994263541663 20.4751598013394 -13.8252171659228 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000154065476269875 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 49 47 96 23.2747992239582 24.6751925811013 -1.40039335714314 T:C C T 10 0.525004097470241 0.838208687964096 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 417 363 780 198.073291354909 190.576487381697 7.496803973212 T:C C T 10 0.525004097470241 0.615760473887093 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 448 381 829 212.798164333332 200.026561136162 12.7716031971702 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.384724186842841 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 223 244 467 105.924086264136 128.100999782739 -22.1769135186025 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.0414686399151684 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 51870429 G/A 1 9 1 10 4.27496312276783 0.525004097470241 3.74995902529759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0230306542002755 ENSG00000160318:ENST00000291715:exon_51870352_51870469:CLDND2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 51875286 C/T 1 31 77 108 14.7248729784225 40.4253155052086 -25.700442526786 T:C C T 10 0.525004097470241 6.17017455513273e-07 ENSG00000105374:ENST00000221978:exon_51875194_51875328:NKG7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 21 25 46 9.97491395312494 13.125102436756 -3.15018848363109 A:G A G 10 0.525004097470241 0.378211437553437 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 52658510 T/C 1 14 10 24 6.64994263541663 5.25004097470241 1.39990166071422 T:C T C 10 0.525004097470241 0.684012711255136 ENSG00000196267:ENST00000322146:exon_52658125_52660793:ZNF836;ENSG00000196267:ENST00000457013:exon_52658125_52660793:ZNF836 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:C A C 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 12 13 0.474995902529759 6.30004916964289 -5.82505326711313 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00119315603838211 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 53085684 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 53453384 A/G 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 A:G A G 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 53454387 G/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 C:G G C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 53572494 G/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:G G T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 53572917 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 1 9 2 11 4.27496312276783 1.05000819494048 3.22495492782735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0690623754843889 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 54610170 C/T 1 444 556 1000 210.898180723213 291.902278193454 -81.004097470241 A:T:C C T 10 0.525004097470241 3.25562945926758e-07 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 54611377 G/A 1 89 114 203 42.2746353251486 59.8504671116075 -17.5758317864589 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0139010512725304 ENSG00000105619:ENST00000391759:exon_54611333_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000391758:exon_54611333_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000391757:exon_54611333_54611514:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000339150:exon_54611333_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000420715:exon_54611335_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000437524:exon_54611356_54611514:TFPT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 66 50 116 31.3497295669641 26.2502048735121 5.09952469345204 T:C C T 10 0.525004097470241 0.354057047674214 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 27 16 43 12.8248893683035 8.40006555952386 4.42482380877964 C:G C G 10 0.525004097470241 0.221626992802355 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 54974068 G/A 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 T:C T C 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 11 16 27 5.22495492782735 8.40006555952386 -3.17511063169651 T:G G T 10 0.525004097470241 0.250547223446268 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 4 10 14 1.89998361011904 5.25004097470241 -3.35005736458337 T:C T C 10 0.525004097470241 0.106123236614285 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55175290 A/G 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 A:G A G 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55175212_55175413:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175212_55175496:LILRB4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 19 22 41 9.02492214806542 11.5500901443453 -2.52516799627988 T:C C T 10 0.525004097470241 0.439272768938261 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 13 10 23 6.17494673288687 5.25004097470241 0.924905758184457 A:G A G 10 0.525004097470241 0.835357270424024 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 40 43 83 18.9998361011904 22.5751761912204 -3.57534009003 A:G A G 10 0.525004097470241 0.443690634565609 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55441902 T/C 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000167634:ENST00000340844:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000328092:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000446217:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000448121:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000427260:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000399724:exon_55441882_55441965:NLRP7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55494881 C/G 1 52 6 58 24.6997869315475 3.15002458482145 21.549762346726 C:G C G 10 0.525004097470241 2.36455416543783e-09 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55493530_55495096:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55493530_55495096:NLRP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55512137 C/A 1 218 36 254 103.549106751487 18.9001475089287 84.6489592425588 A:C C A 10 0.525004097470241 2.99974085712774e-29 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55512232 C/A 1 238 39 277 113.049024802083 20.4751598013394 92.5738650007432 A:C C A 10 0.525004097470241 6.03277613695385e-32 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55512279 C/A 1 256 37 293 121.598951047618 19.4251516063989 102.173799441219 A:C C A 10 0.525004097470241 4.75633324445216e-37 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55512316 T/G 1 210 27 237 99.7491395312494 14.1751106316965 85.5740288995529 A:T:G T G 10 0.525004097470241 1.48667808126716e-32 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55559715 G/A 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55756980 A/G 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55899602 C/T 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55967848 C/T 1 112 147 259 53.199541083333 77.1756023281254 -23.9760612447924 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00337663094923548 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55967716_55967856:ISOC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 55995272 G/A 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 56090076 G/T 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 T:G G T 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 21 6 27 9.97491395312494 3.15002458482145 6.82488936830349 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0109237616307856 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 84 58 142 39.8996558124998 30.450237653274 9.44941815922577 A:G A G 10 0.525004097470241 0.130151537081029 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G A G 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 57133333 T/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 57703258 C/T 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57702869_57703314:ZNF264 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 57705281 C/T 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000083844:ENST00000263095:exon_57705243_57705369:ZNF264 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 57890172 T/A 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:T T A 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000152433:ENST00000282282:exon_57888496_57890923:ZNF547 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 8 1 9 3.79996722023807 0.525004097470241 3.27496312276783 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0411787126107114 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 58058739 T/C 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000251369:ENST00000506609:exon_58058343_58059361:ZNF550 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 58084930 G/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416;ENSG00000083817:ENST00000359489:exon_58084378_58085069:ZNF416;ENSG00000083817:ENST00000428052:exon_58084378_58085069:ZNF416 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 T:C T C 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 42 41 83 19.9498279062499 21.5251679962799 -1.57534009003001 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.742802756032367 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 1 29 27 56 13.774881173363 14.1751106316965 -0.400229458333497 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 T:C T C 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 44 19 63 20.8998197113094 9.97507785193458 10.9247418593748 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0075637808708523 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3483181 C/T 1 128 91 219 60.7994755238091 47.7753728697919 13.0241026540172 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0789362268416319 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 112 81 193 53.199541083333 42.5253318950895 10.6742091882435 T:C C T 10 0.525004097470241 0.130374797635149 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 64 61 125 30.3997377619046 32.0252499456847 -1.62551218378012 A:G A G 10 0.525004097470241 0.788719674499012 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3504687 A/G 1 29 31 60 13.774881173363 16.2751270215775 -2.50024584821446 A:G A G 10 0.525004097470241 0.521586947720975 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 3628383 C/A 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 6990020 C/T 1 10 1 11 4.74995902529759 0.525004097470241 4.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0128013828038059 ENSG00000134326:ENST00000256722:exon_6988447_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000478738:exon_6988449_6990104:CMPK2;ENSG00000134326:ENST00000491738:exon_6990020_6990104:CMPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 408 377 785 193.798328232142 197.926544746281 -4.12821651413918 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.775051012001389 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 85 85 170 40.3746517150295 44.6253482849705 -4.25069656994097 T:C C T 10 0.525004097470241 0.539360339834138 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 19 15 34 9.02492214806542 7.87506146205362 1.14986068601181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.7339423545076 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10929938 G/A 1 225 209 434 106.874078069196 109.72585637128 -2.8517783020846 A:G G A 10 0.525004097470241 0.81013781841284 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10929875_10930015:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10929875_10930015:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10929875_10930015:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10929875_10930015:PDIA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 136 117 253 64.5994427440472 61.4254794040182 3.17396334002903 T:C T C 10 0.525004097470241 0.706011657726386 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 108 124 232 51.299557473214 65.1005080863099 -13.8009506130959 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0757948925074182 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 35 24 59 16.6248565885416 12.6000983392858 4.02475824925578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.30092603334815 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 15 17 32 7.12493853794638 8.9250696569941 -1.80013111904771 T:C C T 10 0.525004097470241 0.596850804818577 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 40 34 74 18.9998361011904 17.8501393139882 1.14969678720217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.816802540330584 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 20838222 C/T 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 24431184 C/T 1 11 19 30 5.22495492782735 9.97507785193458 -4.75012292410723 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0996988732909661 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000427234:exon_24431106_24431188:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449392:exon_24431106_24431185:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24431106_24431188:ITSN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 24432839 A/G 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 A:G A G 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24432687_24432902:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000479575:exon_24432687_24433198:ITSN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 T:C T C 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 25 16 41 11.874897563244 8.40006555952386 3.47483200372012 A:G G A 10 0.525004097470241 0.348315823129575 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27290525 A/G 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27293150 G/T 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 T:G G T 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27315252 G/A 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000429697:exon_27315200_27315316:KHK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 10 15 25 4.74995902529759 7.87506146205362 -3.12510243675603 A:G G A 10 0.525004097470241 0.233781441016375 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27459364 T/C 1 14 5 19 6.64994263541663 2.6250204873512 4.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0697954757664585 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27459152_27459391:CAD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 24 22 46 11.3999016607142 11.5500901443453 -0.150188483631087 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 49 42 91 23.2747992239582 22.0501720937501 1.22462713020807 T:C T C 10 0.525004097470241 0.834197045162833 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 T:C C T 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 33783393 G/A 1 48 39 87 22.7998033214284 20.4751598013394 2.32464352008903 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.668174055462244 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33783278_33783403:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33783278_33783403:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33783278_33783403:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33783278_33783403:RASGRP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 36805923 C/T 1 10 11 21 4.74995902529759 5.77504507217265 -1.02508604687506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.669130983480659 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36805740_36805975:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36805740_36806008:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36805740_36806008:FEZ2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 38298150 A/G 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:G T G 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 9 15 24 4.27496312276783 7.87506146205362 -3.60009833928578 A:C C A 10 0.525004097470241 0.156343128579509 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 A:T T A 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 43015719 T/C 1 14 6 20 6.64994263541663 3.15002458482145 3.49991805059518 T:C T C 10 0.525004097470241 0.177763485431309 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 43518843 A/G 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 A:G A G 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43518835_43519361:THADA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 43625184 T/A 1 3 9 12 1.42498770758928 4.72503687723217 -3.30004916964289 A:T T A 10 0.525004097470241 0.0805904843052766 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43625110_43625197:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 44028013 A/T 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:T A T 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 57 64 121 27.0747664441963 33.6002622380954 -6.52549579389916 T:C T C 10 0.525004097470241 0.238210304917365 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 9 11 20 4.27496312276783 5.77504507217265 -1.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.512362550711290 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 46839477 T/C 1 8 13 21 3.79996722023807 6.82505326711313 -3.02508604687506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.197762713297050 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46839367_46839483:PIGF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 48028282 A/G 1 93 71 164 44.1746189352676 37.2752909203871 6.89932801488047 A:G A G 10 0.525004097470241 0.309510424388014 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48025750_48028294:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48025750_48028294:MSH6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 54093956 G/A 1 31 39 70 14.7248729784225 20.4751598013394 -5.75028682291687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.188377673846220 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 16 12 28 7.59993444047614 6.30004916964289 1.29988527083325 A:G G A 10 0.525004097470241 0.706845049695895 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 55462523 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 55462714 C/A 1 1041 758 1799 494.470734533479 397.953105882443 96.5176286510364 A:T:C C A 10 0.525004097470241 5.12399923883395e-06 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55462564_55462724:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55462564_55462989:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55462564_55462891:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55462564_55462745:RPS27A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 51 29 80 24.2247910290177 15.225118826637 8.99967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0445138097257605 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 55490819 G/T 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 T:G G T 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 55771169 A/T 1 139 95 234 66.0244304516365 49.8753892596729 16.1490411919636 A:T A T 10 0.525004097470241 0.0361709198479197 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 55872538 T/C 1 29 35 64 13.774881173363 18.3751434114584 -4.60026223809543 T:C T C 10 0.525004097470241 0.262038420987785 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 58316814 A/G 1 37 37 74 17.5748483936011 19.4251516063989 -1.85030321279783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.727327097352604 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58316766_58316858:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58316766_58316858:VRK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 58388696 A/G 1 99 104 203 47.0245943504461 54.6004261369051 -7.57583178645893 A:G A G 10 0.525004097470241 0.292602143883411 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58388657_58388773:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58388657_58388773:FANCL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 97 67 164 46.0746025453866 35.1752745305062 10.8993280148805 A:G A G 10 0.525004097470241 0.100363582513668 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.587301756220491 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 16 13 29 7.59993444047614 6.82505326711313 0.774881173363011 A:G G A 10 0.525004097470241 0.853536524042373 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 17 14 31 8.0749303430059 7.35005736458337 0.724872978422528 A:G G A 10 0.525004097470241 0.858468340181549 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 33 35 68 15.674864783482 18.3751434114584 -2.70027862797639 A:G G A 10 0.525004097470241 0.545009886738779 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 65298806 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 T:C T C 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 68385516 G/C 1 47 31 78 22.3248074188987 16.2751270215775 6.0496803973212 A:T:C:G G C 10 0.525004097470241 0.175644183323046 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68385512_68385661:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385512_68385661:PNO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 69659049 C/A 1 34 45 79 16.1498606860118 23.6251843861608 -7.47532370014904 A:C C A 10 0.525004097470241 0.114202587711412 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 20 17 37 9.49991805059518 8.9250696569941 0.574848393601084 A:T A T 10 0.525004097470241 0.870934568892643 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 39 47 86 18.5248401986606 24.6751925811013 -6.15035238244073 T:C C T 10 0.525004097470241 0.196007233531127 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 160 109 269 75.9993444047614 57.2254466242563 18.7738977805052 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0237642369463878 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 70528092 G/A 1 44 52 96 20.8998197113094 27.3002130684525 -6.40039335714314 A:G G A 10 0.525004097470241 0.219963915419930 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70527972_70528735:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000498665:exon_70527640_70528112:FAM136A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71351403 C/A 1 27 18 45 12.8248893683035 9.45007375446434 3.37481561383916 A:C C A 10 0.525004097470241 0.371125755176210 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 36 33 69 17.0998524910713 17.325135216518 -0.225282725446629 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71360282 G/A 1 62 53 115 29.4497459568451 27.8252171659228 1.62452879092228 A:G G A 10 0.525004097470241 0.780137991170263 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 77 69 146 36.5746844947914 36.2252827254466 0.349401769344809 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 56 50 106 26.5997705416665 26.2502048735121 0.349565668154451 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 214 139 353 101.649123141368 72.9755695483635 28.6735535930049 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00234804304992267 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71650231 A/G 1 15 8 23 7.12493853794638 4.20003277976193 2.92490575818446 A:G A G 10 0.525004097470241 0.296814718785059 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000462695:exon_71649944_71650438:ZNF638 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 107 75 182 50.8245615706842 39.3753073102681 11.4492542604161 A:G G A 10 0.525004097470241 0.102259252553961 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 391 360 751 185.723397889136 189.001475089287 -3.27807720015102 T:C C T 10 0.525004097470241 0.826516318020445 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 73800270 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73799389_73800707:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73799389_73800551:ALMS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 73800527 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73799389_73800707:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73799389_73800551:ALMS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 160 194 354 75.9993444047614 101.850794909227 -25.8514505044653 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.00657583842616224 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 24 38 62 11.3999016607142 19.9501557038692 -8.55025404315494 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0309760841375863 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 74596321 T/C 1 28 25 53 13.2998852708333 13.125102436756 0.174782834077226 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74596225_74596341:DCTN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 74597937 G/T 1 18 20 38 8.54992624553566 10.5000819494048 -1.95015570386916 T:G G T 10 0.525004097470241 0.626675337426101 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74597748_74597952:DCTN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 74756242 G/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000115307:ENST00000459792:exon_74755544_74756626:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000258081:exon_74756160_74756409:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000463900:exon_74755878_74756409:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000466894:exon_74755878_74756409:AUP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 74757788 G/A 1 124 5 129 58.8994919136901 2.6250204873512 56.2744714263389 A:G G A 10 0.525004097470241 2.45052618204436e-28 ENSG00000115317:ENST00000258080:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000462909:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000467961:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000484881:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000352222:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000437202:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000484352:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000465521:exon_74757744_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000482205:exon_74757724_74757948:HTRA2;ENSG00000115317:ENST00000482331:exon_74757738_74757948:HTRA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 T:C T C 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 22 11 33 10.4499098556547 5.77504507217265 4.67486478348205 T:C C T 10 0.525004097470241 0.117814033540653 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 85770131 C/T 1 72 48 120 34.1997049821426 25.2001966785716 8.99950830357108 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.119858853134327 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85770024_85770157:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85770024_85770157:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000450355:exon_85770024_85770157:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85770024_85770341:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85770024_85770731:MAT2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 190 149 339 90.2492214806542 78.2256105230659 12.0236109575883 T:C T C 10 0.525004097470241 0.192393223654728 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 86433240 C/T 1 122 168 290 57.9495001086306 88.2006883750005 -30.2511882663699 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.00040489986885816 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 7550 2 7552 3586.21906409968 1.05000819494048 3585.16905590474 A:T:C:G C T 10 0.525004097470241 4.94065645841247e-324 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 89185363 C/T 1 35 7976 8011 16.6248565885416 4187.43268142264 -4170.8078248341 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 89185466 A/G 1 69 6435 6504 32.7747172745534 3378.401367221 -3345.62664994645 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 4.94065645841247e-324 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 89185475 A/G 1 76 7848 7924 36.0996885922617 4120.23215694645 -4084.13246835419 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 89185519 G/A 1 66 4744 4810 31.3497295669641 2490.61943839882 -2459.26970883186 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 17 19 36 8.0749303430059 9.97507785193458 -1.90014750892868 A:G A G 10 0.525004097470241 0.617382886844251 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 3 10 13 1.42498770758928 5.25004097470241 -3.82505326711313 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0487659359645473 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 96940713 T/C 1 632 646 1278 300.197410398808 339.152646965776 -38.955236566968 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.0309977164296916 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96940074_96940893:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000349783:exon_96940077_96940893:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96940469_96940893:SNRNP200 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 14 18 32 6.64994263541663 9.45007375446434 -2.80013111904771 A:G A G 10 0.525004097470241 0.377440218208842 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 18 14 32 8.54992624553566 7.35005736458337 1.19986888095229 T:C C T 10 0.525004097470241 0.725678409930913 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 18 19 37 8.54992624553566 9.97507785193458 -1.42515160639892 A:G A G 10 0.525004097470241 0.742546320002449 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 27 24 51 12.8248893683035 12.6000983392858 0.224791029017709 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 39 56 95 18.5248401986606 29.4002294583335 -10.8753892596729 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0305090992096082 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 97166204 A/G 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G A G 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 98373842 A/T 1 26 40 66 12.3498934657737 21.0001638988096 -8.6502704330359 A:T A T 10 0.525004097470241 0.0360916756390828 ENSG00000075568:ENST00000485245:exon_98372799_98373846:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98372803_98373846:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98372803_98373846:TMEM131 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 98409228 C/T 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 249 223 472 118.27397972991 117.075913735864 1.19806599404623 T:C C T 10 0.525004097470241 0.92660666956836 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 104 86 190 49.3995738630949 45.1503523824407 4.24922148065421 T:C T C 10 0.525004097470241 0.561588032358509 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 35 11 46 16.6248565885416 5.77504507217265 10.8498115163689 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00162459387598983 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:C C T 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 36 4 40 17.0998524910713 2.10001638988096 14.9998361011904 T:C C T 10 0.525004097470241 5.87831214649744e-07 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 101879023 G/A 1 39 25 64 18.5248401986606 13.125102436756 5.39973776190458 A:G G A 10 0.525004097470241 0.210573804775858 ENSG00000158435:ENST00000289382:exon_101879001_101879153:C2orf29;ENSG00000158435:ENST00000462489:exon_101878893_101879153:C2orf29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 44 33 77 20.8998197113094 17.325135216518 3.57468449479144 T:C C T 10 0.525004097470241 0.427010661830064 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 34 26 60 16.1498606860118 13.6501065342263 2.49975415178554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.605505739688403 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 126 107 233 59.8494837187496 56.1754384293158 3.67404528943384 A:G A G 10 0.525004097470241 0.646557041363898 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 105959592 G/A 1 45 47 92 21.3748156138392 24.6751925811013 -3.30037696726217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.5316096668298 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105959305_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105959558_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105959558_105959680:C2orf49 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 109400267 C/T 1 171 162 333 81.2242993325888 85.050663790179 -3.82636445759026 T:C C T 10 0.525004097470241 0.70101919188412 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109400052_109402267:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109400052_109400561:RANBP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 109429146 T/A 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:T T A 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000163006:ENST00000412964:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000409529:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000295124:exon_109429087_109429164:CCDC138;ENSG00000163006:ENST00000456512:exon_109429087_109429164:CCDC138 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 C:G G C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G A G 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 54 41 95 25.649778736607 21.5251679962799 4.1246107403271 T:C T C 10 0.525004097470241 0.412851653845789 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 41 47 88 19.4748320037201 24.6751925811013 -5.20036057738121 A:G A G 10 0.525004097470241 0.286639728082381 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 128047304 G/A 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G G A 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000163161:ENST00000426778:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000285398:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000445889:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000494464:exon_128046913_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000456257:exon_128047265_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000460485:exon_128046952_128047400:ERCC3;ENSG00000163161:ENST00000462306:exon_128047272_128047849:ERCC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 128934400 T/C 1 2 9 11 0.949991805059518 4.72503687723217 -3.77504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0314607471472406 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128934388_128934472:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128934388_128934472:UGGT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 18 5 23 8.54992624553566 2.6250204873512 5.92490575818446 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0195670078465095 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 133539566 G/A 1 6 11 17 2.84997541517855 5.77504507217265 -2.9250696569941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.223914944795774 ENSG00000176771:ENST00000317721:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000409261:exon_133539513_133543291:NCKAP5;ENSG00000176771:ENST00000473859:exon_133539513_133539596:NCKAP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 135911422 T/C 1 30 40 70 14.2498770758928 21.0001638988096 -6.75028682291687 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.119775777318410 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135911219_135911446:RAB3GAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 136473229 T/C 1 11 2 13 5.22495492782735 1.05000819494048 4.17494673288687 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0245694251324368 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136473120_136473264:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136473120_136473264:R3HDM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 16 18 34 7.59993444047614 9.45007375446434 -1.85013931398819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.607465957103586 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 37 22 59 17.5748483936011 11.5500901443453 6.02475824925578 A:T:G A T 10 0.525004097470241 0.119901044753437 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 152331418 C/G 1 14 20 34 6.64994263541663 10.5000819494048 -3.85013931398819 C:G C G 10 0.525004097470241 0.22939073204673 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 160139284 A/C 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:C A C 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160139183_160139604:WDSUB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 160182302 C/T 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000474437:exon_160182275_160182429:BAZ2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 162087835 G/A 1 35 33 68 16.6248565885416 17.325135216518 -0.700278627976388 A:G G A 10 0.525004097470241 0.903687295297579 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000439442:exon_162087697_162088062:TANK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 21 22 43 9.97491395312494 11.5500901443453 -1.57517619122036 A:G G A 10 0.525004097470241 0.649848981747698 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 474 408 882 225.148057799106 214.201671767858 10.9463860312474 A:T:G T A 10 0.525004097470241 0.478975717050283 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 170678476 G/A 1 151 127 278 71.7243812819936 66.6755203787206 5.048860903273 A:G G A 10 0.525004097470241 0.54888584765612 ENSG00000138382:ENST00000409837:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000260953:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000392640:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000409965:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000410097:exon_170678453_170678567:METTL5;ENSG00000138382:ENST00000308099:exon_170678453_170678567:METTL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 16 18 34 7.59993444047614 9.45007375446434 -1.85013931398819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.607465957103586 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 52 58 110 24.6997869315475 30.450237653274 -5.75045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.294103356041538 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 173460640 T/C 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 T:C T C 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000152256:ENST00000282077:exon_173460557_173461193:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000392571:exon_173460557_173460697:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000410055:exon_173460557_173460751:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000466437:exon_173460557_173460690:PDK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 40 33 73 18.9998361011904 17.325135216518 1.67470088467241 A:C A C 10 0.525004097470241 0.726307451616351 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 179403593 G/A 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:G G A 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 179406191 C/T 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000460472:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000359218:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342175:exon_179406009_179406311:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179406009_179406311:TTN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 153 147 300 72.6743730870531 77.1756023281254 -4.50122924107231 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.603498517783449 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 151 146 297 71.7243812819936 76.6505982306552 -4.92621694866159 A:T A T 10 0.525004097470241 0.601132752361929 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 182395345 G/A 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 A:G G A 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 16 22 38 7.59993444047614 11.5500901443453 -3.95015570386916 T:C T C 10 0.525004097470241 0.255294680918394 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 13 17 30 6.17494673288687 8.9250696569941 -2.75012292410723 T:G T G 10 0.525004097470241 0.362674876612972 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 41 37 78 19.4748320037201 19.4251516063989 0.0496803973212003 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 10 15 25 4.74995902529759 7.87506146205362 -3.12510243675603 A:G A G 10 0.525004097470241 0.233781441016375 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 191231458 G/A 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 191235901 A/C 1 40 39 79 18.9998361011904 20.4751598013394 -1.47532370014904 A:C A C 10 0.525004097470241 0.821923291744223 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 20 22 42 9.49991805059518 11.5500901443453 -2.05017209375012 A:G A G 10 0.525004097470241 0.540604176828727 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 21 16 37 9.97491395312494 8.40006555952386 1.57484839360108 A:T T A 10 0.525004097470241 0.62577475340014 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G G A 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 73 98 171 34.6747008846724 51.4504015520836 -16.7757006674112 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0113558578337253 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 200820554 C/T 1 21 14 35 9.97491395312494 7.35005736458337 2.62485658854156 T:C C T 10 0.525004097470241 0.401942910298358 ENSG00000178074:ENST00000491721:exon_200820091_200820658:C2orf69;ENSG00000162972:ENST00000295079:exon_200820220_200820971:C2orf47;ENSG00000162972:ENST00000392290:exon_200820326_200820971:C2orf47;ENSG00000162972:ENST00000435773:exon_200820544_200820971:C2orf47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 201253956 A/G 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000196141:ENST00000439084:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000444012:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000471601:exon_201253946_201255577:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000428692:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000459656:exon_201253946_201255591:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201253946_201254006:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201253946_201254006:SPATS2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 20 14 34 9.49991805059518 7.35005736458337 2.14986068601181 C:G C G 10 0.525004097470241 0.496235271064969 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 5 12 17 2.3749795126488 6.30004916964289 -3.9250696569941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.086338764497693 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 12 13 25 5.69995083035711 6.82505326711313 -1.12510243675603 A:C C A 10 0.525004097470241 0.692480003939152 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 203130632 G/C 1 39 39 78 18.5248401986606 20.4751598013394 -1.9503196026788 C:G G C 10 0.525004097470241 0.734023198748124 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203130439_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203130459_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203130459_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203130488_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203130488_203130709:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000467734:exon_203130502_203130709:NOP58 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 204154552 C/T 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431075:exon_204154488_204154599:CYP20A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 207631461 G/A 1 9 4 13 4.27496312276783 2.10001638988096 2.17494673288687 A:G G A 10 0.525004097470241 0.274674059283919 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000418289:exon_207631368_207631789:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207631368_207632194:FASTKD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 207636983 A/T 1 20 16 36 9.49991805059518 8.40006555952386 1.09985249107132 A:T A T 10 0.525004097470241 0.741571737994055 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207636905_207637044:FASTKD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 208477852 G/A 1 58 24 82 27.549762346726 12.6000983392858 14.9496640074402 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000859362974161158 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 208477956 C/T 1 38 26 64 18.0498442961308 13.6501065342263 4.39973776190458 T:C C T 10 0.525004097470241 0.31691615587941 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 22 19 41 10.4499098556547 9.97507785193458 0.474832003720119 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 215712095 A/G 0 209 0 209 99.2741436287196 0 99.2741436287196 A A 10 0.525004097470241 3.58036377981916e-59 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 24 19 43 11.3999016607142 9.97507785193458 1.42482380877964 A:T A T 10 0.525004097470241 0.760602724661103 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 2 14 16 0.949991805059518 7.35005736458337 -6.40006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00162538620142623 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 15 8 23 7.12493853794638 4.20003277976193 2.92490575818446 C:G G C 10 0.525004097470241 0.296814718785059 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219501133 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000115556:ENST00000396797:exon_219500966_219501300:PLCD4;ENSG00000115556:ENST00000459791:exon_219500966_219501907:PLCD4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219526649 G/A 1 25 15 40 11.874897563244 7.87506146205362 3.99983610119036 A:G G A 10 0.525004097470241 0.267578525144482 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000443791:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219526389_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526574_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219526641_219526676:BCS1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 38 29 67 18.0498442961308 15.225118826637 2.82472546949385 T:C T C 10 0.525004097470241 0.541583122222804 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 71 63 134 33.7247090796129 33.0752581406252 0.649450938987705 T:C T C 10 0.525004097470241 0.931259506732838 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 20 18 38 9.49991805059518 9.45007375446434 0.0498442961308427 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219674482 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000135929:ENST00000494263:exon_219674300_219674490:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000258415:exon_219674300_219674490:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000411688:exon_219674300_219674490:CYP27A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 22 17 39 10.4499098556547 8.9250696569941 1.5248401986606 A:G G A 10 0.525004097470241 0.635382193648771 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 27 28 55 12.8248893683035 14.7001147291667 -1.87522536086326 A:G A G 10 0.525004097470241 0.685951321633768 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 43 29 72 20.4248238087796 15.225118826637 5.19970498214265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.239080579176920 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 32 35 67 15.1998688809523 18.3751434114584 -3.17527453050615 A:G A G 10 0.525004097470241 0.464478916334747 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220045902 C/T 1 19 24 43 9.02492214806542 12.6000983392858 -3.57517619122036 T:C C T 10 0.525004097470241 0.288768991270959 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 21 16 37 9.97491395312494 8.40006555952386 1.57484839360108 A:C C A 10 0.525004097470241 0.62577475340014 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 18 17 35 8.54992624553566 8.9250696569941 -0.375143411458435 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220405321 T/C 1 17 10 27 8.0749303430059 5.25004097470241 2.82488936830349 T:C T C 10 0.525004097470241 0.336808455248746 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 224824617 A/G 1 94 88 182 44.6496148377973 46.2003605773812 -1.55074573958387 A:G A G 10 0.525004097470241 0.824223050113404 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 225653845 G/T 1 21 10 31 9.97491395312494 5.25004097470241 4.72487297842253 T:G G T 10 0.525004097470241 0.105800853185697 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225653781_225653887:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225653781_225653887:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409802:exon_225653781_225653887:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225653781_225653887:DOCK10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 225750861 C/T 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225750780_225750902:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000471810:exon_225750798_225750902:DOCK10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 228194480 A/T 1 10 1 11 4.74995902529759 0.525004097470241 4.22495492782735 A:T A T 10 0.525004097470241 0.0128013828038059 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 228194481 G/T 1 10 1 11 4.74995902529759 0.525004097470241 4.22495492782735 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0128013828038059 ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228193394_228195562:MFF;ENSG00000168958:ENST00000485697:exon_228194322_228194806:MFF;ENSG00000168958:ENST00000436237:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000443428:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000418961:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228194322_228194499:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228194462_228194499:MFF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 323 335 658 153.423676517112 175.876372652531 -22.4526961354186 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.0858215003541052 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 23 39 62 10.9249057581845 20.4751598013394 -9.55025404315494 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0157647431503693 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 231256812 A/G 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 115 121 236 54.6245287909223 63.5254957938992 -8.90096700297688 A:G G A 10 0.525004097470241 0.267854389055719 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 25 24 49 11.874897563244 12.6000983392858 -0.72520077604181 T:C C T 10 0.525004097470241 0.886736941622127 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 234115337 G/A 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.324211612884598 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 4 12 16 1.89998361011904 6.30004916964289 -4.40006555952386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0420296821516283 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 238990388 G/A 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 A:G G A 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 239237953 G/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:G G T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 46 36 82 21.8498115163689 18.9001475089287 2.94966400744024 T:C T C 10 0.525004097470241 0.580685575672348 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 A:G G A 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 6 10 16 2.84997541517855 5.25004097470241 -2.40006555952386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.317285569368452 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 242179134 G/A 1 110 115 225 52.2495492782735 60.3754712090777 -8.12592193080422 A:G G A 10 0.525004097470241 0.286044278311903 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242179017_242179151:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427487:exon_242179017_242179235:HDLBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 242189379 G/A 1 25 32 57 11.874897563244 16.8001311190477 -4.92523355580374 A:G G A 10 0.525004097470241 0.232421281604629 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242189256_242190352:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000498595:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000476807:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000477477:exon_242189256_242189395:HDLBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 28 27 55 13.2998852708333 14.1751106316965 -0.875225360863256 T:C T C 10 0.525004097470241 0.892804290201531 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 54 28 82 25.649778736607 14.7001147291667 10.9496640074402 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0196715581595067 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 2 242707213 G/A 1 20 15 35 9.49991805059518 7.87506146205362 1.62485658854157 A:G G A 10 0.525004097470241 0.615470018039268 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242707128_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242707125_242707363:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242707125_242708231:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000468064:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000445308:exon_242707125_242707377:D2HGDH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 14 8 22 6.64994263541663 4.20003277976193 2.4499098556547 T:C T C 10 0.525004097470241 0.393965092361931 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 12 16 28 5.69995083035711 8.40006555952386 -2.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.347018973521548 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 T:C T C 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 826127 C/T 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 T:C C T 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 76 58 134 36.0996885922617 30.450237653274 5.64945093898771 T:G T G 10 0.525004097470241 0.342382834118644 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 1115919 A/G 1 97 81 178 46.0746025453866 42.5253318950895 3.5492706502971 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.600395641905281 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1115764_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1115483_1115949:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1115821_1115949:PSMF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 79 74 153 37.524676299851 38.8503032127978 -1.32562691294687 T:C C T 10 0.525004097470241 0.871494853892851 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 2464112 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000088876:ENST00000278772:exon_2462463_2465302:ZNF343;ENSG00000088876:ENST00000465019:exon_2462463_2465302:ZNF343 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 291 310 601 138.22380763616 162.751270215775 -24.5274625796148 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0454409324090793 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 2638982 C/G 1 535 423 958 254.122807853421 222.076733229912 32.0460746235091 T:C:G C G 10 0.525004097470241 0.0384448321558810 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:G T G 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 3783764 C/T 1 18 15 33 8.54992624553566 7.87506146205362 0.674864783482047 T:C C T 10 0.525004097470241 0.862974571050688 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000480816:exon_3783755_3783853:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000468979:exon_3783755_3783822:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000495915:exon_3783755_3783853:CDC25B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 5547384 C/T 1 14 11 25 6.64994263541663 5.77504507217265 0.874897563243974 T:C C T 10 0.525004097470241 0.842085588637267 ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5547379_5547418:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5547379_5547418:GPCPD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 5556512 G/A 1 7 18 25 3.32497131770831 9.45007375446434 -6.12510243675603 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0158902127618526 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556462_5556624:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556462_5556624:GPCPD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 22 25 47 10.4499098556547 13.125102436756 -2.67519258110133 T:C T C 10 0.525004097470241 0.467369378092847 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 22 25 47 10.4499098556547 13.125102436756 -2.67519258110133 T:C T C 10 0.525004097470241 0.467369378092847 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 42 63 105 19.9498279062499 33.0752581406252 -13.1254302343753 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0109678659051932 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 7980390 C/T 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000527925:exon_7980379_7980469:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000462384:exon_7980379_7980507:TMX4;ENSG00000125827:ENST00000530935:exon_7980379_7980507:TMX4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 78 70 148 37.0496803973212 36.7502868229169 0.299393574404334 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 13756539 C/A 1 58 48 106 27.549762346726 25.2001966785716 2.34956566815445 A:C C A 10 0.525004097470241 0.697632500238385 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13756519_13756916:ESF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 14 10 24 6.64994263541663 5.25004097470241 1.39990166071422 T:C T C 10 0.525004097470241 0.684012711255136 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 24944447 G/A 1 40 26 66 18.9998361011904 13.6501065342263 5.3497295669641 A:G G A 10 0.525004097470241 0.217849321954996 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24943581_24944658:C20orf3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 25260931 A/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 25261605 C/T 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 T:C C T 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25261585_25261748:PYGB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 7 16 23 3.32497131770831 8.40006555952386 -5.07509424181554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0376646068509559 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 68 56 124 32.2997213720236 29.4002294583335 2.89949191369011 C:G G C 10 0.525004097470241 0.653270692181145 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 30382315 A/G 1 72 67 139 34.1997049821426 35.1752745305062 -0.975569548363502 A:G A G 10 0.525004097470241 0.865683236511141 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 59 57 116 28.0247582492558 29.9252335558037 -1.90047530654796 T:C C T 10 0.525004097470241 0.780490596989483 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 32256055 G/T 0 0 9 9 0 4.72503687723217 -4.72503687723217 T G T 10 0.525004097470241 0.00123086031483276 ENSG00000182584:ENST00000330271:exon_32254304_32256331:C20orf134 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 37 25 62 17.5748483936011 13.125102436756 4.44974595684506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.309076323543211 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 33068898 G/A 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 A:G G A 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000078747:ENST00000374864:exon_33068871_33069011:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000262650:exon_33068871_33069011:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000483727:exon_33068871_33068981:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000461661:exon_33068871_33068987:ITCH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 33703607 C/T 1 56 69 125 26.5997705416665 36.2252827254466 -9.62551218378013 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0891513568486114 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 C:G G C 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 39797465 T/C 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 T:C T C 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000124181:ENST00000244007:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373271:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000373272:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000477870:exon_39797407_39797510:PLCG1;ENSG00000124181:ENST00000483175:exon_39797396_39797510:PLCG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 43118017 G/A 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000124120:ENST00000262605:exon_43117904_43123244:TTPAL;ENSG00000124120:ENST00000372904:exon_43117904_43123244:TTPAL;ENSG00000124120:ENST00000372906:exon_43117904_43118477:TTPAL;ENSG00000124120:ENST00000456317:exon_43117904_43118094:TTPAL;ENSG00000124120:ENST00000461134:exon_43117904_43120456:TTPAL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 144 147 291 68.3994099642853 77.1756023281254 -8.77619236384014 A:C A C 10 0.525004097470241 0.318515839616170 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 A:G A G 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 23 13 36 10.9249057581845 6.82505326711313 4.09985249107132 A:G G A 10 0.525004097470241 0.185209330972454 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 18 10 28 8.54992624553566 5.25004097470241 3.29988527083325 T:C T C 10 0.525004097470241 0.257446536150787 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44507214 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000132801:ENST00000255152:exon_44505353_44507761:ZSWIM3;ENSG00000132801:ENST00000454862:exon_44505353_44507767:ZSWIM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44512082 G/A 1 10 5 15 4.74995902529759 2.6250204873512 2.12493853794639 A:G G A 10 0.525004097470241 0.310879488899670 ENSG00000168612:ENST00000372523:exon_44511172_44513905:ZSWIM1;ENSG00000168612:ENST00000372520:exon_44511172_44513037:ZSWIM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44578674 T/A 1 21 10 31 9.97491395312494 5.25004097470241 4.72487297842253 A:T T A 10 0.525004097470241 0.105800853185697 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578605_44578708:ZNF335 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44645010 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000100985:ENST00000372330:exon_44644889_44645200:MMP9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 44698893 G/A 1 20 8 28 9.49991805059518 4.20003277976193 5.29988527083325 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0571845827946928 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44698849_44699175:NCOA5;ENSG00000124160:ENST00000372291:exon_44698849_44699175:NCOA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 47258763 C/T 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47258706_47258796:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000496915:exon_47258651_47258796:PREX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 27 9 36 12.8248893683035 4.72503687723217 8.09985249107132 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00715431589478223 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 47267480 A/G 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G A G 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267432_47267593:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267432_47267593:PREX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 16 18 34 7.59993444047614 9.45007375446434 -1.85013931398819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.607465957103586 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 19 19 38 9.02492214806542 9.97507785193458 -0.950155703869157 A:G G A 10 0.525004097470241 0.871256227671061 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 52573971 T/G 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 A:T:G T G 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52573971_52574036:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52573971_52574036:BCAS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 55931594 C/T 1 39 48 87 18.5248401986606 25.2001966785716 -6.67535647991097 T:C C T 10 0.525004097470241 0.163451333342962 ENSG00000101146:ENST00000395841:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000371242:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000527947:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000492498:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000411894:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000429339:exon_55931502_55931594:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000395840:exon_55931502_55931594:RAE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 55982858 G/C 1 27 16 43 12.8248893683035 8.40006555952386 4.42482380877964 C:G G C 10 0.525004097470241 0.221626992802355 ENSG00000132819:ENST00000356208:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000344785:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000371219:exon_55982599_55982916:RBM38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 56179586 G/A 1 20 12 32 9.49991805059518 6.30004916964289 3.19986888095229 A:G G A 10 0.525004097470241 0.291118989255871 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 A:G G A 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 56227514 T/C 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 15 18 33 7.12493853794638 9.45007375446434 -2.32513521651795 C:G C G 10 0.525004097470241 0.486906182454096 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 57478807 C/T 1 468 445 913 222.298082383927 233.626823374257 -11.32874099033 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.466038990119716 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 57564695 C/T 1 17 7 24 8.0749303430059 3.67502868229169 4.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.100334464797444 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000482747:exon_57563969_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57564543_57564695:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57564543_57564695:TH1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 233 236 469 110.674045289434 123.900967002977 -13.226921713543 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.229432450996445 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 75 74 149 35.6246926897319 38.8503032127978 -3.22561052306591 A:T:C C A 10 0.525004097470241 0.623051500851494 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 816 794 1610 387.596656464283 416.853253391371 -29.256596927088 A:G G A 10 0.525004097470241 0.147817550805598 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 736 724 1460 349.596984261903 380.102966568455 -30.5059823065519 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.110029982294253 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 60966374 G/C 1 1 10 11 0.474995902529759 5.25004097470241 -4.77504507217265 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0044893073339257 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 5 12 17 2.3749795126488 6.30004916964289 -3.9250696569941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.086338764497693 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 20 62607160 C/T 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 T:C C T 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 15399864 T/C 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 T T 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 15889304 C/G 1 35 51 86 16.6248565885416 26.7752089709823 -10.1503523824407 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0307400754482876 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 19169218 G/C 1 21 27 48 9.97491395312494 14.1751106316965 -4.20019667857157 C:G G C 10 0.525004097470241 0.248962696608899 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000493464:exon_19169040_19169435:C21orf91 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 26965100 C/A 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 A:C C A 10 0.525004097470241 0.208503308664772 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 239 288 527 113.524020704612 151.201180071429 -37.677159366817 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00105912670107415 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 315 361 676 149.623709296874 189.526479186757 -39.9027698898829 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00232536741093549 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 89 98 187 42.2746353251486 51.4504015520836 -9.17576622693507 T:C T C 10 0.525004097470241 0.187842938567879 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 26978950 A/G 1 124 112 236 58.8994919136901 58.800458916667 0.0990329970231159 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34715699 G/C 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 A:C:G G C 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34715574_34715728:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34715574_34715728:IFNAR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34721562 G/C 1 43 35 78 20.4248238087796 18.3751434114584 2.0496803973212 C:G G C 10 0.525004097470241 0.652348003252989 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721397_34721596:IFNAR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34925689 G/A 1 4 19 23 1.89998361011904 9.97507785193458 -8.07509424181554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00114816581989630 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 28 20 48 13.2998852708333 10.5000819494048 2.79980332142843 A:G G A 10 0.525004097470241 0.47121270323275 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 21 28 49 9.97491395312494 14.7001147291667 -4.72520077604181 T:C C T 10 0.525004097470241 0.198758133251434 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 9 31 40 4.27496312276783 16.2751270215775 -12.0001638988096 T:C T C 10 0.525004097470241 0.000179755238300890 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 34971474 T/C 1 17 19 36 8.0749303430059 9.97507785193458 -1.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.617382886844251 ENSG00000205758:ENST00000381554:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000416217:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000290244:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000381540:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000452420:exon_34971456_34971591:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000437996:exon_34971456_34971591:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000361534:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000429827:exon_34971456_34971591:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000420072:exon_34971456_34971591:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000440526:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000479964:exon_34971456_34971554:CRYZL1;ENSG00000205758:ENST00000414079:exon_34971456_34971554:CRYZL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 792 819 1611 376.196754803569 429.978355828127 -53.7816010245583 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.00758899455152272 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:C C T 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 37741929 T/C 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000159256:ENST00000400485:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000290384:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000487909:exon_37741286_37742174:MORC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 12 6 18 5.69995083035711 3.15002458482145 2.54992624553566 T:C T C 10 0.525004097470241 0.248457334165905 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 42749081 T/C 1 24 15 39 11.3999016607142 7.87506146205362 3.5248401986606 T:C T C 10 0.525004097470241 0.267348993594656 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 8 14 22 3.79996722023807 7.35005736458337 -3.5500901443453 C:G C G 10 0.525004097470241 0.140344488198196 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 29 21 50 13.774881173363 11.0250860468751 2.74979512648795 A:G G A 10 0.525004097470241 0.480613854738352 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 35 39 74 16.6248565885416 20.4751598013394 -3.85030321279783 T:G T G 10 0.525004097470241 0.415607206018568 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 51 53 104 24.2247910290177 27.8252171659228 -3.60042613690506 A:G G A 10 0.525004097470241 0.493287620415974 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 A:G G A 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45107875 G/A 1 12 9 21 5.69995083035711 4.72503687723217 0.974913953124939 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827768170148087 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45173480 C/T 1 310 322 632 147.248729784225 169.051319385418 -21.8025896011923 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0867455916723946 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45173464_45173535:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45173464_45173600:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000461123:exon_45173464_45173600:PDXK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 137 104 241 65.074438646577 54.6004261369051 10.4740125096719 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.196976825529621 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45217973 C/T 1 89 78 167 42.2746353251486 40.9503196026788 1.32431572246976 T:C C T 10 0.525004097470241 0.87697215316094 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45389040 C/T 1 13 7 20 6.17494673288687 3.67502868229169 2.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 0.3710246623915 ENSG00000160216:ENST00000291572:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000438598:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398061:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000327505:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398063:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000398058:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000457068:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000422850:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000479117:exon_45388999_45389160:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000481319:exon_45388999_45389148:AGPAT3;ENSG00000160216:ENST00000467358:exon_45388999_45389160:AGPAT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 17 18 35 8.0749303430059 9.45007375446434 -1.37514341145843 A:G A G 10 0.525004097470241 0.735698242022473 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45542141 A/G 1 14 22 36 6.64994263541663 11.5500901443453 -4.90014750892868 A:G A G 10 0.525004097470241 0.132185565685893 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45542058_45542238:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 45773559 T/A 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 A:T T A 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45773484_45773748:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000431901:exon_45773484_45773748:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45773139_45773748:TRPM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 46311813 A/G 1 43 37 80 20.4248238087796 19.4251516063989 0.999672202380719 A:G A G 10 0.525004097470241 0.910961682452758 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46311724_46311911:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46311724_46311911:ITGB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 A:C C A 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 46935540 G/A 1 13 10 23 6.17494673288687 5.25004097470241 0.924905758184457 A:G G A 10 0.525004097470241 0.835357270424024 ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46933690_46936054:SLC19A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 1 63 44 107 29.9247418593748 23.1001802886906 6.82456157068421 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208363192017786 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47581961 C/A 1 34 11 45 16.1498606860118 5.77504507217265 10.3748156138392 A:C C A 10 0.525004097470241 0.00243198300032491 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47664746 C/T 1 42 65 107 19.9498279062499 34.1252663355657 -14.1754384293158 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00658338887987452 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47664721_47665111:MCM3AP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47665033 C/T 1 16 23 39 7.59993444047614 12.0750942418155 -4.4751598013394 T:C C T 10 0.525004097470241 0.199015696651785 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47664721_47665111:MCM3AP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 4 10 14 1.89998361011904 5.25004097470241 -3.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.106123236614285 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47695220 A/G 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G A G 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47695100_47695239:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47695100_47695239:MCM3AP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47836206 A/C 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47836216 A/G 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 A:G A G 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47836395 T/G 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47836547 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47850100 C/T 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47849924_47850146:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47849924_47850146:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 17589567 C/T 1 2 9 11 0.949991805059518 4.72503687723217 -3.77504507217265 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0314607471472406 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 17590269 C/T 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 A:C C A 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 A:G A G 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 18209920 C/T 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 320 275 595 151.998688809523 144.376126804316 7.62256200520662 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.53833867727492 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 19468514 T/C 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000438587:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000455750:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000491520:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000483431:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19468476_19468568:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000487669:exon_19468476_19468568:CDC45 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 33 16 49 15.674864783482 8.40006555952386 7.27479922395819 T:C:G T G 10 0.525004097470241 0.044526909599566 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 19906511 G/A 1 11 15 26 5.22495492782735 7.87506146205362 -2.65010653422627 A:G G A 10 0.525004097470241 0.330387936784344 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19906383_19906527:TXNRD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 16 6 22 7.59993444047614 3.15002458482145 4.4499098556547 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0854160379206465 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 29 15 44 13.774881173363 7.87506146205362 5.89981971130939 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0958729023015922 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 22162126 A/G 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000100030:ENST00000215832:exon_22161953_22162135:MAPK1;ENSG00000100030:ENST00000415911:exon_22161953_22162135:MAPK1;ENSG00000100030:ENST00000398822:exon_22161953_22162135:MAPK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 22550401 C/G 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 C:G C G 10 0.525004097470241 0.187185823684523 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 22550450 C/G 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23055533 G/A 0 25 0 25 11.874897563244 0 11.874897563244 G G 10 0.525004097470241 1.09206005896166e-07 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23055539 G/T 0 25 0 25 11.874897563244 0 11.874897563244 G G 10 0.525004097470241 1.09206005896166e-07 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23101523 G/A 0 0 13 13 0 6.82505326711313 -6.82505326711313 A G A 10 0.525004097470241 6.26568016864116e-05 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23213940 C/T 1 1 231 232 0.474995902529759 121.275946515626 -120.800950613096 T:C C T 10 0.525004097470241 2.52754822006230e-73 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23213972 A/G 0 0 135 135 0 70.8755531584825 -70.8755531584825 G A G 10 0.525004097470241 2.25492209487244e-44 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23213985 A/G 1 1 206 207 0.474995902529759 108.15084407887 -107.67584817634 A:C:G A G 10 0.525004097470241 2.72985093675413e-65 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23214048 G/C 1 1 597 598 0.474995902529759 313.427446189734 -312.952450287204 C:G G C 10 0.525004097470241 3.02948511687456e-191 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 23264785 C/A 1 16 3 19 7.59993444047614 1.57501229241072 6.02492214806542 A:C C A 10 0.525004097470241 0.00532952606411964 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 169 165 334 80.2743075275293 86.6256760825898 -6.35136855506049 A:G G A 10 0.525004097470241 0.511002476263543 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 49 68 117 23.2747992239582 35.7002786279764 -12.4254794040182 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 0.0259070558803608 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 24179922 G/C 1 21 19 40 9.97491395312494 9.97507785193458 -0.000163898809640628 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000099958:ENST00000406855:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24179846_24180041:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24179846_24180041:DERL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 24224655 G/A 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 24224659 C/A 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224646_24224733:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224646_24224833:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24222596_24224833:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224646_24224833:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224646_24224833:AP000350.10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 17 19 36 8.0749303430059 9.97507785193458 -1.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.617382886844251 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 25753231 G/A 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G G A 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29090074 C/T 1 27 19 46 12.8248893683035 9.97507785193458 2.84981151636891 T:C C T 10 0.525004097470241 0.46138635759268 ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000434810:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382563:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382578:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000403642:exon_29090020_29090105:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29090020_29090105:CHEK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29130458 T/C 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382578:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382565:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000403642:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000447421:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000439200:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000398017:exon_29130391_29130715:CHEK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29656389 G/T 1 35 29 64 16.6248565885416 15.225118826637 1.39973776190457 T:G G T 10 0.525004097470241 0.802678181275534 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29656315_29656602:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656315_29656602:RHBDD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29724792 T/C 1 33 47 80 15.674864783482 24.6751925811013 -9.00032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0563487732977311 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29724727_29724884:AP1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29736660 A/G 1 19 16 35 9.02492214806542 8.40006555952386 0.624856588541565 A:G A G 10 0.525004097470241 0.867113990064794 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29736645_29736826:AP1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 50 54 104 23.7497951264879 28.350221263393 -4.60042613690506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.378311429789059 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 28 25 53 13.2998852708333 13.125102436756 0.174782834077226 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 1121 1159 2280 532.47040673586 608.479748968009 -76.0093422321495 A:T:G A G 10 0.525004097470241 0.00153834443494864 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 15 8 23 7.12493853794638 4.20003277976193 2.92490575818446 T:G T G 10 0.525004097470241 0.296814718785059 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 30973025 G/A 1 162 153 315 76.949336209821 80.3256269129469 -3.37629070312592 A:G G A 10 0.525004097470241 0.735073002268481 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30972617_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30972619_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30972623_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30972652_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30972822_30973116:PES1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 30975861 C/T 1 186 174 360 88.3492378705352 91.3507129598219 -3.00147508928676 T:C C T 10 0.525004097470241 0.751879014381013 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 22 8 30 10.4499098556547 4.20003277976193 6.24987707589277 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0271302618884822 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 31011674 T/C 1 9 11 20 4.27496312276783 5.77504507217265 -1.50008194940482 T:C T C 10 0.525004097470241 0.512362550711290 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 13 3 16 6.17494673288687 1.57501229241072 4.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0237907033315813 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 C:G G C 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 49 40 89 23.2747992239582 21.0001638988096 2.27463532514855 A:G G A 10 0.525004097470241 0.671847583834076 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G G A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 5 20 25 2.3749795126488 10.5000819494048 -8.12510243675602 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00110843664148622 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 32014161 G/A 1 74 81 155 35.1496967872022 42.5253318950895 -7.37563510788735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.260205690047113 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32014101_32014212:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32014101_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32014101_32014212:SFI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 32044248 G/A 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000241878:ENST00000460723:exon_32044087_32044262:PISD;ENSG00000241878:ENST00000437808:exon_32044087_32044262:PISD;ENSG00000241878:ENST00000435900:exon_32044087_32044262:PISD;ENSG00000241878:ENST00000439502:exon_32044087_32044262:PISD;ENSG00000241878:ENST00000336566:exon_32044087_32044262:PISD;ENSG00000241878:ENST00000422296:exon_32044087_32044262:PISD;ENSG00000241878:ENST00000474017:exon_32044087_32044262:PISD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36537500 A/T 1 44 42 86 20.8998197113094 22.0501720937501 -1.15035238244073 A:T A T 10 0.525004097470241 0.829604654627686 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36537798 G/A 1 26 29 55 12.3498934657737 15.225118826637 -2.87522536086326 A:G G A 10 0.525004097470241 0.500176764913102 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 79 129 208 37.524676299851 67.7255285736611 -30.2008522738101 A:G G A 10 0.525004097470241 2.83553720016759e-05 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36657740 G/A 1 22 35 57 10.4499098556547 18.3751434114584 -7.92523355580374 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0457583233429046 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000439680:exon_36657642_36657745:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36657642_36657768:APOL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 137 130 267 65.074438646577 68.2505326711313 -3.17609402455436 T:C T C 10 0.525004097470241 0.713389560258462 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 128 108 236 60.7994755238091 56.700442526786 4.09903299702312 A:C C A 10 0.525004097470241 0.60272767273932 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 6 11 17 2.84997541517855 5.77504507217265 -2.9250696569941 T:C T C 10 0.525004097470241 0.223914944795774 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 410 405 815 194.748320037201 212.626659475448 -17.8783394382464 A:G A G 10 0.525004097470241 0.219611645865256 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 457 412 869 217.0731274561 216.301688157739 0.771439298360548 C:G G C 10 0.525004097470241 0.972911509055419 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 123 145 268 58.4244960111604 76.1255941331849 -17.7010981220246 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0322350787449076 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 T:C C T 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 38205989 T/C 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 38882027 C/T 1 107 78 185 50.8245615706842 40.9503196026788 9.87424196800541 T:C C T 10 0.525004097470241 0.161815375936891 ENSG00000100201:ENST00000396821:exon_38879445_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000532271:exon_38879445_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000381633:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415456:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415748:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000444597:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000216019:exon_38881686_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000403230:exon_38881883_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000404499:exon_38881883_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000431312:exon_38881940_38882445:DDX17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 38883946 T/C 1 32 19 51 15.1998688809523 9.97507785193458 5.22479102901771 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161577290059920 ENSG00000100201:ENST00000396821:exon_38883878_38884120:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000532271:exon_38883878_38884120:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000381633:exon_38883884_38884120:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415456:exon_38883884_38884116:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415748:exon_38883878_38884535:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000444597:exon_38883884_38884535:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000216019:exon_38883884_38888120:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000403230:exon_38883884_38884120:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000404499:exon_38883884_38884120:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000431312:exon_38883878_38884120:DDX17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 18 13 31 8.54992624553566 6.82505326711313 1.72487297842253 T:C T C 10 0.525004097470241 0.592389490433888 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39095849 G/C 1 8 1 9 3.79996722023807 0.525004097470241 3.27496312276783 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0411787126107114 ENSG00000100221:ENST00000216039:exon_39095808_39096672:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000427389:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000412832:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000417712:exon_39095806_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000456626:exon_39095808_39096623:JOSD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 18 23 41 8.54992624553566 12.0750942418155 -3.52516799627988 T:C T C 10 0.525004097470241 0.278449355239952 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39178701 A/G 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G A G 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000100246:ENST00000216068:exon_39178668_39178875:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000437501:exon_39178668_39178750:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000406199:exon_39178668_39178875:DNAL4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 21 22 43 9.97491395312494 11.5500901443453 -1.57517619122036 T:C C T 10 0.525004097470241 0.649848981747698 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 A:G G A 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 16 24 40 7.59993444047614 12.6000983392858 -5.00016389880964 A:C C A 10 0.525004097470241 0.116728081916134 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 19 28 47 9.02492214806542 14.7001147291667 -5.67519258110133 T:C T C 10 0.525004097470241 0.108724159744575 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 123 119 242 58.4244960111604 62.4754875989587 -4.05099158779832 A:G A G 10 0.525004097470241 0.607250588383761 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 33 36 69 15.674864783482 18.9001475089287 -3.22528272544663 C:G G C 10 0.525004097470241 0.470632128308667 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39497406 C/T 1 5 11 16 2.3749795126488 5.77504507217265 -3.40006555952386 T:C C T 10 0.525004097470241 0.131035812516567 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 422 438 860 200.448270867558 229.951794691966 -29.5035238244073 A:T:C A C 10 0.525004097470241 0.0476108262500345 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 39928738 G/A 1 73 53 126 34.6747008846724 27.8252171659228 6.84948371874963 A:G G A 10 0.525004097470241 0.246313115548879 ENSG00000187051:ENST00000334678:exon_39928692_39928860:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000420879:exon_39928692_39928766:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000459956:exon_39928400_39928743:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000472291:exon_39928692_39928765:RPS19BP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 40814497 G/T 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:G G T 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 C:G G C 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 42486736 C/A 1 456 419 875 216.59813155357 219.976716840031 -3.37858528646089 A:T:C C A 10 0.525004097470241 0.83908157397389 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 42912097 C/T 1 189 44 233 89.7742255781244 23.1001802886906 66.6740452894338 T:C C T 10 0.525004097470241 1.26965592202005e-19 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 50 193 243 23.7497951264879 101.325790811757 -77.5759956852686 A:T:C C T 10 0.525004097470241 2.00650190535554e-24 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 68 115 183 32.2997213720236 60.3754712090777 -28.0757498370541 T:C C T 10 0.525004097470241 4.11964837630138e-05 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 18 14 32 8.54992624553566 7.35005736458337 1.19986888095229 T:C T C 10 0.525004097470241 0.725678409930913 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 43195134 C/T 1 15 14 29 7.12493853794638 7.35005736458337 -0.22511882663699 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 43206950 A/C 1 7 18 25 3.32497131770831 9.45007375446434 -6.12510243675603 A:C A C 10 0.525004097470241 0.0158902127618526 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43206819_43206950:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43206819_43206950:ARFGAP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 T:C C T 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 43447827 G/A 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43447807_43447893:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43447807_43447893:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43447807_43447893:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43447807_43447893:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43447807_43447893:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43447807_43447893:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43447807_43447893:TTLL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 35 35 70 16.6248565885416 18.3751434114584 -1.75028682291687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.720251074594589 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 85 79 164 40.3746517150295 41.475323700149 -1.10067198511953 T:C C T 10 0.525004097470241 0.876013015270232 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 75 52 127 35.6246926897319 27.3002130684525 8.32447962127939 T:C T C 10 0.525004097470241 0.155098726182373 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 91 52 143 43.2246271302081 27.3002130684525 15.9244140617555 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00920404077292081 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 138 154 292 65.5494345491067 80.8506310104171 -15.3011964613104 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.0786807013392653 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 5 11 16 2.3749795126488 5.77504507217265 -3.40006555952386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.131035812516567 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 6 7 13 2.84997541517855 3.67502868229169 -0.825053267113133 C:G G C 10 0.525004097470241 0.783331730996985 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 22 10 32 10.4499098556547 5.25004097470241 5.19986888095229 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0767448487782624 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 98 98 196 46.5495984479164 51.4504015520836 -4.90080310416724 C:G G C 10 0.525004097470241 0.519923332982222 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50685332 G/A 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 A:G G A 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496235:exon_50685108_50685395:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50685304_50685395:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50685304_50685395:MAPK12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 59 71 130 28.0247582492558 37.2752909203871 -9.25053267113134 T:C C T 10 0.525004097470241 0.113936380127690 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50873497 C/T 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 T:C C T 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50873395_50873510:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50873395_50873510:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50873395_50873510:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50873395_50873510:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50873395_50873510:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50873395_50873510:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50873395_50873510:PPP6R2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 21 23 44 9.97491395312494 12.0750942418155 -2.10018028869061 C:G G C 10 0.525004097470241 0.549061024798999 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 19 21 40 9.02492214806542 11.0250860468751 -2.00016389880964 A:G G A 10 0.525004097470241 0.531760897822857 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50882590 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 71 66 137 33.7247090796129 34.6502704330359 -0.925561353423021 A:G A G 10 0.525004097470241 0.931873365414235 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 28 24 52 13.2998852708333 12.6000983392858 0.699786931547466 T:C C T 10 0.525004097470241 0.89018562011959 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 14 8 22 6.64994263541663 4.20003277976193 2.4499098556547 A:G G A 10 0.525004097470241 0.393965092361931 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 267 249 516 126.823905975446 130.72602027009 -3.90211429464435 T:G T G 10 0.525004097470241 0.757707489318588 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 86 62 148 40.8496476175593 32.5502540431549 8.29939357440433 C:G C G 10 0.525004097470241 0.187975244271607 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 50964153 T/C 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 T:C T C 10 0.525004097470241 0.293975731308556 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 7 16 23 3.32497131770831 8.40006555952386 -5.07509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0376646068509559 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 4878595 C/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4878458_4878619:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000478515:exon_4878458_4878632:ITPR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 8977580 T/C 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C T C 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8977555_8977739:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_8977555_8977739:RAD18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 51 41 92 24.2247910290177 21.5251679962799 2.69962303273783 A:G G A 10 0.525004097470241 0.602775701862583 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 44 59 103 20.8998197113094 30.9752417507442 -10.0754220394348 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0487703727452982 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 121 119 240 57.4745042061008 62.4754875989587 -5.00098339285784 A:G G A 10 0.525004097470241 0.51895989923755 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 9495467 A/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:T A T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000443339:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000488236:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000421188:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000478961:exon_9495423_9495552:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000476740:exon_9495423_9495552:SETD5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G A G 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 63 51 114 29.9247418593748 26.7752089709823 3.14953288839252 T:C C T 10 0.525004097470241 0.574793556058649 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 11831953 C/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000498127:exon_11831916_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11831920_11832055:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000486090:exon_11831922_11832055:C3orf31 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 8 11 19 3.79996722023807 5.77504507217265 -1.97507785193458 T:C T C 10 0.525004097470241 0.491879724510898 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 45 57 102 21.3748156138392 29.9252335558037 -8.55041794196459 T:C C T 10 0.525004097470241 0.092714242005907 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 12962074 G/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000144711:ENST00000273221:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000435445:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000450726:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000429247:exon_12961930_12962096:IQSEC1;ENSG00000144711:ENST00000452608:exon_12961930_12962096:IQSEC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 13361391 A/G 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 A:G A G 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 13395076 C/G 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 C:G C G 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395054_13395160:NUP210 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 14199649 G/T 1 22 14 36 10.4499098556547 7.35005736458337 3.09985249107132 T:G G T 10 0.525004097470241 0.321383593781034 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 14199887 G/A 1 11 8 19 5.22495492782735 4.20003277976193 1.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.655458483185457 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G A G 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 15731536 A/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 A:T A T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15731526_15731727:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15731347_15731727:ANKRD28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 16312564 C/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16312436_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000486267:exon_16312452_16312702:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16312452_16312578:OXNAD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 16344928 G/A 1 41 40 81 19.4748320037201 21.0001638988096 -1.52533189508952 A:G G A 10 0.525004097470241 0.740051287967571 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16344915_16347594:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16344915_16345490:OXNAD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 273 314 587 129.673881390624 164.851286605656 -35.1774052150315 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.00379716856337676 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 209 216 425 99.2741436287196 113.400885053572 -14.1267414248524 A:T:C A C 10 0.525004097470241 0.174057187469884 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 17131402 T/G 1 19 10 29 9.02492214806542 5.25004097470241 3.77488117336301 T:G T G 10 0.525004097470241 0.193951541859934 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17131225_17132086:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17131225_17132094:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17131225_17132085:PLCL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 20212621 T/G 1 13 29 42 6.17494673288687 15.225118826637 -9.05017209375012 T:G T G 10 0.525004097470241 0.00532086629860097 ENSG00000129810:ENST00000306698:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000429446:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522489:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000529155:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000452020:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000440105:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000442720:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000460637:exon_20212535_20212759:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000427162:exon_20212535_20212724:SGOL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 32578505 T/C 1 37 35 72 17.5748483936011 18.3751434114584 -0.800295017857351 T:C T C 10 0.525004097470241 0.906254918748831 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32578503_32578596:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32578503_32578596:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000432458:exon_32578503_32578596:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000472985:exon_32578503_32578764:DYNC1LI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 32769189 A/T 1 19 20 39 9.02492214806542 10.5000819494048 -1.4751598013394 A:T A T 10 0.525004097470241 0.74894974708352 ENSG00000182973:ENST00000331889:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000328834:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000454516:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000435630:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000416457:exon_32769160_32769362:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000455381:exon_32769160_32769366:CNOT10;ENSG00000182973:ENST00000463697:exon_32769160_32769300:CNOT10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 A:G G A 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 33887008 G/A 1 38 25 63 18.0498442961308 13.125102436756 4.92474185937482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.25618778879661 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000462070:exon_33886911_33887080:PDCD6IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 38 39 77 18.0498442961308 20.4751598013394 -2.42531550520856 T:C C T 10 0.525004097470241 0.64839919748902 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 33907915 A/G 1 79 65 144 37.524676299851 34.1252663355657 3.39940996428529 A:G A G 10 0.525004097470241 0.61686153869561 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 73 73 146 34.6747008846724 38.3252991153276 -3.65059823065519 A:G A G 10 0.525004097470241 0.562601279270506 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 37053568 A/G 1 15 22 37 7.12493853794638 11.5500901443453 -4.42515160639892 A:G A G 10 0.525004097470241 0.187269652464798 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 66 107 173 31.3497295669641 56.1754384293158 -24.8257088623517 A:C C A 10 0.525004097470241 0.000176257700377174 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 46 38 84 21.8498115163689 19.9501557038692 1.89965581249976 A:T:G T A 10 0.525004097470241 0.743422933161169 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 12 9 21 5.69995083035711 4.72503687723217 0.974913953124939 C:G G C 10 0.525004097470241 0.827768170148087 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 T:C T C 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 T:C C T 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 126 64 190 59.8494837187496 33.6002622380954 26.2492214806542 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.000145358854246046 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 4 11 15 1.89998361011904 5.77504507217265 -3.87506146205362 C:G C G 10 0.525004097470241 0.067305095126841 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 21 15 36 9.97491395312494 7.87506146205362 2.09985249107132 A:G G A 10 0.525004097470241 0.509178418666553 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 6 11 17 2.84997541517855 5.77504507217265 -2.9250696569941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.223914944795774 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 T:C C T 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C T C 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 49570200 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000173402:ENST00000308775:exon_49568230_49573044:DAG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 21 23 44 9.97491395312494 12.0750942418155 -2.10018028869061 T:G T G 10 0.525004097470241 0.549061024798999 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 50326292 C/T 1 30 41 71 14.2498770758928 21.5251679962799 -7.27529092038711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.095968293220733 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326231_50326491:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326231_50326368:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50326231_50326657:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000469855:exon_50326231_50326694:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50326230_50326368:IFRD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 50391167 C/T 1 60 67 127 28.4997541517855 35.1752745305062 -6.67552037872061 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.248701533678049 ENSG00000114395:ENST00000425346:exon_50390672_50391500:CYB561D2;ENSG00000114395:ENST00000424512:exon_50390672_50391483:CYB561D2;ENSG00000114395:ENST00000232508:exon_50390672_50391500:CYB561D2;ENSG00000114395:ENST00000418577:exon_50390672_50391463:CYB561D2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 51980193 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51980182_51980359:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000475782:exon_51980182_51980277:PARP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 52233265 G/A 1 29 26 55 13.774881173363 13.6501065342263 0.124774639136744 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52233226_52233456:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52233237_52233456:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52233237_52233456:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52233226_52233456:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52233237_52233456:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52233226_52233456:ALAS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 177 195 372 84.0742747477673 102.375799006697 -18.3015242589297 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.0615547698288864 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 113 121 234 53.6745369858628 63.5254957938992 -9.8509588080364 T:C C T 10 0.525004097470241 0.213620637674308 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 994 868 1862 472.14592711458 455.703556604169 16.4423705104113 T:C C T 10 0.525004097470241 0.457788555339347 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 387 305 692 183.823414279017 160.126249728424 23.6971645505932 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0736281456358397 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 206 147 353 97.8491559211303 77.1756023281254 20.6735535930049 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0288377720812315 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 97 41 138 46.0746025453866 21.5251679962799 24.5494345491067 A:G G A 10 0.525004097470241 2.51852579588391e-05 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 25 24 49 11.874897563244 12.6000983392858 -0.72520077604181 A:C A C 10 0.525004097470241 0.886736941622127 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 65 63 128 30.8747336644343 33.0752581406252 -2.20052447619085 T:C T C 10 0.525004097470241 0.723806283837597 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 35 19 54 16.6248565885416 9.97507785193458 6.64977873660699 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0768739323786076 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 53914055 C/A 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 A:C C A 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 A:G A G 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 61 23 84 28.9747500543153 12.0750942418155 16.8996558124998 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000261503509680621 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 8 20 28 3.79996722023807 10.5000819494048 -6.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0131580685328847 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 59997112 G/A 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59997097_59997126:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59997097_59997126:FHIT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 A:G G A 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 67426281 T/C 1 15 11 26 7.12493853794638 5.77504507217265 1.34989346577373 T:C T C 10 0.525004097470241 0.696014850562397 ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67425143_67426283:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67425143_67426283:SUCLG2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 42 38 80 19.9498279062499 19.9501557038692 -0.000327797619281256 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 81698119 C/T 1 7 17 24 3.32497131770831 8.9250696569941 -5.60009833928578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0246148340315966 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 15 7 22 7.12493853794638 3.67502868229169 3.4499098556547 T:C T C 10 0.525004097470241 0.199378987179183 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 13 25 38 6.17494673288687 13.125102436756 -6.95015570386916 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0333567975840330 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 87295049 T/C 1 38 38 76 18.0498442961308 19.9501557038692 -1.90031140773831 T:C T C 10 0.525004097470241 0.730720594437391 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C T C 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 T:C T C 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 13 20 33 6.17494673288687 10.5000819494048 -4.32513521651795 A:G A G 10 0.525004097470241 0.162915745529303 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 105438957 T/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 107937408 C/T 1 15 13 28 7.12493853794638 6.82505326711313 0.299885270833252 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107937382_107937500:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000485979:exon_107937240_107937500:IFT57 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 108373022 G/A 1 16 14 30 7.59993444047614 7.35005736458337 0.249877075892769 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108372992_108373157:DZIP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 112063850 C/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 A:G G A 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 119305169 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 20 33 53 9.49991805059518 17.325135216518 -7.82521716592277 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0383495902117323 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 119327677 G/A 1 17 24 41 8.0749303430059 12.6000983392858 -4.52516799627988 A:G G A 10 0.525004097470241 0.162946865324769 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 119331874 C/T 1 27 20 47 12.8248893683035 10.5000819494048 2.32480741889867 T:C C T 10 0.525004097470241 0.560212581690767 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 32 26 58 15.1998688809523 13.6501065342263 1.54976234672602 C:G C G 10 0.525004097470241 0.69586471488693 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 121151812 G/C 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121151765_121151883:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121151765_121151880:POLQ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 121518221 A/G 1 13 13 26 6.17494673288687 6.82505326711313 -0.650106534226266 A:G A G 10 0.525004097470241 0.84603224725779 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121518043_121518221:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121518043_121518221:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121518043_121518221:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121518043_121518221:IQCB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 121659860 C/T 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163406:ENST00000489711:exon_121659678_121662949:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000295605:exon_121659678_121660099:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000436799:exon_121659678_121660457:SLC15A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 122056432 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000121552:ENST00000264474:exon_122056394_122056495:CSTA;ENSG00000121552:ENST00000479204:exon_122056394_122057117:CSTA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 122290579 C/T 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122290525_122294050:DTX3L;ENSG00000163840:ENST00000383661:exon_122290525_122290594:DTX3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 49 57 106 23.2747992239582 29.9252335558037 -6.65043433184555 A:G A G 10 0.525004097470241 0.206903396291169 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 55 62 117 26.1247746391367 32.5502540431549 -6.4254794040182 A:G G A 10 0.525004097470241 0.266607458974609 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 19 18 37 9.02492214806542 9.45007375446434 -0.425151606398916 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 122496628 A/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 A:C A C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122496568_122496753:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122496568_122496753:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000465044:exon_122496568_122496753:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000467643:exon_122496568_122496753:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000478601:exon_122496568_122496753:HSPBAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 123633665 T/C 1 14 9 23 6.64994263541663 4.72503687723217 1.92490575818446 T:C T C 10 0.525004097470241 0.532417104873035 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123632572_123633979:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 124732618 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124732316_124732834:HEG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 125725334 T/C 1 75 67 142 35.6246926897319 35.1752745305062 0.449418159225772 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725200_125725407:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504118:exon_125725201_125725471:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725206_125725407:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725216_125725407:SLC41A3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 127540635 C/T 1 36 31 67 17.0998524910713 16.2751270215775 0.824725469493853 T:C C T 10 0.525004097470241 0.902878702840988 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000479967:exon_127540537_127540681:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000494830:exon_127540537_127540681:MGLL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 127783698 A/T 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:T A T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000175792:ENST00000472125:exon_127783625_127784063:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127783628_127784063:RUVBL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 152 186 338 72.1993771845234 97.6507621294648 -25.4513849449415 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00638580321294503 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 127983495 T/C 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 T:C T C 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127983460_127983624:EEFSEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 128622922 G/A 1 11 13 24 5.22495492782735 6.82505326711313 -1.60009833928578 A:G G A 10 0.525004097470241 0.545429500501973 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128622905_128622975:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128622905_128622975:ACAD9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 130743812 G/A 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000034533:ENST00000514044:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000264992:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000507978:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000446270:exon_130743068_130744175:ASTE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 133327457 T/C 1 44 55 99 20.8998197113094 28.8752253608633 -7.97540564955386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.130769182301986 ENSG00000163781:ENST00000503338:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000503464:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133327379_133327540:TOPBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 12 4 16 5.69995083035711 2.10001638988096 3.59993444047614 T:C T C 10 0.525004097470241 0.08265372637292 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 136062724 C/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000118007:ENST00000383202:exon_136062674_136062848:STAG1;ENSG00000118007:ENST00000236698:exon_136062674_136062848:STAG1;ENSG00000118007:ENST00000483235:exon_136062674_136062848:STAG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 136574501 A/G 1 3 11 14 1.42498770758928 5.77504507217265 -4.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0290810870910102 ENSG00000168917:ENST00000446465:exon_136573285_136574734:TMEM22;ENSG00000168917:ENST00000448682:exon_136573285_136574732:TMEM22;ENSG00000168917:ENST00000393079:exon_136573285_136574730:TMEM22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 141464146 G/A 1 224 215 439 106.399082166666 112.875880956102 -6.47679878943582 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.566391510861567 ENSG00000114125:ENST00000273480:exon_141464001_141466402:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000480908:exon_141464001_141464542:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000393000:exon_141464001_141464544:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477012:exon_141464001_141464511:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477393:exon_141464001_141464359:RNF7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 142168331 C/T 1 89 91 180 42.2746353251486 47.7753728697919 -5.50073754464338 T:C C T 10 0.525004097470241 0.412958164377567 ENSG00000175054:ENST00000504521:exon_142168077_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515810:exon_142168079_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142168080_142172075:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142168080_142168444:ATR;ENSG00000175054:ENST00000515107:exon_142168160_142168444:ATR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 148759325 T/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148759277_148759467:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000471807:exon_148759277_148759455:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000497427:exon_148759277_148759831:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148759288_148759455:HLTF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 27 19 46 12.8248893683035 9.97507785193458 2.84981151636891 C:G C G 10 0.525004097470241 0.46138635759268 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 150460117 G/A 1 106 115 221 50.3495656681545 60.3754712090777 -10.0259055409233 A:G G A 10 0.525004097470241 0.178683674195133 ENSG00000181788:ENST00000312960:exon_150458914_150460485:SIAH2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 168 153 321 79.7993116249995 80.3256269129469 -0.526315287947369 T:C C T 10 0.525004097470241 0.955501106670305 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 158320597 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 A:G G A 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 T:C T C 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 69 66 135 32.7747172745534 34.6502704330359 -1.87555315848254 T:C C T 10 0.525004097470241 0.796148182911378 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 170843782 C/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:C C A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170843701_170843940:TNIK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 18 20 38 8.54992624553566 10.5000819494048 -1.95015570386916 A:G G A 10 0.525004097470241 0.626675337426101 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 270 265 535 128.248893683035 139.126085829614 -10.8771921465789 T:C C T 10 0.525004097470241 0.363357550730327 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 179322385 A/C 1 143 140 283 67.9244140617555 73.5005736458337 -5.5761595840782 A:C A C 10 0.525004097470241 0.513212867401309 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179322315_179322442:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179322315_179322428:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179322315_179322434:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179322315_179322437:MRPL47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 182755209 T/G 1 24 28 52 11.3999016607142 14.7001147291667 -3.30021306845253 T:G T G 10 0.525004097470241 0.405619485745815 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755202_182755222:MCCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 182790249 G/A 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000486226:exon_182790215_182790275:MCCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 182853554 G/A 1 33 34 67 15.674864783482 17.8501393139882 -2.17527453050615 A:G G A 10 0.525004097470241 0.625901631429529 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 36 28 64 17.0998524910713 14.7001147291667 2.39973776190457 T:C T C 10 0.525004097470241 0.617150301320136 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 183861243 A/G 1 77 78 155 36.5746844947914 40.9503196026788 -4.37563510788735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.520165253728534 ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 183901281 G/A 1 157 134 291 74.5743566971722 70.3505490610123 4.22380763615986 A:G G A 10 0.525004097470241 0.638953555973387 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183901270_183901450:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183901270_183901836:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183901270_183901853:AP2M1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 183911516 A/G 1 105 81 186 49.8745697656247 42.5253318950895 7.34923787053517 A:G A G 10 0.525004097470241 0.304168535904016 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183911328_183911795:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183911328_183911793:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183911328_183911800:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000468892:exon_183911328_183911790:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183911328_183911794:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480539:exon_183911328_183911557:ABCF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 20 22 42 9.49991805059518 11.5500901443453 -2.05017209375012 T:C T C 10 0.525004097470241 0.540604176828727 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 183976241 A/G 1 34 42 76 16.1498606860118 22.0501720937501 -5.90031140773832 A:G A G 10 0.525004097470241 0.206252656388290 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 305 240 545 144.873750271576 126.000983392858 18.8727668787186 T:C C T 10 0.525004097470241 0.112475818148258 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 90 80 170 42.7496312276783 42.0003277976193 0.74930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 0.938872790672595 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 185209413 C/T 1 9 17 26 4.27496312276783 8.9250696569941 -4.65010653422627 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0779921882534435 ENSG00000163900:ENST00000421852:exon_185207389_185209545:TMEM41A;ENSG00000163900:ENST00000296254:exon_185208785_185209545:TMEM41A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 272 249 521 129.198885488094 130.72602027009 -1.52713478199556 A:G A G 10 0.525004097470241 0.8953995185843 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 186501379 C/T 0 8 0 8 3.79996722023807 0 3.79996722023807 C C 10 0.525004097470241 0.00836297791075555 ENSG00000156976:ENST00000441007:exon_186501237_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000445596:exon_186501094_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000323963:exon_186501336_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000426808:exon_186501361_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000465222:exon_186501364_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000425053:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000440191:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000491473:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000486805:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000465032:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000465267:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000495049:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000429589:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000356531:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000396527:exon_186501366_186501428:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000485101:exon_186501367_186501428:EIF4A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 187088612 C/T 1 18 19 37 8.54992624553566 9.97507785193458 -1.42515160639892 T:C C T 10 0.525004097470241 0.742546320002449 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 23 23 46 10.9249057581845 12.0750942418155 -1.15018848363109 A:G G A 10 0.525004097470241 0.769203854017533 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 2 11 13 0.949991805059518 5.77504507217265 -4.82505326711313 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00987123193747848 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 1 8 9 0.474995902529759 4.20003277976193 -3.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0165050332792042 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 A:T T A 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 96 98 194 45.5996066428569 51.4504015520836 -5.85079490922676 A:C C A 10 0.525004097470241 0.429246959046981 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 30 29 59 14.2498770758928 15.225118826637 -0.975241750744221 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.89643317546073 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 195063347 G/A 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 A:G G A 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000114331:ENST00000326793:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000423531:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000480906:exon_195063200_195063383:ACAP2;ENSG00000114331:ENST00000481463:exon_195063335_195063383:ACAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 195594805 A/G 1 7 14 21 3.32497131770831 7.35005736458337 -4.02508604687506 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0846287424702238 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 195595054 C/T 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195594955_195595168:TNK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 195778972 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195776155_195779055:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195776347_195779055:TFRC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 195800923 G/A 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 196388099 G/C 1 92 85 177 43.6996230327378 44.6253482849705 -0.92572525223266 A:C:G G C 10 0.525004097470241 0.94003844129814 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 196449372 G/A 1 13 17 30 6.17494673288687 8.9250696569941 -2.75012292410723 A:G G A 10 0.525004097470241 0.362674876612972 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000457284:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000421265:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000451319:exon_196449286_196449427:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000495440:exon_196449286_196449427:PIGX HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 31 44 75 14.7248729784225 23.1001802886906 -8.37530731026808 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0637283699763788 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 196771513 G/A 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000469371:exon_196769904_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196770502_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196771131_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196771202_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196771422_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196771431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196771494_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196771494_196771600:DLG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 196771554 T/C 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000469371:exon_196769904_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196770502_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196771131_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196771202_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196771422_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196771431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000392382:exon_196771494_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000450955:exon_196771494_196771600:DLG1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 3 197597044 C/T 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197597031_197597047:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000471667:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000473177:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000428136:exon_197597031_197597149:LRCH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 843695 A/G 1 104 98 202 49.3995738630949 51.4504015520836 -2.05082768898868 A:G A G 10 0.525004097470241 0.77857044466132 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_843680_844197:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_843680_843856:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_843680_843856:GAK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 844781 G/A 1 78 70 148 37.0496803973212 36.7502868229169 0.299393574404334 A:C:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000178950:ENST00000502799:exon_843680_845461:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504668:exon_844724_844805:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_844724_845762:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511345:exon_844724_847616:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_844724_844872:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_844724_844872:GAK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 24 23 47 11.3999016607142 12.0750942418155 -0.675192581101328 A:G A G 10 0.525004097470241 0.884521909264506 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C T C 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 29 24 53 13.774881173363 12.6000983392858 1.17478283407723 T:C T C 10 0.525004097470241 0.784542140375959 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 101 73 174 47.9745861555057 38.3252991153276 9.64928704017806 A:G G A 10 0.525004097470241 0.149639163254002 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 74 67 141 35.1496967872022 35.1752745305062 -0.0255777433039839 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 73 71 144 34.6747008846724 37.2752909203871 -2.60059003571471 A:G G A 10 0.525004097470241 0.677282930715726 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 124 103 227 58.8994919136901 54.0754220394348 4.82406987425529 A:G A G 10 0.525004097470241 0.55000503047159 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 58 83 141 27.549762346726 43.57534009003 -16.025577743304 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0087123741412802 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 70 62 132 33.2497131770831 32.5502540431549 0.699459133928187 T:C C T 10 0.525004097470241 0.930708228801249 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 3516560 G/A 1 72 57 129 34.1997049821426 29.9252335558037 4.27447142633891 A:G G A 10 0.525004097470241 0.481214448770277 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3516479_3516655:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3516479_3516655:LRPAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 4389435 C/T 1 15 2 17 7.12493853794638 1.05000819494048 6.0749303430059 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00282649415662947 ENSG00000168824:ENST00000421177:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000513555:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000505246:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000506380:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000397958:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000433139:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000513829:exon_4389331_4389485:AC110814.1;ENSG00000168824:ENST00000504171:exon_4389331_4389485:AC110814.1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 6303857 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 A:G A G 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 8233786 C/T 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C C T 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000513495:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000507801:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8232869_8233883:SH3TC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 10099440 G/A 1 68 69 137 32.2997213720236 36.2252827254466 -3.92556135342302 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.549478316388265 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 10447848 T/G 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:G T G 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B;ENSG00000178163:ENST00000507515:exon_10447726_10448163:ZNF518B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 T:C T C 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 C:G G C 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 51 69 120 24.2247910290177 36.2252827254466 -12.0004916964289 A:T:C A T 10 0.525004097470241 0.0350913286340717 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 48 52 100 22.7998033214284 27.3002130684525 -4.5004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.369811201392792 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 15640168 C/T 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000118564:ENST00000422585:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000382358:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000341285:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000412094:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000511441:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000513163:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000507700:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000504837:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000512066:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000503196:exon_15640162_15640317:FBXL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 17506042 G/A 1 22 20 42 10.4499098556547 10.5000819494048 -0.0501720937501222 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17506002_17506098:QDPR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 22729165 T/C 0 432 0 432 205.198229892856 0 205.198229892856 T T 10 0.525004097470241 2.00167905389409e-121 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 52 32 84 24.6997869315475 16.8001311190477 7.89965581249976 T:C C T 10 0.525004097470241 0.100789322154481 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 T:C T C 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 46 54 100 21.8498115163689 28.350221263393 -6.5004097470241 C:G G C 10 0.525004097470241 0.194915266146722 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 53 100 153 25.1747828340772 52.5004097470241 -27.3256269129469 T:C T C 10 0.525004097470241 1.03172671838928e-05 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38776235 A/G 1 14 4 18 6.64994263541663 2.10001638988096 4.54992624553566 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0345863775726509 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38776320 C/T 1 11 3 14 5.22495492782735 1.57501229241072 3.64994263541663 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0616618009545916 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38776725 C/A 1 119 65 184 56.5245124010413 34.1252663355657 22.3992460654757 A:C C A 10 0.525004097470241 0.00110581868642000 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 54 13 67 25.649778736607 6.82505326711313 18.8247254694939 T:C C T 10 0.525004097470241 3.31324968638578e-06 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 45 10 55 21.3748156138392 5.25004097470241 16.1247746391367 A:T A T 10 0.525004097470241 8.85439367883721e-06 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 41 19 60 19.4748320037201 9.97507785193458 9.49975415178554 T:G T G 10 0.525004097470241 0.0140967215916155 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 21 18 39 9.97491395312494 9.45007375446434 0.5248401986606 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 100 2 102 47.4995902529759 1.05000819494048 46.4495820580354 A:G A G 10 0.525004097470241 1.30251180444102e-25 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 39471733 A/G 1 17 14 31 8.0749303430059 7.35005736458337 0.724872978422528 A:G A G 10 0.525004097470241 0.858468340181549 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39471639_39471784:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39471639_39471784:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000433013:exon_39471639_39471784:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000513731:exon_39471639_39471784:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39471639_39471784:LIAS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 41946923 G/T 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 T:G G T 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000109133:ENST00000504986:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000264452:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000508448:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000513702:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000506794:exon_41946810_41946943:TMEM33;ENSG00000109133:ENST00000513558:exon_41946810_41946943:TMEM33 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 48147309 T/C 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48147096_48147312:TEC;ENSG00000135605:ENST00000511471:exon_48147095_48147312:TEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 17 2 19 8.0749303430059 1.05000819494048 7.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000928596916837583 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 22 24 46 10.4499098556547 12.6000983392858 -2.15018848363109 A:G A G 10 0.525004097470241 0.557157218919631 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 56262374 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000134851:ENST00000381334:exon_56262124_56262563:TMEM165;ENSG00000134851:ENST00000506198:exon_56262124_56262563:TMEM165;ENSG00000134851:ENST00000508404:exon_56262130_56262563:TMEM165 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 T:C T C 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 56874517 A/C 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 A:C A C 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56874493_56874548:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56874493_56874548:CEP135 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 27 32 59 12.8248893683035 16.8001311190477 -3.97524175074422 A:C A C 10 0.525004097470241 0.361646820787627 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 T:C T C 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 57333822 G/T 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:G G T 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57333081_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57333783_57333910:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57333784_57333910:SRP72 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 57797414 C/T 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 57798189 G/A 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 68374597 C/T 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 68380215 G/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 68384008 C/T 1 16 7 23 7.59993444047614 3.67502868229169 3.92490575818446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.142500180591913 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 42 70 112 19.9498279062499 36.7502868229169 -16.800458916667 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00169349396468403 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 73942678 C/T 1 47 56 103 22.3248074188987 29.4002294583335 -7.07542203943483 T:C C T 10 0.525004097470241 0.168334348847590 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 74451073 A/G 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000335049:exon_74450897_74451081:RASSF6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 46 49 95 21.8498115163689 25.7252007760418 -3.8753892596729 A:G G A 10 0.525004097470241 0.472378384612015 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 50 64 114 23.7497951264879 33.6002622380954 -9.85046711160748 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0744413810456204 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 76903105 A/G 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G A G 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76903086_76903190:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76903086_76903190:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76903086_76903190:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000503411:exon_76903086_76903190:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000504975:exon_76903086_76903190:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000514710:exon_76903086_76903190:SDAD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 8 15 23 3.79996722023807 7.87506146205362 -4.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0979472344223015 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 5 13 18 2.3749795126488 6.82505326711313 -4.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0559985703651949 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C T C 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 43 27 70 20.4248238087796 14.1751106316965 6.24971317708313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.151245845106087 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 84380955 G/T 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 T:G G T 10 0.525004097470241 0.369764717315095 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 89397091 A/G 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89396992_89397181:HERC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 95585225 A/G 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 A:G A G 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95585129_95589377:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95585129_95589374:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95585129_95586652:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95585129_95586632:PDLIM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 103514658 T/C 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000508584:exon_103514582_103514725:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000504044:exon_103514406_103514725:NFKB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 12 16 28 5.69995083035711 8.40006555952386 -2.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.347018973521548 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 103557077 G/A 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 103964529 A/C 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000164038:ENST00000362026:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000506288:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000339611:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000394785:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503103:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503230:exon_103964453_103964602:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000510976:exon_103964453_103964602:NHEDC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 104004073 C/T 1 6 15 21 2.84997541517855 7.87506146205362 -5.02508604687506 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0301927360337929 ENSG00000164038:ENST00000508136:exon_104004028_104004086:NHEDC2;ENSG00000164039:ENST00000296424:exon_104004028_104004086:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000492366:exon_104004028_104004086:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000464039:exon_104004028_104004086:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000475058:exon_104004028_104004086:BDH2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 104013796 T/C 1 2 9 11 0.949991805059518 4.72503687723217 -3.77504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0314607471472406 ENSG00000164039:ENST00000296424:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000492366:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000464039:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000475058:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000432053:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000506521:exon_104013757_104013875:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000511354:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000504285:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000509245:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000513518:exon_104013533_104013853:BDH2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 26 42 68 12.3498934657737 22.0501720937501 -9.70027862797639 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0207539442405684 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 21 32 53 9.97491395312494 16.8001311190477 -6.82521716592277 T:C C T 10 0.525004097470241 0.073120200894362 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 20 32 52 9.49991805059518 16.8001311190477 -7.30021306845253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0512367931449868 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 106604164 C/A 1 127 155 282 60.3244796212794 81.3756351078874 -21.051155486608 A:T:C C A 10 0.525004097470241 0.0122770406695923 ENSG00000236699:ENST00000503289:exon_106604079_106604203:ARHGEF38;ENSG00000138785:ENST00000394735:exon_106603784_106604474:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000340139:exon_106603784_106604474:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000451321:exon_106603784_106604474:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000265150:exon_106603787_106604474:INTS12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 103 89 192 48.9245779605652 46.7253646748514 2.19921328571372 T:C T C 10 0.525004097470241 0.77288416759849 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 110638810 C/T 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000123739:ENST00000243501:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502283:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000507961:exon_110638704_110638869:PLA2G12A;ENSG00000123739:ENST00000502772:exon_110638704_110638869:PLA2G12A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 180 115 295 85.4992624553566 60.3754712090777 25.1237912462789 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00351346186719775 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 T:C T C 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.369764717315095 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 119718936 T/C 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119718838_119718965:SEC24D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:C A C 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 122735142 A/G 1 266 259 525 126.348910072916 135.976061244792 -9.62715117187653 A:G A G 10 0.525004097470241 0.406634336210044 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000509980:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122735021_122737602:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000511132:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503139:exon_122734910_122735782:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122734910_122735202:EXOSC9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 129867228 C/T 1 16 22 38 7.59993444047614 11.5500901443453 -3.95015570386916 T:C C T 10 0.525004097470241 0.255294680918394 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 0 919 0 919 436.521234424849 0 436.521234424849 G G 10 0.525004097470241 6.88785778585024e-258 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:C T C 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 99 103 202 47.0245943504461 54.0754220394348 -7.05082768898869 A:T:C:G A C 10 0.525004097470241 0.32490052377374 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 199 189 388 94.524184603422 99.2257744218756 -4.70158981845351 T:C T C 10 0.525004097470241 0.647511108256673 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 177243366 G/T 1 59 34 93 28.0247582492558 17.8501393139882 10.1746189352676 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0376825776010811 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177243321_177243396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177243321_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177243321_177243394:SPCS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 20 23 43 9.49991805059518 12.0750942418155 -2.57517619122036 A:G A G 10 0.525004097470241 0.449011591135732 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 183812579 G/A 1 57 54 111 27.0747664441963 28.350221263393 -1.27545481919675 A:G G A 10 0.525004097470241 0.8494693872334 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183811213_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183811257_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183811258_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183811258_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183811408_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183811408_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183812167_183812630:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183812525_183812630:DCTD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 33 30 63 15.674864783482 15.7501229241072 -0.0752581406251842 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 186084021 C/T 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:C C T 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186080819_186084079:KIAA1430 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 23 14 37 10.9249057581845 7.35005736458337 3.57484839360108 T:C T C 10 0.525004097470241 0.253832840762598 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 101 92 193 47.9745861555057 48.3003769672622 -0.325790811756519 T:C:G T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 154 203 357 73.1493689895829 106.575831786459 -33.426462796876 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.000454349437056900 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 422955 C/G 1 8 14 22 3.79996722023807 7.35005736458337 -3.5500901443453 C:G C G 10 0.525004097470241 0.140344488198196 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_422844_422973:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510910:exon_422492_422973:AHRR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 442933 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 1344498 C/G 1 10 11 21 4.74995902529759 5.77504507217265 -1.02508604687506 C:G C G 10 0.525004097470241 0.669130983480659 ENSG00000049656:ENST00000320895:exon_1344466_1344566:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000320927:exon_1344466_1344566:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000513491:exon_1344466_1344527:CLPTM1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 7 12 19 3.32497131770831 6.30004916964289 -2.97507785193458 A:G G A 10 0.525004097470241 0.250200211214515 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 T:C C T 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 6600064 G/T 1 169 194 363 80.2743075275293 101.850794909227 -21.5764873816975 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.0238551644238291 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 115 64 179 54.6245287909223 33.6002622380954 21.0242665528269 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00163166606874304 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 7878179 C/T 1 2 7 9 0.949991805059518 3.67502868229169 -2.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0953110686449535 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510279:exon_7878057_7878262:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514220:exon_7878057_7878348:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000505257:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000514369:exon_7878062_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7878057_7878435:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508890:exon_7878057_7878188:MTRR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 10 11 21 4.74995902529759 5.77504507217265 -1.02508604687506 A:G G A 10 0.525004097470241 0.669130983480659 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 10239278 C/T 1 15 7 22 7.12493853794638 3.67502868229169 3.4499098556547 T:C C T 10 0.525004097470241 0.199378987179183 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 15 13 28 7.12493853794638 6.82505326711313 0.299885270833252 A:C:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 23 21 44 10.9249057581845 11.0250860468751 -0.100180288690606 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 177 153 330 84.0742747477673 80.3256269129469 3.74864783482046 A:G A G 10 0.525004097470241 0.69982210720558 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 98 112 210 46.5495984479164 58.800458916667 -12.2508604687506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0972315024954383 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 15 4 19 7.12493853794638 2.10001638988096 5.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0220116996462910 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 39 22 61 18.5248401986606 11.5500901443453 6.9747500543153 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0947947659428525 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 19 20 39 9.02492214806542 10.5000819494048 -1.4751598013394 T:C T C 10 0.525004097470241 0.74894974708352 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 34945122 A/G 1 112 146 258 53.199541083333 76.6505982306552 -23.4510571473222 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.00405289735935666 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34944972_34945130:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000514237:exon_34944972_34945130:DNAJC21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 34954079 C/G 1 89 159 248 42.2746353251486 83.4756514977683 -41.2010161726198 C:G C G 10 0.525004097470241 2.03594337148808e-07 ENSG00000168724:ENST00000342382:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000303525:exon_34954031_34954106:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000506762:exon_34954031_34954296:DNAJC21;ENSG00000168724:ENST00000509626:exon_34953631_34954106:DNAJC21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 37721219 T/C 1 19 16 35 9.02492214806542 8.40006555952386 0.624856588541565 T:C T C 10 0.525004097470241 0.867113990064794 ENSG00000082068:ENST00000265107:exon_37721217_37721317:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000511906:exon_37721217_37725152:WDR70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 41862819 G/A 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 A:G G A 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000083720:ENST00000196371:exon_41862744_41862852:OXCT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 43175040 T/G 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 T:G T G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000172262:ENST00000510026:exon_43174549_43175836:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509156:exon_43174549_43175390:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000306938:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000399534:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000505606:exon_43174549_43176342:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509634:exon_43174549_43176349:ZNF131 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 43294192 C/T 1 58 59 117 27.549762346726 30.9752417507442 -3.4254794040182 T:C C T 10 0.525004097470241 0.578829541436832 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43294158_43294264:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000508319:exon_43293836_43294264:HMGCS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 50057729 G/A 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000151883:ENST00000505697:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000511363:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503888:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000510303:exon_50057655_50057736:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000281631:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503707:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000514067:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000423185:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503193:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000515166:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505554:exon_50057655_50057732:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000505180:exon_50057655_50057734:PARP8;ENSG00000151883:ENST00000503561:exon_50057655_50057732:PARP8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 54585213 C/T 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C C T 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54585098_54585256:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54585098_54585256:DHX29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 54586170 A/G 1 19 20 39 9.02492214806542 10.5000819494048 -1.4751598013394 A:G A G 10 0.525004097470241 0.74894974708352 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54586046_54586172:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54586046_54586172:DHX29 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 56209735 A/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000155542:ENST00000475908:exon_56209701_56209816:C5orf35;ENSG00000155542:ENST00000285947:exon_56209701_56209816:C5orf35;ENSG00000155542:ENST00000418299:exon_56209701_56209816:C5orf35;ENSG00000155542:ENST00000463805:exon_56209701_56209816:C5orf35;ENSG00000155542:ENST00000472636:exon_56209701_56209804:C5orf35;ENSG00000155542:ENST00000477359:exon_56209701_56209809:C5orf35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 13 31 44 6.17494673288687 16.2751270215775 -10.1001802886906 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00237614591336906 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 93 90 183 44.1746189352676 47.2503687723217 -3.0757498370541 C:G C G 10 0.525004097470241 0.657658453633782 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 59 43 102 28.0247582492558 22.5751761912204 5.44958205803541 T:C T C 10 0.525004097470241 0.32154657002008 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 88 86 174 41.7996394226188 45.1503523824407 -3.35071295982194 A:G G A 10 0.525004097470241 0.648984557925196 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 14 9 23 6.64994263541663 4.72503687723217 1.92490575818446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.532417104873035 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 17 16 33 8.0749303430059 8.40006555952386 -0.325135216517953 A:T A T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 36 27 63 17.0998524910713 14.1751106316965 2.92474185937482 T:G G T 10 0.525004097470241 0.528675631804657 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 30 19 49 14.2498770758928 9.97507785193458 4.27479922395819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.253376456348157 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 68660964 C/T 1 473 457 930 224.673061896576 239.9268725439 -15.2538106473241 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.32469390555767 ENSG00000085231:ENST00000506736:exon_68660570_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000328663:exon_68660571_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000217893:exon_68660572_68661581:TAF9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 19 23 42 9.02492214806542 12.0750942418155 -3.05017209375012 C:G C G 10 0.525004097470241 0.358333713723525 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 22 16 38 10.4499098556547 8.40006555952386 2.04984429613084 A:G A G 10 0.525004097470241 0.521289907656754 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 1143 1151 2294 542.920316591515 604.279716188247 -61.3593995967329 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0107463795254211 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 73985215 A/G 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000049860:ENST00000511181:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000261416:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000513079:exon_73985153_73985298:HEXB;ENSG00000049860:ENST00000515528:exon_73985153_73985674:HEXB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 39 32 71 18.5248401986606 16.8001311190477 1.72470907961289 T:C C T 10 0.525004097470241 0.722426091063354 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 74077474 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000198780:ENST00000389156:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000514215:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510496:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510609:exon_74073401_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000380515:exon_74076956_74077833:FAM169A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 30 29 59 14.2498770758928 15.225118826637 -0.975241750744221 A:G G A 10 0.525004097470241 0.89643317546073 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 52 25 77 24.6997869315475 13.125102436756 11.5746844947914 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.00851738405955922 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:C C A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 35 44 79 16.6248565885416 23.1001802886906 -6.47532370014904 T:C C T 10 0.525004097470241 0.176063332118682 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 86707121 T/C 1 33 33 66 15.674864783482 17.325135216518 -1.65027043303591 T:C T C 10 0.525004097470241 0.71276021885517 ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86707041_86707163:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86707041_86707163:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86707041_86707163:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000513499:exon_86707041_86707163:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510020:exon_86707041_86707163:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000505230:exon_86707041_86707163:CCNH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 87491964 C/T 1 9 18 27 4.27496312276783 9.45007375446434 -5.17511063169651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.053921247170162 ENSG00000164180:ENST00000511087:exon_87490864_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000510089:exon_87490986_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000296595:exon_87491023_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000506536:exon_87491024_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511218:exon_87491645_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000512429:exon_87491934_87492305:TMEM161B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 60 39 99 28.4997541517855 20.4751598013394 8.02459435044614 C:G C G 10 0.525004097470241 0.108545062710169 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 T:C C T 10 0.525004097470241 0.394915481182600 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 19 13 32 9.02492214806542 6.82505326711313 2.19986888095229 A:T T A 10 0.525004097470241 0.482359714707828 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 94278129 T/C 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 T:C T C 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 T:G G T 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 51 4 55 24.2247910290177 2.10001638988096 22.1247746391367 T:C C T 10 0.525004097470241 1.98964310393898e-10 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 48 3 51 22.7998033214284 1.57501229241072 21.2247910290177 T:C C T 10 0.525004097470241 1.01403329799869e-10 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 79 3 82 37.524676299851 1.57501229241072 35.9496640074402 T:C C T 10 0.525004097470241 9.20223493055883e-19 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 97 79 176 46.0746025453866 41.475323700149 4.59927884523758 A:G G A 10 0.525004097470241 0.497958241963817 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 83 62 145 39.42465990997 32.5502540431549 6.87440586681505 T:C C T 10 0.525004097470241 0.279806663362307 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96512865 T/A 1 12 5 17 5.69995083035711 2.6250204873512 3.0749303430059 A:T T A 10 0.525004097470241 0.151946029965317 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96512871 T/A 1 12 6 18 5.69995083035711 3.15002458482145 2.54992624553566 A:T T A 10 0.525004097470241 0.248457334165905 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 11 11 22 5.22495492782735 5.77504507217265 -0.550090144345303 C:G G C 10 0.525004097470241 0.834225569957072 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 108521932 C/T 1 13 5 18 6.17494673288687 2.6250204873512 3.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.103690377865023 ENSG00000151422:ENST00000281092:exon_108521901_108522023:FER;ENSG00000151422:ENST00000504143:exon_108521901_108522023:FER;ENSG00000151422:ENST00000438717:exon_108521901_108522023:FER;ENSG00000151422:ENST00000513777:exon_108521901_108522023:FER HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 108714681 A/G 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G A G 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 110456263 C/G 1 17 20 37 8.0749303430059 10.5000819494048 -2.42515160639892 C:G C G 10 0.525004097470241 0.5108991695235 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 19 13 32 9.02492214806542 6.82505326711313 2.19986888095229 A:T A T 10 0.525004097470241 0.482359714707828 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 36 35 71 17.0998524910713 18.3751434114584 -1.27529092038711 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0.812561980197661 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 112349070 T/C 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 T:C T C 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000172795:ENST00000515408:exon_112349018_112355820:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000513585:exon_112349018_112349546:DCP2;ENSG00000172795:ENST00000389063:exon_112349018_112356667:DCP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 A:T T A 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 114961448 C/T 1 12 9 21 5.69995083035711 4.72503687723217 0.974913953124939 T:C C T 10 0.525004097470241 0.827768170148087 ENSG00000251201:ENST00000282382:exon_114961298_114961858:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000408996:exon_114961298_114961870:TMED7-TICAM2;ENSG00000251201:ENST00000333314:exon_114961298_114961711:TMED7-TICAM2;ENSG00000134970:ENST00000456936:exon_114961298_114961870:TMED7;ENSG00000134970:ENST00000508420:exon_114961298_114961679:TMED7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 115428381 T/G 1 13 17 30 6.17494673288687 8.9250696569941 -2.75012292410723 T:G T G 10 0.525004097470241 0.362674876612972 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 118464964 C/T 1 91 75 166 43.2246271302081 39.3753073102681 3.84931981993999 T:C C T 10 0.525004097470241 0.586718448992489 ENSG00000172869:ENST00000503802:exon_118464906_118465118:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118464906_118465118:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514151:exon_118464906_118465027:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000504031:exon_118464904_118465118:DMXL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 118691784 T/C 1 72 64 136 34.1997049821426 33.6002622380954 0.599442744047224 T:C T C 10 0.525004097470241 0.93180285842925 ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 118811533 G/A 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 A:G G A 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512841:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503168:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507695:exon_118811519_118811568:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515250:exon_118811519_118811565:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118811519_118811565:HSD17B4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 118860938 T/C 1 32 34 66 15.1998688809523 17.8501393139882 -2.65027043303591 T:C T C 10 0.525004097470241 0.539382390582144 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000520244:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118860911_118860980:HSD17B4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 43 35 78 20.4248238087796 18.3751434114584 2.0496803973212 A:G A G 10 0.525004097470241 0.652348003252989 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 122359640 T/C 1 16 6 22 7.59993444047614 3.15002458482145 4.4499098556547 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0854160379206465 ENSG00000168938:ENST00000306442:exon_122358945_122359698:PPIC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 130498364 A/G 1 1587 1653 3240 753.818497314728 867.831773118308 -114.013275803581 A:T:G A G 10 0.525004097470241 6.48313355009381e-05 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506207:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130498265_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130497936_130498369:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130497984_130498369:HINT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 41 30 71 19.4748320037201 15.7501229241072 3.72470907961289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.406849028180994 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 A:G A G 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 132203152 T/G 1 28 106 134 13.2998852708333 55.6504343318455 -42.3505490610123 T:G T G 10 0.525004097470241 9.82638449938262e-14 ENSG00000164405:ENST00000498309:exon_132202561_132203379:UQCRQ HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 28 17 45 13.2998852708333 8.9250696569941 4.37481561383915 A:G A G 10 0.525004097470241 0.232494766281864 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 18 25 43 8.54992624553566 13.125102436756 -4.57517619122036 A:G G A 10 0.525004097470241 0.172084847617343 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 127 98 225 60.3244796212794 51.4504015520836 8.87407806919578 A:G G A 10 0.525004097470241 0.256510210846652 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 138463538 G/C 1 26 15 41 12.3498934657737 7.87506146205362 4.47483200372012 C:G G C 10 0.525004097470241 0.210468158711768 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138463428_138463542:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138463428_138463542:SIL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 138755866 A/G 1 22 23 45 10.4499098556547 12.0750942418155 -1.62518438616085 A:G A G 10 0.525004097470241 0.65655506552178 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138755742_138755914:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000510770:exon_138755742_138755999:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000508445:exon_138755742_138755914:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000514052:exon_138755742_138755914:DNAJC18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 138856923 C/T 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 T:C C T 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 103 122 225 48.9245779605652 64.0504998913694 -15.1259219308042 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0452698139499577 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 139946888 G/A 1 30 28 58 14.2498770758928 14.7001147291667 -0.45023765327398 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 140041960 T/G 1 188 132 320 89.2992296755947 69.3005408660718 19.9986888095229 T:C:G T G 10 0.525004097470241 0.0252258744283303 ENSG00000113141:ENST00000417647:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000261812:exon_140041887_140042063:IK;ENSG00000113141:ENST00000515592:exon_140041764_140042064:IK;ENSG00000113141:ENST00000518969:exon_140041887_140042012:IK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 23 18 41 10.9249057581845 9.45007375446434 1.47483200372012 T:C T C 10 0.525004097470241 0.754955179775073 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 141021096 G/A 1 17 21 38 8.0749303430059 11.0250860468751 -2.95015570386916 A:G G A 10 0.525004097470241 0.417117826524397 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141019979_141021179:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141020549_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141020554_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518160:exon_141020776_141021130:FCHSD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 141307833 T/C 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 T:C T C 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 141312988 T/C 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 T:C T C 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000081791:ENST00000506775:exon_141312824_141313447:KIAA0141 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 142661490 A/G 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 A:G A G 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142660685_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142660703_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142660727_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142661376_142661606:NR3C1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 16 20 36 7.59993444047614 10.5000819494048 -2.90014750892868 T:C C T 10 0.525004097470241 0.404596615121924 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 83 83 166 39.42465990997 43.57534009003 -4.15068018006001 T:C C T 10 0.525004097470241 0.534793448172419 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 7 1 8 3.32497131770831 0.525004097470241 2.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0730511813390402 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.293975731308556 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 15 36 51 7.12493853794638 18.9001475089287 -11.7752089709823 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00108851514567581 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 158 106 264 75.0493525997019 55.6504343318455 19.3989182678564 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 0.0190319880546928 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150489390 A/G 1 818 659 1477 388.546648269343 345.977700232889 42.568948036454 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0267974827564392 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 205 205 410 97.3741600186006 107.625839981399 -10.2516799627988 A:G G A 10 0.525004097470241 0.322807291347145 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 T:C C T 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 9 14 23 4.27496312276783 7.35005736458337 -3.07509424181554 A:G A G 10 0.525004097470241 0.216196426553944 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150632832 G/A 1 13 17 30 6.17494673288687 8.9250696569941 -2.75012292410723 A:G G A 10 0.525004097470241 0.362674876612972 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150632453_150632858:GM2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150639409 A/G 1 14 17 31 6.64994263541663 8.9250696569941 -2.27512702157747 A:G A G 10 0.525004097470241 0.473731462150969 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150639439 A/G 1 18 21 39 8.54992624553566 11.0250860468751 -2.4751598013394 A:G A G 10 0.525004097470241 0.521866243287664 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 150646888 T/C 1 20 15 35 9.49991805059518 7.87506146205362 1.62485658854157 T:C T C 10 0.525004097470241 0.615470018039268 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 154282163 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 156565839 C/T 1 130 110 240 61.7494673288687 57.7504507217265 3.99901660714216 T:C C T 10 0.525004097470241 0.651061797148072 ENSG00000155868:ENST00000286317:exon_156564423_156566459:MED7;ENSG00000155868:ENST00000420343:exon_156565453_156566459:MED7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 24 26 50 11.3999016607142 13.6501065342263 -2.25020487351205 A:G A G 10 0.525004097470241 0.572360723487627 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 156753257 C/T 1 26 15 41 12.3498934657737 7.87506146205362 4.47483200372012 T:C C T 10 0.525004097470241 0.210468158711768 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520960:exon_156753179_156753275:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000518555:exon_156752608_156753275:CYFIP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 60 46 106 28.4997541517855 24.1501884836311 4.34956566815445 T:C T C 10 0.525004097470241 0.436962418317987 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 16 3 19 7.59993444047614 1.57501229241072 6.02492214806542 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.00532952606411964 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 159833529 C/T 1 112 85 197 53.199541083333 44.6253482849705 8.57419279836252 T:C C T 10 0.525004097470241 0.226052190882897 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159833475_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000520841:exon_159833356_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000523219:exon_159833372_159833636:SLU7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 39 41 80 18.5248401986606 21.5251679962799 -3.00032779761928 A:G A G 10 0.525004097470241 0.504479286351859 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 33 38 71 15.674864783482 19.9501557038692 -4.27529092038711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.342440897752735 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 162909687 G/A 1 29 26 55 13.774881173363 13.6501065342263 0.124774639136744 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 162909716 C/T 1 32 24 56 15.1998688809523 12.6000983392858 2.5997705416665 T:C C T 10 0.525004097470241 0.50654987014446 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162909648_162909794:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162909648_162909794:HMMR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 162911075 C/A 1 66 68 134 31.3497295669641 35.7002786279764 -4.35054906101229 A:C C A 10 0.525004097470241 0.489209679214844 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162911075_162911251:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162911075_162911251:HMMR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 167913510 G/A 1 24 22 46 11.3999016607142 11.5500901443453 -0.150188483631087 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167913450_167913548:RARS;ENSG00000113643:ENST00000524082:exon_167913456_167913548:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521329:exon_167913475_167913548:RARS;ENSG00000113643:ENST00000522834:exon_167913487_167913548:RARS;ENSG00000113643:ENST00000521939:exon_167913491_167913548:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167913496_167913548:RARS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 167943827 G/A 1 128 122 250 60.7994755238091 64.0504998913694 -3.25102436756025 A:G G A 10 0.525004097470241 0.704177823139398 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169021233 G/A 1 7 15 22 3.32497131770831 7.87506146205362 -4.5500901443453 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0568692815375409 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021176_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000513941:exon_169021149_169021298:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021149_169021298:CCDC99 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 13 8 21 6.17494673288687 4.20003277976193 1.97491395312494 A:G A G 10 0.525004097470241 0.513304745439729 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169267784 G/A 1 35 29 64 16.6248565885416 15.225118826637 1.39973776190457 A:G G A 10 0.525004097470241 0.802678181275534 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520836:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520181:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519628:exon_169267761_169267856:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169267761_169267856:DOCK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 36 25 61 17.0998524910713 13.125102436756 3.9747500543153 C:G C G 10 0.525004097470241 0.369680563390392 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 29 38 67 13.774881173363 19.9501557038692 -6.17527453050615 T:C C T 10 0.525004097470241 0.142770652594291 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 78 71 149 37.0496803973212 37.2752909203871 -0.22561052306591 T:C:G T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 169509844 G/A 1 226 209 435 107.349073971726 109.72585637128 -2.37678239955484 A:G G A 10 0.525004097470241 0.847756437370372 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169509800_169510386:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169509800_169509938:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169509800_169510383:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169509800_169510381:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169509800_169510381:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169509800_169510381:DOCK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 16 26 42 7.59993444047614 13.6501065342263 -6.05017209375012 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0650777886403642 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176081907 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000048140:ENST00000310032:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000405525:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000514705:exon_176079744_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000508164:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000504168:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000503045:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000515708:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000507471:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000414405:exon_176081380_176082021:TSPAN17 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 30 37 67 14.2498770758928 19.4251516063989 -5.17527453050615 A:G A G 10 0.525004097470241 0.222306282463676 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176396334 T/A 1 2 9 11 0.949991805059518 4.72503687723217 -3.77504507217265 A:T T A 10 0.525004097470241 0.0314607471472406 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176721272 G/C 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 C:G G C 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 8 13 21 3.79996722023807 6.82505326711313 -3.02508604687506 C:G G C 10 0.525004097470241 0.197762713297050 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 78 75 153 37.0496803973212 39.3753073102681 -2.32562691294687 C:G G C 10 0.525004097470241 0.746291607087993 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 46 30 76 21.8498115163689 15.7501229241072 6.09968859226168 A:G A G 10 0.525004097470241 0.169601446610776 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 42 20 62 19.9498279062499 10.5000819494048 9.44974595684506 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0213202528531328 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 16 11 27 7.59993444047614 5.77504507217265 1.82488936830349 T:C C T 10 0.525004097470241 0.565180073022297 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 27 16 43 12.8248893683035 8.40006555952386 4.42482380877964 T:C C T 10 0.525004097470241 0.221626992802355 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 70 70 140 33.2497131770831 36.7502868229169 -3.50057364583374 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.555057020933386 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 22 19 41 10.4499098556547 9.97507785193458 0.474832003720119 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 1 20 2 22 9.49991805059518 1.05000819494048 8.4499098556547 A:G A G 10 0.525004097470241 0.000170198477812454 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 177548196 G/A 1 13 7 20 6.17494673288687 3.67502868229169 2.49991805059518 A:G G A 10 0.525004097470241 0.3710246623915 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177548099_177548353:N4BP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 177565255 C/T 1 13 11 24 6.17494673288687 5.77504507217265 0.399901660714216 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000502814:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512663:exon_177565109_177565397:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000508647:exon_177565109_177565259:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177565109_177565259:RMND5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 177569969 C/G 1 15 21 36 7.12493853794638 11.0250860468751 -3.90014750892868 C:G C G 10 0.525004097470241 0.242570652607124 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177569584_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512663:exon_177569853_177569977:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177568673_177569993:RMND5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 177574561 T/C 1 31 43 74 14.7248729784225 22.5751761912204 -7.85030321279784 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0803066571579153 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 28 43 71 13.2998852708333 22.5751761912204 -9.27529092038711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0319865060516035 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 179996111 C/T 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 T:C C T 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000113300:ENST00000261951:exon_179996110_179996340:CNOT6;ENSG00000113300:ENST00000393356:exon_179996110_179996340:CNOT6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 34 31 65 16.1498606860118 16.2751270215775 -0.125266335565666 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 5 180669136 C/T 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 172 60 232 81.6992952351185 31.5002458482145 50.1990493869041 A:G G A 10 0.525004097470241 1.60629641671739e-11 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 42 41 83 19.9498279062499 21.5251679962799 -1.57534009003001 A:G A G 10 0.525004097470241 0.742802756032367 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 24 1 25 11.3999016607142 0.525004097470241 10.874897563244 T:C C T 10 0.525004097470241 2.62073701802986e-06 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 19 2 21 9.02492214806542 1.05000819494048 7.97491395312494 A:G A G 10 0.525004097470241 0.000300554352515043 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 4135805 G/T 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4135745_4135825:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4135745_4135824:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4135745_4135809:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4135745_4135807:PECI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 4943846 T/C 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000472453:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397586:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000469671:exon_4943780_4944047:CDYL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 11 7 18 5.22495492782735 3.67502868229169 1.54992624553566 A:G A G 10 0.525004097470241 0.490617940005165 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 40 27 67 18.9998361011904 14.1751106316965 4.82472546949385 A:G A G 10 0.525004097470241 0.271335522183808 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 7590624 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7590432_7590646:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000397475:exon_7590432_7590646:SNRNP48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 18 31 49 8.54992624553566 16.2751270215775 -7.72520077604181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0314288709807922 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 17 23 40 8.0749303430059 12.0750942418155 -4.00016389880964 T:G G T 10 0.525004097470241 0.210178107722630 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 16290761 T/A 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 A:T T A 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000137198:ENST00000259727:exon_16290693_16290852:GMPR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 A:G G A 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 14 11 25 6.64994263541663 5.77504507217265 0.874897563243974 A:G G A 10 0.525004097470241 0.842085588637267 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 C:G G C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 50 34 84 23.7497951264879 17.8501393139882 5.89965581249976 C:G G C 10 0.525004097470241 0.229417045951023 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 104 86 190 49.3995738630949 45.1503523824407 4.24922148065421 A:G G A 10 0.525004097470241 0.561588032358509 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 12 13 25 5.69995083035711 6.82505326711313 -1.12510243675603 T:C T C 10 0.525004097470241 0.692480003939152 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26055963 A/C 1 1377 50 1427 654.069357783478 26.2502048735121 627.819152909966 A:T:C:G A C 10 0.525004097470241 2.85634249308202e-309 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26056399 G/A 1 812 1034 1846 385.696672854164 542.854236784229 -157.157563930065 A:T:G G A 10 0.525004097470241 2.65257965274117e-13 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26056477 A/C 1 1039 1457 2496 493.52074272842 764.930970014141 -271.410227285722 A:T:C A C 10 0.525004097470241 1.69362464759182e-27 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 115 134 249 54.6245287909223 70.3505490610123 -15.72602027009 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0491077302148395 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 T:C C T 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26273497 T/G 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:G T G 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000168242:ENST00000377733:exon_26273144_26273622:HIST1H2BI HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 17 15 32 8.0749303430059 7.87506146205362 0.199868880952287 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26388405 G/A 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G G A 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000124508:ENST00000469230:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000490025:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000467485:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000493275:exon_26388241_26388517:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000472507:exon_26388241_26388477:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000396910:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482842:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26388241_26388522:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000483410:exon_26388241_26388522:BTN2A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26392905 C/T 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 T:C C T 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000124508:ENST00000490025:exon_26392603_26392950:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26468201 C/T 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26468319 C/T 1 7 6 13 3.32497131770831 3.15002458482145 0.174946732886867 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26468660 G/A 1 11 13 24 5.22495492782735 6.82505326711313 -1.60009833928578 A:G G A 10 0.525004097470241 0.545429500501973 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 87 90 177 41.324643520089 47.2503687723217 -5.92572525223266 A:G G A 10 0.525004097470241 0.40784222159318 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 25 32 57 11.874897563244 16.8001311190477 -4.92523355580374 A:G A G 10 0.525004097470241 0.232421281604629 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 45 35 80 21.3748156138392 18.3751434114584 2.99967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.575953536806043 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 28264692 C/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 20 11 31 9.49991805059518 5.77504507217265 3.72487297842253 C:G C G 10 0.525004097470241 0.209839722363348 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 28270064 T/A 1 12 17 29 5.69995083035711 8.9250696569941 -3.22511882663699 A:T T A 10 0.525004097470241 0.266530934871153 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 24 34 58 11.3999016607142 17.8501393139882 -6.45023765327398 A:G A G 10 0.525004097470241 0.113888646061969 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 34 18 52 16.1498606860118 9.45007375446434 6.69978693154747 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.0710106718860226 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 17 18 35 8.0749303430059 9.45007375446434 -1.37514341145843 T:C C T 10 0.525004097470241 0.735698242022473 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 159 203 362 75.5243485022317 106.575831786459 -31.0514832842272 C:G G C 10 0.525004097470241 0.00129506516893681 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 153 34 187 72.6743730870531 17.8501393139882 54.8242337730649 A:T:G T G 10 0.525004097470241 8.94373905119782e-17 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 154 33 187 73.1493689895829 17.325135216518 55.8242337730649 A:C C A 10 0.525004097470241 2.22282106752729e-17 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30314598 C/T 0 40 0 40 18.9998361011904 0 18.9998361011904 C C 10 0.525004097470241 1.1687350677357e-11 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 30880211 C/T 1 48 32 80 22.7998033214284 16.8001311190477 5.99967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.217935687839664 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30880105_30880235:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30880105_30880235:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000483318:exon_30879728_30880235:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000475845:exon_30880000_30880235:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30879791_30880235:VARS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 99 81 180 47.0245943504461 42.5253318950895 4.49926245535661 A:T T A 10 0.525004097470241 0.550606775909543 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 49 25 74 23.2747992239582 13.125102436756 10.1496967872022 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0196616278466433 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 42 26 68 19.9498279062499 13.6501065342263 6.29972137202361 A:G A G 10 0.525004097470241 0.145063220835434 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 27 19 46 12.8248893683035 9.97507785193458 2.84981151636891 A:G G A 10 0.525004097470241 0.46138635759268 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 15 12 27 7.12493853794638 6.30004916964289 0.824889368303492 A:G G A 10 0.525004097470241 0.848106200368835 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 28 23 51 13.2998852708333 12.0750942418155 1.22479102901771 C:G C G 10 0.525004097470241 0.780244102616645 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 15 10 25 7.12493853794638 5.25004097470241 1.87489756324397 A:G G A 10 0.525004097470241 0.549607407879178 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 A:G A G 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 A:C A C 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 28 29 57 13.2998852708333 15.225118826637 -1.92523355580374 T:C T C 10 0.525004097470241 0.691128986956403 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 3136 412 3548 1489.58715033332 216.301688157739 1273.28546217558 A:T:C T C 10 0.525004097470241 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 3141 163 3304 1491.96212984597 85.5756678876493 1406.38646195832 A:C:G C G 10 0.525004097470241 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 0 919 0 919 436.521234424849 0 436.521234424849 T T 10 0.525004097470241 6.88785778585024e-258 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 920 98 1018 436.996230327378 51.4504015520836 385.545828775295 T:C C T 10 0.525004097470241 5.78102505481238e-151 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 6 3 9 2.84997541517855 1.57501229241072 1.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512717550149286 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 11 1 12 5.22495492782735 0.525004097470241 4.69995083035711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00708055669270639 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 1432 1169 2601 680.194132422615 613.729789942712 66.4643424799032 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.0095432406861250 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31323203 A/G 1 3406 2671 6077 1617.83604401636 1402.28594434301 215.550099673345 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 3.06084988956971e-08 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 1504 427 1931 714.393837404758 224.176749619793 490.217087784965 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 7.16839730014048e-118 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 17 17 34 8.0749303430059 8.9250696569941 -0.850139313988194 A:G A G 10 0.525004097470241 0.86411538909421 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 20 26 46 9.49991805059518 13.6501065342263 -4.15018848363109 T:C C T 10 0.525004097470241 0.239578627728506 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31473546 A/G 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 10 5 15 4.74995902529759 2.6250204873512 2.12493853794639 A:G G A 10 0.525004097470241 0.310879488899670 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31503118 G/A 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 110 108 218 52.2495492782735 56.700442526786 -4.45089324851254 T:C T C 10 0.525004097470241 0.587571836612008 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 141 120 261 66.974422256696 63.0004916964289 3.97393056026709 A:C C A 10 0.525004097470241 0.664497611760904 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31557791 G/A 1 20 22 42 9.49991805059518 11.5500901443453 -2.05017209375012 A:G G A 10 0.525004097470241 0.540604176828727 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 90 79 169 42.7496312276783 41.475323700149 1.27430752752927 A:G A G 10 0.525004097470241 0.877727504499015 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 146 136 282 69.3494017693448 71.4005572559528 -2.05115548660797 T:C C T 10 0.525004097470241 0.81178448931965 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 23 35 58 10.9249057581845 18.3751434114584 -7.45023765327398 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0647680054617226 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31631921 G/A 1 71 57 128 33.7247090796129 29.9252335558037 3.79947552380915 A:G G A 10 0.525004097470241 0.536070071328989 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 64 46 110 30.3997377619046 24.1501884836311 6.24954927827349 A:T:C C A 10 0.525004097470241 0.252457694259922 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 409 447 856 194.273324134671 234.676831569198 -40.4035074345263 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.00615521820200362 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 13 13 26 6.17494673288687 6.82505326711313 -0.650106534226266 T:C C T 10 0.525004097470241 0.84603224725779 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 27 39 66 12.8248893683035 20.4751598013394 -7.6502704330359 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0646974273243076 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31656515 G/A 1 11 16 27 5.22495492782735 8.40006555952386 -3.17511063169651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.250547223446268 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31656500_31656896:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31656500_31656563:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31656500_31656563:XXbac-BPG32J3.20 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 89 72 161 42.2746353251486 37.8002950178574 4.4743403072912 T:C C T 10 0.525004097470241 0.527998340061397 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31929014 A/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928973_31929163:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31928973_31929163:SKIV2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31936668 T/C 1 53 68 121 25.1747828340772 35.7002786279764 -10.5254957938992 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0564306780126477 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 10 19 29 4.74995902529759 9.97507785193458 -5.22511882663699 T:G G T 10 0.525004097470241 0.062526232967949 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 10 15 25 4.74995902529759 7.87506146205362 -3.12510243675603 T:C T C 10 0.525004097470241 0.233781441016375 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32097290 C/T 1 12 20 32 5.69995083035711 10.5000819494048 -4.80013111904771 T:C C T 10 0.525004097470241 0.110587139099520 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 1 27 1 28 12.8248893683035 0.525004097470241 12.2998852708333 A:G G A 10 0.525004097470241 4.12938094543095e-07 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 87 32 119 41.324643520089 16.8001311190477 24.5245124010413 A:G A G 10 0.525004097470241 5.27508370946906e-06 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 73 62 135 34.6747008846724 32.5502540431549 2.12444684151746 T:C T C 10 0.525004097470241 0.731074678697727 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32163274 G/A 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G G A 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32163203_32163300:GPSM3;ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 59 46 105 28.0247582492558 24.1501884836311 3.87456976562469 A:G G A 10 0.525004097470241 0.494344282245769 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 70 56 126 33.2497131770831 29.4002294583335 3.84948371874963 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.532729752104573 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32797309 T/G 1 81 81 162 38.4746681049105 42.5253318950895 -4.05066379017904 T:G T G 10 0.525004097470241 0.530190960836231 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 50 47 97 23.7497951264879 24.6751925811013 -0.925397454613378 A:C C A 10 0.525004097470241 0.919098105208365 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 405 434 839 192.373340524552 227.851778302085 -35.4784377775322 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.0154839136055841 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 1309 1040 2349 621.769636411454 546.004261369051 75.7653750424038 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.00180640089534314 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32902693 A/G 1 773 716 1489 367.171832655504 375.902933788693 -8.73110113318887 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.65917467577563 ENSG00000242574:ENST00000487996:exon_32902406_32902764:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000477537:exon_32902406_32902764:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32902406_32902764:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32902406_32902764:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32902406_32902795:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32902406_32902764:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32902415_32902764:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32902415_32902764:HLA-DMB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32916555 G/A 1 575 645 1220 273.122643954611 338.627642868305 -65.504998913694 A:G G A 10 0.525004097470241 0.000191625243926215 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32916391_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000473725:exon_32916518_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32916548_32916645:HLA-DMA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32917042 A/C 1 1 11 12 0.474995902529759 5.77504507217265 -5.30004916964289 A:C A C 10 0.525004097470241 0.00231996722343116 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 25 19 44 11.874897563244 9.97507785193458 1.8998197113094 A:G G A 10 0.525004097470241 0.651398281956876 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 178 214 392 84.5492706502971 112.350876858632 -27.8016062083345 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00535920539580929 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 14 9 23 6.64994263541663 4.72503687723217 1.92490575818446 T:C C T 10 0.525004097470241 0.532417104873035 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 0 340 0 340 161.498606860118 0 161.498606860118 A A 10 0.525004097470241 9.55488669878365e-96 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 1614 468 2082 766.643386683031 245.701917616073 520.941469066958 T:C T C 10 0.525004097470241 3.5704738039507e-123 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 1820 522 2342 864.492542604161 274.052138879466 590.440403724696 T:C C T 10 0.525004097470241 1.83718321743910e-140 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 1608 392 2000 763.793411267852 205.801606208334 557.991805059518 A:T:C T C 10 0.525004097470241 5.96093382249422e-149 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 2015 933 2948 957.116743597464 489.828822939735 467.28792065773 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 2.52177998884062e-68 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 30 24 54 14.2498770758928 12.6000983392858 1.64977873660698 T:C C T 10 0.525004097470241 0.684645699658707 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33218589 C/T 1 40 51 91 18.9998361011904 26.7752089709823 -7.77537286979193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.115288564263080 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33218049_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33218050_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495981:exon_33218383_33218764:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000493674:exon_33218588_33218764:VPS52 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 7 15 22 3.32497131770831 7.87506146205362 -4.5500901443453 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0568692815375409 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 72 53 125 34.1997049821426 27.8252171659228 6.37448781621988 A:G A G 10 0.525004097470241 0.282631231459479 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 35 34 69 16.6248565885416 17.8501393139882 -1.22528272544663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.810048718039565 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 133 117 250 63.1744550364579 61.4254794040182 1.74897563243974 A:C:G G C 10 0.525004097470241 0.84946735933516 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 T:C T C 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 14 14 28 6.64994263541663 7.35005736458337 -0.700114729166749 A:G G A 10 0.525004097470241 0.851142914584854 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:G A G 10 0.525004097470241 0.195366298779196 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 17 10 27 8.0749303430059 5.25004097470241 2.82488936830349 A:G G A 10 0.525004097470241 0.336808455248746 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 37443950 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 40 38 78 18.9998361011904 19.9501557038692 -0.950319602678796 T:G T G 10 0.525004097470241 0.909834541060719 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 3 16 19 1.42498770758928 8.40006555952386 -6.97507785193458 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00187016053313376 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 115 145 260 54.6245287909223 76.1255941331849 -21.5010653422627 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00897814709328216 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 40 49 89 18.9998361011904 25.7252007760418 -6.72536467485145 T:C C T 10 0.525004097470241 0.167985270022743 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 24 19 43 11.3999016607142 9.97507785193458 1.42482380877964 A:G G A 10 0.525004097470241 0.760602724661103 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 127 92 219 60.3244796212794 48.3003769672622 12.0241026540172 T:C C T 10 0.525004097470241 0.104929817213211 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 18 21 39 8.54992624553566 11.0250860468751 -2.4751598013394 A:T T A 10 0.525004097470241 0.521866243287664 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42858227 G/A 1 38 20 58 18.0498442961308 10.5000819494048 7.54976234672602 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0491964619865243 ENSG00000221821:ENST00000408925:exon_42858005_42858554:C6orf226 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 24 33 57 11.3999016607142 17.325135216518 -5.92523355580374 T:G G T 10 0.525004097470241 0.144015378090640 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 25 32 57 11.874897563244 16.8001311190477 -4.92523355580374 T:C C T 10 0.525004097470241 0.232421281604629 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 27 15 42 12.8248893683035 7.87506146205362 4.94982790624988 T:C C T 10 0.525004097470241 0.163677646720061 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 29 28 57 13.774881173363 14.7001147291667 -0.925233555803739 T:C T C 10 0.525004097470241 0.894656480406071 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 31 29 60 14.7248729784225 15.225118826637 -0.500245848214462 C:G C G 10 0.525004097470241 0.898050611415441 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 127 97 224 60.3244796212794 50.9253974546134 9.39908216666601 A:G A G 10 0.525004097470241 0.228493917553299 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 12 18 30 5.69995083035711 9.45007375446434 -3.75012292410723 T:C C T 10 0.525004097470241 0.201612504132499 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 43273604 A/G 1 9 19 28 4.27496312276783 9.97507785193458 -5.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0368015667258374 ENSG00000146215:ENST00000372569:exon_43273210_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000451294:exon_43273251_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000477866:exon_43273455_43273613:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000274990:exon_43273563_43273862:CRIP3;ENSG00000146215:ENST00000449267:exon_43273563_43273862:CRIP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 29 29 58 13.774881173363 15.225118826637 -1.45023765327398 A:G G A 10 0.525004097470241 0.792875066118341 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 84 78 162 39.8996558124998 40.9503196026788 -1.05066379017904 A:G G A 10 0.525004097470241 0.8753205063428 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 38 24 62 18.0498442961308 12.6000983392858 5.44974595684506 A:C A C 10 0.525004097470241 0.203200647255466 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 52129484 C/T 1 207 223 430 98.3241518236601 117.075913735864 -18.7517619122036 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0739733632412805 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52129419_52129584:MCM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 53133954 C/T 1 9 1 10 4.27496312276783 0.525004097470241 3.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0230306542002755 ENSG00000012660:ENST00000370918:exon_53132196_53134068:ELOVL5;ENSG00000012660:ENST00000304434:exon_53132197_53134068:ELOVL5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 54191686 C/T 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 T:C C T 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000339741:exon_54191596_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370865:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54191600_54191804:TINAG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 56373536 C/T 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 T:C C T 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56373327_56373553:DST;ENSG00000151914:ENST00000340834:exon_56373327_56373553:DST HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 18 13 31 8.54992624553566 6.82505326711313 1.72487297842253 A:G G A 10 0.525004097470241 0.592389490433888 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 23 0 23 10.9249057581845 0 10.9249057581845 G G 10 0.525004097470241 4.02852423161511e-07 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 17 0 17 8.0749303430059 0 8.0749303430059 A A 10 0.525004097470241 2.06785695297461e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 15 15 0 7.87506146205362 -7.87506146205362 G A G 10 0.525004097470241 1.41366969838873e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57393144 A/T 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 A A 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 10 10 0 5.25004097470241 -5.25004097470241 G A G 10 0.525004097470241 0.00058465360613205 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 27 27 0 14.1751106316965 -14.1751106316965 A G A 10 0.525004097470241 1.86477444269075e-09 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 17 0 17 8.0749303430059 0 8.0749303430059 C C 10 0.525004097470241 2.06785695297461e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 16 16 0 8.40006555952386 -8.40006555952386 C T C 10 0.525004097470241 6.71487314265126e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 70916888 A/C 1 7 3 10 3.32497131770831 1.57501229241072 1.74995902529759 A:C A C 10 0.525004097470241 0.349883865038242 ENSG00000082293:ENST00000322773:exon_70916851_70919679:COL19A1;ENSG00000082293:ENST00000393344:exon_70916851_70919679:COL19A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 20 21 41 9.49991805059518 11.0250860468751 -1.52516799627988 T:C C T 10 0.525004097470241 0.642817141960355 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 74190448 T/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000135297:ENST00000498286:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415954:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000357845:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370305:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370308:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000370300:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000415228:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000462039:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000445187:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000520366:exon_74190398_74190485:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000487960:exon_74190398_74190528:MTO1;ENSG00000135297:ENST00000524046:exon_74190398_74190528:MTO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 76376552 G/A 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:G G A 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76376428_76376657:SENP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 76425288 A/G 1 151 165 316 71.7243812819936 86.6256760825898 -14.9012948005962 A:G A G 10 0.525004097470241 0.102248122875295 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76425101_76425620:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76425101_76427997:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76425101_76427994:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76425101_76425593:SENP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 76624741 C/T 1 21 24 45 9.97491395312494 12.6000983392858 -2.62518438616085 T:C C T 10 0.525004097470241 0.458369751247753 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76624530_76629254:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76624530_76626329:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76624530_76626329:MYO6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 26 27 53 12.3498934657737 14.1751106316965 -1.82521716592277 T:C C T 10 0.525004097470241 0.680560997846566 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 15 21 36 7.12493853794638 11.0250860468751 -3.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.242570652607124 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 83938603 A/G 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83938545_83938650:ME1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C T C 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 26 21 47 12.3498934657737 11.0250860468751 1.32480741889867 T:C T C 10 0.525004097470241 0.770958365094865 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 99956560 T/C 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99956486_99956657:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000506871:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000329966:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000472914:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000430949:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369232:exon_99956486_99956658:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369231:exon_99956486_99956658:USP45 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 18 12 30 8.54992624553566 6.30004916964289 2.24987707589277 C:G G C 10 0.525004097470241 0.467433292521780 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 73 58 131 34.6747008846724 30.450237653274 4.22446323139842 T:C C T 10 0.525004097470241 0.484756011753022 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 105821449 A/G 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105821244_105821453:PREP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 20 11 31 9.49991805059518 5.77504507217265 3.72487297842253 A:G G A 10 0.525004097470241 0.209839722363348 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 36 30 66 17.0998524910713 15.7501229241072 1.34972956696409 A:G G A 10 0.525004097470241 0.80570645533961 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 38 32 70 18.0498442961308 16.8001311190477 1.24971317708313 T:G G T 10 0.525004097470241 0.81144602154692 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 52 7 59 24.6997869315475 3.67502868229169 21.0247582492558 T:G G T 10 0.525004097470241 9.1754538911535e-09 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 53 7 60 25.1747828340772 3.67502868229169 21.4997541517855 T:C C T 10 0.525004097470241 5.32721324430328e-09 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 40 25 65 18.9998361011904 13.125102436756 5.87473366443434 A:G G A 10 0.525004097470241 0.171674253964087 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 109774985 C/T 1 9 11 20 4.27496312276783 5.77504507217265 -1.50008194940482 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512362550711290 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109774841_109775048:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109774841_109775048:MICAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 37 23 60 17.5748483936011 12.0750942418155 5.49975415178554 T:C T C 10 0.525004097470241 0.195731549537337 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 57 28 85 27.0747664441963 14.7001147291667 12.3746517150295 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00876310546642629 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 110146497 G/A 1 50 37 87 23.7497951264879 19.4251516063989 4.32464352008903 A:G G A 10 0.525004097470241 0.391003035659587 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 111695073 C/T 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 13 16 29 6.17494673288687 8.40006555952386 -2.22511882663699 A:G G A 10 0.525004097470241 0.459653232536022 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 111696257 G/A 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 111696852 T/C 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C T C 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 111912641 G/T 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 T:G G T 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000532708:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000528599:exon_111912461_111913297:TRAF3IP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 C:G C G 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 45 41 86 21.3748156138392 21.5251679962799 -0.15035238244073 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 118028145 A/G 1 12 17 29 5.69995083035711 8.9250696569941 -3.22511882663699 A:G A G 10 0.525004097470241 0.266530934871153 ENSG00000153989:ENST00000368494:exon_118028088_118031803:NUS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 0 99 0 99 47.0245943504461 0 47.0245943504461 C C 10 0.525004097470241 2.57050470772915e-28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 122766138 G/A 1 9 7 16 4.27496312276783 3.67502868229169 0.599934440476144 A:G G A 10 0.525004097470241 0.807514066959471 ENSG00000111897:ENST00000339697:exon_122764496_122766324:SERINC1;ENSG00000111897:ENST00000368454:exon_122764499_122766324:SERINC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 129905249 A/G 1 14 20 34 6.64994263541663 10.5000819494048 -3.85013931398819 A:G A G 10 0.525004097470241 0.22939073204673 ENSG00000146376:ENST00000368149:exon_129905133_129905257:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_129905133_129905257:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000483367:exon_129905133_129905257:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000463225:exon_129905133_129905257:ARHGAP18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 T:C T C 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 27 42 69 12.8248893683035 22.0501720937501 -9.22528272544663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.029687592949752 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 133072306 C/T 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 T:C C T 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133072284_133072417:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 1963 1068 3031 932.416956665917 560.704376098217 371.7125805677 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 2.42820965900045e-42 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 134308187 T/G 1 43 43 86 20.4248238087796 22.5751761912204 -2.15035238244073 T:G T G 10 0.525004097470241 0.666855660811686 ENSG00000028839:ENST00000237264:exon_134308099_134308637:TBPL1;ENSG00000028839:ENST00000477527:exon_134308099_134308637:TBPL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 135716008 T/C 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.125338991076950 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000531788:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000327035:exon_135715914_135716034:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000529865:exon_135715795_135716034:AHI1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 228 0 228 108.299065776785 0 108.299065776785 T T 10 0.525004097470241 3.16944821702806e-64 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 255 0 255 121.123955145089 0 121.123955145089 A A 10 0.525004097470241 4.90196511665589e-72 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 252 0 252 119.698967437499 0 119.698967437499 A A 10 0.525004097470241 3.48574094668916e-71 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136599391 C/T 0 41 0 41 19.4748320037201 0 19.4748320037201 C C 10 0.525004097470241 5.93307965178521e-12 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 39 0 39 18.5248401986606 0 18.5248401986606 G G 10 0.525004097470241 2.30488925992827e-11 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 42 0 42 19.9498279062499 0 19.9498279062499 T T 10 0.525004097470241 3.01548137354910e-12 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 136913684 C/T 1 12 21 33 5.69995083035711 11.0250860468751 -5.32513521651795 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0803226802492965 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136913575_136913752:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136913575_136913755:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136913575_136913761:MAP3K5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 95 100 195 45.1246107403271 52.5004097470241 -7.37579900669699 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.315521761657654 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 143823112 G/A 1 39 34 73 18.5248401986606 17.8501393139882 0.674700884672408 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.907126209948754 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 143823157 T/C 1 36 21 57 17.0998524910713 11.0250860468751 6.07476644419626 T:C T C 10 0.525004097470241 0.113039590673095 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000367585:exon_143823082_143823259:FUCA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 143825104 G/T 1 27 44 71 12.8248893683035 23.1001802886906 -10.2752909203871 T:G G T 10 0.525004097470241 0.017047870117752 ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143825050_143825389:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143825050_143825389:FUCA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 149922850 C/T 1 22 13 35 10.4499098556547 6.82505326711313 3.62485658854156 T:C C T 10 0.525004097470241 0.239759358776754 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000494504:exon_149922730_149922935:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000481905:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000470620:exon_149922730_149922888:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149922776_149922888:KATNA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 16 15 31 7.59993444047614 7.87506146205362 -0.275127021577472 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 T:C C T 10 0.525004097470241 0.125338991076950 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 155143502 A/G 1 1 7 8 0.474995902529759 3.67502868229169 -3.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0312759656569811 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155143410_155143543:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155143410_155143543:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155143410_155143543:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000479234:exon_155143296_155143513:RBM16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 157743818 G/A 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 A:G G A 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000215712:ENST00000400788:exon_157743737_157743837:C6orf35;ENSG00000215712:ENST00000367144:exon_157743737_157743837:C6orf35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 19 12 31 9.02492214806542 6.30004916964289 2.72487297842253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.371508072375509 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 40 39 79 18.9998361011904 20.4751598013394 -1.47532370014904 A:G A G 10 0.525004097470241 0.821923291744223 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 159184507 C/T 1 57 64 121 27.0747664441963 33.6002622380954 -6.52549579389916 T:C C T 10 0.525004097470241 0.238210304917365 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 159206423 C/T 1 134 93 227 63.6494509389877 48.8253810647324 14.8240698742553 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.0537737770156293 ENSG00000092820:ENST00000337147:exon_159206341_159206615:EZR;ENSG00000092820:ENST00000392177:exon_159206341_159206615:EZR;ENSG00000092820:ENST00000367075:exon_159206341_159206615:EZR;ENSG00000092820:ENST00000476189:exon_159206341_159206615:EZR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 159420545 G/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159420467_159421219:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159420467_159420813:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159420467_159421198:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159420467_159421198:RSPH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 159420574 T/C 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159420467_159421219:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159420467_159420813:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159420467_159421198:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159420467_159421198:RSPH3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 282 253 535 133.948844513392 132.826036659971 1.12280785342105 A:G A G 10 0.525004097470241 0.931060853720942 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 249 270 519 118.27397972991 141.751106316965 -23.4771265870551 A:G G A 10 0.525004097470241 0.043103324259841 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 89 93 182 42.2746353251486 48.8253810647324 -6.55074573958386 T:C T C 10 0.525004097470241 0.335635242226527 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 24 33 57 11.3999016607142 17.325135216518 -5.92523355580374 T:C C T 10 0.525004097470241 0.144015378090640 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 161508880 A/C 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 A:C A C 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000085511:ENST00000366920:exon_161508720_161508986:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000392142:exon_161508720_161508986:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000348824:exon_161508720_161508986:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000366919:exon_161508720_161508986:MAP3K4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 170155517 A/G 0 10 0 10 4.74995902529759 0 4.74995902529759 A A 10 0.525004097470241 0.00217549517025948 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170155379_170155518:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170155379_170155518:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170155379_170155518:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170155379_170155518:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170155379_170155518:C6orf70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 6 170846369 C/A 1 940 972 1912 446.496148377973 510.303982741074 -63.8078343631008 A:C C A 10 0.525004097470241 0.00362774836284798 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170846322_170846428:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000462957:exon_170846322_170846428:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170846322_170846428:PSMB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 552046 A/G 1 14 7 21 6.64994263541663 3.67502868229169 2.97491395312494 A:G A G 10 0.525004097470241 0.274430295423959 ENSG00000197461:ENST00000402802:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000344323:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000354513:exon_551988_552092:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000482462:exon_551988_553104:PDGFA;ENSG00000197461:ENST00000400761:exon_551988_552092:PDGFA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 7 9 16 3.32497131770831 4.72503687723217 -1.40006555952386 A:G A G 10 0.525004097470241 0.618401972843943 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 1132456 C/T 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 1132505 G/A 1 8 10 18 3.79996722023807 5.25004097470241 -1.45007375446434 A:G G A 10 0.525004097470241 0.638276163881484 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 1195215 A/C 1 34 18 52 16.1498606860118 9.45007375446434 6.69978693154747 A:C A C 10 0.525004097470241 0.0710106718860226 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 2290522 C/T 1 232 185 417 110.199049386904 97.1257580319946 13.0732913549095 T:C C T 10 0.525004097470241 0.202732158838385 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 13 10 23 6.17494673288687 5.25004097470241 0.924905758184457 T:C T C 10 0.525004097470241 0.835357270424024 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 2963884 C/T 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2963867_2963999:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2963867_2963999:CARD11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 2985586 C/G 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 C:G C G 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2985453_2985590:CARD11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 4802035 A/G 1 8 12 20 3.79996722023807 6.30004916964289 -2.50008194940482 A:G A G 10 0.525004097470241 0.273669762374101 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4801815_4802171:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4801815_4811074:FOXK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 4827884 C/T 1 11 7 18 5.22495492782735 3.67502868229169 1.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.490617940005165 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4827785_4827925:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4827785_4827925:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4827785_4827925:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4827785_4827925:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4827785_4827925:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477454:exon_4827785_4827925:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000469614:exon_4827857_4828582:KIAA0415 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 5528883 G/A 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5528809_5529843:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5528880_5528927:FBXL18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 A:G G A 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 A:G G A 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6036980 G/C 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 C:G G C 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382321:exon_6036957_6037054:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6036957_6037054:PMS2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 239 221 460 113.524020704612 116.025905540923 -2.50188483631086 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.815644239330637 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6194266 G/C 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 C:G G C 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 T:C T C 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6370165 C/T 1 8 1 9 3.79996722023807 0.525004097470241 3.27496312276783 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0411787126107114 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 126 146 272 59.8494837187496 76.6505982306552 -16.8011145119056 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0449999255231181 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 7646720 A/G 1 161 145 306 76.4743403072912 76.1255941331849 0.348746174106253 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 10979697 G/A 1 475 427 902 225.623053701636 224.176749619793 1.44630408184261 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.946845099856604 ENSG00000189043:ENST00000339600:exon_10979643_10979883:NDUFA4;ENSG00000189043:ENST00000486007:exon_10979643_10979706:NDUFA4;ENSG00000189043:ENST00000492822:exon_10979587_10979762:NDUFA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 20418678 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000105855:ENST00000478974:exon_20418674_20418920:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000222573:exon_20418674_20418920:ITGB8;ENSG00000105855:ENST00000477859:exon_20418674_20421704:ITGB8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 34 86 120 16.1498606860118 45.1503523824407 -29.0004916964289 T:C T C 10 0.525004097470241 1.10291310955789e-07 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 53 18 71 25.1747828340772 9.45007375446434 15.7247090796129 T:C C T 10 0.525004097470241 0.000185142692621234 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 44 8 52 20.8998197113094 4.20003277976193 16.6997869315475 T:C C T 10 0.525004097470241 2.00533640758176e-06 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 34 12 46 16.1498606860118 6.30004916964289 9.84981151636891 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.00450171841099373 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 24854765 G/A 1 17 15 32 8.0749303430059 7.87506146205362 0.199868880952287 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 71 46 117 33.7247090796129 24.1501884836311 9.5745205959818 C:G G C 10 0.525004097470241 0.079097973728352 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 138 139 277 65.5494345491067 72.9755695483635 -7.42613499925676 C:G G C 10 0.525004097470241 0.399708501816995 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 32613020 A/G 1 31 28 59 14.7248729784225 14.7001147291667 0.024758249255779 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 32623477 C/G 1 42 40 82 19.9498279062499 21.0001638988096 -1.05033599255976 C:G C G 10 0.525004097470241 0.825903290884153 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 26 30 56 12.3498934657737 15.7501229241072 -3.4002294583335 A:G G A 10 0.525004097470241 0.4224579608206 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 4 7 11 1.89998361011904 3.67502868229169 -1.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.369764717315095 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 42957446 A/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:T A T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 498 388 886 236.54795945982 203.701589818454 32.8463696413664 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0287322764495201 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 43664280 A/G 1 226 251 477 107.349073971726 131.77602846503 -24.426954493305 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0276696517597576 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43664117_43666385:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43664117_43664783:STK17A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 43810764 G/A 1 85 82 167 40.3746517150295 43.0503359925598 -2.67568427753025 A:G G A 10 0.525004097470241 0.698893684513243 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43810737_43810769:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43810734_43810769:BLVRA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 398 344 742 189.048369206844 180.601409529763 8.44695967708117 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.556490200909338 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 15 17 32 7.12493853794638 8.9250696569941 -1.80013111904771 T:G T G 10 0.525004097470241 0.596850804818577 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 43917274 A/G 1 8 5 13 3.79996722023807 2.6250204873512 1.17494673288687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.587301756220491 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 44746975 A/G 1 41 51 92 19.4748320037201 26.7752089709823 -7.30037696726217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.143805872075016 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44746824_44746987:OGDH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 44806089 G/A 1 46 32 78 21.8498115163689 16.8001311190477 5.0496803973212 A:G G A 10 0.525004097470241 0.259415180203576 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463931:exon_44806020_44806262:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000482322:exon_44806020_44806153:ZMIZ2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 A:G G A 10 0.525004097470241 0.797381480539751 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:G A G 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 29 15 44 13.774881173363 7.87506146205362 5.89981971130939 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0958729023015922 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 A:C A C 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 64439701 C/T 1 8 2 10 3.79996722023807 1.05000819494048 2.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.113770946252455 ENSG00000152926:ENST00000398695:exon_64439109_64439914:ZNF117;ENSG00000152926:ENST00000282869:exon_64438360_64439914:ZNF117 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 5 19 24 2.3749795126488 9.97507785193458 -7.60009833928578 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00188582279160452 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 18 29 47 8.54992624553566 15.225118826637 -6.67519258110133 A:C:G A G 10 0.525004097470241 0.057614276006144 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 216 173 389 102.599114946428 90.8257088623517 11.7734060840763 A:T:C:G A G 10 0.525004097470241 0.243067817687441 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 66774604 G/C 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 A:C:G G C 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 56 49 105 26.5997705416665 25.7252007760418 0.874569765624692 T:C C T 10 0.525004097470241 0.922255306669914 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 26 29 55 12.3498934657737 15.225118826637 -2.87522536086326 T:C C T 10 0.525004097470241 0.500176764913102 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 15 19 34 7.12493853794638 9.97507785193458 -2.85013931398819 T:C C T 10 0.525004097470241 0.391391271595591 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 73097720 G/C 1 14 13 27 6.64994263541663 6.82505326711313 -0.175110631696508 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 75051195 C/T 1 6 8 14 2.84997541517855 4.20003277976193 -1.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.595101394248563 ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75050792_75052486:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75050792_75052486:POM121C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 75517386 A/G 1 11 17 28 5.22495492782735 8.9250696569941 -3.70011472916675 A:G A G 10 0.525004097470241 0.186999313696584 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 75933501 C/T 1 590 557 1147 280.247582492558 292.427282290924 -12.1796997983665 T:C:G C T 10 0.525004097470241 0.478077657809773 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75933301_75933612:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75933301_75933609:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000447574:exon_75933301_75933577:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000429938:exon_75933301_75933612:HSPB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 A:G G A 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 9 11 20 4.27496312276783 5.77504507217265 -1.50008194940482 T:G T G 10 0.525004097470241 0.512362550711290 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 89984409 A/G 1 7 11 18 3.32497131770831 5.77504507217265 -2.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.345616127476845 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 89984515 A/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:C A C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 115 97 212 54.6245287909223 50.9253974546134 3.6991313363089 A:G G A 10 0.525004097470241 0.630698975997209 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 26 16 42 12.3498934657737 8.40006555952386 3.94982790624988 T:C C T 10 0.525004097470241 0.279439130429551 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 42 60 102 19.9498279062499 31.5002458482145 -11.5504179419646 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0227125498737333 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 10 5 15 4.74995902529759 2.6250204873512 2.12493853794639 T:C C T 10 0.525004097470241 0.310879488899670 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 20 14 34 9.49991805059518 7.35005736458337 2.14986068601181 A:G A G 10 0.525004097470241 0.496235271064969 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 A:C A C 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 48 58 106 22.7998033214284 30.450237653274 -7.65043433184555 A:G A G 10 0.525004097470241 0.145165212326368 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 13 17 30 6.17494673288687 8.9250696569941 -2.75012292410723 A:C C A 10 0.525004097470241 0.362674876612972 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 A:G A G 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 97487664 C/T 1 95 98 193 45.1246107403271 51.4504015520836 -6.32579081175651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.387284752634128 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97487590_97487717:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000462436:exon_97487590_97487691:ASNS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 T:C C T 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 98645517 G/A 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198742:ENST00000468960:exon_98645278_98645710:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000482799:exon_98645278_98645863:SMURF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 T:C T C 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 7 2 9 3.32497131770831 1.05000819494048 2.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.184604821888191 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99654689 G/A 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 A:T:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99654630_99654872:ZSCAN21 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 298 272 570 141.548778953868 142.801114511906 -1.25233555803737 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.933176463990132 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 133 153 286 63.1744550364579 80.3256269129469 -17.1511718764889 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0441171327225663 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99799845 T/A 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:T T A 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000066923:ENST00000426455:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000394018:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000379577:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000317296:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000491498:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000440830:exon_99799795_99799963:STAG3;ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99798283_99800226:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99798283_99800226:GATS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99817585 G/T 1 15 9 24 7.12493853794638 4.72503687723217 2.39990166071422 T:G G T 10 0.525004097470241 0.414804146453808 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99816240_99817651:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817336_99817651:PVRIG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 1 32 8 40 15.1998688809523 4.20003277976193 10.9998361011904 A:G A G 10 0.525004097470241 0.000400900621785404 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99821685 C/T 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821505_99821698:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821505_99821698:GATS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99926612 C/T 1 21 15 36 9.97491395312494 7.87506146205362 2.09985249107132 T:C C T 10 0.525004097470241 0.509178418666553 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 99926619 T/C 1 22 13 35 10.4499098556547 6.82505326711313 3.62485658854156 T:C T C 10 0.525004097470241 0.239759358776754 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 100028484 T/C 1 13 20 33 6.17494673288687 10.5000819494048 -4.32513521651795 T:C T C 10 0.525004097470241 0.162915745529303 ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 128 108 236 60.7994755238091 56.700442526786 4.09903299702312 A:G A G 10 0.525004097470241 0.60272767273932 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 100072031 T/C 1 52 66 118 24.6997869315475 34.6502704330359 -9.95048350148844 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0794654259482919 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 65 46 111 30.8747336644343 24.1501884836311 6.72454518080325 T:C T C 10 0.525004097470241 0.217167842601877 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 24 35 59 11.3999016607142 18.3751434114584 -6.97524175074422 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0893013732691296 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 100850144 G/A 0 26 0 26 12.3498934657737 0 12.3498934657737 G G 10 0.525004097470241 5.69202792885613e-08 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850060_100850185:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100850060_100850185:PLOD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 13 14 27 6.17494673288687 7.35005736458337 -1.17511063169651 T:C C T 10 0.525004097470241 0.702605538446534 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 111981007 G/A 1 34 29 63 16.1498606860118 15.225118826637 0.924741859374816 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.89977964736875 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 20 25 45 9.49991805059518 13.125102436756 -3.62518438616084 T:G T G 10 0.525004097470241 0.298799113842865 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 30 37 67 14.2498770758928 19.4251516063989 -5.17527453050615 A:G G A 10 0.525004097470241 0.222306282463676 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 49 45 94 23.2747992239582 23.6251843861608 -0.350385162202656 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 120610901 C/T 1 18 17 35 8.54992624553566 8.9250696569941 -0.375143411458435 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120610742_120610934:ING3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 A:G G A 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 127222544 G/A 1 12 6 18 5.69995083035711 3.15002458482145 2.54992624553566 A:G G A 10 0.525004097470241 0.248457334165905 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 128038555 C/G 1 11 5 16 5.22495492782735 2.6250204873512 2.59993444047614 C:G C G 10 0.525004097470241 0.219246573425815 ENSG00000106348:ENST00000469328:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000484496:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000419067:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000338791:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000496200:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000354269:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000348127:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000378717:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000416064:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000343214:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000470772:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000480861:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000497868:exon_128038468_128038667:IMPDH1;ENSG00000106348:ENST00000468842:exon_128038544_128038667:IMPDH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 10 10 20 4.74995902529759 5.25004097470241 -0.500081949404819 T:C T C 10 0.525004097470241 0.827335021974845 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 66 55 121 31.3497295669641 28.8752253608633 2.47450420610084 A:G G A 10 0.525004097470241 0.715963122844085 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 5 10 15 2.3749795126488 5.25004097470241 -2.87506146205361 A:G G A 10 0.525004097470241 0.195366298779196 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 134135621 T/C 1 38 57 95 18.0498442961308 29.9252335558037 -11.8753892596729 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0177238953677186 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000498771:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000458165:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000487438:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000489022:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000491741:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000497983:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000484592:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467829:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000426422:exon_134135538_134135709:AKR1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 61 59 120 28.9747500543153 30.9752417507442 -2.00049169642892 T:C T C 10 0.525004097470241 0.715847145347701 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 137600690 C/T 1 6 19 25 2.84997541517855 9.97507785193458 -7.12510243675603 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00463274281219082 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000458726:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137600583_137600758:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000420629:exon_137600583_137600758:CREB3L2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139026152 T/G 1 63 60 123 29.9247418593748 31.5002458482145 -1.57550398883965 T:C:G T G 10 0.525004097470241 0.787184846127935 ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 6 12 18 2.84997541517855 6.30004916964289 -3.45007375446434 A:G A G 10 0.525004097470241 0.154967787345994 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139661964 C/G 1 13 11 24 6.17494673288687 5.77504507217265 0.399901660714216 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000469630:exon_139661718_139662850:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000494876:exon_139661718_139662035:TBXAS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 31 37 68 14.7248729784225 19.4251516063989 -4.70027862797639 A:G G A 10 0.525004097470241 0.275523276363734 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 18 23 41 8.54992624553566 12.0750942418155 -3.52516799627988 T:C C T 10 0.525004097470241 0.278449355239952 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 11 5 16 5.22495492782735 2.6250204873512 2.59993444047614 A:G G A 10 0.525004097470241 0.219246573425815 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 139757712 C/A 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 A:C C A 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139757699_139757834:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139757699_139757834:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000467638:exon_139757699_139757834:PARP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 23 7 30 10.9249057581845 3.67502868229169 7.24987707589277 T:C T C 10 0.525004097470241 0.00951172139095886 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 142495156 T/G 0 0 9 9 0 4.72503687723217 -4.72503687723217 G T G 10 0.525004097470241 0.00123086031483276 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 92 0 92 43.6996230327378 0 43.6996230327378 T T 10 0.525004097470241 2.73812873725814e-26 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 245 381 626 116.373996119791 200.026561136162 -83.6525650163709 T:C C T 10 0.525004097470241 2.36715415149523e-11 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 149133916 C/T 1 16 15 31 7.59993444047614 7.87506146205362 -0.275127021577472 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149133666_149133917:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149133666_149133917:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149133666_149133917:ZNF777 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 12 11 23 5.69995083035711 5.77504507217265 -0.0750942418155436 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 12 12 24 5.69995083035711 6.30004916964289 -0.600098339285784 T:C C T 10 0.525004097470241 0.840421955114944 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 12 10 22 5.69995083035711 5.25004097470241 0.449909855654698 A:T T A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150768849 C/T 1 4 10 14 1.89998361011904 5.25004097470241 -3.35005736458337 T:C C T 10 0.525004097470241 0.106123236614285 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482697:exon_150768816_150768924:SLC4A2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 109 94 203 51.7745533757437 49.3503851622027 2.42416821354107 A:T A T 10 0.525004097470241 0.778738828923993 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150839306 C/T 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000133612:ENST00000463381:exon_150839250_150839340:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150839250_150839340:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000428334:exon_150839250_150839340:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397232:exon_150839250_150839340:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150839250_150839340:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000461065:exon_150839250_150839340:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000473633:exon_150839250_150839340:AGAP3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 37 35 72 17.5748483936011 18.3751434114584 -0.800295017857351 A:G G A 10 0.525004097470241 0.906254918748831 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 15 15 30 7.12493853794638 7.87506146205362 -0.750122924107231 C:G C G 10 0.525004097470241 0.85582389061096 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 59 50 109 28.0247582492558 26.2502048735121 1.77455337574373 C:G C G 10 0.525004097470241 0.773976594202574 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 53 53 106 25.1747828340772 27.8252171659228 -2.65043433184555 T:C T C 10 0.525004097470241 0.627686935592816 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 17 17 34 8.0749303430059 8.9250696569941 -0.850139313988194 C:G G C 10 0.525004097470241 0.86411538909421 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 21 26 47 9.97491395312494 13.6501065342263 -3.67519258110133 A:G G A 10 0.525004097470241 0.308548266321126 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 T:C:G T C 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 21 42 63 9.97491395312494 22.0501720937501 -12.0752581406252 A:C:G G A 10 0.525004097470241 0.00237370769202930 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 27 33 60 12.8248893683035 17.325135216518 -4.50024584821446 A:G A G 10 0.525004097470241 0.248171777232123 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 8 12 20 3.79996722023807 6.30004916964289 -2.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.273669762374101 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 8 12 20 3.79996722023807 6.30004916964289 -2.50008194940482 C:G G C 10 0.525004097470241 0.273669762374101 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 10 6 16 4.74995902529759 3.15002458482145 1.59993444047614 A:G A G 10 0.525004097470241 0.463601014689429 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 13 17 30 6.17494673288687 8.9250696569941 -2.75012292410723 C:G C G 10 0.525004097470241 0.362674876612972 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 33 32 65 15.674864783482 16.8001311190477 -1.12526633556567 A:G A G 10 0.525004097470241 0.804791386675283 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 623696 G/A 1 65 74 139 30.8747336644343 38.8503032127978 -7.9755695483635 A:G G A 10 0.525004097470241 0.202537685343545 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6272399 G/T 1 2 8 10 0.949991805059518 4.20003277976193 -3.25004097470241 T:G G T 10 0.525004097470241 0.0551714633384594 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6272286_6272404:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6302154 G/T 1 12 7 19 5.69995083035711 3.67502868229169 2.02492214806542 T:C:G G T 10 0.525004097470241 0.370733908601317 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6302183 G/C 1 11 14 25 5.22495492782735 7.35005736458337 -2.12510243675603 C:G G C 10 0.525004097470241 0.42834615206919 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6338306 C/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6338235_6338397:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6338235_6338397:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C C T 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 5 9 14 2.3749795126488 4.72503687723217 -2.35005736458337 A:C C A 10 0.525004097470241 0.28547061214872 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 6588258 G/T 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 T:G G T 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6588232_6588347:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6588232_6588347:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523586:exon_6588232_6588264:AGPAT5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 9609331 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9609119_9609356:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000518281:exon_9609119_9609356:TNKS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 12232222 A/G 1 8 1 9 3.79996722023807 0.525004097470241 3.27496312276783 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0411787126107114 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 12 5 17 5.69995083035711 2.6250204873512 3.0749303430059 T:C T C 10 0.525004097470241 0.151946029965317 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 23 21 44 10.9249057581845 11.0250860468751 -0.100180288690606 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 50 55 105 23.7497951264879 28.8752253608633 -5.1254302343753 T:C T C 10 0.525004097470241 0.329702662587163 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 37 35 72 17.5748483936011 18.3751434114584 -0.800295017857351 T:C C T 10 0.525004097470241 0.906254918748831 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 41 45 86 19.4748320037201 23.6251843861608 -4.15035238244073 A:G A G 10 0.525004097470241 0.389052781320348 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 13 20 33 6.17494673288687 10.5000819494048 -4.32513521651795 T:C T C 10 0.525004097470241 0.162915745529303 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 21997738 A/T 1 21 20 41 9.97491395312494 10.5000819494048 -0.525167996279881 A:T A T 10 0.525004097470241 0.877184167059315 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519875:exon_21997685_21997761:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000521744:exon_21997719_21997761:REEP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22428708 A/G 1 2 9 11 0.949991805059518 4.72503687723217 -3.77504507217265 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0314607471472406 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22463623 C/T 1 13 8 21 6.17494673288687 4.20003277976193 1.97491395312494 T:C C T 10 0.525004097470241 0.513304745439729 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523801:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521301:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521837:exon_22463598_22463689:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000523349:exon_22463598_22463689:KIAA1967 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 12 16 28 5.69995083035711 8.40006555952386 -2.70011472916675 A:G G A 10 0.525004097470241 0.347018973521548 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 41 29 70 19.4748320037201 15.225118826637 4.24971317708313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.339416689751366 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22864475 G/A 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 A:G G A 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22864241_22865259:RHOBTB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22874892 A/G 1 10 16 26 4.74995902529759 8.40006555952386 -3.65010653422627 A:G A G 10 0.525004097470241 0.171904784111560 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22874765_22875954:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22874765_22877705:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22874765_22877712:RHOBTB2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 33 20 53 15.674864783482 10.5000819494048 5.17478283407723 C:G G C 10 0.525004097470241 0.170244798038353 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 26240637 C/G 1 19 17 36 9.02492214806542 8.9250696569941 0.0998524910713243 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 18 20 38 8.54992624553566 10.5000819494048 -1.95015570386916 A:G A G 10 0.525004097470241 0.626675337426101 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 15 6 21 7.12493853794638 3.15002458482145 3.97491395312494 A:G A G 10 0.525004097470241 0.124173724060978 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 15 4 19 7.12493853794638 2.10001638988096 5.02492214806542 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0220116996462910 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 13 6 19 6.17494673288687 3.15002458482145 3.02492214806542 A:G G A 10 0.525004097470241 0.177129332411914 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 13 7 20 6.17494673288687 3.67502868229169 2.49991805059518 A:G A G 10 0.525004097470241 0.3710246623915 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 34 27 61 16.1498606860118 14.1751106316965 1.9747500543153 T:C C T 10 0.525004097470241 0.700899388091255 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 61 49 110 28.9747500543153 25.7252007760418 3.24954927827349 C:G C G 10 0.525004097470241 0.567505763056137 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 71 93 164 33.7247090796129 48.8253810647324 -15.1006719851195 A:C A C 10 0.525004097470241 0.0189825952925487 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27401964 A/C 1 12 14 26 5.69995083035711 7.35005736458337 -1.65010653422627 A:C A C 10 0.525004097470241 0.559872705946098 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27634064 C/T 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 9 13 22 4.27496312276783 6.82505326711313 -2.5500901443453 T:C T C 10 0.525004097470241 0.29381892710228 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 27685706 G/A 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27685622_27685715:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27685622_27685715:PBK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 28304769 C/T 1 4 11 15 1.89998361011904 5.77504507217265 -3.87506146205362 T:C C T 10 0.525004097470241 0.067305095126841 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:G G T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 21 17 38 9.97491395312494 8.9250696569941 1.04984429613084 T:C C T 10 0.525004097470241 0.748645125802599 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 13 9 22 6.17494673288687 4.72503687723217 1.4499098556547 A:G A G 10 0.525004097470241 0.670606743027349 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 19 13 32 9.02492214806542 6.82505326711313 2.19986888095229 T:C T C 10 0.525004097470241 0.482359714707828 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 24 14 38 11.3999016607142 7.35005736458337 4.04984429613084 A:G A G 10 0.525004097470241 0.198158084984322 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 37728017 A/G 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 A:G A G 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 37728019 T/G 1 8 4 12 3.79996722023807 2.10001638988096 1.69995083035711 T:G T G 10 0.525004097470241 0.394915481182600 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 37985903 C/T 1 31 14 45 14.7248729784225 7.35005736458337 7.37481561383915 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0355661418256007 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 10 0 10 4.74995902529759 0 4.74995902529759 T T 10 0.525004097470241 0.00217549517025948 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 41525914 C/T 1 8 9 17 3.79996722023807 4.72503687723217 -0.925069656994097 T:C C T 10 0.525004097470241 0.809116626624642 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41525859_41526082:ANK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 53568773 C/T 1 32 36 68 15.1998688809523 18.9001475089287 -3.70027862797639 T:C C T 10 0.525004097470241 0.396616064777518 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 57129896 A/G 1 340 445 785 161.498606860118 233.626823374257 -72.1282165141392 A:G A G 10 0.525004097470241 2.99048361958862e-07 ENSG00000170791:ENST00000521831:exon_57129890_57130097:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000355315:exon_57129890_57131172:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000303759:exon_57129890_57131174:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000396727:exon_57129890_57131174:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523532:exon_57129890_57129971:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523667:exon_57129890_57129988:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000521982:exon_57129890_57130000:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000522166:exon_57129890_57130024:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000518488:exon_57129890_57130028:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000518801:exon_57129890_57131178:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523975:exon_57129890_57131357:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000396723:exon_57129890_57131083:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000523061:exon_57129890_57130272:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000521524:exon_57129890_57130248:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000396728:exon_57129890_57131174:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000519367:exon_57129890_57130028:CHCHD7;ENSG00000170791:ENST00000518944:exon_57129890_57130149:CHCHD7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 59512334 G/A 1 4 9 13 1.89998361011904 4.72503687723217 -2.82505326711313 A:G G A 10 0.525004097470241 0.164385685942995 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59512309_59512429:NSMAF HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 63951312 A/G 1 6 2 8 2.84997541517855 1.05000819494048 1.79996722023807 A:G A G 10 0.525004097470241 0.293975731308556 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 5 8 13 2.3749795126488 4.20003277976193 -1.82505326711313 T:C T C 10 0.525004097470241 0.407692213676216 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 29 37 66 13.774881173363 19.4251516063989 -5.65027043303591 A:G G A 10 0.525004097470241 0.176253064550906 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 47 41 88 22.3248074188987 21.5251679962799 0.799639422618789 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.915177025411595 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 7 8 15 3.32497131770831 4.20003277976193 -0.875061462053615 T:C T C 10 0.525004097470241 0.797381480539751 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 86392989 A/G 1 17 11 28 8.0749303430059 5.77504507217265 2.29988527083325 A:G A G 10 0.525004097470241 0.451315745002794 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86392899_86393693:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86392899_86393115:CA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 87567193 C/T 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 T:C C T 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517354:exon_87567079_87567207:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87567079_87567212:CPNE3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 23 18 41 10.9249057581845 9.45007375446434 1.47483200372012 A:C A C 10 0.525004097470241 0.754955179775073 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 9 5 14 4.27496312276783 2.6250204873512 1.64994263541663 A:G A G 10 0.525004097470241 0.432152883362831 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 95541302 A/G 1 11 3 14 5.22495492782735 1.57501229241072 3.64994263541663 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0616618009545916 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95541298_95541570:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95541298_95541570:KIAA1429 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 12 10 22 5.69995083035711 5.25004097470241 0.449909855654698 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 99101976 A/C 1 17 31 48 8.0749303430059 16.2751270215775 -8.20019667857157 A:C A C 10 0.525004097470241 0.0203304715211214 ENSG00000177459:ENST00000318528:exon_99101304_99102257:C8orf47 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 99115082 C/T 1 57 53 110 27.0747664441963 27.8252171659228 -0.750450721726512 T:C C T 10 0.525004097470241 0.924071163376078 ENSG00000132541:ENST00000254878:exon_99114572_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000522791:exon_99114625_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000520507:exon_99114667_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000521560:exon_99114692_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000519608:exon_99114847_99115132:HRSP12;ENSG00000132541:ENST00000520989:exon_99114975_99115132:HRSP12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 13 18 31 6.17494673288687 9.45007375446434 -3.27512702157747 A:C A C 10 0.525004097470241 0.281773518402083 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 3512 3066 6578 1668.18560968451 1609.66256284376 58.5230468407547 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.148654410120311 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 103276753 T/G 1 32 52 84 15.1998688809523 27.3002130684525 -12.1003441875002 T:G T G 10 0.525004097470241 0.00864836644675373 ENSG00000104517:ENST00000522784:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000518205:exon_103276702_103276786:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103276702_103276786:UBR5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 107754473 G/A 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 A:G G A 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000435082:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000449762:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000297447:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521592:exon_107754450_107754545:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000521864:exon_107754450_107754712:OXR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 109215368 T/C 1 4 8 12 1.89998361011904 4.20003277976193 -2.30004916964289 T:C T C 10 0.525004097470241 0.249481398660317 ENSG00000104408:ENST00000523674:exon_109215212_109215575:EIF3E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 120575184 G/A 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000523861:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522826:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000075322:exon_120575097_120575253:ENPP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 120744399 C/T 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 121528385 T/C 1 12 10 22 5.69995083035711 5.25004097470241 0.449909855654698 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121528165_121528431:MTBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 121530190 A/G 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G A G 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000172167:ENST00000305949:exon_121530091_121530340:MTBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 123964080 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 9 12 21 4.27496312276783 6.30004916964289 -2.02508604687506 C:G G C 10 0.525004097470241 0.39191640161615 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 229 126 355 108.774061679315 66.1505162812504 42.6235453980645 T:C T C 10 0.525004097470241 5.71500055980994e-06 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124031541 T/C 1 66 59 125 31.3497295669641 30.9752417507442 0.374487816219872 A:T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124141368 A/G 1 4 10 14 1.89998361011904 5.25004097470241 -3.35005736458337 A:G A G 10 0.525004097470241 0.106123236614285 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000378080:exon_124141310_124141442:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124141306_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124141310_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124141310_124141458:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518577:exon_124141306_124141412:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124141306_124141458:WDR67 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G A G 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 15 11 26 7.12493853794638 5.77504507217265 1.34989346577373 A:G A G 10 0.525004097470241 0.696014850562397 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 20 11 31 9.49991805059518 5.77504507217265 3.72487297842253 A:T T A 10 0.525004097470241 0.209839722363348 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 22 13 35 10.4499098556547 6.82505326711313 3.62485658854156 T:C C T 10 0.525004097470241 0.239759358776754 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 10 7 17 4.74995902529759 3.67502868229169 1.0749303430059 T:C C T 10 0.525004097470241 0.636415459812334 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 125499216 G/A 1 24 25 49 11.3999016607142 13.125102436756 -1.72520077604181 A:G G A 10 0.525004097470241 0.669081750313326 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 128098838 G/A 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 G G 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 20 20 40 9.49991805059518 10.5000819494048 -1.00016389880964 T:C C T 10 0.525004097470241 0.754653566683135 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 135521970 G/A 1 54 48 102 25.649778736607 25.2001966785716 0.449582058035418 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135521952_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135521862_135521992:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522723:exon_135521944_135521992:ZFAT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 135602581 A/G 1 12 3 15 5.69995083035711 1.57501229241072 4.12493853794638 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0385064590919159 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 A:G A G 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 6 9 15 2.84997541517855 4.72503687723217 -1.87506146205362 A:G G A 10 0.525004097470241 0.439879280556418 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 42 37 79 19.9498279062499 19.4251516063989 0.52467629985096 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 11 10 21 5.22495492782735 5.25004097470241 -0.0250860468750611 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 7 1 8 3.32497131770831 0.525004097470241 2.79996722023807 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0730511813390402 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 29 25 54 13.774881173363 13.125102436756 0.649778736606985 A:G G A 10 0.525004097470241 0.892341079755901 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144643938 G/A 1 28 28 56 13.2998852708333 14.7001147291667 -1.4002294583335 A:G G A 10 0.525004097470241 0.789340670288447 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144643912_144643958:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643912_144644048:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144643912_144643998:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144643900_144643998:GSDMD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 36 36 72 17.0998524910713 18.9001475089287 -1.80029501785735 A:G G A 10 0.525004097470241 0.723838674047367 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 73 17 90 34.6747008846724 8.9250696569941 25.7496312276783 A:G G A 10 0.525004097470241 2.99064436781741e-08 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 9 42 51 4.27496312276783 22.0501720937501 -17.7752089709823 A:G G A 10 0.525004097470241 3.59255858920162e-07 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 1 3 5 8 1.42498770758928 2.6250204873512 -1.20003277976193 A:G G A 10 0.525004097470241 0.489916777330051 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A,G 0 0 9 9 0 4.72503687723217 -4.72503687723217 A:G C A 10 0.525004097470241 0.00123086031483276 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144671956 G/A 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144681714 G/A 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 A:G G A 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 T:G G T 10 0.525004097470241 0.125338991076950 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144697041 A/G 1 39 44 83 18.5248401986606 23.1001802886906 -4.57534009003 A:G A G 10 0.525004097470241 0.324554383732803 ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144776633 G/A 1 7 10 17 3.32497131770831 5.25004097470241 -1.9250696569941 A:G G A 10 0.525004097470241 0.467631598516222 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 T:C C T 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144995736 G/A 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 144999876 C/T 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 C C 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145058986 A/G 1 9 15 24 4.27496312276783 7.87506146205362 -3.60009833928578 A:G A G 10 0.525004097470241 0.156343128579509 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:G G A 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145535785 T/G 1 26 22 48 12.3498934657737 11.5500901443453 0.799803321428431 T:G T G 10 0.525004097470241 0.885527054056377 ENSG00000185122:ENST00000328245:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000528838:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000400779:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000415363:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000400780:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000532338:exon_145535649_145535930:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000527328:exon_145535649_145535930:HSF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145541766 G/T 1 9 14 23 4.27496312276783 7.35005736458337 -3.07509424181554 T:G G T 10 0.525004097470241 0.216196426553944 ENSG00000185000:ENST00000332324:exon_145541758_145541832:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524965:exon_145541758_145541832:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524844:exon_145541758_145541832:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000531896:exon_145541758_145542025:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000525371:exon_145541757_145541832:DGAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145542021 G/A 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 A:G G A 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000185000:ENST00000332324:exon_145541924_145542025:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524965:exon_145541924_145542025:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000526479:exon_145541924_145542025:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000531896:exon_145541758_145542025:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000525371:exon_145541924_145542229:DGAT1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 11 4 15 5.22495492782735 2.10001638988096 3.12493853794638 A:G G A 10 0.525004097470241 0.125338991076950 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145736254 C/T 1 22 15 37 10.4499098556547 7.87506146205362 2.57484839360108 T:C C T 10 0.525004097470241 0.415815313336837 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145736177_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 11 12 23 5.22495492782735 6.30004916964289 -1.07509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.681377126912361 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 8 146068594 T/C 1 30 40 70 14.2498770758928 21.0001638988096 -6.75028682291687 T:C T C 10 0.525004097470241 0.119775777318410 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 2 7 9 0.949991805059518 3.67502868229169 -2.72503687723217 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0953110686449535 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 78 51 129 37.0496803973212 26.7752089709823 10.2744714263389 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0777074883781427 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 57 50 107 27.0747664441963 26.2502048735121 0.82456157068421 A:C C A 10 0.525004097470241 0.923006377950147 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 63 54 117 29.9247418593748 28.350221263393 1.5745205959818 C:G C G 10 0.525004097470241 0.782118944142065 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 2838470 C/T 1 25 43 68 11.874897563244 22.5751761912204 -10.7002786279764 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0104919254237929 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 5335470 C/T 1 5 19 24 2.3749795126488 9.97507785193458 -7.60009833928578 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00188582279160452 ENSG00000107018:ENST00000223862:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000487557:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000223858:exon_5334969_5335597:RLN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 5762600 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5762541_5762660:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5762541_5762660:KIAA1432 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 10 16 26 4.74995902529759 8.40006555952386 -3.65010653422627 A:G A G 10 0.525004097470241 0.171904784111560 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 46 69 115 21.8498115163689 36.2252827254466 -14.3754712090777 C:G C G 10 0.525004097470241 0.00867873407724209 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 7103816 C/T 1 3 6 9 1.42498770758928 3.15002458482145 -1.72503687723217 T:C C T 10 0.525004097470241 0.324211612884598 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7103685_7103870:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000495890:exon_7103685_7104017:KDM4C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 16 10 26 7.59993444047614 5.25004097470241 2.34989346577373 A:G G A 10 0.525004097470241 0.433839753051869 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 7798518 G/C 1 522 385 907 247.947861120534 202.126577526043 45.8212835944914 C:G G C 10 0.525004097470241 0.00246534000022509 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7796490_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000484082:exon_7798199_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000469050:exon_7798344_7798637:C9orf123 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 15459821 A/C 1 2 17 19 0.949991805059518 8.9250696569941 -7.97507785193458 A:C A C 10 0.525004097470241 0.000253848899975249 ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15459717_15464132:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15459717_15460311:SNAPC3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 5 4 9 2.3749795126488 2.10001638988096 0.274963122767831 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 C:G G C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 19380238 C/T 1 10 13 23 4.74995902529759 6.82505326711313 -2.07509424181554 T:C C T 10 0.525004097470241 0.41085183626134 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19380188_19380252:RPS6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 20413813 G/A 1 21 14 35 9.97491395312494 7.35005736458337 2.62485658854156 A:G G A 10 0.525004097470241 0.401942910298358 ENSG00000171843:ENST00000380338:exon_20413719_20414423:MLLT3;ENSG00000171843:ENST00000475957:exon_20413719_20414423:MLLT3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G A G 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 21029330 T/C 1 7 5 12 3.32497131770831 2.6250204873512 0.699950830357108 T:C T C 10 0.525004097470241 0.777777868734111 ENSG00000188921:ENST00000495827:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000513293:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000521505:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000531631:exon_21029294_21029397:PTPLAD2;ENSG00000188921:ENST00000380233:exon_21029294_21029397:PTPLAD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32430553 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32430416_32430572:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32430416_32430572:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32430416_32430572:ACO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32448959 T/G 1 21 24 45 9.97491395312494 12.6000983392858 -2.62518438616085 T:G T G 10 0.525004097470241 0.458369751247753 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32448894_32449079:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32448894_32449079:ACO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32450043 T/C 1 23 26 49 10.9249057581845 13.6501065342263 -2.72520077604181 T:C T C 10 0.525004097470241 0.476031187030533 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 12 24 36 5.69995083035711 12.6000983392858 -6.90014750892868 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0287271841567151 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 18 11 29 8.54992624553566 5.77504507217265 2.77488117336301 T:G T G 10 0.525004097470241 0.354749309262073 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32542088 G/C 1 28 44 72 13.2998852708333 23.1001802886906 -9.80029501785735 C:G G C 10 0.525004097470241 0.0244684001101746 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 34 36 70 16.1498606860118 18.9001475089287 -2.75028682291687 A:G A G 10 0.525004097470241 0.550494515130616 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 33369943 G/A 1 33 33 66 15.674864783482 17.325135216518 -1.65027043303591 A:G G A 10 0.525004097470241 0.71276021885517 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33369904_33371155:NFX1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 33944465 C/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:C C A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33944363_33944637:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33944363_33944637:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33944363_33944637:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33944363_33944637:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33944363_33944637:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33944363_33944637:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33944363_33944637:UBAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 7 7 14 3.32497131770831 3.67502868229169 -0.350057364583375 A:G A G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 34635749 G/A 1 13 5 18 6.17494673288687 2.6250204873512 3.54992624553566 A:G G A 10 0.525004097470241 0.103690377865023 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000476705:exon_34635392_34635805:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34635480_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34635494_34635855:SIGMAR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35076755 G/A 1 19 12 31 9.02492214806542 6.30004916964289 2.72487297842253 A:G G A 10 0.525004097470241 0.371508072375509 ENSG00000221829:ENST00000425676:exon_35076721_35076867:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000378643:exon_35076721_35076867:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000474894:exon_35076721_35076849:FANCG HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 6 14 20 2.84997541517855 7.35005736458337 -4.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0705637200303957 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35660901 C/T 1 82 75 157 38.9496640074402 39.3753073102681 -0.425643302827844 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35660091_35660964:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35661057 C/G 1 137 94 231 65.074438646577 49.3503851622027 15.7240534843743 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0410224744076154 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35661088 G/A 1 139 80 219 66.0244304516365 42.0003277976193 24.0241026540172 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00113593859407130 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 6 5 11 2.84997541517855 2.6250204873512 0.224954927827349 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35705759 G/A 1 74 65 139 35.1496967872022 34.1252663355657 1.0244304516365 A:T:G G A 10 0.525004097470241 0.932361092732679 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35705747_35705848:TLN1;ENSG00000137076:ENST00000486788:exon_35705747_35705848:TLN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35714269 G/A 1 15 9 24 7.12493853794638 4.72503687723217 2.39990166071422 A:G G A 10 0.525004097470241 0.414804146453808 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35714236_35714370:TLN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35740559 C/T 1 8 3 11 3.79996722023807 1.57501229241072 2.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.232993801633964 ENSG00000070610:ENST00000378103:exon_35740523_35740625:GBA2;ENSG00000070610:ENST00000378094:exon_35740523_35740625:GBA2;ENSG00000070610:ENST00000467252:exon_35740523_35740625:GBA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35846469 C/T 1 15 11 26 7.12493853794638 5.77504507217265 1.34989346577373 T:C C T 10 0.525004097470241 0.696014850562397 ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35846466_35846608:TMEM8B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 35971564 C/T 0 43 0 43 20.4248238087796 0 20.4248238087796 C C 10 0.525004097470241 1.53446375467991e-12 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 36840623 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_36833272_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520281:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000414447:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000524340:exon_36840555_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522932:exon_36840555_36840633:PAX5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 295 376 671 140.123791246279 197.401540648811 -57.2777494025317 A:C:G A G 10 0.525004097470241 1.01050623220671e-05 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37441650 T/C 1 5 3 8 2.3749795126488 1.57501229241072 0.799967220238072 T:C T C 10 0.525004097470241 0.729287527860715 ENSG00000168795:ENST00000307750:exon_37438111_37442552:ZBTB5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37489378 C/T 1 12 16 28 5.69995083035711 8.40006555952386 -2.70011472916675 T:C C T 10 0.525004097470241 0.347018973521548 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37489312_37489397:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37489312_37489397:POLR1E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 31 17 48 14.7248729784225 8.9250696569941 5.79980332142843 T:G G T 10 0.525004097470241 0.11157295319663 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 36 22 58 17.0998524910713 11.5500901443453 5.54976234672602 A:T:C C T 10 0.525004097470241 0.150440026484760 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 64 41 105 30.3997377619046 21.5251679962799 8.87456976562469 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0963252707695901 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 95 88 183 45.1246107403271 46.2003605773812 -1.0757498370541 A:G G A 10 0.525004097470241 0.882574576991403 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37592452 G/A 1 426 407 833 202.348254477677 213.676667670388 -11.3284131927108 A:T:C:G G A 10 0.525004097470241 0.445382006908215 ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 17 16 33 8.0749303430059 8.40006555952386 -0.325135216517953 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 38395940 T/C 1 5 12 17 2.3749795126488 6.30004916964289 -3.9250696569941 T:C T C 10 0.525004097470241 0.086338764497693 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 T:G G T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 38396502 G/A 1 26 16 42 12.3498934657737 8.40006555952386 3.94982790624988 A:G G A 10 0.525004097470241 0.279439130429551 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 71851080 C/T 1 17 15 32 8.0749303430059 7.87506146205362 0.199868880952287 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71850944_71851154:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71850944_71851154:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71850944_71851154:TJP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 71851913 G/A 1 21 18 39 9.97491395312494 9.45007375446434 0.5248401986606 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71851865_71852052:TJP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 72897434 G/A 1 14 14 28 6.64994263541663 7.35005736458337 -0.700114729166749 A:G G A 10 0.525004097470241 0.851142914584854 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 11 13 24 5.22495492782735 6.82505326711313 -1.60009833928578 T:C T C 10 0.525004097470241 0.545429500501973 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 72933774 A/G 1 17 13 30 8.0749303430059 6.82505326711313 1.24987707589277 A:G A G 10 0.525004097470241 0.716684788710682 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72933710_72933879:SMC5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 74586457 T/C 1 9 9 18 4.27496312276783 4.72503687723217 -0.450073754464338 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000155621:ENST00000479413:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000334731:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377031:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000473252:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377027:exon_74586421_74586534:C9orf85 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 A:C A C 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 10 11 21 4.74995902529759 5.77504507217265 -1.02508604687506 A:G A G 10 0.525004097470241 0.669130983480659 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 43 57 100 20.4248238087796 29.9252335558037 -9.5004097470241 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0709684637151342 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 88959938 C/T 1 4 6 10 1.89998361011904 3.15002458482145 -1.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.533119208307706 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000427388:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000432440:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000449875:exon_88959892_88960069:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375947:exon_88959785_88960069:ZCCHC6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 90265015 C/T 1 10 9 19 4.74995902529759 4.72503687723217 0.0249221480654214 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90264836_90265426:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000475804:exon_90264836_90265033:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000495281:exon_90264836_90265394:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90264905_90265033:DAPK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 93606309 G/A 1 10 8 18 4.74995902529759 4.20003277976193 0.549926245535662 A:G G A 10 0.525004097470241 0.818662359571293 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93606140_93606597:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93606140_93606597:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93606140_93606597:SYK;ENSG00000165025:ENST00000476708:exon_93606140_93606528:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93606140_93606597:SYK HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 95068046 C/T 1 54 51 105 25.649778736607 26.7752089709823 -1.1254302343753 T:C C T 10 0.525004097470241 0.845532309208475 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95068035_95068112:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000477862:exon_95068035_95068112:NOL8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 95077513 A/G 1 12 6 18 5.69995083035711 3.15002458482145 2.54992624553566 A:G A G 10 0.525004097470241 0.248457334165905 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 9 11 20 4.27496312276783 5.77504507217265 -1.50008194940482 T:C C T 10 0.525004097470241 0.512362550711290 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 21 14 35 9.97491395312494 7.35005736458337 2.62485658854156 A:G A G 10 0.525004097470241 0.401942910298358 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 95870005 C/A 1 20 9 29 9.49991805059518 4.72503687723217 4.77488117336301 A:C C A 10 0.525004097470241 0.0937233023349748 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000495641:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466929:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000498243:exon_95869956_95870098:C9orf89 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 98740466 T/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:T T A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98740343_98740497:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98740343_98740497:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98740343_98740497:C9orf102 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 98766902 C/A 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 A:C C A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 99250463 C/T 1 18 56 74 8.54992624553566 29.4002294583335 -20.8503032127978 T:C C T 10 0.525004097470241 1.01726170740094e-06 ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 20 11 31 9.49991805059518 5.77504507217265 3.72487297842253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.209839722363348 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 16 8 24 7.59993444047614 4.20003277976193 3.39990166071422 T:G T G 10 0.525004097470241 0.219830529208092 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 13 20 33 6.17494673288687 10.5000819494048 -4.32513521651795 A:G G A 10 0.525004097470241 0.162915745529303 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 3 8 11 1.42498770758928 4.20003277976193 -2.77504507217265 A:T A T 10 0.525004097470241 0.130933915960759 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 C:G C G 10 0.525004097470241 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 68 55 123 32.2997213720236 28.8752253608633 3.42449601116036 C:G C G 10 0.525004097470241 0.588276727458517 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 3 7 10 1.42498770758928 3.67502868229169 -2.25004097470241 T:C C T 10 0.525004097470241 0.208503308664772 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 2 8 10 0.949991805059518 4.20003277976193 -3.25004097470241 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0551714633384594 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 1149 1184 2333 545.770292006693 621.604851404765 -75.8345593980722 A:G A G 10 0.525004097470241 0.00174217060064246 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 6 6 12 2.84997541517855 3.15002458482145 -0.300049169642892 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 13 20 33 6.17494673288687 10.5000819494048 -4.32513521651795 A:C C A 10 0.525004097470241 0.162915745529303 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 51 54 105 24.2247910290177 28.350221263393 -4.1254302343753 T:C T C 10 0.525004097470241 0.435632621499091 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 62 57 119 29.4497459568451 29.9252335558037 -0.475487598958683 T:C C T 10 0.525004097470241 0.927223873289386 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 38 32 70 18.0498442961308 16.8001311190477 1.24971317708313 A:G A G 10 0.525004097470241 0.81144602154692 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 31 38 69 14.7248729784225 19.9501557038692 -5.22528272544663 A:G G A 10 0.525004097470241 0.228733658505936 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 8 7 15 3.79996722023807 3.67502868229169 0.124938537946385 A:C A C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 115968797 C/T 1 6 4 10 2.84997541517855 2.10001638988096 0.74995902529759 T:C C T 10 0.525004097470241 0.756968077815852 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000493847:exon_115968291_115968858:FKBP15 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 14 3 17 6.64994263541663 1.57501229241072 5.0749303430059 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0145626325999383 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 117139280 T/C 1 9 3 12 4.27496312276783 1.57501229241072 2.69995083035711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.152032961859646 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117138746_117139340:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117138746_117139915:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394574:exon_117138387_117139812:AKNA HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C:G C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:T T A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 21 31 52 9.97491395312494 16.2751270215775 -6.30021306845253 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0952257026393271 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 73 85 158 34.6747008846724 44.6253482849705 -9.95064740029808 T:C C T 10 0.525004097470241 0.129909949608361 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 5 5 10 2.3749795126488 2.6250204873512 -0.25004097470241 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 11 6 17 5.22495492782735 3.15002458482145 2.0749303430059 A:G A G 10 0.525004097470241 0.342630903103395 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 27 36 63 12.8248893683035 18.9001475089287 -6.07525814062518 A:G G A 10 0.525004097470241 0.131579652228349 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130536717 G/A 1 14 12 26 6.64994263541663 6.30004916964289 0.349893465773733 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130536631_130536746:SH2D3C HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130670652 A/G 1 86 124 210 40.8496476175593 65.1005080863099 -24.2508604687506 A:G A G 10 0.525004097470241 0.000878927674185637 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130884753 C/T 1 43 51 94 20.4248238087796 26.7752089709823 -6.35038516220266 T:C C T 10 0.525004097470241 0.215216274194552 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130884641_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130884641_130884925:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130884725_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130884727_130884758:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130884745_130884758:PTGES2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130925911 A/C 1 277 260 537 131.573865000743 136.501065342263 -4.92720034151944 A:C A C 10 0.525004097470241 0.697415990193473 ENSG00000171159:ENST00000372994:exon_130925722_130926207:C9orf16;ENSG00000171159:ENST00000492588:exon_130925722_130926169:C9orf16;ENSG00000171159:ENST00000486420:exon_130925722_130926016:C9orf16 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130941451 C/T 1 19 20 39 9.02492214806542 10.5000819494048 -1.4751598013394 T:C C T 10 0.525004097470241 0.74894974708352 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130941352_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130941268_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130941352_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130941268_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130941330_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130941396_130941694:CIZ1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 130948018 G/A 1 11 9 20 5.22495492782735 4.72503687723217 0.49991805059518 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000474442:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000420484:exon_130947908_130948055:CIZ1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131023505 T/C 1 9 6 15 4.27496312276783 3.15002458482145 1.12493853794638 T:C T C 10 0.525004097470241 0.614062975057572 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000470630:exon_131023400_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131023471_131023538:GOLGA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131346710 C/A 1 5 7 12 2.3749795126488 3.67502868229169 -1.30004916964289 A:C C A 10 0.525004097470241 0.567248179936242 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131346561_131346804:SPTAN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 10 4 14 4.74995902529759 2.10001638988096 2.64994263541663 T:C C T 10 0.525004097470241 0.187185823684523 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131379967 C/T 1 18 38 56 8.54992624553566 19.9501557038692 -11.4002294583335 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00291372952285964 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131379919_131380039:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131379919_131380039:SPTAN1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131398636 C/T 1 25 37 62 11.874897563244 19.4251516063989 -7.55025404315494 T:C C T 10 0.525004097470241 0.0572508091423283 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 27 26 53 12.8248893683035 13.6501065342263 -0.825217165922773 A:G A G 10 0.525004097470241 0.89087110828166 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 15 14 29 7.12493853794638 7.35005736458337 -0.22511882663699 A:G G A 10 0.525004097470241 1 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 11 15 26 5.22495492782735 7.87506146205362 -2.65010653422627 C:G G C 10 0.525004097470241 0.330387936784344 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 47 44 91 22.3248074188987 23.1001802886906 -0.775372869791934 A:C A C 10 0.525004097470241 0.916556001813217 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 132569553 C/T 1 2 6 8 0.949991805059518 3.15002458482145 -2.20003277976193 T:C C T 10 0.525004097470241 0.161689721920031 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132569467_132569642:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000488169:exon_132569467_132569642:TOR1B HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 133346226 C/T 1 12 6 18 5.69995083035711 3.15002458482145 2.54992624553566 T:C C T 10 0.525004097470241 0.248457334165905 ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000422569:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000443588:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133346221_133346291:ASS1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 134073642 C/A 1 23 16 39 10.9249057581845 8.40006555952386 2.5248401986606 A:C C A 10 0.525004097470241 0.428902041109362 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000529286:exon_134073306_134073719:NUP214 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 134136515 A/G 1 16 20 36 7.59993444047614 10.5000819494048 -2.90014750892868 A:G A G 10 0.525004097470241 0.404596615121924 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 134136677 A/G 1 5 6 11 2.3749795126488 3.15002458482145 -0.775045072172651 A:G A G 10 0.525004097470241 0.766079949234965 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 135203630 T/C 1 4 4 8 1.89998361011904 2.10001638988096 -0.200032779761928 T:C T C 10 0.525004097470241 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 23 30 53 10.9249057581845 15.7501229241072 -4.82521716592277 C:G G C 10 0.525004097470241 0.215870293552196 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 136337168 G/A 1 21 14 35 9.97491395312494 7.35005736458337 2.62485658854156 A:G G A 10 0.525004097470241 0.401942910298358 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136336217_136337298:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136336217_136337298:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136336217_136337298:SLC2A6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 9 2 11 4.27496312276783 1.05000819494048 3.22495492782735 T:G T G 10 0.525004097470241 0.0690623754843889 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 136633699 G/C 1 10 15 25 4.74995902529759 7.87506146205362 -3.12510243675603 C:G G C 10 0.525004097470241 0.233781441016375 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 137726831 C/T 0 18 0 18 8.54992624553566 0 8.54992624553566 C C 10 0.525004097470241 1.06968307334339e-05 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000371820:exon_137726817_137727050:COL5A1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 138838140 T/C 1 30 32 62 14.2498770758928 16.8001311190477 -2.55025404315494 T:C T C 10 0.525004097470241 0.527676660954539 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138838115_138838217:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138838115_138838217:UBAC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 138852904 C/G 1 6 16 22 2.84997541517855 8.40006555952386 -5.5500901443453 C:G C G 10 0.525004097470241 0.0192284907141501 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138852871_138853226:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138852871_138853058:UBAC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 139270901 G/A 1 51 62 113 24.2247910290177 32.5502540431549 -8.32546301413723 A:G G A 10 0.525004097470241 0.131630087598032 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 139272045 C/A 1 46 54 100 21.8498115163689 28.350221263393 -6.5004097470241 A:C C A 10 0.525004097470241 0.194915266146722 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 0 20 0 20 9.49991805059518 0 9.49991805059518 T T 10 0.525004097470241 2.87259672131860e-06 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 4 5 9 1.89998361011904 2.6250204873512 -0.725036877232169 A:G G A 10 0.525004097470241 0.744174717203038 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 12 8 20 5.69995083035711 4.20003277976193 1.49991805059518 T:C C T 10 0.525004097470241 0.655495081650022 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 139756980 T/C 1 24 27 51 11.3999016607142 14.1751106316965 -2.77520897098229 T:C T C 10 0.525004097470241 0.484374527649928 ENSG00000107223:ENST00000371648:exon_139756942_139757451:EDF1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 7 4 11 3.32497131770831 2.10001638988096 1.22495492782735 T:C C T 10 0.525004097470241 0.55444147599573 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 132 174 306 62.6994591339282 91.3507129598219 -28.6512538258937 A:G G A 10 0.525004097470241 0.00108478331410827 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 929 859 1788 441.271193450146 450.978519726937 -9.70732627679092 A:G G A 10 0.525004097470241 0.652822655341232 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 10 18 28 4.74995902529759 9.45007375446434 -4.70011472916675 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0888132751837173 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 1561194 A/G 1 42 22 64 19.9498279062499 11.5500901443453 8.39973776190457 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0444311767959463 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1561079_1561210:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1561079_1561210:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1561079_1561210:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000474865:exon_1560485_1561210:ASMTL HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 23 16 39 10.9249057581845 8.40006555952386 2.5248401986606 T:C C T 10 0.525004097470241 0.428902041109362 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 14 11 25 6.64994263541663 5.77504507217265 0.874897563243974 C:G C G 10 0.525004097470241 0.842085588637267 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 2656261 A/G 1 243 181 424 115.424004314731 95.0257416421136 20.3982626726178 A:G A G 10 0.525004097470241 0.0516554136715514 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 2656283 A/T 1 306 220 526 145.348746174106 115.500901443453 29.8478447306532 A:T A T 10 0.525004097470241 0.00993979873004735 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 6995417 C/T 1 8 8 16 3.79996722023807 4.20003277976193 -0.400065559523856 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 6995438 C/T 1 9 8 17 4.27496312276783 4.20003277976193 0.074930343005903 T:C C T 10 0.525004097470241 1 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 7023678 G/A 1 9 10 19 4.27496312276783 5.25004097470241 -0.975077851934579 A:G G A 10 0.525004097470241 0.819114291923753 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000498474:exon_7023661_7023879:HDHD1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 13681115 C/T 1 8 6 14 3.79996722023807 3.15002458482145 0.649942635416626 T:C C T 10 0.525004097470241 0.794166920030705 ENSG00000176896:ENST00000314720:exon_13680620_13682247:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000490617:exon_13680620_13682947:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000380600:exon_13680620_13683528:TCEANC;ENSG00000176896:ENST00000467590:exon_13680863_13681679:TCEANC HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 22 8 30 10.4499098556547 4.20003277976193 6.24987707589277 A:G G A 10 0.525004097470241 0.0271302618884822 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 18926099 C/T 0 0 9 9 0 4.72503687723217 -4.72503687723217 T C T 10 0.525004097470241 0.00123086031483276 ENSG00000044446:ENST00000379942:exon_18926018_18926174:PHKA2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 20071046 T/C 0 0 10 10 0 5.25004097470241 -5.25004097470241 C T C 10 0.525004097470241 0.00058465360613205 ENSG00000184368:ENST00000379651:exon_20070996_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000485173:exon_20070996_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000379643:exon_20070992_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000443379:exon_20070992_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000452324:exon_20070996_20071106:MAP7D2;ENSG00000184368:ENST00000330274:exon_20070992_20071106:MAP7D2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 1 158 2 160 75.0493525997019 1.05000819494048 73.9993444047614 A:G G A 10 0.525004097470241 2.52278491705436e-41 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 46472826 G/A 0 36 0 36 17.0998524910713 0 17.0998524910713 G G 10 0.525004097470241 8.66009781880717e-11 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46472724_46472829:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000491894:exon_46472724_46472829:SLC9A7 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 24 121 145 11.3999016607142 63.5254957938992 -52.1255941331849 A:G G A 10 0.525004097470241 4.99091329223689e-19 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 47106715 C/T 1 2 139 141 0.949991805059518 72.9755695483635 -72.025577743304 T:C C T 10 0.525004097470241 3.16334356753143e-42 ENSG00000102226:ENST00000377107:exon_47106703_47106818:USP11;ENSG00000102226:ENST00000218348:exon_47106703_47106818:USP11;ENSG00000102226:ENST00000469080:exon_47106471_47107098:USP11;ENSG00000102226:ENST00000497179:exon_47106471_47106818:USP11;ENSG00000102226:ENST00000467378:exon_47106703_47107098:USP11 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 47483800 G/A 0 0 108 108 0 56.700442526786 -56.700442526786 A G A 10 0.525004097470241 1.20921975508135e-35 ENSG00000126759:ENST00000478222:exon_47483612_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000396992:exon_47483613_47483839:CFP;ENSG00000126759:ENST00000247153:exon_47483625_47483839:CFP HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 48385586 C/T 1 3 311 314 1.42498770758928 163.276274313245 -161.851286605656 A:T:C C T 10 0.525004097470241 2.10521474621904e-95 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48385543_48385673:EBP;ENSG00000147155:ENST00000276096:exon_48385543_48385673:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48385543_48385673:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48385543_48385673:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48385543_48385641:EBP;ENSG00000147155:ENST00000466461:exon_48385543_48386059:EBP HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 0 0 18 18 0 9.45007375446434 -9.45007375446434 G A G 10 0.525004097470241 1.5150171146302e-06 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 1 1 19 20 0.474995902529759 9.97507785193458 -9.50008194940482 A:G G A 10 0.525004097470241 1.04287383722904e-05 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 1 182 183 0.474995902529759 95.5507457395839 -95.0757498370541 A:G A G 10 0.525004097470241 1.38774844225072e-57 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 0 26 0 26 12.3498934657737 0 12.3498934657737 T T 10 0.525004097470241 5.69202792885613e-08 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 48888074 T/C 0 22 0 22 10.4499098556547 0 10.4499098556547 T T 10 0.525004097470241 7.7467803710883e-07 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48887729_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000495940:exon_48888024_48888110:TFE3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 49104709 C/T 0 32 0 32 15.1998688809523 0 15.1998688809523 C C 10 0.525004097470241 1.15479102332191e-09 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49104652_49104771:CCDC22;ENSG00000101997:ENST00000492334:exon_49104652_49104771:CCDC22 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 55479299 G/A 0 0 113 113 0 59.3254630141372 -59.3254630141372 A G A 10 0.525004097470241 2.92384637419898e-37 ENSG00000187601:ENST00000342972:exon_55478538_55479998:MAGEH1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 57475132 T/C 0 17 1 18 8.0749303430059 0.525004097470241 7.54992624553566 T:G T G 10 0.525004097470241 0.000190368129067054 ENSG00000165591:ENST00000374900:exon_57474957_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000491179:exon_57475115_57475151:FAAH2;ENSG00000165591:ENST00000465623:exon_57474957_57475151:FAAH2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 70324157 C/T 1 2 11 13 0.949991805059518 5.77504507217265 -4.82505326711313 T:C C T 10 0.525004097470241 0.00987123193747848 ENSG00000204165:ENST00000374251:exon_70324148_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000485951:exon_70324088_70324254:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000466160:exon_70324148_70324298:CXorf65;ENSG00000204165:ENST00000438526:exon_70324088_70324254:CXorf65 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 71424861 T/C 0 74 0 74 35.1496967872022 0 35.1496967872022 T T 10 0.525004097470241 2.05743021045830e-21 ENSG00000186871:ENST00000373657:exon_71424510_71428548:ERCC6L;ENSG00000186871:ENST00000334463:exon_71424510_71428548:ERCC6L HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 71791912 C/T 0 0 28 28 0 14.7001147291667 -14.7001147291667 T C T 10 0.525004097470241 8.85760219420315e-10 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373568:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000436675:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000415409:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000440442:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000412342:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373571:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000439122:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373560:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373559:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373561:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000478743:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000421523:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373556:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373554:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000340176:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000444609:exon_71791907_71791959:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000486704:exon_71791796_71791959:HDAC8 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 73041771 G/A 1 381 1 382 180.973438863838 0.525004097470241 180.448434766368 A:G G A 10 0.525004097470241 4.72713998478068e-105 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 73042607 C/T 0 97 0 97 46.0746025453866 0 46.0746025453866 C C 10 0.525004097470241 9.69815768005366e-28 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 73043817 T/C 0 85 1 86 40.3746517150295 0.525004097470241 39.8496476175593 A:T T A 10 0.525004097470241 9.00778691188965e-23 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 73046038 C/T 0 44 0 44 20.8998197113094 0 20.8998197113094 C C 10 0.525004097470241 7.8178659020492e-13 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 73046557 G/T 0 61 0 61 28.9747500543153 0 28.9747500543153 G G 10 0.525004097470241 9.80790752884472e-18 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 73062694 A/T 0 17 0 17 8.0749303430059 0 8.0749303430059 A A 10 0.525004097470241 2.06785695297461e-05 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 78426988 T/C 1 10 2 12 4.74995902529759 1.05000819494048 3.69995083035711 T:C T C 10 0.525004097470241 0.0414055133593032 ENSG00000147138:ENST00000276077:exon_78426469_78427726:GPR174 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 100911066 C/T 0 12 0 12 5.69995083035711 0 5.69995083035711 C C 10 0.525004097470241 0.000570392744559241 ENSG00000184867:ENST00000328766:exon_100910267_100912701:ARMCX2;ENSG00000184867:ENST00000330154:exon_100910267_100912701:ARMCX2;ENSG00000184867:ENST00000356824:exon_100910453_100912701:ARMCX2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 1 653 3 656 310.172324351933 1.57501229241072 308.597312059522 A:T:C:G T C 10 0.525004097470241 1.24604728300169e-176 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 120183030 T/G 0 10 0 10 4.74995902529759 0 4.74995902529759 T T 10 0.525004097470241 0.00217549517025948 ENSG00000182890:ENST00000328078:exon_120181462_120183794:GLUD2 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 0 50 0 50 23.7497951264879 0 23.7497951264879 A A 10 0.525004097470241 1.40325492798787e-14 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 132437337 G/A 0 0 11 11 0 5.77504507217265 -5.77504507217265 A G A 10 0.525004097470241 0.000277708067311971 ENSG00000076716:ENST00000370828:exon_132437194_132437369:GPC4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 133963268 C/T 0 10 0 10 4.74995902529759 0 4.74995902529759 C C 10 0.525004097470241 0.00217549517025948 ENSG00000156500:ENST00000370785:exon_133963256_133963312:FAM122C;ENSG00000156500:ENST00000370784:exon_133963256_133963312:FAM122C;ENSG00000156500:ENST00000458639:exon_133963256_133963312:FAM122C;ENSG00000156500:ENST00000445123:exon_133963256_133963312:FAM122C;ENSG00000156500:ENST00000470657:exon_133963256_133963312:FAM122C HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 0 59 0 59 28.0247582492558 0 28.0247582492558 T T 10 0.525004097470241 3.6441614813535e-17 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 0 8 0 8 3.79996722023807 0 3.79996722023807 T T 10 0.525004097470241 0.00836297791075555 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 148582549 G/A 0 31 0 31 14.7248729784225 0 14.7248729784225 G G 10 0.525004097470241 2.20862677675910e-09 ENSG00000010404:ENST00000340855:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000466323:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000370441:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000490775:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000464251:exon_148582480_148582568:IDS;ENSG00000010404:ENST00000370443:exon_148582480_148582568:IDS HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153176254 A/G 1 36 1 37 17.0998524910713 0.525004097470241 16.5748483936011 A:G A G 10 0.525004097470241 2.45864042611261e-09 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000420383:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494397:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000454164:exon_153176154_153176288:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000467421:exon_153176154_153176325:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000442172:exon_153176154_153176288:ARHGAP4 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153195393 G/A 1 377 5 382 179.073455253719 2.6250204873512 176.448434766368 A:G G A 10 0.525004097470241 9.68299220423158e-97 ENSG00000102030:ENST00000464845:exon_153194695_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000482485:exon_153195280_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370015:exon_153195367_153195760:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000393712:exon_153195374_153195756:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000370009:exon_153195377_153195676:NAA10;ENSG00000102030:ENST00000466877:exon_153195379_153195676:NAA10 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153215839 G/A 1 3 23 26 1.42498770758928 12.0750942418155 -10.6501065342263 A:G G A 10 0.525004097470241 1.67575686026632e-05 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000444191:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153215694_153215994:HCFC1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153247954 C/T 0 9 0 9 4.27496312276783 0 4.27496312276783 C C 10 0.525004097470241 0.00426101107326108 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153248248 G/A 1 23 1 24 10.9249057581845 0.525004097470241 10.3999016607142 A:G G A 10 0.525004097470241 4.84611148910147e-06 ENSG00000177854:ENST00000369982:exon_153247301_153248646:TMEM187 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 0 0 12 12 0 6.30004916964289 -6.30004916964289 A G A 10 0.525004097470241 0.000131910194072645 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP01275_parsed_pileup.txt . X 153577719 G/A 0 0 11 11 0 5.77504507217265 -5.77504507217265 A G A 10 0.525004097470241 0.000277708067311971